avoid warnings with modern compilers due to unused variables or wrong comparison...
[u/mrichter/AliRoot.git] / EMCAL / AliEMCALRecPoint.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15 /* $Id$ */
16 //_________________________________________________________________________
17 //  Reconstructed Points for the EMCAL
18 //  A RecPoint is a cluster of digits
19 //  
20 //  
21 //*-- Author: Yves Schutz (SUBATECH)
22 //*-- Author: Dmitri Peressounko (RRC KI & SUBATECH)
23 //*-- Author: Heather Gray (LBL) merged AliEMCALRecPoint and AliEMCALTowerRecPoint 02/04
24
25 // --- ROOT system ---
26 #include "TPad.h"
27 #include "TGraph.h"
28 #include "TPaveText.h"
29 #include "TClonesArray.h"
30 #include "TMath.h"
31 #include "TGeoMatrix.h"
32 #include "TGeoManager.h"
33 #include "TGeoPhysicalNode.h"
34 #include "TRandom.h"
35
36 // --- Standard library ---
37 #include <Riostream.h>
38
39 // --- AliRoot header files ---
40 //#include "AliGenerator.h"
41 class AliGenerator;
42 class AliEMCAL;
43 #include "AliLog.h"
44 #include "AliGeomManager.h"
45 #include "AliEMCALGeometry.h"
46 #include "AliEMCALHit.h"
47 #include "AliEMCALDigit.h"
48 #include "AliEMCALRecPoint.h"
49 #include "AliCaloCalibPedestal.h"
50 #include "AliEMCALGeoParams.h"
51
52 ClassImp(AliEMCALRecPoint)
53
54 //____________________________________________________________________________
55 AliEMCALRecPoint::AliEMCALRecPoint()
56   : AliCluster(), fGeomPtr(0),
57     fAmp(0), fIndexInList(-1), //to be set when the point is already stored
58     fGlobPos(0,0,0),fLocPos(0,0,0), 
59     fMaxDigit(100), fMulDigit(0), fMaxTrack(200),
60     fMulTrack(0), fDigitsList(0), fTracksList(0),
61     fClusterType(-1), fCoreEnergy(0), fDispersion(0),
62     fEnergyList(0), fAbsIdList(0),
63     fTime(0.), fNExMax(0), fCoreRadius(10),  //HG check this 
64     fDETracksList(0), fMulParent(0), fMaxParent(0),
65     fParentsList(0), fDEParentsList(0), fSuperModuleNumber(0),
66     fDigitIndMax(-1), fDistToBadTower(-1), fSharedCluster(kFALSE)
67 {
68   // ctor
69   fGeomPtr = AliEMCALGeometry::GetInstance();
70   
71   fLambda[0] = 0;
72   fLambda[1] = 0;
73
74 }
75
76 //____________________________________________________________________________
77 AliEMCALRecPoint::AliEMCALRecPoint(const char *) 
78   : AliCluster(), fGeomPtr(0),
79     fAmp(0), fIndexInList(-1), //to be set when the point is already stored
80     fGlobPos(0,0,0), fLocPos(0,0,0),
81     fMaxDigit(100), fMulDigit(0), fMaxTrack(1000), fMulTrack(0),
82     fDigitsList(new Int_t[fMaxDigit]), fTracksList(new Int_t[fMaxTrack]),
83     fClusterType(-1), fCoreEnergy(0), fDispersion(0),
84     fEnergyList(new Float_t[fMaxDigit]), 
85     fAbsIdList(new Int_t[fMaxDigit]), fTime(-1.), fNExMax(0), fCoreRadius(10),
86     fDETracksList(new Float_t[fMaxTrack]), fMulParent(0), fMaxParent(1000),
87     fParentsList(new Int_t[fMaxParent]), fDEParentsList(new Float_t[fMaxParent]),
88     fSuperModuleNumber(0), fDigitIndMax(-1), fDistToBadTower(-1),fSharedCluster(kFALSE)
89 {
90   // ctor
91   for (Int_t i = 0; i < fMaxTrack; i++)
92     fDETracksList[i] = 0;
93   for (Int_t i = 0; i < fMaxParent; i++) {
94     fParentsList[i] = -1;
95     fDEParentsList[i] = 0;
96   }
97
98   fGeomPtr = AliEMCALGeometry::GetInstance();
99   fLambda[0] = 0;
100   fLambda[1] = 0;
101 }
102
103 //____________________________________________________________________________
104 AliEMCALRecPoint::AliEMCALRecPoint(const AliEMCALRecPoint & rp) 
105   : AliCluster(rp), fGeomPtr(rp.fGeomPtr),
106     fAmp(rp.fAmp), fIndexInList(rp.fIndexInList),
107     fGlobPos(rp.fGlobPos),fLocPos(rp.fLocPos),
108     fMaxDigit(rp.fMaxDigit), fMulDigit(rp.fMulDigit),
109     fMaxTrack(rp.fMaxTrack), fMulTrack(rp.fMaxTrack),
110     fDigitsList(new Int_t[rp.fMaxDigit]), fTracksList(new Int_t[rp.fMaxTrack]),
111     fClusterType(rp.fClusterType), fCoreEnergy(rp.fCoreEnergy), 
112     fDispersion(rp.fDispersion),
113     fEnergyList(new Float_t[rp.fMaxDigit]),  
114     fAbsIdList(new Int_t[rp.fMaxDigit]), fTime(rp.fTime), fNExMax(rp.fNExMax),fCoreRadius(rp.fCoreRadius),
115     fDETracksList(new Float_t[rp.fMaxTrack]), fMulParent(rp.fMulParent), 
116     fMaxParent(rp.fMaxParent), fParentsList(new Int_t[rp.fMaxParent]), 
117     fDEParentsList(new Float_t[rp.fMaxParent]),
118     fSuperModuleNumber(rp.fSuperModuleNumber), fDigitIndMax(rp.fDigitIndMax), 
119     fDistToBadTower(rp.fDistToBadTower), fSharedCluster(rp.fSharedCluster)
120 {
121   //copy ctor
122   fLambda[0] = rp.fLambda[0];
123   fLambda[1] = rp.fLambda[1];
124
125   for(Int_t i = 0; i < rp.fMulDigit; i++) {
126     fEnergyList[i] = rp.fEnergyList[i];
127     fAbsIdList[i]  = rp.fAbsIdList[i];
128   }
129
130   for(Int_t i = 0; i < rp.fMulTrack; i++) fDETracksList[i] = rp.fDETracksList[i];
131
132   for(Int_t i = 0; i < rp.fMulParent; i++) {
133     fParentsList[i] = rp.fParentsList[i];
134     fDEParentsList[i] = rp.fDEParentsList[i];
135   }
136
137 }
138 //____________________________________________________________________________
139 AliEMCALRecPoint::~AliEMCALRecPoint()
140 {
141   // dtor
142   if ( fEnergyList )
143     delete[] fEnergyList ; 
144   if ( fAbsIdList )
145     delete[] fAbsIdList ; 
146    if ( fDETracksList)
147     delete[] fDETracksList;
148    if ( fParentsList)
149     delete[] fParentsList;
150    if ( fDEParentsList)
151     delete[] fDEParentsList;
152         
153    delete [] fDigitsList ;
154    delete [] fTracksList ;
155 }
156
157 //____________________________________________________________________________
158 AliEMCALRecPoint& AliEMCALRecPoint::operator= (const AliEMCALRecPoint &rp)
159 {
160   // assignment operator
161
162   if(&rp == this) return *this;
163
164   fGeomPtr     = rp.fGeomPtr;
165   fAmp         = rp.fAmp;
166   fIndexInList = rp.fIndexInList;
167   fGlobPos     = rp.fGlobPos;
168   fLocPos      = rp.fLocPos;
169   fMaxDigit    = rp.fMaxDigit;
170   fMulDigit    = rp.fMulDigit;
171   fMaxTrack    = rp.fMaxTrack;
172   fMulTrack    = rp.fMulTrack;
173   
174   if(fDigitsList) delete [] fDigitsList;
175   fDigitsList = new Int_t[rp.fMaxDigit];
176   if(fTracksList) delete [] fTracksList;
177   fTracksList = new Int_t[rp.fMaxTrack];
178   for(Int_t i = 0; i<fMaxDigit; i++) fDigitsList[i] = rp.fDigitsList[i];
179   for(Int_t i = 0; i<fMaxTrack; i++) fTracksList[i] = rp.fTracksList[i];
