EMCAL/AliEMCALRecPoint.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15 /* $Id$ */
  16 //_________________________________________________________________________
  17 //  Reconstructed Points for the EMCAL
  18 //  A RecPoint is a cluster of digits
  19 //
  20 //
  21 //*-- Author: Yves Schutz (SUBATECH)
  22 //*-- Author: Dmitri Peressounko (RRC KI & SUBATECH)
  23 //*-- Author: Heather Gray (LBL) merged AliEMCALRecPoint and AliEMCALTowerRecPoint 02/04
  24
  25 // --- ROOT system ---
  26 #include "TPad.h"
  27 #include "TGraph.h"
  28 #include "TPaveText.h"
  29 #include "TClonesArray.h"
  30 #include "TMath.h"
  31 #include "TGeoMatrix.h"
  32 #include "TGeoManager.h"
  33 #include "TGeoPhysicalNode.h"
  34 #include "TRandom.h"
  35
  36 // --- Standard library ---
  37 #include <Riostream.h>
  38
  39 // --- AliRoot header files ---
  40 //#include "AliGenerator.h"
  41 class AliGenerator;
  42 class AliEMCAL;
  43 #include "AliLog.h"
  44 #include "AliGeomManager.h"
  45 #include "AliEMCALGeometry.h"
  46 #include "AliEMCALHit.h"
  47 #include "AliEMCALDigit.h"
  48 #include "AliEMCALRecPoint.h"
  49 #include "AliCaloCalibPedestal.h"
  50 #include "AliEMCALGeoParams.h"
  51
  52 ClassImp(AliEMCALRecPoint)
  53
  54 //____________________________________________________________________________
  55 AliEMCALRecPoint::AliEMCALRecPoint()
  56   : AliCluster(), fGeomPtr(0),
  57     fAmp(0), fIndexInList(-1), //to be set when the point is already stored
  58     fGlobPos(0,0,0),fLocPos(0,0,0),
  59     fMaxDigit(100), fMulDigit(0), fMaxTrack(200),
  60     fMulTrack(0), fDigitsList(0), fTracksList(0),
  61     fClusterType(-1), fCoreEnergy(0), fDispersion(0),
  62     fEnergyList(0), fAbsIdList(0),
  63     fTime(0.), fNExMax(0), fCoreRadius(10),  //HG check this
  64     fDETracksList(0), fMulParent(0), fMaxParent(0),
  65     fParentsList(0), fDEParentsList(0), fSuperModuleNumber(0),
  66     fDigitIndMax(-1), fDistToBadTower(-1), fSharedCluster(kFALSE)
  67 {
  68   // ctor
  69   fGeomPtr = AliEMCALGeometry::GetInstance();
  70
  71   fLambda[0] = 0;
  72   fLambda[1] = 0;
  73
  74 }
  75
  76 //____________________________________________________________________________
  77 AliEMCALRecPoint::AliEMCALRecPoint(const char *)
  78   : AliCluster(), fGeomPtr(0),
  79     fAmp(0), fIndexInList(-1), //to be set when the point is already stored
  80     fGlobPos(0,0,0), fLocPos(0,0,0),
  81     fMaxDigit(100), fMulDigit(0), fMaxTrack(1000), fMulTrack(0),
  82     fDigitsList(new Int_t[fMaxDigit]), fTracksList(new Int_t[fMaxTrack]),
  83     fClusterType(-1), fCoreEnergy(0), fDispersion(0),
  84     fEnergyList(new Float_t[fMaxDigit]),
  85     fAbsIdList(new Int_t[fMaxDigit]), fTime(-1.), fNExMax(0), fCoreRadius(10),
  86     fDETracksList(new Float_t[fMaxTrack]), fMulParent(0), fMaxParent(1000),
  87     fParentsList(new Int_t[fMaxParent]), fDEParentsList(new Float_t[fMaxParent]),
  88     fSuperModuleNumber(0), fDigitIndMax(-1), fDistToBadTower(-1),fSharedCluster(kFALSE)
  89 {
  90   // ctor
  91   for (Int_t i = 0; i < fMaxTrack; i++)
  92     fDETracksList[i] = 0;
  93   for (Int_t i = 0; i < fMaxParent; i++) {
  94     fParentsList[i] = -1;
  95     fDEParentsList[i] = 0;
  96   }
  97
  98   fGeomPtr = AliEMCALGeometry::GetInstance();
  99   fLambda[0] = 0;
 100   fLambda[1] = 0;
 101 }
 102
 103 //____________________________________________________________________________
 104 AliEMCALRecPoint::AliEMCALRecPoint(const AliEMCALRecPoint & rp)
 105   : AliCluster(rp), fGeomPtr(rp.fGeomPtr),
 106     fAmp(rp.fAmp), fIndexInList(rp.fIndexInList),
 107     fGlobPos(rp.fGlobPos),fLocPos(rp.fLocPos),
 108     fMaxDigit(rp.fMaxDigit), fMulDigit(rp.fMulDigit),
 109     fMaxTrack(rp.fMaxTrack), fMulTrack(rp.fMaxTrack),
 110     fDigitsList(new Int_t[rp.fMaxDigit]), fTracksList(new Int_t[rp.fMaxTrack]),
 111     fClusterType(rp.fClusterType), fCoreEnergy(rp.fCoreEnergy),
 112     fDispersion(rp.fDispersion),
 113     fEnergyList(new Float_t[rp.fMaxDigit]),
 114     fAbsIdList(new Int_t[rp.fMaxDigit]), fTime(rp.fTime), fNExMax(rp.fNExMax),fCoreRadius(rp.fCoreRadius),
 115     fDETracksList(new Float_t[rp.fMaxTrack]), fMulParent(rp.fMulParent),
 116     fMaxParent(rp.fMaxParent), fParentsList(new Int_t[rp.fMaxParent]),
 117     fDEParentsList(new Float_t[rp.fMaxParent]),
 118     fSuperModuleNumber(rp.fSuperModuleNumber), fDigitIndMax(rp.fDigitIndMax),
 119     fDistToBadTower(rp.fDistToBadTower), fSharedCluster(rp.fSharedCluster)
 120 {
 121   //copy ctor
 122   fLambda[0] = rp.fLambda[0];
 123   fLambda[1] = rp.fLambda[1];
 124
 125   for(Int_t i = 0; i < rp.fMulDigit; i++) {
 126     fEnergyList[i] = rp.fEnergyList[i];
 127     fAbsIdList[i]  = rp.fAbsIdList[i];
 128   }
 129
 130   for(Int_t i = 0; i < rp.fMulTrack; i++) fDETracksList[i] = rp.fDETracksList[i];
 131
 132   for(Int_t i = 0; i < rp.fMulParent; i++) {
 133     fParentsList[i] = rp.fParentsList[i];
 134     fDEParentsList[i] = rp.fDEParentsList[i];
 135   }
 136
 137 }
 138 //____________________________________________________________________________
 139 AliEMCALRecPoint::~AliEMCALRecPoint()
 140 {
 141   // dtor
 142   if ( fEnergyList )
 143     delete[] fEnergyList ;
 144   if ( fAbsIdList )
 145     delete[] fAbsIdList ;
 146    if ( fDETracksList)
 147     delete[] fDETracksList;
 148    if ( fParentsList)
 149     delete[] fParentsList;
 150    if ( fDEParentsList)
 151     delete[] fDEParentsList;
 152
 153    delete [] fDigitsList ;
 154    delete [] fTracksList ;
 155 }
 156
 157 //____________________________________________________________________________
 158 AliEMCALRecPoint& AliEMCALRecPoint::operator= (const AliEMCALRecPoint &rp)
 159 {
 160   // assignment operator
 161
 162   if(&rp == this) return *this;
 163
 164   fGeomPtr     = rp.fGeomPtr;
 165   fAmp         = rp.fAmp;
 166   fIndexInList = rp.fIndexInList;
 167   fGlobPos     = rp.fGlobPos;
 168   fLocPos      = rp.fLocPos;
 169   fMaxDigit    = rp.fMaxDigit;
 170   fMulDigit    = rp.fMulDigit;
 171   fMaxTrack    = rp.fMaxTrack;
 172   fMulTrack    = rp.fMulTrack;
 173
 174   if(fDigitsList) delete [] fDigitsList;
 175   fDigitsList = new Int_t[rp.fMaxDigit];
 176   if(fTracksList) delete [] fTracksList;
