Skip local Terminate if there was a merging+terminate job
[u/mrichter/AliRoot.git] / ANALYSIS / AliAnalysisAlien.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-2007, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16 // Author: Mihaela Gheata, 01/09/2008
17
18 //==============================================================================
19 //   AliAnalysisAlien - AliEn utility class. Provides interface for creating
20 // a personalized JDL, finding and creating a dataset.
21 //==============================================================================
22
23 #include "Riostream.h"
24 #include "TEnv.h"
25 #include "TError.h"
26 #include "TROOT.h"
27 #include "TSystem.h"
28 #include "TFile.h"
29 #include "TObjString.h"
30 #include "TObjArray.h"
31 #include "TGrid.h"
32 #include "TGridResult.h"
33 #include "TGridCollection.h"
34 #include "TGridJDL.h"
35 #include "TGridJobStatusList.h"
36 #include "TGridJobStatus.h"
37 #include "TFileMerger.h"
38 #include "AliAnalysisManager.h"
39 #include "AliVEventHandler.h"
40 #include "AliAnalysisDataContainer.h"
41 #include "AliAnalysisAlien.h"
42
43 ClassImp(AliAnalysisAlien)
44
45 //______________________________________________________________________________
46 AliAnalysisAlien::AliAnalysisAlien()
47                  :AliAnalysisGrid(),
48                   fGridJDL(NULL),
49                   fMergingJDL(NULL),
50                   fPrice(0),
51                   fTTL(0),
52                   fSplitMaxInputFileNumber(0),
53                   fMaxInitFailed(0),
54                   fMasterResubmitThreshold(0),
55                   fNtestFiles(0),
56                   fNrunsPerMaster(0),
57                   fMaxMergeFiles(0),
58                   fNsubmitted(0),
59                   fProductionMode(0),
60                   fOutputToRunNo(0),
61                   fMergeViaJDL(0),
62                   fFastReadOption(0),
63                   fOverwriteMode(0),
64                   fRunNumbers(),
65                   fExecutable(),
66                   fExecutableCommand(),
67                   fArguments(),
68                   fExecutableArgs(),
69                   fAnalysisMacro(),
70                   fAnalysisSource(),
71                   fAdditionalRootLibs(),
72                   fAdditionalLibs(),
73                   fSplitMode(),
74                   fAPIVersion(),
75                   fROOTVersion(),
76                   fAliROOTVersion(),
77                   fExternalPackages(),
78                   fUser(),
79                   fGridWorkingDir(),
80                   fGridDataDir(),
81                   fDataPattern(),
82                   fGridOutputDir(),
83                   fOutputArchive(),
84                   fOutputFiles(),
85                   fInputFormat(),
86                   fDatasetName(),
87                   fJDLName(),
88                             fMergeExcludes(),
89                   fIncludePath(),
90                   fCloseSE(),
91                   fFriendChainName(),
92                   fJobTag(),
93                   fOutputSingle(),
94                   fRunPrefix(),
95                   fInputFiles(0),
96                   fPackages(0)
97 {
98 // Dummy ctor.
99    SetDefaults();
100 }
101
102 //______________________________________________________________________________
103 AliAnalysisAlien::AliAnalysisAlien(const char *name)
104                  :AliAnalysisGrid(name),
105                   fGridJDL(NULL),
106                   fMergingJDL(NULL),
107                   fPrice(0),
108                   fTTL(0),
109                   fSplitMaxInputFileNumber(0),
110                   fMaxInitFailed(0),
111                   fMasterResubmitThreshold(0),
112                   fNtestFiles(0),
113                   fNrunsPerMaster(0),
114                   fMaxMergeFiles(0),
115                   fNsubmitted(0),
116                   fProductionMode(0),
117                   fOutputToRunNo(0),
118                   fMergeViaJDL(0),
119                   fFastReadOption(0),
120                   fOverwriteMode(0),
121                   fRunNumbers(),
122                   fExecutable(),
123                   fExecutableCommand(),
124                   fArguments(),
125                   fExecutableArgs(),
126                   fAnalysisMacro(),
127                   fAnalysisSource(),
128                   fAdditionalRootLibs(),
129                   fAdditionalLibs(),
130                   fSplitMode(),
131                   fAPIVersion(),
132                   fROOTVersion(),
133                   fAliROOTVersion(),
134                   fExternalPackages(),
135                   fUser(),
136                   fGridWorkingDir(),
137                   fGridDataDir(),
138                   fDataPattern(),
139                   fGridOutputDir(),
140                   fOutputArchive(),
141                   fOutputFiles(),
142                   fInputFormat(),
143                   fDatasetName(),
144                   fJDLName(),
145                   fMergeExcludes(),
146                   fIncludePath(),
147                   fCloseSE(),
148                   fFriendChainName(),
149                   fJobTag(),
150                   fOutputSingle(),
151                   fRunPrefix(),
152                   fInputFiles(0),
153                   fPackages(0)
154 {
155 // Default ctor.
156    SetDefaults();
157 }
158
159 //______________________________________________________________________________
160 AliAnalysisAlien::AliAnalysisAlien(const AliAnalysisAlien& other)
161                  :AliAnalysisGrid(other),
162                   fGridJDL(NULL),
163                   fMergingJDL(NULL),
164                   fPrice(other.fPrice),
165                   fTTL(other.fTTL),
166                   fSplitMaxInputFileNumber(other.fSplitMaxInputFileNumber),
167                   fMaxInitFailed(other.fMaxInitFailed),
168                   fMasterResubmitThreshold(other.fMasterResubmitThreshold),
169                   fNtestFiles(other.fNtestFiles),
170                   fNrunsPerMaster(other.fNrunsPerMaster),
171                   fMaxMergeFiles(other.fMaxMergeFiles),
172                   fNsubmitted(other.fNsubmitted),
173                   fProductionMode(other.fProductionMode),
174                   fOutputToRunNo(other.fOutputToRunNo),
175                   fMergeViaJDL(other.fMergeViaJDL),
176                   fFastReadOption(other.fFastReadOption),
177                   fOverwriteMode(other.fOverwriteMode),
178                   fRunNumbers(other.fRunNumbers),
179                   fExecutable(other.fExecutable),
180                   fExecutableCommand(other.fExecutableCommand),
181                   fArguments(other.fArguments),
182                   fExecutableArgs(other.fExecutableArgs),
183                   fAnalysisMacro(other.fAnalysisMacro),
184                   fAnalysisSource(other.fAnalysisSource),
185                   fAdditionalRootLibs(other.fAdditionalRootLibs),
186                   fAdditionalLibs(other.fAdditionalLibs),
187                   fSplitMode(other.fSplitMode),
188                   fAPIVersion(other.fAPIVersion),
189                   fROOTVersion(other.fROOTVersion),
190                   fAliROOTVersion(other.fAliROOTVersion),
191                   fExternalPackages(other.fExternalPackages),
192                   fUser(other.fUser),
193                   fGridWorkingDir(other.fGridWorkingDir),
194                   fGridDataDir(other.fGridDataDir),
195                   fDataPattern(other.fDataPattern),
196                   fGridOutputDir(other.fGridOutputDir),
197                   fOutputArchive(other.fOutputArchive),
198                   fOutputFiles(other.fOutputFiles),
199                   fInputFormat(other.fInputFormat),
200                   fDatasetName(other.fDatasetName),
201                   fJDLName(other.fJDLName),
202                   fMergeExcludes(other.fMergeExcludes),
203                   fIncludePath(other.fIncludePath),
204                   fCloseSE(other.fCloseSE),
205                   fFriendChainName(other.fFriendChainName),
206                   fJobTag(other.fJobTag),
207                   fOutputSingle(other.fOutputSingle),
208                   fRunPrefix(other.fRunPrefix),
209                   fInputFiles(0),
210                   fPackages(0)
211 {
212 // Copy ctor.
213    fGridJDL = (TGridJDL*)gROOT->ProcessLine("new TAlienJDL()");
214    fMergingJDL = (TGridJDL*)gROOT->ProcessLine("new TAlienJDL()");
215    fRunRange[0] = other.fRunRange[0];
216    fRunRange[1] = other.fRunRange[1];
217    if (other.fInputFiles) {
218       fInputFiles = new TObjArray();
219       TIter next(other.fInputFiles);
220       TObject *obj;
221       while ((obj=next())) fInputFiles->Add(new TObjString(obj->GetName()));
222       fInputFiles->SetOwner();
223    }   
224    if (other.fPackages) {
225       fPackages = new TObjArray();
226       TIter next(other.fPackages);
227       TObject *obj;
228       while ((obj=next())) fPackages->Add(new TObjString(obj->GetName()));
229       fPackages->SetOwner();
230    }   
231 }
232
233 //______________________________________________________________________________
234 AliAnalysisAlien::~AliAnalysisAlien()
235 {
236 // Destructor.
237    if (fGridJDL) delete fGridJDL;
238    if (fMergingJDL) delete fMergingJDL;
239    if (fInputFiles) delete fInputFiles;
240    if (fPackages) delete fPackages;
241 }   
242
243 //______________________________________________________________________________
244 AliAnalysisAlien &AliAnalysisAlien::operator=(const AliAnalysisAlien& other)
245 {
246 // Assignment.
247    if (this != &other) {
248       AliAnalysisGrid::operator=(other);
249       fGridJDL = (TGridJDL*)gROOT->ProcessLine("new TAlienJDL()");
250       fMergingJDL = (TGridJDL*)gROOT->ProcessLine("new TAlienJDL()");
251       fPrice                   = other.fPrice;
252       fTTL                     = other.fTTL;
253       fSplitMaxInputFileNumber = other.fSplitMaxInputFileNumber;
254       fMaxInitFailed           = other.fMaxInitFailed;
255       fMasterResubmitThreshold = other.fMasterResubmitThreshold;
256       fNtestFiles              = other.fNtestFiles;
257       fNrunsPerMaster          = other.fNrunsPerMaster;
258       fMaxMergeFiles           = other.fMaxMergeFiles;
259       fNsubmitted              = other.fNsubmitted;
260       fProductionMode          = other.fProductionMode;
261       fOutputToRunNo           = other.fOutputToRunNo;
262       fMergeViaJDL             = other.fMergeViaJDL;
263       fFastReadOption          = other.fFastReadOption;
264       fOverwriteMode           = other.fOverwriteMode;
265       fRunNumbers              = other.fRunNumbers;
266       fExecutable              = other.fExecutable;
267       fExecutableCommand       = other.fExecutableCommand;
268       fArguments               = other.fArguments;
269       fExecutableArgs          = other.fExecutableArgs;
270       fAnalysisMacro           = other.fAnalysisMacro;
271       fAnalysisSource          = other.fAnalysisSource;
272       fAdditionalRootLibs      = other.fAdditionalRootLibs;
273       fAdditionalLibs          = other.fAdditionalLibs;
274       fSplitMode               = other.fSplitMode;
275       fAPIVersion              = other.fAPIVersion;
276       fROOTVersion             = other.fROOTVersion;
277       fAliROOTVersion          = other.fAliROOTVersion;
278       fExternalPackages        = other.fExternalPackages;
279       fUser                    = other.fUser;
280       fGridWorkingDir          = other.fGridWorkingDir;
281       fGridDataDir             = other.fGridDataDir;
282       fDataPattern             = other.fDataPattern;
283       fGridOutputDir           = other.fGridOutputDir;
284       fOutputArchive           = other.fOutputArchive;
285       fOutputFiles             = other.fOutputFiles;
286       fInputFormat             = other.fInputFormat;
287       fDatasetName             = other.fDatasetName;
288       fJDLName                 = other.fJDLName;
289       fMergeExcludes           = other.fMergeExcludes;
290       fIncludePath             = other.fIncludePath;
291       fCloseSE                 = other.fCloseSE;
292       fFriendChainName         = other.fFriendChainName;
293       fJobTag                  = other.fJobTag;
294       fOutputSingle            = other.fOutputSingle;
295       fRunPrefix               = other.fRunPrefix;
296       if (other.fInputFiles) {
297          fInputFiles = new TObjArray();
298          TIter next(other.fInputFiles);
299          TObject *obj;
300          while ((obj=next())) fInputFiles->Add(new TObjString(obj->GetName()));
301          fInputFiles->SetOwner();
302       }   
303       if (other.fPackages) {
304          fPackages = new TObjArray();
305          TIter next(other.fPackages);
306          TObject *obj;
307          while ((obj=next())) fPackages->Add(new TObjString(obj->GetName()));
308          fPackages->SetOwner();
309       }   
310    }
311    return *this;
312 }
313
314 //______________________________________________________________________________
315 void AliAnalysisAlien::AddIncludePath(const char *path)
316 {
317 // Add include path in the remote analysis macro.
318    TString p(path);
319    if (p.Contains("-I")) fIncludePath += Form("%s ", path);
320    else                  fIncludePath += Form("-I%s ", path);
321 }
322
323 //______________________________________________________________________________
324 void AliAnalysisAlien::AddRunNumber(Int_t run)
325 {
326 // Add a run number to the list of runs to be processed.
327    if (fRunNumbers.Length()) fRunNumbers += " ";
328    fRunNumbers += Form("%s%d", fRunPrefix.Data(), run);
329 }   
330
331 //______________________________________________________________________________
332 void AliAnalysisAlien::AddRunNumber(const char* run)
333 {
334 // Add a run number to the list of runs to be processed.
335    if (fRunNumbers.Length()) fRunNumbers += " ";
336    fRunNumbers += run;
337 }   
338
339 //______________________________________________________________________________
340 void AliAnalysisAlien::AddDataFile(const char *lfn)
341 {
342 // Adds a data file to the input to be analysed. The file should be a valid LFN
343 // or point to an existing file in the alien workdir.
344    if (!fInputFiles) fInputFiles = new TObjArray();
345    fInputFiles->Add(new TObjString(lfn));
346 }
347
348 //______________________________________________________________________________
349 void AliAnalysisAlien::AddExternalPackage(const char *package)
350 {
351 // Adds external packages w.r.t to the default ones (root,aliroot and gapi)
352    if (fExternalPackages) fExternalPackages += " ";
353    fExternalPackages += package;
354 }   
355       
356 //______________________________________________________________________________
357 Bool_t AliAnalysisAlien::Connect()
358 {
359 // Try to connect to AliEn. User needs a valid token and /tmp/gclient_env_$UID sourced.
360    if (gGrid && gGrid->IsConnected()) return kTRUE;
361    if (!gSystem->Getenv("alien_API_USER")) {
362       Error("Connect", "Make sure you:\n 1. Have called: alien-token-init <username> today\n 2. Have sourced /tmp/gclient_env_%s",
363             gSystem->Getenv("UID"));
364       return kFALSE;
365    }         
366    if (!gGrid) {
367       Info("Connect", "Trying to connect to AliEn ...");
368       TGrid::Connect("alien://");
369    }
370    if (!gGrid || !gGrid->IsConnected()) {
371       Error("Connect", "Did not managed to connect to AliEn. Make sure you have a valid token.");
372       return kFALSE;
373    }  
374    fUser = gGrid->GetUser();
375    Info("Connect", "\n#####   Connected to AliEn as user %s. Setting analysis user to <%s>", fUser.Data(), fUser.Data());
376    return kTRUE;
377 }
378
379 //______________________________________________________________________________
380 void AliAnalysisAlien::CdWork()
381 {
382 // Check validity of alien workspace. Create directory if possible.
383    if (!Connect()) {
384       Error("CdWork", "Alien connection required");
385       return;
386    } 
387    TString homedir = gGrid->GetHomeDirectory();
388    TString workdir = homedir + fGridWorkingDir;
389    if (DirectoryExists(workdir)) {
390       gGrid->Cd(workdir);
391       return;
392    }   
393    // Work directory not existing - create it
394    gGrid->Cd(homedir);
395    if (gGrid->Mkdir(workdir)) {
396       gGrid->Cd(fGridWorkingDir);
397       Info("CreateJDL", "\n#####   Created alien working directory %s", fGridWorkingDir.Data());
398    } else {
399       Warning("CreateJDL", "Working directory %s cannot be created.\n Using %s instead.",
400               workdir.Data(), homedir.Data());
401       fGridWorkingDir = "";
402    }          
403 }
404
405 //______________________________________________________________________________
406 Bool_t AliAnalysisAlien::CheckInputData()
407 {
408 // Check validity of input data. If necessary, create xml files.
