]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blob - EMCAL/AliEMCALHistoUtilities.cxx
adding separate primary vertex and V0 finder components (Timur)
[u/mrichter/AliRoot.git] / EMCAL / AliEMCALHistoUtilities.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-2002, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16 /* $Id$ */
17
18 //_________________________________________________________________________
19 // This is a set of histogram
20 // utilities for the EMCAL
21 // to make some common
22 // functions easier
23 //
24 //*-- Authors: J.L. Klay (LLNL) & Aleksei Pavlinov (WSU) 
25
26 #include "AliEMCALHistoUtilities.h"
27
28 #include <iostream>
29 #include <iomanip>
30 #include <fstream>
31
32 #include <TROOT.h>
33 #include <TPad.h>
34 #include <TFile.h>
35 #include <TH1.h>
36 #include <TH2.h>
37 #include <THnSparse.h>
38 #include <TF1.h>
39 #include <TGraph.h>
40 #include <TGraphErrors.h>
41 #include <TLatex.h>
42 #include <TChain.h>
43 #include <TList.h>
44 #include <TObjArray.h>
45 #include <TObjString.h>
46 #include <TRegexp.h>
47 #include <TString.h>
48 #include <TLorentzVector.h>
49 #include <Gtypes.h> // color, line style and so on
50 #include <TArrayF.h>
51
52 //#include "AliESDCaloCluster.h"
53 //#include "AliEMCALRecPoint.h"
54 //#include "AliRunLoader.h"
55 #include "AliHeader.h"
56 #include "AliGenEventHeader.h"
57 #include "AliGenPythiaEventHeader.h"
58
59 using namespace std;
60
61 ClassImp(AliEMCALHistoUtilities)
62
63 AliEMCALHistoUtilities::AliEMCALHistoUtilities(const char *name, const char *tit) : TNamed(name,tit)
64 {
65   // constructor
66 }
67
68 AliEMCALHistoUtilities::~AliEMCALHistoUtilities()
69 {
70         //destructor
71 }  
72
73 TList* AliEMCALHistoUtilities::MoveHistsToList(const char* name, Bool_t putToBrowser, Bool_t setOwner)
74 {
75   // Move HIST to list
76   gROOT->cd();
77   TIter nextHist(gDirectory->GetList());
78   TList *list = new TList;
79   list->SetName(name);
80   if(setOwner) list->SetOwner(setOwner);
81   TObject *objHist;
82   while((objHist=nextHist())){
83     if (!objHist->InheritsFrom("TH1")) continue;
84     ((TH1*)objHist)->SetDirectory(0); // Remove from gROOT
85     list->Add(objHist);
86     gDirectory->GetList()->Remove(objHist);
87   }
88   if(putToBrowser) gROOT->GetListOfBrowsables()->Add((TObject*)list);
89   return list;
90 }
91
92 void AliEMCALHistoUtilities::FillH1(TList *l, Int_t ind, Double_t x, Double_t w, Double_t error)
93 {
94   //fill 1d histogram
95   static TH1* hid=0;
96   static int  bin=0;
97   if(l == 0) return;
98
99   if(ind>=0 && ind < l->GetSize()){
100     hid = (TH1*)l->At(ind);
101     if(error <= 0.0) { // standard way
102       hid->Fill(x,w);
103     } else{
104       bin = hid->FindBin(x);
105       hid->SetBinContent(bin,w);
106       hid->SetBinError(bin,error);
107     }
108   }
109 }
110
111 void AliEMCALHistoUtilities::FillH2(TList *l, Int_t ind, Double_t x, Double_t y, Double_t w)
112 {
113   //fill 2d histogram
114   static TH2* hid=0;
115   if(l == 0) return;
116   if(ind>=0 && ind < l->GetSize()){
117     hid = (TH2*)l->At(ind);
118     hid->Fill(x,y,w);
119   }
120 }
121
122 void AliEMCALHistoUtilities:: FillHnSparse(TList *l, Int_t ind, Double_t* x, Double_t w)
123 {
124   // Nov 02,2010: fill THnSparse hist
125   static THnSparse* hsp=0;
126   if(l==0 || x==0) return;
127   if(ind>=0 && ind < l->GetSize()){
128     hsp = dynamic_cast<THnSparse *>(l->At(ind));
129     if(hsp) hsp->Fill(x,w);
130   }
131 }
132
133 int AliEMCALHistoUtilities::SaveListOfHists(TList *mylist,const char* name,Bool_t kSingleKey,const char* opt)
134 {
135   //write histograms to file
136   printf(" Name of out file |%s|\n", name); 
137   int save = 0;
138   if(mylist && mylist->GetSize() && strlen(name)){
139     TString nf(name); 
140     if(nf.Contains(".root") == kFALSE) nf += ".root";
141     TFile file(nf.Data(),opt);
142     TIter nextHist(mylist);
143     TObject* objHist=0;
144     int nh=0;
145     if(kSingleKey) {
146        file.cd();
147        mylist->Write(mylist->GetName(),TObject::kSingleKey);
148        mylist->ls();
149        save = 1;
150     } else {
151       while((objHist=nextHist())) { // loop over list 
152         if(objHist->InheritsFrom("TH1")) {
153           TH1* hid = (TH1*)objHist;
