EMCAL/AliEMCALRawUtils.cxx

   1 // -*- mode: c++ -*-
   2 /**************************************************************************
   3  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   4  *                                                                        *
   5  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   6  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   7  *                                                                        *
   8  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   9  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
  10  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  11  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  12  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  13  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  14  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  15  **************************************************************************/
  16
  17 /* $Id$ */
  18
  19
  20 //_________________________________________________________________________
  21 //  Utility Class for handling Raw data
  22 //  Does all transitions from Digits to Raw and vice versa,
  23 //  for simu and reconstruction
  24 //
  25 //  Note: the current version is still simplified. Only
  26 //    one raw signal per digit is generated; either high-gain or low-gain
  27 //    Need to add concurrent high and low-gain info in the future
  28 //    No pedestal is added to the raw signal.
  29 //*-- Author: Marco van Leeuwen (LBL)
  30 //*-- Major refactoring by Per Thomas Hille
  31
  32 //#include "AliCDBManager.h"
  33 #include "AliEMCALRawUtils.h"
  34 #include "AliRun.h"
  35 #include "AliRunLoader.h"
  36 #include "AliAltroBuffer.h"
  37 #include "AliRawReader.h"
  38 #include "AliCaloRawStreamV3.h"
  39 #include "AliDAQ.h"
  40 #include "AliEMCALRecParam.h"
  41 #include "AliEMCALLoader.h"
  42 #include "AliEMCALGeometry.h"
  43 #include "AliEMCALDigit.h"
  44 #include "AliEMCALRawDigit.h"
  45 #include "AliEMCAL.h"
  46 #include "AliCaloCalibPedestal.h"
  47 #include "AliCaloBunchInfo.h"
  48 #include "AliCaloFitResults.h"
  49 #include "AliEMCALTriggerRawDigitMaker.h"
  50 #include "AliEMCALTriggerSTURawStream.h"
  51 #include "AliEMCALTriggerData.h"
  52 #include "AliCaloConstants.h"
  53 #include "AliCaloRawAnalyzer.h"
  54 #include "AliCaloRawAnalyzerFactory.h"
  55 #include "AliEMCALRawResponse.h"
  56
  57 using namespace CALO;
  58 using namespace EMCAL;
  59
  60 using std::vector;
  61 ClassImp(AliEMCALRawUtils)
  62
  63
  64 AliEMCALRawUtils::AliEMCALRawUtils( Algo::fitAlgorithm fitAlgo) : fNoiseThreshold(3),
  65                                                                   fNPedSamples(4),
  66                                                                   fGeom(0),
  67                                                                   fOption(""),
  68                                                                   fRemoveBadChannels(kFALSE),
  69                                                                   fFittingAlgorithm(fitAlgo),
  70                                                                   fTimeMin(-1.),
  71                                                                   fTimeMax(1.),
  72                                                                   fUseFALTRO(kTRUE),
  73                                                                   fRawAnalyzer(0),
  74                                                                   fTriggerRawDigitMaker(0x0)
  75 {
  76   // ctor; set up fit algo etc
  77
  78   SetFittingAlgorithm(fitAlgo);
  79
  80   const TObjArray* maps = AliEMCALRecParam::GetMappings();
  81
  82   if(!maps) AliFatal("Cannot retrieve ALTRO mappings!!");
  83
  84   for(Int_t i = 0; i < 4; i++)
  85   {
  86     fMapping[i] = (AliAltroMapping*)maps->At(i);
  87   }
  88
  89   AliRunLoader *rl = AliRunLoader::Instance();
  90   if (rl && rl->GetAliRun())
  91   {
