reverting coverity fix
[u/mrichter/AliRoot.git] / EMCAL / AliEMCALQADataMakerRec.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15 /*
16 Based on the QA code for PHOS written by Yves Schutz July 2007
17
18 Authors:  J.Klay (Cal Poly) May 2008
19           S. Salur LBL April 2008
20  
21 Created one histogram for QA shifter;-- Yaxian Mao: 11/2009
22 The idea:average counts for all the towers should be flat 
23 Change all existing histograms as experts
24
25 Change histograms for DQM shifter: --  Yaxian Mao 04/2010
26 Calcuate the amplitude ratio from current run and the LED reference, for QAChecker use
27 Also calculate the ratio of amplitude from LED Monitor system (current/Reference), to check LED system  
28  
29 */
30
31 // --- ROOT system ---
32 #include <TClonesArray.h>
33 #include <TFile.h> 
34 #include <TH1F.h> 
35 #include <TH1I.h> 
36 #include <TH2F.h> 
37 #include <TLine.h>
38 #include <TText.h>
39 #include <TProfile.h> 
40 #include <TStyle.h>
41 // --- Standard library ---
42
43
44 // --- AliRoot header files ---
45 #include "AliDAQ.h"
46 #include "AliESDCaloCluster.h"
47 #include "AliESDCaloCells.h"
48 #include "AliESDEvent.h"
49 #include "AliLog.h"
50 #include "AliEMCALQADataMakerRec.h"
51 #include "AliQAChecker.h"
52 #include "AliEMCALDigit.h" 
53 #include "AliEMCALRecPoint.h" 
54 #include "AliEMCALRawUtils.h"
55 #include "AliEMCALReconstructor.h"
56 #include "AliEMCALRecParam.h"
57 #include "AliRawReader.h"
58 #include "AliCaloRawStreamV3.h"
59 #include "AliEMCALGeoParams.h"
60 #include "AliRawEventHeaderBase.h"
61 #include "AliQAManager.h"
62 #include "AliCDBEntry.h"
63
64 #include "AliCaloBunchInfo.h"
65 #include "AliCaloFitResults.h"
66 #include "AliCaloRawAnalyzerFastFit.h"
67 #include "AliCaloRawAnalyzerNN.h"
68 #include "AliCaloRawAnalyzerLMS.h"
69 #include "AliCaloRawAnalyzerPeakFinder.h"
70 #include "AliCaloRawAnalyzerCrude.h"
71
72 #include "AliCaloRawAnalyzerFactory.h"
73
74 using namespace std;
75
76 ClassImp(AliEMCALQADataMakerRec)
77            
78 //____________________________________________________________________________ 
79 AliEMCALQADataMakerRec::AliEMCALQADataMakerRec(fitAlgorithm fitAlgo) : 
80   AliQADataMakerRec(AliQAv1::GetDetName(AliQAv1::kEMCAL), "EMCAL Quality Assurance Data Maker"),
81   fFittingAlgorithm(0),
82   fRawAnalyzer(0),
83   fRawAnalyzerTRU(0),
84   fSuperModules(10), // FIXME!!! number of SuperModules; 10 for 2011; update default for later runs 
85   fFirstPedestalSample(0),
86   fLastPedestalSample(3),
87   fFirstPedestalSampleTRU(0),
88   fLastPedestalSampleTRU(3),
89   fMinSignalLG(0),
90   fMaxSignalLG(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
91   fMinSignalHG(0),
92   fMaxSignalHG(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
93   fMinSignalTRU(0),
94   fMaxSignalTRU(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
95   fMinSignalLGLEDMon(0),
96   fMaxSignalLGLEDMon(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
97   fMinSignalHGLEDMon(0),
98   fMaxSignalHGLEDMon(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
99   fCalibRefHistoPro(NULL),
100   fCalibRefHistoH2F(NULL),
101   fLEDMonRefHistoPro(NULL),
102   fHighEmcHistoH2F(NULL)
103 //  fTextSM(new TText*[fSuperModules]) ,
104 //  fLineCol(NULL),
105 //  fLineRow(NULL)
106
107 {
108   // ctor
109   SetFittingAlgorithm(fitAlgo);
110   
111   //fRawAnalyzerTRU = new AliCaloRawAnalyzerLMS();
112   
113   fRawAnalyzerTRU =  ( AliCaloRawAnalyzerLMS*)AliCaloRawAnalyzerFactory::CreateAnalyzer(kLMS);
114   
115   fRawAnalyzerTRU->SetFixTau(kTRUE); 
116   fRawAnalyzerTRU->SetTau(2.5); // default for TRU shaper
117 //  for (Int_t sm = 0 ; sm < fSuperModules ; sm++){
118 //    fTextSM[sm] = NULL ;
119 //  }
120 }
121
122 //____________________________________________________________________________ 
123 AliEMCALQADataMakerRec::AliEMCALQADataMakerRec(const AliEMCALQADataMakerRec& qadm) :
124   AliQADataMakerRec(), 
125   fFittingAlgorithm(0),
126   fRawAnalyzer(0),
127   fRawAnalyzerTRU(0),
128   fSuperModules(qadm.GetSuperModules()), 
129   fFirstPedestalSample(qadm.GetFirstPedestalSample()), 
130   fLastPedestalSample(qadm.GetLastPedestalSample()),  
131   fFirstPedestalSampleTRU(qadm.GetFirstPedestalSampleTRU()), 
132   fLastPedestalSampleTRU(qadm.GetLastPedestalSampleTRU()),  
133   fMinSignalLG(qadm.GetMinSignalLG()),
134   fMaxSignalLG(qadm.GetMaxSignalLG()),
135   fMinSignalHG(qadm.GetMinSignalHG()),
136   fMaxSignalHG(qadm.GetMaxSignalHG()),
137   fMinSignalTRU(qadm.GetMinSignalTRU()),
138   fMaxSignalTRU(qadm.GetMaxSignalTRU()),
139   fMinSignalLGLEDMon(qadm.GetMinSignalLGLEDMon()),
140   fMaxSignalLGLEDMon(qadm.GetMaxSignalLGLEDMon()),
141   fMinSignalHGLEDMon(qadm.GetMinSignalHGLEDMon()),
142   fMaxSignalHGLEDMon(qadm.GetMaxSignalHGLEDMon()),
143   fCalibRefHistoPro(NULL),
144   fCalibRefHistoH2F(NULL),
145   fLEDMonRefHistoPro(NULL),
146   fHighEmcHistoH2F(NULL)
147 //  fTextSM(new TText*[fSuperModules]) ,
148 //  fLineCol(NULL),
149 //  fLineRow(NULL)
150 {
151   //copy ctor 
152   SetName((const char*)qadm.GetName()) ; 
153   SetTitle((const char*)qadm.GetTitle()); 
154   SetFittingAlgorithm(qadm.GetFittingAlgorithm());
155   
156   //fRawAnalyzerTRU = new AliCaloRawAnalyzerLMS();
157   fRawAnalyzerTRU = (AliCaloRawAnalyzerLMS*)AliCaloRawAnalyzerFactory::CreateAnalyzer(kLMS);
158   fRawAnalyzerTRU->SetFixTau(kTRUE); 
159   fRawAnalyzerTRU->SetTau(2.5); // default for TRU shaper
160 //  for (Int_t sm = 0 ; sm < fSuperModules ; sm++){
161 //    fTextSM[sm] = qadm.fTextSM[sm] ;
162 //  }  
163 }
164
165 //__________________________________________________________________
166 AliEMCALQADataMakerRec& AliEMCALQADataMakerRec::operator = (const AliEMCALQADataMakerRec& qadm )
167 {
168   // Equal operator.