180   
181   fClusterType = rp.fClusterType;
182   fCoreEnergy  = rp.fCoreEnergy; 
183   fDispersion  = rp.fDispersion;
184   
185   
186   if(fEnergyList) delete [] fEnergyList;
187   fEnergyList = new Float_t[rp.fMaxDigit];
188   if(fAbsIdList) delete [] fAbsIdList;
189   fAbsIdList = new Int_t[rp.fMaxDigit];  
190   for(Int_t i = 0; i<fMaxDigit; i++) {
191     fEnergyList[i] = rp.fEnergyList[i];
192     fAbsIdList[i]  = rp.fAbsIdList[i];
193   }
194   
195   fTime       = rp.fTime;
196   fNExMax     = rp.fNExMax;
197   fCoreRadius = rp.fCoreRadius;
198   
199   if(fDETracksList) delete [] fDETracksList;
200   fDETracksList = new Float_t[rp.fMaxTrack];
201   for(Int_t i = 0; i < fMaxTrack; i++) fDETracksList[i] = rp.fDETracksList[i];
202
203   fMulParent = rp.fMulParent;
204   fMaxParent = rp.fMaxParent;
205   
206   if(fParentsList) delete [] fParentsList;
207   fParentsList = new Int_t[rp.fMaxParent];
208   if(fDEParentsList) delete [] fDEParentsList;
209   fDEParentsList = new Float_t[rp.fMaxParent];
210   for(Int_t i = 0; i < fMaxParent; i++) {
211     fParentsList[i]   = rp.fParentsList[i]; 
212     fDEParentsList[i] = rp.fDEParentsList[i];
213   }
214   
215   fSuperModuleNumber = rp.fSuperModuleNumber;
216   fDigitIndMax       = rp.fDigitIndMax;
217
218   fLambda[0] = rp.fLambda[0];
219   fLambda[1] = rp.fLambda[1];
220         
221   fDistToBadTower = rp.fDistToBadTower;
222   fSharedCluster  = rp.fSharedCluster;
223         
224   return *this;
225
226 }
227
228 //____________________________________________________________________________
229 void AliEMCALRecPoint::AddDigit(AliEMCALDigit & digit, const Float_t energy, const Bool_t shared)
230 {
231   // Adds a digit to the RecPoint
232   // and accumulates the total amplitude and the multiplicity 
233   
234   if(fEnergyList == 0)
235     fEnergyList =  new Float_t[fMaxDigit]; 
236  
237   if(fAbsIdList == 0) {
238     fAbsIdList  =  new Int_t  [fMaxDigit];
239   }
240
241   if ( fMulDigit >= fMaxDigit ) { // increase the size of the lists 
242     fMaxDigit*=2 ; 
243     Int_t   * tempo   = new Int_t  [fMaxDigit]; 
244     Float_t * tempoE  = new Float_t[fMaxDigit];
245     Int_t   * tempoId = new Int_t  [fMaxDigit]; 
246
247     Int_t index ;     
248     for ( index = 0 ; index < fMulDigit ; index++ ){
249       tempo  [index] = fDigitsList[index] ;
250       tempoE [index] = fEnergyList[index] ; 
251       tempoId[index] = fAbsIdList [index] ; 
252     }
253     
254     delete [] fDigitsList ;
255     delete [] fEnergyList ;
256     delete [] fAbsIdList ;
257
258     fDigitsList = tempo;
259     fEnergyList = tempoE; 
260     fAbsIdList  = tempoId;
261   } // if
262   
263   fDigitsList[fMulDigit]   = digit.GetIndexInList()  ; 
264   fEnergyList[fMulDigit]   = energy ;
265   fAbsIdList [fMulDigit]   = digit.GetId();
266   fMulDigit++ ; 
267   fAmp += energy ; 
268         
269   if(shared) fSharedCluster = kTRUE;
270 }
271 //____________________________________________________________________________
272 Bool_t AliEMCALRecPoint::AreNeighbours(AliEMCALDigit * digit1, AliEMCALDigit * digit2 ) const
273 {
274   // Tells if (true) or not (false) two digits are neighbours
275   // A neighbour is defined as being two digits which share a corner
276   // ONLY USED IN CASE OF UNFOLDING 
277         
278   Bool_t areNeighbours = kFALSE ;
279   Int_t nSupMod=0, nModule=0, nIphi=0, nIeta=0;
280   Int_t nSupMod1=0, nModule1=0, nIphi1=0, nIeta1=0;
281   Int_t relid1[2] , relid2[2] ; // ieta, iphi
282   Int_t rowdiff=0, coldiff=0;
283
284   areNeighbours = kFALSE ;
285
286   fGeomPtr->GetCellIndex(digit1->GetId(), nSupMod,nModule,nIphi,nIeta);
287   fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nModule,nIphi,nIeta, relid1[0],relid1[1]);
288
289   fGeomPtr->GetCellIndex(digit2->GetId(), nSupMod1,nModule1,nIphi1,nIeta1);
290   fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod1,nModule1,nIphi1,nIeta1, relid2[0],relid2[1]);
291   
292   // In case of a shared cluster, index of SM in C side, columns start at 48 and ends at 48*2-1
293   // C Side impair SM, nSupMod%2=1; A side pair SM nSupMod%2=0
294   if(fSharedCluster){
295     //printf("Shared cluster in 2 SMs!\n");
296
297     //    if(nSupMod1%2) relid1[1]+=AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;//bad
298     //    else           relid2[1]+=AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;//bad
299     if(nSupMod1%2) relid2[1]+=AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
300     else           relid1[1]+=AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
301   }
302         
303   rowdiff = TMath::Abs( relid1[0] - relid2[0] ) ;  
304   coldiff = TMath::Abs( relid1[1] - relid2[1] ) ;  
305
306   //if (( coldiff <= 1 )  && ( rowdiff <= 1 ) && (coldiff + rowdiff > 0)) 
307   if ((coldiff + rowdiff == 1 )) 
308     areNeighbours = kTRUE ;
309   
310   return areNeighbours;
311 }
312
313 //____________________________________________________________________________
314 Int_t AliEMCALRecPoint::Compare(const TObject * obj) const
315 {
316   // Compares two RecPoints according to their position in the EMCAL modules
317
318   Float_t delta = 1 ; //Width of "Sorting row". 
319         
320   Int_t rv = 2 ; 
321
322   AliEMCALRecPoint * clu = (AliEMCALRecPoint *)obj ; 
323
324   TVector3 locpos1; 
325   GetLocalPosition(locpos1);
326   TVector3 locpos2;  
327   clu->GetLocalPosition(locpos2);  
328
329   Int_t rowdif = (Int_t)(TMath::Ceil(locpos1.X()/delta)-TMath::Ceil(locpos2.X()/delta)) ;
330   if (rowdif> 0) 
331     rv = 1 ;
332   else if(rowdif < 0) 
333     rv = -1 ;
334   else if(locpos1.Y()>locpos2.Y()) 
335     rv = -1 ;
336   else 
337     rv = 1 ; 
338
339   return rv ; 
340 }
341
342 //___________________________________________________________________________
343  void AliEMCALRecPoint::Draw(Option_t *option)
344  {
345    // Draw this AliEMCALRecPoint with its current attributes
346    
347    AppendPad(option);
348  }
349
350 //____________________________________________________________________________
351 void AliEMCALRecPoint::EvalAll(Float_t logWeight,TClonesArray * digits, const Bool_t justClusters) 
352 {
353   // Evaluates cluster parameters
354         
355   // First calculate the index of digit with maximum amplitude and get 
356   // the supermodule number where it sits.
