EMCAL/AliEMCALRecPoint.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15 /* $Id$ */
  16 //_________________________________________________________________________
  17 //  Reconstructed Points for the EMCAL
  18 //  A RecPoint is a cluster of digits
  19 //
  20 //
  21 //*-- Author: Yves Schutz (SUBATECH)
  22 //*-- Author: Dmitri Peressounko (RRC KI & SUBATECH)
  23 //*-- Author: Heather Gray (LBL) merged AliEMCALRecPoint and AliEMCALTowerRecPoint 02/04
  24
  25 // --- ROOT system ---
  26 #include "TPad.h"
  27 #include "TGraph.h"
  28 #include "TPaveText.h"
  29 #include "TClonesArray.h"
  30 #include "TMath.h"
  31 #include "TGeoMatrix.h"
  32 #include "TGeoManager.h"
  33 #include "TGeoPhysicalNode.h"
  34 #include "TRandom.h"
  35
  36 // --- Standard library ---
  37 #include <Riostream.h>
  38
  39 // --- AliRoot header files ---
  40 //#include "AliGenerator.h"
  41 class AliGenerator;
  42 class AliEMCAL;
  43 #include "AliLog.h"
  44 #include "AliGeomManager.h"
  45 #include "AliEMCALGeometry.h"
  46 #include "AliEMCALHit.h"
  47 #include "AliEMCALDigit.h"
  48 #include "AliEMCALRecPoint.h"
  49 #include "AliCaloCalibPedestal.h"
  50 #include "AliEMCALGeoParams.h"
  51
  52 ClassImp(AliEMCALRecPoint)
  53
  54 //____________________________________________________________________________
  55 AliEMCALRecPoint::AliEMCALRecPoint()
  56   : AliCluster(), fGeomPtr(0),
  57     fAmp(0), fIndexInList(-1), //to be set when the point is already stored
  58     fGlobPos(0,0,0),fLocPos(0,0,0),
  59     fMaxDigit(100), fMulDigit(0), fMaxTrack(200),
  60     fMulTrack(0), fDigitsList(0), fTracksList(0),
  61     fClusterType(-1), fCoreEnergy(0), fDispersion(0),
  62     fEnergyList(0), fAbsIdList(0),
  63     fTime(0.), fNExMax(0), fCoreRadius(10),  //HG check this
  64     fDETracksList(0), fMulParent(0), fMaxParent(0),
  65     fParentsList(0), fDEParentsList(0), fSuperModuleNumber(0),
  66     fDigitIndMax(-1), fDistToBadTower(-1), fSharedCluster(kFALSE)
  67 {
  68   // ctor
  69   fGeomPtr = AliEMCALGeometry::GetInstance();
  70
  71   fLambda[0] = 0;
  72   fLambda[1] = 0;
  73
  74 }
  75
  76 //____________________________________________________________________________
  77 AliEMCALRecPoint::AliEMCALRecPoint(const char *)
  78   : AliCluster(), fGeomPtr(0),
  79     fAmp(0), fIndexInList(-1), //to be set when the point is already stored
  80     fGlobPos(0,0,0), fLocPos(0,0,0),
  81     fMaxDigit(100), fMulDigit(0), fMaxTrack(1000), fMulTrack(0),
  82     fDigitsList(new Int_t[fMaxDigit]), fTracksList(new Int_t[fMaxTrack]),
  83     fClusterType(-1), fCoreEnergy(0), fDispersion(0),
  84     fEnergyList(new Float_t[fMaxDigit]),
  85     fAbsIdList(new Int_t[fMaxDigit]), fTime(-1.), fNExMax(0), fCoreRadius(10),
  86     fDETracksList(new Float_t[fMaxTrack]), fMulParent(0), fMaxParent(1000),
  87     fParentsList(new Int_t[fMaxParent]), fDEParentsList(new Float_t[fMaxParent]),
  88     fSuperModuleNumber(0), fDigitIndMax(-1), fDistToBadTower(-1),fSharedCluster(kFALSE)
  89 {
  90   // ctor
  91   for (Int_t i = 0; i < fMaxTrack; i++)
  92     fDETracksList[i] = 0;
  93   for (Int_t i = 0; i < fMaxParent; i++) {
  94     fParentsList[i] = -1;
  95     fDEParentsList[i] = 0;
  96   }
  97
  98   fGeomPtr = AliEMCALGeometry::GetInstance();
  99   fLambda[0] = 0;
 100   fLambda[1] = 0;
 101 }
 102
 103 //____________________________________________________________________________
 104 AliEMCALRecPoint::AliEMCALRecPoint(const AliEMCALRecPoint & rp)
 105   : AliCluster(rp), fGeomPtr(rp.fGeomPtr),
 106     fAmp(rp.fAmp), fIndexInList(rp.fIndexInList),
 107     fGlobPos(rp.fGlobPos),fLocPos(rp.fLocPos),
 108     fMaxDigit(rp.fMaxDigit), fMulDigit(rp.fMulDigit),
 109     fMaxTrack(rp.fMaxTrack), fMulTrack(rp.fMaxTrack),
 110     fDigitsList(new Int_t[rp.fMaxDigit]), fTracksList(new Int_t[rp.fMaxTrack]),
 111     fClusterType(rp.fClusterType), fCoreEnergy(rp.fCoreEnergy),
 112     fDispersion(rp.fDispersion),
 113     fEnergyList(new Float_t[rp.fMaxDigit]),
 114     fAbsIdList(new Int_t[rp.fMaxDigit]), fTime(rp.fTime), fNExMax(rp.fNExMax),fCoreRadius(rp.fCoreRadius),
 115     fDETracksList(new Float_t[rp.fMaxTrack]), fMulParent(rp.fMulParent),
 116     fMaxParent(rp.fMaxParent), fParentsList(new Int_t[rp.fMaxParent]),
 117     fDEParentsList(new Float_t[rp.fMaxParent]),
 118     fSuperModuleNumber(rp.fSuperModuleNumber), fDigitIndMax(rp.fDigitIndMax),
 119     fDistToBadTower(rp.fDistToBadTower), fSharedCluster(rp.fSharedCluster)
 120 {
 121   //copy ctor
 122   fLambda[0] = rp.fLambda[0];
 123   fLambda[1] = rp.fLambda[1];
 124
 125   for(Int_t i = 0; i < rp.fMulDigit; i++) {
 126     fEnergyList[i] = rp.fEnergyList[i];
 127     fAbsIdList[i]  = rp.fAbsIdList[i];
 128   }
 129
 130   for(Int_t i = 0; i < rp.fMulTrack; i++) fDETracksList[i] = rp.fDETracksList[i];
 131
 132   for(Int_t i = 0; i < rp.fMulParent; i++) {
 133     fParentsList[i] = rp.fParentsList[i];
 134     fDEParentsList[i] = rp.fDEParentsList[i];
 135   }
 136
 137 }
 138 //____________________________________________________________________________
 139 AliEMCALRecPoint::~AliEMCALRecPoint()
 140 {
 141   // dtor
 142   if ( fEnergyList )
 143     delete[] fEnergyList ;
 144   if ( fAbsIdList )
 145     delete[] fAbsIdList ;
 146    if ( fDETracksList)
 147     delete[] fDETracksList;
 148    if ( fParentsList)
 149     delete[] fParentsList;
 150    if ( fDEParentsList)
 151     delete[] fDEParentsList;
 152
 153    delete [] fDigitsList ;
 154    delete [] fTracksList ;
 155 }
 156
 157 //____________________________________________________________________________
 158 AliEMCALRecPoint& AliEMCALRecPoint::operator= (const AliEMCALRecPoint &rp)
 159 {
 160   // assignment operator
 161
 162   if(&rp == this) return *this;
 163
 164   fGeomPtr     = rp.fGeomPtr;
 165   fAmp         = rp.fAmp;
 166   fIndexInList = rp.fIndexInList;
 167   fGlobPos     = rp.fGlobPos;
 168   fLocPos      = rp.fLocPos;
 169   fMaxDigit    = rp.fMaxDigit;
 170   fMulDigit    = rp.fMulDigit;
 171   fMaxTrack    = rp.fMaxTrack;
 172   fMulTrack    = rp.fMulTrack;
 173
 174   if(fDigitsList) delete [] fDigitsList;
 175   fDigitsList = new Int_t[rp.fMaxDigit];
 176   if(fTracksList) delete [] fTracksList;
 177   fTracksList = new Int_t[rp.fMaxTrack];
 178   for(Int_t i = 0; i<fMaxDigit; i++) fDigitsList[i] = rp.fDigitsList[i];