169   this->~AliEMCALQADataMakerRec();
170   new(this) AliEMCALQADataMakerRec(qadm);
171 //  fLineCol = NULL;
172 //  fLineRow = NULL;
173 //  for (Int_t sm = 0 ; sm < fSuperModules ; sm++){
174 //    fTextSM[sm] = qadm.fTextSM[sm] ;
175 //  }    
176   return *this;
177 }
178  
179 //____________________________________________________________________________ 
180 void AliEMCALQADataMakerRec::EndOfDetectorCycle(AliQAv1::TASKINDEX_t task, TObjArray ** list)
181 {
182   //Detector specific actions at end of cycle
183         
184 //  if(fCycleCounter)
185 //        GetRawsData(kNEventsPerTower)->Scale(1./fCycleCounter);
186
187   // do the QA checking
188   AliQAChecker::Instance()->Run(AliQAv1::kEMCAL, task, list) ;  
189 }
190
191 //____________________________________________________________________________ 
192 void AliEMCALQADataMakerRec::GetCalibRefFromOCDB()
193 {
194   //Get the reference histogram from OCDB
195   TString sName1("hHighEmcalRawMaxMinusMin") ;
196   TString sName2("hLowLEDMonEmcalRawMaxMinusMin") ;
197   sName1.Prepend(Form("%s_", AliRecoParam::GetEventSpecieName(AliRecoParam::kCalib))) ; 
198   sName2.Prepend(Form("%s_", AliRecoParam::GetEventSpecieName(AliRecoParam::kCalib))) ; 
199   
200   TString refStorage(AliQAv1::GetQARefStorage()) ;
201   if (!refStorage.Contains(AliQAv1::GetLabLocalOCDB()) && !refStorage.Contains(AliQAv1::GetLabAliEnOCDB())) {
202     AliFatal(Form("%s is not a valid location for reference data", refStorage.Data())) ; 
203   } else {
204     AliQAManager* manQA = AliQAManager::QAManager(AliQAv1::kRAWS) ;    
205     AliQAv1::SetQARefDataDirName(AliRecoParam::kCalib) ;
206     if ( ! manQA->GetLock() ) { 
207       manQA->SetDefaultStorage(AliQAv1::GetQARefStorage()) ; 
208       manQA->SetSpecificStorage("*", AliQAv1::GetQARefStorage()) ;
209       manQA->SetRun(AliCDBManager::Instance()->GetRun()) ; 
210       manQA->SetLock() ; 
211     }
212     char * detOCDBDir = Form("%s/%s/%s", GetName(), AliQAv1::GetRefOCDBDirName(), AliQAv1::GetRefDataDirName()) ; 
213     AliCDBEntry * entry = manQA->Get(detOCDBDir, manQA->GetRun()) ;
214     if (entry) {
215       TList * listDetQAD =static_cast<TList *>(entry->GetObject()) ;
216       if ( strcmp(listDetQAD->ClassName(), "TList") != 0 ) {
217         AliError(Form("Expected a Tlist and found a %s for detector %s", listDetQAD->ClassName(), GetName())) ; 
218         listDetQAD = NULL ; 
219       }
220       TObjArray * dirOCDB= NULL ; 
221       if ( listDetQAD )
222         dirOCDB = static_cast<TObjArray *>(listDetQAD->FindObject(Form("%s/%s", AliQAv1::GetTaskName(AliQAv1::kRAWS).Data(), AliRecoParam::GetEventSpecieName(AliRecoParam::kCalib)))) ;       
223       if (dirOCDB){
224         fCalibRefHistoPro = dynamic_cast<TProfile *>(dirOCDB->FindObject(sName1.Data())) ; 
225         fLEDMonRefHistoPro = dynamic_cast<TProfile *>(dirOCDB->FindObject(sName2.Data())) ; 
226       }
227     }
228   }
229  
230   if(fCalibRefHistoPro && fLEDMonRefHistoPro){
231     
232     //Defining histograms binning, each 2D histogram covers all SMs
233     Int_t nSMSectors = fSuperModules / 2; // 2 SMs per sector
234     Int_t nbinsZ = 2*AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
235     Int_t nbinsPhi = nSMSectors * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows;
236     
237     if(!fCalibRefHistoH2F)
238       fCalibRefHistoH2F =  new TH2F("hCalibRefHisto", "hCalibRefHisto", nbinsZ, -0.5, nbinsZ - 0.5, nbinsPhi, -0.5, nbinsPhi -0.5);
239     ConvertProfile2H(fCalibRefHistoPro,fCalibRefHistoH2F) ; 
240   } else {
241     AliFatal(Form("No reference object with name %s or %s found", sName1.Data(), sName2.Data())) ; 
242   }
243 }
244 //____________________________________________________________________________ 
245 void AliEMCALQADataMakerRec::InitESDs()
246 {
247   //Create histograms to controll ESD
248   const Bool_t expert   = kTRUE ; 
249   const Bool_t image    = kTRUE ; 
250   
251   TH1F * h1 = new TH1F("hESDCaloClusterE",  "ESDs CaloCluster energy in EMCAL;Energy [GeV];Counts",    200, 0., 100.) ; 
252   h1->Sumw2() ;
253   Add2ESDsList(h1, kESDCaloClusE, !expert, image)  ;                                                     
254
255   TH1I * h2 = new TH1I("hESDCaloClusterM", "ESDs CaloCluster multiplicity in EMCAL;# of Clusters;Entries", 100, 0,  100) ; 
256   h2->Sumw2() ;
257   Add2ESDsList(h2, kESDCaloClusM, !expert, image)  ;
258
259   TH1F * h3 = new TH1F("hESDCaloCellA",  "ESDs CaloCell amplitude in EMCAL;Energy [GeV];Counts",    500, 0., 50.) ; 
260   h3->Sumw2() ;
261   Add2ESDsList(h3, kESDCaloCellA, !expert, image)  ;  
262  
