Added AddTrackParams() method for convenience + some comments
[u/mrichter/AliRoot.git] / ANALYSIS / AliAnalysisManager.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16 /* $Id$ */
17 // Author: Andrei Gheata, 31/05/2006
18
19 //==============================================================================
20 //   AliAnalysysManager - Manager analysis class. Allows creation of several
21 // analysis tasks and data containers storing their input/output. Allows
22 // connecting/chaining tasks via shared data containers. Serializes the current
23 // event for all tasks depending only on initial input data.
24 //==============================================================================
25 //
26 //==============================================================================
27
28 #include <Riostream.h>
29
30 #include <TClass.h>
31 #include <TFile.h>
32 #include <TKey.h>
33 #include <TMethodCall.h>
34 #include <TChain.h>
35 #include <TSystem.h>
36 #include <TROOT.h>
37 #include <TCanvas.h>
38
39 #include "AliAnalysisSelector.h"
40 #include "AliAnalysisGrid.h"
41 #include "AliAnalysisTask.h"
42 #include "AliAnalysisDataContainer.h"
43 #include "AliAnalysisDataSlot.h"
44 #include "AliVEventHandler.h"
45 #include "AliVEventPool.h"
46 #include "AliSysInfo.h"
47 #include "AliAnalysisManager.h"
48
49 ClassImp(AliAnalysisManager)
50
51 AliAnalysisManager *AliAnalysisManager::fgAnalysisManager = NULL;
52
53 //______________________________________________________________________________
54 AliAnalysisManager::AliAnalysisManager(const char *name, const char *title)
55                    :TNamed(name,title),
56                     fTree(NULL),
57                     fInputEventHandler(NULL),
58                     fOutputEventHandler(NULL),
59                     fMCtruthEventHandler(NULL),
60                     fEventPool(NULL),
61                     fCurrentEntry(-1),
62                     fNSysInfo(0),
63                     fMode(kLocalAnalysis),
64                     fInitOK(kFALSE),
65                     fDebug(0),
66                     fSpecialOutputLocation(""), 
67                     fTasks(NULL),
68                     fTopTasks(NULL),
69                     fZombies(NULL),
70                     fContainers(NULL),
71                     fInputs(NULL),
72                     fOutputs(NULL),
73                     fCommonInput(NULL),
74                     fCommonOutput(NULL),
75                     fSelector(NULL),
76                     fGridHandler(NULL)
77 {
78 // Default constructor.
79    fgAnalysisManager = this;
80    fTasks      = new TObjArray();
81    fTopTasks   = new TObjArray();
82    fZombies    = new TObjArray();
83    fContainers = new TObjArray();
84    fInputs     = new TObjArray();
85    fOutputs    = new TObjArray();
86    SetEventLoop(kTRUE);
87 }
88
89 //______________________________________________________________________________
90 AliAnalysisManager::AliAnalysisManager(const AliAnalysisManager& other)
91                    :TNamed(other),
92                     fTree(NULL),
93                     fInputEventHandler(NULL),
94                     fOutputEventHandler(NULL),
95                     fMCtruthEventHandler(NULL),
96                     fEventPool(NULL),
97                     fCurrentEntry(-1),
98                     fNSysInfo(0),
99                     fMode(other.fMode),
100                     fInitOK(other.fInitOK),
101                     fDebug(other.fDebug),
102                     fSpecialOutputLocation(""), 
103                     fTasks(NULL),
104                     fTopTasks(NULL),
105                     fZombies(NULL),
106                     fContainers(NULL),
107                     fInputs(NULL),
108                     fOutputs(NULL),
109                     fCommonInput(NULL),
110                     fCommonOutput(NULL),
111                     fSelector(NULL),
112                     fGridHandler(NULL)
113 {
114 // Copy constructor.
115    fTasks      = new TObjArray(*other.fTasks);
116    fTopTasks   = new TObjArray(*other.fTopTasks);
117    fZombies    = new TObjArray(*other.fZombies);
118    fContainers = new TObjArray(*other.fContainers);
119    fInputs     = new TObjArray(*other.fInputs);
120    fOutputs    = new TObjArray(*other.fOutputs);
121    fgAnalysisManager = this;
122 }
123    
124 //______________________________________________________________________________
125 AliAnalysisManager& AliAnalysisManager::operator=(const AliAnalysisManager& other)
126 {
127 // Assignment
128    if (&other != this) {
129       TNamed::operator=(other);
130       fInputEventHandler   = other.fInputEventHandler;
131       fOutputEventHandler  = other.fOutputEventHandler;
132       fMCtruthEventHandler = other.fMCtruthEventHandler;
133       fEventPool           = other.fEventPool;
134       fTree       = NULL;
135       fCurrentEntry = -1;
136       fNSysInfo   = other.fNSysInfo;
137       fMode       = other.fMode;
138       fInitOK     = other.fInitOK;
139       fDebug      = other.fDebug;
140       fTasks      = new TObjArray(*other.fTasks);
141       fTopTasks   = new TObjArray(*other.fTopTasks);
142       fZombies    = new TObjArray(*other.fZombies);
143       fContainers = new TObjArray(*other.fContainers);
144       fInputs     = new TObjArray(*other.fInputs);
145       fOutputs    = new TObjArray(*other.fOutputs);
146       fCommonInput = NULL;
147       fCommonOutput = NULL;
148       fSelector   = NULL;
149       fGridHandler = NULL;
150       fgAnalysisManager = this;
151    }
152    return *this;
153 }
154
155 //______________________________________________________________________________
156 AliAnalysisManager::~AliAnalysisManager()
157 {
158 // Destructor.
159    if (fTasks) {fTasks->Delete(); delete fTasks;}
160    if (fTopTasks) delete fTopTasks;
161    if (fZombies) delete fZombies;
162    if (fContainers) {fContainers->Delete(); delete fContainers;}
163    if (fInputs) delete fInputs;
164    if (fOutputs) delete fOutputs;
165    if (fGridHandler) delete fGridHandler;
166    if (fgAnalysisManager==this) fgAnalysisManager = NULL;
167 }
168
169 //______________________________________________________________________________
170 Int_t AliAnalysisManager::GetEntry(Long64_t entry, Int_t getall)
171 {
172 // Read one entry of the tree or a whole branch.
173    if (fDebug > 0) printf("== AliAnalysisManager::GetEntry(%lld)\n", entry);
174    fCurrentEntry = entry;
175    return fTree ? fTree->GetTree()->GetEntry(entry, getall) : 0;
176 }
177    
178 //______________________________________________________________________________
179 Bool_t AliAnalysisManager::Init(TTree *tree)
180 {
181   // The Init() function is called when the selector needs to initialize
182   // a new tree or chain. Typically here the branch addresses of the tree
183   // will be set. It is normaly not necessary to make changes to the
184   // generated code, but the routine can be extended by the user if needed.
185   // Init() will be called many times when running with PROOF.