 179   for(Int_t i = 0; i<fMaxTrack; i++) fTracksList[i] = rp.fTracksList[i];
 180
 181   fClusterType = rp.fClusterType;
 182   fCoreEnergy  = rp.fCoreEnergy;
 183   fDispersion  = rp.fDispersion;
 184
 185
 186   if(fEnergyList) delete [] fEnergyList;
 187   fEnergyList = new Float_t[rp.fMaxDigit];
 188   if(fAbsIdList) delete [] fAbsIdList;
 189   fAbsIdList = new Int_t[rp.fMaxDigit];
 190   for(Int_t i = 0; i<fMaxDigit; i++) {
 191     fEnergyList[i] = rp.fEnergyList[i];
 192     fAbsIdList[i]  = rp.fAbsIdList[i];
 193   }
 194
 195   fTime       = rp.fTime;
 196   fNExMax     = rp.fNExMax;
 197   fCoreRadius = rp.fCoreRadius;
 198
 199   if(fDETracksList) delete [] fDETracksList;
 200   fDETracksList = new Float_t[rp.fMaxTrack];
 201   for(Int_t i = 0; i < fMaxTrack; i++) fDETracksList[i] = rp.fDETracksList[i];
 202
 203   fMulParent = rp.fMulParent;
 204   fMaxParent = rp.fMaxParent;
 205
 206   if(fParentsList) delete [] fParentsList;
 207   fParentsList = new Int_t[rp.fMaxParent];
 208   if(fDEParentsList) delete [] fDEParentsList;
 209   fDEParentsList = new Float_t[rp.fMaxParent];
 210   for(Int_t i = 0; i < fMaxParent; i++) {
 211     fParentsList[i]   = rp.fParentsList[i];
 212     fDEParentsList[i] = rp.fDEParentsList[i];
 213   }
 214
 215   fSuperModuleNumber = rp.fSuperModuleNumber;
 216   fDigitIndMax       = rp.fDigitIndMax;
 217
 218   fLambda[0] = rp.fLambda[0];
 219   fLambda[1] = rp.fLambda[1];
 220
 221   fDistToBadTower = rp.fDistToBadTower;
 222   fSharedCluster  = rp.fSharedCluster;
 223
 224   return *this;
 225
 226 }
 227
 228 //____________________________________________________________________________
 229 void AliEMCALRecPoint::AddDigit(AliEMCALDigit & digit, const Float_t energy, const Bool_t shared)
 230 {
 231   // Adds a digit to the RecPoint
 232   // and accumulates the total amplitude and the multiplicity
 233
 234   if(fEnergyList == 0)
 235     fEnergyList =  new Float_t[fMaxDigit];
 236
 237   if(fAbsIdList == 0) {
 238     fAbsIdList  =  new Int_t  [fMaxDigit];
 239   }
 240
 241   if ( fMulDigit >= fMaxDigit ) { // increase the size of the lists
 242     fMaxDigit*=2 ;
 243     Int_t   * tempo   = new Int_t  [fMaxDigit];
 244     Float_t * tempoE  = new Float_t[fMaxDigit];
 245     Int_t   * tempoId = new Int_t  [fMaxDigit];
 246
 247     Int_t index ;
 248     for ( index = 0 ; index < fMulDigit ; index++ ){
 249       tempo  [index] = fDigitsList[index] ;
 250       tempoE [index] = fEnergyList[index] ;
 251       tempoId[index] = fAbsIdList [index] ;
 252     }
 253
 254     delete [] fDigitsList ;
 255     delete [] fEnergyList ;
 256     delete [] fAbsIdList ;
 257
 258     fDigitsList = tempo;
 259     fEnergyList = tempoE;
 260     fAbsIdList  = tempoId;
 261   } // if
 262
 263   fDigitsList[fMulDigit]   = digit.GetIndexInList()  ;
 264   fEnergyList[fMulDigit]   = energy ;
 265   fAbsIdList [fMulDigit]   = digit.GetId();
 266   fMulDigit++ ;
 267   fAmp += energy ;
 268
 269   if(shared) fSharedCluster = kTRUE;
 270 }
 271 //____________________________________________________________________________
 272 Bool_t AliEMCALRecPoint::AreNeighbours(AliEMCALDigit * digit1, AliEMCALDigit * digit2 ) const
 273 {
 274   // Tells if (true) or not (false) two digits are neighbours
 275   // A neighbour is defined as being two digits which share a corner
 276   // ONLY USED IN CASE OF UNFOLDING
 277
 278   Bool_t areNeighbours = kFALSE ;
 279   Int_t nSupMod=0, nModule=0, nIphi=0, nIeta=0;
 280   Int_t nSupMod1=0, nModule1=0, nIphi1=0, nIeta1=0;
 281   Int_t relid1[2] , relid2[2] ; // ieta, iphi
 282   Int_t rowdiff=0, coldiff=0;
 283
 284   areNeighbours = kFALSE ;
 285
 286   fGeomPtr->GetCellIndex(digit1->GetId(), nSupMod,nModule,nIphi,nIeta);
 287   fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nModule,nIphi,nIeta, relid1[0],relid1[1]);
 288
 289   fGeomPtr->GetCellIndex(digit2->GetId(), nSupMod1,nModule1,nIphi1,nIeta1);
 290   fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod1,nModule1,nIphi1,nIeta1, relid2[0],relid2[1]);
 291
 292   // In case of a shared cluster, index of SM in C side, columns start at 48 and ends at 48*2-1
 293   // C Side impair SM, nSupMod%2=1; A side pair SM nSupMod%2=0
 294   if(fSharedCluster){
 295     //printf("Shared cluster in 2 SMs!\n");
 296
 297     //    if(nSupMod1%2) relid1[1]+=AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;//bad
 298     //    else           relid2[1]+=AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;//bad
 299     if(nSupMod1%2) relid2[1]+=AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
 300     else           relid1[1]+=AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
 301   }
 302
 303   rowdiff = TMath::Abs( relid1[0] - relid2[0] ) ;
 304   coldiff = TMath::Abs( relid1[1] - relid2[1] ) ;
 305
 306   if (( coldiff <= 1 )  && ( rowdiff <= 1 ) && (coldiff + rowdiff > 0))
 307   areNeighbours = kTRUE ;
 308
 309   return areNeighbours;
 310 }
 311
 312 //____________________________________________________________________________
 313 Int_t AliEMCALRecPoint::Compare(const TObject * obj) const
 314 {
 315   // Compares two RecPoints according to their position in the EMCAL modules
 316
 317   Float_t delta = 1 ; //Width of "Sorting row".
 318
 319   Int_t rv = 2 ;
 320
 321   AliEMCALRecPoint * clu = (AliEMCALRecPoint *)obj ;
 322
 323   TVector3 locpos1;
 324   GetLocalPosition(locpos1);
 325   TVector3 locpos2;
 326   clu->GetLocalPosition(locpos2);
 327
 328   Int_t rowdif = (Int_t)(TMath::Ceil(locpos1.X()/delta)-TMath::Ceil(locpos2.X()/delta)) ;
 329   if (rowdif> 0)
 330     rv = 1 ;
 331   else if(rowdif < 0)
 332     rv = -1 ;
 333   else if(locpos1.Y()>locpos2.Y())
 334     rv = -1 ;
 335   else
 336     rv = 1 ;
 337
 338   return rv ;
 339 }
 340
 341 //___________________________________________________________________________
 342  void AliEMCALRecPoint::Draw(Option_t *option)
 343  {
 344    // Draw this AliEMCALRecPoint with its current attributes
 345
 346    AppendPad(option);
 347  }
 348
 349 //____________________________________________________________________________
 350 void AliEMCALRecPoint::EvalAll(Float_t logWeight,TClonesArray * digits, const Bool_t justClusters)
 351 {
 352   // Evaluates cluster parameters
 353
 354   // First calculate the index of digit with maximum amplitude and get
 355   // the supermodule number where it sits.