 177   fTracksList = new Int_t[rp.fMaxTrack];
 178   for(Int_t i = 0; i<fMaxDigit; i++) fDigitsList[i] = rp.fDigitsList[i];
 179   for(Int_t i = 0; i<fMaxTrack; i++) fTracksList[i] = rp.fTracksList[i];
 180
 181   fClusterType = rp.fClusterType;
 182   fCoreEnergy  = rp.fCoreEnergy;
 183   fDispersion  = rp.fDispersion;
 184
 185
 186   if(fEnergyList) delete [] fEnergyList;
 187   fEnergyList = new Float_t[rp.fMaxDigit];
 188   if(fAbsIdList) delete [] fAbsIdList;
 189   fAbsIdList = new Int_t[rp.fMaxDigit];
 190   for(Int_t i = 0; i<fMaxDigit; i++) {
 191     fEnergyList[i] = rp.fEnergyList[i];
 192     fAbsIdList[i]  = rp.fAbsIdList[i];
 193   }
 194
 195   fTime       = rp.fTime;
 196   fNExMax     = rp.fNExMax;
 197   fCoreRadius = rp.fCoreRadius;
 198
 199   if(fDETracksList) delete [] fDETracksList;
 200   fDETracksList = new Float_t[rp.fMaxTrack];
 201   for(Int_t i = 0; i < fMaxTrack; i++) fDETracksList[i] = rp.fDETracksList[i];
 202
 203   fMulParent = rp.fMulParent;
 204   fMaxParent = rp.fMaxParent;
 205
 206   if(fParentsList) delete [] fParentsList;
 207   fParentsList = new Int_t[rp.fMaxParent];
 208   if(fDEParentsList) delete [] fDEParentsList;
 209   fDEParentsList = new Float_t[rp.fMaxParent];
 210   for(Int_t i = 0; i < fMaxParent; i++) {
 211     fParentsList[i]   = rp.fParentsList[i];
 212     fDEParentsList[i] = rp.fDEParentsList[i];
 213   }
 214
 215   fSuperModuleNumber = rp.fSuperModuleNumber;
 216   fDigitIndMax       = rp.fDigitIndMax;
 217
 218   fLambda[0] = rp.fLambda[0];
 219   fLambda[1] = rp.fLambda[1];
 220
 221   fDistToBadTower = rp.fDistToBadTower;
 222   fSharedCluster  = rp.fSharedCluster;
 223
 224   return *this;
 225
 226 }
 227
 228 //____________________________________________________________________________
 229 void AliEMCALRecPoint::AddDigit(AliEMCALDigit & digit, const Float_t energy, const Bool_t shared)
 230 {
 231   // Adds a digit to the RecPoint
 232   // and accumulates the total amplitude and the multiplicity
 233
 234   if(fEnergyList == 0)
 235     fEnergyList =  new Float_t[fMaxDigit];
 236
 237   if(fAbsIdList == 0) {
 238     fAbsIdList  =  new Int_t  [fMaxDigit];
 239   }
 240
 241   if ( fMulDigit >= fMaxDigit ) { // increase the size of the lists
 242     fMaxDigit*=2 ;
 243     Int_t   * tempo   = new Int_t  [fMaxDigit];
 244     Float_t * tempoE  = new Float_t[fMaxDigit];
 245     Int_t   * tempoId = new Int_t  [fMaxDigit];
 246
 247     Int_t index ;
 248     for ( index = 0 ; index < fMulDigit ; index++ ){
 249       tempo  [index] = fDigitsList[index] ;
 250       tempoE [index] = fEnergyList[index] ;
 251       tempoId[index] = fAbsIdList [index] ;
 252     }
 253
 254     delete [] fDigitsList ;
 255     delete [] fEnergyList ;
 256     delete [] fAbsIdList ;
 257
 258     fDigitsList = tempo;
 259     fEnergyList = tempoE;
 260     fAbsIdList  = tempoId;
 261   } // if
 262
 263   fDigitsList[fMulDigit]   = digit.GetIndexInList()  ;
 264   fEnergyList[fMulDigit]   = energy ;
 265   fAbsIdList [fMulDigit]   = digit.GetId();
 266   fMulDigit++ ;
 267   fAmp += energy ;
 268
 269   if(shared) fSharedCluster = kTRUE;
 270 }
 271 //____________________________________________________________________________
 272 Bool_t AliEMCALRecPoint::AreNeighbours(AliEMCALDigit * digit1, AliEMCALDigit * digit2 ) const
 273 {
 274   // Tells if (true) or not (false) two digits are neighbours
 275   // A neighbour is defined as being two digits which share a corner
 276   // ONLY USED IN CASE OF UNFOLDING
 277
 278   Bool_t areNeighbours = kFALSE ;
 279   Int_t nSupMod=0, nModule=0, nIphi=0, nIeta=0;
 280   Int_t nSupMod1=0, nModule1=0, nIphi1=0, nIeta1=0;
 281   Int_t relid1[2] , relid2[2] ; // ieta, iphi
 282   Int_t rowdiff=0, coldiff=0;
 283
 284   areNeighbours = kFALSE ;
 285
 286   fGeomPtr->GetCellIndex(digit1->GetId(), nSupMod,nModule,nIphi,nIeta);
 287   fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nModule,nIphi,nIeta, relid1[0],relid1[1]);
 288
 289   fGeomPtr->GetCellIndex(digit2->GetId(), nSupMod1,nModule1,nIphi1,nIeta1);
 290   fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod1,nModule1,nIphi1,nIeta1, relid2[0],relid2[1]);
 291
 292   // In case of a shared cluster, index of SM in C side, columns start at 48 and ends at 48*2-1
 293   // C Side impair SM, nSupMod%2=1; A side pair SM nSupMod%2=0
 294   if(fSharedCluster){
 295     if(nSupMod1%2) relid1[1]+=AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
 296     else           relid2[1]+=AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
 297   }
 298
 299   rowdiff = TMath::Abs( relid1[0] - relid2[0] ) ;
 300   coldiff = TMath::Abs( relid1[1] - relid2[1] ) ;
 301
 302   if (( coldiff <= 1 )  && ( rowdiff <= 1 ) && (coldiff + rowdiff > 0))
 303   areNeighbours = kTRUE ;
 304
 305   return areNeighbours;
 306 }
 307
 308 //____________________________________________________________________________
 309 Int_t AliEMCALRecPoint::Compare(const TObject * obj) const
 310 {
 311   // Compares two RecPoints according to their position in the EMCAL modules
 312
 313   Float_t delta = 1 ; //Width of "Sorting row".
 314
 315   Int_t rv = 2 ;
 316
 317   AliEMCALRecPoint * clu = (AliEMCALRecPoint *)obj ;
 318
 319   TVector3 locpos1;
 320   GetLocalPosition(locpos1);
 321   TVector3 locpos2;
 322   clu->GetLocalPosition(locpos2);
 323
 324   Int_t rowdif = (Int_t)(TMath::Ceil(locpos1.X()/delta)-TMath::Ceil(locpos2.X()/delta)) ;
 325   if (rowdif> 0)
 326     rv = 1 ;
 327   else if(rowdif < 0)
 328     rv = -1 ;
 329   else if(locpos1.Y()>locpos2.Y())
 330     rv = -1 ;
 331   else
 332     rv = 1 ;
 333
 334   return rv ;
 335 }
 336
 337 //___________________________________________________________________________
 338  void AliEMCALRecPoint::Draw(Option_t *option)
 339  {
 340    // Draw this AliEMCALRecPoint with its current attributes
 341
 342    AppendPad(option);
 343  }
 344
 345 //____________________________________________________________________________
 346 void AliEMCALRecPoint::EvalAll(Float_t logWeight,TClonesArray * digits, const Bool_t justClusters)
 347 {
 348   // Evaluates cluster parameters
 349
 350   // First calculate the index of digit with maximum amplitude and get
 351   // the supermodule number where it sits.
