EMCAL/AliEMCALHistoUtilities.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-2002, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18 //_________________________________________________________________________
  19 // This is a set of histogram
  20 // utilities for the EMCAL
  21 // to make some common
  22 // functions easier
  23 //
  24 //*-- Authors: J.L. Klay (LLNL) & Aleksei Pavlinov (WSU)
  25
  26 #include "AliEMCALHistoUtilities.h"
  27
  28 #include <iostream>
  29 #include <iomanip>
  30 #include <fstream>
  31
  32 #include <TROOT.h>
  33 #include <TPad.h>
  34 #include <TFile.h>
  35 #include <TH1.h>
  36 #include <TH2.h>
  37 #include <TF1.h>
  38 #include <TGraph.h>
  39 #include <TGraphErrors.h>
  40 #include <TLatex.h>
  41 #include <TChain.h>
  42 #include <TList.h>
  43 #include <TObjArray.h>
  44 #include <TObjString.h>
  45 #include <TRegexp.h>
  46 #include <TString.h>
  47 #include <TLorentzVector.h>
  48 #include <Gtypes.h> // color, line style and so on
  49 #include <TArrayF.h>
  50
  51 #include "AliESDCaloCluster.h"
  52 #include "AliEMCALRecPoint.h"
  53 #include "AliRunLoader.h"
  54 #include "AliHeader.h"
  55 #include "AliGenEventHeader.h"
  56 #include "AliGenPythiaEventHeader.h"
  57
  58 using namespace std;
  59
  60 ClassImp(AliEMCALHistoUtilities)
  61
  62 AliEMCALHistoUtilities::AliEMCALHistoUtilities(const char *name, const char *tit) : TNamed(name,tit)
  63 {
  64   // constructor
  65 }
  66
  67 AliEMCALHistoUtilities::~AliEMCALHistoUtilities()
  68 {
  69         //destructor
  70 }
  71
  72 TList* AliEMCALHistoUtilities::MoveHistsToList(const char* name, Bool_t putToBrowser)
  73 {
  74   // Move HIST to list
  75   gROOT->cd();
  76   TIter nextHist(gDirectory->GetList());
  77   TList *list = new TList;
  78   list->SetName(name);
  79   TObject *objHist;
  80   while((objHist=nextHist())){
  81     if (!objHist->InheritsFrom("TH1")) continue;
  82     ((TH1*)objHist)->SetDirectory(0); // Remove from gROOT
  83     list->Add(objHist);
  84     gDirectory->GetList()->Remove(objHist);
  85   }
  86   if(putToBrowser) gROOT->GetListOfBrowsables()->Add((TObject*)list);
  87   return list;
  88 }
  89
  90 void AliEMCALHistoUtilities::FillH1(TList *l, Int_t ind, Double_t x, Double_t w)
  91 {
  92   //fill 1d histogram
  93   static TH1* hid=0;
  94   if(l == 0) return;
  95   if(ind>=0 && ind < l->GetSize()){
  96     hid = (TH1*)l->At(ind);
  97     hid->Fill(x,w);
  98   }
  99 }
 100
 101 void AliEMCALHistoUtilities::FillH2(TList *l, Int_t ind, Double_t x, Double_t y, Double_t w)
 102 {
 103   //fill 2d histogram
 104   static TH2* hid=0;
 105   if(l == 0) return;
 106   if(ind>=0 && ind < l->GetSize()){
 107     hid = (TH2*)l->At(ind);
 108     hid->Fill(x,y,w);
 109   }
 110 }
 111
 112 int AliEMCALHistoUtilities::SaveListOfHists(TList *mylist,const char* name,Bool_t kSingleKey,const char* opt)
 113 {
 114   //write histograms to file
 115   printf(" Name of out file |%s|\n", name);
 116   int save = 0;
 117   if(mylist && mylist->GetSize() && strlen(name)){
 118     TString nf(name);
 119     if(nf.Contains(".root") == kFALSE) nf += ".root";
 120     TFile file(nf.Data(),opt);
 121     TIter nextHist(mylist);
 122     TObject* objHist=0;
 123     int nh=0;
 124     if(kSingleKey) {
 125        file.cd();
 126        mylist->Write(mylist->GetName(),TObject::kSingleKey);
 127        mylist->ls();
 128        save = 1;
 129     } else {
 130       while((objHist=nextHist())) { // loop over list
 131         if(objHist->InheritsFrom("TH1")) {
 132           TH1* hid = (TH1*)objHist;