 356
 357   fDigitIndMax       = GetMaximalEnergyIndex();
 358   fSuperModuleNumber = fGeomPtr->GetSuperModuleNumber(GetAbsIdMaxDigit());
 359
 360   //Evaluate global and local position
 361   EvalGlobalPosition(logWeight, digits) ;
 362   EvalLocalPosition(logWeight, digits) ;
 363
 364   //Evaluate shower parameters
 365   EvalElipsAxis(logWeight, digits) ;
 366   EvalDispersion(logWeight, digits) ;
 367
 368   //EvalCoreEnergy(logWeight, digits);
 369   EvalTime(digits) ;
 370   EvalPrimaries(digits) ;
 371   EvalParents(digits);
 372
 373   //Called last because it sets the global position of the cluster?
 374   //Do not call it when recalculating clusters out of standard reconstruction
 375   if(!justClusters){
 376     EvalLocal2TrackingCSTransform();
 377   }
 378
 379 }
 380
 381 //____________________________________________________________________________
 382 void  AliEMCALRecPoint::EvalDispersion(Float_t logWeight, TClonesArray * digits)
 383 {
 384   // Calculates the dispersion of the shower at the origin of the RecPoint
 385   // in cell units - Nov 16,2006
 386
 387   Double_t d = 0., wtot = 0., w = 0.;
 388   Int_t iDigit=0, nstat=0;
 389   AliEMCALDigit * digit=0;
 390
 391   // Calculates the dispersion in cell units
 392   Double_t etai, phii, etaMean=0.0, phiMean=0.0;
 393   int nSupMod=0, nModule=0, nIphi=0, nIeta=0;
 394   int iphi=0, ieta=0;
 395   // Calculate mean values
 396   for(iDigit=0; iDigit < fMulDigit; iDigit++) {
 397     digit = (AliEMCALDigit *) digits->At(fDigitsList[iDigit])  ;
 398
 399     if (fAmp>0 && fEnergyList[iDigit]>0) {
 400       fGeomPtr->GetCellIndex(digit->GetId(), nSupMod,nModule,nIphi,nIeta);
 401       fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nModule,nIphi,nIeta, iphi,ieta);
 402
 403       // In case of a shared cluster, index of SM in C side, columns start at 48 and ends at 48*2
 404       // C Side impair SM, nSupMod%2=1; A side pair SM nSupMod%2=0
 405       if(fSharedCluster && nSupMod%2) ieta+=AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
 406
 407       etai=(Double_t)ieta;
 408       phii=(Double_t)iphi;
 409       w = TMath::Max(0.,logWeight+TMath::Log(fEnergyList[iDigit]/fAmp ) ) ;
 410
 411       if(w>0.0) {
 412         phiMean += phii*w;
 413         etaMean += etai*w;
 414         wtot    += w;
 415       }
 416     }
 417   }
 418   if (wtot>0) {
 419     phiMean /= wtot ;
 420     etaMean /= wtot ;
 421   } else AliError(Form("Wrong weight %f\n", wtot));
 422
 423   // Calculate dispersion
 424   for(iDigit=0; iDigit < fMulDigit; iDigit++) {
 425     digit = (AliEMCALDigit *) digits->At(fDigitsList[iDigit])  ;
 426
 427     if (fAmp>0 && fEnergyList[iDigit]>0) {
 428       fGeomPtr->GetCellIndex(digit->GetId(), nSupMod,nModule,nIphi,nIeta);
 429       fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nModule,nIphi,nIeta, iphi,ieta);
 430
 431       // In case of a shared cluster, index of SM in C side, columns start at 48 and ends at 48*2
 432       // C Side impair SM, nSupMod%2=1; A side pair SM, nSupMod%2=0
 433       if(fSharedCluster && nSupMod%2) ieta+=AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
 434
 435       etai=(Double_t)ieta;
 436       phii=(Double_t)iphi;
 437       w = TMath::Max(0.,logWeight+TMath::Log(fEnergyList[iDigit]/fAmp ) ) ;
 438
 439       if(w>0.0) {
 440         nstat++;
 441         d += w*((etai-etaMean)*(etai-etaMean)+(phii-phiMean)*(phii-phiMean));
 442       }
 443     }
 444   }
 445
 446   if ( wtot > 0 && nstat>1) d /= wtot ;
 447   else                      d = 0. ;
 448
 449   fDispersion = TMath::Sqrt(d) ;
 450   //printf("AliEMCALRecPoint::EvalDispersion() : Dispersion %f \n",fDispersion);
 451 }
 452
 453 //____________________________________________________________________________
 454 void AliEMCALRecPoint::EvalDistanceToBadChannels(AliCaloCalibPedestal* caloped)
 455 {
 456   //For each EMC rec. point set the distance to the nearest bad channel.
 457   //AliInfo(Form("%d bad channel(s) found.\n", caloped->GetDeadTowerCount()));
 458   //It is done in cell units and not in global or local position as before (Sept 2010)
 459
 460   if(!caloped->GetDeadTowerCount()) return;
 461
 462   //Get channels map of the supermodule where the cluster is.
 463   TH2D* hMap  = caloped->GetDeadMap(fSuperModuleNumber);
 464
 465   Int_t dRrow, dReta;
 466   Float_t  minDist = 10000.;
 467   Float_t  dist    = 0.;
 468   Int_t nSupMod, nModule;
 469   Int_t nIphi, nIeta;
 470   Int_t iphi, ieta;
 471   fDigitIndMax  = GetMaximalEnergyIndex();
 472   fGeomPtr->GetCellIndex(fAbsIdList[fDigitIndMax], nSupMod,nModule,nIphi,nIeta);
 473   fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nModule,nIphi,nIeta, iphi,ieta);
 474
 475   //Loop on tower status map
 476   for(Int_t irow = 0; irow < AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows; irow++){
 477     for(Int_t icol = 0; icol < AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols; icol++){
 478       //Check if tower is bad.
 479       if(hMap->GetBinContent(icol,irow)==AliCaloCalibPedestal::kAlive) continue;
 480       //printf("AliEMCALRecPoint::EvalDistanceToBadChannels() - Bad channel in SM %d, col %d, row %d\n",iSM,icol, irow);
 481
 482       dRrow=TMath::Abs(irow-iphi);
 483       dReta=TMath::Abs(icol-ieta);
 484       dist=TMath::Sqrt(dRrow*dRrow+dReta*dReta);
 485       if(dist < minDist) minDist = dist;
 486
 487     }
 488   }
 489
 490   //In case the cluster is shared by 2 SuperModules, need to check the map of the second Super Module
 491   if (fSharedCluster) {
 492     TH2D* hMap2 = 0;
 493     Int_t nSupMod2 = -1;
 494
 495     //The only possible combinations are (0,1), (2,3) ... (10,11)
 496     if(fSuperModuleNumber%2) nSupMod2 = fSuperModuleNumber-1;
 497     else                     nSupMod2 = fSuperModuleNumber+1;
 498     hMap2  = caloped->GetDeadMap(nSupMod2);
 499
 500     //Loop on tower status map of second super module
 501     for(Int_t irow = 0; irow < AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows; irow++){
 502       for(Int_t icol = 0; icol < AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols; icol++){
 503         //Check if tower is bad.
 504         if(hMap2->GetBinContent(icol,irow)==AliCaloCalibPedestal::kAlive) continue;
 505         //printf("AliEMCALRecPoint::EvalDistanceToBadChannels() - Bad channel in SM %d, col %d, row %d\n",iSM,icol, irow);
 506         dRrow=TMath::Abs(irow-iphi);
 507
 508         if(fSuperModuleNumber%2) {
 509           dReta=TMath::Abs(icol-(AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols+ieta));
 510        }
 511        else {
 512          dReta=TMath::Abs(AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols+icol-ieta);
 513        }
 514
 515        dist=TMath::Sqrt(dRrow*dRrow+dReta*dReta);
 516         if(dist < minDist) minDist = dist;
 517
 518       }
 519     }
 520
 521   }// shared cluster in 2 SuperModules
 522
 523   fDistToBadTower = minDist;
 524   //printf("AliEMCALRecPoint::EvalDistanceToBadChannel() - Distance to Bad is %f cm, shared cluster? %d \n",fDistToBadTower,fSharedCluster);
 525 }
 526
 527
 528 //____________________________________________________________________________
 529 void AliEMCALRecPoint::EvalLocalPosition(Float_t logWeight, TClonesArray * digits)
 530 {
 531   // Calculates the center of gravity in the local EMCAL-module coordinates
 532   //  Info("Print", " logWeight %f : cluster energy %f ", logWeight, fAmp); // for testing
 533
 534   AliEMCALDigit * digit=0;
 535   Int_t i=0, nstat=0;
 536
 537   Double_t dist  = TmaxInCm(Double_t(fAmp));
 538   //Int_t       idMax = GetAbsIdMaxDigit();// idMax is not used at all in RelPosCellInSModule, why use it?
