EMCAL/AliEMCALRecoUtils.h

   1 #ifndef ALIEMCALRECOUTILS_H
   2 #define ALIEMCALRECOUTILS_H
   3
   4 /* $Id: AliEMCALRecoUtils.h 33808 2009-07-15 09:48:08Z gconesab $ */
   5
   6 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
   7 //
   8 // Class AliEMCALRecoUtils
   9 // Some utilities to recalculate the cluster position or energy linearity
  10 //
  11 //
  12 // Author:  Gustavo Conesa (LPSC- Grenoble)
  13 //          Track matching part: Rongrong Ma (Yale)
  14 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  15
  16 //Root includes
  17 #include <TNamed.h>
  18 #include <TMath.h>
  19 class TObjArray;
  20 class TArrayI;
  21 class TArrayF;
  22 #include <TH2I.h>
  23 class TH2F;
  24 #include <TRandom3.h>
  25
  26 //AliRoot includes
  27 class AliVCluster;
  28 class AliVCaloCells;
  29 class AliVEvent;
  30 #include "AliLog.h"
  31
  32 // EMCAL includes
  33 class AliEMCALGeometry;
  34 class AliEMCALPIDUtils;
  35 class AliESDtrack;
  36 class AliExternalTrackParam;
  37
  38 class AliEMCALRecoUtils : public TNamed {
  39
  40 public:
  41
  42   AliEMCALRecoUtils();
  43   AliEMCALRecoUtils(const AliEMCALRecoUtils&);
  44   AliEMCALRecoUtils& operator=(const AliEMCALRecoUtils&);
  45   virtual ~AliEMCALRecoUtils() ;
  46
  47   void     InitParameters();
  48
  49   void     Print(const Option_t*) const;
  50
  51   //enums
  52   enum     NonlinearityFunctions{kPi0MC=0,kPi0GammaGamma=1,kPi0GammaConversion=2,kNoCorrection=3,kBeamTest=4,kBeamTestCorrected=5,kPi0MCv2=6,kPi0MCv3=7};
  53   enum     PositionAlgorithms{kUnchanged=-1,kPosTowerIndex=0, kPosTowerGlobal=1};
  54   enum     ParticleType{kPhoton=0, kElectron=1,kHadron =2, kUnknown=-1};
  55   enum     { kNCuts = 11 }; //track matching
  56   enum     TrackCutsType{kTPCOnlyCut=0, kGlobalCut=1, kLooseCut=2};
  57
  58   //-----------------------------------------------------
  59   //Position recalculation
  60   //-----------------------------------------------------
  61
  62   void     RecalculateClusterPosition               (const AliEMCALGeometry *geom, AliVCaloCells* cells, AliVCluster* clu);
  63   void     RecalculateClusterPositionFromTowerIndex (const AliEMCALGeometry *geom, AliVCaloCells* cells, AliVCluster* clu);
  64   void     RecalculateClusterPositionFromTowerGlobal(const AliEMCALGeometry *geom, AliVCaloCells* cells, AliVCluster* clu);
  65
  66   Float_t  GetCellWeight(const Float_t eCell, const Float_t eCluster) const { return TMath::Max( 0., fW0 + TMath::Log( eCell / eCluster )) ; }
  67
  68   Float_t  GetDepth(const Float_t eCluster, const Int_t iParticle, const Int_t iSM) const ;
  69
  70   void     GetMaxEnergyCell(const AliEMCALGeometry *geom, AliVCaloCells* cells, const AliVCluster* clu,
  71                             Int_t & absId,  Int_t& iSupMod, Int_t& ieta, Int_t& iphi, Bool_t &shared);
  72
  73   Float_t  GetMisalTransShift(const Int_t i)       const { if(i < 15 ) { return fMisalTransShift[i] ; }
  74                                                            else        { AliInfo(Form("Index %d larger than 15, do nothing\n",i)) ;
  75                                                                          return 0.                  ; } }
  76   Float_t* GetMisalTransShiftArray()                     { return fMisalTransShift ; }
  77
  78   void     SetMisalTransShift(const Int_t i, const Float_t shift) {
  79                                                            if(i < 15 ) { fMisalTransShift[i] = shift ; }
  80                                                            else        { AliInfo(Form("Index %d larger than 15, do nothing\n",i)) ; } }
  81   void     SetMisalTransShiftArray(Float_t * misal)               { for(Int_t i = 0; i < 15; i++) fMisalTransShift[i] = misal[i]  ; }
  82
  83   Float_t  GetMisalRotShift(const Int_t i)         const { if(i < 15 ) { return fMisalRotShift[i]    ; }
