EMCAL/AliEMCALQADataMakerRec.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15 /*
  16 Based on the QA code for PHOS written by Yves Schutz July 2007
  17
  18 Authors:  J.Klay (Cal Poly) May 2008
  19           S. Salur LBL April 2008
  20
  21 Created one histogram for QA shifter;-- Yaxian Mao: 11/2009
  22 The idea:average counts for all the towers should be flat
  23 Change all existing histograms as experts
  24
  25 Change histograms for DQM shifter: --  Yaxian Mao 04/2010
  26 Calcuate the amplitude ratio from current run and the LED reference, for QAChecker use
  27 Also calculate the ratio of amplitude from LED Monitor system (current/Reference), to check LED system
  28
  29 */
  30
  31 // --- ROOT system ---
  32 #include <TClonesArray.h>
  33 #include <TFile.h>
  34 #include <TH1F.h>
  35 #include <TH1I.h>
  36 #include <TH2F.h>
  37 #include <TLine.h>
  38 #include <TText.h>
  39 #include <TProfile.h>
  40 #include <TStyle.h>
  41 // --- Standard library ---
  42
  43
  44 // --- AliRoot header files ---
  45 #include "AliDAQ.h"
  46 #include "AliESDCaloCluster.h"
  47 #include "AliESDCaloCells.h"
  48 #include "AliESDEvent.h"
  49 #include "AliLog.h"
  50 #include "AliEMCALQADataMakerRec.h"
  51 #include "AliQAChecker.h"
  52 #include "AliEMCALDigit.h"
  53 #include "AliEMCALRecPoint.h"
  54 #include "AliEMCALRawUtils.h"
  55 #include "AliEMCALReconstructor.h"
  56 #include "AliEMCALRecParam.h"
  57 #include "AliRawReader.h"
  58 #include "AliCaloRawStreamV3.h"
  59 #include "AliEMCALGeoParams.h"
  60 #include "AliRawEventHeaderBase.h"
  61 #include "AliQAManager.h"
  62 #include "AliCDBEntry.h"
  63
  64 #include "AliCaloBunchInfo.h"
  65 #include "AliCaloFitResults.h"
  66 #include "AliCaloRawAnalyzerFastFit.h"
  67 #include "AliCaloRawAnalyzerNN.h"
  68 //#include "AliCaloRawAnalyzerLMS.h"
  69 #include "AliCaloRawAnalyzerKStandard.h"
  70 #include "AliCaloRawAnalyzerPeakFinder.h"
  71 #include "AliCaloRawAnalyzerCrude.h"
  72
  73 #include "AliCaloRawAnalyzerFactory.h"
  74
  75 using namespace std;
  76
  77 ClassImp(AliEMCALQADataMakerRec)
  78
  79 //____________________________________________________________________________
  80 AliEMCALQADataMakerRec::AliEMCALQADataMakerRec(fitAlgorithm fitAlgo) :
  81   AliQADataMakerRec(AliQAv1::GetDetName(AliQAv1::kEMCAL), "EMCAL Quality Assurance Data Maker"),
  82   fFittingAlgorithm(0),
  83   fRawAnalyzer(0),
  84   fRawAnalyzerTRU(0),
  85   fSuperModules(10), // FIXME!!! number of SuperModules; 10 for 2011; update default for later runs
  86   fFirstPedestalSample(0),
  87   fLastPedestalSample(3),
  88   fFirstPedestalSampleTRU(0),
  89   fLastPedestalSampleTRU(3),
  90   fMinSignalLG(0),
  91   fMaxSignalLG(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
  92   fMinSignalHG(0),
  93   fMaxSignalHG(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
  94   fMinSignalTRU(0),
  95   fMaxSignalTRU(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
  96   fMinSignalLGLEDMon(0),
  97   fMaxSignalLGLEDMon(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
  98   fMinSignalHGLEDMon(0),
  99   fMaxSignalHGLEDMon(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
 100   fCalibRefHistoPro(NULL),
 101   fCalibRefHistoH2F(NULL),
 102   fLEDMonRefHistoPro(NULL),
 103   fHighEmcHistoH2F(NULL)
 104 //  fTextSM(new TText*[fSuperModules]) ,
 105 //  fLineCol(NULL),
 106 //  fLineRow(NULL)
 107
 108 {
 109   // ctor
 110   SetFittingAlgorithm(fitAlgo);
 111
 112   //fRawAnalyzerTRU = new AliCaloRawAnalyzerLMS();
 113
 114   fRawAnalyzerTRU =  ( AliCaloRawAnalyzerKStandard*)AliCaloRawAnalyzerFactory::CreateAnalyzer(kLMS);
 115
 116   fRawAnalyzerTRU->SetFixTau(kTRUE);
 117   fRawAnalyzerTRU->SetTau(2.5); // default for TRU shaper
 118 //  for (Int_t sm = 0 ; sm < fSuperModules ; sm++){
 119 //    fTextSM[sm] = NULL ;
 120 //  }
 121 }
 122
 123 //____________________________________________________________________________
 124 AliEMCALQADataMakerRec::AliEMCALQADataMakerRec(const AliEMCALQADataMakerRec& qadm) :
 125   AliQADataMakerRec(),
 126   fFittingAlgorithm(0),
 127   fRawAnalyzer(0),
 128   fRawAnalyzerTRU(0),
 129   fSuperModules(qadm.GetSuperModules()),
 130   fFirstPedestalSample(qadm.GetFirstPedestalSample()),
 131   fLastPedestalSample(qadm.GetLastPedestalSample()),
 132   fFirstPedestalSampleTRU(qadm.GetFirstPedestalSampleTRU()),
 133   fLastPedestalSampleTRU(qadm.GetLastPedestalSampleTRU()),
 134   fMinSignalLG(qadm.GetMinSignalLG()),
 135   fMaxSignalLG(qadm.GetMaxSignalLG()),
 136   fMinSignalHG(qadm.GetMinSignalHG()),
 137   fMaxSignalHG(qadm.GetMaxSignalHG()),
 138   fMinSignalTRU(qadm.GetMinSignalTRU()),
 139   fMaxSignalTRU(qadm.GetMaxSignalTRU()),
 140   fMinSignalLGLEDMon(qadm.GetMinSignalLGLEDMon()),
 141   fMaxSignalLGLEDMon(qadm.GetMaxSignalLGLEDMon()),
 142   fMinSignalHGLEDMon(qadm.GetMinSignalHGLEDMon()),
 143   fMaxSignalHGLEDMon(qadm.GetMaxSignalHGLEDMon()),
 144   fCalibRefHistoPro(NULL),
 145   fCalibRefHistoH2F(NULL),
 146   fLEDMonRefHistoPro(NULL),
 147   fHighEmcHistoH2F(NULL)
 148 //  fTextSM(new TText*[fSuperModules]) ,
 149 //  fLineCol(NULL),
 150 //  fLineRow(NULL)
 151 {
 152   //copy ctor
 153   SetName((const char*)qadm.GetName()) ;
 154   SetTitle((const char*)qadm.GetTitle());
 155   SetFittingAlgorithm(qadm.GetFittingAlgorithm());
 156
 157   //fRawAnalyzerTRU = new AliCaloRawAnalyzerLMS();
 158   fRawAnalyzerTRU = (AliCaloRawAnalyzerKStandard*)AliCaloRawAnalyzerFactory::CreateAnalyzer(kLMS);
 159   fRawAnalyzerTRU->SetFixTau(kTRUE);
 160   fRawAnalyzerTRU->SetTau(2.5); // default for TRU shaper
 161 //  for (Int_t sm = 0 ; sm < fSuperModules ; sm++){
 162 //    fTextSM[sm] = qadm.fTextSM[sm] ;
 163 //  }
 164 }
 165
 166 //__________________________________________________________________
 167 AliEMCALQADataMakerRec& AliEMCALQADataMakerRec::operator = (const AliEMCALQADataMakerRec& qadm )
 168 {
 169   // Equal operator.
