]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blob - EMCAL/AliEMCALQADataMakerRec.cxx
Fixes for DQM to have TRU information displayed - Francesco Blanco
[u/mrichter/AliRoot.git] / EMCAL / AliEMCALQADataMakerRec.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15 /*
16 Based on the QA code for PHOS written by Yves Schutz July 2007
17
18 Authors:  J.Klay (Cal Poly) May 2008
19           S. Salur LBL April 2008
20  
21 Created one histogram for QA shifter;-- Yaxian Mao: 11/2009
22 The idea:average counts for all the towers should be flat 
23 Change all existing histograms as experts
24
25 Change histograms for DQM shifter: --  Yaxian Mao 04/2010
26 Calcuate the amplitude ratio from current run and the LED reference, for QAChecker use
27 Also calculate the ratio of amplitude from LED Monitor system (current/Reference), to check LED system  
28  
29 */
30
31 // --- ROOT system ---
32 #include <TClonesArray.h>
33 #include <TFile.h> 
34 #include <TH1F.h> 
35 #include <TH1I.h> 
36 #include <TH2F.h> 
37 #include <TLine.h>
38 #include <TText.h>
39 #include <TProfile.h> 
40 #include <TProfile2D.h> 
41 #include <TStyle.h>
42 // --- Standard library ---
43
44
45 // --- AliRoot header files ---
46 #include "AliDAQ.h"
47 #include "AliESDCaloCluster.h"
48 #include "AliESDCaloCells.h"
49 #include "AliESDEvent.h"
50 #include "AliLog.h"
51 #include "AliEMCALQADataMakerRec.h"
52 #include "AliQAChecker.h"
53 #include "AliEMCALDigit.h" 
54 #include "AliEMCALRecPoint.h" 
55 #include "AliEMCALRawUtils.h"
56 #include "AliEMCALReconstructor.h"
57 #include "AliEMCALRecParam.h"
58 #include "AliRawReader.h"
59 #include "AliCaloRawStreamV3.h"
60 #include "AliEMCALGeoParams.h"
61 #include "AliRawEventHeaderBase.h"
62 #include "AliQAManager.h"
63 #include "AliCDBEntry.h"
64
65 #include "AliCaloBunchInfo.h"
66 #include "AliCaloFitResults.h"
67 #include "AliCaloRawAnalyzerFastFit.h"
68 #include "AliCaloRawAnalyzerNN.h"
69 //#include "AliCaloRawAnalyzerLMS.h"
70 #include "AliCaloRawAnalyzerKStandard.h"
71 #include "AliCaloRawAnalyzerPeakFinder.h"
72 #include "AliCaloRawAnalyzerCrude.h"
73
74 #include "AliCaloRawAnalyzerFactory.h"
75
76 using namespace std;
77
78 ClassImp(AliEMCALQADataMakerRec)
79            
80 //____________________________________________________________________________ 
81 AliEMCALQADataMakerRec::AliEMCALQADataMakerRec(fitAlgorithm fitAlgo) : 
82   AliQADataMakerRec(AliQAv1::GetDetName(AliQAv1::kEMCAL), "EMCAL Quality Assurance Data Maker"),
83   fFittingAlgorithm(0),
84   fRawAnalyzer(0),
85   fRawAnalyzerTRU(0),
86   fSuperModules(10), // FIXME!!! number of SuperModules; 10 for 2011; update default for later runs 
87   fFirstPedestalSample(0),
88   fLastPedestalSample(3),
89   fFirstPedestalSampleTRU(0),
90   fLastPedestalSampleTRU(3),
91   fMinSignalLG(0),
92   fMaxSignalLG(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
93   fMinSignalHG(0),
94   fMaxSignalHG(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
95   fMinSignalTRU(0),
96   fMaxSignalTRU(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
97   fMinSignalLGLEDMon(0),
98   fMaxSignalLGLEDMon(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
99   fMinSignalHGLEDMon(0),
100   fMaxSignalHGLEDMon(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
101   fCalibRefHistoPro(NULL),
102   fCalibRefHistoH2F(NULL),
103   fLEDMonRefHistoPro(NULL),
104   fHighEmcHistoH2F(NULL)
105 //  fTextSM(new TText*[fSuperModules]) ,
106 //  fLineCol(NULL),
107 //  fLineRow(NULL)
108
109 {
110   // ctor
111   SetFittingAlgorithm(fitAlgo);
112   
113   //fRawAnalyzerTRU = new AliCaloRawAnalyzerLMS();
114   
115   fRawAnalyzerTRU =  ( AliCaloRawAnalyzerKStandard*)AliCaloRawAnalyzerFactory::CreateAnalyzer(kLMS);
116   
117   fRawAnalyzerTRU->SetFixTau(kTRUE); 
118   fRawAnalyzerTRU->SetTau(2.5); // default for TRU shaper
119 //  for (Int_t sm = 0 ; sm < fSuperModules ; sm++){
120 //    fTextSM[sm] = NULL ;
121 //  }
122 }
123
124 //____________________________________________________________________________ 
125 AliEMCALQADataMakerRec::AliEMCALQADataMakerRec(const AliEMCALQADataMakerRec& qadm) :
126   AliQADataMakerRec(), 
127   fFittingAlgorithm(0),
128   fRawAnalyzer(0),
129   fRawAnalyzerTRU(0),
130   fSuperModules(qadm.GetSuperModules()), 
131   fFirstPedestalSample(qadm.GetFirstPedestalSample()), 
132   fLastPedestalSample(qadm.GetLastPedestalSample()),  
133   fFirstPedestalSampleTRU(qadm.GetFirstPedestalSampleTRU()), 
134   fLastPedestalSampleTRU(qadm.GetLastPedestalSampleTRU()),  
135   fMinSignalLG(qadm.GetMinSignalLG()),
136   fMaxSignalLG(qadm.GetMaxSignalLG()),
137   fMinSignalHG(qadm.GetMinSignalHG()),
138   fMaxSignalHG(qadm.GetMaxSignalHG()),
139   fMinSignalTRU(qadm.GetMinSignalTRU()),
140   fMaxSignalTRU(qadm.GetMaxSignalTRU()),
141   fMinSignalLGLEDMon(qadm.GetMinSignalLGLEDMon()),
142   fMaxSignalLGLEDMon(qadm.GetMaxSignalLGLEDMon()),
143   fMinSignalHGLEDMon(qadm.GetMinSignalHGLEDMon()),
144   fMaxSignalHGLEDMon(qadm.GetMaxSignalHGLEDMon()),
145   fCalibRefHistoPro(NULL),
146   fCalibRefHistoH2F(NULL),
147   fLEDMonRefHistoPro(NULL),
148   fHighEmcHistoH2F(NULL)
149 //  fTextSM(new TText*[fSuperModules]) ,
150 //  fLineCol(NULL),
151 //  fLineRow(NULL)
152 {
153   //copy ctor 
154   SetName((const char*)qadm.GetName()) ; 
155   SetTitle((const char*)qadm.GetTitle()); 
156   SetFittingAlgorithm(qadm.GetFittingAlgorithm());
157   
158   //fRawAnalyzerTRU = new AliCaloRawAnalyzerLMS();
159   fRawAnalyzerTRU = (AliCaloRawAnalyzerKStandard*)AliCaloRawAnalyzerFactory::CreateAnalyzer(kLMS);
160   fRawAnalyzerTRU->SetFixTau(kTRUE); 
161   fRawAnalyzerTRU->SetTau(2.5); // default for TRU shaper
162 //  for (Int_t sm = 0 ; sm < fSuperModules ; sm++){
163 //    fTextSM[sm] = qadm.fTextSM[sm] ;
164 //  }  
165 }
166
167 //__________________________________________________________________
168 AliEMCALQADataMakerRec& AliEMCALQADataMakerRec::operator = (const AliEMCALQADataMakerRec& qadm )
169 {
170   // Equal operator.
