correct mask for V0 charge decoding in STU payload
[u/mrichter/AliRoot.git] / EMCAL / AliEMCALRecoUtils.h
1 #ifndef ALIEMCALRECOUTILS_H
2 #define ALIEMCALRECOUTILS_H
3
4 /* $Id: AliEMCALRecoUtils.h 33808 2009-07-15 09:48:08Z gconesab $ */
5
6 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
7 //
8 // Class AliEMCALRecoUtils
9 // Some utilities to recalculate the cluster position or energy linearity
10 //
11 //
12 // Author:  Gustavo Conesa (LPSC- Grenoble) 
13 //          Track matching part: Rongrong Ma (Yale)
14 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
15
16 //Root includes
17 #include <TNamed.h>
18 #include <TMath.h>
19 class TObjArray;
20 class TArrayI;
21 class TArrayF;
22 #include <TH2I.h>
23 class TH2F;
24 #include <TRandom3.h>
25
26 //AliRoot includes
27 class AliVCluster;
28 class AliVCaloCells;
29 class AliVEvent;
30 #include "AliESDEvent.h"
31
32 // EMCAL includes
33 class AliEMCALGeometry;
34 class AliEMCALPIDUtils;
35 class AliESDtrack;
36 class AliExternalTrackParam;
37
38 class AliEMCALRecoUtils : public TNamed {
39   
40 public:
41   
42   AliEMCALRecoUtils();
43   AliEMCALRecoUtils(const AliEMCALRecoUtils&); 
44   AliEMCALRecoUtils& operator=(const AliEMCALRecoUtils&); 
45   virtual ~AliEMCALRecoUtils() ;  
46   void     Print(const Option_t*) const;
47
48   //enums
49   enum     NonlinearityFunctions{kPi0MC=0,kPi0GammaGamma=1,kPi0GammaConversion=2,kNoCorrection=3,kBeamTest=4,kBeamTestCorrected=5};
50   enum     PositionAlgorithms{kUnchanged=-1,kPosTowerIndex=0, kPosTowerGlobal=1};
51   enum     ParticleType{kPhoton=0, kElectron=1,kHadron =2, kUnknown=-1};
52   enum     { kNCuts = 11 }; //track matching
53   enum     TrackCutsType{kTPCOnlyCut=0, kGlobalCut=1, kLooseCut=2};
54
55   //-----------------------------------------------------
56   //Position recalculation
57   //-----------------------------------------------------
58
59   void     RecalculateClusterPosition               (AliEMCALGeometry *geom, AliVCaloCells* cells, AliVCluster* clu); 
60   void     RecalculateClusterPositionFromTowerIndex (AliEMCALGeometry *geom, AliVCaloCells* cells, AliVCluster* clu); 
61   void     RecalculateClusterPositionFromTowerGlobal(AliEMCALGeometry *geom, AliVCaloCells* cells, AliVCluster* clu); 
62   
63   Float_t  GetCellWeight(const Float_t eCell, const Float_t eCluster) const { return TMath::Max( 0., fW0 + TMath::Log( eCell / eCluster )) ; }
64   
65   Float_t  GetDepth(const Float_t eCluster, const Int_t iParticle, const Int_t iSM) const ; 
66   
67   void     GetMaxEnergyCell(AliEMCALGeometry *geom, AliVCaloCells* cells, AliVCluster* clu, 
68                             Int_t & absId,  Int_t& iSupMod, Int_t& ieta, Int_t& iphi, Bool_t &shared);
69   
70   Float_t  GetMisalTransShift(const Int_t i)       const { if(i < 15 ) { return fMisalTransShift[i] ; }
71                                                            else        { AliInfo(Form("Index %d larger than 15, do nothing\n",i)) ; 
72                                                                          return 0.                  ; } }
73   Float_t* GetMisalTransShiftArray()                     { return fMisalTransShift ; }
74
75   void     SetMisalTransShift(const Int_t i, const Float_t shift) {
76                                                            if(i < 15 ) { fMisalTransShift[i] = shift ; }
77                                                            else        { AliInfo(Form("Index %d larger than 15, do nothing\n",i)) ; } }
78   void     SetMisalTransShiftArray(Float_t * misal)               { for(Int_t i = 0; i < 15; i++) fMisalTransShift[i] = misal[i]  ; }
79
80   Float_t  GetMisalRotShift(const Int_t i)         const { if(i < 15 ) { return fMisalRotShift[i]    ; }
81                                                            else        { AliInfo(Form("Index %d larger than 15, do nothing\n",i)) ; 
82                                                                          return 0.                   ; } }
83   
84   Float_t* GetMisalRotShiftArray()                       { return fMisalRotShift                     ; }
85   