 133           file.cd();
 134           hid->Write();
 135           nh++;
 136           printf("Save hist. %s \n",hid ->GetName());
 137         }
 138       }
 139       printf("%i hists. save to file -> %s\n", nh,file.GetName());
 140       if(nh>0) save = 1;
 141     }
 142     file.Close();
 143   } else {
 144     printf("AliEMCALHistoUtilities::SaveListOfHists : N O  S A V I N G \n");
 145   }
 146   return save;
 147 }
 148
 149 void AliEMCALHistoUtilities::AddToNameAndTitle(TH1 *h, const char *name, const char *title)
 150 {
 151   // Oct 15, 2007
 152   if(h==0) return;
 153   if(name  && strlen(name))  h->SetName(Form("%s%s",h->GetName(),name));
 154   if(title && strlen(title)) h->SetTitle(Form("%s%s",h->GetTitle(),title));
 155 }
 156
 157 void AliEMCALHistoUtilities::AddToNameAndTitleToList(TList *l, const char *name, const char *title)
 158 {
 159   // Oct 15, 2007
 160   if(l==0) return;
 161   if(name || title) {
 162     for(int i=0; i<l->GetSize(); i++) {
 163       TObject *o = l->At(i);
 164       if(o->InheritsFrom("TH1")) {
 165         TH1 *h = (TH1*)o;
 166         AddToNameAndTitle(h, name, title);
 167       }
 168     }
 169   }
 170 }
 171
 172 void AliEMCALHistoUtilities::ResetListOfHists(TList *l)
 173 {
 174   // Oct 15, 2007
 175   if(l==0) return;
 176   for(int i=0; i<l->GetSize(); i++) {
 177     TH1F* h = (TH1F*)l->At(i);
 178     h->Reset();
 179   }
 180 }
 181
 182 TLatex *AliEMCALHistoUtilities::Lat(const char *text, Float_t x,Float_t y, Int_t align, Float_t tsize, short tcolor)
 183 {
 184   // Oct 15, 2007
 185   double y1=y;
 186   TLatex *latex = new TLatex;
 187   latex->SetTextAlign(align);
 188   latex->SetTextSize(tsize);
 189   latex->SetTextColor(tcolor);
 190   latex->DrawLatex(x, y1, text);
 191   printf("<I> AliEMCALHistoUtilities::lat() -> %s gPad->GetLogy() %i\n",
 192   text, gPad->GetLogy());
 193   return latex;
 194 }
 195
 196 TGraph *AliEMCALHistoUtilities::DrawGraph(Int_t n, Double_t *x, Double_t *y, Int_t markerColor,
 197 Int_t markerStyle, const char* opt, const char* tit, const char* xTit,const char* yTit, Int_t ifun,
 198 const char *optFit, const char *fun)
 199 {
 200   /* Drawing options
 201   chopt='L' :  A simple polyline between every points is drawn
 202   chopt='F' :  A fill area is drawn ('CF' draw a smooth fill area)
 203   chopt='A' :  Axis are drawn around the graph
 204   chopt='C' :  A smooth Curve is drawn
 205   chopt='*' :  A Star is plotted at each point
 206   chopt='P' :  Idem with the current marker
 207   chopt='B' :  A Bar chart is drawn at each point
 208   chopt='1' :  ylow=rwymin
 209   chopt='X+' : The X-axis is drawn on the top side of the plot.
 210   chopt='Y+' : The Y-axis is drawn on the right side of the plot.
 211
 212     Fitting options
 213    The list of fit options is given in parameter option.
 214       option = "W"  Set all errors to 1
 215              = "U" Use a User specified fitting algorithm (via SetFCN)
 216              = "Q" Quiet mode (minimum printing)
 217              = "V" Verbose mode (default is between Q and V)
 218              = "B" Use this option when you want to fix one or more parameters
 219                    and the fitting function is like "gaus","expo","poln","landau".
 220              = "R" Use the Range specified in the function range
 221              = "N" Do not store the graphics function, do not draw
 222              = "0" Do not plot the result of the fit. By default the fitted function
 223                    is drawn unless the option"N" above is specified.