 539
 540   Double_t clXYZ[3]={0.,0.,0.}, clRmsXYZ[3]={0.,0.,0.}, xyzi[3], wtot=0., w=0.;
 541
 542   //printf(" dist : %f  e : %f \n", dist, fAmp);
 543   for(Int_t iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
 544     digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At(fDigitsList[iDigit])) ;
 545
 546     if(!digit) {
 547       AliError("No Digit!!");
 548       continue;
 549     }
 550
 551     fGeomPtr->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), dist, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
 552
 553     //Temporal patch, due to mapping problem, need to swap "y" in one of the 2 SM, although no effect in position calculation. GCB 05/2010
 554     if(fSharedCluster && fSuperModuleNumber != fGeomPtr->GetSuperModuleNumber(digit->GetId())) xyzi[1]*=-1;
 555
 556     //printf("EvalLocalPosition Cell:  Id %i, SM %i : dist %f Local x,y,z %f %f %f \n",
 557     //          digit->GetId(), fGeomPtr->GetSuperModuleNumber(digit->GetId()), dist, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
 558
 559     if(logWeight > 0.0)  w = TMath::Max( 0., logWeight + TMath::Log( fEnergyList[iDigit] / fAmp ));
 560     else  w = fEnergyList[iDigit]; // just energy
 561
 562     if(w>0.0) {
 563       wtot += w ;
 564       nstat++;
 565       for(i=0; i<3; i++ ) {
 566         clXYZ[i]    += (w*xyzi[i]);
 567         clRmsXYZ[i] += (w*xyzi[i]*xyzi[i]);
 568       }
 569     }
 570   }
 571   //  cout << " wtot " << wtot << endl;
 572   if ( wtot > 0 ) {
 573     //    xRMS   = TMath::Sqrt(x2m - xMean*xMean);
 574     for(i=0; i<3; i++ ) {
 575       clXYZ[i] /= wtot;
 576       if(nstat>1) {
 577         clRmsXYZ[i] /= (wtot*wtot);
 578         clRmsXYZ[i]  =  clRmsXYZ[i] - clXYZ[i]*clXYZ[i];
 579         if(clRmsXYZ[i] > 0.0) {
 580           clRmsXYZ[i] =  TMath::Sqrt(clRmsXYZ[i]);
 581         } else      clRmsXYZ[i] = 0;
 582       } else        clRmsXYZ[i] = 0;
 583     }
 584   } else {
 585     for(i=0; i<3; i++ ) {
 586       clXYZ[i] = clRmsXYZ[i] = -1.;
 587     }
 588   }
 589
 590   //    // Cluster of one single digit, smear the position to avoid discrete position
 591   //    // smear x and z with +- 3 cm to uniform (avoid discrete effects). Tower size is approx 6 cm.
 592   //    // Rndm generates a number in ]0,1]
 593   //    if (fMulDigit==1) {
 594   //      clXYZ[0] += fGeomPtr->GetPhiTileSize()*(0.5 - gRandom->Rndm());
 595   //      clXYZ[2] += fGeomPtr->GetEtaTileSize()*(0.5 - gRandom->Rndm());
 596   //    }
 597
 598   //Set position in local vector
 599   fLocPos.SetX(clXYZ[0]);
 600   fLocPos.SetY(clXYZ[1]);
 601   fLocPos.SetZ(clXYZ[2]);
 602
 603   if (gDebug==2)
 604     printf("EvalLocalPosition Cluster: Local (x,y,z) = (%f,%f,%f) \n", fLocPos.X(), fLocPos.Y(), fLocPos.Z()) ;
 605
 606 }
 607
 608
 609 //____________________________________________________________________________
 610 void AliEMCALRecPoint::EvalGlobalPosition(Float_t logWeight, TClonesArray * digits)
 611 {
 612   // Calculates the center of gravity in the global ALICE coordinates
 613   //  Info("Print", " logWeight %f : cluster energy %f ", logWeight, fAmp); // for testing
 614
 615   AliEMCALDigit * digit=0;
 616   Int_t i=0, nstat=0;
 617
 618   Double_t dist  = TmaxInCm(Double_t(fAmp));
 619   //Int_t       idMax = GetAbsIdMaxDigit();// idMax is not used at all in RelPosCellInSModule, why use it?
 620
 621   Double_t clXYZ[3]={0.,0.,0.}, clRmsXYZ[3]={0.,0.,0.}, lxyzi[3], xyzi[3], wtot=0., w=0.;
 622
 623   //printf(" dist : %f  e : %f \n", dist, fAmp);
 624   for(Int_t iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
 625     digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At(fDigitsList[iDigit])) ;
 626
 627     if(!digit) {
 628       AliError("No Digit!!");
 629       continue;
 630     }
 631
 632     //Get the local coordinates of the cell
 633     fGeomPtr->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), dist, lxyzi[0], lxyzi[1], lxyzi[2]);
 634
 635     //Now get the global coordinate
 636     fGeomPtr->GetGlobal(lxyzi,xyzi, fGeomPtr->GetSuperModuleNumber(digit->GetId()));
 637     //TVector3 pos(xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
 638     //printf("EvalGlobalPosition Cell:  Id %i, SM %i : dist %f Local (x,y,z) = (%f %f %f), eta %f, phi%f \n",
 639     //     digit->GetId(), fGeomPtr->GetSuperModuleNumber(digit->GetId()),dist, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2],pos.Eta(),pos.Phi()*TMath::RadToDeg());
 640
 641     if(logWeight > 0.0)  w = TMath::Max( 0., logWeight + TMath::Log( fEnergyList[iDigit] / fAmp ));
 642     else  w = fEnergyList[iDigit]; // just energy
 643
 644     if(w>0.0) {
 645       wtot += w ;
 646       nstat++;
 647       for(i=0; i<3; i++ ) {
 648         clXYZ[i]    += (w*xyzi[i]);
 649         clRmsXYZ[i] += (w*xyzi[i]*xyzi[i]);
 650       }
 651     }
 652   }
 653   //  cout << " wtot " << wtot << endl;
 654   if ( wtot > 0 ) {
 655     //    xRMS   = TMath::Sqrt(x2m - xMean*xMean);
 656     for(i=0; i<3; i++ ) {
 657       clXYZ[i] /= wtot;
 658       if(nstat>1) {
 659         clRmsXYZ[i] /= (wtot*wtot);
 660         clRmsXYZ[i]  =  clRmsXYZ[i] - clXYZ[i]*clXYZ[i];
 661         if(clRmsXYZ[i] > 0.0) {
 662           clRmsXYZ[i] =  TMath::Sqrt(clRmsXYZ[i]);
 663         } else      clRmsXYZ[i] = 0;
 664       } else        clRmsXYZ[i] = 0;
 665     }
 666   } else {
 667     for(i=0; i<3; i++ ) {
 668       clXYZ[i] = clRmsXYZ[i] = -1.;
 669     }
 670   }
 671
 672 //  // Cluster of one single digit, smear the position to avoid discrete position
 673 //  // smear x and z with +- 3 cm to uniform (avoid discrete effects). Tower size is approx 6 cm.