86   void     SetMisalRotShift(const Int_t i, const Float_t shift) {
87                                                            if(i < 15 ) { fMisalRotShift[i] = shift   ; }
88                                                            else        { AliInfo(Form("Index %d larger than 15, do nothing\n",i)) ; } }
89   
90   void     SetMisalRotShiftArray(Float_t * misal)        { for(Int_t i = 0; i < 15; i++)fMisalRotShift[i] = misal[i] ; }
91   
92   Int_t    GetParticleType()                       const { return  fParticleType    ; }
93   void     SetParticleType(Int_t particle)               { fParticleType = particle ; }
94   
95   Int_t    GetPositionAlgorithm()                  const { return fPosAlgo          ; }
96   void     SetPositionAlgorithm(Int_t alg)               { fPosAlgo = alg           ; }
97   
98   Float_t  GetW0()                                 const { return fW0               ; }
99   void     SetW0(Float_t w0)                             { fW0  = w0                ; }
100
101   //-----------------------------------------------------
102   // Non Linearity
103   //-----------------------------------------------------
104
105   Float_t  CorrectClusterEnergyLinearity(AliVCluster* clu) ;
106   
107   Float_t  GetNonLinearityParam(const Int_t i)     const { if(i < 7 ){ return fNonLinearityParams[i] ; }
108                                                           else      { AliInfo(Form("Index %d larger than 7, do nothing\n",i)) ; 
109                                                                        return 0.                     ; } }
110   void     SetNonLinearityParam(const Int_t i, const Float_t param) {
111                                                           if(i < 7 ){fNonLinearityParams[i] = param ; }
112                                                           else { AliInfo(Form("Index %d larger than 7, do nothing\n",i)) ; } }
113   void     InitNonLinearityParam();
114
115   Int_t    GetNonLinearityFunction() const               { return fNonLinearityFunction    ; }
116   void     SetNonLinearityFunction(Int_t fun)            { fNonLinearityFunction = fun     ; InitNonLinearityParam() ; }
117
118   void     SetNonLinearityThreshold(Int_t threshold)     { fNonLinearThreshold = threshold ; } //only for Alexie's non linearity correction
119   Int_t    GetNonLinearityThreshold()              const { return fNonLinearThreshold      ; }
120 //  
121   //-----------------------------------------------------
122   // MC clusters energy smearing
123   //-----------------------------------------------------
124   
125   Float_t  SmearClusterEnergy(AliVCluster* clu) ;
126   void     SwitchOnClusterEnergySmearing()               { fSmearClusterEnergy = kTRUE         ; }
127   void     SwitchOffClusterEnergySmearing()              { fSmearClusterEnergy = kFALSE        ; }
128   Bool_t   IsClusterEnergySmeared()                const { return fSmearClusterEnergy          ; }   
129   void     SetSmearingParameters(Int_t i, Float_t param) { if(i < 3){ fSmearClusterParam[i] = param ; }
130                                                            else     { AliInfo(Form("Index %d larger than 2, do nothing\n",i)) ; } }
131   //-----------------------------------------------------
132   // Recalibration
133   //-----------------------------------------------------
134   Bool_t   AcceptCalibrateCell(const Int_t absId, const Int_t bc,
135                                Float_t & amp, Double_t & time, AliVCaloCells* cells) ; // Energy and Time
136   void     RecalibrateCells(AliVCaloCells * cells, Int_t bc) ; // Energy and Time
137   void     RecalibrateClusterEnergy(AliEMCALGeometry* geom, AliVCluster* cluster, AliVCaloCells * cells, const Int_t bc=-1) ; // Energy and time
138
139   // Energy recalibration
140   Bool_t   IsRecalibrationOn()                     const { return fRecalibration ; }
141   void     SwitchOffRecalibration()                      { fRecalibration = kFALSE ; }
142   void     SwitchOnRecalibration()                       { fRecalibration = kTRUE  ; 
143                                                            if(!fEMCALRecalibrationFactors)InitEMCALRecalibrationFactors() ; }