 352
 353   fDigitIndMax       = GetMaximalEnergyIndex();
 354   fSuperModuleNumber = fGeomPtr->GetSuperModuleNumber(GetAbsIdMaxDigit());
 355
 356   //Evaluate global and local position
 357   EvalGlobalPosition(logWeight, digits) ;
 358   EvalLocalPosition(logWeight, digits) ;
 359
 360   //Evaluate shower parameters
 361   EvalElipsAxis(logWeight, digits) ;
 362   EvalDispersion(logWeight, digits) ;
 363
 364   //EvalCoreEnergy(logWeight, digits);
 365   EvalTime(digits) ;
 366   EvalPrimaries(digits) ;
 367   EvalParents(digits);
 368
 369   //Called last because it sets the global position of the cluster?
 370   //Do not call it when recalculating clusters out of standard reconstruction
 371   if(!justClusters){
 372     EvalLocal2TrackingCSTransform();
 373   }
 374
 375 }
 376
 377 //____________________________________________________________________________
 378 void  AliEMCALRecPoint::EvalDispersion(Float_t logWeight, TClonesArray * digits)
 379 {
 380   // Calculates the dispersion of the shower at the origin of the RecPoint
 381   // in cell units - Nov 16,2006
 382
 383   Double_t d = 0., wtot = 0., w = 0.;
 384   Int_t iDigit=0, nstat=0;
 385   AliEMCALDigit * digit=0;
 386
 387   // Calculates the dispersion in cell units
 388   Double_t etai, phii, etaMean=0.0, phiMean=0.0;
 389   int nSupMod=0, nModule=0, nIphi=0, nIeta=0;
 390   int iphi=0, ieta=0;
 391   // Calculate mean values
 392   for(iDigit=0; iDigit < fMulDigit; iDigit++) {
 393     digit = (AliEMCALDigit *) digits->At(fDigitsList[iDigit])  ;
 394
 395     if (fAmp>0 && fEnergyList[iDigit]>0) {
 396       fGeomPtr->GetCellIndex(digit->GetId(), nSupMod,nModule,nIphi,nIeta);
 397       fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nModule,nIphi,nIeta, iphi,ieta);
 398
 399       // In case of a shared cluster, index of SM in C side, columns start at 48 and ends at 48*2
 400       // C Side impair SM, nSupMod%2=1; A side pair SM nSupMod%2=0
 401       if(fSharedCluster && nSupMod%2) ieta+=AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
 402
 403       etai=(Double_t)ieta;
 404       phii=(Double_t)iphi;
 405       w = TMath::Max(0.,logWeight+TMath::Log(fEnergyList[iDigit]/fAmp ) ) ;
 406
 407       if(w>0.0) {
 408         phiMean += phii*w;
 409         etaMean += etai*w;
 410         wtot    += w;
 411       }
 412     }
 413   }
 414   if (wtot>0) {
 415     phiMean /= wtot ;
 416     etaMean /= wtot ;
 417   } else AliError(Form("Wrong weight %f\n", wtot));
 418
 419   // Calculate dispersion
 420   for(iDigit=0; iDigit < fMulDigit; iDigit++) {
 421     digit = (AliEMCALDigit *) digits->At(fDigitsList[iDigit])  ;
 422
 423     if (fAmp>0 && fEnergyList[iDigit]>0) {
 424       fGeomPtr->GetCellIndex(digit->GetId(), nSupMod,nModule,nIphi,nIeta);
 425       fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nModule,nIphi,nIeta, iphi,ieta);
 426
 427       // In case of a shared cluster, index of SM in C side, columns start at 48 and ends at 48*2
 428       // C Side impair SM, nSupMod%2=1; A side pair SM, nSupMod%2=0
 429       if(fSharedCluster && nSupMod%2) ieta+=AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
 430
 431       etai=(Double_t)ieta;
 432       phii=(Double_t)iphi;
 433       w = TMath::Max(0.,logWeight+TMath::Log(fEnergyList[iDigit]/fAmp ) ) ;
 434
 435       if(w>0.0) {
 436         nstat++;
 437         d += w*((etai-etaMean)*(etai-etaMean)+(phii-phiMean)*(phii-phiMean));
 438       }
 439     }
 440   }
 441
 442   if ( wtot > 0 && nstat>1) d /= wtot ;
 443   else                      d = 0. ;
 444
 445   fDispersion = TMath::Sqrt(d) ;
 446   //printf("AliEMCALRecPoint::EvalDispersion() : Dispersion %f \n",fDispersion);
 447 }
 448
 449 //____________________________________________________________________________
 450 void AliEMCALRecPoint::EvalDistanceToBadChannels(AliCaloCalibPedestal* caloped)
 451 {
 452   //For each EMC rec. point set the distance to the nearest bad channel.
 453   //AliInfo(Form("%d bad channel(s) found.\n", caloped->GetDeadTowerCount()));
 454   //It is done in cell units and not in global or local position as before (Sept 2010)
 455
 456   if(!caloped->GetDeadTowerCount()) return;
 457
 458   //Get channels map of the supermodule where the cluster is.
 459   TH2D* hMap  = caloped->GetDeadMap(fSuperModuleNumber);
 460
 461   Int_t dRrow, dReta;
 462   Float_t  minDist = 10000.;
 463   Float_t  dist    = 0.;
 464   Int_t nSupMod, nModule;
 465   Int_t nIphi, nIeta;
 466   Int_t iphi, ieta;
 467   fDigitIndMax  = GetMaximalEnergyIndex();
 468   fGeomPtr->GetCellIndex(fAbsIdList[fDigitIndMax], nSupMod,nModule,nIphi,nIeta);
 469   fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nModule,nIphi,nIeta, iphi,ieta);
 470
 471   //Loop on tower status map
 472   for(Int_t irow = 0; irow < AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows; irow++){
 473     for(Int_t icol = 0; icol < AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols; icol++){
 474       //Check if tower is bad.
 475       if(hMap->GetBinContent(icol,irow)==AliCaloCalibPedestal::kAlive) continue;
 476       //printf("AliEMCALRecPoint::EvalDistanceToBadChannels() - Bad channel in SM %d, col %d, row %d\n",iSM,icol, irow);
 477
 478       dRrow=TMath::Abs(irow-iphi);
 479       dReta=TMath::Abs(icol-ieta);
 480       dist=TMath::Sqrt(dRrow*dRrow+dReta*dReta);
 481       if(dist < minDist) minDist = dist;
 482
 483     }
 484   }
 485
 486   //In case the cluster is shared by 2 SuperModules, need to check the map of the second Super Module
 487   if (fSharedCluster) {
 488     TH2D* hMap2 = 0;
 489     Int_t nSupMod2 = -1;
 490
 491     //The only possible combinations are (0,1), (2,3) ... (10,11)
 492     if(fSuperModuleNumber%2) nSupMod2 = fSuperModuleNumber-1;
 493     else                     nSupMod2 = fSuperModuleNumber+1;
 494     hMap2  = caloped->GetDeadMap(nSupMod2);
 495
 496     //Loop on tower status map of second super module
 497     for(Int_t irow = 0; irow < AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows; irow++){
 498       for(Int_t icol = 0; icol < AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols; icol++){
 499         //Check if tower is bad.
 500         if(hMap2->GetBinContent(icol,irow)==AliCaloCalibPedestal::kAlive) continue;
 501         //printf("AliEMCALRecPoint::EvalDistanceToBadChannels() - Bad channel in SM %d, col %d, row %d\n",iSM,icol, irow);
 502         dRrow=TMath::Abs(irow-iphi);
 503
 504         if(fSuperModuleNumber%2) {
 505           dReta=TMath::Abs(icol-(AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols+ieta));
 506        }
 507        else {
 508          dReta=TMath::Abs(AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols+icol-ieta);
 509        }
 510
 511        dist=TMath::Sqrt(dRrow*dRrow+dReta*dReta);
 512         if(dist < minDist) minDist = dist;
 513
 514       }
 515     }
 516
 517   }// shared cluster in 2 SuperModules
 518
 519   fDistToBadTower = minDist;
 520   //printf("AliEMCALRecPoint::EvalDistanceToBadChannel() - Distance to Bad is %f cm, shared cluster? %d \n",fDistToBadTower,fSharedCluster);
 521 }
 522
 523
 524 //____________________________________________________________________________
 525 void AliEMCALRecPoint::EvalLocalPosition(Float_t logWeight, TClonesArray * digits)
 526 {
 527   // Calculates the center of gravity in the local EMCAL-module coordinates
 528   //  Info("Print", " logWeight %f : cluster energy %f ", logWeight, fAmp); // for testing
 529
 530   AliEMCALDigit * digit=0;
 531   Int_t i=0, nstat=0;
 532
 533   Double_t dist  = TmaxInCm(Double_t(fAmp));
 534   //Int_t       idMax = GetAbsIdMaxDigit();// idMax is not used at all in RelPosCellInSModule, why use it?