263   TH1I * h4 = new TH1I("hESDCaloCellM", "ESDs CaloCell multiplicity in EMCAL;# of Clusters;Entries", 200, 0,  1000) ; 
264   h4->Sumw2() ;
265   Add2ESDsList(h4, kESDCaloCellM, !expert, image) ;
266         
267 }
268
269 //____________________________________________________________________________ 
270 void AliEMCALQADataMakerRec::InitDigits()
271 {
272   // create Digits histograms in Digits subdir
273   const Bool_t expert   = kTRUE ; 
274   const Bool_t image    = kTRUE ; 
275   
276   TH1I * h0 = new TH1I("hEmcalDigits",    "Digits amplitude distribution in EMCAL;Amplitude [ADC counts];Counts",    500, 0, 500) ; 
277   h0->Sumw2() ;
278   Add2DigitsList(h0, 0, !expert, image) ;
279   TH1I * h1 = new TH1I("hEmcalDigitsMul", "Digits multiplicity distribution in EMCAL;# of Digits;Entries", 200, 0, 2000) ; 
280   h1->Sumw2() ;
281   Add2DigitsList(h1, 1, !expert, image) ;
282 }
283
284 //____________________________________________________________________________ 
285 void AliEMCALQADataMakerRec::InitRecPoints()
286 {
287   // create Reconstructed PoInt_ts histograms in RecPoints subdir
288   const Bool_t expert   = kTRUE ; 
289   const Bool_t image    = kTRUE ; 
290   
291   TH1F* h0 = new TH1F("hEMCALRpE","EMCAL RecPoint energies;Energy [GeV];Counts",200, 0.,20.); //GeV
292   h0->Sumw2();
293   Add2RecPointsList(h0,kRecPE, !expert, image);
294
295   TH1I* h1 = new TH1I("hEMCALRpM","EMCAL RecPoint multiplicities;# of Clusters;Entries",100,0,100);
296   h1->Sumw2();
297   Add2RecPointsList(h1,kRecPM, !expert, image);
298
299   TH1I* h2 = new TH1I("hEMCALRpDigM","EMCAL RecPoint Digit Multiplicities;# of Digits;Entries",20,0,20);
300   h2->Sumw2();
301   Add2RecPointsList(h2,kRecPDigM, !expert, image);
302
303 }
304
305 //____________________________________________________________________________ 
306 void AliEMCALQADataMakerRec::InitRaws()
307 {
308   // create Raws histograms in Raws subdir
309   const Bool_t expert   = kTRUE ; 
310   const Bool_t saveCorr = kTRUE ; 
311   const Bool_t image    = kTRUE ; 
312   const Option_t *profileOption = "s";
313
314   Int_t nTowersPerSM = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols; // number of towers in a SuperModule; 24x48
315   Int_t nTot = fSuperModules * nTowersPerSM; // max number of towers in all SuperModules
316     
317   //Defining histograms binning, each 2D histogram covers all SMs
318   Int_t nSMSectors = fSuperModules / 2; // 2 SMs per sector
319   Int_t nbinsZ = 2*AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
320   Int_t nbinsPhi = nSMSectors * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows;
321    
322    // counter info: number of channels per event (bins are SM index)
323   TProfile * h0 = new TProfile("hLowEmcalSupermodules", "Low Gain EMC: # of towers vs SuperMod;SM Id;# of towers",
324                                fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5, profileOption) ;
325   Add2RawsList(h0, kNsmodLG, expert, !image, !saveCorr) ;
326   TProfile * h1 = new TProfile("hHighEmcalSupermodules", "High Gain EMC: # of towers vs SuperMod;SM Id;# of towers",  
327                                fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5, profileOption) ; 
328   Add2RawsList(h1, kNsmodHG, expert, !image, !saveCorr) ;
329
330   // where did max sample occur? (bins are towers)
331   TProfile * h2 = new TProfile("hLowEmcalRawtime", "Low Gain EMC: Time at Max vs towerId;Tower Id;Time [ticks]", 
332                                nTot, -0.5, nTot-0.5, profileOption) ;
333   Add2RawsList(h2, kTimeLG, expert, !image, !saveCorr) ;
334   TProfile * h3 = new TProfile("hHighEmcalRawtime", "High Gain EMC: Time at Max vs towerId;Tower Id;Time [ticks]", 
335                                nTot, -0.5, nTot-0.5, profileOption) ;
336   Add2RawsList(h3, kTimeHG, expert, !image, !saveCorr) ;
337
338   // how much above pedestal was the max sample?  (bins are towers)
339   TProfile * h4 = new TProfile("hLowEmcalRawMaxMinusMin", "Low Gain EMC: Max - Min vs towerId;Tower Id;Max-Min [ADC counts]", 
340                                nTot, -0.5, nTot-0.5, profileOption) ;
341   Add2RawsList(h4, kSigLG, expert, image, !saveCorr) ;
342   TProfile * h5 = new TProfile("hHighEmcalRawMaxMinusMin", "High Gain EMC: Max - Min vs towerId;Tower Id;Max-Min [ADC counts]",
343                                nTot, -0.5, nTot-0.5, profileOption) ;
344   Add2RawsList(h5, kSigHG, expert, image, !saveCorr) ;
345
346   // total counter: channels per event
347   TH1I * h6 = new TH1I("hLowNtot", "Low Gain EMC: Total Number of found towers;# of Towers;Counts", 200, 0, nTot) ;
348   h6->Sumw2() ;
