coverity
[u/mrichter/AliRoot.git] / EMCAL / AliEMCALRecoUtils.h
1 #ifndef ALIEMCALRECOUTILS_H
2 #define ALIEMCALRECOUTILS_H
3
4 /* $Id: AliEMCALRecoUtils.h 33808 2009-07-15 09:48:08Z gconesab $ */
5
6 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
7 //
8 // Class AliEMCALRecoUtils
9 // Some utilities to recalculate the cluster position or energy linearity
10 //
11 //
12 // Author:  Gustavo Conesa (LPSC- Grenoble) 
13 //          Track matching part: Rongrong Ma (Yale)
14 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
15
16 //Root includes
17 #include <TNamed.h>
18 #include <TMath.h>
19 class TObjArray;
20 class TArrayI;
21 class TArrayF;
22 #include <TH2I.h>
23 class TH2F;
24 #include <TRandom3.h>
25
26 //AliRoot includes
27 class AliVCluster;
28 class AliVCaloCells;
29 class AliVEvent;
30 class AliESDEvent;
31 #include "AliLog.h"
32
33 // EMCAL includes
34 class AliEMCALGeometry;
35 class AliEMCALPIDUtils;
36 class AliESDtrack;
37 class AliExternalTrackParam;
38
39 class AliEMCALRecoUtils : public TNamed {
40   
41 public:
42   
43   AliEMCALRecoUtils();
44   AliEMCALRecoUtils(const AliEMCALRecoUtils&); 
45   AliEMCALRecoUtils& operator=(const AliEMCALRecoUtils&); 
46   virtual ~AliEMCALRecoUtils() ;  
47   
48   void     InitParameters();
49   
50   void     Print(const Option_t*) const;
51
52   //enums
53   enum     NonlinearityFunctions{kPi0MC=0,kPi0GammaGamma=1,kPi0GammaConversion=2,kNoCorrection=3,kBeamTest=4,kBeamTestCorrected=5};
54   enum     PositionAlgorithms{kUnchanged=-1,kPosTowerIndex=0, kPosTowerGlobal=1};
55   enum     ParticleType{kPhoton=0, kElectron=1,kHadron =2, kUnknown=-1};
56   enum     { kNCuts = 11 }; //track matching
57   enum     TrackCutsType{kTPCOnlyCut=0, kGlobalCut=1, kLooseCut=2};
58
59   //-----------------------------------------------------
60   //Position recalculation
61   //-----------------------------------------------------
62
63   void     RecalculateClusterPosition               (AliEMCALGeometry *geom, AliVCaloCells* cells, AliVCluster* clu); 
64   void     RecalculateClusterPositionFromTowerIndex (AliEMCALGeometry *geom, AliVCaloCells* cells, AliVCluster* clu); 
65   void     RecalculateClusterPositionFromTowerGlobal(AliEMCALGeometry *geom, AliVCaloCells* cells, AliVCluster* clu); 
66   
67   Float_t  GetCellWeight(const Float_t eCell, const Float_t eCluster) const { return TMath::Max( 0., fW0 + TMath::Log( eCell / eCluster )) ; }
68   
69   Float_t  GetDepth(const Float_t eCluster, const Int_t iParticle, const Int_t iSM) const ; 
70   
71   void     GetMaxEnergyCell(const AliEMCALGeometry *geom, AliVCaloCells* cells, const AliVCluster* clu, 
72                             Int_t & absId,  Int_t& iSupMod, Int_t& ieta, Int_t& iphi, Bool_t &shared);
73   
74   Float_t  GetMisalTransShift(const Int_t i)       const { if(i < 15 ) { return fMisalTransShift[i] ; }
75                                                            else        { AliInfo(Form("Index %d larger than 15, do nothing\n",i)) ; 
76                                                                          return 0.                  ; } }
77   Float_t* GetMisalTransShiftArray()                     { return fMisalTransShift ; }
78
79   void     SetMisalTransShift(const Int_t i, const Float_t shift) {
80                                                            if(i < 15 ) { fMisalTransShift[i] = shift ; }
81                                                            else        { AliInfo(Form("Index %d larger than 15, do nothing\n",i)) ; } }
82   void     SetMisalTransShiftArray(Float_t * misal)               { for(Int_t i = 0; i < 15; i++) fMisalTransShift[i] = misal[i]  ; }
83
84   Float_t  GetMisalRotShift(const Int_t i)         const { if(i < 15 ) { return fMisalRotShift[i]    ; }
85                                                            else        { AliInfo(Form("Index %d larger than 15, do nothing\n",i)) ; 
86                                                                          return 0.                   ; } }
87   
88   Float_t* GetMisalRotShiftArray()                       { return fMisalRotShift                     ; }
89   
90   void     SetMisalRotShift(const Int_t i, const Float_t shift) {
