ANALYSIS/AliAnalysisManager.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17 // Author: Andrei Gheata, 31/05/2006
  18
  19 //==============================================================================
  20 //   AliAnalysysManager - Manager analysis class. Allows creation of several
  21 // analysis tasks and data containers storing their input/output. Allows
  22 // connecting/chaining tasks via shared data containers. Serializes the current
  23 // event for all tasks depending only on initial input data.
  24 //==============================================================================
  25 //
  26 //==============================================================================
  27
  28 #include <Riostream.h>
  29
  30 #include <TClass.h>
  31 #include <TFile.h>
  32 #include <TKey.h>
  33 #include <TMethodCall.h>
  34 #include <TChain.h>
  35 #include <TSystem.h>
  36 #include <TROOT.h>
  37 #include <TCanvas.h>
  38
  39 #include "AliAnalysisSelector.h"
  40 #include "AliAnalysisGrid.h"
  41 #include "AliAnalysisTask.h"
  42 #include "AliAnalysisDataContainer.h"
  43 #include "AliAnalysisDataSlot.h"
  44 #include "AliVEventHandler.h"
  45 #include "AliVEventPool.h"
  46 #include "AliSysInfo.h"
  47 #include "AliAnalysisManager.h"
  48
  49 ClassImp(AliAnalysisManager)
  50
  51 AliAnalysisManager *AliAnalysisManager::fgAnalysisManager = NULL;
  52
  53 //______________________________________________________________________________
  54 AliAnalysisManager::AliAnalysisManager(const char *name, const char *title)
  55                    :TNamed(name,title),
  56                     fTree(NULL),
  57                     fInputEventHandler(NULL),
  58                     fOutputEventHandler(NULL),
  59                     fMCtruthEventHandler(NULL),
  60                     fEventPool(NULL),
  61                     fCurrentEntry(-1),
  62                     fNSysInfo(0),
  63                     fMode(kLocalAnalysis),
  64                     fInitOK(kFALSE),
  65                     fDebug(0),
  66                     fSpecialOutputLocation(""),
  67                     fTasks(NULL),
  68                     fTopTasks(NULL),
  69                     fZombies(NULL),
  70                     fContainers(NULL),
  71                     fInputs(NULL),
  72                     fOutputs(NULL),
  73                     fSelector(NULL),
  74                     fGridHandler(NULL)
  75 {
  76 // Default constructor.
  77    fgAnalysisManager = this;
  78    fTasks      = new TObjArray();
  79    fTopTasks   = new TObjArray();
  80    fZombies    = new TObjArray();
  81    fContainers = new TObjArray();
  82    fInputs     = new TObjArray();
  83    fOutputs    = new TObjArray();
  84    SetEventLoop(kTRUE);
  85 }
  86
  87 //______________________________________________________________________________
  88 AliAnalysisManager::AliAnalysisManager(const AliAnalysisManager& other)
  89                    :TNamed(other),
  90                     fTree(NULL),
  91                     fInputEventHandler(NULL),
  92                     fOutputEventHandler(NULL),
  93                     fMCtruthEventHandler(NULL),
  94                     fEventPool(NULL),
  95                     fCurrentEntry(-1),
  96                     fNSysInfo(0),
  97                     fMode(other.fMode),
  98                     fInitOK(other.fInitOK),
  99                     fDebug(other.fDebug),
 100                     fSpecialOutputLocation(""),
 101                     fTasks(NULL),
 102                     fTopTasks(NULL),
 103                     fZombies(NULL),
 104                     fContainers(NULL),
 105                     fInputs(NULL),
 106                     fOutputs(NULL),
 107                     fSelector(NULL),
 108                     fGridHandler(NULL)
 109 {
 110 // Copy constructor.
 111    fTasks      = new TObjArray(*other.fTasks);
 112    fTopTasks   = new TObjArray(*other.fTopTasks);
 113    fZombies    = new TObjArray(*other.fZombies);
 114    fContainers = new TObjArray(*other.fContainers);
 115    fInputs     = new TObjArray(*other.fInputs);
 116    fOutputs    = new TObjArray(*other.fOutputs);
 117    fgAnalysisManager = this;
 118 }
 119
 120 //______________________________________________________________________________
 121 AliAnalysisManager& AliAnalysisManager::operator=(const AliAnalysisManager& other)
 122 {
 123 // Assignment
 124    if (&other != this) {
 125       TNamed::operator=(other);
 126       fInputEventHandler   = other.fInputEventHandler;
 127       fOutputEventHandler  = other.fOutputEventHandler;
 128       fMCtruthEventHandler = other.fMCtruthEventHandler;
 129       fEventPool           = other.fEventPool;
 130       fTree       = NULL;
 131       fCurrentEntry = -1;
 132       fNSysInfo   = other.fNSysInfo;
 133       fMode       = other.fMode;
 134       fInitOK     = other.fInitOK;
 135       fDebug      = other.fDebug;
 136       fTasks      = new TObjArray(*other.fTasks);
 137       fTopTasks   = new TObjArray(*other.fTopTasks);
 138       fZombies    = new TObjArray(*other.fZombies);
 139       fContainers = new TObjArray(*other.fContainers);
 140       fInputs     = new TObjArray(*other.fInputs);
 141       fOutputs    = new TObjArray(*other.fOutputs);
 142       fSelector   = NULL;
 143       fGridHandler = NULL;
 144       fgAnalysisManager = this;
 145    }
 146    return *this;
 147 }
 148
 149 //______________________________________________________________________________
 150 AliAnalysisManager::~AliAnalysisManager()
 151 {
 152 // Destructor.
 153    if (fTasks) {fTasks->Delete(); delete fTasks;}
 154    if (fTopTasks) delete fTopTasks;
 155    if (fZombies) delete fZombies;
 156    if (fContainers) {fContainers->Delete(); delete fContainers;}
 157    if (fInputs) delete fInputs;
 158    if (fOutputs) delete fOutputs;
 159    if (fGridHandler) delete fGridHandler;
 160    if (fgAnalysisManager==this) fgAnalysisManager = NULL;
 161 }
 162
 163 //______________________________________________________________________________
 164 Int_t AliAnalysisManager::GetEntry(Long64_t entry, Int_t getall)
 165 {
 166 // Read one entry of the tree or a whole branch.
 167    if (fDebug > 0) printf("== AliAnalysisManager::GetEntry(%lld)\n", entry);
 168    fCurrentEntry = entry;
 169    return fTree ? fTree->GetTree()->GetEntry(entry, getall) : 0;
 170 }
 171
 172 //______________________________________________________________________________
 173 Bool_t AliAnalysisManager::Init(TTree *tree)
 174 {
 175   // The Init() function is called when the selector needs to initialize
 176   // a new tree or chain. Typically here the branch addresses of the tree
 177   // will be set. It is normaly not necessary to make changes to the
 178   // generated code, but the routine can be extended by the user if needed.
 179   // Init() will be called many times when running with PROOF.