171   this->~AliEMCALQADataMakerRec();
172   new(this) AliEMCALQADataMakerRec(qadm);
173 //  fLineCol = NULL;
174 //  fLineRow = NULL;
175 //  for (Int_t sm = 0 ; sm < fSuperModules ; sm++){
176 //    fTextSM[sm] = qadm.fTextSM[sm] ;
177 //  }    
178   return *this;
179 }
180  
181 //____________________________________________________________________________ 
182 void AliEMCALQADataMakerRec::EndOfDetectorCycle(AliQAv1::TASKINDEX_t task, TObjArray ** list)
183 {
184   //Detector specific actions at end of cycle
185         
186 //  if(fCycleCounter)
187 //        GetRawsData(kNEventsPerTower)->Scale(1./fCycleCounter);
188
189   // do the QA checking
190   ResetEventTrigClasses(); // reset triggers list to select all histos
191   AliQAChecker::Instance()->Run(AliQAv1::kEMCAL, task, list) ;  
192 }
193
194 //____________________________________________________________________________ 
195 void AliEMCALQADataMakerRec::GetCalibRefFromOCDB()
196 {
197   //Get the reference histogram from OCDB
198   TString sName1("hHighEmcalRawMaxMinusMin") ;
199   TString sName2("hLowLEDMonEmcalRawMaxMinusMin") ;
200   sName1.Prepend(Form("%s_", AliRecoParam::GetEventSpecieName(AliRecoParam::kCalib))) ; 
201   sName2.Prepend(Form("%s_", AliRecoParam::GetEventSpecieName(AliRecoParam::kCalib))) ; 
202   
203   TString refStorage(AliQAv1::GetQARefStorage()) ;
204   if (!refStorage.Contains(AliQAv1::GetLabLocalOCDB()) && !refStorage.Contains(AliQAv1::GetLabAliEnOCDB())) {
205     AliFatal(Form("%s is not a valid location for reference data", refStorage.Data())) ; 
206   } else {
207     AliQAManager* manQA = AliQAManager::QAManager(AliQAv1::kRAWS) ;    
208     AliQAv1::SetQARefDataDirName(AliRecoParam::kCalib) ;
209     if ( ! manQA->GetLock() ) { 
210       manQA->SetDefaultStorage(AliQAv1::GetQARefStorage()) ; 
211       manQA->SetSpecificStorage("*", AliQAv1::GetQARefStorage()) ;
212       manQA->SetRun(AliCDBManager::Instance()->GetRun()) ; 
213       manQA->SetLock() ; 
214     }
215     char * detOCDBDir = Form("%s/%s/%s", GetName(), AliQAv1::GetRefOCDBDirName(), AliQAv1::GetRefDataDirName()) ; 
216     AliCDBEntry * entry = manQA->Get(detOCDBDir, manQA->GetRun()) ;
217     if (entry) {
218       TList * listDetQAD =static_cast<TList *>(entry->GetObject()) ;
219       if ( strcmp(listDetQAD->ClassName(), "TList") != 0 ) {
220         AliError(Form("Expected a Tlist and found a %s for detector %s", listDetQAD->ClassName(), GetName())) ; 
221         listDetQAD = NULL ; 
222       }
223       TObjArray * dirOCDB= NULL ; 
224       if ( listDetQAD )
225         dirOCDB = static_cast<TObjArray *>(listDetQAD->FindObject(Form("%s/%s", AliQAv1::GetTaskName(AliQAv1::kRAWS).Data(), AliRecoParam::GetEventSpecieName(AliRecoParam::kCalib)))) ;       
226       if (dirOCDB){
227         fCalibRefHistoPro = dynamic_cast<TProfile *>(dirOCDB->FindObject(sName1.Data())) ; 
228         fLEDMonRefHistoPro = dynamic_cast<TProfile *>(dirOCDB->FindObject(sName2.Data())) ; 
229       }
230     }
231   }
232  
233   if(fCalibRefHistoPro && fLEDMonRefHistoPro){
234     
235     //Defining histograms binning, each 2D histogram covers all SMs
236     Int_t nSMSectors = fSuperModules / 2; // 2 SMs per sector
237     Int_t nbinsZ = 2*AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
238     Int_t nbinsPhi = nSMSectors * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows;
239     
240     if(!fCalibRefHistoH2F)
241       fCalibRefHistoH2F =  new TH2F("hCalibRefHisto", "hCalibRefHisto", nbinsZ, -0.5, nbinsZ - 0.5, nbinsPhi, -0.5, nbinsPhi -0.5);
242     ConvertProfile2H(fCalibRefHistoPro,fCalibRefHistoH2F) ; 
243   } else {
244     AliFatal(Form("No reference object with name %s or %s found", sName1.Data(), sName2.Data())) ; 
245   }
246 }
247 //____________________________________________________________________________ 
248 void AliEMCALQADataMakerRec::InitESDs()
249 {
250   //Create histograms to controll ESD
251   const Bool_t expert   = kTRUE ; 
252   const Bool_t image    = kTRUE ; 
253   
254   TH1F * h1 = new TH1F("hESDCaloClusterE",  "ESDs CaloCluster energy in EMCAL;Energy [GeV];Counts",    200, 0., 100.) ; 
255   h1->Sumw2() ;
256   Add2ESDsList(h1, kESDCaloClusE, !expert, image)  ;                                                     
257
258   TH1I * h2 = new TH1I("hESDCaloClusterM", "ESDs CaloCluster multiplicity in EMCAL;# of Clusters;Entries", 100, 0,  100) ; 
259   h2->Sumw2() ;
260   Add2ESDsList(h2, kESDCaloClusM, !expert, image)  ;
261
262   TH1F * h3 = new TH1F("hESDCaloCellA",  "ESDs CaloCell amplitude in EMCAL;Energy [GeV];Counts",    500, 0., 50.) ; 
263   h3->Sumw2() ;
264   Add2ESDsList(h3, kESDCaloCellA, !expert, image)  ;  
265  
266   TH1I * h4 = new TH1I("hESDCaloCellM", "ESDs CaloCell multiplicity in EMCAL;# of Clusters;Entries", 200, 0,  1000) ; 
267   h4->Sumw2() ;
268   Add2ESDsList(h4, kESDCaloCellM, !expert, image) ;
269   //
270   ClonePerTrigClass(AliQAv1::kESDS); // this should be the last line    
271 }
272
273 //____________________________________________________________________________ 
274 void AliEMCALQADataMakerRec::InitDigits()
275 {
276   // create Digits histograms in Digits subdir
277   const Bool_t expert   = kTRUE ; 
278   const Bool_t image    = kTRUE ; 
279   
280   TH1I * h0 = new TH1I("hEmcalDigits",    "Digits amplitude distribution in EMCAL;Amplitude [ADC counts];Counts",    500, 0, 500) ; 
281   h0->Sumw2() ;
282   Add2DigitsList(h0, 0, !expert, image) ;
283   TH1I * h1 = new TH1I("hEmcalDigitsMul", "Digits multiplicity distribution in EMCAL;# of Digits;Entries", 200, 0, 2000) ; 
284   h1->Sumw2() ;
285   Add2DigitsList(h1, 1, !expert, image) ;
286   //
287   ClonePerTrigClass(AliQAv1::kDIGITS); // this should be the last line
288 }
289
290 //____________________________________________________________________________ 
291 void AliEMCALQADataMakerRec::InitRecPoints()
292 {
293   // create Reconstructed PoInt_ts histograms in RecPoints subdir
294   const Bool_t expert   = kTRUE ; 
295   const Bool_t image    = kTRUE ; 
296   