186    Bool_t init = kFALSE;
187    if (!tree) return kFALSE; // Should not happen - protected in selector caller
188    if (fDebug > 0) {
189       printf("->AliAnalysisManager::Init(%s)\n", tree->GetName());
190    }
191    // Call InitTree of EventHandler
192    if (fOutputEventHandler) {
193       if (fMode == kProofAnalysis) {
194          init = fOutputEventHandler->Init(0x0, "proof");
195       } else {
196          init = fOutputEventHandler->Init(0x0, "local");
197       }
198       if (!init) {
199          Error("Init", "Output event handler failed to initialize");
200          return kFALSE;
201       }         
202    }
203    
204    if (fInputEventHandler) {
205       if (fMode == kProofAnalysis) {
206          init = fInputEventHandler->Init(tree, "proof");
207       } else {
208          init = fInputEventHandler->Init(tree, "local");
209       }
210       if (!init) {
211          Error("Init", "Input event handler failed to initialize tree"); 
212          return kFALSE;
213       }         
214    } else {
215       // If no input event handler we need to get the tree once
216       // for the chain
217       if(!tree->GetTree()) {
218          Long64_t readEntry = tree->LoadTree(0);
219          if (readEntry == -2) {
220             Error("Init", "Input tree has no entry. Aborting");
221             return kFALSE;
222          }
223       }   
224    }
225
226    if (fMCtruthEventHandler) {
227       if (fMode == kProofAnalysis) {
228          init = fMCtruthEventHandler->Init(0x0, "proof");
229       } else {
230          init = fMCtruthEventHandler->Init(0x0, "local");
231       }
232       if (!init) {
233          Error("Init", "MC event handler failed to initialize"); 
234          return kFALSE;
235       }         
236    }
237
238    if (!fInitOK) InitAnalysis();
239    if (!fInitOK) return kFALSE;
240    fTree = tree;
241    AliAnalysisDataContainer *top = fCommonInput;
242    if (!top) top = (AliAnalysisDataContainer*)fInputs->At(0);
243    if (!top) {
244       Error("Init","No top input container !");
245       return kFALSE;
246    }
247    top->SetData(tree);
248    if (fDebug > 0) {
249       printf("<-AliAnalysisManager::Init(%s)\n", tree->GetName());
250    }
251    return kTRUE;
252 }
253
254 //______________________________________________________________________________
255 void AliAnalysisManager::SlaveBegin(TTree *tree)
256 {
257   // The SlaveBegin() function is called after the Begin() function.
258   // When running with PROOF SlaveBegin() is called on each slave server.
259   // The tree argument is deprecated (on PROOF 0 is passed).
260    if (fDebug > 0) printf("->AliAnalysisManager::SlaveBegin()\n");
261    static Bool_t isCalled = kFALSE;
262    Bool_t init = kFALSE;
263    Bool_t initOK = kTRUE;
264    TString msg;
265    TDirectory *curdir = gDirectory;
266    // Call SlaveBegin only once in case of mixing
267    if (isCalled && fMode==kMixingAnalysis) return;
268    // Call Init of EventHandler
269    if (fOutputEventHandler) {
270       if (fMode == kProofAnalysis) {
271          TIter nextout(fOutputs);
272          AliAnalysisDataContainer *c_aod;
273          while ((c_aod=(AliAnalysisDataContainer*)nextout())) if (!strcmp(c_aod->GetFileName(),"default")) break;
274          if (c_aod && c_aod->IsSpecialOutput()) {
275             // Merging via files
276             if (fDebug > 1) printf("   Initializing special output file %s...\n", fOutputEventHandler->GetOutputFileName());
277             OpenProofFile(fOutputEventHandler->GetOutputFileName(), "RECREATE");
278             c_aod->SetFile(gFile);
279             init = fOutputEventHandler->Init("proofspecial");
280             if (!init) msg = "Failed to initialize output handler on worker using special proof output";
281          } else {
282             // Merging in memory
283             init = fOutputEventHandler->Init("proof");
284             if (!init) msg = "Failed to initialize output handler on worker";
285          }   
286       } else {
287          init = fOutputEventHandler->Init("local");
288          if (!init) msg = "Failed to initialize output handler on worker";
289       }
290       initOK &= init;
291       if (!fSelector) Error("SlaveBegin", "Selector not set");
292       else if (!init) {fSelector->Abort(msg); fSelector->SetStatus(-1);}
293    }
294
295    if (fInputEventHandler) {
296       fInputEventHandler->SetInputTree(tree);
297       if (fMode == kProofAnalysis) {
298          init = fInputEventHandler->Init("proof");
299          if (!init) msg = "Failed to initialize input handler on worker";
300       } else {
301          init = fInputEventHandler->Init("local");
302          if (!init) msg = "Failed to initialize input handler";
303       }
304       initOK &= init;
305       if (!fSelector) Error("SlaveBegin", "Selector not set");      
306       else if (!init) {fSelector->Abort(msg); fSelector->SetStatus(-1);}
307    }
308
309    if (fMCtruthEventHandler) {
310       if (fMode == kProofAnalysis) {
311          init = fMCtruthEventHandler->Init("proof");
312          if (!init) msg = "Failed to initialize MC handler on worker";
313       } else {
314          init = fMCtruthEventHandler->Init("local");
315          if (!init) msg = "Failed to initialize MC handler";
316       }
317       initOK &= init;
318       if (!fSelector) Error("SlaveBegin", "Selector not set");      
319       else if (!init) {fSelector->Abort(msg); fSelector->SetStatus(-1);}
320    }
321    if (curdir) curdir->cd();
322    isCalled = kTRUE;
323    if (!initOK) return;   
324    TIter next(fTasks);
325    AliAnalysisTask *task;
326    // Call CreateOutputObjects for all tasks
327    while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) {
328       curdir = gDirectory;
329       task->CreateOutputObjects();
330       if (curdir) curdir->cd();
331    }
332    if (fDebug > 0) printf("<-AliAnalysisManager::SlaveBegin()\n");
333 }
334
335 //______________________________________________________________________________
336 Bool_t AliAnalysisManager::Notify()
337 {
338    // The Notify() function is called when a new file is opened. This
339    // can be either for a new TTree in a TChain or when when a new TTree
340    // is started when using PROOF. It is normaly not necessary to make changes
341    // to the generated code, but the routine can be extended by the
342    // user if needed. The return value is currently not used.
343    if (!fTree) return kFALSE;
344
345    TFile *curfile = fTree->GetCurrentFile();
346    if (!curfile) {
347       Error("Notify","No current file");
348       return kFALSE;
349    }   
350    
351    if (fDebug > 0) printf("->AliAnalysisManager::Notify() file: %s\n", curfile->GetName());
352    TIter next(fTasks);
353    AliAnalysisTask *task;
354    // Call Notify for all tasks
355    while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) 
356       task->Notify();
357         
358    // Call Notify of the event handlers
359    if (fInputEventHandler) {
360        fInputEventHandler->Notify(curfile->GetName());
361    }
362
363    if (fOutputEventHandler) {
364        fOutputEventHandler->Notify(curfile->GetName());
365    }
366
367    if (fMCtruthEventHandler) {
368        fMCtruthEventHandler->Notify(curfile->GetName());
369    }
370    if (fDebug > 0) printf("<-AliAnalysisManager::Notify()\n");
371    return kTRUE;
372 }    
373
374 //______________________________________________________________________________
375 Bool_t AliAnalysisManager::Process(Long64_t entry)
376 {
377   // The Process() function is called for each entry in the tree (or possibly
378   // keyed object in the case of PROOF) to be processed. The entry argument
379   // specifies which entry in the currently loaded tree is to be processed.