 180    Bool_t init = kFALSE;
 181    if (!tree) return kFALSE; // Should not happen - protected in selector caller
 182    if (fDebug > 0) {
 183       printf("->AliAnalysisManager::Init(%s)\n", tree->GetName());
 184    }
 185    // Call InitTree of EventHandler
 186    if (fOutputEventHandler) {
 187       if (fMode == kProofAnalysis) {
 188          init = fOutputEventHandler->Init(0x0, "proof");
 189       } else {
 190          init = fOutputEventHandler->Init(0x0, "local");
 191       }
 192       if (!init) {
 193          Error("Init", "Output event handler failed to initialize");
 194          return kFALSE;
 195       }
 196    }
 197
 198    if (fInputEventHandler) {
 199       if (fMode == kProofAnalysis) {
 200          init = fInputEventHandler->Init(tree, "proof");
 201       } else {
 202          init = fInputEventHandler->Init(tree, "local");
 203       }
 204       if (!init) {
 205          Error("Init", "Input event handler failed to initialize tree");
 206          return kFALSE;
 207       }
 208    } else {
 209       // If no input event handler we need to get the tree once
 210       // for the chain
 211       if(!tree->GetTree()) {
 212          Long64_t readEntry = tree->LoadTree(0);
 213          if (readEntry == -2) {
 214             Error("Init", "Input tree has no entry. Aborting");
 215             return kFALSE;
 216          }
 217       }
 218    }
 219
 220    if (fMCtruthEventHandler) {
 221       if (fMode == kProofAnalysis) {
 222          init = fMCtruthEventHandler->Init(0x0, "proof");
 223       } else {
 224          init = fMCtruthEventHandler->Init(0x0, "local");
 225       }
 226       if (!init) {
 227          Error("Init", "MC event handler failed to initialize");
 228          return kFALSE;
 229       }
 230    }
 231
 232    if (!fInitOK) InitAnalysis();
 233    if (!fInitOK) return kFALSE;
 234    fTree = tree;
 235    AliAnalysisDataContainer *top = (AliAnalysisDataContainer*)fInputs->At(0);
 236    if (!top) {
 237       Error("Init","No top input container !");
 238       return kFALSE;
 239    }
 240    top->SetData(tree);
 241    if (fDebug > 0) {
 242       printf("<-AliAnalysisManager::Init(%s)\n", tree->GetName());
 243    }
 244    return kTRUE;
 245 }
 246
 247 //______________________________________________________________________________
 248 void AliAnalysisManager::SlaveBegin(TTree *tree)
 249 {
 250   // The SlaveBegin() function is called after the Begin() function.
 251   // When running with PROOF SlaveBegin() is called on each slave server.
 252   // The tree argument is deprecated (on PROOF 0 is passed).
 253    if (fDebug > 0) printf("->AliAnalysisManager::SlaveBegin()\n");
 254    static Bool_t isCalled = kFALSE;
 255    Bool_t init = kFALSE;
 256    Bool_t initOK = kTRUE;
 257    TString msg;
 258    TDirectory *curdir = gDirectory;
 259    // Call SlaveBegin only once in case of mixing
 260    if (isCalled && fMode==kMixingAnalysis) return;
 261    // Call Init of EventHandler
 262    if (fOutputEventHandler) {
 263       if (fMode == kProofAnalysis) {
 264          TIter nextout(fOutputs);
 265          AliAnalysisDataContainer *c_aod;
 266          while ((c_aod=(AliAnalysisDataContainer*)nextout())) if (!strcmp(c_aod->GetFileName(),"default")) break;
 267          if (c_aod && c_aod->IsSpecialOutput()) {
 268             // Merging via files
 269             if (fDebug > 1) printf("   Initializing special output file %s...\n", fOutputEventHandler->GetOutputFileName());
 270             OpenProofFile(fOutputEventHandler->GetOutputFileName(), "RECREATE");
 271             c_aod->SetFile(gFile);
 272             init = fOutputEventHandler->Init("proofspecial");
 273             if (!init) msg = "Failed to initialize output handler on worker using special proof output";
 274          } else {
 275             // Merging in memory
 276             init = fOutputEventHandler->Init("proof");
 277             if (!init) msg = "Failed to initialize output handler on worker";
 278          }
 279       } else {
 280          init = fOutputEventHandler->Init("local");
 281          if (!init) msg = "Failed to initialize output handler on worker";
 282       }
 283       initOK &= init;
 284       if (!fSelector) Error("SlaveBegin", "Selector not set");
 285       else if (!init) {fSelector->Abort(msg); fSelector->SetStatus(-1);}
 286    }
 287
 288    if (fInputEventHandler) {
 289       fInputEventHandler->SetInputTree(tree);
 290       if (fMode == kProofAnalysis) {
 291          init = fInputEventHandler->Init("proof");
 292          if (!init) msg = "Failed to initialize input handler on worker";
 293       } else {
 294          init = fInputEventHandler->Init("local");
 295          if (!init) msg = "Failed to initialize input handler";
 296       }
 297       initOK &= init;
 298       if (!fSelector) Error("SlaveBegin", "Selector not set");
 299       else if (!init) {fSelector->Abort(msg); fSelector->SetStatus(-1);}
 300    }
 301
 302    if (fMCtruthEventHandler) {
 303       if (fMode == kProofAnalysis) {
 304          init = fMCtruthEventHandler->Init("proof");
 305          if (!init) msg = "Failed to initialize MC handler on worker";
 306       } else {
 307          init = fMCtruthEventHandler->Init("local");
 308          if (!init) msg = "Failed to initialize MC handler";
 309       }
 310       initOK &= init;
 311       if (!fSelector) Error("SlaveBegin", "Selector not set");
 312       else if (!init) {fSelector->Abort(msg); fSelector->SetStatus(-1);}
 313    }
 314    if (curdir) curdir->cd();
 315    isCalled = kTRUE;
 316    if (!initOK) return;
 317    TIter next(fTasks);
 318    AliAnalysisTask *task;
 319    // Call CreateOutputObjects for all tasks
 320    while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) {
 321       curdir = gDirectory;
 322       task->CreateOutputObjects();
 323       if (curdir) curdir->cd();
 324    }
 325    if (fDebug > 0) printf("<-AliAnalysisManager::SlaveBegin()\n");
 326 }
 327
 328 //______________________________________________________________________________
 329 Bool_t AliAnalysisManager::Notify()
 330 {
 331    // The Notify() function is called when a new file is opened. This
 332    // can be either for a new TTree in a TChain or when when a new TTree
 333    // is started when using PROOF. It is normaly not necessary to make changes
 334    // to the generated code, but the routine can be extended by the
 335    // user if needed. The return value is currently not used.
