5f5c70fa76ab559c404f5aa463a6fb3e71f0bfef
[u/mrichter/AliRoot.git] / ANALYSIS / AliAnalysisManager.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16 /* $Id$ */
17 // Author: Andrei Gheata, 31/05/2006
18
19 //==============================================================================
20 //   AliAnalysysManager - Manager analysis class. Allows creation of several
21 // analysis tasks and data containers storing their input/output. Allows
22 // connecting/chaining tasks via shared data containers. Serializes the current
23 // event for all tasks depending only on initial input data.
24 //==============================================================================
25 //
26 //==============================================================================
27
28 #include <Riostream.h>
29
30 #include <TClass.h>
31 #include <TFile.h>
32 #include <TKey.h>
33 #include <TMethodCall.h>
34 #include <TChain.h>
35 #include <TSystem.h>
36 #include <TROOT.h>
37 #include <TCanvas.h>
38
39 #include "AliAnalysisSelector.h"
40 #include "AliAnalysisGrid.h"
41 #include "AliAnalysisTask.h"
42 #include "AliAnalysisDataContainer.h"
43 #include "AliAnalysisDataSlot.h"
44 #include "AliVEventHandler.h"
45 #include "AliVEventPool.h"
46 #include "AliSysInfo.h"
47 #include "AliAnalysisManager.h"
48
49 ClassImp(AliAnalysisManager)
50
51 AliAnalysisManager *AliAnalysisManager::fgAnalysisManager = NULL;
52
53 //______________________________________________________________________________
54 AliAnalysisManager::AliAnalysisManager(const char *name, const char *title)
55                    :TNamed(name,title),
56                     fTree(NULL),
57                     fInputEventHandler(NULL),
58                     fOutputEventHandler(NULL),
59                     fMCtruthEventHandler(NULL),
60                     fEventPool(NULL),
61                     fCurrentEntry(-1),
62                     fNSysInfo(0),
63                     fMode(kLocalAnalysis),
64                     fInitOK(kFALSE),
65                     fDebug(0),
66                     fSpecialOutputLocation(""), 
67                     fTasks(NULL),
68                     fTopTasks(NULL),
69                     fZombies(NULL),
70                     fContainers(NULL),
71                     fInputs(NULL),
72                     fOutputs(NULL),
73                     fCommonInput(NULL),
74                     fCommonOutput(NULL),
75                     fSelector(NULL),
76                     fGridHandler(NULL)
77 {
78 // Default constructor.
79    fgAnalysisManager = this;
80    fTasks      = new TObjArray();
81    fTopTasks   = new TObjArray();
82    fZombies    = new TObjArray();
83    fContainers = new TObjArray();
84    fInputs     = new TObjArray();
85    fOutputs    = new TObjArray();
86    SetEventLoop(kTRUE);
87 }
88
89 //______________________________________________________________________________
90 AliAnalysisManager::AliAnalysisManager(const AliAnalysisManager& other)
91                    :TNamed(other),
92                     fTree(NULL),
93                     fInputEventHandler(NULL),
94                     fOutputEventHandler(NULL),
95                     fMCtruthEventHandler(NULL),
96                     fEventPool(NULL),
97                     fCurrentEntry(-1),
98                     fNSysInfo(0),
99                     fMode(other.fMode),
100                     fInitOK(other.fInitOK),
101                     fDebug(other.fDebug),
102                     fSpecialOutputLocation(""), 
103                     fTasks(NULL),
104                     fTopTasks(NULL),
105                     fZombies(NULL),
106                     fContainers(NULL),
107                     fInputs(NULL),
108                     fOutputs(NULL),
109                     fCommonInput(NULL),
110                     fCommonOutput(NULL),
111                     fSelector(NULL),
112                     fGridHandler(NULL)
113 {
114 // Copy constructor.
115    fTasks      = new TObjArray(*other.fTasks);
116    fTopTasks   = new TObjArray(*other.fTopTasks);
117    fZombies    = new TObjArray(*other.fZombies);
118    fContainers = new TObjArray(*other.fContainers);
119    fInputs     = new TObjArray(*other.fInputs);
120    fOutputs    = new TObjArray(*other.fOutputs);
121    fgAnalysisManager = this;
122 }
123    
124 //______________________________________________________________________________
125 AliAnalysisManager& AliAnalysisManager::operator=(const AliAnalysisManager& other)
126 {
127 // Assignment
128    if (&other != this) {
129       TNamed::operator=(other);
130       fInputEventHandler   = other.fInputEventHandler;
131       fOutputEventHandler  = other.fOutputEventHandler;
132       fMCtruthEventHandler = other.fMCtruthEventHandler;
133       fEventPool           = other.fEventPool;
134       fTree       = NULL;
135       fCurrentEntry = -1;
136       fNSysInfo   = other.fNSysInfo;
137       fMode       = other.fMode;
138       fInitOK     = other.fInitOK;
139       fDebug      = other.fDebug;
140       fTasks      = new TObjArray(*other.fTasks);
141       fTopTasks   = new TObjArray(*other.fTopTasks);
142       fZombies    = new TObjArray(*other.fZombies);
143       fContainers = new TObjArray(*other.fContainers);
144       fInputs     = new TObjArray(*other.fInputs);
145       fOutputs    = new TObjArray(*other.fOutputs);
146       fCommonInput = NULL;
147       fCommonOutput = NULL;
148       fSelector   = NULL;
149       fGridHandler = NULL;
150       fgAnalysisManager = this;
151    }
152    return *this;
153 }
154
155 //______________________________________________________________________________
156 AliAnalysisManager::~AliAnalysisManager()
157 {
158 // Destructor.
159    if (fTasks) {fTasks->Delete(); delete fTasks;}
160    if (fTopTasks) delete fTopTasks;
161    if (fZombies) delete fZombies;
162    if (fContainers) {fContainers->Delete(); delete fContainers;}
163    if (fInputs) delete fInputs;
164    if (fOutputs) delete fOutputs;
165    if (fGridHandler) delete fGridHandler;
166    if (fgAnalysisManager==this) fgAnalysisManager = NULL;
167 }
168
169 //______________________________________________________________________________
170 Int_t AliAnalysisManager::GetEntry(Long64_t entry, Int_t getall)
171 {
172 // Read one entry of the tree or a whole branch.
173    if (fDebug > 0) printf("== AliAnalysisManager::GetEntry(%lld)\n", entry);
174    fCurrentEntry = entry;
175    return fTree ? fTree->GetTree()->GetEntry(entry, getall) : 0;
176 }
177    
178 //______________________________________________________________________________
179 Bool_t AliAnalysisManager::Init(TTree *tree)
180 {
181   // The Init() function is called when the selector needs to initialize
182   // a new tree or chain. Typically here the branch addresses of the tree
183   // will be set. It is normaly not necessary to make changes to the
184   // generated code, but the routine can be extended by the user if needed.
185   // Init() will be called many times when running with PROOF.