  84                                                            else        { AliInfo(Form("Index %d larger than 15, do nothing\n",i)) ;
  85                                                                          return 0.                   ; } }
  86
  87   Float_t* GetMisalRotShiftArray()                       { return fMisalRotShift                     ; }
  88
  89   void     SetMisalRotShift(const Int_t i, const Float_t shift) {
  90                                                            if(i < 15 ) { fMisalRotShift[i] = shift   ; }
  91                                                            else        { AliInfo(Form("Index %d larger than 15, do nothing\n",i)) ; } }
  92
  93   void     SetMisalRotShiftArray(Float_t * misal)        { for(Int_t i = 0; i < 15; i++)fMisalRotShift[i] = misal[i] ; }
  94
  95   Int_t    GetParticleType()                       const { return  fParticleType    ; }
  96   void     SetParticleType(Int_t particle)               { fParticleType = particle ; }
  97
  98   Int_t    GetPositionAlgorithm()                  const { return fPosAlgo          ; }
  99   void     SetPositionAlgorithm(Int_t alg)               { fPosAlgo = alg           ; }
 100
 101   Float_t  GetW0()                                 const { return fW0               ; }
 102   void     SetW0(Float_t w0)                             { fW0  = w0                ; }
 103
 104   //-----------------------------------------------------
 105   // Non Linearity
 106   //-----------------------------------------------------
 107
 108   Float_t  CorrectClusterEnergyLinearity(AliVCluster* clu) ;
 109
 110   Float_t  GetNonLinearityParam(const Int_t i)     const { if(i < 7 ){ return fNonLinearityParams[i] ; }
 111                                                           else      { AliInfo(Form("Index %d larger than 7, do nothing\n",i)) ;
 112                                                                        return 0.                     ; } }
 113   void     SetNonLinearityParam(const Int_t i, const Float_t param) {
 114                                                           if(i < 7 ){fNonLinearityParams[i] = param ; }
 115                                                           else { AliInfo(Form("Index %d larger than 7, do nothing\n",i)) ; } }
 116   void     InitNonLinearityParam();
 117
 118   Int_t    GetNonLinearityFunction() const               { return fNonLinearityFunction    ; }
 119   void     SetNonLinearityFunction(Int_t fun)            { fNonLinearityFunction = fun     ; InitNonLinearityParam() ; }
 120
 121   void     SetNonLinearityThreshold(Int_t threshold)     { fNonLinearThreshold = threshold ; } //only for Alexie's non linearity correction
 122   Int_t    GetNonLinearityThreshold()              const { return fNonLinearThreshold      ; }
 123 //
 124   //-----------------------------------------------------
 125   // MC clusters energy smearing
 126   //-----------------------------------------------------
 127
 128   Float_t  SmearClusterEnergy(const AliVCluster* clu) ;
 129   void     SwitchOnClusterEnergySmearing()               { fSmearClusterEnergy = kTRUE         ; }
 130   void     SwitchOffClusterEnergySmearing()              { fSmearClusterEnergy = kFALSE        ; }
 131   Bool_t   IsClusterEnergySmeared()                const { return fSmearClusterEnergy          ; }
 132   void     SetSmearingParameters(Int_t i, Float_t param) { if(i < 3){ fSmearClusterParam[i] = param ; }
 133                                                            else     { AliInfo(Form("Index %d larger than 2, do nothing\n",i)) ; } }
 134   //-----------------------------------------------------
 135   // Recalibration
 136   //-----------------------------------------------------
 137   Bool_t   AcceptCalibrateCell(const Int_t absId, const Int_t bc,