91                                                            if(i < 15 ) { fMisalRotShift[i] = shift   ; }
92                                                            else        { AliInfo(Form("Index %d larger than 15, do nothing\n",i)) ; } }
93   
94   void     SetMisalRotShiftArray(Float_t * misal)        { for(Int_t i = 0; i < 15; i++)fMisalRotShift[i] = misal[i] ; }
95   
96   Int_t    GetParticleType()                       const { return  fParticleType    ; }
97   void     SetParticleType(Int_t particle)               { fParticleType = particle ; }
98   
99   Int_t    GetPositionAlgorithm()                  const { return fPosAlgo          ; }
100   void     SetPositionAlgorithm(Int_t alg)               { fPosAlgo = alg           ; }
101   
102   Float_t  GetW0()                                 const { return fW0               ; }
103   void     SetW0(Float_t w0)                             { fW0  = w0                ; }
104
105   //-----------------------------------------------------
106   // Non Linearity
107   //-----------------------------------------------------
108
109   Float_t  CorrectClusterEnergyLinearity(AliVCluster* clu) ;
110   
111   Float_t  GetNonLinearityParam(const Int_t i)     const { if(i < 7 ){ return fNonLinearityParams[i] ; }
112                                                           else      { AliInfo(Form("Index %d larger than 7, do nothing\n",i)) ; 
113                                                                        return 0.                     ; } }
114   void     SetNonLinearityParam(const Int_t i, const Float_t param) {
115                                                           if(i < 7 ){fNonLinearityParams[i] = param ; }
116                                                           else { AliInfo(Form("Index %d larger than 7, do nothing\n",i)) ; } }
117   void     InitNonLinearityParam();
118
119   Int_t    GetNonLinearityFunction() const               { return fNonLinearityFunction    ; }
120   void     SetNonLinearityFunction(Int_t fun)            { fNonLinearityFunction = fun     ; InitNonLinearityParam() ; }
121
122   void     SetNonLinearityThreshold(Int_t threshold)     { fNonLinearThreshold = threshold ; } //only for Alexie's non linearity correction
123   Int_t    GetNonLinearityThreshold()              const { return fNonLinearThreshold      ; }
124 //  
125   //-----------------------------------------------------
126   // MC clusters energy smearing
127   //-----------------------------------------------------
128   
129   Float_t  SmearClusterEnergy(const AliVCluster* clu) ;
130   void     SwitchOnClusterEnergySmearing()               { fSmearClusterEnergy = kTRUE         ; }
131   void     SwitchOffClusterEnergySmearing()              { fSmearClusterEnergy = kFALSE        ; }
132   Bool_t   IsClusterEnergySmeared()                const { return fSmearClusterEnergy          ; }   
133   void     SetSmearingParameters(Int_t i, Float_t param) { if(i < 3){ fSmearClusterParam[i] = param ; }
134                                                            else     { AliInfo(Form("Index %d larger than 2, do nothing\n",i)) ; } }
135   //-----------------------------------------------------
136   // Recalibration
137   //-----------------------------------------------------
138   Bool_t   AcceptCalibrateCell(const Int_t absId, const Int_t bc,
139                                Float_t & amp, Double_t & time, AliVCaloCells* cells) ; // Energy and Time
140   void     RecalibrateCells(AliVCaloCells * cells, Int_t bc) ; // Energy and Time
141   void     RecalibrateClusterEnergy(const AliEMCALGeometry* geom, AliVCluster* cluster, AliVCaloCells * cells, const Int_t bc=-1) ; // Energy and time
142   void     ResetCellsCalibrated()                        { fCellsRecalibrated = kFALSE; }
143
144   // Energy recalibration
145   Bool_t   IsRecalibrationOn()                     const { return fRecalibration ; }
146   void     SwitchOffRecalibration()                      { fRecalibration = kFALSE ; }
147   void     SwitchOnRecalibration()                       { fRecalibration = kTRUE  ; 