349   Add2RawsList(h6, kNtotLG, expert, !image, !saveCorr) ;
350   TH1I * h7 = new TH1I("hHighNtot", "High Gain EMC: Total Number of found towers;# of Towers;Counts", 200,0, nTot) ;
351   h7->Sumw2() ;
352   Add2RawsList(h7, kNtotHG, expert, !image, !saveCorr) ;
353
354   // pedestal (bins are towers)
355   TProfile * h8 = new TProfile("hLowEmcalRawPed", "Low Gain EMC: Pedestal vs towerId;Tower Id;Pedestal [ADC counts]", 
356                                nTot, -0.5, nTot-0.5, profileOption) ;
357   Add2RawsList(h8, kPedLG, expert, !image, !saveCorr) ;
358   TProfile * h9 = new TProfile("hHighEmcalRawPed", "High Gain EMC: Pedestal vs towerId;Tower Id;Pedestal [ADC counts]",
359                                nTot, -0.5, nTot-0.5, profileOption) ;
360   Add2RawsList(h9, kPedHG, expert, !image, !saveCorr) ;
361         
362   //temp 2D amplitude histogram for the current run
363   fHighEmcHistoH2F = new TH2F("h2DHighEC2", "High Gain EMC:Max - Min [ADC counts]", nbinsZ, -0.5 , nbinsZ-0.5, nbinsPhi, -0.5, nbinsPhi-0.5);
364    fHighEmcHistoH2F->SetDirectory(0) ; // this histo must be memory resident
365   //add ratio histograms: to comapre the current run with the reference data 
366   TH2F * h15 = new TH2F("h2DRatioAmp", "High Gain Ratio to Reference:Amplitude_{current run}/Amplitude_{reference run}", nbinsZ, -0.5 , nbinsZ-0.5, 
367                         nbinsPhi, -0.5, nbinsPhi-0.5);
368   //settings for display in amore
369   h15->SetTitle("Amplitude_{current run}/Amplitude_{reference run}"); 
370   h15->SetMaximum(2.0);
371   h15->SetMinimum(0.1);
372   h15->SetOption("COLZ");
373   gStyle->SetOptStat(0);
374   Int_t color[] = {4,3,2} ;
375   gStyle->SetPalette(3,color);
376   h15->GetZaxis()->SetNdivisions(3);
377   h15->UseCurrentStyle();
378   h15->SetDirectory(0);
379   Add2RawsList(h15, k2DRatioAmp, !expert, image, !saveCorr) ;
380
381         TH1F * h16 = new TH1F("hRatioDist", "Amplitude_{current run}/Amplitude_{reference run} ratio distribution", nTot, 0., 2.);
382   h16->SetMinimum(0.1); 
383   h16->SetMaximum(100.);
384   gStyle->SetOptStat(0);
385   h16->UseCurrentStyle();
386   h16->SetDirectory(0);
387   Add2RawsList(h16, kRatioDist, !expert, image, !saveCorr) ;
388  
389   // now repeat the same for TRU and LEDMon data
390   Int_t nTot2x2 = fSuperModules * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALTRUsPerSM * AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU; // max number of TRU channels for all SuperModules
391
392   // counter info: number of channels per event (bins are SM index)
393   TProfile * hT0 = new TProfile("hTRUEmcalSupermodules", "TRU EMC: # of TRU channels vs SuperMod;SM Id;# of TRU channels",
394                                 fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5, profileOption) ;
395   Add2RawsList(hT0, kNsmodTRU, expert, !image, !saveCorr) ;
396
397   // where did max sample occur? (bins are TRU channels)
398   TProfile * hT1 = new TProfile("hTRUEmcalRawtime", "TRU EMC: Time at Max vs 2x2Id;2x2 Id;Time [ticks]", 
399                                 nTot2x2, -0.5, nTot2x2-0.5, profileOption) ;
400   Add2RawsList(hT1, kTimeTRU, expert, !image, !saveCorr) ;
401
402   // how much above pedestal was the max sample?  (bins are TRU channels)
403   TProfile * hT2 = new TProfile("hTRUEmcalRawMaxMinusMin", "TRU EMC: Max - Min vs 2x2Id;2x2 Id;Max-Min [ADC counts]", 
404                                 nTot2x2, -0.5, nTot2x2-0.5, profileOption) ;
405   Add2RawsList(hT2, kSigTRU, expert, !image, !saveCorr) ;
406
407   // total counter: channels per event
408   TH1I * hT3 = new TH1I("hTRUNtot", "TRU EMC: Total Number of found TRU channels;# of TRU Channels;Counts", 200, 0, nTot2x2) ;
409   hT3->Sumw2() ;
410   Add2RawsList(hT3, kNtotTRU, expert, !image, !saveCorr) ;
411
412   // pedestal (bins are TRU channels)
413   TProfile * hT4 = new TProfile("hTRUEmcalRawPed", "TRU EMC: Pedestal vs 2x2Id;2x2 Id;Pedestal [ADC counts]", 
414                                 nTot2x2, -0.5, nTot2x2-0.5, profileOption) ;
415   Add2RawsList(hT4, kPedTRU, expert, !image, !saveCorr) ;
416
417   // L0 trigger hits: # of hits (bins are TRU channels)
418   TH1I * hT5 = new TH1I("hTRUEmcalL0hits", "L0 trigger hits: Total number of 2x2 L0 generated", nTot2x2, -0.5, nTot2x2);
419   hT5->Sumw2();
420   Add2RawsList(hT5, kNL0TRU, expert, !image, !saveCorr);
421
422   // L0 trigger hits: average time (bins are TRU channels)
423   TProfile * hT6 = new TProfile("hTRUEmcalL0hitsAvgTime", "L0 trigger hits: average time bin", nTot2x2, -0.5, nTot2x2, profileOption); 
424   Add2RawsList(hT6, kTimeL0TRU, expert, !image, !saveCorr);
425
426   // and also LED Mon..