409    if (!fInputFiles && !fRunNumbers.Length() && !fRunRange[0]) {
410       if (!fGridDataDir.Length()) {
411          Error("CkeckInputData", "AliEn path to base data directory must be set.\n = Use: SetGridDataDir()");
412          return kFALSE;
413       }
414       Info("CheckInputData", "Analysis will make a single xml for base data directory %s",fGridDataDir.Data());
415       return kTRUE;
416    }
417    // Process declared files
418    Bool_t is_collection = kFALSE;
419    Bool_t is_xml = kFALSE;
420    Bool_t use_tags = kFALSE;
421    Bool_t checked = kFALSE;
422    CdWork();
423    TString file;
424    TString workdir = gGrid->GetHomeDirectory();
425    workdir += fGridWorkingDir;
426    if (fInputFiles) {
427       TObjString *objstr;
428       TIter next(fInputFiles);
429       while ((objstr=(TObjString*)next())) {
430          file = workdir;
431          file += "/";
432          file += objstr->GetString();
433          // Store full lfn path
434          if (FileExists(file)) objstr->SetString(file);
435          else {
436             file = objstr->GetName();
437             if (!FileExists(objstr->GetName())) {
438                Error("CheckInputData", "Data file %s not found or not in your working dir: %s",
439                      objstr->GetName(), workdir.Data());
440                return kFALSE;
441             }         
442          }
443          Bool_t iscoll, isxml, usetags;
444          CheckDataType(file, iscoll, isxml, usetags);
445          if (!checked) {
446             checked = kTRUE;
447             is_collection = iscoll;
448             is_xml = isxml;
449             use_tags = usetags;
450             TObject::SetBit(AliAnalysisGrid::kUseTags, use_tags);
451          } else {
452             if ((iscoll != is_collection) || (isxml != is_xml) || (usetags != use_tags)) {
453                Error("CheckInputData", "Some conflict was found in the types of inputs");
454                return kFALSE;
455             } 
456          }
457       }
458    }
459    // Process requested run numbers
460    if (!fRunNumbers.Length() && !fRunRange[0]) return kTRUE;
461    // Check validity of alien data directory
462    if (!fGridDataDir.Length()) {
463       Error("CkeckInputData", "AliEn path to base data directory must be set.\n = Use: SetGridDataDir()");
464       return kFALSE;
465    }
466    if (!DirectoryExists(fGridDataDir)) {
467       Error("CheckInputData", "Data directory %s not existing.", fGridDataDir.Data());
468       return kFALSE;
469    }
470    if (is_collection) {
471       Error("CheckInputData", "You are using raw AliEn collections as input. Cannot process run numbers.");
472       return kFALSE;   
473    }
474    
475    if (checked && !is_xml) {
476       Error("CheckInputData", "Cannot mix processing of full runs with non-xml files");
477       return kFALSE;   
478    }
479    // Check validity of run number(s)
480    TObjArray *arr;
481    TObjString *os;
482    Int_t nruns = 0;
483    TString schunk, schunk2;
484    TString path;
485    if (!checked) {
486       checked = kTRUE;
487       use_tags = fDataPattern.Contains("tag");
488       TObject::SetBit(AliAnalysisGrid::kUseTags, use_tags);
489    }   
490    if (use_tags != fDataPattern.Contains("tag")) {
491       Error("CheckInputData", "Cannot mix input files using/not using tags");
492       return kFALSE;
493    }
494    if (fRunNumbers.Length()) {
495       Info("CheckDataType", "Using supplied run numbers (run ranges are ignored)");
496       arr = fRunNumbers.Tokenize(" ");
497       TIter next(arr);
498       while ((os=(TObjString*)next())) {
499          path = Form("%s/%s ", fGridDataDir.Data(), os->GetString().Data());
500          if (!DirectoryExists(path)) {
501             Warning("CheckInputData", "Run number %s not found in path: <%s>", os->GetString().Data(), path.Data());
502             continue;
503          }
504          path = Form("%s/%s.xml", workdir.Data(),os->GetString().Data());
505          TString msg = "\n#####   file: ";
506          msg += path;
507          msg += " type: xml_collection;";
508          if (use_tags) msg += " using_tags: Yes";
509          else          msg += " using_tags: No";
510          Info("CheckDataType", msg.Data());
511          if (fNrunsPerMaster<2) {
512             AddDataFile(Form("%s.xml", os->GetString().Data()));
513          } else {
514             nruns++;
515             if (((nruns-1)%fNrunsPerMaster) == 0) {
516                schunk = os->GetString();
517             }   
518             if ((nruns%fNrunsPerMaster)!=0 && os!=arr->Last()) continue;
519             schunk += Form("_%s.xml", os->GetString().Data());
520             AddDataFile(schunk);
521          }   
522       }
523       delete arr;   
524    } else {
525       Info("CheckDataType", "Using run range [%d, %d]", fRunRange[0], fRunRange[1]);
526       for (Int_t irun=fRunRange[0]; irun<=fRunRange[1]; irun++) {
527          path = Form("%s/%s%d ", fGridDataDir.Data(), fRunPrefix.Data(), irun);
528          if (!DirectoryExists(path)) {
529 //            Warning("CheckInputData", "Run number %d not found in path: <%s>", irun, path.Data());
530             continue;
531          }
532          path = Form("%s/%s%d.xml", workdir.Data(),fRunPrefix.Data(),irun);
533          TString msg = "\n#####   file: ";
534          msg += path;
535          msg += " type: xml_collection;";
536          if (use_tags) msg += " using_tags: Yes";
537          else          msg += " using_tags: No";
538          Info("CheckDataType", msg.Data());
539          if (fNrunsPerMaster<2) {
540             AddDataFile(Form("%s%d.xml",fRunPrefix.Data(),irun));
541          } else {
542             nruns++;
543             if (((nruns-1)%fNrunsPerMaster) == 0) {
544                schunk = Form("%s%d", fRunPrefix.Data(),irun);
545             }
546             schunk2 = Form("_%s%d.xml", fRunPrefix.Data(), irun);
547             if ((nruns%fNrunsPerMaster)!=0 && irun != fRunRange[1]) continue;
548             schunk += schunk2;
549             AddDataFile(schunk);
550          }   
551       }
552       if (!fInputFiles) {
553          schunk += schunk2;
554          AddDataFile(schunk);
555       }   
556    }
557    return kTRUE;      
558 }   
559
560 //______________________________________________________________________________
561 Bool_t AliAnalysisAlien::CreateDataset(const char *pattern)
562 {
563 // Create dataset for the grid data directory + run number.
564    if (TestBit(AliAnalysisGrid::kOffline)) return kFALSE;
565    if (!Connect()) {
566       Error("CreateDataset", "Cannot create dataset with no grid connection");
567       return kFALSE;
568    }   
569
570    // Cd workspace
571    CdWork();
572    TString workdir = gGrid->GetHomeDirectory();
573    workdir += fGridWorkingDir;
574
575    // Compose the 'find' command arguments
576    TString command;
577    TString options = "-x collection ";
578    if (TestBit(AliAnalysisGrid::kTest)) options += Form("-l %d ", fNtestFiles);
579    TString conditions = "";
580    
581    TString file;
582    TString path;
583    Int_t nruns = 0;
584    TString schunk, schunk2;
585    TGridCollection *cbase=0, *cadd=0;
586    if (!fRunNumbers.Length() && !fRunRange[0]) {
587       if (fInputFiles && fInputFiles->GetEntries()) return kTRUE;
588       // Make a single data collection from data directory.
589       path = fGridDataDir;
590       if (!DirectoryExists(path)) {
591          Error("CreateDataset", "Path to data directory %s not valid",fGridDataDir.Data());
592          return kFALSE;
593       }   
594 //      CdWork();
595       if (TestBit(AliAnalysisGrid::kTest)) file = "wn.xml";
596       else file = Form("%s.xml", gSystem->BaseName(path));
597       if (gSystem->AccessPathName(file) || TestBit(AliAnalysisGrid::kTest) || fOverwriteMode) {
598          command = "find ";
599          command += options;
600          command += path;
601          command += " ";
602          command += pattern;
603          command += conditions;
604          printf("command: %s\n", command.Data());
605          TGridResult *res = gGrid->Command(command);
606          if (res) delete res;
607          // Write standard output to file
608          gROOT->ProcessLine(Form("gGrid->Stdout(); > %s", file.Data()));
609       }
610       Bool_t fileExists = FileExists(file);
611       if (!TestBit(AliAnalysisGrid::kTest) && (!fileExists || fOverwriteMode)) {
612          // Copy xml file to alien space
613          if (fileExists) gGrid->Rm(file);
614          TFile::Cp(Form("file:%s",file.Data()), Form("alien://%s/%s",workdir.Data(), file.Data()));
615          if (!FileExists(file)) {
616             Error("CreateDataset", "Command %s did NOT succeed", command.Data());
617             return kFALSE;
618          }
619          // Update list of files to be processed.
620       }
621       AddDataFile(Form("%s/%s", workdir.Data(), file.Data()));
622       return kTRUE;
623    }   
624    // Several runs
625    if (fRunNumbers.Length()) {
626       TObjArray *arr = fRunNumbers.Tokenize(" ");
627       TObjString *os;
628       TIter next(arr);
629       while ((os=(TObjString*)next())) {
630          path = Form("%s/%s ", fGridDataDir.Data(), os->GetString().Data());
631          if (!DirectoryExists(path)) continue;
632 //         CdWork();
633          if (TestBit(AliAnalysisGrid::kTest)) file = "wn.xml";
634          else file = Form("%s.xml", os->GetString().Data());
635          // If local collection file does not exist, create it via 'find' command.
636          if (gSystem->AccessPathName(file)) {
637             command = "find ";
638             command += options;
639             command += path;
640             command += pattern;
641             command += conditions;
642             TGridResult *res = gGrid->Command(command);
643             if (res) delete res;
644             // Write standard output to file
645             gROOT->ProcessLine(Form("gGrid->Stdout(); > %s", file.Data()));
646          }   
647          if (TestBit(AliAnalysisGrid::kTest)) break;
648          // Check if there is one run per master job.
649          if (fNrunsPerMaster<2) {
650             if (FileExists(file)) {
651                if (fOverwriteMode) gGrid->Rm(file);
652                else {
653                   Info("CreateDataset", "\n#####   Dataset %s exist. Skipping creation...", file.Data());
654                   continue;
655                }   
656             }        
657             // Copy xml file to alien space
658             TFile::Cp(Form("file:%s",file.Data()), Form("alien://%s/%s",workdir.Data(), file.Data()));
659             if (!FileExists(file)) {
660                Error("CreateDataset", "Command %s did NOT succeed", command.Data());
661                delete arr;
662                return kFALSE;
663             }
664          } else {
665             nruns++;
666             if (((nruns-1)%fNrunsPerMaster) == 0) {
667                schunk = os->GetString();
668                cbase = (TGridCollection*)gROOT->ProcessLine(Form("new TAlienCollection(\"%s\", 1000000);",file.Data()));
669             } else {
670                cadd = (TGridCollection*)gROOT->ProcessLine(Form("new TAlienCollection(\"%s\", 1000000);",file.Data()));
671                printf("   Merging collection <%s> into masterjob input...\n", file.Data());
672                cbase->Add(cadd);
673                delete cadd;
674             }
675             if ((nruns%fNrunsPerMaster)!=0 && os!=arr->Last()) {
676                continue;
677             }   
678             schunk += Form("_%s.xml", os->GetString().Data());
679             if (FileExists(schunk)) {               
680                if (fOverwriteMode) gGrid->Rm(file);
681                else {
682                   Info("CreateDataset", "\n#####   Dataset %s exist. Skipping creation...", schunk.Data());
683                   continue;
684                }   
685             }        
686             printf("Exporting merged collection <%s> and copying to AliEn\n", schunk.Data());
687             cbase->ExportXML(Form("file://%s", schunk.Data()),kFALSE,kFALSE, schunk, "Merged runs");
688             TFile::Cp(Form("file:%s",schunk.Data()), Form("alien://%s/%s",workdir.Data(), schunk.Data()));
689             if (!FileExists(schunk)) {
690                Error("CreateDataset", "Copy command did NOT succeed for %s", schunk.Data());
691                delete arr;
692                return kFALSE;
693             }
694          }   
695       }   
696       delete arr;
697    } else {
698       // Process a full run range.
699       for (Int_t irun=fRunRange[0]; irun<=fRunRange[1]; irun++) {
700          path = Form("%s/%s%d ", fGridDataDir.Data(), fRunPrefix.Data(), irun);
701          if (!DirectoryExists(path)) continue;
702 //         CdWork();
703          if (TestBit(AliAnalysisGrid::kTest)) file = "wn.xml";
704          else file = Form("%s%d.xml", fRunPrefix.Data(), irun);
705          if (FileExists(file) && fNrunsPerMaster<2 && !TestBit(AliAnalysisGrid::kTest)) {         
706             if (fOverwriteMode) gGrid->Rm(file);
707             else {
708                Info("CreateDataset", "\n#####   Dataset %s exist. Skipping creation...", file.Data());
709                continue;
710             }   
711          }
712          // If local collection file does not exist, create it via 'find' command.
713          if (gSystem->AccessPathName(file) || fOverwriteMode) {
714             command = "find ";
715             command += options;
716             command += path;
717             command += pattern;
718             command += conditions;
719             TGridResult *res = gGrid->Command(command);
720             if (res) delete res;
721             // Write standard output to file
722             gROOT->ProcessLine(Form("gGrid->Stdout(); > %s", file.Data()));
723          }   
724          if (TestBit(AliAnalysisGrid::kTest)) break;
725          // Check if there is one run per master job.
726          if (fNrunsPerMaster<2) {
727             if (FileExists(file)) {
728                if (fOverwriteMode) gGrid->Rm(file);
729                else {
730                   Info("CreateDataset", "\n#####   Dataset %s exist. Skipping creation...", file.Data());
731                   continue;
732                }   
733             }        
734             // Copy xml file to alien space
735             TFile::Cp(Form("file:%s",file.Data()), Form("alien://%s/%s",workdir.Data(), file.Data()));
736             if (!FileExists(file)) {
737                Error("CreateDataset", "Command %s did NOT succeed", command.Data());
738                return kFALSE;
739             }
740          } else {
741             nruns++;
742             // Check if the collection for the chunk exist locally.
743             Int_t nchunk = (nruns-1)/fNrunsPerMaster;
744             if (FileExists(fInputFiles->At(nchunk)->GetName())) {
745                if (fOverwriteMode) gGrid->Rm(fInputFiles->At(nchunk)->GetName());
746                else continue;
747             }   
748             printf("   Merging collection <%s> into %d runs chunk...\n",file.Data(),fNrunsPerMaster);
749             if (((nruns-1)%fNrunsPerMaster) == 0) {
750                schunk = Form("%s%d", fRunPrefix.Data(), irun);
751                cbase = (TGridCollection*)gROOT->ProcessLine(Form("new TAlienCollection(\"%s\", 1000000);",file.Data()));
752             } else {
753                cadd = (TGridCollection*)gROOT->ProcessLine(Form("new TAlienCollection(\"%s\", 1000000);",file.Data()));
754                cbase->Add(cadd);
755                delete cadd;
756             }
757             schunk2 = Form("%s_%s%d.xml", schunk.Data(), fRunPrefix.Data(), irun);
758             if ((nruns%fNrunsPerMaster)!=0 && irun!=fRunRange[1] && schunk2 != fInputFiles->Last()->GetName()) {
759                continue;
760             }   
761             schunk = schunk2;
762             if (FileExists(schunk)) {
763                if (fOverwriteMode) gGrid->Rm(schunk);
764                else {
765                   Info("CreateDataset", "\n#####   Dataset %s exist. Skipping creation...", schunk.Data());
766                   continue;
767                }   
768             }        
769             printf("Exporting merged collection <%s> and copying to AliEn.\n", schunk.Data());
770             cbase->ExportXML(Form("file://%s", schunk.Data()),kFALSE,kFALSE, schunk, "Merged runs");
771             if (FileExists(schunk)) {
772                if (fOverwriteMode) gGrid->Rm(schunk);
773                else {
774                   Info("CreateDataset", "\n#####   Dataset %s exist. Skipping copy...", schunk.Data());
775                   continue;
776                }   
777             }   
778             TFile::Cp(Form("file:%s",schunk.Data()), Form("alien://%s/%s",workdir.Data(), schunk.Data()));
779             if (!FileExists(schunk)) {
780                Error("CreateDataset", "Copy command did NOT succeed for %s", schunk.Data());
781                return kFALSE;
782             }
783          }   
784       }
785    }      
786    return kTRUE;
787 }
788
789 //______________________________________________________________________________
790 Bool_t AliAnalysisAlien::CreateJDL()
791 {
792 // Generate a JDL file according to current settings. The name of the file is 
793 // specified by fJDLName.