357     
358   fDigitIndMax       = GetMaximalEnergyIndex();
359   fSuperModuleNumber = fGeomPtr->GetSuperModuleNumber(GetAbsIdMaxDigit());
360   
361   //Evaluate global and local position
362   EvalGlobalPosition(logWeight, digits) ;
363   EvalLocalPosition(logWeight, digits) ;
364         
365   //Evaluate shower parameters
366   EvalElipsAxis(logWeight, digits) ;
367   EvalDispersion(logWeight, digits) ;
368
369   //EvalCoreEnergy(logWeight, digits);
370   EvalTime(digits) ;
371   EvalPrimaries(digits) ;
372   EvalParents(digits);
373         
374   //Called last because it sets the global position of the cluster?
375   //Do not call it when recalculating clusters out of standard reconstruction
376   if(!justClusters){ 
377     EvalLocal2TrackingCSTransform();
378   }
379
380 }
381
382 //____________________________________________________________________________
383 void  AliEMCALRecPoint::EvalDispersion(Float_t logWeight, TClonesArray * digits)
384 {
385   // Calculates the dispersion of the shower at the origin of the RecPoint
386   // in cell units - Nov 16,2006
387
388   Double_t d = 0., wtot = 0., w = 0.;
389   Int_t iDigit=0, nstat=0;
390   AliEMCALDigit * digit=0;
391         
392   // Calculates the dispersion in cell units 
393   Double_t etai, phii, etaMean=0.0, phiMean=0.0; 
394   int nSupMod=0, nModule=0, nIphi=0, nIeta=0;
395   int iphi=0, ieta=0;
396   // Calculate mean values
397   for(iDigit=0; iDigit < fMulDigit; iDigit++) {
398     digit = (AliEMCALDigit *) digits->At(fDigitsList[iDigit])  ;
399
400     if (fAmp>0 && fEnergyList[iDigit]>0) {
401       fGeomPtr->GetCellIndex(digit->GetId(), nSupMod,nModule,nIphi,nIeta);
402       fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nModule,nIphi,nIeta, iphi,ieta);
403         
404       // In case of a shared cluster, index of SM in C side, columns start at 48 and ends at 48*2
405       // C Side impair SM, nSupMod%2=1; A side pair SM nSupMod%2=0
406       if(fSharedCluster && nSupMod%2) ieta+=AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
407                 
408       etai=(Double_t)ieta;
409       phii=(Double_t)iphi;
410       w = TMath::Max(0.,logWeight+TMath::Log(fEnergyList[iDigit]/fAmp ) ) ;
411
412       if(w>0.0) {
413         phiMean += phii*w;
414         etaMean += etai*w;
415         wtot    += w;
416       }
417     }
418   }
419   if (wtot>0) {
420     phiMean /= wtot ;
421     etaMean /= wtot ;
422   } else AliError(Form("Wrong weight %f\n", wtot));
423
424   // Calculate dispersion
425   for(iDigit=0; iDigit < fMulDigit; iDigit++) {
426     digit = (AliEMCALDigit *) digits->At(fDigitsList[iDigit])  ;
427
428     if (fAmp>0 && fEnergyList[iDigit]>0) {
429       fGeomPtr->GetCellIndex(digit->GetId(), nSupMod,nModule,nIphi,nIeta);
430       fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nModule,nIphi,nIeta, iphi,ieta);
431                 
432       // In case of a shared cluster, index of SM in C side, columns start at 48 and ends at 48*2
433       // C Side impair SM, nSupMod%2=1; A side pair SM, nSupMod%2=0
434       if(fSharedCluster && nSupMod%2) ieta+=AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
435       
436       etai=(Double_t)ieta;
437       phii=(Double_t)iphi;
438       w = TMath::Max(0.,logWeight+TMath::Log(fEnergyList[iDigit]/fAmp ) ) ;
439
440       if(w>0.0) {
441         nstat++;
442         d += w*((etai-etaMean)*(etai-etaMean)+(phii-phiMean)*(phii-phiMean));
443       }
444     }
445   }
446   
447   if ( wtot > 0 && nstat>1) d /= wtot ;
448   else                      d = 0. ; 
449
450   fDispersion = TMath::Sqrt(d) ;
451   //printf("AliEMCALRecPoint::EvalDispersion() : Dispersion %f \n",fDispersion);
452 }
453
454 //____________________________________________________________________________
455 void AliEMCALRecPoint::EvalDistanceToBadChannels(AliCaloCalibPedestal* caloped)
456 {
457   //For each EMC rec. point set the distance to the nearest bad channel.
458   //AliInfo(Form("%d bad channel(s) found.\n", caloped->GetDeadTowerCount()));
459   //It is done in cell units and not in global or local position as before (Sept 2010)
460   
461   if(!caloped->GetDeadTowerCount()) return;
462   
463   //Get channels map of the supermodule where the cluster is.
464   TH2D* hMap  = caloped->GetDeadMap(fSuperModuleNumber);
465   
466   Int_t dRrow, dReta;   
467   Float_t  minDist = 10000.;
468   Float_t  dist    = 0.;
469   Int_t nSupMod, nModule;
470   Int_t nIphi, nIeta;
471   Int_t iphi, ieta;
472   fDigitIndMax  = GetMaximalEnergyIndex();
473   fGeomPtr->GetCellIndex(fAbsIdList[fDigitIndMax], nSupMod,nModule,nIphi,nIeta);
474   fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nModule,nIphi,nIeta, iphi,ieta);
475   
476   //Loop on tower status map 
477   for(Int_t irow = 0; irow < AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows; irow++){
478     for(Int_t icol = 0; icol < AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols; icol++){
479       //Check if tower is bad.
480       if(hMap->GetBinContent(icol,irow)==AliCaloCalibPedestal::kAlive) continue;
481       //printf("AliEMCALRecPoint::EvalDistanceToBadChannels() - Bad channel in SM %d, col %d, row %d\n",iSM,icol, irow);
482       
483       dRrow=TMath::Abs(irow-iphi);
484       dReta=TMath::Abs(icol-ieta);
485       dist=TMath::Sqrt(dRrow*dRrow+dReta*dReta);
486       if(dist < minDist) minDist = dist;
487       
488     }
489   }
490   
491   //In case the cluster is shared by 2 SuperModules, need to check the map of the second Super Module
492   if (fSharedCluster) {
493     TH2D* hMap2 = 0;
494     Int_t nSupMod2 = -1;
495     
496     //The only possible combinations are (0,1), (2,3) ... (10,11)
497     if(fSuperModuleNumber%2) nSupMod2 = fSuperModuleNumber-1;
498     else                     nSupMod2 = fSuperModuleNumber+1;
499     hMap2  = caloped->GetDeadMap(nSupMod2);
500     
501     //Loop on tower status map of second super module
502     for(Int_t irow = 0; irow < AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows; irow++){
503       for(Int_t icol = 0; icol < AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols; icol++){
504         //Check if tower is bad.
505         if(hMap2->GetBinContent(icol,irow)==AliCaloCalibPedestal::kAlive) continue;
506         //printf("AliEMCALRecPoint::EvalDistanceToBadChannels() - Bad channel in SM %d, col %d, row %d\n",iSM,icol, irow);
507         dRrow=TMath::Abs(irow-iphi);
508         
509         if(fSuperModuleNumber%2) {
510           dReta=TMath::Abs(icol-(AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols+ieta));
511        }
512        else {
513          dReta=TMath::Abs(AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols+icol-ieta);
514        }                    
515         
516        dist=TMath::Sqrt(dRrow*dRrow+dReta*dReta);
517         if(dist < minDist) minDist = dist;        
518
519       }
520     }
521     
522   }// shared cluster in 2 SuperModules
523   
524   fDistToBadTower = minDist;
525   //printf("AliEMCALRecPoint::EvalDistanceToBadChannel() - Distance to Bad is %f cm, shared cluster? %d \n",fDistToBadTower,fSharedCluster);
526 }
527
528
529 //____________________________________________________________________________
530 void AliEMCALRecPoint::EvalLocalPosition(Float_t logWeight, TClonesArray * digits)
531 {
532   // Calculates the center of gravity in the local EMCAL-module coordinates 
533   //  Info("Print", " logWeight %f : cluster energy %f ", logWeight, fAmp); // for testing
534   
535   AliEMCALDigit * digit=0;
536   Int_t i=0, nstat=0;
537   
538   Double_t dist  = TmaxInCm(Double_t(fAmp));
539   //Int_t       idMax = GetAbsIdMaxDigit();// idMax is not used at all in RelPosCellInSModule, why use it?
