ANALYSIS/macros/AnalysisTrainNew.C

   1 //===================== ANALYSIS TRAIN =========================================
   2 // To use: copy this macro to your work directory, modify the global part to match
   3 // your needs, then run root.
   4 //    root[0] .L AnalysisTrain.C
   5 // Grid full mode as below (other modes: test, offline, submit, terminate)
   6 //    root[1] AnalysisTrainNew("grid", "full")
   7 // CAF mode (requires root v5-23-02 + aliroot v4-16-Rev08)
   8 //    root[2] AnalysisTrainNew("proof")
   9 // Local mode requires AliESds.root or AliAOD.root in ./data directory
  10 //    root[3] AnalysisTrainNew("local")
  11 // In proof and grid modes, a token is needed and sourcing the produced environment file.
  12 //
  13 // If 'saveTrain' flag is set, the train will generate a directory name and run
  14 // in this directory. A configuration file 'ConfigTrain.C' will be generated.
  15 // One can replay at any time the train via:
  16 //    root[1] AnalysisTrainNew(ana_mode, plugin_mode, "train_default_<date>/ConfigTrain.C")
  17
  18 //==================   TRAIN NAME   ============================================
  19 TString     train_name         = "FILTER_DATA"; // *CHANGE ME* (no blancs or special characters)
  20 TString     job_tag            = "FILTER_DATA: data ESD + PhysSel + Tender -> AOD + Muons + Vertices"; // *CHANGE ME*
  21 //==============================================================================
  22
  23 // ### Settings that make sense in PROOF only
  24 //==============================================================================
  25 TString     proof_cluster      = "alicecaf.cern.ch";
  26 Bool_t      useAFPAR           = kFALSE;  // use AF special par file
  27 TString     AFversion          = "AF-v4-17";
  28 // Change CAF dataset here
  29 TString     proof_dataset      = "/COMMON/COMMON/LHC09a4_run8100X#/esdTree";
  30 TString     proof_outdir       = "";
  31
  32 // ### Settings that make sense when using the Alien plugin
  33 //==============================================================================
  34 Int_t       runOnData          = 1;       // Set to 1 if processing real data
  35 Int_t       iCollision         = 0;       // 0=pp, 1=Pb-Pb
  36 Bool_t      usePLUGIN          = kTRUE;   // do not change
  37 Bool_t      useProductionMode  = kTRUE;   // use the plugin in production mode
  38 // Usage of par files ONLY in grid mode and ONLY if the code is not available
  39 // in the deployed AliRoot versions. Par file search path: local dir, if not there $ALICE_ROOT.
  40 // To refresh par files, remove the ones in the workdir, then do "make <target.par>" in
  41 // AliRoot.
  42 Bool_t      usePAR             = kFALSE;  // use par files for extra libs
  43 Bool_t      useCPAR            = kFALSE;  // use par files for common libs
  44 TString     root_version       = "v5-27-05";  // *CHANGE ME IF MORE RECENT IN GRID*
  45 TString     aliroot_version    = "v4-20-06-AN-1";  // *CHANGE ME IF MORE RECENT IN GRID*
  46 // Change production base directory here
  47 TString     alien_datadir      = "/alice/data/2010/LHC10d";
  48 // AliEn output directory. If blank will become output_<train_name>
  49 //TString     alien_outdir       = "/alice/data/2010/LHC10b/AOD1";
  50 TString     alien_outdir       = "";
  51 // Output folder to write delta AOD's. Considered if not null.
  52 TString     outputSingleFolder = "";
  53 //TString     outputSingleFolder = "deltas";
  54 // Number of files merged in a chunk
  55 Int_t       maxMergeFiles      = 20;
  56 // Files that should not be merged
  57 TString     mergeExclude       = "AliAOD.root AliAOD.VertexingHF.root AliAOD.Jets.root deltaAODPartCorr.root AliAOD.Muons.root AliAOD.Dimuons.root";
  58 // Make replicas on the storages below
  59 TString     outputStorages      = "disk=4";
  60 // Number of runs per master job
  61 Int_t       nRunsPerMaster     = 10;
  62 // Maximum number of files per job (gives size of AOD)
  63 Int_t       nFilesPerJob       = 50;
  64 // Int_t       nFilesPerJob       = 1; (AOD->delta AOD production case)
  65 // Set the run range
  66 Int_t run_numbers[10] = {126432}; // **********************!!!!!!!
  67 //Int_t       run_range[2]       =  {114786, 114949};  // LHC09a7   *CHANGE ME*
  68 // ### Settings that make sense only for local analysis
  69 //==============================================================================
  70 // Change local xml dataset for local interactive analysis
  71 TString     local_xmldataset   = "";
  72
  73 // ### Other flags to steer the analysis
  74 //==============================================================================
  75 Bool_t      usePhysicsSelection = kTRUE; // use physics selection
  76 Bool_t      useTender           = kTRUE; // use tender wagon
  77 Bool_t      useMergeViaJDL      = kTRUE;  // merge via JDL
  78 Bool_t      useFastReadOption   = kTRUE;  // use xrootd tweaks
  79 Bool_t      useOverwriteMode    = kTRUE;  // overwrite existing collections
  80 Bool_t      useDATE             = kFALSE; // use date in train name
  81 Bool_t      useDBG              = kTRUE;  // activate debugging
  82 Bool_t      useMC               = kFALSE;  // use MC info
  83 Bool_t      useTAGS             = kFALSE;  // use ESD tags for selection
  84 Bool_t      useKFILTER          = kFALSE;  // use Kinematics filter
  85 Bool_t      useTR               = kFALSE;  // use track references
  86 Bool_t      useCORRFW           = kFALSE; // do not change
  87 Bool_t      useAODTAGS          = kFALSE; // use AOD tags
  88 Bool_t      saveTrain           = kTRUE;  // save train configuration as:
  89 Bool_t      saveCanvases        = kFALSE;  // save canvases created in Terminate
  90 Bool_t      saveProofToAlien    = kFALSE; // save proof outputs in AliEn
  91
  92 // ### Analysis modules to be included. Some may not be yet fully implemented.
  93 //==============================================================================
  94 Int_t       iAODanalysis       = 0;      // Analysis on input AOD's
  95 Int_t       iAODhandler        = 1;      // Analysis produces an AOD or dAOD's
  96 Int_t       iESDfilter         = 1;      // ESD to AOD filter (barrel + muon tracks)
  97 Int_t       iMUONcopyAOD       = 1;      // Task that copies only muon events in a separate AOD (PWG3)
  98 Int_t       iJETAN             = 1;      // Jet analysis (PWG4)
  99 Int_t       iJETANdelta        = 0;      // Jet delta AODs
 100 Int_t       iPWG4partcorr      = 0;      // Gamma-hadron correlations task (PWG4)
 101 Int_t       iPWG4gammaconv     = 0;      // Gamma conversion analysis (PWG4)
 102 Int_t       iPWG4omega3pi      = 0;      // Omega to 3 pi analysis (PWG4)
 103 Int_t       iPWG3vertexing     = 1;      // Vertexing HF task (PWG3)
 104 Int_t       iPWG3hfe           = 0;      // Electrons analysis (PWG3)
 105 Int_t       iPWG3d2h           = 0;      // D0->2 hadrons (PWG3)
 106 Int_t        iPWG3d0mass       = 1;      // D0 mass (PWG3D2H)
 107 Int_t        iPWG3d0massLS     = 1;      // D0 mass LS (PWG3D2H)
 108 Int_t        iPWG3dplus        = 1;      // D+ analysis (PWG3D2H)
 109 Int_t        iPWG3LSd0         = 1;      // LS D0 analysis (PWG3D2H)
 110 Int_t        iPWG3LSjpsi       = 1;      // LS J/Psi analysis (PWG3D2H)
 111 Int_t        iPWG3CFd0         = 1;      // CF D0 analysis (PWG3D2H)
 112 Int_t        iPWG3promptd0     = 1;      // prompt D0 analysis (PWG3D2H)
 113 Int_t       iPWG3MuonTrain     = 0;      // Muon analysis train
 114 Int_t       iPWG2femto         = 0;      // Femtoscopy task (PWG2)
 115 Int_t       iPWG2spectra       = 0;      // Spectra tasks (PWG2
 116 Int_t        iPWG2protons      = 1;         // Proton-antiproton analysis
 117 Int_t        iPWG2checkcascade = 1;         // Check cascades task
 118 Int_t        iPWG2perfcascade  = 1;         // Check performance cascade
 119 Int_t        iPWG2checkv0      = 1;         // Check V0 task
 120 Int_t        iPWG2strange      = 1;         // Strangeness task
 121 Int_t        iPWG2central      = 1;         // Anisothropy in central collisions
 122 Int_t       iPWG2flow          = 0;      // Flow analysis tasks (PWG2)
 123 Int_t       iPWG2res           = 0;      // Resonances task (PWG2)
 124 Int_t        iPWG2rsneff       = 0;      // Resonances efficiency
 125 Int_t       iPWG2kink          = 0;      // Kink analysis tasks (PWG2)
 126 Int_t        iPWG2kinkESDMC    = 1;         // Kink ESD-MC comparison (PWG2)
 127 Int_t        iPWG2kinkLSKstar  = 1;      // Kink like-sign K* (PWG2)
 128 Int_t        iPWG2kinkLSL1520  = 1;      // Kink like-sign L1520 (PWG2)
 129 Int_t        iPWG2kinkLSPhi    = 1;      // Kink like-sign Phi (PWG2)
 130 Int_t        iPWG2kinkKstarESD = 1;      // Kink Kstar ESD (PWG2)
 131 Int_t        iPWG2kinkKstarMC  = 1;      // Kink Kstar MC (PWG2)
 132 Int_t        iPWG2kinkL1520ESD = 1;      // Kink L1520 ESD (PWG2)
 133 Int_t        iPWG2kinkL1520MC  = 1;      // Kink L1520 MC (PWG2)
 134 Int_t        iPWG2kinkPhiESD   = 1;      // Kink resonances Phi ESD (PWG2)
 135 Int_t        iPWG2kinkPhiMC    = 1;      // Kink resonances Phi MC (PWG2)
 136 Int_t       iPWG2evchar        = 0;      // Event characteristics (PWG2)
 137 Int_t       iPWG2unicor        = 0;      // Unicor analysis (PWG2)
 138 Int_t       iPWG2forward       = 0;      // FMD analysis (PWG2)
 139
 140 // ### Configuration macros used for each module
 141 //==============================================================================
 142 TString     configPWG2femto    = "$ALICE_ROOT/PWG2/FEMTOSCOPY/macros/Train/Train3/ConfigFemtoAnalysis.C";
 143 //TString     configPWG3d2h      = "$ALICE_ROOT/PWG3/vertexingHF/ConfigVertexingHF_highmult.C";
 144 TString     configPWG3d2h      = "$ALICE_ROOT/PWG3/vertexingHF/ConfigVertexingHF.C";
 145 // Temporaries.