148                                                            if(!fEMCALRecalibrationFactors)InitEMCALRecalibrationFactors() ; }
149   void     InitEMCALRecalibrationFactors() ;
150
151   TH2F *   GetEMCALChannelRecalibrationFactors(Int_t iSM)     const { return (TH2F*)fEMCALRecalibrationFactors->At(iSM) ; }     
152   void     SetEMCALChannelRecalibrationFactors(TObjArray *map)      { fEMCALRecalibrationFactors = map                  ; }
153   void     SetEMCALChannelRecalibrationFactors(Int_t iSM , TH2F* h) { fEMCALRecalibrationFactors->AddAt(h,iSM)          ; }
154   
155   Float_t  GetEMCALChannelRecalibrationFactor(Int_t iSM , Int_t iCol, Int_t iRow) const { 
156     if(fEMCALRecalibrationFactors) 
157       return (Float_t) ((TH2F*)fEMCALRecalibrationFactors->At(iSM))->GetBinContent(iCol,iRow); 
158     else return 1 ; } 
159         
160   void     SetEMCALChannelRecalibrationFactor(Int_t iSM , Int_t iCol, Int_t iRow, Double_t c = 1) { 
161     if(!fEMCALRecalibrationFactors) InitEMCALRecalibrationFactors() ;
162     ((TH2F*)fEMCALRecalibrationFactors->At(iSM))->SetBinContent(iCol,iRow,c) ; }
163   
164   //Recalibrate channels energy with run dependent corrections
165   void     SwitchOffRunDepCorrection()                   { fUseRunCorrectionFactors = kFALSE ; }
166   void     SwitchOnRunDepCorrection()                    { fUseRunCorrectionFactors = kTRUE  ; 
167                                                            SwitchOnRecalibration()           ; }
168   void     SetRunDependentCorrections(Int_t runnumber);
169       
170   // Time Recalibration  
171   void     RecalibrateCellTime(const Int_t absId, const Int_t bc, Double_t & time) const;
172   
173   Bool_t   IsTimeRecalibrationOn()                 const { return fTimeRecalibration   ; }
174   void     SwitchOffTimeRecalibration()                  { fTimeRecalibration = kFALSE ; }
175   void     SwitchOnTimeRecalibration()                   { fTimeRecalibration = kTRUE  ; 
176     if(!fEMCALTimeRecalibrationFactors)InitEMCALTimeRecalibrationFactors() ; }
177   void     InitEMCALTimeRecalibrationFactors() ;
178   
179   Float_t  GetEMCALChannelTimeRecalibrationFactor(const Int_t bc, const Int_t absID) const { 
180     if(fEMCALTimeRecalibrationFactors) 
181       return (Float_t) ((TH1F*)fEMCALTimeRecalibrationFactors->At(bc))->GetBinContent(absID); 
182     else return 0 ; } 
183         
184   void     SetEMCALChannelTimeRecalibrationFactor(const Int_t bc, const Int_t absID, Double_t c = 0) { 
185     if(!fEMCALTimeRecalibrationFactors) InitEMCALTimeRecalibrationFactors() ;
186     ((TH1F*)fEMCALTimeRecalibrationFactors->At(bc))->SetBinContent(absID,c) ; }  
187   
188   TH1F *   GetEMCALChannelTimeRecalibrationFactors(const Int_t bc)const       { return (TH1F*)fEMCALTimeRecalibrationFactors->At(bc) ; }        
189   void     SetEMCALChannelTimeRecalibrationFactors(TObjArray *map)            { fEMCALTimeRecalibrationFactors = map                 ; }
190   void     SetEMCALChannelTimeRecalibrationFactors(const Int_t bc , TH1F* h)  { fEMCALTimeRecalibrationFactors->AddAt(h,bc)          ; }
191   
192   //-----------------------------------------------------
193   // Modules fiducial region, remove clusters in borders
194   //-----------------------------------------------------
195
196   Bool_t   CheckCellFiducialRegion(AliEMCALGeometry* geom, AliVCluster* cluster, AliVCaloCells* cells) ;
197   void     SetNumberOfCellsFromEMCALBorder(const Int_t n){ fNCellsFromEMCALBorder = n      ; }
198   Int_t    GetNumberOfCellsFromEMCALBorder()      const  { return fNCellsFromEMCALBorder   ; }
199     
200   void     SwitchOnNoFiducialBorderInEMCALEta0()         { fNoEMCALBorderAtEta0 = kTRUE    ; }
201   void     SwitchOffNoFiducialBorderInEMCALEta0()        { fNoEMCALBorderAtEta0 = kFALSE   ; }
202   Bool_t   IsEMCALNoBorderAtEta0()                 const { return fNoEMCALBorderAtEta0     ; }
203   
204   //-----------------------------------------------------
205   // Bad channels
206   //-----------------------------------------------------
207
208   Bool_t   IsBadChannelsRemovalSwitchedOn()        const { return fRemoveBadChannels       ; }
209   void     SwitchOffBadChannelsRemoval()                 { fRemoveBadChannels = kFALSE     ; }
