ANALYSIS/macros/AnalysisTrainNew.C

   1 //===================== ANALYSIS TRAIN =========================================
   2 // To use: copy this macro to your work directory, modify the global part to match
   3 // your needs, then run root.
   4 //    root[0] .L AnalysisTrain.C
   5 // Grid full mode as below (other modes: test, offline, submit, terminate)
   6 //    root[1] AnalysisTrainNew("grid", "full")
   7 // CAF mode (requires root v5-23-02 + aliroot v4-16-Rev08)
   8 //    root[2] AnalysisTrainNew("proof")
   9 // Local mode requires AliESds.root or AliAOD.root in ./data directory
  10 //    root[3] AnalysisTrainNew("local")
  11 // In proof and grid modes, a token is needed and sourcing the produced environment file.
  12 //
  13 // If 'saveTrain' flag is set, the train will generate a directory name and run
  14 // in this directory. A configuration file 'ConfigTrain.C' will be generated.
  15 // One can replay at any time the train via:
  16 //    root[1] AnalysisTrainNew(ana_mode, plugin_mode, "train_default_<date>/ConfigTrain.C")
  17
  18 //==================   TRAIN NAME   ============================================
  19 TString     train_name         = "testTR018_LHC10a6ESD"; // *CHANGE ME* (no blancs or special characters)
  20 TString     job_tag            = "testTR018: ESD -> histograms"; // *CHANGE ME*
  21 //==============================================================================
  22
  23 // ### Settings that make sense in PROOF only
  24 //==============================================================================
  25 TString     proof_cluster      = "alicecaf.cern.ch";
  26 Bool_t      useAFPAR           = kFALSE;  // use AF special par file
  27 TString     AFversion          = "AF-v4-17";
  28 // Change CAF dataset here
  29 TString     proof_dataset      = "/COMMON/COMMON/LHC09a4_run8100X#/esdTree";
  30 TString     proof_outdir       = "";
  31
  32 // ### Settings that make sense when using the Alien plugin
  33 //==============================================================================
  34 Int_t       runOnData          = 0;       // Set to 1 if processing real data
  35 Int_t       iCollision         = 0;       // 0=pp, 1=Pb-Pb
  36 Bool_t      usePLUGIN          = kTRUE;   // do not change
  37 Bool_t      useProductionMode  = kFALSE;   // use the plugin in production mode
  38 // Usage of par files ONLY in grid mode and ONLY if the code is not available
  39 // in the deployed AliRoot versions. Par file search path: local dir, if not there $ALICE_ROOT.
  40 // To refresh par files, remove the ones in the workdir, then do "make <target.par>" in
  41 // AliRoot.
  42 Bool_t      usePAR             = kFALSE;  // use par files for extra libs
  43 Bool_t      useCPAR            = kFALSE;  // use par files for common libs
  44 TString     root_version       = "v5-26-00b";  // *CHANGE ME IF MORE RECENT IN GRID*
  45 TString     aliroot_version    = "v4-19-06-AN";  // *CHANGE ME IF MORE RECENT IN GRID*
  46 // Change production base directory here
  47 TString     alien_datadir      = "/alice/sim/LHC10a13";
  48 // AliEn output directory. If blank will become output_<train_name>
  49 //TString     alien_outdir       = "/alice/sim/LHC10a6/analysis/ESD/TR016";
  50  TString     alien_outdir       = "";
  51 // Output folder to write delta AOD's. Considered if not null.
  52 TString     outputSingleFolder = "";
  53 //TString     outputSingleFolder = "deltas";
  54 // Number of files merged in a chunk
  55 Int_t       maxMergeFiles      = 20;
  56 // Files that should not be merged
  57 TString     mergeExclude       = "AliAOD.root AliAOD.VertexingHF.root AliAOD.Jets.root deltaAODPartCorr.root AliAOD.Muons.root resonances.root forward.root";
  58 // Make replicas on the storages below
  59 TString     outputStorages      = "disk=4";
  60 // Number of runs per master job
  61 Int_t       nRunsPerMaster     = 10;
  62 // Maximum number of files per job (gives size of AOD)
  63 Int_t       nFilesPerJob       = 10;
  64 // Int_t       nFilesPerJob       = 1; (AOD->delta AOD production case)
  65 // Set the run range
  66 Int_t       run_range[2]       =  {104824, 104825};  //  *CHANGE ME*
  67 // ### Settings that make sense only for local analysis
  68 //==============================================================================
  69 // Change local xml dataset for local interactive analysis
  70 TString     local_xmldataset   = "";
  71
  72 // ### Other flags to steer the analysis
  73 //==============================================================================
  74 Bool_t      useDATE            = kFALSE; // use date in train name
  75 Bool_t      useDBG             = kTRUE; // activate debugging
  76 Bool_t      useMC              = kTRUE;  // use MC info
  77 Bool_t      useTAGS            = kTRUE; // use ESD tags for selection
  78 Bool_t      useKFILTER         = kTRUE; // use Kinematics filter
  79 Bool_t      useTR              = kTRUE;  // use track references
  80 Bool_t      useCORRFW          = kFALSE; // do not change
  81 Bool_t      useAODTAGS         = kFALSE;  // use AOD tags
  82 Bool_t      saveTrain          = kTRUE;  // save train configuration as:
  83 Bool_t      saveCanvases       = kTRUE; // save canvases created in Terminate
  84 Bool_t      saveProofToAlien   = kFALSE; // save proof outputs in AliEn
  85                                          // train_[trainName]_ddMonthyyyy_time.C
  86 // ### Analysis modules to be included. Some may not be yet fully implemented.
  87 //==============================================================================
  88 Int_t       iAODanalysis       = 0;      // Analysis on input AOD's
  89 Int_t       iAODhandler        = 1;      // Analysis produces an AOD or dAOD's
  90 Int_t       iESDfilter         = 1;      // ESD to AOD filter (barrel + muon tracks)
  91 Int_t       iMUONcopyAOD       = 1;      // Task that copies only muon events in a separate AOD (PWG3)
  92 Int_t       iJETAN             = 1;      // Jet analysis (PWG4)
  93 Int_t       iJETANdelta        = 1;      // Jet delta AODs
  94 Int_t       iPWG4partcorr      = 1;      // Gamma-hadron correlations task (PWG4)
  95 Int_t       iPWG4gammaconv     = 1;      // Gamma conversion analysis (PWG4)
  96 Int_t       iPWG4omega3pi      = 1;      // Omega to 3 pi analysis (PWG4)
  97 Int_t       iPWG3vertexing     = 1;      // Vertexing HF task (PWG3)
  98 Int_t       iPWG3hfe           = 1;      // Electrons analysis (PWG3)
  99 Int_t       iPWG3d2h           = 1;      // D0->2 hadrons (PWG3)
 100 Int_t        iPWG3d0mass       = 1;      // D0 mass (PWG3D2H)
 101 Int_t        iPWG3d0massLS     = 1;      // D0 mass LS (PWG3D2H)
 102 Int_t        iPWG3dplus        = 1;      // D+ analysis (PWG3D2H)
 103 Int_t        iPWG3LSd0         = 1;      // LS D0 analysis (PWG3D2H)
 104 Int_t        iPWG3LSjpsi       = 1;      // LS J/Psi analysis (PWG3D2H)
 105 Int_t        iPWG3CFd0         = 1;      // CF D0 analysis (PWG3D2H)
 106 Int_t        iPWG3promptd0     = 1;      // prompt D0 analysis (PWG3D2H)
 107 Int_t       iPWG3MuonTrain     = 1;      // Muon analysis train
 108 Int_t       iPWG2femto         = 1;      // Femtoscopy task (PWG2)
 109 Int_t       iPWG2spectra       = 1;      // Spectra tasks (PWG2
 110 Int_t        iPWG2protons      = 1;         // Proton-antiproton analysis
 111 Int_t        iPWG2checkcascade = 1;         // Check cascades task
 112 Int_t        iPWG2perfcascade  = 1;         // Check performance cascade
 113 Int_t        iPWG2checkv0      = 1;         // Check V0 task
 114 Int_t        iPWG2strange      = 1;         // Strangeness task
 115 Int_t        iPWG2central      = 1;         // Anisothropy in central collisions
 116 Int_t       iPWG2flow          = 1;      // Flow analysis tasks (PWG2)
 117 Int_t       iPWG2res           = 1;      // Resonances task (PWG2)
 118 Int_t        iPWG2rsneff       = 1;      // Resonances efficiency
 119 Int_t       iPWG2kink          = 1;      // Kink analysis tasks (PWG2)
 120 Int_t        iPWG2kinkESDMC    = 1;         // Kink ESD-MC comparison (PWG2)
 121 Int_t        iPWG2kinkLSKstar  = 1;      // Kink like-sign K* (PWG2)
 122 Int_t        iPWG2kinkLSL1520  = 1;      // Kink like-sign L1520 (PWG2)
 123 Int_t        iPWG2kinkLSPhi    = 1;      // Kink like-sign Phi (PWG2)
 124 Int_t        iPWG2kinkKstarESD = 1;      // Kink Kstar ESD (PWG2)
 125 Int_t        iPWG2kinkKstarMC  = 1;      // Kink Kstar MC (PWG2)
 126 Int_t        iPWG2kinkL1520ESD = 1;      // Kink L1520 ESD (PWG2)
 127 Int_t        iPWG2kinkL1520MC  = 1;      // Kink L1520 MC (PWG2)
 128 Int_t        iPWG2kinkPhiESD   = 1;      // Kink resonances Phi ESD (PWG2)
 129 Int_t        iPWG2kinkPhiMC    = 1;      // Kink resonances Phi MC (PWG2)
 130 Int_t       iPWG2evchar        = 1;      // Event characteristics (PWG2)
 131 Int_t       iPWG2unicor        = 1;      // Unicor analysis (PWG2)
 132 Int_t       iPWG2forward       = 1;      // FMD analysis (PWG2)
 133
 134 // ### Configuration macros used for each module
 135 //==============================================================================
 136 //TString     configPWG2femto    = "$ALICE_ROOT/PWG2/FEMTOSCOPY/macros/Train/Train3/ConfigFemtoAnalysis.C";
 137 TString     configPWG2femto    = "$ALICE_ROOT/PWG2/FEMTOSCOPY/macros/Train/PWG2TrainLHC10a6/ConfigFemtoAnalysis.C";
 138 //TString     configPWG3d2h      = "$ALICE_ROOT/PWG3/vertexingHF/ConfigVertexingHF_highmult.C";
 139 TString     configPWG3d2h      = "$ALICE_ROOT/PWG3/vertexingHF/ConfigVertexingHF.C";
 140 // Temporaries.