 224              = "+" Add this new fitted function to the list of fitted functions
 225                    (by default, any previous function is deleted)
 226              = "C" In case of linear fitting, not calculate the chisquare
 227                     (saves time)
 228              = "F" If fitting a polN, switch to minuit fitter
 229              = "ROB" In case of linear fitting, compute the LTS regression
 230                      coefficients (robust(resistant) regression), using
 231                      the default fraction of good points
 232                "ROB=0.x" - compute the LTS regression coefficients, using
 233                            0.x as a fraction of good points
 234
 235   */
 236   printf("AliEMCALHistoUtilities::drawGraph started \n");
 237   printf("Drawing opt |%s| : Fitting opt |%s|\n", opt, optFit);
 238
 239     TGraph *gr = new TGraph(n, x, y);
 240     gr->SetMarkerColor(markerColor);
 241     gr->SetLineColor(markerColor);
 242     gr->SetMarkerStyle(markerStyle);
 243     gr->SetTitle(tit);
 244     gr->Draw(opt);
 245
 246     TString ctmp(opt);
 247     if(ctmp.Contains("A")) {
 248        gr->GetHistogram()->SetXTitle(xTit);
 249        gr->GetHistogram()->SetYTitle(yTit);
 250     }
 251     ctmp = optFit;
 252     if(ifun>=0) {
 253       TString sf("pol"); sf += ifun;
 254       gr->Fit(sf.Data(),optFit);
 255       printf("\n ** Fit by Polynomial of degree %i : %s **\n", ifun, sf.Data());
 256     } else if(!ctmp.Contains("no",TString::kIgnoreCase)){
 257       printf("\n ** ifun %i : %s **\n", ifun, fun);
 258       gr->Fit(fun, optFit);
 259     }
 260
 261     return gr;
 262 }
 263
 264 TGraphErrors *AliEMCALHistoUtilities::DrawGraphErrors(const Int_t n,Double_t *x,Double_t *y,Double_t *ex,
 265 Double_t *ey, Int_t markerColor,  Int_t markerStyle, const char* opt, const char* tit,
 266 const char* xTit,const char* yTit, Int_t ifun, const char *optFit, const char *fun)
 267 {
 268   // Oct 15, 2007
 269   printf("AliEMCALHistoUtilities::drawGraphErrors started \n");
 270   printf("Drawing opt |%s| : ifun %i: Fitting opt |%s|, fun |%s|\n",
 271          opt, ifun, optFit, fun);
 272
 273   TGraphErrors *gr = new TGraphErrors(n, x,y,ex,ey);
 274   gr->SetMarkerColor(markerColor);
 275   gr->SetLineColor(markerColor);
 276   gr->SetMarkerStyle(markerStyle);
 277   if(tit&&strlen(tit)>0) gr->SetTitle(tit);
 278
 279   TString ctmp(opt);
 280   if(ctmp.Contains("A")) {
 281      gr->GetHistogram()->SetXTitle(xTit);
 282      gr->GetHistogram()->SetYTitle(yTit);
 283   }
 284   if(ifun>0) {
 285     if(ifun != 999) {
 286       TString sf("pol"); sf += ifun;
 287       gr->Fit(sf.Data(),optFit);
 288       printf("\n ** Fit by Polynomial of degree %i : %s **\n", ifun, sf.Data());
 289     } else {
 290       gr->Fit(fun, optFit);
 291       printf("\n ** Fit by %s **\n", fun);
 292     }
 293   } else {
 294     if(strlen(optFit)) {
 295       printf("\n ** ifun %i : %s **\n", ifun, fun);
 296       gr->Fit(fun, optFit);
 297     }
 298   }
 299
 300   gr->Draw(opt);
 301
 302   return gr;
 303 }
 304
 305 TF1* AliEMCALHistoUtilities::GetResolutionFunction(const char *opt, TString &latexName)
 306 {
 307   // Oct 15, 2007
 308   TString sopt(opt);
 309   sopt.ToUpper();
 310   TF1 *fres=0;
 311   if      (sopt.Contains("FRES1")) {
 312     fres = new TF1("fres","[0]+[1]/sqrt(x)", 0.0, 101.);
 313     latexName = "#frac{#sigma_{E}}{E} = A+#frac{B}{#sqrt{E}}";
 314   } else if(sopt.Contains("FRES2")) {
 315     fres = new TF1("fres","sqrt([0]*[0]+[1]*[1]/x)", 0.0, 101.);
 316     latexName = "#sqrt{A^{2}+#frac{B^{2}}{E}}";