427   // LEDMon has both high and low gain channels, just as regular FEE/towers
428   Int_t nTotLEDMon = fSuperModules * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALLEDRefs; // max number of LEDMon channels for all SuperModules
429
430   // counter info: number of channels per event (bins are SM index)
431   TProfile * hL0 = new TProfile("hLowLEDMonEmcalSupermodules", "LowLEDMon Gain EMC: # of strips vs SuperMod;SM Id;# of strips",
432                                fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5, profileOption) ;
433   Add2RawsList(hL0, kNsmodLGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
434   TProfile * hL1 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalSupermodules", "HighLEDMon Gain EMC: # of strips vs SuperMod;SM Id;# of strips",  
435                                fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5, profileOption) ; 
436   Add2RawsList(hL1, kNsmodHGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
437
438   // where did max sample occur? (bins are strips)
439   TProfile * hL2 = new TProfile("hLowLEDMonEmcalRawtime", "LowLEDMon Gain EMC: Time at Max vs stripId;Strip Id;Time [ticks]", 
440                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5, profileOption) ;
441   Add2RawsList(hL2, kTimeLGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
442   TProfile * hL3 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalRawtime", "HighLEDMon Gain EMC: Time at Max vs stripId;Strip Id;Time [ticks]", 
443                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5, profileOption) ;
444   Add2RawsList(hL3, kTimeHGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
445
446   // how much above pedestal was the max sample?  (bins are strips)
447   TProfile * hL4 = new TProfile("hLowLEDMonEmcalRawMaxMinusMin", "LowLEDMon Gain EMC: Max - Min vs stripId;Strip Id;Max-Min [ADC counts]", 
448                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5, profileOption) ;
449   Add2RawsList(hL4, kSigLGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
450   TProfile * hL5 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalRawMaxMinusMin", "HighLEDMon Gain EMC: Max - Min vs stripId;Strip Id;Max-Min [ADC counts]",
451                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5, profileOption) ;
452   Add2RawsList(hL5, kSigHGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
453   
454     // total counter: channels per event
455   TH1I * hL6 = new TH1I("hLowLEDMonNtot", "LowLEDMon Gain EMC: Total Number of found strips;# of Strips;Counts", 200, 0, nTotLEDMon) ;
456   hL6->Sumw2() ;
457   Add2RawsList(hL6, kNtotLGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
458   TH1I * hL7 = new TH1I("hHighLEDMonNtot", "HighLEDMon Gain EMC: Total Number of found strips;# of Strips;Counts", 200,0, nTotLEDMon) ;
459   hL7->Sumw2() ;
460   Add2RawsList(hL7, kNtotHGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
461
462   // pedestal (bins are strips)
463   TProfile * hL8 = new TProfile("hLowLEDMonEmcalRawPed", "LowLEDMon Gain EMC: Pedestal vs stripId;Strip Id;Pedestal [ADC counts]", 
464                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5, profileOption) ;
465   Add2RawsList(hL8, kPedLGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
466   TProfile * hL9 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalRawPed", "HighLEDMon Gain EMC: Pedestal vs stripId;Strip Id;Pedestal [ADC counts]",
467                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5, profileOption) ;
468   Add2RawsList(hL9, kPedHGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
469   
470   //add two histograms for shifter from the LED monitor system: comapre LED monitor with the reference run
471   //to be used for decision whether we need to change reference data
472   TH1F * hL10 = new TH1F("hMaxMinusMinLEDMonRatio", "LEDMon amplitude, Ratio to reference run", nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5) ;
473   //settings for display in amore
474   hL10->SetTitle("Amplitude_{LEDMon current}/Amplitude_{LEDMon reference}"); 
475   hL10->SetMaximum(2.0);
476   hL10->SetMinimum(0.1); 
477   gStyle->SetOptStat(0);
478   hL10->UseCurrentStyle();
479   hL10->SetDirectory(0);
480 //  hL10->SetOption("E");
481   Add2RawsList(hL10, kLEDMonRatio, !expert, image, !saveCorr) ;
482
483   TH1F * hL11 = new TH1F("hMaxMinusMinLEDMonRatioDist", "LEDMon amplitude, Ratio distribution", nTotLEDMon, 0, 2);
484   hL11->SetMinimum(0.1) ;
485   gStyle->SetOptStat(0);
486   hL11->UseCurrentStyle();
487   hL11->SetDirectory(0);
488   Add2RawsList(hL11, kLEDMonRatioDist, !expert, image, !saveCorr) ;
489   
490   GetCalibRefFromOCDB();   
491 }
492
493 //____________________________________________________________________________
494 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeESDs(AliESDEvent * esd)
495 {
496   // make QA data from ESDs
497
498   Int_t nTot = 0 ; 
499   for ( Int_t index = 0; index < esd->GetNumberOfCaloClusters() ; index++ ) {
500     AliESDCaloCluster * clu = esd->GetCaloCluster(index) ;
501     if( clu->IsEMCAL() ) {
502       GetESDsData(kESDCaloClusE)->Fill(clu->E()) ;
503       nTot++ ;
504     } 
505   }
506   GetESDsData(kESDCaloClusM)->Fill(nTot) ;
507
508   //fill calo cells
509   AliESDCaloCells* cells = esd->GetEMCALCells();
510   GetESDsData(kESDCaloCellM)->Fill(cells->GetNumberOfCells()) ;
511
512   for ( Int_t index = 0; index < cells->GetNumberOfCells() ; index++ ) {
513     GetESDsData(kESDCaloCellA)->Fill(cells->GetAmplitude(index)) ;
514   }
515
516 }
517
518 //____________________________________________________________________________
519 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeRaws(AliRawReader* rawReader)
520 {
521  // Check that all the reference histograms exist before we try to use them - otherwise call InitRaws
522   if (!fCalibRefHistoPro || !fCalibRefHistoH2F || !fLEDMonRefHistoPro || !fHighEmcHistoH2F) {
523     InitRaws();
524   }
525
526   // make sure EMCal was readout during the event
527   Int_t emcID = AliDAQ::DetectorID("EMCAL"); // bit 18..
528   const UInt_t *detPattern = rawReader->GetDetectorPattern(); 
529   UInt_t emcInReadout = ( ((1 << emcID) & detPattern[0]) >> emcID);
530   if (! emcInReadout) return; // no poInt_t in looking at this event, if no EMCal data
531
532   // setup
533   rawReader->Reset() ;
534   AliCaloRawStreamV3 in(rawReader,"EMCAL"); 
535   rawReader->Select("EMCAL", 0, AliEMCALGeoParams::fgkLastAltroDDL) ; //select EMCAL DDL's 
536
537   AliRecoParam::EventSpecie_t saveSpecie = fEventSpecie ;
538
539   if (rawReader->GetType() == AliRawEventHeaderBase::kCalibrationEvent) { 
540     SetEventSpecie(AliRecoParam::kCalib) ;
541   }
542  
543   const Int_t nTowersPerSM = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols; // number of towers in a SuperModule; 24x48
544   const Int_t nRows        = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows; // number of rows per SuperModule
545   const Int_t nStripsPerSM = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALLEDRefs; // number of strips per SuperModule
546   const Int_t n2x2PerSM    = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALTRUsPerSM * AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU; // number of TRU 2x2's per SuperModule
547   const Int_t n2x2PerTRU   = AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU;
548
549   // SM counters; decl. should be safe, assuming we don't get more than expected SuperModules..
550   Int_t nTotalSMLG[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules]       = {0};
551   Int_t nTotalSMHG[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules]       = {0};
552   Int_t nTotalSMTRU[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules]      = {0};
553   Int_t nTotalSMLGLEDMon[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules] = {0};
554   Int_t nTotalSMHGLEDMon[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules] = {0};
555
556   const Int_t nTRUL0ChannelBits = 10; // used for L0 trigger bits checks
557   Int_t iSM = 0; // SuperModule index 
558   // start loop over input stream  
559   while (in.NextDDL()) {
560     Int_t iRCU = in.GetDDLNumber() % 2; // RCU0 or RCU1, within SuperModule
561     fRawAnalyzer->SetIsZeroSuppressed( in.GetZeroSupp() ); 
562
563     while (in.NextChannel()) {
564       iSM = in.GetModule(); // SuperModule
565       //prInt_tf("iSM %d DDL %d", iSM, in.GetDDLNumber()); 
566       if (iSM>=0 && iSM<fSuperModules) { // valid module reading
567
568         Int_t nsamples = 0;
569         vector<AliCaloBunchInfo> bunchlist; 
570         while (in.NextBunch()) {
571           nsamples += in.GetBunchLength();
572           bunchlist.push_back( AliCaloBunchInfo(in.GetStartTimeBin(), in.GetBunchLength(), in.GetSignals() ) );
573         } 
574         
575         if (nsamples > 0) { // this check is needed for when we have zero-supp. on, but not sparse readout
576           Float_t time = 0.; 
577           Float_t amp  = 0.; 
578           // indices for pedestal calc.