380   // It can be passed to either TTree::GetEntry() or TBranch::GetEntry()
381   // to read either all or the required parts of the data. When processing
382   // keyed objects with PROOF, the object is already loaded and is available
383   // via the fObject pointer.
384   //
385   // This function should contain the "body" of the analysis. It can contain
386   // simple or elaborate selection criteria, run algorithms on the data
387   // of the event and typically fill histograms.
388
389   // WARNING when a selector is used with a TChain, you must use
390   //  the pointer to the current TTree to call GetEntry(entry).
391   //  The entry is always the local entry number in the current tree.
392   //  Assuming that fChain is the pointer to the TChain being processed,
393   //  use fChain->GetTree()->GetEntry(entry).
394    if (fDebug > 0) printf("->AliAnalysisManager::Process(%lld)\n", entry);
395
396    if (fInputEventHandler)   fInputEventHandler  ->BeginEvent(entry);
397    if (fOutputEventHandler)  fOutputEventHandler ->BeginEvent(entry);
398    if (fMCtruthEventHandler) fMCtruthEventHandler->BeginEvent(entry);
399    
400    GetEntry(entry);
401    ExecAnalysis();
402    if (fDebug > 0) printf("<-AliAnalysisManager::Process()\n");
403    return kTRUE;
404 }
405
406 //______________________________________________________________________________
407 void AliAnalysisManager::PackOutput(TList *target)
408 {
409   // Pack all output data containers in the output list. Called at SlaveTerminate
410   // stage in PROOF case for each slave.
411    if (fDebug > 0) printf("->AliAnalysisManager::PackOutput()\n");
412    if (!target) {
413       Error("PackOutput", "No target. Aborting.");
414       return;
415    }
416    if (fInputEventHandler)   fInputEventHandler  ->Terminate();
417    if (fOutputEventHandler)  fOutputEventHandler ->Terminate();
418    if (fMCtruthEventHandler) fMCtruthEventHandler->Terminate();
419
420    // Call FinishTaskOutput() for each event loop task (not called for 
421    // post-event loop tasks - use Terminate() fo those)
422    TIter nexttask(fTasks);
423    AliAnalysisTask *task;
424    while ((task=(AliAnalysisTask*)nexttask())) {
425       if (!task->IsPostEventLoop()) {
426          if (fDebug > 0) printf("->FinishTaskOutput: task %s\n", task->GetName());
427          task->FinishTaskOutput();
428          if (fDebug > 0) printf("<-FinishTaskOutput: task %s\n", task->GetName());
429       }
430    }      
431    
432    if (fMode == kProofAnalysis) {
433       TIter next(fOutputs);
434       AliAnalysisDataContainer *output;
435       Bool_t isManagedByHandler = kFALSE;
436       while ((output=(AliAnalysisDataContainer*)next())) {
437          // Do not consider outputs of post event loop tasks
438          isManagedByHandler = kFALSE;
439          if (output->GetProducer()->IsPostEventLoop()) continue;
440          const char *filename = output->GetFileName();
441          if (!(strcmp(filename, "default")) && fOutputEventHandler) {
442             isManagedByHandler = kTRUE;
443             filename = fOutputEventHandler->GetOutputFileName();
444          }
445          // Check if data was posted to this container. If not, issue an error.
446          if (!output->GetData() && !isManagedByHandler) {
447             Error("PackOutput", "No data for output container %s. Forgot to PostData ?\n", output->GetName());
448             continue;
449          }   
450          if (!output->IsSpecialOutput()) {
451             // Normal outputs
452             if (strlen(filename) && !isManagedByHandler) {
453                // File resident outputs
454                TFile *file = output->GetFile();
455                // Backup current folder
456                TDirectory *opwd = gDirectory;
457                // Create file if not existing and register to container.
458                if (file) file->cd();
459                else      file = new TFile(filename, "RECREATE"); 
460                if (file->IsZombie()) {
461                   Fatal("PackOutput", "Could not recreate file %s\n", filename);
462                   return;
463                }   
464                output->SetFile(file);
465                // Clear file list to release object ownership to user.
466                file->Clear();
467                // Save data to file, then close.
468                if (output->GetData()->InheritsFrom(TCollection::Class())) {
469                   // If data is a collection, we set the name of the collection 
470                   // as the one of the container and we save as a single key.
471                   TCollection *coll = (TCollection*)output->GetData();
472                   coll->SetName(output->GetName());
473                   coll->Write(output->GetName(), TObject::kSingleKey);
474                } else {
475                   if (output->GetData()->InheritsFrom(TTree::Class())) {
476                      TTree *tree = (TTree*)output->GetData();
477                      tree->SetDirectory(file);
478                      tree->AutoSave();
479                   } else {
480                      output->GetData()->Write();
481                   }   
482                }      
483                if (fDebug > 1) printf("PackOutput %s: memory merge, file resident output\n", output->GetName());
484                if (fDebug > 2) {
485                   printf("   file %s listing content:\n", filename);
486                   file->ls();
487                }   
488                file->Close();
489                // Restore current directory
490                if (opwd) opwd->cd();
491             } else {
492                // Memory-resident outputs   
493                if (fDebug > 1) printf("PackOutput %s: memory merge memory resident output\n", filename);
494             }   
495             AliAnalysisDataWrapper *wrap = 0;
496             if (isManagedByHandler) {
497                wrap = new AliAnalysisDataWrapper(fOutputEventHandler->GetTree());
498                wrap->SetName(output->GetName());
499             }   
500             else                    wrap =output->ExportData();
501             // Output wrappers must NOT delete data after merging - the user owns them
502             wrap->SetDeleteData(kFALSE);
503             target->Add(wrap);
504          } else {
505          // Special outputs
506             TDirectory *opwd = gDirectory;
507             TFile *file = output->GetFile();
508             if (fDebug > 1 && file) printf("PackOutput %s: file merge, special output\n", output->GetName());
509             if (isManagedByHandler) {
510                // Terminate IO for files managed by the output handler
511                if (file) file->Write();
512                if (file && fDebug > 2) {
513                   printf("   handled file %s listing content:\n", file->GetName());
514                   file->ls();
515                }   
516                fOutputEventHandler->TerminateIO();
517                continue;
518             }   
519             
520             if (!file) {
521                AliAnalysisTask *producer = output->GetProducer();
522                Error("PackOutput", 
523                      "File %s for special container %s was NOT opened in %s::CreateOutputObjects !!!",
524                      output->GetFileName(), output->GetName(), producer->ClassName());
525                continue;
526             }   
527             file->cd();
528             // Release object ownership to users after writing data to file
529             if (output->GetData()->InheritsFrom(TCollection::Class())) {
530                // If data is a collection, we set the name of the collection 
531                // as the one of the container and we save as a single key.