 170   this->~AliEMCALQADataMakerRec();
 171   new(this) AliEMCALQADataMakerRec(qadm);
 172 //  fLineCol = NULL;
 173 //  fLineRow = NULL;
 174 //  for (Int_t sm = 0 ; sm < fSuperModules ; sm++){
 175 //    fTextSM[sm] = qadm.fTextSM[sm] ;
 176 //  }
 177   return *this;
 178 }
 179
 180 //____________________________________________________________________________
 181 void AliEMCALQADataMakerRec::EndOfDetectorCycle(AliQAv1::TASKINDEX_t task, TObjArray ** list)
 182 {
 183   //Detector specific actions at end of cycle
 184
 185 //  if(fCycleCounter)
 186 //        GetRawsData(kNEventsPerTower)->Scale(1./fCycleCounter);
 187
 188   // do the QA checking
 189   ResetEventTrigClasses(); // reset triggers list to select all histos
 190   AliQAChecker::Instance()->Run(AliQAv1::kEMCAL, task, list) ;
 191 }
 192
 193 //____________________________________________________________________________
 194 void AliEMCALQADataMakerRec::GetCalibRefFromOCDB()
 195 {
 196   //Get the reference histogram from OCDB
 197   TString sName1("hHighEmcalRawMaxMinusMin") ;
 198   TString sName2("hLowLEDMonEmcalRawMaxMinusMin") ;
 199   sName1.Prepend(Form("%s_", AliRecoParam::GetEventSpecieName(AliRecoParam::kCalib))) ;
 200   sName2.Prepend(Form("%s_", AliRecoParam::GetEventSpecieName(AliRecoParam::kCalib))) ;
 201
 202   TString refStorage(AliQAv1::GetQARefStorage()) ;
 203   if (!refStorage.Contains(AliQAv1::GetLabLocalOCDB()) && !refStorage.Contains(AliQAv1::GetLabAliEnOCDB())) {
 204     AliFatal(Form("%s is not a valid location for reference data", refStorage.Data())) ;
 205   } else {
 206     AliQAManager* manQA = AliQAManager::QAManager(AliQAv1::kRAWS) ;
 207     AliQAv1::SetQARefDataDirName(AliRecoParam::kCalib) ;
 208     if ( ! manQA->GetLock() ) {
 209       manQA->SetDefaultStorage(AliQAv1::GetQARefStorage()) ;
 210       manQA->SetSpecificStorage("*", AliQAv1::GetQARefStorage()) ;
 211       manQA->SetRun(AliCDBManager::Instance()->GetRun()) ;
 212       manQA->SetLock() ;
 213     }
 214     char * detOCDBDir = Form("%s/%s/%s", GetName(), AliQAv1::GetRefOCDBDirName(), AliQAv1::GetRefDataDirName()) ;
 215     AliCDBEntry * entry = manQA->Get(detOCDBDir, manQA->GetRun()) ;
 216     if (entry) {
 217       TList * listDetQAD =static_cast<TList *>(entry->GetObject()) ;
 218       if ( strcmp(listDetQAD->ClassName(), "TList") != 0 ) {
 219         AliError(Form("Expected a Tlist and found a %s for detector %s", listDetQAD->ClassName(), GetName())) ;
 220         listDetQAD = NULL ;
 221       }
 222       TObjArray * dirOCDB= NULL ;
 223       if ( listDetQAD )
 224         dirOCDB = static_cast<TObjArray *>(listDetQAD->FindObject(Form("%s/%s", AliQAv1::GetTaskName(AliQAv1::kRAWS).Data(), AliRecoParam::GetEventSpecieName(AliRecoParam::kCalib)))) ;
 225       if (dirOCDB){
 226         fCalibRefHistoPro = dynamic_cast<TProfile *>(dirOCDB->FindObject(sName1.Data())) ;
 227         fLEDMonRefHistoPro = dynamic_cast<TProfile *>(dirOCDB->FindObject(sName2.Data())) ;
 228       }
 229     }
 230   }
 231
 232   if(fCalibRefHistoPro && fLEDMonRefHistoPro){
 233
 234     //Defining histograms binning, each 2D histogram covers all SMs
 235     Int_t nSMSectors = fSuperModules / 2; // 2 SMs per sector
 236     Int_t nbinsZ = 2*AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
 237     Int_t nbinsPhi = nSMSectors * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows;
 238
 239     if(!fCalibRefHistoH2F)
 240       fCalibRefHistoH2F =  new TH2F("hCalibRefHisto", "hCalibRefHisto", nbinsZ, -0.5, nbinsZ - 0.5, nbinsPhi, -0.5, nbinsPhi -0.5);
 241     ConvertProfile2H(fCalibRefHistoPro,fCalibRefHistoH2F) ;
 242   } else {
 243     AliFatal(Form("No reference object with name %s or %s found", sName1.Data(), sName2.Data())) ;
 244   }
 245 }
 246 //____________________________________________________________________________
 247 void AliEMCALQADataMakerRec::InitESDs()
 248 {
 249   //Create histograms to controll ESD
 250   const Bool_t expert   = kTRUE ;
 251   const Bool_t image    = kTRUE ;
 252
 253   TH1F * h1 = new TH1F("hESDCaloClusterE",  "ESDs CaloCluster energy in EMCAL;Energy [GeV];Counts",    200, 0., 100.) ;
 254   h1->Sumw2() ;
 255   Add2ESDsList(h1, kESDCaloClusE, !expert, image)  ;
 256
 257   TH1I * h2 = new TH1I("hESDCaloClusterM", "ESDs CaloCluster multiplicity in EMCAL;# of Clusters;Entries", 100, 0,  100) ;
 258   h2->Sumw2() ;
 259   Add2ESDsList(h2, kESDCaloClusM, !expert, image)  ;
 260
 261   TH1F * h3 = new TH1F("hESDCaloCellA",  "ESDs CaloCell amplitude in EMCAL;Energy [GeV];Counts",    500, 0., 50.) ;
 262   h3->Sumw2() ;
 263   Add2ESDsList(h3, kESDCaloCellA, !expert, image)  ;
 264
 265   TH1I * h4 = new TH1I("hESDCaloCellM", "ESDs CaloCell multiplicity in EMCAL;# of Clusters;Entries", 200, 0,  1000) ;
 266   h4->Sumw2() ;
 267   Add2ESDsList(h4, kESDCaloCellM, !expert, image) ;
 268   //
 269   ClonePerTrigClass(AliQAv1::kESDS); // this should be the last line
 270 }
 271
 272 //____________________________________________________________________________
 273 void AliEMCALQADataMakerRec::InitDigits()
 274 {
 275   // create Digits histograms in Digits subdir
 276   const Bool_t expert   = kTRUE ;
 277   const Bool_t image    = kTRUE ;
 278
 279   TH1I * h0 = new TH1I("hEmcalDigits",    "Digits amplitude distribution in EMCAL;Amplitude [ADC counts];Counts",    500, 0, 500) ;
 280   h0->Sumw2() ;
 281   Add2DigitsList(h0, 0, !expert, image) ;
 282   TH1I * h1 = new TH1I("hEmcalDigitsMul", "Digits multiplicity distribution in EMCAL;# of Digits;Entries", 200, 0, 2000) ;
 283   h1->Sumw2() ;
 284   Add2DigitsList(h1, 1, !expert, image) ;
 285   //
 286   ClonePerTrigClass(AliQAv1::kDIGITS); // this should be the last line
 287 }
 288
 289 //____________________________________________________________________________
 290 void AliEMCALQADataMakerRec::InitRecPoints()
 291 {
 292   // create Reconstructed PoInt_ts histograms in RecPoints subdir