144   void     InitEMCALRecalibrationFactors() ;
145
146   TH2F *   GetEMCALChannelRecalibrationFactors(Int_t iSM)     const { return (TH2F*)fEMCALRecalibrationFactors->At(iSM) ; }     
147   void     SetEMCALChannelRecalibrationFactors(TObjArray *map)      { fEMCALRecalibrationFactors = map                  ; }
148   void     SetEMCALChannelRecalibrationFactors(Int_t iSM , TH2F* h) { fEMCALRecalibrationFactors->AddAt(h,iSM)          ; }
149   
150   Float_t  GetEMCALChannelRecalibrationFactor(Int_t iSM , Int_t iCol, Int_t iRow) const { 
151     if(fEMCALRecalibrationFactors) 
152       return (Float_t) ((TH2F*)fEMCALRecalibrationFactors->At(iSM))->GetBinContent(iCol,iRow); 
153     else return 1 ; } 
154         
155   void     SetEMCALChannelRecalibrationFactor(Int_t iSM , Int_t iCol, Int_t iRow, Double_t c = 1) { 
156     if(!fEMCALRecalibrationFactors) InitEMCALRecalibrationFactors() ;
157     ((TH2F*)fEMCALRecalibrationFactors->At(iSM))->SetBinContent(iCol,iRow,c) ; }
158   
159   //Recalibrate channels energy with run dependent corrections
160   void     SwitchOffRunDepCorrection()                   { fUseRunCorrectionFactors = kFALSE ; }
161   void     SwitchOnRunDepCorrection()                    { fUseRunCorrectionFactors = kTRUE  ; 
162                                                            SwitchOnRecalibration()           ; }
163   void     SetRunDependentCorrections(Int_t runnumber);
164       
165   // Time Recalibration  
166   void     RecalibrateCellTime(const Int_t absId, const Int_t bc, Double_t & time);
167   
168   Bool_t   IsTimeRecalibrationOn()                 const { return fTimeRecalibration   ; }
169   void     SwitchOffTimeRecalibration()                  { fTimeRecalibration = kFALSE ; }
170   void     SwitchOnTimeRecalibration()                   { fTimeRecalibration = kTRUE  ; 
171     if(!fEMCALTimeRecalibrationFactors)InitEMCALTimeRecalibrationFactors() ; }
172   void     InitEMCALTimeRecalibrationFactors() ;
173   
174   Float_t  GetEMCALChannelTimeRecalibrationFactor(const Int_t bc, const Int_t absID) const { 
175     if(fEMCALTimeRecalibrationFactors) 
176       return (Float_t) ((TH1F*)fEMCALTimeRecalibrationFactors->At(bc))->GetBinContent(absID); 
177     else return 0 ; } 
178         
179   void     SetEMCALChannelTimeRecalibrationFactor(const Int_t bc, const Int_t absID, Double_t c = 0) { 
180     if(!fEMCALTimeRecalibrationFactors) InitEMCALTimeRecalibrationFactors() ;
181     ((TH1F*)fEMCALTimeRecalibrationFactors->At(bc))->SetBinContent(absID,c) ; }  
182   
183   TH1F *   GetEMCALChannelTimeRecalibrationFactors(const Int_t bc)const       { return (TH1F*)fEMCALTimeRecalibrationFactors->At(bc) ; }        
184   void     SetEMCALChannelTimeRecalibrationFactors(TObjArray *map)            { fEMCALTimeRecalibrationFactors = map                 ; }
185   void     SetEMCALChannelTimeRecalibrationFactors(const Int_t bc , TH1F* h)  { fEMCALTimeRecalibrationFactors->AddAt(h,bc)          ; }
186   
187   //-----------------------------------------------------
188   // Modules fiducial region, remove clusters in borders
189   //-----------------------------------------------------
190
191   Bool_t   CheckCellFiducialRegion(AliEMCALGeometry* geom, AliVCluster* cluster, AliVCaloCells* cells) ;
192   void     SetNumberOfCellsFromEMCALBorder(const Int_t n){ fNCellsFromEMCALBorder = n      ; }
193   Int_t    GetNumberOfCellsFromEMCALBorder()      const  { return fNCellsFromEMCALBorder   ; }
194     
195   void     SwitchOnNoFiducialBorderInEMCALEta0()         { fNoEMCALBorderAtEta0 = kTRUE    ; }
196   void     SwitchOffNoFiducialBorderInEMCALEta0()        { fNoEMCALBorderAtEta0 = kFALSE   ; }
197   Bool_t   IsEMCALNoBorderAtEta0()                 const { return fNoEMCALBorderAtEta0     ; }
198   
199   //-----------------------------------------------------
200   // Bad channels
201   //-----------------------------------------------------
202
203   Bool_t   IsBadChannelsRemovalSwitchedOn()        const { return fRemoveBadChannels       ; }
