bug in loop, wrong varialble in increment
[u/mrichter/AliRoot.git] / EMCAL / AliEMCALQADataMakerRec.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15 /*
16 Based on the QA code for PHOS written by Yves Schutz July 2007
17
18 Authors:  J.Klay (Cal Poly) May 2008
19           S. Salur LBL April 2008
20  
21 Created one histogram for QA shifter;-- Yaxian Mao: 11/2009
22 The idea:average counts for all the towers should be flat 
23 Change all existing histograms as experts
24
25 Change histograms for DQM shifter: --  Yaxian Mao 04/2010
26 Calcuate the amplitude ratio from current run and the LED reference, for QAChecker use
27 Also calculate the ratio of amplitude from LED Monitor system (current/Reference), to check LED system  
28  
29 */
30
31 // --- ROOT system ---
32 #include <TClonesArray.h>
33 #include <TFile.h> 
34 #include <TH1F.h> 
35 #include <TH1I.h> 
36 #include <TH2F.h> 
37 #include <TLine.h>
38 #include <TText.h>
39 #include <TProfile.h> 
40 #include <TStyle.h>
41 // --- Standard library ---
42
43
44 // --- AliRoot header files ---
45 #include "AliDAQ.h"
46 #include "AliESDCaloCluster.h"
47 #include "AliESDCaloCells.h"
48 #include "AliESDEvent.h"
49 #include "AliLog.h"
50 #include "AliEMCALQADataMakerRec.h"
51 #include "AliQAChecker.h"
52 #include "AliEMCALDigit.h" 
53 #include "AliEMCALRecPoint.h" 
54 #include "AliEMCALRawUtils.h"
55 #include "AliEMCALReconstructor.h"
56 #include "AliEMCALRecParam.h"
57 #include "AliRawReader.h"
58 #include "AliCaloRawStreamV3.h"
59 #include "AliEMCALGeoParams.h"
60 #include "AliRawEventHeaderBase.h"
61 #include "AliQAManager.h"
62 #include "AliCDBEntry.h"
63
64 #include "AliCaloBunchInfo.h"
65 #include "AliCaloFitResults.h"
66 #include "AliCaloRawAnalyzerFastFit.h"
67 #include "AliCaloRawAnalyzerNN.h"
68 #include "AliCaloRawAnalyzerLMS.h"
69 #include "AliCaloRawAnalyzerPeakFinder.h"
70 #include "AliCaloRawAnalyzerCrude.h"
71
72 using namespace std;
73
74 ClassImp(AliEMCALQADataMakerRec)
75            
76 //____________________________________________________________________________ 
77 AliEMCALQADataMakerRec::AliEMCALQADataMakerRec(fitAlgorithm fitAlgo) : 
78   AliQADataMakerRec(AliQAv1::GetDetName(AliQAv1::kEMCAL), "EMCAL Quality Assurance Data Maker"),
79   fFittingAlgorithm(0),
80   fRawAnalyzer(0),
81   fRawAnalyzerTRU(0),
82   fSuperModules(4), // FIXME!!! number of SuperModules; 4 for 2009; update default to 12 for later runs..
83   fFirstPedestalSample(0),
84   fLastPedestalSample(3),
85   fFirstPedestalSampleTRU(0),
86   fLastPedestalSampleTRU(3),
87   fMinSignalLG(0),
88   fMaxSignalLG(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
89   fMinSignalHG(0),
90   fMaxSignalHG(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
91   fMinSignalTRU(0),
92   fMaxSignalTRU(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
93   fMinSignalLGLEDMon(0),
94   fMaxSignalLGLEDMon(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
95   fMinSignalHGLEDMon(0),
96   fMaxSignalHGLEDMon(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
97   fCalibRefHistoPro(NULL),
98   fCalibRefHistoH2F(NULL),
99   fLEDMonRefHistoPro(NULL),
100   fHighEmcHistoH2F(NULL)
101 //  fTextSM(new TText*[fSuperModules]) ,
102 //  fLineCol(NULL),
103 //  fLineRow(NULL)
104
105 {
106   // ctor
107   SetFittingAlgorithm(fitAlgo);
108   fRawAnalyzerTRU = new AliCaloRawAnalyzerLMS();
109   fRawAnalyzerTRU->SetFixTau(kTRUE); 
110   fRawAnalyzerTRU->SetTau(2.5); // default for TRU shaper
111 //  for (Int_t sm = 0 ; sm < fSuperModules ; sm++){
112 //    fTextSM[sm] = NULL ;
113 //  }
114 }
115
116 //____________________________________________________________________________ 
117 AliEMCALQADataMakerRec::AliEMCALQADataMakerRec(const AliEMCALQADataMakerRec& qadm) :
118   AliQADataMakerRec(), 
119   fFittingAlgorithm(0),
120   fRawAnalyzer(0),
121   fRawAnalyzerTRU(0),
122   fSuperModules(qadm.GetSuperModules()), 
123   fFirstPedestalSample(qadm.GetFirstPedestalSample()), 
124   fLastPedestalSample(qadm.GetLastPedestalSample()),  
125   fFirstPedestalSampleTRU(qadm.GetFirstPedestalSampleTRU()), 
126   fLastPedestalSampleTRU(qadm.GetLastPedestalSampleTRU()),  
127   fMinSignalLG(qadm.GetMinSignalLG()),
128   fMaxSignalLG(qadm.GetMaxSignalLG()),
129   fMinSignalHG(qadm.GetMinSignalHG()),
130   fMaxSignalHG(qadm.GetMaxSignalHG()),
131   fMinSignalTRU(qadm.GetMinSignalTRU()),
132   fMaxSignalTRU(qadm.GetMaxSignalTRU()),
133   fMinSignalLGLEDMon(qadm.GetMinSignalLGLEDMon()),
134   fMaxSignalLGLEDMon(qadm.GetMaxSignalLGLEDMon()),
135   fMinSignalHGLEDMon(qadm.GetMinSignalHGLEDMon()),
136   fMaxSignalHGLEDMon(qadm.GetMaxSignalHGLEDMon()),
137   fCalibRefHistoPro(NULL),
138   fCalibRefHistoH2F(NULL),
139   fLEDMonRefHistoPro(NULL),
140   fHighEmcHistoH2F(NULL)
141 //  fTextSM(new TText*[fSuperModules]) ,
142 //  fLineCol(NULL),
143 //  fLineRow(NULL)
144 {
145   //copy ctor 
146   SetName((const char*)qadm.GetName()) ; 
147   SetTitle((const char*)qadm.GetTitle()); 
148   SetFittingAlgorithm(qadm.GetFittingAlgorithm());
149   fRawAnalyzerTRU = new AliCaloRawAnalyzerLMS();
150   fRawAnalyzerTRU->SetFixTau(kTRUE); 
151   fRawAnalyzerTRU->SetTau(2.5); // default for TRU shaper
152 //  for (Int_t sm = 0 ; sm < fSuperModules ; sm++){
153 //    fTextSM[sm] = qadm.fTextSM[sm] ;
154 //  }  
155 }
156
157 //__________________________________________________________________
158 AliEMCALQADataMakerRec& AliEMCALQADataMakerRec::operator = (const AliEMCALQADataMakerRec& qadm )
159 {
160   // Equal operator.