 293   const Bool_t expert   = kTRUE ;
 294   const Bool_t image    = kTRUE ;
 295
 296   TH1F* h0 = new TH1F("hEMCALRpE","EMCAL RecPoint energies;Energy [GeV];Counts",200, 0.,20.); //GeV
 297   h0->Sumw2();
 298   Add2RecPointsList(h0,kRecPE, !expert, image);
 299
 300   TH1I* h1 = new TH1I("hEMCALRpM","EMCAL RecPoint multiplicities;# of Clusters;Entries",100,0,100);
 301   h1->Sumw2();
 302   Add2RecPointsList(h1,kRecPM, !expert, image);
 303
 304   TH1I* h2 = new TH1I("hEMCALRpDigM","EMCAL RecPoint Digit Multiplicities;# of Digits;Entries",20,0,20);
 305   h2->Sumw2();
 306   Add2RecPointsList(h2,kRecPDigM, !expert, image);
 307   //
 308   ClonePerTrigClass(AliQAv1::kRECPOINTS); // this should be the last line
 309 }
 310
 311 //____________________________________________________________________________
 312 void AliEMCALQADataMakerRec::InitRaws()
 313 {
 314   // create Raws histograms in Raws subdir
 315   const Bool_t expert   = kTRUE ;
 316   const Bool_t saveCorr = kTRUE ;
 317   const Bool_t image    = kTRUE ;
 318   const Option_t *profileOption = "s";
 319
 320   Int_t nTowersPerSM = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols; // number of towers in a SuperModule; 24x48
 321   Int_t nTot = fSuperModules * nTowersPerSM; // max number of towers in all SuperModules
 322
 323   //Defining histograms binning, each 2D histogram covers all SMs
 324   Int_t nSMSectors = fSuperModules / 2; // 2 SMs per sector
 325   Int_t nbinsZ = 2*AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
 326   Int_t nbinsPhi = nSMSectors * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows;
 327
 328    // counter info: number of channels per event (bins are SM index)
 329   TProfile * h0 = new TProfile("hLowEmcalSupermodules", "Low Gain EMC: # of towers vs SuperMod;SM Id;# of towers",
 330                                fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5, profileOption) ;
 331   Add2RawsList(h0, kNsmodLG, expert, !image, !saveCorr) ;
 332   TProfile * h1 = new TProfile("hHighEmcalSupermodules", "High Gain EMC: # of towers vs SuperMod;SM Id;# of towers",
 333                                fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5, profileOption) ;
 334   Add2RawsList(h1, kNsmodHG, expert, !image, !saveCorr) ;
 335
 336   // where did max sample occur? (bins are towers)
 337   TProfile * h2 = new TProfile("hLowEmcalRawtime", "Low Gain EMC: Time at Max vs towerId;Tower Id;Time [ticks]",
 338                                nTot, -0.5, nTot-0.5, profileOption) ;
 339   Add2RawsList(h2, kTimeLG, expert, !image, !saveCorr) ;
 340   TProfile * h3 = new TProfile("hHighEmcalRawtime", "High Gain EMC: Time at Max vs towerId;Tower Id;Time [ticks]",
 341                                nTot, -0.5, nTot-0.5, profileOption) ;
 342   Add2RawsList(h3, kTimeHG, expert, !image, !saveCorr) ;
 343
 344   // how much above pedestal was the max sample?  (bins are towers)
 345   TProfile * h4 = new TProfile("hLowEmcalRawMaxMinusMin", "Low Gain EMC: Max - Min vs towerId;Tower Id;Max-Min [ADC counts]",
 346                                nTot, -0.5, nTot-0.5, profileOption) ;
 347   Add2RawsList(h4, kSigLG, expert, image, !saveCorr) ;
 348   TProfile * h5 = new TProfile("hHighEmcalRawMaxMinusMin", "High Gain EMC: Max - Min vs towerId;Tower Id;Max-Min [ADC counts]",
 349                                nTot, -0.5, nTot-0.5, profileOption) ;
 350   Add2RawsList(h5, kSigHG, expert, image, !saveCorr) ;
 351
 352   // total counter: channels per event
 353   TH1I * h6 = new TH1I("hLowNtot", "Low Gain EMC: Total Number of found towers;# of Towers;Counts", 200, 0, nTot) ;
 354   h6->Sumw2() ;
 355   Add2RawsList(h6, kNtotLG, expert, !image, !saveCorr) ;
 356   TH1I * h7 = new TH1I("hHighNtot", "High Gain EMC: Total Number of found towers;# of Towers;Counts", 200,0, nTot) ;
 357   h7->Sumw2() ;
 358   Add2RawsList(h7, kNtotHG, expert, !image, !saveCorr) ;
 359
 360   // pedestal (bins are towers)
 361   TProfile * h8 = new TProfile("hLowEmcalRawPed", "Low Gain EMC: Pedestal vs towerId;Tower Id;Pedestal [ADC counts]",
 362                                nTot, -0.5, nTot-0.5, profileOption) ;
 363   Add2RawsList(h8, kPedLG, expert, !image, !saveCorr) ;
 364   TProfile * h9 = new TProfile("hHighEmcalRawPed", "High Gain EMC: Pedestal vs towerId;Tower Id;Pedestal [ADC counts]",
 365                                nTot, -0.5, nTot-0.5, profileOption) ;
 366   Add2RawsList(h9, kPedHG, expert, !image, !saveCorr) ;
 367
 368   //temp 2D amplitude histogram for the current run
 369   fHighEmcHistoH2F = new TH2F("h2DHighEC2", "High Gain EMC:Max - Min [ADC counts]", nbinsZ, -0.5 , nbinsZ-0.5, nbinsPhi, -0.5, nbinsPhi-0.5);
 370    fHighEmcHistoH2F->SetDirectory(0) ; // this histo must be memory resident
 371   //add ratio histograms: to comapre the current run with the reference data
 372   TH2F * h15 = new TH2F("h2DRatioAmp", "High Gain Ratio to Reference:Amplitude_{current run}/Amplitude_{reference run}", nbinsZ, -0.5 , nbinsZ-0.5,
 373                         nbinsPhi, -0.5, nbinsPhi-0.5);
 374   //settings for display in amore
 375   h15->SetTitle("Amplitude_{current run}/Amplitude_{reference run}");
 376   h15->SetMaximum(2.0);
 377   h15->SetMinimum(0.1);
 378   h15->SetOption("COLZ");
 379   gStyle->SetOptStat(0);
 380   Int_t color[] = {4,3,2} ;
 381   gStyle->SetPalette(3,color);
 382   h15->GetZaxis()->SetNdivisions(3);
 383   h15->UseCurrentStyle();
 384   h15->SetDirectory(0);
 385   Add2RawsList(h15, k2DRatioAmp, !expert, image, !saveCorr) ;
 386
 387   TH1F * h16 = new TH1F("hRatioDist", "Amplitude_{current run}/Amplitude_{reference run} ratio distribution", nTot, 0., 2.);
 388   h16->SetMinimum(0.1);
 389   h16->SetMaximum(100.);
 390   gStyle->SetOptStat(0);
 391   h16->UseCurrentStyle();
 392   h16->SetDirectory(0);
 393   Add2RawsList(h16, kRatioDist, !expert, image, !saveCorr) ;
 394
 395   // now repeat the same for TRU and LEDMon data