204   void     SwitchOffBadChannelsRemoval()                 { fRemoveBadChannels = kFALSE     ; }
205   void     SwitchOnBadChannelsRemoval ()                 { fRemoveBadChannels = kTRUE ; 
206                                                            if(!fEMCALBadChannelMap)InitEMCALBadChannelStatusMap() ; }
207         
208   Bool_t   IsDistanceToBadChannelRecalculated()    const { return fRecalDistToBadChannels   ; }
209   void     SwitchOffDistToBadChannelRecalculation()      { fRecalDistToBadChannels = kFALSE ; }
210   void     SwitchOnDistToBadChannelRecalculation()       { fRecalDistToBadChannels = kTRUE  ; 
211                                                            if(!fEMCALBadChannelMap)InitEMCALBadChannelStatusMap() ; }
212   
213   void     InitEMCALBadChannelStatusMap() ;
214         
215   Int_t    GetEMCALChannelStatus(Int_t iSM , Int_t iCol, Int_t iRow) const { 
216     if(fEMCALBadChannelMap) return (Int_t) ((TH2I*)fEMCALBadChannelMap->At(iSM))->GetBinContent(iCol,iRow); 
217     else return 0;}//Channel is ok by default
218         
219   void     SetEMCALChannelStatus(Int_t iSM , Int_t iCol, Int_t iRow, Double_t c = 1) { 
220                                                            if(!fEMCALBadChannelMap)InitEMCALBadChannelStatusMap()               ;
221                                                            ((TH2I*)fEMCALBadChannelMap->At(iSM))->SetBinContent(iCol,iRow,c)    ; }
222         
223   TH2I *   GetEMCALChannelStatusMap(Int_t iSM)     const { return (TH2I*)fEMCALBadChannelMap->At(iSM) ; }
224   void     SetEMCALChannelStatusMap(TObjArray *map)      { fEMCALBadChannelMap = map                  ; }
225   void     SetEMCALChannelStatusMap(Int_t iSM , TH2I* h) { fEMCALBadChannelMap->AddAt(h,iSM)          ; }
226
227   Bool_t   ClusterContainsBadChannel(AliEMCALGeometry* geom, UShort_t* cellList, const Int_t nCells);
228  
229   //-----------------------------------------------------
230   // Recalculate other cluster parameters
231   //-----------------------------------------------------
232
233   void     RecalculateClusterDistanceToBadChannel (AliEMCALGeometry * geom, AliVCaloCells* cells, AliVCluster * cluster);
234   void     RecalculateClusterShowerShapeParameters(AliEMCALGeometry * geom, AliVCaloCells* cells, AliVCluster * cluster);
235   void     RecalculateClusterPID(AliVCluster * cluster);
236
237   AliEMCALPIDUtils * GetPIDUtils() { return fPIDUtils;}
238
239
240   //----------------------------------------------------
241   // Track matching
242   //----------------------------------------------------
243
244   void     FindMatches(AliVEvent *event, TObjArray * clusterArr=0x0, AliEMCALGeometry *geom=0x0);
245   Int_t    FindMatchedClusterInEvent(AliESDtrack *track, AliVEvent *event, AliEMCALGeometry *geom, Float_t &dEta, Float_t &dPhi);
246   Int_t    FindMatchedClusterInClusterArr(AliExternalTrackParam *emcalParam, AliExternalTrackParam *trkParam, TObjArray * clusterArr, Float_t &dEta, Float_t &dPhi);
247   
248   static Bool_t ExtrapolateTrackToEMCalSurface(AliExternalTrackParam *trkParam, Double_t emcalR, Double_t mass, Double_t step, Float_t &eta, Float_t &phi);
249   static Bool_t ExtrapolateTrackToPosition(AliExternalTrackParam *trkParam, Float_t *clsPos, Double_t mass, Double_t step, Float_t &tmpEta, Float_t &tmpPhi);
250   static Bool_t ExtrapolateTrackToCluster (AliExternalTrackParam *trkParam, AliVCluster *cluster, Double_t mass, Double_t step, Float_t &tmpEta, Float_t &tmpPhi);
251   Bool_t        ExtrapolateTrackToCluster (AliExternalTrackParam *trkParam, AliVCluster *cluster, Float_t &tmpEta, Float_t &tmpPhi);
252
253   UInt_t   FindMatchedPosForCluster(Int_t clsIndex) const;
254   UInt_t   FindMatchedPosForTrack(Int_t trkIndex)   const;
255   
256   void     GetMatchedResiduals(Int_t clsIndex, Float_t &dEta, Float_t &dPhi);
257   void     GetMatchedClusterResiduals(Int_t trkIndex, Float_t &dEta, Float_t &dPhi);
258   Int_t    GetMatchedTrackIndex(Int_t clsIndex);
259   Int_t    GetMatchedClusterIndex(Int_t trkIndex);
260   
261   Bool_t   IsClusterMatched(Int_t clsIndex)         const;
