1) Add initialization of magnetic field in case of track matching recalculation,...
[u/mrichter/AliRoot.git] / EMCAL / AliEMCALRecoUtils.h
1 #ifndef ALIEMCALRECOUTILS_H
2 #define ALIEMCALRECOUTILS_H
3
4 /* $Id: AliEMCALRecoUtils.h 33808 2009-07-15 09:48:08Z gconesab $ */
5
6 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
7 //
8 // Class AliEMCALRecoUtils
9 // Some utilities to recalculate the cluster position or energy linearity
10 //
11 //
12 // Author:  Gustavo Conesa (LPSC- Grenoble) 
13 //          Track matching part: Rongrong Ma (Yale)
14 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
15
16 //Root includes
17 #include <TNamed.h>
18 #include <TMath.h>
19 class TObjArray;
20 class TArrayI;
21 class TArrayF;
22 #include <TH2I.h>
23 class TH2F;
24 #include <TRandom3.h>
25
26 //AliRoot includes
27 class AliVCluster;
28 class AliVCaloCells;
29 class AliVEvent;
30 class AliESDEvent;
31 #include "AliLog.h"
32
33 // EMCAL includes
34 class AliEMCALGeometry;
35 class AliEMCALPIDUtils;
36 class AliESDtrack;
37 class AliExternalTrackParam;
38
39 class AliEMCALRecoUtils : public TNamed {
40   
41 public:
42   
43   AliEMCALRecoUtils();
44   AliEMCALRecoUtils(const AliEMCALRecoUtils&); 
45   AliEMCALRecoUtils& operator=(const AliEMCALRecoUtils&); 
46   virtual ~AliEMCALRecoUtils() ;  
47   
48   void     InitParameters();
49   
50   void     Print(const Option_t*) const;
51
52   //enums
53   enum     NonlinearityFunctions{kPi0MC=0,kPi0GammaGamma=1,kPi0GammaConversion=2,kNoCorrection=3,kBeamTest=4,kBeamTestCorrected=5};
54   enum     PositionAlgorithms{kUnchanged=-1,kPosTowerIndex=0, kPosTowerGlobal=1};
55   enum     ParticleType{kPhoton=0, kElectron=1,kHadron =2, kUnknown=-1};
56   enum     { kNCuts = 11 }; //track matching
57   enum     TrackCutsType{kTPCOnlyCut=0, kGlobalCut=1, kLooseCut=2};
58
59   //-----------------------------------------------------
60   //Position recalculation
61   //-----------------------------------------------------
62
63   void     RecalculateClusterPosition               (AliEMCALGeometry *geom, AliVCaloCells* cells, AliVCluster* clu); 
64   void     RecalculateClusterPositionFromTowerIndex (AliEMCALGeometry *geom, AliVCaloCells* cells, AliVCluster* clu); 
65   void     RecalculateClusterPositionFromTowerGlobal(AliEMCALGeometry *geom, AliVCaloCells* cells, AliVCluster* clu); 
66   
67   Float_t  GetCellWeight(const Float_t eCell, const Float_t eCluster) const { return TMath::Max( 0., fW0 + TMath::Log( eCell / eCluster )) ; }
68   
69   Float_t  GetDepth(const Float_t eCluster, const Int_t iParticle, const Int_t iSM) const ; 
70   
71   void     GetMaxEnergyCell(const AliEMCALGeometry *geom, AliVCaloCells* cells, const AliVCluster* clu, 
72                             Int_t & absId,  Int_t& iSupMod, Int_t& ieta, Int_t& iphi, Bool_t &shared);
73   
74   Float_t  GetMisalTransShift(const Int_t i)       const { if(i < 15 ) { return fMisalTransShift[i] ; }
75                                                            else        { AliInfo(Form("Index %d larger than 15, do nothing\n",i)) ; 
76                                                                          return 0.                  ; } }
77   Float_t* GetMisalTransShiftArray()                     { return fMisalTransShift ; }
78
79   void     SetMisalTransShift(const Int_t i, const Float_t shift) {
80                                                            if(i < 15 ) { fMisalTransShift[i] = shift ; }
81                                                            else        { AliInfo(Form("Index %d larger than 15, do nothing\n",i)) ; } }
82   void     SetMisalTransShiftArray(Float_t * misal)               { for(Int_t i = 0; i < 15; i++) fMisalTransShift[i] = misal[i]  ; }
83
