EMCAL/AliEMCALRecPoint.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15 /* $Id$ */
  16 //_________________________________________________________________________
  17 //  Reconstructed Points for the EMCAL
  18 //  A RecPoint is a cluster of digits
  19 //
  20 //
  21 //*-- Author: Yves Schutz (SUBATECH)
  22 //*-- Author: Dmitri Peressounko (RRC KI & SUBATECH)
  23 //*-- Author: Heather Gray (LBL) merged AliEMCALRecPoint and AliEMCALTowerRecPoint 02/04
  24
  25 // --- ROOT system ---
  26 #include "TPad.h"
  27 #include "TGraph.h"
  28 #include "TPaveText.h"
  29 #include "TClonesArray.h"
  30 #include "TMath.h"
  31 #include "TGeoMatrix.h"
  32 #include "TGeoManager.h"
  33 #include "TGeoPhysicalNode.h"
  34 #include "TRandom.h"
  35
  36 // --- Standard library ---
  37 #include <Riostream.h>
  38
  39 // --- AliRoot header files ---
  40 //#include "AliGenerator.h"
  41 class AliGenerator;
  42 class AliEMCAL;
  43 #include "AliLog.h"
  44 #include "AliGeomManager.h"
  45 #include "AliEMCALGeometry.h"
  46 #include "AliEMCALHit.h"
  47 #include "AliEMCALDigit.h"
  48 #include "AliEMCALRecPoint.h"
  49 #include "AliCaloCalibPedestal.h"
  50 #include "AliEMCALGeoParams.h"
  51
  52 ClassImp(AliEMCALRecPoint)
  53
  54 //____________________________________________________________________________
  55 AliEMCALRecPoint::AliEMCALRecPoint()
  56   : AliCluster(), fGeomPtr(0),
  57     fAmp(0), fIndexInList(-1), //to be set when the point is already stored
  58     fGlobPos(0,0,0),fLocPos(0,0,0),
  59     fMaxDigit(100), fMulDigit(0), fMaxTrack(200),
  60     fMulTrack(0), fDigitsList(0), fTracksList(0),
  61     fClusterType(-1), fCoreEnergy(0), fDispersion(0),
  62     fEnergyList(0), fTimeList(0), fAbsIdList(0),
  63     fTime(0.), fNExMax(0), fCoreRadius(10),  //HG check this
  64     fDETracksList(0), fMulParent(0), fMaxParent(0),
  65     fParentsList(0), fDEParentsList(0), fSuperModuleNumber(0),
  66     fDigitIndMax(-1), fDistToBadTower(-1), fSharedCluster(kFALSE)
  67 {
  68   // ctor
  69   fGeomPtr = AliEMCALGeometry::GetInstance();
  70
  71   fLambda[0] = 0;
  72   fLambda[1] = 0;
  73
  74 }
  75
  76 //____________________________________________________________________________
  77 AliEMCALRecPoint::AliEMCALRecPoint(const char *)
  78   : AliCluster(), fGeomPtr(0),
  79     fAmp(0), fIndexInList(-1), //to be set when the point is already stored
  80     fGlobPos(0,0,0), fLocPos(0,0,0),
  81     fMaxDigit(100), fMulDigit(0), fMaxTrack(1000), fMulTrack(0),
  82     fDigitsList(new Int_t[fMaxDigit]), fTracksList(new Int_t[fMaxTrack]),
  83     fClusterType(-1), fCoreEnergy(0), fDispersion(0),
  84     fEnergyList(new Float_t[fMaxDigit]), fTimeList(new Float_t[fMaxDigit]),
  85     fAbsIdList(new Int_t[fMaxDigit]), fTime(-1.), fNExMax(0), fCoreRadius(10),
  86     fDETracksList(new Float_t[fMaxTrack]), fMulParent(0), fMaxParent(1000),
  87     fParentsList(new Int_t[fMaxParent]), fDEParentsList(new Float_t[fMaxParent]),
  88     fSuperModuleNumber(0), fDigitIndMax(-1), fDistToBadTower(-1),fSharedCluster(kFALSE)
  89 {
  90   // ctor
  91   for (Int_t i = 0; i < fMaxTrack; i++)
  92     fDETracksList[i] = 0;
  93   for (Int_t i = 0; i < fMaxParent; i++) {
  94     fParentsList[i] = -1;
  95     fDEParentsList[i] = 0;
  96   }
  97
  98   fGeomPtr = AliEMCALGeometry::GetInstance();
  99   fLambda[0] = 0;
 100   fLambda[1] = 0;
 101 }
 102
 103 //____________________________________________________________________________
 104 AliEMCALRecPoint::AliEMCALRecPoint(const AliEMCALRecPoint & rp)
 105   : AliCluster(rp), fGeomPtr(rp.fGeomPtr),
 106     fAmp(rp.fAmp), fIndexInList(rp.fIndexInList),
 107     fGlobPos(rp.fGlobPos),fLocPos(rp.fLocPos),
 108     fMaxDigit(rp.fMaxDigit), fMulDigit(rp.fMulDigit),
 109     fMaxTrack(rp.fMaxTrack), fMulTrack(rp.fMaxTrack),
 110     fDigitsList(new Int_t[rp.fMaxDigit]), fTracksList(new Int_t[rp.fMaxTrack]),
 111     fClusterType(rp.fClusterType), fCoreEnergy(rp.fCoreEnergy),
 112     fDispersion(rp.fDispersion),
 113     fEnergyList(new Float_t[rp.fMaxDigit]), fTimeList(new Float_t[rp.fMaxDigit]),
 114     fAbsIdList(new Int_t[rp.fMaxDigit]), fTime(rp.fTime), fNExMax(rp.fNExMax),fCoreRadius(rp.fCoreRadius),
 115     fDETracksList(new Float_t[rp.fMaxTrack]), fMulParent(rp.fMulParent),
 116     fMaxParent(rp.fMaxParent), fParentsList(new Int_t[rp.fMaxParent]),
 117     fDEParentsList(new Float_t[rp.fMaxParent]),
 118     fSuperModuleNumber(rp.fSuperModuleNumber), fDigitIndMax(rp.fDigitIndMax),
 119     fDistToBadTower(rp.fDistToBadTower), fSharedCluster(rp.fSharedCluster)
 120 {
 121   //copy ctor
 122   fLambda[0] = rp.fLambda[0];
 123   fLambda[1] = rp.fLambda[1];
 124
 125   for(Int_t i = 0; i < rp.fMulDigit; i++) {
 126     fEnergyList[i] = rp.fEnergyList[i];
 127     fTimeList[i] = rp.fTimeList[i];
 128     fAbsIdList[i] = rp.fAbsIdList[i];
 129   }
 130
 131   for(Int_t i = 0; i < rp.fMulTrack; i++) fDETracksList[i] = rp.fDETracksList[i];
 132
 133   for(Int_t i = 0; i < rp.fMulParent; i++) {
 134     fParentsList[i] = rp.fParentsList[i];
 135     fDEParentsList[i] = rp.fDEParentsList[i];
 136   }
 137
 138 }
 139 //____________________________________________________________________________
 140 AliEMCALRecPoint::~AliEMCALRecPoint()
 141 {
 142   // dtor
 143   if ( fEnergyList )
 144     delete[] fEnergyList ;
 145   if ( fTimeList )
 146     delete[] fTimeList ;
 147   if ( fAbsIdList )
 148     delete[] fAbsIdList ;
 149    if ( fDETracksList)
 150     delete[] fDETracksList;
 151    if ( fParentsList)
 152     delete[] fParentsList;
 153    if ( fDEParentsList)
 154     delete[] fDEParentsList;
 155
 156    delete [] fDigitsList ;
 157    delete [] fTracksList ;
 158 }
 159
 160 //____________________________________________________________________________
 161 AliEMCALRecPoint& AliEMCALRecPoint::operator= (const AliEMCALRecPoint &rp)
 162 {
 163   // assignment operator
 164
 165   if(&rp == this) return *this;
 166
 167   fGeomPtr = rp.fGeomPtr;
 168   fAmp = rp.fAmp;
 169   fIndexInList = rp.fIndexInList;
 170   fGlobPos = rp.fGlobPos;
 171   fLocPos  = rp.fLocPos;
 172   fMaxDigit = rp.fMaxDigit;
 173   fMulDigit = rp.fMulDigit;
 174   fMaxTrack = rp.fMaxTrack;
 175   fMulTrack = rp.fMaxTrack;
 176   for(Int_t i = 0; i<fMaxDigit; i++) fDigitsList[i] = rp.fDigitsList[i];
 177   for(Int_t i = 0; i<fMaxTrack; i++) fTracksList[i] = rp.fTracksList[i];
 178   fClusterType = rp.fClusterType;
 179   fCoreEnergy  = rp.fCoreEnergy;
 180   fDispersion  = rp.fDispersion;
 181   for(Int_t i = 0; i<fMaxDigit; i++) {
 182     fEnergyList[i] = rp.fEnergyList[i];
 183     fTimeList[i]   = rp.fTimeList[i];
 184     fAbsIdList[i]  = rp.fAbsIdList[i];
 185   }
 186   fTime = rp.fTime;
 187   fNExMax = rp.fNExMax;
 188   fCoreRadius = rp.fCoreRadius;
 189   for(Int_t i = 0; i < fMaxTrack; i++) fDETracksList[i] = rp.fDETracksList[i];
 190   fMulParent = rp.fMulParent;