 396   Int_t nTot2x2 = fSuperModules * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALTRUsPerSM * AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU; // max number of TRU channels for all SuperModules
 397
 398   // counter info: number of channels per event (bins are SM index)
 399   TProfile * hT0 = new TProfile("hTRUEmcalSupermodules", "TRU EMC: # of TRU channels vs SuperMod;SM Id;# of TRU channels",
 400                                 fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5, profileOption) ;
 401   Add2RawsList(hT0, kNsmodTRU, expert, !image, !saveCorr) ;
 402
 403   // where did max sample occur? (bins are TRU channels)
 404   TProfile * hT1 = new TProfile("hTRUEmcalRawtime", "TRU EMC: Time at Max vs 2x2Id;2x2 Id;Time [ticks]",
 405                                 nTot2x2, -0.5, nTot2x2-0.5, profileOption) ;
 406   Add2RawsList(hT1, kTimeTRU, expert, !image, !saveCorr) ;
 407
 408   // how much above pedestal was the max sample?  (bins are TRU channels)
 409   TProfile * hT2 = new TProfile("hTRUEmcalRawMaxMinusMin", "TRU EMC: Max - Min vs 2x2Id;2x2 Id;Max-Min [ADC counts]",
 410                                 nTot2x2, -0.5, nTot2x2-0.5, profileOption) ;
 411   Add2RawsList(hT2, kSigTRU, expert, !image, !saveCorr) ;
 412
 413   // total counter: channels per event
 414   TH1I * hT3 = new TH1I("hTRUNtot", "TRU EMC: Total Number of found TRU channels;# of TRU Channels;Counts", 200, 0, nTot2x2) ;
 415   hT3->Sumw2() ;
 416   Add2RawsList(hT3, kNtotTRU, expert, !image, !saveCorr) ;
 417
 418   // pedestal (bins are TRU channels)
 419   TProfile * hT4 = new TProfile("hTRUEmcalRawPed", "TRU EMC: Pedestal vs 2x2Id;2x2 Id;Pedestal [ADC counts]",
 420                                 nTot2x2, -0.5, nTot2x2-0.5, profileOption) ;
 421   Add2RawsList(hT4, kPedTRU, expert, !image, !saveCorr) ;
 422
 423   // L0 trigger hits: # of hits (bins are TRU channels)
 424   TH1I * hT5 = new TH1I("hTRUEmcalL0hits", "L0 trigger hits: Total number of 2x2 L0 generated", nTot2x2, -0.5, nTot2x2);
 425   hT5->Sumw2();
 426   Add2RawsList(hT5, kNL0TRU, expert, !image, !saveCorr);
 427
 428   // L0 trigger hits: average time (bins are TRU channels)
 429   TProfile * hT6 = new TProfile("hTRUEmcalL0hitsAvgTime", "L0 trigger hits: average time bin", nTot2x2, -0.5, nTot2x2, profileOption);
 430   Add2RawsList(hT6, kTimeL0TRU, expert, !image, !saveCorr);
 431
 432   // and also LED Mon..
 433   // LEDMon has both high and low gain channels, just as regular FEE/towers
 434   Int_t nTotLEDMon = fSuperModules * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALLEDRefs; // max number of LEDMon channels for all SuperModules
 435
 436   // counter info: number of channels per event (bins are SM index)
 437   TProfile * hL0 = new TProfile("hLowLEDMonEmcalSupermodules", "LowLEDMon Gain EMC: # of strips vs SuperMod;SM Id;# of strips",
 438                                fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5, profileOption) ;
 439   Add2RawsList(hL0, kNsmodLGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
 440   TProfile * hL1 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalSupermodules", "HighLEDMon Gain EMC: # of strips vs SuperMod;SM Id;# of strips",
 441                                fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5, profileOption) ;
 442   Add2RawsList(hL1, kNsmodHGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
 443
 444   // where did max sample occur? (bins are strips)
 445   TProfile * hL2 = new TProfile("hLowLEDMonEmcalRawtime", "LowLEDMon Gain EMC: Time at Max vs stripId;Strip Id;Time [ticks]",
 446                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5, profileOption) ;
 447   Add2RawsList(hL2, kTimeLGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
 448   TProfile * hL3 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalRawtime", "HighLEDMon Gain EMC: Time at Max vs stripId;Strip Id;Time [ticks]",
 449                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5, profileOption) ;
 450   Add2RawsList(hL3, kTimeHGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
 451
 452   // how much above pedestal was the max sample?  (bins are strips)
 453   TProfile * hL4 = new TProfile("hLowLEDMonEmcalRawMaxMinusMin", "LowLEDMon Gain EMC: Max - Min vs stripId;Strip Id;Max-Min [ADC counts]",
 454                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5, profileOption) ;
 455   Add2RawsList(hL4, kSigLGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
 456   TProfile * hL5 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalRawMaxMinusMin", "HighLEDMon Gain EMC: Max - Min vs stripId;Strip Id;Max-Min [ADC counts]",
 457                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5, profileOption) ;
 458   Add2RawsList(hL5, kSigHGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
 459
 460     // total counter: channels per event
 461   TH1I * hL6 = new TH1I("hLowLEDMonNtot", "LowLEDMon Gain EMC: Total Number of found strips;# of Strips;Counts", 200, 0, nTotLEDMon) ;
 462   hL6->Sumw2() ;
 463   Add2RawsList(hL6, kNtotLGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
 464   TH1I * hL7 = new TH1I("hHighLEDMonNtot", "HighLEDMon Gain EMC: Total Number of found strips;# of Strips;Counts", 200,0, nTotLEDMon) ;
 465   hL7->Sumw2() ;
 466   Add2RawsList(hL7, kNtotHGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
 467
 468   // pedestal (bins are strips)
 469   TProfile * hL8 = new TProfile("hLowLEDMonEmcalRawPed", "LowLEDMon Gain EMC: Pedestal vs stripId;Strip Id;Pedestal [ADC counts]",
 470                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5, profileOption) ;
 471   Add2RawsList(hL8, kPedLGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
 472   TProfile * hL9 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalRawPed", "HighLEDMon Gain EMC: Pedestal vs stripId;Strip Id;Pedestal [ADC counts]",