297   TH1F* h0 = new TH1F("hEMCALRpE","EMCAL RecPoint energies;Energy [GeV];Counts",200, 0.,20.); //GeV
298   h0->Sumw2();
299   Add2RecPointsList(h0,kRecPE, !expert, image);
300
301   TH1I* h1 = new TH1I("hEMCALRpM","EMCAL RecPoint multiplicities;# of Clusters;Entries",100,0,100);
302   h1->Sumw2();
303   Add2RecPointsList(h1,kRecPM, !expert, image);
304
305   TH1I* h2 = new TH1I("hEMCALRpDigM","EMCAL RecPoint Digit Multiplicities;# of Digits;Entries",20,0,20);
306   h2->Sumw2();
307   Add2RecPointsList(h2,kRecPDigM, !expert, image);
308   //
309   ClonePerTrigClass(AliQAv1::kRECPOINTS); // this should be the last line
310 }
311
312 //____________________________________________________________________________ 
313 void AliEMCALQADataMakerRec::InitRaws()
314 {
315   // create Raws histograms in Raws subdir
316   const Bool_t expert   = kTRUE ; 
317   const Bool_t saveCorr = kTRUE ; 
318   const Bool_t image    = kTRUE ; 
319   const Option_t *profileOption = "s";
320
321   Int_t nTowersPerSM = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols; // number of towers in a SuperModule; 24x48
322   Int_t nTot = fSuperModules * nTowersPerSM; // max number of towers in all SuperModules
323     
324   //Defining histograms binning, each 2D histogram covers all SMs
325   Int_t nSMSectors = fSuperModules / 2; // 2 SMs per sector
326   Int_t nbinsZ = 2*AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
327   Int_t nbinsPhi = nSMSectors * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows;
328         
329   Int_t nTRUCols = 2*AliEMCALGeoParams::fgkEMCALTRUCols; //total TRU columns for 2D TRU histos
330   Int_t nTRURows = nSMSectors*AliEMCALGeoParams::fgkEMCALTRUsPerSM*AliEMCALGeoParams::fgkEMCALTRURows; //total TRU rows for 2D TRU histos
331    // counter info: number of channels per event (bins are SM index)
332   TProfile * h0 = new TProfile("hLowEmcalSupermodules", "Low Gain EMC: # of towers vs SuperMod;SM Id;# of towers",
333                                fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5, profileOption) ;
334   Add2RawsList(h0, kNsmodLG, expert, !image, !saveCorr) ;
335   TProfile * h1 = new TProfile("hHighEmcalSupermodules", "High Gain EMC: # of towers vs SuperMod;SM Id;# of towers",  
336                                fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5, profileOption) ; 
337   Add2RawsList(h1, kNsmodHG, expert, !image, !saveCorr) ;
338
339   // where did max sample occur? (bins are towers)
340   TProfile * h2 = new TProfile("hLowEmcalRawtime", "Low Gain EMC: Time at Max vs towerId;Tower Id;Time [ticks]", 
341                                nTot, -0.5, nTot-0.5, profileOption) ;
342   Add2RawsList(h2, kTimeLG, expert, !image, !saveCorr) ;
343   TProfile * h3 = new TProfile("hHighEmcalRawtime", "High Gain EMC: Time at Max vs towerId;Tower Id;Time [ticks]", 
344                                nTot, -0.5, nTot-0.5, profileOption) ;
345   Add2RawsList(h3, kTimeHG, expert, !image, !saveCorr) ;
346
347   // how much above pedestal was the max sample?  (bins are towers)
348   TProfile * h4 = new TProfile("hLowEmcalRawMaxMinusMin", "Low Gain EMC: Max - Min vs towerId;Tower Id;Max-Min [ADC counts]", 
349                                nTot, -0.5, nTot-0.5, profileOption) ;
350   Add2RawsList(h4, kSigLG, expert, !image, !saveCorr) ;
351   TProfile * h5 = new TProfile("hHighEmcalRawMaxMinusMin", "High Gain EMC: Max - Min vs towerId;Tower Id;Max-Min [ADC counts]",
352                                nTot, -0.5, nTot-0.5, profileOption) ;
353   Add2RawsList(h5, kSigHG, expert, !image, !saveCorr) ;
354
355   // total counter: channels per event
356   TH1I * h6 = new TH1I("hLowNtot", "Low Gain EMC: Total Number of found towers;# of Towers;Counts", 200, 0, nTot) ;
357   h6->Sumw2() ;
358   Add2RawsList(h6, kNtotLG, expert, !image, !saveCorr) ;
359   TH1I * h7 = new TH1I("hHighNtot", "High Gain EMC: Total Number of found towers;# of Towers;Counts", 200,0, nTot) ;
360   h7->Sumw2() ;
361   Add2RawsList(h7, kNtotHG, expert, !image, !saveCorr) ;
362
363   // pedestal (bins are towers)
364   TProfile * h8 = new TProfile("hLowEmcalRawPed", "Low Gain EMC: Pedestal vs towerId;Tower Id;Pedestal [ADC counts]", 
365                                nTot, -0.5, nTot-0.5, profileOption) ;
366   Add2RawsList(h8, kPedLG, expert, !image, !saveCorr) ;
367   TProfile * h9 = new TProfile("hHighEmcalRawPed", "High Gain EMC: Pedestal vs towerId;Tower Id;Pedestal [ADC counts]",
368                                nTot, -0.5, nTot-0.5, profileOption) ;
369   Add2RawsList(h9, kPedHG, expert, !image, !saveCorr) ;
370         
371  
372   // now repeat the same for TRU and LEDMon data
373   Int_t nTot2x2 = fSuperModules * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALTRUsPerSM * AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU; // max number of TRU channels for all SuperModules
374
375   // counter info: number of channels per event (bins are SM index)
376   TProfile * hT0 = new TProfile("hTRUEmcalSupermodules", "TRU EMC: # of TRU channels vs SuperMod;SM Id;# of TRU channels",
377                                 fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5, profileOption) ;
378   Add2RawsList(hT0, kNsmodTRU, expert, !image, !saveCorr) ;
379
380   // how much above pedestal was the max sample?  (bins are TRU channels)
381   TProfile * hT1 = new TProfile("hTRUEmcalRawMaxMinusMin", "TRU EMC: Max - Min vs 2x2Id;2x2 Id;Max-Min [ADC counts]", 
382                                 nTot2x2, -0.5, nTot2x2-0.5, profileOption) ;
383   Add2RawsList(hT1, kSigTRU, expert, !image, !saveCorr) ;
384
385   // total counter: channels per event
386   TH1I * hT2 = new TH1I("hTRUNtot", "TRU EMC: Total Number of found TRU channels;# of TRU Channels;Counts", 200, 0, nTot2x2) ;
387   hT2->Sumw2() ;
388   Add2RawsList(hT2, kNtotTRU, expert, !image, !saveCorr) ;
389
390   // L0 trigger hits: # of hits (bins are TRU channels)
391   TH2I * hT3 = new TH2I("hTRUEmcalL0hits", "L0 trigger hits: Total number of 2x2 L0 generated",  nTRUCols, -0.5, nTRUCols - 0.5, nTRURows, -0.5, nTRURows-0.5);