 141 TString anaPars = "";
 142 TString anaLibs = "";
 143 // Function signatures
 144 class AliAnalysisAlien;
 145
 146 //______________________________________________________________________________
 147 void AnalysisTrainNew(const char *analysis_mode="grid",
 148                       const char *plugin_mode="full",
 149                       const char *config_file="")
 150 {
 151 // Main analysis train macro. If a configuration file is provided, all parameters
 152 // are taken from there but may be altered by CheckModuleFlags.
 153    if (strlen(config_file) && !LoadConfig(config_file)) return;
 154    TString smode(analysis_mode);
 155    smode.ToUpper();
 156    // Check compatibility of selected modules
 157    CheckModuleFlags(smode);
 158    if (saveTrain)              WriteConfig();
 159
 160    printf("==================================================================\n");
 161    printf("===========    RUNNING ANALYSIS TRAIN %s IN %s MODE   ==========\n", train_name.Data(),smode.Data());
 162    printf("==================================================================\n");
 163    printf("=  Configuring analysis train for:                               =\n");
 164    if (iAODanalysis) printf("=  AOD analysis                                                  =\n");
 165    else              printf("=  ESD analysis                                                  =\n");
 166    if (iESDfilter)   printf("=  ESD filter                                                    =\n");
 167    if (iMUONcopyAOD) printf("=  MUON copy AOD                                                 =\n");
 168    if (iJETAN)       printf("=  Jet analysis                                                  =\n");
 169    if (iJETANdelta)  printf("=     Jet delta AODs                                             =\n");
 170    if (iPWG2spectra) {
 171       printf("=  PWG2 SPECTRA tasks :                                          =\n");
 172       if (iPWG2protons)      printf("=     PWG2 proton-antiproton                                     =\n");
 173       if (iPWG2checkcascade) printf("=     PWG2 check cascades                                        =\n");
 174       if (iPWG2perfcascade)  printf("=     PWG2 performance cascades                                  =\n");
 175       if (iPWG2checkv0)      printf("=     PWG2 check V0                                              =\n");
 176       if (iPWG2strange)      printf("=     PWG2 strangeness                                           =\n");
 177       if (iPWG2central)      printf("=     PWG2 central                                               =\n");
 178    }
 179    if (iPWG2femto) {
 180       printf("=  PWG2 femtoscopy                                               =\n");
 181       printf("   +++ configured by: %s\n", configPWG2femto.Data());
 182    }
 183    if (iPWG2flow)    printf("=  PWG2 flow                                                     =\n");
 184    if (iPWG2res)     printf("=  PWG2 resonances                                               =\n");
 185       if (iPWG2rsneff)    printf("=     PWG2 resonances efficiency                                    =\n");
 186    if (iPWG2kink) {
 187       printf("=  PWG2 kink analysis tasks:                                     =\n");
 188       if (iPWG2kinkESDMC)    printf("=     PWG2 ESD-MC kinks                                          =\n");
 189       if (iPWG2kinkLSKstar)  printf("=     PWG2 kink like-sign analysis K*                            =\n");
 190       if (iPWG2kinkLSL1520)  printf("=     PWG2 kink like-sign analysis L1520                         =\n");
 191       if (iPWG2kinkLSPhi)    printf("=     PWG2 kink like-sign analysis Phi                           =\n");
 192       if (iPWG2kinkKstarESD) printf("=     PWG2 kink Kstar ESD analysis                               =\n");
 193       if (iPWG2kinkKstarMC)  printf("=     PWG2 kink Kstar MC analysis                                =\n");
 194       if (iPWG2kinkL1520ESD) printf("=     PWG2 kink L1520 ESD analysis                               =\n");
 195       if (iPWG2kinkL1520MC)  printf("=     PWG2 kink L1520 MC analysis                                =\n");
 196       if (iPWG2kinkPhiESD) printf("=     PWG2 kink Phi ESD analysis                                 =\n");
 197       if (iPWG2kinkPhiMC)  printf("=     PWG2 kink Phi MC analysis                                  =\n");
 198   }
 199    if (iPWG2evchar)    printf("=  PWG2 event characteristics                                    =\n");
 200    if (iPWG2unicor)    printf("=  PWG2 Unicor analysis                                          =\n");
 201    if (iPWG2forward)   printf("=  PWG2 forward: sharing, density, bkg. correction, dNdEta       =\n");
 202    if (iPWG3vertexing) printf("=  PWG3 vertexing                                                =\n");
 203    if (iPWG3hfe)       printf("=  PWG3 electrons                                                =\n");
 204    if (iPWG3d2h) {
 205       printf("=  PWG3 D0->2 hadrons tasks                                      =\n");
 206       printf("   +++ configured by: %s\n", configPWG3d2h.Data());
 207       if (iPWG3d0mass)       printf("=     PWG3 D0 mass                                               =\n");
 208       if (iPWG3d0massLS)     printf("=     PWG3 D0 mass LS                                            =\n");
 209       if (iPWG3dplus)        printf("=     PWG3 D+ analysis                                           =\n");
 210       if (iPWG3LSd0)         printf("=     PWG3 LS D0                                                 =\n");
 211       if (iPWG3LSjpsi)       printf("=     PWG3 LS J/Psi                                              =\n");
 212       if (iPWG3CFd0)         printf("=     PWG3 CF D0                                                 =\n");
 213       if (iPWG3promptd0)     printf("=     PWG3 prompt D0                                             =\n");
 214    }
 215    if (iPWG3MuonTrain) printf("=  PWG3 muon train                                               =\n");
 216    if (iPWG4partcorr)  printf("=  PWG4 gamma-hadron, pi0 and gamma-jet correlations             =\n");
 217    if (iPWG4gammaconv) printf("=  PWG4 gamma conversion                                         =\n");
 218    if (iPWG4omega3pi)  printf("=  PWG4 omega to 3 pions                                         =\n");
 219    printf("==================================================================\n");
 220    printf(":: use MC truth      %d\n", (UInt_t)useMC);
 221    printf(":: use KINE filter   %d\n", (UInt_t)useKFILTER);
 222    printf(":: use track refs    %d\n", (UInt_t)useTR);
 223    printf(":: use tags          %d\n", (UInt_t)useTAGS);
 224    printf(":: use AOD tags      %d\n", (UInt_t)useAODTAGS);
 225    printf(":: use debugging     %d\n", (UInt_t)useDBG);
 226    printf(":: use PAR files     %d\n", (UInt_t)usePAR);
 227    printf(":: use AliEn plugin  %d\n", (UInt_t)usePLUGIN);
 228
 229    //==========================================================================
 230    // Connect to back-end system
 231    if (!Connect(smode)) {
 232       ::Error("AnalysisTrain", "Could not connect to %s back-end", analysis_mode);
 233       return;
 234    }
 235
 236    // Load common libraries and set include path
 237    if (!LoadCommonLibraries(smode)) {
 238       ::Error("AnalysisTrain", "Could not load common libraries");
 239       return;
 240    }
 241
 242    // Make the analysis manager and connect event handlers
 243    AliAnalysisManager *mgr  = new AliAnalysisManager("Analysis Train", "Production train");
 244    if (saveProofToAlien) mgr->SetSpecialOutputLocation(proof_outdir);
 245    if (!strcmp(plugin_mode, "test")) mgr->SetNSysInfo(1);
 246    // Load analysis specific libraries
 247    if (!LoadAnalysisLibraries(smode)) {
 248       ::Error("AnalysisTrain", "Could not load analysis libraries");
 249       return;
 250    }
 251
 252    // Create input handler (input container created automatically)
 253    if (iAODanalysis) {
 254    // AOD input handler
 255       AliAODInputHandler *aodH = new AliAODInputHandler();
 256       if (iPWG3d2h) aodH->AddFriend("AliAOD.VertexingHF.root");
 257       mgr->SetInputEventHandler(aodH);
 258    } else {
 259    // ESD input handler
 260       AliESDInputHandler *esdHandler = new AliESDInputHandler();
 261       if (useTAGS) esdHandler->SetReadTags();
 262       mgr->SetInputEventHandler(esdHandler);
 263    }
 264    // Monte Carlo handler
 265    if (useMC && !iAODanalysis) {
 266       AliMCEventHandler* mcHandler = new AliMCEventHandler();
 267       mgr->SetMCtruthEventHandler(mcHandler);
 268       mcHandler->SetReadTR(useTR);
 269    }
 270    // AOD output container, created automatically when setting an AOD handler
 271    if (iAODhandler) {
 272       // AOD output handler
 273       AliAODHandler* aodHandler   = new AliAODHandler();
 274       aodHandler->SetOutputFileName("AliAOD.root");
 275       mgr->SetOutputEventHandler(aodHandler);
 276       if (iAODanalysis) {
 277          aodHandler->SetFillAOD(kFALSE);
 278          aodHandler->SetCreateNonStandardAOD();
 279          aodHandler->SetOutputFileName("");
 280          if (iJETAN)         aodHandler->SetOutputFileName("AliAOD.Jets.root");
 281 //         if (iPWG3vertexing) aodHandler->SetOutputFileName("AliAOD.VertexingHF.root");
 282       }
 283    }
 284    // Debugging if needed
 285    if (useDBG) mgr->SetDebugLevel(2);
 286    if (saveCanvases) mgr->SetSaveCanvases(kTRUE);
 287
 288    //==========================================================================
 289    // Create the chain. In this example it is created only from ALIEN files but
 290    // can be done to work in batch or grid mode as well.