84   Float_t  GetMisalRotShift(const Int_t i)         const { if(i < 15 ) { return fMisalRotShift[i]    ; }
85                                                            else        { AliInfo(Form("Index %d larger than 15, do nothing\n",i)) ; 
86                                                                          return 0.                   ; } }
87   
88   Float_t* GetMisalRotShiftArray()                       { return fMisalRotShift                     ; }
89   
90   void     SetMisalRotShift(const Int_t i, const Float_t shift) {
91                                                            if(i < 15 ) { fMisalRotShift[i] = shift   ; }
92                                                            else        { AliInfo(Form("Index %d larger than 15, do nothing\n",i)) ; } }
93   
94   void     SetMisalRotShiftArray(Float_t * misal)        { for(Int_t i = 0; i < 15; i++)fMisalRotShift[i] = misal[i] ; }
95   
96   Int_t    GetParticleType()                       const { return  fParticleType    ; }
97   void     SetParticleType(Int_t particle)               { fParticleType = particle ; }
98   
99   Int_t    GetPositionAlgorithm()                  const { return fPosAlgo          ; }
100   void     SetPositionAlgorithm(Int_t alg)               { fPosAlgo = alg           ; }
101   
102   Float_t  GetW0()                                 const { return fW0               ; }
103   void     SetW0(Float_t w0)                             { fW0  = w0                ; }
104
105   //-----------------------------------------------------
106   // Non Linearity
107   //-----------------------------------------------------
108
109   Float_t  CorrectClusterEnergyLinearity(AliVCluster* clu) ;
110   
111   Float_t  GetNonLinearityParam(const Int_t i)     const { if(i < 7 ){ return fNonLinearityParams[i] ; }
112                                                           else      { AliInfo(Form("Index %d larger than 7, do nothing\n",i)) ; 
113                                                                        return 0.                     ; } }
114   void     SetNonLinearityParam(const Int_t i, const Float_t param) {
115                                                           if(i < 7 ){fNonLinearityParams[i] = param ; }
116                                                           else { AliInfo(Form("Index %d larger than 7, do nothing\n",i)) ; } }
117   void     InitNonLinearityParam();
118
119   Int_t    GetNonLinearityFunction() const               { return fNonLinearityFunction    ; }
120   void     SetNonLinearityFunction(Int_t fun)            { fNonLinearityFunction = fun     ; InitNonLinearityParam() ; }
121
122   void     SetNonLinearityThreshold(Int_t threshold)     { fNonLinearThreshold = threshold ; } //only for Alexie's non linearity correction
123   Int_t    GetNonLinearityThreshold()              const { return fNonLinearThreshold      ; }
124 //  
125   //-----------------------------------------------------
126   // MC clusters energy smearing
127   //-----------------------------------------------------
128   
129   Float_t  SmearClusterEnergy(const AliVCluster* clu) ;
130   void     SwitchOnClusterEnergySmearing()               { fSmearClusterEnergy = kTRUE         ; }
131   void     SwitchOffClusterEnergySmearing()              { fSmearClusterEnergy = kFALSE        ; }
132   Bool_t   IsClusterEnergySmeared()                const { return fSmearClusterEnergy          ; }   
133   void     SetSmearingParameters(Int_t i, Float_t param) { if(i < 3){ fSmearClusterParam[i] = param ; }
134                                                            else     { AliInfo(Form("Index %d larger than 2, do nothing\n",i)) ; } }
135   //-----------------------------------------------------
136   // Recalibration
137   //-----------------------------------------------------
