EMCAL/AliEMCALClusterizerv1.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18 //-- Author: Yves Schutz (SUBATECH)  & Dmitri Peressounko (SUBATECH & Kurchatov Institute)
  19 //  August 2002 Yves Schutz: clone PHOS as closely as possible and intoduction
  20 //                           of new  IO (à la PHOS)
  21 //  Mar 2007, Aleksei Pavlinov - new algoritmh of pseudo clusters
  22 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  23 //  Clusterization class. Performs clusterization (collects neighbouring active cells) and
  24 //  unfolds the clusters having several local maxima.
  25 //  Results are stored in TreeR#, branches EMCALTowerRP (EMC recPoints),
  26 //  EMCALPreShoRP (CPV RecPoints) and AliEMCALClusterizer (Clusterizer with all
  27 //  parameters including input digits branch title, thresholds etc.)
  28 //  This TTask is normally called from Reconstructioner, but can as well be used in
  29 //  standalone mode.
  30 // Use Case:
  31 //  root [0] AliEMCALClusterizerv1 * cl = new AliEMCALClusterizerv1("galice.root")
  32 //  Warning in <TDatabasePDG::TDatabasePDG>: object already instantiated
  33 //               //reads gAlice from header file "..."
  34 //  root [1] cl->ExecuteTask()
  35 //               //finds RecPoints in all events stored in galice.root
  36 //  root [2] cl->SetDigitsBranch("digits2")
  37 //               //sets another title for Digitis (input) branch
  38 //  root [3] cl->SetRecPointsBranch("recp2")
  39 //               //sets another title four output branches
  40 //  root [4] cl->SetTowerLocalMaxCut(0.03)
  41 //               //set clusterization parameters
  42 //  root [5] cl->ExecuteTask("deb all time")
  43 //               //once more finds RecPoints options are
  44 //               // deb - print number of found rec points
  45 //               // deb all - print number of found RecPoints and some their characteristics
  46 //               // time - print benchmarking results
  47
  48 // --- ROOT system ---
  49 #include <cassert>
  50
  51 class TROOT;
  52 #include <TH1.h>
  53 #include <TFile.h>
  54 class TFolder;
  55 #include <TMath.h>
  56 #include <TMinuit.h>
  57 #include <TTree.h>
  58 class TSystem;
  59 #include <TBenchmark.h>
  60 #include <TBrowser.h>
  61 #include <TROOT.h>
  62
  63 // --- Standard library ---
  64
  65
  66 // --- AliRoot header files ---
  67 #include "AliRunLoader.h"
  68 #include "AliRun.h"
  69 #include "AliESD.h"
  70 #include "AliEMCALClusterizerv1.h"
  71 #include "AliEMCALRecPoint.h"
  72 #include "AliEMCALDigit.h"
  73 #include "AliEMCALDigitizer.h"
  74 #include "AliEMCAL.h"
  75 #include "AliEMCALGeometry.h"
  76 #include "AliEMCALRecParam.h"
  77 #include "AliEMCALReconstructor.h"
  78 #include "AliCDBManager.h"
  79
  80 class AliCDBStorage;
  81 #include "AliCDBEntry.h"
  82
  83 ClassImp(AliEMCALClusterizerv1)
  84
  85 //____________________________________________________________________________
  86 AliEMCALClusterizerv1::AliEMCALClusterizerv1()
  87   : AliEMCALClusterizer(),
  88     fGeom(0),
  89     fDefaultInit(kFALSE),
  90     fToUnfold(kFALSE),
  91     fNumberOfECAClusters(0),fCalibData(0),
  92     fADCchannelECA(0.),fADCpedestalECA(0.),fECAClusteringThreshold(0.),fECALocMaxCut(0.),
  93     fECAW0(0.),fTimeCut(0.),fMinECut(0.)
  94 {
  95   // ctor with the indication of the file where header Tree and digits Tree are stored
  96
  97   InitParameters() ;
  98   Init() ;
  99 }
 100
 101 //____________________________________________________________________________
 102 AliEMCALClusterizerv1::AliEMCALClusterizerv1(AliEMCALGeometry* geometry)
 103   : AliEMCALClusterizer(),
 104     fGeom(geometry),
 105     fDefaultInit(kFALSE),
 106     fToUnfold(kFALSE),
 107     fNumberOfECAClusters(0),fCalibData(0),
 108     fADCchannelECA(0.),fADCpedestalECA(0.),fECAClusteringThreshold(0.),fECALocMaxCut(0.),
 109     fECAW0(0.),fTimeCut(0.),fMinECut(0.)
