TRD1, 12 SM, 110 degree as default
[u/mrichter/AliRoot.git] / EMCAL / AliEMCALClusterizerv1.cxx
1
2 /**************************************************************************
3  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
4  *                                                                        *
5  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
6  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
7  *                                                                        *
8  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
9  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
10  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
11  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
12  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
13  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
14  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
15  **************************************************************************/
16
17 /* $Id$ */
18
19 //*-- Author: Yves Schutz (SUBATECH)  & Dmitri Peressounko (SUBATECH & Kurchatov Institute)
20 //  August 2002 Yves Schutz: clone PHOS as closely as possible and intoduction
21 //                           of new  IO (à la PHOS)
22 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
23 //  Clusterization class. Performs clusterization (collects neighbouring active cells) and 
24 //  unfolds the clusters having several local maxima.  
25 //  Results are stored in TreeR#, branches EMCALTowerRP (EMC recPoints),
26 //  EMCALPreShoRP (CPV RecPoints) and AliEMCALClusterizer (Clusterizer with all 
27 //  parameters including input digits branch title, thresholds etc.)
28 //  This TTask is normally called from Reconstructioner, but can as well be used in 
29 //  standalone mode.
30 // Use Case:
31 //  root [0] AliEMCALClusterizerv1 * cl = new AliEMCALClusterizerv1("galice.root")  
32 //  Warning in <TDatabasePDG::TDatabasePDG>: object already instantiated
33 //               //reads gAlice from header file "..."                      
34 //  root [1] cl->ExecuteTask()  
35 //               //finds RecPoints in all events stored in galice.root
36 //  root [2] cl->SetDigitsBranch("digits2") 
37 //               //sets another title for Digitis (input) branch
38 //  root [3] cl->SetRecPointsBranch("recp2")  
39 //               //sets another title four output branches
40 //  root [4] cl->SetTowerLocalMaxCut(0.03)  
41 //               //set clusterization parameters
42 //  root [5] cl->ExecuteTask("deb all time")  
43 //               //once more finds RecPoints options are 
44 //               // deb - print number of found rec points
45 //               // deb all - print number of found RecPoints and some their characteristics 
46 //               // time - print benchmarking results
47
48 // --- ROOT system ---
49
50 #include "TROOT.h" 
51 #include "TFile.h" 
52 #include "TFolder.h" 
53 #include "TMath.h" 
54 #include "TMinuit.h"
55 #include "TTree.h" 
56 #include "TSystem.h" 
57 #include "TBenchmark.h"
58
59 // --- Standard library ---
60
61
62 // --- AliRoot header files ---
63 #include "AliEMCALGetter.h"
64 #include "AliEMCALClusterizerv1.h"
65 #include "AliEMCALRecPoint.h"
66 #include "AliEMCALDigit.h"
67 #include "AliEMCALDigitizer.h"
68 #include "AliEMCAL.h"
69 #include "AliEMCALGeometry.h"
70
71 ClassImp(AliEMCALClusterizerv1)
72
73 Int_t addOn[20][60][60]; 
74
75 //____________________________________________________________________________
76   AliEMCALClusterizerv1::AliEMCALClusterizerv1() : AliEMCALClusterizer()
77 {
78   // default ctor (to be used mainly by Streamer)
79   
80   InitParameters() ; 
81   fDefaultInit = kTRUE ;
82   for(Int_t is=0;is<20;is++){ 
83     for(Int_t i=0;i<60;i++){ 
84       for(Int_t j=0;j<60;j++){ 
85         addOn[is][i][j]=0;
86       }
87     }
88   }
89 //PH   cout<<"file to read 1"<<endl;
90   ReadFile();
91 //PH   cout<<"file read 1"<<endl;
92 }
93
94 //____________________________________________________________________________
95 AliEMCALClusterizerv1::AliEMCALClusterizerv1(const TString alirunFileName, const TString eventFolderName)
96 :AliEMCALClusterizer(alirunFileName, eventFolderName)
97 {
98   // ctor with the indication of the file where header Tree and digits Tree are stored
99   
100   InitParameters() ; 
101   Init() ;
102   fDefaultInit = kFALSE ; 
103   for(Int_t is=0;is<20;is++){ 
104     for(Int_t i=0;i<60;i++){ 
105       for(Int_t j=0;j<60;j++){ 
106         addOn[is][i][j]=0;
107       }
108     }
109   }
110 //PH   cout<<"file to read 2"<<endl;
111   ReadFile();
112 //PH   cout<<"file read 2"<<endl;
113
114 }
115
116 //____________________________________________________________________________
117   AliEMCALClusterizerv1::~AliEMCALClusterizerv1()
118 {
119   // dtor
120   
121 }
122
123 //____________________________________________________________________________
124 const TString AliEMCALClusterizerv1::BranchName() const 
125
126    return GetName();
127
128 }
129
130 //____________________________________________________________________________
131 Float_t  AliEMCALClusterizerv1::Calibrate(Int_t amp) const
132 {
133   //To be replased later by the method, reading individual parameters from the database 
134   return -fADCpedestalECA + amp * fADCchannelECA ; 
135 }
136
137 //____________________________________________________________________________
138 void AliEMCALClusterizerv1::Exec(Option_t * option)
139 {
140   // Steering method to perform clusterization for events
141   // in the range from fFirstEvent to fLastEvent.