138   Bool_t   AcceptCalibrateCell(const Int_t absId, const Int_t bc,
139                                Float_t & amp, Double_t & time, AliVCaloCells* cells) ; // Energy and Time
140   void     RecalibrateCells(AliVCaloCells * cells, Int_t bc) ; // Energy and Time
141   void     RecalibrateClusterEnergy(const AliEMCALGeometry* geom, AliVCluster* cluster, AliVCaloCells * cells, const Int_t bc=-1) ; // Energy and time
142
143   // Energy recalibration
144   Bool_t   IsRecalibrationOn()                     const { return fRecalibration ; }
145   void     SwitchOffRecalibration()                      { fRecalibration = kFALSE ; }
146   void     SwitchOnRecalibration()                       { fRecalibration = kTRUE  ; 
147                                                            if(!fEMCALRecalibrationFactors)InitEMCALRecalibrationFactors() ; }
148   void     InitEMCALRecalibrationFactors() ;
149
150   TH2F *   GetEMCALChannelRecalibrationFactors(Int_t iSM)     const { return (TH2F*)fEMCALRecalibrationFactors->At(iSM) ; }     
151   void     SetEMCALChannelRecalibrationFactors(TObjArray *map)      { fEMCALRecalibrationFactors = map                  ; }
152   void     SetEMCALChannelRecalibrationFactors(Int_t iSM , TH2F* h) { fEMCALRecalibrationFactors->AddAt(h,iSM)          ; }
153   
154   Float_t  GetEMCALChannelRecalibrationFactor(Int_t iSM , Int_t iCol, Int_t iRow) const { 
155     if(fEMCALRecalibrationFactors) 
156       return (Float_t) ((TH2F*)fEMCALRecalibrationFactors->At(iSM))->GetBinContent(iCol,iRow); 
157     else return 1 ; } 
158         
159   void     SetEMCALChannelRecalibrationFactor(Int_t iSM , Int_t iCol, Int_t iRow, Double_t c = 1) { 
160     if(!fEMCALRecalibrationFactors) InitEMCALRecalibrationFactors() ;
161     ((TH2F*)fEMCALRecalibrationFactors->At(iSM))->SetBinContent(iCol,iRow,c) ; }
162   
163   //Recalibrate channels energy with run dependent corrections
164   void     SwitchOffRunDepCorrection()                   { fUseRunCorrectionFactors = kFALSE ; }
165   void     SwitchOnRunDepCorrection()                    { fUseRunCorrectionFactors = kTRUE  ; 
166                                                            SwitchOnRecalibration()           ; }
167   void     SetRunDependentCorrections(Int_t runnumber);
168       
169   // Time Recalibration  
170   void     RecalibrateCellTime(const Int_t absId, const Int_t bc, Double_t & time) const;
171   
172   Bool_t   IsTimeRecalibrationOn()                 const { return fTimeRecalibration   ; }
173   void     SwitchOffTimeRecalibration()                  { fTimeRecalibration = kFALSE ; }
174   void     SwitchOnTimeRecalibration()                   { fTimeRecalibration = kTRUE  ; 
175     if(!fEMCALTimeRecalibrationFactors)InitEMCALTimeRecalibrationFactors() ; }
176   void     InitEMCALTimeRecalibrationFactors() ;
177   
178   Float_t  GetEMCALChannelTimeRecalibrationFactor(const Int_t bc, const Int_t absID) const { 
179     if(fEMCALTimeRecalibrationFactors) 
180       return (Float_t) ((TH1F*)fEMCALTimeRecalibrationFactors->At(bc))->GetBinContent(absID); 
181     else return 0 ; } 
182         
183   void     SetEMCALChannelTimeRecalibrationFactor(const Int_t bc, const Int_t absID, Double_t c = 0) { 
184     if(!fEMCALTimeRecalibrationFactors) InitEMCALTimeRecalibrationFactors() ;
185     ((TH1F*)fEMCALTimeRecalibrationFactors->At(bc))->SetBinContent(absID,c) ; }  
186   
187   TH1F *   GetEMCALChannelTimeRecalibrationFactors(const Int_t bc)const       { return (TH1F*)fEMCALTimeRecalibrationFactors->At(bc) ; }        
188   void     SetEMCALChannelTimeRecalibrationFactors(TObjArray *map)            { fEMCALTimeRecalibrationFactors = map                 ; }
189   void     SetEMCALChannelTimeRecalibrationFactors(const Int_t bc , TH1F* h)  { fEMCALTimeRecalibrationFactors->AddAt(h,bc)          ; }