154           file.cd();
155           hid->Write();
156           nh++;
157           printf("Save hist. %s \n",hid ->GetName());
158         }
159       }
160       printf("%i hists. save to file -> %s\n", nh,file.GetName());
161       if(nh>0) save = 1;
162     }
163     file.Close();
164   } else {
165     printf("AliEMCALHistoUtilities::SaveListOfHists : N O  S A V I N G \n");
166   }
167   return save;
168 }
169
170 void AliEMCALHistoUtilities::AddToNameAndTitle(TNamed *h, const char *name, const char *title)
171 {
172   // Oct 15, 2007
173   if(h==0) return;
174   if(name  && strlen(name))  h->SetName(Form("%s%s",h->GetName(),name));
175   if(title && strlen(title)) h->SetTitle(Form("%s%s",h->GetTitle(),title));
176 }
177
178 void AliEMCALHistoUtilities::AddToNameAndTitleToList(TList *l, const char *name, const char *title)
179 {
180   // Oct 15, 2007
181   if(l==0) return;
182   if(name || title) {
183     for(int i=0; i<l->GetSize(); i++) {
184       TObject *o = l->At(i);
185       if(o->InheritsFrom("TNamed")) {
186         TNamed *h = dynamic_cast<TNamed *>(o);
187         AddToNameAndTitle(h, name, title);
188       }
189     }
190   }
191 }
192
193 void AliEMCALHistoUtilities::ResetListOfHists(TList *l)
194 {
195   // Oct 15, 2007
196   if(l==0) return;
197   for(int i=0; i<l->GetSize(); i++) {
198     TH1F* h = (TH1F*)l->At(i);
199     h->Reset(); 
200   }
201 }
202
203 void AliEMCALHistoUtilities::Titles(TH1 *hid, const char *titx,const char *tity)
204 {
205   if(hid) {
206     hid->SetXTitle(titx);
207     hid->SetYTitle(tity);
208   } else {
209     printf("<W> TAliasPAI::titles() -> hid is 0 !\n");
210   }
211 }
212
213 TList* AliEMCALHistoUtilities::CreateProjectionsX(TList *l, const Int_t ind, const Char_t* name)
214 {
215   // Sep 4 - seperate list for projections
216   TH2F *hid = dynamic_cast<TH2F *>(l->At(ind));
217   if(hid == 0) {
218     printf("<E> Object at ind %i is %s : should ne TH2F \n",
219            ind, l->At(ind)->ClassName());
220     return 0;
221   }
222  
223   TList *lpt = new TList;
224   lpt->SetName(Form("%s%s", hid->GetName(), name));
225   l->Add(lpt);
226
227   TAxis*  yax   = hid->GetYaxis();
228   TString tity  = yax->GetTitle();
229   tity.ReplaceAll(" ","");
230   TString name1 = hid->GetName();
231   TString nam   = name1(3,name1.Length()-3);
232   TString tit1  = hid->GetTitle(), tit=tit1;
233
234   TH1::AddDirectory(0);
235
236   TH1D *hd = hid->ProjectionX(Form("00_%sProx",nam.Data()), 1, yax->GetNbins());
237   tit += Form(" : %5.2f < %s < %5.2f (GeV/c)", yax->GetXmin(),tity.Data(),yax->GetXmax());
238   hd->SetTitle(tit.Data());
239   lpt->Add(hd);
240
241   for(Int_t iy=1; iy<=yax->GetNbins(); iy++){
242     tit = tit1; 
243     tit += Form(" : %5.2f < %s  < %5.2f (GeV/c)", yax->GetBinLowEdge(iy), tity.Data(), yax->GetBinUpEdge(iy));
244     hd = hid->ProjectionX(Form("%2.2i_%sProx%i",iy, nam.Data(),iy),iy,iy);
245     hd->SetTitle(tit.Data());
246     lpt->Add(hd);    
247   }
248
249   return lpt;
250 }
251
252 TLatex *AliEMCALHistoUtilities::Lat(const char *text, Float_t x,Float_t y, Int_t align, Float_t tsize, short tcolor)
253
254   // Oct 15, 2007
255   double y1=y;
256   TLatex *latex = new TLatex;
257   latex->SetTextAlign(align);
258   latex->SetTextSize(tsize);
259   latex->SetTextColor(tcolor);
260   latex->DrawLatex(x, y1, text);
261   printf("<I> AliEMCALHistoUtilities::lat() -> %s gPad->GetLogy() %i\n", 
262   text, gPad->GetLogy());
263   return latex;
264 }
265
266 TGraph *AliEMCALHistoUtilities::DrawGraph(Int_t n, Double_t *x, Double_t *y, Int_t markerColor, 
267 Int_t markerStyle, const char* opt, const char* tit, const char* xTit,const char* yTit, Int_t ifun,  
268 const char *optFit, const char *fun)
269 {
270   /* Drawing options 
271   chopt='L' :  A simple polyline between every points is drawn
272   chopt='F' :  A fill area is drawn ('CF' draw a smooth fill area)
273   chopt='A' :  Axis are drawn around the graph
274   chopt='C' :  A smooth Curve is drawn
275   chopt='*' :  A Star is plotted at each point
276   chopt='P' :  Idem with the current marker
277   chopt='B' :  A Bar chart is drawn at each point
278   chopt='1' :  ylow=rwymin
279   chopt='X+' : The X-axis is drawn on the top side of the plot.