 110 {
 111   // ctor with the indication of the file where header Tree and digits Tree are stored
 112   // use this contructor to avoid usage of Init() which uses runloader
 113   // change needed by HLT - MP
 114
 115   InitParameters() ;
 116
 117   // Note for the future: the use on runloader should be avoided or optional at least
 118   // another way is to make Init virtual and protected at least such that the deriving classes can overload
 119   // Init() ;
 120   //
 121
 122   if (!fGeom)
 123     {
 124       AliFatal("Geometry not initialized.");
 125     }
 126
 127   if(!gMinuit)
 128     gMinuit = new TMinuit(100) ;
 129
 130 }
 131
 132 //____________________________________________________________________________
 133   AliEMCALClusterizerv1::~AliEMCALClusterizerv1()
 134 {
 135   // dtor
 136 }
 137
 138 //____________________________________________________________________________
 139 Float_t  AliEMCALClusterizerv1::Calibrate(Int_t amp, Int_t AbsId)
 140 {
 141
 142   // Convert digitized amplitude into energy.
 143   // Calibration parameters are taken from calibration data base for raw data,
 144   // or from digitizer parameters for simulated data.
 145
 146   if(fCalibData){
 147
 148     if (fGeom==0)
 149       AliFatal("Did not get geometry from EMCALLoader") ;
 150
 151     Int_t iSupMod = -1;
 152     Int_t nModule  = -1;
 153     Int_t nIphi   = -1;
 154     Int_t nIeta   = -1;
 155     Int_t iphi    = -1;
 156     Int_t ieta    = -1;
 157
 158     Bool_t bCell = fGeom->GetCellIndex(AbsId, iSupMod, nModule, nIphi, nIeta) ;
 159     if(!bCell) {
 160       fGeom->PrintGeometry();
 161       Error("Calibrate()"," Wrong cell id number : %i", AbsId);
 162       assert(0);
 163     }
 164
 165     fGeom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(iSupMod,nModule,nIphi, nIeta,iphi,ieta);
 166
 167     fADCchannelECA  = fCalibData->GetADCchannel (iSupMod,ieta,iphi);
 168     fADCpedestalECA = fCalibData->GetADCpedestal(iSupMod,ieta,iphi);
 169
 170    return -fADCpedestalECA + amp * fADCchannelECA ;
 171
 172   }
 173   else //Return energy with default parameters if calibration is not available
 174     return -fADCpedestalECA + amp * fADCchannelECA ;
 175
 176 }
 177
 178 //____________________________________________________________________________
 179 void AliEMCALClusterizerv1::Digits2Clusters(Option_t * option)
 180 {
 181   // Steering method to perform clusterization for the current event
 182   // in AliEMCALLoader
 183
 184   if(strstr(option,"tim"))
 185     gBenchmark->Start("EMCALClusterizer");
 186
 187   if(strstr(option,"print"))
 188     Print("") ;
 189
 190   //Get calibration parameters from file or digitizer default values.
 191   GetCalibrationParameters() ;
 192
 193
 194   fNumberOfECAClusters = 0;
 195
 196   MakeClusters() ;  //only the real clusters
 197
 198   if(fToUnfold)
 199     MakeUnfolding() ;
 200
 201   Int_t index ;
 202
 203   //Evaluate position, dispersion and other RecPoint properties for EC section
 204   for(index = 0; index < fRecPoints->GetEntries(); index++) {
 205       dynamic_cast<AliEMCALRecPoint *>(fRecPoints->At(index))->EvalAll(fECAW0,fDigitsArr) ;
 206   }
 207
 208   fRecPoints->Sort() ;
 209
 210   for(index = 0; index < fRecPoints->GetEntries(); index++) {
 211     (dynamic_cast<AliEMCALRecPoint *>(fRecPoints->At(index)))->SetIndexInList(index) ;
 212     (dynamic_cast<AliEMCALRecPoint *>(fRecPoints->At(index)))->Print();
 213   }
 214
 215   fTreeR->Fill();
 216
 217   if(strstr(option,"deb") || strstr(option,"all"))
 218     PrintRecPoints(option) ;
 219
 220   AliDebug(1,Form("EMCAL Clusterizer found %d Rec Points",fRecPoints->GetEntriesFast()));
 221
 222   if(strstr(option,"tim")){
 223     gBenchmark->Stop("EMCALClusterizer");
 224     printf("Exec took %f seconds for Clusterizing",
 225            gBenchmark->GetCpuTime("EMCALClusterizer"));
 226   }
 227 }
 228
 229 //____________________________________________________________________________
 230 Bool_t AliEMCALClusterizerv1::FindFit(AliEMCALRecPoint * RecPoint, AliEMCALDigit ** maxAt,
 231                                       Float_t* maxAtEnergy,
 232                                       Int_t nPar, Float_t * fitparameters) const
 233 {
 234   // Calls TMinuit to fit the energy distribution of a cluster with several maxima
 235   // The initial values for fitting procedure are set equal to the
 236   // positions of local maxima.