 291    TChain *chain = CreateChain(smode, plugin_mode);
 292
 293    //==========================================================================
 294    // Load the tasks configuration macros for all wagons. These files are supposed now to be
 295    // in the current workdir, but in AliEn they will be in the file catalog,
 296    // mapped from AliRoot and pecified in the jdl input list.
 297
 298    // For now connection to top input container and common AOD output container
 299    // is done in this macro, but in future these containers will be connected
 300    // from each task configuration macro.
 301
 302    AddAnalysisTasks();
 303
 304    // Run the analysis
 305    //
 306    if (usePLUGIN) {
 307       AliAnalysisGrid *alienHandler = CreateAlienHandler(plugin_mode);
 308       AliAnalysisManager::GetAnalysisManager()->SetGridHandler(alienHandler);
 309    }
 310
 311    if (mgr->InitAnalysis()) {
 312       mgr->PrintStatus();
 313       if (saveTrain || strlen(config_file)) gSystem->ChangeDirectory(train_name);
 314       StartAnalysis(smode, chain);
 315       if (saveTrain && smode=="GRID") {
 316          AliAnalysisAlien *gridhandler = (AliAnalysisAlien*)mgr->GetGridHandler();
 317          TString alien_workdir = gGrid->GetHomeDirectory();
 318          if (iAODanalysis) alien_workdir += "analysisAOD";
 319          else              alien_workdir += "analysisESD";
 320          alien_outdir = gridhandler->GetGridOutputDir();
 321          printf("=== Registering ConfigTrain.C in the work directory <%s> ===\n",
 322                 alien_workdir.Data());
 323          if (AliAnalysisAlien::FileExists(Form("%s/%sConfig.C", alien_workdir.Data(), train_name.Data())))
 324             gGrid->Rm(Form("%s/%sConfig.C", alien_workdir.Data(), train_name.Data()));
 325          if (strcmp(plugin_mode, "test"))
 326             TFile::Cp(Form("file:%sConfig.C",train_name.Data()), Form("alien://%s/%sConfig.C", alien_workdir.Data(), train_name.Data()));
 327       }
 328    }
 329 }
 330
 331 //______________________________________________________________________________
 332 void AddAnalysisTasks()
 333 {
 334 // Add all analysis task wagons to the train
 335    AliAnalysisManager *mgr = AliAnalysisManager::GetAnalysisManager();
 336
 337    if (iESDfilter && !iAODanalysis) {
 338       //  ESD filter task configuration.
 339       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/ANALYSIS/macros/AddTaskESDFilter.C");
 340       if (iMUONcopyAOD) {
 341          printf("Registering delta AOD file\n");
 342          mgr->RegisterExtraFile("AliAOD.Muons.root");
 343          AliAnalysisTaskESDfilter *taskesdfilter = AddTaskESDFilter(useKFILTER, kTRUE);
 344       } else {
 345          AliAnalysisTaskESDfilter *taskesdfilter = AddTaskESDFilter(useKFILTER, kFALSE);
 346       }
 347    }
 348
 349    // AOD tags
 350    if (useAODTAGS) {
 351       AliAnalysisTaskTagCreator* tagTask = new AliAnalysisTaskTagCreator("AOD Tag Creator");
 352       mgr->AddTask(tagTask);
 353       AliAnalysisDataContainer *coutTags = mgr->CreateContainer("cTag",  TTree::Class(),
 354                                            AliAnalysisManager::kOutputContainer, "AOD.tag.root");
 355       mgr->ConnectInput (tagTask, 0, mgr->GetCommonInputContainer());
 356       mgr->ConnectOutput(tagTask, 1, coutTags);
 357    }
 358
 359 // ********** PWG2 wagons ******************************************************
 360    AliAnalysisManager::SetCommonFileName("PWG2histograms.root");
 361
 362    // Proton analysis
 363    if (iPWG2spectra) {
 364       // protons
 365       if (iPWG2protons) {
 366         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/SPECTRA/macros/AddTaskProtons.C");
 367         AliAnalysisTaskProtons *taskprotons = AddTaskProtons();
 368         if (!taskprotons) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskProtons cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 369       }
 370       // cascades
 371       if (iPWG2checkcascade) {
 372         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/SPECTRA/macros/AddTaskCheckCascade.C");
 373         AliAnalysisTaskCheckCascade *taskcheckcascade = AddTaskCheckCascade(iCollision);
 374         if (!taskcheckcascade) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskCheckCascade cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 375       }
 376       // v0's
 377       if (iPWG2checkv0) {
 378         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/SPECTRA/macros/AddTaskCheckV0.C");
 379         AliAnalysisTaskCheckV0 *taskcheckV0 = AddTaskCheckV0();
 380         if (!taskcheckV0) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskCheckV0 cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 381       }
 382       // strangeness
 383       if (iPWG2strange) {
 384         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/SPECTRA/macros/AddTaskStrange.C");
 385         AliAnalysisTaskStrange *taskstrange = AddTaskStrange();
 386         if (!taskstrange) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskStrange cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 387       }
 388       // performance cascades
 389       if (iPWG2perfcascade) {
 390         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/SPECTRA/macros/AddTaskCheckPerformanceCascade.C");
 391         AliAnalysisTaskCheckPerformanceCascade *taskperfcascade = AddTaskCheckPerformanceCascade();
 392         if (!taskperfcascade) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskCheckPerformanceCascade cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 393       }
 394        // central
 395       if (iPWG2central) {
 396         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/SPECTRA/macros/AddTaskCentral.C");
 397         AliAnalysisTaskCentral *taskcentral = AddTaskCentral();
 398         if (!taskcentral) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskCentral cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 399       }
 400   }
 401
 402    // Femtoscopy analysis modules
 403    if (iPWG2femto) {
 404       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/FEMTOSCOPY/macros/AddTaskFemto.C");
 405       AliAnalysisTaskFemto *taskfemto = AddTaskFemto(configPWG2femto);
 406       if (!taskfemto) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskFemto cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 407    }
 408
 409    // Kink analysis
 410    if (iPWG2kink) {
 411       if (iPWG2kinkESDMC) {
 412         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKink.C");
 413         AliAnalysisKinkESDMC *taskkink1 = AddTaskKink();
 414         if (!taskkink1) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisKinkESDMC cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 415       }
 416       if (iPWG2kinkLSKstar) {
 417         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResLikeSignKstar.C");
 418         AliResonanceKinkLikeSign *taskkink2 = AddTaskKinkResLikeSignKstar();
 419         if (!taskkink2) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliResonanceKinkLikeSign cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 420       }
 421       if (iPWG2kinkLSL1520) {
 422         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResLikeSignL1520.C");
 423         AliResonanceKinkLikeSign *taskkink3 = AddTaskKinkResLikeSignL1520();
 424         if (!taskkink3) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliResonanceKinkLikeSign cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 425       }
 426       if (iPWG2kinkLSPhi) {
 427         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResLikeSignPhi.C");
 428         AliResonanceKinkLikeSign *taskkink4 = AddTaskKinkResLikeSignPhi();
 429         if (!taskkink4) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliResonanceKinkLikeSign cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 430       }
 431       if (iPWG2kinkKstarESD) {
 432         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResonanceKstarESD.C");
 433         AliAnalysisTaskKinkResonance *taskkink5 = AddTaskKinkResonanceKstarESD();
 434         if (!taskkink5) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisKinkResonanceKstarESD cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 435       }
 436       if (iPWG2kinkKstarMC) {
 437         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResonanceKstarMC.C");
 438         AliAnalysisTaskKinkResonance *taskkink6 = AddTaskKinkResonanceKstarMC();
 439         if (!taskkink6) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisKinkResonanceKstarMC cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 440       }
 441       if (iPWG2kinkL1520ESD) {
 442         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResonanceL1520ESD.C");
 443         AliAnalysisTaskKinkResonance *taskkink7 = AddTaskKinkResonanceL1520ESD();
 444         if (!taskkink7) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisKinkResonanceL1520ESD cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 445       }
 446       if (iPWG2kinkL1520MC) {
 447         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResonanceL1520MC.C");
 448         AliAnalysisTaskKinkResonance *taskkink8 = AddTaskKinkResonanceL1520MC();
 449         if (!taskkink8) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisKinkResonanceL1520MC cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 450       }
 451       if (iPWG2kinkPhiESD) {