 336    if (!fTree) return kFALSE;
 337
 338    TFile *curfile = fTree->GetCurrentFile();
 339    if (!curfile) {
 340       Error("Notify","No current file");
 341       return kFALSE;
 342    }
 343
 344    if (fDebug > 0) printf("->AliAnalysisManager::Notify() file: %s\n", curfile->GetName());
 345    TIter next(fTasks);
 346    AliAnalysisTask *task;
 347    // Call Notify for all tasks
 348    while ((task=(AliAnalysisTask*)next()))
 349       task->Notify();
 350
 351    // Call Notify of the event handlers
 352    if (fInputEventHandler) {
 353        fInputEventHandler->Notify(curfile->GetName());
 354    }
 355
 356    if (fOutputEventHandler) {
 357        fOutputEventHandler->Notify(curfile->GetName());
 358    }
 359
 360    if (fMCtruthEventHandler) {
 361        fMCtruthEventHandler->Notify(curfile->GetName());
 362    }
 363    if (fDebug > 0) printf("<-AliAnalysisManager::Notify()\n");
 364    return kTRUE;
 365 }
 366
 367 //______________________________________________________________________________
 368 Bool_t AliAnalysisManager::Process(Long64_t entry)
 369 {
 370   // The Process() function is called for each entry in the tree (or possibly
 371   // keyed object in the case of PROOF) to be processed. The entry argument
 372   // specifies which entry in the currently loaded tree is to be processed.
 373   // It can be passed to either TTree::GetEntry() or TBranch::GetEntry()
 374   // to read either all or the required parts of the data. When processing
 375   // keyed objects with PROOF, the object is already loaded and is available
 376   // via the fObject pointer.
 377   //
 378   // This function should contain the "body" of the analysis. It can contain
 379   // simple or elaborate selection criteria, run algorithms on the data
 380   // of the event and typically fill histograms.
 381
 382   // WARNING when a selector is used with a TChain, you must use
 383   //  the pointer to the current TTree to call GetEntry(entry).
 384   //  The entry is always the local entry number in the current tree.
 385   //  Assuming that fChain is the pointer to the TChain being processed,
 386   //  use fChain->GetTree()->GetEntry(entry).
 387    if (fDebug > 0) printf("->AliAnalysisManager::Process(%lld)\n", entry);
 388
 389    if (fInputEventHandler)   fInputEventHandler  ->BeginEvent(entry);
 390    if (fOutputEventHandler)  fOutputEventHandler ->BeginEvent(entry);
 391    if (fMCtruthEventHandler) fMCtruthEventHandler->BeginEvent(entry);
 392
 393    GetEntry(entry);
 394    ExecAnalysis();
 395    if (fDebug > 0) printf("<-AliAnalysisManager::Process()\n");
 396    return kTRUE;
 397 }
 398
 399 //______________________________________________________________________________
 400 void AliAnalysisManager::PackOutput(TList *target)
 401 {
 402   // Pack all output data containers in the output list. Called at SlaveTerminate
 403   // stage in PROOF case for each slave.
 404    if (fDebug > 0) printf("->AliAnalysisManager::PackOutput()\n");
 405    if (!target) {
 406       Error("PackOutput", "No target. Aborting.");
 407       return;
 408    }
 409    if (fInputEventHandler)   fInputEventHandler  ->Terminate();
 410    if (fOutputEventHandler)  fOutputEventHandler ->Terminate();
 411    if (fMCtruthEventHandler) fMCtruthEventHandler->Terminate();
 412
 413    // Call FinishTaskOutput() for each event loop task (not called for
 414    // post-event loop tasks - use Terminate() fo those)
 415    TIter nexttask(fTasks);
 416    AliAnalysisTask *task;
 417    while ((task=(AliAnalysisTask*)nexttask())) {
 418       if (!task->IsPostEventLoop()) {
 419          if (fDebug > 0) printf("->FinishTaskOutput: task %s\n", task->GetName());
 420          task->FinishTaskOutput();
 421          if (fDebug > 0) printf("<-FinishTaskOutput: task %s\n", task->GetName());
 422       }
 423    }
 424
 425    if (fMode == kProofAnalysis) {
 426       TIter next(fOutputs);
 427       AliAnalysisDataContainer *output;
 428       Bool_t isManagedByHandler = kFALSE;
 429       while ((output=(AliAnalysisDataContainer*)next())) {
 430          // Do not consider outputs of post event loop tasks
 431          isManagedByHandler = kFALSE;
 432          if (output->GetProducer()->IsPostEventLoop()) continue;
 433          const char *filename = output->GetFileName();
 434          if (!(strcmp(filename, "default")) && fOutputEventHandler) {
 435             isManagedByHandler = kTRUE;
 436             filename = fOutputEventHandler->GetOutputFileName();
 437          }
 438          // Check if data was posted to this container. If not, issue an error.
 439          if (!output->GetData() && !isManagedByHandler) {
 440             Error("PackOutput", "No data for output container %s. Forgot to PostData ?\n", output->GetName());
 441             continue;
 442          }
 443          if (!output->IsSpecialOutput()) {
 444             // Normal outputs
 445             if (strlen(filename) && !isManagedByHandler) {
 446                // File resident outputs
 447                TFile *file = output->GetFile();
 448                // Backup current folder
 449                TDirectory *opwd = gDirectory;
 450                // Create file if not existing and register to container.
 451                if (file) file->cd();
 452                else      file = new TFile(filename, "RECREATE");
 453                if (file->IsZombie()) {
 454                   Fatal("PackOutput", "Could not recreate file %s\n", filename);
 455                   return;
 456                }
 457                output->SetFile(file);
 458                // Clear file list to release object ownership to user.
 459                file->Clear();
 460                // Save data to file, then close.
 461                if (output->GetData()->InheritsFrom(TCollection::Class())) {
 462                   // If data is a collection, we set the name of the collection
 463                   // as the one of the container and we save as a single key.
 464                   TCollection *coll = (TCollection*)output->GetData();
 465                   coll->SetName(output->GetName());
 466                   coll->Write(output->GetName(), TObject::kSingleKey);
 467                } else {
 468                   if (output->GetData()->InheritsFrom(TTree::Class())) {
 469                      TTree *tree = (TTree*)output->GetData();
 470                      tree->SetDirectory(file);
 471                      tree->AutoSave();
 472                   } else {
 473                      output->GetData()->Write();
 474                   }
 475                }
 476                if (fDebug > 1) printf("PackOutput %s: memory merge, file resident output\n", output->GetName());
 477                if (fDebug > 2) {
 478                   printf("   file %s listing content:\n", filename);
 479                   file->ls();
 480                }
 481                file->Close();
 482                // Restore current directory
 483                if (opwd) opwd->cd();
 484             } else {
 485                // Memory-resident outputs
 486                if (fDebug > 1) printf("PackOutput %s: memory merge memory resident output\n", filename);
 487             }
 488             AliAnalysisDataWrapper *wrap = 0;
 489             if (isManagedByHandler) {
 490                wrap = new AliAnalysisDataWrapper(fOutputEventHandler->GetTree());
 491                wrap->SetName(output->GetName());
 492             }
 493             else                    wrap =output->ExportData();
 494             // Output wrappers must NOT delete data after merging - the user owns them
 495             wrap->SetDeleteData(kFALSE);
 496             target->Add(wrap);
 497          } else {
 498          // Special outputs
 499             TDirectory *opwd = gDirectory;
 500             TFile *file = output->GetFile();
 501             if (fDebug > 1 && file) printf("PackOutput %s: file merge, special output\n", output->GetName());
 502             if (isManagedByHandler) {
 503                // Terminate IO for files managed by the output handler
 504                if (file) file->Write();
 505                if (file && fDebug > 2) {
 506                   printf("   handled file %s listing content:\n", file->GetName());
 507                   file->ls();
 508                }
 509                fOutputEventHandler->TerminateIO();
 510                continue;
 511             }
 512
 513             if (!file) {
 514                AliAnalysisTask *producer = output->GetProducer();
 515                Error("PackOutput",
 516                      "File %s for special container %s was NOT opened in %s::CreateOutputObjects !!!",
 517                      output->GetFileName(), output->GetName(), producer->ClassName());
 518                continue;
 519             }
 520             file->cd();
 521             // Release object ownership to users after writing data to file
 522             if (output->GetData()->InheritsFrom(TCollection::Class())) {
 523                // If data is a collection, we set the name of the collection
 524                // as the one of the container and we save as a single key.