579           Int_t firstPedSample = 0;
580           Int_t lastPedSample  = 0;
581           bool isTRUL0IdData   = false;
582
583           if (! in.IsTRUData() ) { // high gain, low gain, LED Mon data - all have the same shaper/sampling 
584             AliCaloFitResults fitResults = fRawAnalyzer->Evaluate( bunchlist, in.GetAltroCFG1(), in.GetAltroCFG2()); 
585             amp  = fitResults.GetAmp();
586             time = fitResults.GetTof(); 
587             firstPedSample = fFirstPedestalSample;
588             lastPedSample  = fLastPedestalSample;
589           }
590           else { // TRU data is special, needs its own analyzer
591             AliCaloFitResults fitResults = fRawAnalyzerTRU->Evaluate( bunchlist, in.GetAltroCFG1(), in.GetAltroCFG2()); 
592             amp  = fitResults.GetAmp();
593             time = fitResults.GetTof(); 
594             firstPedSample = fFirstPedestalSampleTRU;
595             lastPedSample  = fLastPedestalSampleTRU;
596             if (in.GetColumn() > n2x2PerTRU) {
597               isTRUL0IdData = true;
598             }
599           }
600   
601           // pedestal samples
602           Int_t nPed = 0;
603           vector<Int_t> pedSamples; 
604         
605           // select earliest bunch 
606           unsigned int bunchIndex = 0;
607           unsigned int startBin = bunchlist.at(0).GetStartBin();
608           if (bunchlist.size() > 0) {
609             for(unsigned int ui=1; ui < bunchlist.size(); ui++ ) {
610               if (startBin > bunchlist.at(ui).GetStartBin() ) {
611                 startBin = bunchlist.at(ui).GetStartBin();
612                 bunchIndex = ui;
613               }
614             }
615           }
616
617           // check bunch for entries in the pedestal sample range
618           Int_t bunchLength = bunchlist.at(bunchIndex).GetLength(); 
619           const UShort_t *sig = bunchlist.at(bunchIndex).GetData();
620           Int_t timebin = 0;
621
622           if (! isTRUL0IdData) { // regular data, can look at pedestals
623             for (Int_t i = 0; i<bunchLength; i++) {
624               timebin = startBin--;
625               if ( firstPedSample<=timebin && timebin<=lastPedSample ) {
626                 pedSamples.push_back( sig[i] );
627                 nPed++;
628               }     
629             } // i
630           }
631           else { // TRU L0 Id Data
632             // which TRU the channel belongs to?
633             Int_t iTRUId = in.GetModule()*3 + (iRCU*in.GetBranch() + iRCU);
634
635             for (Int_t i = 0; i< bunchLength; i++) {
636               for( Int_t j = 0; j < nTRUL0ChannelBits; j++ ){
637                 // check if the bit j is 1
638                 if( (sig[i] & ( 1 << j )) > 0 ){
639                   Int_t iTRUIdInSM = (in.GetColumn() - n2x2PerTRU)*nTRUL0ChannelBits+j;
640                   if(iTRUIdInSM < n2x2PerTRU) {
641                     Int_t iTRUAbsId = iTRUIdInSM + n2x2PerTRU * iTRUId;
642                     // Fill the histograms
643                     GetRawsData(kNL0TRU)->Fill(iTRUAbsId);
644                     GetRawsData(kTimeL0TRU)->Fill(iTRUAbsId, startBin);
645                   }
646                 }
647               }
648               startBin--;
649             } // i      
650           } // TRU L0 Id data                   
651
652           // fill histograms
653           if ( in.IsLowGain() || in.IsHighGain() ) { // regular towers
654             Int_t towerId = iSM*nTowersPerSM + in.GetColumn()*nRows + in.GetRow();
655             if ( in.IsLowGain() ) { 
656               nTotalSMLG[iSM]++; 
657               if ( (amp > fMinSignalLG) && (amp < fMaxSignalLG) ) { 
658                 GetRawsData(kSigLG)->Fill(towerId, amp);
659                 GetRawsData(kTimeLG)->Fill(towerId, time);
660               }
661               if (nPed > 0) {
662                 for (Int_t i=0; i<nPed; i++) {
663                   GetRawsData(kPedLG)->Fill(towerId, pedSamples[i]);
664                 }
665               }
666             } // gain==0
667             else if ( in.IsHighGain() ) {               
668               nTotalSMHG[iSM]++; 
669               if ( (amp > fMinSignalHG) && (amp < fMaxSignalHG) ) { 
670                 GetRawsData(kSigHG)->Fill(towerId, amp);
671                 GetRawsData(kTimeHG)->Fill(towerId, time);
672               } 
673               if (nPed > 0) {
674                 for (Int_t i=0; i<nPed; i++) {
675                   GetRawsData(kPedHG)->Fill(towerId, pedSamples[i]);
676                 }
677               }
678             } // gain==1
679           } // low or high gain
680           // TRU
681           else if ( in.IsTRUData() && in.GetColumn()<AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU) {
682             // for TRU data, the mapping class holds the TRU Int_ternal 2x2 number (0..95) in the Column var..
683             Int_t iTRU = (iRCU*in.GetBranch() + iRCU); //TRU0 is from RCU0, TRU1 from RCU1, TRU2 is from branch B on RCU1
684             Int_t iTRU2x2Id = iSM*n2x2PerSM + iTRU*AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU 
685               + in.GetColumn();
686             nTotalSMTRU[iSM]++; 
687             if ( (amp > fMinSignalTRU) && (amp < fMaxSignalTRU) ) { 
688               GetRawsData(kSigTRU)->Fill(iTRU2x2Id, amp);
689               GetRawsData(kTimeTRU)->Fill(iTRU2x2Id, time);
690             }
691             if (nPed > 0) {
692               for (Int_t i=0; i<nPed; i++) {
693                 GetRawsData(kPedTRU)->Fill(iTRU2x2Id, pedSamples[i]);
694               }
695             }
696           }
697           // LED Mon
698           else if ( in.IsLEDMonData() ) {
699             // for LED Mon data, the mapping class holds the gain info in the Row variable
700             // and the Strip number in the Column..