161   this->~AliEMCALQADataMakerRec();
162   new(this) AliEMCALQADataMakerRec(qadm);
163 //  fLineCol = NULL;
164 //  fLineRow = NULL;
165 //  for (Int_t sm = 0 ; sm < fSuperModules ; sm++){
166 //    fTextSM[sm] = qadm.fTextSM[sm] ;
167 //  }    
168   return *this;
169 }
170  
171 //____________________________________________________________________________ 
172 void AliEMCALQADataMakerRec::EndOfDetectorCycle(AliQAv1::TASKINDEX_t task, TObjArray ** list)
173 {
174   //Detector specific actions at end of cycle
175         
176 //  if(fCycleCounter)
177 //        GetRawsData(kNEventsPerTower)->Scale(1./fCycleCounter);
178
179   // do the QA checking
180   AliQAChecker::Instance()->Run(AliQAv1::kEMCAL, task, list) ;  
181 }
182
183 //____________________________________________________________________________ 
184 void AliEMCALQADataMakerRec::GetCalibRefFromOCDB()
185 {
186   //Get the reference histogram from OCDB
187   TString sName1("hHighEmcalRawMaxMinusMin") ;
188   TString sName2("hLowLEDMonEmcalRawMaxMinusMin") ;
189   sName1.Prepend(Form("%s_", AliRecoParam::GetEventSpecieName(AliRecoParam::kCalib))) ; 
190   sName2.Prepend(Form("%s_", AliRecoParam::GetEventSpecieName(AliRecoParam::kCalib))) ; 
191   
192   TString refStorage(AliQAv1::GetQARefStorage()) ;
193   if (!refStorage.Contains(AliQAv1::GetLabLocalOCDB()) && !refStorage.Contains(AliQAv1::GetLabAliEnOCDB())) {
194     AliFatal(Form("%s is not a valid location for reference data", refStorage.Data())) ; 
195   } else {
196     AliQAManager* manQA = AliQAManager::QAManager(AliQAv1::kRAWS) ;    
197     AliQAv1::SetQARefDataDirName(AliRecoParam::kCalib) ;
198     if ( ! manQA->GetLock() ) { 
199       manQA->SetDefaultStorage(AliQAv1::GetQARefStorage()) ; 
200       manQA->SetSpecificStorage("*", AliQAv1::GetQARefStorage()) ;
201       manQA->SetRun(AliCDBManager::Instance()->GetRun()) ; 
202       manQA->SetLock() ; 
203     }
204     char * detOCDBDir = Form("%s/%s/%s", GetName(), AliQAv1::GetRefOCDBDirName(), AliQAv1::GetRefDataDirName()) ; 
205     AliCDBEntry * entry = manQA->Get(detOCDBDir, manQA->GetRun()) ;
206     if (entry) {
207       TList * listDetQAD =static_cast<TList *>(entry->GetObject()) ;
208       if ( strcmp(listDetQAD->ClassName(), "TList") != 0 ) {
209         AliError(Form("Expected a Tlist and found a %s for detector %s", listDetQAD->ClassName(), GetName())) ; 
210         listDetQAD = NULL ; 
211       }
212       TObjArray * dirOCDB= NULL ; 
213       if ( listDetQAD )
214         dirOCDB = static_cast<TObjArray *>(listDetQAD->FindObject(Form("%s/%s", AliQAv1::GetTaskName(AliQAv1::kRAWS).Data(), AliRecoParam::GetEventSpecieName(AliRecoParam::kCalib)))) ;       
215       if (dirOCDB){
216         fCalibRefHistoPro = dynamic_cast<TProfile *>(dirOCDB->FindObject(sName1.Data())) ; 
217         fLEDMonRefHistoPro = dynamic_cast<TProfile *>(dirOCDB->FindObject(sName2.Data())) ; 
218       }
219     }
220   }
221  
222   if(fCalibRefHistoPro && fLEDMonRefHistoPro){
223     
224     //Defining histograms binning, each 2D histogram covers all SMs
225     Int_t nSMSectors = fSuperModules / 2; // 2 SMs per sector
226     Int_t nbinsZ = 2*AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
227     Int_t nbinsPhi = nSMSectors * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows;
228     
229     if(!fCalibRefHistoH2F)
230       fCalibRefHistoH2F =  new TH2F("hCalibRefHisto", "hCalibRefHisto", nbinsZ, -0.5, nbinsZ - 0.5, nbinsPhi, -0.5, nbinsPhi -0.5);
231     ConvertProfile2H(fCalibRefHistoPro,fCalibRefHistoH2F) ; 
232   } else {
233     AliFatal(Form("No reference object with name %s or %s found", sName1.Data(), sName2.Data())) ; 
234   }
235 }
236 //____________________________________________________________________________ 
237 void AliEMCALQADataMakerRec::InitESDs()
238 {
239   //Create histograms to controll ESD
240   const Bool_t expert   = kTRUE ; 
241   const Bool_t image    = kTRUE ; 
242   
243   TH1F * h1 = new TH1F("hESDCaloClusterE",  "ESDs CaloCluster energy in EMCAL;Energy [GeV];Counts",    200, 0., 100.) ; 
244   h1->Sumw2() ;
245   Add2ESDsList(h1, kESDCaloClusE, !expert, image)  ;                                                     
246
247   TH1I * h2 = new TH1I("hESDCaloClusterM", "ESDs CaloCluster multiplicity in EMCAL;# of Clusters;Entries", 100, 0,  100) ; 
248   h2->Sumw2() ;
249   Add2ESDsList(h2, kESDCaloClusM, !expert, image)  ;
250
251   TH1F * h3 = new TH1F("hESDCaloCellA",  "ESDs CaloCell amplitude in EMCAL;Energy [GeV];Counts",    500, 0., 50.) ; 
252   h3->Sumw2() ;
253   Add2ESDsList(h3, kESDCaloCellA, !expert, image)  ;  
254  