 525                TCollection *coll = (TCollection*)output->GetData();
 526                coll->SetName(output->GetName());
 527                coll->Write(output->GetName(), TObject::kSingleKey);
 528             } else {
 529                if (output->GetData()->InheritsFrom(TTree::Class())) {
 530                   TTree *tree = (TTree*)output->GetData();
 531                   tree->SetDirectory(file);
 532                   tree->AutoSave();
 533                } else {
 534                   output->GetData()->Write();
 535                }
 536             }
 537             file->Clear();
 538             if (fDebug > 2) {
 539                printf("   file %s listing content:\n", output->GetFileName());
 540                file->ls();
 541             }
 542             TString outFilename = file->GetName();
 543             file->Close();
 544             // Restore current directory
 545             if (opwd) opwd->cd();
 546             // Check if a special output location was provided or the output files have to be merged
 547             if (strlen(fSpecialOutputLocation.Data())) {
 548                TString remote = fSpecialOutputLocation;
 549                remote += "/";
 550                Int_t gid = gROOT->ProcessLine("gProofServ->GetGroupId();");
 551                remote += Form("%s_%d_", gSystem->HostName(), gid);
 552                remote += output->GetFileName();
 553                TFile::Cp ( outFilename.Data(), remote.Data() );
 554             } else {
 555             // No special location specified-> use TProofOutputFile as merging utility
 556             // The file at this output slot must be opened in CreateOutputObjects
 557                if (fDebug > 1) printf("   File %s to be merged...\n", output->GetFileName());
 558             }
 559          }
 560       }
 561    }
 562    if (fDebug > 0) printf("<-AliAnalysisManager::PackOutput: output list contains %d containers\n", target->GetSize());
 563 }
 564
 565 //______________________________________________________________________________
 566 void AliAnalysisManager::ImportWrappers(TList *source)
 567 {
 568 // Import data in output containers from wrappers coming in source.
 569    if (fDebug > 0) printf("->AliAnalysisManager::ImportWrappers()\n");
 570    TIter next(fOutputs);
 571    AliAnalysisDataContainer *cont;
 572    AliAnalysisDataWrapper   *wrap;
 573    Int_t icont = 0;
 574    Bool_t inGrid = (fMode == kGridAnalysis)?kTRUE:kFALSE;
 575    while ((cont=(AliAnalysisDataContainer*)next())) {
 576       wrap = 0;
 577       if (cont->GetProducer()->IsPostEventLoop() && !inGrid) continue;
 578       const char *filename = cont->GetFileName();
 579       Bool_t isManagedByHandler = kFALSE;
 580       if (!(strcmp(filename, "default")) && fOutputEventHandler) {
 581          isManagedByHandler = kTRUE;
 582          filename = fOutputEventHandler->GetOutputFileName();
 583       }
 584       if (cont->IsSpecialOutput() || inGrid) {
 585          if (strlen(fSpecialOutputLocation.Data()) && !isManagedByHandler) continue;
 586          // Copy merged file from PROOF scratch space.
 587          // In case of grid the files are already in the current directory.
 588          if (!inGrid) {
 589             char full_path[512];
 590             char ch_url[512];
 591             TObject *pof =  source->FindObject(filename);
 592             if (!pof || !pof->InheritsFrom("TProofOutputFile")) {
 593                Error("ImportWrappers", "TProofOutputFile object not found in output list for container %s", cont->GetName());
 594                continue;
 595             }
 596             gROOT->ProcessLine(Form("sprintf((char*)0x%lx, \"%%s\", ((TProofOutputFile*)0x%lx)->GetOutputFileName();)", full_path, pof));
 597             gROOT->ProcessLine(Form("sprintf((char*)0x%lx, \"%%s\", gProof->GetUrl();)", ch_url));
 598             TString clientUrl(ch_url);
 599             TString full_path_str(full_path);
 600             if (clientUrl.Contains("localhost")){
 601                TObjArray* array = full_path_str.Tokenize ( "//" );
 602                TObjString *strobj = ( TObjString *)array->At(1);
 603                TObjArray* arrayPort = strobj->GetString().Tokenize ( ":" );
 604                TObjString *strobjPort = ( TObjString *) arrayPort->At(1);
 605                full_path_str.ReplaceAll(strobj->GetString().Data(),"localhost:PORT");
 606                full_path_str.ReplaceAll(":PORT",Form(":%s",strobjPort->GetString().Data()));
 607                if (fDebug > 1) Info("ImportWrappers","Using tunnel from %s to %s",full_path_str.Data(),filename);
 608             }
 609             if (fDebug > 1)
 610                printf("   Copying file %s from PROOF scratch space\n", full_path_str.Data());
 611             Bool_t gotit = TFile::Cp(full_path_str.Data(), filename);
 612             if (!gotit) {
 613                Error("ImportWrappers", "Could not get file %s from proof scratch space", cont->GetFileName());
 614                continue;
 615             }
 616          }
 617          // Normally we should connect data from the copied file to the
 618          // corresponding output container, but it is not obvious how to do this
 619          // automatically if several objects in file...
 620          TFile *f = TFile::Open(filename, "READ");
 621          if (!f) {
 622             Error("ImportWrappers", "Cannot open file %s in read-only mode", filename);
 623             continue;
 624          }
 625          TObject *obj = 0;
 626          // Try to fetch first a list object having the container name.
 627          obj = f->Get(cont->GetName());
 628          if (!obj) {
 629          // Fetch first object from file having the container type.