 452         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResonancePhiESD.C");
 453         AliAnalysisTaskKinkResonance *taskkink9 = AddTaskKinkResonancePhiESD();
 454         if (!taskkink9) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisKinkResonancePhiESD cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 455       }
 456       if (iPWG2kinkPhiMC) {
 457         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResonancePhiMC.C");
 458         AliAnalysisTaskKinkResonance *taskkink10 = AddTaskKinkResonancePhiMC();
 459         if (!taskkink10) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisKinkResonancePhiMC cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 460       }
 461    }
 462
 463    // Event characterization
 464    if (iPWG2evchar) {
 465       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/EVCHAR/macros/AddTaskSPDdNdEta.C");
 466       AliAnalysisTaskSPDdNdEta *taskspddndeta = AddTaskSPDdNdEta();
 467       if (!taskspddndeta) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskSPDdNdEta cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 468       taskspddndeta->SetReadMC(useMC);
 469    }
 470
 471    // Unicor
 472    if (iPWG2unicor) {
 473       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/UNICOR/AddTaskUnicor.C");
 474       AliAnalysisTaskUnicor *taskunicor = AddTaskUnicor();
 475       if (!taskunicor) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskUnicor cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 476    }
 477
 478    // FMD
 479    AliAnalysisManager::SetCommonFileName("forward.root");
 480    if (iPWG2forward) {
 481       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/FORWARD/analysis/AddTaskFMD.C");
 482       AliFMDAnalysisTaskSE *taskfmd = AddTaskFMD();
 483       if (!taskfmd) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliFMDAnalysisTaskSE cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 484    }
 485    AliAnalysisManager::SetCommonFileName("PWG2histograms.root");
 486
 487    // Flow analysis
 488    if (iPWG2flow) {
 489       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/FLOW/macros/AddTaskFlow.C");
 490       Bool_t SP       = kTRUE;
 491       Bool_t LYZ1SUM  = kTRUE;
 492       Bool_t LYZ1PROD = kTRUE;
 493       Bool_t LYZ2SUM  = kFALSE;
 494       Bool_t LYZ2PROD = kFALSE;
 495       Bool_t LYZEP    = kFALSE;
 496       Bool_t GFC      = kTRUE;
 497       Bool_t QC       = kTRUE;
 498       Bool_t FQD      = kFALSE;
 499       Bool_t MCEP     = kFALSE; //does not work yet 24/12/08
 500       Bool_t kineFromESD = kTRUE;
 501       Bool_t METHODS[] = {SP,LYZ1SUM,LYZ1PROD,LYZ2SUM,LYZ2PROD,LYZEP,GFC,QC,FQD,MCEP};
 502       // Analysis type can be ESD, AOD, MC, ESDMC0, ESDMC1
 503       TString type = "AOD";
 504       if (!iAODanalysis) type = "ESD";
 505       // Boolean to fill/not fill the QA histograms
 506       Bool_t QA = kTRUE;
 507       // Boolean to use/not use weights for the Q vector
 508       Bool_t WEIGHTS[] = {kFALSE,kFALSE,kFALSE}; //Phi, v'(pt), v'(eta)
 509       AliAnalysisTaskFlowEvent* taskFE = AddTaskFlow(type,METHODS,QA,WEIGHTS);
 510       if (!taskFE) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskFlowEvent cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 511    }
 512
 513    // PWG2 resonances
 514    AliAnalysisManager::SetCommonFileName("resonances.root");
 515    if (iPWG2res) {
 516       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/RESONANCES/macros/train/AddAnalysisTaskRsnNew.C");
 517       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/RESONANCES/macros/train/AddAnalysisTaskRsnEffNew.C");
 518       TString path = gROOT->GetMacroPath();
 519       path += ":$ALICE_ROOT/PWG2/RESONANCES/macros/train";
 520       gROOT->SetMacroPath(path);
 521       AddAnalysisTaskRsnNew();
 522       if (iPWG2rsneff) AddAnalysisTaskRsnEffNew();
 523    }
 524    AliAnalysisManager::SetCommonFileName("PWG2histograms.root");
 525
 526 // ********** PWG3 wagons ******************************************************
 527    AliAnalysisManager::SetCommonFileName("PWG3histograms.root");
 528
 529    // PWG3 vertexing
 530    if (iPWG3vertexing) {
 531       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG3/vertexingHF/AddTaskVertexingHF.C");
 532       if (!iPWG3d2h) TFile::Cp(gSystem->ExpandPathName(configPWG3d2h.Data()), Form("%s/ConfigVertexingHF.C", train_name.Data()));
 533       AliAnalysisTaskSEVertexingHF *taskvertexingHF = AddTaskVertexingHF();
 534       if (!taskvertexingHF) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskSEVertexingHF cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 535       else mgr->RegisterExtraFile("AliAOD.VertexingHF.root");
 536    }
 537
 538    // PWG3 electrons
 539    if (iPWG3hfe) {
 540       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG3/hfe/AddTaskHFE.C");
 541       AliAnalysisTaskHFE *taskHFE = AddTaskHFE();
 542       if (!taskHFE) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskHFE cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 543    }
 544
 545    // PWG3 D2h
 546    if (iPWG3d2h) {
 547       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG3/vertexingHF/AddD2HTrain.C");
 548       TFile::Cp(gSystem->ExpandPathName(configPWG3d2h.Data()), Form("%s/ConfigVertexingHF.C", train_name.Data()));
 549       AddD2HTrain(kTRUE, iPWG3d0mass,iPWG3d0massLS,iPWG3dplus, iPWG3LSd0, iPWG3LSjpsi, iPWG3CFd0, iPWG3promptd0);
 550    }
 551
 552    // PWG3 muon
 553    if (iPWG3MuonTrain) {
 554       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG3/muon/AddPWG3MuonTrain.C");
 555       // iESDAnalysis, iAODAnalysis -> flags to select if the train is AOD or ESD based
 556       // iMuonDistributions, iSingleMuonANAlysis -> flags to switch on/off analysis wagons
 557       Int_t isESDAnalysis = (iAODanalysis)?0:1;
 558       Int_t isAODAnalysis = (iAODanalysis)?1:0;
 559       Int_t addMuonDistributions = 1;
 560       Int_t addSingleMuonAnalysis = 1;
 561       Int_t addMuonHFAnalysis = 1;
 562       Int_t ntaskmuon = AddPWG3MuonTrain(isESDAnalysis,isAODAnalysis,addMuonDistributions,addSingleMuonAnalysis,addMuonHFAnalysis);
 563       printf("Added %d muon tasks\n", ntaskmuon);
 564    }
 565
 566 // ********** PWG4 wagons ******************************************************
 567    AliAnalysisManager::SetCommonFileName("PWG4histograms.root");
 568
 569     // Jet analysis
 570    if (iJETAN) {
 571       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG4/macros/AddTaskJets.C");
 572       if (!iAODanalysis) {
 573          // Default jet reconstructor running on ESD's
 574          AliAnalysisTaskJets * taskjets = AddTaskJets();
 575          if (!taskjets) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskJets cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 576          if (iJETANdelta) {
 577             AddTaskJetsDelta("AliAOD.Jets.root");
 578             mgr->RegisterExtraFile("AliAOD.Jets.root");
 579          }
 580       } else {
 581          // AOD-based analysis. Add all reconstructors to write into delta AOD's
 582          if (iJETANdelta) {
 583             Int_t ntasksjets = AddTaskJetsDelta("AliAOD.Jets.root");
 584             if (ntasksjets) printf("Added %d jet reconstructors\n", ntasksjets);
 585          }
 586       }
 587    }
 588    // PWG4 hadron correlations
 589    if (iPWG4partcorr) {
 590       Bool_t isSimulation = (runOnData)?kFALSE:kTRUE;
 591       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG4/macros/AddTaskPartCorr.C");
 592       AliAnalysisTaskParticleCorrelation *taskpartcorrPHOS = AddTaskPartCorr("AOD", "PHOS", kFALSE, isSimulation);
 593       if (!taskpartcorrPHOS) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskParticleCorrelation PHOS cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 594       AliAnalysisTaskParticleCorrelation *taskpartcorrEMCAL = AddTaskPartCorr("AOD", "EMCAL", kFALSE, isSimulation);
 595       if (!taskpartcorrEMCAL) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskParticleCorrelation EMCAL cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 596       mgr->RegisterExtraFile("deltaAODPartCorr.root");
 597    }
 598
 599    // PWG4 gamma conversion analysis
 600    if (iPWG4gammaconv) {
 601       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG4/macros/AddTaskGammaConversion.C");
 602       TString cdir = gSystem->WorkingDirectory();
 603       gSystem->ChangeDirectory(gSystem->ExpandPathName("$ALICE_ROOT/PWG4/macros/"));
 604       TString gcArguments = "-run-on-train -run-jet -run-chic -run-neutralmeson -run-cf";
 605       AliAnalysisTaskGammaConversion * taskGammaConversion = AddTaskGammaConversion(gcArguments,mgr->GetCommonInputContainer());
 606       gSystem->ChangeDirectory(cdir);
 607       if (!taskGammaConversion) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskGammaConversion cannot run for these train conditions - EXCLUDED");
 608    }
 609
 610    // PWG4 omega to 3 pions analysis
 611    if (iPWG4omega3pi) {
 612       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG4/macros/AddTaskomega3pi.C");
 613       AliAnalysisTaskOmegaPi0PiPi *taskomega3pi = AddTaskomega3pi();
 614       if (!taskomega3pi) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskomega3pi cannot run for these train conditions - EXCLUDED");
 615    }
 616 }
 617
 618 //______________________________________________________________________________
 619 void StartAnalysis(const char *mode, TChain *chain) {
 620 // Start analysis.