 138                                Float_t & amp, Double_t & time, AliVCaloCells* cells) ; // Energy and Time
 139   void     RecalibrateCells(AliVCaloCells * cells, Int_t bc) ; // Energy and Time
 140   void     RecalibrateClusterEnergy(const AliEMCALGeometry* geom, AliVCluster* cluster, AliVCaloCells * cells, const Int_t bc=-1) ; // Energy and time
 141   void     ResetCellsCalibrated()                        { fCellsRecalibrated = kFALSE; }
 142
 143   // Energy recalibration
 144   Bool_t   IsRecalibrationOn()                     const { return fRecalibration ; }
 145   void     SwitchOffRecalibration()                      { fRecalibration = kFALSE ; }
 146   void     SwitchOnRecalibration()                       { fRecalibration = kTRUE  ;
 147                                                            if(!fEMCALRecalibrationFactors)InitEMCALRecalibrationFactors() ; }
 148   void     InitEMCALRecalibrationFactors() ;
 149   TObjArray* GetEMCALRecalibrationFactorsArray()   const { return fEMCALRecalibrationFactors ; }
 150
 151   TH2F *   GetEMCALChannelRecalibrationFactors(Int_t iSM)     const { return (TH2F*)fEMCALRecalibrationFactors->At(iSM) ; }
 152   void     SetEMCALChannelRecalibrationFactors(TObjArray *map)      { fEMCALRecalibrationFactors = map                  ; }
 153   void     SetEMCALChannelRecalibrationFactors(Int_t iSM , TH2F* h) { fEMCALRecalibrationFactors->AddAt(h,iSM)          ; }
 154
 155   Float_t  GetEMCALChannelRecalibrationFactor(Int_t iSM , Int_t iCol, Int_t iRow) const {
 156     if(fEMCALRecalibrationFactors)
 157       return (Float_t) ((TH2F*)fEMCALRecalibrationFactors->At(iSM))->GetBinContent(iCol,iRow);
 158     else return 1 ; }
 159
 160   void     SetEMCALChannelRecalibrationFactor(Int_t iSM , Int_t iCol, Int_t iRow, Double_t c = 1) {
 161     if(!fEMCALRecalibrationFactors) InitEMCALRecalibrationFactors() ;
 162     ((TH2F*)fEMCALRecalibrationFactors->At(iSM))->SetBinContent(iCol,iRow,c) ; }
 163
 164   //Recalibrate channels energy with run dependent corrections
 165   Bool_t   IsRunDepRecalibrationOn()               const { return fUseRunCorrectionFactors ; }
 166
 167   void     SwitchOffRunDepCorrection()                   { fUseRunCorrectionFactors = kFALSE ; }
 168   void     SwitchOnRunDepCorrection()                    { fUseRunCorrectionFactors = kTRUE  ;
 169                                                            SwitchOnRecalibration()           ; }
 170   // Time Recalibration
 171   void     RecalibrateCellTime(const Int_t absId, const Int_t bc, Double_t & time) const;
 172
 173   Bool_t   IsTimeRecalibrationOn()                 const { return fTimeRecalibration   ; }
 174   void     SwitchOffTimeRecalibration()                  { fTimeRecalibration = kFALSE ; }
 175   void     SwitchOnTimeRecalibration()                   { fTimeRecalibration = kTRUE  ;
 176     if(!fEMCALTimeRecalibrationFactors)InitEMCALTimeRecalibrationFactors() ; }
 177   void     InitEMCALTimeRecalibrationFactors() ;
 178   TObjArray* GetEMCALTimeRecalibrationFactorsArray() const { return fEMCALTimeRecalibrationFactors ; }
 179
 180   Float_t  GetEMCALChannelTimeRecalibrationFactor(const Int_t bc, const Int_t absID) const {
 181     if(fEMCALTimeRecalibrationFactors)
 182       return (Float_t) ((TH1F*)fEMCALTimeRecalibrationFactors->At(bc))->GetBinContent(absID);
 183     else return 0 ; }
 184
 185   void     SetEMCALChannelTimeRecalibrationFactor(const Int_t bc, const Int_t absID, Double_t c = 0) {
 186     if(!fEMCALTimeRecalibrationFactors) InitEMCALTimeRecalibrationFactors() ;
 187     ((TH1F*)fEMCALTimeRecalibrationFactors->At(bc))->SetBinContent(absID,c) ; }
 188
 189   TH1F *   GetEMCALChannelTimeRecalibrationFactors(const Int_t bc)const       { return (TH1F*)fEMCALTimeRecalibrationFactors->At(bc) ; }
 190   void     SetEMCALChannelTimeRecalibrationFactors(TObjArray *map)            { fEMCALTimeRecalibrationFactors = map                 ; }