 317   }
 318   if(fres) {
 319     fres->SetParName(0,"A");
 320     fres->SetParName(1,"B");
 321
 322     fres->SetParameter(0, 2.0);
 323     fres->SetParameter(1, 6.6);
 324     fres->SetLineWidth(2);
 325     fres->SetLineColor(kRed);
 326   }
 327   return fres;
 328 }
 329
 330 void AliEMCALHistoUtilities::InitChain(TChain *chain, const char* nameListOfFiles, Int_t nFileMax)
 331 {
 332   // Read name of files from text file with nameListOfFiles and added to the chain
 333   if(chain==0 || nameListOfFiles==0) return;
 334
 335   ifstream fin;
 336   fin.open(nameListOfFiles);
 337   if (!fin.is_open()) {
 338     cout << "Input file "<<nameListOfFiles<<" cannot be opened.\n";
 339     return;
 340   }
 341
 342   Int_t nfiles = 0; // number of files in chain
 343   char nf[200];     // name of current file
 344   while (!fin.getline(nf,200).eof()) {
 345     if(!fin.good()) break;
 346     chain->Add(nf);
 347     nfiles++;
 348     cout<<nfiles<<" "<<nf<<endl;
 349     if(nFileMax && nfiles>=nFileMax) break;
 350   }
 351   fin.close();
 352   //
 353   cout << " \n ********** <I> Accepted file "<< nfiles << "********* \n"<<endl;
 354   //  chainEsd->Print();
 355   //  chain->Lookup();
 356 }
 357
 358 AliRunLoader* AliEMCALHistoUtilities::InitKinematics(const Int_t nev, const char* galiceName)
 359 {
 360   // Oct 15, 2007
 361   // nev == 0 - new file
 362   static AliRunLoader *rl = 0;
 363
 364   if((rl == 0 || nev==0) && galiceName) {
 365     //printf("<I> AliEMCALHistoUtilities::InitKinematics() : nev %i : rl %p : %s (IN)\n",
 366         // nev, rl, galiceName);
 367     if(rl)  {
 368       rl->UnloadgAlice();
 369       delete rl;
 370     }
 371     rl = AliRunLoader::Open(galiceName,AliConfig::GetDefaultEventFolderName(),"read");
 372     rl->LoadgAlice(); // obligatory
 373     //printf("<I> AliEMCALHistoUtilities::InitKinematics() : nev %i : rl %p : %s (OUT)\n",
 374          //nev, rl, galiceName);
 375   }
 376   if(rl) {
 377     rl->GetEvent(nev);
 378     rl->LoadKinematics();
 379     /* Get what you need after that
 380       rl->LoadHits();
 381       AliStack *stack=rl->Stack();
 382       AliESDCaloCluster * clus = esd->GetCaloCluster(n);
 383       Int_t label = clus->GetLabel(); // what is this
 384       TParticle *primary=stack->Particle(label);
 385     */
 386   }
 387   return rl;
 388 }
 389
 390 AliRunLoader* AliEMCALHistoUtilities::GetRunLoader(const Int_t nev, const Char_t* galiceName,
 391                                        const Char_t* eventFolderName, AliRunLoader* rlOld)
 392 {
 393   // Nov 26, 2007
 394   // nev == 0 - new file
 395   AliRunLoader *rl = 0;
 396
 397   if(nev==0 && galiceName) {
 398     printf("<I> AliEMCALHistoUtilities::GetLoader() : nev %i : %s (IN)\n",
 399            nev, galiceName);
 400     if(rlOld) {
 401       rlOld->UnloadgAlice();
 402       delete rlOld;
 403     }
 404     TString folderName(eventFolderName);
 405     if(folderName.Length() == 0) folderName = AliConfig::GetDefaultEventFolderName();
 406     rl = AliRunLoader::Open(galiceName, folderName.Data(),"read");
 407     rl->LoadgAlice(); // obligatory
 408     printf("<I> AliEMCALHistoUtilities::GetLoader() : nev %i : %s : %s (OUT)\n",
 409            nev, galiceName, folderName.Data());
 410   } else {
 411     rl = rlOld;
 412   }
 413   if(rl) rl->LoadgAlice(); // obligatory
 414   // if(rl) rl->GetEvent(nev);
 415   return rl;
 416 }
 417
 418 Double_t AliEMCALHistoUtilities::GetMomentum(const char* nameListOfFiles)
 419 {
 420   // Get momentum value from string  - like /....100GEV/..