 237   // Cluster will be fitted as a superposition of nPar/3
 238   // electromagnetic showers
 239
 240   if (fGeom==0) AliFatal("Did not get geometry from EMCALLoader");
 241
 242   gMinuit->mncler();                     // Reset Minuit's list of paramters
 243   gMinuit->SetPrintLevel(-1) ;           // No Printout
 244   gMinuit->SetFCN(AliEMCALClusterizerv1::UnfoldingChiSquare) ;
 245   // To set the address of the minimization function
 246   TList * toMinuit = new TList();
 247   toMinuit->AddAt(RecPoint,0) ;
 248   toMinuit->AddAt(fDigitsArr,1) ;
 249   toMinuit->AddAt(fGeom,2) ;
 250
 251   gMinuit->SetObjectFit(toMinuit) ;         // To tranfer pointer to UnfoldingChiSquare
 252
 253   // filling initial values for fit parameters
 254   AliEMCALDigit * digit ;
 255
 256   Int_t ierflg  = 0;
 257   Int_t index   = 0 ;
 258   Int_t nDigits = (Int_t) nPar / 3 ;
 259
 260   Int_t iDigit ;
 261
 262   for(iDigit = 0; iDigit < nDigits; iDigit++){
 263     digit = maxAt[iDigit];
 264     Double_t x = 0.;
 265     Double_t y = 0.;
 266     Double_t z = 0.;
 267
 268     fGeom->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), y, x, z);
 269
 270     Float_t energy = maxAtEnergy[iDigit] ;
 271
 272     gMinuit->mnparm(index, "x",  x, 0.1, 0, 0, ierflg) ;
 273     index++ ;
 274     if(ierflg != 0){
 275       Error("FindFit", "EMCAL Unfolding  Unable to set initial value for fit procedure : x = %f", x ) ;
 276       return kFALSE;
 277     }
 278     gMinuit->mnparm(index, "z",  z, 0.1, 0, 0, ierflg) ;
 279     index++ ;
 280     if(ierflg != 0){
 281       Error("FindFit", "EMCAL Unfolding  Unable to set initial value for fit procedure : z = %f", z) ;
 282       return kFALSE;
 283     }
 284     gMinuit->mnparm(index, "Energy",  energy , 0.05*energy, 0., 4.*energy, ierflg) ;
 285     index++ ;
 286     if(ierflg != 0){
 287       Error("FindFit", "EMCAL Unfolding  Unable to set initial value for fit procedure : energy = %f", energy) ;
 288       return kFALSE;
 289     }
 290   }
 291
 292   Double_t p0 = 0.1 ; // "Tolerance" Evaluation stops when EDM = 0.0001*p0 ;
 293                       // The number of function call slightly depends on it.
 294   //Double_t p1 = 1.0 ;
 295   Double_t p2 = 0.0 ;
 296
 297   gMinuit->mnexcm("SET STR", &p2, 0, ierflg) ;   // force TMinuit to reduce function calls
 298   //  gMinuit->mnexcm("SET GRA", &p1, 1, ierflg) ;   // force TMinuit to use my gradient
 299   gMinuit->SetMaxIterations(5);
 300   gMinuit->mnexcm("SET NOW", &p2 , 0, ierflg) ;  // No Warnings
 301   gMinuit->mnexcm("MIGRAD", &p0, 0, ierflg) ;    // minimize
 302
 303   if(ierflg == 4){  // Minimum not found
 304     Error("FindFit", "EMCAL Unfolding  Fit not converged, cluster abandoned " ) ;
 305     return kFALSE ;
 306   }
 307   for(index = 0; index < nPar; index++){
 308     Double_t err ;
 309     Double_t val ;
 310     gMinuit->GetParameter(index, val, err) ;    // Returns value and error of parameter index
 311     fitparameters[index] = val ;
 312   }
 313
 314   delete toMinuit ;
 315   return kTRUE;
 316
 317 }
 318
 319 //____________________________________________________________________________
 320 void AliEMCALClusterizerv1::GetCalibrationParameters()
 321 {
 322   // Set calibration parameters:
 323   // if calibration database exists, they are read from database,
 324   // otherwise, they are taken from digitizer.
 325   //
 326   // It is a user responsilibity to open CDB before reconstruction,
 327   // for example:
 328   // AliCDBStorage* storage = AliCDBManager::Instance()->GetStorage("local://CalibDB");
 329
 330   //Check if calibration is stored in data base
 331
 332   if(!fCalibData && (AliCDBManager::Instance()->IsDefaultStorageSet()))
 333     {
 334       AliCDBEntry *entry = (AliCDBEntry*)
 335         AliCDBManager::Instance()->Get("EMCAL/Calib/Data");
 336       if (entry) fCalibData =  (AliEMCALCalibData*) entry->GetObject();
 337     }
 338
 339   if(!fCalibData)
 340     AliFatal("Calibration parameters not found in CDB!");
 341
 342 }
 343
 344 //____________________________________________________________________________
 345 void AliEMCALClusterizerv1::Init()
 346 {
 347   // Make all memory allocations which can not be done in default constructor.