 674 //  // Rndm generates a number in ]0,1]
 675 //  if (fMulDigit==1) {
 676 //    clXYZ[0] += fGeomPtr->GetPhiTileSize()*(0.5 - gRandom->Rndm());
 677 //    clXYZ[2] += fGeomPtr->GetEtaTileSize()*(0.5 - gRandom->Rndm());
 678 //  }
 679
 680   //Set position in global vector
 681   fGlobPos.SetX(clXYZ[0]);
 682   fGlobPos.SetY(clXYZ[1]);
 683   fGlobPos.SetZ(clXYZ[2]);
 684
 685   if (gDebug==2)
 686         printf("EvalGlobalPosition Cluster: (x ,y ,z) = (%f,%f,%f), eta %f,phi %f\n",
 687                    fGlobPos.X(), fGlobPos.Y(), fGlobPos.Z(),fGlobPos.Eta(),fGlobPos.Phi()*TMath::RadToDeg()) ;
 688 }
 689
 690 //____________________________________________________________________________
 691 void AliEMCALRecPoint::EvalLocalPositionFit(Double_t deff, Double_t logWeight,
 692 Double_t phiSlope, TClonesArray * digits)
 693 {
 694   // Evaluates local position of clusters in SM
 695
 696   Double_t ycorr=0;
 697   AliEMCALDigit *digit=0;
 698   Int_t i=0, nstat=0;
 699   Double_t clXYZ[3]={0.,0.,0.}, clRmsXYZ[3]={0.,0.,0.}, xyzi[3], wtot=0., w=0.;
 700
 701   Double_t dist  = TmaxInCm(Double_t(fAmp));
 702   //Int_t       idMax = GetAbsIdMaxDigit();// idMax is not used at all in RelPosCellInSModule, why use it?
 703
 704   for(Int_t iDigit=0; iDigit<digits->GetEntries(); iDigit++) {
 705     digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At(fDigitsList[iDigit])) ;
 706     if(digit){
 707       dist = deff;
 708       //fGeomPtr->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), idMax, dist, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
 709       fGeomPtr->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), dist, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
 710
 711       if(logWeight > 0.0)  w = TMath::Max( 0., logWeight + TMath::Log( fEnergyList[iDigit] / fAmp ));
 712       else                 w = fEnergyList[iDigit]; // just energy
 713
 714       if(w>0.0) {
 715         wtot += w ;
 716         nstat++;
 717         for(i=0; i<3; i++ ) {
 718           clXYZ[i]    += (w*xyzi[i]);
 719           clRmsXYZ[i] += (w*xyzi[i]*xyzi[i]);
 720         }
 721       }
 722     }else AliError("Digit null");
 723   }//loop
 724   //  cout << " wtot " << wtot << endl;
 725   if ( wtot > 0 ) {
 726     //    xRMS   = TMath::Sqrt(x2m - xMean*xMean);
 727     for(i=0; i<3; i++ ) {
 728       clXYZ[i] /= wtot;
 729       if(nstat>1) {
 730         clRmsXYZ[i] /= (wtot*wtot);
 731         clRmsXYZ[i]  =  clRmsXYZ[i] - clXYZ[i]*clXYZ[i];
 732         if(clRmsXYZ[i] > 0.0) {
 733           clRmsXYZ[i] =  TMath::Sqrt(clRmsXYZ[i]);
 734         } else      clRmsXYZ[i] = 0;
 735       } else        clRmsXYZ[i] = 0;
 736     }
 737   } else {
 738     for(i=0; i<3; i++ ) {
 739       clXYZ[i] = clRmsXYZ[i] = -1.;
 740     }
 741   }
 742   // clRmsXYZ[i] ??
 743   if(phiSlope != 0.0 && logWeight > 0.0 && wtot) {
 744     // Correction in phi direction (y - coords here); Aug 16;
 745     // May be put to global level or seperate method
 746     ycorr = clXYZ[1] * (1. + phiSlope);
 747     //printf(" y %f : ycorr %f : slope %f \n", clXYZ[1], ycorr, phiSlope);
 748     clXYZ[1] = ycorr;
 749   }
 750
 751   fLocPos.SetX(clXYZ[0]);
 752   fLocPos.SetY(clXYZ[1]);
 753   fLocPos.SetZ(clXYZ[2]);
 754
 755 //  if (gDebug==2)
 756 //    printf("EvalLocalPosition: eta,phi,r = %f,%f,%f", fLocPos.X(), fLocPos.Y(), fLocPos.Z()) ;
 757 }
 758
 759 //_____________________________________________________________________________
 760 Bool_t AliEMCALRecPoint::EvalLocalPosition2(TClonesArray * digits, TArrayD &ed)
 761 {
 762   // Evaluated local position of rec.point using digits
 763   // and parametrisation of w0 and deff
 764   //printf(" <I> AliEMCALRecPoint::EvalLocalPosition2() \n");
 765   return AliEMCALRecPoint::EvalLocalPositionFromDigits(digits, ed, fLocPos);
 766 }
 767
 768 //_____________________________________________________________________________
 769 Bool_t AliEMCALRecPoint::EvalLocalPositionFromDigits(TClonesArray *digits, TArrayD &ed, TVector3 &locPos)
 770 {
 771   // Used when digits should be recalibrated
 772   Double_t deff=0, w0=0, esum=0;
 773   Int_t iDigit=0;
 774   //  AliEMCALDigit *digit;
 775
 776   if(ed.GetSize() && (digits->GetEntries()!=ed.GetSize())) return kFALSE;
 777
 778   // Calculate sum energy of digits
 779   esum = 0.0;
 780   for(iDigit=0; iDigit<ed.GetSize(); iDigit++) esum += ed[iDigit];
 781
 782   GetDeffW0(esum, deff, w0);
 783
 784   return EvalLocalPositionFromDigits(esum, deff, w0, digits, ed, locPos);
 785 }
 786
 787 //_____________________________________________________________________________
 788 Bool_t AliEMCALRecPoint::EvalLocalPositionFromDigits(const Double_t esum, const Double_t deff, const Double_t w0, TClonesArray *digits, TArrayD &ed, TVector3 &locPos)
 789 {
 790   //Evaluate position of digits in supermodule.
 791   AliEMCALDigit *digit=0;
 792
 793   Int_t i=0, nstat=0;
 794   Double_t clXYZ[3]={0.,0.,0.}, xyzi[3], wtot=0., w=0.;
 795   //Int_t       idMax = GetAbsIdMaxDigit();// idMax is not used at all in RelPosCellInSModule, why use it?
 796
 797   // Get pointer to EMCAL geometry
 798   // (can't use fGeomPtr in static method)
 799   AliEMCALGeometry* geo = AliEMCALGeometry::GetInstance();
 800
 801   for(Int_t iDigit=0; iDigit<digits->GetEntries(); iDigit++) {
 802     digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At(iDigit));
 803     if(digit){
 804       //geo->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), idMax, deff, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
 805       geo->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), deff, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
 806
 807       if(w0 > 0.0)  w = TMath::Max( 0., w0 + TMath::Log(ed[iDigit] / esum));
 808       else          w = ed[iDigit]; // just energy
 809
 810       if(w>0.0) {
 811         wtot += w ;
 812         nstat++;
 813         for(i=0; i<3; i++ ) {
 814           clXYZ[i] += (w*xyzi[i]);
 815         }
 816       }
 817     }else AliError("Digit null");
 818   }//loop
 819   //  cout << " wtot " << wtot << endl;
 820   if (wtot > 0) {
 821     for(i=0; i<3; i++ ) {
 822       clXYZ[i] /= wtot;
 823     }
 824     locPos.SetX(clXYZ[0]);
 825     locPos.SetY(clXYZ[1]);
 826     locPos.SetZ(clXYZ[2]);
 827     return kTRUE;
 828   } else {
 829     return kFALSE;
 830   }
 831
 832 }
 833
 834 //_____________________________________________________________________________
 835 void AliEMCALRecPoint::GetDeffW0(const Double_t esum , Double_t &deff,  Double_t &w0)
 836 {
 837   //
 838   // Aug 31, 2001
 839   // Applied for simulation data with threshold 3 adc
 840   // Calculate efective distance (deff) and weigh parameter (w0)
 841   // for coordinate calculation; 0.5 GeV < esum <100 GeV.