540   
541   Double_t clXYZ[3]={0.,0.,0.}, clRmsXYZ[3]={0.,0.,0.}, xyzi[3], wtot=0., w=0.;
542   
543   //printf(" dist : %f  e : %f \n", dist, fAmp);
544   for(Int_t iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
545     digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At(fDigitsList[iDigit])) ;
546     
547     if(!digit) {
548       AliError("No Digit!!");
549       continue;
550     }
551     
552     fGeomPtr->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), dist, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
553     
554     //Temporal patch, due to mapping problem, need to swap "y" in one of the 2 SM, although no effect in position calculation. GCB 05/2010
555     if(fSharedCluster && fSuperModuleNumber != fGeomPtr->GetSuperModuleNumber(digit->GetId())) xyzi[1]*=-1;
556     
557     //printf("EvalLocalPosition Cell:  Id %i, SM %i : dist %f Local x,y,z %f %f %f \n", 
558     //          digit->GetId(), fGeomPtr->GetSuperModuleNumber(digit->GetId()), dist, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
559     
560     if(logWeight > 0.0)  w = TMath::Max( 0., logWeight + TMath::Log( fEnergyList[iDigit] / fAmp ));
561     else  w = fEnergyList[iDigit]; // just energy
562     
563     if(w>0.0) {
564       wtot += w ;
565       nstat++;
566       for(i=0; i<3; i++ ) {
567         clXYZ[i]    += (w*xyzi[i]);
568         clRmsXYZ[i] += (w*xyzi[i]*xyzi[i]);
569       }
570     }
571   }
572   //  cout << " wtot " << wtot << endl;
573   if ( wtot > 0 ) { 
574     //    xRMS   = TMath::Sqrt(x2m - xMean*xMean);
575     for(i=0; i<3; i++ ) {
576       clXYZ[i] /= wtot;
577       if(nstat>1) {
578         clRmsXYZ[i] /= (wtot*wtot);  
579         clRmsXYZ[i]  =  clRmsXYZ[i] - clXYZ[i]*clXYZ[i];
580         if(clRmsXYZ[i] > 0.0) {
581           clRmsXYZ[i] =  TMath::Sqrt(clRmsXYZ[i]);
582         } else      clRmsXYZ[i] = 0;
583       } else        clRmsXYZ[i] = 0;
584     }    
585   } else {
586     for(i=0; i<3; i++ ) {
587       clXYZ[i] = clRmsXYZ[i] = -1.;
588     }
589   }
590   
591   //    // Cluster of one single digit, smear the position to avoid discrete position
592   //    // smear x and z with +- 3 cm to uniform (avoid discrete effects). Tower size is approx 6 cm.
593   //    // Rndm generates a number in ]0,1]
594   //    if (fMulDigit==1) { 
595   //      clXYZ[0] += fGeomPtr->GetPhiTileSize()*(0.5 - gRandom->Rndm()); 
596   //      clXYZ[2] += fGeomPtr->GetEtaTileSize()*(0.5 - gRandom->Rndm()); 
597   //    }
598   
599   //Set position in local vector
600   fLocPos.SetX(clXYZ[0]);
601   fLocPos.SetY(clXYZ[1]);
602   fLocPos.SetZ(clXYZ[2]);
603   
604   if (gDebug==2)
605     printf("EvalLocalPosition Cluster: Local (x,y,z) = (%f,%f,%f) \n", fLocPos.X(), fLocPos.Y(), fLocPos.Z()) ; 
606   
607 }
608
609
610 //____________________________________________________________________________
611 void AliEMCALRecPoint::EvalGlobalPosition(Float_t logWeight, TClonesArray * digits)
612 {
613   // Calculates the center of gravity in the global ALICE coordinates 
614   //  Info("Print", " logWeight %f : cluster energy %f ", logWeight, fAmp); // for testing
615   
616   AliEMCALDigit * digit=0;
617   Int_t i=0, nstat=0;
618         
619   Double_t dist  = TmaxInCm(Double_t(fAmp));
620   //Int_t       idMax = GetAbsIdMaxDigit();// idMax is not used at all in RelPosCellInSModule, why use it?
621         
622   Double_t clXYZ[3]={0.,0.,0.}, clRmsXYZ[3]={0.,0.,0.}, lxyzi[3], xyzi[3], wtot=0., w=0.;
623
624   //printf(" dist : %f  e : %f \n", dist, fAmp);
625   for(Int_t iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
626     digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At(fDigitsList[iDigit])) ;
627
628     if(!digit) {
629       AliError("No Digit!!");
630       continue;
631     }    
632     
633     //Get the local coordinates of the cell
634     fGeomPtr->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), dist, lxyzi[0], lxyzi[1], lxyzi[2]);
635     
636     //Now get the global coordinate
637     fGeomPtr->GetGlobal(lxyzi,xyzi, fGeomPtr->GetSuperModuleNumber(digit->GetId()));
638     //TVector3 pos(xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
639     //printf("EvalGlobalPosition Cell:  Id %i, SM %i : dist %f Local (x,y,z) = (%f %f %f), eta %f, phi%f \n", 
640     //     digit->GetId(), fGeomPtr->GetSuperModuleNumber(digit->GetId()),dist, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2],pos.Eta(),pos.Phi()*TMath::RadToDeg());
641           
642     if(logWeight > 0.0)  w = TMath::Max( 0., logWeight + TMath::Log( fEnergyList[iDigit] / fAmp ));
643     else  w = fEnergyList[iDigit]; // just energy
644
645     if(w>0.0) {
646       wtot += w ;
647       nstat++;
648       for(i=0; i<3; i++ ) {
649         clXYZ[i]    += (w*xyzi[i]);
650         clRmsXYZ[i] += (w*xyzi[i]*xyzi[i]);
651       }
652     }
653   }
654   //  cout << " wtot " << wtot << endl;
655   if ( wtot > 0 ) { 
656     //    xRMS   = TMath::Sqrt(x2m - xMean*xMean);
657     for(i=0; i<3; i++ ) {
658       clXYZ[i] /= wtot;
659       if(nstat>1) {
660         clRmsXYZ[i] /= (wtot*wtot);  
661         clRmsXYZ[i]  =  clRmsXYZ[i] - clXYZ[i]*clXYZ[i];
662         if(clRmsXYZ[i] > 0.0) {
663           clRmsXYZ[i] =  TMath::Sqrt(clRmsXYZ[i]);
664         } else      clRmsXYZ[i] = 0;
665       } else        clRmsXYZ[i] = 0;
666     }    
667   } else {
668     for(i=0; i<3; i++ ) {
669       clXYZ[i] = clRmsXYZ[i] = -1.;
670     }
671   }
672
673 //  // Cluster of one single digit, smear the position to avoid discrete position
674 //  // smear x and z with +- 3 cm to uniform (avoid discrete effects). Tower size is approx 6 cm.