 348   // Attach the Clusterizer task to the list of EMCAL tasks
 349
 350   AliRunLoader *rl = AliRunLoader::GetRunLoader();
 351   if (rl->GetAliRun() && rl->GetAliRun()->GetDetector("EMCAL"))
 352     fGeom = dynamic_cast<AliEMCAL*>(rl->GetAliRun()->GetDetector("EMCAL"))->GetGeometry();
 353   else
 354     fGeom =  AliEMCALGeometry::GetInstance(AliEMCALGeometry::GetDefaultGeometryName());
 355
 356   AliDebug(1,Form("geom 0x%x",fGeom));
 357
 358   if(!gMinuit)
 359     gMinuit = new TMinuit(100) ;
 360
 361 }
 362
 363 //____________________________________________________________________________
 364 void AliEMCALClusterizerv1::InitParameters()
 365 {
 366   // Initializes the parameters for the Clusterizer
 367   fNumberOfECAClusters = 0;
 368   fTimeCut = 300e-9 ; // 300 ns time cut (to be tuned)
 369
 370   fCalibData               = 0 ;
 371
 372   const AliEMCALRecParam* recParam = AliEMCALReconstructor::GetRecParam();
 373   if(!recParam) {
 374     AliFatal("Reconstruction parameters for EMCAL not set!");
 375   }
 376   else {
 377     fECAClusteringThreshold = recParam->GetClusteringThreshold();
 378     fECAW0                  = recParam->GetW0();
 379     fMinECut                = recParam->GetMinECut();
 380     fToUnfold               = recParam->GetUnfold();
 381     if(fToUnfold) AliWarning("Cluster Unfolding ON. Implementing only for eta=0 case!!!");
 382     fECALocMaxCut           = recParam->GetLocMaxCut();
 383
 384     AliDebug(1,Form("Reconstruction parameters: fECAClusteringThreshold=%.3f, fECAW=%.3f, fMinECut=%.3f, fToUnfold=%d, fECALocMaxCut=%.3f",
 385                  fECAClusteringThreshold,fECAW0,fMinECut,fToUnfold,fECALocMaxCut));
 386   }
 387
 388 }
 389
 390 //____________________________________________________________________________
 391 Int_t AliEMCALClusterizerv1::AreNeighbours(AliEMCALDigit * d1, AliEMCALDigit * d2) const
 392 {
 393   // Gives the neighbourness of two digits = 0 are not neighbour ; continue searching
 394   //                                       = 1 are neighbour
 395   //                                       = 2 is in different SM; continue searching
 396   // neighbours are defined as digits having at least a common vertex
 397   // The order of d1 and d2 is important: first (d1) should be a digit already in a cluster
 398   //                                      which is compared to a digit (d2)  not yet in a cluster
 399
 400   static Int_t rv;
 401   static Int_t nSupMod1=0, nModule1=0, nIphi1=0, nIeta1=0, iphi1=0, ieta1=0;
 402   static Int_t nSupMod2=0, nModule2=0, nIphi2=0, nIeta2=0, iphi2=0, ieta2=0;
 403   static Int_t rowdiff, coldiff;
 404   rv = 0 ;
 405
 406   fGeom->GetCellIndex(d1->GetId(), nSupMod1,nModule1,nIphi1,nIeta1);
 407   fGeom->GetCellIndex(d2->GetId(), nSupMod2,nModule2,nIphi2,nIeta2);
 408   if(nSupMod1 != nSupMod2) return 2; // different SM
 409
 410   fGeom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod1,nModule1,nIphi1,nIeta1, iphi1,ieta1);
 411   fGeom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod2,nModule2,nIphi2,nIeta2, iphi2,ieta2);
 412
 413   rowdiff = TMath::Abs(iphi1 - iphi2);
 414   coldiff = TMath::Abs(ieta1 - ieta2) ;
 415
 416   // neighbours with at least commom side; May 11, 2007
 417   if ((coldiff==0 && abs(rowdiff)==1) || (rowdiff==0 && abs(coldiff)==1)) rv = 1;
 418
 419   if (gDebug == 2 && rv==1)
 420   printf("AreNeighbours: neighbours=%d, id1=%d, relid1=%d,%d \n id2=%d, relid2=%d,%d \n",
 421          rv, d1->GetId(), iphi1,ieta1, d2->GetId(), iphi2,ieta2);
 422
 423   return rv ;
 424 }
 425
 426 //____________________________________________________________________________
 427 void AliEMCALClusterizerv1::MakeClusters()
 428 {
 429   // Steering method to construct the clusters stored in a list of Reconstructed Points
 430   // A cluster is defined as a list of neighbour digits
 431   // Mar 03, 2007 by PAI
 432
 433   if (fGeom==0) AliFatal("Did not get geometry from EMCALLoader");
 434
 435   fRecPoints->Clear();
 436
 437   // Set up TObjArray with pointers to digits to work on