186    Bool_t init = kFALSE;
187    if (!tree) return kFALSE; // Should not happen - protected in selector caller
188    if (fDebug > 0) {
189       printf("->AliAnalysisManager::Init(%s)\n", tree->GetName());
190    }
191    // Call InitTree of EventHandler
192    if (fOutputEventHandler) {
193       if (fMode == kProofAnalysis) {
194          init = fOutputEventHandler->Init(0x0, "proof");
195       } else {
196          init = fOutputEventHandler->Init(0x0, "local");
197       }
198       if (!init) {
199          Error("Init", "Output event handler failed to initialize");
200          return kFALSE;
201       }         
202    }
203    
204    if (fInputEventHandler) {
205       if (fMode == kProofAnalysis) {
206          init = fInputEventHandler->Init(tree, "proof");
207       } else {
208          init = fInputEventHandler->Init(tree, "local");
209       }
210       if (!init) {
211          Error("Init", "Input event handler failed to initialize tree"); 
212          return kFALSE;
213       }         
214    } else {
215       // If no input event handler we need to get the tree once
216       // for the chain
217       if(!tree->GetTree()) {
218          Long64_t readEntry = tree->LoadTree(0);
219          if (readEntry == -2) {
220             Error("Init", "Input tree has no entry. Aborting");
221             return kFALSE;
222          }
223       }   
224    }
225
226    if (fMCtruthEventHandler) {
227       if (fMode == kProofAnalysis) {
228          init = fMCtruthEventHandler->Init(0x0, "proof");
229       } else {
230          init = fMCtruthEventHandler->Init(0x0, "local");
231       }
232       if (!init) {
233          Error("Init", "MC event handler failed to initialize"); 
234          return kFALSE;
235       }         
236    }
237
238    if (!fInitOK) InitAnalysis();
239    if (!fInitOK) return kFALSE;
240    fTree = tree;
241    AliAnalysisDataContainer *top = (AliAnalysisDataContainer*)fInputs->At(0);
242    if (!top) {
243       Error("Init","No top input container !");
244       return kFALSE;
245    }
246    top->SetData(tree);
247    if (fDebug > 0) {
248       printf("<-AliAnalysisManager::Init(%s)\n", tree->GetName());
249    }
250    return kTRUE;
251 }
252
253 //______________________________________________________________________________
254 void AliAnalysisManager::SlaveBegin(TTree *tree)
255 {
256   // The SlaveBegin() function is called after the Begin() function.
257   // When running with PROOF SlaveBegin() is called on each slave server.
258   // The tree argument is deprecated (on PROOF 0 is passed).
259    if (fDebug > 0) printf("->AliAnalysisManager::SlaveBegin()\n");
260    static Bool_t isCalled = kFALSE;
261    Bool_t init = kFALSE;
262    Bool_t initOK = kTRUE;
263    TString msg;
264    TDirectory *curdir = gDirectory;
265    // Call SlaveBegin only once in case of mixing
266    if (isCalled && fMode==kMixingAnalysis) return;
267    // Call Init of EventHandler
268    if (fOutputEventHandler) {
269       if (fMode == kProofAnalysis) {
270          TIter nextout(fOutputs);
271          AliAnalysisDataContainer *c_aod;
272          while ((c_aod=(AliAnalysisDataContainer*)nextout())) if (!strcmp(c_aod->GetFileName(),"default")) break;
273          if (c_aod && c_aod->IsSpecialOutput()) {
274             // Merging via files
275             if (fDebug > 1) printf("   Initializing special output file %s...\n", fOutputEventHandler->GetOutputFileName());
276             OpenProofFile(fOutputEventHandler->GetOutputFileName(), "RECREATE");
277             c_aod->SetFile(gFile);
278             init = fOutputEventHandler->Init("proofspecial");
279             if (!init) msg = "Failed to initialize output handler on worker using special proof output";
280          } else {
281             // Merging in memory
282             init = fOutputEventHandler->Init("proof");
283             if (!init) msg = "Failed to initialize output handler on worker";
284          }   
285       } else {
286          init = fOutputEventHandler->Init("local");
287          if (!init) msg = "Failed to initialize output handler on worker";
288       }
289       initOK &= init;
290       if (!fSelector) Error("SlaveBegin", "Selector not set");
291       else if (!init) {fSelector->Abort(msg); fSelector->SetStatus(-1);}
292    }
293
294    if (fInputEventHandler) {
295       fInputEventHandler->SetInputTree(tree);
296       if (fMode == kProofAnalysis) {
297          init = fInputEventHandler->Init("proof");
298          if (!init) msg = "Failed to initialize input handler on worker";
299       } else {
300          init = fInputEventHandler->Init("local");
301          if (!init) msg = "Failed to initialize input handler";
302       }
303       initOK &= init;
304       if (!fSelector) Error("SlaveBegin", "Selector not set");      
305       else if (!init) {fSelector->Abort(msg); fSelector->SetStatus(-1);}
306    }
307
308    if (fMCtruthEventHandler) {
309       if (fMode == kProofAnalysis) {
310          init = fMCtruthEventHandler->Init("proof");
311          if (!init) msg = "Failed to initialize MC handler on worker";
312       } else {
313          init = fMCtruthEventHandler->Init("local");
314          if (!init) msg = "Failed to initialize MC handler";
315       }
316       initOK &= init;
317       if (!fSelector) Error("SlaveBegin", "Selector not set");      
318       else if (!init) {fSelector->Abort(msg); fSelector->SetStatus(-1);}
319    }
320    if (curdir) curdir->cd();
321    isCalled = kTRUE;
322    if (!initOK) return;   
323    TIter next(fTasks);
324    AliAnalysisTask *task;
325    // Call CreateOutputObjects for all tasks
326    while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) {
327       curdir = gDirectory;
328       task->CreateOutputObjects();
329       if (curdir) curdir->cd();
330    }
331    if (fDebug > 0) printf("<-AliAnalysisManager::SlaveBegin()\n");
332 }
333
334 //______________________________________________________________________________
335 Bool_t AliAnalysisManager::Notify()
336 {
337    // The Notify() function is called when a new file is opened. This
338    // can be either for a new TTree in a TChain or when when a new TTree
339    // is started when using PROOF. It is normaly not necessary to make changes
340    // to the generated code, but the routine can be extended by the
341    // user if needed. The return value is currently not used.