701             Int_t gain = in.GetRow(); 
702             Int_t stripId = iSM*nStripsPerSM + in.GetColumn();
703           
704             if ( gain == 0 ) { 
705               nTotalSMLGLEDMon[iSM]++; 
706               if ( (amp > fMinSignalLGLEDMon) && (amp < fMaxSignalLGLEDMon) ) { 
707                 GetRawsData(kSigLGLEDMon)->Fill(stripId, amp);
708                 GetRawsData(kTimeLGLEDMon)->Fill(stripId, time);
709               }
710               if (nPed > 0) {
711                 for (Int_t i=0; i<nPed; i++) {
712                   GetRawsData(kPedLGLEDMon)->Fill(stripId, pedSamples[i]);
713                 }
714               }
715             } // gain==0
716             else if ( gain == 1 ) {             
717               nTotalSMHGLEDMon[iSM]++; 
718               if ( (amp > fMinSignalHGLEDMon) && (amp < fMaxSignalHGLEDMon) ) { 
719                 GetRawsData(kSigHGLEDMon)->Fill(stripId, amp);
720                 GetRawsData(kTimeHGLEDMon)->Fill(stripId, time);
721               }
722               if (nPed > 0) {
723                 for (Int_t i=0; i<nPed; i++) {
724                   GetRawsData(kPedHGLEDMon)->Fill(stripId, pedSamples[i]);
725                 }
726               }
727             } // low or high gain
728           } // LEDMon
729
730         } // SM index OK
731
732       } // nsamples>0 check, some data found for this channel; not only trailer/header
733     }// end while over channel 
734    
735   }//end while over DDL's, of input stream 
736
737  // TProfile * p = dynamic_cast<TProfile *>(GetRawsData(kSigHG)) ;
738   ConvertProfile2H(dynamic_cast<TProfile *>(GetRawsData(kSigHG)), fHighEmcHistoH2F) ;  
739   Double_t binContent = 0. ;
740   
741   
742   //calculate the ratio of the amplitude and fill the histograms, only if the events type is Calib
743  if (rawReader->GetType() == AliRawEventHeaderBase::kCalibrationEvent) {
744                 //reset ratio histograms
745                 GetRawsData(k2DRatioAmp)->Reset("ICE"); 
746                 GetRawsData(kRatioDist)->Reset("ICE"); 
747                 GetRawsData(kLEDMonRatio)->Reset("ICE");        
748                 GetRawsData(kLEDMonRatioDist)->Reset("ICE");
749                 GetRawsData(k2DRatioAmp)->ResetStats(); 
750                 GetRawsData(kRatioDist)->ResetStats();
751                 GetRawsData(kLEDMonRatio)->ResetStats();
752                 GetRawsData(kLEDMonRatioDist)->ResetStats();
753
754     for(Int_t ix = 1; ix <= fHighEmcHistoH2F->GetNbinsX(); ix++) {
755      for(Int_t iy = 1; iy <= fHighEmcHistoH2F->GetNbinsY(); iy++) {
756        if(fCalibRefHistoH2F->GetBinContent(ix, iy))binContent = fHighEmcHistoH2F->GetBinContent(ix, iy)/fCalibRefHistoH2F->GetBinContent(ix, iy) ;
757         GetRawsData(k2DRatioAmp)->SetBinContent(ix, iy, binContent);
758         GetRawsData(kRatioDist)->Fill(GetRawsData(k2DRatioAmp)->GetBinContent(ix, iy));
759       }
760     } 
761    
762                 //Now for LED monitor system, to calculate the ratio as well
763                 Double_t binError = 0. ;
764                 // for the binError, we add the relative errors, squared
765                 Double_t relativeErrorSqr = 0. ;
766   
767                 for(int ib = 1; ib <= fLEDMonRefHistoPro->GetNbinsX(); ib++) {
768     
769                         if(fLEDMonRefHistoPro->GetBinContent(ib) != 0) {
770                                 binContent = GetRawsData(kSigLGLEDMon)->GetBinContent(ib) / fLEDMonRefHistoPro->GetBinContent(ib);
771
772                                 relativeErrorSqr = TMath::Power( (fLEDMonRefHistoPro->GetBinError(ib) / fLEDMonRefHistoPro->GetBinContent(ib)), 2);
773                                 if(GetRawsData(kSigLGLEDMon)->GetBinContent(ib) != 0) {
774                         relativeErrorSqr += TMath::Power( (GetRawsData(kSigLGLEDMon)->GetBinError(ib)/GetRawsData(kSigLGLEDMon)->GetBinContent(ib)), 2);
775                                 }
776                         }
777                         else {
778                                 binContent = 0;
779                                 relativeErrorSqr = 0;
780                         }
781                         GetRawsData(kLEDMonRatio)->SetBinContent(ib, binContent);
782     
783                         binError = sqrt(relativeErrorSqr) * binContent;
784                         GetRawsData(kLEDMonRatio)->SetBinError(ib, binError);
785                         GetRawsData(kLEDMonRatioDist)->Fill(GetRawsData(kLEDMonRatio)->GetBinContent(ib));
786                 }
787   
788         } 
789   // let's also fill the SM and event counter histograms
790   Int_t nTotalHG = 0;
791   Int_t nTotalLG = 0;
792   Int_t nTotalTRU = 0;
793   Int_t nTotalHGLEDMon = 0;
794   Int_t nTotalLGLEDMon = 0;
795   for (iSM=0; iSM<fSuperModules; iSM++) {  
796     nTotalLG += nTotalSMLG[iSM]; 
797     nTotalHG += nTotalSMHG[iSM]; 
798     nTotalTRU += nTotalSMTRU[iSM]; 
799     nTotalLGLEDMon += nTotalSMLGLEDMon[iSM]; 
800     nTotalHGLEDMon += nTotalSMHGLEDMon[iSM]; 
801     GetRawsData(kNsmodLG)->Fill(iSM, nTotalSMLG[iSM]); 
802     GetRawsData(kNsmodHG)->Fill(iSM, nTotalSMHG[iSM]); 
803     GetRawsData(kNsmodTRU)->Fill(iSM, nTotalSMTRU[iSM]); 
804     GetRawsData(kNsmodLGLEDMon)->Fill(iSM, nTotalSMLGLEDMon[iSM]); 
805     GetRawsData(kNsmodHGLEDMon)->Fill(iSM, nTotalSMHGLEDMon[iSM]); 
806   }
807   
808   GetRawsData(kNtotLG)->Fill(nTotalLG);
809   GetRawsData(kNtotHG)->Fill(nTotalHG);
810   GetRawsData(kNtotTRU)->Fill(nTotalTRU);
811   GetRawsData(kNtotLGLEDMon)->Fill(nTotalLGLEDMon);
812   GetRawsData(kNtotHGLEDMon)->Fill(nTotalHGLEDMon);
813  
814
815   SetEventSpecie(saveSpecie) ; 
816   // just in case the next rawreader consumer forgets to reset; let's do it here again..