 191   void     SetEMCALChannelTimeRecalibrationFactors(const Int_t bc , TH1F* h)  { fEMCALTimeRecalibrationFactors->AddAt(h,bc)          ; }
 192
 193   //-----------------------------------------------------
 194   // Modules fiducial region, remove clusters in borders
 195   //-----------------------------------------------------
 196
 197   Bool_t   CheckCellFiducialRegion(const AliEMCALGeometry* geom,
 198                                    const AliVCluster* cluster,
 199                                    AliVCaloCells* cells) ;
 200   void     SetNumberOfCellsFromEMCALBorder(const Int_t n){ fNCellsFromEMCALBorder = n      ; }
 201   Int_t    GetNumberOfCellsFromEMCALBorder()      const  { return fNCellsFromEMCALBorder   ; }
 202
 203   void     SwitchOnNoFiducialBorderInEMCALEta0()         { fNoEMCALBorderAtEta0 = kTRUE    ; }
 204   void     SwitchOffNoFiducialBorderInEMCALEta0()        { fNoEMCALBorderAtEta0 = kFALSE   ; }
 205   Bool_t   IsEMCALNoBorderAtEta0()                 const { return fNoEMCALBorderAtEta0     ; }
 206
 207   //-----------------------------------------------------
 208   // Bad channels
 209   //-----------------------------------------------------
 210
 211   Bool_t   IsBadChannelsRemovalSwitchedOn()        const { return fRemoveBadChannels       ; }
 212   void     SwitchOffBadChannelsRemoval()                 { fRemoveBadChannels = kFALSE     ; }
 213   void     SwitchOnBadChannelsRemoval ()                 { fRemoveBadChannels = kTRUE ;
 214                                                            if(!fEMCALBadChannelMap)InitEMCALBadChannelStatusMap() ; }
 215
 216   Bool_t   IsDistanceToBadChannelRecalculated()    const { return fRecalDistToBadChannels   ; }
 217   void     SwitchOffDistToBadChannelRecalculation()      { fRecalDistToBadChannels = kFALSE ; }
 218   void     SwitchOnDistToBadChannelRecalculation()       { fRecalDistToBadChannels = kTRUE  ;
 219                                                            if(!fEMCALBadChannelMap)InitEMCALBadChannelStatusMap() ; }
 220
 221   TObjArray* GetEMCALBadChannelStatusMapArray()     const { return fEMCALBadChannelMap ; }
 222   void     InitEMCALBadChannelStatusMap() ;
 223
 224   Int_t    GetEMCALChannelStatus(Int_t iSM , Int_t iCol, Int_t iRow) const {
 225     if(fEMCALBadChannelMap) return (Int_t) ((TH2I*)fEMCALBadChannelMap->At(iSM))->GetBinContent(iCol,iRow);
 226     else return 0;}//Channel is ok by default
 227
 228   void     SetEMCALChannelStatus(Int_t iSM , Int_t iCol, Int_t iRow, Double_t c = 1) {
 229                                                            if(!fEMCALBadChannelMap)InitEMCALBadChannelStatusMap()               ;
 230                                                            ((TH2I*)fEMCALBadChannelMap->At(iSM))->SetBinContent(iCol,iRow,c)    ; }
 231
 232   TH2I *   GetEMCALChannelStatusMap(Int_t iSM)     const { return (TH2I*)fEMCALBadChannelMap->At(iSM) ; }
 233   void     SetEMCALChannelStatusMap(TObjArray *map)      { fEMCALBadChannelMap = map                  ; }
 234   void     SetEMCALChannelStatusMap(Int_t iSM , TH2I* h) { fEMCALBadChannelMap->AddAt(h,iSM)          ; }
 235
 236   Bool_t   ClusterContainsBadChannel(const AliEMCALGeometry* geom, const UShort_t* cellList, const Int_t nCells);
 237
 238   //-----------------------------------------------------
 239   // Recalculate other cluster parameters
 240   //-----------------------------------------------------
 241
 242   void     RecalculateClusterDistanceToBadChannel (const AliEMCALGeometry * geom, AliVCaloCells* cells, AliVCluster * cluster);
 243   void     RecalculateClusterShowerShapeParameters(const AliEMCALGeometry * geom, AliVCaloCells* cells, AliVCluster * cluster);
 244   void     RecalculateClusterShowerShapeParameters(const AliEMCALGeometry * geom, AliVCaloCells* cells, AliVCluster * cluster,