794    Bool_t error = kFALSE;
795    TObjArray *arr = 0;
796    Bool_t copy = kTRUE;
797    if (TestBit(AliAnalysisGrid::kOffline) || TestBit(AliAnalysisGrid::kTest)) copy = kFALSE;
798    Bool_t generate = kTRUE;
799    if (TestBit(AliAnalysisGrid::kTest) || TestBit(AliAnalysisGrid::kSubmit)) generate = kFALSE;
800    if (!Connect()) {
801       Error("CreateJDL", "Alien connection required");
802       return kFALSE;
803    }   
804    // Check validity of alien workspace
805    CdWork();
806    TString workdir = gGrid->GetHomeDirectory();
807    workdir += fGridWorkingDir;
808    if (generate) {
809       TObjString *os;
810       if (!fInputFiles) {
811          Error("CreateJDL()", "Define some input files for your analysis.");
812          error = kTRUE;
813       }
814       // Compose list of input files   
815       // Check if output files were defined
816       if (!fOutputFiles.Length()) {
817          Error("CreateJDL", "You must define at least one output file");
818          error = kTRUE;
819       }   
820       // Check if an output directory was defined and valid
821       if (!fGridOutputDir.Length()) {
822          Error("CreateJDL", "You must define AliEn output directory");
823          error = kTRUE;
824       } else {
825          if (!fGridOutputDir.Contains("/")) fGridOutputDir = Form("%s/%s", workdir.Data(), fGridOutputDir.Data());
826          if (!DirectoryExists(fGridOutputDir)) {
827             if (gGrid->Mkdir(fGridOutputDir)) {
828                Info("CreateJDL", "\n#####   Created alien output directory %s", fGridOutputDir.Data());
829             } else {
830                Error("CreateJDL", "Could not create alien output directory %s", fGridOutputDir.Data());
831                // error = kTRUE;
832             }
833          }
834          gGrid->Cd(workdir);
835       }   
836       // Exit if any error up to now
837       if (error) return kFALSE;   
838       // Set JDL fields
839       if (!fUser.IsNull()) {
840          fGridJDL->SetValue("User", Form("\"%s\"", fUser.Data()));
841          fMergingJDL->SetValue("User", Form("\"%s\"", fUser.Data()));
842       }   
843       fGridJDL->SetExecutable(fExecutable, "This is the startup script");
844       TString mergeExec = fExecutable;
845       mergeExec.ReplaceAll(".sh", "_merge.sh");
846       fMergingJDL->SetExecutable(mergeExec, "This is the startup script");
847       mergeExec.ReplaceAll(".sh", ".C");
848       fMergingJDL->AddToInputSandbox(Form("LF:%s/%s", workdir.Data(),mergeExec.Data()), "List of input files to be uploaded to workers");
849       if (!fArguments.IsNull())
850          fGridJDL->SetArguments(fArguments, "Arguments for the executable command");
851       fMergingJDL->SetArguments("$1");   
852       fGridJDL->SetTTL((UInt_t)fTTL);
853       fMergingJDL->SetTTL((UInt_t)fTTL);
854       if (fMaxInitFailed > 0) {
855          fGridJDL->SetValue("MaxInitFailed", Form("\"%d\"",fMaxInitFailed));
856          fGridJDL->SetDescription("MaxInitFailed", "Maximum number of first failing jobs to abort the master job");
857       }   
858       if (fSplitMaxInputFileNumber > 0) {
859          fGridJDL->SetValue("SplitMaxInputFileNumber", Form("\"%d\"", fSplitMaxInputFileNumber));
860          fGridJDL->SetDescription("SplitMaxInputFileNumber", "Maximum number of input files to be processed per subjob");
861       }   
862       if (fSplitMode.Length()) {
863          fGridJDL->SetValue("Split", Form("\"%s\"", fSplitMode.Data()));
864          fGridJDL->SetDescription("Split", "We split per SE or file");
865       }   
866       if (!fAliROOTVersion.IsNull()) {
867          fGridJDL->AddToPackages("AliRoot", fAliROOTVersion,"VO_ALICE", "List of requested packages");
868          fMergingJDL->AddToPackages("AliRoot", fAliROOTVersion, "VO_ALICE", "List of requested packages");
869       }   
870       if (!fROOTVersion.IsNull()) {
871          fGridJDL->AddToPackages("ROOT", fROOTVersion);
872          fMergingJDL->AddToPackages("ROOT", fROOTVersion);
873       }   
874       if (!fAPIVersion.IsNull()) {
875          fGridJDL->AddToPackages("APISCONFIG", fAPIVersion);
876          fMergingJDL->AddToPackages("APISCONFIG", fAPIVersion);
877       }   
878       if (!fExternalPackages.IsNull()) {
879          arr = fExternalPackages.Tokenize(" ");
880          TIter next(arr);
881          while ((os=(TObjString*)next())) {
882             TString pkgname = os->GetString();
883             Int_t index = pkgname.Index("::");
884             TString pkgversion = pkgname(index+2, pkgname.Length());
885             pkgname.Remove(index);
886             fGridJDL->AddToPackages(pkgname, pkgversion);
887             fMergingJDL->AddToPackages(pkgname, pkgversion);
888          }   
889          delete arr;   
890       }   
891       fGridJDL->SetInputDataListFormat(fInputFormat, "Format of input data");
892       fGridJDL->SetInputDataList("wn.xml", "Collection name to be processed on each worker node");
893       fGridJDL->AddToInputSandbox(Form("LF:%s/%s", workdir.Data(), fAnalysisMacro.Data()), "List of input files to be uploaded to workers");
894       TString analysisFile = fExecutable;
895       analysisFile.ReplaceAll(".sh", ".root");
896       fGridJDL->AddToInputSandbox(Form("LF:%s/%s", workdir.Data(),analysisFile.Data()));
897       fMergingJDL->AddToInputSandbox(Form("LF:%s/%s", workdir.Data(),analysisFile.Data()));
898       if (IsUsingTags() && !gSystem->AccessPathName("ConfigureCuts.C"))
899          fGridJDL->AddToInputSandbox(Form("LF:%s/ConfigureCuts.C", workdir.Data()));
900       if (fAdditionalLibs.Length()) {
901          arr = fAdditionalLibs.Tokenize(" ");
902          TIter next(arr);
903          while ((os=(TObjString*)next())) {
904             if (os->GetString().Contains(".so")) continue;
905             fGridJDL->AddToInputSandbox(Form("LF:%s/%s", workdir.Data(), os->GetString().Data()));
906             fMergingJDL->AddToInputSandbox(Form("LF:%s/%s", workdir.Data(), os->GetString().Data()));
907          }   
908          delete arr;   
909       }
910       if (fPackages) {
911          TIter next(fPackages);
912          TObject *obj;
913          while ((obj=next())) {
914             fGridJDL->AddToInputSandbox(Form("LF:%s/%s", workdir.Data(), obj->GetName()));
915             fMergingJDL->AddToInputSandbox(Form("LF:%s/%s", workdir.Data(), obj->GetName()));
916          }
917       }
918       if (fOutputArchive.Length()) {
919          arr = fOutputArchive.Tokenize(" ");
920          TIter next(arr);
921          Bool_t first = kTRUE;
922          const char *comment = "Files to be archived";
923          const char *comment1 = comment;
924          while ((os=(TObjString*)next())) {
925             if (!first) comment = NULL;
926             if (!os->GetString().Contains("@") && fCloseSE.Length())
927                fGridJDL->AddToOutputArchive(Form("%s@%s",os->GetString().Data(), fCloseSE.Data()), comment); 
928             else
929                fGridJDL->AddToOutputArchive(os->GetString(), comment);
930             first = kFALSE;   
931          }      
932          delete arr;
933          TString outputArchive = fOutputArchive;
934          if (!fMergeExcludes.IsNull()) {
935             arr = fMergeExcludes.Tokenize(" ");
936             TIter next1(arr);
937             while ((os=(TObjString*)next1())) {
938                outputArchive.ReplaceAll(Form("%s,",os->GetString().Data()),"");
939                outputArchive.ReplaceAll(os->GetString(),"");
940             }
941             delete arr;
942          }
943          arr = outputArchive.Tokenize(" ");
944          TIter next2(arr);
945          comment = comment1;
946          first = kTRUE;
947          while ((os=(TObjString*)next2())) {
948             if (!first) comment = NULL;
949             if (!os->GetString().Contains("@") && fCloseSE.Length())
950                fMergingJDL->AddToOutputArchive(Form("%s@%s",os->GetString().Data(), fCloseSE.Data()), comment); 
951             else
952                fMergingJDL->AddToOutputArchive(os->GetString(), comment);
953             first = kFALSE;   
954          }      
955          delete arr;         
956       }      
957       arr = fOutputFiles.Tokenize(" ");
958       TIter next(arr);
959       Bool_t first = kTRUE;
960       const char *comment = "Files to be archived";
961       const char *comment1 = comment;
962       while ((os=(TObjString*)next())) {
963          // Ignore ouputs in jdl that are also in outputarchive
964          TString sout = os->GetString();
965          if (sout.Index("@")>0) sout.Remove(sout.Index("@"));
966          if (fOutputArchive.Contains(sout)) continue;
967          if (!first) comment = NULL;
968          if (!os->GetString().Contains("@") && fCloseSE.Length())
969             fGridJDL->AddToOutputSandbox(Form("%s@%s",os->GetString().Data(), fCloseSE.Data()), comment); 
970          else
971             fGridJDL->AddToOutputSandbox(os->GetString(), comment);
972          first = kFALSE;   
973       }   
974       delete arr;
975       if (fOutputFiles.Length()) {
976          TString outputFiles = fOutputFiles;
977          if (!fMergeExcludes.IsNull()) {
978             arr = fMergeExcludes.Tokenize(" ");
979             TIter next1(arr);
980             while ((os=(TObjString*)next1())) {
981                outputFiles.ReplaceAll(Form("%s,",os->GetString().Data()),"");
982                outputFiles.ReplaceAll(os->GetString(),"");
983             }
984             delete arr;
985          }
986          arr = outputFiles.Tokenize(" ");
987          TIter next2(arr);
988          comment = comment1;
989          first = kTRUE;
990          while ((os=(TObjString*)next2())) {
991             // Ignore ouputs in jdl that are also in outputarchive
992             TString sout = os->GetString();
993             if (sout.Index("@")>0) sout.Remove(sout.Index("@"));
994             if (fOutputArchive.Contains(sout)) continue;
995             if (!first) comment = NULL;
996             if (!os->GetString().Contains("@") && fCloseSE.Length())
997                fMergingJDL->AddToOutputSandbox(Form("%s@%s",os->GetString().Data(), fCloseSE.Data()), comment); 
998             else
999                fMergingJDL->AddToOutputSandbox(os->GetString(), comment);
1000          }   
1001          delete arr;
1002       }
1003       fGridJDL->SetPrice((UInt_t)fPrice, "AliEn price for this job");
1004       fMergingJDL->SetPrice((UInt_t)fPrice, "AliEn price for this job");
1005       TString validationScript = fExecutable;
1006       validationScript.ReplaceAll(".sh", "_validation.sh");
1007       fGridJDL->SetValidationCommand(Form("%s/%s", workdir.Data(),validationScript.Data()), "Validation script to be run for each subjob");
1008       validationScript = fExecutable;
1009       validationScript.ReplaceAll(".sh", "_mergevalidation.sh");
1010       fMergingJDL->SetValidationCommand(Form("%s/%s", workdir.Data(),validationScript.Data()), "Validation script to be run for each subjob");
1011       if (fMasterResubmitThreshold) {
1012          fGridJDL->SetValue("MasterResubmitThreshold", Form("\"%d%%\"", fMasterResubmitThreshold));
1013          fGridJDL->SetDescription("MasterResubmitThreshold", "Resubmit failed jobs until DONE rate reaches this percentage");
1014       }   
1015       // Write a jdl with 2 input parameters: collection name and output dir name.
1016       WriteJDL(copy);
1017    }
1018    // Copy jdl to grid workspace   
1019    if (copy) {
1020       // Check if an output directory was defined and valid
1021       if (!fGridOutputDir.Length()) {
1022          Error("CreateJDL", "You must define AliEn output directory");
1023          return kFALSE;
1024       } else {
1025          if (!fGridOutputDir.Contains("/")) fGridOutputDir = Form("%s/%s", workdir.Data(), fGridOutputDir.Data());
1026          if (!fProductionMode && !DirectoryExists(fGridOutputDir)) {
1027             if (gGrid->Mkdir(fGridOutputDir)) {
1028                Info("CreateJDL", "\n#####   Created alien output directory %s", fGridOutputDir.Data());
1029             } else {
1030                Error("CreateJDL", "Could not create alien output directory %s", fGridOutputDir.Data());
1031                return kFALSE;
1032             }
1033          }
1034          gGrid->Cd(workdir);
1035       }   
1036       if (TestBit(AliAnalysisGrid::kSubmit)) {
1037          TString mergeJDLName = fExecutable;
1038          mergeJDLName.ReplaceAll(".sh", "_merge.jdl");
1039          TString locjdl = Form("%s/%s", fGridOutputDir.Data(),fJDLName.Data());
1040          TString locjdl1 = Form("%s/%s", fGridOutputDir.Data(),mergeJDLName.Data());
1041          if (fProductionMode) {
1042             locjdl = Form("%s/%s", workdir.Data(),fJDLName.Data());
1043             locjdl1 = Form("%s/%s", workdir.Data(),mergeJDLName.Data());
1044          }   
1045          if (FileExists(locjdl)) gGrid->Rm(locjdl);
1046          if (FileExists(locjdl1)) gGrid->Rm(locjdl1);
1047          Info("CreateJDL", "\n#####   Copying JDL file <%s> to your AliEn output directory", fJDLName.Data());
1048          TFile::Cp(Form("file:%s",fJDLName.Data()), Form("alien://%s", locjdl.Data()));
1049          if (fMergeViaJDL) {
1050             Info("CreateJDL", "\n#####   Copying merging JDL file <%s> to your AliEn output directory", mergeJDLName.Data());
1051             TFile::Cp(Form("file:%s",mergeJDLName.Data()), Form("alien://%s", locjdl1.Data()));
1052          }   
1053       }
1054       if (fAdditionalLibs.Length()) {
1055          arr = fAdditionalLibs.Tokenize(" ");
1056          TObjString *os;
1057          TIter next(arr);
1058          while ((os=(TObjString*)next())) {
1059             if (os->GetString().Contains(".so")) continue;
1060             Info("CreateJDL", "\n#####   Copying dependency: <%s> to your alien workspace", os->GetString().Data());
1061             if (FileExists(os->GetString())) gGrid->Rm(os->GetString());
1062             TFile::Cp(Form("file:%s",os->GetString().Data()), Form("alien://%s/%s", workdir.Data(), os->GetString().Data()));
1063          }   
1064          delete arr;   
1065       }
1066       if (fPackages) {
1067          TIter next(fPackages);
1068          TObject *obj;
1069          while ((obj=next())) {
1070             if (FileExists(obj->GetName())) gGrid->Rm(obj->GetName());
1071             Info("CreateJDL", "\n#####   Copying dependency: <%s> to your alien workspace", obj->GetName());
1072             TFile::Cp(Form("file:%s",obj->GetName()), Form("alien://%s/%s", workdir.Data(), obj->GetName()));
1073          }   
1074       }      
1075    } 
1076    return kTRUE;
1077 }
1078
1079 //______________________________________________________________________________
1080 Bool_t AliAnalysisAlien::WriteJDL(Bool_t copy)
1081 {
1082 // Writes one or more JDL's corresponding to findex. If findex is negative,
1083 // all run numbers are considered in one go (jdl). For non-negative indices
1084 // they correspond to the indices in the array fInputFiles.
1085    if (!fInputFiles) return kFALSE;
1086    TObjString *os;
1087    TString workdir = gGrid->GetHomeDirectory();
1088    workdir += fGridWorkingDir;
1089    
1090    if (!fRunNumbers.Length() && !fRunRange[0]) {
1091       // One jdl with no parameters in case input data is specified by name.
1092       TIter next(fInputFiles);
1093       while ((os=(TObjString*)next()))
1094          fGridJDL->AddToInputDataCollection(Form("LF:%s,nodownload", os->GetString().Data()), "Input xml collections");
1095       if (!fOutputSingle.IsNull())
1096          fGridJDL->SetOutputDirectory(Form("#alienfulldir#/../%s",fOutputSingle.Data()), "Output directory");
1097       else {
1098          fGridJDL->SetOutputDirectory(Form("%s/#alien_counter_03i#", fGridOutputDir.Data()), "Output directory");
1099          fMergingJDL->SetOutputDirectory(fGridOutputDir);         
1100       }   
1101    } else {
1102       // One jdl to be submitted with 2 input parameters: data collection name and output dir prefix
1103       fGridJDL->AddToInputDataCollection(Form("LF:%s/$1,nodownload", workdir.Data()), "Input xml collections");
1104       if (!fOutputSingle.IsNull()) {
1105          if (!fOutputToRunNo) fGridJDL->SetOutputDirectory(Form("#alienfulldir#/%s",fOutputSingle.Data()), "Output directory");
1106          else fGridJDL->SetOutputDirectory(Form("%s/$2",fGridOutputDir.Data()), "Output directory");
1107       } else {   
1108          fGridJDL->SetOutputDirectory(Form("%s/$2/#alien_counter_03i#", fGridOutputDir.Data()), "Output directory");
1109          fMergingJDL->SetOutputDirectory(Form("%s/$1", fGridOutputDir.Data()), "Output directory");
1110       }   
1111    }
1112       
1113
1114    // Generate the JDL as a string
1115    TString sjdl = fGridJDL->Generate();
1116    TString sjdl1 = fMergingJDL->Generate();
1117    Int_t index;
1118    sjdl.ReplaceAll("\"LF:", "\n   \"LF:");
1119    sjdl.ReplaceAll("(member", "\n   (member");
1120    sjdl.ReplaceAll("\",\"VO_", "\",\n   \"VO_");
1121    sjdl.ReplaceAll("{", "{\n   ");
1122    sjdl.ReplaceAll("};", "\n};");
1123    sjdl.ReplaceAll("{\n   \n", "{\n");
1124    sjdl.ReplaceAll("\n\n", "\n");
1125    sjdl.ReplaceAll("OutputDirectory", "OutputDir");
1126    sjdl1.ReplaceAll("\"LF:", "\n   \"LF:");
1127    sjdl1.ReplaceAll("(member", "\n   (member");
1128    sjdl1.ReplaceAll("\",\"VO_", "\",\n   \"VO_");
1129    sjdl1.ReplaceAll("{", "{\n   ");
1130    sjdl1.ReplaceAll("};", "\n};");
1131    sjdl1.ReplaceAll("{\n   \n", "{\n");
1132    sjdl1.ReplaceAll("\n\n", "\n");
1133    sjdl1.ReplaceAll("OutputDirectory", "OutputDir");
1134    sjdl += "JDLVariables = \n{\n   \"Packages\",\n   \"OutputDir\"\n};\n";
1135    sjdl.Prepend(Form("Jobtag = {\n   \"comment:%s\"\n};\n", fJobTag.Data()));
1136    index = sjdl.Index("JDLVariables");
1137    if (index >= 0) sjdl.Insert(index, "\n# JDL variables\n");
1138    sjdl1 += "JDLVariables = \n{\n   \"Packages\",\n   \"OutputDir\"\n};\n";
1139    sjdl1.Prepend(Form("Jobtag = {\n   \"comment:Merging_%s\"\n};\n", fJobTag.Data()));
1140    index = sjdl1.Index("JDLVariables");
1141    if (index >= 0) sjdl1.Insert(index, "\n# JDL variables\n");
1142    // Write jdl to file
1143    ofstream out;
1144    out.open(fJDLName.Data(), ios::out);
1145    if (out.bad()) {
1146       Error("CreateJDL", "Bad file name: %s", fJDLName.Data());
1147       return kFALSE;
1148    }
1149    out << sjdl << endl;
1150    TString mergeJDLName = fExecutable;
1151    mergeJDLName.ReplaceAll(".sh", "_merge.jdl");
1152    if (fMergeViaJDL) {
1153       ofstream out1;
1154       out1.open(mergeJDLName.Data(), ios::out);
1155       if (out.bad()) {
1156          Error("CreateJDL", "Bad file name: %s", mergeJDLName.Data());
1157          return kFALSE;
1158       }
1159       out1 << sjdl1 << endl;
1160    }   
1161
1162    // Copy jdl to grid workspace   
1163    if (!copy) {
1164       Info("CreateJDL", "\n#####   You may want to review jdl:%s and analysis macro:%s before running in <submit> mode", fJDLName.Data(), fAnalysisMacro.Data());
1165    } else {
1166       TString locjdl = Form("%s/%s", fGridOutputDir.Data(),fJDLName.Data());
1167       TString locjdl1 = Form("%s/%s", fGridOutputDir.Data(),mergeJDLName.Data());
1168       if (fProductionMode) {
1169          locjdl = Form("%s/%s", workdir.Data(),fJDLName.Data());
1170          locjdl1 = Form("%s/%s", workdir.Data(),mergeJDLName.Data());
1171       }   
1172       if (FileExists(locjdl)) gGrid->Rm(locjdl);
1173       if (FileExists(locjdl1)) gGrid->Rm(locjdl1);
1174       Info("CreateJDL", "\n#####   Copying JDL file <%s> to your AliEn output directory", fJDLName.Data());
1175       TFile::Cp(Form("file:%s",fJDLName.Data()), Form("alien://%s", locjdl.Data()));
1176       if (fMergeViaJDL) {
1177          Info("CreateJDL", "\n#####   Copying merging JDL file <%s> to your AliEn output directory", mergeJDLName.Data());
1178          TFile::Cp(Form("file:%s",mergeJDLName.Data()), Form("alien://%s", locjdl1.Data()));
1179       }   
1180    } 
1181    return kTRUE;
1182 }
1183
1184 //______________________________________________________________________________
1185 Bool_t AliAnalysisAlien::FileExists(const char *lfn)
1186 {
1187 // Returns true if file exists.
1188    if (!gGrid) return kFALSE;
1189    TGridResult *res = gGrid->Ls(lfn);
1190    if (!res) return kFALSE;
1191    TMap *map = dynamic_cast<TMap*>(res->At(0));
1192    if (!map) {
1193       delete res;
1194       return kFALSE;
1195    }   
1196    TObjString *objs = dynamic_cast<TObjString*>(map->GetValue("name"));
1197    if (!objs || !objs->GetString().Length()) {
1198       delete res;
1199       return kFALSE;
1200    }
1201    delete res;   
1202    return kTRUE;
1203 }
1204
1205 //______________________________________________________________________________
1206 Bool_t AliAnalysisAlien::DirectoryExists(const char *dirname)
1207 {
1208 // Returns true if directory exists. Can be also a path.