 438   TObjArray *digitsC = new TObjArray();
 439   TIter nextdigit(fDigitsArr);
 440   AliEMCALDigit *digit;
 441   while ( (digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit*>(nextdigit())) ) {
 442     digitsC->AddLast(digit);
 443   }
 444
 445   double e = 0.0, ehs = 0.0;
 446   TIter nextdigitC(digitsC);
 447
 448   while ( (digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(nextdigitC())) ) { // clean up digits
 449     e = Calibrate(digit->GetAmp(), digit->GetId());
 450     if ( e < fMinECut || digit->GetTimeR() > fTimeCut )
 451       digitsC->Remove(digit);
 452     else
 453       ehs += e;
 454   }
 455   AliDebug(1,Form("MakeClusters: Number of digits %d  -> (e %f), ehs %d\n",
 456                   fDigitsArr->GetEntries(),fMinECut,ehs));
 457
 458   nextdigitC.Reset();
 459
 460   while ( (digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(nextdigitC())) ) { // scan over the list of digitsC
 461     TArrayI clusterECAdigitslist(fDigitsArr->GetEntries());
 462
 463     if(fGeom->CheckAbsCellId(digit->GetId()) && (Calibrate(digit->GetAmp(), digit->GetId()) > fECAClusteringThreshold  ) ){
 464       // start a new Tower RecPoint
 465       if(fNumberOfECAClusters >= fRecPoints->GetSize()) fRecPoints->Expand(2*fNumberOfECAClusters+1) ;
 466
 467       AliEMCALRecPoint *recPoint = new  AliEMCALRecPoint("") ;
 468       fRecPoints->AddAt(recPoint, fNumberOfECAClusters) ;
 469       recPoint = dynamic_cast<AliEMCALRecPoint *>(fRecPoints->At(fNumberOfECAClusters)) ;
 470       fNumberOfECAClusters++ ;
 471
 472       recPoint->SetClusterType(AliESDCaloCluster::kEMCALClusterv1);
 473
 474       recPoint->AddDigit(*digit, Calibrate(digit->GetAmp(), digit->GetId())) ;
 475       TObjArray clusterDigits;
 476       clusterDigits.AddLast(digit);
 477       digitsC->Remove(digit) ;
 478
 479       AliDebug(1,Form("MakeClusters: OK id = %d, ene = %f , cell.th. = %f \n", digit->GetId(),
 480       Calibrate(digit->GetAmp(),digit->GetId()), fECAClusteringThreshold));
 481
 482       // Grow cluster by finding neighbours
 483       TIter nextClusterDigit(&clusterDigits);
 484       while ( (digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit*>(nextClusterDigit())) ) { // scan over digits in cluster
 485         TIter nextdigitN(digitsC);
 486         AliEMCALDigit *digitN = 0; // digi neighbor
 487         while ( (digitN = (AliEMCALDigit *)nextdigitN()) ) { // scan over all digits to look for neighbours
 488           if (AreNeighbours(digit, digitN)==1) {      // call (digit,digitN) in THAT oder !!!!!
 489             recPoint->AddDigit(*digitN, Calibrate(digitN->GetAmp(),digitN->GetId()) ) ;
 490             clusterDigits.AddLast(digitN) ;
 491             digitsC->Remove(digitN) ;
 492           } // if(ineb==1)
 493         } // scan over digits
 494       } // scan over digits already in cluster
 495       if(recPoint)
 496         AliDebug(2,Form("MakeClusters: %d digitd, energy %f \n", clusterDigits.GetEntries(), recPoint->GetEnergy()));
 497     } // If seed found
 498   } // while digit
 499
 500   delete digitsC ;
 501
 502   AliDebug(1,Form("total no of clusters %d from %d digits",fNumberOfECAClusters,fDigitsArr->GetEntriesFast()));
 503 }
 504
 505 //____________________________________________________________________________
 506 void AliEMCALClusterizerv1::MakeUnfolding()
 507 {
 508   // Unfolds clusters using the shape of an ElectroMagnetic shower
 509   // Performs unfolding of all clusters
 510
 511   if(fNumberOfECAClusters > 0){
 512     if (fGeom==0)
 513       AliFatal("Did not get geometry from EMCALLoader") ;
 514     Int_t nModulesToUnfold = fGeom->GetNCells();
 515
 516     Int_t numberofNotUnfolded = fNumberOfECAClusters ;
 517     Int_t index ;
 518     for(index = 0 ; index < numberofNotUnfolded ; index++){
 519
 520       AliEMCALRecPoint * RecPoint = dynamic_cast<AliEMCALRecPoint *>( fRecPoints->At(index) ) ;
 521
 522       TVector3 gpos;
 523       Int_t absId;
 524       RecPoint->GetGlobalPosition(gpos);
 525       fGeom->GetAbsCellIdFromEtaPhi(gpos.Eta(),gpos.Phi(),absId);