 421   Double_t p=-1; // negative if undefined
 422   TString st(nameListOfFiles);
 423   if(st.Length()>=5) {
 424     st.ToUpper();
 425     Ssiz_t ind1 = st.Index("GEV"), ind2=0;
 426     if(ind1>0) {
 427       for(Int_t i=2; i<=10; i++) {
 428         ind2 = st.Index("/",ind1-i);
 429         if(ind2>0 && ind2<ind1) break;
 430       }
 431       TString mom  = st(ind2+1, ind1-ind2-1);
 432       if(mom.IsFloat()) p = mom.Atof();
 433       printf(" dir |%s| : mom |%s| : p %f : ind2,1 %i->%i\n", st.Data(), mom.Data(), p, ind2, ind1);
 434     }
 435   }
 436   return p;
 437 }
 438
 439 int AliEMCALHistoUtilities::ParseString(const TString &topt, TObjArray &Opt)
 440 {
 441   // Moved from AliEMCALGeometry
 442   // Feb 06, 2006
 443   Ssiz_t begin, index, end, end2;
 444   begin = index = end = end2 = 0;
 445   TRegexp separator("[^ ;,\\t\\s/]+");
 446   while ( (begin < topt.Length()) && (index != kNPOS) ) {
 447     // loop over given options
 448     index = topt.Index(separator,&end,begin);
 449     if (index >= 0 && end >= 1) {
 450       TString substring(topt(index,end));
 451       Opt.Add(new TObjString(substring.Data()));
 452     }
 453     begin += end+1;
 454   }
 455   return Opt.GetEntries();
 456 }
 457
 458 // Analysis utilites
 459 Bool_t AliEMCALHistoUtilities::GetLorentzVectorFromESDCluster(TLorentzVector &v, const AliESDCaloCluster* cl)
 460 {
 461   // May 8, 2007
 462   static Double_t e=0.0;
 463   static Float_t pos[3];
 464   static TVector3 gpos;
 465   if(cl==0) return kFALSE;
 466
 467   e = Double_t(cl->E());
 468   if(e<=0.0) {
 469     printf(" negative cluster energy : %f \n", e);
 470     return kFALSE;
 471   }
 472   cl->GetPosition(pos);
 473   gpos.SetXYZ(Double_t(pos[0]), Double_t(pos[1]), Double_t(pos[2]));
 474   gpos.SetMag(e);
 475   v.SetVectM(gpos, 0.0);
 476
 477   return kTRUE;
 478 }
 479
 480 Bool_t AliEMCALHistoUtilities::GetLorentzVectorFromRecPoint(TLorentzVector &v, const AliEMCALRecPoint  *rp)
 481 {
 482   // Jun 20, 2007
 483   static Double_t e=0.0;
 484   static TVector3 gpos;
 485   if(rp==0) return kFALSE;
 486
 487   e = Double_t(rp->GetPointEnergy());
 488   if(e<=0.0) {
 489     printf(" negative rec.point energy : %f \n", e);
 490     return kFALSE;
 491   }
 492   rp->GetGlobalPosition(gpos);
 493   gpos.SetMag(e);
 494   v.SetVectM(gpos, 0.0);
 495
 496   return kTRUE;
 497 }
 498 //
 499 //// Drawing:
 500 //
 501 void AliEMCALHistoUtilities::DrawHist(TH1* hid,int lineWidth,int lineColor,const char* opt, int lineStyle)
 502 {
 503   // Oct 15, 2007
 504   TString sopt;
 505   sopt = opt;
 506   if(!hid) return;
 507   printf(" Hist. %s : option |%s| \n", hid->GetName(), opt);
 508   if(hid && hid->GetEntries()>=1.) {
 509     if(lineWidth) hid->SetLineWidth(lineWidth);
 510     if(lineColor) hid->SetLineColor(lineColor);
 511     if(lineStyle) hid->SetLineStyle(lineStyle);
 512     if(sopt.Contains("stat",TString::kIgnoreCase)) hid->SetStats(kTRUE);
 513     hid->Draw(opt);
 514   } else {
 515     if   (strcmp(opt,"empty")==0) hid->Draw();
 516     else printf(" has fewer entries %i or hid is zero\n", (int) hid->GetEntries());