280   chopt='Y+' : The Y-axis is drawn on the right side of the plot.
281
282     Fitting options
283    The list of fit options is given in parameter option.
284       option = "W"  Set all errors to 1
285              = "U" Use a User specified fitting algorithm (via SetFCN)
286              = "Q" Quiet mode (minimum printing)
287              = "V" Verbose mode (default is between Q and V)
288              = "B" Use this option when you want to fix one or more parameters
289                    and the fitting function is like "gaus","expo","poln","landau".
290              = "R" Use the Range specified in the function range
291              = "N" Do not store the graphics function, do not draw
292              = "0" Do not plot the result of the fit. By default the fitted function
293                    is drawn unless the option"N" above is specified.
294              = "+" Add this new fitted function to the list of fitted functions
295                    (by default, any previous function is deleted)
296              = "C" In case of linear fitting, not calculate the chisquare
297                     (saves time)
298              = "F" If fitting a polN, switch to minuit fitter
299              = "ROB" In case of linear fitting, compute the LTS regression
300                      coefficients (robust(resistant) regression), using
301                      the default fraction of good points
302                "ROB=0.x" - compute the LTS regression coefficients, using
303                            0.x as a fraction of good points
304
305   */
306   printf("AliEMCALHistoUtilities::drawGraph started \n");
307   printf("Drawing opt |%s| : Fitting opt |%s|\n", opt, optFit);
308
309     TGraph *gr = new TGraph(n, x, y);
310     gr->SetMarkerColor(markerColor);
311     gr->SetLineColor(markerColor);
312     gr->SetMarkerStyle(markerStyle);
313     gr->SetTitle(tit);
314     gr->Draw(opt);
315
316     TString ctmp(opt);
317     if(ctmp.Contains("A")) {
318        gr->GetHistogram()->SetXTitle(xTit);
319        gr->GetHistogram()->SetYTitle(yTit);
320     }
321     ctmp = optFit; 
322     if(ifun>=0) {
323       TString sf("pol"); sf += ifun;
324       gr->Fit(sf.Data(),optFit);
325       printf("\n ** Fit by Polynomial of degree %i : %s **\n", ifun, sf.Data());
326     } else if(!ctmp.Contains("no",TString::kIgnoreCase)){
327       printf("\n ** ifun %i : %s **\n", ifun, fun);
328       gr->Fit(fun, optFit);
329     }
330
331     return gr;
332 }
333
334 TGraphErrors *AliEMCALHistoUtilities::DrawGraphErrors(const Int_t n,Double_t *x,Double_t *y,Double_t *ex, 
335 Double_t *ey, Int_t markerColor,  Int_t markerStyle, const char* opt, const char* tit, 
336 const char* xTit,const char* yTit, Int_t ifun, const char *optFit, const char *fun)
337 {
338   // Oct 15, 2007
339   printf("AliEMCALHistoUtilities::drawGraphErrors started \n");
340   printf("Drawing opt |%s| : ifun %i: Fitting opt |%s|, fun |%s|\n", 
341          opt, ifun, optFit, fun);
342
343   TGraphErrors *gr = new TGraphErrors(n, x,y,ex,ey);
344   gr->SetMarkerColor(markerColor);
345   gr->SetLineColor(markerColor);
346   gr->SetMarkerStyle(markerStyle);
347   if(tit&&strlen(tit)>0) gr->SetTitle(tit);
348
349   TString ctmp(opt);
350   if(ctmp.Contains("A")) {
351      gr->GetHistogram()->SetXTitle(xTit);
352      gr->GetHistogram()->SetYTitle(yTit);
353   }
354   if(ifun>0) {
355     if(ifun != 999) {