210   void     SwitchOnBadChannelsRemoval ()                 { fRemoveBadChannels = kTRUE ; 
211                                                            if(!fEMCALBadChannelMap)InitEMCALBadChannelStatusMap() ; }
212         
213   Bool_t   IsDistanceToBadChannelRecalculated()    const { return fRecalDistToBadChannels   ; }
214   void     SwitchOffDistToBadChannelRecalculation()      { fRecalDistToBadChannels = kFALSE ; }
215   void     SwitchOnDistToBadChannelRecalculation()       { fRecalDistToBadChannels = kTRUE  ; 
216                                                            if(!fEMCALBadChannelMap)InitEMCALBadChannelStatusMap() ; }
217   
218   void     InitEMCALBadChannelStatusMap() ;
219         
220   Int_t    GetEMCALChannelStatus(Int_t iSM , Int_t iCol, Int_t iRow) const { 
221     if(fEMCALBadChannelMap) return (Int_t) ((TH2I*)fEMCALBadChannelMap->At(iSM))->GetBinContent(iCol,iRow); 
222     else return 0;}//Channel is ok by default
223         
224   void     SetEMCALChannelStatus(Int_t iSM , Int_t iCol, Int_t iRow, Double_t c = 1) { 
225                                                            if(!fEMCALBadChannelMap)InitEMCALBadChannelStatusMap()               ;
226                                                            ((TH2I*)fEMCALBadChannelMap->At(iSM))->SetBinContent(iCol,iRow,c)    ; }
227         
228   TH2I *   GetEMCALChannelStatusMap(Int_t iSM)     const { return (TH2I*)fEMCALBadChannelMap->At(iSM) ; }
229   void     SetEMCALChannelStatusMap(TObjArray *map)      { fEMCALBadChannelMap = map                  ; }
230   void     SetEMCALChannelStatusMap(Int_t iSM , TH2I* h) { fEMCALBadChannelMap->AddAt(h,iSM)          ; }
231
232   Bool_t   ClusterContainsBadChannel(const AliEMCALGeometry* geom, const UShort_t* cellList, const Int_t nCells);
233  
234   //-----------------------------------------------------
235   // Recalculate other cluster parameters
236   //-----------------------------------------------------
237
238   void     RecalculateClusterDistanceToBadChannel (AliEMCALGeometry * geom, AliVCaloCells* cells, AliVCluster * cluster);
239   void     RecalculateClusterShowerShapeParameters(AliEMCALGeometry * geom, AliVCaloCells* cells, AliVCluster * cluster);
240   void     RecalculateClusterPID(AliVCluster * cluster);
241
242   AliEMCALPIDUtils * GetPIDUtils() { return fPIDUtils;}
243
244
245   //----------------------------------------------------
246   // Track matching
247   //----------------------------------------------------
248
249   void     FindMatches(AliVEvent *event, TObjArray * clusterArr=0x0, AliEMCALGeometry *geom=0x0);
250   Int_t    FindMatchedClusterInEvent(AliESDtrack *track, AliVEvent *event, AliEMCALGeometry *geom, Float_t &dEta, Float_t &dPhi);
251   Int_t    FindMatchedClusterInClusterArr(AliExternalTrackParam *emcalParam, AliExternalTrackParam *trkParam, TObjArray * clusterArr, Float_t &dEta, Float_t &dPhi);
252   
253   static Bool_t ExtrapolateTrackToEMCalSurface(AliExternalTrackParam *trkParam, Double_t emcalR, 
254                                                Double_t mass, Double_t step, Float_t &eta, Float_t &phi);
255   static Bool_t ExtrapolateTrackToPosition(AliExternalTrackParam *trkParam, const Float_t *clsPos, 
256                                            Double_t mass, Double_t step, Float_t &tmpEta, Float_t &tmpPhi);
257   static Bool_t ExtrapolateTrackToCluster (AliExternalTrackParam *trkParam, AliVCluster *cluster, 
258                                            Double_t mass, Double_t step, Float_t &tmpEta, Float_t &tmpPhi);
259   Bool_t        ExtrapolateTrackToCluster (AliExternalTrackParam *trkParam, AliVCluster *cluster, 
260                                            Float_t &tmpEta, Float_t &tmpPhi);
261
262   UInt_t   FindMatchedPosForCluster(Int_t clsIndex) const;
263   UInt_t   FindMatchedPosForTrack(Int_t trkIndex)   const;
264   
265   void     GetMatchedResiduals(Int_t clsIndex, Float_t &dEta, Float_t &dPhi);
266   void     GetMatchedClusterResiduals(Int_t trkIndex, Float_t &dEta, Float_t &dPhi);
267   Int_t    GetMatchedTrackIndex(Int_t clsIndex);
268   Int_t    GetMatchedClusterIndex(Int_t trkIndex);