 191   fMaxParent = rp.fMaxParent;
 192   for(Int_t i = 0; i < fMaxParent; i++) {
 193     fParentsList[i] = rp.fParentsList[i];
 194     fDEParentsList[i] = rp.fDEParentsList[i];
 195   }
 196   fSuperModuleNumber = rp.fSuperModuleNumber;
 197   fDigitIndMax = rp.fDigitIndMax;
 198
 199   fLambda[0] = rp.fLambda[0];
 200   fLambda[1] = rp.fLambda[1];
 201
 202   fDistToBadTower = rp.fDistToBadTower;
 203   fSharedCluster  = rp.fSharedCluster;
 204
 205   return *this;
 206
 207 }
 208
 209 //____________________________________________________________________________
 210 void AliEMCALRecPoint::AddDigit(AliEMCALDigit & digit, Float_t energy, Bool_t shared)
 211 {
 212   // Adds a digit to the RecPoint
 213   // and accumulates the total amplitude and the multiplicity
 214
 215   if(fEnergyList == 0)
 216     fEnergyList =  new Float_t[fMaxDigit];
 217   if(fTimeList == 0)
 218     fTimeList =  new Float_t[fMaxDigit];
 219   if(fAbsIdList == 0) {
 220     fAbsIdList =  new Int_t[fMaxDigit];
 221   }
 222
 223   if ( fMulDigit >= fMaxDigit ) { // increase the size of the lists
 224     fMaxDigit*=2 ;
 225     Int_t   * tempo   = new Int_t[fMaxDigit];
 226     Float_t * tempoE  = new Float_t[fMaxDigit];
 227     Float_t * tempoT  = new Float_t[fMaxDigit];
 228     Int_t   * tempoId = new Int_t[fMaxDigit];
 229
 230     Int_t index ;
 231     for ( index = 0 ; index < fMulDigit ; index++ ){
 232       tempo[index]   = fDigitsList[index] ;
 233       tempoE[index]  = fEnergyList[index] ;
 234       tempoT[index]  = fTimeList[index] ;
 235       tempoId[index] = fAbsIdList[index] ;
 236     }
 237
 238     delete [] fDigitsList ;
 239     delete [] fEnergyList ;
 240     delete [] fTimeList ;
 241     delete [] fAbsIdList ;
 242
 243     fDigitsList = tempo;
 244     fEnergyList = tempoE;
 245     fTimeList   = tempoT;
 246     fAbsIdList  = tempoId;
 247   } // if
 248
 249   fDigitsList[fMulDigit]   = digit.GetIndexInList()  ;
 250   fEnergyList[fMulDigit]   = energy ;
 251   fTimeList[fMulDigit]     = digit.GetTimeR() ;
 252   fAbsIdList[fMulDigit]    = digit.GetId();
 253   fMulDigit++ ;
 254   fAmp += energy ;
 255
 256   if(shared) fSharedCluster = kTRUE;
 257
 258   //GCB, May-2010, setting moved to EvalAll method, set the super module number for the largest energy digit position.
 259   //JLK 10-Oct-2007 this hasn't been filled before because it was in
 260   //the wrong place in previous versions.
 261   //Now we evaluate it only if the supermodulenumber for this recpoint
 262   //has not yet been set (or is the 0th one)
 263   //if(fSuperModuleNumber == 0)
 264     //fSuperModuleNumber = fGeomPtr->GetSuperModuleNumber(digit.GetId());
 265
 266 }
 267 //____________________________________________________________________________
 268 Bool_t AliEMCALRecPoint::AreNeighbours(AliEMCALDigit * digit1, AliEMCALDigit * digit2 ) const
 269 {
 270   // Tells if (true) or not (false) two digits are neighbours
 271   // A neighbour is defined as being two digits which share a corner
 272   // ONLY USED IN CASE OF UNFOLDING
 273
 274   Bool_t areNeighbours = kFALSE ;
 275   Int_t nSupMod=0, nModule=0, nIphi=0, nIeta=0;
 276   Int_t nSupMod1=0, nModule1=0, nIphi1=0, nIeta1=0;
 277   Int_t relid1[2] , relid2[2] ; // ieta, iphi
 278   Int_t rowdiff=0, coldiff=0;
 279
 280   areNeighbours = kFALSE ;
 281
 282   fGeomPtr->GetCellIndex(digit1->GetId(), nSupMod,nModule,nIphi,nIeta);
 283   fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nModule,nIphi,nIeta, relid1[0],relid1[1]);
 284
 285   fGeomPtr->GetCellIndex(digit2->GetId(), nSupMod1,nModule1,nIphi1,nIeta1);
 286   fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod1,nModule1,nIphi1,nIeta1, relid2[0],relid2[1]);
 287
 288   // In case of a shared cluster, index of SM in C side, columns start at 48 and ends at 48*2-1
 289   // C Side impair SM, nSupMod%2=1; A side pair SM nSupMod%2=0
 290   if(fSharedCluster){
 291     if(nSupMod1%2) relid1[1]+=AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
 292     else           relid2[1]+=AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
 293   }
 294
 295   rowdiff = TMath::Abs( relid1[0] - relid2[0] ) ;
 296   coldiff = TMath::Abs( relid1[1] - relid2[1] ) ;
 297
 298   if (( coldiff <= 1 )  && ( rowdiff <= 1 ) && (coldiff + rowdiff > 0))
 299   areNeighbours = kTRUE ;
 300
 301   return areNeighbours;
 302 }
 303
 304 //____________________________________________________________________________
 305 Int_t AliEMCALRecPoint::Compare(const TObject * obj) const
 306 {
 307   // Compares two RecPoints according to their position in the EMCAL modules
 308
 309   Float_t delta = 1 ; //Width of "Sorting row".
 310
 311   Int_t rv = 2 ;
 312
 313   AliEMCALRecPoint * clu = (AliEMCALRecPoint *)obj ;
 314
 315   TVector3 locpos1;
 316   GetLocalPosition(locpos1);
 317   TVector3 locpos2;
 318   clu->GetLocalPosition(locpos2);
 319
 320   Int_t rowdif = (Int_t)(TMath::Ceil(locpos1.X()/delta)-TMath::Ceil(locpos2.X()/delta)) ;
 321   if (rowdif> 0)
 322     rv = 1 ;
 323   else if(rowdif < 0)
 324     rv = -1 ;
 325   else if(locpos1.Y()>locpos2.Y())
 326     rv = -1 ;
 327   else
 328     rv = 1 ;
 329
 330   return rv ;
 331 }
 332
 333 // GCB, May-2010, Method not used, just comment it but remove?
 334 //____________________________________________________________________________
 335 //Int_t AliEMCALRecPoint::DistancetoPrimitive(Int_t px, Int_t py)
 336 //{
 337 //  // Compute distance from point px,py to  a AliEMCALRecPoint considered as a Tmarker
 338 //  // Compute the closest distance of approach from point px,py to this marker.
 339 //  // The distance is computed in pixels units.
 340 //  // HG Still need to update -> Not sure what this should achieve
 341 //
 342 //  TVector3 pos(0.,0.,0.) ;
 343 //  GetLocalPosition(pos) ;
 344 //  Float_t x =  pos.X() ;
 345 //  Float_t y =  pos.Y() ;
 346 //  const Int_t kMaxDiff = 10;
 347 //  Int_t pxm  = gPad->XtoAbsPixel(x);
 348 //  Int_t pym  = gPad->YtoAbsPixel(y);
 349 //  Int_t dist = (px-pxm)*(px-pxm) + (py-pym)*(py-pym);
 350 //
 351 //  if (dist > kMaxDiff) return 9999;
 352 //  return dist;
 353 //}
 354
 355 //___________________________________________________________________________
 356  void AliEMCALRecPoint::Draw(Option_t *option)
 357  {
 358    // Draw this AliEMCALRecPoint with its current attributes
 359
 360    AppendPad(option);
 361  }
 362
 363 // GCB, May-2010, Method not used, just comment it but remove?
 364 //______________________________________________________________________________
 365 //void AliEMCALRecPoint::ExecuteEvent(Int_t /*event*/, Int_t, Int_t)
 366 //{
 367 //  // Execute action corresponding to one event
 368 //  // This member function is called when a AliEMCALRecPoint is clicked with the locator
 369 //  //
 370 //  // If Left button is clicked on AliEMCALRecPoint, the digits are switched on
 371 //  // and switched off when the mouse button is released.