675 //  // Rndm generates a number in ]0,1]
676 //  if (fMulDigit==1) { 
677 //    clXYZ[0] += fGeomPtr->GetPhiTileSize()*(0.5 - gRandom->Rndm()); 
678 //    clXYZ[2] += fGeomPtr->GetEtaTileSize()*(0.5 - gRandom->Rndm());   
679 //  }
680         
681   //Set position in global vector
682   fGlobPos.SetX(clXYZ[0]);
683   fGlobPos.SetY(clXYZ[1]);
684   fGlobPos.SetZ(clXYZ[2]);
685                 
686   if (gDebug==2)
687         printf("EvalGlobalPosition Cluster: (x ,y ,z) = (%f,%f,%f), eta %f,phi %f\n", 
688                    fGlobPos.X(), fGlobPos.Y(), fGlobPos.Z(),fGlobPos.Eta(),fGlobPos.Phi()*TMath::RadToDeg()) ; 
689 }
690
691 //____________________________________________________________________________
692 void AliEMCALRecPoint::EvalLocalPositionFit(Double_t deff, Double_t logWeight, 
693 Double_t phiSlope, TClonesArray * digits)
694 {
695   // Evaluates local position of clusters in SM
696   
697   Double_t ycorr=0;
698   AliEMCALDigit *digit=0;
699   Int_t i=0, nstat=0;
700   Double_t clXYZ[3]={0.,0.,0.}, clRmsXYZ[3]={0.,0.,0.}, xyzi[3], wtot=0., w=0.; 
701
702   Double_t dist  = TmaxInCm(Double_t(fAmp));
703   //Int_t       idMax = GetAbsIdMaxDigit();// idMax is not used at all in RelPosCellInSModule, why use it?
704         
705   for(Int_t iDigit=0; iDigit<digits->GetEntries(); iDigit++) {
706     digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At(fDigitsList[iDigit])) ;
707     if(digit){
708       dist = deff;
709       //fGeomPtr->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), idMax, dist, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
710       fGeomPtr->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), dist, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
711       
712       if(logWeight > 0.0)  w = TMath::Max( 0., logWeight + TMath::Log( fEnergyList[iDigit] / fAmp ));
713       else                 w = fEnergyList[iDigit]; // just energy
714       
715       if(w>0.0) {
716         wtot += w ;
717         nstat++;
718         for(i=0; i<3; i++ ) {
719           clXYZ[i]    += (w*xyzi[i]);
720           clRmsXYZ[i] += (w*xyzi[i]*xyzi[i]);
721         }
722       }
723     }else AliError("Digit null");
724   }//loop
725   //  cout << " wtot " << wtot << endl;
726   if ( wtot > 0 ) { 
727     //    xRMS   = TMath::Sqrt(x2m - xMean*xMean);
728     for(i=0; i<3; i++ ) {
729       clXYZ[i] /= wtot;
730       if(nstat>1) {
731         clRmsXYZ[i] /= (wtot*wtot);  
732         clRmsXYZ[i]  =  clRmsXYZ[i] - clXYZ[i]*clXYZ[i];
733         if(clRmsXYZ[i] > 0.0) {
734           clRmsXYZ[i] =  TMath::Sqrt(clRmsXYZ[i]);
735         } else      clRmsXYZ[i] = 0;
736       } else        clRmsXYZ[i] = 0;
737     }    
738   } else {
739     for(i=0; i<3; i++ ) {
740       clXYZ[i] = clRmsXYZ[i] = -1.;
741     }
742   }
743   // clRmsXYZ[i] ??
744   if(phiSlope != 0.0 && logWeight > 0.0 && wtot) { 
745     // Correction in phi direction (y - coords here); Aug 16;
746     // May be put to global level or seperate method
747     ycorr = clXYZ[1] * (1. + phiSlope);
748     //printf(" y %f : ycorr %f : slope %f \n", clXYZ[1], ycorr, phiSlope); 
749     clXYZ[1] = ycorr;
750   }
751         
752   fLocPos.SetX(clXYZ[0]);
753   fLocPos.SetY(clXYZ[1]);
754   fLocPos.SetZ(clXYZ[2]);
755     
756 //  if (gDebug==2)
757 //    printf("EvalLocalPosition: eta,phi,r = %f,%f,%f", fLocPos.X(), fLocPos.Y(), fLocPos.Z()) ; 
758 }
759
760 //_____________________________________________________________________________
761 Bool_t AliEMCALRecPoint::EvalLocalPosition2(TClonesArray * digits, TArrayD &ed)
762 {
763   // Evaluated local position of rec.point using digits 
764   // and parametrisation of w0 and deff
765   //printf(" <I> AliEMCALRecPoint::EvalLocalPosition2() \n"); 
766   return AliEMCALRecPoint::EvalLocalPositionFromDigits(digits, ed, fLocPos);
767 }
768
769 //_____________________________________________________________________________
770 Bool_t AliEMCALRecPoint::EvalLocalPositionFromDigits(TClonesArray *digits, TArrayD &ed, TVector3 &locPos)
771 {
772   // Used when digits should be recalibrated
773   Double_t deff=0, w0=0, esum=0;
774   Int_t iDigit=0;
775   //  AliEMCALDigit *digit;
776
777   if(ed.GetSize() && (digits->GetEntries()!=ed.GetSize())) return kFALSE;
778
779   // Calculate sum energy of digits
780   esum = 0.0;
781   for(iDigit=0; iDigit<ed.GetSize(); iDigit++) esum += ed[iDigit];
782
783   GetDeffW0(esum, deff, w0);
784   
785   return EvalLocalPositionFromDigits(esum, deff, w0, digits, ed, locPos); 
786 }
787
788 //_____________________________________________________________________________
789 Bool_t AliEMCALRecPoint::EvalLocalPositionFromDigits(const Double_t esum, const Double_t deff, const Double_t w0, TClonesArray *digits, TArrayD &ed, TVector3 &locPos)
790 {
791   //Evaluate position of digits in supermodule.
792   AliEMCALDigit *digit=0;
793
794   Int_t i=0, nstat=0;
795   Double_t clXYZ[3]={0.,0.,0.}, xyzi[3], wtot=0., w=0.; 
796   //Int_t       idMax = GetAbsIdMaxDigit();// idMax is not used at all in RelPosCellInSModule, why use it?
797         
798   // Get pointer to EMCAL geometry
799   // (can't use fGeomPtr in static method)
800   AliEMCALGeometry* geo = AliEMCALGeometry::GetInstance(); 
801
802   for(Int_t iDigit=0; iDigit<digits->GetEntries(); iDigit++) {
803     digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At(iDigit));
804     if(digit){
805       //geo->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), idMax, deff, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
806       geo->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), deff, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
807       
808       if(w0 > 0.0)  w = TMath::Max( 0., w0 + TMath::Log(ed[iDigit] / esum));
809       else          w = ed[iDigit]; // just energy
810       
811       if(w>0.0) {
812         wtot += w ;
813         nstat++;
814         for(i=0; i<3; i++ ) {
815           clXYZ[i] += (w*xyzi[i]);
816         }
817       }
818     }else AliError("Digit null");
819   }//loop
820   //  cout << " wtot " << wtot << endl;
821   if (wtot > 0) { 
822     for(i=0; i<3; i++ ) {
823       clXYZ[i] /= wtot;
824     }
825     locPos.SetX(clXYZ[0]);
826     locPos.SetY(clXYZ[1]);
827     locPos.SetZ(clXYZ[2]);
828     return kTRUE;
829   } else {
830     return kFALSE;
831   }
832
833 }
834
835 //_____________________________________________________________________________
836 void AliEMCALRecPoint::GetDeffW0(const Double_t esum , Double_t &deff,  Double_t &w0)
837 {
838   //
839   // Aug 31, 2001 
840   // Applied for simulation data with threshold 3 adc
841   // Calculate efective distance (deff) and weigh parameter (w0) 
842   // for coordinate calculation; 0.5 GeV < esum <100 GeV.