 526       if(absId > nModulesToUnfold)
 527         break ;
 528
 529       Int_t nMultipl = RecPoint->GetMultiplicity() ;
 530       AliEMCALDigit ** maxAt = new AliEMCALDigit*[nMultipl] ;
 531       Float_t * maxAtEnergy = new Float_t[nMultipl] ;
 532       Int_t nMax = RecPoint->GetNumberOfLocalMax(maxAt, maxAtEnergy,fECALocMaxCut,fDigitsArr) ;
 533
 534       if( nMax > 1 ) {     // if cluster is very flat (no pronounced maximum) then nMax = 0
 535         UnfoldCluster(RecPoint, nMax, maxAt, maxAtEnergy) ;
 536         fRecPoints->Remove(RecPoint);
 537         fRecPoints->Compress() ;
 538         index-- ;
 539         fNumberOfECAClusters-- ;
 540         numberofNotUnfolded-- ;
 541       }
 542       else{
 543         RecPoint->SetNExMax(1) ; //Only one local maximum
 544       }
 545
 546       delete[] maxAt ;
 547       delete[] maxAtEnergy ;
 548     }
 549   }
 550   // End of Unfolding of clusters
 551 }
 552
 553 //____________________________________________________________________________
 554 Double_t  AliEMCALClusterizerv1::ShowerShape(Double_t x, Double_t y)
 555 {
 556   // Shape of the shower
 557   // If you change this function, change also the gradient evaluation in ChiSquare()
 558
 559   Double_t r = sqrt(x*x+y*y);
 560   Double_t r133  = TMath::Power(r, 1.33) ;
 561   Double_t r669  = TMath::Power(r, 6.69) ;
 562   Double_t shape = TMath::Exp( -r133 * (1. / (1.57 + 0.0860 * r133) - 0.55 / (1 + 0.000563 * r669) ) ) ;
 563   return shape ;
 564 }
 565
 566 //____________________________________________________________________________
 567 void  AliEMCALClusterizerv1::UnfoldCluster(AliEMCALRecPoint * iniTower,
 568                                            Int_t nMax,
 569                                            AliEMCALDigit ** maxAt,
 570                                            Float_t * maxAtEnergy)
 571 {
 572   // Performs the unfolding of a cluster with nMax overlapping showers
 573   Int_t nPar = 3 * nMax ;
 574   Float_t * fitparameters = new Float_t[nPar] ;
 575
 576   if (fGeom==0)
 577     AliFatal("Did not get geometry from EMCALLoader") ;
 578
 579   Bool_t rv = FindFit(iniTower, maxAt, maxAtEnergy, nPar, fitparameters) ;
 580   if( !rv ) {
 581     // Fit failed, return and remove cluster
 582     iniTower->SetNExMax(-1) ;
 583     delete[] fitparameters ;
 584     return ;
 585   }
 586
 587   // create unfolded rec points and fill them with new energy lists
 588   // First calculate energy deposited in each sell in accordance with
 589   // fit (without fluctuations): efit[]
 590   // and later correct this number in acordance with actual energy
 591   // deposition
 592
 593   Int_t nDigits = iniTower->GetMultiplicity() ;
 594   Float_t * efit = new Float_t[nDigits] ;
 595   Double_t xDigit=0.,yDigit=0.,zDigit=0. ;
 596   Float_t xpar=0.,zpar=0.,epar=0.  ;
 597
 598   AliEMCALDigit * digit = 0 ;
 599   Int_t * Digits = iniTower->GetDigitsList() ;
 600
 601   Int_t iparam ;
 602   Int_t iDigit ;
 603   for(iDigit = 0 ; iDigit < nDigits ; iDigit ++){
 604     digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit*>( fDigitsArr->At(Digits[iDigit] ) ) ;
 605     fGeom->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), yDigit, xDigit, zDigit);
 606     efit[iDigit] = 0;
 607
 608     iparam = 0 ;
 609     while(iparam < nPar ){
 610       xpar = fitparameters[iparam] ;
 611       zpar = fitparameters[iparam+1] ;
 612       epar = fitparameters[iparam+2] ;
 613       iparam += 3 ;
 614       efit[iDigit] += epar * ShowerShape(xDigit - xpar,zDigit - zpar) ;
 615     }
 616   }
 617
 618
 619   // Now create new RecPoints and fill energy lists with efit corrected to fluctuations
 620   // so that energy deposited in each cell is distributed between new clusters proportionally
 621   // to its contribution to efit
 622
 623   Float_t * Energies = iniTower->GetEnergiesList() ;
 624   Float_t ratio ;
 625
 626   iparam = 0 ;
 627   while(iparam < nPar ){
 628     xpar = fitparameters[iparam] ;
 629     zpar = fitparameters[iparam+1] ;
 630     epar = fitparameters[iparam+2] ;