 372 //
 373 //  //  static Int_t pxold, pyold;
 374 //
 375 //  /*  static TGraph *  digitgraph = 0 ;
 376 //  static TPaveText* clustertext = 0 ;
 377 //
 378 //  if (!gPad->IsEditable()) return;
 379 //
 380 //  switch (event) {
 381 //
 382 //
 383 //  case kButton1Down:{
 384 //    AliEMCALDigit * digit ;
 385 //
 386 //    Int_t iDigit;
 387 //    Int_t relid[2] ;
 388 //
 389 //    const Int_t kMulDigit=AliEMCALRecPoint::GetDigitsMultiplicity() ;
 390 //    Float_t * xi = new Float_t [kMulDigit] ;
 391 //    Float_t * zi = new Float_t [kMulDigit] ;
 392 //
 393 //    for(iDigit = 0; iDigit < kMulDigit; iDigit++) {
 394 //      Fatal("AliEMCALRecPoint::ExecuteEvent", " -> Something wrong with the code");
 395 //      digit = 0 ; //dynamic_cast<AliEMCALDigit *>((fDigitsList)[iDigit]);
 396 //      fGeomPtr->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
 397 //      fGeomPtr->PosInAlice(relid, xi[iDigit], zi[iDigit]) ;
 398 //    }
 399 //
 400 //    if (!digitgraph) {
 401 //      digitgraph = new TGraph(fMulDigit,xi,zi);
 402 //      digitgraph-> SetMarkerStyle(5) ;
 403 //      digitgraph-> SetMarkerSize(1.) ;
 404 //      digitgraph-> SetMarkerColor(1) ;
 405 //      digitgraph-> Draw("P") ;
 406 //    }
 407 //    if (!clustertext) {
 408 //
 409 //      TVector3 pos(0.,0.,0.) ;
 410 //      GetLocalPosition(pos) ;
 411 //      clustertext = new TPaveText(pos.X()-10,pos.Z()+10,pos.X()+50,pos.Z()+35,"") ;
 412 //      Text_t  line1[40] ;
 413 //      Text_t  line2[40] ;
 414 //      sprintf(line1,"Energy=%1.2f GeV",GetEnergy()) ;
 415 //      sprintf(line2,"%d Digits",GetDigitsMultiplicity()) ;
 416 //      clustertext ->AddText(line1) ;
 417 //      clustertext ->AddText(line2) ;
 418 //      clustertext ->Draw("");
 419 //    }
 420 //    gPad->Update() ;
 421 //    Print("") ;
 422 //    delete[] xi ;
 423 //    delete[] zi ;
 424 //   }
 425 //
 426 //break;
 427 //
 428 //  case kButton1Up:
 429 //    if (digitgraph) {
 430 //      delete digitgraph  ;
 431 //      digitgraph = 0 ;
 432 //    }
 433 //    if (clustertext) {
 434 //      delete clustertext ;
 435 //      clustertext = 0 ;
 436 //    }
 437 //
 438 //    break;
 439 //
 440 //    }*/
 441 //}
 442
 443 //____________________________________________________________________________
 444 void AliEMCALRecPoint::EvalAll(Float_t logWeight,TClonesArray * digits, const Bool_t justClusters)
 445 {
 446   // Evaluates cluster parameters
 447
 448   // First calculate the index of digit with maximum amplitude and get
 449   // the supermodule number where it sits.
 450
 451   fDigitIndMax       = GetMaximalEnergyIndex();
 452   fSuperModuleNumber = fGeomPtr->GetSuperModuleNumber(GetAbsIdMaxDigit());
 453
 454   //Evaluate global and local position
 455   EvalGlobalPosition(logWeight, digits) ;
 456   EvalLocalPosition(logWeight, digits) ;
 457
 458   //Evaluate shower parameters
 459   EvalElipsAxis(logWeight, digits) ;
 460   EvalDispersion(logWeight, digits) ;
 461
 462   //EvalCoreEnergy(logWeight, digits);
 463   EvalTime(digits) ;
 464   EvalPrimaries(digits) ;
 465   EvalParents(digits);
 466
 467   //Called last because it sets the global position of the cluster?
 468   //Do not call it when recalculating clusters out of standard reconstruction
 469   if(!justClusters){
 470     EvalLocal2TrackingCSTransform();
 471   }
 472
 473 }
 474
 475 //____________________________________________________________________________
 476 void  AliEMCALRecPoint::EvalDispersion(Float_t logWeight, TClonesArray * digits)
 477 {
 478   // Calculates the dispersion of the shower at the origin of the RecPoint
 479   // in cell units - Nov 16,2006
 480
 481   Double_t d = 0., wtot = 0., w = 0.;
 482   Int_t iDigit=0, nstat=0;
 483   AliEMCALDigit * digit=0;
 484
 485   // Calculates the dispersion in cell units
 486   Double_t etai, phii, etaMean=0.0, phiMean=0.0;
 487   int nSupMod=0, nModule=0, nIphi=0, nIeta=0;
 488   int iphi=0, ieta=0;
 489   // Calculate mean values
 490   for(iDigit=0; iDigit < fMulDigit; iDigit++) {
 491     digit = (AliEMCALDigit *) digits->At(fDigitsList[iDigit])  ;
 492
 493     if (fAmp>0 && fEnergyList[iDigit]>0) {
 494       fGeomPtr->GetCellIndex(digit->GetId(), nSupMod,nModule,nIphi,nIeta);
 495       fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nModule,nIphi,nIeta, iphi,ieta);
 496
 497       // In case of a shared cluster, index of SM in C side, columns start at 48 and ends at 48*2
 498       // C Side impair SM, nSupMod%2=1; A side pair SM nSupMod%2=0
 499       if(fSharedCluster && nSupMod%2) ieta+=AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
 500
 501       etai=(Double_t)ieta;
 502       phii=(Double_t)iphi;
 503       w = TMath::Max(0.,logWeight+TMath::Log(fEnergyList[iDigit]/fAmp ) ) ;
 504
 505       if(w>0.0) {
 506         phiMean += phii*w;
 507         etaMean += etai*w;
 508         wtot    += w;
 509       }
 510     }
 511   }
 512   if (wtot>0) {
 513     phiMean /= wtot ;
 514     etaMean /= wtot ;
 515   } else AliError(Form("Wrong weight %f\n", wtot));
 516
 517   // Calculate dispersion
 518   for(iDigit=0; iDigit < fMulDigit; iDigit++) {
 519     digit = (AliEMCALDigit *) digits->At(fDigitsList[iDigit])  ;
 520
 521     if (fAmp>0 && fEnergyList[iDigit]>0) {
 522       fGeomPtr->GetCellIndex(digit->GetId(), nSupMod,nModule,nIphi,nIeta);
 523       fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nModule,nIphi,nIeta, iphi,ieta);
 524
 525       // In case of a shared cluster, index of SM in C side, columns start at 48 and ends at 48*2
 526       // C Side impair SM, nSupMod%2=1; A side pair SM, nSupMod%2=0
 527       if(fSharedCluster && nSupMod%2) ieta+=AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
 528
 529       etai=(Double_t)ieta;
 530       phii=(Double_t)iphi;
 531       w = TMath::Max(0.,logWeight+TMath::Log(fEnergyList[iDigit]/fAmp ) ) ;
 532
 533       if(w>0.0) {
 534         nstat++;
 535         d += w*((etai-etaMean)*(etai-etaMean)+(phii-phiMean)*(phii-phiMean));
 536       }
 537     }
 538   }
 539
 540   if ( wtot > 0 && nstat>1) d /= wtot ;
 541   else                      d = 0. ;
 542
 543   fDispersion = TMath::Sqrt(d) ;
 544   //printf("AliEMCALRecPoint::EvalDispersion() : Dispersion %f \n",fDispersion);
 545 }
 546
 547 //____________________________________________________________________________
 548 void AliEMCALRecPoint::EvalDistanceToBadChannels(AliCaloCalibPedestal* caloped)
 549 {
 550   //For each EMC rec. point set the distance to the nearest bad channel.
 551   //AliInfo(Form("%d bad channel(s) found.\n", caloped->GetDeadTowerCount()));
 552   //It is done in cell units and not in global or local position as before (Sept 2010)
 553
 554   if(!caloped->GetDeadTowerCount()) return;
 555
 556   //Get channels map of the supermodule where the cluster is.
 557   TH2D* hMap  = caloped->GetDeadMap(fSuperModuleNumber);
 558
 559   Int_t dRrow, dReta;
 560   Float_t  minDist = 10000.;
 561   Float_t  dist    = 0.;
 562   Int_t nSupMod, nModule;
 563   Int_t nIphi, nIeta;
 564   Int_t iphi, ieta;
 565   fDigitIndMax  = GetMaximalEnergyIndex();
 566   fGeomPtr->GetCellIndex(fAbsIdList[fDigitIndMax], nSupMod,nModule,nIphi,nIeta);
 567   fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nModule,nIphi,nIeta, iphi,ieta);
 568
 569   //    TVector3 dR;
 570   //    TVector3 cellpos;
 571   //    Float_t  minDist = 100000;
 572   //    Float_t  dist    = 0;
 573   //    Int_t    absId   = -1;
 574
 575   //Loop on tower status map
 576   for(Int_t irow = 0; irow < AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows; irow++){
 577     for(Int_t icol = 0; icol < AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols; icol++){
 578       //Check if tower is bad.