356       TString sf("pol"); sf += ifun;
357       gr->Fit(sf.Data(),optFit);
358       printf("\n ** Fit by Polynomial of degree %i : %s **\n", ifun, sf.Data());
359     } else {
360       gr->Fit(fun, optFit);
361       printf("\n ** Fit by %s **\n", fun);
362     }
363   } else {
364     if(strlen(optFit)) {
365       printf("\n ** ifun %i : %s **\n", ifun, fun);
366       gr->Fit(fun, optFit);
367     }
368   }
369
370   gr->Draw(opt);
371
372   return gr;
373 }
374
375 TF1* AliEMCALHistoUtilities::GetResolutionFunction(const char *opt, TString &latexName)
376 {
377   // Oct 15, 2007
378   TString sopt(opt);
379   sopt.ToUpper();
380   TF1 *fres=0;
381   if      (sopt.Contains("FRES1")) {
382     fres = new TF1("fres","[0]+[1]/sqrt(x)", 0.0, 101.);
383     latexName = "#frac{#sigma_{E}}{E} = A+#frac{B}{#sqrt{E}}";
384   } else if(sopt.Contains("FRES2")) { 
385     fres = new TF1("fres","sqrt([0]*[0]+[1]*[1]/x)", 0.0, 101.);
386     latexName = "#sqrt{A^{2}+#frac{B^{2}}{E}}";
387   }
388   if(fres) {
389     fres->SetParName(0,"A");
390     fres->SetParName(1,"B");
391
392     fres->SetParameter(0, 2.0);
393     fres->SetParameter(1, 6.6);
394     fres->SetLineWidth(2);
395     fres->SetLineColor(kRed);
396   }
397   return fres;
398 }
399
400 void AliEMCALHistoUtilities::InitChain(TChain *chain, const char* nameListOfFiles, Int_t nFileMax)
401 {
402   // Read name of files from text file with nameListOfFiles and added to the chain
403   if(chain==0 || nameListOfFiles==0) return;
404  
405   ifstream fin;
406   fin.open(nameListOfFiles);
407   if (!fin.is_open()) {
408     cout << "Input file "<<nameListOfFiles<<" cannot be opened.\n";
409     return;
410   }
411
412   Int_t nfiles = 0; // number of files in chain
413   char nf[200];     // name of current file
414   while (!fin.getline(nf,200).eof()) {
415     if(!fin.good()) break;
416     chain->Add(nf);
417     nfiles++;
418     cout<<nfiles<<" "<<nf<<endl;
419     if(nFileMax && nfiles>=nFileMax) break;
420   }
421   fin.close();
422   //
423   cout << " \n ********** <I> Accepted file "<< nfiles << "********* \n"<<endl;
424   //  chainEsd->Print();
425   //  chain->Lookup();
426 }
427
428 //AliRunLoader* AliEMCALHistoUtilities::InitKinematics(const Int_t nev, const char* galiceName)
429 //{
430 //  // Oct 15, 2007
431 //  // nev == 0 - new file
432 //  static AliRunLoader *rl = 0;
433 //
434 //  if((rl == 0 || nev==0) && galiceName) {
435 //    //printf("<I> AliEMCALHistoUtilities::InitKinematics() : nev %i : rl %p : %s (IN)\n", 
436 //      // nev, rl, galiceName);  
437 //    if(rl)  {
438 //      rl->UnloadgAlice();
439 //      delete rl;
440 //    }
441 //    rl = AliRunLoader::Open(galiceName,AliConfig::GetDefaultEventFolderName(),"read");
442 //    rl->LoadgAlice(); // obligatory
443 //    //printf("<I> AliEMCALHistoUtilities::InitKinematics() : nev %i : rl %p : %s (OUT)\n", 
444 //       //nev, rl, galiceName);  
445 //  }
446 //  if(rl) {
447 //    rl->GetEvent(nev);
448 //    rl->LoadKinematics();
449 //    /* Get what you need after that
450 //      rl->LoadHits();
451 //      AliStack *stack=rl->Stack();
452 //      AliESDCaloCluster * clus = esd->GetCaloCluster(n);
453 //      Int_t label = clus->GetLabel(); // what is this 
454 //      TParticle *primary=stack->Particle(label); 
455 //    */
456 //  }
457 //  return rl;
458 //}
459