269   
270   Bool_t   IsClusterMatched(Int_t clsIndex)         const;
271   Bool_t   IsTrackMatched(Int_t trkIndex)           const;
272
273   void     SetClusterMatchedToTrack (const AliESDEvent *event);
274   
275   void     SetTracksMatchedToCluster(const AliESDEvent *event);  
276
277   void     SwitchOnCutEtaPhiSum()                     { fCutEtaPhiSum      = kTRUE    ; 
278                                                         fCutEtaPhiSeparate = kFALSE   ; }
279   void     SwitchOnCutEtaPhiSeparate()                { fCutEtaPhiSeparate = kTRUE    ;
280                                                         fCutEtaPhiSum      = kFALSE   ; }
281
282   Float_t  GetCutR()                            const { return fCutR                  ; }
283   Float_t  GetCutEta()                          const { return fCutEta                ; }
284   Float_t  GetCutPhi()                          const { return fCutPhi                ; }
285   Double_t GetClusterWindow()                   const { return fClusterWindow         ; }
286   void     SetCutR(Float_t cutR)                      { fCutR   = cutR                ; }
287   void     SetCutEta(Float_t cutEta)                  { fCutEta = cutEta              ; }
288   void     SetCutPhi(Float_t cutPhi)                  { fCutPhi = cutPhi              ; }
289   void     SetClusterWindow(Double_t window)          { fClusterWindow = window       ; }
290   void     SetCutZ(Float_t cutZ)                      { printf("Obsolete fucntion of cutZ=%1.1f\n",cutZ) ; } //Obsolete
291
292   Double_t GetMass()                            const { return fMass                  ; }
293   Double_t GetStep()                            const { return fStepCluster           ; }
294   Double_t GetStepSurface()                     const { return fStepSurface           ; }
295   void     SetMass(Double_t mass)                     { fMass = mass                  ; }
296   void     SetStep(Double_t step)                     { fStepSurface = step           ; }
297   void     SetStepCluster(Double_t step)              { fStepCluster = step           ; }
298  
299   // Exotic cells / clusters
300   
301   Bool_t   IsExoticCell(const Int_t absId, AliVCaloCells* cells, const Int_t bc =-1) ;
302   void     SwitchOnRejectExoticCell()                 { fRejectExoticCells = kTRUE     ; }
303   void     SwitchOffRejectExoticCell()                { fRejectExoticCells = kFALSE    ; } 
304    
305   void     SetExoticCellFractionCut(Float_t f)        { fExoticCellFraction     = f    ; }
306   void     SetExoticCellDiffTimeCut(Float_t dt)       { fExoticCellDiffTime     = dt   ; }
307   void     SetExoticCellMinAmplitudeCut(Float_t ma)   { fExoticCellMinAmplitude = ma   ; }
308   
309   Bool_t   IsExoticCluster(AliVCluster *cluster, AliVCaloCells* cells, const Int_t bc=0) ;
310   void     SwitchOnRejectExoticCluster()              { fRejectExoticCluster = kTRUE   ;
311                                                         fRejectExoticCells   = kTRUE   ; }
312   void     SwitchOffRejectExoticCluster()             { fRejectExoticCluster = kFALSE  ; }
313   Bool_t   IsRejectExoticCluster()              const { return fRejectExoticCluster    ; }
314   
315   //Cluster cut
316   Bool_t   IsGoodCluster(AliVCluster *cluster, AliEMCALGeometry *geom, AliVCaloCells* cells, const Int_t bc =-1);
317
318   //Track Cuts 
319   Bool_t   IsAccepted(AliESDtrack *track);
320   void     InitTrackCuts();
321   void     SetTrackCutsType(Int_t type)              { fTrackCutsType = type           ; 
322                                                        InitTrackCuts()                 ; }
323   Int_t    GetTrackCutsType() const                  { return fTrackCutsType; }
324
325   // track quality cut setters  
326   void     SetMinTrackPt(Double_t pt=0)              { fCutMinTrackPt           = pt   ; }
327   void     SetMinNClustersTPC(Int_t min=-1)          { fCutMinNClusterTPC       = min  ; }
328   void     SetMinNClustersITS(Int_t min=-1)          { fCutMinNClusterITS       = min  ; }
329   void     SetMaxChi2PerClusterTPC(Float_t max=1e10) { fCutMaxChi2PerClusterTPC = max  ; }