142   // This range is optionally set by SetEventRange().
143   // if fLastEvent=-1 (by default), then process events until the end.
144
145   if(strstr(option,"tim"))
146     gBenchmark->Start("EMCALClusterizer"); 
147   
148   if(strstr(option,"print"))
149     Print("") ; 
150
151   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::Instance() ;
152
153   if (fLastEvent == -1) 
154     fLastEvent = gime->MaxEvent() - 1;
155   Int_t nEvents   = fLastEvent - fFirstEvent + 1;
156
157   Int_t ievent ;
158   for (ievent = fFirstEvent; ievent <= fLastEvent; ievent++) {
159     gime->Event(ievent,"D") ;
160     GetCalibrationParameters() ;
161
162     fNumberOfECAClusters = 0;
163            
164     MakeClusters() ;
165
166     if(fToUnfold)
167       MakeUnfolding() ;
168
169     WriteRecPoints() ;
170
171     if(strstr(option,"deb"))  
172       PrintRecPoints(option) ;
173
174     //increment the total number of recpoints per run   
175     fRecPointsInRun += gime->ECARecPoints()->GetEntriesFast() ;  
176   }
177   
178   Unload();
179
180   if(strstr(option,"tim")){
181     gBenchmark->Stop("EMCALClusterizer");
182     printf("Exec took %f seconds for Clusterizing %f seconds per event", 
183          gBenchmark->GetCpuTime("EMCALClusterizer"), gBenchmark->GetCpuTime("EMCALClusterizer")/nEvents ) ;
184   }
185
186   SaveHists();
187
188 }
189
190 //____________________________________________________________________________
191 Bool_t AliEMCALClusterizerv1::FindFit(AliEMCALRecPoint * emcRP, AliEMCALDigit ** maxAt, Float_t * maxAtEnergy,
192                                     Int_t nPar, Float_t * fitparameters) const
193
194   // Calls TMinuit to fit the energy distribution of a cluster with several maxima 
195   // The initial values for fitting procedure are set equal to the positions of local maxima.