 579       if(hMap->GetBinContent(icol,irow)==AliCaloCalibPedestal::kAlive) continue;
 580       //printf("AliEMCALRecPoint::EvalDistanceToBadChannels() - Bad channel in SM %d, col %d, row %d\n",iSM,icol, irow);
 581
 582       dRrow=TMath::Abs(irow-iphi);
 583       dReta=TMath::Abs(icol-ieta);
 584       dist=TMath::Sqrt(dRrow*dRrow+dReta*dReta);
 585       if(dist < minDist) minDist = dist;
 586
 587       //                        //Tower is bad, get the absId of the index.
 588       //                        absId = fGeomPtr->GetAbsCellIdFromCellIndexes(fSuperModuleNumber, irow, icol);
 589       //
 590       //                        //Get the position of this tower.
 591       //
 592       //                        //Calculate the distance in local coordinates
 593       //                        //fGeomPtr->RelPosCellInSModule(absId,cellpos);
 594       //                        //Calculate distance between this tower and cluster, set if is smaller than previous.
 595       //                        //dR = cellpos-fLocPos;
 596       //
 597       //                        //Calculate the distance in global coordinates
 598       //                        fGeomPtr->GetGlobal(absId,cellpos);
 599       //                        //Calculate distance between this tower and cluster, set if it is smaller than previous.
 600       //                        dR = cellpos-fGlobPos;
 601       //
 602       //                        dist = dR.Mag();
 603       //                        if(dist < minDist) minDist = dist;
 604
 605     }
 606   }
 607
 608   //In case the cluster is shared by 2 SuperModules, need to check the map of the second Super Module
 609   if (fSharedCluster) {
 610     TH2D* hMap2 = 0;
 611     Int_t nSupMod2 = -1;
 612
 613     //The only possible combinations are (0,1), (2,3) ... (10,11)
 614     if(fSuperModuleNumber%2) nSupMod2 = fSuperModuleNumber-1;
 615     else                     nSupMod2 = fSuperModuleNumber+1;
 616     hMap2  = caloped->GetDeadMap(nSupMod2);
 617
 618     //Loop on tower status map of second super module
 619     for(Int_t irow = 0; irow < AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows; irow++){
 620       for(Int_t icol = 0; icol < AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols; icol++){
 621         //Check if tower is bad.
 622         if(hMap2->GetBinContent(icol,irow)==AliCaloCalibPedestal::kAlive) continue;
 623         //printf("AliEMCALRecPoint::EvalDistanceToBadChannels() - Bad channel in SM %d, col %d, row %d\n",iSM,icol, irow);
 624         dRrow=TMath::Abs(irow-iphi);
 625
 626         if(fSuperModuleNumber%2) {
 627           dReta=TMath::Abs(icol-(AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols+ieta));
 628        }
 629        else {
 630          dReta=TMath::Abs(AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols+icol-ieta);
 631        }
 632
 633        dist=TMath::Sqrt(dRrow*dRrow+dReta*dReta);
 634         if(dist < minDist) minDist = dist;
 635
 636 //
 637 //                              //Tower is bad, get the absId of the index.
 638 //                              absId = fGeomPtr->GetAbsCellIdFromCellIndexes(nSupMod2, irow, icol);
 639 //
 640 //                              //Get the position of this tower.
 641 //
 642 //                              //Calculate the distance in global coordinates
 643 //                              fGeomPtr->GetGlobal(absId,cellpos);
 644 //                              //Calculate distance between this tower and cluster, set if it is smaller than previous.
 645 //                              dR = cellpos-fGlobPos;
 646 //
 647 //                              dist = dR.Mag();
 648 //                              if(dist < minDist) minDist = dist;
 649       }
 650     }
 651
 652   }// shared cluster in 2 SuperModules
 653
 654   fDistToBadTower = minDist;
 655   //printf("AliEMCALRecPoint::EvalDistanceToBadChannel() - Distance to Bad is %f cm, shared cluster? %d \n",fDistToBadTower,fSharedCluster);
 656 }
 657
 658
 659 //____________________________________________________________________________
 660 void AliEMCALRecPoint::EvalLocalPosition(Float_t logWeight, TClonesArray * digits)
 661 {
 662   // Calculates the center of gravity in the local EMCAL-module coordinates
 663   //  Info("Print", " logWeight %f : cluster energy %f ", logWeight, fAmp); // for testing
 664
 665   AliEMCALDigit * digit=0;
 666   Int_t i=0, nstat=0;
 667
 668   Double_t dist  = TmaxInCm(Double_t(fAmp));
 669   //Int_t       idMax = GetAbsIdMaxDigit();// idMax is not used at all in RelPosCellInSModule, why use it?
 670
 671   Double_t clXYZ[3]={0.,0.,0.}, clRmsXYZ[3]={0.,0.,0.}, xyzi[3], wtot=0., w=0.;
 672
 673   //printf(" dist : %f  e : %f \n", dist, fAmp);
 674   for(Int_t iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
 675     digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At(fDigitsList[iDigit])) ;
 676
 677     if(!digit) {
 678       AliError("No Digit!!");
 679       continue;
 680     }
 681
 682     //fGeomPtr->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), idMax, dist, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
 683     fGeomPtr->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), dist, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
 684
 685     //Temporal patch, due to mapping problem, need to swap "y" in one of the 2 SM, although no effect in position calculation. GCB 05/2010
 686     if(fSharedCluster && fSuperModuleNumber != fGeomPtr->GetSuperModuleNumber(digit->GetId())) xyzi[1]*=-1;
 687
 688     //printf("EvalLocalPosition Cell:  Id %i, SM %i : dist %f Local x,y,z %f %f %f \n",
 689     //          digit->GetId(), fGeomPtr->GetSuperModuleNumber(digit->GetId()), dist, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
 690
 691     if(logWeight > 0.0)  w = TMath::Max( 0., logWeight + TMath::Log( fEnergyList[iDigit] / fAmp ));
 692     else  w = fEnergyList[iDigit]; // just energy
 693
 694     if(w>0.0) {
 695       wtot += w ;
 696       nstat++;
 697       for(i=0; i<3; i++ ) {
 698         clXYZ[i]    += (w*xyzi[i]);
 699         clRmsXYZ[i] += (w*xyzi[i]*xyzi[i]);
 700       }
 701     }
 702   }
 703   //  cout << " wtot " << wtot << endl;
 704   if ( wtot > 0 ) {
 705     //    xRMS   = TMath::Sqrt(x2m - xMean*xMean);
 706     for(i=0; i<3; i++ ) {
 707       clXYZ[i] /= wtot;
 708       if(nstat>1) {
 709         clRmsXYZ[i] /= (wtot*wtot);
 710         clRmsXYZ[i]  =  clRmsXYZ[i] - clXYZ[i]*clXYZ[i];
 711         if(clRmsXYZ[i] > 0.0) {
 712           clRmsXYZ[i] =  TMath::Sqrt(clRmsXYZ[i]);
 713         } else      clRmsXYZ[i] = 0;
 714       } else        clRmsXYZ[i] = 0;
 715     }
 716   } else {
 717     for(i=0; i<3; i++ ) {
 718       clXYZ[i] = clRmsXYZ[i] = -1.;
 719     }
 720   }
 721   // clRmsXYZ[i] ??
 722
 723   //    // Cluster of one single digit, smear the position to avoid discrete position
 724   //    // smear x and z with +- 3 cm to uniform (avoid discrete effects). Tower size is approx 6 cm.
 725   //    // Rndm generates a number in ]0,1]
 726   //    if (fMulDigit==1) {
 727   //      clXYZ[0] += fGeomPtr->GetPhiTileSize()*(0.5 - gRandom->Rndm());
 728   //      clXYZ[2] += fGeomPtr->GetEtaTileSize()*(0.5 - gRandom->Rndm());
 729   //    }
 730
 731   //Set position in local vector
 732   fLocPos.SetX(clXYZ[0]);
 733   fLocPos.SetY(clXYZ[1]);
 734   fLocPos.SetZ(clXYZ[2]);
 735
 736   if (gDebug==2)
 737     printf("EvalLocalPosition Cluster: Local (x,y,z) = (%f,%f,%f) \n", fLocPos.X(), fLocPos.Y(), fLocPos.Z()) ;
 738
 739 }
 740
 741
 742 //____________________________________________________________________________
 743 void AliEMCALRecPoint::EvalGlobalPosition(Float_t logWeight, TClonesArray * digits)
 744 {
 745   // Calculates the center of gravity in the global ALICE coordinates
 746   //  Info("Print", " logWeight %f : cluster energy %f ", logWeight, fAmp); // for testing
 747
 748   AliEMCALDigit * digit=0;
 749   Int_t i=0, nstat=0;
 750
 751   Double_t dist  = TmaxInCm(Double_t(fAmp));
 752   //Int_t       idMax = GetAbsIdMaxDigit();// idMax is not used at all in RelPosCellInSModule, why use it?