330   void     SetMaxChi2PerClusterITS(Float_t max=1e10) { fCutMaxChi2PerClusterITS = max  ; }
331   void     SetRequireTPCRefit(Bool_t b=kFALSE)       { fCutRequireTPCRefit      = b    ; }
332   void     SetRequireITSRefit(Bool_t b=kFALSE)       { fCutRequireITSRefit      = b    ; }
333   void     SetAcceptKinkDaughters(Bool_t b=kTRUE)    { fCutAcceptKinkDaughters  = b    ; }
334   void     SetMaxDCAToVertexXY(Float_t dist=1e10)    { fCutMaxDCAToVertexXY     = dist ; }
335   void     SetMaxDCAToVertexZ(Float_t dist=1e10)     { fCutMaxDCAToVertexZ      = dist ; }
336   void     SetDCAToVertex2D(Bool_t b=kFALSE)         { fCutDCAToVertex2D        = b    ; }
337
338   // getters                                                            
339   Double_t GetMinTrackPt()                     const { return fCutMinTrackPt           ; }
340   Int_t    GetMinNClusterTPC()                 const { return fCutMinNClusterTPC       ; }
341   Int_t    GetMinNClustersITS()                const { return fCutMinNClusterITS       ; }
342   Float_t  GetMaxChi2PerClusterTPC()           const { return fCutMaxChi2PerClusterTPC ; }
343   Float_t  GetMaxChi2PerClusterITS()           const { return fCutMaxChi2PerClusterITS ; }
344   Bool_t   GetRequireTPCRefit()                const { return fCutRequireTPCRefit      ; }
345   Bool_t   GetRequireITSRefit()                const { return fCutRequireITSRefit      ; }
346   Bool_t   GetAcceptKinkDaughters()            const { return fCutAcceptKinkDaughters  ; }
347   Float_t  GetMaxDCAToVertexXY()               const { return fCutMaxDCAToVertexXY     ; }
348   Float_t  GetMaxDCAToVertexZ()                const { return fCutMaxDCAToVertexZ      ; }
349   Bool_t   GetDCAToVertex2D()                  const { return fCutDCAToVertex2D        ; }
350
351
352 private:  
353   //Position recalculation
354   Float_t    fMisalTransShift[15];       // Shift parameters
355   Float_t    fMisalRotShift[15];         // Shift parameters
356   Int_t      fParticleType;              // Particle type for depth calculation
357   Int_t      fPosAlgo;                   // Position recalculation algorithm
358   Float_t    fW0;                        // Weight0
359     
360   // Non linearity
361   Int_t      fNonLinearityFunction;      // Non linearity function choice
362   Float_t    fNonLinearityParams[7];     // Parameters for the non linearity function
363   Int_t      fNonLinearThreshold;        // Non linearity threshold value for kBeamTesh non linearity function 
364   
365   // Energy smearing for MC
366   Bool_t     fSmearClusterEnergy;        // Smear cluster energy, to be done only for simulated data to match real data
367   Float_t    fSmearClusterParam[3];      // Smearing parameters
368   TRandom3   fRandom;                    // Random generator
369     
370   // Energy Recalibration 
371   Bool_t     fCellsRecalibrated;         // Internal bool to check if cells (time/energy) where recalibrated and not recalibrate them when recalculating different things
372   Bool_t     fRecalibration;             // Switch on or off the recalibration
373   TObjArray* fEMCALRecalibrationFactors; // Array of histograms with map of recalibration factors, EMCAL
374     
375   // Time Recalibration 
376   Bool_t     fTimeRecalibration;             // Switch on or off the time recalibration
377   TObjArray* fEMCALTimeRecalibrationFactors; // Array of histograms with map of time recalibration factors, EMCAL
378   
379   // Recalibrate with run dependent corrections, energy
380   Bool_t     fUseRunCorrectionFactors;   // Use Run Dependent Correction
381   Bool_t     fRunCorrectionFactorsSet;   // Run Correction set at leat once
382     
383   // Bad Channels
384   Bool_t     fRemoveBadChannels;         // Check the channel status provided and remove clusters with bad channels
385   Bool_t     fRecalDistToBadChannels;    // Calculate distance from highest energy tower of cluster to closes bad channel
386   TObjArray* fEMCALBadChannelMap;        // Array of histograms with map of bad channels, EMCAL
387
388   // Border cells
389   Int_t      fNCellsFromEMCALBorder;     // Number of cells from EMCAL border the cell with maximum amplitude has to be.