 245                                                    Float_t & l0,   Float_t & l1,
 246                                                    Float_t & disp, Float_t & dEta, Float_t & dPhi,
 247                                                    Float_t & sEta, Float_t & sPhi, Float_t & sEtaPhi);
 248
 249   void     RecalculateClusterPID(AliVCluster * cluster);
 250
 251   AliEMCALPIDUtils * GetPIDUtils() { return fPIDUtils;}
 252
 253
 254   //----------------------------------------------------
 255   // Track matching
 256   //----------------------------------------------------
 257
 258   void     FindMatches(AliVEvent *event, TObjArray * clusterArr=0x0, const AliEMCALGeometry *geom=0x0);
 259   Int_t    FindMatchedClusterInEvent(const AliESDtrack *track, const AliVEvent *event,
 260                                      const AliEMCALGeometry *geom, Float_t &dEta, Float_t &dPhi);
 261   Int_t    FindMatchedClusterInClusterArr(const AliExternalTrackParam *emcalParam,
 262                                           AliExternalTrackParam *trkParam,
 263                                           const TObjArray * clusterArr,
 264                                           Float_t &dEta, Float_t &dPhi);
 265
 266   static Bool_t ExtrapolateTrackToEMCalSurface(AliExternalTrackParam *trkParam,
 267                                                const Double_t emcalR, const Double_t mass, const Double_t step,
 268                                                Float_t &eta, Float_t &phi);
 269   static Bool_t ExtrapolateTrackToPosition(AliExternalTrackParam *trkParam, const Float_t *clsPos,
 270                                            const Double_t mass, const Double_t step,
 271                                            Float_t &tmpEta, Float_t &tmpPhi);
 272   static Bool_t ExtrapolateTrackToCluster (AliExternalTrackParam *trkParam, const AliVCluster *cluster,
 273                                            const Double_t mass, const Double_t step,
 274                                            Float_t &tmpEta, Float_t &tmpPhi);
 275   Bool_t        ExtrapolateTrackToCluster (AliExternalTrackParam *trkParam, const AliVCluster *cluster,
 276                                            Float_t &tmpEta, Float_t &tmpPhi);
 277
 278   UInt_t   FindMatchedPosForCluster(const Int_t clsIndex) const;
 279   UInt_t   FindMatchedPosForTrack  (const Int_t trkIndex) const;
 280
 281   void     GetMatchedResiduals       (const Int_t clsIndex, Float_t &dEta, Float_t &dPhi);
 282   void     GetMatchedClusterResiduals(const Int_t trkIndex, Float_t &dEta, Float_t &dPhi);
 283   Int_t    GetMatchedTrackIndex(Int_t clsIndex);
 284   Int_t    GetMatchedClusterIndex(Int_t trkIndex);
 285
 286   Bool_t   IsClusterMatched(const Int_t clsIndex)         const;
 287   Bool_t   IsTrackMatched  (const Int_t trkIndex)         const;
 288
 289   void     SetClusterMatchedToTrack (const AliVEvent *event);
 290   void     SetTracksMatchedToCluster(const AliVEvent *event);
 291
 292   void     SwitchOnCutEtaPhiSum()                     { fCutEtaPhiSum      = kTRUE    ;
 293                                                         fCutEtaPhiSeparate = kFALSE   ; }
 294   void     SwitchOnCutEtaPhiSeparate()                { fCutEtaPhiSeparate = kTRUE    ;
 295                                                         fCutEtaPhiSum      = kFALSE   ; }
 296
 297   Float_t  GetCutR()                            const { return fCutR                  ; }
 298   Float_t  GetCutEta()                          const { return fCutEta                ; }
 299   Float_t  GetCutPhi()                          const { return fCutPhi                ; }
 300   Double_t GetClusterWindow()                   const { return fClusterWindow         ; }
 301   void     SetCutR(Float_t cutR)                      { fCutR   = cutR                ; }