196   // Cluster will be fitted as a superposition of nPar/3 electromagnetic showers
197
198   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::Instance() ; 
199   TClonesArray * digits = gime->Digits() ; 
200   
201   gMinuit->mncler();                     // Reset Minuit's list of paramters
202   gMinuit->SetPrintLevel(-1) ;           // No Printout
203   gMinuit->SetFCN(AliEMCALClusterizerv1::UnfoldingChiSquare) ;  
204                                          // To set the address of the minimization function 
205   TList * toMinuit = new TList();
206   toMinuit->AddAt(emcRP,0) ;
207   toMinuit->AddAt(digits,1) ;
208   
209   gMinuit->SetObjectFit(toMinuit) ;         // To tranfer pointer to UnfoldingChiSquare
210
211   // filling initial values for fit parameters
212   AliEMCALDigit * digit ;
213
214   Int_t ierflg  = 0; 
215   Int_t index   = 0 ;
216   Int_t nDigits = (Int_t) nPar / 3 ;
217
218   Int_t iDigit ;
219
220   AliEMCALGeometry * geom = gime->EMCALGeometry() ; 
221
222   for(iDigit = 0; iDigit < nDigits; iDigit++){
223     digit = maxAt[iDigit]; 
224
225     Int_t relid[2] ;
226     Float_t x = 0.;
227     Float_t z = 0.;
228     geom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
229     geom->PosInAlice(relid, x, z) ;
230
231     Float_t energy = maxAtEnergy[iDigit] ;
232
233     gMinuit->mnparm(index, "x",  x, 0.1, 0, 0, ierflg) ;
234     index++ ;   
235     if(ierflg != 0){ 
236       Error("FindFit", "EMCAL Unfolding  Unable to set initial value for fit procedure : x = %f",  x ) ;
237       return kFALSE;
238     }
239     gMinuit->mnparm(index, "z",  z, 0.1, 0, 0, ierflg) ;
240     index++ ;   
241     if(ierflg != 0){
242        Error("FindFit", "EMCAL Unfolding  Unable to set initial value for fit procedure : z = %f", z) ;
243       return kFALSE;
244     }
245     gMinuit->mnparm(index, "Energy",  energy , 0.05*energy, 0., 4.*energy, ierflg) ;
246     index++ ;   
247     if(ierflg != 0){
248      Error("FindFit", "EMCAL Unfolding  Unable to set initial value for fit procedure : energy = %f", energy) ;      
249       return kFALSE;
250     }
251   }
252
253   Double_t p0 = 0.1 ; // "Tolerance" Evaluation stops when EDM = 0.0001*p0 ; The number of function call slightly
254                       //  depends on it. 
255   Double_t p1 = 1.0 ;
256   Double_t p2 = 0.0 ;
257
258   gMinuit->mnexcm("SET STR", &p2, 0, ierflg) ;   // force TMinuit to reduce function calls  
259   gMinuit->mnexcm("SET GRA", &p1, 1, ierflg) ;   // force TMinuit to use my gradient  
260   gMinuit->SetMaxIterations(5);
261   gMinuit->mnexcm("SET NOW", &p2 , 0, ierflg) ;  // No Warnings
262
263   gMinuit->mnexcm("MIGRAD", &p0, 0, ierflg) ;    // minimize 
264
265   if(ierflg == 4){  // Minimum not found   
266     Error("FindFit", "EMCAL Unfolding  Fit not converged, cluster abandoned " ) ;      
267     return kFALSE ;
268   }            
269   for(index = 0; index < nPar; index++){
270     Double_t err ;
271     Double_t val ;
272     gMinuit->GetParameter(index, val, err) ;    // Returns value and error of parameter index
273     fitparameters[index] = val ;
274    }
275
276   delete toMinuit ;
277   return kTRUE;
278
279 }
280
281 //____________________________________________________________________________
282 void AliEMCALClusterizerv1::GetCalibrationParameters() 
283 {
284   // Gets the parameters for the calibration from the digitizer
285   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::Instance() ;
286
287   if ( !gime->Digitizer() ) 
288     gime->LoadDigitizer();
289   AliEMCALDigitizer * dig = gime->Digitizer();  
290
291   fADCchannelECA   = dig->GetECAchannel() ;
292   fADCpedestalECA  = dig->GetECApedestal();
293 //PH  cout<<"ChannelECA, peds "<<fADCchannelECA<<" "<<fADCpedestalECA<<endl;
294 }
295
296 //____________________________________________________________________________
297 void AliEMCALClusterizerv1::Init()
298 {
299   // Make all memory allocations which can not be done in default constructor.