 631     iparam += 3 ;
 632
 633     AliEMCALRecPoint * RecPoint = 0 ;
 634
 635     if(fNumberOfECAClusters >= fRecPoints->GetSize())
 636       fRecPoints->Expand(2*fNumberOfECAClusters) ;
 637
 638     (*fRecPoints)[fNumberOfECAClusters] = new AliEMCALRecPoint("") ;
 639     RecPoint = dynamic_cast<AliEMCALRecPoint *>( fRecPoints->At(fNumberOfECAClusters) ) ;
 640     fNumberOfECAClusters++ ;
 641     RecPoint->SetNExMax((Int_t)nPar/3) ;
 642
 643     Float_t eDigit ;
 644     for(iDigit = 0 ; iDigit < nDigits ; iDigit ++){
 645       digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit*>( fDigitsArr->At( Digits[iDigit] ) ) ;
 646       fGeom->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), yDigit, xDigit, zDigit);
 647
 648       ratio = epar * ShowerShape(xDigit - xpar,zDigit - zpar) / efit[iDigit] ;
 649       eDigit = Energies[iDigit] * ratio ;
 650       RecPoint->AddDigit( *digit, eDigit ) ;
 651     }
 652   }
 653
 654   delete[] fitparameters ;
 655   delete[] efit ;
 656
 657 }
 658
 659 //_____________________________________________________________________________
 660 void AliEMCALClusterizerv1::UnfoldingChiSquare(Int_t & nPar, Double_t * Grad,
 661                                                Double_t & fret,
 662                                                Double_t * x, Int_t iflag)
 663 {
 664   // Calculates the Chi square for the cluster unfolding minimization
 665   // Number of parameters, Gradient, Chi squared, parameters, what to do
 666
 667   TList * toMinuit = dynamic_cast<TList*>( gMinuit->GetObjectFit() ) ;
 668
 669   AliEMCALRecPoint * RecPoint = dynamic_cast<AliEMCALRecPoint*>( toMinuit->At(0) )  ;
 670   TClonesArray * digits = dynamic_cast<TClonesArray*>( toMinuit->At(1) )  ;
 671   // A bit buggy way to get an access to the geometry
 672   // To be revised!
 673   AliEMCALGeometry *geom = dynamic_cast<AliEMCALGeometry *>(toMinuit->At(2));
 674
 675   Int_t * Digits     = RecPoint->GetDigitsList() ;
 676
 677   Int_t nOdigits = RecPoint->GetDigitsMultiplicity() ;
 678
 679   Float_t * Energies = RecPoint->GetEnergiesList() ;
 680
 681   fret = 0. ;
 682   Int_t iparam ;
 683
 684   if(iflag == 2)
 685     for(iparam = 0 ; iparam < nPar ; iparam++)
 686       Grad[iparam] = 0 ; // Will evaluate gradient
 687
 688   Double_t efit ;
 689
 690   AliEMCALDigit * digit ;
 691   Int_t iDigit ;
 692
 693   for( iDigit = 0 ; iDigit < nOdigits ; iDigit++) {
 694
 695     digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit*>( digits->At( Digits[iDigit] ) );
 696
 697     Double_t xDigit=0 ;
 698     Double_t zDigit=0 ;
 699     Double_t yDigit=0 ;//not used yet, assumed to be 0
 700
 701     geom->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), yDigit, xDigit, zDigit);
 702
 703     if(iflag == 2){  // calculate gradient
 704       Int_t iParam = 0 ;
 705       efit = 0 ;
 706       while(iParam < nPar ){
 707         Double_t dx = (xDigit - x[iParam]) ;
 708         iParam++ ;
 709         Double_t dz = (zDigit - x[iParam]) ;
 710         iParam++ ;
 711         efit += x[iParam] * ShowerShape(dx,dz) ;
 712         iParam++ ;
 713       }
 714       Double_t sum = 2. * (efit - Energies[iDigit]) / Energies[iDigit] ; // Here we assume, that sigma = sqrt(E)
 715       iParam = 0 ;
 716       while(iParam < nPar ){
 717         Double_t xpar = x[iParam] ;
 718         Double_t zpar = x[iParam+1] ;
 719         Double_t epar = x[iParam+2] ;
 720         Double_t dr = TMath::Sqrt( (xDigit - xpar) * (xDigit - xpar) + (zDigit - zpar) * (zDigit - zpar) );
 721         Double_t shape = sum * ShowerShape(xDigit - xpar,zDigit - zpar) ;
 722         Double_t r133 =  TMath::Power(dr, 1.33);
 723         Double_t r669 = TMath::Power(dr,6.69);
 724         Double_t deriv =-1.33 * TMath::Power(dr,0.33)*dr * ( 1.57 / ( (1.57 + 0.0860 * r133) * (1.57 + 0.0860 * r133) )
 725                                                              - 0.55 / (1 + 0.000563 * r669) / ( (1 + 0.000563 * r669) * (1 + 0.000563 * r669) ) ) ;
 726
 727         Grad[iParam] += epar * shape * deriv * (xpar - xDigit) ;  // Derivative over x