 753
 754   Double_t clXYZ[3]={0.,0.,0.}, clRmsXYZ[3]={0.,0.,0.}, lxyzi[3], xyzi[3], wtot=0., w=0.;
 755
 756   //printf(" dist : %f  e : %f \n", dist, fAmp);
 757   for(Int_t iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
 758     digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At(fDigitsList[iDigit])) ;
 759
 760     if(!digit) {
 761       AliError("No Digit!!");
 762       continue;
 763     }
 764
 765     //Get the local coordinates of the cell
 766     //fGeomPtr->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), idMax, dist, lxyzi[0], lxyzi[1], lxyzi[2]);
 767     fGeomPtr->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), dist, lxyzi[0], lxyzi[1], lxyzi[2]);
 768
 769     //Now get the global coordinate
 770     fGeomPtr->GetGlobal(lxyzi,xyzi, fGeomPtr->GetSuperModuleNumber(digit->GetId()));
 771     //TVector3 pos(xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
 772     //printf("EvalGlobalPosition Cell:  Id %i, SM %i : dist %f Local (x,y,z) = (%f %f %f), eta %f, phi%f \n",
 773     //     digit->GetId(), fGeomPtr->GetSuperModuleNumber(digit->GetId()),dist, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2],pos.Eta(),pos.Phi()*TMath::RadToDeg());
 774
 775     if(logWeight > 0.0)  w = TMath::Max( 0., logWeight + TMath::Log( fEnergyList[iDigit] / fAmp ));
 776     else  w = fEnergyList[iDigit]; // just energy
 777
 778     if(w>0.0) {
 779       wtot += w ;
 780       nstat++;
 781       for(i=0; i<3; i++ ) {
 782         clXYZ[i]    += (w*xyzi[i]);
 783         clRmsXYZ[i] += (w*xyzi[i]*xyzi[i]);
 784       }
 785     }
 786   }
 787   //  cout << " wtot " << wtot << endl;
 788   if ( wtot > 0 ) {
 789     //    xRMS   = TMath::Sqrt(x2m - xMean*xMean);
 790     for(i=0; i<3; i++ ) {
 791       clXYZ[i] /= wtot;
 792       if(nstat>1) {
 793         clRmsXYZ[i] /= (wtot*wtot);
 794         clRmsXYZ[i]  =  clRmsXYZ[i] - clXYZ[i]*clXYZ[i];
 795         if(clRmsXYZ[i] > 0.0) {
 796           clRmsXYZ[i] =  TMath::Sqrt(clRmsXYZ[i]);
 797         } else      clRmsXYZ[i] = 0;
 798       } else        clRmsXYZ[i] = 0;
 799     }
 800   } else {
 801     for(i=0; i<3; i++ ) {
 802       clXYZ[i] = clRmsXYZ[i] = -1.;
 803     }
 804   }
 805   // clRmsXYZ[i] ??
 806
 807 //  // Cluster of one single digit, smear the position to avoid discrete position
 808 //  // smear x and z with +- 3 cm to uniform (avoid discrete effects). Tower size is approx 6 cm.
 809 //  // Rndm generates a number in ]0,1]
 810 //  if (fMulDigit==1) {
 811 //    clXYZ[0] += fGeomPtr->GetPhiTileSize()*(0.5 - gRandom->Rndm());
 812 //    clXYZ[2] += fGeomPtr->GetEtaTileSize()*(0.5 - gRandom->Rndm());
 813 //  }
 814
 815   //Set position in global vector
 816   fGlobPos.SetX(clXYZ[0]);
 817   fGlobPos.SetY(clXYZ[1]);
 818   fGlobPos.SetZ(clXYZ[2]);
 819
 820   if (gDebug==2)
 821         printf("EvalGlobalPosition Cluster: (x ,y ,z) = (%f,%f,%f), eta %f,phi %f\n",
 822                    fGlobPos.X(), fGlobPos.Y(), fGlobPos.Z(),fGlobPos.Eta(),fGlobPos.Phi()*TMath::RadToDeg()) ;
 823 }
 824
 825 //____________________________________________________________________________
 826 void AliEMCALRecPoint::EvalLocalPositionFit(Double_t deff, Double_t logWeight,
 827 Double_t phiSlope, TClonesArray * digits)
 828 {
 829   // Evaluates local position of clusters in SM
 830
 831   Double_t ycorr=0;
 832   AliEMCALDigit *digit=0;
 833   Int_t i=0, nstat=0;
 834   Double_t clXYZ[3]={0.,0.,0.}, clRmsXYZ[3]={0.,0.,0.}, xyzi[3], wtot=0., w=0.;
 835
 836   Double_t dist  = TmaxInCm(Double_t(fAmp));
 837   //Int_t       idMax = GetAbsIdMaxDigit();// idMax is not used at all in RelPosCellInSModule, why use it?
 838
 839   for(Int_t iDigit=0; iDigit<digits->GetEntries(); iDigit++) {
 840     digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At(fDigitsList[iDigit])) ;
 841     if(digit){
 842       dist = deff;
 843       //fGeomPtr->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), idMax, dist, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
 844       fGeomPtr->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), dist, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
 845
 846       if(logWeight > 0.0)  w = TMath::Max( 0., logWeight + TMath::Log( fEnergyList[iDigit] / fAmp ));
 847       else                 w = fEnergyList[iDigit]; // just energy
 848
 849       if(w>0.0) {
 850         wtot += w ;
 851         nstat++;
 852         for(i=0; i<3; i++ ) {
 853           clXYZ[i]    += (w*xyzi[i]);
 854           clRmsXYZ[i] += (w*xyzi[i]*xyzi[i]);
 855         }
 856       }
 857     }else AliError("Digit null");
 858   }//loop
 859   //  cout << " wtot " << wtot << endl;
 860   if ( wtot > 0 ) {
 861     //    xRMS   = TMath::Sqrt(x2m - xMean*xMean);
 862     for(i=0; i<3; i++ ) {
 863       clXYZ[i] /= wtot;
 864       if(nstat>1) {
 865         clRmsXYZ[i] /= (wtot*wtot);
 866         clRmsXYZ[i]  =  clRmsXYZ[i] - clXYZ[i]*clXYZ[i];
 867         if(clRmsXYZ[i] > 0.0) {
 868           clRmsXYZ[i] =  TMath::Sqrt(clRmsXYZ[i]);
 869         } else      clRmsXYZ[i] = 0;
 870       } else        clRmsXYZ[i] = 0;
 871     }
 872   } else {
 873     for(i=0; i<3; i++ ) {
 874       clXYZ[i] = clRmsXYZ[i] = -1.;
 875     }
 876   }
 877   // clRmsXYZ[i] ??
 878   if(phiSlope != 0.0 && logWeight > 0.0 && wtot) {
 879     // Correction in phi direction (y - coords here); Aug 16;
 880     // May be put to global level or seperate method
 881     ycorr = clXYZ[1] * (1. + phiSlope);
 882     //printf(" y %f : ycorr %f : slope %f \n", clXYZ[1], ycorr, phiSlope);
 883     clXYZ[1] = ycorr;
 884   }
 885
 886   fLocPos.SetX(clXYZ[0]);
 887   fLocPos.SetY(clXYZ[1]);
 888   fLocPos.SetZ(clXYZ[2]);
 889
 890 //  if (gDebug==2)
 891 //    printf("EvalLocalPosition: eta,phi,r = %f,%f,%f", fLocPos.X(), fLocPos.Y(), fLocPos.Z()) ;
 892 }
 893
 894 //_____________________________________________________________________________
 895 Bool_t AliEMCALRecPoint::EvalLocalPosition2(TClonesArray * digits, TArrayD &ed)
 896 {
 897   // Evaluated local position of rec.point using digits
 898   // and parametrisation of w0 and deff
 899   //printf(" <I> AliEMCALRecPoint::EvalLocalPosition2() \n");
 900   return AliEMCALRecPoint::EvalLocalPositionFromDigits(digits, ed, fLocPos);
 901 }
 902
 903 //_____________________________________________________________________________
 904 Bool_t AliEMCALRecPoint::EvalLocalPositionFromDigits(TClonesArray *digits, TArrayD &ed, TVector3 &locPos)
 905 {
 906   // Used when digits should be recalibrated
 907   Double_t deff=0, w0=0, esum=0;
 908   Int_t iDigit=0;
 909   //  AliEMCALDigit *digit;
 910
 911   if(ed.GetSize() && (digits->GetEntries()!=ed.GetSize())) return kFALSE;
 912
 913   // Calculate sum energy of digits
 914   esum = 0.0;
 915   for(iDigit=0; iDigit<ed.GetSize(); iDigit++) esum += ed[iDigit];
 916
 917   GetDeffW0(esum, deff, w0);
 918
 919   return EvalLocalPositionFromDigits(esum, deff, w0, digits, ed, locPos);
 920 }
 921
 922 //_____________________________________________________________________________
 923 Bool_t AliEMCALRecPoint::EvalLocalPositionFromDigits(const Double_t esum, const Double_t deff, const Double_t w0, TClonesArray *digits, TArrayD &ed, TVector3 &locPos)
 924 {
 925   //Evaluate position of digits in supermodule.