 146 TString anaPars = "";
 147 TString anaLibs = "";
 148 // Function signatures
 149 class AliAnalysisAlien;
 150
 151 //______________________________________________________________________________
 152 void AnalysisTrainNew(const char *analysis_mode="grid",
 153                       const char *plugin_mode="full",
 154                       const char *config_file="")
 155 {
 156 // Main analysis train macro. If a configuration file is provided, all parameters
 157 // are taken from there but may be altered by CheckModuleFlags.
 158    if (strlen(config_file) && !LoadConfig(config_file)) return;
 159    TString smode(analysis_mode);
 160    smode.ToUpper();
 161    // Check compatibility of selected modules
 162    CheckModuleFlags(smode);
 163    if (saveTrain)              WriteConfig();
 164
 165    printf("==================================================================\n");
 166    printf("===========    RUNNING ANALYSIS TRAIN %s IN %s MODE   ==========\n", train_name.Data(),smode.Data());
 167    printf("==================================================================\n");
 168    printf("=  Configuring analysis train for:                               =\n");
 169    if (iAODanalysis) printf("=  AOD analysis                                                  =\n");
 170    else              printf("=  ESD analysis                                                  =\n");
 171    if (usePhysicsSelection)   printf("=  Physics selection                                                =\n");
 172    if (useTender)    printf("=  TENDER                                                        =\n");
 173    if (iESDfilter)   printf("=  ESD filter                                                    =\n");
 174    if (iMUONcopyAOD) printf("=  MUON copy AOD                                                 =\n");
 175    if (iJETAN)       printf("=  Jet analysis                                                  =\n");
 176    if (iJETANdelta)  printf("=     Jet delta AODs                                             =\n");
 177    if (iPWG2spectra) {
 178       printf("=  PWG2 SPECTRA tasks :                                          =\n");
 179       if (iPWG2protons)      printf("=     PWG2 proton-antiproton                                     =\n");
 180       if (iPWG2checkcascade) printf("=     PWG2 check cascades                                        =\n");
 181       if (iPWG2perfcascade)  printf("=     PWG2 performance cascades                                  =\n");
 182       if (iPWG2checkv0)      printf("=     PWG2 check V0                                              =\n");
 183       if (iPWG2strange)      printf("=     PWG2 strangeness                                           =\n");
 184       if (iPWG2central)      printf("=     PWG2 central                                               =\n");
 185    }
 186    if (iPWG2femto) {
 187       printf("=  PWG2 femtoscopy                                               =\n");
 188       printf("   +++ configured by: %s\n", configPWG2femto.Data());
 189    }
 190    if (iPWG2flow)    printf("=  PWG2 flow                                                     =\n");
 191    if (iPWG2res)     printf("=  PWG2 resonances                                               =\n");
 192       if (iPWG2rsneff)    printf("=     PWG2 resonances efficiency                                    =\n");
 193    if (iPWG2kink) {
 194       printf("=  PWG2 kink analysis tasks:                                     =\n");
 195       if (iPWG2kinkESDMC)    printf("=     PWG2 ESD-MC kinks                                          =\n");
 196       if (iPWG2kinkLSKstar)  printf("=     PWG2 kink like-sign analysis K*                            =\n");
 197       if (iPWG2kinkLSL1520)  printf("=     PWG2 kink like-sign analysis L1520                         =\n");
 198       if (iPWG2kinkLSPhi)    printf("=     PWG2 kink like-sign analysis Phi                           =\n");
 199       if (iPWG2kinkKstarESD) printf("=     PWG2 kink Kstar ESD analysis                               =\n");
 200       if (iPWG2kinkKstarMC)  printf("=     PWG2 kink Kstar MC analysis                                =\n");
 201       if (iPWG2kinkL1520ESD) printf("=     PWG2 kink L1520 ESD analysis                               =\n");
 202       if (iPWG2kinkL1520MC)  printf("=     PWG2 kink L1520 MC analysis                                =\n");
 203       if (iPWG2kinkPhiESD) printf("=     PWG2 kink Phi ESD analysis                                 =\n");
 204       if (iPWG2kinkPhiMC)  printf("=     PWG2 kink Phi MC analysis                                  =\n");
 205   }
 206    if (iPWG2evchar)    printf("=  PWG2 event characteristics                                    =\n");
 207    if (iPWG2unicor)    printf("=  PWG2 Unicor analysis                                          =\n");
 208    if (iPWG2forward)   printf("=  PWG2 forward: sharing, density, bkg. correction, dNdEta       =\n");
 209    if (iPWG3vertexing) printf("=  PWG3 vertexing                                                =\n");
 210    if (iPWG3hfe)       printf("=  PWG3 electrons                                                =\n");
 211    if (iPWG3d2h) {
 212       printf("=  PWG3 D0->2 hadrons tasks                                      =\n");
 213       printf("   +++ configured by: %s\n", configPWG3d2h.Data());
 214       if (iPWG3d0mass)       printf("=     PWG3 D0 mass                                               =\n");
 215       if (iPWG3d0massLS)     printf("=     PWG3 D0 mass LS                                            =\n");
 216       if (iPWG3dplus)        printf("=     PWG3 D+ analysis                                           =\n");
 217       if (iPWG3LSd0)         printf("=     PWG3 LS D0                                                 =\n");
 218       if (iPWG3LSjpsi)       printf("=     PWG3 LS J/Psi                                              =\n");
 219       if (iPWG3CFd0)         printf("=     PWG3 CF D0                                                 =\n");
 220       if (iPWG3promptd0)     printf("=     PWG3 prompt D0                                             =\n");
 221    }
 222    if (iPWG3MuonTrain) printf("=  PWG3 muon train                                               =\n");
 223    if (iPWG4partcorr)  printf("=  PWG4 gamma-hadron, pi0 and gamma-jet correlations             =\n");
 224    if (iPWG4gammaconv) printf("=  PWG4 gamma conversion                                         =\n");
 225    if (iPWG4omega3pi)  printf("=  PWG4 omega to 3 pions                                         =\n");
 226    printf("==================================================================\n");
 227    printf(":: use physics selection: %d\n", (UInt_t)usePhysicsSelection);
 228    printf(":: use xrootd tweaks:     %d\n", (UInt_t)useFastReadOption);
 229    printf(":: use overwrite xml    : %d\n", (UInt_t)useOverwriteMode);
 230    printf(":: use merge via JDL:     %d\n", (UInt_t)useMergeViaJDL);
 231    printf(":: use MC truth:          %d\n", (UInt_t)useMC);
 232    printf(":: use KINE filter:       %d\n", (UInt_t)useKFILTER);
 233    printf(":: use track references:  %d\n", (UInt_t)useTR);
 234    printf(":: use tags:              %d\n", (UInt_t)useTAGS);
 235    printf(":: use AOD tags:          %d\n", (UInt_t)useAODTAGS);
 236    printf(":: use debugging:         %d\n", (UInt_t)useDBG);
 237    printf(":: use PAR files:         %d\n", (UInt_t)usePAR);
 238    printf(":: use AliEn plugin:      %d\n", (UInt_t)usePLUGIN);
 239
 240    //==========================================================================
 241    // Connect to back-end system
 242    if (!Connect(smode)) {
 243       ::Error("AnalysisTrain", "Could not connect to %s back-end", analysis_mode);
 244       return;
 245    }
 246
 247    // Load common libraries and set include path
 248    if (!LoadCommonLibraries(smode)) {
 249       ::Error("AnalysisTrain", "Could not load common libraries");
 250       return;
 251    }
 252
 253    // Make the analysis manager and connect event handlers
 254    AliAnalysisManager *mgr  = new AliAnalysisManager("Analysis Train", "Production train");
 255    if (saveProofToAlien) mgr->SetSpecialOutputLocation(proof_outdir);
 256    if (!strcmp(plugin_mode, "test")) mgr->SetNSysInfo(1);
 257    // Load analysis specific libraries
 258    if (!LoadAnalysisLibraries(smode)) {
 259       ::Error("AnalysisTrain", "Could not load analysis libraries");
 260       return;
 261    }
 262
 263    // Create input handler (input container created automatically)
 264    if (iAODanalysis) {
 265    // AOD input handler
 266       AliAODInputHandler *aodH = new AliAODInputHandler();
 267       if (iPWG3d2h) aodH->AddFriend("AliAOD.VertexingHF.root");
 268       mgr->SetInputEventHandler(aodH);
 269    } else {
 270    // ESD input handler
 271       AliESDInputHandler *esdHandler = new AliESDInputHandler();
 272       if (useTAGS) esdHandler->SetReadTags();
 273       mgr->SetInputEventHandler(esdHandler);
 274    }
 275    // Monte Carlo handler
 276    if (useMC && !iAODanalysis) {
 277       AliMCEventHandler* mcHandler = new AliMCEventHandler();
 278       mgr->SetMCtruthEventHandler(mcHandler);
 279       mcHandler->SetReadTR(useTR);
 280    }
 281    // AOD output container, created automatically when setting an AOD handler
 282    if (iAODhandler) {
 283       // AOD output handler
 284       AliAODHandler* aodHandler   = new AliAODHandler();
 285       aodHandler->SetOutputFileName("AliAOD.root");
 286       mgr->SetOutputEventHandler(aodHandler);
 287       if (iAODanalysis) {
 288          aodHandler->SetFillAOD(kFALSE);
 289          aodHandler->SetCreateNonStandardAOD();
 290          if (iJETAN)         aodHandler->SetOutputFileName("AliAOD.Jets.root");
 291 //         if (iPWG3vertexing) aodHandler->SetOutputFileName("AliAOD.VertexingHF.root");
 292       }
 293    }
 294    // Debugging if needed
 295    if (useDBG) mgr->SetDebugLevel(3);
 296    if (saveCanvases) mgr->SetSaveCanvases(kTRUE);
 297
 298    //==========================================================================
 299    // Create the chain. In this example it is created only from ALIEN files but
 300    // can be done to work in batch or grid mode as well.