  92     AliEMCAL * emcal = dynamic_cast<AliEMCAL*>(rl->GetAliRun()->GetDetector("EMCAL"));
  93     if(emcal)
  94     {
  95       fGeom = emcal->GetGeometry();
  96     }
  97     else
  98     {
  99       AliDebug(1, Form("Using default geometry in raw reco"));
 100       fGeom =  AliEMCALGeometry::GetInstance(AliEMCALGeometry::GetDefaultGeometryName());
 101     }
 102   }
 103   else
 104   {
 105     AliDebug(1, Form("Using default geometry in raw reco"));
 106     fGeom =  AliEMCALGeometry::GetInstance(AliEMCALGeometry::GetDefaultGeometryName());
 107   }
 108
 109   if(!fGeom) AliFatal(Form("Could not get geometry!"));
 110   fTriggerRawDigitMaker = new AliEMCALTriggerRawDigitMaker();
 111 }
 112
 113
 114 AliEMCALRawUtils::~AliEMCALRawUtils()
 115 {
 116   //dtor
 117   delete fRawAnalyzer;
 118   delete fTriggerRawDigitMaker;
 119 }
 120
 121
 122 void AliEMCALRawUtils::Digits2Raw()
 123 {
 124   // convert digits of the current event to raw data
 125   AliRunLoader *rl = AliRunLoader::Instance();
 126   AliEMCALLoader *loader = dynamic_cast<AliEMCALLoader*>(rl->GetDetectorLoader("EMCAL"));
 127   loader->LoadDigits("EMCAL");
 128   loader->GetEvent();
 129   TClonesArray* digits = loader->Digits() ;
 130
 131   if (!digits) {
 132     Warning("Digits2Raw", "no digits found !");
 133     return;
 134   }
 135
 136   static const Int_t nDDL = 20*2; // 20 SM for EMCal + DCal hardcoded for now. Buffers allocated dynamically, when needed, so just need an upper limit here
 137   AliAltroBuffer* buffers[nDDL];
 138   for (Int_t i=0; i < nDDL; i++)
 139     buffers[i] = 0;
 140
 141   TArrayI adcValuesLow( TIMEBINS );
 142   TArrayI adcValuesHigh( TIMEBINS );
 143
 144   // loop over digits (assume ordered digits)
 145   for (Int_t iDigit = 0; iDigit < digits->GetEntries(); iDigit++) {
 146     AliEMCALDigit* digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At(iDigit)) ;
 147     if(!digit) {
 148       AliFatal("NULL Digit");
 149     } else {
 150       if (digit->GetAmplitude() <  AliEMCALRawResponse::GetRawFormatThreshold() ) {
 151         continue;
 152       }
 153       //get cell indices
 154       Int_t nSM = 0;
 155       Int_t nIphi = 0;
 156       Int_t nIeta = 0;
 157       Int_t iphi = 0;
 158       Int_t ieta = 0;
 159       Int_t nModule = 0;
 160       fGeom->GetCellIndex(digit->GetId(), nSM, nModule, nIphi, nIeta);
 161       fGeom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSM, nModule, nIphi, nIeta,iphi, ieta) ;
 162
 163       //Check which is the RCU, 0 or 1, of the cell.
 164       Int_t iRCU = -111;
 165       if (0<=iphi&&iphi<8) iRCU=0; // first cable row
 166       else if (8<=iphi&&iphi<16 && 0<=ieta&&ieta<24) iRCU=0; // first half;
 167       else if(8<=iphi&&iphi<16 && 24<=ieta&&ieta<48) iRCU=1; // second half;
 168       //second cable row
 169       else if(16<=iphi&&iphi<24) iRCU=1; // third cable row
 170
 171       if (nSM%2==1) iRCU = 1 - iRCU; // swap for odd=C side, to allow us to cable both sides the same
 172
 173       if (iRCU<0)
 174         Fatal("Digits2Raw()","Non-existent RCU number: %d", iRCU);
 175
 176       //Which DDL?
 177       Int_t iDDL = NRCUSPERMODULE*nSM + iRCU;
 178       if (iDDL < 0 || iDDL >= nDDL){
 179         Fatal("Digits2Raw()","Non-existent DDL board number: %d", iDDL);
 180       } else {
 181         if (buffers[iDDL] == 0) {
 182           // open new file and write dummy header
 183           TString fileName = AliDAQ::DdlFileName("EMCAL",iDDL);
 184           //Select mapping file RCU0A, RCU0C, RCU1A, RCU1C
 185           Int_t iRCUside=iRCU+(nSM%2)*2;
 186           //iRCU=0 and even (0) SM -> RCU0A.data   0
 187           //iRCU=1 and even (0) SM -> RCU1A.data   1
 188           //iRCU=0 and odd  (1) SM -> RCU0C.data   2
 189           //iRCU=1 and odd  (1) SM -> RCU1C.data   3
 190           buffers[iDDL] = new AliAltroBuffer(fileName.Data(),fMapping[iRCUside]);
 191           buffers[iDDL]->WriteDataHeader(kTRUE, kFALSE);  //Dummy;
 192         }
 193
 194         // out of time range signal (?)