392   hT3->SetOption("COLZ");
393   //hT3->Sumw2();
394   Add2RawsList(hT3, kNL0TRU, !expert, image, !saveCorr);
395
396   // L0 trigger hits: average time (bins are TRU channels)
397   TProfile2D * hT4 = new TProfile2D("hTRUEmcalL0hitsAvgTime", "L0 trigger hits: average time bin", nTRUCols, -0.5, nTRUCols - 0.5, nTRURows, -0.5, nTRURows-0.5, profileOption);
398   hT4->SetOption("COLZ");
399   Add2RawsList(hT4, kTimeL0TRU, !expert, image, !saveCorr);
400
401   // L0 trigger hits: first in the event (bins are TRU channels)
402   TH1I * hT5 = new TH1I("hTRUEmcalL0hitsFirst", "L0 trigger hits: First hit in the event", nTot2x2, -0.5, nTot2x2);
403   hT5->Sumw2();
404   Add2RawsList(hT5, kNL0FirstTRU, expert, !image, !saveCorr);
405         
406   // L0 trigger hits: average time of first hit in the event (bins are TRU channels)
407   TProfile * hT6 = new TProfile("hTRUEmcalL0hitsFirstAvgTime", "L0 trigger hits: average time of first hit", nTot2x2, -0.5, nTot2x2, profileOption); 
408   Add2RawsList(hT6, kTimeL0FirstTRU, expert, !image, !saveCorr);
409
410   // and also LED Mon..
411   // LEDMon has both high and low gain channels, just as regular FEE/towers
412   Int_t nTotLEDMon = fSuperModules * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALLEDRefs; // max number of LEDMon channels for all SuperModules
413
414   // counter info: number of channels per event (bins are SM index)
415   TProfile * hL0 = new TProfile("hLowLEDMonEmcalSupermodules", "LowLEDMon Gain EMC: # of strips vs SuperMod;SM Id;# of strips",
416                                fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5, profileOption) ;
417   Add2RawsList(hL0, kNsmodLGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
418   TProfile * hL1 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalSupermodules", "HighLEDMon Gain EMC: # of strips vs SuperMod;SM Id;# of strips",  
419                                fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5, profileOption) ; 
420   Add2RawsList(hL1, kNsmodHGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
421
422   // where did max sample occur? (bins are strips)
423   TProfile * hL2 = new TProfile("hLowLEDMonEmcalRawtime", "LowLEDMon Gain EMC: Time at Max vs stripId;Strip Id;Time [ticks]", 
424                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5, profileOption) ;
425   Add2RawsList(hL2, kTimeLGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
426   TProfile * hL3 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalRawtime", "HighLEDMon Gain EMC: Time at Max vs stripId;Strip Id;Time [ticks]", 
427                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5, profileOption) ;
428   Add2RawsList(hL3, kTimeHGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
429
430   // how much above pedestal was the max sample?  (bins are strips)
431   TProfile * hL4 = new TProfile("hLowLEDMonEmcalRawMaxMinusMin", "LowLEDMon Gain EMC: Max - Min vs stripId;Strip Id;Max-Min [ADC counts]", 
432                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5, profileOption) ;
433   Add2RawsList(hL4, kSigLGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
434   TProfile * hL5 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalRawMaxMinusMin", "HighLEDMon Gain EMC: Max - Min vs stripId;Strip Id;Max-Min [ADC counts]",
435                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5, profileOption) ;
436   Add2RawsList(hL5, kSigHGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
437   
438     // total counter: channels per event
439   TH1I * hL6 = new TH1I("hLowLEDMonNtot", "LowLEDMon Gain EMC: Total Number of found strips;# of Strips;Counts", 200, 0, nTotLEDMon) ;
440   hL6->Sumw2() ;
441   Add2RawsList(hL6, kNtotLGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
442   TH1I * hL7 = new TH1I("hHighLEDMonNtot", "HighLEDMon Gain EMC: Total Number of found strips;# of Strips;Counts", 200,0, nTotLEDMon) ;
443   hL7->Sumw2() ;
444   Add2RawsList(hL7, kNtotHGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
445
446   // pedestal (bins are strips)
447   TProfile * hL8 = new TProfile("hLowLEDMonEmcalRawPed", "LowLEDMon Gain EMC: Pedestal vs stripId;Strip Id;Pedestal [ADC counts]", 
448                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5, profileOption) ;
449   Add2RawsList(hL8, kPedLGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
450   TProfile * hL9 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalRawPed", "HighLEDMon Gain EMC: Pedestal vs stripId;Strip Id;Pedestal [ADC counts]",
451                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5, profileOption) ;
452   Add2RawsList(hL9, kPedHGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
453   
454   //temp 2D amplitude histogram for the current run
455   fHighEmcHistoH2F = new TH2F("h2DHighEC2", "High Gain EMC:Max - Min [ADC counts]", nbinsZ, -0.5 , nbinsZ-0.5, nbinsPhi, -0.5, nbinsPhi-0.5);
456    fHighEmcHistoH2F->SetDirectory(0) ; // this histo must be memory resident
457   //add ratio histograms: to comapre the current run with the reference data 
458   TH2F * h15 = new TH2F("h2DRatioAmp", "High Gain Ratio to Reference:Amplitude_{current run}/Amplitude_{reference run}", nbinsZ, -0.5 , nbinsZ-0.5, 
459                         nbinsPhi, -0.5, nbinsPhi-0.5);
460   //settings for display in amore
461   h15->SetTitle("Amplitude_{current run}/Amplitude_{reference run}"); 
462   h15->SetMaximum(2.0);
463   h15->SetMinimum(0.1);
464   h15->SetOption("COLZ");
465   gStyle->SetOptStat(0);
466   Int_t color[] = {4,3,2} ;
467   gStyle->SetPalette(3,color);
468   h15->GetZaxis()->SetNdivisions(3);
469   h15->UseCurrentStyle();
470   h15->SetDirectory(0);
471   Add2RawsList(h15, k2DRatioAmp, !expert, image, !saveCorr) ;
472
473   TH1F * h16 = new TH1F("hRatioDist", "Amplitude_{current run}/Amplitude_{reference run} ratio distribution", nTot, 0., 2.);
474   h16->SetMinimum(0.1); 
475   h16->SetMaximum(100.);
476   gStyle->SetOptStat(0);
477   h16->UseCurrentStyle();
478   h16->SetDirectory(0);