342    if (!fTree) return kFALSE;
343
344    TFile *curfile = fTree->GetCurrentFile();
345    if (!curfile) {
346       Error("Notify","No current file");
347       return kFALSE;
348    }   
349    
350    if (fDebug > 0) printf("->AliAnalysisManager::Notify() file: %s\n", curfile->GetName());
351    TIter next(fTasks);
352    AliAnalysisTask *task;
353    // Call Notify for all tasks
354    while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) 
355       task->Notify();
356         
357    // Call Notify of the event handlers
358    if (fInputEventHandler) {
359        fInputEventHandler->Notify(curfile->GetName());
360    }
361
362    if (fOutputEventHandler) {
363        fOutputEventHandler->Notify(curfile->GetName());
364    }
365
366    if (fMCtruthEventHandler) {
367        fMCtruthEventHandler->Notify(curfile->GetName());
368    }
369    if (fDebug > 0) printf("<-AliAnalysisManager::Notify()\n");
370    return kTRUE;
371 }    
372
373 //______________________________________________________________________________
374 Bool_t AliAnalysisManager::Process(Long64_t entry)
375 {
376   // The Process() function is called for each entry in the tree (or possibly
377   // keyed object in the case of PROOF) to be processed. The entry argument
378   // specifies which entry in the currently loaded tree is to be processed.
379   // It can be passed to either TTree::GetEntry() or TBranch::GetEntry()
380   // to read either all or the required parts of the data. When processing
381   // keyed objects with PROOF, the object is already loaded and is available
382   // via the fObject pointer.
383   //
384   // This function should contain the "body" of the analysis. It can contain
385   // simple or elaborate selection criteria, run algorithms on the data
386   // of the event and typically fill histograms.
387
388   // WARNING when a selector is used with a TChain, you must use
389   //  the pointer to the current TTree to call GetEntry(entry).
390   //  The entry is always the local entry number in the current tree.
391   //  Assuming that fChain is the pointer to the TChain being processed,
392   //  use fChain->GetTree()->GetEntry(entry).
393    if (fDebug > 0) printf("->AliAnalysisManager::Process(%lld)\n", entry);
394
395    if (fInputEventHandler)   fInputEventHandler  ->BeginEvent(entry);
396    if (fOutputEventHandler)  fOutputEventHandler ->BeginEvent(entry);
397    if (fMCtruthEventHandler) fMCtruthEventHandler->BeginEvent(entry);
398    
399    GetEntry(entry);
400    ExecAnalysis();
401    if (fDebug > 0) printf("<-AliAnalysisManager::Process()\n");
402    return kTRUE;
403 }
404
405 //______________________________________________________________________________
406 void AliAnalysisManager::PackOutput(TList *target)
407 {
408   // Pack all output data containers in the output list. Called at SlaveTerminate
409   // stage in PROOF case for each slave.
410    if (fDebug > 0) printf("->AliAnalysisManager::PackOutput()\n");
411    if (!target) {
412       Error("PackOutput", "No target. Aborting.");
413       return;
414    }
415    if (fInputEventHandler)   fInputEventHandler  ->Terminate();
416    if (fOutputEventHandler)  fOutputEventHandler ->Terminate();
417    if (fMCtruthEventHandler) fMCtruthEventHandler->Terminate();
418
419    // Call FinishTaskOutput() for each event loop task (not called for 
420    // post-event loop tasks - use Terminate() fo those)
421    TIter nexttask(fTasks);
422    AliAnalysisTask *task;
423    while ((task=(AliAnalysisTask*)nexttask())) {
424       if (!task->IsPostEventLoop()) {
425          if (fDebug > 0) printf("->FinishTaskOutput: task %s\n", task->GetName());
426          task->FinishTaskOutput();
427          if (fDebug > 0) printf("<-FinishTaskOutput: task %s\n", task->GetName());
428       }
429    }      
430    
431    if (fMode == kProofAnalysis) {
432       TIter next(fOutputs);
433       AliAnalysisDataContainer *output;
434       Bool_t isManagedByHandler = kFALSE;
435       while ((output=(AliAnalysisDataContainer*)next())) {
436          // Do not consider outputs of post event loop tasks
437          isManagedByHandler = kFALSE;
438          if (output->GetProducer()->IsPostEventLoop()) continue;
439          const char *filename = output->GetFileName();
440          if (!(strcmp(filename, "default")) && fOutputEventHandler) {
441             isManagedByHandler = kTRUE;
442             filename = fOutputEventHandler->GetOutputFileName();
443          }
444          // Check if data was posted to this container. If not, issue an error.
445          if (!output->GetData() && !isManagedByHandler) {
446             Error("PackOutput", "No data for output container %s. Forgot to PostData ?\n", output->GetName());
447             continue;
448          }   
449          if (!output->IsSpecialOutput()) {
450             // Normal outputs
451             if (strlen(filename) && !isManagedByHandler) {
452                // File resident outputs
453                TFile *file = output->GetFile();
454                // Backup current folder
455                TDirectory *opwd = gDirectory;
456                // Create file if not existing and register to container.
457                if (file) file->cd();
458                else      file = new TFile(filename, "RECREATE"); 
459                if (file->IsZombie()) {
460                   Fatal("PackOutput", "Could not recreate file %s\n", filename);
461                   return;
462                }   
463                output->SetFile(file);
464                // Clear file list to release object ownership to user.
465                file->Clear();
466                // Save data to file, then close.
467                if (output->GetData()->InheritsFrom(TCollection::Class())) {
468                   // If data is a collection, we set the name of the collection 
469                   // as the one of the container and we save as a single key.
470                   TCollection *coll = (TCollection*)output->GetData();
471                   coll->SetName(output->GetName());
472                   coll->Write(output->GetName(), TObject::kSingleKey);
473                } else {
474                   if (output->GetData()->InheritsFrom(TTree::Class())) {
475                      TTree *tree = (TTree*)output->GetData();
476                      tree->SetDirectory(file);
477                      tree->AutoSave();
478                   } else {
479                      output->GetData()->Write();
480                   }   
481                }      
482                if (fDebug > 1) printf("PackOutput %s: memory merge, file resident output\n", output->GetName());
483                if (fDebug > 2) {
484                   printf("   file %s listing content:\n", filename);
485                   file->ls();
486                }   
487                file->Close();
488                // Restore current directory
489                if (opwd) opwd->cd();
490             } else {
491                // Memory-resident outputs   
492                if (fDebug > 1) printf("PackOutput %s: memory merge memory resident output\n", filename);
493             }   
494             AliAnalysisDataWrapper *wrap = 0;
495             if (isManagedByHandler) {
496                wrap = new AliAnalysisDataWrapper(fOutputEventHandler->GetTree());
497                wrap->SetName(output->GetName());
498             }   
499             else                    wrap =output->ExportData();
500             // Output wrappers must NOT delete data after merging - the user owns them
501             wrap->SetDeleteData(kFALSE);
502             target->Add(wrap);
503          } else {
504          // Special outputs
505             TDirectory *opwd = gDirectory;
506             TFile *file = output->GetFile();
507             if (fDebug > 1 && file) printf("PackOutput %s: file merge, special output\n", output->GetName());
508             if (isManagedByHandler) {
509                // Terminate IO for files managed by the output handler
510                if (file) file->Write();
511                if (file && fDebug > 2) {
512                   printf("   handled file %s listing content:\n", file->GetName());
513                   file->ls();
514                }   
515                fOutputEventHandler->TerminateIO();
516                continue;
517             }   
518             
519             if (!file) {
520                AliAnalysisTask *producer = output->GetProducer();
521                Error("PackOutput", 
522                      "File %s for special container %s was NOT opened in %s::CreateOutputObjects !!!",
523                      output->GetFileName(), output->GetName(), producer->ClassName());
524                continue;
525             }   
526             file->cd();
527             // Release object ownership to users after writing data to file
528             if (output->GetData()->InheritsFrom(TCollection::Class())) {
529                // If data is a collection, we set the name of the collection 
530                // as the one of the container and we save as a single key.