 301    TChain *chain = CreateChain(smode, plugin_mode);
 302
 303    //==========================================================================
 304    // Load the tasks configuration macros for all wagons. These files are supposed now to be
 305    // in the current workdir, but in AliEn they will be in the file catalog,
 306    // mapped from AliRoot and pecified in the jdl input list.
 307
 308    // For now connection to top input container and common AOD output container
 309    // is done in this macro, but in future these containers will be connected
 310    // from each task configuration macro.
 311
 312    AddAnalysisTasks();
 313
 314    // Run the analysis
 315    //
 316    if (usePLUGIN) {
 317       AliAnalysisGrid *alienHandler = CreateAlienHandler(plugin_mode);
 318       AliAnalysisManager::GetAnalysisManager()->SetGridHandler(alienHandler);
 319    }
 320
 321    if (mgr->InitAnalysis()) {
 322       mgr->PrintStatus();
 323       if (saveTrain || strlen(config_file)) gSystem->ChangeDirectory(train_name);
 324       StartAnalysis(smode, chain);
 325       if (saveTrain && smode=="GRID") {
 326          AliAnalysisAlien *gridhandler = (AliAnalysisAlien*)mgr->GetGridHandler();
 327          TString alien_workdir = gGrid->GetHomeDirectory();
 328          alien_workdir += train_name;
 329          alien_outdir = gridhandler->GetGridOutputDir();
 330          printf("=== Registering ConfigTrain.C in the work directory <%s> ===\n",
 331                 alien_workdir.Data());
 332          if (AliAnalysisAlien::FileExists(Form("%s/%sConfig.C", alien_workdir.Data(), train_name.Data())))
 333             gGrid->Rm(Form("%s/%sConfig.C", alien_workdir.Data(), train_name.Data()));
 334          if (strcmp(plugin_mode, "test"))
 335             TFile::Cp(Form("file:%sConfig.C",train_name.Data()), Form("alien://%s/%sConfig.C", alien_workdir.Data(), train_name.Data()));
 336       }
 337    }
 338 }
 339
 340 //______________________________________________________________________________
 341 void AddAnalysisTasks()
 342 {
 343 // Add all analysis task wagons to the train
 344    AliAnalysisManager *mgr = AliAnalysisManager::GetAnalysisManager();
 345
 346   //
 347   // Tender and supplies
 348   //
 349    if (useTender) {
 350       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/ANALYSIS/TenderSupplies/AddTaskTender.C");
 351       AliAnalysisTaskSE *tender = AddTaskTender(kTRUE);
 352 //      tender->SelectCollisionCandidates();
 353       tender->SetDebugLevel(2);
 354    }
 355    if (usePhysicsSelection) {
 356    // Physics selection task
 357       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/ANALYSIS/macros/AddTaskPhysicsSelection.C");
 358       mgr->RegisterExtraFile("event_stat.root");
 359       AliPhysicsSelectionTask *physSel = AddTaskPhysicsSelection(useMC);
 360    }
 361
 362    if (iESDfilter && !iAODanalysis) {
 363       //  ESD filter task configuration.
 364       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/ANALYSIS/macros/AddTaskESDFilter.C");
 365       if (iMUONcopyAOD) {
 366          printf("Registering delta AOD file\n");
 367          mgr->RegisterExtraFile("AliAOD.Muons.root");
 368          mgr->RegisterExtraFile("AliAOD.Dimuons.root");
 369          AliAnalysisTaskESDfilter *taskesdfilter = AddTaskESDFilter(useKFILTER, kTRUE, kTRUE, usePhysicsSelection);
 370       } else {
 371          AliAnalysisTaskESDfilter *taskesdfilter = AddTaskESDFilter(useKFILTER, kFALSE, kFALSE, usePhysicsSelection);
 372       }
 373    }
 374
 375    // AOD tags
 376    if (useAODTAGS) {
 377       AliAnalysisTaskTagCreator* tagTask = new AliAnalysisTaskTagCreator("AOD Tag Creator");
 378       mgr->AddTask(tagTask);
 379       AliAnalysisDataContainer *coutTags = mgr->CreateContainer("cTag",  TTree::Class(),
 380                                            AliAnalysisManager::kOutputContainer, "AOD.tag.root");
 381       mgr->ConnectInput (tagTask, 0, mgr->GetCommonInputContainer());
 382       mgr->ConnectOutput(tagTask, 1, coutTags);
 383    }
 384
 385 // ********** PWG2 wagons ******************************************************
 386    AliAnalysisManager::SetCommonFileName("PWG2histograms.root");
 387
 388    // Proton analysis
 389    if (iPWG2spectra) {
 390       // protons
 391       if (iPWG2protons) {
 392         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/SPECTRA/macros/AddTaskProtons.C");
 393         AliAnalysisTaskProtons *taskprotons = AddTaskProtons();
 394         if (!taskprotons) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskProtons cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 395       }
 396       // cascades
 397       if (iPWG2checkcascade) {
 398         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/SPECTRA/macros/AddTaskCheckCascade.C");
 399         AliAnalysisTaskCheckCascade *taskcheckcascade = AddTaskCheckCascade(iCollision,runOnData);
 400         if (!taskcheckcascade) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskCheckCascade cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 401       }
 402       // v0's
 403       if (iPWG2checkv0) {
 404         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/SPECTRA/macros/AddTaskCheckV0.C");
 405         AliAnalysisTaskCheckV0 *taskcheckV0 = AddTaskCheckV0();
 406         if (!taskcheckV0) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskCheckV0 cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 407       }
 408       // strangeness
 409       if (iPWG2strange) {
 410         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/SPECTRA/macros/AddTaskStrange.C");
 411         AliAnalysisTaskStrange *taskstrange = AddTaskStrange();
 412         if (!taskstrange) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskStrange cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 413       }
 414       // performance cascades
 415       if (iPWG2perfcascade) {
 416         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/SPECTRA/macros/AddTaskCheckPerformanceCascade.C");
 417         AliAnalysisTaskCheckPerformanceCascade *taskperfcascade = AddTaskCheckPerformanceCascade();
 418         if (!taskperfcascade) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskCheckPerformanceCascade cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 419       }
 420        // central
 421       if (iPWG2central) {
 422         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/SPECTRA/macros/AddTaskCentral.C");
 423         AliAnalysisTaskCentral *taskcentral = AddTaskCentral();
 424         if (!taskcentral) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskCentral cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 425       }
 426   }
 427
 428    // Femtoscopy analysis modules
 429    if (iPWG2femto) {
 430       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/FEMTOSCOPY/macros/AddTaskFemto.C");
 431       AliAnalysisTaskFemto *taskfemto = AddTaskFemto(configPWG2femto);
 432       if (!taskfemto) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskFemto cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 433    }
 434
 435    // Kink analysis
 436    if (iPWG2kink) {
 437       if (iPWG2kinkESDMC) {
 438         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKink.C");
 439         AliAnalysisKinkESDMC *taskkink1 = AddTaskKink();
 440         if (!taskkink1) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisKinkESDMC cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 441       }
 442       if (iPWG2kinkLSKstar) {
 443         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResLikeSignKstar.C");
 444         AliResonanceKinkLikeSign *taskkink2 = AddTaskKinkResLikeSignKstar();
 445         if (!taskkink2) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliResonanceKinkLikeSign cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 446       }
 447       if (iPWG2kinkLSL1520) {
 448         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResLikeSignL1520.C");
 449         AliResonanceKinkLikeSign *taskkink3 = AddTaskKinkResLikeSignL1520();
 450         if (!taskkink3) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliResonanceKinkLikeSign cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 451       }
 452       if (iPWG2kinkLSPhi) {
 453         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResLikeSignPhi.C");
 454         AliResonanceKinkLikeSign *taskkink4 = AddTaskKinkResLikeSignPhi();
 455         if (!taskkink4) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliResonanceKinkLikeSign cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 456       }
 457       if (iPWG2kinkKstarESD) {
 458         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResonanceKstarESD.C");
 459         AliAnalysisTaskKinkResonance *taskkink5 = AddTaskKinkResonanceKstarESD();
 460         if (!taskkink5) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisKinkResonanceKstarESD cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 461       }
 462       if (iPWG2kinkKstarMC) {
 463         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResonanceKstarMC.C");
 464         AliAnalysisTaskKinkResonance *taskkink6 = AddTaskKinkResonanceKstarMC();
 465         if (!taskkink6) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisKinkResonanceKstarMC cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 466       }
 467       if (iPWG2kinkL1520ESD) {
 468         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResonanceL1520ESD.C");
 469         AliAnalysisTaskKinkResonance *taskkink7 = AddTaskKinkResonanceL1520ESD();
 470         if (!taskkink7) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisKinkResonanceL1520ESD cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 471       }
 472       if (iPWG2kinkL1520MC) {
 473         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResonanceL1520MC.C");
 474         AliAnalysisTaskKinkResonance *taskkink8 = AddTaskKinkResonanceL1520MC();
 475         if (!taskkink8) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisKinkResonanceL1520MC cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 476       }
 477       if (iPWG2kinkPhiESD) {
 478         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResonancePhiESD.C");
 479         AliAnalysisTaskKinkResonance *taskkink9 = AddTaskKinkResonancePhiESD();