 621    Int_t imode = -1;
 622    AliAnalysisManager *mgr = AliAnalysisManager::GetAnalysisManager();
 623    if (!strcmp(mode, "LOCAL")) imode = 0;
 624    if (!strcmp(mode, "PROOF")) imode = 1;
 625    if (!strcmp(mode, "GRID"))  imode = 2;
 626    switch (imode) {
 627       case 0:
 628          if (!chain) {
 629             ::Error("AnalysisTrainNew.C::StartAnalysis", "Cannot create the chain");
 630             return;
 631          }
 632          mgr->StartAnalysis(mode, chain);
 633          return;
 634       case 1:
 635          if (!proof_dataset.Length()) {
 636             ::Error("AnalysisTrainNew.C::StartAnalysis", "proof_dataset is empty");
 637             return;
 638          }
 639          mgr->StartAnalysis(mode, proof_dataset, 1000);
 640          return;
 641       case 2:
 642          if (usePLUGIN) {
 643             if (!mgr->GetGridHandler()) {
 644                ::Error("AnalysisTrainNew.C::StartAnalysis", "Grid plugin not initialized");
 645                return;
 646             }
 647             mgr->StartAnalysis("grid");
 648          } else {
 649             if (!chain) {
 650                ::Error("AnalysisTrainNew.C::StartAnalysis", "Cannot create the chain");
 651                return;
 652             }
 653             mgr->StartAnalysis(mode, chain);
 654          }
 655          return;
 656    }
 657 }
 658
 659 //______________________________________________________________________________
 660 void CheckModuleFlags(const char *mode) {
 661 // Checks selected modules and insure compatibility
 662    Int_t imode = -1;
 663    if (!strcmp(mode, "LOCAL")) imode = 0;
 664    if (!strcmp(mode, "PROOF")) imode = 1;
 665    if (!strcmp(mode, "GRID"))  imode = 2;
 666    if (!iJETAN) iJETANdelta = 0;
 667    if (imode==1) {
 668       if (!usePAR) {
 669          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PAR files enabled due to PROOF analysis");
 670          usePAR = kTRUE;
 671       }
 672    }
 673    if (imode != 2) {
 674       ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "AliEn plugin disabled since not in GRID mode");
 675       usePLUGIN = kFALSE;
 676    }
 677    if (iAODanalysis) {
 678    // AOD analysis
 679       if (useMC)
 680          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "MC usage disabled in analysis on AOD's");
 681       if (useAODTAGS)
 682          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "AOD tags usage disabled in analysis on AOD's");
 683       useMC = kFALSE;
 684       useTR = kFALSE;
 685       useAODTAGS = kFALSE;
 686       if (iESDfilter)
 687          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "ESD filter disabled in analysis on AOD's");
 688       iESDfilter   = 0;
 689       if (!iAODhandler) {
 690          if (iJETAN)
 691             ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "JETAN disabled in analysis on AOD's without AOD handler");
 692          iJETAN = 0;
 693          iJETANdelta = 0;
 694       }
 695       // Disable tasks that do not work yet on AOD data
 696       if (iPWG4gammaconv)
 697          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG4gammaconv disabled on AOD's without AOD handler");
 698       iPWG4gammaconv = 0;
 699       if (iPWG2central)
 700          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2central disabled on AOD's");
 701          iPWG2central = 0;
 702       if (iPWG2flow)
 703          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2flow disabled on AOD's");
 704          iPWG2flow = 0;
 705       if (iPWG2femto)
 706          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2femto disabled on AOD's");
 707          iPWG2femto = 0;
 708       if (iPWG2res)
 709          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2res disabled on AOD's");
 710          iPWG2res = 0;
 711        if (iPWG2rsneff)
 712          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2rsneff disabled on AOD's");
 713          iPWG2rsneff = 0;
 714      if (iPWG2kink)
 715          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2kink disabled in analysis on AOD's");
 716          iPWG2kink = 0;
 717       if (iPWG2unicor)
 718          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2unicor disabled in analysis on AOD's");
 719          iPWG2unicor = 0;
 720       if (iPWG2evchar)
 721          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG4evchar disabled on AOD's");
 722          iPWG2evchar = 0;
 723       if (iPWG2forward)
 724          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2forward disabled in analysis on AOD's");
 725          iPWG2forward = 0;
 726       if (iPWG3hfe)
 727          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG3hfe disabled on AOD's");
 728          iPWG3hfe = 0;
 729       if (iPWG4omega3pi)
 730          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG4omega3pi disabled on AOD's");
 731          iPWG4omega3pi = 0;
 732    } else {
 733    // ESD analysis
 734       if (!useMC) useTR = kFALSE;
 735       if (!useTR) {
 736          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "iPWG2evchar disabled if not reading track references");
 737          iPWG2evchar = 0;
 738       }
 739       if (!iAODhandler) {
 740          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "iPWG3d2h disabled on ESD analysis without AOD handler");
 741          iPWG3d2h = 0;
 742       }
 743    }
 744    if (!useMC) {
 745       if (iPWG2perfcascade)
 746          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2perfcascade disabled without MC info");
 747       iPWG2perfcascade = 0;
 748       if (iPWG2central)
 749          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2central disabled without MC info");
 750          iPWG2central = 0;
 751       if (iPWG2rsneff)
 752          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2rsneff disabled without MC info");
 753          iPWG2rsneff = 0;
 754    }
 755    if (iJETAN && !iAODanalysis) iESDfilter=1;
 756    if (iESDfilter) {iAODhandler=1; useCORRFW = kTRUE;}
 757    if (iPWG2spectra || iPWG2flow || iPWG3vertexing || iPWG3hfe || iPWG2res || iPWG2rsneff) useCORRFW = kTRUE;
 758    if (useKFILTER && !useMC) useKFILTER = kFALSE;
 759    if (useAODTAGS && !iAODhandler) useAODTAGS = kFALSE;
 760 }
 761
 762 //______________________________________________________________________________
 763 Bool_t Connect(const char *mode) {
 764 // Connect <username> to the back-end system.
 765    Int_t imode = -1;
 766    if (!strcmp(mode, "LOCAL")) imode = 0;
 767    if (!strcmp(mode, "PROOF")) imode = 1;
 768    if (!strcmp(mode, "GRID"))  imode = 2;
 769    TString username = gSystem->Getenv("alien_API_USER");
 770    switch (imode) {
 771       case 0:
 772          break;
 773       case 1:
 774          if  (!username.Length()) {
 775             ::Error(Form("AnalysisTrainNew.C::Connect <%s>", mode), "Make sure you:\n \
 776                            1. Have called: alien-token-init <username>\n \
 777                            2. Have called: >source /tmp/gclient_env_$UID");
 778             return kFALSE;
 779          }
 780          ::Info("AnalysisTrainNew.C::Connect", "Connecting user <%s> to PROOF cluster <%s>",
 781                 username.Data(), proof_cluster.Data());
 782          gEnv->SetValue("XSec.GSI.DelegProxy", "2");
 783 //         TProof::Open(Form("%s@%s:31093", username.Data(), proof_cluster.Data()));
 784          TProof::Open(Form("%s@%s", username.Data(), proof_cluster.Data()));
 785          if (!gProof) {
 786             if (strcmp(gSystem->Getenv("XrdSecGSISRVNAMES"), "lxfsrd0506.cern.ch"))
 787                ::Error(Form("AnalysisTrainNew.C::Connect <%s>", mode), "Environment XrdSecGSISRVNAMES different from lxfsrd0506.cern.ch");
 788             return kFALSE;
 789          }
 790          TGrid::Connect("alien://");
 791          if (gGrid) {
 792             TString homedir = gGrid->GetHomeDirectory();
 793             TString workdir = homedir + train_name;
 794             if (!gGrid->Cd(workdir)) {
 795                gGrid->Cd(homedir);
 796                if (gGrid->Mkdir(workdir)) {
 797                   gGrid->Cd(train_name);
 798                   ::Info("AnalysisTrainNew::Connect()", "Directory %s created", gGrid->Pwd());
 799                }
 800             }
 801             gGrid->Mkdir("proof_output");
 802             gGrid->Cd("proof_output");
 803             proof_outdir = Form("alien://%s", gGrid->Pwd());
 804          }
 805          break;
 806       case 2:
 807          if  (!username.Length()) {
 808             ::Error(Form("AnalysisTrainNew.C::Connect <%s>", mode), "Make sure you:\n \
 809                            1. Have called: alien-token-init <username>\n \
 810                            2. Have called: >source /tmp/gclient_env_$UID");
 811             return kFALSE;
 812          }
 813          if (usePLUGIN && !gSystem->Getenv("alien_CLOSE_SE")) {
 814             ::Error(Form("AnalysisTrainNew.C::Connect <%s>", mode),
 815                            "When using the AliEn plugin it is preferable to define the \
 816                            variable alien_CLOSE_SE in your environment.");
 817             return kFALSE;
 818          }
 819          ::Info("AnalysisTrainNew.C::Connect", "Connecting user <%s> to AliEn ...",
 820                 username.Data());
 821          TGrid::Connect("alien://");
 822          if (!gGrid || !gGrid->IsConnected()) return kFALSE;
 823          break;
 824       default:
 825          ::Error("AnalysisTrainNew.C::Connect", "Unknown run mode: %s", mode);
 826          return kFALSE;
 827    }
 828    ::Info("AnalysisTrainNew.C::Connect","Connected in %s mode", mode);
 829    return kTRUE;
 830 }
 831
 832 //______________________________________________________________________________
 833 Bool_t LoadCommonLibraries(const char *mode)
 834 {
 835 // Load common analysis libraries.
 836    Int_t imode = -1;
 837    if (!strcmp(mode, "LOCAL")) imode = 0;
 838    if (!strcmp(mode, "PROOF")) imode = 1;
 839    if (!strcmp(mode, "GRID"))  imode = 2;
 840    if (!gSystem->Getenv("ALICE_ROOT")) {
 841       ::Error("AnalysisTrainNew.C::LoadCommonLibraries", "Analysis train requires that analysis libraries are compiled with a local AliRoot");
 842       return kFALSE;
 843    }
 844    Bool_t success = kTRUE;
 845    // ROOT libraries
 846    gSystem->Load("libTree.so");
 847    gSystem->Load("libGeom.so");
 848    gSystem->Load("libVMC.so");
 849    gSystem->Load("libPhysics.so");
 850    gSystem->Load("libMinuit.so");
 851
 852    // Load framework classes. Par option ignored here.
 853    switch (imode) {
 854       case 0:
 855       case 2:
 856          if (useCPAR) {
 857             success &= LoadLibrary("STEERBase", mode, kTRUE);
 858             success &= LoadLibrary("ESD", mode, kTRUE);
 859             success &= LoadLibrary("AOD", mode, kTRUE);
 860             success &= LoadLibrary("ANALYSIS", mode, kTRUE);
 861             success &= LoadLibrary("ANALYSISalice", mode, kTRUE);
 862             if (useCORRFW) success &= LoadLibrary("CORRFW", mode, kTRUE);
 863          } else {
 864             success &= LoadLibrary("libSTEERBase.so", mode);
 865             success &= LoadLibrary("libESD.so", mode);
 866             success &= LoadLibrary("libAOD.so", mode);
 867             success &= LoadLibrary("libANALYSIS.so", mode);
 868             success &= LoadLibrary("libANALYSISalice.so", mode);
 869             if (useCORRFW) success &= LoadLibrary("libCORRFW.so", mode);
 870             gROOT->ProcessLine(".include $ALICE_ROOT/include");
 871          }
 872          break;
 873       case 1:
 874          Int_t ires = -1;
 875          if (useAFPAR && !gSystem->AccessPathName(AFversion)) ires = gProof->UploadPackage(AFversion);
 876          if (ires < 0) {
 877             success &= LoadLibrary("STEERBase", mode);
 878             success &= LoadLibrary("ESD", mode);
 879             success &= LoadLibrary("AOD", mode);
 880             success &= LoadLibrary("ANALYSIS", mode);
 881             success &= LoadLibrary("ANALYSISalice", mode);
 882             if (useCORRFW) success &= LoadLibrary("CORRFW", mode);
 883          } else {
 884             ires = gProof->EnablePackage(AFversion);
 885             if (ires<0) success = kFALSE;
 886             if (useCORRFW) success &= LoadLibrary("CORRFW", mode);
 887          }
 888          break;
 889       default:
 890          ::Error("AnalysisTrainNew.C::LoadCommonLibraries", "Unknown run mode: %s", mode);
 891          return kFALSE;
 892    }
 893    if (success) {
 894       ::Info("AnalysisTrainNew.C::LoadCommodLibraries", "Load common libraries:    SUCCESS");
 895       ::Info("AnalysisTrainNew.C::LoadCommodLibraries", "Include path for Aclic compilation:\n%s",
 896               gSystem->GetIncludePath());
 897    } else {
 898       ::Info("AnalysisTrainNew.C::LoadCommodLibraries", "Load common libraries:    FAILED");
 899    }
 900
 901    return success;
 902 }
 903
 904 //______________________________________________________________________________
 905 Bool_t LoadAnalysisLibraries(const char *mode)
 906 {
 907 // Load common analysis libraries.