1209    if (!gGrid) return kFALSE;
1210    // Check if dirname is a path
1211    TString dirstripped = dirname;
1212    dirstripped = dirstripped.Strip();
1213    dirstripped = dirstripped.Strip(TString::kTrailing, '/');
1214    TString dir = gSystem->BaseName(dirstripped);
1215    dir += "/";
1216    TString path = gSystem->DirName(dirstripped);
1217    TGridResult *res = gGrid->Ls(path, "-F");
1218    if (!res) return kFALSE;
1219    TIter next(res);
1220    TMap *map;
1221    TObject *obj;
1222    while ((map=dynamic_cast<TMap*>(next()))) {
1223       obj = map->GetValue("name");
1224       if (!obj) break;
1225       if (dir == obj->GetName()) {
1226          delete res;
1227          return kTRUE;
1228       }
1229    }
1230    delete res;
1231    return kFALSE;
1232 }      
1233
1234 //______________________________________________________________________________
1235 void AliAnalysisAlien::CheckDataType(const char *lfn, Bool_t &is_collection, Bool_t &is_xml, Bool_t &use_tags)
1236 {
1237 // Check input data type.
1238    is_collection = kFALSE;
1239    is_xml = kFALSE;
1240    use_tags = kFALSE;
1241    if (!gGrid) {
1242       Error("CheckDataType", "No connection to grid");
1243       return;
1244    }
1245    is_collection = IsCollection(lfn);
1246    TString msg = "\n#####   file: ";
1247    msg += lfn;
1248    if (is_collection) {
1249       msg += " type: raw_collection;";
1250    // special treatment for collections
1251       is_xml = kFALSE;
1252       // check for tag files in the collection
1253       TGridResult *res = gGrid->Command(Form("listFilesFromCollection -z -v %s",lfn), kFALSE);
1254       if (!res) {
1255          msg += " using_tags: No (unknown)";
1256          Info("CheckDataType", msg.Data());
1257          return;
1258       }   
1259       const char* typeStr = res->GetKey(0, "origLFN");
1260       if (!typeStr || !strlen(typeStr)) {
1261          msg += " using_tags: No (unknown)";
1262          Info("CheckDataType", msg.Data());
1263          return;
1264       }   
1265       TString file = typeStr;
1266       use_tags = file.Contains(".tag");
1267       if (use_tags) msg += " using_tags: Yes";
1268       else          msg += " using_tags: No";
1269       Info("CheckDataType", msg.Data());
1270       return;
1271    }
1272    TString slfn(lfn);
1273    slfn.ToLower();
1274    is_xml = slfn.Contains(".xml");
1275    if (is_xml) {
1276    // Open xml collection and check if there are tag files inside
1277       msg += " type: xml_collection;";
1278       TGridCollection *coll = (TGridCollection*)gROOT->ProcessLine(Form("TAlienCollection::Open(\"alien://%s\",1);",lfn));
1279       if (!coll) {
1280          msg += " using_tags: No (unknown)";
1281          Info("CheckDataType", msg.Data());
1282          return;
1283       }   
1284       TMap *map = coll->Next();
1285       if (!map) {
1286          msg += " using_tags: No (unknown)";
1287          Info("CheckDataType", msg.Data());
1288          return;
1289       }   
1290       map = (TMap*)map->GetValue("");
1291       TString file;
1292       if (map && map->GetValue("name")) file = map->GetValue("name")->GetName();
1293       use_tags = file.Contains(".tag");
1294       delete coll;
1295       if (use_tags) msg += " using_tags: Yes";
1296       else          msg += " using_tags: No";
1297       Info("CheckDataType", msg.Data());
1298       return;
1299    }
1300    use_tags = slfn.Contains(".tag");
1301    if (slfn.Contains(".root")) msg += " type: root file;";
1302    else                        msg += " type: unknown file;";
1303    if (use_tags) msg += " using_tags: Yes";
1304    else          msg += " using_tags: No";
1305    Info("CheckDataType", msg.Data());
1306 }
1307
1308 //______________________________________________________________________________
1309 void AliAnalysisAlien::EnablePackage(const char *package)
1310 {
1311 // Enables a par file supposed to exist in the current directory.
1312    TString pkg(package);
1313    pkg.ReplaceAll(".par", "");
1314    pkg += ".par";
1315    if (gSystem->AccessPathName(pkg)) {
1316       Fatal("EnablePackage", "Package %s not found", pkg.Data());
1317       return;
1318    }
1319    if (!TObject::TestBit(AliAnalysisGrid::kUsePars))
1320       Info("EnablePackage", "AliEn plugin will use .par packages");
1321    TObject::SetBit(AliAnalysisGrid::kUsePars, kTRUE);
1322    if (!fPackages) {
1323       fPackages = new TObjArray();
1324       fPackages->SetOwner();
1325    }
1326    fPackages->Add(new TObjString(pkg));
1327 }      
1328
1329 //______________________________________________________________________________
1330 const char *AliAnalysisAlien::GetJobStatus(Int_t jobidstart, Int_t lastid, Int_t &nrunning, Int_t &nwaiting, Int_t &nerror, Int_t &ndone)
1331 {
1332 // Get job status for all jobs with jobid>jobidstart.
1333    static char mstatus[20];
1334    mstatus[0] = '\0';
1335    nrunning = 0;
1336    nwaiting = 0;
1337    nerror   = 0;
1338    ndone    = 0;
1339    TGridJobStatusList *list = gGrid->Ps("");
1340    if (!list) return mstatus;
1341    Int_t nentries = list->GetSize();
1342    TGridJobStatus *status;
1343    Int_t pid;
1344    for (Int_t ijob=0; ijob<nentries; ijob++) {
1345       status = (TGridJobStatus *)list->At(ijob);
1346       pid = gROOT->ProcessLine(Form("atoi(((TAlienJobStatus*)0x%lx)->GetKey(\"queueId\"));", (ULong_t)status));
1347       if (pid<jobidstart) continue;
1348       if (pid == lastid) {
1349          gROOT->ProcessLine(Form("sprintf((char*)0x%lx,((TAlienJobStatus*)0x%lx)->GetKey(\"status\"));",(ULong_t)mstatus, (ULong_t)status));
1350       }   
1351       switch (status->GetStatus()) {
1352          case TGridJobStatus::kWAITING:
1353             nwaiting++; break;
1354          case TGridJobStatus::kRUNNING:
1355             nrunning++; break;
1356          case TGridJobStatus::kABORTED:
1357          case TGridJobStatus::kFAIL:
1358          case TGridJobStatus::kUNKNOWN:
1359             nerror++; break;
1360          case TGridJobStatus::kDONE:
1361             ndone++;
1362       }
1363    }
1364    list->Delete();
1365    delete list;
1366    return mstatus;
1367 }
1368
1369 //______________________________________________________________________________
1370 Bool_t AliAnalysisAlien::IsCollection(const char *lfn) const
1371 {
1372 // Returns true if file is a collection. Functionality duplicated from
1373 // TAlien::Type() because we don't want to directly depend on TAlien.
1374    if (!gGrid) {
1375       Error("IsCollection", "No connection to grid");
1376       return kFALSE;
1377    }
1378    TGridResult *res = gGrid->Command(Form("type -z %s",lfn),kFALSE);
1379    if (!res) return kFALSE;
1380    const char* typeStr = res->GetKey(0, "type");
1381    if (!typeStr || !strlen(typeStr)) return kFALSE;
1382    if (!strcmp(typeStr, "collection")) return kTRUE;
1383    delete res;
1384    return kFALSE;
1385 }   
1386
1387 //______________________________________________________________________________
1388 Bool_t AliAnalysisAlien::IsSingleOutput() const
1389 {
1390 // Check if single-ouput option is on.
1391    return (!fOutputSingle.IsNull());
1392 }
1393    
1394 //______________________________________________________________________________
1395 void AliAnalysisAlien::Print(Option_t *) const
1396 {
1397 // Print current plugin settings.
1398    printf("### AliEn analysis plugin current settings ###\n");
1399    printf("=   Production mode:______________________________ %d\n", fProductionMode);
1400    printf("=   Version of API requested: ____________________ %s\n", fAPIVersion.Data());
1401    printf("=   Version of ROOT requested: ___________________ %s\n", fROOTVersion.Data());
1402    printf("=   Version of AliRoot requested: ________________ %s\n", fAliROOTVersion.Data());
1403    if (fUser.Length()) 
1404    printf("=   User running the plugin: _____________________ %s\n", fUser.Data());
1405    printf("=   Grid workdir relative to user $HOME: _________ %s\n", fGridWorkingDir.Data());
1406    printf("=   Grid output directory relative to workdir: ___ %s\n", fGridOutputDir.Data());
1407    printf("=   Data base directory path requested: __________ %s\n", fGridDataDir.Data());
1408    printf("=   Data search pattern: _________________________ %s\n", fDataPattern.Data());
1409    printf("=   Input data format: ___________________________ %s\n", fInputFormat.Data());
1410    if (fRunNumbers.Length()) 
1411    printf("=   Run numbers to be processed: _________________ %s\n", fRunNumbers.Data());
1412    if (fRunRange[0])
1413    printf("=   Run range to be processed: ___________________ %s%d-%s%d\n", fRunPrefix.Data(), fRunRange[0], fRunPrefix.Data(), fRunRange[1]);
1414    if (!fRunRange[0] && !fRunNumbers.Length()) {
1415       TIter next(fInputFiles);
1416       TObject *obj;
1417       TString list;
1418       while ((obj=next())) list += obj->GetName();
1419       printf("=   Input files to be processed: _________________ %s\n", list.Data());
1420    }
1421    if (TestBit(AliAnalysisGrid::kTest))
1422    printf("=   Number of input files used in test mode: _____ %d\n", fNtestFiles);
1423    printf("=   List of output files to be registered: _______ %s\n", fOutputFiles.Data());
1424    printf("=   List of outputs going to be archived: ________ %s\n", fOutputArchive.Data());
1425    printf("=   List of outputs that should not be merged: ___ %s\n", fMergeExcludes.Data());
1426    printf("=====================================================================\n");
1427    printf("=   Job price: ___________________________________ %d\n", fPrice);
1428    printf("=   Time to live (TTL): __________________________ %d\n", fTTL);
1429    printf("=   Max files per subjob: ________________________ %d\n", fSplitMaxInputFileNumber);
1430    if (fMaxInitFailed>0) 
1431    printf("=   Max number of subjob fails to kill: __________ %d\n", fMaxInitFailed);
1432    if (fMasterResubmitThreshold>0) 
1433    printf("=   Resubmit master job if failed subjobs >_______ %d\n", fMasterResubmitThreshold);
1434    if (fNrunsPerMaster>0)
1435    printf("=   Number of runs per master job: _______________ %d\n", fNrunsPerMaster);
1436    printf("=   Number of files in one chunk to be merged: ___ %d\n", fMaxMergeFiles);
1437    printf("=   Name of the generated execution script: ______ %s\n", fExecutable.Data());
1438    printf("=   Executable command: __________________________ %s\n", fExecutableCommand.Data());
1439    if (fArguments.Length()) 
1440    printf("=   Arguments for the execution script: __________ %s\n",fArguments.Data());
1441    if (fExecutableArgs.Length()) 
1442    printf("=   Arguments after macro name in executable______ %s\n",fExecutableArgs.Data());
1443    printf("=   Name of the generated analysis macro: ________ %s\n",fAnalysisMacro.Data());
1444    printf("=   User analysis files to be deployed: __________ %s\n",fAnalysisSource.Data());
1445    printf("=   Additional libs to be loaded or souces to be compiled runtime: <%s>\n",fAdditionalLibs.Data());
1446    printf("=   Master jobs split mode: ______________________ %s\n",fSplitMode.Data());
1447    if (fDatasetName)
1448    printf("=   Custom name for the dataset to be created: ___ %s\n", fDatasetName.Data());
1449    printf("=   Name of the generated JDL: ___________________ %s\n", fJDLName.Data());
1450    if (fIncludePath.Data())
1451    printf("=   Include path for runtime task compilation: ___ %s\n", fIncludePath.Data());
1452    if (fCloseSE.Length())
1453    printf("=   Force job outputs to storage element: ________ %s\n", fCloseSE.Data());
1454    if (fFriendChainName.Length())
1455    printf("=   Open friend chain file on worker: ____________ %s\n", fFriendChainName.Data());
1456    if (fPackages) {
1457       TIter next(fPackages);
1458       TObject *obj;
1459       TString list;
1460       while ((obj=next())) list += obj->GetName();
1461       printf("=   Par files to be used: ________________________ %s\n", list.Data());
1462    }   
1463 }
1464
1465 //______________________________________________________________________________
1466 void AliAnalysisAlien::SetDefaults()
1467 {
1468 // Set default values for everything. What cannot be filled will be left empty.
1469    if (fGridJDL) delete fGridJDL;
1470    fGridJDL = (TGridJDL*)gROOT->ProcessLine("new TAlienJDL()");
1471    fMergingJDL = (TGridJDL*)gROOT->ProcessLine("new TAlienJDL()");
1472    fPrice                      = 1;
1473    fTTL                        = 30000;
1474    fSplitMaxInputFileNumber    = 100;
1475    fMaxInitFailed              = 0;
1476    fMasterResubmitThreshold    = 0;
1477    fNtestFiles                 = 10;
1478    fRunRange[0]                = 0;
1479    fRunRange[1]                = 0;
1480    fNrunsPerMaster             = 1;
1481    fMaxMergeFiles              = 100;
1482    fRunNumbers                 = "";
1483    fExecutable                 = "analysis.sh";
1484    fExecutableCommand          = "root -b -q";
1485    fArguments                  = "";
1486    fExecutableArgs             = "";
1487    fAnalysisMacro              = "myAnalysis.C";
1488    fAnalysisSource             = "";
1489    fAdditionalLibs             = "";
1490    fSplitMode                  = "se";
1491    fAPIVersion                 = "";
1492    fROOTVersion                = "";
1493    fAliROOTVersion             = "";
1494    fUser                       = "";  // Your alien user name
1495    fGridWorkingDir             = "";
1496    fGridDataDir                = "";  // Can be like: /alice/sim/PDC_08a/LHC08c9/
1497    fDataPattern                = "*AliESDs.root";  // Can be like: *AliESDs.root, */pass1/*AliESDs.root, ...
1498    fFriendChainName            = "";
1499    fGridOutputDir              = "output";
1500    fOutputArchive              = "log_archive.zip:stdout,stderr root_archive.zip:*.root";
1501    fOutputFiles                = "";  // Like "AliAODs.root histos.root"
1502    fInputFormat                = "xml-single";
1503    fJDLName                    = "analysis.jdl";
1504    fJobTag                     = "Automatically generated analysis JDL";
1505    fMergeExcludes              = "";
1506    fMergeViaJDL                = 0;
1507 }   
1508
1509 //______________________________________________________________________________
1510 Bool_t AliAnalysisAlien::MergeOutput(const char *output, const char *basedir, Int_t nmaxmerge)
1511 {
1512 // Merge all registered outputs from basedir.
1513    TString output_file = output;
1514    TString command;
1515    TString output_chunk;
1516    TString previous_chunk = "";
1517    Int_t count_chunk = 0;
1518    Int_t count_zero = nmaxmerge;
1519    Bool_t merged = kTRUE;
1520    Int_t index = output_file.Index("@");
1521    if (index > 0) output_file.Remove(index);
1522    command = Form("find %s/ *%s", basedir, output_file.Data());
1523    printf("command: %s\n", command.Data());
1524    TGridResult *res = gGrid->Command(command);
1525    if (!res) {
1526       printf("Error: No result for the find command\n");
1527       return kFALSE;
1528    }     
1529
1530    TFileMerger *fm = 0;
1531    TIter nextmap(res);
1532    TMap *map = 0;
1533    // Check if there is a merge operation to resume
1534    output_chunk = output_file;
1535    output_chunk.ReplaceAll(".root", "_*.root");
1536    // Check for existent temporary merge files
1537    if (!gSystem->Exec(Form("ls %s", output_chunk.Data()))) {
1538       while (1) {
1539          // Skip as many input files as in a chunk
1540          for (Int_t counter=0; counter<nmaxmerge; counter++) map = (TMap*)nextmap();
1541          if (!map) {
1542             ::Error("MergeOutputs", "Cannot resume merging for <%s>, nentries=%d", output_file.Data(), res->GetSize());
1543             delete res;
1544             return kFALSE;
1545          }
1546          output_chunk = output_file;
1547          output_chunk.ReplaceAll(".root", Form("_%04d.root", count_chunk));
1548          count_chunk++;
1549          if (gSystem->AccessPathName(output_chunk)) continue;
1550          // Merged file with chunks up to <count_chunk> found
1551          printf("Resume merging of <%s> from <%s>\n", output_file.Data(), output_chunk.Data());
1552          previous_chunk = output_chunk;
1553          break;
1554       }
1555    }   
1556    count_zero = nmaxmerge;
1557    
1558    while ((map=(TMap*)nextmap())) {
1559    // Loop 'find' results and get next LFN
1560       if (count_zero == nmaxmerge) {
1561          // First file in chunk - create file merger and add previous chunk if any.
1562          fm = new TFileMerger(kFALSE);
1563          fm->SetFastMethod(kTRUE);
1564          if (previous_chunk.Length()) fm->AddFile(previous_chunk.Data());
1565          output_chunk = output_file;
1566          output_chunk.ReplaceAll(".root", Form("_%04d.root", count_chunk));
1567       }
1568       // If last file found, put merged results in the output file
1569       if (map == res->Last()) output_chunk = output_file;
1570       TObjString *objs = dynamic_cast<TObjString*>(map->GetValue("turl"));
1571       if (!objs || !objs->GetString().Length()) {
1572          // Nothing found - skip this output
1573          delete res;
1574          delete fm;
1575          return kFALSE;
1576       } 
1577       // Add file to be merged and decrement chunk counter.
1578       fm->AddFile(objs->GetString());
1579       count_zero--;
1580       if (count_zero==0 || map == res->Last()) {            
1581          fm->OutputFile(output_chunk);
1582          if (!fm->GetMergeList() || !fm->GetMergeList()->GetSize()) {
1583          // Nothing found - skip this output
1584             ::Warning("MergeOutputs", "No <%s> files found.", output_file.Data());
1585             delete res;
1586             delete fm;
1587             return kFALSE;
1588          }
1589          // Merge the outputs, then go to next chunk      
1590          if (!fm->Merge()) {
1591             ::Error("MergeOutputs", "Could not merge all <%s> files", output_file.Data());
1592             delete res;
1593             delete fm;
1594             merged = kFALSE;
1595             return kFALSE;
1596          } else {
1597             ::Info("MergeOutputs", "\n#####   Merged %d output files to <%s>", fm->GetMergeList()->GetSize(), output_chunk.Data());
1598             gSystem->Unlink(previous_chunk);
1599          }
1600          if (map == res->Last()) {
1601             delete res;
1602             delete fm;
1603             break;
1604          }      
1605          count_chunk++;
1606          count_zero = nmaxmerge;
1607          previous_chunk = output_chunk;
1608       }
1609    }
1610    return merged;
1611
1612
1613 //______________________________________________________________________________
1614 Bool_t AliAnalysisAlien::MergeOutputs()
1615 {
1616 // Merge analysis outputs existing in the AliEn space.