 480         if (!taskkink9) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisKinkResonancePhiESD cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 481       }
 482       if (iPWG2kinkPhiMC) {
 483         gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/KINK/macros/AddTaskKinkResonancePhiMC.C");
 484         AliAnalysisTaskKinkResonance *taskkink10 = AddTaskKinkResonancePhiMC();
 485         if (!taskkink10) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisKinkResonancePhiMC cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 486       }
 487    }
 488
 489    // Event characterization
 490    if (iPWG2evchar) {
 491       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/EVCHAR/macros/AddTaskSPDdNdEta.C");
 492       AliAnalysisTaskSPDdNdEta *taskspddndeta = AddTaskSPDdNdEta();
 493       if (!taskspddndeta) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskSPDdNdEta cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 494       taskspddndeta->SetReadMC(useMC);
 495    }
 496
 497    // Unicor
 498    if (iPWG2unicor) {
 499       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/UNICOR/AddTaskUnicor.C");
 500       AliAnalysisTaskUnicor *taskunicor = AddTaskUnicor();
 501       if (!taskunicor) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskUnicor cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 502    }
 503
 504    // Forward Multiplicity
 505    AliAnalysisManager::SetCommonFileName("forward.root");
 506    if (iPWG2forward) {
 507       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/FORWARD/analysis2/AddTaskForwardMult.C");
 508       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/FORWARD/analysis2/AddTaskCentralMult.C");
 509       Bool_t   mc  = false;
 510       UShort_t sys = 0; // 0: get from data, 1: pp, 2: AA
 511       UShort_t sNN = 0; // 0: get from data, otherwise center of mass
 512                         // energy (per nucleon pair)
 513       Short_t  fld = 0; // 0: get from data, otherwise L3 field in kG
 514       AliAnalysisTask *taskForward = AddTaskForwardMult(mc, sys, sNN, fld);
 515       if (!taskForward)
 516         ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliForwardMultiplicityTask cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 517       AliAnalysisTask *taskCentral = AddTaskCentralMult(mc, sys, sNN, fld);
 518       if (!taskCentral)
 519         ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliCentralMultiplicityTask cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 520    }
 521    AliAnalysisManager::SetCommonFileName("PWG2histograms.root");
 522
 523    // Flow analysis
 524    if (iPWG2flow) {
 525       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/FLOW/macros/AddTaskFlow.C");
 526       Bool_t SP       = kTRUE;
 527       Bool_t LYZ1SUM  = kTRUE;
 528       Bool_t LYZ1PROD = kTRUE;
 529       Bool_t LYZ2SUM  = kFALSE;
 530       Bool_t LYZ2PROD = kFALSE;
 531       Bool_t LYZEP    = kFALSE;
 532       Bool_t GFC      = kTRUE;
 533       Bool_t QC       = kTRUE;
 534       Bool_t FQD      = kFALSE;
 535       Bool_t MCEP     = kFALSE; //does not work yet 24/12/08
 536       Bool_t kineFromESD = kTRUE;
 537       Bool_t METHODS[] = {SP,LYZ1SUM,LYZ1PROD,LYZ2SUM,LYZ2PROD,LYZEP,GFC,QC,FQD,MCEP};
 538       // Analysis type can be ESD, AOD, MC, ESDMC0, ESDMC1
 539       TString type = "AOD";
 540       if (!iAODanalysis) type = "ESD";
 541       // Boolean to fill/not fill the QA histograms
 542       Bool_t QA = kTRUE;
 543       // Boolean to use/not use weights for the Q vector
 544       Bool_t WEIGHTS[] = {kFALSE,kFALSE,kFALSE}; //Phi, v'(pt), v'(eta)
 545       AliAnalysisTaskFlowEvent* taskFE = AddTaskFlow(type,METHODS,QA,WEIGHTS);
 546       if (!taskFE) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskFlowEvent cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 547    }
 548
 549    // PWG2 resonances
 550    AliAnalysisManager::SetCommonFileName("resonances.root");
 551    if (iPWG2res) {
 552       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/RESONANCES/macros/train/AddAnalysisTaskRsnNew.C");
 553       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG2/RESONANCES/macros/train/AddAnalysisTaskRsnEffNew.C");
 554       TString path = gROOT->GetMacroPath();
 555       path += ":$ALICE_ROOT/PWG2/RESONANCES/macros/train";
 556       gROOT->SetMacroPath(path);
 557       AddAnalysisTaskRsn(kTRUE);
 558       if (iPWG2rsneff) AddAnalysisTaskRsnEff();
 559    }
 560    AliAnalysisManager::SetCommonFileName("PWG2histograms.root");
 561
 562 // ********** PWG3 wagons ******************************************************
 563    AliAnalysisManager::SetCommonFileName("PWG3histograms.root");
 564
 565    // PWG3 vertexing
 566    if (iPWG3vertexing) {
 567       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG3/vertexingHF/macros/AddTaskVertexingHF.C");
 568       if (!iPWG3d2h) TFile::Cp(gSystem->ExpandPathName(configPWG3d2h.Data()), Form("%s/ConfigVertexingHF.C", train_name.Data()));
 569       AliAnalysisTaskSEVertexingHF *taskvertexingHF = AddTaskVertexingHF();
 570       if (!taskvertexingHF) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskSEVertexingHF cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 571       else mgr->RegisterExtraFile("AliAOD.VertexingHF.root");
 572    }
 573
 574    // PWG3 electrons
 575    if (iPWG3hfe) {
 576       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG3/hfe/AddTaskHFE.C");
 577       AliAnalysisTaskHFE *taskHFE = AddTaskHFE();
 578       if (!taskHFE) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskHFE cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 579    }
 580
 581    // PWG3 D2h
 582    if (iPWG3d2h) {
 583       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG3/vertexingHF/AddD2HTrain.C");
 584       TFile::Cp(gSystem->ExpandPathName(configPWG3d2h.Data()), Form("%s/ConfigVertexingHF.C", train_name.Data()));
 585       AddD2HTrain(iPWG3d0mass,iPWG3d0massLS,iPWG3dplus, iPWG3LSd0, iPWG3LSjpsi, iPWG3CFd0, iPWG3promptd0);
 586    }
 587
 588    // PWG3 muon
 589    if (iPWG3MuonTrain) {
 590       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG3/muon/AddPWG3MuonTrain.C");
 591       // iESDAnalysis, iAODAnalysis -> flags to select if the train is AOD or ESD based
 592       // iMuonDistributions, iSingleMuonANAlysis -> flags to switch on/off analysis wagons
 593       Int_t isESDAnalysis = (iAODanalysis)?0:1;
 594       Int_t isAODAnalysis = (iAODanalysis)?1:0;
 595       Int_t addMuonDistributions = 1;
 596       Int_t addSingleMuonAnalysis = 1;
 597       Int_t addMuonHFAnalysis = 1;
 598       Int_t ntaskmuon = AddPWG3MuonTrain(isESDAnalysis,isAODAnalysis,addMuonDistributions,addSingleMuonAnalysis,addMuonHFAnalysis);
 599       printf("Added %d muon tasks\n", ntaskmuon);
 600    }
 601
 602 // ********** PWG4 wagons ******************************************************
 603    AliAnalysisManager::SetCommonFileName("PWG4histograms.root");
 604
 605     // Jet analysis
 606    if (iJETAN) {
 607       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG4/macros/AddTaskJets.C");
 608       if (!iAODanalysis) {
 609          // Default jet reconstructor running on ESD's
 610          AliAnalysisTaskJets * taskjets = AddTaskJets();
 611          if (!taskjets) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskJets cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 612          if (iJETANdelta) {
 613             AddTaskJetsDelta("AliAOD.Jets.root");
 614             mgr->RegisterExtraFile("AliAOD.Jets.root");
 615          }
 616       } else {
 617          // AOD-based analysis. Add all reconstructors to write into delta AOD's
 618          if (iJETANdelta) {
 619             Int_t ntasksjets = AddTaskJetsDelta("AliAOD.Jets.root",0,kFALSE);
 620             if (ntasksjets) printf("Added %d jet reconstructors\n", ntasksjets);
 621          }
 622       }
 623    }
 624    // PWG4 hadron correlations
 625    if (iPWG4partcorr) {
 626       Bool_t isSimulation = (runOnData)?kFALSE:kTRUE;
 627       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG4/macros/AddTaskPartCorr.C");
 628       AliAnalysisTaskParticleCorrelation *taskpartcorrPHOS = AddTaskPartCorr("AOD", "PHOS", kFALSE, isSimulation);
 629       if (!taskpartcorrPHOS) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskParticleCorrelation PHOS cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 630       AliAnalysisTaskParticleCorrelation *taskpartcorrEMCAL = AddTaskPartCorr("AOD", "EMCAL", kFALSE, isSimulation);
 631       if (!taskpartcorrEMCAL) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskParticleCorrelation EMCAL cannot run for this train conditions - EXCLUDED");
 632       mgr->RegisterExtraFile("deltaAODPartCorr.root");
 633    }
 634
 635    // PWG4 gamma conversion analysis
 636    if (iPWG4gammaconv) {
 637       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG4/macros/AddTaskGammaConversion.C");
 638       TString cdir = gSystem->WorkingDirectory();
 639       gSystem->ChangeDirectory(gSystem->ExpandPathName("$ALICE_ROOT/PWG4/macros/"));
 640       TString gcArguments = "-run-on-train   -use-own-xyz  -run-jet  -run-neutralmeson -no-aod  -apply-chi2-cut -low-memory -use-v0-multiplicity -move-bg-vertex ";
 641       TString kGCAnalysisCutSelectionId="900110204010001";
 642       gcArguments.Append(Form(" -set-cut-selection %s",kGCAnalysisCutSelectionId.Data()));
 643       if(!useMC)gcArguments += " -mc-off";
 644       AliAnalysisTaskGammaConversion * taskGammaConversion = AddTaskGammaConversion(gcArguments,mgr->GetCommonInputContainer());
 645       gSystem->ChangeDirectory(cdir);
 646       taskGammaConversion->SelectCollisionCandidates();
 647       if (!taskGammaConversion) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskGammaConversion cannot run for these train conditions - EXCLUDED");
 648    }
 649
 650    // PWG4 omega to 3 pions analysis
 651    if (iPWG4omega3pi) {
 652       gROOT->LoadMacro("$ALICE_ROOT/PWG4/macros/AddTaskomega3pi.C");
 653       AliAnalysisTaskOmegaPi0PiPi *taskomega3pi = AddTaskomega3pi();
 654       if (!taskomega3pi) ::Warning("AnalysisTrainNew", "AliAnalysisTaskomega3pi cannot run for these train conditions - EXCLUDED");
 655    }
 656 }
 657
 658 //______________________________________________________________________________
 659 void StartAnalysis(const char *mode, TChain *chain) {
 660 // Start analysis.