 535
 536   Double_t clXYZ[3]={0.,0.,0.}, clRmsXYZ[3]={0.,0.,0.}, xyzi[3], wtot=0., w=0.;
 537
 538   //printf(" dist : %f  e : %f \n", dist, fAmp);
 539   for(Int_t iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
 540     digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At(fDigitsList[iDigit])) ;
 541
 542     if(!digit) {
 543       AliError("No Digit!!");
 544       continue;
 545     }
 546
 547     fGeomPtr->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), dist, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
 548
 549     //Temporal patch, due to mapping problem, need to swap "y" in one of the 2 SM, although no effect in position calculation. GCB 05/2010
 550     if(fSharedCluster && fSuperModuleNumber != fGeomPtr->GetSuperModuleNumber(digit->GetId())) xyzi[1]*=-1;
 551
 552     //printf("EvalLocalPosition Cell:  Id %i, SM %i : dist %f Local x,y,z %f %f %f \n",
 553     //          digit->GetId(), fGeomPtr->GetSuperModuleNumber(digit->GetId()), dist, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
 554
 555     if(logWeight > 0.0)  w = TMath::Max( 0., logWeight + TMath::Log( fEnergyList[iDigit] / fAmp ));
 556     else  w = fEnergyList[iDigit]; // just energy
 557
 558     if(w>0.0) {
 559       wtot += w ;
 560       nstat++;
 561       for(i=0; i<3; i++ ) {
 562         clXYZ[i]    += (w*xyzi[i]);
 563         clRmsXYZ[i] += (w*xyzi[i]*xyzi[i]);
 564       }
 565     }
 566   }
 567   //  cout << " wtot " << wtot << endl;
 568   if ( wtot > 0 ) {
 569     //    xRMS   = TMath::Sqrt(x2m - xMean*xMean);
 570     for(i=0; i<3; i++ ) {
 571       clXYZ[i] /= wtot;
 572       if(nstat>1) {
 573         clRmsXYZ[i] /= (wtot*wtot);
 574         clRmsXYZ[i]  =  clRmsXYZ[i] - clXYZ[i]*clXYZ[i];
 575         if(clRmsXYZ[i] > 0.0) {
 576           clRmsXYZ[i] =  TMath::Sqrt(clRmsXYZ[i]);
 577         } else      clRmsXYZ[i] = 0;
 578       } else        clRmsXYZ[i] = 0;
 579     }
 580   } else {
 581     for(i=0; i<3; i++ ) {
 582       clXYZ[i] = clRmsXYZ[i] = -1.;
 583     }
 584   }
 585
 586   //    // Cluster of one single digit, smear the position to avoid discrete position
 587   //    // smear x and z with +- 3 cm to uniform (avoid discrete effects). Tower size is approx 6 cm.
 588   //    // Rndm generates a number in ]0,1]
 589   //    if (fMulDigit==1) {
 590   //      clXYZ[0] += fGeomPtr->GetPhiTileSize()*(0.5 - gRandom->Rndm());
 591   //      clXYZ[2] += fGeomPtr->GetEtaTileSize()*(0.5 - gRandom->Rndm());
 592   //    }
 593
 594   //Set position in local vector
 595   fLocPos.SetX(clXYZ[0]);
 596   fLocPos.SetY(clXYZ[1]);
 597   fLocPos.SetZ(clXYZ[2]);
 598
 599   if (gDebug==2)
 600     printf("EvalLocalPosition Cluster: Local (x,y,z) = (%f,%f,%f) \n", fLocPos.X(), fLocPos.Y(), fLocPos.Z()) ;
 601
 602 }
 603
 604
 605 //____________________________________________________________________________
 606 void AliEMCALRecPoint::EvalGlobalPosition(Float_t logWeight, TClonesArray * digits)
 607 {
 608   // Calculates the center of gravity in the global ALICE coordinates
 609   //  Info("Print", " logWeight %f : cluster energy %f ", logWeight, fAmp); // for testing
 610
 611   AliEMCALDigit * digit=0;
 612   Int_t i=0, nstat=0;
 613
 614   Double_t dist  = TmaxInCm(Double_t(fAmp));
 615   //Int_t       idMax = GetAbsIdMaxDigit();// idMax is not used at all in RelPosCellInSModule, why use it?
 616
 617   Double_t clXYZ[3]={0.,0.,0.}, clRmsXYZ[3]={0.,0.,0.}, lxyzi[3], xyzi[3], wtot=0., w=0.;
 618
 619   //printf(" dist : %f  e : %f \n", dist, fAmp);
 620   for(Int_t iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
 621     digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At(fDigitsList[iDigit])) ;
 622
 623     if(!digit) {
 624       AliError("No Digit!!");
 625       continue;
 626     }
 627
 628     //Get the local coordinates of the cell
 629     fGeomPtr->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), dist, lxyzi[0], lxyzi[1], lxyzi[2]);
 630
 631     //Now get the global coordinate
 632     fGeomPtr->GetGlobal(lxyzi,xyzi, fGeomPtr->GetSuperModuleNumber(digit->GetId()));
 633     //TVector3 pos(xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
 634     //printf("EvalGlobalPosition Cell:  Id %i, SM %i : dist %f Local (x,y,z) = (%f %f %f), eta %f, phi%f \n",
 635     //     digit->GetId(), fGeomPtr->GetSuperModuleNumber(digit->GetId()),dist, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2],pos.Eta(),pos.Phi()*TMath::RadToDeg());
 636
 637     if(logWeight > 0.0)  w = TMath::Max( 0., logWeight + TMath::Log( fEnergyList[iDigit] / fAmp ));
 638     else  w = fEnergyList[iDigit]; // just energy
 639
 640     if(w>0.0) {
 641       wtot += w ;
 642       nstat++;
 643       for(i=0; i<3; i++ ) {
 644         clXYZ[i]    += (w*xyzi[i]);
 645         clRmsXYZ[i] += (w*xyzi[i]*xyzi[i]);
 646       }
 647     }
 648   }
 649   //  cout << " wtot " << wtot << endl;
 650   if ( wtot > 0 ) {
 651     //    xRMS   = TMath::Sqrt(x2m - xMean*xMean);
 652     for(i=0; i<3; i++ ) {
 653       clXYZ[i] /= wtot;
 654       if(nstat>1) {
 655         clRmsXYZ[i] /= (wtot*wtot);
 656         clRmsXYZ[i]  =  clRmsXYZ[i] - clXYZ[i]*clXYZ[i];
 657         if(clRmsXYZ[i] > 0.0) {
 658           clRmsXYZ[i] =  TMath::Sqrt(clRmsXYZ[i]);
 659         } else      clRmsXYZ[i] = 0;
 660       } else        clRmsXYZ[i] = 0;
 661     }
 662   } else {
 663     for(i=0; i<3; i++ ) {
 664       clXYZ[i] = clRmsXYZ[i] = -1.;
 665     }
 666   }
 667
 668 //  // Cluster of one single digit, smear the position to avoid discrete position
 669 //  // smear x and z with +- 3 cm to uniform (avoid discrete effects). Tower size is approx 6 cm.
