EMCAL/AliEMCALRecPoint.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15 /* $Id$ */
  16 //_________________________________________________________________________
  17 //  Reconstructed Points for the EMCAL
  18 //  A RecPoint is a cluster of digits
  19 //
  20 //
  21 //*-- Author: Yves Schutz (SUBATECH)
  22 //*-- Author: Dmitri Peressounko (RRC KI & SUBATECH)
  23 //*-- Author: Heather Gray (LBL) merged AliEMCALRecPoint and AliEMCALTowerRecPoint 02/04
  24
  25 // --- ROOT system ---
  26 #include "TPad.h"
  27 #include "TGraph.h"
  28 #include "TPaveText.h"
  29 #include "TClonesArray.h"
  30 #include "TMath.h"
  31 #include "TGeoMatrix.h"
  32 #include "TGeoManager.h"
  33 #include "TGeoPhysicalNode.h"
  34 #include "TRandom.h"
  35
  36 // --- Standard library ---
  37 #include <Riostream.h>
  38
  39 // --- AliRoot header files ---
  40 //#include "AliGenerator.h"
  41 class AliGenerator;
  42 class AliEMCAL;
  43 #include "AliLog.h"
  44 #include "AliGeomManager.h"
  45 #include "AliEMCALGeometry.h"
  46 #include "AliEMCALHit.h"
  47 #include "AliEMCALDigit.h"
  48 #include "AliEMCALRecPoint.h"
  49 #include "AliCaloCalibPedestal.h"
  50 #include "AliEMCALGeoParams.h"
  51
  52 ClassImp(AliEMCALRecPoint)
  53
  54 //____________________________________________________________________________
  55 AliEMCALRecPoint::AliEMCALRecPoint()
  56   : AliCluster(), fGeomPtr(0),
  57     fAmp(0), fIndexInList(-1), //to be set when the point is already stored
  58     fGlobPos(0,0,0),fLocPos(0,0,0),
  59     fMaxDigit(100), fMulDigit(0), fMaxTrack(200),
  60     fMulTrack(0), fDigitsList(0), fTracksList(0),
  61     fClusterType(-1), fCoreEnergy(0), fDispersion(0),
  62     fEnergyList(0), fAbsIdList(0),
  63     fTime(0.), fNExMax(0), fCoreRadius(10),  //HG check this
  64     fDETracksList(0), fMulParent(0), fMaxParent(0),
  65     fParentsList(0), fDEParentsList(0), fSuperModuleNumber(0),
  66     fDigitIndMax(-1), fDistToBadTower(-1), fSharedCluster(kFALSE)
  67 {
  68   // ctor
  69   fGeomPtr = AliEMCALGeometry::GetInstance();
  70
  71   fLambda[0] = 0;
  72   fLambda[1] = 0;
  73
  74 }
  75
  76 //____________________________________________________________________________
  77 AliEMCALRecPoint::AliEMCALRecPoint(const char *)
  78   : AliCluster(), fGeomPtr(0),
  79     fAmp(0), fIndexInList(-1), //to be set when the point is already stored
  80     fGlobPos(0,0,0), fLocPos(0,0,0),
  81     fMaxDigit(100), fMulDigit(0), fMaxTrack(1000), fMulTrack(0),
  82     fDigitsList(new Int_t[fMaxDigit]), fTracksList(new Int_t[fMaxTrack]),
  83     fClusterType(-1), fCoreEnergy(0), fDispersion(0),
  84     fEnergyList(new Float_t[fMaxDigit]),
  85     fAbsIdList(new Int_t[fMaxDigit]), fTime(-1.), fNExMax(0), fCoreRadius(10),
  86     fDETracksList(new Float_t[fMaxTrack]), fMulParent(0), fMaxParent(1000),
  87     fParentsList(new Int_t[fMaxParent]), fDEParentsList(new Float_t[fMaxParent]),
  88     fSuperModuleNumber(0), fDigitIndMax(-1), fDistToBadTower(-1),fSharedCluster(kFALSE)
  89 {
  90   // ctor
  91   for (Int_t i = 0; i < fMaxTrack; i++)
  92     fDETracksList[i] = 0;
  93   for (Int_t i = 0; i < fMaxParent; i++) {
  94     fParentsList[i] = -1;
  95     fDEParentsList[i] = 0;
  96   }
  97
  98   fGeomPtr = AliEMCALGeometry::GetInstance();
  99   fLambda[0] = 0;
 100   fLambda[1] = 0;
 101 }
 102
 103 //____________________________________________________________________________
 104 AliEMCALRecPoint::AliEMCALRecPoint(const AliEMCALRecPoint & rp)
 105   : AliCluster(rp), fGeomPtr(rp.fGeomPtr),
 106     fAmp(rp.fAmp), fIndexInList(rp.fIndexInList),
 107     fGlobPos(rp.fGlobPos),fLocPos(rp.fLocPos),
 108     fMaxDigit(rp.fMaxDigit), fMulDigit(rp.fMulDigit),
 109     fMaxTrack(rp.fMaxTrack), fMulTrack(rp.fMaxTrack),
 110     fDigitsList(new Int_t[rp.fMaxDigit]), fTracksList(new Int_t[rp.fMaxTrack]),
 111     fClusterType(rp.fClusterType), fCoreEnergy(rp.fCoreEnergy),
 112     fDispersion(rp.fDispersion),
 113     fEnergyList(new Float_t[rp.fMaxDigit]),
 114     fAbsIdList(new Int_t[rp.fMaxDigit]), fTime(rp.fTime), fNExMax(rp.fNExMax),fCoreRadius(rp.fCoreRadius),
 115     fDETracksList(new Float_t[rp.fMaxTrack]), fMulParent(rp.fMulParent),
 116     fMaxParent(rp.fMaxParent), fParentsList(new Int_t[rp.fMaxParent]),
 117     fDEParentsList(new Float_t[rp.fMaxParent]),
 118     fSuperModuleNumber(rp.fSuperModuleNumber), fDigitIndMax(rp.fDigitIndMax),
 119     fDistToBadTower(rp.fDistToBadTower), fSharedCluster(rp.fSharedCluster)
 120 {
 121   //copy ctor
 122   fLambda[0] = rp.fLambda[0];
 123   fLambda[1] = rp.fLambda[1];
 124
 125   for(Int_t i = 0; i < rp.fMulDigit; i++) {
 126     fEnergyList[i] = rp.fEnergyList[i];
 127     fAbsIdList[i]  = rp.fAbsIdList[i];
 128   }
 129
 130   for(Int_t i = 0; i < rp.fMulTrack; i++) fDETracksList[i] = rp.fDETracksList[i];
 131
 132   for(Int_t i = 0; i < rp.fMulParent; i++) {
 133     fParentsList[i] = rp.fParentsList[i];
 134     fDEParentsList[i] = rp.fDEParentsList[i];
 135   }
 136
 137 }
 138 //____________________________________________________________________________
 139 AliEMCALRecPoint::~AliEMCALRecPoint()
 140 {
 141   // dtor
 142   if ( fEnergyList )
 143     delete[] fEnergyList ;
 144   if ( fAbsIdList )
 145     delete[] fAbsIdList ;
 146    if ( fDETracksList)
 147     delete[] fDETracksList;
 148    if ( fParentsList)
 149     delete[] fParentsList;
 150    if ( fDEParentsList)
 151     delete[] fDEParentsList;
 152
 153    delete [] fDigitsList ;
 154    delete [] fTracksList ;
 155 }
 156
 157 //____________________________________________________________________________
 158 AliEMCALRecPoint& AliEMCALRecPoint::operator= (const AliEMCALRecPoint &rp)
 159 {
 160   // assignment operator
 161
 162   if(&rp == this) return *this;
 163
 164   fGeomPtr = rp.fGeomPtr;
 165   fAmp = rp.fAmp;
 166   fIndexInList = rp.fIndexInList;
 167   fGlobPos = rp.fGlobPos;
 168   fLocPos  = rp.fLocPos;
 169   fMaxDigit = rp.fMaxDigit;
 170   fMulDigit = rp.fMulDigit;
 171   fMaxTrack = rp.fMaxTrack;
 172   fMulTrack = rp.fMaxTrack;
 173   for(Int_t i = 0; i<fMaxDigit; i++) fDigitsList[i] = rp.fDigitsList[i];