479   Add2RawsList(h16, kRatioDist, !expert, image, !saveCorr) ;
480
481   //add two histograms for shifter from the LED monitor system: comapre LED monitor with the reference run
482   //to be used for decision whether we need to change reference data
483   TH1F * hL10 = new TH1F("hMaxMinusMinLEDMonRatio", "LEDMon amplitude, Ratio to reference run", nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5) ;
484   //settings for display in amore
485   hL10->SetTitle("Amplitude_{LEDMon current}/Amplitude_{LEDMon reference}"); 
486   hL10->SetMaximum(2.0);
487   hL10->SetMinimum(0.1); 
488   gStyle->SetOptStat(0);
489   hL10->UseCurrentStyle();
490   hL10->SetDirectory(0);
491 //  hL10->SetOption("E");
492   Add2RawsList(hL10, kLEDMonRatio, !expert, image, !saveCorr) ;
493
494   TH1F * hL11 = new TH1F("hMaxMinusMinLEDMonRatioDist", "LEDMon amplitude, Ratio distribution", nTotLEDMon, 0, 2);
495   hL11->SetMinimum(0.1) ;
496   gStyle->SetOptStat(0);
497   hL11->UseCurrentStyle();
498   hL11->SetDirectory(0);
499   Add2RawsList(hL11, kLEDMonRatioDist, !expert, image, !saveCorr) ;
500   
501   GetCalibRefFromOCDB();   
502   //
503   ClonePerTrigClass(AliQAv1::kRAWS); // this should be the last line
504 }
505
506 //____________________________________________________________________________
507 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeESDs(AliESDEvent * esd)
508 {
509   // make QA data from ESDs
510
511   Int_t nTot = 0 ; 
512   for ( Int_t index = 0; index < esd->GetNumberOfCaloClusters() ; index++ ) {
513     AliESDCaloCluster * clu = esd->GetCaloCluster(index) ;
514     if( clu->IsEMCAL() ) {
515       FillESDsData(kESDCaloClusE,clu->E()) ;
516       nTot++ ;
517     } 
518   }
519   FillESDsData(kESDCaloClusM,nTot) ;
520
521   //fill calo cells
522   AliESDCaloCells* cells = esd->GetEMCALCells();
523   FillESDsData(kESDCaloCellM,cells->GetNumberOfCells()) ;
524
525   for ( Int_t index = 0; index < cells->GetNumberOfCells() ; index++ ) {
526     FillESDsData(kESDCaloCellA,cells->GetAmplitude(index)) ;
527   }
528   //
529   IncEvCountCycleESDs();
530   IncEvCountTotalESDs();
531 }
532
533 //____________________________________________________________________________
534 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeRaws(AliRawReader* rawReader)
535 {
536   // Check that all the reference histograms exist before we try to use them - otherwise call InitRaws
537   // RS: Attention: the counters are increments after custom modification of eventSpecie
538   if (!fCalibRefHistoPro || !fCalibRefHistoH2F || !fLEDMonRefHistoPro || !fHighEmcHistoH2F) {
539     InitRaws();
540   }
541
542   // make sure EMCal was readout during the event
543   Int_t emcID = AliDAQ::DetectorID("EMCAL"); // bit 18..
544   const UInt_t *detPattern = rawReader->GetDetectorPattern(); 
545   UInt_t emcInReadout = ( ((1 << emcID) & detPattern[0]) >> emcID);
546   if (! emcInReadout) return; // no poInt_t in looking at this event, if no EMCal data
547
548   // setup
549   rawReader->Reset() ;
550   AliCaloRawStreamV3 in(rawReader,"EMCAL"); 
551   rawReader->Select("EMCAL", 0, AliEMCALGeoParams::fgkLastAltroDDL) ; //select EMCAL DDL's 
552
553   AliRecoParam::EventSpecie_t saveSpecie = fEventSpecie ;
554   if (rawReader->GetType() == AliRawEventHeaderBase::kCalibrationEvent) { 
555     SetEventSpecie(AliRecoParam::kCalib) ;      
556   }
557
558   const Int_t nTowersPerSM = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols; // number of towers in a SuperModule; 24x48
559   const Int_t nRows        = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows; // number of rows per SuperModule
560   const Int_t nStripsPerSM = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALLEDRefs; // number of strips per SuperModule
561   const Int_t n2x2PerSM    = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALTRUsPerSM * AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU; // number of TRU 2x2's per SuperModule
562   const Int_t n2x2PerTRU   = AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU;
563   const Int_t nTot2x2      = fSuperModules * n2x2PerSM; // total TRU channel
564
565   // SM counters; decl. should be safe, assuming we don't get more than expected SuperModules..
566   Int_t nTotalSMLG[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules]       = {0};
567   Int_t nTotalSMHG[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules]       = {0};
568   Int_t nTotalSMTRU[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules]      = {0};
569   Int_t nTotalSMLGLEDMon[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules] = {0};
570   Int_t nTotalSMHGLEDMon[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules] = {0};
571
572   const Int_t nTRUL0ChannelBits = 10; // used for L0 trigger bits checks
573         int firstL0TimeBin = 999;
574   int triggers[nTot2x2][24]; //auxiliary array for L0 trigger - TODO remove hardcoded 24
575         memset(triggers, 0, sizeof(int) * 24 * nTot2x2);
576
577   Int_t iSM = 0; // SuperModule index 
578   // start loop over input stream  
579   while (in.NextDDL()) {
580     Int_t iRCU = in.GetDDLNumber() % 2; // RCU0 or RCU1, within SuperModule
581     Int_t iDDL = in.GetDDLNumber();
582     fRawAnalyzer->SetIsZeroSuppressed( in.GetZeroSupp() ); 
583     
584     while (in.NextChannel()) {
585       Int_t iBranch = in.GetBranch();
586       
587       iSM = in.GetModule(); // SuperModule
588       //prInt_tf("iSM %d DDL %d", iSM, in.GetDDLNumber()); 
589       if (iSM>=0 && iSM<fSuperModules) { // valid module reading
590
591         Int_t nsamples = 0;
592         vector<AliCaloBunchInfo> bunchlist; 
593         while (in.NextBunch()) {
594           nsamples += in.GetBunchLength();
595           bunchlist.push_back( AliCaloBunchInfo(in.GetStartTimeBin(), in.GetBunchLength(), in.GetSignals() ) );
596         } 
597         
598         if (nsamples > 0) { // this check is needed for when we have zero-supp. on, but not sparse readout
599           Float_t time = 0.; 
600           Float_t amp  = 0.; 
601           // indices for pedestal calc.