390   Bool_t     fNoEMCALBorderAtEta0;       // Do fiducial cut in EMCAL region eta = 0?
391   
392   // Exotic cell / cluster
393   Bool_t     fRejectExoticCluster;       // Switch on or off exotic cluster rejection
394   Bool_t     fRejectExoticCells;         // Remove exotic cells
395   Float_t    fExoticCellFraction;        // Good cell if fraction < 1-ecross/ecell
396   Float_t    fExoticCellDiffTime;        // If time of candidate to exotic and close cell is too different (in ns), it must be noisy, set amp to 0
397   Float_t    fExoticCellMinAmplitude;    // Check for exotic only if amplitud is larger than this value
398   
399   // PID
400   AliEMCALPIDUtils * fPIDUtils;          // Recalculate PID parameters
401     
402   //Track matching
403   UInt_t     fAODFilterMask;             // Filter mask to select AOD tracks. Refer to $ALICE_ROOT/ANALYSIS/macros/AddTaskESDFilter.C
404   TArrayI  * fMatchedTrackIndex;         // Array that stores indexes of matched tracks      
405   TArrayI  * fMatchedClusterIndex;       // Array that stores indexes of matched clusters
406   TArrayF  * fResidualEta;               // Array that stores the residual eta
407   TArrayF  * fResidualPhi;               // Array that stores the residual phi
408   Bool_t     fCutEtaPhiSum;              // Place cut on sqrt(dEta^2+dPhi^2)
409   Bool_t     fCutEtaPhiSeparate;         // Cut on dEta and dPhi separately
410   Float_t    fCutR;                      // sqrt(dEta^2+dPhi^2) cut on matching
411   Float_t    fCutEta;                    // dEta cut on matching
412   Float_t    fCutPhi;                    // dPhi cut on matching
413   Double_t   fClusterWindow;             // Select clusters in the window to be matched
414   Double_t   fMass;                      // Mass hypothesis of the track
415   Double_t   fStepSurface;               // Length of step to extrapolate tracks to EMCal surface
416   Double_t   fStepCluster;               // Length of step to extrapolate tracks to clusters
417
418   // Track cuts  
419   Int_t      fTrackCutsType;             // Esd track cuts type for matching
420   Double_t   fCutMinTrackPt;             // Cut on track pT
421   Int_t      fCutMinNClusterTPC;         // Min number of tpc clusters
422   Int_t      fCutMinNClusterITS;         // Min number of its clusters  
423   Float_t    fCutMaxChi2PerClusterTPC;   // Max tpc fit chi2 per tpc cluster
424   Float_t    fCutMaxChi2PerClusterITS;   // Max its fit chi2 per its cluster
425   Bool_t     fCutRequireTPCRefit;        // Require TPC refit
426   Bool_t     fCutRequireITSRefit;        // Require ITS refit
427   Bool_t     fCutAcceptKinkDaughters;    // Accepting kink daughters?
428   Float_t    fCutMaxDCAToVertexXY;       // Track-to-vertex cut in max absolute distance in xy-plane
429   Float_t    fCutMaxDCAToVertexZ;        // Track-to-vertex cut in max absolute distance in z-plane
430   Bool_t     fCutDCAToVertex2D;          // If true a 2D DCA cut is made.
431   
432   ClassDef(AliEMCALRecoUtils, 17)
433   
434 };
435
436 #endif // ALIEMCALRECOUTILS_H
437
438