843   // Look to:  http://rhic.physics.wayne.edu/~pavlinov/ALICE/SHISHKEBAB/RES/CALIB/GEOMCORR/deffandW0VaEgamma_2.gif
844   //
845   Double_t e=0.0;
846   const  Double_t kdp0=9.25147, kdp1=1.16700; // Hard coded now
847   const  Double_t kwp0=4.83713, kwp1=-2.77970e-01, kwp2 = 4.41116;
848
849   // No extrapolation here
850   e = esum<0.5?0.5:esum;
851   e = e>100.?100.:e;
852
853   deff = kdp0 + kdp1*TMath::Log(e);
854   w0   = kwp0 / (1. + TMath::Exp(kwp1*(e+kwp2)));
855   //printf("<I> AliEMCALRecPoint::GetDeffW0 esum %5.2f : deff %5.2f : w0 %5.2f \n", esum, deff, w0); 
856 }
857
858 //______________________________________________________________________________
859 void AliEMCALRecPoint::EvalCoreEnergy(Float_t logWeight, TClonesArray * digits)
860 {
861   // This function calculates energy in the core, 
862   // i.e. within a radius rad = fCoreEnergy around the center. Beyond this radius
863   // in accordance with shower profile the energy deposition 
864   // should be less than 2%
865   // Unfinished - Nov 15,2006
866   // Distance is calculate in (phi,eta) units
867
868   AliEMCALDigit * digit = 0 ;
869
870   Int_t iDigit=0;
871
872   if (!fLocPos.Mag()) {
873     EvalLocalPosition(logWeight, digits);
874   }
875   
876   Double_t phiPoint = fLocPos.Phi(), etaPoint = fLocPos.Eta();
877   Double_t eta, phi, distance;
878   for(iDigit=0; iDigit < fMulDigit; iDigit++) {
879     digit = (AliEMCALDigit *) ( digits->At(fDigitsList[iDigit]) ) ;
880     
881     eta = phi = 0.0;
882     fGeomPtr->EtaPhiFromIndex(digit->GetId(),eta, phi) ;
883     phi = phi * TMath::DegToRad();
884   
885     distance = TMath::Sqrt((eta-etaPoint)*(eta-etaPoint)+(phi-phiPoint)*(phi-phiPoint));
886     if(distance < fCoreRadius)
887       fCoreEnergy += fEnergyList[iDigit] ;
888   }
889   
890 }
891 //____________________________________________________________________________
892 void  AliEMCALRecPoint::EvalElipsAxis(Float_t logWeight,TClonesArray * digits)
893 {
894   // Calculates the axis of the shower ellipsoid in eta and phi
895   // in cell units
896
897   TString gn(fGeomPtr->GetName());
898
899   Double_t wtot = 0.;
900   Double_t x    = 0.;
901   Double_t z    = 0.;
902   Double_t dxx  = 0.;
903   Double_t dzz  = 0.;
904   Double_t dxz  = 0.;
905
906   AliEMCALDigit * digit = 0;
907         
908   Double_t etai =0, phii=0, w=0; 
909   int nSupMod=0, nModule=0, nIphi=0, nIeta=0;
910   int iphi=0, ieta=0;
911   for(Int_t iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
912     digit = (AliEMCALDigit *) digits->At(fDigitsList[iDigit])  ;
913     etai = phii = 0.; 
914     // Nov 15,2006 - use cell numbers as coordinates
915     // Copied for shish-kebab geometry, ieta,iphi is cast as double as eta,phi
916     // We can use the eta,phi(or coordinates) of cell
917     nSupMod = nModule = nIphi = nIeta = iphi = ieta = 0;
918
919     fGeomPtr->GetCellIndex(digit->GetId(), nSupMod,nModule,nIphi,nIeta);
920     fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nModule,nIphi,nIeta, iphi,ieta);
921           
922     // In case of a shared cluster, index of SM in C side, columns start at 48 and ends at 48*2
923     // C Side impair SM, nSupMod%2=1; A side pair SM, nSupMod%2=0
924     if(fSharedCluster && nSupMod%2) ieta+=AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
925     
926     etai=(Double_t)ieta;
927     phii=(Double_t)iphi;
928           
929     w = TMath::Max(0.,logWeight+TMath::Log(fEnergyList[iDigit]/fAmp ) ) ;
930     // fAmp summed amplitude of digits, i.e. energy of recpoint 
931     // Gives smaller value of lambda than log weight  
932     // w = fEnergyList[iDigit] / fAmp; // Nov 16, 2006 - try just energy
933
934     dxx  += w * etai * etai ;
935     x    += w * etai ;
936     dzz  += w * phii * phii ;
937     z    += w * phii ; 
938
939     dxz  += w * etai * phii ; 
940
941     wtot += w ;
942   }
943
944   if ( wtot > 0 ) { 
945     dxx /= wtot ;
946     x   /= wtot ;
947     dxx -= x * x ;
948     dzz /= wtot ;
949     z   /= wtot ;
950     dzz -= z * z ;
951     dxz /= wtot ;
952     dxz -= x * z ;
953
954     fLambda[0] =  0.5 * (dxx + dzz) + TMath::Sqrt( 0.25 * (dxx - dzz) * (dxx - dzz) + dxz * dxz )  ;
955     if(fLambda[0] > 0)
956       fLambda[0] = TMath::Sqrt(fLambda[0]) ;
957     else
958       fLambda[0] = 0;
959     
960     fLambda[1] =  0.5 * (dxx + dzz) - TMath::Sqrt( 0.25 * (dxx - dzz) * (dxx - dzz) + dxz * dxz )  ;
961
962     if(fLambda[1] > 0) //To avoid exception if numerical errors lead to negative lambda.
963       fLambda[1] = TMath::Sqrt(fLambda[1]) ;
964     else
965       fLambda[1]= 0. ;
966   } else { 
967     fLambda[0]= 0. ;
968     fLambda[1]= 0. ;
969   }
970
971   //printf("AliEMCALRecPoint::EvalElipsAxis() lambdas  = %f,%f \n", fLambda[0],fLambda[1]) ; 
972
973 }
974
975 //______________________________________________________________________________
976 void  AliEMCALRecPoint::EvalPrimaries(TClonesArray * digits)
977 {
978   // Constructs the list of primary particles (tracks) which 
979   // have contributed to this RecPoint and calculate deposited energy 
980   // for each track
981     
982   AliEMCALDigit * digit =0;
983   Int_t * primArray = new Int_t[fMaxTrack] ;
984   memset(primArray,-1,sizeof(Int_t)*fMaxTrack);
985   Float_t * dEPrimArray = new Float_t[fMaxTrack] ;
986   memset(dEPrimArray,-1,sizeof(Int_t)*fMaxTrack);
987   
988   Int_t index ;  
989   for ( index = 0 ; index < GetDigitsMultiplicity() ; index++ ) { // all digits
990     digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At( fDigitsList[index] )) ; 
991     if(!digit) {
992       AliError("No Digit!!");
993       continue;
994     }
995     
996     Int_t nprimaries = digit->GetNprimary() ;
997     if ( nprimaries == 0 ) continue ;
998     Int_t jndex ;
999     for ( jndex = 0 ; jndex < nprimaries ; jndex++ ) { // all primaries in digit
1000       if ( fMulTrack > fMaxTrack ) {
1001         fMulTrack = fMaxTrack ;
1002         Error("EvalPrimaries", "increase fMaxTrack ")  ;
1003         break ;
1004       }
1005       Int_t newPrimary = digit->GetPrimary(jndex+1);
1006       Float_t dEPrimary = digit->GetDEPrimary(jndex+1);
1007       Int_t kndex ;
1008       Bool_t already = kFALSE ;
1009       for ( kndex = 0 ; kndex < fMulTrack ; kndex++ ) { //check if not already stored
1010         if ( newPrimary == primArray[kndex] ){
1011           already = kTRUE ;
1012           dEPrimArray[kndex] += dEPrimary; 
1013           break ;
1014         }
1015       } // end of check
1016       if ( !already && (fMulTrack < fMaxTrack)) { // store it
1017         primArray[fMulTrack] = newPrimary ; 
1018         dEPrimArray[fMulTrack] = dEPrimary ; 
1019         fMulTrack++ ;
1020       } // store it
1021     } // all primaries in digit
1022   } // all digits
1023   
1024   Int_t *sortIdx = new Int_t[fMulTrack];
1025   TMath::Sort(fMulTrack,dEPrimArray,sortIdx); 
1026   for(index = 0; index < fMulTrack; index++) {
1027     fTracksList[index] = primArray[sortIdx[index]] ;    
1028     fDETracksList[index] = dEPrimArray[sortIdx[index]] ;
1029   }
1030   delete [] sortIdx;
1031   delete [] primArray ;
1032   delete [] dEPrimArray ;
1033   
1034 }
1035
1036 //______________________________________________________________________________
1037 void  AliEMCALRecPoint::EvalParents(TClonesArray * digits)
1038 {
1039   // Constructs the list of parent particles (tracks) which have contributed to this RecPoint
1040
1041   AliEMCALDigit * digit=0 ;
1042   Int_t * parentArray = new Int_t[fMaxTrack] ;
1043   memset(parentArray,-1,sizeof(Int_t)*fMaxTrack);
1044   Float_t * dEParentArray = new Float_t[fMaxTrack] ;
1045   memset(dEParentArray,-1,sizeof(Int_t)*fMaxTrack);
1046   
1047   Int_t index ;  