 842   // Look to:  http://rhic.physics.wayne.edu/~pavlinov/ALICE/SHISHKEBAB/RES/CALIB/GEOMCORR/deffandW0VaEgamma_2.gif
 843   //
 844   Double_t e=0.0;
 845   const  Double_t kdp0=9.25147, kdp1=1.16700; // Hard coded now
 846   const  Double_t kwp0=4.83713, kwp1=-2.77970e-01, kwp2 = 4.41116;
 847
 848   // No extrapolation here
 849   e = esum<0.5?0.5:esum;
 850   e = e>100.?100.:e;
 851
 852   deff = kdp0 + kdp1*TMath::Log(e);
 853   w0   = kwp0 / (1. + TMath::Exp(kwp1*(e+kwp2)));
 854   //printf("<I> AliEMCALRecPoint::GetDeffW0 esum %5.2f : deff %5.2f : w0 %5.2f \n", esum, deff, w0);
 855 }
 856
 857 //______________________________________________________________________________
 858 void AliEMCALRecPoint::EvalCoreEnergy(Float_t logWeight, TClonesArray * digits)
 859 {
 860   // This function calculates energy in the core,
 861   // i.e. within a radius rad = fCoreEnergy around the center. Beyond this radius
 862   // in accordance with shower profile the energy deposition
 863   // should be less than 2%
 864   // Unfinished - Nov 15,2006
 865   // Distance is calculate in (phi,eta) units
 866
 867   AliEMCALDigit * digit = 0 ;
 868
 869   Int_t iDigit=0;
 870
 871   if (!fLocPos.Mag()) {
 872     EvalLocalPosition(logWeight, digits);
 873   }
 874
 875   Double_t phiPoint = fLocPos.Phi(), etaPoint = fLocPos.Eta();
 876   Double_t eta, phi, distance;
 877   for(iDigit=0; iDigit < fMulDigit; iDigit++) {
 878     digit = (AliEMCALDigit *) ( digits->At(fDigitsList[iDigit]) ) ;
 879
 880     eta = phi = 0.0;
 881     fGeomPtr->EtaPhiFromIndex(digit->GetId(),eta, phi) ;
 882     phi = phi * TMath::DegToRad();
 883
 884     distance = TMath::Sqrt((eta-etaPoint)*(eta-etaPoint)+(phi-phiPoint)*(phi-phiPoint));
 885     if(distance < fCoreRadius)
 886       fCoreEnergy += fEnergyList[iDigit] ;
 887   }
 888
 889 }
 890 //____________________________________________________________________________
 891 void  AliEMCALRecPoint::EvalElipsAxis(Float_t logWeight,TClonesArray * digits)
 892 {
 893   // Calculates the axis of the shower ellipsoid in eta and phi
 894   // in cell units
 895
 896   TString gn(fGeomPtr->GetName());
 897
 898   Double_t wtot = 0.;
 899   Double_t x    = 0.;
 900   Double_t z    = 0.;
 901   Double_t dxx  = 0.;
 902   Double_t dzz  = 0.;
 903   Double_t dxz  = 0.;
 904
 905   AliEMCALDigit * digit = 0;
 906
 907   Double_t etai =0, phii=0, w=0;
 908   int nSupMod=0, nModule=0, nIphi=0, nIeta=0;
 909   int iphi=0, ieta=0;
 910   for(Int_t iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
 911     digit = (AliEMCALDigit *) digits->At(fDigitsList[iDigit])  ;
 912     etai = phii = 0.;
 913     // Nov 15,2006 - use cell numbers as coordinates
 914     // Copied for shish-kebab geometry, ieta,iphi is cast as double as eta,phi
 915     // We can use the eta,phi(or coordinates) of cell
 916     nSupMod = nModule = nIphi = nIeta = iphi = ieta = 0;
 917
 918     fGeomPtr->GetCellIndex(digit->GetId(), nSupMod,nModule,nIphi,nIeta);
 919     fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nModule,nIphi,nIeta, iphi,ieta);
 920
 921     // In case of a shared cluster, index of SM in C side, columns start at 48 and ends at 48*2
 922     // C Side impair SM, nSupMod%2=1; A side pair SM, nSupMod%2=0
 923     if(fSharedCluster && nSupMod%2) ieta+=AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
 924
 925     etai=(Double_t)ieta;
 926     phii=(Double_t)iphi;
 927
 928     w = TMath::Max(0.,logWeight+TMath::Log(fEnergyList[iDigit]/fAmp ) ) ;
 929     // fAmp summed amplitude of digits, i.e. energy of recpoint
 930     // Gives smaller value of lambda than log weight
 931     // w = fEnergyList[iDigit] / fAmp; // Nov 16, 2006 - try just energy
 932
 933     dxx  += w * etai * etai ;
 934     x    += w * etai ;
 935     dzz  += w * phii * phii ;
 936     z    += w * phii ;
 937
 938     dxz  += w * etai * phii ;
 939
 940     wtot += w ;
 941   }
 942
 943   if ( wtot > 0 ) {
 944     dxx /= wtot ;
 945     x   /= wtot ;
 946     dxx -= x * x ;
 947     dzz /= wtot ;
 948     z   /= wtot ;
 949     dzz -= z * z ;
 950     dxz /= wtot ;
 951     dxz -= x * z ;
 952
 953     fLambda[0] =  0.5 * (dxx + dzz) + TMath::Sqrt( 0.25 * (dxx - dzz) * (dxx - dzz) + dxz * dxz )  ;
 954     if(fLambda[0] > 0)
 955       fLambda[0] = TMath::Sqrt(fLambda[0]) ;
 956     else
 957       fLambda[0] = 0;
 958
 959     fLambda[1] =  0.5 * (dxx + dzz) - TMath::Sqrt( 0.25 * (dxx - dzz) * (dxx - dzz) + dxz * dxz )  ;
 960
 961     if(fLambda[1] > 0) //To avoid exception if numerical errors lead to negative lambda.
 962       fLambda[1] = TMath::Sqrt(fLambda[1]) ;
 963     else
 964       fLambda[1]= 0. ;
 965   } else {
 966     fLambda[0]= 0. ;
 967     fLambda[1]= 0. ;
 968   }
 969
 970   //printf("AliEMCALRecPoint::EvalElipsAxis() lambdas  = %f,%f \n", fLambda[0],fLambda[1]) ;
 971
 972 }
 973
 974 //______________________________________________________________________________
 975 void  AliEMCALRecPoint::EvalPrimaries(TClonesArray * digits)
 976 {
 977   // Constructs the list of primary particles (tracks) which
 978   // have contributed to this RecPoint and calculate deposited energy
 979   // for each track
 980
 981   AliEMCALDigit * digit =0;
 982   Int_t * primArray = new Int_t[fMaxTrack] ;
 983   memset(primArray,-1,sizeof(Int_t)*fMaxTrack);
 984   Float_t * dEPrimArray = new Float_t[fMaxTrack] ;
 985   memset(dEPrimArray,-1,sizeof(Int_t)*fMaxTrack);
 986
 987   Int_t index ;
 988   for ( index = 0 ; index < GetDigitsMultiplicity() ; index++ ) { // all digits
 989     digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At( fDigitsList[index] )) ;
 990     if(!digit) {
 991       AliError("No Digit!!");
 992       continue;
 993     }
 994
 995     Int_t nprimaries = digit->GetNprimary() ;
 996     if ( nprimaries == 0 ) continue ;
 997     Int_t jndex ;
 998     for ( jndex = 0 ; jndex < nprimaries ; jndex++ ) { // all primaries in digit
 999       if ( fMulTrack > fMaxTrack ) {
1000         fMulTrack = fMaxTrack ;
1001         Error("EvalPrimaries", "increase fMaxTrack ")  ;
1002         break ;
1003       }
1004       Int_t newPrimary = digit->GetPrimary(jndex+1);
1005       Float_t dEPrimary = digit->GetDEPrimary(jndex+1);
1006       Int_t kndex ;
1007       Bool_t already = kFALSE ;
1008       for ( kndex = 0 ; kndex < fMulTrack ; kndex++ ) { //check if not already stored
1009         if ( newPrimary == primArray[kndex] ){
1010           already = kTRUE ;
1011           dEPrimArray[kndex] += dEPrimary;
1012           break ;
1013         }
1014       } // end of check
1015       if ( !already && (fMulTrack < fMaxTrack)) { // store it
1016         primArray[fMulTrack] = newPrimary ;
1017         dEPrimArray[fMulTrack] = dEPrimary ;
1018         fMulTrack++ ;
1019       } // store it
1020     } // all primaries in digit
1021   } // all digits
1022
1023   Int_t *sortIdx = new Int_t[fMulTrack];
1024   TMath::Sort(fMulTrack,dEPrimArray,sortIdx);
1025   for(index = 0; index < fMulTrack; index++) {
1026     fTracksList[index] = primArray[sortIdx[index]] ;
1027     fDETracksList[index] = dEPrimArray[sortIdx[index]] ;
1028   }
1029   delete [] sortIdx;
1030   delete [] primArray ;
1031   delete [] dEPrimArray ;
1032
1033 }
1034
1035 //______________________________________________________________________________
1036 void  AliEMCALRecPoint::EvalParents(TClonesArray * digits)
1037 {
1038   // Constructs the list of parent particles (tracks) which have contributed to this RecPoint
1039
1040   AliEMCALDigit * digit=0 ;
1041   Int_t * parentArray = new Int_t[fMaxTrack] ;
1042   memset(parentArray,-1,sizeof(Int_t)*fMaxTrack);
1043   Float_t * dEParentArray = new Float_t[fMaxTrack] ;