460 //AliRunLoader* AliEMCALHistoUtilities::GetRunLoader(const Int_t nev, const Char_t* galiceName,
461 //                                     const Char_t* eventFolderName, AliRunLoader* rlOld)
462 //{
463 //  // Nov 26, 2007
464 //  // nev == 0 - new file
465 //  AliRunLoader *rl = 0;
466 //
467 //  if(nev==0 && galiceName) {
468 //    printf("<I> AliEMCALHistoUtilities::GetLoader() : nev %i : %s (IN)\n", 
469 //         nev, galiceName);  
470 //    if(rlOld) {
471 //      rlOld->UnloadgAlice();
472 //      delete rlOld;
473 //    }
474 //    TString folderName(eventFolderName);
475 //    if(folderName.Length() == 0) folderName = AliConfig::GetDefaultEventFolderName();
476 //    rl = AliRunLoader::Open(galiceName, folderName.Data(),"read");
477 //    rl->LoadgAlice(); // obligatory
478 //    printf("<I> AliEMCALHistoUtilities::GetLoader() : nev %i : %s : %s (OUT)\n", 
479 //         nev, galiceName, folderName.Data());  
480 //  } else {
481 //    rl = rlOld;
482 //  }
483 //  if(rl) rl->LoadgAlice(); // obligatory
484 //  // if(rl) rl->GetEvent(nev);
485 //  return rl;
486 //}
487
488 Double_t AliEMCALHistoUtilities::GetMomentum(const char* nameListOfFiles)
489 {
490   // Get momentum value from string  - like /....100GEV/.. 
491   Double_t p=-1; // negative if undefined 
492   TString st(nameListOfFiles);
493   if(st.Length()>=5) {
494     st.ToUpper();
495     Ssiz_t ind1 = st.Index("GEV"), ind2=0;
496     if(ind1>0) {
497       for(Int_t i=2; i<=10; i++) {
498         ind2 = st.Index("/",ind1-i);
499         if(ind2>0 && ind2<ind1) break;
500       }
501       TString mom  = st(ind2+1, ind1-ind2-1);
502       if(mom.IsFloat()) p = mom.Atof();
503       printf(" dir |%s| : mom |%s| : p %f : ind2,1 %i->%i\n", st.Data(), mom.Data(), p, ind2, ind1);
504     }
505   }
506   return p;
507 }
508
509 int AliEMCALHistoUtilities::ParseString(const TString &topt, TObjArray &Opt)
510
511   // Moved from AliEMCALGeometry
512   // Feb 06, 2006
513   Ssiz_t begin, index, end, end2;
514   begin = index = end = end2 = 0;
515   TRegexp separator("[^ ;,\\t\\s/]+");
516   while ( (begin < topt.Length()) && (index != kNPOS) ) {
517     // loop over given options
518     index = topt.Index(separator,&end,begin);
519     if (index >= 0 && end >= 1) {
520       TString substring(topt(index,end));
521       Opt.Add(new TObjString(substring.Data()));
522     }
523     begin += end+1;
524   }
525   return Opt.GetEntries();
526 }
527
528 // Analysis utilites
529 //Bool_t AliEMCALHistoUtilities::GetLorentzVectorFromESDCluster(TLorentzVector &v, const AliESDCaloCluster* cl)
530 //{
531 //  // May 8, 2007
532 //  static Double_t e=0.0;
533 //  static Float_t pos[3];
534 //  static TVector3 gpos;
535 //  if(cl==0) return kFALSE;
536 //  
537 //  e = Double_t(cl->E());
538 //  if(e<=0.0) {
539 //    printf(" negative cluster energy : %f \n", e);
540 //    return kFALSE;
541 //  }
542 //  cl->GetPosition(pos);
543 //  gpos.SetXYZ(Double_t(pos[0]), Double_t(pos[1]), Double_t(pos[2]));
544 //  gpos.SetMag(e);
545 //  v.SetVectM(gpos, 0.0);
546 //
547 //  return kTRUE;
548 //}
549
550 //Bool_t AliEMCALHistoUtilities::GetLorentzVectorFromRecPoint(TLorentzVector &v, const AliEMCALRecPoint  *rp)
551 //{
552 //  // Jun 20, 2007
553 //  static Double_t e=0.0;
554 //  static TVector3 gpos;
555 //  if(rp==0) return kFALSE;
556 //  
557 //  e = Double_t(rp->GetPointEnergy());
558 //  if(e<=0.0) {
559 //    printf(" negative rec.point energy : %f \n", e);