532                TCollection *coll = (TCollection*)output->GetData();
533                coll->SetName(output->GetName());
534                coll->Write(output->GetName(), TObject::kSingleKey);
535             } else {
536                if (output->GetData()->InheritsFrom(TTree::Class())) {
537                   TTree *tree = (TTree*)output->GetData();
538                   tree->SetDirectory(file);
539                   tree->AutoSave();
540                } else {
541                   output->GetData()->Write();
542                }   
543             }      
544             file->Clear();
545             if (fDebug > 2) {
546                printf("   file %s listing content:\n", output->GetFileName());
547                file->ls();
548             }
549             TString outFilename = file->GetName();
550             file->Close();
551             // Restore current directory
552             if (opwd) opwd->cd();
553             // Check if a special output location was provided or the output files have to be merged
554             if (strlen(fSpecialOutputLocation.Data())) {
555                TString remote = fSpecialOutputLocation;
556                remote += "/";
557                Int_t gid = gROOT->ProcessLine("gProofServ->GetGroupId();");
558                remote += Form("%s_%d_", gSystem->HostName(), gid);
559                remote += output->GetFileName();
560                TFile::Cp ( outFilename.Data(), remote.Data() );
561             } else {
562             // No special location specified-> use TProofOutputFile as merging utility
563             // The file at this output slot must be opened in CreateOutputObjects
564                if (fDebug > 1) printf("   File %s to be merged...\n", output->GetFileName());
565             }
566          }      
567       }
568    } 
569    if (fDebug > 0) printf("<-AliAnalysisManager::PackOutput: output list contains %d containers\n", target->GetSize());
570 }
571
572 //______________________________________________________________________________
573 void AliAnalysisManager::ImportWrappers(TList *source)
574 {
575 // Import data in output containers from wrappers coming in source.
576    if (fDebug > 0) printf("->AliAnalysisManager::ImportWrappers()\n");
577    TIter next(fOutputs);
578    AliAnalysisDataContainer *cont;
579    AliAnalysisDataWrapper   *wrap;
580    Int_t icont = 0;
581    Bool_t inGrid = (fMode == kGridAnalysis)?kTRUE:kFALSE;
582    while ((cont=(AliAnalysisDataContainer*)next())) {
583       wrap = 0;
584       if (cont->GetProducer()->IsPostEventLoop() && !inGrid) continue;
585       const char *filename = cont->GetFileName();
586       Bool_t isManagedByHandler = kFALSE;
587       if (!(strcmp(filename, "default")) && fOutputEventHandler) {
588          isManagedByHandler = kTRUE;
589          filename = fOutputEventHandler->GetOutputFileName();
590       }
591       if (cont->IsSpecialOutput() || inGrid) {
592          if (strlen(fSpecialOutputLocation.Data()) && !isManagedByHandler) continue;
593          // Copy merged file from PROOF scratch space. 
594          // In case of grid the files are already in the current directory.
595          if (!inGrid) {
596             char full_path[512];
597             char ch_url[512];
598             TObject *pof =  source->FindObject(filename);
599             if (!pof || !pof->InheritsFrom("TProofOutputFile")) {
600                Error("ImportWrappers", "TProofOutputFile object not found in output list for container %s", cont->GetName());
601                continue;
602             }
603             gROOT->ProcessLine(Form("sprintf((char*)0x%lx, \"%%s\", ((TProofOutputFile*)0x%lx)->GetOutputFileName();)", full_path, pof));
604             gROOT->ProcessLine(Form("sprintf((char*)0x%lx, \"%%s\", gProof->GetUrl();)", ch_url));
605             TString clientUrl(ch_url);
606             TString full_path_str(full_path);
607             if (clientUrl.Contains("localhost")){
608                TObjArray* array = full_path_str.Tokenize ( "//" );
609                TObjString *strobj = ( TObjString *)array->At(1);
610                TObjArray* arrayPort = strobj->GetString().Tokenize ( ":" );
611                TObjString *strobjPort = ( TObjString *) arrayPort->At(1);
612                full_path_str.ReplaceAll(strobj->GetString().Data(),"localhost:PORT");
613                full_path_str.ReplaceAll(":PORT",Form(":%s",strobjPort->GetString().Data()));
614                if (fDebug > 1) Info("ImportWrappers","Using tunnel from %s to %s",full_path_str.Data(),filename);
615             }
616             if (fDebug > 1) 
617                printf("   Copying file %s from PROOF scratch space\n", full_path_str.Data());
618             Bool_t gotit = TFile::Cp(full_path_str.Data(), filename); 
619             if (!gotit) {
620                Error("ImportWrappers", "Could not get file %s from proof scratch space", cont->GetFileName());
621                continue;
622             }
623          }   
624          // Normally we should connect data from the copied file to the
625          // corresponding output container, but it is not obvious how to do this
626          // automatically if several objects in file...
627          TFile *f = TFile::Open(filename, "READ");
628          if (!f) {
629             Error("ImportWrappers", "Cannot open file %s in read-only mode", filename);
630             continue;
631          }   
632          TObject *obj = 0;
633          // Try to fetch first a list object having the container name.
634          obj = f->Get(cont->GetName());
635          if (!obj) {
636          // Fetch first object from file having the container type.
637             TIter nextkey(f->GetListOfKeys());
638             TKey *key;
639             while ((key=(TKey*)nextkey())) {
640                obj = f->Get(key->GetName());
641                if (obj && obj->IsA()->InheritsFrom(cont->GetType())) break;
642             }                     
643          }
644          if (!obj) {
645             Error("ImportWrappers", "Could not find object for container %s in file %s", cont->GetName(), filename);
646             continue;
647          }  
648          wrap = new AliAnalysisDataWrapper(obj);
649          wrap->SetDeleteData(kFALSE);
650       }   
651       if (!wrap) wrap = (AliAnalysisDataWrapper*)source->FindObject(cont->GetName());
652       if (!wrap) {
653          Error("ImportWrappers","Container %s not found in analysis output !", cont->GetName());
654          continue;
655       }
656       icont++;
657       if (fDebug > 1) {
658          printf("   Importing data for container %s", cont->GetName());
659          if (strlen(filename)) printf("    -> file %s\n", filename);
660          else printf("\n");
661       }   
662       cont->ImportData(wrap);
663    }         
664    if (fDebug > 0) printf("<-AliAnalysisManager::ImportWrappers(): %d containers imported\n", icont);
665 }
666
667 //______________________________________________________________________________
668 void AliAnalysisManager::UnpackOutput(TList *source)
669 {
670   // Called by AliAnalysisSelector::Terminate only on the client.