1044   memset(dEParentArray,-1,sizeof(Int_t)*fMaxTrack);
1045
1046   Int_t index ;
1047   for ( index = 0 ; index < GetDigitsMultiplicity() ; index++ ) { // all digits
1048     if (fDigitsList[index] >= digits->GetEntries() || fDigitsList[index] < 0)
1049       AliError(Form("Trying to get invalid digit %d (idx in WriteRecPoint %d)",fDigitsList[index],index));
1050     digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At( fDigitsList[index] )) ;
1051     if(!digit) {
1052       AliError("No Digit!!");
1053       continue;
1054     }
1055
1056     Int_t nparents = digit->GetNiparent() ;
1057     if ( nparents == 0 ) continue ;
1058
1059     Int_t jndex ;
1060     for ( jndex = 0 ; jndex < nparents ; jndex++ ) { // all primaries in digit
1061       if ( fMulParent > fMaxParent ) {
1062         fMulTrack = - 1 ;
1063         Error("EvalParents", "increase fMaxParent")  ;
1064         break ;
1065       }
1066       Int_t newParent = digit->GetIparent(jndex+1) ;
1067       Float_t newdEParent = digit->GetDEParent(jndex+1) ;
1068       Int_t kndex ;
1069       Bool_t already = kFALSE ;
1070       for ( kndex = 0 ; kndex < fMulParent ; kndex++ ) { //check if not already stored
1071         if ( newParent == parentArray[kndex] ){
1072           dEParentArray[kndex] += newdEParent;
1073           already = kTRUE ;
1074           break ;
1075         }
1076       } // end of check
1077       if ( !already && (fMulParent < fMaxParent)) { // store it
1078         parentArray[fMulParent] = newParent ;
1079         dEParentArray[fMulParent] = newdEParent ;
1080         fMulParent++ ;
1081       } // store it
1082     } // all parents in digit
1083   } // all digits
1084
1085   if (fMulParent>0) {
1086     Int_t *sortIdx = new Int_t[fMulParent];
1087     TMath::Sort(fMulParent,dEParentArray,sortIdx);
1088     for(index = 0; index < fMulParent; index++) {
1089       fParentsList[index] = parentArray[sortIdx[index]] ;
1090       fDEParentsList[index] = dEParentArray[sortIdx[index]] ;
1091     }
1092     delete [] sortIdx;
1093   }
1094
1095   delete [] parentArray;
1096   delete [] dEParentArray;
1097 }
1098
1099 //____________________________________________________________________________
1100 void AliEMCALRecPoint::GetLocalPosition(TVector3 & lpos) const
1101 {
1102   // returns the position of the cluster in the local reference system
1103   // of the sub-detector
1104
1105   lpos = fLocPos;
1106 }
1107
1108 //____________________________________________________________________________
1109 void AliEMCALRecPoint::GetGlobalPosition(TVector3 & gpos) const
1110 {
1111   // returns the position of the cluster in the global reference system of ALICE
1112   // These are now the Cartesian X, Y and Z
1113   //  cout<<" geom "<<geom<<endl;
1114   // fGeomPtr->GetGlobal(fLocPos, gpos, fSuperModuleNumber);
1115   gpos = fGlobPos;
1116
1117 }
1118
1119 //____________________________________________________________________________
1120 //void AliEMCALRecPoint::GetGlobalPosition(TVector3 & gpos, TMatrixF & gmat) const
1121 //{
1122 //  // returns the position of the cluster in the global reference system of ALICE
1123 //  // These are now the Cartesian X, Y and Z
1124 //  //  cout<<" geom "<<geom<<endl;
1125 //
1126 //  //To be implemented
1127 //  fGeomPtr->GetGlobalEMCAL(this, gpos, gmat);
1128 //
1129 //}
1130
1131 //_____________________________________________________________________________
1132 void AliEMCALRecPoint::EvalLocal2TrackingCSTransform()
1133 {
1134   //Evaluates local to "tracking" c.s. transformation (B.P.).
1135   //All evaluations should be completed before calling for this
1136   //function.
1137   //See ALICE PPR Chapter 5 p.18 for "tracking" c.s. definition,
1138   //or just ask Jouri Belikov. :)
1139
1140   SetVolumeId(AliGeomManager::LayerToVolUID(AliGeomManager::kEMCAL,GetSuperModuleNumber()));
1141
1142   const TGeoHMatrix* tr2loc = GetTracking2LocalMatrix();
1143   if(!tr2loc) AliFatal(Form("No Tracking2LocalMatrix found."));
1144
1145   Double_t lxyz[3] = {fLocPos.X(),fLocPos.Y(),fLocPos.Z()};
1146   Double_t txyz[3] = {0,0,0};
1147
1148   tr2loc->MasterToLocal(lxyz,txyz);
1149   SetX(txyz[0]); SetY(txyz[1]); SetZ(txyz[2]);
1150
1151   if(AliLog::GetGlobalDebugLevel()>0) {
1152     TVector3 gpos; //TMatrixF gmat;
1153     //GetGlobalPosition(gpos,gmat); //Not doing anythin special, replace by next line.
1154     fGeomPtr->GetGlobal(fLocPos, gpos, GetSuperModuleNumber());
1155
1156     Float_t gxyz[3];
1157     GetGlobalXYZ(gxyz);
1158     AliInfo(Form("lCS-->(%.3f,%.3f,%.3f), tCS-->(%.3f,%.3f,%.3f), gCS-->(%.3f,%.3f,%.3f),  gCScalc-\
1159 ->(%.3f,%.3f,%.3f), supermodule %d",
1160                  fLocPos.X(),fLocPos.Y(),fLocPos.Z(),
1161                  GetX(),GetY(),GetZ(),
1162                  gpos.X(),gpos.Y(),gpos.Z(),
1163                  gxyz[0],gxyz[1],gxyz[2],GetSuperModuleNumber()));
1164   }
1165
1166 }
1167
1168 //____________________________________________________________________________
1169 Float_t AliEMCALRecPoint::GetMaximalEnergy(void) const
1170 {
1171   // Finds the maximum energy in the cluster
1172
1173   Float_t menergy = 0. ;
1174
1175   Int_t iDigit;
1176   for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
1177
1178     if(fEnergyList[iDigit] > menergy)
1179       menergy = fEnergyList[iDigit] ;
1180   }
1181   return menergy ;
1182 }
1183
1184 //____________________________________________________________________________
1185 Int_t AliEMCALRecPoint::GetMaximalEnergyIndex(void) const
1186 {
1187   // Finds the maximum energy in the cluster
1188
1189   Float_t menergy = 0. ;
1190   Int_t mid       = 0  ;
1191   Int_t iDigit;
1192
1193   for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
1194
1195     if(fEnergyList[iDigit] > menergy){
1196       menergy = fEnergyList[iDigit] ;
1197       mid     = iDigit ;
1198     }
1199   }//loop on cluster digits
1200
1201   return mid ;
1202 }
1203
1204
1205 //____________________________________________________________________________
1206 Int_t AliEMCALRecPoint::GetMultiplicityAtLevel(Float_t H) const
1207 {
1208   // Calculates the multiplicity of digits with energy larger than H*energy
1209
1210   Int_t multipl   = 0 ;
1211   Int_t iDigit ;
1212   for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
1213
1214     if(fEnergyList[iDigit] > H * fAmp)
1215       multipl++ ;
1216   }
1217   return multipl ;
1218 }
1219
1220 //____________________________________________________________________________
1221 Int_t  AliEMCALRecPoint::GetNumberOfLocalMax(AliEMCALDigit **  maxAt, Float_t * maxAtEnergy,
1222                                                Float_t locMaxCut,TClonesArray * digits) const
1223 {
1224   // Calculates the number of local maxima in the cluster using fLocalMaxCut as the minimum
1225   // energy difference between two local maxima
1226
1227   AliEMCALDigit * digit  = 0;
1228   AliEMCALDigit * digitN = 0;
1229
1230   Int_t iDigitN = 0 ;
1231   Int_t iDigit  = 0 ;
1232
1233   for(iDigit = 0; iDigit < fMulDigit; iDigit++)
1234     maxAt[iDigit] = (AliEMCALDigit*) digits->At(fDigitsList[iDigit])  ;
1235
1236   for(iDigit = 0 ; iDigit < fMulDigit; iDigit++) {
1237     if(maxAt[iDigit]) {
1238       digit = maxAt[iDigit] ;
1239
1240       for(iDigitN = 0; iDigitN < fMulDigit; iDigitN++) {
1241         if(iDigitN == iDigit) continue;//the same digit
1242         digitN = (AliEMCALDigit *) digits->At(fDigitsList[iDigitN]) ;
1243
1244         if ( AreNeighbours(digit, digitN) ) {
1245           if (fEnergyList[iDigit] > fEnergyList[iDigitN] ) {
1246             maxAt[iDigitN] = 0 ;
1247             // but may be digit too is not local max ?