602           Int_t firstPedSample = 0;
603           Int_t lastPedSample  = 0;
604           bool isTRUL0IdData   = false;
605
606           if (! in.IsTRUData() ) { // high gain, low gain, LED Mon data - all have the same shaper/sampling 
607             AliCaloFitResults fitResults = fRawAnalyzer->Evaluate( bunchlist, in.GetAltroCFG1(), in.GetAltroCFG2()); 
608             amp  = fitResults.GetAmp();
609             time = fitResults.GetTof(); 
610             firstPedSample = fFirstPedestalSample;
611             lastPedSample  = fLastPedestalSample;
612           }
613           else { // TRU data is special, needs its own analyzer
614             AliCaloFitResults fitResults = fRawAnalyzerTRU->Evaluate( bunchlist, in.GetAltroCFG1(), in.GetAltroCFG2()); 
615             amp  = fitResults.GetAmp();
616             time = fitResults.GetTof(); 
617             firstPedSample = fFirstPedestalSampleTRU;
618             lastPedSample  = fLastPedestalSampleTRU;
619             if (in.GetColumn() >= n2x2PerTRU) {
620               isTRUL0IdData = true;
621             }
622           }
623   
624           // pedestal samples
625           Int_t nPed = 0;
626           vector<Int_t> pedSamples; 
627         
628           // select earliest bunch 
629           unsigned int bunchIndex = 0;
630           unsigned int startBin = bunchlist.at(0).GetStartBin();
631           if (bunchlist.size() > 0) {
632             for(unsigned int ui=1; ui < bunchlist.size(); ui++ ) {
633               if (startBin > bunchlist.at(ui).GetStartBin() ) {
634                 startBin = bunchlist.at(ui).GetStartBin();
635                 bunchIndex = ui;
636               }
637             }
638           }
639
640           // check bunch for entries in the pedestal sample range
641           Int_t bunchLength = bunchlist.at(bunchIndex).GetLength(); 
642           const UShort_t *sig = bunchlist.at(bunchIndex).GetData();
643           Int_t timebin = 0;
644
645           if (! isTRUL0IdData) { // regular data, can look at pedestals
646             for (Int_t i = 0; i<bunchLength; i++) {
647               timebin = startBin--;
648               if ( firstPedSample<=timebin && timebin<=lastPedSample ) {
649                 pedSamples.push_back( sig[i] );
650                 nPed++;
651               }     
652             } // i
653           }
654           else { // TRU L0 Id Data
655             // which TRU the channel belongs to?
656             Int_t iTRUId = in.GetModule()*3 + (iRCU*in.GetBranch() + iRCU);
657
658             for (Int_t i = 0; i< bunchLength; i++) {
659               for( Int_t j = 0; j < nTRUL0ChannelBits; j++ ){
660                 // check if the bit j is 1
661                 if( (sig[i] & ( 1 << j )) > 0 ){
662                   Int_t iTRUIdInSM = (in.GetColumn() - n2x2PerTRU)*nTRUL0ChannelBits+j;
663                   if(iTRUIdInSM < n2x2PerTRU) {
664                     Int_t iTRUAbsId = iTRUIdInSM + n2x2PerTRU * iTRUId;
665                     // Fill the histograms
666                     Int_t globTRUCol, globTRURow;
667                     GetTruChannelPosition(globTRURow, globTRUCol, iSM, iDDL, iBranch, iTRUIdInSM );
668                     
669                     FillRawsData(kNL0TRU, globTRUCol, globTRURow);
670                     FillRawsData(kTimeL0TRU, globTRUCol, globTRURow, startBin);
671                     triggers[iTRUAbsId][startBin] = 1;
672                     
673                     if((int)startBin < firstL0TimeBin) firstL0TimeBin = startBin;
674                   }
675                 }
676               }
677               startBin--;
678             } // i      
679           } // TRU L0 Id data                   
680           
681           // fill histograms
682           if ( in.IsLowGain() || in.IsHighGain() ) { // regular towers
683             Int_t towerId = iSM*nTowersPerSM + in.GetColumn()*nRows + in.GetRow();
684             if ( in.IsLowGain() ) { 
685               nTotalSMLG[iSM]++; 
686               if ( (amp > fMinSignalLG) && (amp < fMaxSignalLG) ) { 
687                 FillRawsData(kSigLG,towerId, amp);
688                 FillRawsData(kTimeLG,towerId, time);
689               }
690               if (nPed > 0) {
691                 for (Int_t i=0; i<nPed; i++) {
692                   FillRawsData(kPedLG,towerId, pedSamples[i]);
693                 }
694               }
695             } // gain==0
696             else if ( in.IsHighGain() ) {               
697               nTotalSMHG[iSM]++; 
698               if ( (amp > fMinSignalHG) && (amp < fMaxSignalHG) ) { 
699                 FillRawsData(kSigHG,towerId, amp);
700                 FillRawsData(kTimeHG,towerId, time);
701               } 
702               if (nPed > 0) {
703                 for (Int_t i=0; i<nPed; i++) {
704                   FillRawsData(kPedHG,towerId, pedSamples[i]);
705                 }
706               }
707             } // gain==1
708           } // low or high gain
709           // TRU
710           else if ( in.IsTRUData() && in.GetColumn()<AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU) {
711             // for TRU data, the mapping class holds the TRU Int_ternal 2x2 number (0..95) in the Column var..
712             Int_t iTRU = (iRCU*in.GetBranch() + iRCU); //TRU0 is from RCU0, TRU1 from RCU1, TRU2 is from branch B on RCU1
713             Int_t iTRU2x2Id = iSM*n2x2PerSM + iTRU*AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU 
714               + in.GetColumn();
715             nTotalSMTRU[iSM]++; 
716             if ( (amp > fMinSignalTRU) && (amp < fMaxSignalTRU) ) { 
717               FillRawsData(kSigTRU,iTRU2x2Id, amp);
718               //FillRawsData(kTimeTRU,iTRU2x2Id, time);
719             }
720             //if (nPed > 0) {
721               //for (Int_t i=0; i<nPed; i++) {
722                 //FillRawsData(kPedTRU,iTRU2x2Id, pedSamples[i]);
723               //}
724             //}
725           }
726           // LED Mon
727           else if ( in.IsLEDMonData() ) {
728             // for LED Mon data, the mapping class holds the gain info in the Row variable
729             // and the Strip number in the Column..