 630             TIter nextkey(f->GetListOfKeys());
 631             TKey *key;
 632             while ((key=(TKey*)nextkey())) {
 633                obj = f->Get(key->GetName());
 634                if (obj && obj->IsA()->InheritsFrom(cont->GetType())) break;
 635             }
 636          }
 637          if (!obj) {
 638             Error("ImportWrappers", "Could not find object for container %s in file %s", cont->GetName(), filename);
 639             continue;
 640          }
 641          wrap = new AliAnalysisDataWrapper(obj);
 642          wrap->SetDeleteData(kFALSE);
 643       }
 644       if (!wrap) wrap = (AliAnalysisDataWrapper*)source->FindObject(cont->GetName());
 645       if (!wrap) {
 646          Error("ImportWrappers","Container %s not found in analysis output !", cont->GetName());
 647          continue;
 648       }
 649       icont++;
 650       if (fDebug > 1) {
 651          printf("   Importing data for container %s", cont->GetName());
 652          if (strlen(filename)) printf("    -> file %s\n", filename);
 653          else printf("\n");
 654       }
 655       cont->ImportData(wrap);
 656    }
 657    if (fDebug > 0) printf("<-AliAnalysisManager::ImportWrappers(): %d containers imported\n", icont);
 658 }
 659
 660 //______________________________________________________________________________
 661 void AliAnalysisManager::UnpackOutput(TList *source)
 662 {
 663   // Called by AliAnalysisSelector::Terminate only on the client.
 664    if (fDebug > 0) printf("->AliAnalysisManager::UnpackOutput()\n");
 665    if (!source) {
 666       Error("UnpackOutput", "No target. Aborting.");
 667       return;
 668    }
 669    if (fDebug > 1) printf("   Source list contains %d containers\n", source->GetSize());
 670
 671    if (fMode == kProofAnalysis) ImportWrappers(source);
 672
 673    TIter next(fOutputs);
 674    AliAnalysisDataContainer *output;
 675    while ((output=(AliAnalysisDataContainer*)next())) {
 676       if (!output->GetData()) continue;
 677       // Check if there are client tasks that run post event loop
 678       if (output->HasConsumers()) {
 679          // Disable event loop semaphore
 680          output->SetPostEventLoop(kTRUE);
 681          TObjArray *list = output->GetConsumers();
 682          Int_t ncons = list->GetEntriesFast();
 683          for (Int_t i=0; i<ncons; i++) {
 684             AliAnalysisTask *task = (AliAnalysisTask*)list->At(i);
 685             task->CheckNotify(kTRUE);
 686             // If task is active, execute it
 687             if (task->IsPostEventLoop() && task->IsActive()) {
 688                if (fDebug > 0) printf("== Executing post event loop task %s\n", task->GetName());
 689                task->ExecuteTask();
 690             }
 691          }
 692       }
 693    }
 694    if (fDebug > 0) printf("<-AliAnalysisManager::UnpackOutput()\n");
 695 }
 696
 697 //______________________________________________________________________________
 698 void AliAnalysisManager::Terminate()
 699 {
 700   // The Terminate() function is the last function to be called during
 701   // a query. It always runs on the client, it can be used to present
 702   // the results graphically.
 703    if (fDebug > 0) printf("->AliAnalysisManager::Terminate()\n");
 704    AliAnalysisTask *task;
 705    TIter next(fTasks);
 706    // Call Terminate() for tasks
 707    while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) task->Terminate();
 708    //
 709    TIter next1(fOutputs);
 710    AliAnalysisDataContainer *output;
 711    while ((output=(AliAnalysisDataContainer*)next1())) {
 712       // Special outputs or grid files have the files already closed and written.
 713       if (fMode == kGridAnalysis) continue;
 714       if (output->IsSpecialOutput()&&(fMode == kProofAnalysis)) continue;
 715       const char *filename = output->GetFileName();
 716       if (!(strcmp(filename, "default"))) {
 717          if (fOutputEventHandler) filename = fOutputEventHandler->GetOutputFileName();
 718          TFile *aodfile = (TFile*)gROOT->GetListOfFiles()->FindObject(filename);
 719          if (aodfile) {
 720             if (fDebug > 1) printf("Writing output handler file: %s\n", filename);
 721             aodfile->Write();
 722             continue;
 723          }
 724       }
 725       if (!strlen(filename)) continue;
 726       if (!output->GetData()) continue;
 727       TFile *file = output->GetFile();
 728       TDirectory *opwd = gDirectory;
 729       file = (TFile*)gROOT->GetListOfFiles()->FindObject(filename);
 730       if (!file) file = new TFile(filename, "RECREATE");
 731       if (file->IsZombie()) continue;
 732       output->SetFile(file);
 733       file->cd();
 734       if (fDebug > 1) printf("   writing output data %s to file %s\n", output->GetData()->GetName(), file->GetName());
 735       if (output->GetData()->InheritsFrom(TCollection::Class())) {
 736       // If data is a collection, we set the name of the collection
 737       // as the one of the container and we save as a single key.
 738          TCollection *coll = (TCollection*)output->GetData();
 739          coll->SetName(output->GetName());
 740          coll->Write(output->GetName(), TObject::kSingleKey);
 741       } else {
 742          if (output->GetData()->InheritsFrom(TTree::Class())) {
 743             TTree *tree = (TTree*)output->GetData();
 744             tree->SetDirectory(file);
 745             tree->AutoSave();
 746          } else {
 747             output->GetData()->Write();
 748          }
 749       }
 750       if (opwd) opwd->cd();
 751    }
 752    next1.Reset();
 753    while ((output=(AliAnalysisDataContainer*)next1())) {
 754       // Close all files at output
 755       TDirectory *opwd = gDirectory;
 756       if (output->GetFile()) output->GetFile()->Close();
 757       if (opwd) opwd->cd();
 758    }
 759
 760    if (fInputEventHandler)   fInputEventHandler  ->TerminateIO();
 761    if (fOutputEventHandler)  fOutputEventHandler ->TerminateIO();
 762    if (fMCtruthEventHandler) fMCtruthEventHandler->TerminateIO();
 763
 764    Bool_t getsysInfo = ((fNSysInfo>0) && (fMode==kLocalAnalysis))?kTRUE:kFALSE;
 765    if (getsysInfo) {
 766       TDirectory *cdir = gDirectory;
 767       TFile f("syswatch.root", "RECREATE");
 768       if (!f.IsZombie()) {
 769          TTree *tree = AliSysInfo::MakeTree("syswatch.log");
 770          tree->SetMarkerStyle(kCircle);
 771          tree->SetMarkerColor(kBlue);
 772          tree->SetMarkerSize(0.5);
 773          if (!gROOT->IsBatch()) {
 774             tree->SetAlias("event", "id0");
 775             tree->SetAlias("memUSED", "mi.fMemUsed");
 776             new TCanvas("SysInfo","SysInfo",10,10,800,600);
 777             tree->Draw("memUSED:event","","", 1234567890, 0);
 778          }
 779          tree->Write();
 780          f.Close();
 781          delete tree;
 782       }
 783       if (cdir) cdir->cd();
 784    }
 785    if (fDebug > 0) printf("<-AliAnalysisManager::Terminate()\n");
 786 }
 787
 788 //______________________________________________________________________________
 789 void AliAnalysisManager::AddTask(AliAnalysisTask *task)
 790 {
 791 // Adds a user task to the global list of tasks.