1048   for ( index = 0 ; index < GetDigitsMultiplicity() ; index++ ) { // all digits
1049     if (fDigitsList[index] >= digits->GetEntries() || fDigitsList[index] < 0)
1050       AliError(Form("Trying to get invalid digit %d (idx in WriteRecPoint %d)",fDigitsList[index],index));
1051     digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At( fDigitsList[index] )) ; 
1052     if(!digit) {
1053       AliError("No Digit!!");
1054       continue;
1055     }
1056     
1057     Int_t nparents = digit->GetNiparent() ;
1058     if ( nparents == 0 ) continue ;
1059     
1060     Int_t jndex ;
1061     for ( jndex = 0 ; jndex < nparents ; jndex++ ) { // all primaries in digit
1062       if ( fMulParent > fMaxParent ) {
1063         fMulTrack = - 1 ;
1064         Error("EvalParents", "increase fMaxParent")  ;
1065         break ;
1066       }
1067       Int_t newParent = digit->GetIparent(jndex+1) ;
1068       Float_t newdEParent = digit->GetDEParent(jndex+1) ;
1069       Int_t kndex ;
1070       Bool_t already = kFALSE ;
1071       for ( kndex = 0 ; kndex < fMulParent ; kndex++ ) { //check if not already stored
1072         if ( newParent == parentArray[kndex] ){
1073           dEParentArray[kndex] += newdEParent;
1074           already = kTRUE ;
1075           break ;
1076         }
1077       } // end of check
1078       if ( !already && (fMulParent < fMaxParent)) { // store it
1079         parentArray[fMulParent] = newParent ; 
1080         dEParentArray[fMulParent] = newdEParent ; 
1081         fMulParent++ ;
1082       } // store it
1083     } // all parents in digit
1084   } // all digits
1085   
1086   if (fMulParent>0) {
1087     Int_t *sortIdx = new Int_t[fMulParent];
1088     TMath::Sort(fMulParent,dEParentArray,sortIdx); 
1089     for(index = 0; index < fMulParent; index++) {
1090       fParentsList[index] = parentArray[sortIdx[index]] ;      
1091       fDEParentsList[index] = dEParentArray[sortIdx[index]] ;
1092     }
1093     delete [] sortIdx;
1094   }
1095   
1096   delete [] parentArray;
1097   delete [] dEParentArray;
1098 }
1099
1100 //____________________________________________________________________________
1101 void AliEMCALRecPoint::GetLocalPosition(TVector3 & lpos) const
1102 {
1103   // returns the position of the cluster in the local reference system
1104   // of the sub-detector
1105   
1106   lpos = fLocPos;
1107 }
1108
1109 //____________________________________________________________________________
1110 void AliEMCALRecPoint::GetGlobalPosition(TVector3 & gpos) const
1111 {
1112   // returns the position of the cluster in the global reference system of ALICE
1113   // These are now the Cartesian X, Y and Z
1114   //  cout<<" geom "<<geom<<endl;
1115   // fGeomPtr->GetGlobal(fLocPos, gpos, fSuperModuleNumber);
1116   gpos = fGlobPos;
1117         
1118 }
1119
1120 //____________________________________________________________________________
1121 //void AliEMCALRecPoint::GetGlobalPosition(TVector3 & gpos, TMatrixF & gmat) const
1122 //{
1123 //  // returns the position of the cluster in the global reference system of ALICE
1124 //  // These are now the Cartesian X, Y and Z
1125 //  //  cout<<" geom "<<geom<<endl;
1126 //
1127 //  //To be implemented
1128 //  fGeomPtr->GetGlobalEMCAL(this, gpos, gmat);
1129 //
1130 //}
1131
1132 //_____________________________________________________________________________
1133 void AliEMCALRecPoint::EvalLocal2TrackingCSTransform()
1134 {
1135   //Evaluates local to "tracking" c.s. transformation (B.P.).
1136   //All evaluations should be completed before calling for this
1137   //function.                           
1138   //See ALICE PPR Chapter 5 p.18 for "tracking" c.s. definition,
1139   //or just ask Jouri Belikov. :) 
1140
1141   SetVolumeId(AliGeomManager::LayerToVolUID(AliGeomManager::kEMCAL,GetSuperModuleNumber()));
1142
1143   const TGeoHMatrix* tr2loc = GetTracking2LocalMatrix();
1144   if(!tr2loc) AliFatal(Form("No Tracking2LocalMatrix found."));
1145
1146   Double_t lxyz[3] = {fLocPos.X(),fLocPos.Y(),fLocPos.Z()};
1147   Double_t txyz[3] = {0,0,0};
1148
1149   tr2loc->MasterToLocal(lxyz,txyz);
1150   SetX(txyz[0]); SetY(txyz[1]); SetZ(txyz[2]);
1151
1152   if(AliLog::GetGlobalDebugLevel()>0) {
1153     TVector3 gpos; //TMatrixF gmat;
1154     //GetGlobalPosition(gpos,gmat); //Not doing anythin special, replace by next line.  
1155     fGeomPtr->GetGlobal(fLocPos, gpos, GetSuperModuleNumber());
1156     
1157     Float_t gxyz[3];
1158     GetGlobalXYZ(gxyz);
1159     AliInfo(Form("lCS-->(%.3f,%.3f,%.3f), tCS-->(%.3f,%.3f,%.3f), gCS-->(%.3f,%.3f,%.3f),  gCScalc-\
1160 ->(%.3f,%.3f,%.3f), supermodule %d",
1161                  fLocPos.X(),fLocPos.Y(),fLocPos.Z(),
1162                  GetX(),GetY(),GetZ(),
1163                  gpos.X(),gpos.Y(),gpos.Z(),
1164                  gxyz[0],gxyz[1],gxyz[2],GetSuperModuleNumber()));
1165   }
1166
1167 }
1168
1169 //____________________________________________________________________________
1170 Float_t AliEMCALRecPoint::GetMaximalEnergy(void) const
1171 {
1172   // Finds the maximum energy in the cluster
1173   
1174   Float_t menergy = 0. ;
1175
1176   Int_t iDigit;
1177   for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
1178  
1179     if(fEnergyList[iDigit] > menergy) 
1180       menergy = fEnergyList[iDigit] ;
1181   }
1182   return menergy ;
1183 }
1184
1185 //____________________________________________________________________________
1186 Int_t AliEMCALRecPoint::GetMaximalEnergyIndex(void) const
1187 {
1188   // Finds the maximum energy in the cluster
1189   
1190   Float_t menergy = 0. ;
1191   Int_t mid       = 0  ;
1192   Int_t iDigit;
1193   
1194   for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
1195     
1196     if(fEnergyList[iDigit] > menergy){ 
1197       menergy = fEnergyList[iDigit] ;
1198       mid     = iDigit ;
1199     }
1200   }//loop on cluster digits
1201   
1202   return mid ;
1203 }
1204
1205
1206 //____________________________________________________________________________
1207 Int_t AliEMCALRecPoint::GetMultiplicityAtLevel(Float_t H) const
1208 {
1209   // Calculates the multiplicity of digits with energy larger than H*energy 
1210   
1211   Int_t multipl   = 0 ;
1212   Int_t iDigit ;
1213   for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
1214
1215     if(fEnergyList[iDigit] > H * fAmp) 
1216       multipl++ ;
1217   }
1218   return multipl ;
1219 }
1220
1221 //____________________________________________________________________________
1222 Int_t  AliEMCALRecPoint::GetNumberOfLocalMax(AliEMCALDigit **  maxAt, Float_t * maxAtEnergy,
1223                                                Float_t locMaxCut,TClonesArray * digits) const
1224
1225   // Calculates the number of local maxima in the cluster using fLocalMaxCut as the minimum
1226   // energy difference between two local maxima
1227
1228   AliEMCALDigit * digit  = 0;
1229   AliEMCALDigit * digitN = 0;
1230   
1231   Int_t iDigitN = 0 ;
1232   Int_t iDigit  = 0 ;
1233
1234   for(iDigit = 0; iDigit < fMulDigit; iDigit++)
1235     maxAt[iDigit] = (AliEMCALDigit*) digits->At(fDigitsList[iDigit])  ;
1236   
1237   for(iDigit = 0 ; iDigit < fMulDigit; iDigit++) {   
1238     if(maxAt[iDigit]) {
1239       digit = maxAt[iDigit] ;
1240           
1241       for(iDigitN = 0; iDigitN < fMulDigit; iDigitN++) {        
1242         if(iDigitN == iDigit) continue;//the same digit
1243         digitN = (AliEMCALDigit *) digits->At(fDigitsList[iDigitN]) ; 
1244         
1245         if ( AreNeighbours(digit, digitN) ) {
1246           if (fEnergyList[iDigit] > fEnergyList[iDigitN] ) {    
1247             maxAt[iDigitN] = 0 ;
1248             // but may be digit too is not local max ?