730             Int_t gain = in.GetRow(); 
731             Int_t stripId = iSM*nStripsPerSM + in.GetColumn();
732           
733             if ( gain == 0 ) { 
734               nTotalSMLGLEDMon[iSM]++; 
735               if ( (amp > fMinSignalLGLEDMon) && (amp < fMaxSignalLGLEDMon) ) {
736                 FillRawsData(kSigLGLEDMon,stripId, amp);
737                 FillRawsData(kTimeLGLEDMon,stripId, time);
738               }
739               if (nPed > 0) {
740                 for (Int_t i=0; i<nPed; i++) {
741                   FillRawsData(kPedLGLEDMon,stripId, pedSamples[i]);
742                 }
743               }
744             } // gain==0
745             else if ( gain == 1 ) {             
746               nTotalSMHGLEDMon[iSM]++; 
747               if ( (amp > fMinSignalHGLEDMon) && (amp < fMaxSignalHGLEDMon) ) { 
748                 FillRawsData(kSigHGLEDMon,stripId, amp);
749                 FillRawsData(kTimeHGLEDMon,stripId, time);
750               }
751               if (nPed > 0) {
752                 for (Int_t i=0; i<nPed; i++) {
753                   FillRawsData(kPedHGLEDMon,stripId, pedSamples[i]);
754                 }
755               }
756             } // low or high gain
757           } // LEDMon
758
759         } // SM index OK
760
761       } // nsamples>0 check, some data found for this channel; not only trailer/header
762     }// end while over channel 
763    
764   }//end while over DDL's, of input stream 
765   //filling some L0 trigger histos
766   if( firstL0TimeBin < 999 ){
767     for(Int_t i = 0; i < nTot2x2; i++) {        
768       if( triggers[i][firstL0TimeBin] > 0 ) {
769         //histo->Fill(i,j);
770         FillRawsData(kNL0FirstTRU, i);
771         FillRawsData(kTimeL0FirstTRU, i, firstL0TimeBin);
772       }
773     }
774   }
775   
776   //calculate the ratio of the amplitude and fill the histograms, only if the events type is Calib
777   // RS: operation on the group of histos kSigHG,k2DRatioAmp,kRatioDist,kLEDMonRatio,kLEDMonRatio,kSigLGLEDMon
778   const int hGrp[] = {kSigHG,k2DRatioAmp,kRatioDist,kLEDMonRatio,kLEDMonRatioDist,kSigLGLEDMon};
779   if ( rawReader->GetType() == AliRawEventHeaderBase::kCalibrationEvent &&
780        CheckCloningConsistency(fRawsQAList, hGrp, sizeof(hGrp)/sizeof(int)) ) {  // RS converting original code to loop over all matching triggers
781     int nTrig =IsClonedPerTrigClass(kSigHG,fRawsQAList) ? GetNEventTrigClasses() : 0; // loop over triggers only if histos were cloned
782     //
783     for (int itr=-1;itr<nTrig;itr++) { // start from -1 to acknowledge original histos if they were kept
784       TObjArray* trArr = GetMatchingRawsHistosSet(hGrp, sizeof(hGrp)/sizeof(int) ,itr);
785       if (!trArr) continue;  // no histos for current trigger
786       //
787       Double_t binContent = 0.;
788       TProfile* prSigHG      = (TProfile *)trArr->At(0); //kSigHG
789       TH1* th2DRatioAmp      = (TH1*) trArr->At(1); //k2DRatioAmp
790       TH1* thRatioDist       = (TH1*) trArr->At(2); //kRatioDist
791       TH1* thLEDMonRatio     = (TH1*) trArr->At(3); //kLEDMonRatio
792       TH1* thLEDMonRatioDist = (TH1*) trArr->At(4); //kLEDMonRatio
793       TH1* hSigLGLEDMon      = (TH1*) trArr->At(5); //kSigLGLEDMon
794       th2DRatioAmp->Reset("ICE");
795       thRatioDist->Reset("ICE");
796       thLEDMonRatio->Reset("ICE");
797       thLEDMonRatioDist->Reset("ICE");
798       th2DRatioAmp->ResetStats();
799       thRatioDist->ResetStats();
800       thLEDMonRatio->ResetStats();
801       thLEDMonRatioDist->ResetStats();
802       ConvertProfile2H(prSigHG, fHighEmcHistoH2F);  
803       //
804       for(Int_t ix = 1; ix <= fHighEmcHistoH2F->GetNbinsX(); ix++) {
805         for(Int_t iy = 1; iy <= fHighEmcHistoH2F->GetNbinsY(); iy++) { 
806           if(fCalibRefHistoH2F->GetBinContent(ix, iy)) 
807             binContent = fHighEmcHistoH2F->GetBinContent(ix, iy)/fCalibRefHistoH2F->GetBinContent(ix, iy);
808           th2DRatioAmp->SetBinContent(ix, iy, binContent);
809           thRatioDist->Fill(binContent);
810         }
811       } 
812       //
813       //Now for LED monitor system, to calculate the ratio as well
814       Double_t binError = 0. ;
815       // for the binError, we add the relative errors, squared
816       Double_t relativeErrorSqr = 0. ;
817       //
818       for(int ib = 1; ib <= fLEDMonRefHistoPro->GetNbinsX(); ib++) {
819         //
820         if(fLEDMonRefHistoPro->GetBinContent(ib) != 0) {
821           binContent = hSigLGLEDMon->GetBinContent(ib) / fLEDMonRefHistoPro->GetBinContent(ib);
822
823           relativeErrorSqr = TMath::Power( (fLEDMonRefHistoPro->GetBinError(ib) / fLEDMonRefHistoPro->GetBinContent(ib)), 2);
824           if( hSigLGLEDMon->GetBinContent(ib) != 0) {
825             relativeErrorSqr += TMath::Power( (hSigLGLEDMon->GetBinError(ib)/hSigLGLEDMon->GetBinContent(ib)), 2);
826           }
827         }
828         else { // ref. run info is zero
829           binContent = -1;
830           relativeErrorSqr = 1;
831         }
832         thLEDMonRatio->SetBinContent(ib, binContent);
833         
834         binError = sqrt(relativeErrorSqr) * binContent;
835         thLEDMonRatio->SetBinError(ib, binError);
836         thLEDMonRatioDist->Fill(thLEDMonRatio->GetBinContent(ib));
837       }
838     } // loop over eventual trigger clones
839   } 
840   // let's also fill the SM and event counter histograms
841   Int_t nTotalHG = 0;
842   Int_t nTotalLG = 0;
843   Int_t nTotalTRU = 0;
844   Int_t nTotalHGLEDMon = 0;
845   Int_t nTotalLGLEDMon = 0;
846   for (iSM=0; iSM<fSuperModules; iSM++) {  
847     nTotalLG += nTotalSMLG[iSM]; 
848     nTotalHG += nTotalSMHG[iSM]; 
849     nTotalTRU += nTotalSMTRU[iSM]; 
850     nTotalLGLEDMon += nTotalSMLGLEDMon[iSM]; 
851     nTotalHGLEDMon += nTotalSMHGLEDMon[iSM]; 
852     FillRawsData(kNsmodLG,iSM, nTotalSMLG[iSM]); 
853     FillRawsData(kNsmodHG,iSM, nTotalSMHG[iSM]); 
854     FillRawsData(kNsmodTRU,iSM, nTotalSMTRU[iSM]); 
855     FillRawsData(kNsmodLGLEDMon,iSM, nTotalSMLGLEDMon[iSM]); 
856     FillRawsData(kNsmodHGLEDMon,iSM, nTotalSMHGLEDMon[iSM]); 
857   }
858  
859   FillRawsData(kNtotLG,nTotalLG);
860   FillRawsData(kNtotHG,nTotalHG);
861   FillRawsData(kNtotTRU,nTotalTRU);
862   FillRawsData(kNtotLGLEDMon,nTotalLGLEDMon);
863   FillRawsData(kNtotHGLEDMon,nTotalHGLEDMon);
864  
865   IncEvCountCycleESDs();
866   IncEvCountTotalESDs();
867   SetEventSpecie(saveSpecie) ; 
868   // just in case the next rawreader consumer forgets to reset; let's do it here again..