671    if (fDebug > 0) printf("->AliAnalysisManager::UnpackOutput()\n");
672    if (!source) {
673       Error("UnpackOutput", "No target. Aborting.");
674       return;
675    }
676    if (fDebug > 1) printf("   Source list contains %d containers\n", source->GetSize());
677
678    if (fMode == kProofAnalysis) ImportWrappers(source);
679
680    TIter next(fOutputs);
681    AliAnalysisDataContainer *output;
682    while ((output=(AliAnalysisDataContainer*)next())) {
683       if (!output->GetData()) continue;
684       // Check if there are client tasks that run post event loop
685       if (output->HasConsumers()) {
686          // Disable event loop semaphore
687          output->SetPostEventLoop(kTRUE);
688          TObjArray *list = output->GetConsumers();
689          Int_t ncons = list->GetEntriesFast();
690          for (Int_t i=0; i<ncons; i++) {
691             AliAnalysisTask *task = (AliAnalysisTask*)list->At(i);
692             task->CheckNotify(kTRUE);
693             // If task is active, execute it
694             if (task->IsPostEventLoop() && task->IsActive()) {
695                if (fDebug > 0) printf("== Executing post event loop task %s\n", task->GetName());
696                task->ExecuteTask();
697             }   
698          }
699       }   
700    }
701    if (fDebug > 0) printf("<-AliAnalysisManager::UnpackOutput()\n");
702 }
703
704 //______________________________________________________________________________
705 void AliAnalysisManager::Terminate()
706 {
707   // The Terminate() function is the last function to be called during
708   // a query. It always runs on the client, it can be used to present
709   // the results graphically.
710    if (fDebug > 0) printf("->AliAnalysisManager::Terminate()\n");
711    AliAnalysisTask *task;
712    TIter next(fTasks);
713    // Call Terminate() for tasks
714    while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) task->Terminate();
715    //
716    TIter next1(fOutputs);
717    AliAnalysisDataContainer *output;
718    while ((output=(AliAnalysisDataContainer*)next1())) {
719       // Special outputs or grid files have the files already closed and written.
720       if (fMode == kGridAnalysis) continue;
721       if (output->IsSpecialOutput()&&(fMode == kProofAnalysis)) continue;
722       const char *filename = output->GetFileName();
723       if (!(strcmp(filename, "default"))) {
724          if (fOutputEventHandler) filename = fOutputEventHandler->GetOutputFileName();
725          TFile *aodfile = (TFile*)gROOT->GetListOfFiles()->FindObject(filename);
726          if (aodfile) {
727             if (fDebug > 1) printf("Writing output handler file: %s\n", filename);
728             aodfile->Write();
729             continue;
730          }   
731       }      
732       if (!strlen(filename)) continue;
733       if (!output->GetData()) continue;
734       TFile *file = output->GetFile();
735       TDirectory *opwd = gDirectory;
736       file = (TFile*)gROOT->GetListOfFiles()->FindObject(filename);
737       if (!file) file = new TFile(filename, "RECREATE");
738       if (file->IsZombie()) continue;
739       output->SetFile(file);
740       file->cd();
741       if (fDebug > 1) printf("   writing output data %s to file %s\n", output->GetData()->GetName(), file->GetName());
742       if (output->GetData()->InheritsFrom(TCollection::Class())) {
743       // If data is a collection, we set the name of the collection 
744       // as the one of the container and we save as a single key.
745          TCollection *coll = (TCollection*)output->GetData();
746          coll->SetName(output->GetName());
747          coll->Write(output->GetName(), TObject::kSingleKey);
748       } else {
749          if (output->GetData()->InheritsFrom(TTree::Class())) {
750             TTree *tree = (TTree*)output->GetData();
751             tree->SetDirectory(file);
752             tree->AutoSave();
753          } else {
754             output->GetData()->Write();
755          }   
756       }      
757       if (opwd) opwd->cd();
758    }   
759    next1.Reset();
760    while ((output=(AliAnalysisDataContainer*)next1())) {
761       // Close all files at output
762       TDirectory *opwd = gDirectory;
763       if (output->GetFile()) output->GetFile()->Close();
764       if (opwd) opwd->cd();
765    }   
766
767    if (fInputEventHandler)   fInputEventHandler  ->TerminateIO();
768    if (fOutputEventHandler)  fOutputEventHandler ->TerminateIO();
769    if (fMCtruthEventHandler) fMCtruthEventHandler->TerminateIO();
770
771    Bool_t getsysInfo = ((fNSysInfo>0) && (fMode==kLocalAnalysis))?kTRUE:kFALSE;
772    if (getsysInfo) {
773       TDirectory *cdir = gDirectory;
774       TFile f("syswatch.root", "RECREATE");
775       if (!f.IsZombie()) {
776          TTree *tree = AliSysInfo::MakeTree("syswatch.log");
777          tree->SetMarkerStyle(kCircle);
778          tree->SetMarkerColor(kBlue);
779          tree->SetMarkerSize(0.5);
780          if (!gROOT->IsBatch()) {
781             tree->SetAlias("event", "id0");
782             tree->SetAlias("memUSED", "mi.fMemUsed");
783             new TCanvas("SysInfo","SysInfo",10,10,800,600);
784             tree->Draw("memUSED:event","","", 1234567890, 0);
785          }   
786          tree->Write();
787          f.Close();
788          delete tree;
789       }
790       if (cdir) cdir->cd();
791    }      
792    if (fDebug > 0) printf("<-AliAnalysisManager::Terminate()\n");
793 }
794
795 //______________________________________________________________________________
796 void AliAnalysisManager::AddTask(AliAnalysisTask *task)
797 {
798 // Adds a user task to the global list of tasks.
799    if (fTasks->FindObject(task)) {
800       Warning("AddTask", "Task %s: the same object already added to the analysis manager. Not adding.", task->GetName());
801       return;
802    }   
803    task->SetActive(kFALSE);
804    fTasks->Add(task);
805 }  
806
807 //______________________________________________________________________________
808 AliAnalysisTask *AliAnalysisManager::GetTask(const char *name) const
809 {
810 // Retreive task by name.
811    if (!fTasks) return NULL;
812    return (AliAnalysisTask*)fTasks->FindObject(name);
813 }
814
815 //______________________________________________________________________________
816 AliAnalysisDataContainer *AliAnalysisManager::CreateContainer(const char *name, 
817                                 TClass *datatype, EAliAnalysisContType type, const char *filename)
818 {
819 // Create a data container of a certain type. Types can be:
820 //   kExchangeContainer  = 0, used to exchange date between tasks
821 //   kInputContainer   = 1, used to store input data
822 //   kOutputContainer  = 2, used for posting results
823    if (fContainers->FindObject(name)) {
824       Error("CreateContainer","A container named %s already defined !\n",name);
825       return NULL;
826    }   
827    AliAnalysisDataContainer *cont = new AliAnalysisDataContainer(name, datatype);
828    fContainers->Add(cont);
829    switch (type) {
830       case kInputContainer:
831          fInputs->Add(cont);
832          break;
833       case kOutputContainer:
834          fOutputs->Add(cont);
835          if (filename && strlen(filename)) {
836             cont->SetFileName(filename);
837             cont->SetDataOwned(kFALSE);  // data owned by the file
838          }   
839          break;
840       case kExchangeContainer:
841          break;   
842    }
843    return cont;
844 }
845          
846 //______________________________________________________________________________
847 Bool_t AliAnalysisManager::ConnectInput(AliAnalysisTask *task, Int_t islot,
848                                         AliAnalysisDataContainer *cont)
849 {
850 // Connect input of an existing task to a data container.