 670 //  // Rndm generates a number in ]0,1]
 671 //  if (fMulDigit==1) {
 672 //    clXYZ[0] += fGeomPtr->GetPhiTileSize()*(0.5 - gRandom->Rndm());
 673 //    clXYZ[2] += fGeomPtr->GetEtaTileSize()*(0.5 - gRandom->Rndm());
 674 //  }
 675
 676   //Set position in global vector
 677   fGlobPos.SetX(clXYZ[0]);
 678   fGlobPos.SetY(clXYZ[1]);
 679   fGlobPos.SetZ(clXYZ[2]);
 680
 681   if (gDebug==2)
 682         printf("EvalGlobalPosition Cluster: (x ,y ,z) = (%f,%f,%f), eta %f,phi %f\n",
 683                    fGlobPos.X(), fGlobPos.Y(), fGlobPos.Z(),fGlobPos.Eta(),fGlobPos.Phi()*TMath::RadToDeg()) ;
 684 }
 685
 686 //____________________________________________________________________________
 687 void AliEMCALRecPoint::EvalLocalPositionFit(Double_t deff, Double_t logWeight,
 688 Double_t phiSlope, TClonesArray * digits)
 689 {
 690   // Evaluates local position of clusters in SM
 691
 692   Double_t ycorr=0;
 693   AliEMCALDigit *digit=0;
 694   Int_t i=0, nstat=0;
 695   Double_t clXYZ[3]={0.,0.,0.}, clRmsXYZ[3]={0.,0.,0.}, xyzi[3], wtot=0., w=0.;
 696
 697   Double_t dist  = TmaxInCm(Double_t(fAmp));
 698   //Int_t       idMax = GetAbsIdMaxDigit();// idMax is not used at all in RelPosCellInSModule, why use it?
 699
 700   for(Int_t iDigit=0; iDigit<digits->GetEntries(); iDigit++) {
 701     digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At(fDigitsList[iDigit])) ;
 702     if(digit){
 703       dist = deff;
 704       //fGeomPtr->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), idMax, dist, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
 705       fGeomPtr->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), dist, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
 706
 707       if(logWeight > 0.0)  w = TMath::Max( 0., logWeight + TMath::Log( fEnergyList[iDigit] / fAmp ));
 708       else                 w = fEnergyList[iDigit]; // just energy
 709
 710       if(w>0.0) {
 711         wtot += w ;
 712         nstat++;
 713         for(i=0; i<3; i++ ) {
 714           clXYZ[i]    += (w*xyzi[i]);
 715           clRmsXYZ[i] += (w*xyzi[i]*xyzi[i]);
 716         }
 717       }
 718     }else AliError("Digit null");
 719   }//loop
 720   //  cout << " wtot " << wtot << endl;
 721   if ( wtot > 0 ) {
 722     //    xRMS   = TMath::Sqrt(x2m - xMean*xMean);
 723     for(i=0; i<3; i++ ) {
 724       clXYZ[i] /= wtot;
 725       if(nstat>1) {
 726         clRmsXYZ[i] /= (wtot*wtot);
 727         clRmsXYZ[i]  =  clRmsXYZ[i] - clXYZ[i]*clXYZ[i];
 728         if(clRmsXYZ[i] > 0.0) {
 729           clRmsXYZ[i] =  TMath::Sqrt(clRmsXYZ[i]);
 730         } else      clRmsXYZ[i] = 0;
 731       } else        clRmsXYZ[i] = 0;
 732     }
 733   } else {
 734     for(i=0; i<3; i++ ) {
 735       clXYZ[i] = clRmsXYZ[i] = -1.;
 736     }
 737   }
 738   // clRmsXYZ[i] ??
 739   if(phiSlope != 0.0 && logWeight > 0.0 && wtot) {
 740     // Correction in phi direction (y - coords here); Aug 16;
 741     // May be put to global level or seperate method
 742     ycorr = clXYZ[1] * (1. + phiSlope);
 743     //printf(" y %f : ycorr %f : slope %f \n", clXYZ[1], ycorr, phiSlope);
 744     clXYZ[1] = ycorr;
 745   }
 746
 747   fLocPos.SetX(clXYZ[0]);
 748   fLocPos.SetY(clXYZ[1]);
 749   fLocPos.SetZ(clXYZ[2]);
 750
 751 //  if (gDebug==2)
 752 //    printf("EvalLocalPosition: eta,phi,r = %f,%f,%f", fLocPos.X(), fLocPos.Y(), fLocPos.Z()) ;
 753 }
 754
 755 //_____________________________________________________________________________
 756 Bool_t AliEMCALRecPoint::EvalLocalPosition2(TClonesArray * digits, TArrayD &ed)
 757 {
 758   // Evaluated local position of rec.point using digits
 759   // and parametrisation of w0 and deff
 760   //printf(" <I> AliEMCALRecPoint::EvalLocalPosition2() \n");
 761   return AliEMCALRecPoint::EvalLocalPositionFromDigits(digits, ed, fLocPos);
 762 }
 763
 764 //_____________________________________________________________________________
 765 Bool_t AliEMCALRecPoint::EvalLocalPositionFromDigits(TClonesArray *digits, TArrayD &ed, TVector3 &locPos)
 766 {
 767   // Used when digits should be recalibrated
 768   Double_t deff=0, w0=0, esum=0;
 769   Int_t iDigit=0;
 770   //  AliEMCALDigit *digit;
 771
 772   if(ed.GetSize() && (digits->GetEntries()!=ed.GetSize())) return kFALSE;
 773
 774   // Calculate sum energy of digits
 775   esum = 0.0;
 776   for(iDigit=0; iDigit<ed.GetSize(); iDigit++) esum += ed[iDigit];
 777
 778   GetDeffW0(esum, deff, w0);
 779
 780   return EvalLocalPositionFromDigits(esum, deff, w0, digits, ed, locPos);
 781 }
 782
 783 //_____________________________________________________________________________
 784 Bool_t AliEMCALRecPoint::EvalLocalPositionFromDigits(const Double_t esum, const Double_t deff, const Double_t w0, TClonesArray *digits, TArrayD &ed, TVector3 &locPos)
 785 {
 786   //Evaluate position of digits in supermodule.
 787   AliEMCALDigit *digit=0;
 788
 789   Int_t i=0, nstat=0;
 790   Double_t clXYZ[3]={0.,0.,0.}, xyzi[3], wtot=0., w=0.;
 791   //Int_t       idMax = GetAbsIdMaxDigit();// idMax is not used at all in RelPosCellInSModule, why use it?
 792
 793   // Get pointer to EMCAL geometry
 794   // (can't use fGeomPtr in static method)
 795   AliEMCALGeometry* geo = AliEMCALGeometry::GetInstance();
 796
 797   for(Int_t iDigit=0; iDigit<digits->GetEntries(); iDigit++) {
 798     digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At(iDigit));
 799     if(digit){
 800       //geo->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), idMax, deff, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
 801       geo->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), deff, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
 802
 803       if(w0 > 0.0)  w = TMath::Max( 0., w0 + TMath::Log(ed[iDigit] / esum));
 804       else          w = ed[iDigit]; // just energy
 805
 806       if(w>0.0) {
 807         wtot += w ;
 808         nstat++;
 809         for(i=0; i<3; i++ ) {
 810           clXYZ[i] += (w*xyzi[i]);
 811         }
 812       }
 813     }else AliError("Digit null");
 814   }//loop
 815   //  cout << " wtot " << wtot << endl;
 816   if (wtot > 0) {
 817     for(i=0; i<3; i++ ) {
 818       clXYZ[i] /= wtot;
 819     }
 820     locPos.SetX(clXYZ[0]);
 821     locPos.SetY(clXYZ[1]);
 822     locPos.SetZ(clXYZ[2]);
 823     return kTRUE;
 824   } else {
 825     return kFALSE;
 826   }
 827
 828 }
 829
 830 //_____________________________________________________________________________
 831 void AliEMCALRecPoint::GetDeffW0(const Double_t esum , Double_t &deff,  Double_t &w0)
 832 {
 833   //
 834   // Aug 31, 2001
 835   // Applied for simulation data with threshold 3 adc
 836   // Calculate efective distance (deff) and weigh parameter (w0)
 837   // for coordinate calculation; 0.5 GeV < esum <100 GeV.