 517   }
 518 }
 519
 520 //
 521 //// Fitting:
 522 //
 523 TF1* AliEMCALHistoUtilities::Gausi(const char *addName,double xmi,double xma,double N,double mean,double sig,double width)
 524 {
 525   // Fit by gaus where first parameter is the number of events under ga
 526   // Oct 15, 2007
 527   TString name("gi");
 528   name += addName;
 529   TF1 *f = new TF1(name.Data(), Gi, xmi, xma, 4);
 530   f->SetParNames("INTEGRAL","MEAN","SIGMA","WIDTH");
 531
 532   f->SetParameter(0,N);
 533   f->SetParameter(1,mean);
 534   f->SetParameter(2,sig);
 535
 536   f->FixParameter(3,width); // width of histogramm bin
 537   return f;
 538 }
 539
 540 TF1* AliEMCALHistoUtilities::Gausi(const char *addName, double xmi, double xma, TH1 *h)
 541 {
 542   // You can change parameters after that if you don't like this assumption
 543   if(h) return Gausi(addName, xmi, xma, h->Integral(), h->GetMean(),h->GetRMS(), h->GetBinWidth(1));
 544   else  return 0;
 545 }
 546
 547 TF1* AliEMCALHistoUtilities::GausiPol2(const char *addName,double xmi,double xma, TF1 *g, TF1* bg)
 548 {
 549   // Fit by gaus where first parameter is the number of events under ga
 550   TString name("giPol2");
 551   name += addName;
 552   TF1 *f = new TF1(name.Data(), GiPol2, xmi, xma, 7);
 553   f->SetParNames("INTEGRAL","MEAN","SIGMA","WIDTH","a0","a1","a2");
 554
 555   if(g) {
 556     for(int i=0; i<4; i++) f->SetParameter(i, g->GetParameter(i));
 557     f->FixParameter(3,g->GetParameter(3));
 558   }
 559
 560   if(bg) {
 561     for(int i=4; i<7; i++) f->SetParameter(i, bg->GetParameter(i+4));
 562   }
 563   f->SetLineColor(kRed);
 564   return f;
 565 }
 566
 567 Double_t AliEMCALHistoUtilities::Gi(Double_t *x, Double_t *par)
 568 {
 569   // First parameter is integral (number events under gaus)
 570   // Forth parameter (par[3]) is width of histogram bin
 571   // gaus(0) is a substitute for [0]*exp(-0.5*((x-[1])/[2])**2)
 572
 573   static Double_t c = TMath::Sqrt(2.*TMath::Pi()), y=0.0, f=0.0; // sqrt(2.*pi)
 574
 575   y  = (x[0]-par[1])/par[2];
 576   f  = par[0]*par[3]/(par[2]*c) * TMath::Exp(-0.5*y*y);
 577
 578   return f;
 579 }
 580
 581 Double_t AliEMCALHistoUtilities::GiPol2(Double_t *x, Double_t *par)
 582 {
 583   // First parameter is integral (number events under gaus)
 584   // Forth parameter (par[3]) is width of histogram bin
 585   // gaus(0) is a substitute for [0]*exp(-0.5*((x-[1])/[2])**2)
 586   // + pol2 -> 7 parameters
 587   static Double_t c = TMath::Sqrt(2.*TMath::Pi()), y=0.0, f=0.0; // sqrt(2.*pi)
 588
 589   y  = (x[0]-par[1])/par[2];
 590   f  = par[0]*par[3]/(par[2]*c) * TMath::Exp(-0.5*y*y);
 591
 592   f += par[4] + par[5]*x[0] + par[6]*x[0]*x[0];
 593
 594   return f;
 595 }
 596
 597 // Calibration stuff
 598 Double_t AliEMCALHistoUtilities::GetCorrectionCoefficientForGamma1(const Double_t eRec)
 599 {
 600   // Correction to rec.energy - Jul 15, 2007
 601   // E(gamma) = corr * E(eRec);
 602   /* corr = p0*(eRec-7.5)+p1*(eRec-7.5)*(eRec-7.5)+p2; 0.0<eRec<10.0
 603    1  p0           6.07157e-05   1.15179e-04  -0.00000e+00   1.20997e-03
 604    2  p1           1.50019e-04   3.13566e-05  -0.00000e+00   1.22531e-02