 926   AliEMCALDigit *digit=0;
 927
 928   Int_t i=0, nstat=0;
 929   Double_t clXYZ[3]={0.,0.,0.}, xyzi[3], wtot=0., w=0.;
 930   //Int_t       idMax = GetAbsIdMaxDigit();// idMax is not used at all in RelPosCellInSModule, why use it?
 931
 932   // Get pointer to EMCAL geometry
 933   // (can't use fGeomPtr in static method)
 934   AliEMCALGeometry* geo = AliEMCALGeometry::GetInstance();
 935
 936   for(Int_t iDigit=0; iDigit<digits->GetEntries(); iDigit++) {
 937     digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At(iDigit));
 938     if(digit){
 939       //geo->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), idMax, deff, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
 940       geo->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), deff, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
 941
 942       if(w0 > 0.0)  w = TMath::Max( 0., w0 + TMath::Log(ed[iDigit] / esum));
 943       else          w = ed[iDigit]; // just energy
 944
 945       if(w>0.0) {
 946         wtot += w ;
 947         nstat++;
 948         for(i=0; i<3; i++ ) {
 949           clXYZ[i] += (w*xyzi[i]);
 950         }
 951       }
 952     }else AliError("Digit null");
 953   }//loop
 954   //  cout << " wtot " << wtot << endl;
 955   if (wtot > 0) {
 956     for(i=0; i<3; i++ ) {
 957       clXYZ[i] /= wtot;
 958     }
 959     locPos.SetX(clXYZ[0]);
 960     locPos.SetY(clXYZ[1]);
 961     locPos.SetZ(clXYZ[2]);
 962     return kTRUE;
 963   } else {
 964     return kFALSE;
 965   }
 966
 967 }
 968
 969 //_____________________________________________________________________________
 970 void AliEMCALRecPoint::GetDeffW0(const Double_t esum , Double_t &deff,  Double_t &w0)
 971 {
 972   //
 973   // Aug 31, 2001
 974   // Applied for simulation data with threshold 3 adc
 975   // Calculate efective distance (deff) and weigh parameter (w0)
 976   // for coordinate calculation; 0.5 GeV < esum <100 GeV.
 977   // Look to:  http://rhic.physics.wayne.edu/~pavlinov/ALICE/SHISHKEBAB/RES/CALIB/GEOMCORR/deffandW0VaEgamma_2.gif
 978   //
 979   Double_t e=0.0;
 980   const  Double_t kdp0=9.25147, kdp1=1.16700; // Hard coded now
 981   const  Double_t kwp0=4.83713, kwp1=-2.77970e-01, kwp2 = 4.41116;
 982
 983   // No extrapolation here
 984   e = esum<0.5?0.5:esum;
 985   e = e>100.?100.:e;
 986
 987   deff = kdp0 + kdp1*TMath::Log(e);
 988   w0   = kwp0 / (1. + TMath::Exp(kwp1*(e+kwp2)));
 989   //printf("<I> AliEMCALRecPoint::GetDeffW0 esum %5.2f : deff %5.2f : w0 %5.2f \n", esum, deff, w0);
 990 }
 991
 992 //______________________________________________________________________________
 993 void AliEMCALRecPoint::EvalCoreEnergy(Float_t logWeight, TClonesArray * digits)
 994 {
 995   // This function calculates energy in the core,
 996   // i.e. within a radius rad = fCoreEnergy around the center. Beyond this radius
 997   // in accordance with shower profile the energy deposition
 998   // should be less than 2%
 999   // Unfinished - Nov 15,2006
1000   // Distance is calculate in (phi,eta) units
1001
1002   AliEMCALDigit * digit = 0 ;
1003
1004   Int_t iDigit=0;
1005
1006   if (!fLocPos.Mag()) {
1007     EvalLocalPosition(logWeight, digits);
1008   }
1009
1010   Double_t phiPoint = fLocPos.Phi(), etaPoint = fLocPos.Eta();
1011   Double_t eta, phi, distance;
1012   for(iDigit=0; iDigit < fMulDigit; iDigit++) {
1013     digit = (AliEMCALDigit *) ( digits->At(fDigitsList[iDigit]) ) ;
1014
1015     eta = phi = 0.0;
1016     fGeomPtr->EtaPhiFromIndex(digit->GetId(),eta, phi) ;
1017     phi = phi * TMath::DegToRad();
1018
1019     distance = TMath::Sqrt((eta-etaPoint)*(eta-etaPoint)+(phi-phiPoint)*(phi-phiPoint));
1020     if(distance < fCoreRadius)
1021       fCoreEnergy += fEnergyList[iDigit] ;
1022   }
1023
1024 }
1025 //____________________________________________________________________________
1026 void  AliEMCALRecPoint::EvalElipsAxis(Float_t logWeight,TClonesArray * digits)
1027 {
1028   // Calculates the axis of the shower ellipsoid in eta and phi
1029   // in cell units
1030
1031   TString gn(fGeomPtr->GetName());
1032
1033   Double_t wtot = 0.;
1034   Double_t x    = 0.;
1035   Double_t z    = 0.;
1036   Double_t dxx  = 0.;
1037   Double_t dzz  = 0.;
1038   Double_t dxz  = 0.;
1039
1040   AliEMCALDigit * digit = 0;
1041
1042   Double_t etai =0, phii=0, w=0;
1043   int nSupMod=0, nModule=0, nIphi=0, nIeta=0;
1044   int iphi=0, ieta=0;
1045   for(Int_t iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
1046     digit = (AliEMCALDigit *) digits->At(fDigitsList[iDigit])  ;
1047     etai = phii = 0.;
1048     // Nov 15,2006 - use cell numbers as coordinates
1049     // Copied for shish-kebab geometry, ieta,iphi is cast as double as eta,phi
1050     // We can use the eta,phi(or coordinates) of cell
1051     nSupMod = nModule = nIphi = nIeta = iphi = ieta = 0;
1052
1053     fGeomPtr->GetCellIndex(digit->GetId(), nSupMod,nModule,nIphi,nIeta);
1054     fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nModule,nIphi,nIeta, iphi,ieta);
1055
1056     // In case of a shared cluster, index of SM in C side, columns start at 48 and ends at 48*2
1057     // C Side impair SM, nSupMod%2=1; A side pair SM, nSupMod%2=0
1058     if(fSharedCluster && nSupMod%2) ieta+=AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
1059
1060     etai=(Double_t)ieta;
1061     phii=(Double_t)iphi;
1062
1063     w = TMath::Max(0.,logWeight+TMath::Log(fEnergyList[iDigit]/fAmp ) ) ;
1064     // fAmp summed amplitude of digits, i.e. energy of recpoint
1065     // Gives smaller value of lambda than log weight
1066     // w = fEnergyList[iDigit] / fAmp; // Nov 16, 2006 - try just energy
1067
1068     dxx  += w * etai * etai ;
1069     x    += w * etai ;
1070     dzz  += w * phii * phii ;
1071     z    += w * phii ;
1072
1073     dxz  += w * etai * phii ;
1074
1075     wtot += w ;
1076   }
1077
1078   if ( wtot > 0 ) {
1079     dxx /= wtot ;
1080     x   /= wtot ;
1081     dxx -= x * x ;
1082     dzz /= wtot ;
1083     z   /= wtot ;
1084     dzz -= z * z ;
1085     dxz /= wtot ;
1086     dxz -= x * z ;
1087
1088     fLambda[0] =  0.5 * (dxx + dzz) + TMath::Sqrt( 0.25 * (dxx - dzz) * (dxx - dzz) + dxz * dxz )  ;
1089     if(fLambda[0] > 0)
1090       fLambda[0] = TMath::Sqrt(fLambda[0]) ;
1091     else
1092       fLambda[0] = 0;
1093
1094     fLambda[1] =  0.5 * (dxx + dzz) - TMath::Sqrt( 0.25 * (dxx - dzz) * (dxx - dzz) + dxz * dxz )  ;
1095
1096     if(fLambda[1] > 0) //To avoid exception if numerical errors lead to negative lambda.