1617    if (TestBit(AliAnalysisGrid::kTest)) return kTRUE;
1618    if (TestBit(AliAnalysisGrid::kOffline)) return kFALSE;
1619    if (!Connect()) {
1620       Error("MergeOutputs", "Cannot merge outputs without grid connection. Terminate will NOT be executed");
1621       return kFALSE;
1622    }
1623    if (fMergeViaJDL && !fProductionMode && TestBit(AliAnalysisGrid::kMerge)) {
1624       Info("MergeOutputs", "Submitting merging JDL");
1625       SubmitMerging();
1626       Info("MergeOutputs", "### Re-run with <MergeViaJDL> off to collect results after merging jobs are done ###");
1627       Info("MergeOutputs", "### Not executing Terminate for now. This is not an error.");
1628       return kFALSE;
1629    }   
1630    // Get the output path
1631    if (!fGridOutputDir.Contains("/")) fGridOutputDir = Form("/%s/%s/%s", gGrid->GetHomeDirectory(), fGridWorkingDir.Data(), fGridOutputDir.Data());
1632    if (!DirectoryExists(fGridOutputDir)) {
1633       Error("MergeOutputs", "Grid output directory %s not found. Terminate() will NOT be executed", fGridOutputDir.Data());
1634       return kFALSE;
1635    }
1636    if (!fOutputFiles.Length()) {
1637       Error("MergeOutputs", "No output file names defined. Are you running the right AliAnalysisAlien configuration ?");
1638       return kFALSE;
1639    }
1640    // Check if fast read option was requested
1641    if (fFastReadOption) {
1642       Warning("MergeOutputs", "You requested FastRead option. Using xrootd flags to reduce timeouts. Note that this may skip some files that could be accessed !");
1643       gEnv->SetValue("XNet.ConnectTimeout",5);
1644       gEnv->SetValue("XNet.RequestTimeout",5);
1645       gEnv->SetValue("XNet.MaxRedirectCount",2);
1646       gEnv->SetValue("XNet.ReconnectTimeout",5);
1647       gEnv->SetValue("XNet.FirstConnectMaxCnt",1);
1648    }   
1649    TObjArray *list = fOutputFiles.Tokenize(" ");
1650    TIter next(list);
1651    TObjString *str;
1652    TString output_file;
1653    Bool_t merged = kTRUE;
1654    while((str=(TObjString*)next())) {
1655       output_file = str->GetString();
1656       Int_t index = output_file.Index("@");
1657       if (index > 0) output_file.Remove(index);
1658       // Skip already merged outputs
1659       if (!gSystem->AccessPathName(output_file)) {
1660          Info("MergeOutputs", "Output file <%s> found. Not merging again.", output_file.Data());
1661          continue;
1662       }   
1663       if (fMergeExcludes.Length() &&
1664           fMergeExcludes.Contains(output_file.Data())) continue;
1665       // Perform a 'find' command in the output directory, looking for registered outputs    
1666       merged = MergeOutput(output_file, fGridOutputDir, fMaxMergeFiles);
1667       if (!merged) {
1668          Error("MergeOutputs", "Terminate() will  NOT be executed");
1669          return kFALSE;
1670       }   
1671    } 
1672    return kTRUE;
1673 }   
1674
1675 //______________________________________________________________________________
1676 void AliAnalysisAlien::SetDefaultOutputs(Bool_t flag)
1677 {
1678 // Use the output files connected to output containers from the analysis manager
1679 // rather than the files defined by SetOutputFiles
1680    if (flag && !TObject::TestBit(AliAnalysisGrid::kDefaultOutputs))
1681       Info("SetDefaultOutputs", "Plugin will use the output files taken from \
1682       analysis manager");
1683    TObject::SetBit(AliAnalysisGrid::kDefaultOutputs, flag);
1684 }
1685       
1686 //______________________________________________________________________________
1687 Bool_t AliAnalysisAlien::StartAnalysis(Long64_t /*nentries*/, Long64_t /*firstEntry*/)
1688 {
1689 // Start remote grid analysis.
1690    
1691    // Check if output files have to be taken from the analysis manager
1692    if (TestBit(AliAnalysisGrid::kDefaultOutputs)) {
1693       AliAnalysisManager *mgr = AliAnalysisManager::GetAnalysisManager();
1694       if (!mgr || !mgr->IsInitialized()) {
1695          Error("StartAnalysis", "You need an initialized analysis manager for this");
1696          return kFALSE;
1697       }
1698       fOutputFiles = "";
1699       TIter next(mgr->GetOutputs());
1700       AliAnalysisDataContainer *output;
1701       while ((output=(AliAnalysisDataContainer*)next())) {
1702          const char *filename = output->GetFileName();
1703          if (!(strcmp(filename, "default"))) {
1704             if (!mgr->GetOutputEventHandler()) continue;
1705             filename = mgr->GetOutputEventHandler()->GetOutputFileName();
1706          }
1707          if (fOutputFiles.Contains(filename)) continue;
1708          if (fOutputFiles.Length()) fOutputFiles += " ";
1709          fOutputFiles += filename;
1710       }
1711       // Add extra files registered to the analysis manager
1712       if (mgr->GetExtraFiles().Length()) {
1713          if (fOutputFiles.Length()) fOutputFiles += " ";
1714          fOutputFiles += mgr->GetExtraFiles();
1715       }
1716    }
1717 //   if (!fCloseSE.Length()) fCloseSE = gSystem->Getenv("alien_CLOSE_SE");
1718    if (TestBit(AliAnalysisGrid::kOffline)) {
1719       Info("StartAnalysis","\n##### OFFLINE MODE ##### Files to be used in GRID are produced but not copied \
1720       \n                         there nor any job run. You can revise the JDL and analysis \
1721       \n                         macro then run the same in \"submit\" mode.");
1722    } else if (TestBit(AliAnalysisGrid::kTest)) {
1723       Info("StartAnalysis","\n##### LOCAL MODE #####   Your analysis will be run locally on a subset of the requested \
1724       \n                         dataset.");
1725    } else if (TestBit(AliAnalysisGrid::kSubmit)) {
1726       Info("StartAnalysis","\n##### SUBMIT MODE #####  Files required by your analysis are copied to your grid working \
1727       \n                         space and job submitted.");
1728    } else if (TestBit(AliAnalysisGrid::kMerge)) {
1729       Info("StartAnalysis","\n##### MERGE MODE #####   The registered outputs of the analysis will be merged");
1730       if (fMergeViaJDL) CheckInputData();
1731       return kTRUE;
1732    } else {
1733       Info("StartAnalysis","\n##### FULL ANALYSIS MODE ##### Producing needed files and submitting your analysis job...");   
1734    }   
1735       
1736    if (!Connect()) {
1737       Error("StartAnalysis", "Cannot start grid analysis without grid connection");
1738       return kFALSE;
1739    }
1740    Print();   
1741    if (!CheckInputData()) {
1742       Error("StartAnalysis", "There was an error in preprocessing your requested input data");
1743       return kFALSE;
1744    }   
1745    CreateDataset(fDataPattern);
1746    WriteAnalysisFile();   
1747    WriteAnalysisMacro();
1748    WriteExecutable();
1749    WriteValidationScript();
1750    if (fMergeViaJDL) {
1751       WriteMergingMacro();
1752       WriteMergeExecutable();
1753       WriteValidationScript(kTRUE);
1754    }   
1755    if (!CreateJDL()) return kFALSE;
1756    if (TestBit(AliAnalysisGrid::kOffline)) return kFALSE;
1757    if (TestBit(AliAnalysisGrid::kTest)) {
1758       // Locally testing the analysis
1759       Info("StartAnalysis", "\n_______________________________________________________________________ \
1760       \n   Running analysis script in a daughter shell as on a worker node \
1761       \n_______________________________________________________________________");
1762       TObjArray *list = fOutputFiles.Tokenize(" ");
1763       TIter next(list);
1764       TObjString *str;
1765       TString output_file;
1766       while((str=(TObjString*)next())) {
1767          output_file = str->GetString();
1768          Int_t index = output_file.Index("@");
1769          if (index > 0) output_file.Remove(index);         
1770          if (!gSystem->AccessPathName(output_file)) gSystem->Exec(Form("rm %s", output_file.Data()));
1771       }
1772       delete list;
1773       gSystem->Exec(Form("bash %s 2>stderr", fExecutable.Data()));
1774       TString validationScript = fExecutable;
1775       validationScript.ReplaceAll(".sh", "_validation.sh");
1776       gSystem->Exec(Form("bash %s",validationScript.Data()));
1777 //      gSystem->Exec("cat stdout");
1778       return kFALSE;
1779    }
1780    // Check if submitting is managed by LPM manager
1781    if (fProductionMode) {
1782       TString prodfile = fJDLName;
1783       prodfile.ReplaceAll(".jdl", ".prod");
1784       WriteProductionFile(prodfile);
1785       Info("StartAnalysis", "Job submitting is managed by LPM. Rerun in terminate mode after jobs finished.");
1786       return kFALSE;
1787    }   
1788    // Submit AliEn job(s)
1789    gGrid->Cd(fGridOutputDir);
1790    TGridResult *res;
1791    TString jobID = "";
1792    if (!fRunNumbers.Length() && !fRunRange[0]) {
1793       // Submit a given xml or a set of runs
1794       res = gGrid->Command(Form("submit %s", fJDLName.Data()));
1795       printf("*************************** %s\n",Form("submit %s", fJDLName.Data()));
1796       if (res) {
1797          const char *cjobId = res->GetKey(0,"jobId");
1798          if (!cjobId) {
1799             Error("StartAnalysis", "Your JDL %s could not be submitted", fJDLName.Data());
1800             return kFALSE;
1801          } else {
1802             Info("StartAnalysis", "\n_______________________________________________________________________ \
1803             \n#####   Your JDL %s was successfully submitted. \nTHE JOB ID IS: %s \
1804             \n_______________________________________________________________________",
1805                    fJDLName.Data(), cjobId);
1806             jobID = cjobId;      
1807          }          
1808          delete res;
1809       }   
1810    } else {
1811       // Submit for a range of enumeration of runs.
1812       Submit();
1813    }   
1814          
1815    Info("StartAnalysis", "\n#### STARTING AN ALIEN SHELL FOR YOU. EXIT WHEN YOUR JOB %s HAS FINISHED. #### \
1816    \n You may exit at any time and terminate the job later using the option <terminate> \
1817    \n ##################################################################################", jobID.Data());
1818    gSystem->Exec("aliensh");
1819    return kTRUE;
1820 }
1821
1822 //______________________________________________________________________________
1823 void AliAnalysisAlien::Submit()
1824 {
1825 // Submit all master jobs.
1826    Int_t nmasterjobs = fInputFiles->GetEntries();
1827    Long_t tshoot = gSystem->Now();
1828    if (!fNsubmitted) SubmitNext();
1829    while (fNsubmitted < nmasterjobs) {
1830       Long_t now = gSystem->Now();
1831       if ((now-tshoot)>30000) {
1832          tshoot = now;
1833          SubmitNext();
1834       }   
1835    }
1836 }
1837
1838 //______________________________________________________________________________
1839 void AliAnalysisAlien::SubmitMerging()
1840 {
1841 // Submit all merging jobs.
1842    if (!fGridOutputDir.Contains("/")) fGridOutputDir = Form("/%s/%s/%s", gGrid->GetHomeDirectory(), fGridWorkingDir.Data(), fGridOutputDir.Data());
1843    gGrid->Cd(fGridOutputDir);
1844    TString mergeJDLName = fExecutable;
1845    mergeJDLName.ReplaceAll(".sh", "_merge.jdl");
1846    Int_t ntosubmit = fInputFiles->GetEntries();
1847    printf("### Submitting %d merging jobs...\n", ntosubmit);
1848    for (Int_t i=0; i<ntosubmit; i++) {
1849       TString query;
1850       TString runOutDir = gSystem->BaseName(fInputFiles->At(i)->GetName());
1851       runOutDir.ReplaceAll(".xml", "");
1852       if (fOutputToRunNo)
1853          query = Form("submit %s %s", mergeJDLName.Data(), runOutDir.Data());
1854       else
1855          query = Form("submit %s %03d", mergeJDLName.Data(), i);
1856       printf("********* %s\n",query.Data());
1857       TGridResult *res = gGrid->Command(query);
1858       if (res) {
1859          const char *cjobId = res->GetKey(0,"jobId");
1860          if (!cjobId) {
1861             Error("StartAnalysis", "Your JDL %s could not be submitted", mergeJDLName.Data());
1862             return;
1863          } else {
1864             Info("StartAnalysis", "\n_______________________________________________________________________ \
1865             \n#####   Your JDL %s was successfully submitted. \nTHE JOB ID IS: %s \
1866             \n_______________________________________________________________________",
1867                    mergeJDLName.Data(), cjobId);
1868          }
1869          delete res;
1870       }             
1871    }
1872    if (!ntosubmit) return;
1873    Info("StartAnalysis", "\n#### STARTING AN ALIEN SHELL FOR YOU. EXIT WHEN YOUR MERGING JOBS HAVE FINISHED. #### \
1874    \n You may exit at any time and terminate the job later using the option <terminate> but disabling SetMergeViaJDL\
1875    \n ##################################################################################");
1876    gSystem->Exec("aliensh");
1877 }
1878
1879 //______________________________________________________________________________
1880 void AliAnalysisAlien::SubmitNext()
1881 {
1882 // Submit next bunch of master jobs if the queue is free.
1883    static Bool_t iscalled = kFALSE;
1884    static Int_t firstmaster = 0;
1885    static Int_t lastmaster = 0;
1886    static Int_t npermaster  = 0;
1887    if (iscalled) return;
1888    iscalled = kTRUE;
1889    Int_t nrunning=0, nwaiting=0, nerror=0, ndone=0;
1890    Int_t ntosubmit = 0;
1891    TGridResult *res;
1892    TString jobID = "";
1893    if (!fNsubmitted) ntosubmit = 1;
1894    else {
1895       TString status = GetJobStatus(firstmaster, lastmaster, nrunning, nwaiting, nerror, ndone);
1896       printf("=== master %d: %s\n", lastmaster, status.Data());
1897       // If last master not split, just return
1898       if (status != "SPLIT") {iscalled = kFALSE; return;}
1899       // No more than 100 waiting jobs
1900       if (nwaiting>100) {iscalled = kFALSE; return;}
1901       npermaster = (nrunning+nwaiting+nerror+ndone)/fNsubmitted;      
1902       if (npermaster) ntosubmit = (100-nwaiting)/npermaster;
1903       printf("=== WAITING(%d) RUNNING(%d) DONE(%d) OTHER(%d) NperMaster=%d => to submit %d jobs\n", 
1904              nwaiting, nrunning, ndone, nerror, npermaster, ntosubmit);
1905    }
1906    Int_t nmasterjobs = fInputFiles->GetEntries();
1907    for (Int_t i=0; i<ntosubmit; i++) {
1908       // Submit for a range of enumeration of runs.
1909       if (fNsubmitted>=nmasterjobs) {iscalled = kFALSE; return;}
1910       TString query;
1911       TString runOutDir = gSystem->BaseName(fInputFiles->At(fNsubmitted)->GetName());
1912       runOutDir.ReplaceAll(".xml", "");
1913       if (fOutputToRunNo)
1914          query = Form("submit %s %s %s", fJDLName.Data(), fInputFiles->At(fNsubmitted)->GetName(), runOutDir.Data());
1915       else
1916          query = Form("submit %s %s %03d", fJDLName.Data(), fInputFiles->At(fNsubmitted)->GetName(), fNsubmitted);
1917       printf("********* %s\n",query.Data());
1918       res = gGrid->Command(query);
1919       if (res) {
1920          TString cjobId1 = res->GetKey(0,"jobId");
1921          if (!cjobId1.Length()) {
1922             Error("StartAnalysis", "Your JDL %s could not be submitted", fJDLName.Data());
1923             iscalled = kFALSE;
1924             return;
1925          } else {
1926             Info("StartAnalysis", "\n_______________________________________________________________________ \
1927             \n#####   Your JDL %s submitted (%d to go). \nTHE JOB ID IS: %s \
1928             \n_______________________________________________________________________",
1929                 fJDLName.Data(), nmasterjobs-fNsubmitted-1, cjobId1.Data());
1930             jobID += cjobId1;
1931             jobID += " ";
1932             lastmaster = cjobId1.Atoi();
1933             if (!firstmaster) firstmaster = lastmaster;
1934             fNsubmitted++;
1935          }          
1936          delete res;
1937       }   
1938    }
1939    iscalled = kFALSE;
1940 }
1941
1942 //______________________________________________________________________________
1943 void AliAnalysisAlien::WriteAnalysisFile()
1944 {
1945 // Write current analysis manager into the file <analysisFile>
1946    TString analysisFile = fExecutable;
1947    analysisFile.ReplaceAll(".sh", ".root");
1948    if (!TestBit(AliAnalysisGrid::kSubmit)) {  
1949       AliAnalysisManager *mgr = AliAnalysisManager::GetAnalysisManager();
1950       if (!mgr || !mgr->IsInitialized()) {
1951          Error("WriteAnalysisFile", "You need an initialized analysis manager for this");
1952          return;
1953       }
1954       // Check analysis type
1955       TObject *handler;
1956       if (mgr->GetMCtruthEventHandler()) TObject::SetBit(AliAnalysisGrid::kUseMC);
1957       handler = (TObject*)mgr->GetInputEventHandler();
1958       if (handler) {
1959          if (handler->InheritsFrom("AliESDInputHandler")) TObject::SetBit(AliAnalysisGrid::kUseESD);
1960          if (handler->InheritsFrom("AliAODInputHandler")) TObject::SetBit(AliAnalysisGrid::kUseAOD);
1961       }
1962       TDirectory *cdir = gDirectory;
1963       TFile *file = TFile::Open(analysisFile, "RECREATE");
1964       if (file) {
1965          // Skip task Terminate calls for the grid job
1966          mgr->SetSkipTerminate(kTRUE);
1967          // Unless merging makes no sense
1968          if (IsSingleOutput()) mgr->SetSkipTerminate(kFALSE);
1969          mgr->Write();
1970          delete file;
1971          // Enable termination for local jobs
1972          mgr->SetSkipTerminate(kFALSE);
1973       }
1974       if (cdir) cdir->cd();
1975       Info("WriteAnalysisFile", "\n#####   Analysis manager: %s wrote to file <%s>\n", mgr->GetName(),analysisFile.Data());
1976    }   
1977    Bool_t copy = kTRUE;
1978    if (TestBit(AliAnalysisGrid::kOffline) || TestBit(AliAnalysisGrid::kTest)) copy = kFALSE;
1979    if (copy) {
1980       CdWork();
1981       TString workdir = gGrid->GetHomeDirectory();
1982       workdir += fGridWorkingDir;
1983       Info("CreateJDL", "\n#####   Copying file <%s> containing your initialized analysis manager to your alien workspace", analysisFile.Data());
1984       if (FileExists(analysisFile)) gGrid->Rm(analysisFile);
1985       TFile::Cp(Form("file:%s",analysisFile.Data()), Form("alien://%s/%s", workdir.Data(),analysisFile.Data()));
1986    }   
1987 }
1988
1989 //______________________________________________________________________________
1990 void AliAnalysisAlien::WriteAnalysisMacro()
1991 {
1992 // Write the analysis macro that will steer the analysis in grid mode.