 174   for(Int_t i = 0; i<fMaxTrack; i++) fTracksList[i] = rp.fTracksList[i];
 175   fClusterType = rp.fClusterType;
 176   fCoreEnergy  = rp.fCoreEnergy;
 177   fDispersion  = rp.fDispersion;
 178   for(Int_t i = 0; i<fMaxDigit; i++) {
 179     fEnergyList[i] = rp.fEnergyList[i];
 180     fAbsIdList[i]  = rp.fAbsIdList[i];
 181   }
 182   fTime = rp.fTime;
 183   fNExMax = rp.fNExMax;
 184   fCoreRadius = rp.fCoreRadius;
 185   for(Int_t i = 0; i < fMaxTrack; i++) fDETracksList[i] = rp.fDETracksList[i];
 186   fMulParent = rp.fMulParent;
 187   fMaxParent = rp.fMaxParent;
 188   for(Int_t i = 0; i < fMaxParent; i++) {
 189     fParentsList[i] = rp.fParentsList[i];
 190     fDEParentsList[i] = rp.fDEParentsList[i];
 191   }
 192   fSuperModuleNumber = rp.fSuperModuleNumber;
 193   fDigitIndMax = rp.fDigitIndMax;
 194
 195   fLambda[0] = rp.fLambda[0];
 196   fLambda[1] = rp.fLambda[1];
 197
 198   fDistToBadTower = rp.fDistToBadTower;
 199   fSharedCluster  = rp.fSharedCluster;
 200
 201   return *this;
 202
 203 }
 204
 205 //____________________________________________________________________________
 206 void AliEMCALRecPoint::AddDigit(AliEMCALDigit & digit, const Float_t energy, const Bool_t shared)
 207 {
 208   // Adds a digit to the RecPoint
 209   // and accumulates the total amplitude and the multiplicity
 210
 211   if(fEnergyList == 0)
 212     fEnergyList =  new Float_t[fMaxDigit];
 213
 214   if(fAbsIdList == 0) {
 215     fAbsIdList  =  new Int_t  [fMaxDigit];
 216   }
 217
 218   if ( fMulDigit >= fMaxDigit ) { // increase the size of the lists
 219     fMaxDigit*=2 ;
 220     Int_t   * tempo   = new Int_t  [fMaxDigit];
 221     Float_t * tempoE  = new Float_t[fMaxDigit];
 222     Int_t   * tempoId = new Int_t  [fMaxDigit];
 223
 224     Int_t index ;
 225     for ( index = 0 ; index < fMulDigit ; index++ ){
 226       tempo  [index] = fDigitsList[index] ;
 227       tempoE [index] = fEnergyList[index] ;
 228       tempoId[index] = fAbsIdList [index] ;
 229     }
 230
 231     delete [] fDigitsList ;
 232     delete [] fEnergyList ;
 233     delete [] fAbsIdList ;
 234
 235     fDigitsList = tempo;
 236     fEnergyList = tempoE;
 237     fAbsIdList  = tempoId;
 238   } // if
 239
 240   fDigitsList[fMulDigit]   = digit.GetIndexInList()  ;
 241   fEnergyList[fMulDigit]   = energy ;
 242   fAbsIdList [fMulDigit]   = digit.GetId();
 243   fMulDigit++ ;
 244   fAmp += energy ;
 245
 246   if(shared) fSharedCluster = kTRUE;
 247 }
 248 //____________________________________________________________________________
 249 Bool_t AliEMCALRecPoint::AreNeighbours(AliEMCALDigit * digit1, AliEMCALDigit * digit2 ) const
 250 {
 251   // Tells if (true) or not (false) two digits are neighbours
 252   // A neighbour is defined as being two digits which share a corner
 253   // ONLY USED IN CASE OF UNFOLDING
 254
 255   Bool_t areNeighbours = kFALSE ;
 256   Int_t nSupMod=0, nModule=0, nIphi=0, nIeta=0;
 257   Int_t nSupMod1=0, nModule1=0, nIphi1=0, nIeta1=0;
 258   Int_t relid1[2] , relid2[2] ; // ieta, iphi
 259   Int_t rowdiff=0, coldiff=0;
 260
 261   areNeighbours = kFALSE ;
 262
 263   fGeomPtr->GetCellIndex(digit1->GetId(), nSupMod,nModule,nIphi,nIeta);
 264   fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nModule,nIphi,nIeta, relid1[0],relid1[1]);
 265
 266   fGeomPtr->GetCellIndex(digit2->GetId(), nSupMod1,nModule1,nIphi1,nIeta1);
 267   fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod1,nModule1,nIphi1,nIeta1, relid2[0],relid2[1]);
 268
 269   // In case of a shared cluster, index of SM in C side, columns start at 48 and ends at 48*2-1
 270   // C Side impair SM, nSupMod%2=1; A side pair SM nSupMod%2=0
 271   if(fSharedCluster){
 272     if(nSupMod1%2) relid1[1]+=AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
 273     else           relid2[1]+=AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
 274   }
 275
 276   rowdiff = TMath::Abs( relid1[0] - relid2[0] ) ;
 277   coldiff = TMath::Abs( relid1[1] - relid2[1] ) ;
 278
 279   if (( coldiff <= 1 )  && ( rowdiff <= 1 ) && (coldiff + rowdiff > 0))
 280   areNeighbours = kTRUE ;
 281
 282   return areNeighbours;
 283 }
 284
 285 //____________________________________________________________________________
 286 Int_t AliEMCALRecPoint::Compare(const TObject * obj) const
 287 {
 288   // Compares two RecPoints according to their position in the EMCAL modules
 289
 290   Float_t delta = 1 ; //Width of "Sorting row".
 291
 292   Int_t rv = 2 ;
 293
 294   AliEMCALRecPoint * clu = (AliEMCALRecPoint *)obj ;
 295
 296   TVector3 locpos1;
 297   GetLocalPosition(locpos1);
 298   TVector3 locpos2;
 299   clu->GetLocalPosition(locpos2);
 300
 301   Int_t rowdif = (Int_t)(TMath::Ceil(locpos1.X()/delta)-TMath::Ceil(locpos2.X()/delta)) ;
 302   if (rowdif> 0)
 303     rv = 1 ;
 304   else if(rowdif < 0)
 305     rv = -1 ;
 306   else if(locpos1.Y()>locpos2.Y())
 307     rv = -1 ;
 308   else
 309     rv = 1 ;
 310
 311   return rv ;
 312 }
 313
 314 //___________________________________________________________________________
 315  void AliEMCALRecPoint::Draw(Option_t *option)
 316  {
 317    // Draw this AliEMCALRecPoint with its current attributes
 318
 319    AppendPad(option);
 320  }
 321
 322 //____________________________________________________________________________
 323 void AliEMCALRecPoint::EvalAll(Float_t logWeight,TClonesArray * digits, const Bool_t justClusters)
 324 {
 325   // Evaluates cluster parameters
 326
 327   // First calculate the index of digit with maximum amplitude and get
 328   // the supermodule number where it sits.
 329
 330   fDigitIndMax       = GetMaximalEnergyIndex();
 331   fSuperModuleNumber = fGeomPtr->GetSuperModuleNumber(GetAbsIdMaxDigit());
 332
 333   //Evaluate global and local position
 334   EvalGlobalPosition(logWeight, digits) ;
 335   EvalLocalPosition(logWeight, digits) ;
 336
 337   //Evaluate shower parameters
 338   EvalElipsAxis(logWeight, digits) ;
 339   EvalDispersion(logWeight, digits) ;
 340
 341   //EvalCoreEnergy(logWeight, digits);
 342   EvalTime(digits) ;
 343   EvalPrimaries(digits) ;
 344   EvalParents(digits);
 345
 346   //Called last because it sets the global position of the cluster?