 473                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5, profileOption) ;
 474   Add2RawsList(hL9, kPedHGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
 475
 476   //add two histograms for shifter from the LED monitor system: comapre LED monitor with the reference run
 477   //to be used for decision whether we need to change reference data
 478   TH1F * hL10 = new TH1F("hMaxMinusMinLEDMonRatio", "LEDMon amplitude, Ratio to reference run", nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5) ;
 479   //settings for display in amore
 480   hL10->SetTitle("Amplitude_{LEDMon current}/Amplitude_{LEDMon reference}");
 481   hL10->SetMaximum(2.0);
 482   hL10->SetMinimum(0.1);
 483   gStyle->SetOptStat(0);
 484   hL10->UseCurrentStyle();
 485   hL10->SetDirectory(0);
 486 //  hL10->SetOption("E");
 487   Add2RawsList(hL10, kLEDMonRatio, !expert, image, !saveCorr) ;
 488
 489   TH1F * hL11 = new TH1F("hMaxMinusMinLEDMonRatioDist", "LEDMon amplitude, Ratio distribution", nTotLEDMon, 0, 2);
 490   hL11->SetMinimum(0.1) ;
 491   gStyle->SetOptStat(0);
 492   hL11->UseCurrentStyle();
 493   hL11->SetDirectory(0);
 494   Add2RawsList(hL11, kLEDMonRatioDist, !expert, image, !saveCorr) ;
 495
 496   GetCalibRefFromOCDB();
 497   //
 498   ClonePerTrigClass(AliQAv1::kRAWS); // this should be the last line
 499 }
 500
 501 //____________________________________________________________________________
 502 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeESDs(AliESDEvent * esd)
 503 {
 504   // make QA data from ESDs
 505
 506   Int_t nTot = 0 ;
 507   for ( Int_t index = 0; index < esd->GetNumberOfCaloClusters() ; index++ ) {
 508     AliESDCaloCluster * clu = esd->GetCaloCluster(index) ;
 509     if( clu->IsEMCAL() ) {
 510       FillESDsData(kESDCaloClusE,clu->E()) ;
 511       nTot++ ;
 512     }
 513   }
 514   FillESDsData(kESDCaloClusM,nTot) ;
 515
 516   //fill calo cells
 517   AliESDCaloCells* cells = esd->GetEMCALCells();
 518   FillESDsData(kESDCaloCellM,cells->GetNumberOfCells()) ;
 519
 520   for ( Int_t index = 0; index < cells->GetNumberOfCells() ; index++ ) {
 521     FillESDsData(kESDCaloCellA,cells->GetAmplitude(index)) ;
 522   }
 523   //
 524   IncEvCountCycleESDs();
 525   IncEvCountTotalESDs();
 526 }
 527
 528 //____________________________________________________________________________
 529 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeRaws(AliRawReader* rawReader)
 530 {
 531   // Check that all the reference histograms exist before we try to use them - otherwise call InitRaws
 532   // RS: Attention: the counters are increments after custom modification of eventSpecie
 533   if (!fCalibRefHistoPro || !fCalibRefHistoH2F || !fLEDMonRefHistoPro || !fHighEmcHistoH2F) {
 534     InitRaws();
 535   }
 536
 537   // make sure EMCal was readout during the event
 538   Int_t emcID = AliDAQ::DetectorID("EMCAL"); // bit 18..
 539   const UInt_t *detPattern = rawReader->GetDetectorPattern();
 540   UInt_t emcInReadout = ( ((1 << emcID) & detPattern[0]) >> emcID);
 541   if (! emcInReadout) return; // no poInt_t in looking at this event, if no EMCal data
 542
 543   // setup
 544   rawReader->Reset() ;
 545   AliCaloRawStreamV3 in(rawReader,"EMCAL");
 546   rawReader->Select("EMCAL", 0, AliEMCALGeoParams::fgkLastAltroDDL) ; //select EMCAL DDL's
 547
 548   AliRecoParam::EventSpecie_t saveSpecie = fEventSpecie ;
 549   if (rawReader->GetType() == AliRawEventHeaderBase::kCalibrationEvent) {
 550     SetEventSpecie(AliRecoParam::kCalib) ;
 551   }
 552
 553   const Int_t nTowersPerSM = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols; // number of towers in a SuperModule; 24x48
 554   const Int_t nRows        = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows; // number of rows per SuperModule
 555   const Int_t nStripsPerSM = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALLEDRefs; // number of strips per SuperModule
 556   const Int_t n2x2PerSM    = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALTRUsPerSM * AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU; // number of TRU 2x2's per SuperModule
 557   const Int_t n2x2PerTRU   = AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU;
 558
 559   // SM counters; decl. should be safe, assuming we don't get more than expected SuperModules..
 560   Int_t nTotalSMLG[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules]       = {0};
 561   Int_t nTotalSMHG[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules]       = {0};
 562   Int_t nTotalSMTRU[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules]      = {0};
 563   Int_t nTotalSMLGLEDMon[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules] = {0};
 564   Int_t nTotalSMHGLEDMon[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules] = {0};
 565
 566   const Int_t nTRUL0ChannelBits = 10; // used for L0 trigger bits checks
 567   Int_t iSM = 0; // SuperModule index
 568   // start loop over input stream
 569   while (in.NextDDL()) {
 570     Int_t iRCU = in.GetDDLNumber() % 2; // RCU0 or RCU1, within SuperModule
 571     fRawAnalyzer->SetIsZeroSuppressed( in.GetZeroSupp() );
 572
 573     while (in.NextChannel()) {
 574       iSM = in.GetModule(); // SuperModule
 575       //prInt_tf("iSM %d DDL %d", iSM, in.GetDDLNumber());
 576       if (iSM>=0 && iSM<fSuperModules) { // valid module reading
 577
 578         Int_t nsamples = 0;
 579         vector<AliCaloBunchInfo> bunchlist;
 580         while (in.NextBunch()) {
 581           nsamples += in.GetBunchLength();
 582           bunchlist.push_back( AliCaloBunchInfo(in.GetStartTimeBin(), in.GetBunchLength(), in.GetSignals() ) );
 583         }
 584
 585         if (nsamples > 0) { // this check is needed for when we have zero-supp. on, but not sparse readout
 586           Float_t time = 0.;
 587           Float_t amp  = 0.;
 588           // indices for pedestal calc.