190   
191   //-----------------------------------------------------
192   // Modules fiducial region, remove clusters in borders
193   //-----------------------------------------------------
194
195   Bool_t   CheckCellFiducialRegion(AliEMCALGeometry* geom, AliVCluster* cluster, AliVCaloCells* cells) ;
196   void     SetNumberOfCellsFromEMCALBorder(const Int_t n){ fNCellsFromEMCALBorder = n      ; }
197   Int_t    GetNumberOfCellsFromEMCALBorder()      const  { return fNCellsFromEMCALBorder   ; }
198     
199   void     SwitchOnNoFiducialBorderInEMCALEta0()         { fNoEMCALBorderAtEta0 = kTRUE    ; }
200   void     SwitchOffNoFiducialBorderInEMCALEta0()        { fNoEMCALBorderAtEta0 = kFALSE   ; }
201   Bool_t   IsEMCALNoBorderAtEta0()                 const { return fNoEMCALBorderAtEta0     ; }
202   
203   //-----------------------------------------------------
204   // Bad channels
205   //-----------------------------------------------------
206
207   Bool_t   IsBadChannelsRemovalSwitchedOn()        const { return fRemoveBadChannels       ; }
208   void     SwitchOffBadChannelsRemoval()                 { fRemoveBadChannels = kFALSE     ; }
209   void     SwitchOnBadChannelsRemoval ()                 { fRemoveBadChannels = kTRUE ; 
210                                                            if(!fEMCALBadChannelMap)InitEMCALBadChannelStatusMap() ; }
211         
212   Bool_t   IsDistanceToBadChannelRecalculated()    const { return fRecalDistToBadChannels   ; }
213   void     SwitchOffDistToBadChannelRecalculation()      { fRecalDistToBadChannels = kFALSE ; }
214   void     SwitchOnDistToBadChannelRecalculation()       { fRecalDistToBadChannels = kTRUE  ; 
215                                                            if(!fEMCALBadChannelMap)InitEMCALBadChannelStatusMap() ; }
216   
217   void     InitEMCALBadChannelStatusMap() ;
218         
219   Int_t    GetEMCALChannelStatus(Int_t iSM , Int_t iCol, Int_t iRow) const { 
220     if(fEMCALBadChannelMap) return (Int_t) ((TH2I*)fEMCALBadChannelMap->At(iSM))->GetBinContent(iCol,iRow); 
221     else return 0;}//Channel is ok by default
222         
223   void     SetEMCALChannelStatus(Int_t iSM , Int_t iCol, Int_t iRow, Double_t c = 1) { 
224                                                            if(!fEMCALBadChannelMap)InitEMCALBadChannelStatusMap()               ;
225                                                            ((TH2I*)fEMCALBadChannelMap->At(iSM))->SetBinContent(iCol,iRow,c)    ; }
226         
227   TH2I *   GetEMCALChannelStatusMap(Int_t iSM)     const { return (TH2I*)fEMCALBadChannelMap->At(iSM) ; }
228   void     SetEMCALChannelStatusMap(TObjArray *map)      { fEMCALBadChannelMap = map                  ; }
229   void     SetEMCALChannelStatusMap(Int_t iSM , TH2I* h) { fEMCALBadChannelMap->AddAt(h,iSM)          ; }
230
231   Bool_t   ClusterContainsBadChannel(const AliEMCALGeometry* geom, const UShort_t* cellList, const Int_t nCells);
232  
233   //-----------------------------------------------------
234   // Recalculate other cluster parameters
235   //-----------------------------------------------------
236
237   void     RecalculateClusterDistanceToBadChannel (AliEMCALGeometry * geom, AliVCaloCells* cells, AliVCluster * cluster);
238   void     RecalculateClusterShowerShapeParameters(AliEMCALGeometry * geom, AliVCaloCells* cells, AliVCluster * cluster);
239   void     RecalculateClusterPID(AliVCluster * cluster);
240
241   AliEMCALPIDUtils * GetPIDUtils() { return fPIDUtils;}
242
243
244   //----------------------------------------------------
245   // Track matching
246   //----------------------------------------------------
247
248   void     FindMatches(AliVEvent *event, TObjArray * clusterArr=0x0, AliEMCALGeometry *geom=0x0);