1248             if(fEnergyList[iDigit] < fEnergyList[iDigitN] + locMaxCut)
1249               maxAt[iDigit] = 0 ;
1250           } else {
1251             maxAt[iDigit] = 0 ;
1252             // but may be digitN too is not local max ?
1253             if(fEnergyList[iDigit] > fEnergyList[iDigitN] - locMaxCut)
1254               maxAt[iDigitN] = 0 ;
1255           }
1256         } // if Areneighbours
1257       } // while digitN
1258     } // slot not empty
1259   } // while digit
1260
1261   iDigitN = 0 ;
1262   for(iDigit = 0; iDigit < fMulDigit; iDigit++) {
1263     if(maxAt[iDigit] ){
1264       maxAt[iDigitN] = maxAt[iDigit] ;
1265       maxAtEnergy[iDigitN] = fEnergyList[iDigit] ;
1266       iDigitN++ ;
1267     }
1268   }
1269
1270   return iDigitN ;
1271 }
1272
1273 //____________________________________________________________________________
1274 Int_t AliEMCALRecPoint::GetPrimaryIndex() const
1275 {
1276   // Get the primary track index in TreeK which deposits the most energy
1277   // in Digits which forms RecPoint.
1278
1279   if (fMulTrack)
1280     return fTracksList[0];
1281   return -12345;
1282 }
1283
1284 //____________________________________________________________________________
1285 void AliEMCALRecPoint::EvalTime(TClonesArray * digits){
1286   // time is set to the time of the digit with the maximum energy
1287
1288   Float_t maxE  = 0;
1289   Int_t   maxAt = 0;
1290   for(Int_t idig=0; idig < fMulDigit; idig++){
1291     if(fEnergyList[idig] > maxE){
1292       maxE  = fEnergyList[idig] ;
1293       maxAt = idig;
1294     }
1295   }
1296   fTime = ((AliEMCALDigit*) digits->At(fDigitsList[maxAt]))->GetTime() ;
1297
1298 }
1299
1300 //______________________________________________________________________________
1301 void AliEMCALRecPoint::Paint(Option_t *)
1302 {
1303   // Paint this ALiRecPoint as a TMarker  with its current attributes
1304
1305   TVector3 pos(0.,0.,0.)  ;
1306   GetLocalPosition(pos)   ;
1307   Coord_t x = pos.X()     ;
1308   Coord_t y = pos.Z()     ;
1309   Color_t markercolor = 1 ;
1310   Size_t  markersize  = 1.;
1311   Style_t markerstyle = 5 ;
1312
1313   if (!gPad->IsBatch()) {
1314     gVirtualX->SetMarkerColor(markercolor) ;
1315     gVirtualX->SetMarkerSize (markersize)  ;
1316     gVirtualX->SetMarkerStyle(markerstyle) ;
1317   }
1318   gPad->SetAttMarkerPS(markercolor,markerstyle,markersize) ;
1319   gPad->PaintPolyMarker(1,&x,&y,"") ;
1320 }
1321
1322 //_____________________________________________________________________
1323 Double_t AliEMCALRecPoint::TmaxInCm(const Double_t e , const Int_t key)
1324 {
1325   // e energy in GeV)
1326   // key  =  0(gamma, default)
1327   //     !=  0(electron)
1328   const Double_t ca   = 4.82;  // shower max parameter - first guess; ca=TMath::Log(1000./8.07)
1329   Double_t tmax = 0.;    // position of electromagnetic shower max in cm
1330
1331   Double_t x0   = 1.31;  // radiation lenght (cm)
1332   //If old geometry in use
1333   if(!((fGeomPtr->GetEMCGeometry()->GetGeoName()).Contains("V1"))) x0 = 1.28;
1334
1335   if(e>0.1) {
1336     tmax = TMath::Log(e) + ca;
1337     if      (key==0) tmax += 0.5;
1338     else             tmax -= 0.5;
1339     tmax *= x0; // convert to cm
1340   }
1341   return tmax;
1342 }
1343
1344 //______________________________________________________________________________
1345 Float_t AliEMCALRecPoint::EtaToTheta(Float_t arg) const
1346 {
1347   //Converts Theta (Radians) to Eta(Radians)
1348   return (2.*TMath::ATan(TMath::Exp(-arg)));
1349 }
1350
1351 //______________________________________________________________________________
1352 Float_t AliEMCALRecPoint::ThetaToEta(Float_t arg) const
1353 {
1354   //Converts Eta (Radians) to Theta(Radians)
1355   return (-1 * TMath::Log(TMath::Tan(0.5 * arg)));
1356 }
1357
1358 //____________________________________________________________________________
1359 void AliEMCALRecPoint::Print(Option_t *opt) const
1360 {
1361   // Print the list of digits belonging to the cluster
1362   if(strlen(opt)==0) return;
1363   TString message ;
1364   message  = "AliEMCALRecPoint:\n" ;
1365   message +=  " digits # = " ;
1366   AliInfo(message.Data()) ;
1367
1368   Int_t iDigit;
1369   for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++)
1370     printf(" %d ", fDigitsList[iDigit] ) ;
1371   printf("\n");
1372
1373   AliInfo(" Energies = ") ;
1374   for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++)
1375     printf(" %f ", fEnergyList[iDigit] ) ;
1376   printf("\n");
1377
1378   AliInfo("\n Abs Ids = ") ;
1379   for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++)
1380     printf(" %i ", fAbsIdList[iDigit] ) ;
1381   printf("\n");
1382
1383   AliInfo(" Primaries  ") ;
1384   for(iDigit = 0;iDigit < fMulTrack; iDigit++)
1385     printf(" %d ", fTracksList[iDigit]) ;
1386
1387   printf("\n Local x %6.2f y %7.2f z %7.1f \n", fLocPos[0], fLocPos[1], fLocPos[2]);
1388
1389   message  = "       ClusterType     = %d" ;
1390   message += "       Multiplicity    = %d" ;
1391   message += "       Cluster Energy  = %f" ;
1392   message += "       Core energy     = %f" ;
1393   message += "       Core radius     = %f" ;
1394   message += "       Number of primaries %d" ;
1395   message += "       Stored at position %d" ;
1396   AliInfo(Form(message.Data(), fClusterType, fMulDigit, fAmp, fCoreEnergy, fCoreRadius, fMulTrack, GetIndexInList()) ) ;
1397 }
1398
1399 //___________________________________________________________
1400 Double_t  AliEMCALRecPoint::GetPointEnergy() const
1401 {
1402   //Returns energy ....
1403   Double_t e=0.0;
1404   for(int ic=0; ic<GetMultiplicity(); ic++) e += double(fEnergyList[ic]);
1405   return e;
1406 }