 195         if (digit->GetTimeR() >  TIMEBINMAX  ) {
 196           AliInfo("Signal is out of time range.\n");
 197           buffers[iDDL]->FillBuffer((Int_t)digit->GetAmplitude());
 198           buffers[iDDL]->FillBuffer( TIMEBINS );  // time bin
 199           buffers[iDDL]->FillBuffer(3);          // bunch length
 200           buffers[iDDL]->WriteTrailer(3, ieta, iphi, nSM);  // trailer
 201           // calculate the time response function
 202         } else {
 203           Bool_t lowgain = AliEMCALRawResponse::RawSampledResponse(digit->GetTimeR(), digit->GetAmplitude(),
 204                                                                    adcValuesHigh.GetArray(), adcValuesLow.GetArray()) ;
 205
 206           if (lowgain)
 207             buffers[iDDL]->WriteChannel(ieta, iphi, 0, TIMEBINS, adcValuesLow.GetArray(),  AliEMCALRawResponse::GetRawFormatThreshold()  );
 208           else
 209             buffers[iDDL]->WriteChannel(ieta,iphi, 1, TIMEBINS, adcValuesHigh.GetArray(),  AliEMCALRawResponse::GetRawFormatThreshold()  );
 210         }
 211       }// iDDL under the limits
 212     }//digit exists
 213   }//Digit loop
 214
 215   // write headers and close files
 216   for (Int_t i=0; i < nDDL; i++) {
 217     if (buffers[i]) {
 218       buffers[i]->Flush();
 219       buffers[i]->WriteDataHeader(kFALSE, kFALSE);
 220       delete buffers[i];
 221     }
 222   }
 223
 224   loader->UnloadDigits();
 225 }
 226
 227
 228
 229 void AliEMCALRawUtils::AddDigit(TClonesArray *digitsArr, Int_t id, Int_t lowGain, Float_t amp, Float_t time, Float_t chi2, Int_t ndf)
 230 {
 231   // comment
 232   AliEMCALDigit *digit = 0, *tmpdigit = 0;
 233   TIter nextdigit(digitsArr);
 234
 235   while (digit == 0 && (tmpdigit = (AliEMCALDigit*) nextdigit()))
 236     {
 237       if (tmpdigit->GetId() == id) digit = tmpdigit;
 238     }
 239
 240   if (!digit) { // no digit existed for this tower; create one
 241     Int_t type = AliEMCALDigit::kHG; // use enum in AliEMCALDigit
 242     if (lowGain)
 243       {
 244         amp *= HGLGFACTOR;
 245         type = AliEMCALDigit::kLGnoHG;
 246       }
 247
 248     Int_t idigit = digitsArr->GetEntries();
 249     new((*digitsArr)[idigit]) AliEMCALDigit( -1, -1, id, amp, time, type, idigit, chi2, ndf);
 250     AliDebug(2,Form("Add digit Id %d for the first time, type %d", id, type));
 251   }//digit added first time
 252   else
 253     { // a digit already exists, check range
 254                 // (use high gain if signal < cut value, otherwise low gain)
 255       if (lowGain)
 256         { // new digit is low gain
 257           if (digit->GetAmplitude() >  OVERFLOWCUT )
 258             {  // use if previously stored (HG) digit is out of range
 259               digit->SetAmplitude( HGLGFACTOR * amp);
 260               digit->SetTime(time);
 261               digit->SetType(AliEMCALDigit::kLG);
 262               AliDebug(2,Form("Add LG digit ID %d for the second time, type %d", digit->GetId(), digit->GetType()));
 263             }
 264         }//new low gain digit
 265       else { // new digit is high gain
 266
 267         if (amp <  OVERFLOWCUT  )
 268           { // new digit is high gain; use if not out of range
 269             digit->SetAmplitude(amp);
 270             digit->SetTime(time);
 271             digit->SetType(AliEMCALDigit::kHG);
 272             AliDebug(2,Form("Add HG digit ID %d for the second time, type %d", digit->GetId(), digit->GetType()));
 273           }
 274         else
 275           { // HG out of range, just change flag value to show that HG did exist
 276             digit->SetType(AliEMCALDigit::kLG);
 277             AliDebug(2,Form("Change LG digit to HG, ID %d, type %d", digit->GetId(), digit->GetType()));
 278           }
 279       }//new high gain digit
 280     }//digit existed replace it
 281 }
 282
 283
 284 void AliEMCALRawUtils::Raw2Digits(AliRawReader* reader,TClonesArray *digitsArr, const AliCaloCalibPedestal* pedbadmap, TClonesArray *digitsTRG, AliEMCALTriggerData* trgData)
 285 {
 286   //conversion of raw data to digits
 287   if ( digitsArr) digitsArr->Clear("C");
 288   if (!digitsArr) { Error("Raw2Digits", "no digits found !");return;}
 289   if (!reader) {Error("Raw2Digits", "no raw reader found !");return;}
 290   AliEMCALTriggerSTURawStream inSTU(reader);
 291   AliCaloRawStreamV3 in(reader,"EMCAL",fMapping);
 292   reader->Select("EMCAL",0,39); // 39 = AliEMCALGeoParams::fgkLastAltroDDL
 293   fTriggerRawDigitMaker->Reset();
 294   fTriggerRawDigitMaker->SetIO(reader, in, inSTU, digitsTRG, trgData);
 295   fRawAnalyzer->SetIsZeroSuppressed(true); // TMP - should use stream->IsZeroSuppressed(), or altro cfg registers later