300   // Attach the Clusterizer task to the list of EMCAL tasks
301   
302   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::Instance();
303   if(!gime)
304     gime = AliEMCALGetter::Instance(GetTitle(), fEventFolderName.Data());
305
306   AliEMCALGeometry * geom = gime->EMCALGeometry() ;
307 //PH   cout<<"gime,geom "<<gime<<" "<<geom<<endl;
308
309 //Sub  fNTowers = geom->GetNZ() *  geom->GetNPhi() ;
310   fNTowers =400;
311   if(!gMinuit) 
312     gMinuit = new TMinuit(100) ;
313  //Sub if ( !gime->Clusterizer() ) 
314  //Sub   gime->PostClusterizer(this); 
315  BookHists();
316 //PH   cout<<"hists booked "<<endl;
317 }
318
319 //____________________________________________________________________________
320 void AliEMCALClusterizerv1::InitParameters()
321
322   // Initializes the parameters for the Clusterizer
323   fNumberOfECAClusters = 0;
324
325   fECAClusteringThreshold   = 0.5;  // value obtained from Alexei
326   fECALocMaxCut = 0.03;
327
328   fECAW0     = 4.5 ;
329   fTimeGate = 1.e-8 ; 
330   fToUnfold = kFALSE ;
331   fRecPointsInRun  = 0 ;
332   fMinECut = 0.3;
333 }
334
335 //____________________________________________________________________________
336 Int_t AliEMCALClusterizerv1::AreNeighbours(AliEMCALDigit * d1, AliEMCALDigit * d2)const
337 {
338   // Gives the neighbourness of two digits = 0 are not neighbour but continue searching 
339   //                                       = 1 are neighbour
340   //                                       = 2 are not neighbour but do not continue searching
341   // neighbours are defined as digits having at least a common vertex 
342   // The order of d1 and d2 is important: first (d1) should be a digit already in a cluster 
343   //                                      which is compared to a digit (d2)  not yet in a cluster  
344
345    AliEMCALGeometry * geom = AliEMCALGetter::Instance()->EMCALGeometry() ;
346
347   Int_t rv = 0 ; 
348
349   Int_t relid1[2] ; 
350  //Sub geom->AbsToRelNumbering(d1->GetId(), relid1) ; 
351     Int_t nSupMod=0;
352     Int_t nTower=0;
353     Int_t nIphi=0;
354     Int_t nIeta=0;
355     Int_t iphi=0;
356     Int_t ieta=0;
357    geom->GetCellIndex(d1->GetId(), nSupMod,nTower,nIphi,nIeta);
358    geom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nTower,nIphi,nIeta, iphi,ieta);
359    relid1[0]=ieta;
360    relid1[1]=iphi;
361
362
363     Int_t nSupMod1=0;
364     Int_t nTower1=0;
365     Int_t nIphi1=0;
366     Int_t nIeta1=0;
367     Int_t iphi1=0;
368     Int_t ieta1=0;
369    geom->GetCellIndex(d2->GetId(), nSupMod1,nTower1,nIphi1,nIeta1);
370    geom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod1, nTower1,nIphi1,nIeta1, iphi1,ieta1);
371    Int_t relid2[2] ; 
372    relid2[0]=ieta1;
373    relid2[1]=iphi1;
374
375   //Sub  geom->AbsToRelNumbering(d2->GetId(), relid2) ; 
376   
377
378   Int_t rowdiff = TMath::Abs( relid1[0] - relid2[0] ) ;  
379   Int_t coldiff = TMath::Abs( relid1[1] - relid2[1] ) ;  
380   
381   if (( coldiff <= 1 )  && ( rowdiff <= 1 )){
382       rv = 1 ; 
383   }
384   else {
385     if((relid2[0] > relid1[0]) && (relid2[1] > relid1[1]+1)) 
386       rv = 2; //  Difference in row numbers is too large to look further 
387   }
388  
389   if (gDebug == 2 ) 
390 if(rv==1)printf("AreNeighbours: neighbours=%d, id1=%d, relid1=%d,%d \n id2=%d, relid2=%d,%d \n", 
391          rv, d1->GetId(), relid1[0], relid1[1],
392          d2->GetId(), relid2[0], relid2[1]) ;   
393   
394   return rv ; 
395 }
396
397 //____________________________________________________________________________
398 void AliEMCALClusterizerv1::Unload() 
399 {
400   // Unloads the Digits and RecPoints
401   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::Instance() ; 
402   gime->EmcalLoader()->UnloadDigits() ; 
403   gime->EmcalLoader()->UnloadRecPoints() ; 
404 }
405  
406 //____________________________________________________________________________
407 void AliEMCALClusterizerv1::WriteRecPoints()
408 {
409
410   // Creates new branches with given title
411   // fills and writes into TreeR.