531                TCollection *coll = (TCollection*)output->GetData();
532                coll->SetName(output->GetName());
533                coll->Write(output->GetName(), TObject::kSingleKey);
534             } else {
535                if (output->GetData()->InheritsFrom(TTree::Class())) {
536                   TTree *tree = (TTree*)output->GetData();
537                   tree->SetDirectory(file);
538                   tree->AutoSave();
539                } else {
540                   output->GetData()->Write();
541                }   
542             }      
543             file->Clear();
544             if (fDebug > 2) {
545                printf("   file %s listing content:\n", output->GetFileName());
546                file->ls();
547             }
548             TString outFilename = file->GetName();
549             file->Close();
550             // Restore current directory
551             if (opwd) opwd->cd();
552             // Check if a special output location was provided or the output files have to be merged
553             if (strlen(fSpecialOutputLocation.Data())) {
554                TString remote = fSpecialOutputLocation;
555                remote += "/";
556                Int_t gid = gROOT->ProcessLine("gProofServ->GetGroupId();");
557                remote += Form("%s_%d_", gSystem->HostName(), gid);
558                remote += output->GetFileName();
559                TFile::Cp ( outFilename.Data(), remote.Data() );
560             } else {
561             // No special location specified-> use TProofOutputFile as merging utility
562             // The file at this output slot must be opened in CreateOutputObjects
563                if (fDebug > 1) printf("   File %s to be merged...\n", output->GetFileName());
564             }
565          }      
566       }
567    } 
568    if (fDebug > 0) printf("<-AliAnalysisManager::PackOutput: output list contains %d containers\n", target->GetSize());
569 }
570
571 //______________________________________________________________________________
572 void AliAnalysisManager::ImportWrappers(TList *source)
573 {
574 // Import data in output containers from wrappers coming in source.
575    if (fDebug > 0) printf("->AliAnalysisManager::ImportWrappers()\n");
576    TIter next(fOutputs);
577    AliAnalysisDataContainer *cont;
578    AliAnalysisDataWrapper   *wrap;
579    Int_t icont = 0;
580    Bool_t inGrid = (fMode == kGridAnalysis)?kTRUE:kFALSE;
581    while ((cont=(AliAnalysisDataContainer*)next())) {
582       wrap = 0;
583       if (cont->GetProducer()->IsPostEventLoop() && !inGrid) continue;
584       const char *filename = cont->GetFileName();
585       Bool_t isManagedByHandler = kFALSE;
586       if (!(strcmp(filename, "default")) && fOutputEventHandler) {
587          isManagedByHandler = kTRUE;
588          filename = fOutputEventHandler->GetOutputFileName();
589       }
590       if (cont->IsSpecialOutput() || inGrid) {
591          if (strlen(fSpecialOutputLocation.Data()) && !isManagedByHandler) continue;
592          // Copy merged file from PROOF scratch space. 
593          // In case of grid the files are already in the current directory.
594          if (!inGrid) {
595             char full_path[512];
596             char ch_url[512];
597             TObject *pof =  source->FindObject(filename);
598             if (!pof || !pof->InheritsFrom("TProofOutputFile")) {
599                Error("ImportWrappers", "TProofOutputFile object not found in output list for container %s", cont->GetName());
600                continue;
601             }
602             gROOT->ProcessLine(Form("sprintf((char*)0x%lx, \"%%s\", ((TProofOutputFile*)0x%lx)->GetOutputFileName();)", full_path, pof));
603             gROOT->ProcessLine(Form("sprintf((char*)0x%lx, \"%%s\", gProof->GetUrl();)", ch_url));
604             TString clientUrl(ch_url);
605             TString full_path_str(full_path);
606             if (clientUrl.Contains("localhost")){
607                TObjArray* array = full_path_str.Tokenize ( "//" );
608                TObjString *strobj = ( TObjString *)array->At(1);
609                TObjArray* arrayPort = strobj->GetString().Tokenize ( ":" );
610                TObjString *strobjPort = ( TObjString *) arrayPort->At(1);
611                full_path_str.ReplaceAll(strobj->GetString().Data(),"localhost:PORT");
612                full_path_str.ReplaceAll(":PORT",Form(":%s",strobjPort->GetString().Data()));
613                if (fDebug > 1) Info("ImportWrappers","Using tunnel from %s to %s",full_path_str.Data(),filename);
614             }
615             if (fDebug > 1) 
616                printf("   Copying file %s from PROOF scratch space\n", full_path_str.Data());
617             Bool_t gotit = TFile::Cp(full_path_str.Data(), filename); 
618             if (!gotit) {
619                Error("ImportWrappers", "Could not get file %s from proof scratch space", cont->GetFileName());
620                continue;
621             }
622          }   
623          // Normally we should connect data from the copied file to the
624          // corresponding output container, but it is not obvious how to do this
625          // automatically if several objects in file...
626          TFile *f = TFile::Open(filename, "READ");
627          if (!f) {
628             Error("ImportWrappers", "Cannot open file %s in read-only mode", filename);
629             continue;
630          }   
631          TObject *obj = 0;
632          // Try to fetch first a list object having the container name.
633          obj = f->Get(cont->GetName());
634          if (!obj) {
635          // Fetch first object from file having the container type.
636             TIter nextkey(f->GetListOfKeys());
637             TKey *key;
638             while ((key=(TKey*)nextkey())) {
639                obj = f->Get(key->GetName());
640                if (obj && obj->IsA()->InheritsFrom(cont->GetType())) break;
641             }                     
642          }
643          if (!obj) {
644             Error("ImportWrappers", "Could not find object for container %s in file %s", cont->GetName(), filename);
645             continue;
646          }  
647          wrap = new AliAnalysisDataWrapper(obj);
648          wrap->SetDeleteData(kFALSE);
649       }   
650       if (!wrap) wrap = (AliAnalysisDataWrapper*)source->FindObject(cont->GetName());
651       if (!wrap) {
652          Error("ImportWrappers","Container %s not found in analysis output !", cont->GetName());
653          continue;
654       }
655       icont++;
656       if (fDebug > 1) {
657          printf("   Importing data for container %s", cont->GetName());
658          if (strlen(filename)) printf("    -> file %s\n", filename);
659          else printf("\n");
660       }   
661       cont->ImportData(wrap);
662    }         
663    if (fDebug > 0) printf("<-AliAnalysisManager::ImportWrappers(): %d containers imported\n", icont);
664 }
665
666 //______________________________________________________________________________
667 void AliAnalysisManager::UnpackOutput(TList *source)
668 {
669   // Called by AliAnalysisSelector::Terminate only on the client.