 347   //Do not call it when recalculating clusters out of standard reconstruction
 348   if(!justClusters){
 349     EvalLocal2TrackingCSTransform();
 350   }
 351
 352 }
 353
 354 //____________________________________________________________________________
 355 void  AliEMCALRecPoint::EvalDispersion(Float_t logWeight, TClonesArray * digits)
 356 {
 357   // Calculates the dispersion of the shower at the origin of the RecPoint
 358   // in cell units - Nov 16,2006
 359
 360   Double_t d = 0., wtot = 0., w = 0.;
 361   Int_t iDigit=0, nstat=0;
 362   AliEMCALDigit * digit=0;
 363
 364   // Calculates the dispersion in cell units
 365   Double_t etai, phii, etaMean=0.0, phiMean=0.0;
 366   int nSupMod=0, nModule=0, nIphi=0, nIeta=0;
 367   int iphi=0, ieta=0;
 368   // Calculate mean values
 369   for(iDigit=0; iDigit < fMulDigit; iDigit++) {
 370     digit = (AliEMCALDigit *) digits->At(fDigitsList[iDigit])  ;
 371
 372     if (fAmp>0 && fEnergyList[iDigit]>0) {
 373       fGeomPtr->GetCellIndex(digit->GetId(), nSupMod,nModule,nIphi,nIeta);
 374       fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nModule,nIphi,nIeta, iphi,ieta);
 375
 376       // In case of a shared cluster, index of SM in C side, columns start at 48 and ends at 48*2
 377       // C Side impair SM, nSupMod%2=1; A side pair SM nSupMod%2=0
 378       if(fSharedCluster && nSupMod%2) ieta+=AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
 379
 380       etai=(Double_t)ieta;
 381       phii=(Double_t)iphi;
 382       w = TMath::Max(0.,logWeight+TMath::Log(fEnergyList[iDigit]/fAmp ) ) ;
 383
 384       if(w>0.0) {
 385         phiMean += phii*w;
 386         etaMean += etai*w;
 387         wtot    += w;
 388       }
 389     }
 390   }
 391   if (wtot>0) {
 392     phiMean /= wtot ;
 393     etaMean /= wtot ;
 394   } else AliError(Form("Wrong weight %f\n", wtot));
 395
 396   // Calculate dispersion
 397   for(iDigit=0; iDigit < fMulDigit; iDigit++) {
 398     digit = (AliEMCALDigit *) digits->At(fDigitsList[iDigit])  ;
 399
 400     if (fAmp>0 && fEnergyList[iDigit]>0) {
 401       fGeomPtr->GetCellIndex(digit->GetId(), nSupMod,nModule,nIphi,nIeta);
 402       fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nModule,nIphi,nIeta, iphi,ieta);
 403
 404       // In case of a shared cluster, index of SM in C side, columns start at 48 and ends at 48*2
 405       // C Side impair SM, nSupMod%2=1; A side pair SM, nSupMod%2=0
 406       if(fSharedCluster && nSupMod%2) ieta+=AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
 407
 408       etai=(Double_t)ieta;
 409       phii=(Double_t)iphi;
 410       w = TMath::Max(0.,logWeight+TMath::Log(fEnergyList[iDigit]/fAmp ) ) ;
 411
 412       if(w>0.0) {
 413         nstat++;
 414         d += w*((etai-etaMean)*(etai-etaMean)+(phii-phiMean)*(phii-phiMean));
 415       }
 416     }
 417   }
 418
 419   if ( wtot > 0 && nstat>1) d /= wtot ;
 420   else                      d = 0. ;
 421
 422   fDispersion = TMath::Sqrt(d) ;
 423   //printf("AliEMCALRecPoint::EvalDispersion() : Dispersion %f \n",fDispersion);
 424 }
 425
 426 //____________________________________________________________________________
 427 void AliEMCALRecPoint::EvalDistanceToBadChannels(AliCaloCalibPedestal* caloped)
 428 {
 429   //For each EMC rec. point set the distance to the nearest bad channel.
 430   //AliInfo(Form("%d bad channel(s) found.\n", caloped->GetDeadTowerCount()));
 431   //It is done in cell units and not in global or local position as before (Sept 2010)
 432
 433   if(!caloped->GetDeadTowerCount()) return;
 434
 435   //Get channels map of the supermodule where the cluster is.
 436   TH2D* hMap  = caloped->GetDeadMap(fSuperModuleNumber);
 437
 438   Int_t dRrow, dReta;
 439   Float_t  minDist = 10000.;
 440   Float_t  dist    = 0.;
 441   Int_t nSupMod, nModule;
 442   Int_t nIphi, nIeta;
 443   Int_t iphi, ieta;
 444   fDigitIndMax  = GetMaximalEnergyIndex();
 445   fGeomPtr->GetCellIndex(fAbsIdList[fDigitIndMax], nSupMod,nModule,nIphi,nIeta);
 446   fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nModule,nIphi,nIeta, iphi,ieta);
 447
 448   //Loop on tower status map
 449   for(Int_t irow = 0; irow < AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows; irow++){
 450     for(Int_t icol = 0; icol < AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols; icol++){
 451       //Check if tower is bad.
 452       if(hMap->GetBinContent(icol,irow)==AliCaloCalibPedestal::kAlive) continue;
 453       //printf("AliEMCALRecPoint::EvalDistanceToBadChannels() - Bad channel in SM %d, col %d, row %d\n",iSM,icol, irow);
 454
 455       dRrow=TMath::Abs(irow-iphi);
 456       dReta=TMath::Abs(icol-ieta);
 457       dist=TMath::Sqrt(dRrow*dRrow+dReta*dReta);
 458       if(dist < minDist) minDist = dist;
 459
 460     }
 461   }
 462
 463   //In case the cluster is shared by 2 SuperModules, need to check the map of the second Super Module
 464   if (fSharedCluster) {
 465     TH2D* hMap2 = 0;
 466     Int_t nSupMod2 = -1;
 467
 468     //The only possible combinations are (0,1), (2,3) ... (10,11)
 469     if(fSuperModuleNumber%2) nSupMod2 = fSuperModuleNumber-1;
 470     else                     nSupMod2 = fSuperModuleNumber+1;
 471     hMap2  = caloped->GetDeadMap(nSupMod2);
 472
 473     //Loop on tower status map of second super module
 474     for(Int_t irow = 0; irow < AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows; irow++){
 475       for(Int_t icol = 0; icol < AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols; icol++){
 476         //Check if tower is bad.
 477         if(hMap2->GetBinContent(icol,irow)==AliCaloCalibPedestal::kAlive) continue;
 478         //printf("AliEMCALRecPoint::EvalDistanceToBadChannels() - Bad channel in SM %d, col %d, row %d\n",iSM,icol, irow);
 479         dRrow=TMath::Abs(irow-iphi);
 480
 481         if(fSuperModuleNumber%2) {
 482           dReta=TMath::Abs(icol-(AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols+ieta));
 483        }
 484        else {
 485          dReta=TMath::Abs(AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols+icol-ieta);
 486        }
 487
 488        dist=TMath::Sqrt(dRrow*dRrow+dReta*dReta);
 489         if(dist < minDist) minDist = dist;
 490
 491       }
 492     }
 493
 494   }// shared cluster in 2 SuperModules
 495
 496   fDistToBadTower = minDist;
 497   //printf("AliEMCALRecPoint::EvalDistanceToBadChannel() - Distance to Bad is %f cm, shared cluster? %d \n",fDistToBadTower,fSharedCluster);
 498 }
 499
 500
 501 //____________________________________________________________________________
 502 void AliEMCALRecPoint::EvalLocalPosition(Float_t logWeight, TClonesArray * digits)
 503 {
 504   // Calculates the center of gravity in the local EMCAL-module coordinates
 505   //  Info("Print", " logWeight %f : cluster energy %f ", logWeight, fAmp); // for testing
 506
 507   AliEMCALDigit * digit=0;
 508   Int_t i=0, nstat=0;
 509
 510   Double_t dist  = TmaxInCm(Double_t(fAmp));
 511   //Int_t       idMax = GetAbsIdMaxDigit();// idMax is not used at all in RelPosCellInSModule, why use it?