255   TH1I * h4 = new TH1I("hESDCaloCellM", "ESDs CaloCell multiplicity in EMCAL;# of Clusters;Entries", 200, 0,  1000) ; 
256   h4->Sumw2() ;
257   Add2ESDsList(h4, kESDCaloCellM, !expert, image) ;
258         
259 }
260
261 //____________________________________________________________________________ 
262 void AliEMCALQADataMakerRec::InitDigits()
263 {
264   // create Digits histograms in Digits subdir
265   const Bool_t expert   = kTRUE ; 
266   const Bool_t image    = kTRUE ; 
267   
268   TH1I * h0 = new TH1I("hEmcalDigits",    "Digits amplitude distribution in EMCAL;Amplitude [ADC counts];Counts",    500, 0, 500) ; 
269   h0->Sumw2() ;
270   Add2DigitsList(h0, 0, !expert, image) ;
271   TH1I * h1 = new TH1I("hEmcalDigitsMul", "Digits multiplicity distribution in EMCAL;# of Digits;Entries", 200, 0, 2000) ; 
272   h1->Sumw2() ;
273   Add2DigitsList(h1, 1, !expert, image) ;
274 }
275
276 //____________________________________________________________________________ 
277 void AliEMCALQADataMakerRec::InitRecPoints()
278 {
279   // create Reconstructed PoInt_ts histograms in RecPoints subdir
280   const Bool_t expert   = kTRUE ; 
281   const Bool_t image    = kTRUE ; 
282   
283   TH1F* h0 = new TH1F("hEMCALRpE","EMCAL RecPoint energies;Energy [GeV];Counts",200, 0.,20.); //GeV
284   h0->Sumw2();
285   Add2RecPointsList(h0,kRecPE, !expert, image);
286
287   TH1I* h1 = new TH1I("hEMCALRpM","EMCAL RecPoint multiplicities;# of Clusters;Entries",100,0,100);
288   h1->Sumw2();
289   Add2RecPointsList(h1,kRecPM, !expert, image);
290
291   TH1I* h2 = new TH1I("hEMCALRpDigM","EMCAL RecPoint Digit Multiplicities;# of Digits;Entries",20,0,20);
292   h2->Sumw2();
293   Add2RecPointsList(h2,kRecPDigM, !expert, image);
294
295 }
296
297 //____________________________________________________________________________ 
298 void AliEMCALQADataMakerRec::InitRaws()
299 {
300   // create Raws histograms in Raws subdir
301   const Bool_t expert   = kTRUE ; 
302   const Bool_t saveCorr = kTRUE ; 
303   const Bool_t image    = kTRUE ; 
304   const Option_t *profileOption = "s";
305
306   Int_t nTowersPerSM = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols; // number of towers in a SuperModule; 24x48
307   Int_t nTot = fSuperModules * nTowersPerSM; // max number of towers in all SuperModules
308     
309   //Defining histograms binning, each 2D histogram covers all SMs
310   Int_t nSMSectors = fSuperModules / 2; // 2 SMs per sector
311   Int_t nbinsZ = 2*AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
312   Int_t nbinsPhi = nSMSectors * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows;
313    
314    // counter info: number of channels per event (bins are SM index)
315   TProfile * h0 = new TProfile("hLowEmcalSupermodules", "Low Gain EMC: # of towers vs SuperMod;SM Id;# of towers",
316                                fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5, profileOption) ;
317   Add2RawsList(h0, kNsmodLG, expert, !image, !saveCorr) ;
318   TProfile * h1 = new TProfile("hHighEmcalSupermodules", "High Gain EMC: # of towers vs SuperMod;SM Id;# of towers",  
319                                fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5, profileOption) ; 
320   Add2RawsList(h1, kNsmodHG, expert, !image, !saveCorr) ;
321
322   // where did max sample occur? (bins are towers)
323   TProfile * h2 = new TProfile("hLowEmcalRawtime", "Low Gain EMC: Time at Max vs towerId;Tower Id;Time [ticks]", 
324                                nTot, -0.5, nTot-0.5, profileOption) ;
325   Add2RawsList(h2, kTimeLG, expert, !image, !saveCorr) ;
326   TProfile * h3 = new TProfile("hHighEmcalRawtime", "High Gain EMC: Time at Max vs towerId;Tower Id;Time [ticks]", 
327                                nTot, -0.5, nTot-0.5, profileOption) ;
328   Add2RawsList(h3, kTimeHG, expert, !image, !saveCorr) ;
329
330   // how much above pedestal was the max sample?  (bins are towers)
331   TProfile * h4 = new TProfile("hLowEmcalRawMaxMinusMin", "Low Gain EMC: Max - Min vs towerId;Tower Id;Max-Min [ADC counts]", 
332                                nTot, -0.5, nTot-0.5, profileOption) ;
333   Add2RawsList(h4, kSigLG, expert, image, !saveCorr) ;
334   TProfile * h5 = new TProfile("hHighEmcalRawMaxMinusMin", "High Gain EMC: Max - Min vs towerId;Tower Id;Max-Min [ADC counts]",
335                                nTot, -0.5, nTot-0.5, profileOption) ;
336   Add2RawsList(h5, kSigHG, expert, image, !saveCorr) ;
337
338   // total counter: channels per event
339   TH1I * h6 = new TH1I("hLowNtot", "Low Gain EMC: Total Number of found towers;# of Towers;Counts", 200, 0, nTot) ;
340   h6->Sumw2() ;