851    if (!task) {
852       Error("ConnectInput", "Task pointer is NULL");
853       return kFALSE;
854    }   
855    if (!fTasks->FindObject(task)) {
856       AddTask(task);
857       Info("ConnectInput", "Task %s was not registered. Now owned by analysis manager", task->GetName());
858    } 
859    Bool_t connected = task->ConnectInput(islot, cont);
860    return connected;
861 }   
862
863 //______________________________________________________________________________
864 Bool_t AliAnalysisManager::ConnectOutput(AliAnalysisTask *task, Int_t islot,
865                                         AliAnalysisDataContainer *cont)
866 {
867 // Connect output of an existing task to a data container.
868    if (!task) {
869       Error("ConnectOutput", "Task pointer is NULL");
870       return kFALSE;
871    }   
872    if (!fTasks->FindObject(task)) {
873       AddTask(task);
874       Warning("ConnectOutput", "Task %s not registered. Now owned by analysis manager", task->GetName());
875    } 
876    Bool_t connected = task->ConnectOutput(islot, cont);
877    return connected;
878 }   
879                                
880 //______________________________________________________________________________
881 void AliAnalysisManager::CleanContainers()
882 {
883 // Clean data from all containers that have already finished all client tasks.
884    TIter next(fContainers);
885    AliAnalysisDataContainer *cont;
886    while ((cont=(AliAnalysisDataContainer *)next())) {
887       if (cont->IsOwnedData() && 
888           cont->IsDataReady() && 
889           cont->ClientsExecuted()) cont->DeleteData();
890    }
891 }
892
893 //______________________________________________________________________________
894 Bool_t AliAnalysisManager::InitAnalysis()
895 {
896 // Initialization of analysis chain of tasks. Should be called after all tasks
897 // and data containers are properly connected
898    // Check for input/output containers
899    fInitOK = kFALSE;
900    // Check for top tasks (depending only on input data containers)
901    if (!fTasks->First()) {
902       Error("InitAnalysis", "Analysis has no tasks !");
903       return kFALSE;
904    }   
905    TIter next(fTasks);
906    AliAnalysisTask *task;
907    AliAnalysisDataContainer *cont;
908    Int_t ntop = 0;
909    Int_t nzombies = 0;
910    Bool_t iszombie = kFALSE;
911    Bool_t istop = kTRUE;
912    Int_t i;
913    while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) {
914       istop = kTRUE;
915       iszombie = kFALSE;
916       Int_t ninputs = task->GetNinputs();
917       for (i=0; i<ninputs; i++) {
918          cont = task->GetInputSlot(i)->GetContainer();
919          if (!cont) {
920             if (!iszombie) {
921                task->SetZombie();
922                fZombies->Add(task);
923                nzombies++;
924                iszombie = kTRUE;
925             }   
926             Error("InitAnalysis", "Input slot %d of task %s has no container connected ! Declared zombie...", 
927                   i, task->GetName()); 
928          }
929          if (iszombie) continue;
930          // Check if cont is an input container
931          if (istop && !fInputs->FindObject(cont)) istop=kFALSE;
932          // Connect to parent task
933       }
934       if (istop) {
935          ntop++;
936          fTopTasks->Add(task);
937       }
938    }
939    if (!ntop) {
940       Error("InitAnalysis", "No top task defined. At least one task should be connected only to input containers");
941       return kFALSE;
942    }                        
943    // Check now if there are orphan tasks
944    for (i=0; i<ntop; i++) {
945       task = (AliAnalysisTask*)fTopTasks->At(i);
946       task->SetUsed();
947    }
948    Int_t norphans = 0;
949    next.Reset();
950    while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) {
951       if (!task->IsUsed()) {
952          norphans++;
953          Warning("InitAnalysis", "Task %s is orphan", task->GetName());
954       }   
955    }          
956    // Check the task hierarchy (no parent task should depend on data provided
957    // by a daughter task)
958    for (i=0; i<ntop; i++) {
959       task = (AliAnalysisTask*)fTopTasks->At(i);
960       if (task->CheckCircularDeps()) {
961          Error("InitAnalysis", "Found illegal circular dependencies between following tasks:");
962          PrintStatus("dep");
963          return kFALSE;
964       }   
965    }
966    // Check that all containers feeding post-event loop tasks are in the outputs list
967    TIter nextcont(fContainers); // loop over all containers
968    while ((cont=(AliAnalysisDataContainer*)nextcont())) {
969       if (!cont->IsPostEventLoop() && !fOutputs->FindObject(cont)) {
970          if (cont->HasConsumers()) {
971          // Check if one of the consumers is post event loop
972             TIter nextconsumer(cont->GetConsumers());
973             while ((task=(AliAnalysisTask*)nextconsumer())) {
974                if (task->IsPostEventLoop()) {
975                   fOutputs->Add(cont);
976                   break;
977                }
978             }
979          }
980       }
981    }   
982    // Check if all special output containers have a file name provided
983    TIter nextout(fOutputs);
984    while ((cont=(AliAnalysisDataContainer*)nextout())) {
985       if (cont->IsSpecialOutput() && !strlen(cont->GetFileName())) {
986          Error("InitAnalysis", "Wrong container %s : a file name MUST be provided for special outputs", cont->GetName());
987          return kFALSE;
988       }
989    }      
990    fInitOK = kTRUE;
991    return kTRUE;
992 }   
993
994 //______________________________________________________________________________
995 void AliAnalysisManager::PrintStatus(Option_t *option) const
996 {
997 // Print task hierarchy.
998    if (!fInitOK) {
999       Info("PrintStatus", "Analysis manager %s not initialized : call InitAnalysis() first", GetName());
1000       return;
1001    }   
1002    Bool_t getsysInfo = ((fNSysInfo>0) && (fMode==kLocalAnalysis))?kTRUE:kFALSE;
1003    if (getsysInfo)
1004       Info("PrintStatus", "System information will be collected each %lld events", fNSysInfo);
1005    TIter next(fTopTasks);
1006    AliAnalysisTask *task;
1007    while ((task=(AliAnalysisTask*)next()))
1008       task->PrintTask(option);
1009 }
1010
1011 //______________________________________________________________________________
1012 void AliAnalysisManager::ResetAnalysis()
1013 {
1014 // Reset all execution flags and clean containers.