 838   // Look to:  http://rhic.physics.wayne.edu/~pavlinov/ALICE/SHISHKEBAB/RES/CALIB/GEOMCORR/deffandW0VaEgamma_2.gif
 839   //
 840   Double_t e=0.0;
 841   const  Double_t kdp0=9.25147, kdp1=1.16700; // Hard coded now
 842   const  Double_t kwp0=4.83713, kwp1=-2.77970e-01, kwp2 = 4.41116;
 843
 844   // No extrapolation here
 845   e = esum<0.5?0.5:esum;
 846   e = e>100.?100.:e;
 847
 848   deff = kdp0 + kdp1*TMath::Log(e);
 849   w0   = kwp0 / (1. + TMath::Exp(kwp1*(e+kwp2)));
 850   //printf("<I> AliEMCALRecPoint::GetDeffW0 esum %5.2f : deff %5.2f : w0 %5.2f \n", esum, deff, w0);
 851 }
 852
 853 //______________________________________________________________________________
 854 void AliEMCALRecPoint::EvalCoreEnergy(Float_t logWeight, TClonesArray * digits)
 855 {
 856   // This function calculates energy in the core,
 857   // i.e. within a radius rad = fCoreEnergy around the center. Beyond this radius
 858   // in accordance with shower profile the energy deposition
 859   // should be less than 2%
 860   // Unfinished - Nov 15,2006
 861   // Distance is calculate in (phi,eta) units
 862
 863   AliEMCALDigit * digit = 0 ;
 864
 865   Int_t iDigit=0;
 866
 867   if (!fLocPos.Mag()) {
 868     EvalLocalPosition(logWeight, digits);
 869   }
 870
 871   Double_t phiPoint = fLocPos.Phi(), etaPoint = fLocPos.Eta();
 872   Double_t eta, phi, distance;
 873   for(iDigit=0; iDigit < fMulDigit; iDigit++) {
 874     digit = (AliEMCALDigit *) ( digits->At(fDigitsList[iDigit]) ) ;
 875
 876     eta = phi = 0.0;
 877     fGeomPtr->EtaPhiFromIndex(digit->GetId(),eta, phi) ;
 878     phi = phi * TMath::DegToRad();
 879
 880     distance = TMath::Sqrt((eta-etaPoint)*(eta-etaPoint)+(phi-phiPoint)*(phi-phiPoint));
 881     if(distance < fCoreRadius)
 882       fCoreEnergy += fEnergyList[iDigit] ;
 883   }
 884
 885 }
 886 //____________________________________________________________________________
 887 void  AliEMCALRecPoint::EvalElipsAxis(Float_t logWeight,TClonesArray * digits)
 888 {
 889   // Calculates the axis of the shower ellipsoid in eta and phi
 890   // in cell units
 891
 892   TString gn(fGeomPtr->GetName());
 893
 894   Double_t wtot = 0.;
 895   Double_t x    = 0.;
 896   Double_t z    = 0.;
 897   Double_t dxx  = 0.;
 898   Double_t dzz  = 0.;
 899   Double_t dxz  = 0.;
 900
 901   AliEMCALDigit * digit = 0;
 902
 903   Double_t etai =0, phii=0, w=0;
 904   int nSupMod=0, nModule=0, nIphi=0, nIeta=0;
 905   int iphi=0, ieta=0;
 906   for(Int_t iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
 907     digit = (AliEMCALDigit *) digits->At(fDigitsList[iDigit])  ;
 908     etai = phii = 0.;
 909     // Nov 15,2006 - use cell numbers as coordinates
 910     // Copied for shish-kebab geometry, ieta,iphi is cast as double as eta,phi
 911     // We can use the eta,phi(or coordinates) of cell
 912     nSupMod = nModule = nIphi = nIeta = iphi = ieta = 0;
 913
 914     fGeomPtr->GetCellIndex(digit->GetId(), nSupMod,nModule,nIphi,nIeta);
 915     fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nModule,nIphi,nIeta, iphi,ieta);
 916
 917     // In case of a shared cluster, index of SM in C side, columns start at 48 and ends at 48*2
 918     // C Side impair SM, nSupMod%2=1; A side pair SM, nSupMod%2=0
 919     if(fSharedCluster && nSupMod%2) ieta+=AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
 920
 921     etai=(Double_t)ieta;
 922     phii=(Double_t)iphi;
 923
 924     w = TMath::Max(0.,logWeight+TMath::Log(fEnergyList[iDigit]/fAmp ) ) ;
 925     // fAmp summed amplitude of digits, i.e. energy of recpoint
 926     // Gives smaller value of lambda than log weight
 927     // w = fEnergyList[iDigit] / fAmp; // Nov 16, 2006 - try just energy
 928
 929     dxx  += w * etai * etai ;
 930     x    += w * etai ;
 931     dzz  += w * phii * phii ;
 932     z    += w * phii ;
 933
 934     dxz  += w * etai * phii ;
 935
 936     wtot += w ;
 937   }
 938
 939   if ( wtot > 0 ) {
 940     dxx /= wtot ;
 941     x   /= wtot ;
 942     dxx -= x * x ;
 943     dzz /= wtot ;
 944     z   /= wtot ;
 945     dzz -= z * z ;
 946     dxz /= wtot ;
 947     dxz -= x * z ;
 948
 949     fLambda[0] =  0.5 * (dxx + dzz) + TMath::Sqrt( 0.25 * (dxx - dzz) * (dxx - dzz) + dxz * dxz )  ;
 950     if(fLambda[0] > 0)
 951       fLambda[0] = TMath::Sqrt(fLambda[0]) ;
 952     else
 953       fLambda[0] = 0;
 954
 955     fLambda[1] =  0.5 * (dxx + dzz) - TMath::Sqrt( 0.25 * (dxx - dzz) * (dxx - dzz) + dxz * dxz )  ;
 956
 957     if(fLambda[1] > 0) //To avoid exception if numerical errors lead to negative lambda.
 958       fLambda[1] = TMath::Sqrt(fLambda[1]) ;
 959     else
 960       fLambda[1]= 0. ;
 961   } else {
 962     fLambda[0]= 0. ;
 963     fLambda[1]= 0. ;
 964   }
 965
 966   //printf("AliEMCALRecPoint::EvalElipsAxis() lambdas  = %f,%f \n", fLambda[0],fLambda[1]) ;
 967
 968 }
 969
 970 //______________________________________________________________________________
 971 void  AliEMCALRecPoint::EvalPrimaries(TClonesArray * digits)
 972 {
 973   // Constructs the list of primary particles (tracks) which
 974   // have contributed to this RecPoint and calculate deposited energy
 975   // for each track
 976
 977   AliEMCALDigit * digit =0;
 978   Int_t * primArray = new Int_t[fMaxTrack] ;
 979   memset(primArray,-1,sizeof(Int_t)*fMaxTrack);
 980   Float_t * dEPrimArray = new Float_t[fMaxTrack] ;
 981   memset(dEPrimArray,-1,sizeof(Int_t)*fMaxTrack);
 982
 983   Int_t index ;
 984   for ( index = 0 ; index < GetDigitsMultiplicity() ; index++ ) { // all digits
 985     digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At( fDigitsList[index] )) ;
 986     if(!digit) {
 987       AliError("No Digit!!");
 988       continue;
 989     }
 990
 991     Int_t nprimaries = digit->GetNprimary() ;
 992     if ( nprimaries == 0 ) continue ;
 993     Int_t jndex ;
 994     for ( jndex = 0 ; jndex < nprimaries ; jndex++ ) { // all primaries in digit
 995       if ( fMulTrack > fMaxTrack ) {
 996         fMulTrack = fMaxTrack ;
 997         Error("EvalPrimaries", "increase fMaxTrack ")  ;
 998         break ;
 999       }
1000       Int_t newPrimary = digit->GetPrimary(jndex+1);
1001       Float_t dEPrimary = digit->GetDEPrimary(jndex+1);
1002       Int_t kndex ;
1003       Bool_t already = kFALSE ;
1004       for ( kndex = 0 ; kndex < fMulTrack ; kndex++ ) { //check if not already stored
1005         if ( newPrimary == primArray[kndex] ){
1006           already = kTRUE ;
1007           dEPrimArray[kndex] += dEPrimary;
1008           break ;
1009         }
1010       } // end of check
1011       if ( !already && (fMulTrack < fMaxTrack)) { // store it
1012         primArray[fMulTrack] = newPrimary ;
1013         dEPrimArray[fMulTrack] = dEPrimary ;
1014         fMulTrack++ ;
1015       } // store it
1016     } // all primaries in digit
1017   } // all digits
1018
1019   Int_t *sortIdx = new Int_t[fMulTrack];
1020   TMath::Sort(fMulTrack,dEPrimArray,sortIdx);
1021   for(index = 0; index < fMulTrack; index++) {
1022     fTracksList[index] = primArray[sortIdx[index]] ;
1023     fDETracksList[index] = dEPrimArray[sortIdx[index]] ;
1024   }
1025   delete [] sortIdx;
1026   delete [] primArray ;
1027   delete [] dEPrimArray ;
1028
1029 }
1030
1031 //______________________________________________________________________________
1032 void  AliEMCALRecPoint::EvalParents(TClonesArray * digits)
1033 {
1034   // Constructs the list of parent particles (tracks) which have contributed to this RecPoint
1035
1036   AliEMCALDigit * digit=0 ;
1037   Int_t * parentArray = new Int_t[fMaxTrack] ;
1038   memset(parentArray,-1,sizeof(Int_t)*fMaxTrack);