 728         iParam++ ;
 729         Grad[iParam] += epar * shape * deriv * (zpar - zDigit) ;  // Derivative over z
 730         iParam++ ;
 731         Grad[iParam] += shape ;                                  // Derivative over energy
 732         iParam++ ;
 733       }
 734     }
 735     efit = 0;
 736     iparam = 0 ;
 737
 738
 739     while(iparam < nPar ){
 740       Double_t xpar = x[iparam] ;
 741       Double_t zpar = x[iparam+1] ;
 742       Double_t epar = x[iparam+2] ;
 743       iparam += 3 ;
 744       efit += epar * ShowerShape(xDigit - xpar,zDigit - zpar) ;
 745     }
 746
 747     fret += (efit-Energies[iDigit])*(efit-Energies[iDigit])/Energies[iDigit] ;
 748     // Here we assume, that sigma = sqrt(E)
 749   }
 750 }
 751 //____________________________________________________________________________
 752 void AliEMCALClusterizerv1::Print(Option_t * /*option*/)const
 753 {
 754   // Print clusterizer parameters
 755
 756   TString message("\n") ;
 757
 758   if( strcmp(GetName(), "") !=0 ){
 759
 760     // Print parameters
 761
 762     TString taskName(Version()) ;
 763
 764     printf("--------------- ");
 765     printf(taskName.Data()) ;
 766     printf(" ");
 767     printf("Clusterizing digits: ");
 768     printf("\n                       ECA Local Maximum cut    = %f", fECALocMaxCut);
 769     printf("\n                       ECA Logarithmic weight   = %f", fECAW0);
 770     if(fToUnfold)
 771       printf("\nUnfolding on\n");
 772     else
 773       printf("\nUnfolding off\n");
 774
 775     printf("------------------------------------------------------------------");
 776   }
 777   else
 778     printf("AliEMCALClusterizerv1 not initialized ") ;
 779 }
 780
 781 //____________________________________________________________________________
 782 void AliEMCALClusterizerv1::PrintRecPoints(Option_t * option)
 783 {
 784   // Prints list of RecPoints produced at the current pass of AliEMCALClusterizer
 785   if(strstr(option,"deb")) {
 786     printf("PrintRecPoints: Clusterization result:") ;
 787
 788     printf("           Found %d ECA Rec Points\n ",
 789          fRecPoints->GetEntriesFast()) ;
 790   }
 791
 792   if(strstr(option,"all")) {
 793     if(strstr(option,"deb")) {
 794       printf("\n-----------------------------------------------------------------------\n") ;
 795       printf("Clusters in ECAL section\n") ;
 796       printf("Index    Ene(GeV) Multi Module     GX    GY   GZ  lX    lY   lZ   Dispersion Lambda 1   Lambda 2  # of prim  Primaries list\n") ;
 797     }
 798    Int_t index =0;
 799
 800     for (index = 0 ; index < fRecPoints->GetEntries() ; index++) {
 801       AliEMCALRecPoint * rp = dynamic_cast<AliEMCALRecPoint * >(fRecPoints->At(index)) ;
 802       TVector3  globalpos;
 803       //rp->GetGlobalPosition(globalpos);
 804       TVector3  localpos;
 805       rp->GetLocalPosition(localpos);
 806       Float_t lambda[2];
 807       rp->GetElipsAxis(lambda);
 808       Int_t * primaries;
 809       Int_t nprimaries;
 810       primaries = rp->GetPrimaries(nprimaries);
 811       if(strstr(option,"deb"))
 812       printf("\n%6d  %8.4f  %3d     %4.1f    %4.1f %4.1f  %4.1f %4.1f %4.1f    %4.1f   %4f  %4f    %2d     : ",
 813              rp->GetIndexInList(), rp->GetEnergy(), rp->GetMultiplicity(),
 814              globalpos.X(), globalpos.Y(), globalpos.Z(), localpos.X(), localpos.Y(), localpos.Z(),
 815              rp->GetDispersion(), lambda[0], lambda[1], nprimaries) ;
 816       if(strstr(option,"deb")){
 817         for (Int_t iprimary=0; iprimary<nprimaries; iprimary++) {
 818           printf("%d ", primaries[iprimary] ) ;
 819         }
 820       }
 821     }
 822
 823     if(strstr(option,"deb"))
 824     printf("\n-----------------------------------------------------------------------\n");
 825   }
 826 }
 827
 828 //___________________________________________________________________
 829 void  AliEMCALClusterizerv1::PrintRecoInfo()
 830 {
 831   printf(" AliEMCALClusterizerv1::PrintRecoInfo() : version %s \n", Version() );
 832
 833 }