249   Int_t    FindMatchedClusterInEvent(AliESDtrack *track, AliVEvent *event, AliEMCALGeometry *geom, Float_t &dEta, Float_t &dPhi);
250   Int_t    FindMatchedClusterInClusterArr(AliExternalTrackParam *emcalParam, AliExternalTrackParam *trkParam, TObjArray * clusterArr, Float_t &dEta, Float_t &dPhi);
251   
252   static Bool_t ExtrapolateTrackToEMCalSurface(AliExternalTrackParam *trkParam, Double_t emcalR, 
253                                                Double_t mass, Double_t step, Float_t &eta, Float_t &phi);
254   static Bool_t ExtrapolateTrackToPosition(AliExternalTrackParam *trkParam, const Float_t *clsPos, 
255                                            Double_t mass, Double_t step, Float_t &tmpEta, Float_t &tmpPhi);
256   static Bool_t ExtrapolateTrackToCluster (AliExternalTrackParam *trkParam, AliVCluster *cluster, 
257                                            Double_t mass, Double_t step, Float_t &tmpEta, Float_t &tmpPhi);
258   Bool_t        ExtrapolateTrackToCluster (AliExternalTrackParam *trkParam, AliVCluster *cluster, 
259                                            Float_t &tmpEta, Float_t &tmpPhi);
260
261   UInt_t   FindMatchedPosForCluster(Int_t clsIndex) const;
262   UInt_t   FindMatchedPosForTrack(Int_t trkIndex)   const;
263   
264   void     GetMatchedResiduals(Int_t clsIndex, Float_t &dEta, Float_t &dPhi);
265   void     GetMatchedClusterResiduals(Int_t trkIndex, Float_t &dEta, Float_t &dPhi);
266   Int_t    GetMatchedTrackIndex(Int_t clsIndex);
267   Int_t    GetMatchedClusterIndex(Int_t trkIndex);
268   
269   Bool_t   IsClusterMatched(Int_t clsIndex)         const;
270   Bool_t   IsTrackMatched(Int_t trkIndex)           const;
271
272   void     SetClusterMatchedToTrack (const AliESDEvent *event);
273   
274   void     SetTracksMatchedToCluster(const AliESDEvent *event);  
275
276   void     SwitchOnCutEtaPhiSum()                     { fCutEtaPhiSum      = kTRUE    ; 
277                                                         fCutEtaPhiSeparate = kFALSE   ; }
278   void     SwitchOnCutEtaPhiSeparate()                { fCutEtaPhiSeparate = kTRUE    ;
279                                                         fCutEtaPhiSum      = kFALSE   ; }
280
281   Float_t  GetCutR()                            const { return fCutR                  ; }
282   Float_t  GetCutEta()                          const { return fCutEta                ; }
283   Float_t  GetCutPhi()                          const { return fCutPhi                ; }
284   Double_t GetClusterWindow()                   const { return fClusterWindow         ; }
285   void     SetCutR(Float_t cutR)                      { fCutR   = cutR                ; }
286   void     SetCutEta(Float_t cutEta)                  { fCutEta = cutEta              ; }
287   void     SetCutPhi(Float_t cutPhi)                  { fCutPhi = cutPhi              ; }
288   void     SetClusterWindow(Double_t window)          { fClusterWindow = window       ; }
289   void     SetCutZ(Float_t cutZ)                      { printf("Obsolete fucntion of cutZ=%1.1f\n",cutZ) ; } //Obsolete
290
291   Double_t GetMass()                            const { return fMass                  ; }
292   Double_t GetStep()                            const { return fStepCluster           ; }
293   Double_t GetStepSurface()                     const { return fStepSurface           ; }
294   void     SetMass(Double_t mass)                     { fMass = mass                  ; }
295   void     SetStep(Double_t step)                     { fStepSurface = step           ; }
296   void     SetStepCluster(Double_t step)              { fStepCluster = step           ; }
297  
298   // Exotic cells / clusters
299   
300   Bool_t   IsExoticCell(const Int_t absId, AliVCaloCells* cells, const Int_t bc =-1) ;