262   Bool_t   IsTrackMatched(Int_t trkIndex)           const;
263
264   void     SetClusterMatchedToTrack (AliESDEvent *event);
265   
266   void     SetTracksMatchedToCluster(AliESDEvent *event);  
267
268   void     SwitchOnCutEtaPhiSum()                     { fCutEtaPhiSum      = kTRUE    ; 
269                                                         fCutEtaPhiSeparate = kFALSE   ; }
270   void     SwitchOnCutEtaPhiSeparate()                { fCutEtaPhiSeparate = kTRUE    ;
271                                                         fCutEtaPhiSum      = kFALSE   ; }
272
273   Float_t  GetCutR()                            const { return fCutR                  ; }
274   Float_t  GetCutEta()                          const { return fCutEta                ; }
275   Float_t  GetCutPhi()                          const { return fCutPhi                ; }
276   Double_t GetClusterWindow()                   const { return fClusterWindow         ; }
277   void     SetCutR(Float_t cutR)                      { fCutR   = cutR                ; }
278   void     SetCutEta(Float_t cutEta)                  { fCutEta = cutEta              ; }
279   void     SetCutPhi(Float_t cutPhi)                  { fCutPhi = cutPhi              ; }
280   void     SetClusterWindow(Double_t window)          { fClusterWindow = window       ; }
281   void     SetCutZ(Float_t cutZ)                      { printf("Obsolete fucntion of cutZ=%1.1f\n",cutZ) ; } //Obsolete
282
283   Double_t GetMass()                            const { return fMass                  ; }
284   Double_t GetStep()                            const { return fStepCluster           ; }
285   Double_t GetStepSurface()                     const { return fStepSurface           ; }
286   void     SetMass(Double_t mass)                     { fMass = mass                  ; }
287   void     SetStep(Double_t step)                     { fStepSurface = step           ; }
288   void     SetStepCluster(Double_t step)              { fStepCluster = step           ; }
289  
290   // Exotic cells / clusters
291   
292   Bool_t   IsExoticCell(const Int_t absId, AliVCaloCells* cells, const Int_t bc =-1) ;
293   void     SwitchOnRejectExoticCell()                 { fRejectExoticCells = kTRUE     ; }
294   void     SwitchOffRejectExoticCell()                { fRejectExoticCells = kFALSE    ; } 
295    
296   void     SetExoticCellFractionCut(Float_t f)        { fExoticCellFraction     = f    ; }
297   void     SetExoticCellDiffTimeCut(Float_t dt)       { fExoticCellDiffTime     = dt   ; }
298   void     SetExoticCellMinAmplitudeCut(Float_t ma)   { fExoticCellMinAmplitude = ma   ; }
299   
300   Bool_t   IsExoticCluster(AliVCluster *cluster, AliVCaloCells* cells, const Int_t bc=0) ;
301   void     SwitchOnRejectExoticCluster()              { fRejectExoticCluster = kTRUE   ;
302                                                         fRejectExoticCells   = kTRUE   ; }
303   void     SwitchOffRejectExoticCluster()             { fRejectExoticCluster = kFALSE  ; }
304   Bool_t   IsRejectExoticCluster()              const { return fRejectExoticCluster    ; }
305   
306   //Cluster cut
307   Bool_t   IsGoodCluster(AliVCluster *cluster, AliEMCALGeometry *geom, AliVCaloCells* cells, const Int_t bc =-1);
308
309   //Track Cuts 
310   Bool_t   IsAccepted(AliESDtrack *track);
311   void     InitTrackCuts();
312   void     SetTrackCutsType(Int_t type)              { fTrackCutsType = type           ; 
313                                                        InitTrackCuts()                 ; }
314   Int_t    GetTrackCutsType() const                  { return fTrackCutsType; }
315
316   // track quality cut setters  
317   void     SetMinTrackPt(Double_t pt=0)              { fCutMinTrackPt           = pt   ; }
318   void     SetMinNClustersTPC(Int_t min=-1)          { fCutMinNClusterTPC       = min  ; }
319   void     SetMinNClustersITS(Int_t min=-1)          { fCutMinNClusterITS       = min  ; }
320   void     SetMaxChi2PerClusterTPC(Float_t max=1e10) { fCutMaxChi2PerClusterTPC = max  ; }
321   void     SetMaxChi2PerClusterITS(Float_t max=1e10) { fCutMaxChi2PerClusterITS = max  ; }