 605    3  p2           9.99019e-01   4.08251e-04  -0.00000e+00   1.40606e-03
 606
 607      corr = p3 + p4*eRec + p5*eRec*eRec
 608    1  p3           9.97135e-01   5.31970e-04   1.37962e-09   1.68120e-08
 609    2  p4           3.15740e-04   2.53371e-05   1.11475e-11   1.74192e-04
 610    3  p5          -1.35383e-06   2.19495e-07  -5.82864e-13   4.52277e-02
 611   */
 612   static Double_t p0=6.07157e-05, p1=1.50019e-04, p2=9.99019e-01;
 613   static Double_t p3=9.97135e-01, p4=3.15740e-04, p5=-1.35383e-06;
 614   static Double_t corr=1.0;
 615   if(eRec>=0.0 && eRec <=10.0) {
 616     corr = p0*(eRec-7.5) + p1*(eRec-7.5)*(eRec-7.5) + p2;
 617   } else if(eRec>10.0 && eRec <=105.0) {
 618     corr = p3 + p4*eRec + p5*eRec*eRec;
 619   }
 620   //printf(" eRec %f | corr %f \n", eRec, corr);
 621   return corr;
 622 }
 623
 624 Double_t AliEMCALHistoUtilities::GetCorrectedEnergyForGamma1(const Double_t eRec)
 625 {
 626   return GetCorrectionCoefficientForGamma1(eRec) * eRec;
 627 }
 628
 629 // Trigger
 630 TList* AliEMCALHistoUtilities::GetTriggersListOfHists(const Int_t scale, const Int_t nTrig, const Bool_t toBrowser)
 631 {
 632   // Oct 22, 2007 - trigger technical assurance
 633   gROOT->cd();
 634   TH1::AddDirectory(1);
 635
 636   new TH1F("00_hXpos2x2", "X coord. of max Amp 2x2",100, -500., +500.);
 637   new TH1F("01_hYpos2x2", "Y coord. of max Amp 2x2",100, -500., +500.);
 638   new TH1F("02_hZpos2x2", "Z coord. of max Amp 2x2",100, -500., +500.);
 639   new TH1F("03_hXposnxn", "X coord. of max Amp NXN",100, -500., +500.);
 640   new TH1F("04_hYposnxn", "Y coord. of max Amp NXN",100, -500., +500.);
 641   new TH1F("05_hZposnxn", "Z coord. of max Amp NXN",100, -500., +500.);
 642   // May 7, 2008 - jet trigger
 643   new TH1F("06_hJetTriggerPhi", "%phi of COG of jet trigger patch", 110, 80., 190.);
 644   new TH1F("07_hJetTriggerEta", "%eta of COG of jet trigger patch", 70, -0.7, +0.7);
 645   //
 646   new TH1F("08_hMaxAmp2x2", "max Amp 2x2", 1000, 0.0, pow(2.,14.));
 647   new TH1F("09_hAmpOutOf2x2", "Amp out of patch 2x2", 1000, 0.0, pow(2.,14.));
 648   new TH1F("10_hMaxAmpnxn", "max Amp NXN", 1000, 0.0, pow(2.,14.));
 649   new TH1F("11_hAmpOutOfnxn", "Amp out of patch nxn", 1000, 0.0, pow(2.,14.));
 650   // May 7, 2008 - jet trigger
 651   for(Int_t i=0; i<nTrig; i++) {
 652     new TH1F(Form("%2.2i_hJetPatchAmp%2.2i",i+12,i), Form("jet patch amplitude : jet trig %i",i),
 653     1000, 0.0, pow(2.,14.));
 654   }
 655   // For checking
 656   Double_t maxEdigit=100., maxN=1000., maxPC = 200.;
 657   if(scale==1) {
 658     maxN  *= 10.;
 659     maxPC *= 10.;
 660   }
 661   Int_t ind = 12+nTrig;
 662   new TH1F(Form("%2.2i_hDigitsAmp",ind++), "amplitude of digits (PC)  ", 1001, -0.5, 1000.5);
 663   new TH1F(Form("%2.2i_hDigitsE",ind++), " energy of digits (PC)", 1000, 0.0, maxEdigit);
 664   new TH1F(Form("%2.2i_hNDigitsInPCs",ind++), " number of digits in PC's", 1000, 0.0, maxN);
 665   new TH1F(Form("%2.2i_hEinInPCs",ind++), " energy in PC's", 200, 0.0, maxPC);
 666
 667   return MoveHistsToList("TriggerLiOfHists", toBrowser);
 668 }