670    if (fDebug > 0) printf("->AliAnalysisManager::UnpackOutput()\n");
671    if (!source) {
672       Error("UnpackOutput", "No target. Aborting.");
673       return;
674    }
675    if (fDebug > 1) printf("   Source list contains %d containers\n", source->GetSize());
676
677    if (fMode == kProofAnalysis) ImportWrappers(source);
678
679    TIter next(fOutputs);
680    AliAnalysisDataContainer *output;
681    while ((output=(AliAnalysisDataContainer*)next())) {
682       if (!output->GetData()) continue;
683       // Check if there are client tasks that run post event loop
684       if (output->HasConsumers()) {
685          // Disable event loop semaphore
686          output->SetPostEventLoop(kTRUE);
687          TObjArray *list = output->GetConsumers();
688          Int_t ncons = list->GetEntriesFast();
689          for (Int_t i=0; i<ncons; i++) {
690             AliAnalysisTask *task = (AliAnalysisTask*)list->At(i);
691             task->CheckNotify(kTRUE);
692             // If task is active, execute it
693             if (task->IsPostEventLoop() && task->IsActive()) {
694                if (fDebug > 0) printf("== Executing post event loop task %s\n", task->GetName());
695                task->ExecuteTask();
696             }   
697          }
698       }   
699    }
700    if (fDebug > 0) printf("<-AliAnalysisManager::UnpackOutput()\n");
701 }
702
703 //______________________________________________________________________________
704 void AliAnalysisManager::Terminate()
705 {
706   // The Terminate() function is the last function to be called during
707   // a query. It always runs on the client, it can be used to present
708   // the results graphically.
709    if (fDebug > 0) printf("->AliAnalysisManager::Terminate()\n");
710    AliAnalysisTask *task;
711    TIter next(fTasks);
712    // Call Terminate() for tasks
713    while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) task->Terminate();
714    //
715    TIter next1(fOutputs);
716    AliAnalysisDataContainer *output;
717    while ((output=(AliAnalysisDataContainer*)next1())) {
718       // Special outputs or grid files have the files already closed and written.
719       if (fMode == kGridAnalysis) continue;
720       if (output->IsSpecialOutput()&&(fMode == kProofAnalysis)) continue;
721       const char *filename = output->GetFileName();
722       if (!(strcmp(filename, "default"))) {
723          if (fOutputEventHandler) filename = fOutputEventHandler->GetOutputFileName();
724          TFile *aodfile = (TFile*)gROOT->GetListOfFiles()->FindObject(filename);
725          if (aodfile) {
726             if (fDebug > 1) printf("Writing output handler file: %s\n", filename);
727             aodfile->Write();
728             continue;
729          }   
730       }      
731       if (!strlen(filename)) continue;
732       if (!output->GetData()) continue;
733       TFile *file = output->GetFile();
734       TDirectory *opwd = gDirectory;
735       file = (TFile*)gROOT->GetListOfFiles()->FindObject(filename);
736       if (!file) file = new TFile(filename, "RECREATE");
737       if (file->IsZombie()) continue;
738       output->SetFile(file);
739       file->cd();
740       if (fDebug > 1) printf("   writing output data %s to file %s\n", output->GetData()->GetName(), file->GetName());
741       if (output->GetData()->InheritsFrom(TCollection::Class())) {
742       // If data is a collection, we set the name of the collection 
743       // as the one of the container and we save as a single key.
744          TCollection *coll = (TCollection*)output->GetData();
745          coll->SetName(output->GetName());
746          coll->Write(output->GetName(), TObject::kSingleKey);
747       } else {
748          if (output->GetData()->InheritsFrom(TTree::Class())) {
749             TTree *tree = (TTree*)output->GetData();
750             tree->SetDirectory(file);
751             tree->AutoSave();
752          } else {
753             output->GetData()->Write();
754          }   
755       }      
756       if (opwd) opwd->cd();
757    }   
758    next1.Reset();
759    while ((output=(AliAnalysisDataContainer*)next1())) {
760       // Close all files at output
761       TDirectory *opwd = gDirectory;
762       if (output->GetFile()) output->GetFile()->Close();
763       if (opwd) opwd->cd();
764    }   
765
766    if (fInputEventHandler)   fInputEventHandler  ->TerminateIO();
767    if (fOutputEventHandler)  fOutputEventHandler ->TerminateIO();
768    if (fMCtruthEventHandler) fMCtruthEventHandler->TerminateIO();
769
770    Bool_t getsysInfo = ((fNSysInfo>0) && (fMode==kLocalAnalysis))?kTRUE:kFALSE;
771    if (getsysInfo) {
772       TDirectory *cdir = gDirectory;
773       TFile f("syswatch.root", "RECREATE");
774       if (!f.IsZombie()) {
775          TTree *tree = AliSysInfo::MakeTree("syswatch.log");
776          tree->SetMarkerStyle(kCircle);
777          tree->SetMarkerColor(kBlue);
778          tree->SetMarkerSize(0.5);
779          if (!gROOT->IsBatch()) {
780             tree->SetAlias("event", "id0");
781             tree->SetAlias("memUSED", "mi.fMemUsed");
782             new TCanvas("SysInfo","SysInfo",10,10,800,600);
783             tree->Draw("memUSED:event","","", 1234567890, 0);
784          }   
785          tree->Write();
786          f.Close();
787          delete tree;
788       }
789       if (cdir) cdir->cd();
790    }      
791    if (fDebug > 0) printf("<-AliAnalysisManager::Terminate()\n");
792 }
793
794 //______________________________________________________________________________
795 void AliAnalysisManager::AddTask(AliAnalysisTask *task)
796 {
797 // Adds a user task to the global list of tasks.
798    if (fTasks->FindObject(task)) {
799       Warning("AddTask", "Task %s: the same object already added to the analysis manager. Not adding.", task->GetName());
800       return;
801    }   
802    task->SetActive(kFALSE);
803    fTasks->Add(task);
804 }  
805
806 //______________________________________________________________________________
807 AliAnalysisTask *AliAnalysisManager::GetTask(const char *name) const
808 {
809 // Retreive task by name.