1039   Float_t * dEParentArray = new Float_t[fMaxTrack] ;
1040   memset(dEParentArray,-1,sizeof(Int_t)*fMaxTrack);
1041
1042   Int_t index ;
1043   for ( index = 0 ; index < GetDigitsMultiplicity() ; index++ ) { // all digits
1044     if (fDigitsList[index] >= digits->GetEntries() || fDigitsList[index] < 0)
1045       AliError(Form("Trying to get invalid digit %d (idx in WriteRecPoint %d)",fDigitsList[index],index));
1046     digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At( fDigitsList[index] )) ;
1047     if(!digit) {
1048       AliError("No Digit!!");
1049       continue;
1050     }
1051
1052     Int_t nparents = digit->GetNiparent() ;
1053     if ( nparents == 0 ) continue ;
1054
1055     Int_t jndex ;
1056     for ( jndex = 0 ; jndex < nparents ; jndex++ ) { // all primaries in digit
1057       if ( fMulParent > fMaxParent ) {
1058         fMulTrack = - 1 ;
1059         Error("EvalParents", "increase fMaxParent")  ;
1060         break ;
1061       }
1062       Int_t newParent = digit->GetIparent(jndex+1) ;
1063       Float_t newdEParent = digit->GetDEParent(jndex+1) ;
1064       Int_t kndex ;
1065       Bool_t already = kFALSE ;
1066       for ( kndex = 0 ; kndex < fMulParent ; kndex++ ) { //check if not already stored
1067         if ( newParent == parentArray[kndex] ){
1068           dEParentArray[kndex] += newdEParent;
1069           already = kTRUE ;
1070           break ;
1071         }
1072       } // end of check
1073       if ( !already && (fMulParent < fMaxParent)) { // store it
1074         parentArray[fMulParent] = newParent ;
1075         dEParentArray[fMulParent] = newdEParent ;
1076         fMulParent++ ;
1077       } // store it
1078     } // all parents in digit
1079   } // all digits
1080
1081   if (fMulParent>0) {
1082     Int_t *sortIdx = new Int_t[fMulParent];
1083     TMath::Sort(fMulParent,dEParentArray,sortIdx);
1084     for(index = 0; index < fMulParent; index++) {
1085       fParentsList[index] = parentArray[sortIdx[index]] ;
1086       fDEParentsList[index] = dEParentArray[sortIdx[index]] ;
1087     }
1088     delete [] sortIdx;
1089   }
1090
1091   delete [] parentArray;
1092   delete [] dEParentArray;
1093 }
1094
1095 //____________________________________________________________________________
1096 void AliEMCALRecPoint::GetLocalPosition(TVector3 & lpos) const
1097 {
1098   // returns the position of the cluster in the local reference system
1099   // of the sub-detector
1100
1101   lpos = fLocPos;
1102 }
1103
1104 //____________________________________________________________________________
1105 void AliEMCALRecPoint::GetGlobalPosition(TVector3 & gpos) const
1106 {
1107   // returns the position of the cluster in the global reference system of ALICE
1108   // These are now the Cartesian X, Y and Z
1109   //  cout<<" geom "<<geom<<endl;
1110   // fGeomPtr->GetGlobal(fLocPos, gpos, fSuperModuleNumber);
1111   gpos = fGlobPos;
1112
1113 }
1114
1115 //____________________________________________________________________________
1116 //void AliEMCALRecPoint::GetGlobalPosition(TVector3 & gpos, TMatrixF & gmat) const
1117 //{
1118 //  // returns the position of the cluster in the global reference system of ALICE
1119 //  // These are now the Cartesian X, Y and Z
1120 //  //  cout<<" geom "<<geom<<endl;
1121 //
1122 //  //To be implemented
1123 //  fGeomPtr->GetGlobalEMCAL(this, gpos, gmat);
1124 //
1125 //}
1126
1127 //_____________________________________________________________________________
1128 void AliEMCALRecPoint::EvalLocal2TrackingCSTransform()
1129 {
1130   //Evaluates local to "tracking" c.s. transformation (B.P.).
1131   //All evaluations should be completed before calling for this
1132   //function.
1133   //See ALICE PPR Chapter 5 p.18 for "tracking" c.s. definition,
1134   //or just ask Jouri Belikov. :)
1135
1136   SetVolumeId(AliGeomManager::LayerToVolUID(AliGeomManager::kEMCAL,GetSuperModuleNumber()));
1137
1138   const TGeoHMatrix* tr2loc = GetTracking2LocalMatrix();
1139   if(!tr2loc) AliFatal(Form("No Tracking2LocalMatrix found."));
1140
1141   Double_t lxyz[3] = {fLocPos.X(),fLocPos.Y(),fLocPos.Z()};
1142   Double_t txyz[3] = {0,0,0};
1143
1144   tr2loc->MasterToLocal(lxyz,txyz);
1145   SetX(txyz[0]); SetY(txyz[1]); SetZ(txyz[2]);
1146
1147   if(AliLog::GetGlobalDebugLevel()>0) {
1148     TVector3 gpos; //TMatrixF gmat;
1149     //GetGlobalPosition(gpos,gmat); //Not doing anythin special, replace by next line.
1150     fGeomPtr->GetGlobal(fLocPos, gpos, GetSuperModuleNumber());
1151
1152     Float_t gxyz[3];
1153     GetGlobalXYZ(gxyz);
1154     AliInfo(Form("lCS-->(%.3f,%.3f,%.3f), tCS-->(%.3f,%.3f,%.3f), gCS-->(%.3f,%.3f,%.3f),  gCScalc-\
1155 ->(%.3f,%.3f,%.3f), supermodule %d",
1156                  fLocPos.X(),fLocPos.Y(),fLocPos.Z(),
1157                  GetX(),GetY(),GetZ(),
1158                  gpos.X(),gpos.Y(),gpos.Z(),
1159                  gxyz[0],gxyz[1],gxyz[2],GetSuperModuleNumber()));
1160   }
1161
1162 }
1163
1164 //____________________________________________________________________________
1165 Float_t AliEMCALRecPoint::GetMaximalEnergy(void) const
1166 {
1167   // Finds the maximum energy in the cluster
1168
1169   Float_t menergy = 0. ;
1170
1171   Int_t iDigit;
1172   for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
1173
1174     if(fEnergyList[iDigit] > menergy)
1175       menergy = fEnergyList[iDigit] ;
1176   }
1177   return menergy ;
1178 }
1179
1180 //____________________________________________________________________________
1181 Int_t AliEMCALRecPoint::GetMaximalEnergyIndex(void) const
1182 {
1183   // Finds the maximum energy in the cluster
1184
1185   Float_t menergy = 0. ;
1186   Int_t mid       = 0  ;
1187   Int_t iDigit;
1188
1189   for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
1190
1191     if(fEnergyList[iDigit] > menergy){
1192       menergy = fEnergyList[iDigit] ;
1193       mid     = iDigit ;
1194     }
1195   }//loop on cluster digits
1196
1197   return mid ;
1198 }
1199
1200
1201 //____________________________________________________________________________
1202 Int_t AliEMCALRecPoint::GetMultiplicityAtLevel(Float_t H) const
1203 {
1204   // Calculates the multiplicity of digits with energy larger than H*energy
1205
1206   Int_t multipl   = 0 ;
1207   Int_t iDigit ;
1208   for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
1209
1210     if(fEnergyList[iDigit] > H * fAmp)
1211       multipl++ ;
1212   }
1213   return multipl ;
1214 }
1215
1216 //____________________________________________________________________________
1217 Int_t  AliEMCALRecPoint::GetNumberOfLocalMax(AliEMCALDigit **  maxAt, Float_t * maxAtEnergy,
1218                                                Float_t locMaxCut,TClonesArray * digits) const
1219 {
1220   // Calculates the number of local maxima in the cluster using fLocalMaxCut as the minimum
1221   // energy difference between two local maxima
1222
1223   AliEMCALDigit * digit  = 0;
1224   AliEMCALDigit * digitN = 0;
1225
1226   Int_t iDigitN = 0 ;
1227   Int_t iDigit  = 0 ;
1228
1229   for(iDigit = 0; iDigit < fMulDigit; iDigit++)
1230     maxAt[iDigit] = (AliEMCALDigit*) digits->At(fDigitsList[iDigit])  ;
1231
1232   for(iDigit = 0 ; iDigit < fMulDigit; iDigit++) {
1233     if(maxAt[iDigit]) {
1234       digit = maxAt[iDigit] ;
1235
1236       for(iDigitN = 0; iDigitN < fMulDigit; iDigitN++) {
1237         digitN = (AliEMCALDigit *) digits->At(fDigitsList[iDigitN]) ;
1238
1239         if ( AreNeighbours(digit, digitN) ) {
1240           if (fEnergyList[iDigit] > fEnergyList[iDigitN] ) {
1241             maxAt[iDigitN] = 0 ;
1242             // but may be digit too is not local max ?