 792    if (fTasks->FindObject(task)) {
 793       Warning("AddTask", "Task %s: the same object already added to the analysis manager. Not adding.", task->GetName());
 794       return;
 795    }
 796    task->SetActive(kFALSE);
 797    fTasks->Add(task);
 798 }
 799
 800 //______________________________________________________________________________
 801 AliAnalysisTask *AliAnalysisManager::GetTask(const char *name) const
 802 {
 803 // Retreive task by name.
 804    if (!fTasks) return NULL;
 805    return (AliAnalysisTask*)fTasks->FindObject(name);
 806 }
 807
 808 //______________________________________________________________________________
 809 AliAnalysisDataContainer *AliAnalysisManager::CreateContainer(const char *name,
 810                                 TClass *datatype, EAliAnalysisContType type, const char *filename)
 811 {
 812 // Create a data container of a certain type. Types can be:
 813 //   kExchangeContainer  = 0, used to exchange date between tasks
 814 //   kInputContainer   = 1, used to store input data
 815 //   kOutputContainer  = 2, used for posting results
 816    if (fContainers->FindObject(name)) {
 817       Error("CreateContainer","A container named %s already defined !\n",name);
 818       return NULL;
 819    }
 820    AliAnalysisDataContainer *cont = new AliAnalysisDataContainer(name, datatype);
 821    fContainers->Add(cont);
 822    switch (type) {
 823       case kInputContainer:
 824          fInputs->Add(cont);
 825          break;
 826       case kOutputContainer:
 827          fOutputs->Add(cont);
 828          if (filename && strlen(filename)) {
 829             cont->SetFileName(filename);
 830             cont->SetDataOwned(kFALSE);  // data owned by the file
 831          }
 832          break;
 833       case kExchangeContainer:
 834          break;
 835    }
 836    return cont;
 837 }
 838
 839 //______________________________________________________________________________
 840 Bool_t AliAnalysisManager::ConnectInput(AliAnalysisTask *task, Int_t islot,
 841                                         AliAnalysisDataContainer *cont)
 842 {
 843 // Connect input of an existing task to a data container.
 844    if (!fTasks->FindObject(task)) {
 845       AddTask(task);
 846       Info("ConnectInput", "Task %s was not registered. Now owned by analysis manager", task->GetName());
 847    }
 848    Bool_t connected = task->ConnectInput(islot, cont);
 849    return connected;
 850 }
 851
 852 //______________________________________________________________________________
 853 Bool_t AliAnalysisManager::ConnectOutput(AliAnalysisTask *task, Int_t islot,
 854                                         AliAnalysisDataContainer *cont)
 855 {
 856 // Connect output of an existing task to a data container.
 857    if (!fTasks->FindObject(task)) {
 858       AddTask(task);
 859       Warning("ConnectOutput", "Task %s not registered. Now owned by analysis manager", task->GetName());
 860    }
 861    Bool_t connected = task->ConnectOutput(islot, cont);
 862    return connected;
 863 }
 864
 865 //______________________________________________________________________________
 866 void AliAnalysisManager::CleanContainers()
 867 {
 868 // Clean data from all containers that have already finished all client tasks.
 869    TIter next(fContainers);
 870    AliAnalysisDataContainer *cont;
 871    while ((cont=(AliAnalysisDataContainer *)next())) {
 872       if (cont->IsOwnedData() &&
 873           cont->IsDataReady() &&
 874           cont->ClientsExecuted()) cont->DeleteData();
 875    }
 876 }
 877
 878 //______________________________________________________________________________
 879 Bool_t AliAnalysisManager::InitAnalysis()
 880 {
 881 // Initialization of analysis chain of tasks. Should be called after all tasks
 882 // and data containers are properly connected
 883    // Check for input/output containers
 884    fInitOK = kFALSE;
 885    // Check for top tasks (depending only on input data containers)
 886    if (!fTasks->First()) {
 887       Error("InitAnalysis", "Analysis has no tasks !");
 888       return kFALSE;
 889    }
 890    TIter next(fTasks);
 891    AliAnalysisTask *task;
 892    AliAnalysisDataContainer *cont;
 893    Int_t ntop = 0;
 894    Int_t nzombies = 0;
 895    Bool_t iszombie = kFALSE;
 896    Bool_t istop = kTRUE;
 897    Int_t i;
 898    while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) {
 899       istop = kTRUE;
 900       iszombie = kFALSE;
 901       Int_t ninputs = task->GetNinputs();
 902       for (i=0; i<ninputs; i++) {
 903          cont = task->GetInputSlot(i)->GetContainer();
 904          if (!cont) {
 905             if (!iszombie) {
 906                task->SetZombie();
 907                fZombies->Add(task);
 908                nzombies++;
 909                iszombie = kTRUE;
 910             }
 911             Error("InitAnalysis", "Input slot %d of task %s has no container connected ! Declared zombie...",
 912                   i, task->GetName());
 913          }
 914          if (iszombie) continue;
 915          // Check if cont is an input container
 916          if (istop && !fInputs->FindObject(cont)) istop=kFALSE;
 917          // Connect to parent task
 918       }
 919       if (istop) {
 920          ntop++;
 921          fTopTasks->Add(task);
 922       }
 923    }
 924    if (!ntop) {
 925       Error("InitAnalysis", "No top task defined. At least one task should be connected only to input containers");
 926       return kFALSE;
 927    }
 928    // Check now if there are orphan tasks
 929    for (i=0; i<ntop; i++) {
 930       task = (AliAnalysisTask*)fTopTasks->At(i);
 931       task->SetUsed();
 932    }
 933    Int_t norphans = 0;
 934    next.Reset();
 935    while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) {
 936       if (!task->IsUsed()) {
 937          norphans++;
 938          Warning("InitAnalysis", "Task %s is orphan", task->GetName());
 939       }
 940    }
 941    // Check the task hierarchy (no parent task should depend on data provided
 942    // by a daughter task)
 943    for (i=0; i<ntop; i++) {
 944       task = (AliAnalysisTask*)fTopTasks->At(i);
 945       if (task->CheckCircularDeps()) {
 946          Error("InitAnalysis", "Found illegal circular dependencies between following tasks:");
 947          PrintStatus("dep");
 948          return kFALSE;
 949       }
 950    }
 951    // Check that all containers feeding post-event loop tasks are in the outputs list
 952    TIter nextcont(fContainers); // loop over all containers
 953    while ((cont=(AliAnalysisDataContainer*)nextcont())) {
 954       if (!cont->IsPostEventLoop() && !fOutputs->FindObject(cont)) {
 955          if (cont->HasConsumers()) {
 956          // Check if one of the consumers is post event loop
 957             TIter nextconsumer(cont->GetConsumers());
 958             while ((task=(AliAnalysisTask*)nextconsumer())) {
 959                if (task->IsPostEventLoop()) {
 960                   fOutputs->Add(cont);
 961                   break;
 962                }
 963             }
 964          }
 965       }
 966    }
 967    // Check if all special output containers have a file name provided
 968    TIter nextout(fOutputs);
 969    while ((cont=(AliAnalysisDataContainer*)nextout())) {
 970       if (cont->IsSpecialOutput() && !strlen(cont->GetFileName())) {
 971          Error("InitAnalysis", "Wrong container %s : a file name MUST be provided for special outputs", cont->GetName());
 972          return kFALSE;
 973       }
 974    }
 975    fInitOK = kTRUE;
 976    return kTRUE;
 977 }
 978
 979 //______________________________________________________________________________
 980 void AliAnalysisManager::PrintStatus(Option_t *option) const
 981 {
 982 // Print task hierarchy.