1097       fLambda[1] = TMath::Sqrt(fLambda[1]) ;
1098     else
1099       fLambda[1]= 0. ;
1100   } else {
1101     fLambda[0]= 0. ;
1102     fLambda[1]= 0. ;
1103   }
1104
1105   //printf("AliEMCALRecPoint::EvalElipsAxis() lambdas  = %f,%f \n", fLambda[0],fLambda[1]) ;
1106
1107 }
1108
1109 //______________________________________________________________________________
1110 void  AliEMCALRecPoint::EvalPrimaries(TClonesArray * digits)
1111 {
1112   // Constructs the list of primary particles (tracks) which
1113   // have contributed to this RecPoint and calculate deposited energy
1114   // for each track
1115
1116   AliEMCALDigit * digit =0;
1117   Int_t * primArray = new Int_t[fMaxTrack] ;
1118   memset(primArray,-1,sizeof(Int_t)*fMaxTrack);
1119   Float_t * dEPrimArray = new Float_t[fMaxTrack] ;
1120   memset(dEPrimArray,-1,sizeof(Int_t)*fMaxTrack);
1121
1122   Int_t index ;
1123   for ( index = 0 ; index < GetDigitsMultiplicity() ; index++ ) { // all digits
1124     digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At( fDigitsList[index] )) ;
1125     if(!digit) {
1126       AliError("No Digit!!");
1127       continue;
1128     }
1129
1130     Int_t nprimaries = digit->GetNprimary() ;
1131     if ( nprimaries == 0 ) continue ;
1132     Int_t jndex ;
1133     for ( jndex = 0 ; jndex < nprimaries ; jndex++ ) { // all primaries in digit
1134       if ( fMulTrack > fMaxTrack ) {
1135         fMulTrack = fMaxTrack ;
1136         Error("EvalPrimaries", "increase fMaxTrack ")  ;
1137         break ;
1138       }
1139       Int_t newPrimary = digit->GetPrimary(jndex+1);
1140       Float_t dEPrimary = digit->GetDEPrimary(jndex+1);
1141       Int_t kndex ;
1142       Bool_t already = kFALSE ;
1143       for ( kndex = 0 ; kndex < fMulTrack ; kndex++ ) { //check if not already stored
1144         if ( newPrimary == primArray[kndex] ){
1145           already = kTRUE ;
1146           dEPrimArray[kndex] += dEPrimary;
1147           break ;
1148         }
1149       } // end of check
1150       if ( !already && (fMulTrack < fMaxTrack)) { // store it
1151         primArray[fMulTrack] = newPrimary ;
1152         dEPrimArray[fMulTrack] = dEPrimary ;
1153         fMulTrack++ ;
1154       } // store it
1155     } // all primaries in digit
1156   } // all digits
1157
1158   Int_t *sortIdx = new Int_t[fMulTrack];
1159   TMath::Sort(fMulTrack,dEPrimArray,sortIdx);
1160   for(index = 0; index < fMulTrack; index++) {
1161     fTracksList[index] = primArray[sortIdx[index]] ;
1162     fDETracksList[index] = dEPrimArray[sortIdx[index]] ;
1163   }
1164   delete [] sortIdx;
1165   delete [] primArray ;
1166   delete [] dEPrimArray ;
1167
1168 }
1169
1170 //______________________________________________________________________________
1171 void  AliEMCALRecPoint::EvalParents(TClonesArray * digits)
1172 {
1173   // Constructs the list of parent particles (tracks) which have contributed to this RecPoint
1174
1175   AliEMCALDigit * digit=0 ;
1176   Int_t * parentArray = new Int_t[fMaxTrack] ;
1177   memset(parentArray,-1,sizeof(Int_t)*fMaxTrack);
1178   Float_t * dEParentArray = new Float_t[fMaxTrack] ;
1179   memset(dEParentArray,-1,sizeof(Int_t)*fMaxTrack);
1180
1181   Int_t index ;
1182   for ( index = 0 ; index < GetDigitsMultiplicity() ; index++ ) { // all digits
1183     if (fDigitsList[index] >= digits->GetEntries() || fDigitsList[index] < 0)
1184       AliError(Form("Trying to get invalid digit %d (idx in WriteRecPoint %d)",fDigitsList[index],index));
1185     digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At( fDigitsList[index] )) ;
1186     if(!digit) {
1187       AliError("No Digit!!");
1188       continue;
1189     }
1190
1191     Int_t nparents = digit->GetNiparent() ;
1192     if ( nparents == 0 ) continue ;
1193
1194     Int_t jndex ;
1195     for ( jndex = 0 ; jndex < nparents ; jndex++ ) { // all primaries in digit
1196       if ( fMulParent > fMaxParent ) {
1197         fMulTrack = - 1 ;
1198         Error("EvalParents", "increase fMaxParent")  ;
1199         break ;
1200       }
1201       Int_t newParent = digit->GetIparent(jndex+1) ;
1202       Float_t newdEParent = digit->GetDEParent(jndex+1) ;
1203       Int_t kndex ;
1204       Bool_t already = kFALSE ;
1205       for ( kndex = 0 ; kndex < fMulParent ; kndex++ ) { //check if not already stored
1206         if ( newParent == parentArray[kndex] ){
1207           dEParentArray[kndex] += newdEParent;
1208           already = kTRUE ;
1209           break ;
1210         }
1211       } // end of check
1212       if ( !already && (fMulParent < fMaxParent)) { // store it
1213         parentArray[fMulParent] = newParent ;
1214         dEParentArray[fMulParent] = newdEParent ;
1215         fMulParent++ ;
1216       } // store it
1217     } // all parents in digit
1218   } // all digits
1219
1220   if (fMulParent>0) {
1221     Int_t *sortIdx = new Int_t[fMulParent];
1222     TMath::Sort(fMulParent,dEParentArray,sortIdx);
1223     for(index = 0; index < fMulParent; index++) {
1224       fParentsList[index] = parentArray[sortIdx[index]] ;
1225       fDEParentsList[index] = dEParentArray[sortIdx[index]] ;
1226     }
1227     delete [] sortIdx;
1228   }
1229
1230   delete [] parentArray;
1231   delete [] dEParentArray;
1232 }
1233
1234 //____________________________________________________________________________
1235 void AliEMCALRecPoint::GetLocalPosition(TVector3 & lpos) const
1236 {
1237   // returns the position of the cluster in the local reference system
1238   // of the sub-detector
1239
1240   lpos = fLocPos;
1241 }
1242
1243 //____________________________________________________________________________
1244 void AliEMCALRecPoint::GetGlobalPosition(TVector3 & gpos) const
1245 {
1246   // returns the position of the cluster in the global reference system of ALICE
1247   // These are now the Cartesian X, Y and Z
1248   //  cout<<" geom "<<geom<<endl;
1249   // fGeomPtr->GetGlobal(fLocPos, gpos, fSuperModuleNumber);
1250   gpos = fGlobPos;
1251
1252 }
1253
1254 //____________________________________________________________________________
1255 //void AliEMCALRecPoint::GetGlobalPosition(TVector3 & gpos, TMatrixF & gmat) const
1256 //{
1257 //  // returns the position of the cluster in the global reference system of ALICE
1258 //  // These are now the Cartesian X, Y and Z
1259 //  //  cout<<" geom "<<geom<<endl;
1260 //
1261 //  //To be implemented
1262 //  fGeomPtr->GetGlobalEMCAL(this, gpos, gmat);
1263 //
1264 //}
1265
1266 //_____________________________________________________________________________
1267 void AliEMCALRecPoint::EvalLocal2TrackingCSTransform()
1268 {
1269   //Evaluates local to "tracking" c.s. transformation (B.P.).
1270   //All evaluations should be completed before calling for this
1271   //function.
1272   //See ALICE PPR Chapter 5 p.18 for "tracking" c.s. definition,
1273   //or just ask Jouri Belikov. :)
1274
1275   SetVolumeId(AliGeomManager::LayerToVolUID(AliGeomManager::kEMCAL,GetSuperModuleNumber()));
1276
1277   const TGeoHMatrix* tr2loc = GetTracking2LocalMatrix();
1278   if(!tr2loc) AliFatal(Form("No Tracking2LocalMatrix found."));
1279
1280   Double_t lxyz[3] = {fLocPos.X(),fLocPos.Y(),fLocPos.Z()};
1281   Double_t txyz[3] = {0,0,0};
1282
1283   tr2loc->MasterToLocal(lxyz,txyz);
1284   SetX(txyz[0]); SetY(txyz[1]); SetZ(txyz[2]);
1285
1286   if(AliLog::GetGlobalDebugLevel()>0) {
1287     TVector3 gpos; //TMatrixF gmat;
1288     //GetGlobalPosition(gpos,gmat); //Not doing anythin special, replace by next line.