869   rawReader->Reset() ;
870   
871   return;
872 }
873
874 //____________________________________________________________________________
875 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeDigits()
876 {
877   // makes data from Digits
878   FillDigitsData(1,fDigitsArray->GetEntriesFast()) ; 
879   TIter next(fDigitsArray) ; 
880   AliEMCALDigit * digit ; 
881   while ( (digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(next())) ) {
882     FillDigitsData(0, digit->GetAmplitude()) ;
883   }  
884   //
885 }
886
887 //____________________________________________________________________________
888 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeDigits(TTree * digitTree)
889 {
890   // makes data from Digit Tree
891   // RS: Attention: the counters are increments in the MakeDigits()
892   if (fDigitsArray) 
893     fDigitsArray->Clear("C") ; 
894   else
895     fDigitsArray = new TClonesArray("AliEMCALDigit", 1000) ; 
896   
897   TBranch * branch = digitTree->GetBranch("EMCAL") ;
898   if ( ! branch ) { AliWarning("EMCAL branch in Digit Tree not found"); return; }
899   //
900   branch->SetAddress(&fDigitsArray) ;
901   branch->GetEntry(0) ; 
902   MakeDigits() ; 
903   //
904   IncEvCountCycleDigits();
905   IncEvCountTotalDigits();  
906   //  
907 }
908
909 //____________________________________________________________________________
910 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeRecPoints(TTree * clustersTree)
911 {
912   // makes data from RecPoints
913   TBranch *emcbranch = clustersTree->GetBranch("EMCALECARP");
914   if (!emcbranch) { 
915     AliError("can't get the branch with the EMCAL clusters !");
916     return;
917   }
918   
919   TObjArray * emcRecPoints = new TObjArray(100) ;
920   emcbranch->SetAddress(&emcRecPoints);
921   emcbranch->GetEntry(0);
922   
923   FillRecPointsData(kRecPM,emcRecPoints->GetEntriesFast()) ; 
924   TIter next(emcRecPoints) ; 
925   AliEMCALRecPoint * rp ; 
926   while ( (rp = dynamic_cast<AliEMCALRecPoint *>(next())) ) {
927     FillRecPointsData(kRecPE,rp->GetEnergy()) ;
928     FillRecPointsData(kRecPDigM,rp->GetMultiplicity());
929   }
930   emcRecPoints->Delete();
931   delete emcRecPoints;
932   IncEvCountCycleRecPoints();
933   IncEvCountTotalRecPoints();
934 }
935
936 //____________________________________________________________________________ 
937 void AliEMCALQADataMakerRec::StartOfDetectorCycle()
938 {
939   //Detector specific actions at start of cycle
940   
941 }
942
943 //____________________________________________________________________________ 
944 void AliEMCALQADataMakerRec::SetFittingAlgorithm(Int_t fitAlgo)              
945 {
946   //Set fitting algorithm and initialize it if this same algorithm was not set before.
947   //printf("**** Set Algorithm , number %d ****\n",fitAlgo);
948
949   
950   fRawAnalyzer =  AliCaloRawAnalyzerFactory::CreateAnalyzer(fitAlgo);
951   fFittingAlgorithm = fitAlgo; 
952
953   /*
954   if(fitAlgo == fFittingAlgorithm && fRawAnalyzer) {
955     //Do nothing, this same algorithm already set before.
956     //printf("**** Algorithm already set before, number %d, %s ****\n",fitAlgo, fRawAnalyzer->GetName());
957     return;
958   }
959   //Initialize the requested algorithm
960   if(fitAlgo != fFittingAlgorithm || !fRawAnalyzer) {
961     //printf("**** Init Algorithm , number %d ****\n",fitAlgo);
962                 
963     fFittingAlgorithm = fitAlgo; 
964     if (fRawAnalyzer) delete fRawAnalyzer;  // delete prev. analyzer if existed.
965                 
966     if (fitAlgo == kFastFit) {
967       fRawAnalyzer = new AliCaloRawAnalyzerFastFit();
968     }
969     else if (fitAlgo == kNeuralNet) {
970       fRawAnalyzer = new AliCaloRawAnalyzerNN();
971     }
972     else if (fitAlgo == kLMS) {
973       fRawAnalyzer = new AliCaloRawAnalyzerLMS();
974     }
975     else if (fitAlgo == kPeakFinder) {
976       fRawAnalyzer = new AliCaloRawAnalyzerPeakFinder();
977     }
978     else if (fitAlgo == kCrude) {
979       fRawAnalyzer = new AliCaloRawAnalyzerCrude();
980     }
981     else {
982       AliWarning("EMCAL QA invalid fit algorithm choice") ; 
983     }
984
985   }
986   return;
987   */
988 }
989
990 //_____________________________________________________________________________________
991 void AliEMCALQADataMakerRec::ConvertProfile2H(TProfile * p, TH2 * histo) 
992 {  
993   // reset histogram
994   histo->Reset("ICE") ; 
995   histo->ResetStats(); 
996
997   Int_t nbinsProf = p->GetNbinsX();
998   
999   // loop through the TProfile p and fill the TH2F histo 
1000   Int_t row = 0;
1001   Int_t col = 0;
1002   Double_t binContent = 0;
1003   Int_t towerNum = 0; // global tower Id
1004   //  i = 0; // tower Id within SuperModule
1005   Int_t iSM = 0; // SuperModule index 
1006   Int_t iSMSide = 0; // 0=A, 1=C side
1007   Int_t iSMSector = 0; // 2 SM's per sector
1008   
1009   // indices for 2D plots
1010   Int_t col2d = 0;
1011   Int_t row2d = 0;
1012   
1013   for (Int_t ibin = 1; ibin <= nbinsProf; ibin++) {
1014     towerNum = (Int_t) p->GetBinCenter(ibin);
1015     binContent = p->GetBinContent(ibin);
1016     
1017     // figure out what the tower indices are: col, row within a SuperModule
1018     iSM = towerNum/(AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols);
1019     col = (towerNum/AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows) % (AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols);
1020     row = towerNum % (AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows);
1021     
1022     //DecodeTowerNum(towerNum, &SM, &col, &row);
1023     // then we calculate what the global 2D coord are, based on which SM 
1024     // we are in
1025     iSMSector = iSM / 2;
1026     iSMSide = iSM % 2;
1027     
1028     if (iSMSide == 1) { // C side, shown to the right
1029       col2d = col + AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
1030     }
1031     else { // A side, shown to the left 
1032       col2d = col; 
1033     }
1034     
1035     row2d = row + iSMSector * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows;
1036     
1037     histo->SetBinContent(col2d+1, row2d+1, binContent);
1038   }
1039
1040
1041
1042
1043 void AliEMCALQADataMakerRec::GetTruChannelPosition( Int_t &globRow, Int_t &globColumn, Int_t module, Int_t ddl, Int_t branch, Int_t column )
1044 {
1045   Int_t mrow;
1046   Int_t mcol;
1047   Int_t trow;
1048   Int_t tcol;
1049   Int_t drow;
1050   Int_t rcu;
1051   // RCU 0 or 1
1052   rcu = ddl % 2;
1053
1054   // 12 rows of 2x2s in a module (3 TRUs by 4 rows)
1055   mrow = (module/2) * 12;
1056   // 24 columns per module, odd module numbers increased by 24
1057   mcol = (module%2) * 24;
1058
1059   // position within TRU coordinates
1060   tcol = column / 4;
1061   trow = column % 4;
1062
1063   //.combine
1064   if( module%2 == 0 ){   // A side
1065     // mirror rows
1066     trow = 3 - trow;
1067
1068     // TRU in module row addition
1069     drow = (rcu*branch+rcu) * 4;
1070
1071   }
1072   else{   // C side
1073     // mirror columns
1074     tcol = 23 - tcol;
1075
1076     // TRU in module row addition
1077     drow = (2 - (rcu*branch+rcu)) * 4;
1078   }
1079
1080   // output global row/collumn position (0,0 = SMA0, phi = 0, |eta| = max)
1081   globRow = mrow + drow + trow;
1082   globColumn = mcol + tcol;
1083         return;
1084
1085 }
1086