 512
 513   Double_t clXYZ[3]={0.,0.,0.}, clRmsXYZ[3]={0.,0.,0.}, xyzi[3], wtot=0., w=0.;
 514
 515   //printf(" dist : %f  e : %f \n", dist, fAmp);
 516   for(Int_t iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
 517     digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At(fDigitsList[iDigit])) ;
 518
 519     if(!digit) {
 520       AliError("No Digit!!");
 521       continue;
 522     }
 523
 524     fGeomPtr->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), dist, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
 525
 526     //Temporal patch, due to mapping problem, need to swap "y" in one of the 2 SM, although no effect in position calculation. GCB 05/2010
 527     if(fSharedCluster && fSuperModuleNumber != fGeomPtr->GetSuperModuleNumber(digit->GetId())) xyzi[1]*=-1;
 528
 529     //printf("EvalLocalPosition Cell:  Id %i, SM %i : dist %f Local x,y,z %f %f %f \n",
 530     //          digit->GetId(), fGeomPtr->GetSuperModuleNumber(digit->GetId()), dist, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
 531
 532     if(logWeight > 0.0)  w = TMath::Max( 0., logWeight + TMath::Log( fEnergyList[iDigit] / fAmp ));
 533     else  w = fEnergyList[iDigit]; // just energy
 534
 535     if(w>0.0) {
 536       wtot += w ;
 537       nstat++;
 538       for(i=0; i<3; i++ ) {
 539         clXYZ[i]    += (w*xyzi[i]);
 540         clRmsXYZ[i] += (w*xyzi[i]*xyzi[i]);
 541       }
 542     }
 543   }
 544   //  cout << " wtot " << wtot << endl;
 545   if ( wtot > 0 ) {
 546     //    xRMS   = TMath::Sqrt(x2m - xMean*xMean);
 547     for(i=0; i<3; i++ ) {
 548       clXYZ[i] /= wtot;
 549       if(nstat>1) {
 550         clRmsXYZ[i] /= (wtot*wtot);
 551         clRmsXYZ[i]  =  clRmsXYZ[i] - clXYZ[i]*clXYZ[i];
 552         if(clRmsXYZ[i] > 0.0) {
 553           clRmsXYZ[i] =  TMath::Sqrt(clRmsXYZ[i]);
 554         } else      clRmsXYZ[i] = 0;
 555       } else        clRmsXYZ[i] = 0;
 556     }
 557   } else {
 558     for(i=0; i<3; i++ ) {
 559       clXYZ[i] = clRmsXYZ[i] = -1.;
 560     }
 561   }
 562
 563   //    // Cluster of one single digit, smear the position to avoid discrete position
 564   //    // smear x and z with +- 3 cm to uniform (avoid discrete effects). Tower size is approx 6 cm.
 565   //    // Rndm generates a number in ]0,1]
 566   //    if (fMulDigit==1) {
 567   //      clXYZ[0] += fGeomPtr->GetPhiTileSize()*(0.5 - gRandom->Rndm());
 568   //      clXYZ[2] += fGeomPtr->GetEtaTileSize()*(0.5 - gRandom->Rndm());
 569   //    }
 570
 571   //Set position in local vector
 572   fLocPos.SetX(clXYZ[0]);
 573   fLocPos.SetY(clXYZ[1]);
 574   fLocPos.SetZ(clXYZ[2]);
 575
 576   if (gDebug==2)
 577     printf("EvalLocalPosition Cluster: Local (x,y,z) = (%f,%f,%f) \n", fLocPos.X(), fLocPos.Y(), fLocPos.Z()) ;
 578
 579 }
 580
 581
 582 //____________________________________________________________________________
 583 void AliEMCALRecPoint::EvalGlobalPosition(Float_t logWeight, TClonesArray * digits)
 584 {
 585   // Calculates the center of gravity in the global ALICE coordinates
 586   //  Info("Print", " logWeight %f : cluster energy %f ", logWeight, fAmp); // for testing
 587
 588   AliEMCALDigit * digit=0;
 589   Int_t i=0, nstat=0;
 590
 591   Double_t dist  = TmaxInCm(Double_t(fAmp));
 592   //Int_t       idMax = GetAbsIdMaxDigit();// idMax is not used at all in RelPosCellInSModule, why use it?
 593
 594   Double_t clXYZ[3]={0.,0.,0.}, clRmsXYZ[3]={0.,0.,0.}, lxyzi[3], xyzi[3], wtot=0., w=0.;
 595
 596   //printf(" dist : %f  e : %f \n", dist, fAmp);
 597   for(Int_t iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
 598     digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At(fDigitsList[iDigit])) ;
 599
 600     if(!digit) {
 601       AliError("No Digit!!");
 602       continue;
 603     }
 604
 605     //Get the local coordinates of the cell
 606     fGeomPtr->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), dist, lxyzi[0], lxyzi[1], lxyzi[2]);
 607
 608     //Now get the global coordinate
 609     fGeomPtr->GetGlobal(lxyzi,xyzi, fGeomPtr->GetSuperModuleNumber(digit->GetId()));
 610     //TVector3 pos(xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
 611     //printf("EvalGlobalPosition Cell:  Id %i, SM %i : dist %f Local (x,y,z) = (%f %f %f), eta %f, phi%f \n",
 612     //     digit->GetId(), fGeomPtr->GetSuperModuleNumber(digit->GetId()),dist, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2],pos.Eta(),pos.Phi()*TMath::RadToDeg());
 613
 614     if(logWeight > 0.0)  w = TMath::Max( 0., logWeight + TMath::Log( fEnergyList[iDigit] / fAmp ));
 615     else  w = fEnergyList[iDigit]; // just energy
 616
 617     if(w>0.0) {
 618       wtot += w ;
 619       nstat++;
 620       for(i=0; i<3; i++ ) {
 621         clXYZ[i]    += (w*xyzi[i]);
 622         clRmsXYZ[i] += (w*xyzi[i]*xyzi[i]);
 623       }
 624     }
 625   }
 626   //  cout << " wtot " << wtot << endl;
 627   if ( wtot > 0 ) {
 628     //    xRMS   = TMath::Sqrt(x2m - xMean*xMean);
 629     for(i=0; i<3; i++ ) {
 630       clXYZ[i] /= wtot;
 631       if(nstat>1) {
 632         clRmsXYZ[i] /= (wtot*wtot);
 633         clRmsXYZ[i]  =  clRmsXYZ[i] - clXYZ[i]*clXYZ[i];
 634         if(clRmsXYZ[i] > 0.0) {
 635           clRmsXYZ[i] =  TMath::Sqrt(clRmsXYZ[i]);
 636         } else      clRmsXYZ[i] = 0;
 637       } else        clRmsXYZ[i] = 0;
 638     }
 639   } else {
 640     for(i=0; i<3; i++ ) {
 641       clXYZ[i] = clRmsXYZ[i] = -1.;
 642     }
 643   }
 644
 645 //  // Cluster of one single digit, smear the position to avoid discrete position
 646 //  // smear x and z with +- 3 cm to uniform (avoid discrete effects). Tower size is approx 6 cm.
 647 //  // Rndm generates a number in ]0,1]
 648 //  if (fMulDigit==1) {
 649 //    clXYZ[0] += fGeomPtr->GetPhiTileSize()*(0.5 - gRandom->Rndm());
 650 //    clXYZ[2] += fGeomPtr->GetEtaTileSize()*(0.5 - gRandom->Rndm());
 651 //  }
 652
 653   //Set position in global vector
 654   fGlobPos.SetX(clXYZ[0]);
 655   fGlobPos.SetY(clXYZ[1]);
 656   fGlobPos.SetZ(clXYZ[2]);
 657
 658   if (gDebug==2)
 659         printf("EvalGlobalPosition Cluster: (x ,y ,z) = (%f,%f,%f), eta %f,phi %f\n",
 660                    fGlobPos.X(), fGlobPos.Y(), fGlobPos.Z(),fGlobPos.Eta(),fGlobPos.Phi()*TMath::RadToDeg()) ;
 661 }
 662
 663 //____________________________________________________________________________
 664 void AliEMCALRecPoint::EvalLocalPositionFit(Double_t deff, Double_t logWeight,
 665 Double_t phiSlope, TClonesArray * digits)
 666 {
 667   // Evaluates local position of clusters in SM
 668
 669   Double_t ycorr=0;
 670   AliEMCALDigit *digit=0;
 671   Int_t i=0, nstat=0;
 672   Double_t clXYZ[3]={0.,0.,0.}, clRmsXYZ[3]={0.,0.,0.}, xyzi[3], wtot=0., w=0.;
 673
 674   Double_t dist  = TmaxInCm(Double_t(fAmp));
 675   //Int_t       idMax = GetAbsIdMaxDigit();// idMax is not used at all in RelPosCellInSModule, why use it?