 908    Bool_t success = kTRUE;
 909    if (iESDfilter || iPWG3MuonTrain) {
 910       if (!LoadLibrary("PWG3base", mode, kTRUE) ||
 911           !LoadLibrary("PWG3muon", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 912    }
 913    // JETAN
 914    if (iJETAN) {
 915       if (!LoadLibrary("JETAN", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 916    }
 917    if (iJETANdelta) {
 918       if (!LoadLibrary("JETAN", mode, kTRUE) ||
 919           !LoadLibrary("CGAL", mode, kTRUE) ||
 920           !LoadLibrary("fastjet", mode, kTRUE) ||
 921           !LoadLibrary("siscone", mode, kTRUE) ||
 922           !LoadLibrary("SISConePlugin", mode, kTRUE) ||
 923           !LoadLibrary("FASTJETAN", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 924    }
 925    // PWG4 particle correlations
 926    if (iPWG4partcorr) {
 927       if (!LoadLibrary("EMCALUtils", mode, kTRUE) ||
 928           !LoadLibrary("PHOSUtils", mode, kTRUE) ||
 929           !LoadLibrary("PWG4PartCorrBase", mode, kTRUE) ||
 930           !LoadLibrary("PWG4PartCorrDep", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 931    }
 932    // PWG4 gamma conversion
 933    if (iPWG4gammaconv) {
 934       if (!LoadLibrary("PWG4GammaConv", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 935    }
 936    // PWG4 omega to 3 pions
 937    if (iPWG4omega3pi) {
 938       if (!LoadLibrary("PWG4omega3pi", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 939    }
 940    // PWG2 task protons
 941    if (iPWG2spectra) {
 942       if (!LoadLibrary("PWG2spectra", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 943    }
 944    // PWG2 flow
 945    if (iPWG2flow) {
 946       if (!LoadLibrary("PWG2flowCommon", mode, kTRUE) ||
 947           !LoadLibrary("PWG2flowTasks", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 948    }
 949    // PWG2 resonances
 950    if (iPWG2res || iPWG2rsneff) {
 951       if (!LoadLibrary("PWG2resonances", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 952    }
 953    // PWG2 kink
 954    if (iPWG2kink) {
 955       if (!LoadLibrary("PWG2kink", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 956    }
 957    // PWG2 unicor
 958    if (iPWG2unicor) {
 959       if (!LoadLibrary("PWG2unicor", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 960    }
 961    // PWG2 evchar
 962    if (iPWG2evchar) {
 963       if (!LoadLibrary("PWG2evchar", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 964    }
 965    // PWG2 femtoscopy
 966    if (iPWG2femto) {
 967       if (!LoadLibrary("PWG2AOD", mode, kTRUE) ||
 968           !LoadLibrary("PWG2femtoscopy", mode, kTRUE) ||
 969           !LoadLibrary("PWG2femtoscopyUser", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 970 //      TFile::Cp(gSystem->ExpandPathName("$(ALICE_ROOT)/PWG2/FEMTOSCOPY/macros/ConfigFemtoAnalysis.C"), Form("%s/ConfigFemtoAnalysis.C", train_name.Data()));
 971 //      anaLibs += "ConfigFemtoAnalysis.C ";
 972    }
 973    // PWG2 FORWARD
 974    if (iPWG2forward) {
 975       if (!LoadLibrary("PWG2forward", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 976    }
 977    // PWG3 Vertexing HF
 978    if (iPWG3vertexing || iPWG3d2h) {
 979       if (!LoadLibrary("PWG3base", mode, kTRUE) ||
 980           !LoadLibrary("PWG3vertexingHF", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 981    }
 982    // PWG3 hfe
 983    if (iPWG3hfe) {
 984       if (!LoadLibrary("PWG3hfe", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 985    }
 986
 987    ::Info("AnalysisTrainNew.C::LoadAnalysisLibraries", "Load other libraries:   SUCCESS");
 988    return kTRUE;
 989 }
 990
 991 //______________________________________________________________________________
 992 Bool_t LoadLibrary(const char *module, const char *mode, Bool_t rec=kFALSE)
 993 {
 994 // Load a module library in a given mode. Reports success.
 995    Int_t imode = -1;
 996    Int_t result;
 997    TString smodule(module);
 998    if (!strcmp(mode, "LOCAL")) imode = 0;
 999    if (!strcmp(mode, "PROOF")) imode = 1;
1000    if (!strcmp(mode, "GRID"))  imode = 2;
1001    TString mod(module);
1002    if (!mod.Length()) {
1003       ::Error("AnalysisTrainNew.C::LoadLibrary", "Empty module name");
1004       return kFALSE;
1005    }
1006    // If a library is specified, just load it
1007    if (smodule.EndsWith(".so")) {
1008       mod.Remove(mod.Index(".so"));
1009       result = gSystem->Load(mod);
1010       if (result < 0) {
1011          ::Error("AnalysisTrainNew.C::LoadLibrary", "Could not load library %s", module);
1012          return kFALSE;
1013       }
1014       if (rec) anaLibs += Form("%s.so ",mod.Data());
1015       return kTRUE;
1016    }
1017    // Check if the library is already loaded
1018    if (strlen(gSystem->GetLibraries(Form("%s.so", module), "", kFALSE)) > 0)
1019       return kTRUE;
1020    switch (imode) {
1021       case 0:
1022       case 2:
1023          if (usePAR) {
1024             result = SetupPar(module);
1025             if (rec) anaPars += Form("%s.par ", module);
1026          } else {
1027             result = gSystem->Load(Form("lib%s.so", module));
1028             if (rec) anaLibs += Form("lib%s.so ", module);
1029          }
1030          break;
1031       case 1:
1032          result = gProof->UploadPackage(module);
1033          if (result<0) {
1034             result = gProof->UploadPackage(gSystem->ExpandPathName(Form("$ALICE_ROOT/%s.par", module)));
1035             if (result<0) {
1036                ::Error("AnalysisTrainNew.C::LoadLibrary", "Could not find module %s.par in current directory nor in $ALICE_ROOT", module);
1037                return kFALSE;
1038             }
1039          }
1040          result = gProof->EnablePackage(module);
1041          break;
1042       default:
1043          return kFALSE;
1044    }
1045    if (result < 0) {
1046       ::Error("AnalysisTrainNew.C::LoadLibrary", "Could not load module %s", module);
1047       return kFALSE;
1048    }
1049    return kTRUE;
1050 }
1051
1052
1053 //______________________________________________________________________________
1054 TChain *CreateChain(const char *mode, const char *plugin_mode)
1055 {
1056 // Create the input chain
1057    Int_t imode = -1;
1058    if (!strcmp(mode, "LOCAL")) imode = 0;
1059    if (!strcmp(mode, "PROOF")) imode = 1;
1060    if (!strcmp(mode, "GRID"))  imode = 2;
1061    TChain *chain = NULL;
1062    // Local chain
1063    switch (imode) {
1064       case 0:
1065          if (iAODanalysis) {
1066             if (!local_xmldataset.Length()) {
1067                // Local AOD
1068                chain = new TChain("aodTree");
1069                if (gSystem->AccessPathName("data/AliAOD.root"))
1070                   ::Error("AnalysisTrainNew.C::CreateChain", "File: AliAOD.root not in ./data dir");
1071                else {
1072                   if (!saveTrain) chain->Add("data/AliAOD.root");
1073                   else            chain->Add("../data/AliAOD.root");
1074                }
1075             } else {
1076                // Interactive AOD
1077                chain = CreateChainSingle(local_xmldataset, "aodTree");
1078             }
1079          } else {
1080             if (!local_xmldataset.Length()) {
1081                // Local ESD
1082                chain = new TChain("esdTree");
1083                if (gSystem->AccessPathName("data/AliESDs.root"))
1084                   ::Error("AnalysisTrainNew.C::CreateChain", "File: AliESDs.root not in ./data dir");
1085                else {
1086                   if (!saveTrain) chain->Add("data/AliESDs.root");
1087                   else            chain->Add("../data/AliESDs.root");
1088                }
1089             } else {
1090                // Interactive ESD
1091                chain = CreateChainSingle(local_xmldataset, "esdTree");
1092             }
1093          }
1094          break;
1095       case 1:
1096          break;
1097       case 2:
1098          if (usePLUGIN) {
1099 //            AliAnalysisGrid *alienHandler = CreateAlienHandler(plugin_mode);
1100 //            AliAnalysisManager::GetAnalysisManager()->SetGridHandler(alienHandler);
1101          } else {
1102             TString           treeName = "esdTree";
1103             if (iAODanalysis) treeName = "aodTree";
1104             chain = CreateChainSingle("wn.xml", treeName);
1105          }
1106          break;
1107       default:
1108    }
1109    if (chain && chain->GetNtrees()) return chain;
1110    return NULL;
1111 }
1112
1113 //______________________________________________________________________________
1114 TChain* CreateChainSingle(const char* xmlfile, const char *treeName)
1115 {
1116    printf("*******************************\n");
1117    printf("*** Getting the ESD Chain   ***\n");
1118    printf("*******************************\n");
1119    TAlienCollection * myCollection  = TAlienCollection::Open(xmlfile);
1120
1121    if (!myCollection) {
1122       ::Error("AnalysisTrainNew.C::CreateChainSingle", "Cannot create an AliEn collection from %s", xmlfile) ;
1123       return NULL ;
1124    }
1125
1126    TChain* chain = new TChain(treeName);
1127    myCollection->Reset() ;
1128    while ( myCollection->Next() ) chain->Add(myCollection->GetTURL("")) ;
1129    chain->ls();
1130    return chain;
1131 }
1132
1133 //______________________________________________________________________________
1134 Int_t SetupPar(char* pararchivename)
1135 {
1136    if (!pararchivename || !strlen(pararchivename)) return -1;
1137    char processline[1024];
1138    if (gSystem->AccessPathName(Form("%s.par", pararchivename))) {
1139       if (!gSystem->AccessPathName(Form("%s/%s.par", gSystem->Getenv("ALICE_ROOT"),pararchivename))) {
1140          ::Info("AnalysisTrainNew.C::SetupPar", "Getting %s.par from $ALICE_ROOT", pararchivename);
1141          TFile::Cp(gSystem->ExpandPathName(Form("$ALICE_ROOT/%s.par", pararchivename)),
1142                    Form("%s.par",pararchivename));
1143       } else {
1144          ::Error("AnalysisTrainNew.C::SetupPar", "Cannot find %s.par", pararchivename);
1145          return -1;
1146       }
1147    }
1148    if (usePLUGIN && saveTrain) gSystem->Exec(Form("ln -s ../%s.par %s",pararchivename, train_name.Data()));
1149    gSystem->Exec(Form("tar xvzf %s.par", pararchivename));
1150
1151    TString ocwd = gSystem->WorkingDirectory();
1152    if (!gSystem->ChangeDirectory(pararchivename)) return -1;
1153
1154    // check for BUILD.sh and execute
1155    if (!gSystem->AccessPathName("PROOF-INF/BUILD.sh")) {
1156       printf("*******************************\n");
1157       printf("*** Building PAR archive    ***\n");
1158       printf("*******************************\n");
1159       if (gSystem->Exec("PROOF-INF/BUILD.sh")) {
1160          Error("runProcess","Cannot Build the PAR Archive! - Abort!");
1161          return -1;
1162       }
1163    }
1164
1165         // check for SETUP.C and execute
1166         if (!gSystem->AccessPathName("PROOF-INF/SETUP.C")) {
1167             printf("*******************************\n");
1168             printf("*** Setup PAR archive       ***\n");
1169             printf("*******************************\n");
1170             gROOT->Macro("PROOF-INF/SETUP.C");
1171         }
1172         if (!gSystem->ChangeDirectory(ocwd.Data())) return -1;
1173    return 0;
1174 }
1175
1176 //______________________________________________________________________________
1177 AliAnalysisAlien* CreateAlienHandler(const char *plugin_mode)
1178 {
1179 // Check if user has a valid token, otherwise make one. This has limitations.