412
413   AliEMCALGetter *gime = AliEMCALGetter::Instance() ; 
414
415   TObjArray * aECARecPoints = gime->ECARecPoints() ; 
416
417   TClonesArray * digits = gime->Digits() ; 
418   TTree * treeR = gime->TreeR(); ; 
419   
420   Int_t index ;
421
422   //Evaluate position, dispersion and other RecPoint properties for EC section
423   for(index = 0; index < aECARecPoints->GetEntries(); index++)
424     (dynamic_cast<AliEMCALRecPoint *>(aECARecPoints->At(index)))->EvalAll(fECAW0,digits) ;
425   
426   aECARecPoints->Sort() ;
427
428   for(index = 0; index < aECARecPoints->GetEntries(); index++)
429     (dynamic_cast<AliEMCALRecPoint *>(aECARecPoints->At(index)))->SetIndexInList(index) ;
430
431   aECARecPoints->Expand(aECARecPoints->GetEntriesFast()) ; 
432   
433   Int_t bufferSize = 32000 ;    
434   Int_t splitlevel = 0 ; 
435
436   //EC section branch
437   TBranch * branchECA = treeR->Branch("EMCALECARP","TObjArray",&aECARecPoints,bufferSize,splitlevel);
438   branchECA->SetTitle(BranchName());
439
440   branchECA->Fill() ;
441
442   gime->WriteRecPoints("OVERWRITE");
443   gime->WriteClusterizer("OVERWRITE");
444 }
445
446 //____________________________________________________________________________
447 void AliEMCALClusterizerv1::MakeClusters()
448 {
449   // Steering method to construct the clusters stored in a list of Reconstructed Points
450   // A cluster is defined as a list of neighbour digits
451     
452   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::Instance() ; 
453
454   AliEMCALGeometry * geom = gime->EMCALGeometry() ; 
455
456   TObjArray * aECARecPoints  = gime->ECARecPoints() ; 
457
458   aECARecPoints->Delete() ;
459
460   TClonesArray * digits = gime->Digits() ; 
461   TClonesArray * digitsC =  dynamic_cast<TClonesArray*>(digits->Clone()) ;
462
463   // Clusterization starts    
464   TIter nextdigit(digitsC) ;
465   AliEMCALDigit * digit;
466
467 //just for hist
468 /*
469   while ( (digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(nextdigit())) ) { // scan over the list of digitsC
470           digitAmp->Fill(digit->GetAmp());
471   }
472   */
473 /////////// 
474
475   while ( (digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(nextdigit())) ) { // scan over the list of digitsC
476     AliEMCALRecPoint * clu = 0 ; 
477     
478     TArrayI clusterECAdigitslist(50000);   
479    
480 //Sub    if (gDebug == 2) { 
481    //  printf("MakeClusters: id = %d, ene = %f , thre = %f \n", digit->GetId(),Calibrate(digit->GetAmp()),
482 //         fECAClusteringThreshold) ;  
483 //    }
484 ////////////////////////temp solution, embedding///////////////////
485    int nSupMod=0, nTower=0, nIphi=0, nIeta=0;
486    int iphi=0, ieta=0;
487           geom->GetCellIndex(digit->GetId(), nSupMod,nTower,nIphi,nIeta);
488           geom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nTower,nIphi,nIeta, iphi,ieta);
489
490          /////////////////////////////////// 
491
492 //cout<<ieta<<" "<<iphi<<endl;
493
494 //    if ( geom->IsInECA(digit->GetId()) && (Calibrate(digit->GetAmp()) > fECAClusteringThreshold  ) ){
495     if (geom->CheckAbsCellId(digit->GetId()) && (Calibrate(digit->GetAmp()+addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1]) > fECAClusteringThreshold  ) ){
496       //if(addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1]>0)cout<<"11 digit, add "<<ieta<<" "<<iphi<<" "<<addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1]<<" "<<digit->GetAmp()<<endl;
497 //          cout<<"crossed the threshold "<<endl;
498       Int_t iDigitInECACluster = 0;
499       // start a new Tower RecPoint
500       if(fNumberOfECAClusters >= aECARecPoints->GetSize()) 
501           aECARecPoints->Expand(2*fNumberOfECAClusters+1) ;