322   void     SetRequireTPCRefit(Bool_t b=kFALSE)       { fCutRequireTPCRefit      = b    ; }
323   void     SetRequireITSRefit(Bool_t b=kFALSE)       { fCutRequireITSRefit      = b    ; }
324   void     SetAcceptKinkDaughters(Bool_t b=kTRUE)    { fCutAcceptKinkDaughters  = b    ; }
325   void     SetMaxDCAToVertexXY(Float_t dist=1e10)    { fCutMaxDCAToVertexXY     = dist ; }
326   void     SetMaxDCAToVertexZ(Float_t dist=1e10)     { fCutMaxDCAToVertexZ      = dist ; }
327   void     SetDCAToVertex2D(Bool_t b=kFALSE)         { fCutDCAToVertex2D        = b    ; }
328
329   // getters                                                            
330   Double_t GetMinTrackPt()                     const { return fCutMinTrackPt           ; }
331   Int_t    GetMinNClusterTPC()                 const { return fCutMinNClusterTPC       ; }
332   Int_t    GetMinNClustersITS()                const { return fCutMinNClusterITS       ; }
333   Float_t  GetMaxChi2PerClusterTPC()           const { return fCutMaxChi2PerClusterTPC ; }
334   Float_t  GetMaxChi2PerClusterITS()           const { return fCutMaxChi2PerClusterITS ; }
335   Bool_t   GetRequireTPCRefit()                const { return fCutRequireTPCRefit      ; }
336   Bool_t   GetRequireITSRefit()                const { return fCutRequireITSRefit      ; }
337   Bool_t   GetAcceptKinkDaughters()            const { return fCutAcceptKinkDaughters  ; }
338   Float_t  GetMaxDCAToVertexXY()               const { return fCutMaxDCAToVertexXY     ; }
339   Float_t  GetMaxDCAToVertexZ()                const { return fCutMaxDCAToVertexZ      ; }
340   Bool_t   GetDCAToVertex2D()                  const { return fCutDCAToVertex2D        ; }
341
342
343 private:  
344   //Position recalculation
345   Float_t    fMisalTransShift[15];       // Shift parameters
346   Float_t    fMisalRotShift[15];         // Shift parameters
347   Int_t      fParticleType;              // Particle type for depth calculation
348   Int_t      fPosAlgo;                   // Position recalculation algorithm
349   Float_t    fW0;                        // Weight0
350     
351   // Non linearity
352   Int_t      fNonLinearityFunction;      // Non linearity function choice
353   Float_t    fNonLinearityParams[7];     // Parameters for the non linearity function
354   Int_t      fNonLinearThreshold;        // Non linearity threshold value for kBeamTesh non linearity function 
355   
356   // Energy smearing for MC
357   Bool_t     fSmearClusterEnergy;        // Smear cluster energy, to be done only for simulated data to match real data
358   Float_t    fSmearClusterParam[3];      // Smearing parameters
359   TRandom3   fRandom;                    // Random generator
360     
361   // Energy Recalibration 
362   Bool_t     fCellsRecalibrated;         // Internal bool to check if cells (time/energy) where recalibrated and not recalibrate them when recalculating different things
363   Bool_t     fRecalibration;             // Switch on or off the recalibration
364   TObjArray* fEMCALRecalibrationFactors; // Array of histograms with map of recalibration factors, EMCAL
365     
366   // Time Recalibration 
367   Bool_t     fTimeRecalibration;             // Switch on or off the time recalibration
368   TObjArray* fEMCALTimeRecalibrationFactors; // Array of histograms with map of time recalibration factors, EMCAL
369   
370   // Recalibrate with run dependent corrections, energy
371   Bool_t     fUseRunCorrectionFactors;   // Use Run Dependent Correction
372   Bool_t     fRunCorrectionFactorsSet;   // Run Correction set at leat once
373     
374   // Bad Channels
375   Bool_t     fRemoveBadChannels;         // Check the channel status provided and remove clusters with bad channels
376   Bool_t     fRecalDistToBadChannels;    // Calculate distance from highest energy tower of cluster to closes bad channel
377   TObjArray* fEMCALBadChannelMap;        // Array of histograms with map of bad channels, EMCAL
378
379   // Border cells
380   Int_t      fNCellsFromEMCALBorder;     // Number of cells from EMCAL border the cell with maximum amplitude has to be.