810    if (!fTasks) return NULL;
811    return (AliAnalysisTask*)fTasks->FindObject(name);
812 }
813
814 //______________________________________________________________________________
815 AliAnalysisDataContainer *AliAnalysisManager::CreateContainer(const char *name, 
816                                 TClass *datatype, EAliAnalysisContType type, const char *filename)
817 {
818 // Create a data container of a certain type. Types can be:
819 //   kExchangeContainer  = 0, used to exchange date between tasks
820 //   kInputContainer   = 1, used to store input data
821 //   kOutputContainer  = 2, used for posting results
822    if (fContainers->FindObject(name)) {
823       Error("CreateContainer","A container named %s already defined !\n",name);
824       return NULL;
825    }   
826    AliAnalysisDataContainer *cont = new AliAnalysisDataContainer(name, datatype);
827    fContainers->Add(cont);
828    switch (type) {
829       case kInputContainer:
830          fInputs->Add(cont);
831          break;
832       case kOutputContainer:
833          fOutputs->Add(cont);
834          if (filename && strlen(filename)) {
835             cont->SetFileName(filename);
836             cont->SetDataOwned(kFALSE);  // data owned by the file
837          }   
838          break;
839       case kExchangeContainer:
840          break;   
841    }
842    return cont;
843 }
844          
845 //______________________________________________________________________________
846 Bool_t AliAnalysisManager::ConnectInput(AliAnalysisTask *task, Int_t islot,
847                                         AliAnalysisDataContainer *cont)
848 {
849 // Connect input of an existing task to a data container.
850    if (!task) {
851       Error("ConnectInput", "Task pointer is NULL");
852       return kFALSE;
853    }   
854    if (!fTasks->FindObject(task)) {
855       AddTask(task);
856       Info("ConnectInput", "Task %s was not registered. Now owned by analysis manager", task->GetName());
857    } 
858    Bool_t connected = task->ConnectInput(islot, cont);
859    return connected;
860 }   
861
862 //______________________________________________________________________________
863 Bool_t AliAnalysisManager::ConnectOutput(AliAnalysisTask *task, Int_t islot,
864                                         AliAnalysisDataContainer *cont)
865 {
866 // Connect output of an existing task to a data container.
867    if (!task) {
868       Error("ConnectOutput", "Task pointer is NULL");
869       return kFALSE;
870    }   
871    if (!fTasks->FindObject(task)) {
872       AddTask(task);
873       Warning("ConnectOutput", "Task %s not registered. Now owned by analysis manager", task->GetName());
874    } 
875    Bool_t connected = task->ConnectOutput(islot, cont);
876    return connected;
877 }   
878                                
879 //______________________________________________________________________________
880 void AliAnalysisManager::CleanContainers()
881 {
882 // Clean data from all containers that have already finished all client tasks.
883    TIter next(fContainers);
884    AliAnalysisDataContainer *cont;
885    while ((cont=(AliAnalysisDataContainer *)next())) {
886       if (cont->IsOwnedData() && 
887           cont->IsDataReady() && 
888           cont->ClientsExecuted()) cont->DeleteData();
889    }
890 }
891
892 //______________________________________________________________________________
893 Bool_t AliAnalysisManager::InitAnalysis()
894 {
895 // Initialization of analysis chain of tasks. Should be called after all tasks
896 // and data containers are properly connected
897    // Check for input/output containers
898    fInitOK = kFALSE;
899    // Check for top tasks (depending only on input data containers)
900    if (!fTasks->First()) {
901       Error("InitAnalysis", "Analysis has no tasks !");
902       return kFALSE;
903    }   
904    TIter next(fTasks);
905    AliAnalysisTask *task;
906    AliAnalysisDataContainer *cont;
907    Int_t ntop = 0;
908    Int_t nzombies = 0;
909    Bool_t iszombie = kFALSE;
910    Bool_t istop = kTRUE;
911    Int_t i;
912    while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) {
913       istop = kTRUE;
914       iszombie = kFALSE;
915       Int_t ninputs = task->GetNinputs();
916       for (i=0; i<ninputs; i++) {
917          cont = task->GetInputSlot(i)->GetContainer();
918          if (!cont) {
919             if (!iszombie) {
920                task->SetZombie();
921                fZombies->Add(task);
922                nzombies++;
923                iszombie = kTRUE;
924             }   
925             Error("InitAnalysis", "Input slot %d of task %s has no container connected ! Declared zombie...", 
926                   i, task->GetName()); 
927          }
928          if (iszombie) continue;
929          // Check if cont is an input container
930          if (istop && !fInputs->FindObject(cont)) istop=kFALSE;
931          // Connect to parent task
932       }
933       if (istop) {
934          ntop++;
935          fTopTasks->Add(task);
936       }
937    }
938    if (!ntop) {
939       Error("InitAnalysis", "No top task defined. At least one task should be connected only to input containers");
940       return kFALSE;
941    }                        
942    // Check now if there are orphan tasks
943    for (i=0; i<ntop; i++) {
944       task = (AliAnalysisTask*)fTopTasks->At(i);
945       task->SetUsed();
946    }
947    Int_t norphans = 0;
948    next.Reset();
949    while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) {
950       if (!task->IsUsed()) {
951          norphans++;
952          Warning("InitAnalysis", "Task %s is orphan", task->GetName());
953       }   
954    }          
955    // Check the task hierarchy (no parent task should depend on data provided
956    // by a daughter task)
957    for (i=0; i<ntop; i++) {
958       task = (AliAnalysisTask*)fTopTasks->At(i);
959       if (task->CheckCircularDeps()) {
960          Error("InitAnalysis", "Found illegal circular dependencies between following tasks:");
961          PrintStatus("dep");
962          return kFALSE;
963       }   
964    }
965    // Check that all containers feeding post-event loop tasks are in the outputs list
966    TIter nextcont(fContainers); // loop over all containers
967    while ((cont=(AliAnalysisDataContainer*)nextcont())) {
968       if (!cont->IsPostEventLoop() && !fOutputs->FindObject(cont)) {
969          if (cont->HasConsumers()) {
970          // Check if one of the consumers is post event loop
971             TIter nextconsumer(cont->GetConsumers());
972             while ((task=(AliAnalysisTask*)nextconsumer())) {
973                if (task->IsPostEventLoop()) {
974                   fOutputs->Add(cont);
975                   break;
976                }
977             }
978          }
979       }
980    }   
981    // Check if all special output containers have a file name provided
982    TIter nextout(fOutputs);
983    while ((cont=(AliAnalysisDataContainer*)nextout())) {
984       if (cont->IsSpecialOutput() && !strlen(cont->GetFileName())) {
985          Error("InitAnalysis", "Wrong container %s : a file name MUST be provided for special outputs", cont->GetName());
986          return kFALSE;
987       }
988    }      
989    fInitOK = kTRUE;
990    return kTRUE;
991 }   
992
993 //______________________________________________________________________________
994 void AliAnalysisManager::PrintStatus(Option_t *option) const
995 {
996 // Print task hierarchy.
997    if (!fInitOK) {
998       Info("PrintStatus", "Analysis manager %s not initialized : call InitAnalysis() first", GetName());
999       return;
1000    }   
1001    Bool_t getsysInfo = ((fNSysInfo>0) && (fMode==kLocalAnalysis))?kTRUE:kFALSE;
1002    if (getsysInfo)
1003       Info("PrintStatus", "System information will be collected each %lld events", fNSysInfo);
1004    TIter next(fTopTasks);
1005    AliAnalysisTask *task;
1006    while ((task=(AliAnalysisTask*)next()))
1007       task->PrintTask(option);
1008 }
1009
1010 //______________________________________________________________________________
1011 void AliAnalysisManager::ResetAnalysis()
1012 {
1013 // Reset all execution flags and clean containers.