341   Add2RawsList(h6, kNtotLG, expert, !image, !saveCorr) ;
342   TH1I * h7 = new TH1I("hHighNtot", "High Gain EMC: Total Number of found towers;# of Towers;Counts", 200,0, nTot) ;
343   h7->Sumw2() ;
344   Add2RawsList(h7, kNtotHG, expert, !image, !saveCorr) ;
345
346   // pedestal (bins are towers)
347   TProfile * h8 = new TProfile("hLowEmcalRawPed", "Low Gain EMC: Pedestal vs towerId;Tower Id;Pedestal [ADC counts]", 
348                                nTot, -0.5, nTot-0.5, profileOption) ;
349   Add2RawsList(h8, kPedLG, expert, !image, !saveCorr) ;
350   TProfile * h9 = new TProfile("hHighEmcalRawPed", "High Gain EMC: Pedestal vs towerId;Tower Id;Pedestal [ADC counts]",
351                                nTot, -0.5, nTot-0.5, profileOption) ;
352   Add2RawsList(h9, kPedHG, expert, !image, !saveCorr) ;
353         
354   //temp 2D amplitude histogram for the current run
355   fHighEmcHistoH2F = new TH2F("h2DHighEC2", "High Gain EMC:Max - Min [ADC counts]", nbinsZ, -0.5 , nbinsZ-0.5, nbinsPhi, -0.5, nbinsPhi-0.5);
356    fHighEmcHistoH2F->SetDirectory(0) ; // this histo must be memory resident
357   //add ratio histograms: to comapre the current run with the reference data 
358   TH2F * h15 = new TH2F("h2DRatioAmp", "High Gain Ratio to Reference:Amplitude_{current run}/Amplitude_{reference run}", nbinsZ, -0.5 , nbinsZ-0.5, 
359                         nbinsPhi, -0.5, nbinsPhi-0.5);
360   //settings for display in amore
361   h15->SetTitle("Amplitude_{current run}/Amplitude_{reference run}"); 
362   h15->SetMaximum(2.0);
363   h15->SetMinimum(0.1);
364   h15->SetOption("COLZ");
365   gStyle->SetOptStat(0);
366   Int_t color[] = {4,3,2} ;
367   gStyle->SetPalette(3,color);
368   h15->GetZaxis()->SetNdivisions(3);
369   h15->UseCurrentStyle();
370   h15->SetDirectory(0);
371   Add2RawsList(h15, k2DRatioAmp, !expert, image, !saveCorr) ;
372
373         TH1F * h16 = new TH1F("hRatioDist", "Amplitude_{current run}/Amplitude_{reference run} ratio distribution", nTot, 0., 2.);
374   h16->SetMinimum(0.1); 
375   h16->SetMaximum(100.);
376   gStyle->SetOptStat(0);
377   h16->UseCurrentStyle();
378   h16->SetDirectory(0);
379   Add2RawsList(h16, kRatioDist, !expert, image, !saveCorr) ;
380  
381   // now repeat the same for TRU and LEDMon data
382   Int_t nTot2x2 = fSuperModules * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALTRUsPerSM * AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU; // max number of TRU channels for all SuperModules
383
384   // counter info: number of channels per event (bins are SM index)
385   TProfile * hT0 = new TProfile("hTRUEmcalSupermodules", "TRU EMC: # of TRU channels vs SuperMod;SM Id;# of TRU channels",
386                                 fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5, profileOption) ;
387   Add2RawsList(hT0, kNsmodTRU, expert, !image, !saveCorr) ;
388
389   // where did max sample occur? (bins are TRU channels)
390   TProfile * hT1 = new TProfile("hTRUEmcalRawtime", "TRU EMC: Time at Max vs 2x2Id;2x2 Id;Time [ticks]", 
391                                 nTot2x2, -0.5, nTot2x2-0.5, profileOption) ;
392   Add2RawsList(hT1, kTimeTRU, expert, !image, !saveCorr) ;
393
394   // how much above pedestal was the max sample?  (bins are TRU channels)
395   TProfile * hT2 = new TProfile("hTRUEmcalRawMaxMinusMin", "TRU EMC: Max - Min vs 2x2Id;2x2 Id;Max-Min [ADC counts]", 
396                                 nTot2x2, -0.5, nTot2x2-0.5, profileOption) ;
397   Add2RawsList(hT2, kSigTRU, expert, !image, !saveCorr) ;
398
399   // total counter: channels per event
400   TH1I * hT3 = new TH1I("hTRUNtot", "TRU EMC: Total Number of found TRU channels;# of TRU Channels;Counts", 200, 0, nTot2x2) ;
401   hT3->Sumw2() ;
402   Add2RawsList(hT3, kNtotTRU, expert, !image, !saveCorr) ;
403
404   // pedestal (bins are TRU channels)
405   TProfile * hT4 = new TProfile("hTRUEmcalRawPed", "TRU EMC: Pedestal vs 2x2Id;2x2 Id;Pedestal [ADC counts]", 
406                                 nTot2x2, -0.5, nTot2x2-0.5, profileOption) ;
407   Add2RawsList(hT4, kPedTRU, expert, !image, !saveCorr) ;
408
409   // L0 trigger hits: # of hits (bins are TRU channels)
410   TH1I * hT5 = new TH1I("hTRUEmcalL0hits", "L0 trigger hits: Total number of 2x2 L0 generated", nTot2x2, -0.5, nTot2x2);
411   hT5->Sumw2();
412   Add2RawsList(hT5, kNL0TRU, expert, !image, !saveCorr);
413
414   // L0 trigger hits: average time (bins are TRU channels)
415   TProfile * hT6 = new TProfile("hTRUEmcalL0hitsAvgTime", "L0 trigger hits: average time bin", nTot2x2, -0.5, nTot2x2, profileOption); 
416   Add2RawsList(hT6, kTimeL0TRU, expert, !image, !saveCorr);
417
418   // and also LED Mon..