817   rawReader->Reset() ;
818
819   return;
820 }
821
822 //____________________________________________________________________________
823 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeDigits()
824 {
825   // makes data from Digits
826
827   GetDigitsData(1)->Fill(fDigitsArray->GetEntriesFast()) ; 
828   TIter next(fDigitsArray) ; 
829   AliEMCALDigit * digit ; 
830   while ( (digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(next())) ) {
831     GetDigitsData(0)->Fill( digit->GetAmplitude()) ;
832   }  
833   
834 }
835
836 //____________________________________________________________________________
837 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeDigits(TTree * digitTree)
838 {
839   // makes data from Digit Tree
840   if (fDigitsArray) 
841     fDigitsArray->Clear("C") ; 
842   else
843     fDigitsArray = new TClonesArray("AliEMCALDigit", 1000) ; 
844   
845   TBranch * branch = digitTree->GetBranch("EMCAL") ;
846   if ( ! branch ) {
847     AliWarning("EMCAL branch in Digit Tree not found") ; 
848   } else {
849     branch->SetAddress(&fDigitsArray) ;
850     branch->GetEntry(0) ; 
851     MakeDigits() ; 
852   }
853   
854 }
855
856 //____________________________________________________________________________
857 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeRecPoints(TTree * clustersTree)
858 {
859   // makes data from RecPoints
860   TBranch *emcbranch = clustersTree->GetBranch("EMCALECARP");
861   if (!emcbranch) { 
862     AliError("can't get the branch with the EMCAL clusters !");
863     return;
864   }
865   
866   TObjArray * emcRecPoints = new TObjArray(100) ;
867   emcbranch->SetAddress(&emcRecPoints);
868   emcbranch->GetEntry(0);
869   
870   GetRecPointsData(kRecPM)->Fill(emcRecPoints->GetEntriesFast()) ; 
871   TIter next(emcRecPoints) ; 
872   AliEMCALRecPoint * rp ; 
873   while ( (rp = dynamic_cast<AliEMCALRecPoint *>(next())) ) {
874     GetRecPointsData(kRecPE)->Fill(rp->GetEnergy()) ;
875     GetRecPointsData(kRecPDigM)->Fill(rp->GetMultiplicity());
876   }
877   emcRecPoints->Delete();
878   delete emcRecPoints;
879   
880 }
881
882 //____________________________________________________________________________ 
883 void AliEMCALQADataMakerRec::StartOfDetectorCycle()
884 {
885   //Detector specific actions at start of cycle
886   
887 }
888
889 //____________________________________________________________________________ 
890 void AliEMCALQADataMakerRec::SetFittingAlgorithm(Int_t fitAlgo)              
891 {
892   //Set fitting algorithm and initialize it if this same algorithm was not set before.
893   //printf("**** Set Algorithm , number %d ****\n",fitAlgo);
894
895   
896   fRawAnalyzer =  AliCaloRawAnalyzerFactory::CreateAnalyzer(fitAlgo);
897   fFittingAlgorithm = fitAlgo; 
898
899   /*
900   if(fitAlgo == fFittingAlgorithm && fRawAnalyzer) {
901     //Do nothing, this same algorithm already set before.
902     //printf("**** Algorithm already set before, number %d, %s ****\n",fitAlgo, fRawAnalyzer->GetName());
903     return;
904   }
905   //Initialize the requested algorithm
906   if(fitAlgo != fFittingAlgorithm || !fRawAnalyzer) {
907     //printf("**** Init Algorithm , number %d ****\n",fitAlgo);
908                 
909     fFittingAlgorithm = fitAlgo; 
910     if (fRawAnalyzer) delete fRawAnalyzer;  // delete prev. analyzer if existed.
911                 
912     if (fitAlgo == kFastFit) {
913       fRawAnalyzer = new AliCaloRawAnalyzerFastFit();
914     }
915     else if (fitAlgo == kNeuralNet) {
916       fRawAnalyzer = new AliCaloRawAnalyzerNN();
917     }
918     else if (fitAlgo == kLMS) {
919       fRawAnalyzer = new AliCaloRawAnalyzerLMS();
920     }
921     else if (fitAlgo == kPeakFinder) {
922       fRawAnalyzer = new AliCaloRawAnalyzerPeakFinder();
923     }
924     else if (fitAlgo == kCrude) {
925       fRawAnalyzer = new AliCaloRawAnalyzerCrude();
926     }
927     else {
928       AliWarning("EMCAL QA invalid fit algorithm choice") ; 
929     }
930
931   }
932   return;
933   */
934 }
935
936 //_____________________________________________________________________________________
937 void AliEMCALQADataMakerRec::ConvertProfile2H(TProfile * p, TH2 * histo) 
938 {  
939   // reset histogram
940   histo->Reset("ICE") ; 
941   histo->ResetStats(); 
942
943   Int_t nbinsProf = p->GetNbinsX();
944   
945   // loop through the TProfile p and fill the TH2F histo 
946   Int_t row = 0;
947   Int_t col = 0;
948   Double_t binContent = 0;
949   Int_t towerNum = 0; // global tower Id
950   //  i = 0; // tower Id within SuperModule
951   Int_t iSM = 0; // SuperModule index 
952   Int_t iSMSide = 0; // 0=A, 1=C side
953   Int_t iSMSector = 0; // 2 SM's per sector
954   
955   // indices for 2D plots
956   Int_t col2d = 0;
957   Int_t row2d = 0;
958   
959   for (Int_t ibin = 1; ibin <= nbinsProf; ibin++) {
960     towerNum = (Int_t) p->GetBinCenter(ibin);
961     binContent = p->GetBinContent(ibin);
962     
963     // figure out what the tower indices are: col, row within a SuperModule
964     iSM = towerNum/(AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols);
965     col = (towerNum/AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows) % (AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols);
966     row = towerNum % (AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows);
967     
968     //DecodeTowerNum(towerNum, &SM, &col, &row);
969     // then we calculate what the global 2D coord are, based on which SM 
970     // we are in
971     iSMSector = iSM / 2;
972     iSMSide = iSM % 2;
973     
974     if (iSMSide == 1) { // C side, shown to the right
975       col2d = col + AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
976     }
977     else { // A side, shown to the left 
978       col2d = col; 
979     }
980     
981     row2d = row + iSMSector * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows;
982     
983     histo->SetBinContent(col2d+1, row2d+1, binContent);
984   }
985