502       AliEMCALRecPoint * rp = new  AliEMCALRecPoint("") ; 
503       aECARecPoints->AddAt(rp, fNumberOfECAClusters) ;
504       clu = dynamic_cast<AliEMCALRecPoint *>(aECARecPoints->At(fNumberOfECAClusters)) ; 
505       fNumberOfECAClusters++ ; 
506       clu->AddDigit(*digit, Calibrate(digit->GetAmp()+addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1])) ; 
507       clusterECAdigitslist[iDigitInECACluster] = digit->GetIndexInList() ;      
508       iDigitInECACluster++ ; 
509 //    cout<<" 1st setp:cluno, digNo "<<fNumberOfECAClusters<<" "<<iDigitInECACluster<<endl;
510       digitsC->Remove(digit) ; 
511       if (gDebug == 2 ) 
512         printf("MakeClusters: OK id = %d, ene = %f , thre = %f \n", digit->GetId(),Calibrate(digit->GetAmp()), fECAClusteringThreshold) ;  
513       nextdigit.Reset() ;
514       
515       AliEMCALDigit * digitN ; 
516       Int_t index = 0 ;
517
518       // Find the neighbours
519       while (index < iDigitInECACluster){ // scan over digits already in cluster 
520         digit =  (AliEMCALDigit*)digits->At(clusterECAdigitslist[index])  ;      
521         index++ ; 
522         while ( (digitN = (AliEMCALDigit *)nextdigit())) { // scan over the reduced list of digits 
523 //      cout<<"we have new digit "<<endl;
524           // check that the digit is above the min E Cut
525          ////////////////////
526           geom->GetCellIndex(digitN->GetId(), nSupMod,nTower,nIphi,nIeta);
527           geom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nTower,nIphi,nIeta, iphi,ieta);
528           ////////////////
529           if(Calibrate(digitN->GetAmp()+addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1]) < fMinECut  )  digitsC->Remove(digitN);
530 //      cout<<" new digit above ECut "<<endl;
531           Int_t ineb = AreNeighbours(digit, digitN);       // call (digit,digitN) in THAT oder !!!!! 
532 //      cout<<" new digit neighbour?? "<<ineb<<endl;
533          switch (ineb ) {
534           case 0 :   // not a neighbour
535             break ;
536           case 1 :   // are neighbours 
537             //if(addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1]>0)cout<<"22 digit, add "<<nSupMod<<" "<<ieta<<" "<<iphi<<" "<<addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1]<<" "<<digit->GetAmp()<<endl;
538             clu->AddDigit(*digitN, Calibrate( digitN->GetAmp()+addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1]) ) ;
539             clusterECAdigitslist[iDigitInECACluster] = digitN->GetIndexInList() ; 
540             iDigitInECACluster++ ; 
541 //    cout<<"when neighbour: cluno, digNo "<<digit->GetId()<<" "<<fNumberOfECAClusters<<" "<<iDigitInECACluster<<endl;
542             digitsC->Remove(digitN) ;
543 //          break ;
544 //          case 2 :   // too far from each other
545 //Subh      goto endofloop1;   
546 //          cout<<"earlier go to end of loop"<<endl;   
547           } // switch
548     //cout<<"in nextDigit loop "<<fNumberOfECAClusters<<" "<<iDigitInECACluster<<endl;
549         } // while digitN
550         
551 //Sub      endofloop1: ;
552         nextdigit.Reset() ; 
553       } // loop over ECA cluster
554     } // energy threshold
555     else if(Calibrate(digit->GetAmp()+addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1]) < fMinECut  ){
556       //if(addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1]>0)cout<<"33 digit, add  "<<ieta<<" "<<iphi<<" "<<addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1]<<" "<<digit->GetAmp()<<endl;
557       digitsC->Remove(digit);
558     }
559     //cout<<"after endofloop: cluno, digNo "<<fNumberOfECAClusters<<endl;
560   } // while digit  
561   delete digitsC ;
562 cout<<"total no of clusters "<<fNumberOfECAClusters<<" from "<<digits->GetEntriesFast()<<" digits"<<endl; 