 676
 677   for(Int_t iDigit=0; iDigit<digits->GetEntries(); iDigit++) {
 678     digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At(fDigitsList[iDigit])) ;
 679     if(digit){
 680       dist = deff;
 681       //fGeomPtr->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), idMax, dist, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
 682       fGeomPtr->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), dist, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
 683
 684       if(logWeight > 0.0)  w = TMath::Max( 0., logWeight + TMath::Log( fEnergyList[iDigit] / fAmp ));
 685       else                 w = fEnergyList[iDigit]; // just energy
 686
 687       if(w>0.0) {
 688         wtot += w ;
 689         nstat++;
 690         for(i=0; i<3; i++ ) {
 691           clXYZ[i]    += (w*xyzi[i]);
 692           clRmsXYZ[i] += (w*xyzi[i]*xyzi[i]);
 693         }
 694       }
 695     }else AliError("Digit null");
 696   }//loop
 697   //  cout << " wtot " << wtot << endl;
 698   if ( wtot > 0 ) {
 699     //    xRMS   = TMath::Sqrt(x2m - xMean*xMean);
 700     for(i=0; i<3; i++ ) {
 701       clXYZ[i] /= wtot;
 702       if(nstat>1) {
 703         clRmsXYZ[i] /= (wtot*wtot);
 704         clRmsXYZ[i]  =  clRmsXYZ[i] - clXYZ[i]*clXYZ[i];
 705         if(clRmsXYZ[i] > 0.0) {
 706           clRmsXYZ[i] =  TMath::Sqrt(clRmsXYZ[i]);
 707         } else      clRmsXYZ[i] = 0;
 708       } else        clRmsXYZ[i] = 0;
 709     }
 710   } else {
 711     for(i=0; i<3; i++ ) {
 712       clXYZ[i] = clRmsXYZ[i] = -1.;
 713     }
 714   }
 715   // clRmsXYZ[i] ??
 716   if(phiSlope != 0.0 && logWeight > 0.0 && wtot) {
 717     // Correction in phi direction (y - coords here); Aug 16;
 718     // May be put to global level or seperate method
 719     ycorr = clXYZ[1] * (1. + phiSlope);
 720     //printf(" y %f : ycorr %f : slope %f \n", clXYZ[1], ycorr, phiSlope);
 721     clXYZ[1] = ycorr;
 722   }
 723
 724   fLocPos.SetX(clXYZ[0]);
 725   fLocPos.SetY(clXYZ[1]);
 726   fLocPos.SetZ(clXYZ[2]);
 727
 728 //  if (gDebug==2)
 729 //    printf("EvalLocalPosition: eta,phi,r = %f,%f,%f", fLocPos.X(), fLocPos.Y(), fLocPos.Z()) ;
 730 }
 731
 732 //_____________________________________________________________________________
 733 Bool_t AliEMCALRecPoint::EvalLocalPosition2(TClonesArray * digits, TArrayD &ed)
 734 {
 735   // Evaluated local position of rec.point using digits
 736   // and parametrisation of w0 and deff
 737   //printf(" <I> AliEMCALRecPoint::EvalLocalPosition2() \n");
 738   return AliEMCALRecPoint::EvalLocalPositionFromDigits(digits, ed, fLocPos);
 739 }
 740
 741 //_____________________________________________________________________________
 742 Bool_t AliEMCALRecPoint::EvalLocalPositionFromDigits(TClonesArray *digits, TArrayD &ed, TVector3 &locPos)
 743 {
 744   // Used when digits should be recalibrated
 745   Double_t deff=0, w0=0, esum=0;
 746   Int_t iDigit=0;
 747   //  AliEMCALDigit *digit;
 748
 749   if(ed.GetSize() && (digits->GetEntries()!=ed.GetSize())) return kFALSE;
 750
 751   // Calculate sum energy of digits
 752   esum = 0.0;
 753   for(iDigit=0; iDigit<ed.GetSize(); iDigit++) esum += ed[iDigit];
 754
 755   GetDeffW0(esum, deff, w0);
 756
 757   return EvalLocalPositionFromDigits(esum, deff, w0, digits, ed, locPos);
 758 }
 759
 760 //_____________________________________________________________________________
 761 Bool_t AliEMCALRecPoint::EvalLocalPositionFromDigits(const Double_t esum, const Double_t deff, const Double_t w0, TClonesArray *digits, TArrayD &ed, TVector3 &locPos)
 762 {
 763   //Evaluate position of digits in supermodule.
 764   AliEMCALDigit *digit=0;
 765
 766   Int_t i=0, nstat=0;
 767   Double_t clXYZ[3]={0.,0.,0.}, xyzi[3], wtot=0., w=0.;
 768   //Int_t       idMax = GetAbsIdMaxDigit();// idMax is not used at all in RelPosCellInSModule, why use it?
 769
 770   // Get pointer to EMCAL geometry
 771   // (can't use fGeomPtr in static method)
 772   AliEMCALGeometry* geo = AliEMCALGeometry::GetInstance();
 773
 774   for(Int_t iDigit=0; iDigit<digits->GetEntries(); iDigit++) {
 775     digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At(iDigit));
 776     if(digit){
 777       //geo->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), idMax, deff, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
 778       geo->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), deff, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
 779
 780       if(w0 > 0.0)  w = TMath::Max( 0., w0 + TMath::Log(ed[iDigit] / esum));
 781       else          w = ed[iDigit]; // just energy
 782
 783       if(w>0.0) {
 784         wtot += w ;
 785         nstat++;
 786         for(i=0; i<3; i++ ) {
 787           clXYZ[i] += (w*xyzi[i]);
 788         }
 789       }
 790     }else AliError("Digit null");
 791   }//loop
 792   //  cout << " wtot " << wtot << endl;
 793   if (wtot > 0) {
 794     for(i=0; i<3; i++ ) {
 795       clXYZ[i] /= wtot;
 796     }
 797     locPos.SetX(clXYZ[0]);
 798     locPos.SetY(clXYZ[1]);
 799     locPos.SetZ(clXYZ[2]);
 800     return kTRUE;
 801   } else {
 802     return kFALSE;
 803   }
 804
 805 }
 806
 807 //_____________________________________________________________________________
 808 void AliEMCALRecPoint::GetDeffW0(const Double_t esum , Double_t &deff,  Double_t &w0)
 809 {
 810   //
 811   // Aug 31, 2001
 812   // Applied for simulation data with threshold 3 adc
 813   // Calculate efective distance (deff) and weigh parameter (w0)
 814   // for coordinate calculation; 0.5 GeV < esum <100 GeV.