1289     fGeomPtr->GetGlobal(fLocPos, gpos, GetSuperModuleNumber());
1290
1291     Float_t gxyz[3];
1292     GetGlobalXYZ(gxyz);
1293     AliInfo(Form("lCS-->(%.3f,%.3f,%.3f), tCS-->(%.3f,%.3f,%.3f), gCS-->(%.3f,%.3f,%.3f),  gCScalc-\
1294 ->(%.3f,%.3f,%.3f), supermodule %d",
1295                  fLocPos.X(),fLocPos.Y(),fLocPos.Z(),
1296                  GetX(),GetY(),GetZ(),
1297                  gpos.X(),gpos.Y(),gpos.Z(),
1298                  gxyz[0],gxyz[1],gxyz[2],GetSuperModuleNumber()));
1299   }
1300
1301 }
1302
1303 //____________________________________________________________________________
1304 Float_t AliEMCALRecPoint::GetMaximalEnergy(void) const
1305 {
1306   // Finds the maximum energy in the cluster
1307
1308   Float_t menergy = 0. ;
1309
1310   Int_t iDigit;
1311   for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
1312
1313     if(fEnergyList[iDigit] > menergy)
1314       menergy = fEnergyList[iDigit] ;
1315   }
1316   return menergy ;
1317 }
1318
1319 //____________________________________________________________________________
1320 Int_t AliEMCALRecPoint::GetMaximalEnergyIndex(void) const
1321 {
1322   // Finds the maximum energy in the cluster
1323
1324   Float_t menergy = 0. ;
1325   Int_t mid       = 0  ;
1326   Int_t iDigit;
1327
1328   for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
1329
1330     if(fEnergyList[iDigit] > menergy){
1331       menergy = fEnergyList[iDigit] ;
1332       mid     = iDigit ;
1333     }
1334   }//loop on cluster digits
1335
1336   return mid ;
1337 }
1338
1339
1340 //____________________________________________________________________________
1341 Int_t AliEMCALRecPoint::GetMultiplicityAtLevel(Float_t H) const
1342 {
1343   // Calculates the multiplicity of digits with energy larger than H*energy
1344
1345   Int_t multipl   = 0 ;
1346   Int_t iDigit ;
1347   for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
1348
1349     if(fEnergyList[iDigit] > H * fAmp)
1350       multipl++ ;
1351   }
1352   return multipl ;
1353 }
1354
1355 //____________________________________________________________________________
1356 Int_t  AliEMCALRecPoint::GetNumberOfLocalMax(AliEMCALDigit **  maxAt, Float_t * maxAtEnergy,
1357                                                Float_t locMaxCut,TClonesArray * digits) const
1358 {
1359   // Calculates the number of local maxima in the cluster using fLocalMaxCut as the minimum
1360   // energy difference between two local maxima
1361
1362   AliEMCALDigit * digit  = 0;
1363   AliEMCALDigit * digitN = 0;
1364
1365   Int_t iDigitN = 0 ;
1366   Int_t iDigit  = 0 ;
1367
1368   for(iDigit = 0; iDigit < fMulDigit; iDigit++)
1369     maxAt[iDigit] = (AliEMCALDigit*) digits->At(fDigitsList[iDigit])  ;
1370
1371   for(iDigit = 0 ; iDigit < fMulDigit; iDigit++) {
1372     if(maxAt[iDigit]) {
1373       digit = maxAt[iDigit] ;
1374
1375       for(iDigitN = 0; iDigitN < fMulDigit; iDigitN++) {
1376         digitN = (AliEMCALDigit *) digits->At(fDigitsList[iDigitN]) ;
1377
1378         if ( AreNeighbours(digit, digitN) ) {
1379           if (fEnergyList[iDigit] > fEnergyList[iDigitN] ) {
1380             maxAt[iDigitN] = 0 ;
1381             // but may be digit too is not local max ?
1382             if(fEnergyList[iDigit] < fEnergyList[iDigitN] + locMaxCut)
1383               maxAt[iDigit] = 0 ;
1384           }
1385           else {
1386             maxAt[iDigit] = 0 ;
1387             // but may be digitN too is not local max ?
1388             if(fEnergyList[iDigit] > fEnergyList[iDigitN] - locMaxCut)
1389               maxAt[iDigitN] = 0 ;
1390           }
1391         } // if Areneighbours
1392       } // while digitN
1393     } // slot not empty
1394   } // while digit
1395
1396   iDigitN = 0 ;
1397   for(iDigit = 0; iDigit < fMulDigit; iDigit++) {
1398     if(maxAt[iDigit] ){
1399       maxAt[iDigitN] = maxAt[iDigit] ;
1400       maxAtEnergy[iDigitN] = fEnergyList[iDigit] ;
1401       iDigitN++ ;
1402     }
1403   }
1404   return iDigitN ;
1405 }
1406
1407 //____________________________________________________________________________
1408 Int_t AliEMCALRecPoint::GetPrimaryIndex() const
1409 {
1410   // Get the primary track index in TreeK which deposits the most energy
1411   // in Digits which forms RecPoint.
1412
1413   if (fMulTrack)
1414     return fTracksList[0];
1415   return -12345;
1416 }
1417
1418 //____________________________________________________________________________
1419 void AliEMCALRecPoint::EvalTime(TClonesArray * digits){
1420   // time is set to the time of the digit with the maximum energy
1421
1422   Float_t maxE  = 0;
1423   Int_t   maxAt = 0;
1424   for(Int_t idig=0; idig < fMulDigit; idig++){
1425     if(fEnergyList[idig] > maxE){
1426       maxE  = fEnergyList[idig] ;
1427       maxAt = idig;
1428     }
1429   }
1430   fTime = ((AliEMCALDigit*) digits->At(fDigitsList[maxAt]))->GetTime() ;
1431
1432 }
1433
1434 //______________________________________________________________________________
1435 void AliEMCALRecPoint::Paint(Option_t *)
1436 {
1437   // Paint this ALiRecPoint as a TMarker  with its current attributes
1438
1439   TVector3 pos(0.,0.,0.)  ;
1440   GetLocalPosition(pos)   ;
1441   Coord_t x = pos.X()     ;
1442   Coord_t y = pos.Z()     ;
1443   Color_t markercolor = 1 ;
1444   Size_t  markersize  = 1.;
1445   Style_t markerstyle = 5 ;
1446
1447   if (!gPad->IsBatch()) {
1448     gVirtualX->SetMarkerColor(markercolor) ;
1449     gVirtualX->SetMarkerSize (markersize)  ;
1450     gVirtualX->SetMarkerStyle(markerstyle) ;
1451   }
1452   gPad->SetAttMarkerPS(markercolor,markerstyle,markersize) ;
1453   gPad->PaintPolyMarker(1,&x,&y,"") ;
1454 }
1455
1456 //_____________________________________________________________________
1457 Double_t AliEMCALRecPoint::TmaxInCm(const Double_t e , const Int_t key)
1458 {
1459   // e energy in GeV)
1460   // key  =  0(gamma, default)
1461   //     !=  0(electron)
1462   const Double_t ca   = 4.82;  // shower max parameter - first guess; ca=TMath::Log(1000./8.07)
1463   Double_t tmax = 0.;    // position of electromagnetic shower max in cm
1464
1465   Double_t x0   = 1.31;  // radiation lenght (cm)
1466   //If old geometry in use
1467   if(!((fGeomPtr->GetEMCGeometry()->GetGeoName()).Contains("V1"))) x0 = 1.28;
1468
1469   if(e>0.1) {
1470     tmax = TMath::Log(e) + ca;
1471     if      (key==0) tmax += 0.5;
1472     else             tmax -= 0.5;
1473     tmax *= x0; // convert to cm
1474   }
1475   return tmax;
1476 }
1477
1478 //______________________________________________________________________________
1479 Float_t AliEMCALRecPoint::EtaToTheta(Float_t arg) const
1480 {
1481   //Converts Theta (Radians) to Eta(Radians)
1482   return (2.*TMath::ATan(TMath::Exp(-arg)));
1483 }
1484
1485 //______________________________________________________________________________
1486 Float_t AliEMCALRecPoint::ThetaToEta(Float_t arg) const
1487 {
1488   //Converts Eta (Radians) to Theta(Radians)
1489   return (-1 * TMath::Log(TMath::Tan(0.5 * arg)));
1490 }
1491
1492 //____________________________________________________________________________
1493 void AliEMCALRecPoint::Print(Option_t *opt) const
1494 {
1495   // Print the list of digits belonging to the cluster
1496   if(strlen(opt)==0) return;
1497   TString message ;
1498   message  = "AliEMCALRecPoint:\n" ;
1499   message +=  " digits # = " ;
1500   AliInfo(message.Data()) ;
1501
1502   Int_t iDigit;
1503   for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++)
1504     printf(" %d ", fDigitsList[iDigit] ) ;
1505   printf("\n");
1506
1507   AliInfo(" Energies = ") ;
1508   for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++)
1509     printf(" %f ", fEnergyList[iDigit] ) ;
1510   printf("\n");
1511
1512   AliInfo("\n Abs Ids = ") ;
1513   for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++)
1514     printf(" %i ", fAbsIdList[iDigit] ) ;
1515   printf("\n");
1516
1517   AliInfo(" Primaries  ") ;
1518   for(iDigit = 0;iDigit < fMulTrack; iDigit++)
1519     printf(" %d ", fTracksList[iDigit]) ;
1520
1521   printf("\n Local x %6.2f y %7.2f z %7.1f \n", fLocPos[0], fLocPos[1], fLocPos[2]);
1522
1523   message  = "       ClusterType     = %d" ;
1524   message += "       Multiplicity    = %d" ;
1525   message += "       Cluster Energy  = %f" ;
1526   message += "       Core energy     = %f" ;
1527   message += "       Core radius     = %f" ;
1528   message += "       Number of primaries %d" ;
1529   message += "       Stored at position %d" ;
1530   AliInfo(Form(message.Data(), fClusterType, fMulDigit, fAmp, fCoreEnergy, fCoreRadius, fMulTrack, GetIndexInList()) ) ;
1531 }
1532
1533 //___________________________________________________________
1534 Double_t  AliEMCALRecPoint::GetPointEnergy() const
1535 {
1536   //Returns energy ....
1537   Double_t e=0.0;
1538   for(int ic=0; ic<GetMultiplicity(); ic++) e += double(fEnergyList[ic]);
1539   return e;
1540 }