563 }
564
565 //____________________________________________________________________________
566 void AliEMCALClusterizerv1::MakeUnfolding() const
567 {
568   Fatal("AliEMCALClusterizerv1::MakeUnfolding", "--> Unfolding not implemented") ;
569  
570 }
571
572 //____________________________________________________________________________
573 Double_t  AliEMCALClusterizerv1::ShowerShape(Double_t r)
574
575   // Shape of the shower (see EMCAL TDR)
576   // If you change this function, change also the gradient evaluation in ChiSquare()
577
578   Double_t r4    = r*r*r*r ;
579   Double_t r295  = TMath::Power(r, 2.95) ;
580   Double_t shape = TMath::Exp( -r4 * (1. / (2.32 + 0.26 * r4) + 0.0316 / (1 + 0.0652 * r295) ) ) ;
581   return shape ;
582 }
583
584 //____________________________________________________________________________
585 void  AliEMCALClusterizerv1::UnfoldCluster(AliEMCALRecPoint * /*iniTower*/, 
586                                            Int_t /*nMax*/, 
587                                            AliEMCALDigit ** /*maxAt*/, 
588                                            Float_t * /*maxAtEnergy*/) const
589 {
590   // Performs the unfolding of a cluster with nMax overlapping showers 
591   
592   Fatal("UnfoldCluster", "--> Unfolding not implemented") ;
593
594 }
595
596 //_____________________________________________________________________________
597 void AliEMCALClusterizerv1::UnfoldingChiSquare(Int_t & /*nPar*/, Double_t * /*Grad*/,
598                                                Double_t & /*fret*/,
599                                                Double_t * /*x*/, Int_t /*iflag*/)
600 {
601   // Calculates the Chi square for the cluster unfolding minimization
602   // Number of parameters, Gradient, Chi squared, parameters, what to do
603   
604   ::Fatal("UnfoldingChiSquare","Unfolding not implemented") ;
605 }
606 //____________________________________________________________________________
607 void AliEMCALClusterizerv1::Print(Option_t * /*option*/)const
608 {
609   // Print clusterizer parameters
610
611   TString message("\n") ; 
612   
613   if( strcmp(GetName(), "") !=0 ){
614     
615     // Print parameters
616  
617     TString taskName(GetName()) ;
618     taskName.ReplaceAll(Version(), "") ;
619     
620     printf("--------------- "); 
621     printf(taskName.Data()) ; 
622     printf(" "); 
623     printf(GetTitle()) ; 
624     printf("-----------\n");  
625     printf("Clusterizing digits from the file: "); 
626     printf(taskName.Data());  
627     printf("\n                           Branch: "); 
628     printf(GetName()); 
629     printf("\n                       ECA Local Maximum cut    = %f", fECALocMaxCut); 
630     printf("\n                       ECA Logarithmic weight   = %f", fECAW0); 
631     if(fToUnfold)
632       printf("\nUnfolding on\n");
633     else
634       printf("\nUnfolding off\n");
635     
636     printf("------------------------------------------------------------------"); 
637   }
638   else
639     printf("AliEMCALClusterizerv1 not initialized ") ;
640 }
641
642 //____________________________________________________________________________
643 void AliEMCALClusterizerv1::PrintRecPoints(Option_t * option)
644 {
645   // Prints list of RecPoints produced at the current pass of AliEMCALClusterizer
646
647   TObjArray * aECARecPoints = AliEMCALGetter::Instance()->ECARecPoints() ; 
648   printf("PrintRecPoints: Clusterization result:") ; 
649   
650   printf("event # %d\n", gAlice->GetEvNumber() ) ;
651   printf("           Found %d ECA Rec Points\n ", 
652          aECARecPoints->GetEntriesFast()) ; 
653
654   fRecPointsInRun +=  aECARecPoints->GetEntriesFast() ; 
655   
656   if(strstr(option,"all")) {
657     Int_t index =0;