560 //    return kFALSE;
561 //  }
562 //  rp->GetGlobalPosition(gpos);
563 //  gpos.SetMag(e);
564 //  v.SetVectM(gpos, 0.0);
565 //
566 //  return kTRUE;
567 //}
568 //
569 //// Drawing:
570 //
571 void AliEMCALHistoUtilities::DrawHist(TH1* hid,int lineWidth,int lineColor,const char* opt, int lineStyle)
572 {
573   // Oct 15, 2007
574   TString sopt;
575   sopt = opt;
576   if(!hid) return;
577   printf(" Hist. %s : option |%s| \n", hid->GetName(), opt);
578   if(hid && hid->GetEntries()>=1.) {
579     if(lineWidth) hid->SetLineWidth(lineWidth);
580     if(lineColor) hid->SetLineColor(lineColor);
581     if(lineStyle) hid->SetLineStyle(lineStyle);
582     if(sopt.Contains("stat",TString::kIgnoreCase)) hid->SetStats(kTRUE);
583     hid->Draw(opt);
584   } else {
585     if   (strcmp(opt,"empty")==0) hid->Draw();
586     else printf(" has fewer entries %i or hid is zero\n", (int) hid->GetEntries());
587   }
588 }
589
590 //
591 //// Fitting:
592 //
593 TF1* AliEMCALHistoUtilities::Gausi(const char *addName,double xmi,double xma,double N,double mean,double sig,double width)
594
595   // Fit by gaus where first parameter is the number of events under ga
596   // Oct 15, 2007
597   TString name("gi");
598   name += addName;
599   TF1 *f = new TF1(name.Data(), Gi, xmi, xma, 4); 
600   f->SetParNames("INTEGRAL","MEAN","SIGMA","WIDTH");
601
602   f->SetParameter(0,N);
603   f->SetParameter(1,mean);
604   f->SetParameter(2,sig);
605
606   f->FixParameter(3,width); // width of histogramm bin
607   return f;
608 }
609
610 TF1* AliEMCALHistoUtilities::Gausi(const char *addName, double xmi, double xma, TH1 *h) 
611 {
612   // You can change parameters after that if you don't like this assumption
613   if(h) return Gausi(addName, xmi, xma, h->Integral(), h->GetMean(),h->GetRMS(), h->GetBinWidth(1));
614   else  return 0; 
615 }
616
617 TF1* AliEMCALHistoUtilities::GausiPol2(const char *addName,double xmi,double xma, TF1 *g, TF1* bg)
618
619   // Fit by gaus where first parameter is the number of events under ga
620   TString name("giPol2");
621   name += addName;
622   TF1 *f = new TF1(name.Data(), GiPol2, xmi, xma, 7); 
623   f->SetParNames("INTEGRAL","MEAN","SIGMA","WIDTH","a0","a1","a2");
624
625   if(g) {
626     for(int i=0; i<4; i++) f->SetParameter(i, g->GetParameter(i));
627     f->FixParameter(3,g->GetParameter(3));
628   }
629
630   if(bg) {
631     for(int i=4; i<7; i++) f->SetParameter(i, bg->GetParameter(i+4));
632   }
633   f->SetLineColor(kRed);
634   return f;
635 }
636
637 Double_t AliEMCALHistoUtilities::Gi(Double_t *x, Double_t *par)
638
639   // First parameter is integral (number events under gaus)
640   // Forth parameter (par[3]) is width of histogram bin 
641   // gaus(0) is a substitute for [0]*exp(-0.5*((x-[1])/[2])**2)
642
643   static Double_t c = TMath::Sqrt(2.*TMath::Pi()), y=0.0, f=0.0; // sqrt(2.*pi)
644
645   y  = (x[0]-par[1])/par[2];
646   f  = par[0]*par[3]/(par[2]*c) * TMath::Exp(-0.5*y*y);
647
648   return f;
649 }
650
651 Double_t AliEMCALHistoUtilities::GiPol2(Double_t *x, Double_t *par)
652
653   // First parameter is integral (number events under gaus)
654   // Forth parameter (par[3]) is width of histogram bin 
655   // gaus(0) is a substitute for [0]*exp(-0.5*((x-[1])/[2])**2)
656   // + pol2 -> 7 parameters
657   static Double_t c = TMath::Sqrt(2.*TMath::Pi()), y=0.0, f=0.0; // sqrt(2.*pi)
658