419   // LEDMon has both high and low gain channels, just as regular FEE/towers
420   Int_t nTotLEDMon = fSuperModules * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALLEDRefs; // max number of LEDMon channels for all SuperModules
421
422   // counter info: number of channels per event (bins are SM index)
423   TProfile * hL0 = new TProfile("hLowLEDMonEmcalSupermodules", "LowLEDMon Gain EMC: # of strips vs SuperMod;SM Id;# of strips",
424                                fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5, profileOption) ;
425   Add2RawsList(hL0, kNsmodLGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
426   TProfile * hL1 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalSupermodules", "HighLEDMon Gain EMC: # of strips vs SuperMod;SM Id;# of strips",  
427                                fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5, profileOption) ; 
428   Add2RawsList(hL1, kNsmodHGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
429
430   // where did max sample occur? (bins are strips)
431   TProfile * hL2 = new TProfile("hLowLEDMonEmcalRawtime", "LowLEDMon Gain EMC: Time at Max vs stripId;Strip Id;Time [ticks]", 
432                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5, profileOption) ;
433   Add2RawsList(hL2, kTimeLGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
434   TProfile * hL3 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalRawtime", "HighLEDMon Gain EMC: Time at Max vs stripId;Strip Id;Time [ticks]", 
435                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5, profileOption) ;
436   Add2RawsList(hL3, kTimeHGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
437
438   // how much above pedestal was the max sample?  (bins are strips)
439   TProfile * hL4 = new TProfile("hLowLEDMonEmcalRawMaxMinusMin", "LowLEDMon Gain EMC: Max - Min vs stripId;Strip Id;Max-Min [ADC counts]", 
440                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5, profileOption) ;
441   Add2RawsList(hL4, kSigLGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
442   TProfile * hL5 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalRawMaxMinusMin", "HighLEDMon Gain EMC: Max - Min vs stripId;Strip Id;Max-Min [ADC counts]",
443                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5, profileOption) ;
444   Add2RawsList(hL5, kSigHGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
445   
446     // total counter: channels per event
447   TH1I * hL6 = new TH1I("hLowLEDMonNtot", "LowLEDMon Gain EMC: Total Number of found strips;# of Strips;Counts", 200, 0, nTotLEDMon) ;
448   hL6->Sumw2() ;
449   Add2RawsList(hL6, kNtotLGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
450   TH1I * hL7 = new TH1I("hHighLEDMonNtot", "HighLEDMon Gain EMC: Total Number of found strips;# of Strips;Counts", 200,0, nTotLEDMon) ;
451   hL7->Sumw2() ;
452   Add2RawsList(hL7, kNtotHGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
453
454   // pedestal (bins are strips)
455   TProfile * hL8 = new TProfile("hLowLEDMonEmcalRawPed", "LowLEDMon Gain EMC: Pedestal vs stripId;Strip Id;Pedestal [ADC counts]", 
456                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5, profileOption) ;
457   Add2RawsList(hL8, kPedLGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
458   TProfile * hL9 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalRawPed", "HighLEDMon Gain EMC: Pedestal vs stripId;Strip Id;Pedestal [ADC counts]",
459                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5, profileOption) ;
460   Add2RawsList(hL9, kPedHGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
461   
462   //add two histograms for shifter from the LED monitor system: comapre LED monitor with the reference run
463   //to be used for decision whether we need to change reference data
464   TH1F * hL10 = new TH1F("hMaxMinusMinLEDMonRatio", "LEDMon amplitude, Ratio to reference run", nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5) ;
465   //settings for display in amore
466   hL10->SetTitle("Amplitude_{LEDMon current}/Amplitude_{LEDMon reference}"); 
467   hL10->SetMaximum(2.0);
468   hL10->SetMinimum(0.1); 
469   gStyle->SetOptStat(0);
470   hL10->UseCurrentStyle();
471   hL10->SetDirectory(0);
472 //  hL10->SetOption("E");
473   Add2RawsList(hL10, kLEDMonRatio, !expert, image, !saveCorr) ;
474
475   TH1F * hL11 = new TH1F("hMaxMinusMinLEDMonRatioDist", "LEDMon amplitude, Ratio distribution", nTotLEDMon, 0, 2);
476   hL11->SetMinimum(0.1) ;
477   gStyle->SetOptStat(0);
478   hL11->UseCurrentStyle();
479   hL11->SetDirectory(0);
480   Add2RawsList(hL11, kLEDMonRatioDist, !expert, image, !saveCorr) ;
481   
482   GetCalibRefFromOCDB();   
483 }
484
485 //____________________________________________________________________________
486 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeESDs(AliESDEvent * esd)
487 {
488   // make QA data from ESDs
489
490   Int_t nTot = 0 ; 
491   for ( Int_t index = 0; index < esd->GetNumberOfCaloClusters() ; index++ ) {
492     AliESDCaloCluster * clu = esd->GetCaloCluster(index) ;
493     if( clu->IsEMCAL() ) {
494       GetESDsData(kESDCaloClusE)->Fill(clu->E()) ;
495       nTot++ ;
496     } 
497   }
498   GetESDsData(kESDCaloClusM)->Fill(nTot) ;
499
500   //fill calo cells
501   AliESDCaloCells* cells = esd->GetEMCALCells();
502   GetESDsData(kESDCaloCellM)->Fill(cells->GetNumberOfCells()) ;
503
504   for ( Int_t index = 0; index < cells->GetNumberOfCells() ; index++ ) {
505     GetESDsData(kESDCaloCellA)->Fill(cells->GetAmplitude(index)) ;
506   }
507
508 }
509
510 //____________________________________________________________________________
511 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeRaws(AliRawReader* rawReader)
512 {
513  // Check that all the reference histograms exist before we try to use them - otherwise call InitRaws
514   if (!fCalibRefHistoPro || !fCalibRefHistoH2F || !fLEDMonRefHistoPro || !fHighEmcHistoH2F) {
515     InitRaws();
516   }
517
518   // make sure EMCal was readout during the event
519   Int_t emcID = AliDAQ::DetectorID("EMCAL"); // bit 18..
520   const UInt_t *detPattern = rawReader->GetDetectorPattern(); 
521   UInt_t emcInReadout = ( ((1 << emcID) & detPattern[0]) >> emcID);
522   if (! emcInReadout) return; // no poInt_t in looking at this event, if no EMCal data
523
524   // setup
525   rawReader->Reset() ;
526   AliCaloRawStreamV3 in(rawReader,"EMCAL"); 
527   rawReader->Select("EMCAL", 0, AliEMCALGeoParams::fgkLastAltroDDL) ; //select EMCAL DDL's 
528
529   AliRecoParam::EventSpecie_t saveSpecie = fEventSpecie ;
530
531   if (rawReader->GetType() == AliRawEventHeaderBase::kCalibrationEvent) { 
532     SetEventSpecie(AliRecoParam::kCalib) ;
533   }
534  
535   const Int_t nTowersPerSM = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols; // number of towers in a SuperModule; 24x48
536   const Int_t nRows        = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows; // number of rows per SuperModule
537   const Int_t nStripsPerSM = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALLEDRefs; // number of strips per SuperModule
538   const Int_t n2x2PerSM    = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALTRUsPerSM * AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU; // number of TRU 2x2's per SuperModule
539   const Int_t n2x2PerTRU   = AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU;
540
541   // SM counters; decl. should be safe, assuming we don't get more than expected SuperModules..
542   Int_t nTotalSMLG[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules]       = {0};
543   Int_t nTotalSMHG[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules]       = {0};
544   Int_t nTotalSMTRU[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules]      = {0};
545   Int_t nTotalSMLGLEDMon[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules] = {0};
546   Int_t nTotalSMHGLEDMon[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules] = {0};
547
548   const Int_t nTRUL0ChannelBits = 10; // used for L0 trigger bits checks
549   Int_t iSM = 0; // SuperModule index 
550   // start loop over input stream  
551   while (in.NextDDL()) {
552     Int_t iRCU = in.GetDDLNumber() % 2; // RCU0 or RCU1, within SuperModule
553     fRawAnalyzer->SetIsZeroSuppressed( in.GetZeroSupp() ); 
554
555     while (in.NextChannel()) {
556       iSM = in.GetModule(); // SuperModule
557       //prInt_tf("iSM %d DDL %d", iSM, in.GetDDLNumber()); 
558       if (iSM>=0 && iSM<fSuperModules) { // valid module reading
559
560         Int_t nsamples = 0;
561         vector<AliCaloBunchInfo> bunchlist; 
562         while (in.NextBunch()) {
563           nsamples += in.GetBunchLength();
564           bunchlist.push_back( AliCaloBunchInfo(in.GetStartTimeBin(), in.GetBunchLength(), in.GetSignals() ) );
565         } 
566         
567         if (nsamples > 0) { // this check is needed for when we have zero-supp. on, but not sparse readout
568           Float_t time = 0.; 
569           Float_t amp  = 0.; 
570           // indices for pedestal calc.