 589           Int_t firstPedSample = 0;
 590           Int_t lastPedSample  = 0;
 591           bool isTRUL0IdData   = false;
 592
 593           if (! in.IsTRUData() ) { // high gain, low gain, LED Mon data - all have the same shaper/sampling
 594             AliCaloFitResults fitResults = fRawAnalyzer->Evaluate( bunchlist, in.GetAltroCFG1(), in.GetAltroCFG2());
 595             amp  = fitResults.GetAmp();
 596             time = fitResults.GetTof();
 597             firstPedSample = fFirstPedestalSample;
 598             lastPedSample  = fLastPedestalSample;
 599           }
 600           else { // TRU data is special, needs its own analyzer
 601             AliCaloFitResults fitResults = fRawAnalyzerTRU->Evaluate( bunchlist, in.GetAltroCFG1(), in.GetAltroCFG2());
 602             amp  = fitResults.GetAmp();
 603             time = fitResults.GetTof();
 604             firstPedSample = fFirstPedestalSampleTRU;
 605             lastPedSample  = fLastPedestalSampleTRU;
 606             if (in.GetColumn() > n2x2PerTRU) {
 607               isTRUL0IdData = true;
 608             }
 609           }
 610
 611           // pedestal samples
 612           Int_t nPed = 0;
 613           vector<Int_t> pedSamples;
 614
 615           // select earliest bunch
 616           unsigned int bunchIndex = 0;
 617           unsigned int startBin = bunchlist.at(0).GetStartBin();
 618           if (bunchlist.size() > 0) {
 619             for(unsigned int ui=1; ui < bunchlist.size(); ui++ ) {
 620               if (startBin > bunchlist.at(ui).GetStartBin() ) {
 621                 startBin = bunchlist.at(ui).GetStartBin();
 622                 bunchIndex = ui;
 623               }
 624             }
 625           }
 626
 627           // check bunch for entries in the pedestal sample range
 628           Int_t bunchLength = bunchlist.at(bunchIndex).GetLength();
 629           const UShort_t *sig = bunchlist.at(bunchIndex).GetData();
 630           Int_t timebin = 0;
 631
 632           if (! isTRUL0IdData) { // regular data, can look at pedestals
 633             for (Int_t i = 0; i<bunchLength; i++) {
 634               timebin = startBin--;
 635               if ( firstPedSample<=timebin && timebin<=lastPedSample ) {
 636                 pedSamples.push_back( sig[i] );
 637                 nPed++;
 638               }
 639             } // i
 640           }
 641           else { // TRU L0 Id Data
 642             // which TRU the channel belongs to?
 643             Int_t iTRUId = in.GetModule()*3 + (iRCU*in.GetBranch() + iRCU);
 644
 645             for (Int_t i = 0; i< bunchLength; i++) {
 646               for( Int_t j = 0; j < nTRUL0ChannelBits; j++ ){
 647                 // check if the bit j is 1
 648                 if( (sig[i] & ( 1 << j )) > 0 ){
 649                   Int_t iTRUIdInSM = (in.GetColumn() - n2x2PerTRU)*nTRUL0ChannelBits+j;
 650                   if(iTRUIdInSM < n2x2PerTRU) {
 651                     Int_t iTRUAbsId = iTRUIdInSM + n2x2PerTRU * iTRUId;
 652                     // Fill the histograms
 653                     FillRawsData(kNL0TRU,iTRUAbsId);
 654                     FillRawsData(kTimeL0TRU,iTRUAbsId, startBin);
 655                   }
 656                 }
 657               }
 658               startBin--;
 659             } // i
 660           } // TRU L0 Id data
 661
 662           // fill histograms
 663           if ( in.IsLowGain() || in.IsHighGain() ) { // regular towers
 664             Int_t towerId = iSM*nTowersPerSM + in.GetColumn()*nRows + in.GetRow();
 665             if ( in.IsLowGain() ) {
 666               nTotalSMLG[iSM]++;
 667               if ( (amp > fMinSignalLG) && (amp < fMaxSignalLG) ) {
 668                 FillRawsData(kSigLG,towerId, amp);
 669                 FillRawsData(kTimeLG,towerId, time);
 670               }
 671               if (nPed > 0) {
 672                 for (Int_t i=0; i<nPed; i++) {
 673                   FillRawsData(kPedLG,towerId, pedSamples[i]);
 674                 }
 675               }
 676             } // gain==0
 677             else if ( in.IsHighGain() ) {
 678               nTotalSMHG[iSM]++;
 679               if ( (amp > fMinSignalHG) && (amp < fMaxSignalHG) ) {
 680                 FillRawsData(kSigHG,towerId, amp);
 681                 FillRawsData(kTimeHG,towerId, time);
 682               }
 683               if (nPed > 0) {
 684                 for (Int_t i=0; i<nPed; i++) {
 685                   FillRawsData(kPedHG,towerId, pedSamples[i]);
 686                 }
 687               }
 688             } // gain==1
 689           } // low or high gain
 690           // TRU
 691           else if ( in.IsTRUData() && in.GetColumn()<AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU) {
 692             // for TRU data, the mapping class holds the TRU Int_ternal 2x2 number (0..95) in the Column var..
 693             Int_t iTRU = (iRCU*in.GetBranch() + iRCU); //TRU0 is from RCU0, TRU1 from RCU1, TRU2 is from branch B on RCU1
 694             Int_t iTRU2x2Id = iSM*n2x2PerSM + iTRU*AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU
 695               + in.GetColumn();
 696             nTotalSMTRU[iSM]++;
 697             if ( (amp > fMinSignalTRU) && (amp < fMaxSignalTRU) ) {
 698               FillRawsData(kSigTRU,iTRU2x2Id, amp);
 699               FillRawsData(kTimeTRU,iTRU2x2Id, time);
 700             }
 701             if (nPed > 0) {
 702               for (Int_t i=0; i<nPed; i++) {
 703                 FillRawsData(kPedTRU,iTRU2x2Id, pedSamples[i]);
 704               }
 705             }
 706           }
 707           // LED Mon
 708           else if ( in.IsLEDMonData() ) {
 709             // for LED Mon data, the mapping class holds the gain info in the Row variable
 710             // and the Strip number in the Column..