1015    CleanContainers();
1016 }
1017
1018 //______________________________________________________________________________
1019 void AliAnalysisManager::StartAnalysis(const char *type, TTree *tree, Long64_t nentries, Long64_t firstentry)
1020 {
1021 // Start analysis for this manager. Analysis task can be: LOCAL, PROOF, GRID or
1022 // MIX. Process nentries starting from firstentry
1023    if (!fInitOK) {
1024       Error("StartAnalysis","Analysis manager was not initialized !");
1025       return;
1026    }
1027    if (fDebug > 0) printf("StartAnalysis %s\n",GetName());
1028    TString anaType = type;
1029    anaType.ToLower();
1030    fMode = kLocalAnalysis;
1031    Bool_t runlocalinit = kTRUE;
1032    if (anaType.Contains("file")) runlocalinit = kFALSE;
1033    if (anaType.Contains("proof"))     fMode = kProofAnalysis;
1034    else if (anaType.Contains("grid")) fMode = kGridAnalysis;
1035    else if (anaType.Contains("mix"))  fMode = kMixingAnalysis;
1036
1037    if (fMode == kGridAnalysis) {
1038       if (!fGridHandler) {
1039          Error("StartAnalysis", "Cannot start grid analysis without a grid handler.");
1040          Info("===", "Add an AliAnalysisAlien object as plugin for this manager and configure it.");
1041          return;
1042       }
1043       // Write analysis manager in the analysis file
1044       cout << "===== RUNNING GRID ANALYSIS: " << GetName() << endl;
1045       // run local task configuration
1046       TIter nextTask(fTasks);
1047       AliAnalysisTask *task;
1048       while ((task=(AliAnalysisTask*)nextTask())) {
1049          task->LocalInit();
1050       }
1051       fGridHandler->StartAnalysis(nentries, firstentry);
1052
1053       // Terminate grid analysis
1054       if (fSelector && fSelector->GetStatus() == -1) return;
1055       if (fGridHandler->GetRunMode() == AliAnalysisGrid::kOffline) return;
1056       cout << "===== MERGING OUTPUTS REGISTERED BY YOUR ANALYSIS JOB: " << GetName() << endl;
1057       if (!fGridHandler->MergeOutputs()) {
1058          // Return if outputs could not be merged or if it alien handler
1059          // was configured for offline mode or local testing.
1060          return;
1061       }
1062       ImportWrappers(NULL);
1063       Terminate();
1064       return;
1065    }
1066    char line[256];
1067    SetEventLoop(kFALSE);
1068    // Enable event loop mode if a tree was provided
1069    if (tree || fMode==kMixingAnalysis) SetEventLoop(kTRUE);
1070
1071    TChain *chain = 0;
1072    TString ttype = "TTree";
1073    if (tree && tree->IsA() == TChain::Class()) {
1074       chain = (TChain*)tree;
1075       if (!chain || !chain->GetListOfFiles()->First()) {
1076          Error("StartAnalysis", "Cannot process null or empty chain...");
1077          return;
1078       }   
1079       ttype = "TChain";
1080    }   
1081
1082    // Initialize locally all tasks (happens for all modes)
1083    TIter next(fTasks);
1084    AliAnalysisTask *task;
1085    if (runlocalinit) {
1086       while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) {
1087          task->LocalInit();
1088       }
1089    }   
1090    
1091    switch (fMode) {
1092       case kLocalAnalysis:
1093          if (!tree) {
1094             TIter nextT(fTasks);
1095             // Call CreateOutputObjects for all tasks
1096             while ((task=(AliAnalysisTask*)nextT())) {
1097                TDirectory *curdir = gDirectory;
1098                task->CreateOutputObjects();
1099                if (curdir) curdir->cd();
1100             }   
1101             ExecAnalysis();
1102             Terminate();
1103             return;
1104          } 
1105          // Run tree-based analysis via AliAnalysisSelector  
1106          cout << "===== RUNNING LOCAL ANALYSIS " << GetName() << " ON TREE " << tree->GetName() << endl;
1107          fSelector = new AliAnalysisSelector(this);
1108          tree->Process(fSelector, "", nentries, firstentry);
1109          break;
1110       case kProofAnalysis:
1111          if (!gROOT->GetListOfProofs() || !gROOT->GetListOfProofs()->GetEntries()) {
1112             printf("StartAnalysis: no PROOF!!!\n");
1113             return;
1114          }   
1115          sprintf(line, "gProof->AddInput((TObject*)0x%lx);", (ULong_t)this);
1116          gROOT->ProcessLine(line);
1117          if (chain) {
1118             chain->SetProof();
1119             cout << "===== RUNNING PROOF ANALYSIS " << GetName() << " ON CHAIN " << chain->GetName() << endl;
1120             chain->Process("AliAnalysisSelector", "", nentries, firstentry);
1121          } else {
1122             printf("StartAnalysis: no chain\n");
1123             return;
1124          }      
1125          break;
1126       case kGridAnalysis:
1127          Warning("StartAnalysis", "GRID analysis mode not implemented. Running local.");
1128          break;
1129       case kMixingAnalysis:   
1130          // Run event mixing analysis
1131          if (!fEventPool) {
1132             Error("StartAnalysis", "Cannot run event mixing without event pool");
1133             return;
1134          }
1135          cout << "===== RUNNING EVENT MIXING ANALYSIS " << GetName() << endl;
1136          fSelector = new AliAnalysisSelector(this);
1137          while ((chain=fEventPool->GetNextChain())) {
1138             next.Reset();
1139             // Call NotifyBinChange for all tasks
1140             while ((task=(AliAnalysisTask*)next()))
1141                if (!task->IsPostEventLoop()) task->NotifyBinChange();
1142             chain->Process(fSelector);
1143          }
1144          PackOutput(fSelector->GetOutputList());
1145          Terminate();
1146    }   
1147 }   
1148
1149 //______________________________________________________________________________
1150 void AliAnalysisManager::StartAnalysis(const char *type, const char *dataset, Long64_t nentries, Long64_t firstentry)
1151 {
1152 // Start analysis for this manager on a given dataset. Analysis task can be: 
1153 // LOCAL, PROOF or GRID. Process nentries starting from firstentry.