 669
 670 void AliEMCALHistoUtilities::FillTriggersListOfHists(TList *l, TArrayF *triggerPosition, TArrayF *triggerAmplitudes)
 671 {
 672   // Oct 22, 2007 - trigger technical assurance
 673   if(l==0) {
 674     printf("<E> FillTriggersListOfHists() : list of hists undefined. \n");
 675     return;
 676   }
 677   for(int i=0; i<triggerPosition->GetSize(); i++) {
 678     FillH1(l, i, double(triggerPosition->At(i)));
 679   }
 680
 681   for(int i=0; i<triggerAmplitudes->GetSize(); i++) {
 682     FillH1(l, triggerPosition->GetSize() + i, double(triggerAmplitudes->At(i)) );
 683   }
 684 }
 685
 686 // Jet(s) kinematics
 687 TList* AliEMCALHistoUtilities::GetJetsListOfHists(Int_t njet, Bool_t toBrowser)
 688 {
 689   // Oct 30, 2007
 690   gROOT->cd();
 691   TH1::AddDirectory(1);
 692   new TH1F("00_nJet", "number of jets in Pythia",5, -0.5, +4.5);
 693   int ic=1;
 694   for(Int_t ij=0; ij<njet; ij++)
 695   {
 696     new TH1F(Form("%2.2i_EtaOfJet%i",ic++,ij), Form("#eta of jet (%i)",ij),80, -2., 2.);
 697     new TH1F(Form("%2.2i_ThetaOfJet%i",ic++,ij), Form("#theta(degree) of jet (%i)",ij),
 698     180, 0.0, 180.);
 699     new TH1F(Form("%2.2i_PhiOfJet%i",ic++,ij), Form("#phi(degree) of jet (%i)",ij),
 700     180, 0.0, 360.);
 701     new TH1F(Form("%2.2i_PtOfJet%i",ic++,ij), Form(" p_{T} of jet (%i)",ij),
 702     200, 0.0, 200.);
 703     new TH1F(Form("%2.2i_EOfJet%i",ic++,ij), Form(" E of jet (%i)",ij),
 704     200, 0.0, 200.);
 705   }
 706
 707   return MoveHistsToList("JetLiOfHists", toBrowser);
 708 }
 709
 710 void  AliEMCALHistoUtilities::FillJetKineListOfHists(TList *l, AliRunLoader* rl, TLorentzVector &goodJet)
 711 {
 712   // Oct 30, 2007; Nov 07;
 713   // goodJet - output; only one jet with EMCAL acceptance
 714
 715   // Bad case
 716   goodJet.SetPxPyPzE(0., 0., 0., 0.);
 717
 718   if(l==0 || rl==0) return;
 719   //try to get trigger jet info
 720   AliHeader* alih = rl->GetHeader();
 721   if (alih == 0) return;
 722
 723   AliGenEventHeader * genh = alih->GenEventHeader();
 724   if (genh == 0) return;
 725
 726   AliGenPythiaEventHeader* genhpy = dynamic_cast<AliGenPythiaEventHeader *>(genh);
 727   if(genhpy==0) return; // Not Pythia
 728
 729   Int_t nj = genhpy->NTriggerJets();
 730   FillH1(l, 0, double(nj));
 731
 732   TLorentzVector* jets[4];
 733   nj = nj>4?4:nj;
 734
 735   int ic=1;
 736   for (Int_t i=0; i< nj; i++) {
 737      Float_t p[4];
 738      genhpy->TriggerJet(i,p);
 739      jets[i] = new TLorentzVector(p);
 740      FillH1(l, ic++, jets[i]->Eta());
 741      FillH1(l, ic++, jets[i]->Theta()*TMath::RadToDeg());
 742      FillH1(l, ic++, TVector2::Phi_0_2pi(jets[i]->Phi())*TMath::RadToDeg());
 743      FillH1(l, ic++, jets[i]->Pt());
 744      FillH1(l, ic++, jets[i]->E());
 745
 746      //printf(" %i pj %f %f %f %f : ic %i\n", i, p[0], p[1], p[2], p[3], ic);
 747      if(ic >= l->GetSize()) break;
 748   }
 749   if(nj==1) {
 750     Double_t eta=jets[0]->Eta(), phi=TVector2::Phi_0_2pi(jets[0]->Phi())*TMath::RadToDeg();
 751     if(TMath::Abs(eta)<0.5 && (phi>90.&&phi<180.)) {
 752       goodJet = (*jets[0]);
 753     }
 754   }
 755 }