 711             Int_t gain = in.GetRow();
 712             Int_t stripId = iSM*nStripsPerSM + in.GetColumn();
 713
 714             if ( gain == 0 ) {
 715               nTotalSMLGLEDMon[iSM]++;
 716               if ( (amp > fMinSignalLGLEDMon) && (amp < fMaxSignalLGLEDMon) ) {
 717                 FillRawsData(kSigLGLEDMon,stripId, amp);
 718                 FillRawsData(kTimeLGLEDMon,stripId, time);
 719               }
 720               if (nPed > 0) {
 721                 for (Int_t i=0; i<nPed; i++) {
 722                   FillRawsData(kPedLGLEDMon,stripId, pedSamples[i]);
 723                 }
 724               }
 725             } // gain==0
 726             else if ( gain == 1 ) {
 727               nTotalSMHGLEDMon[iSM]++;
 728               if ( (amp > fMinSignalHGLEDMon) && (amp < fMaxSignalHGLEDMon) ) {
 729                 FillRawsData(kSigHGLEDMon,stripId, amp);
 730                 FillRawsData(kTimeHGLEDMon,stripId, time);
 731               }
 732               if (nPed > 0) {
 733                 for (Int_t i=0; i<nPed; i++) {
 734                   FillRawsData(kPedHGLEDMon,stripId, pedSamples[i]);
 735                 }
 736               }
 737             } // low or high gain
 738           } // LEDMon
 739
 740         } // SM index OK
 741
 742       } // nsamples>0 check, some data found for this channel; not only trailer/header
 743     }// end while over channel
 744
 745   }//end while over DDL's, of input stream
 746
 747
 748   //calculate the ratio of the amplitude and fill the histograms, only if the events type is Calib
 749   // RS: operation on the group of histos kSigHG,k2DRatioAmp,kRatioDist,kLEDMonRatio,kLEDMonRatio,kSigLGLEDMon
 750   const int hGrp[] = {kSigHG,k2DRatioAmp,kRatioDist,kLEDMonRatio,kLEDMonRatioDist,kSigLGLEDMon};
 751   if ( rawReader->GetType() == AliRawEventHeaderBase::kCalibrationEvent &&
 752        CheckCloningConsistency(fRawsQAList, hGrp, sizeof(hGrp)/sizeof(int)) ) {  // RS converting original code to loop over all matching triggers
 753     int nTrig =IsClonedPerTrigClass(kSigHG,fRawsQAList) ? GetNEventTrigClasses() : 0; // loop over triggers only if histos were cloned
 754     //
 755     for (int itr=-1;itr<nTrig;itr++) { // start from -1 to acknowledge original histos if they were kept
 756       TObjArray* trArr = GetMatchingRawsHistosSet(hGrp, sizeof(hGrp)/sizeof(int) ,itr);
 757       if (!trArr) continue;  // no histos for current trigger
 758       //
 759       Double_t binContent = 0.;
 760       TProfile* prSigHG      = (TProfile *)trArr->At(0); //kSigHG
 761       TH1* th2DRatioAmp      = (TH1*) trArr->At(1); //k2DRatioAmp
 762       TH1* thRatioDist       = (TH1*) trArr->At(2); //kRatioDist
 763       TH1* thLEDMonRatio     = (TH1*) trArr->At(3); //kLEDMonRatio
 764       TH1* thLEDMonRatioDist = (TH1*) trArr->At(4); //kLEDMonRatio
 765       TH1* hSigLGLEDMon      = (TH1*) trArr->At(5); //kSigLGLEDMon
 766       th2DRatioAmp->Reset("ICE");
 767       thRatioDist->Reset("ICE");
 768       thLEDMonRatio->Reset("ICE");
 769       thLEDMonRatioDist->Reset("ICE");
 770       th2DRatioAmp->ResetStats();
 771       thRatioDist->ResetStats();
 772       thLEDMonRatio->ResetStats();
 773       thLEDMonRatioDist->ResetStats();
 774       ConvertProfile2H(prSigHG, fHighEmcHistoH2F);
 775       //
 776       for(Int_t ix = 1; ix <= fHighEmcHistoH2F->GetNbinsX(); ix++) {
 777         for(Int_t iy = 1; iy <= fHighEmcHistoH2F->GetNbinsY(); iy++) {
 778           if(fCalibRefHistoH2F->GetBinContent(ix, iy))
 779             binContent = fHighEmcHistoH2F->GetBinContent(ix, iy)/fCalibRefHistoH2F->GetBinContent(ix, iy);
 780           th2DRatioAmp->SetBinContent(ix, iy, binContent);
 781           thRatioDist->Fill(binContent);
 782         }
 783       }
 784       //
 785       //Now for LED monitor system, to calculate the ratio as well
 786       Double_t binError = 0. ;
 787       // for the binError, we add the relative errors, squared
 788       Double_t relativeErrorSqr = 0. ;
 789       //
 790       for(int ib = 1; ib <= fLEDMonRefHistoPro->GetNbinsX(); ib++) {
 791         //
 792         if(fLEDMonRefHistoPro->GetBinContent(ib) != 0) {
 793           binContent = hSigLGLEDMon->GetBinContent(ib) / fLEDMonRefHistoPro->GetBinContent(ib);
 794
 795           relativeErrorSqr = TMath::Power( (fLEDMonRefHistoPro->GetBinError(ib) / fLEDMonRefHistoPro->GetBinContent(ib)), 2);
 796           if( hSigLGLEDMon->GetBinContent(ib) != 0) {
 797             relativeErrorSqr += TMath::Power( (hSigLGLEDMon->GetBinError(ib)/hSigLGLEDMon->GetBinContent(ib)), 2);
 798           }
 799         }
 800         else {
 801           binContent = 0;
 802           relativeErrorSqr = 0;
 803         }
 804         thLEDMonRatio->SetBinContent(ib, binContent);
 805
 806         binError = sqrt(relativeErrorSqr) * binContent;
 807         thLEDMonRatio->SetBinError(ib, binError);
 808         thLEDMonRatioDist->Fill(thLEDMonRatio->GetBinContent(ib));
 809       }
 810     } // loop over eventual trigger clones
 811   }
 812   // let's also fill the SM and event counter histograms
 813   Int_t nTotalHG = 0;
 814   Int_t nTotalLG = 0;
 815   Int_t nTotalTRU = 0;
 816   Int_t nTotalHGLEDMon = 0;
 817   Int_t nTotalLGLEDMon = 0;
 818   for (iSM=0; iSM<fSuperModules; iSM++) {
 819     nTotalLG += nTotalSMLG[iSM];
 820     nTotalHG += nTotalSMHG[iSM];
 821     nTotalTRU += nTotalSMTRU[iSM];
 822     nTotalLGLEDMon += nTotalSMLGLEDMon[iSM];
 823     nTotalHGLEDMon += nTotalSMHGLEDMon[iSM];
 824     FillRawsData(kNsmodLG,iSM, nTotalSMLG[iSM]);
 825     FillRawsData(kNsmodHG,iSM, nTotalSMHG[iSM]);
 826     FillRawsData(kNsmodTRU,iSM, nTotalSMTRU[iSM]);
 827     FillRawsData(kNsmodLGLEDMon,iSM, nTotalSMLGLEDMon[iSM]);
 828     FillRawsData(kNsmodHGLEDMon,iSM, nTotalSMHGLEDMon[iSM]);
 829   }
 830
 831   FillRawsData(kNtotLG,nTotalLG);
 832   FillRawsData(kNtotHG,nTotalHG);
 833   FillRawsData(kNtotTRU,nTotalTRU);
 834   FillRawsData(kNtotLGLEDMon,nTotalLGLEDMon);
 835   FillRawsData(kNtotHGLEDMon,nTotalHGLEDMon);
 836
 837   IncEvCountCycleESDs();
 838   IncEvCountTotalESDs();
 839   SetEventSpecie(saveSpecie) ;
 840   // just in case the next rawreader consumer forgets to reset; let's do it here again..