1180 // One can always follow the standard procedure of calling alien-token-init then
1181 //   source /tmp/gclient_env_$UID in the current shell.
1182    if (!AliAnalysisGrid::CreateToken()) return NULL;
1183    AliAnalysisAlien *plugin = new AliAnalysisAlien();
1184 // Set the run mode (can be "full", "test", "offline", "submit" or "terminate")
1185    plugin->SetRunMode(plugin_mode);
1186    if (useProductionMode) plugin->SetProductionMode();
1187    if (!outputSingleFolder.IsNull()) plugin->SetOutputSingleFolder(outputSingleFolder);
1188    plugin->SetJobTag(job_tag);
1189    plugin->SetNtestFiles(1);
1190 //   plugin->SetPreferedSE("ALICE::NIHAM::File");
1191 // Set versions of used packages
1192 //   plugin->SetAPIVersion("V2.4");
1193    plugin->SetAPIVersion("V1.1x");
1194    plugin->SetROOTVersion(root_version);
1195    plugin->SetAliROOTVersion(aliroot_version);
1196 // Declare input data to be processed.
1197 // Method 1: Create automatically XML collections using alien 'find' command.
1198 // Define production directory LFN
1199    plugin->SetGridDataDir(alien_datadir);
1200 // Set data search pattern
1201    if (iAODanalysis) plugin->SetDataPattern("*AliAOD.root");
1202    else              plugin->SetDataPattern("*AliESDs.root");
1203 // ...then add run numbers to be considered
1204    if (!iAODanalysis) plugin->SetRunRange(run_range[0], run_range[1]);
1205 //   for (Int_t i=0; i<10; i++) {
1206 //      if (run_numbers[i]==0) break;
1207 //      plugin->AddRunNumber(run_numbers[i]);
1208 //   }
1209 // Method 2: Declare existing data files (raw collections, xml collections, root file)
1210 // If no path mentioned data is supposed to be in the work directory (see SetGridWorkingDir())
1211 // XML collections added via this method can be combined with the first method if
1212 // the content is compatible (using or not tags)
1213 //   plugin->AddDataFile("tag.xml");
1214 //   plugin->AddDataFile("/alice/data/2008/LHC08c/000057657/raw/Run57657.Merged.RAW.tag.root");
1215 // Define alien work directory where all files will be copied. Relative to alien $HOME.
1216    if (iAODanalysis) plugin->SetGridWorkingDir("analysisAOD");
1217    else              plugin->SetGridWorkingDir("analysisESD");
1218 // Declare alien output directory. Relative to working directory.
1219    if (!alien_outdir.Length()) alien_outdir = Form("output_%s",train_name.Data());
1220    plugin->SetGridOutputDir(alien_outdir);
1221
1222    TString ana_sources = "";
1223    TString ana_add = "";
1224    if (usePAR && anaPars.Length()) {
1225       printf("%s\n", anaPars.Data());
1226       TObjArray *arr;
1227       TObjString *objstr;
1228       arr = anaPars.Tokenize(" ");
1229       TIter next(arr);
1230       while ((objstr=(TObjString*)next())) plugin->EnablePackage(objstr->GetString());
1231       delete arr;
1232    }
1233 // Add external packages
1234    if (iJETANdelta) {
1235       plugin->AddExternalPackage("boost::v1_38_0");
1236       plugin->AddExternalPackage("cgal::v3.3.1");
1237       plugin->AddExternalPackage("fastjet::v2.4.0");
1238    }
1239
1240 // Declare the analysis source files names separated by blancs. To be compiled runtime
1241 // using ACLiC on the worker nodes.
1242    ana_sources = ana_sources.Strip();
1243 // Declare all libraries (other than the default ones for the framework. These will be
1244 // loaded by the generated analysis macro. Add all extra files (task .cxx/.h) here.
1245    anaLibs     = anaLibs.Strip();
1246    if (ana_sources.Length()) plugin->SetAnalysisSource(ana_sources);
1247    if (anaLibs.Length())     plugin->SetAdditionalLibs(anaLibs);
1248
1249 // Declare the output file names separated by blancs.
1250 // (can be like: file.root or file.root@ALICE::Niham::File)
1251    plugin->SetDefaultOutputs();
1252    plugin->SetMergeExcludes(mergeExclude);
1253    plugin->SetMaxMergeFiles(maxMergeFiles);
1254    plugin->SetNrunsPerMaster(nRunsPerMaster);
1255 // Optionally define the files to be archived.
1256 //   plugin->SetOutputArchive("log_archive.zip:stdout,stderr@ALICE::NIHAM::File root_archive.zip:AliAOD.root,AOD.tag.root@ALICE::NIHAM::File");
1257
1258
1259    // Put default output files to archive
1260    TString listhists = "";
1261    TString listaods  = "";
1262    AliAnalysisManager *mgr = AliAnalysisManager::GetAnalysisManager();
1263    TIter next(mgr->GetOutputs());
1264    AliAnalysisDataContainer *output;
1265    while ((output=(AliAnalysisDataContainer*)next())) {
1266       const char *filename = output->GetFileName();
1267       if (!(strcmp(filename, "default"))) {
1268          if (!mgr->GetOutputEventHandler()) continue;
1269          filename = mgr->GetOutputEventHandler()->GetOutputFileName();
1270          if (listaods.Length()) listaods += ",";
1271          listaods += filename;
1272          listaods += ",";
1273          listaods += "pyxsec_hists.root";
1274       } else {
1275          if (!strcmp(filename, "pyxsec_hists.root")) continue;
1276          if (listhists.Contains(filename)) continue;
1277          if (listhists.Length()) listhists += ",";
1278          listhists += filename;
1279       }
1280    }
1281    if (mgr->GetExtraFiles().Length()) {
1282       if (listaods.Length()) listaods += ",";
1283       listaods += mgr->GetExtraFiles();
1284       listaods.ReplaceAll(" ", ",");
1285    }
1286    if (listhists.Length()) listhists = Form("hist_archive.zip:%s@%s", listhists.Data(), outputStorages.Data());
1287    if (listaods.Length())  listaods  = Form("aod_archive.zip:%s@%s", listaods.Data(), outputStorages.Data());
1288    if (!listhists.Length() && !listaods.Length()) {
1289       ::Fatal("AnalysisTrainNew", "No task output !");
1290    }
1291    TString outputArchive = Form("log_archive.zip:stderr,stdout@%s", outputStorages.Data());
1292    if (listaods.Length()) {
1293       outputArchive += " ";
1294       outputArchive += listaods;
1295    }
1296    if (listhists.Length()) {
1297       outputArchive += " ";
1298       outputArchive += listhists;
1299    }
1300 // Set friends
1301 //   if (iAODanalysis && iPWG3d2h)
1302 //      plugin->SetFriendChainName("AliAOD.VertexingHF.root");
1303    plugin->SetOutputArchive(outputArchive);
1304 // Optionally set a name for the generated analysis macro (default MyAnalysis.C)
1305    plugin->SetAnalysisMacro(Form("%s.C", train_name.Data()));
1306 // Optionally set maximum number of input files/subjob (default 100, put 0 to ignore)
1307    plugin->SetSplitMaxInputFileNumber(nFilesPerJob);
1308 // Optionally set number of failed jobs that will trigger killing waiting sub-jobs.