 302   void     SetCutEta(Float_t cutEta)                  { fCutEta = cutEta              ; }
 303   void     SetCutPhi(Float_t cutPhi)                  { fCutPhi = cutPhi              ; }
 304   void     SetClusterWindow(Double_t window)          { fClusterWindow = window       ; }
 305   void     SetCutZ(Float_t cutZ)                      { printf("Obsolete fucntion of cutZ=%1.1f\n",cutZ) ; } //Obsolete
 306
 307   Double_t GetMass()                            const { return fMass                  ; }
 308   Double_t GetStep()                            const { return fStepCluster           ; }
 309   Double_t GetStepSurface()                     const { return fStepSurface           ; }
 310   void     SetMass(Double_t mass)                     { fMass = mass                  ; }
 311   void     SetStep(Double_t step)                     { fStepSurface = step           ; }
 312   void     SetStepCluster(Double_t step)              { fStepCluster = step           ; }
 313
 314   // Exotic cells / clusters
 315
 316   Bool_t   IsExoticCell(const Int_t absId, AliVCaloCells* cells, const Int_t bc =-1) ;
 317   void     SwitchOnRejectExoticCell()                 { fRejectExoticCells = kTRUE     ; }
 318   void     SwitchOffRejectExoticCell()                { fRejectExoticCells = kFALSE    ; }
 319   Bool_t   IsRejectExoticCell()                 const { return fRejectExoticCells      ; }
 320
 321   Float_t  GetECross(const Int_t absID, const Double_t tcell,
 322                      AliVCaloCells* cells, const Int_t bc);
 323
 324   Float_t  GetExoticCellFractionCut()           const { return fExoticCellFraction     ; }
 325   Float_t  GetExoticCellDiffTimeCut()           const { return fExoticCellDiffTime     ; }
 326   Float_t  GetExoticCellMinAmplitudeCut()       const { return fExoticCellMinAmplitude ; }
 327
 328   void     SetExoticCellFractionCut(Float_t f)        { fExoticCellFraction     = f    ; }
 329   void     SetExoticCellDiffTimeCut(Float_t dt)       { fExoticCellDiffTime     = dt   ; }
 330   void     SetExoticCellMinAmplitudeCut(Float_t ma)   { fExoticCellMinAmplitude = ma   ; }
 331
 332   Bool_t   IsExoticCluster(const AliVCluster *cluster, AliVCaloCells* cells, const Int_t bc=0) ;
 333   void     SwitchOnRejectExoticCluster()              { fRejectExoticCluster = kTRUE   ;
 334                                                         fRejectExoticCells   = kTRUE   ; }
 335   void     SwitchOffRejectExoticCluster()             { fRejectExoticCluster = kFALSE  ; }
 336   Bool_t   IsRejectExoticCluster()              const { return fRejectExoticCluster    ; }
 337
 338   //Cluster cut
 339   Bool_t   IsGoodCluster(AliVCluster *cluster, const AliEMCALGeometry *geom,
 340                          AliVCaloCells* cells, const Int_t bc =-1);
 341
 342   //Track Cuts
 343   Bool_t   IsAccepted(AliESDtrack *track);
 344   void     InitTrackCuts();
 345   void     SetTrackCutsType(Int_t type)              { fTrackCutsType = type           ;
 346                                                        InitTrackCuts()                 ; }
 347   Int_t    GetTrackCutsType() const                  { return fTrackCutsType; }
 348
 349   // track quality cut setters
 350   void     SetMinTrackPt(Double_t pt=0)              { fCutMinTrackPt           = pt   ; }
 351   void     SetMinNClustersTPC(Int_t min=-1)          { fCutMinNClusterTPC       = min  ; }
 352   void     SetMinNClustersITS(Int_t min=-1)          { fCutMinNClusterITS       = min  ; }
 353   void     SetMaxChi2PerClusterTPC(Float_t max=1e10) { fCutMaxChi2PerClusterTPC = max  ; }
 354   void     SetMaxChi2PerClusterITS(Float_t max=1e10) { fCutMaxChi2PerClusterITS = max  ; }
 355   void     SetRequireTPCRefit(Bool_t b=kFALSE)       { fCutRequireTPCRefit      = b    ; }