1249             if(fEnergyList[iDigit] < fEnergyList[iDigitN] + locMaxCut) 
1250               maxAt[iDigit] = 0 ;
1251           } else {
1252             maxAt[iDigit] = 0 ;
1253             // but may be digitN too is not local max ?
1254             if(fEnergyList[iDigit] > fEnergyList[iDigitN] - locMaxCut) 
1255               maxAt[iDigitN] = 0 ; 
1256           } 
1257         } // if Areneighbours
1258       } // while digitN
1259     } // slot not empty
1260   } // while digit
1261   
1262   iDigitN = 0 ;
1263   for(iDigit = 0; iDigit < fMulDigit; iDigit++) { 
1264     if(maxAt[iDigit] ){
1265       maxAt[iDigitN] = maxAt[iDigit] ;
1266       maxAtEnergy[iDigitN] = fEnergyList[iDigit] ;
1267       iDigitN++ ; 
1268     }
1269   }
1270
1271   return iDigitN ;
1272 }
1273
1274 //____________________________________________________________________________
1275 Int_t AliEMCALRecPoint::GetPrimaryIndex() const  
1276 {
1277   // Get the primary track index in TreeK which deposits the most energy 
1278   // in Digits which forms RecPoint. 
1279
1280   if (fMulTrack)
1281     return fTracksList[0];
1282   return -12345;
1283 }
1284
1285 //____________________________________________________________________________
1286 void AliEMCALRecPoint::EvalTime(TClonesArray * digits){
1287   // time is set to the time of the digit with the maximum energy
1288
1289   Float_t maxE  = 0;
1290   Int_t   maxAt = 0;
1291   for(Int_t idig=0; idig < fMulDigit; idig++){
1292     if(fEnergyList[idig] > maxE){
1293       maxE  = fEnergyList[idig] ;
1294       maxAt = idig;
1295     }
1296   }
1297   fTime = ((AliEMCALDigit*) digits->At(fDigitsList[maxAt]))->GetTime() ;
1298   
1299 }
1300
1301 //______________________________________________________________________________
1302 void AliEMCALRecPoint::Paint(Option_t *)
1303 {
1304   // Paint this ALiRecPoint as a TMarker  with its current attributes
1305   
1306   TVector3 pos(0.,0.,0.)  ;
1307   GetLocalPosition(pos)   ;
1308   Coord_t x = pos.X()     ;
1309   Coord_t y = pos.Z()     ;
1310   Color_t markercolor = 1 ;
1311   Size_t  markersize  = 1.;
1312   Style_t markerstyle = 5 ;
1313   
1314   if (!gPad->IsBatch()) {
1315     gVirtualX->SetMarkerColor(markercolor) ;
1316     gVirtualX->SetMarkerSize (markersize)  ;
1317     gVirtualX->SetMarkerStyle(markerstyle) ;
1318   }
1319   gPad->SetAttMarkerPS(markercolor,markerstyle,markersize) ;
1320   gPad->PaintPolyMarker(1,&x,&y,"") ;
1321 }
1322
1323 //_____________________________________________________________________
1324 Double_t AliEMCALRecPoint::TmaxInCm(const Double_t e , const Int_t key)
1325
1326   // e energy in GeV)
1327   // key  =  0(gamma, default)
1328   //     !=  0(electron)
1329   const Double_t ca   = 4.82;  // shower max parameter - first guess; ca=TMath::Log(1000./8.07)
1330   Double_t tmax = 0.;    // position of electromagnetic shower max in cm
1331
1332   Double_t x0   = 1.31;  // radiation lenght (cm)
1333   //If old geometry in use
1334   if(!((fGeomPtr->GetEMCGeometry()->GetGeoName()).Contains("V1"))) x0 = 1.28;
1335
1336   if(e>0.1) {
1337     tmax = TMath::Log(e) + ca;
1338     if      (key==0) tmax += 0.5; 
1339     else             tmax -= 0.5;
1340     tmax *= x0; // convert to cm
1341   }
1342   return tmax;
1343 }
1344
1345 //______________________________________________________________________________
1346 Float_t AliEMCALRecPoint::EtaToTheta(Float_t arg) const
1347 {
1348   //Converts Theta (Radians) to Eta(Radians)
1349   return (2.*TMath::ATan(TMath::Exp(-arg)));
1350 }
1351
1352 //______________________________________________________________________________
1353 Float_t AliEMCALRecPoint::ThetaToEta(Float_t arg) const
1354 {
1355   //Converts Eta (Radians) to Theta(Radians)
1356   return (-1 * TMath::Log(TMath::Tan(0.5 * arg)));
1357 }
1358
1359 //____________________________________________________________________________
1360 void AliEMCALRecPoint::Print(Option_t *opt) const
1361 {
1362   // Print the list of digits belonging to the cluster
1363   if(strlen(opt)==0) return;
1364   TString message ; 
1365   message  = "AliEMCALRecPoint:\n" ;
1366   message +=  " digits # = " ; 
1367   AliInfo(message.Data()) ; 
1368
1369   Int_t iDigit;
1370   for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++)
1371     printf(" %d ", fDigitsList[iDigit] ) ;  
1372   printf("\n");
1373
1374   AliInfo(" Energies = ") ;
1375   for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) 
1376     printf(" %f ", fEnergyList[iDigit] ) ;
1377   printf("\n");
1378
1379   AliInfo("\n Abs Ids = ") ;
1380   for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) 
1381     printf(" %i ", fAbsIdList[iDigit] ) ;
1382   printf("\n");
1383
1384   AliInfo(" Primaries  ") ;
1385   for(iDigit = 0;iDigit < fMulTrack; iDigit++)
1386     printf(" %d ", fTracksList[iDigit]) ;
1387
1388   printf("\n Local x %6.2f y %7.2f z %7.1f \n", fLocPos[0], fLocPos[1], fLocPos[2]);
1389
1390   message  = "       ClusterType     = %d" ;
1391   message += "       Multiplicity    = %d" ;
1392   message += "       Cluster Energy  = %f" ; 
1393   message += "       Core energy     = %f" ; 
1394   message += "       Core radius     = %f" ; 
1395   message += "       Number of primaries %d" ; 
1396   message += "       Stored at position %d" ; 
1397   AliInfo(Form(message.Data(), fClusterType, fMulDigit, fAmp, fCoreEnergy, fCoreRadius, fMulTrack, GetIndexInList()) ) ;  
1398 }
1399
1400 //___________________________________________________________
1401 Double_t  AliEMCALRecPoint::GetPointEnergy() const
1402 {
1403   //Returns energy ....
1404   Double_t e=0.0;
1405   for(int ic=0; ic<GetMultiplicity(); ic++) e += double(fEnergyList[ic]);
1406   return e;
1407 }