 661    Int_t imode = -1;
 662    AliAnalysisManager *mgr = AliAnalysisManager::GetAnalysisManager();
 663    if (!strcmp(mode, "LOCAL")) imode = 0;
 664    if (!strcmp(mode, "PROOF")) imode = 1;
 665    if (!strcmp(mode, "GRID"))  imode = 2;
 666    switch (imode) {
 667       case 0:
 668          if (!chain) {
 669             ::Error("AnalysisTrainNew.C::StartAnalysis", "Cannot create the chain");
 670             return;
 671          }
 672          mgr->StartAnalysis(mode, chain);
 673          return;
 674       case 1:
 675          if (!proof_dataset.Length()) {
 676             ::Error("AnalysisTrainNew.C::StartAnalysis", "proof_dataset is empty");
 677             return;
 678          }
 679          mgr->StartAnalysis(mode, proof_dataset, 1000);
 680          return;
 681       case 2:
 682          if (usePLUGIN) {
 683             if (!mgr->GetGridHandler()) {
 684                ::Error("AnalysisTrainNew.C::StartAnalysis", "Grid plugin not initialized");
 685                return;
 686             }
 687             mgr->StartAnalysis("grid");
 688          } else {
 689             if (!chain) {
 690                ::Error("AnalysisTrainNew.C::StartAnalysis", "Cannot create the chain");
 691                return;
 692             }
 693             mgr->StartAnalysis(mode, chain);
 694          }
 695          return;
 696    }
 697 }
 698
 699 //______________________________________________________________________________
 700 void CheckModuleFlags(const char *mode) {
 701 // Checks selected modules and insure compatibility
 702    Int_t imode = -1;
 703    if (!strcmp(mode, "LOCAL")) imode = 0;
 704    if (!strcmp(mode, "PROOF")) imode = 1;
 705    if (!strcmp(mode, "GRID"))  imode = 2;
 706    if (!iJETAN) iJETANdelta = 0;
 707    if (imode==1) {
 708       if (!usePAR) {
 709          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PAR files enabled due to PROOF analysis");
 710          usePAR = kTRUE;
 711       }
 712    }
 713    if (imode != 2) {
 714       ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "AliEn plugin disabled since not in GRID mode");
 715       usePLUGIN = kFALSE;
 716    }
 717    if (iAODanalysis) {
 718    // AOD analysis
 719       if (useMC)
 720          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "MC usage disabled in analysis on AOD's");
 721       if (useAODTAGS)
 722          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "AOD tags usage disabled in analysis on AOD's");
 723       useMC = kFALSE;
 724       useTR = kFALSE;
 725       useAODTAGS = kFALSE;
 726       if (iESDfilter)
 727          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "ESD filter disabled in analysis on AOD's");
 728       iESDfilter   = 0;
 729       if (!iAODhandler) {
 730          if (iJETAN)
 731             ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "JETAN disabled in analysis on AOD's without AOD handler");
 732          iJETAN = 0;
 733          iJETANdelta = 0;
 734       }
 735       // Disable tasks that do not work yet on AOD data
 736       if (iPWG4gammaconv)
 737          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG4gammaconv disabled on AOD's without AOD handler");
 738       iPWG4gammaconv = 0;
 739       if (iPWG2central)
 740          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2central disabled on AOD's");
 741          iPWG2central = 0;
 742       if (iPWG2flow)
 743          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2flow disabled on AOD's");
 744          iPWG2flow = 0;
 745       if (iPWG2femto)
 746          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2femto disabled on AOD's");
 747          iPWG2femto = 0;
 748       if (iPWG2res)
 749          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2res disabled on AOD's");
 750          iPWG2res = 0;
 751        if (iPWG2rsneff)
 752          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2rsneff disabled on AOD's");
 753          iPWG2rsneff = 0;
 754      if (iPWG2kink)
 755          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2kink disabled in analysis on AOD's");
 756          iPWG2kink = 0;
 757       if (iPWG2unicor)
 758          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2unicor disabled in analysis on AOD's");
 759          iPWG2unicor = 0;
 760       if (iPWG2evchar)
 761          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG4evchar disabled on AOD's");
 762          iPWG2evchar = 0;
 763       if (iPWG2forward)
 764          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2forward disabled in analysis on AOD's");
 765          iPWG2forward = 0;
 766       if (iPWG3hfe)
 767          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG3hfe disabled on AOD's");
 768          iPWG3hfe = 0;
 769       if (iPWG4omega3pi)
 770          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG4omega3pi disabled on AOD's");
 771          iPWG4omega3pi = 0;
 772    } else {
 773    // ESD analysis
 774       if (!useMC) useTR = kFALSE;
 775       if (!useTR) {
 776          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "iPWG2evchar disabled if not reading track references");
 777          iPWG2evchar = 0;
 778       }
 779    }
 780    if (!useMC) {
 781       if (iPWG2perfcascade)
 782          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2perfcascade disabled without MC info");
 783       iPWG2perfcascade = 0;
 784       if (iPWG2central)
 785          ::Info("AnalysisTrainNew.C::CheckModuleFlags", "PWG2central disabled without MC info");
 786          iPWG2central = 0;
 787    }
 788    if (iJETAN && !iAODanalysis) iESDfilter=1;
 789    if (iESDfilter) {iAODhandler=1; useCORRFW = kTRUE;}
 790    if (iPWG2spectra || iPWG2flow || iPWG3vertexing || iPWG3hfe || iPWG2res || iPWG2rsneff) useCORRFW = kTRUE;
 791    if (useKFILTER && !useMC) useKFILTER = kFALSE;
 792    if (useAODTAGS && !iAODhandler) useAODTAGS = kFALSE;
 793 }
 794
 795 //______________________________________________________________________________
 796 Bool_t Connect(const char *mode) {
 797 // Connect <username> to the back-end system.
 798    Int_t imode = -1;
 799    if (!strcmp(mode, "LOCAL")) imode = 0;
 800    if (!strcmp(mode, "PROOF")) imode = 1;
 801    if (!strcmp(mode, "GRID"))  imode = 2;
 802    TString username = gSystem->Getenv("alien_API_USER");
 803    switch (imode) {
 804       case 0:
 805          break;
 806       case 1:
 807          if  (!username.Length()) {
 808             ::Error(Form("AnalysisTrainNew.C::Connect <%s>", mode), "Make sure you:\n \
 809                            1. Have called: alien-token-init <username>\n \
 810                            2. Have called: >source /tmp/gclient_env_$UID");
 811             return kFALSE;
 812          }
 813          ::Info("AnalysisTrainNew.C::Connect", "Connecting user <%s> to PROOF cluster <%s>",
 814                 username.Data(), proof_cluster.Data());
 815          gEnv->SetValue("XSec.GSI.DelegProxy", "2");
 816 //         TProof::Open(Form("%s@%s:31093", username.Data(), proof_cluster.Data()));
 817          TProof::Open(Form("%s@%s", username.Data(), proof_cluster.Data()));
 818          if (!gProof) {
 819             if (strcmp(gSystem->Getenv("XrdSecGSISRVNAMES"), "lxfsrd0506.cern.ch"))
 820                ::Error(Form("AnalysisTrainNew.C::Connect <%s>", mode), "Environment XrdSecGSISRVNAMES different from lxfsrd0506.cern.ch");
 821             return kFALSE;
 822          }
 823          TGrid::Connect("alien://");
 824          if (gGrid) {
 825             TString homedir = gGrid->GetHomeDirectory();
 826             TString workdir = homedir + train_name;
 827             if (!gGrid->Cd(workdir)) {
 828                gGrid->Cd(homedir);
 829                if (gGrid->Mkdir(workdir)) {
 830                   gGrid->Cd(train_name);
 831                   ::Info("AnalysisTrainNew::Connect()", "Directory %s created", gGrid->Pwd());
 832                }
 833             }
 834             gGrid->Mkdir("proof_output");
 835             gGrid->Cd("proof_output");
 836             proof_outdir = Form("alien://%s", gGrid->Pwd());
 837          }
 838          break;
 839       case 2:
 840          if (usePLUGIN && !gSystem->Getenv("alien_CLOSE_SE")) {
 841             ::Error(Form("AnalysisTrainNew.C::Connect <%s>", mode),
 842                            "When using the AliEn plugin it is preferable to define the \
 843                            variable alien_CLOSE_SE in your environment.");
 844             return kFALSE;
 845          }
 846          ::Info("AnalysisTrainNew.C::Connect", "Connecting user <%s> to AliEn ...",
 847                 username.Data());
 848          TGrid::Connect("alien://");
 849          if (!gGrid || !gGrid->IsConnected()) return kFALSE;
 850          break;
 851       default:
 852          ::Error("AnalysisTrainNew.C::Connect", "Unknown run mode: %s", mode);
 853          return kFALSE;
 854    }
 855    ::Info("AnalysisTrainNew.C::Connect","Connected in %s mode", mode);
 856    return kTRUE;
 857 }
 858
 859 //______________________________________________________________________________
 860 Bool_t LoadCommonLibraries(const char *mode)
 861 {
 862 // Load common analysis libraries.
 863    Int_t imode = -1;
 864    if (!strcmp(mode, "LOCAL")) imode = 0;
 865    if (!strcmp(mode, "PROOF")) imode = 1;
 866    if (!strcmp(mode, "GRID"))  imode = 2;
 867    if (!gSystem->Getenv("ALICE_ROOT")) {
 868       ::Error("AnalysisTrainNew.C::LoadCommonLibraries", "Analysis train requires that analysis libraries are compiled with a local AliRoot");
 869       return kFALSE;
 870    }
 871    Bool_t success = kTRUE;
 872    // ROOT libraries
 873    gSystem->Load("libTree");
 874    gSystem->Load("libGeom");
 875    gSystem->Load("libVMC");
 876    gSystem->Load("libPhysics");
 877    gSystem->Load("libMinuit");
 878
 879    // Load framework classes. Par option ignored here.
 880    switch (imode) {
 881       case 0:
 882       case 2:
 883          if (useCPAR) {
 884             success &= LoadLibrary("STEERBase", mode, kTRUE);
 885             success &= LoadLibrary("ESD", mode, kTRUE);
 886             success &= LoadLibrary("AOD", mode, kTRUE);
 887             success &= LoadLibrary("ANALYSIS", mode, kTRUE);
 888             success &= LoadLibrary("ANALYSISalice", mode, kTRUE);
 889             if (useCORRFW) success &= LoadLibrary("CORRFW", mode, kTRUE);
 890          } else {
 891             success &= LoadLibrary("libSTEERBase.so", mode);
 892             success &= LoadLibrary("libESD.so", mode);
 893             success &= LoadLibrary("libAOD.so", mode);
 894             success &= LoadLibrary("libANALYSIS.so", mode);
 895             success &= LoadLibrary("libANALYSISalice.so", mode);
 896             if (useCORRFW) success &= LoadLibrary("libCORRFW.so", mode);
 897             gROOT->ProcessLine(".include $ALICE_ROOT/include");
 898          }
 899          break;
 900       case 1:
 901          Int_t ires = -1;
 902          if (useAFPAR && !gSystem->AccessPathName(AFversion)) ires = gProof->UploadPackage(AFversion);
 903          if (ires < 0) {
 904             success &= LoadLibrary("STEERBase", mode);
 905             success &= LoadLibrary("ESD", mode);
 906             success &= LoadLibrary("AOD", mode);
 907             success &= LoadLibrary("ANALYSIS", mode);
 908             success &= LoadLibrary("ANALYSISalice", mode);
 909             if (useCORRFW) success &= LoadLibrary("CORRFW", mode);
 910          } else {
 911             ires = gProof->EnablePackage(AFversion);
 912             if (ires<0) success = kFALSE;
 913             if (useCORRFW) success &= LoadLibrary("CORRFW", mode);
 914          }
 915          break;
 916       default:
 917          ::Error("AnalysisTrainNew.C::LoadCommonLibraries", "Unknown run mode: %s", mode);
 918          return kFALSE;
 919    }
 920    if (success) {
 921       ::Info("AnalysisTrainNew.C::LoadCommodLibraries", "Load common libraries:    SUCCESS");
 922       ::Info("AnalysisTrainNew.C::LoadCommodLibraries", "Include path for Aclic compilation:\n%s",
 923               gSystem->GetIncludePath());
 924    } else {
 925       ::Info("AnalysisTrainNew.C::LoadCommodLibraries", "Load common libraries:    FAILED");
 926    }
 927
 928    return success;
 929 }
 930
 931 //______________________________________________________________________________
 932 Bool_t LoadAnalysisLibraries(const char *mode)
 933 {
 934 // Load common analysis libraries.