1993    if (!TestBit(AliAnalysisGrid::kSubmit)) {  
1994       ofstream out;
1995       out.open(fAnalysisMacro.Data(), ios::out);
1996       if (!out.good()) {
1997          Error("WriteAnalysisMacro", "could not open file %s for writing", fAnalysisMacro.Data());
1998          return;
1999       }
2000       Bool_t hasSTEERBase = kFALSE;
2001       Bool_t hasESD = kFALSE;
2002       Bool_t hasAOD = kFALSE;
2003       Bool_t hasANALYSIS = kFALSE;
2004       Bool_t hasANALYSISalice = kFALSE;
2005       Bool_t hasCORRFW = kFALSE;
2006       TString func = fAnalysisMacro;
2007       TString type = "ESD";
2008       TString comment = "// Analysis using ";
2009       if (TObject::TestBit(AliAnalysisGrid::kUseESD)) comment += "ESD";
2010       if (TObject::TestBit(AliAnalysisGrid::kUseAOD)) {
2011          type = "AOD";
2012          comment += "AOD";
2013       }   
2014       if (type!="AOD" && fFriendChainName!="") {
2015          Error("WriteAnalysisMacro", "Friend chain can be attached only to AOD");
2016          return;
2017       }
2018       if (TObject::TestBit(AliAnalysisGrid::kUseMC)) comment += "/MC";
2019       else comment += " data";
2020       out << "const char *anatype = \"" << type.Data() << "\";" << endl << endl;
2021       func.ReplaceAll(".C", "");
2022       out << "void " << func.Data() << "()" << endl; 
2023       out << "{" << endl;
2024       out << comment.Data() << endl;
2025       out << "// Automatically generated analysis steering macro executed in grid subjobs" << endl << endl;
2026       out << "   TStopwatch timer;" << endl;
2027       out << "   timer.Start();" << endl << endl;
2028       out << "// load base root libraries" << endl;
2029       out << "   gSystem->Load(\"libTree\");" << endl;
2030       out << "   gSystem->Load(\"libGeom\");" << endl;
2031       out << "   gSystem->Load(\"libVMC\");" << endl;
2032       out << "   gSystem->Load(\"libPhysics\");" << endl << endl;
2033       out << "   gSystem->Load(\"libMinuit\");" << endl << endl;
2034       if (fAdditionalRootLibs.Length()) {
2035          // in principle libtree /lib geom libvmc etc. can go into this list, too
2036          out << "// Add aditional libraries" << endl;
2037          TObjArray *list = fAdditionalRootLibs.Tokenize(" ");
2038          TIter next(list);
2039          TObjString *str;
2040          while((str=(TObjString*)next())) {
2041             if (str->GetString().Contains(".so"))
2042             out << "   gSystem->Load(\"" << str->GetString().Data() << "\");" << endl;
2043          }
2044          if (list) delete list;
2045       }
2046       out << "// include path" << endl;
2047       if (fIncludePath.Length()) out << "   gSystem->AddIncludePath(\"" << fIncludePath.Data() << "\");" << endl;
2048       out << "   gSystem->AddIncludePath(\"-I$ALICE_ROOT/include\");" << endl << endl;
2049       out << "// Load analysis framework libraries" << endl;
2050       if (!fPackages) {
2051          out << "   gSystem->Load(\"libSTEERBase\");" << endl;
2052          out << "   gSystem->Load(\"libESD\");" << endl;
2053          out << "   gSystem->Load(\"libAOD\");" << endl;
2054          out << "   gSystem->Load(\"libANALYSIS\");" << endl;
2055          out << "   gSystem->Load(\"libANALYSISalice\");" << endl;
2056          out << "   gSystem->Load(\"libCORRFW\");" << endl << endl;
2057       } else {
2058          TIter next(fPackages);
2059          TObject *obj;
2060          TString pkgname;
2061          TString setupPar = "AliAnalysisAlien::SetupPar";
2062          while ((obj=next())) {
2063             pkgname = obj->GetName();
2064             if (pkgname == "STEERBase" ||
2065                 pkgname == "STEERBase.par") hasSTEERBase = kTRUE;
2066             if (pkgname == "ESD" ||
2067                 pkgname == "ESD.par")       hasESD = kTRUE;
2068             if (pkgname == "AOD" ||
2069                 pkgname == "AOD.par")       hasAOD = kTRUE;
2070             if (pkgname == "ANALYSIS" ||
2071                 pkgname == "ANALYSIS.par")  hasANALYSIS = kTRUE;
2072             if (pkgname == "ANALYSISalice" ||
2073                 pkgname == "ANALYSISalice.par") hasANALYSISalice = kTRUE;
2074             if (pkgname == "CORRFW" ||
2075                 pkgname == "CORRFW.par")    hasCORRFW = kTRUE;
2076          }
2077          if (hasANALYSISalice) setupPar = "SetupPar";   
2078          if (!hasSTEERBase) out << "   gSystem->Load(\"libSTEERBase\");" << endl;
2079          else out << "   if (!" << setupPar << "(\"STEERBase\")) return;" << endl;
2080          if (!hasESD)       out << "   gSystem->Load(\"libESD\");" << endl;
2081          else out << "   if (!" << setupPar << "(\"ESD\")) return;" << endl;
2082          if (!hasAOD)       out << "   gSystem->Load(\"libAOD\");" << endl;
2083          else out << "   if (!" << setupPar << "(\"AOD\")) return;" << endl;
2084          if (!hasANALYSIS)  out << "   gSystem->Load(\"libANALYSIS\");" << endl;
2085          else out << "   if (!" << setupPar << "(\"ANALYSIS\")) return;" << endl;
2086          if (!hasANALYSISalice)   out << "   gSystem->Load(\"libANALYSISalice\");" << endl;
2087          else out << "   if (!" << setupPar << "(\"ANALYSISalice\")) return;" << endl;
2088          if (!hasCORRFW)    out << "   gSystem->Load(\"libCORRFW\");" << endl << endl;
2089          else out << "   if (!" << setupPar << "(\"CORRFW\")) return;" << endl << endl;
2090          out << "// Compile other par packages" << endl;
2091          next.Reset();
2092          while ((obj=next())) {
2093             pkgname = obj->GetName();
2094             if (pkgname == "STEERBase" ||
2095                 pkgname == "STEERBase.par" ||
2096                 pkgname == "ESD" ||
2097                 pkgname == "ESD.par" ||
2098                 pkgname == "AOD" ||
2099                 pkgname == "AOD.par" ||
2100                 pkgname == "ANALYSIS" ||
2101                 pkgname == "ANALYSIS.par" ||
2102                 pkgname == "ANALYSISalice" ||
2103                 pkgname == "ANALYSISalice.par" ||
2104                 pkgname == "CORRFW" ||
2105                 pkgname == "CORRFW.par") continue;
2106             out << "   if (!" << setupPar << "(\"" << obj->GetName() << "\")) return;" << endl;
2107          }   
2108       }   
2109       if (fAdditionalLibs.Length()) {
2110          out << "// Add aditional AliRoot libraries" << endl;
2111          TObjArray *list = fAdditionalLibs.Tokenize(" ");
2112          TIter next(list);
2113          TObjString *str;
2114          while((str=(TObjString*)next())) {
2115             if (str->GetString().Contains(".so"))
2116                out << "   gSystem->Load(\"" << str->GetString().Data() << "\");" << endl;
2117          }
2118          if (list) delete list;
2119       }
2120       out << endl;
2121       out << "// analysis source to be compiled at runtime (if any)" << endl;
2122       if (fAnalysisSource.Length()) {
2123          TObjArray *list = fAnalysisSource.Tokenize(" ");
2124          TIter next(list);
2125          TObjString *str;
2126          while((str=(TObjString*)next())) {
2127             out << "   gROOT->ProcessLine(\".L " << str->GetString().Data() << "+g\");" << endl;
2128          }   
2129          if (list) delete list;
2130       }
2131       out << endl;
2132       if (fFastReadOption) {
2133          Warning("WriteAnalysisMacro", "!!! You requested FastRead option. Using xrootd flags to reduce timeouts in the grid jobs. Note that this may skip some files that could be accessed !!!");
2134          out << "// fast xrootd reading enabled" << endl;
2135          out << "   printf(\"!!! You requested FastRead option. Using xrootd flags to reduce timeouts. Note that this may skip some files that could be accessed !!!\");" << endl;
2136          out << "   gEnv->SetValue(\"XNet.ConnectTimeout\",5);" << endl;
2137          out << "   gEnv->SetValue(\"XNet.RequestTimeout\",5);" << endl;
2138          out << "   gEnv->SetValue(\"XNet.MaxRedirectCount\",2);" << endl;
2139          out << "   gEnv->SetValue(\"XNet.ReconnectTimeout\",5);" << endl;
2140          out << "   gEnv->SetValue(\"XNet.FirstConnectMaxCnt\",1);" << endl << endl;
2141       }   
2142       out << "// connect to AliEn and make the chain" << endl;
2143       out << "   if (!TGrid::Connect(\"alien://\")) return;" << endl;
2144       if (IsUsingTags()) {
2145          out << "   TChain *chain = CreateChainFromTags(\"wn.xml\", anatype);" << endl << endl;
2146       } else {
2147          if(fFriendChainName!="AliAOD.VertexingHF.root") {
2148             out << "   TChain *chain = CreateChain(\"wn.xml\", anatype);" << endl << endl;    
2149          } else {
2150             out << "   // Check if the macro to create the chain was provided" << endl;
2151             out << "   if (gSystem->AccessPathName(\"MakeAODInputChain.C\")) {" << endl;
2152             out << "      ::Error(\"" << func.Data() << "\", \"File MakeAODInputChain.C not provided. Aborting.\");" << endl;
2153             out << "      return;" << endl;
2154             out << "   }" << endl;
2155             out << "   gROOT->LoadMacro(\"MakeAODInputChain.C\");" << endl;
2156             out << "   TChain *chain = MakeAODInputChain(\"wn.xml\",\"none\");" << endl << endl;
2157          }  
2158       }   
2159       out << "// read the analysis manager from file" << endl;
2160       TString analysisFile = fExecutable;
2161       analysisFile.ReplaceAll(".sh", ".root");
2162       out << "   TFile *file = TFile::Open(\"" << analysisFile << "\");" << endl;
2163       out << "   if (!file) return;" << endl; 
2164       out << "   TIter nextkey(file->GetListOfKeys());" << endl;
2165       out << "   AliAnalysisManager *mgr = 0;" << endl;
2166       out << "   TKey *key;" << endl;
2167       out << "   while ((key=(TKey*)nextkey())) {" << endl;
2168       out << "      if (!strcmp(key->GetClassName(), \"AliAnalysisManager\"))" << endl;
2169       out << "         mgr = (AliAnalysisManager*)file->Get(key->GetName());" << endl;
2170       out << "   };" << endl;
2171       out << "   if (!mgr) {" << endl;
2172       out << "      ::Error(\"" << func.Data() << "\", \"No analysis manager found in file" << analysisFile <<"\");" << endl;
2173       out << "      return;" << endl;
2174       out << "   }" << endl << endl;
2175       out << "   mgr->PrintStatus();" << endl;
2176       if (AliAnalysisManager::GetAnalysisManager()) {
2177          if (AliAnalysisManager::GetAnalysisManager()->GetDebugLevel()>3) {
2178             out << "   gEnv->SetValue(\"XNet.Debug\", \"1\");" << endl;
2179          } else {
2180             out << "   AliLog::SetGlobalLogLevel(AliLog::kError);" << endl;
2181          }
2182       }   
2183       out << "   mgr->StartAnalysis(\"localfile\", chain);" << endl;
2184       out << "   timer.Stop();" << endl;
2185       out << "   timer.Print();" << endl;
2186       out << "}" << endl << endl;
2187       if (IsUsingTags()) {
2188          out << "TChain* CreateChainFromTags(const char *xmlfile, const char *type=\"ESD\")" << endl;
2189          out << "{" << endl;
2190          out << "// Create a chain using tags from the xml file." << endl;
2191          out << "   TAlienCollection* coll = TAlienCollection::Open(xmlfile);" << endl;
2192          out << "   if (!coll) {" << endl;
2193          out << "      ::Error(\"CreateChainFromTags\", \"Cannot create an AliEn collection from %s\", xmlfile);" << endl;
2194          out << "      return NULL;" << endl;
2195          out << "   }" << endl;
2196          out << "   TGridResult* tagResult = coll->GetGridResult(\"\",kFALSE,kFALSE);" << endl;
2197          out << "   AliTagAnalysis *tagAna = new AliTagAnalysis(type);" << endl;
2198          out << "   tagAna->ChainGridTags(tagResult);" << endl << endl;
2199          out << "   AliRunTagCuts      *runCuts = new AliRunTagCuts();" << endl;
2200          out << "   AliLHCTagCuts      *lhcCuts = new AliLHCTagCuts();" << endl;
2201          out << "   AliDetectorTagCuts *detCuts = new AliDetectorTagCuts();" << endl;
2202          out << "   AliEventTagCuts    *evCuts  = new AliEventTagCuts();" << endl;
2203          out << "   // Check if the cuts configuration file was provided" << endl;
2204          out << "   if (!gSystem->AccessPathName(\"ConfigureCuts.C\")) {" << endl;
2205          out << "      gROOT->LoadMacro(\"ConfigureCuts.C\");" << endl;
2206          out << "      ConfigureCuts(runCuts, lhcCuts, detCuts, evCuts);" << endl;
2207          out << "   }" << endl;
2208          if (fFriendChainName=="") {
2209             out << "   TChain *chain = tagAna->QueryTags(runCuts, lhcCuts, detCuts, evCuts);" << endl;
2210          } else {
2211             out << "   TString tmpColl=\"tmpCollection.xml\";" << endl;
2212             out << "   tagAna->CreateXMLCollection(tmpColl.Data(),runCuts, lhcCuts, detCuts, evCuts);" << endl;
2213             out << "   TChain *chain = CreateChain(tmpColl.Data(),type);" << endl;
2214          }
2215          out << "   if (!chain || !chain->GetNtrees()) return NULL;" << endl;
2216          out << "   chain->ls();" << endl;
2217          out << "   return chain;" << endl;
2218          out << "}" << endl << endl;
2219          if (gSystem->AccessPathName("ConfigureCuts.C")) {
2220             TString msg = "\n#####   You may want to provide a macro ConfigureCuts.C with a method:\n";
2221             msg += "   void ConfigureCuts(AliRunTagCuts *runCuts,\n";
2222             msg += "                      AliLHCTagCuts *lhcCuts,\n";
2223             msg += "                      AliDetectorTagCuts *detCuts,\n";
2224             msg += "                      AliEventTagCuts *evCuts)";
2225             Info("WriteAnalysisMacro", msg.Data());
2226          }
2227       } 
2228       if (!IsUsingTags() || fFriendChainName!="") {
2229          out <<"//________________________________________________________________________________" << endl;
2230          out << "TChain* CreateChain(const char *xmlfile, const char *type=\"ESD\")" << endl;
2231          out << "{" << endl;
2232          out << "// Create a chain using url's from xml file" << endl;
2233          out << "   TString treename = type;" << endl;
2234          out << "   treename.ToLower();" << endl;
2235          out << "   treename += \"Tree\";" << endl;
2236          out << "   printf(\"***************************************\\n\");" << endl;
2237          out << "   printf(\"    Getting chain of trees %s\\n\", treename.Data());" << endl;
2238          out << "   printf(\"***************************************\\n\");" << endl;
2239          out << "   TAlienCollection *coll = TAlienCollection::Open(xmlfile);" << endl;
2240          out << "   if (!coll) {" << endl;
2241          out << "      ::Error(\"CreateChain\", \"Cannot create an AliEn collection from %s\", xmlfile);" << endl;
2242          out << "      return NULL;" << endl;
2243          out << "   }" << endl;
2244          out << "   TChain *chain = new TChain(treename);" << endl;
2245          if(fFriendChainName!="") {
2246             out << "   TChain *chainFriend = new TChain(treename);" << endl;
2247          }
2248          out << "   coll->Reset();" << endl;
2249          out << "   while (coll->Next()) {" << endl;
2250          out << "      chain->Add(coll->GetTURL(\"\"));" << endl;
2251          if(fFriendChainName!="") {
2252             out << "      TString fileFriend=coll->GetTURL(\"\");" << endl;
2253             out << "      fileFriend.ReplaceAll(\"AliAOD.root\",\""<<fFriendChainName.Data()<<"\");" << endl;
2254             out << "      fileFriend.ReplaceAll(\"AliAODs.root\",\""<<fFriendChainName.Data()<<"\");" << endl;
2255             out << "      chainFriend->Add(fileFriend.Data());" << endl;
2256          }
2257          out << "   }" << endl;
2258          out << "   if (!chain->GetNtrees()) {" << endl;
2259          out << "      ::Error(\"CreateChain\", \"No tree found from collection %s\", xmlfile);" << endl;
2260          out << "      return NULL;" << endl;
2261          out << "   }" << endl;
2262          if(fFriendChainName!="") {
2263             out << "   chain->AddFriend(chainFriend);" << endl;
2264          }
2265          out << "   return chain;" << endl;
2266          out << "}" << endl << endl;
2267       }   
2268       if (hasANALYSISalice) {
2269          out <<"//________________________________________________________________________________" << endl;
2270          out << "Bool_t SetupPar(const char *package) {" << endl;
2271          out << "// Compile the package and set it up." << endl;
2272          out << "   TString pkgdir = package;" << endl;
2273          out << "   pkgdir.ReplaceAll(\".par\",\"\");" << endl;
2274          out << "   gSystem->Exec(Form(\"tar xvzf %s.par\", pkgdir.Data()));" << endl;
2275          out << "   TString cdir = gSystem->WorkingDirectory();" << endl;
2276          out << "   gSystem->ChangeDirectory(pkgdir);" << endl;
2277          out << "   // Check for BUILD.sh and execute" << endl;
2278          out << "   if (!gSystem->AccessPathName(\"PROOF-INF/BUILD.sh\")) {" << endl;
2279          out << "      printf(\"*******************************\\n\");" << endl;
2280          out << "      printf(\"*** Building PAR archive    ***\\n\");" << endl;
2281          out << "      printf(\"*******************************\\n\");" << endl;
2282          out << "      if (gSystem->Exec(\"PROOF-INF/BUILD.sh\")) {" << endl;
2283          out << "         ::Error(\"SetupPar\", \"Cannot build par archive %s\", pkgdir.Data());" << endl;
2284          out << "         gSystem->ChangeDirectory(cdir);" << endl;
2285          out << "         return kFALSE;" << endl;
2286          out << "      }" << endl;
2287          out << "   } else {" << endl;
2288          out << "      ::Error(\"SetupPar\",\"Cannot access PROOF-INF/BUILD.sh for package %s\", pkgdir.Data());" << endl;
2289          out << "      gSystem->ChangeDirectory(cdir);" << endl;
2290          out << "      return kFALSE;" << endl;
2291          out << "   }" << endl;
2292          out << "   // Check for SETUP.C and execute" << endl;
2293          out << "   if (!gSystem->AccessPathName(\"PROOF-INF/SETUP.C\")) {" << endl;
2294          out << "      printf(\"*******************************\\n\");" << endl;
2295          out << "      printf(\"***    Setup PAR archive    ***\\n\");" << endl;
2296          out << "      printf(\"*******************************\\n\");" << endl;
2297          out << "      gROOT->Macro(\"PROOF-INF/SETUP.C\");" << endl;
2298          out << "   } else {" << endl;
2299          out << "      ::Error(\"SetupPar\",\"Cannot access PROOF-INF/SETUP.C for package %s\", pkgdir.Data());" << endl;
2300          out << "      gSystem->ChangeDirectory(cdir);" << endl;
2301          out << "      return kFALSE;" << endl;
2302          out << "   }" << endl;
2303          out << "   // Restore original workdir" << endl;
2304          out << "   gSystem->ChangeDirectory(cdir);" << endl;
2305          out << "   return kTRUE;" << endl;
2306          out << "}" << endl;
2307       }
2308       Info("WriteAnalysisMacro", "\n#####   Analysis macro to run on worker nodes <%s> written",fAnalysisMacro.Data());
2309    }   
2310    Bool_t copy = kTRUE;
2311    if (TestBit(AliAnalysisGrid::kOffline) || TestBit(AliAnalysisGrid::kTest)) copy = kFALSE;
2312    if (copy) {
2313       CdWork();
2314       TString workdir = gGrid->GetHomeDirectory();
2315       workdir += fGridWorkingDir;
2316       if (FileExists(fAnalysisMacro)) gGrid->Rm(fAnalysisMacro);
2317       if (IsUsingTags() && !gSystem->AccessPathName("ConfigureCuts.C")) {
2318          if (FileExists("ConfigureCuts.C")) gGrid->Rm("ConfigureCuts.C");
2319          Info("WriteAnalysisMacro", "\n#####   Copying cuts configuration macro: <ConfigureCuts.C> to your alien workspace");
2320          TFile::Cp("file:ConfigureCuts.C", Form("alien://%s/ConfigureCuts.C", workdir.Data()));
2321       }   
2322       Info("WriteAnalysisMacro", "\n#####   Copying analysis macro: <%s> to your alien workspace", fAnalysisMacro.Data());
2323       TFile::Cp(Form("file:%s",fAnalysisMacro.Data()), Form("alien://%s/%s", workdir.Data(), fAnalysisMacro.Data()));
2324    }
2325 }
2326
2327 //______________________________________________________________________________
2328 void AliAnalysisAlien::WriteMergingMacro()
2329 {
2330 // Write a macro to merge the outputs per master job.