571           Int_t firstPedSample = 0;
572           Int_t lastPedSample  = 0;
573           bool isTRUL0IdData   = false;
574
575           if (! in.IsTRUData() ) { // high gain, low gain, LED Mon data - all have the same shaper/sampling 
576             AliCaloFitResults fitResults = fRawAnalyzer->Evaluate( bunchlist, in.GetAltroCFG1(), in.GetAltroCFG2()); 
577             amp  = fitResults.GetAmp();
578             time = fitResults.GetTof(); 
579             firstPedSample = fFirstPedestalSample;
580             lastPedSample  = fLastPedestalSample;
581           }
582           else { // TRU data is special, needs its own analyzer
583             AliCaloFitResults fitResults = fRawAnalyzerTRU->Evaluate( bunchlist, in.GetAltroCFG1(), in.GetAltroCFG2()); 
584             amp  = fitResults.GetAmp();
585             time = fitResults.GetTof(); 
586             firstPedSample = fFirstPedestalSampleTRU;
587             lastPedSample  = fLastPedestalSampleTRU;
588             if (in.GetColumn() > n2x2PerTRU) {
589               isTRUL0IdData = true;
590             }
591           }
592   
593           // pedestal samples
594           Int_t nPed = 0;
595           vector<Int_t> pedSamples; 
596         
597           // select earliest bunch 
598           unsigned int bunchIndex = 0;
599           unsigned int startBin = bunchlist.at(0).GetStartBin();
600           if (bunchlist.size() > 0) {
601             for(unsigned int ui=1; ui < bunchlist.size(); ui++ ) {
602               if (startBin > bunchlist.at(ui).GetStartBin() ) {
603                 startBin = bunchlist.at(ui).GetStartBin();
604                 bunchIndex = ui;
605               }
606             }
607           }
608
609           // check bunch for entries in the pedestal sample range
610           Int_t bunchLength = bunchlist.at(bunchIndex).GetLength(); 
611           const UShort_t *sig = bunchlist.at(bunchIndex).GetData();
612           Int_t timebin = 0;
613
614           if (! isTRUL0IdData) { // regular data, can look at pedestals
615             for (Int_t i = 0; i<bunchLength; i++) {
616               timebin = startBin--;
617               if ( firstPedSample<=timebin && timebin<=lastPedSample ) {
618                 pedSamples.push_back( sig[i] );
619                 nPed++;
620               }     
621             } // i
622           }
623           else { // TRU L0 Id Data
624             // which TRU the channel belongs to?
625             Int_t iTRUId = in.GetModule()*3 + (iRCU*in.GetBranch() + iRCU);
626
627             for (Int_t i = 0; i< bunchLength; i++) {
628               for( Int_t j = 0; j < nTRUL0ChannelBits; j++ ){
629                 // check if the bit j is 1
630                 if( (sig[i] & ( 1 << j )) > 0 ){
631                   Int_t iTRUIdInSM = (in.GetColumn() - n2x2PerTRU)*nTRUL0ChannelBits+j;
632                   if(iTRUIdInSM < n2x2PerTRU) {
633                     Int_t iTRUAbsId = iTRUIdInSM + n2x2PerTRU * iTRUId;
634                     // Fill the histograms
635                     GetRawsData(kNL0TRU)->Fill(iTRUAbsId);
636                     GetRawsData(kTimeL0TRU)->Fill(iTRUAbsId, startBin);
637                   }
638                 }
639               }
640               startBin--;
641             } // i      
642           } // TRU L0 Id data                   
643
644           // fill histograms
645           if ( in.IsLowGain() || in.IsHighGain() ) { // regular towers
646             Int_t towerId = iSM*nTowersPerSM + in.GetColumn()*nRows + in.GetRow();
647             if ( in.IsLowGain() ) { 
648               nTotalSMLG[iSM]++; 
649               if ( (amp > fMinSignalLG) && (amp < fMaxSignalLG) ) { 
650                 GetRawsData(kSigLG)->Fill(towerId, amp);
651                 GetRawsData(kTimeLG)->Fill(towerId, time);
652               }
653               if (nPed > 0) {
654                 for (Int_t i=0; i<nPed; i++) {
655                   GetRawsData(kPedLG)->Fill(towerId, pedSamples[i]);
656                 }
657               }
658             } // gain==0
659             else if ( in.IsHighGain() ) {               
660               nTotalSMHG[iSM]++; 
661               if ( (amp > fMinSignalHG) && (amp < fMaxSignalHG) ) { 
662                 GetRawsData(kSigHG)->Fill(towerId, amp);
663                 GetRawsData(kTimeHG)->Fill(towerId, time);
664               } 
665               if (nPed > 0) {
666                 for (Int_t i=0; i<nPed; i++) {
667                   GetRawsData(kPedHG)->Fill(towerId, pedSamples[i]);
668                 }
669               }
670             } // gain==1
671           } // low or high gain
672           // TRU
673           else if ( in.IsTRUData() && in.GetColumn()<AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU) {
674             // for TRU data, the mapping class holds the TRU Int_ternal 2x2 number (0..95) in the Column var..
675             Int_t iTRU = (iRCU*in.GetBranch() + iRCU); //TRU0 is from RCU0, TRU1 from RCU1, TRU2 is from branch B on RCU1
676             Int_t iTRU2x2Id = iSM*n2x2PerSM + iTRU*AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU 
677               + in.GetColumn();
678             nTotalSMTRU[iSM]++; 
679             if ( (amp > fMinSignalTRU) && (amp < fMaxSignalTRU) ) { 
680               GetRawsData(kSigTRU)->Fill(iTRU2x2Id, amp);
681               GetRawsData(kTimeTRU)->Fill(iTRU2x2Id, time);
682             }
683             if (nPed > 0) {
684               for (Int_t i=0; i<nPed; i++) {
685                 GetRawsData(kPedTRU)->Fill(iTRU2x2Id, pedSamples[i]);
686               }
687             }
688           }
689           // LED Mon
690           else if ( in.IsLEDMonData() ) {
691             // for LED Mon data, the mapping class holds the gain info in the Row variable
692             // and the Strip number in the Column..