 935    Bool_t success = kTRUE;
 936    if (useTender) {
 937       if (!LoadLibrary("Tender", mode, kTRUE) ||
 938           !LoadLibrary("TenderSupplies", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 939    }
 940    if (iESDfilter || iPWG3MuonTrain) {
 941       if (!LoadLibrary("PWG3base", mode, kTRUE) ||
 942           !LoadLibrary("PWG3muon", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 943    }
 944    // JETAN
 945    if (iJETAN) {
 946       if (!LoadLibrary("JETAN", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 947    }
 948    if (iJETANdelta) {
 949       if (!LoadLibrary("JETAN", mode, kTRUE) ||
 950           !LoadLibrary("CGAL", mode, kTRUE) ||
 951           !LoadLibrary("fastjet", mode, kTRUE) ||
 952           !LoadLibrary("siscone", mode, kTRUE) ||
 953           !LoadLibrary("SISConePlugin", mode, kTRUE) ||
 954           !LoadLibrary("FASTJETAN", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 955    }
 956    // PWG4 particle correlations
 957    if (iPWG4partcorr) {
 958       if (!LoadLibrary("EMCALUtils", mode, kTRUE) ||
 959           !LoadLibrary("PHOSUtils", mode, kTRUE) ||
 960           !LoadLibrary("PWG4PartCorrBase", mode, kTRUE) ||
 961           !LoadLibrary("PWG4PartCorrDep", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 962    }
 963    // PWG4 gamma conversion
 964    if (iPWG4gammaconv) {
 965       if (!LoadLibrary("PWG4GammaConv", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 966    }
 967    // PWG4 omega to 3 pions
 968    if (iPWG4omega3pi) {
 969       if (!LoadLibrary("PWG4omega3pi", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 970    }
 971    // PWG2 task protons
 972    if (iPWG2spectra) {
 973       if (!LoadLibrary("PWG2spectra", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 974    }
 975    // PWG2 flow
 976    if (iPWG2flow) {
 977       if (!LoadLibrary("PWG2flowCommon", mode, kTRUE) ||
 978           !LoadLibrary("PWG2flowTasks", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 979    }
 980    // PWG2 resonances
 981    if (iPWG2res || iPWG2rsneff) {
 982       if (!LoadLibrary("PWG2resonances", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 983    }
 984    // PWG2 kink
 985    if (iPWG2kink) {
 986       if (!LoadLibrary("PWG2kink", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 987    }
 988    // PWG2 unicor
 989    if (iPWG2unicor) {
 990       if (!LoadLibrary("PWG2unicor", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 991    }
 992    // PWG2 evchar
 993    if (iPWG2evchar) {
 994       if (!LoadLibrary("PWG2evchar", mode, kTRUE)) return kFALSE;
 995    }
 996    // PWG2 femtoscopy
 997    if (iPWG2femto) {
 998       if (!LoadLibrary("PWG2AOD", mode, kTRUE) ||
 999           !LoadLibrary("PWG2femtoscopy", mode, kTRUE) ||
1000           !LoadLibrary("PWG2femtoscopyUser", mode, kTRUE)) return kFALSE;
1001 //      TFile::Cp(gSystem->ExpandPathName("$(ALICE_ROOT)/PWG2/FEMTOSCOPY/macros/ConfigFemtoAnalysis.C"), Form("%s/ConfigFemtoAnalysis.C", train_name.Data()));
1002 //      anaLibs += "ConfigFemtoAnalysis.C ";
1003    }
1004    // PWG2 FORWARD
1005    if (iPWG2forward) {
1006       if (!LoadLibrary("PWG2forward2", mode, kTRUE)) return kFALSE;
1007    }
1008    // PWG3 Vertexing HF
1009    if (iPWG3vertexing || iPWG3d2h) {
1010       if (!LoadLibrary("PWG3base", mode, kTRUE) ||
1011           !LoadLibrary("PWG3vertexingHF", mode, kTRUE)) return kFALSE;
1012    }
1013    // PWG3 hfe
1014    if (iPWG3hfe) {
1015       if (!LoadLibrary("PWG3hfe", mode, kTRUE)) return kFALSE;
1016    }
1017
1018    ::Info("AnalysisTrainNew.C::LoadAnalysisLibraries", "Load other libraries:   SUCCESS");
1019    return kTRUE;
1020 }
1021
1022 //______________________________________________________________________________
1023 Bool_t LoadLibrary(const char *module, const char *mode, Bool_t rec=kFALSE)
1024 {
1025 // Load a module library in a given mode. Reports success.
1026    Int_t imode = -1;
1027    Int_t result;
1028    TString smodule(module);
1029    if (!strcmp(mode, "LOCAL")) imode = 0;
1030    if (!strcmp(mode, "PROOF")) imode = 1;
1031    if (!strcmp(mode, "GRID"))  imode = 2;
1032    TString mod(module);
1033    if (!mod.Length()) {
1034       ::Error("AnalysisTrainNew.C::LoadLibrary", "Empty module name");
1035       return kFALSE;
1036    }
1037    // If a library is specified, just load it
1038    if (smodule.EndsWith(".so")) {
1039       mod.Remove(mod.Index(".so"));
1040       result = gSystem->Load(mod);
1041       if (result < 0) {
1042          ::Error("AnalysisTrainNew.C::LoadLibrary", "Could not load library %s", module);
1043          return kFALSE;
1044       }
1045       if (rec) anaLibs += Form("%s.so ",mod.Data());
1046       return kTRUE;
1047    }
1048    // Check if the library is already loaded
1049    if (strlen(gSystem->GetLibraries(module, "", kFALSE)) > 0)
1050       return kTRUE;
1051    switch (imode) {
1052       case 0:
1053       case 2:
1054          if (usePAR) {
1055             result = SetupPar(module);
1056             if (rec) anaPars += Form("%s.par ", module);
1057          } else {
1058             result = gSystem->Load(Form("lib%s", module));
1059             if (rec) anaLibs += Form("lib%s.so ", module);
1060          }
1061          break;
1062       case 1:
1063          result = gProof->UploadPackage(module);
1064          if (result<0) {
1065             result = gProof->UploadPackage(gSystem->ExpandPathName(Form("$ALICE_ROOT/%s.par", module)));
1066             if (result<0) {
1067                ::Error("AnalysisTrainNew.C::LoadLibrary", "Could not find module %s.par in current directory nor in $ALICE_ROOT", module);
1068                return kFALSE;
1069             }
1070          }
1071          result = gProof->EnablePackage(module);
1072          break;
1073       default:
1074          return kFALSE;
1075    }
1076    if (result < 0) {
1077       ::Error("AnalysisTrainNew.C::LoadLibrary", "Could not load module %s", module);
1078       return kFALSE;
1079    }
1080    return kTRUE;
1081 }
1082
1083
1084 //______________________________________________________________________________
1085 TChain *CreateChain(const char *mode, const char *plugin_mode)
1086 {
1087 // Create the input chain
1088    Int_t imode = -1;
1089    if (!strcmp(mode, "LOCAL")) imode = 0;
1090    if (!strcmp(mode, "PROOF")) imode = 1;
1091    if (!strcmp(mode, "GRID"))  imode = 2;
1092    TChain *chain = NULL;
1093    // Local chain
1094    switch (imode) {
1095       case 0:
1096          if (iAODanalysis) {
1097             if (!local_xmldataset.Length()) {
1098                // Local AOD
1099                chain = new TChain("aodTree");
1100                if (gSystem->AccessPathName("data/AliAOD.root"))
1101                   ::Error("AnalysisTrainNew.C::CreateChain", "File: AliAOD.root not in ./data dir");
1102                else {
1103                   if (!saveTrain) chain->Add("data/AliAOD.root");
1104                   else            chain->Add("../data/AliAOD.root");
1105                }
1106             } else {
1107                // Interactive AOD
1108                chain = CreateChainSingle(local_xmldataset, "aodTree");
1109             }
1110          } else {
1111             if (!local_xmldataset.Length()) {
1112                // Local ESD
1113                chain = new TChain("esdTree");
1114                if (gSystem->AccessPathName("data/AliESDs.root"))
1115                   ::Error("AnalysisTrainNew.C::CreateChain", "File: AliESDs.root not in ./data dir");
1116                else {
1117                   if (!saveTrain) chain->Add("data/AliESDs.root");
1118                   else            chain->Add("../data/AliESDs.root");
1119                }
1120             } else {
1121                // Interactive ESD
1122                chain = CreateChainSingle(local_xmldataset, "esdTree");
1123             }
1124          }
1125          break;
1126       case 1:
1127          break;
1128       case 2:
1129          if (usePLUGIN) {
1130 //            AliAnalysisGrid *alienHandler = CreateAlienHandler(plugin_mode);
1131 //            AliAnalysisManager::GetAnalysisManager()->SetGridHandler(alienHandler);
1132          } else {
1133             TString           treeName = "esdTree";
1134             if (iAODanalysis) treeName = "aodTree";
1135             chain = CreateChainSingle("wn.xml", treeName);
1136          }
1137          break;
1138       default:
1139    }
1140    if (chain && chain->GetNtrees()) return chain;
1141    return NULL;
1142 }
1143
1144 //______________________________________________________________________________
1145 TChain* CreateChainSingle(const char* xmlfile, const char *treeName)
1146 {
1147    printf("*******************************\n");
1148    printf("*** Getting the ESD Chain   ***\n");
1149    printf("*******************************\n");
1150    TAlienCollection * myCollection  = TAlienCollection::Open(xmlfile);
1151
1152    if (!myCollection) {
1153       ::Error("AnalysisTrainNew.C::CreateChainSingle", "Cannot create an AliEn collection from %s", xmlfile) ;
1154       return NULL ;
1155    }
1156
1157    TChain* chain = new TChain(treeName);
1158    myCollection->Reset() ;
1159    while ( myCollection->Next() ) chain->Add(myCollection->GetTURL("")) ;
1160    chain->ls();
1161    return chain;
1162 }
1163
1164 //______________________________________________________________________________
1165 Int_t SetupPar(char* pararchivename)
1166 {
1167    if (!pararchivename || !strlen(pararchivename)) return -1;
1168    char processline[1024];
1169    if (gSystem->AccessPathName(Form("%s.par", pararchivename))) {
1170       if (!gSystem->AccessPathName(Form("%s/%s.par", gSystem->Getenv("ALICE_ROOT"),pararchivename))) {
1171          ::Info("AnalysisTrainNew.C::SetupPar", "Getting %s.par from $ALICE_ROOT", pararchivename);
1172          TFile::Cp(gSystem->ExpandPathName(Form("$ALICE_ROOT/%s.par", pararchivename)),
1173                    Form("%s.par",pararchivename));
1174       } else {
1175          ::Error("AnalysisTrainNew.C::SetupPar", "Cannot find %s.par", pararchivename);
1176          return -1;
1177       }
1178    }
1179    if (usePLUGIN && saveTrain) gSystem->Exec(Form("ln -s ../%s.par %s",pararchivename, train_name.Data()));
1180    gSystem->Exec(Form("tar xvzf %s.par", pararchivename));
1181
1182    TString ocwd = gSystem->WorkingDirectory();
1183    if (!gSystem->ChangeDirectory(pararchivename)) return -1;
1184
1185    // check for BUILD.sh and execute
1186    if (!gSystem->AccessPathName("PROOF-INF/BUILD.sh")) {
1187       printf("*******************************\n");
1188       printf("*** Building PAR archive    ***\n");
1189       printf("*******************************\n");
1190       if (gSystem->Exec("PROOF-INF/BUILD.sh")) {
1191          Error("runProcess","Cannot Build the PAR Archive! - Abort!");
1192          return -1;
1193       }
1194    }
1195
1196         // check for SETUP.C and execute
1197         if (!gSystem->AccessPathName("PROOF-INF/SETUP.C")) {
1198             printf("*******************************\n");
1199             printf("*** Setup PAR archive       ***\n");
1200             printf("*******************************\n");
1201             gROOT->Macro("PROOF-INF/SETUP.C");
1202         }
1203         if (!gSystem->ChangeDirectory(ocwd.Data())) return -1;
1204    return 0;
1205 }
1206
1207 //______________________________________________________________________________
1208 AliAnalysisAlien* CreateAlienHandler(const char *plugin_mode)
1209 {
1210 // Check if user has a valid token, otherwise make one. This has limitations.