 815   // Look to:  http://rhic.physics.wayne.edu/~pavlinov/ALICE/SHISHKEBAB/RES/CALIB/GEOMCORR/deffandW0VaEgamma_2.gif
 816   //
 817   Double_t e=0.0;
 818   const  Double_t kdp0=9.25147, kdp1=1.16700; // Hard coded now
 819   const  Double_t kwp0=4.83713, kwp1=-2.77970e-01, kwp2 = 4.41116;
 820
 821   // No extrapolation here
 822   e = esum<0.5?0.5:esum;
 823   e = e>100.?100.:e;
 824
 825   deff = kdp0 + kdp1*TMath::Log(e);
 826   w0   = kwp0 / (1. + TMath::Exp(kwp1*(e+kwp2)));
 827   //printf("<I> AliEMCALRecPoint::GetDeffW0 esum %5.2f : deff %5.2f : w0 %5.2f \n", esum, deff, w0);
 828 }
 829
 830 //______________________________________________________________________________
 831 void AliEMCALRecPoint::EvalCoreEnergy(Float_t logWeight, TClonesArray * digits)
 832 {
 833   // This function calculates energy in the core,
 834   // i.e. within a radius rad = fCoreEnergy around the center. Beyond this radius
 835   // in accordance with shower profile the energy deposition
 836   // should be less than 2%
 837   // Unfinished - Nov 15,2006
 838   // Distance is calculate in (phi,eta) units
 839
 840   AliEMCALDigit * digit = 0 ;
 841
 842   Int_t iDigit=0;
 843
 844   if (!fLocPos.Mag()) {
 845     EvalLocalPosition(logWeight, digits);
 846   }
 847
 848   Double_t phiPoint = fLocPos.Phi(), etaPoint = fLocPos.Eta();
 849   Double_t eta, phi, distance;
 850   for(iDigit=0; iDigit < fMulDigit; iDigit++) {
 851     digit = (AliEMCALDigit *) ( digits->At(fDigitsList[iDigit]) ) ;
 852
 853     eta = phi = 0.0;
 854     fGeomPtr->EtaPhiFromIndex(digit->GetId(),eta, phi) ;
 855     phi = phi * TMath::DegToRad();
 856
 857     distance = TMath::Sqrt((eta-etaPoint)*(eta-etaPoint)+(phi-phiPoint)*(phi-phiPoint));
 858     if(distance < fCoreRadius)
 859       fCoreEnergy += fEnergyList[iDigit] ;
 860   }
 861
 862 }
 863 //____________________________________________________________________________
 864 void  AliEMCALRecPoint::EvalElipsAxis(Float_t logWeight,TClonesArray * digits)
 865 {
 866   // Calculates the axis of the shower ellipsoid in eta and phi
 867   // in cell units
 868
 869   TString gn(fGeomPtr->GetName());
 870
 871   Double_t wtot = 0.;
 872   Double_t x    = 0.;
 873   Double_t z    = 0.;
 874   Double_t dxx  = 0.;
 875   Double_t dzz  = 0.;
 876   Double_t dxz  = 0.;
 877
 878   AliEMCALDigit * digit = 0;
 879
 880   Double_t etai =0, phii=0, w=0;
 881   int nSupMod=0, nModule=0, nIphi=0, nIeta=0;
 882   int iphi=0, ieta=0;
 883   for(Int_t iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
 884     digit = (AliEMCALDigit *) digits->At(fDigitsList[iDigit])  ;
 885     etai = phii = 0.;
 886     // Nov 15,2006 - use cell numbers as coordinates
 887     // Copied for shish-kebab geometry, ieta,iphi is cast as double as eta,phi
 888     // We can use the eta,phi(or coordinates) of cell
 889     nSupMod = nModule = nIphi = nIeta = iphi = ieta = 0;
 890
 891     fGeomPtr->GetCellIndex(digit->GetId(), nSupMod,nModule,nIphi,nIeta);
 892     fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nModule,nIphi,nIeta, iphi,ieta);
 893
 894     // In case of a shared cluster, index of SM in C side, columns start at 48 and ends at 48*2
 895     // C Side impair SM, nSupMod%2=1; A side pair SM, nSupMod%2=0
 896     if(fSharedCluster && nSupMod%2) ieta+=AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
 897
 898     etai=(Double_t)ieta;
 899     phii=(Double_t)iphi;
 900
 901     w = TMath::Max(0.,logWeight+TMath::Log(fEnergyList[iDigit]/fAmp ) ) ;
 902     // fAmp summed amplitude of digits, i.e. energy of recpoint
 903     // Gives smaller value of lambda than log weight
 904     // w = fEnergyList[iDigit] / fAmp; // Nov 16, 2006 - try just energy
 905
 906     dxx  += w * etai * etai ;
 907     x    += w * etai ;
 908     dzz  += w * phii * phii ;
 909     z    += w * phii ;
 910
 911     dxz  += w * etai * phii ;
 912
 913     wtot += w ;
 914   }
 915
 916   if ( wtot > 0 ) {
 917     dxx /= wtot ;
 918     x   /= wtot ;
 919     dxx -= x * x ;
 920     dzz /= wtot ;
 921     z   /= wtot ;
 922     dzz -= z * z ;
 923     dxz /= wtot ;
 924     dxz -= x * z ;
 925
 926     fLambda[0] =  0.5 * (dxx + dzz) + TMath::Sqrt( 0.25 * (dxx - dzz) * (dxx - dzz) + dxz * dxz )  ;
 927     if(fLambda[0] > 0)
 928       fLambda[0] = TMath::Sqrt(fLambda[0]) ;
 929     else
 930       fLambda[0] = 0;
 931
 932     fLambda[1] =  0.5 * (dxx + dzz) - TMath::Sqrt( 0.25 * (dxx - dzz) * (dxx - dzz) + dxz * dxz )  ;
 933
 934     if(fLambda[1] > 0) //To avoid exception if numerical errors lead to negative lambda.
 935       fLambda[1] = TMath::Sqrt(fLambda[1]) ;
 936     else
 937       fLambda[1]= 0. ;
 938   } else {
 939     fLambda[0]= 0. ;
 940     fLambda[1]= 0. ;
 941   }
 942
 943   //printf("AliEMCALRecPoint::EvalElipsAxis() lambdas  = %f,%f \n", fLambda[0],fLambda[1]) ;
 944
 945 }
 946
 947 //______________________________________________________________________________
 948 void  AliEMCALRecPoint::EvalPrimaries(TClonesArray * digits)
 949 {
 950   // Constructs the list of primary particles (tracks) which
 951   // have contributed to this RecPoint and calculate deposited energy
 952   // for each track
 953
 954   AliEMCALDigit * digit =0;
 955   Int_t * primArray = new Int_t[fMaxTrack] ;
 956   memset(primArray,-1,sizeof(Int_t)*fMaxTrack);
 957   Float_t * dEPrimArray = new Float_t[fMaxTrack] ;
 958   memset(dEPrimArray,-1,sizeof(Int_t)*fMaxTrack);
 959
 960   Int_t index ;
 961   for ( index = 0 ; index < GetDigitsMultiplicity() ; index++ ) { // all digits
 962     digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At( fDigitsList[index] )) ;
 963     if(!digit) {
 964       AliError("No Digit!!");
 965       continue;
 966     }
 967
 968     Int_t nprimaries = digit->GetNprimary() ;
 969     if ( nprimaries == 0 ) continue ;
 970     Int_t jndex ;
 971     for ( jndex = 0 ; jndex < nprimaries ; jndex++ ) { // all primaries in digit
 972       if ( fMulTrack > fMaxTrack ) {
 973         fMulTrack = fMaxTrack ;
 974         Error("EvalPrimaries", "increase fMaxTrack ")  ;
 975         break ;
 976       }
 977       Int_t newPrimary = digit->GetPrimary(jndex+1);
 978       Float_t dEPrimary = digit->GetDEPrimary(jndex+1);
 979       Int_t kndex ;
 980       Bool_t already = kFALSE ;
 981       for ( kndex = 0 ; kndex < fMulTrack ; kndex++ ) { //check if not already stored
 982         if ( newPrimary == primArray[kndex] ){
 983           already = kTRUE ;
 984           dEPrimArray[kndex] += dEPrimary;
 985           break ;
 986         }
 987       } // end of check
 988       if ( !already && (fMulTrack < fMaxTrack)) { // store it
 989         primArray[fMulTrack] = newPrimary ;
 990         dEPrimArray[fMulTrack] = dEPrimary ;
 991         fMulTrack++ ;
 992       } // store it
 993     } // all primaries in digit
 994   } // all digits
 995
 996   Int_t *sortIdx = new Int_t[fMulTrack];
 997   TMath::Sort(fMulTrack,dEPrimArray,sortIdx);
 998   for(index = 0; index < fMulTrack; index++) {
 999     fTracksList[index] = primArray[sortIdx[index]] ;
1000     fDETracksList[index] = dEPrimArray[sortIdx[index]] ;
1001   }
1002   delete [] sortIdx;
1003   delete [] primArray ;
1004   delete [] dEPrimArray ;
1005
1006 }
1007
1008 //______________________________________________________________________________
1009 void  AliEMCALRecPoint::EvalParents(TClonesArray * digits)
1010 {
1011   // Constructs the list of parent particles (tracks) which have contributed to this RecPoint
1012
1013   AliEMCALDigit * digit=0 ;
1014   Int_t * parentArray = new Int_t[fMaxTrack] ;
1015   memset(parentArray,-1,sizeof(Int_t)*fMaxTrack);