2331    if (!fMergeViaJDL) return;
2332    if (!fOutputFiles.Length()) {
2333       Error("WriteMergingMacro", "No output file names defined. Are you running the right AliAnalysisAlien configuration ?");
2334       return;
2335    }   
2336    TString mergingMacro = fExecutable;
2337    mergingMacro.ReplaceAll(".sh","_merge.C");
2338    if (!fGridOutputDir.Contains("/")) fGridOutputDir = Form("/%s/%s/%s", gGrid->GetHomeDirectory(), fGridWorkingDir.Data(), fGridOutputDir.Data());
2339    if (!TestBit(AliAnalysisGrid::kSubmit)) {  
2340       ofstream out;
2341       out.open(mergingMacro.Data(), ios::out);
2342       if (!out.good()) {
2343          Error("WriteMergingMacro", "could not open file %s for writing", fAnalysisMacro.Data());
2344          return;
2345       }
2346       Bool_t hasSTEERBase = kFALSE;
2347       Bool_t hasESD = kFALSE;
2348       Bool_t hasAOD = kFALSE;
2349       Bool_t hasANALYSIS = kFALSE;
2350       Bool_t hasANALYSISalice = kFALSE;
2351       Bool_t hasCORRFW = kFALSE;
2352       TString func = mergingMacro;
2353       TString comment;
2354       func.ReplaceAll(".C", "");
2355       out << "void " << func.Data() << "(const char *dir)" << endl;
2356       out << "{" << endl;
2357       out << "// Automatically generated merging macro executed in grid subjobs" << endl << endl;
2358       out << "   TStopwatch timer;" << endl;
2359       out << "   timer.Start();" << endl << endl;
2360       out << "// load base root libraries" << endl;
2361       out << "   gSystem->Load(\"libTree\");" << endl;
2362       out << "   gSystem->Load(\"libGeom\");" << endl;
2363       out << "   gSystem->Load(\"libVMC\");" << endl;
2364       out << "   gSystem->Load(\"libPhysics\");" << endl << endl;
2365       out << "   gSystem->Load(\"libMinuit\");" << endl << endl;
2366       if (fAdditionalRootLibs.Length()) {
2367          // in principle libtree /lib geom libvmc etc. can go into this list, too
2368          out << "// Add aditional libraries" << endl;
2369          TObjArray *list = fAdditionalRootLibs.Tokenize(" ");
2370          TIter next(list);
2371          TObjString *str;
2372          while((str=(TObjString*)next())) {
2373             if (str->GetString().Contains(".so"))
2374             out << "   gSystem->Load(\"" << str->GetString().Data() << "\");" << endl;
2375          }
2376          if (list) delete list;
2377       }
2378       out << "// include path" << endl;
2379       if (fIncludePath.Length()) out << "   gSystem->AddIncludePath(\"" << fIncludePath.Data() << "\");" << endl;
2380       out << "   gSystem->AddIncludePath(\"-I$ALICE_ROOT/include\");" << endl << endl;
2381       out << "// Load analysis framework libraries" << endl;
2382       if (!fPackages) {
2383          out << "   gSystem->Load(\"libSTEERBase\");" << endl;
2384          out << "   gSystem->Load(\"libESD\");" << endl;
2385          out << "   gSystem->Load(\"libAOD\");" << endl;
2386          out << "   gSystem->Load(\"libANALYSIS\");" << endl;
2387          out << "   gSystem->Load(\"libANALYSISalice\");" << endl;
2388          out << "   gSystem->Load(\"libCORRFW\");" << endl << endl;
2389       } else {
2390          TIter next(fPackages);
2391          TObject *obj;
2392          TString pkgname;
2393          TString setupPar = "AliAnalysisAlien::SetupPar";
2394          while ((obj=next())) {
2395             pkgname = obj->GetName();
2396             if (pkgname == "STEERBase" ||
2397                 pkgname == "STEERBase.par") hasSTEERBase = kTRUE;
2398             if (pkgname == "ESD" ||
2399                 pkgname == "ESD.par")       hasESD = kTRUE;
2400             if (pkgname == "AOD" ||
2401                 pkgname == "AOD.par")       hasAOD = kTRUE;
2402             if (pkgname == "ANALYSIS" ||
2403                 pkgname == "ANALYSIS.par")  hasANALYSIS = kTRUE;
2404             if (pkgname == "ANALYSISalice" ||
2405                 pkgname == "ANALYSISalice.par") hasANALYSISalice = kTRUE;
2406             if (pkgname == "CORRFW" ||
2407                 pkgname == "CORRFW.par")    hasCORRFW = kTRUE;
2408          }   
2409          if (hasANALYSISalice) setupPar = "SetupPar";   
2410          if (!hasSTEERBase) out << "   gSystem->Load(\"libSTEERBase\");" << endl;
2411          else out << "   if (!" << setupPar << "(\"STEERBase\")) return;" << endl;
2412          if (!hasESD)       out << "   gSystem->Load(\"libESD\");" << endl;
2413          else out << "   if (!" << setupPar << "(\"ESD\")) return;" << endl;
2414          if (!hasAOD)       out << "   gSystem->Load(\"libAOD\");" << endl;
2415          else out << "   if (!" << setupPar << "(\"AOD\")) return;" << endl;
2416          if (!hasANALYSIS)  out << "   gSystem->Load(\"libANALYSIS\");" << endl;
2417          else out << "   if (!" << setupPar << "(\"ANALYSIS\")) return;" << endl;
2418          if (!hasANALYSISalice)   out << "   gSystem->Load(\"libANALYSISalice\");" << endl;
2419          else out << "   if (!" << setupPar << "(\"ANALYSISalice\")) return;" << endl;
2420          if (!hasCORRFW)    out << "   gSystem->Load(\"libCORRFW\");" << endl << endl;
2421          else out << "   if (!" << setupPar << "(\"CORRFW\")) return;" << endl << endl;
2422          out << "// Compile other par packages" << endl;
2423          next.Reset();
2424          while ((obj=next())) {
2425             pkgname = obj->GetName();
2426             if (pkgname == "STEERBase" ||
2427                 pkgname == "STEERBase.par" ||
2428                 pkgname == "ESD" ||
2429                 pkgname == "ESD.par" ||
2430                 pkgname == "AOD" ||
2431                 pkgname == "AOD.par" ||
2432                 pkgname == "ANALYSIS" ||
2433                 pkgname == "ANALYSIS.par" ||
2434                 pkgname == "ANALYSISalice" ||
2435                 pkgname == "ANALYSISalice.par" ||
2436                 pkgname == "CORRFW" ||
2437                 pkgname == "CORRFW.par") continue;
2438             out << "   if (!" << setupPar << "(\"" << obj->GetName() << "\")) return;" << endl;
2439          }   
2440       }   
2441       if (fAdditionalLibs.Length()) {
2442          out << "// Add aditional AliRoot libraries" << endl;
2443          TObjArray *list = fAdditionalLibs.Tokenize(" ");
2444          TIter next(list);
2445          TObjString *str;
2446          while((str=(TObjString*)next())) {
2447             if (str->GetString().Contains(".so"))
2448                out << "   gSystem->Load(\"" << str->GetString().Data() << "\");" << endl;
2449          }
2450          if (list) delete list;
2451       }
2452       out << endl;
2453       out << "// Analysis source to be compiled at runtime (if any)" << endl;
2454       if (fAnalysisSource.Length()) {
2455          TObjArray *list = fAnalysisSource.Tokenize(" ");
2456          TIter next(list);
2457          TObjString *str;
2458          while((str=(TObjString*)next())) {
2459             out << "   gROOT->ProcessLine(\".L " << str->GetString().Data() << "+g\");" << endl;
2460          }   
2461          if (list) delete list;
2462       }
2463       out << endl;
2464       if (fFastReadOption) {
2465          Warning("WriteMergingMacro", "!!! You requested FastRead option. Using xrootd flags to reduce timeouts in the grid merging jobs. Note that this may skip some files that could be accessed !!!");
2466          out << "// fast xrootd reading enabled" << endl;
2467          out << "   printf(\"!!! You requested FastRead option. Using xrootd flags to reduce timeouts. Note that this may skip some files that could be accessed !!!\");" << endl;
2468          out << "   gEnv->SetValue(\"XNet.ConnectTimeout\",5);" << endl;
2469          out << "   gEnv->SetValue(\"XNet.RequestTimeout\",5);" << endl;
2470          out << "   gEnv->SetValue(\"XNet.MaxRedirectCount\",2);" << endl;
2471          out << "   gEnv->SetValue(\"XNet.ReconnectTimeout\",5);" << endl;
2472          out << "   gEnv->SetValue(\"XNet.FirstConnectMaxCnt\",1);" << endl << endl;
2473       }   
2474       out << "// Connect to AliEn" << endl;
2475       out << "   if (!TGrid::Connect(\"alien://\")) return;" << endl;
2476       out << "   TString outputDir = \"" << fGridOutputDir << "/\";" << endl;  
2477       out << "   outputDir += dir;" << endl;    
2478       out << "   TString outputFiles = \"" << fOutputFiles << "\";" << endl;
2479       out << "   TString mergeExcludes = \"" << fMergeExcludes << "\";" << endl;
2480       out << "   TObjArray *list = outputFiles.Tokenize(\" \");" << endl;
2481       out << "   TIter *iter = new TIter(list);" << endl;
2482       out << "   TObjString *str;" << endl;
2483       out << "   TString output_file;" << endl;
2484       out << "   Bool_t merged = kTRUE;" << endl;
2485       out << "   while((str=(TObjString*)iter->Next())) {" << endl;
2486       out << "      output_file = str->GetString();" << endl;
2487       out << "      Int_t index = output_file.Index(\"@\");" << endl;
2488       out << "      if (index > 0) output_file.Remove(index);" << endl;
2489       out << "      // Skip already merged outputs" << endl;
2490       out << "      if (!gSystem->AccessPathName(output_file)) {" << endl;
2491       out << "         printf(\"Output file <%s> found. Not merging again.\",output_file.Data());" << endl;
2492       out << "         continue;" << endl;
2493       out << "      }" << endl;
2494       out << "      if (mergeExcludes.Contains(output_file.Data())) continue;" << endl;
2495       out << "      merged = AliAnalysisAlien::MergeOutput(output_file, outputDir, " << fMaxMergeFiles << ");" << endl;
2496       out << "      if (!merged) {" << endl;
2497       out << "         printf(\"ERROR: Cannot merge %s\\n\", output_file.Data());" << endl;
2498       out << "         return;" << endl;
2499       out << "      }" << endl;
2500       out << "   }" << endl;
2501       out << "// read the analysis manager from file" << endl;
2502       TString analysisFile = fExecutable;
2503       analysisFile.ReplaceAll(".sh", ".root");
2504       out << "   TFile *file = TFile::Open(\"" << analysisFile << "\");" << endl;
2505       out << "   if (!file) return;" << endl; 
2506       out << "   TIter nextkey(file->GetListOfKeys());" << endl;
2507       out << "   AliAnalysisManager *mgr = 0;" << endl;
2508       out << "   TKey *key;" << endl;
2509       out << "   while ((key=(TKey*)nextkey())) {" << endl;
2510       out << "      if (!strcmp(key->GetClassName(), \"AliAnalysisManager\"))" << endl;
2511       out << "         mgr = (AliAnalysisManager*)file->Get(key->GetName());" << endl;
2512       out << "   };" << endl;
2513       out << "   if (!mgr) {" << endl;
2514       out << "      ::Error(\"" << func.Data() << "\", \"No analysis manager found in file" << analysisFile <<"\");" << endl;
2515       out << "      return;" << endl;
2516       out << "   }" << endl << endl;
2517       out << "   mgr->SetSkipTerminate(kFALSE);" << endl;
2518       out << "   mgr->PrintStatus();" << endl;
2519       if (AliAnalysisManager::GetAnalysisManager()) {
2520          if (AliAnalysisManager::GetAnalysisManager()->GetDebugLevel()>3) {
2521             out << "   gEnv->SetValue(\"XNet.Debug\", \"1\");" << endl;
2522          } else {
2523             out << "   AliLog::SetGlobalLogLevel(AliLog::kError);" << endl;
2524          }
2525       }   
2526       out << "   mgr->StartAnalysis(\"gridterminate\");" << endl;
2527       out << "}" << endl << endl;
2528       if (hasANALYSISalice) {
2529          out <<"//________________________________________________________________________________" << endl;
2530          out << "Bool_t SetupPar(const char *package) {" << endl;
2531          out << "// Compile the package and set it up." << endl;
2532          out << "   TString pkgdir = package;" << endl;
2533          out << "   pkgdir.ReplaceAll(\".par\",\"\");" << endl;
2534          out << "   gSystem->Exec(Form(\"tar xvzf %s.par\", pkgdir.Data()));" << endl;
2535          out << "   TString cdir = gSystem->WorkingDirectory();" << endl;
2536          out << "   gSystem->ChangeDirectory(pkgdir);" << endl;
2537          out << "   // Check for BUILD.sh and execute" << endl;
2538          out << "   if (!gSystem->AccessPathName(\"PROOF-INF/BUILD.sh\")) {" << endl;
2539          out << "      printf(\"*******************************\\n\");" << endl;
2540          out << "      printf(\"*** Building PAR archive    ***\\n\");" << endl;
2541          out << "      printf(\"*******************************\\n\");" << endl;
2542          out << "      if (gSystem->Exec(\"PROOF-INF/BUILD.sh\")) {" << endl;
2543          out << "         ::Error(\"SetupPar\", \"Cannot build par archive %s\", pkgdir.Data());" << endl;
2544          out << "         gSystem->ChangeDirectory(cdir);" << endl;
2545          out << "         return kFALSE;" << endl;
2546          out << "      }" << endl;
2547          out << "   } else {" << endl;
2548          out << "      ::Error(\"SetupPar\",\"Cannot access PROOF-INF/BUILD.sh for package %s\", pkgdir.Data());" << endl;
2549          out << "      gSystem->ChangeDirectory(cdir);" << endl;
2550          out << "      return kFALSE;" << endl;
2551          out << "   }" << endl;
2552          out << "   // Check for SETUP.C and execute" << endl;
2553          out << "   if (!gSystem->AccessPathName(\"PROOF-INF/SETUP.C\")) {" << endl;
2554          out << "      printf(\"*******************************\\n\");" << endl;
2555          out << "      printf(\"***    Setup PAR archive    ***\\n\");" << endl;
2556          out << "      printf(\"*******************************\\n\");" << endl;
2557          out << "      gROOT->Macro(\"PROOF-INF/SETUP.C\");" << endl;
2558          out << "   } else {" << endl;
2559          out << "      ::Error(\"SetupPar\",\"Cannot access PROOF-INF/SETUP.C for package %s\", pkgdir.Data());" << endl;
2560          out << "      gSystem->ChangeDirectory(cdir);" << endl;
2561          out << "      return kFALSE;" << endl;
2562          out << "   }" << endl;
2563          out << "   // Restore original workdir" << endl;
2564          out << "   gSystem->ChangeDirectory(cdir);" << endl;
2565          out << "   return kTRUE;" << endl;
2566          out << "}" << endl;
2567       }
2568    }   
2569    Bool_t copy = kTRUE;
2570    if (TestBit(AliAnalysisGrid::kOffline) || TestBit(AliAnalysisGrid::kTest)) copy = kFALSE;
2571    if (copy) {
2572       CdWork();
2573       TString workdir = gGrid->GetHomeDirectory();
2574       workdir += fGridWorkingDir;
2575       if (FileExists(mergingMacro)) gGrid->Rm(mergingMacro);
2576       Info("WriteMergingMacro", "\n#####   Copying merging macro: <%s> to your alien workspace", mergingMacro.Data());
2577       TFile::Cp(Form("file:%s",mergingMacro.Data()), Form("alien://%s/%s", workdir.Data(), mergingMacro.Data()));
2578    }
2579 }
2580
2581 //______________________________________________________________________________
2582 Bool_t AliAnalysisAlien::SetupPar(const char *package)
2583 {
2584 // Compile the par file archive pointed by <package>. This must be present in the current durectory.