658     printf("\n-----------------------------------------------------------------------\n") ;
659     printf("Clusters in ECAL section\n") ;
660     printf("Index    Ene(GeV) Multi Module     phi     r   theta    X    Y      Z   Dispersion Lambda 1   Lambda 2  # of prim  Primaries list\n") ;      
661    Float_t maxE=0; 
662    Float_t maxL1=0; 
663    Float_t maxL2=0; 
664    Float_t maxDis=0; 
665
666     for (index = 0 ; index < aECARecPoints->GetEntries() ; index++) {
667       AliEMCALRecPoint * rp = dynamic_cast<AliEMCALRecPoint * >(aECARecPoints->At(index)) ; 
668       TVector3  globalpos;  
669       //rp->GetGlobalPosition(globalpos);
670       TVector3  localpos;  
671       rp->GetLocalPosition(localpos);
672       Float_t lambda[2]; 
673       rp->GetElipsAxis(lambda);
674       Int_t * primaries; 
675       Int_t nprimaries;
676       primaries = rp->GetPrimaries(nprimaries);
677       printf("\n%6d  %8.4f  %3d     %4.1f    %4.1f %4.1f  %4.1f %4.1f %4.1f    %4.1f   %4f  %4f    %2d     : ", 
678              rp->GetIndexInList(), rp->GetEnergy(), rp->GetMultiplicity(),
679              globalpos.X(), globalpos.Y(), globalpos.Z(), localpos.X(), localpos.Y(), localpos.Z(), 
680              rp->GetDispersion(), lambda[0], lambda[1], nprimaries) ; 
681   /////////////
682       if(rp->GetEnergy()>maxE){
683               maxE=rp->GetEnergy();
684               maxL1=lambda[0];
685               maxL2=lambda[1];
686               maxDis=rp->GetDispersion();
687       }
688       pointE->Fill(rp->GetEnergy());
689       pointL1->Fill(lambda[0]);
690       pointL2->Fill(lambda[1]);
691       pointDis->Fill(rp->GetDispersion());
692       pointMult->Fill(rp->GetMultiplicity());
693       ///////////// 
694       for (Int_t iprimary=0; iprimary<nprimaries; iprimary++) {
695         printf("%d ", primaries[iprimary] ) ; 
696       } 
697     }
698
699       MaxE->Fill(maxE);
700       MaxL1->Fill(maxL1);
701       MaxL2->Fill(maxL2);
702       MaxDis->Fill(maxDis);
703
704
705     printf("\n-----------------------------------------------------------------------\n");
706   }
707 }
708   void AliEMCALClusterizerv1::BookHists()
709 {
710         pointE = new TH1F("pointE","point energy", 2000, 0.0, 150.);
711         pointL1 = new TH1F("pointL1","point L1", 1000, 0.0, 3.);
712         pointL2 = new TH1F("pointL2","point L2", 1000, 0.0, 3.);
713         pointDis = new TH1F("pointDis","point Dis", 1000, 0.0, 3.);
714         pointMult = new TH1F("pointMult","point Mult", 100, 0.0, 100.);
715         digitAmp = new TH1F("digitAmp","Digit Amplitude", 2000, 0.0, 5000.);
716         MaxE = new TH1F("maxE","Max point energy", 2000, 0.0, 150.);
717         MaxL1 = new TH1F("maxL1","Max point L1", 1000, 0.0, 3.);
718         MaxL2 = new TH1F("maxL2","Max point L2", 1000, 0.0, 3.);
719         MaxDis = new TH1F("maxDis","Max point Dis", 1000, 0.0, 3.);
720 }
721 void AliEMCALClusterizerv1::SaveHists()
722 {
723  recofile=new TFile("reco.root","RECREATE"); 
724         pointE->Write();
725         pointL1->Write();
726         pointL2->Write();
727         pointDis->Write();
728         pointMult->Write();
729         digitAmp->Write();
730       MaxE->Write();
731       MaxL1->Write();
732       MaxL2->Write();
733       MaxDis->Write();
734 recofile->Close();
735 }
736
737 void AliEMCALClusterizerv1::ReadFile()
738 {
739   return; // 3-jan-05
740         FILE *fp = fopen("hijing1.dat","r");
741         for(Int_t line=0;line<9113;line++){
742          Int_t eg,l1,l2,sm;
743          Int_t ncols0;
744          ncols0 = fscanf(fp,"%d %d %d %d",&sm,&l1,&l2,&eg);
745         // cout<<eg<<" "<<l1<<" "<<l2<<endl;
746          addOn[sm-1][l1-1][l2-1]=eg;
747          //addOn[sm-1][l1-1][l2-1]=0;
748         }
749 }
750