 841   rawReader->Reset() ;
 842
 843   return;
 844 }
 845
 846 //____________________________________________________________________________
 847 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeDigits()
 848 {
 849   // makes data from Digits
 850   FillDigitsData(1,fDigitsArray->GetEntriesFast()) ;
 851   TIter next(fDigitsArray) ;
 852   AliEMCALDigit * digit ;
 853   while ( (digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(next())) ) {
 854     FillDigitsData(0, digit->GetAmplitude()) ;
 855   }
 856   //
 857 }
 858
 859 //____________________________________________________________________________
 860 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeDigits(TTree * digitTree)
 861 {
 862   // makes data from Digit Tree
 863   // RS: Attention: the counters are increments in the MakeDigits()
 864   if (fDigitsArray)
 865     fDigitsArray->Clear("C") ;
 866   else
 867     fDigitsArray = new TClonesArray("AliEMCALDigit", 1000) ;
 868
 869   TBranch * branch = digitTree->GetBranch("EMCAL") ;
 870   if ( ! branch ) { AliWarning("EMCAL branch in Digit Tree not found"); return; }
 871   //
 872   branch->SetAddress(&fDigitsArray) ;
 873   branch->GetEntry(0) ;
 874   MakeDigits() ;
 875   //
 876   IncEvCountCycleDigits();
 877   IncEvCountTotalDigits();
 878   //
 879 }
 880
 881 //____________________________________________________________________________
 882 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeRecPoints(TTree * clustersTree)
 883 {
 884   // makes data from RecPoints
 885   TBranch *emcbranch = clustersTree->GetBranch("EMCALECARP");
 886   if (!emcbranch) {
 887     AliError("can't get the branch with the EMCAL clusters !");
 888     return;
 889   }
 890
 891   TObjArray * emcRecPoints = new TObjArray(100) ;
 892   emcbranch->SetAddress(&emcRecPoints);
 893   emcbranch->GetEntry(0);
 894
 895   FillRecPointsData(kRecPM,emcRecPoints->GetEntriesFast()) ;
 896   TIter next(emcRecPoints) ;
 897   AliEMCALRecPoint * rp ;
 898   while ( (rp = dynamic_cast<AliEMCALRecPoint *>(next())) ) {
 899     FillRecPointsData(kRecPE,rp->GetEnergy()) ;
 900     FillRecPointsData(kRecPDigM,rp->GetMultiplicity());
 901   }
 902   emcRecPoints->Delete();
 903   delete emcRecPoints;
 904   IncEvCountCycleRecPoints();
 905   IncEvCountTotalRecPoints();
 906 }
 907
 908 //____________________________________________________________________________
 909 void AliEMCALQADataMakerRec::StartOfDetectorCycle()
 910 {
 911   //Detector specific actions at start of cycle
 912
 913 }
 914
 915 //____________________________________________________________________________
 916 void AliEMCALQADataMakerRec::SetFittingAlgorithm(Int_t fitAlgo)
 917 {
 918   //Set fitting algorithm and initialize it if this same algorithm was not set before.
 919   //printf("**** Set Algorithm , number %d ****\n",fitAlgo);
 920
 921
 922   fRawAnalyzer =  AliCaloRawAnalyzerFactory::CreateAnalyzer(fitAlgo);
 923   fFittingAlgorithm = fitAlgo;
 924
 925   /*
 926   if(fitAlgo == fFittingAlgorithm && fRawAnalyzer) {
 927     //Do nothing, this same algorithm already set before.
 928     //printf("**** Algorithm already set before, number %d, %s ****\n",fitAlgo, fRawAnalyzer->GetName());
 929     return;
 930   }
 931   //Initialize the requested algorithm
 932   if(fitAlgo != fFittingAlgorithm || !fRawAnalyzer) {
 933     //printf("**** Init Algorithm , number %d ****\n",fitAlgo);
 934
 935     fFittingAlgorithm = fitAlgo;
 936     if (fRawAnalyzer) delete fRawAnalyzer;  // delete prev. analyzer if existed.
 937
 938     if (fitAlgo == kFastFit) {
 939       fRawAnalyzer = new AliCaloRawAnalyzerFastFit();
 940     }
 941     else if (fitAlgo == kNeuralNet) {
 942       fRawAnalyzer = new AliCaloRawAnalyzerNN();
 943     }
 944     else if (fitAlgo == kLMS) {
 945       fRawAnalyzer = new AliCaloRawAnalyzerLMS();
 946     }
 947     else if (fitAlgo == kPeakFinder) {
 948       fRawAnalyzer = new AliCaloRawAnalyzerPeakFinder();
 949     }
 950     else if (fitAlgo == kCrude) {
 951       fRawAnalyzer = new AliCaloRawAnalyzerCrude();
 952     }
 953     else {
 954       AliWarning("EMCAL QA invalid fit algorithm choice") ;
 955     }
 956
 957   }
 958   return;
 959   */
 960 }
 961
 962 //_____________________________________________________________________________________
 963 void AliEMCALQADataMakerRec::ConvertProfile2H(TProfile * p, TH2 * histo)
 964 {
 965   // reset histogram
 966   histo->Reset("ICE") ;
 967   histo->ResetStats();
 968
 969   Int_t nbinsProf = p->GetNbinsX();
 970
 971   // loop through the TProfile p and fill the TH2F histo
 972   Int_t row = 0;
 973   Int_t col = 0;
 974   Double_t binContent = 0;
 975   Int_t towerNum = 0; // global tower Id
 976   //  i = 0; // tower Id within SuperModule
 977   Int_t iSM = 0; // SuperModule index
 978   Int_t iSMSide = 0; // 0=A, 1=C side
 979   Int_t iSMSector = 0; // 2 SM's per sector
 980
 981   // indices for 2D plots
 982   Int_t col2d = 0;
 983   Int_t row2d = 0;
 984
 985   for (Int_t ibin = 1; ibin <= nbinsProf; ibin++) {
 986     towerNum = (Int_t) p->GetBinCenter(ibin);
 987     binContent = p->GetBinContent(ibin);
 988
 989     // figure out what the tower indices are: col, row within a SuperModule
 990     iSM = towerNum/(AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols);
 991     col = (towerNum/AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows) % (AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols);
 992     row = towerNum % (AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows);
 993
 994     //DecodeTowerNum(towerNum, &SM, &col, &row);
 995     // then we calculate what the global 2D coord are, based on which SM
 996     // we are in
 997     iSMSector = iSM / 2;
 998     iSMSide = iSM % 2;
 999
1000     if (iSMSide == 1) { // C side, shown to the right
1001       col2d = col + AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
1002     }
1003     else { // A side, shown to the left
1004       col2d = col;
1005     }
1006
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