659   y  = (x[0]-par[1])/par[2];
660   f  = par[0]*par[3]/(par[2]*c) * TMath::Exp(-0.5*y*y);
661
662   f += par[4] + par[5]*x[0] + par[6]*x[0]*x[0];
663
664   return f;
665 }
666
667 // Calibration stuff
668 Double_t AliEMCALHistoUtilities::GetCorrectionCoefficientForGamma1(const Double_t eRec)
669 {
670   // Correction to rec.energy - Jul 15, 2007
671   // E(gamma) = corr * E(eRec);
672   /* corr = p0*(eRec-7.5)+p1*(eRec-7.5)*(eRec-7.5)+p2; 0.0<eRec<10.0
673    1  p0           6.07157e-05   1.15179e-04  -0.00000e+00   1.20997e-03
674    2  p1           1.50019e-04   3.13566e-05  -0.00000e+00   1.22531e-02
675    3  p2           9.99019e-01   4.08251e-04  -0.00000e+00   1.40606e-03
676
677      corr = p3 + p4*eRec + p5*eRec*eRec
678    1  p3           9.97135e-01   5.31970e-04   1.37962e-09   1.68120e-08
679    2  p4           3.15740e-04   2.53371e-05   1.11475e-11   1.74192e-04
680    3  p5          -1.35383e-06   2.19495e-07  -5.82864e-13   4.52277e-02
681   */
682   static Double_t p0=6.07157e-05, p1=1.50019e-04, p2=9.99019e-01;
683   static Double_t p3=9.97135e-01, p4=3.15740e-04, p5=-1.35383e-06;
684   static Double_t corr=1.0;
685   if(eRec>=0.0 && eRec <=10.0) {
686     corr = p0*(eRec-7.5) + p1*(eRec-7.5)*(eRec-7.5) + p2;
687   } else if(eRec>10.0 && eRec <=105.0) {
688     corr = p3 + p4*eRec + p5*eRec*eRec;
689   }
690   //printf(" eRec %f | corr %f \n", eRec, corr);
691   return corr;
692 }
693
694 Double_t AliEMCALHistoUtilities::GetCorrectedEnergyForGamma1(const Double_t eRec)
695 {
696   return GetCorrectionCoefficientForGamma1(eRec) * eRec;
697 }
698
699 // Trigger 
700 TList* AliEMCALHistoUtilities::GetTriggersListOfHists(const Int_t scale, const Int_t nTrig, const Bool_t toBrowser)
701 {
702   // Oct 22, 2007 - trigger technical assurance
703   gROOT->cd();
704   TH1::AddDirectory(1);
705
706   new TH1F("00_hXpos2x2", "X coord. of max Amp 2x2",100, -500., +500.);
707   new TH1F("01_hYpos2x2", "Y coord. of max Amp 2x2",100, -500., +500.);
708   new TH1F("02_hZpos2x2", "Z coord. of max Amp 2x2",100, -500., +500.);
709   new TH1F("03_hXposnxn", "X coord. of max Amp NXN",100, -500., +500.);
710   new TH1F("04_hYposnxn", "Y coord. of max Amp NXN",100, -500., +500.);
711   new TH1F("05_hZposnxn", "Z coord. of max Amp NXN",100, -500., +500.);
712   // May 7, 2008 - jet trigger
713   new TH1F("06_hJetTriggerPhi", "%phi of COG of jet trigger patch", 110, 80., 190.);
714   new TH1F("07_hJetTriggerEta", "%eta of COG of jet trigger patch", 70, -0.7, +0.7);
715   // 
716   new TH1F("08_hMaxAmp2x2", "max Amp 2x2", 1000, 0.0, pow(2.,14.));
717   new TH1F("09_hAmpOutOf2x2", "Amp out of patch 2x2", 1000, 0.0, pow(2.,14.));
718   new TH1F("10_hMaxAmpnxn", "max Amp NXN", 1000, 0.0, pow(2.,14.));
719   new TH1F("11_hAmpOutOfnxn", "Amp out of patch nxn", 1000, 0.0, pow(2.,14.));
720   // May 7, 2008 - jet trigger
721   for(Int_t i=0; i<nTrig; i++) {
722     new TH1F(Form("%2.2i_hJetPatchAmp%2.2i",i+12,i), Form("jet patch amplitude : jet trig %i",i), 
723     1000, 0.0, pow(2.,14.));
724   }
725   // For checking
726   Double_t maxEdigit=100., maxN=1000., maxPC = 200.;
727   if(scale==1) {
728     maxN  *= 10.;
729     maxPC *= 10.;
730   }
731   Int_t ind = 12+nTrig; 
732   new TH1F(Form("%2.2i_hDigitsAmp",ind++), "amplitude of digits (PC)  ", 1001, -0.5, 1000.5);
733   new TH1F(Form("%2.2i_hDigitsE",ind++), " energy of digits (PC)", 1000, 0.0, maxEdigit);