2585 // Note that for loading the compiled library. The current directory should have precedence in
2586 // LD_LIBRARY_PATH
2587    TString pkgdir = package;
2588    pkgdir.ReplaceAll(".par","");
2589    gSystem->Exec(Form("tar xvzf %s.par", pkgdir.Data()));
2590    TString cdir = gSystem->WorkingDirectory();
2591    gSystem->ChangeDirectory(pkgdir);
2592    // Check for BUILD.sh and execute
2593    if (!gSystem->AccessPathName("PROOF-INF/BUILD.sh")) {
2594       printf("**************************************************\n");
2595       printf("*** Building PAR archive %s\n", package);
2596       printf("**************************************************\n");
2597       if (gSystem->Exec("PROOF-INF/BUILD.sh")) {
2598          ::Error("SetupPar", "Cannot build par archive %s", pkgdir.Data());
2599          gSystem->ChangeDirectory(cdir);
2600          return kFALSE;
2601       }
2602    } else {
2603       ::Error("SetupPar","Cannot access PROOF-INF/BUILD.sh for package %s", pkgdir.Data());
2604       gSystem->ChangeDirectory(cdir);
2605       return kFALSE;
2606    }
2607    // Check for SETUP.C and execute
2608    if (!gSystem->AccessPathName("PROOF-INF/SETUP.C")) {
2609       printf("**************************************************\n");
2610       printf("*** Setup PAR archive %s\n", package);
2611       printf("**************************************************\n");
2612       gROOT->Macro("PROOF-INF/SETUP.C");
2613       printf("*** Loaded library: %s\n", gSystem->GetLibraries(pkgdir,"",kFALSE));
2614    } else {
2615       ::Error("SetupPar","Cannot access PROOF-INF/SETUP.C for package %s", pkgdir.Data());
2616       gSystem->ChangeDirectory(cdir);
2617       return kFALSE;
2618    }   
2619    // Restore original workdir
2620    gSystem->ChangeDirectory(cdir);
2621    return kTRUE;
2622 }
2623
2624 //______________________________________________________________________________
2625 void AliAnalysisAlien::WriteExecutable()
2626 {
2627 // Generate the alien executable script.
2628    if (!TestBit(AliAnalysisGrid::kSubmit)) {  
2629       ofstream out;
2630       out.open(fExecutable.Data(), ios::out);
2631       if (out.bad()) {
2632          Error("WriteExecutable", "Bad file name for executable: %s", fExecutable.Data());
2633          return;
2634       }
2635       out << "#!/bin/bash" << endl;
2636       out << "echo \"=========================================\"" << endl; 
2637       out << "echo \"############## PATH : ##############\"" << endl;
2638       out << "echo $PATH" << endl;
2639       out << "echo \"############## LD_LIBRARY_PATH : ##############\"" << endl;
2640       out << "echo $LD_LIBRARY_PATH" << endl;
2641       out << "echo \"############## ROOTSYS : ##############\"" << endl;
2642       out << "echo $ROOTSYS" << endl;
2643       out << "echo \"############## which root : ##############\"" << endl;
2644       out << "which root" << endl;
2645       out << "echo \"############## ALICE_ROOT : ##############\"" << endl;
2646       out << "echo $ALICE_ROOT" << endl;
2647       out << "echo \"############## which aliroot : ##############\"" << endl;
2648       out << "which aliroot" << endl;
2649       out << "echo \"############## system limits : ##############\"" << endl;
2650       out << "ulimit -a" << endl;
2651       out << "echo \"############## memory : ##############\"" << endl;
2652       out << "free -m" << endl;
2653       out << "echo \"=========================================\"" << endl << endl;
2654       // Make sure we can properly compile par files
2655       if (TObject::TestBit(AliAnalysisGrid::kUsePars)) out << "export LD_LIBRARY_PATH=.:$LD_LIBRARY_PATH" << endl;
2656       out << fExecutableCommand << " "; 
2657       out << fAnalysisMacro.Data() << " " << fExecutableArgs.Data() << endl << endl;
2658       out << "echo \"======== " << fAnalysisMacro.Data() << " finished with exit code: $? ========\"" << endl;
2659       out << "echo \"############## memory after: ##############\"" << endl;
2660       out << "free -m" << endl;
2661       out << "echo \"############## Last 10 lines from dmesg : ##############\"" << endl;
2662       out << "dmesg | tail -n 10" << endl;
2663    }   
2664    Bool_t copy = kTRUE;
2665    if (TestBit(AliAnalysisGrid::kOffline) || TestBit(AliAnalysisGrid::kTest)) copy = kFALSE;
2666    if (copy) {
2667       CdWork();
2668       TString workdir = gGrid->GetHomeDirectory();
2669       TString bindir = Form("%s/bin", workdir.Data());
2670       if (!DirectoryExists(bindir)) gGrid->Mkdir(bindir);
2671       workdir += fGridWorkingDir;
2672       TString executable = Form("%s/bin/%s", gGrid->GetHomeDirectory(), fExecutable.Data());
2673       if (FileExists(executable)) gGrid->Rm(executable);
2674       Info("CreateJDL", "\n#####   Copying executable file <%s> to your AliEn bin directory", fExecutable.Data());
2675       TFile::Cp(Form("file:%s",fExecutable.Data()), Form("alien://%s", executable.Data()));
2676    } 
2677 }
2678
2679 //______________________________________________________________________________
2680 void AliAnalysisAlien::WriteMergeExecutable()
2681 {
2682 // Generate the alien executable script for the merging job.
2683    if (!fMergeViaJDL) return;
2684    TString mergeExec = fExecutable;
2685    mergeExec.ReplaceAll(".sh", "_merge.sh");
2686    if (!TestBit(AliAnalysisGrid::kSubmit)) {
2687       ofstream out;
2688       out.open(mergeExec.Data(), ios::out);
2689       if (out.bad()) {
2690          Error("WriteMergingExecutable", "Bad file name for executable: %s", mergeExec.Data());
2691          return;
2692       }
2693       out << "#!/bin/bash" << endl;
2694       out << "echo \"=========================================\"" << endl; 
2695       out << "echo \"############## PATH : ##############\"" << endl;
2696       out << "echo $PATH" << endl;
2697       out << "echo \"############## LD_LIBRARY_PATH : ##############\"" << endl;
2698       out << "echo $LD_LIBRARY_PATH" << endl;
2699       out << "echo \"############## ROOTSYS : ##############\"" << endl;
2700       out << "echo $ROOTSYS" << endl;
2701       out << "echo \"############## which root : ##############\"" << endl;
2702       out << "which root" << endl;
2703       out << "echo \"############## ALICE_ROOT : ##############\"" << endl;
2704       out << "echo $ALICE_ROOT" << endl;
2705       out << "echo \"############## which aliroot : ##############\"" << endl;
2706       out << "which aliroot" << endl;
2707       out << "echo \"############## system limits : ##############\"" << endl;
2708       out << "ulimit -a" << endl;
2709       out << "echo \"############## memory : ##############\"" << endl;
2710       out << "free -m" << endl;
2711       out << "echo \"=========================================\"" << endl << endl;
2712       // Make sure we can properly compile par files
2713       if (TObject::TestBit(AliAnalysisGrid::kUsePars)) out << "export LD_LIBRARY_PATH=.:$LD_LIBRARY_PATH" << endl;
2714       TString mergeMacro = fExecutable;
2715       mergeMacro.ReplaceAll(".sh", "_merge.C");
2716       out << "export ARG=\"" << mergeMacro << "(\\\"$1\\\")\"" << endl;
2717       out << fExecutableCommand << " " << "$ARG" << endl; 
2718       out << "echo \"======== " << mergeMacro.Data() << " finished with exit code: $? ========\"" << endl;
2719       out << "echo \"############## memory after: ##############\"" << endl;
2720       out << "free -m" << endl;
2721       out << "echo \"############## Last 10 lines from dmesg : ##############\"" << endl;
2722       out << "dmesg | tail -n 10" << endl;
2723    }   
2724    Bool_t copy = kTRUE;
2725    if (TestBit(AliAnalysisGrid::kOffline) || TestBit(AliAnalysisGrid::kTest)) copy = kFALSE;
2726    if (copy) {
2727       CdWork();
2728       TString workdir = gGrid->GetHomeDirectory();
2729       TString bindir = Form("%s/bin", workdir.Data());
2730       if (!DirectoryExists(bindir)) gGrid->Mkdir(bindir);
2731       workdir += fGridWorkingDir;
2732       TString executable = Form("%s/bin/%s", gGrid->GetHomeDirectory(), mergeExec.Data());
2733       if (FileExists(executable)) gGrid->Rm(executable);
2734       Info("CreateJDL", "\n#####   Copying executable file <%s> to your AliEn bin directory", mergeExec.Data());
2735       TFile::Cp(Form("file:%s",mergeExec.Data()), Form("alien://%s", executable.Data()));
2736    } 
2737 }
2738
2739 //______________________________________________________________________________
2740 void AliAnalysisAlien::WriteProductionFile(const char *filename) const
2741 {
2742 // Write the production file to be submitted by LPM manager. The format is:
2743 // First line: full_path_to_jdl estimated_no_subjobs_per_master
2744 // Next lines: full_path_to_dataset XXX (XXX is a string)
2745 // To submit, one has to: submit jdl XXX for all lines
2746    ofstream out;
2747    out.open(filename, ios::out);
2748    if (out.bad()) {
2749       Error("WriteProductionFile", "Bad file name: %s", filename);
2750       return;
2751    }
2752    TString workdir = gGrid->GetHomeDirectory();
2753    workdir += fGridWorkingDir;
2754    Int_t njobspermaster = 1000*fNrunsPerMaster/fSplitMaxInputFileNumber;
2755    TString locjdl = Form("%s/%s", workdir.Data(),fJDLName.Data());
2756    out << locjdl << " " << njobspermaster << endl;
2757    Int_t nmasterjobs = fInputFiles->GetEntries();
2758    for (Int_t i=0; i<nmasterjobs; i++) {
2759       TString runOutDir = gSystem->BaseName(fInputFiles->At(i)->GetName());
2760       runOutDir.ReplaceAll(".xml", "");
2761       if (fOutputToRunNo)
2762          out << Form("%s", fInputFiles->At(i)->GetName()) << " " << runOutDir << endl;
2763       else
2764          out << Form("%s", fInputFiles->At(i)->GetName()) << " " << Form("%03d", i) << endl;
2765    }
2766    Info("WriteProductionFile", "\n#####   Copying production file <%s> to your work directory", filename);
2767    if (FileExists(filename)) gGrid->Rm(filename);
2768    TFile::Cp(Form("file:%s",filename), Form("alien://%s/%s", workdir.Data(),filename));   
2769 }
2770
2771 //______________________________________________________________________________
2772 void AliAnalysisAlien::WriteValidationScript(Bool_t merge)
2773 {
2774 // Generate the alien validation script.
2775    // Generate the validation script
2776    TObjString *os;
2777    TString validationScript = fExecutable;
2778    if (merge) validationScript.ReplaceAll(".sh", "_mergevalidation.sh");
2779    else       validationScript.ReplaceAll(".sh", "_validation.sh");
2780    if (!Connect()) {
2781       Error("WriteValidationScript", "Alien connection required");
2782       return;
2783    }
2784    TString out_stream = "";
2785    if (!TestBit(AliAnalysisGrid::kTest)) out_stream = " >> stdout";
2786    if (!TestBit(AliAnalysisGrid::kSubmit)) {  
2787       ofstream out;
2788       out.open(validationScript, ios::out);
2789       out << "#!/bin/bash" << endl;
2790       out << "##################################################" << endl;
2791       out << "validateout=`dirname $0`" << endl;
2792       out << "validatetime=`date`" << endl;
2793       out << "validated=\"0\";" << endl;
2794       out << "error=0" << endl;
2795       out << "if [ -z $validateout ]" << endl;
2796       out << "then" << endl;
2797       out << "    validateout=\".\"" << endl;
2798       out << "fi" << endl << endl;
2799       out << "cd $validateout;" << endl;
2800       out << "validateworkdir=`pwd`;" << endl << endl;
2801       out << "echo \"*******************************************************\"" << out_stream << endl;
2802       out << "echo \"* Automatically generated validation script           *\""  << out_stream << endl;
2803       out << "" << endl;
2804       out << "echo \"* Time:    $validatetime \""  << out_stream << endl;
2805       out << "echo \"* Dir:     $validateout\""  << out_stream << endl;
2806       out << "echo \"* Workdir: $validateworkdir\""  << out_stream << endl;
2807       out << "echo \"* ----------------------------------------------------*\""  << out_stream << endl;
2808       out << "ls -la ./"  << out_stream << endl;
2809       out << "echo \"* ----------------------------------------------------*\""  << out_stream << endl << endl;
2810       out << "##################################################" << endl;
2811
2812       out << "" << endl;
2813       out << "parArch=`grep -Ei \"Cannot Build the PAR Archive\" stderr`" << endl;
2814       out << "segViol=`grep -Ei \"Segmentation violation\" stderr`" << endl;
2815       out << "segFault=`grep -Ei \"Segmentation fault\" stderr`" << endl;
2816       out << "" << endl;
2817
2818       out << "if [ ! -f stderr ] ; then" << endl;
2819       out << "   error=1" << endl;
2820       out << "   echo \"* ########## Job not validated - no stderr  ###\" " << out_stream << endl;
2821       out << "   echo \"Error = $error\" " << out_stream << endl;
2822       out << "fi" << endl;
2823
2824       out << "if [ \"$parArch\" != \"\" ] ; then" << endl;
2825       out << "   error=1" << endl;
2826       out << "   echo \"* ########## Job not validated - PAR archive not built  ###\" " << out_stream << endl;
2827       out << "   echo \"$parArch\" " << out_stream << endl;
2828       out << "   echo \"Error = $error\" " << out_stream << endl;
2829       out << "fi" << endl;
2830
2831       out << "if [ \"$segViol\" != \"\" ] ; then" << endl;
2832       out << "   error=1" << endl;
2833       out << "   echo \"* ########## Job not validated - Segment. violation  ###\" " << out_stream << endl;
2834       out << "   echo \"$segViol\" " << out_stream << endl;
2835       out << "   echo \"Error = $error\" " << out_stream << endl;
2836       out << "fi" << endl;
2837
2838       out << "if [ \"$segFault\" != \"\" ] ; then" << endl;
2839       out << "   error=1" << endl;
2840       out << "   echo \"* ########## Job not validated - Segment. fault  ###\" " << out_stream << endl;
2841       out << "   echo \"$segFault\" " << out_stream << endl;
2842       out << "   echo \"Error = $error\" " << out_stream << endl;
2843       out << "fi" << endl;
2844
2845       // Part dedicated to the specific analyses running into the train
2846
2847       TObjArray *arr = fOutputFiles.Tokenize(" ");
2848       TIter next1(arr);
2849       TString output_file;
2850       while ((os=(TObjString*)next1())) { 
2851          output_file = os->GetString();
2852          Int_t index = output_file.Index("@");
2853          if (index > 0) output_file.Remove(index);
2854          if (merge && fMergeExcludes.Contains(output_file)) continue;
2855          out << "if ! [ -f " << output_file.Data() << " ] ; then" << endl;
2856          out << "   error=1" << endl;
2857          out << "   echo \"Output file(s) not found. Job FAILED !\""  << out_stream << endl;
2858          out << "   echo \"Output file(s) not found. Job FAILED !\" >> stderr" << endl;
2859          out << "fi" << endl;
2860       }   
2861       delete arr;
2862       if (!merge) {
2863         out << "if ! [ -f outputs_valid ] ; then" << endl;
2864         out << "   error=1" << endl;
2865         out << "   echo \"Output files were not validated by the analysis manager\" >> stdout" << endl;
2866         out << "   echo \"Output files were not validated by the analysis manager\" >> stderr" << endl;
2867         out << "fi" << endl;
2868       }  
2869       
2870       out << "if [ $error = 0 ] ; then" << endl;
2871       out << "   echo \"* ----------------   Job Validated  ------------------*\""  << out_stream << endl;
2872       out << "fi" << endl;
2873
2874       out << "echo \"* ----------------------------------------------------*\""  << out_stream << endl;
2875       out << "echo \"*******************************************************\""  << out_stream << endl;
2876       out << "cd -" << endl;
2877       out << "exit $error" << endl;
2878    }    
2879    Bool_t copy = kTRUE;
2880    if (TestBit(AliAnalysisGrid::kOffline) || TestBit(AliAnalysisGrid::kTest)) copy = kFALSE;
2881    if (copy) {
2882       CdWork();
2883       TString workdir = gGrid->GetHomeDirectory();
2884       workdir += fGridWorkingDir;
2885       Info("CreateJDL", "\n#####   Copying validation script <%s> to your AliEn working space", validationScript.Data());
2886       if (FileExists(validationScript)) gGrid->Rm(validationScript);
2887       TFile::Cp(Form("file:%s",validationScript.Data()), Form("alien://%s/%s", workdir.Data(),validationScript.Data()));
2888    } 
2889 }