 983    if (!fInitOK) {
 984       Info("PrintStatus", "Analysis manager %s not initialized : call InitAnalysis() first", GetName());
 985       return;
 986    }
 987    Bool_t getsysInfo = ((fNSysInfo>0) && (fMode==kLocalAnalysis))?kTRUE:kFALSE;
 988    if (getsysInfo)
 989       Info("PrintStatus", "System information will be collected each %lld events", fNSysInfo);
 990    TIter next(fTopTasks);
 991    AliAnalysisTask *task;
 992    while ((task=(AliAnalysisTask*)next()))
 993       task->PrintTask(option);
 994 }
 995
 996 //______________________________________________________________________________
 997 void AliAnalysisManager::ResetAnalysis()
 998 {
 999 // Reset all execution flags and clean containers.
1000    CleanContainers();
1001 }
1002
1003 //______________________________________________________________________________
1004 void AliAnalysisManager::StartAnalysis(const char *type, TTree *tree, Long64_t nentries, Long64_t firstentry)
1005 {
1006 // Start analysis for this manager. Analysis task can be: LOCAL, PROOF, GRID or
1007 // MIX. Process nentries starting from firstentry
1008    if (!fInitOK) {
1009       Error("StartAnalysis","Analysis manager was not initialized !");
1010       return;
1011    }
1012    if (fDebug > 0) printf("StartAnalysis %s\n",GetName());
1013    TString anaType = type;
1014    anaType.ToLower();
1015    fMode = kLocalAnalysis;
1016    Bool_t runlocalinit = kTRUE;
1017    if (anaType.Contains("file")) runlocalinit = kFALSE;
1018    if (anaType.Contains("proof"))     fMode = kProofAnalysis;
1019    else if (anaType.Contains("grid")) fMode = kGridAnalysis;
1020    else if (anaType.Contains("mix"))  fMode = kMixingAnalysis;
1021
1022    if (fMode == kGridAnalysis) {
1023       if (!fGridHandler) {
1024          Error("StartAnalysis", "Cannot start grid analysis without a grid handler.");
1025          Info("===", "Add an AliAnalysisAlien object as plugin for this manager and configure it.");
1026          return;
1027       }
1028       // Write analysis manager in the analysis file
1029       cout << "===== RUNNING GRID ANALYSIS: " << GetName() << endl;
1030       // run local task configuration
1031       TIter nextTask(fTasks);
1032       AliAnalysisTask *task;
1033       while ((task=(AliAnalysisTask*)nextTask())) {
1034          task->LocalInit();
1035       }
1036       fGridHandler->StartAnalysis(nentries, firstentry);
1037
1038       // Terminate grid analysis
1039       if (fSelector && fSelector->GetStatus() == -1) return;
1040       if (fGridHandler->GetRunMode() == AliAnalysisGrid::kOffline) return;
1041       cout << "===== MERGING OUTPUTS REGISTERED BY YOUR ANALYSIS JOB: " << GetName() << endl;
1042       if (!fGridHandler->MergeOutputs()) {
1043          // Return if outputs could not be merged or if it alien handler
1044          // was configured for offline mode or local testing.
1045          return;
1046       }
1047       ImportWrappers(NULL);
1048       Terminate();
1049       return;
1050    }
1051    char line[256];
1052    SetEventLoop(kFALSE);
1053    // Enable event loop mode if a tree was provided
1054    if (tree || fMode==kMixingAnalysis) SetEventLoop(kTRUE);
1055
1056    TChain *chain = 0;
1057    TString ttype = "TTree";
1058    if (tree && tree->IsA() == TChain::Class()) {
1059       chain = (TChain*)tree;
1060       if (!chain || !chain->GetListOfFiles()->First()) {
1061          Error("StartAnalysis", "Cannot process null or empty chain...");
1062          return;
1063       }
1064       ttype = "TChain";
1065    }
1066
1067    // Initialize locally all tasks (happens for all modes)
1068    TIter next(fTasks);
1069    AliAnalysisTask *task;
1070    if (runlocalinit) {
1071       while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) {
1072          task->LocalInit();
1073       }
1074    }
1075
1076    switch (fMode) {
1077       case kLocalAnalysis:
1078          if (!tree) {
1079             TIter nextT(fTasks);
1080             // Call CreateOutputObjects for all tasks
1081             while ((task=(AliAnalysisTask*)nextT())) {
1082                TDirectory *curdir = gDirectory;
1083                task->CreateOutputObjects();
1084                if (curdir) curdir->cd();
1085             }
1086             ExecAnalysis();
1087             Terminate();
1088             return;
1089          }
1090          // Run tree-based analysis via AliAnalysisSelector
1091          cout << "===== RUNNING LOCAL ANALYSIS " << GetName() << " ON TREE " << tree->GetName() << endl;
1092          fSelector = new AliAnalysisSelector(this);
1093          tree->Process(fSelector, "", nentries, firstentry);
1094          break;
1095       case kProofAnalysis:
1096          if (!gROOT->GetListOfProofs() || !gROOT->GetListOfProofs()->GetEntries()) {
1097             printf("StartAnalysis: no PROOF!!!\n");
1098             return;
1099          }
1100          sprintf(line, "gProof->AddInput((TObject*)0x%lx);", (ULong_t)this);
1101          gROOT->ProcessLine(line);
1102          if (chain) {
1103             chain->SetProof();
1104             cout << "===== RUNNING PROOF ANALYSIS " << GetName() << " ON CHAIN " << chain->GetName() << endl;
1105             chain->Process("AliAnalysisSelector", "", nentries, firstentry);
1106          } else {
1107             printf("StartAnalysis: no chain\n");
1108             return;
1109          }
1110          break;
1111       case kGridAnalysis:
1112          Warning("StartAnalysis", "GRID analysis mode not implemented. Running local.");
1113          break;
1114       case kMixingAnalysis:
1115          // Run event mixing analysis
1116          if (!fEventPool) {
1117             Error("StartAnalysis", "Cannot run event mixing without event pool");
1118             return;
1119          }
1120          cout << "===== RUNNING EVENT MIXING ANALYSIS " << GetName() << endl;
1121          fSelector = new AliAnalysisSelector(this);
1122          while ((chain=fEventPool->GetNextChain())) {
1123             next.Reset();
1124             // Call NotifyBinChange for all tasks
1125             while ((task=(AliAnalysisTask*)next()))
1126                if (!task->IsPostEventLoop()) task->NotifyBinChange();
1127             chain->Process(fSelector);
1128          }
1129          PackOutput(fSelector->GetOutputList());
1130          Terminate();
1131    }
1132 }
1133
1134 //______________________________________________________________________________
1135 void AliAnalysisManager::StartAnalysis(const char *type, const char *dataset, Long64_t nentries, Long64_t firstentry)
1136 {
1137 // Start analysis for this manager on a given dataset. Analysis task can be:
1138 // LOCAL, PROOF or GRID. Process nentries starting from firstentry.