693             Int_t gain = in.GetRow(); 
694             Int_t stripId = iSM*nStripsPerSM + in.GetColumn();
695           
696             if ( gain == 0 ) { 
697               nTotalSMLGLEDMon[iSM]++; 
698               if ( (amp > fMinSignalLGLEDMon) && (amp < fMaxSignalLGLEDMon) ) { 
699                 GetRawsData(kSigLGLEDMon)->Fill(stripId, amp);
700                 GetRawsData(kTimeLGLEDMon)->Fill(stripId, time);
701               }
702               if (nPed > 0) {
703                 for (Int_t i=0; i<nPed; i++) {
704                   GetRawsData(kPedLGLEDMon)->Fill(stripId, pedSamples[i]);
705                 }
706               }
707             } // gain==0
708             else if ( gain == 1 ) {             
709               nTotalSMHGLEDMon[iSM]++; 
710               if ( (amp > fMinSignalHGLEDMon) && (amp < fMaxSignalHGLEDMon) ) { 
711                 GetRawsData(kSigHGLEDMon)->Fill(stripId, amp);
712                 GetRawsData(kTimeHGLEDMon)->Fill(stripId, time);
713               }
714               if (nPed > 0) {
715                 for (Int_t i=0; i<nPed; i++) {
716                   GetRawsData(kPedHGLEDMon)->Fill(stripId, pedSamples[i]);
717                 }
718               }
719             } // low or high gain
720           } // LEDMon
721
722         } // SM index OK
723
724       } // nsamples>0 check, some data found for this channel; not only trailer/header
725     }// end while over channel 
726    
727   }//end while over DDL's, of input stream 
728
729  // TProfile * p = dynamic_cast<TProfile *>(GetRawsData(kSigHG)) ;
730   ConvertProfile2H(dynamic_cast<TProfile *>(GetRawsData(kSigHG)), fHighEmcHistoH2F) ;  
731   Double_t binContent = 0. ;
732   
733   //reset ratio histograms
734   GetRawsData(k2DRatioAmp)->Reset("ICE"); 
735   GetRawsData(kRatioDist)->Reset("ICE"); 
736   GetRawsData(kLEDMonRatio)->Reset("ICE");      
737   GetRawsData(kLEDMonRatioDist)->Reset("ICE");
738   GetRawsData(k2DRatioAmp)->ResetStats(); 
739   GetRawsData(kRatioDist)->ResetStats();
740   GetRawsData(kLEDMonRatio)->ResetStats();
741   GetRawsData(kLEDMonRatioDist)->ResetStats();
742   
743   //calculate the ratio of the amplitude and fill the histograms, only if the events type is Calib
744  if (rawReader->GetType() == AliRawEventHeaderBase::kCalibrationEvent) { 
745       for(Int_t ix = 1; ix <= fHighEmcHistoH2F->GetNbinsX(); ix++) {
746        for(Int_t iy = 1; iy <= fHighEmcHistoH2F->GetNbinsY(); iy++) {
747          if(fCalibRefHistoH2F->GetBinContent(ix, iy))binContent = fHighEmcHistoH2F->GetBinContent(ix, iy)/fCalibRefHistoH2F->GetBinContent(ix, iy) ;
748          GetRawsData(k2DRatioAmp)->SetBinContent(ix, iy, binContent);
749          GetRawsData(kRatioDist)->Fill(GetRawsData(k2DRatioAmp)->GetBinContent(ix, iy));
750        }
751      } 
752    
753  }
754   //Now for LED monitor system, to calculate the ratio as well
755   Double_t binError = 0. ;
756   // for the binError, we add the relative errors, squared
757   Double_t relativeErrorSqr = 0. ;
758   
759   for(int ib = 1; ib <= fLEDMonRefHistoPro->GetNbinsX(); ib++) {
760     
761     if(fLEDMonRefHistoPro->GetBinContent(ib) != 0) {
762       binContent = GetRawsData(kSigLGLEDMon)->GetBinContent(ib) / fLEDMonRefHistoPro->GetBinContent(ib);
763
764       relativeErrorSqr = TMath::Power( (fLEDMonRefHistoPro->GetBinError(ib) / fLEDMonRefHistoPro->GetBinContent(ib)), 2);
765       if(GetRawsData(kSigLGLEDMon)->GetBinContent(ib) != 0) {
766         relativeErrorSqr += TMath::Power( (GetRawsData(kSigLGLEDMon)->GetBinError(ib)/GetRawsData(kSigLGLEDMon)->GetBinContent(ib)), 2);
767       }
768     }
769     else {
770       binContent = 0;
771       relativeErrorSqr = 0;
772     }
773     GetRawsData(kLEDMonRatio)->SetBinContent(ib, binContent);
774     
775     binError = sqrt(relativeErrorSqr) * binContent;
776     GetRawsData(kLEDMonRatio)->SetBinError(ib, binError);
777     GetRawsData(kLEDMonRatioDist)->Fill(GetRawsData(kLEDMonRatio)->GetBinContent(ib));
778     }
779   
780   
781   // let's also fill the SM and event counter histograms
782   Int_t nTotalHG = 0;
783   Int_t nTotalLG = 0;
784   Int_t nTotalTRU = 0;
785   Int_t nTotalHGLEDMon = 0;
786   Int_t nTotalLGLEDMon = 0;
787   for (iSM=0; iSM<fSuperModules; iSM++) {  
788     nTotalLG += nTotalSMLG[iSM]; 
789     nTotalHG += nTotalSMHG[iSM]; 
790     nTotalTRU += nTotalSMTRU[iSM]; 
791     nTotalLGLEDMon += nTotalSMLGLEDMon[iSM]; 
792     nTotalHGLEDMon += nTotalSMHGLEDMon[iSM]; 
793     GetRawsData(kNsmodLG)->Fill(iSM, nTotalSMLG[iSM]); 
794     GetRawsData(kNsmodHG)->Fill(iSM, nTotalSMHG[iSM]); 
795     GetRawsData(kNsmodTRU)->Fill(iSM, nTotalSMTRU[iSM]); 
796     GetRawsData(kNsmodLGLEDMon)->Fill(iSM, nTotalSMLGLEDMon[iSM]); 
797     GetRawsData(kNsmodHGLEDMon)->Fill(iSM, nTotalSMHGLEDMon[iSM]); 
798   }
799   
800   GetRawsData(kNtotLG)->Fill(nTotalLG);
801   GetRawsData(kNtotHG)->Fill(nTotalHG);
802   GetRawsData(kNtotTRU)->Fill(nTotalTRU);
803   GetRawsData(kNtotLGLEDMon)->Fill(nTotalLGLEDMon);
804   GetRawsData(kNtotHGLEDMon)->Fill(nTotalHGLEDMon);
805  
806
807   SetEventSpecie(saveSpecie) ; 
808   // just in case the next rawreader consumer forgets to reset; let's do it here again..