1014    CleanContainers();
1015 }
1016
1017 //______________________________________________________________________________
1018 void AliAnalysisManager::StartAnalysis(const char *type, TTree *tree, Long64_t nentries, Long64_t firstentry)
1019 {
1020 // Start analysis for this manager. Analysis task can be: LOCAL, PROOF, GRID or
1021 // MIX. Process nentries starting from firstentry
1022    if (!fInitOK) {
1023       Error("StartAnalysis","Analysis manager was not initialized !");
1024       return;
1025    }
1026    if (fDebug > 0) printf("StartAnalysis %s\n",GetName());
1027    TString anaType = type;
1028    anaType.ToLower();
1029    fMode = kLocalAnalysis;
1030    Bool_t runlocalinit = kTRUE;
1031    if (anaType.Contains("file")) runlocalinit = kFALSE;
1032    if (anaType.Contains("proof"))     fMode = kProofAnalysis;
1033    else if (anaType.Contains("grid")) fMode = kGridAnalysis;
1034    else if (anaType.Contains("mix"))  fMode = kMixingAnalysis;
1035
1036    if (fMode == kGridAnalysis) {
1037       if (!fGridHandler) {
1038          Error("StartAnalysis", "Cannot start grid analysis without a grid handler.");
1039          Info("===", "Add an AliAnalysisAlien object as plugin for this manager and configure it.");
1040          return;
1041       }
1042       // Write analysis manager in the analysis file
1043       cout << "===== RUNNING GRID ANALYSIS: " << GetName() << endl;
1044       // run local task configuration
1045       TIter nextTask(fTasks);
1046       AliAnalysisTask *task;
1047       while ((task=(AliAnalysisTask*)nextTask())) {
1048          task->LocalInit();
1049       }
1050       fGridHandler->StartAnalysis(nentries, firstentry);
1051
1052       // Terminate grid analysis
1053       if (fSelector && fSelector->GetStatus() == -1) return;
1054       if (fGridHandler->GetRunMode() == AliAnalysisGrid::kOffline) return;
1055       cout << "===== MERGING OUTPUTS REGISTERED BY YOUR ANALYSIS JOB: " << GetName() << endl;
1056       if (!fGridHandler->MergeOutputs()) {
1057          // Return if outputs could not be merged or if it alien handler
1058          // was configured for offline mode or local testing.
1059          return;
1060       }
1061       ImportWrappers(NULL);
1062       Terminate();
1063       return;
1064    }
1065    char line[256];
1066    SetEventLoop(kFALSE);
1067    // Enable event loop mode if a tree was provided
1068    if (tree || fMode==kMixingAnalysis) SetEventLoop(kTRUE);
1069
1070    TChain *chain = 0;
1071    TString ttype = "TTree";
1072    if (tree && tree->IsA() == TChain::Class()) {
1073       chain = (TChain*)tree;
1074       if (!chain || !chain->GetListOfFiles()->First()) {
1075          Error("StartAnalysis", "Cannot process null or empty chain...");
1076          return;
1077       }   
1078       ttype = "TChain";
1079    }   
1080
1081    // Initialize locally all tasks (happens for all modes)
1082    TIter next(fTasks);
1083    AliAnalysisTask *task;
1084    if (runlocalinit) {
1085       while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) {
1086          task->LocalInit();
1087       }
1088    }   
1089    
1090    switch (fMode) {
1091       case kLocalAnalysis:
1092          if (!tree) {
1093             TIter nextT(fTasks);
1094             // Call CreateOutputObjects for all tasks
1095             while ((task=(AliAnalysisTask*)nextT())) {
1096                TDirectory *curdir = gDirectory;
1097                task->CreateOutputObjects();
1098                if (curdir) curdir->cd();
1099             }   
1100             ExecAnalysis();
1101             Terminate();
1102             return;
1103          } 
1104          // Run tree-based analysis via AliAnalysisSelector  
1105          cout << "===== RUNNING LOCAL ANALYSIS " << GetName() << " ON TREE " << tree->GetName() << endl;
1106          fSelector = new AliAnalysisSelector(this);
1107          tree->Process(fSelector, "", nentries, firstentry);
1108          break;
1109       case kProofAnalysis:
1110          if (!gROOT->GetListOfProofs() || !gROOT->GetListOfProofs()->GetEntries()) {
1111             printf("StartAnalysis: no PROOF!!!\n");
1112             return;
1113          }   
1114          sprintf(line, "gProof->AddInput((TObject*)0x%lx);", (ULong_t)this);
1115          gROOT->ProcessLine(line);
1116          if (chain) {
1117             chain->SetProof();
1118             cout << "===== RUNNING PROOF ANALYSIS " << GetName() << " ON CHAIN " << chain->GetName() << endl;
1119             chain->Process("AliAnalysisSelector", "", nentries, firstentry);
1120          } else {
1121             printf("StartAnalysis: no chain\n");
1122             return;
1123          }      
1124          break;
1125       case kGridAnalysis:
1126          Warning("StartAnalysis", "GRID analysis mode not implemented. Running local.");
1127          break;
1128       case kMixingAnalysis:   
1129          // Run event mixing analysis
1130          if (!fEventPool) {
1131             Error("StartAnalysis", "Cannot run event mixing without event pool");
1132             return;
1133          }
1134          cout << "===== RUNNING EVENT MIXING ANALYSIS " << GetName() << endl;
1135          fSelector = new AliAnalysisSelector(this);
1136          while ((chain=fEventPool->GetNextChain())) {
1137             next.Reset();
1138             // Call NotifyBinChange for all tasks
1139             while ((task=(AliAnalysisTask*)next()))
1140                if (!task->IsPostEventLoop()) task->NotifyBinChange();
1141             chain->Process(fSelector);
1142          }
1143          PackOutput(fSelector->GetOutputList());
1144          Terminate();
1145    }   
1146 }   
1147
1148 //______________________________________________________________________________
1149 void AliAnalysisManager::StartAnalysis(const char *type, const char *dataset, Long64_t nentries, Long64_t firstentry)
1150 {
1151 // Start analysis for this manager on a given dataset. Analysis task can be: 
1152 // LOCAL, PROOF or GRID. Process nentries starting from firstentry.