1243             if(fEnergyList[iDigit] < fEnergyList[iDigitN] + locMaxCut)
1244               maxAt[iDigit] = 0 ;
1245           }
1246           else {
1247             maxAt[iDigit] = 0 ;
1248             // but may be digitN too is not local max ?
1249             if(fEnergyList[iDigit] > fEnergyList[iDigitN] - locMaxCut)
1250               maxAt[iDigitN] = 0 ;
1251           }
1252         } // if Areneighbours
1253       } // while digitN
1254     } // slot not empty
1255   } // while digit
1256
1257   iDigitN = 0 ;
1258   for(iDigit = 0; iDigit < fMulDigit; iDigit++) {
1259     if(maxAt[iDigit] ){
1260       maxAt[iDigitN] = maxAt[iDigit] ;
1261       maxAtEnergy[iDigitN] = fEnergyList[iDigit] ;
1262       iDigitN++ ;
1263     }
1264   }
1265   return iDigitN ;
1266 }
1267
1268 //____________________________________________________________________________
1269 Int_t AliEMCALRecPoint::GetPrimaryIndex() const
1270 {
1271   // Get the primary track index in TreeK which deposits the most energy
1272   // in Digits which forms RecPoint.
1273
1274   if (fMulTrack)
1275     return fTracksList[0];
1276   return -12345;
1277 }
1278
1279 //____________________________________________________________________________
1280 void AliEMCALRecPoint::EvalTime(TClonesArray * digits){
1281   // time is set to the time of the digit with the maximum energy
1282
1283   Float_t maxE  = 0;
1284   Int_t   maxAt = 0;
1285   for(Int_t idig=0; idig < fMulDigit; idig++){
1286     if(fEnergyList[idig] > maxE){
1287       maxE  = fEnergyList[idig] ;
1288       maxAt = idig;
1289     }
1290   }
1291   fTime = ((AliEMCALDigit*) digits->At(fDigitsList[maxAt]))->GetTime() ;
1292
1293 }
1294
1295 //______________________________________________________________________________
1296 void AliEMCALRecPoint::Paint(Option_t *)
1297 {
1298   // Paint this ALiRecPoint as a TMarker  with its current attributes
1299
1300   TVector3 pos(0.,0.,0.)  ;
1301   GetLocalPosition(pos)   ;
1302   Coord_t x = pos.X()     ;
1303   Coord_t y = pos.Z()     ;
1304   Color_t markercolor = 1 ;
1305   Size_t  markersize  = 1.;
1306   Style_t markerstyle = 5 ;
1307
1308   if (!gPad->IsBatch()) {
1309     gVirtualX->SetMarkerColor(markercolor) ;
1310     gVirtualX->SetMarkerSize (markersize)  ;
1311     gVirtualX->SetMarkerStyle(markerstyle) ;
1312   }
1313   gPad->SetAttMarkerPS(markercolor,markerstyle,markersize) ;
1314   gPad->PaintPolyMarker(1,&x,&y,"") ;
1315 }
1316
1317 //_____________________________________________________________________
1318 Double_t AliEMCALRecPoint::TmaxInCm(const Double_t e , const Int_t key)
1319 {
1320   // e energy in GeV)
1321   // key  =  0(gamma, default)
1322   //     !=  0(electron)
1323   const Double_t ca   = 4.82;  // shower max parameter - first guess; ca=TMath::Log(1000./8.07)
1324   Double_t tmax = 0.;    // position of electromagnetic shower max in cm
1325
1326   Double_t x0   = 1.31;  // radiation lenght (cm)
1327   //If old geometry in use
1328   if(!((fGeomPtr->GetEMCGeometry()->GetGeoName()).Contains("V1"))) x0 = 1.28;
1329
1330   if(e>0.1) {
1331     tmax = TMath::Log(e) + ca;
1332     if      (key==0) tmax += 0.5;
1333     else             tmax -= 0.5;
1334     tmax *= x0; // convert to cm
1335   }
1336   return tmax;
1337 }
1338
1339 //______________________________________________________________________________
1340 Float_t AliEMCALRecPoint::EtaToTheta(Float_t arg) const
1341 {
1342   //Converts Theta (Radians) to Eta(Radians)
1343   return (2.*TMath::ATan(TMath::Exp(-arg)));
1344 }
1345
1346 //______________________________________________________________________________
1347 Float_t AliEMCALRecPoint::ThetaToEta(Float_t arg) const
1348 {
1349   //Converts Eta (Radians) to Theta(Radians)
1350   return (-1 * TMath::Log(TMath::Tan(0.5 * arg)));
1351 }
1352
1353 //____________________________________________________________________________
1354 void AliEMCALRecPoint::Print(Option_t *opt) const
1355 {
1356   // Print the list of digits belonging to the cluster
1357   if(strlen(opt)==0) return;
1358   TString message ;
1359   message  = "AliEMCALRecPoint:\n" ;
1360   message +=  " digits # = " ;
1361   AliInfo(message.Data()) ;
1362
1363   Int_t iDigit;
1364   for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++)
1365     printf(" %d ", fDigitsList[iDigit] ) ;
1366   printf("\n");
1367
1368   AliInfo(" Energies = ") ;
1369   for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++)
1370     printf(" %f ", fEnergyList[iDigit] ) ;
1371   printf("\n");
1372
1373   AliInfo("\n Abs Ids = ") ;
1374   for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++)
1375     printf(" %i ", fAbsIdList[iDigit] ) ;
1376   printf("\n");
1377
1378   AliInfo(" Primaries  ") ;
1379   for(iDigit = 0;iDigit < fMulTrack; iDigit++)
1380     printf(" %d ", fTracksList[iDigit]) ;
1381
1382   printf("\n Local x %6.2f y %7.2f z %7.1f \n", fLocPos[0], fLocPos[1], fLocPos[2]);
1383
1384   message  = "       ClusterType     = %d" ;
1385   message += "       Multiplicity    = %d" ;
1386   message += "       Cluster Energy  = %f" ;
1387   message += "       Core energy     = %f" ;
1388   message += "       Core radius     = %f" ;
1389   message += "       Number of primaries %d" ;
1390   message += "       Stored at position %d" ;
1391   AliInfo(Form(message.Data(), fClusterType, fMulDigit, fAmp, fCoreEnergy, fCoreRadius, fMulTrack, GetIndexInList()) ) ;
1392 }
1393
1394 //___________________________________________________________
1395 Double_t  AliEMCALRecPoint::GetPointEnergy() const
1396 {
1397   //Returns energy ....
1398   Double_t e=0.0;
1399   for(int ic=0; ic<GetMultiplicity(); ic++) e += double(fEnergyList[ic]);
1400   return e;
1401 }