1154    if (!fInitOK) {
1155       Error("StartAnalysis","Analysis manager was not initialized !");
1156       return;
1157    }
1158    if (fDebug > 0) printf("StartAnalysis %s\n",GetName());
1159    TString anaType = type;
1160    anaType.ToLower();
1161    if (!anaType.Contains("proof")) {
1162       Error("StartAnalysis", "Cannot process datasets in %s mode. Try PROOF.", type);
1163       return;
1164    }   
1165    fMode = kProofAnalysis;
1166    char line[256];
1167    SetEventLoop(kTRUE);
1168    // Set the dataset flag
1169    TObject::SetBit(kUseDataSet);
1170    fTree = 0;
1171
1172    // Initialize locally all tasks
1173    TIter next(fTasks);
1174    AliAnalysisTask *task;
1175    while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) {
1176       task->LocalInit();
1177    }
1178    
1179    if (!gROOT->GetListOfProofs() || !gROOT->GetListOfProofs()->GetEntries()) {
1180       printf("StartAnalysis: no PROOF!!!\n");
1181       return;
1182    }   
1183    sprintf(line, "gProof->AddInput((TObject*)0x%lx);", (ULong_t)this);
1184    gROOT->ProcessLine(line);
1185    sprintf(line, "gProof->GetDataSet(\"%s\");", dataset);
1186    if (!gROOT->ProcessLine(line)) {
1187       Error("StartAnalysis", "Dataset %s not found", dataset);
1188       return;
1189    }   
1190    sprintf(line, "gProof->Process(\"%s\", \"AliAnalysisSelector\", \"\", %lld, %lld);",
1191            dataset, nentries, firstentry);
1192    cout << "===== RUNNING PROOF ANALYSIS " << GetName() << " ON DATASET " << dataset << endl;
1193    gROOT->ProcessLine(line);
1194 }   
1195
1196 //______________________________________________________________________________
1197 TFile *AliAnalysisManager::OpenProofFile(const char *filename, const char *option)
1198 {
1199 // Opens a special output file used in PROOF.
1200    char line[256];
1201    if (fMode!=kProofAnalysis || !fSelector) {
1202       Error("OpenProofFile","Cannot open PROOF file %s",filename);
1203       return NULL;
1204    }   
1205    sprintf(line, "TProofOutputFile *pf = new TProofOutputFile(\"%s\");", filename);
1206    if (fDebug > 1) printf("=== %s\n", line);
1207    gROOT->ProcessLine(line);
1208    sprintf(line, "pf->OpenFile(\"%s\");", option);
1209    gROOT->ProcessLine(line);
1210    if (fDebug > 1) {
1211       gROOT->ProcessLine("pf->Print()");
1212       printf(" == proof file name: %s\n", gFile->GetName());
1213    }   
1214    sprintf(line, "((TList*)0x%lx)->Add(pf);",(ULong_t)fSelector->GetOutputList());
1215    if (fDebug > 1) printf("=== %s\n", line);
1216    gROOT->ProcessLine(line);
1217    return gFile;
1218 }   
1219
1220 //______________________________________________________________________________
1221 void AliAnalysisManager::ExecAnalysis(Option_t *option)
1222 {
1223 // Execute analysis.
1224    static Long64_t ncalls = 0;
1225    Bool_t getsysInfo = ((fNSysInfo>0) && (fMode==kLocalAnalysis))?kTRUE:kFALSE;
1226    if (getsysInfo && ncalls==0) AliSysInfo::AddStamp("Start", (Int_t)ncalls);
1227    ncalls++;
1228    if (!fInitOK) {
1229      Error("ExecAnalysis", "Analysis manager was not initialized !");
1230       return;
1231    }   
1232    AliAnalysisTask *task;
1233    // Check if the top tree is active.
1234    if (fTree) {
1235       TIter next(fTasks);
1236    // De-activate all tasks
1237       while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) task->SetActive(kFALSE);
1238       AliAnalysisDataContainer *cont = fCommonInput;
1239       if (!cont) cont = (AliAnalysisDataContainer*)fInputs->At(0);
1240       if (!cont) {
1241               Error("ExecAnalysis","Cannot execute analysis in TSelector mode without at least one top container");
1242          return;
1243       }   
1244       cont->SetData(fTree); // This will notify all consumers
1245       Long64_t entry = fTree->GetTree()->GetReadEntry();
1246       
1247 //
1248 //    Call BeginEvent() for optional input/output and MC services 
1249       if (fInputEventHandler)   fInputEventHandler  ->BeginEvent(entry);
1250       if (fOutputEventHandler)  fOutputEventHandler ->BeginEvent(entry);
1251       if (fMCtruthEventHandler) fMCtruthEventHandler->BeginEvent(entry);
1252 //
1253 //    Execute the tasks
1254 //      TIter next1(cont->GetConsumers());
1255       TIter next1(fTopTasks);
1256       while ((task=(AliAnalysisTask*)next1())) {
1257          if (fDebug >1) {
1258             cout << "    Executing task " << task->GetName() << endl;
1259          }   
1260          
1261          task->ExecuteTask(option);
1262       }
1263 //
1264 //    Call FinishEvent() for optional output and MC services 
1265       if (fInputEventHandler)   fInputEventHandler  ->FinishEvent();
1266       if (fOutputEventHandler)  fOutputEventHandler ->FinishEvent();
1267       if (fMCtruthEventHandler) fMCtruthEventHandler->FinishEvent();
1268       // Gather system information if requested
1269       if (getsysInfo && ((ncalls%fNSysInfo)==0)) 
1270          AliSysInfo::AddStamp(Form("Event#%lld",ncalls),(Int_t)ncalls);
1271       return;
1272    }   
1273    // The event loop is not controlled by TSelector   
1274 //
1275 //  Call BeginEvent() for optional input/output and MC services 
1276    if (fInputEventHandler)   fInputEventHandler  ->BeginEvent(-1);
1277    if (fOutputEventHandler)  fOutputEventHandler ->BeginEvent(-1);
1278    if (fMCtruthEventHandler) fMCtruthEventHandler->BeginEvent(-1);
1279    TIter next2(fTopTasks);
1280    while ((task=(AliAnalysisTask*)next2())) {
1281       task->SetActive(kTRUE);
1282       if (fDebug > 1) {
1283          cout << "    Executing task " << task->GetName() << endl;
1284       }   
1285       task->ExecuteTask(option);
1286    }   
1287 //
1288 // Call FinishEvent() for optional output and MC services 
1289    if (fInputEventHandler)   fInputEventHandler  ->FinishEvent();
1290    if (fOutputEventHandler)  fOutputEventHandler ->FinishEvent();
1291    if (fMCtruthEventHandler) fMCtruthEventHandler->FinishEvent();
1292 }
1293
1294 //______________________________________________________________________________
1295 void AliAnalysisManager::FinishAnalysis()
1296 {
1297 // Finish analysis.
1298 }
1299
1300 //______________________________________________________________________________
1301 void AliAnalysisManager::SetInputEventHandler(AliVEventHandler*  handler)
1302 {
1303 // Set the input event handler and create a container for it.
1304    fInputEventHandler   = handler;
1305    fCommonInput = CreateContainer("cAUTO_INPUT", TChain::Class(), AliAnalysisManager::kInputContainer);
1306    Warning("SetInputEventHandler", " An automatic input container for the input chain was created.\nPlease use: mgr->GetCommonInputContainer() to access it.");
1307 }
1308
1309 //______________________________________________________________________________
1310 void AliAnalysisManager::SetOutputEventHandler(AliVEventHandler*  handler)
1311 {
1312 // Set the input event handler and create a container for it.
1313    fOutputEventHandler   = handler;
1314    fCommonOutput = CreateContainer("cAUTO_OUTPUT", TTree::Class(), AliAnalysisManager::kOutputContainer, "default");
1315    Warning("SetOutputEventHandler", " An automatic output container for the output tree was created.\nPlease use: mgr->GetCommonOutputContainer() to access it.");
1316 }