1139    if (!fInitOK) {
1140       Error("StartAnalysis","Analysis manager was not initialized !");
1141       return;
1142    }
1143    if (fDebug > 0) printf("StartAnalysis %s\n",GetName());
1144    TString anaType = type;
1145    anaType.ToLower();
1146    if (!anaType.Contains("proof")) {
1147       Error("StartAnalysis", "Cannot process datasets in %s mode. Try PROOF.", type);
1148       return;
1149    }
1150    fMode = kProofAnalysis;
1151    char line[256];
1152    SetEventLoop(kTRUE);
1153    // Set the dataset flag
1154    TObject::SetBit(kUseDataSet);
1155    fTree = 0;
1156
1157    // Initialize locally all tasks
1158    TIter next(fTasks);
1159    AliAnalysisTask *task;
1160    while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) {
1161       task->LocalInit();
1162    }
1163
1164    if (!gROOT->GetListOfProofs() || !gROOT->GetListOfProofs()->GetEntries()) {
1165       printf("StartAnalysis: no PROOF!!!\n");
1166       return;
1167    }
1168    sprintf(line, "gProof->AddInput((TObject*)0x%lx);", (ULong_t)this);
1169    gROOT->ProcessLine(line);
1170    sprintf(line, "gProof->GetDataSet(\"%s\");", dataset);
1171    if (!gROOT->ProcessLine(line)) {
1172       Error("StartAnalysis", "Dataset %s not found", dataset);
1173       return;
1174    }
1175    sprintf(line, "gProof->Process(\"%s\", \"AliAnalysisSelector\", \"\", %lld, %lld);",
1176            dataset, nentries, firstentry);
1177    cout << "===== RUNNING PROOF ANALYSIS " << GetName() << " ON DATASET " << dataset << endl;
1178    gROOT->ProcessLine(line);
1179 }
1180
1181 //______________________________________________________________________________
1182 TFile *AliAnalysisManager::OpenProofFile(const char *filename, const char *option)
1183 {
1184 // Opens a special output file used in PROOF.
1185    char line[256];
1186    if (fMode!=kProofAnalysis || !fSelector) {
1187       Error("OpenProofFile","Cannot open PROOF file %s",filename);
1188       return NULL;
1189    }
1190    sprintf(line, "TProofOutputFile *pf = new TProofOutputFile(\"%s\");", filename);
1191    if (fDebug > 1) printf("=== %s\n", line);
1192    gROOT->ProcessLine(line);
1193    sprintf(line, "pf->OpenFile(\"%s\");", option);
1194    gROOT->ProcessLine(line);
1195    if (fDebug > 1) {
1196       gROOT->ProcessLine("pf->Print()");
1197       printf(" == proof file name: %s\n", gFile->GetName());
1198    }
1199    sprintf(line, "((TList*)0x%lx)->Add(pf);",(ULong_t)fSelector->GetOutputList());
1200    if (fDebug > 1) printf("=== %s\n", line);
1201    gROOT->ProcessLine(line);
1202    return gFile;
1203 }
1204
1205 //______________________________________________________________________________
1206 void AliAnalysisManager::ExecAnalysis(Option_t *option)
1207 {
1208 // Execute analysis.
1209    static Long64_t ncalls = 0;
1210    Bool_t getsysInfo = ((fNSysInfo>0) && (fMode==kLocalAnalysis))?kTRUE:kFALSE;
1211    if (getsysInfo && ncalls==0) AliSysInfo::AddStamp("Start", (Int_t)ncalls);
1212    ncalls++;
1213    if (!fInitOK) {
1214      Error("ExecAnalysis", "Analysis manager was not initialized !");
1215       return;
1216    }
1217    AliAnalysisTask *task;
1218    // Check if the top tree is active.
1219    if (fTree) {
1220       TIter next(fTasks);
1221    // De-activate all tasks
1222       while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) task->SetActive(kFALSE);
1223       AliAnalysisDataContainer *cont = (AliAnalysisDataContainer*)fInputs->At(0);
1224       if (!cont) {
1225               Error("ExecAnalysis","Cannot execute analysis in TSelector mode without at least one top container");
1226          return;
1227       }
1228       cont->SetData(fTree); // This will notify all consumers
1229       Long64_t entry = fTree->GetTree()->GetReadEntry();
1230
1231 //
1232 //    Call BeginEvent() for optional input/output and MC services
1233       if (fInputEventHandler)   fInputEventHandler  ->BeginEvent(entry);
1234       if (fOutputEventHandler)  fOutputEventHandler ->BeginEvent(entry);
1235       if (fMCtruthEventHandler) fMCtruthEventHandler->BeginEvent(entry);
1236 //
1237 //    Execute the tasks
1238 //      TIter next1(cont->GetConsumers());
1239       TIter next1(fTopTasks);
1240       while ((task=(AliAnalysisTask*)next1())) {
1241          if (fDebug >1) {
1242             cout << "    Executing task " << task->GetName() << endl;
1243          }
1244
1245          task->ExecuteTask(option);
1246       }
1247 //
1248 //    Call FinishEvent() for optional output and MC services
1249       if (fInputEventHandler)   fInputEventHandler  ->FinishEvent();
1250       if (fOutputEventHandler)  fOutputEventHandler ->FinishEvent();
1251       if (fMCtruthEventHandler) fMCtruthEventHandler->FinishEvent();
1252       // Gather system information if requested
1253       if (getsysInfo && ((ncalls%fNSysInfo)==0))
1254          AliSysInfo::AddStamp(Form("Event#%lld",ncalls),(Int_t)ncalls);
1255       return;
1256    }
1257    // The event loop is not controlled by TSelector
1258 //
1259 //  Call BeginEvent() for optional input/output and MC services
1260    if (fInputEventHandler)   fInputEventHandler  ->BeginEvent(-1);
1261    if (fOutputEventHandler)  fOutputEventHandler ->BeginEvent(-1);
1262    if (fMCtruthEventHandler) fMCtruthEventHandler->BeginEvent(-1);
1263    TIter next2(fTopTasks);
1264    while ((task=(AliAnalysisTask*)next2())) {
1265       task->SetActive(kTRUE);
1266       if (fDebug > 1) {
1267          cout << "    Executing task " << task->GetName() << endl;
1268       }
1269       task->ExecuteTask(option);
1270    }
1271 //
1272 // Call FinishEvent() for optional output and MC services
1273    if (fInputEventHandler)   fInputEventHandler  ->FinishEvent();
1274    if (fOutputEventHandler)  fOutputEventHandler ->FinishEvent();
1275    if (fMCtruthEventHandler) fMCtruthEventHandler->FinishEvent();
1276 }
1277
1278 //______________________________________________________________________________
1279 void AliAnalysisManager::FinishAnalysis()
1280 {
1281 // Finish analysis.
1282 }