1016   Float_t * dEParentArray = new Float_t[fMaxTrack] ;
1017   memset(dEParentArray,-1,sizeof(Int_t)*fMaxTrack);
1018
1019   Int_t index ;
1020   for ( index = 0 ; index < GetDigitsMultiplicity() ; index++ ) { // all digits
1021     if (fDigitsList[index] >= digits->GetEntries() || fDigitsList[index] < 0)
1022       AliError(Form("Trying to get invalid digit %d (idx in WriteRecPoint %d)",fDigitsList[index],index));
1023     digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At( fDigitsList[index] )) ;
1024     if(!digit) {
1025       AliError("No Digit!!");
1026       continue;
1027     }
1028
1029     Int_t nparents = digit->GetNiparent() ;
1030     if ( nparents == 0 ) continue ;
1031
1032     Int_t jndex ;
1033     for ( jndex = 0 ; jndex < nparents ; jndex++ ) { // all primaries in digit
1034       if ( fMulParent > fMaxParent ) {
1035         fMulTrack = - 1 ;
1036         Error("EvalParents", "increase fMaxParent")  ;
1037         break ;
1038       }
1039       Int_t newParent = digit->GetIparent(jndex+1) ;
1040       Float_t newdEParent = digit->GetDEParent(jndex+1) ;
1041       Int_t kndex ;
1042       Bool_t already = kFALSE ;
1043       for ( kndex = 0 ; kndex < fMulParent ; kndex++ ) { //check if not already stored
1044         if ( newParent == parentArray[kndex] ){
1045           dEParentArray[kndex] += newdEParent;
1046           already = kTRUE ;
1047           break ;
1048         }
1049       } // end of check
1050       if ( !already && (fMulParent < fMaxParent)) { // store it
1051         parentArray[fMulParent] = newParent ;
1052         dEParentArray[fMulParent] = newdEParent ;
1053         fMulParent++ ;
1054       } // store it
1055     } // all parents in digit
1056   } // all digits
1057
1058   if (fMulParent>0) {
1059     Int_t *sortIdx = new Int_t[fMulParent];
1060     TMath::Sort(fMulParent,dEParentArray,sortIdx);
1061     for(index = 0; index < fMulParent; index++) {
1062       fParentsList[index] = parentArray[sortIdx[index]] ;
1063       fDEParentsList[index] = dEParentArray[sortIdx[index]] ;
1064     }
1065     delete [] sortIdx;
1066   }
1067
1068   delete [] parentArray;
1069   delete [] dEParentArray;
1070 }
1071
1072 //____________________________________________________________________________
1073 void AliEMCALRecPoint::GetLocalPosition(TVector3 & lpos) const
1074 {
1075   // returns the position of the cluster in the local reference system
1076   // of the sub-detector
1077
1078   lpos = fLocPos;
1079 }
1080
1081 //____________________________________________________________________________
1082 void AliEMCALRecPoint::GetGlobalPosition(TVector3 & gpos) const
1083 {
1084   // returns the position of the cluster in the global reference system of ALICE
1085   // These are now the Cartesian X, Y and Z
1086   //  cout<<" geom "<<geom<<endl;
1087   // fGeomPtr->GetGlobal(fLocPos, gpos, fSuperModuleNumber);
1088   gpos = fGlobPos;
1089
1090 }
1091
1092 //____________________________________________________________________________
1093 //void AliEMCALRecPoint::GetGlobalPosition(TVector3 & gpos, TMatrixF & gmat) const
1094 //{
1095 //  // returns the position of the cluster in the global reference system of ALICE
1096 //  // These are now the Cartesian X, Y and Z
1097 //  //  cout<<" geom "<<geom<<endl;
1098 //
1099 //  //To be implemented
1100 //  fGeomPtr->GetGlobalEMCAL(this, gpos, gmat);
1101 //
1102 //}
1103
1104 //_____________________________________________________________________________
1105 void AliEMCALRecPoint::EvalLocal2TrackingCSTransform()
1106 {
1107   //Evaluates local to "tracking" c.s. transformation (B.P.).
1108   //All evaluations should be completed before calling for this
1109   //function.
1110   //See ALICE PPR Chapter 5 p.18 for "tracking" c.s. definition,
1111   //or just ask Jouri Belikov. :)
1112
1113   SetVolumeId(AliGeomManager::LayerToVolUID(AliGeomManager::kEMCAL,GetSuperModuleNumber()));
1114
1115   const TGeoHMatrix* tr2loc = GetTracking2LocalMatrix();
1116   if(!tr2loc) AliFatal(Form("No Tracking2LocalMatrix found."));
1117
1118   Double_t lxyz[3] = {fLocPos.X(),fLocPos.Y(),fLocPos.Z()};
1119   Double_t txyz[3] = {0,0,0};
1120
1121   tr2loc->MasterToLocal(lxyz,txyz);
1122   SetX(txyz[0]); SetY(txyz[1]); SetZ(txyz[2]);
1123
1124   if(AliLog::GetGlobalDebugLevel()>0) {
1125     TVector3 gpos; //TMatrixF gmat;
1126     //GetGlobalPosition(gpos,gmat); //Not doing anythin special, replace by next line.
1127     fGeomPtr->GetGlobal(fLocPos, gpos, GetSuperModuleNumber());
1128
1129     Float_t gxyz[3];
1130     GetGlobalXYZ(gxyz);
1131     AliInfo(Form("lCS-->(%.3f,%.3f,%.3f), tCS-->(%.3f,%.3f,%.3f), gCS-->(%.3f,%.3f,%.3f),  gCScalc-\
1132 ->(%.3f,%.3f,%.3f), supermodule %d",
1133                  fLocPos.X(),fLocPos.Y(),fLocPos.Z(),
1134                  GetX(),GetY(),GetZ(),
1135                  gpos.X(),gpos.Y(),gpos.Z(),
1136                  gxyz[0],gxyz[1],gxyz[2],GetSuperModuleNumber()));
1137   }
1138
1139 }
1140
1141 //____________________________________________________________________________
1142 Float_t AliEMCALRecPoint::GetMaximalEnergy(void) const
1143 {
1144   // Finds the maximum energy in the cluster
1145
1146   Float_t menergy = 0. ;
1147
1148   Int_t iDigit;
1149   for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
1150
1151     if(fEnergyList[iDigit] > menergy)
1152       menergy = fEnergyList[iDigit] ;
1153   }
1154   return menergy ;
1155 }
1156
1157 //____________________________________________________________________________
1158 Int_t AliEMCALRecPoint::GetMaximalEnergyIndex(void) const
1159 {
1160   // Finds the maximum energy in the cluster
1161
1162   Float_t menergy = 0. ;
1163   Int_t mid       = 0  ;
1164   Int_t iDigit;
1165
1166   for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
1167
1168     if(fEnergyList[iDigit] > menergy){
1169       menergy = fEnergyList[iDigit] ;
1170       mid     = iDigit ;
1171     }
1172   }//loop on cluster digits
1173
1174   return mid ;
1175 }
1176
1177
1178 //____________________________________________________________________________
1179 Int_t AliEMCALRecPoint::GetMultiplicityAtLevel(Float_t H) const
1180 {
1181   // Calculates the multiplicity of digits with energy larger than H*energy
1182
1183   Int_t multipl   = 0 ;
1184   Int_t iDigit ;
1185   for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
1186
1187     if(fEnergyList[iDigit] > H * fAmp)
1188       multipl++ ;
1189   }
1190   return multipl ;
1191 }
1192
1193 //____________________________________________________________________________
1194 Int_t  AliEMCALRecPoint::GetNumberOfLocalMax(AliEMCALDigit **  maxAt, Float_t * maxAtEnergy,
1195                                                Float_t locMaxCut,TClonesArray * digits) const
1196 {
1197   // Calculates the number of local maxima in the cluster using fLocalMaxCut as the minimum
1198   // energy difference between two local maxima
1199
1200   AliEMCALDigit * digit  = 0;
1201   AliEMCALDigit * digitN = 0;
1202
1203   Int_t iDigitN = 0 ;
1204   Int_t iDigit  = 0 ;
1205
1206   for(iDigit = 0; iDigit < fMulDigit; iDigit++)
1207     maxAt[iDigit] = (AliEMCALDigit*) digits->At(fDigitsList[iDigit])  ;
1208
1209   for(iDigit = 0 ; iDigit < fMulDigit; iDigit++) {
1210     if(maxAt[iDigit]) {
1211       digit = maxAt[iDigit] ;
1212
1213       for(iDigitN = 0; iDigitN < fMulDigit; iDigitN++) {
1214         digitN = (AliEMCALDigit *) digits->At(fDigitsList[iDigitN]) ;
1215
1216         if ( AreNeighbours(digit, digitN) ) {
1217           if (fEnergyList[iDigit] > fEnergyList[iDigitN] ) {
1218             maxAt[iDigitN] = 0 ;
1219             // but may be digit too is not local max ?