809   rawReader->Reset() ;
810
811   return;
812 }
813
814 //____________________________________________________________________________
815 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeDigits()
816 {
817   // makes data from Digits
818
819   GetDigitsData(1)->Fill(fDigitsArray->GetEntriesFast()) ; 
820   TIter next(fDigitsArray) ; 
821   AliEMCALDigit * digit ; 
822   while ( (digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(next())) ) {
823     GetDigitsData(0)->Fill( digit->GetAmplitude()) ;
824   }  
825   
826 }
827
828 //____________________________________________________________________________
829 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeDigits(TTree * digitTree)
830 {
831   // makes data from Digit Tree
832   if (fDigitsArray) 
833     fDigitsArray->Clear("C") ; 
834   else
835     fDigitsArray = new TClonesArray("AliEMCALDigit", 1000) ; 
836   
837   TBranch * branch = digitTree->GetBranch("EMCAL") ;
838   if ( ! branch ) {
839     AliWarning("EMCAL branch in Digit Tree not found") ; 
840   } else {
841     branch->SetAddress(&fDigitsArray) ;
842     branch->GetEntry(0) ; 
843     MakeDigits() ; 
844   }
845   
846 }
847
848 //____________________________________________________________________________
849 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeRecPoints(TTree * clustersTree)
850 {
851   // makes data from RecPoints
852   TBranch *emcbranch = clustersTree->GetBranch("EMCALECARP");
853   if (!emcbranch) { 
854     AliError("can't get the branch with the EMCAL clusters !");
855     return;
856   }
857   
858   TObjArray * emcRecPoints = new TObjArray(100) ;
859   emcbranch->SetAddress(&emcRecPoints);
860   emcbranch->GetEntry(0);
861   
862   GetRecPointsData(kRecPM)->Fill(emcRecPoints->GetEntriesFast()) ; 
863   TIter next(emcRecPoints) ; 
864   AliEMCALRecPoint * rp ; 
865   while ( (rp = dynamic_cast<AliEMCALRecPoint *>(next())) ) {
866     GetRecPointsData(kRecPE)->Fill(rp->GetEnergy()) ;
867     GetRecPointsData(kRecPDigM)->Fill(rp->GetMultiplicity());
868   }
869   emcRecPoints->Delete();
870   delete emcRecPoints;
871   
872 }
873
874 //____________________________________________________________________________ 
875 void AliEMCALQADataMakerRec::StartOfDetectorCycle()
876 {
877   //Detector specific actions at start of cycle
878   
879 }
880
881 //____________________________________________________________________________ 
882 void AliEMCALQADataMakerRec::SetFittingAlgorithm(Int_t fitAlgo)              
883 {
884   //Set fitting algorithm and initialize it if this same algorithm was not set before.
885   //printf("**** Set Algorithm , number %d ****\n",fitAlgo);
886   
887   if(fitAlgo == fFittingAlgorithm && fRawAnalyzer) {
888     //Do nothing, this same algorithm already set before.
889     //printf("**** Algorithm already set before, number %d, %s ****\n",fitAlgo, fRawAnalyzer->GetName());
890     return;
891   }
892   //Initialize the requested algorithm
893   if(fitAlgo != fFittingAlgorithm || !fRawAnalyzer) {
894     //printf("**** Init Algorithm , number %d ****\n",fitAlgo);
895                 
896     fFittingAlgorithm = fitAlgo; 
897     if (fRawAnalyzer) delete fRawAnalyzer;  // delete prev. analyzer if existed.
898                 
899     if (fitAlgo == kFastFit) {
900       fRawAnalyzer = new AliCaloRawAnalyzerFastFit();
901     }
902     else if (fitAlgo == kNeuralNet) {
903       fRawAnalyzer = new AliCaloRawAnalyzerNN();
904     }
905     else if (fitAlgo == kLMS) {
906       fRawAnalyzer = new AliCaloRawAnalyzerLMS();
907     }
908     else if (fitAlgo == kPeakFinder) {
909       fRawAnalyzer = new AliCaloRawAnalyzerPeakFinder();
910     }
911     else if (fitAlgo == kCrude) {
912       fRawAnalyzer = new AliCaloRawAnalyzerCrude();
913     }
914     else {
915       AliWarning("EMCAL QA invalid fit algorithm choice") ; 
916     }
917
918   }
919   return;
920 }
921
922 //_____________________________________________________________________________________
923 void AliEMCALQADataMakerRec::ConvertProfile2H(TProfile * p, TH2 * histo) 
924 {  
925   // reset histogram
926   histo->Reset("ICE") ; 
927   histo->ResetStats(); 
928
929   Int_t nbinsProf = p->GetNbinsX();
930   
931   // loop through the TProfile p and fill the TH2F histo 
932   Int_t row = 0;
933   Int_t col = 0;
934   Double_t binContent = 0;
935   Int_t towerNum = 0; // global tower Id
936   //  i = 0; // tower Id within SuperModule
937   Int_t iSM = 0; // SuperModule index 
938   Int_t iSMSide = 0; // 0=A, 1=C side
939   Int_t iSMSector = 0; // 2 SM's per sector
940   
941   // indices for 2D plots
942   Int_t col2d = 0;
943   Int_t row2d = 0;
944   
945   for (Int_t ibin = 1; ibin <= nbinsProf; ibin++) {
946     towerNum = (Int_t) p->GetBinCenter(ibin);
947     binContent = p->GetBinContent(ibin);
948     
949     // figure out what the tower indices are: col, row within a SuperModule
950     iSM = towerNum/(AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols);
951     col = (towerNum/AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows) % (AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols);
952     row = towerNum % (AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows);
953     
954     //DecodeTowerNum(towerNum, &SM, &col, &row);
955     // then we calculate what the global 2D coord are, based on which SM 
956     // we are in
957     iSMSector = iSM / 2;
958     iSMSide = iSM % 2;
959     
960     if (iSMSide == 1) { // C side, shown to the right
961       col2d = col + AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
962     }
963     else { // A side, shown to the left 
964       col2d = col; 
965     }
966     
967     row2d = row + iSMSector * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows;
968     
969     histo->SetBinContent(col2d+1, row2d+1, binContent);
970   }
971