 356   void     SetRequireITSRefit(Bool_t b=kFALSE)       { fCutRequireITSRefit      = b    ; }
 357   void     SetAcceptKinkDaughters(Bool_t b=kTRUE)    { fCutAcceptKinkDaughters  = b    ; }
 358   void     SetMaxDCAToVertexXY(Float_t dist=1e10)    { fCutMaxDCAToVertexXY     = dist ; }
 359   void     SetMaxDCAToVertexZ(Float_t dist=1e10)     { fCutMaxDCAToVertexZ      = dist ; }
 360   void     SetDCAToVertex2D(Bool_t b=kFALSE)         { fCutDCAToVertex2D        = b    ; }
 361
 362   // getters
 363   Double_t GetMinTrackPt()                     const { return fCutMinTrackPt           ; }
 364   Int_t    GetMinNClusterTPC()                 const { return fCutMinNClusterTPC       ; }
 365   Int_t    GetMinNClustersITS()                const { return fCutMinNClusterITS       ; }
 366   Float_t  GetMaxChi2PerClusterTPC()           const { return fCutMaxChi2PerClusterTPC ; }
 367   Float_t  GetMaxChi2PerClusterITS()           const { return fCutMaxChi2PerClusterITS ; }
 368   Bool_t   GetRequireTPCRefit()                const { return fCutRequireTPCRefit      ; }
 369   Bool_t   GetRequireITSRefit()                const { return fCutRequireITSRefit      ; }
 370   Bool_t   GetAcceptKinkDaughters()            const { return fCutAcceptKinkDaughters  ; }
 371   Float_t  GetMaxDCAToVertexXY()               const { return fCutMaxDCAToVertexXY     ; }
 372   Float_t  GetMaxDCAToVertexZ()                const { return fCutMaxDCAToVertexZ      ; }
 373   Bool_t   GetDCAToVertex2D()                  const { return fCutDCAToVertex2D        ; }
 374
 375
 376 private:
 377   //Position recalculation
 378   Float_t    fMisalTransShift[15];       // Shift parameters
 379   Float_t    fMisalRotShift[15];         // Shift parameters
 380   Int_t      fParticleType;              // Particle type for depth calculation
 381   Int_t      fPosAlgo;                   // Position recalculation algorithm
 382   Float_t    fW0;                        // Weight0
 383
 384   // Non linearity
 385   Int_t      fNonLinearityFunction;      // Non linearity function choice
 386   Float_t    fNonLinearityParams[7];     // Parameters for the non linearity function
 387   Int_t      fNonLinearThreshold;        // Non linearity threshold value for kBeamTesh non linearity function
 388
 389   // Energy smearing for MC
 390   Bool_t     fSmearClusterEnergy;        // Smear cluster energy, to be done only for simulated data to match real data
 391   Float_t    fSmearClusterParam[3];      // Smearing parameters
 392   TRandom3   fRandom;                    // Random generator
 393
 394   // Energy Recalibration
 395   Bool_t     fCellsRecalibrated;         // Internal bool to check if cells (time/energy) where recalibrated and not recalibrate them when recalculating different things
 396   Bool_t     fRecalibration;             // Switch on or off the recalibration
 397   TObjArray* fEMCALRecalibrationFactors; // Array of histograms with map of recalibration factors, EMCAL
 398
 399   // Time Recalibration
 400   Bool_t     fTimeRecalibration;             // Switch on or off the time recalibration
 401   TObjArray* fEMCALTimeRecalibrationFactors; // Array of histograms with map of time recalibration factors, EMCAL
 402
 403   // Recalibrate with run dependent corrections, energy
 404   Bool_t     fUseRunCorrectionFactors;   // Use Run Dependent Correction
 405
 406   // Bad Channels
 407   Bool_t     fRemoveBadChannels;         // Check the channel status provided and remove clusters with bad channels
 408   Bool_t     fRecalDistToBadChannels;    // Calculate distance from highest energy tower of cluster to closes bad channel
 409   TObjArray* fEMCALBadChannelMap;        // Array of histograms with map of bad channels, EMCAL
 410
 411   // Border cells
 412   Int_t      fNCellsFromEMCALBorder;     // Number of cells from EMCAL border the cell with maximum amplitude has to be.