 296
 297   Int_t lowGain  = 0;
 298   Int_t caloFlag = 0; // low, high gain, or TRU, or LED ref.
 299
 300   Float_t bcTimePhaseCorr = 0; // for BC-based L1 phase correction
 301   Int_t bcMod4 = (reader->GetBCID() % 4); // LHC uses 40 MHz, EMCal uses 10 MHz clock
 302
 303   //AliCDBManager* man = AliCDBManager::Instance();
 304   //Int_t runNumber = man->GetRun();
 305
 306  Int_t runNumber = reader->GetRunNumber();
 307
 308   if ((runNumber >130850 ) && (bcMod4==0 || bcMod4==1))
 309     bcTimePhaseCorr = -1e-7; // subtract 100 ns for certain BC values
 310
 311   while (in.NextDDL())
 312     {
 313       while (in.NextChannel())
 314         {
 315           caloFlag = in.GetCaloFlag();
 316           if (caloFlag > 2) continue; // Work with ALTRO and FALTRO
 317           if(caloFlag < 2 && fRemoveBadChannels && pedbadmap->IsBadChannel(in.GetModule(),in.GetColumn(),in.GetRow()))
 318             {
 319               continue;
 320             }
 321           vector<AliCaloBunchInfo> bunchlist;
 322           while (in.NextBunch())
 323             {
 324               bunchlist.push_back( AliCaloBunchInfo(in.GetStartTimeBin(), in.GetBunchLength(), in.GetSignals() ) );
 325             }
 326           if (bunchlist.size() == 0) continue;
 327           if ( caloFlag < 2 )
 328             { // ALTRO
 329               Int_t id = fGeom->GetAbsCellIdFromCellIndexes(in.GetModule(), in.GetRow(), in.GetColumn()) ;
 330               lowGain  = in.IsLowGain();
 331               fRawAnalyzer->SetL1Phase( in.GetL1Phase() );
 332               AliCaloFitResults res =  fRawAnalyzer->Evaluate( bunchlist, in.GetAltroCFG1(), in.GetAltroCFG2());
 333               if(res.GetAmp() >= fNoiseThreshold )
 334                 {
 335                   AddDigit(digitsArr, id, lowGain, res.GetAmp(),  res.GetTime()+bcTimePhaseCorr, res.GetChi2(),  res.GetNdf() );
 336                 }
 337             }//ALTRO
 338           else if(fUseFALTRO)
 339             {// Fake ALTRO
 340               fTriggerRawDigitMaker->Add( bunchlist );
 341             }//Fake ALTRO
 342         } // end while over channel
 343     } //end while over DDL's, of input stream
 344   fTriggerRawDigitMaker->PostProcess();
 345   TrimDigits(digitsArr);
 346 }
 347
 348
 349 void AliEMCALRawUtils::TrimDigits(TClonesArray *digitsArr)
 350 { // rm entries with LGnoHG (unphysical), out of time window, and too bad chi2
 351   AliEMCALDigit *digit = 0;
 352   Int_t n = 0;
 353   Int_t nDigits = digitsArr->GetEntriesFast();
 354   TIter nextdigit(digitsArr);
 355   while ((digit = (AliEMCALDigit*) nextdigit())) {
 356     if (digit->GetType() == AliEMCALDigit::kLGnoHG) {
 357       AliDebug(1,Form("Remove digit with id %d, LGnoHG",digit->GetId()));
 358       digitsArr->Remove(digit);
 359     }
 360     else if(fTimeMin > digit->GetTime() || fTimeMax < digit->GetTime()) {
 361       digitsArr->Remove(digit);
 362       AliDebug(1,Form("Remove digit with id %d, Bad Time %e",digit->GetId(), digit->GetTime()));
 363     }
 364     else if (0 > digit->GetChi2()) {
 365       digitsArr->Remove(digit);
 366       AliDebug(1,Form("Remove digit with id %d, Bad Chi2 %e",digit->GetId(), digit->GetChi2()));
 367     }
 368     else {
 369       digit->SetIndexInList(n);
 370       n++;
 371     }
 372   }//while
 373
 374   digitsArr->Compress();
 375   AliDebug(1,Form("N Digits before trimming : %d; after array compression %d",nDigits,digitsArr->GetEntriesFast()));
 376 }
 377
 378
 379 void AliEMCALRawUtils::SetFittingAlgorithm(Int_t fitAlgo)
 380 { // select which fitting algo should be used
 381   delete fRawAnalyzer; // delete doesn't do anything if the pointer is 0x0
 382   fRawAnalyzer = AliCaloRawAnalyzerFactory::CreateAnalyzer( fitAlgo );
 383   fRawAnalyzer->SetNsampleCut(5); // requirement for fits to be done, for the new methods
 384   fRawAnalyzer->SetOverflowCut ( OVERFLOWCUT );
 385   fRawAnalyzer->SetAmpCut(fNoiseThreshold);
 386   fRawAnalyzer->SetFitArrayCut(fNoiseThreshold);
 387 }
 388
 389
 390