1309 //   plugin->SetMaxInitFailed(5);
1310 // Optionally resubmit threshold.
1311 //   plugin->SetMasterResubmitThreshold(90);
1312 // Optionally set time to live (default 30000 sec)
1313    plugin->SetTTL(70000);
1314 // Optionally set input format (default xml-single)
1315    plugin->SetInputFormat("xml-single");
1316 // Optionally modify the name of the generated JDL (default analysis.jdl)
1317    plugin->SetJDLName(Form("%s.jdl", train_name.Data()));
1318 // Optionally modify the executable name (default analysis.sh)
1319    plugin->SetExecutable(Form("%s.sh", train_name.Data()));
1320 // Optionally modify job price (default 1)
1321    plugin->SetPrice(1);
1322 // Optionally modify split mode (default 'se')
1323 //   plugin->SetSplitMode("se");
1324    return plugin;
1325 }
1326
1327 //______________________________________________________________________________
1328 void WriteConfig()
1329 {
1330 // Write train configuration in a file. The file name has the format:
1331 // train_[trainName]_ddMonthyyyy_time.C
1332    if (useDATE) {
1333       gSystem->Exec("date +%d%b%Y_%Hh%M > date.tmp");
1334       ifstream fdate("date.tmp");
1335       if (!fdate.is_open()) {
1336          ::Error("AnalysisTrainNew.C::Export","Could not generate file name");
1337          return;
1338       }
1339       const char date[64];
1340       fdate.getline(date,64);
1341       fdate.close();
1342       gSystem->Exec("rm date.tmp");
1343       train_name = Form("train_%s_%s", train_name.Data(), date);
1344    } else {
1345       train_name = Form("train_%s", train_name.Data());
1346    }
1347    TString cdir = gSystem->WorkingDirectory();
1348    gSystem->MakeDirectory(train_name);
1349    gSystem->ChangeDirectory(train_name);
1350    ofstream out;
1351    out.open(Form("%sConfig.C",train_name.Data()), ios::out);
1352    if (out.bad()) {
1353       ::Error("AnalysisTrainNew.C::Export", "Cannot open ConfigTrain.C for writing");
1354       return;
1355    }
1356    out << "{" << endl;
1357    out << "   train_name      = " << "\"" << train_name.Data() << "\";" << endl;
1358    out << "   proof_cluster   = " << "\"" << proof_cluster.Data() << "\";" << endl;
1359    out << "   useAFPAR        = " << useAFPAR << ";" << endl;
1360    if (useAFPAR)
1361       out << "   AFversion       = " << AFversion.Data() << ";" << endl;
1362    out << "   proof_dataset   = " << "\"" << proof_dataset.Data() << "\";" << endl;
1363    out << "   usePLUGIN       = " << usePLUGIN << ";" << endl;
1364    out << "   usePAR          = " << usePAR << ";" << endl;
1365    out << "   useCPAR         = " << useCPAR << ";" << endl;
1366    out << "   root_version    = " << "\"" << root_version.Data() << "\";" << endl;
1367    out << "   aliroot_version = " << "\"" << aliroot_version.Data() << "\";" << endl;
1368    out << "   alien_datadir   = " << "\"" << alien_datadir.Data() << "\";" << endl;
1369    if (!alien_outdir.Length()) alien_outdir = Form("output_%s",train_name.Data());
1370    out << "   alien_outdir    = " << "\"" << alien_outdir.Data() << "\";" << endl;
1371    out << "   maxMergeFiles   = " << maxMergeFiles << ";" << endl;
1372    out << "   mergeExclude    = " << "\"" << mergeExclude.Data() << "\";" << endl;
1373    out << "   nRunsPerMaster  = " << nRunsPerMaster << ";" << endl;
1374    out << "   nFilesPerJob    = " << nFilesPerJob << ";" << endl;
1375 //   for (Int_t i=0; i<10; i++) {
1376 //      if (run_numbers[i])
1377 //         out << "   run_numbers[" << i << "]  = " << run_numbers[i] << ";" << endl;
1378 //   }
1379    out << "   run_range[0]    = " << run_range[0] << ";" << endl;
1380    out << "   run_range[1]    = " << run_range[1] << ";" << endl;
1381    out << "   useDBG          = " << useDBG << ";" << endl;
1382    out << "   useMC           = " << useMC << ";" << endl;
1383    out << "   useTAGS         = " << useTAGS << ";" << endl;
1384    out << "   useKFILTER      = " << useKFILTER << ";" << endl;
1385    out << "   useTR           = " << useTR << ";" << endl;
1386    out << "   useCORRFW       = " << useCORRFW << ";" << endl;
1387    out << "   useAODTAGS      = " << useAODTAGS << ";" << endl;
1388    out << "   saveTrain       = " << "kFALSE;" << endl << endl;
1389    out << "   // Analysis modules" << endl;
1390    out << "   iAODanalysis    = " << iAODanalysis << ";" << endl;
1391    out << "   iAODhandler     = " << iAODhandler << ";" << endl;
1392    out << "   iESDfilter      = " << iESDfilter << ";" << endl;
1393    out << "   iMUONcopyAOD    = " << iMUONcopyAOD << ";" << endl;
1394    out << "   iJETAN          = " << iJETAN << ";" << endl;
1395    out << "   iJETANdelta     = " << iJETANdelta << ";" << endl;
1396    out << "   iPWG4partcorr   = " << iPWG4partcorr << ";" << endl;
1397    out << "   iPWG4gammaconv  = " << iPWG4gammaconv << ";" << endl;
1398    out << "   iPWG4omega3pi   = " << iPWG4omega3pi << ";" << endl;
1399    out << "   iPWG3vertexing  = " << iPWG3vertexing << ";" << endl;
1400    out << "   iPWG3hfe        = " << iPWG3hfe << ";" << endl;
1401    out << "   iPWG3d2h        = " << iPWG3d2h << ";" << endl;
1402    out << "     iPWG3d0mass       = " << iPWG3d0mass << ";" << endl;
1403    out << "     iPWG3d0massLS     = " << iPWG3d0massLS << ";" << endl;
1404    out << "     iPWG3dplus        = " << iPWG3dplus << ";" << endl;
1405    out << "     iPWG3LSd0         = " << iPWG3LSd0 << ";" << endl;
1406    out << "     iPWG3LSjpsi       = " << iPWG3LSjpsi << ";" << endl;
1407    out << "     iPWG3CFd0         = " << iPWG3CFd0 << ";" << endl;
1408    out << "     iPWG3promptd0     = " << iPWG3promptd0 << ";" << endl;
1409    out << "   iPWG3MuonTrain      = " << iPWG3MuonTrain << ";" << endl;
1410    out << "   iPWG2femto      = " << iPWG2femto << ";" << endl;
1411    out << "   iPWG2spectra    = " << iPWG2spectra << ";" << endl;
1412    out << "     iPWG2protons      = " << iPWG2protons << ";" << endl;
1413    out << "     iPWG2checkcascade = " << iPWG2checkcascade << ";" << endl;
1414    out << "     iPWG2perfcascade  = " << iPWG2perfcascade << ";" << endl;
1415    out << "     iPWG2checkv0      = " << iPWG2checkv0 << ";" << endl;
1416    out << "     iPWG2strange      = " << iPWG2strange << ";" << endl;
1417    out << "     iPWG2central      = " << iPWG2central << ";" << endl;
1418    out << "   iPWG2flow       = " << iPWG2flow << ";" << endl;
1419    out << "   iPWG2res        = " << iPWG2res << ";" << endl;
1420    out << "     iPWG2rsneff   = " << iPWG2rsneff << ";" << endl;
1421    out << "   iPWG2kink       = " << iPWG2kink << ";" << endl;
1422    out << "     iPWG2kinkESDMC    = " << iPWG2kinkESDMC << ";" << endl;
1423    out << "     iPWG2kinkLSKstar  = " << iPWG2kinkLSKstar << ";" << endl;
1424    out << "     iPWG2kinkLSL1520  = " << iPWG2kinkLSL1520 << ";" << endl;
1425    out << "     iPWG2kinkLSPhi    = " << iPWG2kinkLSPhi << ";" << endl;
1426    out << "     iPWG2kinkKstarESD = " << iPWG2kinkKstarESD << ";" << endl;
1427    out << "     iPWG2kinkKstarMC  = " << iPWG2kinkKstarMC << ";" << endl;
1428    out << "     iPWG2kinkL1520ESD = " << iPWG2kinkL1520ESD << ";" << endl;
1429    out << "     iPWG2kinkL1520MC  = " << iPWG2kinkL1520MC << ";" << endl;
1430    out << "     iPWG2kinkPhiESD   = " << iPWG2kinkPhiESD << ";" << endl;
1431    out << "     iPWG2kinkPhiMC    = " << iPWG2kinkPhiMC << ";" << endl;
1432    out << "   iPWG2unicor     = " << iPWG2unicor << ";" << endl;
1433    out << "   iPWG2evchar     = " << iPWG2evchar << ";" << endl;
1434    out << "   iPWG2forward    = " << iPWG2forward << ";" << endl << endl;
1435    out << "// Configuration fot the wagons" << endl;
1436    out << "   configPWG2femto = \"" << configPWG2femto << "\";" << endl;
1437    out << "   configPWG3d2h   = \"" << configPWG3d2h << "\";" << endl;
1438    out << "}" << endl;
1439    ::Info("AnalysisTrainNew.C::WriteConfig", "Train configuration wrote to file %s", Form("config_%s.C", train_name.Data()));
1440    gSystem->ChangeDirectory(cdir);
1441 }
1442
1443 //______________________________________________________________________________
1444 Bool_t LoadConfig(const char *filename)
1445 {
1446 // Read train configuration from file
1447    if (gSystem->AccessPathName(filename)) {
1448       ::Error("AnalysisTrainNew.C::LoadConfig", "Config file name not found");
1449       return kFALSE;
1450    }
1451    gROOT->ProcessLine(Form(".x %s", filename));
1452    ::Info("AnalysisTrainNew.C::LoadConfig", "Train configuration loaded from file %s", filename);
1453    return kTRUE;
1454 }