1211 // One can always follow the standard procedure of calling alien-token-init then
1212 //   source /tmp/gclient_env_$UID in the current shell.
1213    if (!AliAnalysisGrid::CreateToken()) return NULL;
1214    AliAnalysisAlien *plugin = new AliAnalysisAlien();
1215 // Set the run mode (can be "full", "test", "offline", "submit" or "terminate")
1216    plugin->SetRunMode(plugin_mode);
1217    if (useProductionMode) plugin->SetProductionMode();
1218    if (!outputSingleFolder.IsNull()) {
1219       plugin->SetOutputSingleFolder(outputSingleFolder);
1220       plugin->SetOutputToRunNo();
1221    }
1222    plugin->SetJobTag(job_tag);
1223    plugin->SetNtestFiles(1);
1224 //   plugin->SetPreferedSE("ALICE::NIHAM::File");
1225 // Set versions of used packages
1226 //   plugin->SetAPIVersion("V2.4");
1227    plugin->SetAPIVersion("V1.1x");
1228    plugin->SetROOTVersion(root_version);
1229    plugin->SetAliROOTVersion(aliroot_version);
1230 // Declare input data to be processed.
1231 // Method 1: Create automatically XML collections using alien 'find' command.
1232 // Define production directory LFN
1233    plugin->SetGridDataDir(alien_datadir);
1234 // Set data search pattern
1235    if (runOnData) {
1236       plugin->SetRunPrefix("000");
1237       plugin->SetDataPattern("*ESDs/pass1/*ESDs.root");
1238    } else {
1239       plugin->SetDataPattern("*ESDs.root");
1240    }
1241 // ...then add run numbers to be considered
1242 //   if (!iAODanalysis) plugin->SetRunRange(run_range[0], run_range[1]);
1243    for (Int_t i=0; i<10; i++) {
1244       if (run_numbers[i]==0) break;
1245       plugin->AddRunNumber(run_numbers[i]);
1246    }
1247 // Method 2: Declare existing data files (raw collections, xml collections, root file)
1248 // If no path mentioned data is supposed to be in the work directory (see SetGridWorkingDir())
1249 // XML collections added via this method can be combined with the first method if
1250 // the content is compatible (using or not tags)
1251 //   plugin->AddDataFile("tag.xml");
1252 //   plugin->AddDataFile("/alice/data/2008/LHC08c/000057657/raw/Run57657.Merged.RAW.tag.root");
1253 // Define alien work directory where all files will be copied. Relative to alien $HOME.
1254    plugin->SetGridWorkingDir(train_name);
1255 // Declare alien output directory. Relative to working directory.
1256    if (!alien_outdir.Length()) alien_outdir = Form("output_%s",train_name.Data());
1257    plugin->SetGridOutputDir(alien_outdir);
1258
1259    TString ana_sources = "";
1260    TString ana_add = "";
1261    if (usePAR && anaPars.Length()) {
1262       printf("%s\n", anaPars.Data());
1263       TObjArray *arr;
1264       TObjString *objstr;
1265       arr = anaPars.Tokenize(" ");
1266       TIter next(arr);
1267       while ((objstr=(TObjString*)next())) plugin->EnablePackage(objstr->GetString());
1268       delete arr;
1269    }
1270 // Add external packages
1271    if (iJETANdelta) {
1272       plugin->AddExternalPackage("boost::v1_38_0");
1273       plugin->AddExternalPackage("cgal::v3.3.1");
1274       plugin->AddExternalPackage("fastjet::v2.4.0");
1275    }
1276
1277 // Declare the analysis source files names separated by blancs. To be compiled runtime
1278 // using ACLiC on the worker nodes.
1279    ana_sources = ana_sources.Strip();
1280 // Declare all libraries (other than the default ones for the framework. These will be
1281 // loaded by the generated analysis macro. Add all extra files (task .cxx/.h) here.
1282    anaLibs     = anaLibs.Strip();
1283    if (ana_sources.Length()) plugin->SetAnalysisSource(ana_sources);
1284    if (anaLibs.Length())     plugin->SetAdditionalLibs(anaLibs);
1285
1286 // Declare the output file names separated by blancs.
1287 // (can be like: file.root or file.root@ALICE::Niham::File)
1288    plugin->SetDefaultOutputs();
1289    plugin->SetMergeExcludes(mergeExclude);
1290    plugin->SetMaxMergeFiles(maxMergeFiles);
1291    plugin->SetNrunsPerMaster(nRunsPerMaster);
1292 // Optionally define the files to be archived.
1293 //   plugin->SetOutputArchive("log_archive.zip:stdout,stderr@ALICE::NIHAM::File root_archive.zip:AliAOD.root,AOD.tag.root@ALICE::NIHAM::File");
1294
1295
1296    // Put default output files to archive
1297    TString listhists = "";
1298    TString listaods  = "";
1299    AliAnalysisManager *mgr = AliAnalysisManager::GetAnalysisManager();
1300    TIter next(mgr->GetOutputs());
1301    AliAnalysisDataContainer *output;
1302    while ((output=(AliAnalysisDataContainer*)next())) {
1303       const char *filename = output->GetFileName();
1304       if (!(strcmp(filename, "default"))) {
1305          if (!mgr->GetOutputEventHandler()) continue;
1306          filename = mgr->GetOutputEventHandler()->GetOutputFileName();
1307          if (listaods.Length()) listaods += ",";
1308          listaods += filename;
1309          listaods += ",";
1310          listaods += "pyxsec_hists.root";
1311       } else {
1312          if (!strcmp(filename, "pyxsec_hists.root")) continue;
1313          if (listhists.Contains(filename)) continue;
1314          if (listhists.Length()) listhists += ",";
1315          listhists += filename;
1316       }
1317    }
1318    if (mgr->GetExtraFiles().Length()) {
1319       if (listaods.Length()) listaods += ",";
1320       listaods += mgr->GetExtraFiles();
1321       listaods.ReplaceAll(" ", ",");
1322    }
1323    if (listhists.Length()) listhists = Form("hist_archive.zip:%s@%s", listhists.Data(), outputStorages.Data());
1324    if (listaods.Length())  listaods  = Form("aod_archive.zip:%s@%s", listaods.Data(), outputStorages.Data());
1325    if (!listhists.Length() && !listaods.Length()) {
1326       ::Fatal("AnalysisTrainNew", "No task output !");
1327    }
1328    TString outputArchive = Form("log_archive.zip:stderr@%s", outputStorages.Data());
1329    if (listaods.Length()) {
1330       outputArchive += " ";
1331       outputArchive += listaods;
1332    }
1333    if (listhists.Length()) {
1334       outputArchive += " ";
1335       outputArchive += listhists;
1336    }
1337 // Set friends
1338 //   if (iAODanalysis && iPWG3d2h)
1339 //      plugin->SetFriendChainName("AliAOD.VertexingHF.root");
1340 //   plugin->SetOutputArchive(outputArchive);
1341 // Optionally set a name for the generated analysis macro (default MyAnalysis.C)
1342    plugin->SetAnalysisMacro(Form("%s.C", train_name.Data()));
1343 // Optionally set maximum number of input files/subjob (default 100, put 0 to ignore)
1344    plugin->SetSplitMaxInputFileNumber(nFilesPerJob);
1345 // Optionally set number of failed jobs that will trigger killing waiting sub-jobs.
1346 //   plugin->SetMaxInitFailed(5);
1347 // Optionally resubmit threshold.