1153    if (!fInitOK) {
1154       Error("StartAnalysis","Analysis manager was not initialized !");
1155       return;
1156    }
1157    if (fDebug > 0) printf("StartAnalysis %s\n",GetName());
1158    TString anaType = type;
1159    anaType.ToLower();
1160    if (!anaType.Contains("proof")) {
1161       Error("StartAnalysis", "Cannot process datasets in %s mode. Try PROOF.", type);
1162       return;
1163    }   
1164    fMode = kProofAnalysis;
1165    char line[256];
1166    SetEventLoop(kTRUE);
1167    // Set the dataset flag
1168    TObject::SetBit(kUseDataSet);
1169    fTree = 0;
1170
1171    // Initialize locally all tasks
1172    TIter next(fTasks);
1173    AliAnalysisTask *task;
1174    while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) {
1175       task->LocalInit();
1176    }
1177    
1178    if (!gROOT->GetListOfProofs() || !gROOT->GetListOfProofs()->GetEntries()) {
1179       printf("StartAnalysis: no PROOF!!!\n");
1180       return;
1181    }   
1182    sprintf(line, "gProof->AddInput((TObject*)0x%lx);", (ULong_t)this);
1183    gROOT->ProcessLine(line);
1184    sprintf(line, "gProof->GetDataSet(\"%s\");", dataset);
1185    if (!gROOT->ProcessLine(line)) {
1186       Error("StartAnalysis", "Dataset %s not found", dataset);
1187       return;
1188    }   
1189    sprintf(line, "gProof->Process(\"%s\", \"AliAnalysisSelector\", \"\", %lld, %lld);",
1190            dataset, nentries, firstentry);
1191    cout << "===== RUNNING PROOF ANALYSIS " << GetName() << " ON DATASET " << dataset << endl;
1192    gROOT->ProcessLine(line);
1193 }   
1194
1195 //______________________________________________________________________________
1196 TFile *AliAnalysisManager::OpenProofFile(const char *filename, const char *option)
1197 {
1198 // Opens a special output file used in PROOF.
1199    char line[256];
1200    if (fMode!=kProofAnalysis || !fSelector) {
1201       Error("OpenProofFile","Cannot open PROOF file %s",filename);
1202       return NULL;
1203    }   
1204    sprintf(line, "TProofOutputFile *pf = new TProofOutputFile(\"%s\");", filename);
1205    if (fDebug > 1) printf("=== %s\n", line);
1206    gROOT->ProcessLine(line);
1207    sprintf(line, "pf->OpenFile(\"%s\");", option);
1208    gROOT->ProcessLine(line);
1209    if (fDebug > 1) {
1210       gROOT->ProcessLine("pf->Print()");
1211       printf(" == proof file name: %s\n", gFile->GetName());
1212    }   
1213    sprintf(line, "((TList*)0x%lx)->Add(pf);",(ULong_t)fSelector->GetOutputList());
1214    if (fDebug > 1) printf("=== %s\n", line);
1215    gROOT->ProcessLine(line);
1216    return gFile;
1217 }   
1218
1219 //______________________________________________________________________________
1220 void AliAnalysisManager::ExecAnalysis(Option_t *option)
1221 {
1222 // Execute analysis.
1223    static Long64_t ncalls = 0;
1224    Bool_t getsysInfo = ((fNSysInfo>0) && (fMode==kLocalAnalysis))?kTRUE:kFALSE;
1225    if (getsysInfo && ncalls==0) AliSysInfo::AddStamp("Start", (Int_t)ncalls);
1226    ncalls++;
1227    if (!fInitOK) {
1228      Error("ExecAnalysis", "Analysis manager was not initialized !");
1229       return;
1230    }   
1231    AliAnalysisTask *task;
1232    // Check if the top tree is active.
1233    if (fTree) {
1234       TIter next(fTasks);
1235    // De-activate all tasks
1236       while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) task->SetActive(kFALSE);
1237       AliAnalysisDataContainer *cont = (AliAnalysisDataContainer*)fInputs->At(0);
1238       if (!cont) {
1239               Error("ExecAnalysis","Cannot execute analysis in TSelector mode without at least one top container");
1240          return;
1241       }   
1242       cont->SetData(fTree); // This will notify all consumers
1243       Long64_t entry = fTree->GetTree()->GetReadEntry();
1244       
1245 //
1246 //    Call BeginEvent() for optional input/output and MC services 
1247       if (fInputEventHandler)   fInputEventHandler  ->BeginEvent(entry);
1248       if (fOutputEventHandler)  fOutputEventHandler ->BeginEvent(entry);
1249       if (fMCtruthEventHandler) fMCtruthEventHandler->BeginEvent(entry);
1250 //
1251 //    Execute the tasks
1252 //      TIter next1(cont->GetConsumers());
1253       TIter next1(fTopTasks);
1254       while ((task=(AliAnalysisTask*)next1())) {
1255          if (fDebug >1) {
1256             cout << "    Executing task " << task->GetName() << endl;
1257          }   
1258          
1259          task->ExecuteTask(option);
1260       }
1261 //
1262 //    Call FinishEvent() for optional output and MC services 
1263       if (fInputEventHandler)   fInputEventHandler  ->FinishEvent();
1264       if (fOutputEventHandler)  fOutputEventHandler ->FinishEvent();
1265       if (fMCtruthEventHandler) fMCtruthEventHandler->FinishEvent();
1266       // Gather system information if requested
1267       if (getsysInfo && ((ncalls%fNSysInfo)==0)) 
1268          AliSysInfo::AddStamp(Form("Event#%lld",ncalls),(Int_t)ncalls);
1269       return;
1270    }   
1271    // The event loop is not controlled by TSelector   
1272 //
1273 //  Call BeginEvent() for optional input/output and MC services 
1274    if (fInputEventHandler)   fInputEventHandler  ->BeginEvent(-1);
1275    if (fOutputEventHandler)  fOutputEventHandler ->BeginEvent(-1);
1276    if (fMCtruthEventHandler) fMCtruthEventHandler->BeginEvent(-1);
1277    TIter next2(fTopTasks);
1278    while ((task=(AliAnalysisTask*)next2())) {
1279       task->SetActive(kTRUE);
1280       if (fDebug > 1) {
1281          cout << "    Executing task " << task->GetName() << endl;
1282       }   
1283       task->ExecuteTask(option);
1284    }   
1285 //
1286 // Call FinishEvent() for optional output and MC services 
1287    if (fInputEventHandler)   fInputEventHandler  ->FinishEvent();
1288    if (fOutputEventHandler)  fOutputEventHandler ->FinishEvent();
1289    if (fMCtruthEventHandler) fMCtruthEventHandler->FinishEvent();
1290 }
1291
1292 //______________________________________________________________________________
1293 void AliAnalysisManager::FinishAnalysis()
1294 {
1295 // Finish analysis.
1296 }
1297
1298 //______________________________________________________________________________
1299 void AliAnalysisManager::SetInputEventHandler(AliVEventHandler*  handler)
1300 {
1301 // Set the input event handler and create a container for it.
1302    fInputEventHandler   = handler;
1303    fCommonInput = CreateContainer("cinput", TChain::Class(), AliAnalysisManager::kInputContainer);
1304 }
1305
1306 //______________________________________________________________________________
1307 void AliAnalysisManager::SetOutputEventHandler(AliVEventHandler*  handler)
1308 {
1309 // Set the input event handler and create a container for it.
1310    fOutputEventHandler   = handler;
1311    fCommonOutput = CreateContainer("coutput", TTree::Class(), AliAnalysisManager::kOutputContainer, "default");
1312 }