 413   Bool_t     fNoEMCALBorderAtEta0;       // Do fiducial cut in EMCAL region eta = 0?
 414
 415   // Exotic cell / cluster
 416   Bool_t     fRejectExoticCluster;       // Switch on or off exotic cluster rejection
 417   Bool_t     fRejectExoticCells;         // Remove exotic cells
 418   Float_t    fExoticCellFraction;        // Good cell if fraction < 1-ecross/ecell
 419   Float_t    fExoticCellDiffTime;        // If time of candidate to exotic and close cell is too different (in ns), it must be noisy, set amp to 0
 420   Float_t    fExoticCellMinAmplitude;    // Check for exotic only if amplitud is larger than this value
 421
 422   // PID
 423   AliEMCALPIDUtils * fPIDUtils;          // Recalculate PID parameters
 424
 425   //Track matching
 426   UInt_t     fAODFilterMask;             // Filter mask to select AOD tracks. Refer to $ALICE_ROOT/ANALYSIS/macros/AddTaskESDFilter.C
 427   TArrayI  * fMatchedTrackIndex;         // Array that stores indexes of matched tracks
 428   TArrayI  * fMatchedClusterIndex;       // Array that stores indexes of matched clusters
 429   TArrayF  * fResidualEta;               // Array that stores the residual eta
 430   TArrayF  * fResidualPhi;               // Array that stores the residual phi
 431   Bool_t     fCutEtaPhiSum;              // Place cut on sqrt(dEta^2+dPhi^2)
 432   Bool_t     fCutEtaPhiSeparate;         // Cut on dEta and dPhi separately
 433   Float_t    fCutR;                      // sqrt(dEta^2+dPhi^2) cut on matching
 434   Float_t    fCutEta;                    // dEta cut on matching
 435   Float_t    fCutPhi;                    // dPhi cut on matching
 436   Double_t   fClusterWindow;             // Select clusters in the window to be matched
 437   Double_t   fMass;                      // Mass hypothesis of the track
 438   Double_t   fStepSurface;               // Length of step to extrapolate tracks to EMCal surface
 439   Double_t   fStepCluster;               // Length of step to extrapolate tracks to clusters
 440
 441   // Track cuts
 442   Int_t      fTrackCutsType;             // Esd track cuts type for matching
 443   Double_t   fCutMinTrackPt;             // Cut on track pT
 444   Int_t      fCutMinNClusterTPC;         // Min number of tpc clusters
 445   Int_t      fCutMinNClusterITS;         // Min number of its clusters
 446   Float_t    fCutMaxChi2PerClusterTPC;   // Max tpc fit chi2 per tpc cluster
 447   Float_t    fCutMaxChi2PerClusterITS;   // Max its fit chi2 per its cluster
 448   Bool_t     fCutRequireTPCRefit;        // Require TPC refit
 449   Bool_t     fCutRequireITSRefit;        // Require ITS refit
 450   Bool_t     fCutAcceptKinkDaughters;    // Accepting kink daughters?
 451   Float_t    fCutMaxDCAToVertexXY;       // Track-to-vertex cut in max absolute distance in xy-plane
 452   Float_t    fCutMaxDCAToVertexZ;        // Track-to-vertex cut in max absolute distance in z-plane
 453   Bool_t     fCutDCAToVertex2D;          // If true a 2D DCA cut is made.
 454
 455   ClassDef(AliEMCALRecoUtils, 18)
 456
 457 };
 458
 459 #endif // ALIEMCALRECOUTILS_H
 460
 461