1348 //   plugin->SetMasterResubmitThreshold(90);
1349 // Optionally set time to live (default 30000 sec)
1350    plugin->SetTTL(70000);
1351 // Optionally set input format (default xml-single)
1352    plugin->SetInputFormat("xml-single");
1353 // Optionally modify the name of the generated JDL (default analysis.jdl)
1354    plugin->SetJDLName(Form("%s.jdl", train_name.Data()));
1355 // Optionally modify the executable name (default analysis.sh)
1356    plugin->SetExecutable(Form("%s.sh", train_name.Data()));
1357 // Optionally modify job price (default 1)
1358    plugin->SetPrice(1);
1359 // Merge via JDL
1360    plugin->SetMergeViaJDL(useMergeViaJDL);
1361 // Use fastread option
1362    plugin->SetFastReadOption(useFastReadOption);
1363 // UseOverwrite mode
1364    plugin->SetOverwriteMode(useOverwriteMode);
1365    plugin->SetExecutableCommand("aliroot -b -q");
1366 // Optionally modify split mode (default 'se')
1367    plugin->SetSplitMode("se");
1368    return plugin;
1369 }
1370
1371 //______________________________________________________________________________
1372 void WriteConfig()
1373 {
1374 // Write train configuration in a file. The file name has the format:
1375 // train_[trainName]_ddMonthyyyy_time.C
1376    if (useDATE) {
1377       gSystem->Exec("date +%d%b%Y_%Hh%M > date.tmp");
1378       ifstream fdate("date.tmp");
1379       if (!fdate.is_open()) {
1380          ::Error("AnalysisTrainNew.C::Export","Could not generate file name");
1381          return;
1382       }
1383       const char date[64];
1384       fdate.getline(date,64);
1385       fdate.close();
1386       gSystem->Exec("rm date.tmp");
1387       train_name = Form("%s_%s", train_name.Data(), date);
1388    }
1389    TString cdir = gSystem->WorkingDirectory();
1390    gSystem->MakeDirectory(train_name);
1391    gSystem->ChangeDirectory(train_name);
1392    ofstream out;
1393    out.open(Form("%sConfig.C",train_name.Data()), ios::out);
1394    if (out.bad()) {
1395       ::Error("AnalysisTrainNew.C::Export", "Cannot open ConfigTrain.C for writing");
1396       return;
1397    }
1398    out << "{" << endl;
1399    out << "   train_name      = " << "\"" << train_name.Data() << "\";" << endl;
1400    out << "   proof_cluster   = " << "\"" << proof_cluster.Data() << "\";" << endl;
1401    out << "   useAFPAR        = " << useAFPAR << ";" << endl;
1402    if (useAFPAR)
1403       out << "   AFversion       = " << AFversion.Data() << ";" << endl;
1404    out << "   proof_dataset   = " << "\"" << proof_dataset.Data() << "\";" << endl;
1405    out << "   usePLUGIN       = " << usePLUGIN << ";" << endl;
1406    out << "   usePAR          = " << usePAR << ";" << endl;
1407    out << "   useCPAR         = " << useCPAR << ";" << endl;
1408    out << "   root_version    = " << "\"" << root_version.Data() << "\";" << endl;
1409    out << "   aliroot_version = " << "\"" << aliroot_version.Data() << "\";" << endl;
1410    out << "   alien_datadir   = " << "\"" << alien_datadir.Data() << "\";" << endl;
1411    if (!alien_outdir.Length()) alien_outdir = Form("output_%s",train_name.Data());
1412    out << "   alien_outdir    = " << "\"" << alien_outdir.Data() << "\";" << endl;
1413    out << "   maxMergeFiles   = " << maxMergeFiles << ";" << endl;
1414    out << "   mergeExclude    = " << "\"" << mergeExclude.Data() << "\";" << endl;
1415    out << "   nRunsPerMaster  = " << nRunsPerMaster << ";" << endl;
1416    out << "   nFilesPerJob    = " << nFilesPerJob << ";" << endl;
1417 //   for (Int_t i=0; i<10; i++) {
1418 //      if (run_numbers[i])
1419 //         out << "   run_numbers[" << i << "]  = " << run_numbers[i] << ";" << endl;
1420 //   }
1421 //   out << "   run_range[0]    = " << run_range[0] << ";" << endl;
1422 //   out << "   run_range[1]    = " << run_range[1] << ";" << endl;
1423    out << "   usePhysicsSelection = " << usePhysicsSelection << ";" << endl;
1424    out << "   useTender       = " << useTender << ";" << endl;
1425    out << "   useMergeViaJDL  = " << useMergeViaJDL << ";" << endl;
1426    out << "   useOverwriteMode  = " << useOverwriteMode << ";" << endl;
1427    out << "   useFastReadOption = " << useFastReadOption << ";" << endl;
1428    out << "   useDBG          = " << useDBG << ";" << endl;
1429    out << "   useMC           = " << useMC << ";" << endl;
1430    out << "   useTAGS         = " << useTAGS << ";" << endl;
1431    out << "   useKFILTER      = " << useKFILTER << ";" << endl;
1432    out << "   useTR           = " << useTR << ";" << endl;
1433    out << "   useCORRFW       = " << useCORRFW << ";" << endl;
1434    out << "   useAODTAGS      = " << useAODTAGS << ";" << endl;
1435    out << "   saveTrain       = " << "kFALSE;" << endl << endl;
1436    out << "   // Analysis modules" << endl;
1437    out << "   iAODanalysis    = " << iAODanalysis << ";" << endl;
1438    out << "   iAODhandler     = " << iAODhandler << ";" << endl;
1439    out << "   iESDfilter      = " << iESDfilter << ";" << endl;
1440    out << "   iMUONcopyAOD    = " << iMUONcopyAOD << ";" << endl;
1441    out << "   iJETAN          = " << iJETAN << ";" << endl;
1442    out << "   iJETANdelta     = " << iJETANdelta << ";" << endl;
1443    out << "   iPWG4partcorr   = " << iPWG4partcorr << ";" << endl;
1444    out << "   iPWG4gammaconv  = " << iPWG4gammaconv << ";" << endl;
1445    out << "   iPWG4omega3pi   = " << iPWG4omega3pi << ";" << endl;
1446    out << "   iPWG3vertexing  = " << iPWG3vertexing << ";" << endl;
1447    out << "   iPWG3hfe        = " << iPWG3hfe << ";" << endl;
1448    out << "   iPWG3d2h        = " << iPWG3d2h << ";" << endl;
1449    out << "     iPWG3d0mass       = " << iPWG3d0mass << ";" << endl;
1450    out << "     iPWG3d0massLS     = " << iPWG3d0massLS << ";" << endl;
1451    out << "     iPWG3dplus        = " << iPWG3dplus << ";" << endl;
1452    out << "     iPWG3LSd0         = " << iPWG3LSd0 << ";" << endl;
1453    out << "     iPWG3LSjpsi       = " << iPWG3LSjpsi << ";" << endl;
1454    out << "     iPWG3CFd0         = " << iPWG3CFd0 << ";" << endl;
1455    out << "     iPWG3promptd0     = " << iPWG3promptd0 << ";" << endl;
1456    out << "   iPWG3MuonTrain      = " << iPWG3MuonTrain << ";" << endl;
1457    out << "   iPWG2femto      = " << iPWG2femto << ";" << endl;
1458    out << "   iPWG2spectra    = " << iPWG2spectra << ";" << endl;
1459    out << "     iPWG2protons      = " << iPWG2protons << ";" << endl;
1460    out << "     iPWG2checkcascade = " << iPWG2checkcascade << ";" << endl;
1461    out << "     iPWG2perfcascade  = " << iPWG2perfcascade << ";" << endl;
1462    out << "     iPWG2checkv0      = " << iPWG2checkv0 << ";" << endl;
1463    out << "     iPWG2strange      = " << iPWG2strange << ";" << endl;
1464    out << "     iPWG2central      = " << iPWG2central << ";" << endl;
1465    out << "   iPWG2flow       = " << iPWG2flow << ";" << endl;
1466    out << "   iPWG2res        = " << iPWG2res << ";" << endl;
1467    out << "     iPWG2rsneff   = " << iPWG2rsneff << ";" << endl;
1468    out << "   iPWG2kink       = " << iPWG2kink << ";" << endl;
1469    out << "     iPWG2kinkESDMC    = " << iPWG2kinkESDMC << ";" << endl;
1470    out << "     iPWG2kinkLSKstar  = " << iPWG2kinkLSKstar << ";" << endl;
1471    out << "     iPWG2kinkLSL1520  = " << iPWG2kinkLSL1520 << ";" << endl;
1472    out << "     iPWG2kinkLSPhi    = " << iPWG2kinkLSPhi << ";" << endl;
1473    out << "     iPWG2kinkKstarESD = " << iPWG2kinkKstarESD << ";" << endl;
1474    out << "     iPWG2kinkKstarMC  = " << iPWG2kinkKstarMC << ";" << endl;
1475    out << "     iPWG2kinkL1520ESD = " << iPWG2kinkL1520ESD << ";" << endl;
1476    out << "     iPWG2kinkL1520MC  = " << iPWG2kinkL1520MC << ";" << endl;
1477    out << "     iPWG2kinkPhiESD   = " << iPWG2kinkPhiESD << ";" << endl;
1478    out << "     iPWG2kinkPhiMC    = " << iPWG2kinkPhiMC << ";" << endl;
1479    out << "   iPWG2unicor     = " << iPWG2unicor << ";" << endl;
1480    out << "   iPWG2evchar     = " << iPWG2evchar << ";" << endl;
1481    out << "   iPWG2forward    = " << iPWG2forward << ";" << endl << endl;
1482    out << "// Configuration fot the wagons" << endl;
1483    out << "   configPWG2femto = \"" << configPWG2femto << "\";" << endl;
1484    out << "   configPWG3d2h   = \"" << configPWG3d2h << "\";" << endl;
1485    out << "}" << endl;
1486    ::Info("AnalysisTrainNew.C::WriteConfig", "Train configuration wrote to file %s", Form("config_%s.C", train_name.Data()));
1487    gSystem->ChangeDirectory(cdir);
1488 }
1489
1490 //______________________________________________________________________________
1491 Bool_t LoadConfig(const char *filename)
1492 {
1493 // Read train configuration from file
1494    if (gSystem->AccessPathName(filename)) {
1495       ::Error("AnalysisTrainNew.C::LoadConfig", "Config file name not found");
1496       return kFALSE;
1497    }
1498    gROOT->ProcessLine(Form(".x %s", filename));
1499    ::Info("AnalysisTrainNew.C::LoadConfig", "Train configuration loaded from file %s", filename);
1500    return kTRUE;
1501 }