734   new TH1F(Form("%2.2i_hNDigitsInPCs",ind++), " number of digits in PC's", 1000, 0.0, maxN);
735   new TH1F(Form("%2.2i_hEinInPCs",ind++), " energy in PC's", 200, 0.0, maxPC);
736
737   return MoveHistsToList("TriggerLiOfHists", toBrowser);
738 }
739
740 void AliEMCALHistoUtilities::FillTriggersListOfHists(TList *l, TArrayF *triggerPosition, TArrayF *triggerAmplitudes)
741 {
742   // Oct 22, 2007 - trigger technical assurance
743   if(l==0) {
744     printf("<E> FillTriggersListOfHists() : list of hists undefined. \n");
745     return;
746   }
747   for(int i=0; i<triggerPosition->GetSize(); i++) {
748     FillH1(l, i, double(triggerPosition->At(i)));
749   }
750
751   for(int i=0; i<triggerAmplitudes->GetSize(); i++) {
752     FillH1(l, triggerPosition->GetSize() + i, double(triggerAmplitudes->At(i)) );
753   }
754 }
755
756 // Jet(s) kinematics 
757 TList* AliEMCALHistoUtilities::GetJetsListOfHists(Int_t njet, Bool_t toBrowser)
758 {
759   // Oct 30, 2007
760   gROOT->cd();
761   TH1::AddDirectory(1);
762   new TH1F("00_nJet", "number of jets in Pythia",5, -0.5, +4.5);
763   int ic=1;
764   for(Int_t ij=0; ij<njet; ij++)
765   {
766     new TH1F(Form("%2.2i_EtaOfJet%i",ic++,ij), Form("#eta of jet (%i)",ij),80, -2., 2.);
767     new TH1F(Form("%2.2i_ThetaOfJet%i",ic++,ij), Form("#theta(degree) of jet (%i)",ij),
768     180, 0.0, 180.);
769     new TH1F(Form("%2.2i_PhiOfJet%i",ic++,ij), Form("#phi(degree) of jet (%i)",ij),
770     180, 0.0, 360.);
771     new TH1F(Form("%2.2i_PtOfJet%i",ic++,ij), Form(" p_{T} of jet (%i)",ij),
772     200, 0.0, 200.);
773     new TH1F(Form("%2.2i_EOfJet%i",ic++,ij), Form(" E of jet (%i)",ij),
774     200, 0.0, 200.);
775   }
776
777   return MoveHistsToList("JetLiOfHists", toBrowser);
778 }
779
780 //void  AliEMCALHistoUtilities::FillJetKineListOfHists(TList *l, AliRunLoader* rl, TLorentzVector &goodJet)
781 //{
782 //  // Oct 30, 2007; Nov 07;
783 //  // goodJet - output; only one jet with EMCAL acceptance
784 //
785 //  // Bad case
786 //  goodJet.SetPxPyPzE(0., 0., 0., 0.); 
787 //
788 //  if(l==0 || rl==0) return;
789 //  //try to get trigger jet info
790 //  AliHeader* alih = rl->GetHeader();
791 //  if (alih == 0) return;
792 //
793 //  AliGenEventHeader * genh = alih->GenEventHeader();
794 //  if (genh == 0) return;
795 //
796 //  AliGenPythiaEventHeader* genhpy = dynamic_cast<AliGenPythiaEventHeader *>(genh);
797 //  if(genhpy==0) return; // Not Pythia
798 //
799 //  Int_t nj = genhpy->NTriggerJets();
800 //  FillH1(l, 0, double(nj));
801 //
802 //  TLorentzVector* jets[4];
803 //  nj = nj>4?4:nj;
804 //
805 //  int ic=1;
806 //  for (Int_t i=0; i< nj; i++) {
807 //     Float_t p[4];
808 //     genhpy->TriggerJet(i,p);
809 //     jets[i] = new TLorentzVector(p);
810 //     FillH1(l, ic++, jets[i]->Eta());
811 //     FillH1(l, ic++, jets[i]->Theta()*TMath::RadToDeg());
812 //     FillH1(l, ic++, TVector2::Phi_0_2pi(jets[i]->Phi())*TMath::RadToDeg());
813 //     FillH1(l, ic++, jets[i]->Pt());
814 //     FillH1(l, ic++, jets[i]->E());
815 //
816 //     //printf(" %i pj %f %f %f %f : ic %i\n", i, p[0], p[1], p[2], p[3], ic);
817 //     if(ic >= l->GetSize()) break;
818 //  }
819 //  if(nj==1) {
820 //    Double_t eta=jets[0]->Eta(), phi=TVector2::Phi_0_2pi(jets[0]->Phi())*TMath::RadToDeg();
821 //    if(TMath::Abs(eta)<0.5 && (phi>90.&&phi<180.)) {
822 //      goodJet = (*jets[0]);
823 //    }
824 //  }
825 //}