381   Bool_t     fNoEMCALBorderAtEta0;       // Do fiducial cut in EMCAL region eta = 0?
382   
383   // Exotic cell / cluster
384   Bool_t     fRejectExoticCluster;       // Switch on or off exotic cluster rejection
385   Bool_t     fRejectExoticCells;         // Remove exotic cells
386   Float_t    fExoticCellFraction;        // Good cell if fraction < 1-ecross/ecell
387   Float_t    fExoticCellDiffTime;        // If time of candidate to exotic and close cell is too different (in ns), it must be noisy, set amp to 0
388   Float_t    fExoticCellMinAmplitude;    // Check for exotic only if amplitud is larger than this value
389   
390   // PID
391   AliEMCALPIDUtils * fPIDUtils;          // Recalculate PID parameters
392     
393   //Track matching
394   UInt_t     fAODFilterMask;             // Filter mask to select AOD tracks. Refer to $ALICE_ROOT/ANALYSIS/macros/AddTaskESDFilter.C
395   TArrayI  * fMatchedTrackIndex;         // Array that stores indexes of matched tracks      
396   TArrayI  * fMatchedClusterIndex;       // Array that stores indexes of matched clusters
397   TArrayF  * fResidualEta;               // Array that stores the residual eta
398   TArrayF  * fResidualPhi;               // Array that stores the residual phi
399   Bool_t     fCutEtaPhiSum;              // Place cut on sqrt(dEta^2+dPhi^2)
400   Bool_t     fCutEtaPhiSeparate;         // Cut on dEta and dPhi separately
401   Float_t    fCutR;                      // sqrt(dEta^2+dPhi^2) cut on matching
402   Float_t    fCutEta;                    // dEta cut on matching
403   Float_t    fCutPhi;                    // dPhi cut on matching
404   Double_t   fClusterWindow;             // Select clusters in the window to be matched
405   Double_t   fMass;                      // Mass hypothesis of the track
406   Double_t   fStepSurface;               // Length of step to extrapolate tracks to EMCal surface
407   Double_t   fStepCluster;               // Length of step to extrapolate tracks to clusters
408
409   // Track cuts  
410   Int_t      fTrackCutsType;             // Esd track cuts type for matching
411   Double_t   fCutMinTrackPt;             // Cut on track pT
412   Int_t      fCutMinNClusterTPC;         // Min number of tpc clusters
413   Int_t      fCutMinNClusterITS;         // Min number of its clusters  
414   Float_t    fCutMaxChi2PerClusterTPC;   // Max tpc fit chi2 per tpc cluster
415   Float_t    fCutMaxChi2PerClusterITS;   // Max its fit chi2 per its cluster
416   Bool_t     fCutRequireTPCRefit;        // Require TPC refit
417   Bool_t     fCutRequireITSRefit;        // Require ITS refit
418   Bool_t     fCutAcceptKinkDaughters;    // Accepting kink daughters?
419   Float_t    fCutMaxDCAToVertexXY;       // Track-to-vertex cut in max absolute distance in xy-plane
420   Float_t    fCutMaxDCAToVertexZ;        // Track-to-vertex cut in max absolute distance in z-plane
421   Bool_t     fCutDCAToVertex2D;          // If true a 2D DCA cut is made.
422   
423   ClassDef(AliEMCALRecoUtils, 17)
424   
425 };
426
427 #endif // ALIEMCALRECOUTILS_H
428
429