1220             if(fEnergyList[iDigit] < fEnergyList[iDigitN] + locMaxCut)
1221               maxAt[iDigit] = 0 ;
1222           }
1223           else {
1224             maxAt[iDigit] = 0 ;
1225             // but may be digitN too is not local max ?
1226             if(fEnergyList[iDigit] > fEnergyList[iDigitN] - locMaxCut)
1227               maxAt[iDigitN] = 0 ;
1228           }
1229         } // if Areneighbours
1230       } // while digitN
1231     } // slot not empty
1232   } // while digit
1233
1234   iDigitN = 0 ;
1235   for(iDigit = 0; iDigit < fMulDigit; iDigit++) {
1236     if(maxAt[iDigit] ){
1237       maxAt[iDigitN] = maxAt[iDigit] ;
1238       maxAtEnergy[iDigitN] = fEnergyList[iDigit] ;
1239       iDigitN++ ;
1240     }
1241   }
1242   return iDigitN ;
1243 }
1244
1245 //____________________________________________________________________________
1246 Int_t AliEMCALRecPoint::GetPrimaryIndex() const
1247 {
1248   // Get the primary track index in TreeK which deposits the most energy
1249   // in Digits which forms RecPoint.
1250
1251   if (fMulTrack)
1252     return fTracksList[0];
1253   return -12345;
1254 }
1255
1256 //____________________________________________________________________________
1257 void AliEMCALRecPoint::EvalTime(TClonesArray * digits){
1258   // time is set to the time of the digit with the maximum energy
1259
1260   Float_t maxE  = 0;
1261   Int_t   maxAt = 0;
1262   for(Int_t idig=0; idig < fMulDigit; idig++){
1263     if(fEnergyList[idig] > maxE){
1264       maxE  = fEnergyList[idig] ;
1265       maxAt = idig;
1266     }
1267   }
1268   fTime = ((AliEMCALDigit*) digits->At(fDigitsList[maxAt]))->GetTime() ;
1269
1270 }
1271
1272 //______________________________________________________________________________
1273 void AliEMCALRecPoint::Paint(Option_t *)
1274 {
1275   // Paint this ALiRecPoint as a TMarker  with its current attributes
1276
1277   TVector3 pos(0.,0.,0.)  ;
1278   GetLocalPosition(pos)   ;
1279   Coord_t x = pos.X()     ;
1280   Coord_t y = pos.Z()     ;
1281   Color_t markercolor = 1 ;
1282   Size_t  markersize  = 1.;
1283   Style_t markerstyle = 5 ;
1284
1285   if (!gPad->IsBatch()) {
1286     gVirtualX->SetMarkerColor(markercolor) ;
1287     gVirtualX->SetMarkerSize (markersize)  ;
1288     gVirtualX->SetMarkerStyle(markerstyle) ;
1289   }
1290   gPad->SetAttMarkerPS(markercolor,markerstyle,markersize) ;
1291   gPad->PaintPolyMarker(1,&x,&y,"") ;
1292 }
1293
1294 //_____________________________________________________________________
1295 Double_t AliEMCALRecPoint::TmaxInCm(const Double_t e , const Int_t key)
1296 {
1297   // e energy in GeV)
1298   // key  =  0(gamma, default)
1299   //     !=  0(electron)
1300   const Double_t ca   = 4.82;  // shower max parameter - first guess; ca=TMath::Log(1000./8.07)
1301   Double_t tmax = 0.;    // position of electromagnetic shower max in cm
1302
1303   Double_t x0   = 1.31;  // radiation lenght (cm)
1304   //If old geometry in use
1305   if(!((fGeomPtr->GetEMCGeometry()->GetGeoName()).Contains("V1"))) x0 = 1.28;
1306
1307   if(e>0.1) {
1308     tmax = TMath::Log(e) + ca;
1309     if      (key==0) tmax += 0.5;
1310     else             tmax -= 0.5;
1311     tmax *= x0; // convert to cm
1312   }
1313   return tmax;
1314 }
1315
1316 //______________________________________________________________________________
1317 Float_t AliEMCALRecPoint::EtaToTheta(Float_t arg) const
1318 {
1319   //Converts Theta (Radians) to Eta(Radians)
1320   return (2.*TMath::ATan(TMath::Exp(-arg)));
1321 }
1322
1323 //______________________________________________________________________________
1324 Float_t AliEMCALRecPoint::ThetaToEta(Float_t arg) const
1325 {
1326   //Converts Eta (Radians) to Theta(Radians)
1327   return (-1 * TMath::Log(TMath::Tan(0.5 * arg)));
1328 }
1329
1330 //____________________________________________________________________________
1331 void AliEMCALRecPoint::Print(Option_t *opt) const
1332 {
1333   // Print the list of digits belonging to the cluster
1334   if(strlen(opt)==0) return;
1335   TString message ;
1336   message  = "AliEMCALRecPoint:\n" ;
1337   message +=  " digits # = " ;
1338   AliInfo(message.Data()) ;
1339
1340   Int_t iDigit;
1341   for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++)
1342     printf(" %d ", fDigitsList[iDigit] ) ;
1343   printf("\n");
1344
1345   AliInfo(" Energies = ") ;
1346   for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++)
1347     printf(" %f ", fEnergyList[iDigit] ) ;
1348   printf("\n");
1349
1350   AliInfo("\n Abs Ids = ") ;
1351   for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++)
1352     printf(" %i ", fAbsIdList[iDigit] ) ;
1353   printf("\n");
1354
1355   AliInfo(" Primaries  ") ;
1356   for(iDigit = 0;iDigit < fMulTrack; iDigit++)
1357     printf(" %d ", fTracksList[iDigit]) ;
1358
1359   printf("\n Local x %6.2f y %7.2f z %7.1f \n", fLocPos[0], fLocPos[1], fLocPos[2]);
1360
1361   message  = "       ClusterType     = %d" ;
1362   message += "       Multiplicity    = %d" ;
1363   message += "       Cluster Energy  = %f" ;
1364   message += "       Core energy     = %f" ;
1365   message += "       Core radius     = %f" ;
1366   message += "       Number of primaries %d" ;
1367   message += "       Stored at position %d" ;
1368   AliInfo(Form(message.Data(), fClusterType, fMulDigit, fAmp, fCoreEnergy, fCoreRadius, fMulTrack, GetIndexInList()) ) ;
1369 }
1370
1371 //___________________________________________________________
1372 Double_t  AliEMCALRecPoint::GetPointEnergy() const
1373 {
1374   //Returns energy ....
1375   Double_t e=0.0;
1376   for(int ic=0; ic<GetMultiplicity(); ic++) e += double(fEnergyList[ic]);
1377   return e;
1378 }