301   void     SwitchOnRejectExoticCell()                 { fRejectExoticCells = kTRUE     ; }
302   void     SwitchOffRejectExoticCell()                { fRejectExoticCells = kFALSE    ; } 
303    
304   void     SetExoticCellFractionCut(Float_t f)        { fExoticCellFraction     = f    ; }
305   void     SetExoticCellDiffTimeCut(Float_t dt)       { fExoticCellDiffTime     = dt   ; }
306   void     SetExoticCellMinAmplitudeCut(Float_t ma)   { fExoticCellMinAmplitude = ma   ; }
307   
308   Bool_t   IsExoticCluster(AliVCluster *cluster, AliVCaloCells* cells, const Int_t bc=0) ;
309   void     SwitchOnRejectExoticCluster()              { fRejectExoticCluster = kTRUE   ;
310                                                         fRejectExoticCells   = kTRUE   ; }
311   void     SwitchOffRejectExoticCluster()             { fRejectExoticCluster = kFALSE  ; }
312   Bool_t   IsRejectExoticCluster()              const { return fRejectExoticCluster    ; }
313   
314   //Cluster cut
315   Bool_t   IsGoodCluster(AliVCluster *cluster, AliEMCALGeometry *geom, AliVCaloCells* cells, const Int_t bc =-1);
316
317   //Track Cuts 
318   Bool_t   IsAccepted(AliESDtrack *track);
319   void     InitTrackCuts();
320   void     SetTrackCutsType(Int_t type)              { fTrackCutsType = type           ; 
321                                                        InitTrackCuts()                 ; }
322   Int_t    GetTrackCutsType() const                  { return fTrackCutsType; }
323
324   // track quality cut setters  
325   void     SetMinTrackPt(Double_t pt=0)              { fCutMinTrackPt           = pt   ; }
326   void     SetMinNClustersTPC(Int_t min=-1)          { fCutMinNClusterTPC       = min  ; }
327   void     SetMinNClustersITS(Int_t min=-1)          { fCutMinNClusterITS       = min  ; }
328   void     SetMaxChi2PerClusterTPC(Float_t max=1e10) { fCutMaxChi2PerClusterTPC = max  ; }
329   void     SetMaxChi2PerClusterITS(Float_t max=1e10) { fCutMaxChi2PerClusterITS = max  ; }
330   void     SetRequireTPCRefit(Bool_t b=kFALSE)       { fCutRequireTPCRefit      = b    ; }
331   void     SetRequireITSRefit(Bool_t b=kFALSE)       { fCutRequireITSRefit      = b    ; }
332   void     SetAcceptKinkDaughters(Bool_t b=kTRUE)    { fCutAcceptKinkDaughters  = b    ; }
333   void     SetMaxDCAToVertexXY(Float_t dist=1e10)    { fCutMaxDCAToVertexXY     = dist ; }
334   void     SetMaxDCAToVertexZ(Float_t dist=1e10)     { fCutMaxDCAToVertexZ      = dist ; }
335   void     SetDCAToVertex2D(Bool_t b=kFALSE)         { fCutDCAToVertex2D        = b    ; }
336
337   // getters                                                            
338   Double_t GetMinTrackPt()                     const { return fCutMinTrackPt           ; }
339   Int_t    GetMinNClusterTPC()                 const { return fCutMinNClusterTPC       ; }
340   Int_t    GetMinNClustersITS()                const { return fCutMinNClusterITS       ; }
341   Float_t  GetMaxChi2PerClusterTPC()           const { return fCutMaxChi2PerClusterTPC ; }
342   Float_t  GetMaxChi2PerClusterITS()           const { return fCutMaxChi2PerClusterITS ; }
343   Bool_t   GetRequireTPCRefit()                const { return fCutRequireTPCRefit      ; }
344   Bool_t   GetRequireITSRefit()                const { return fCutRequireITSRefit      ; }
345   Bool_t   GetAcceptKinkDaughters()            const { return fCutAcceptKinkDaughters  ; }
346   Float_t  GetMaxDCAToVertexXY()               const { return fCutMaxDCAToVertexXY     ; }
347   Float_t  GetMaxDCAToVertexZ()                const { return fCutMaxDCAToVertexZ      ; }
348   Bool_t   GetDCAToVertex2D()                  const { return fCutDCAToVertex2D        ; }
349
350
351 private:  
352   //Position recalculation
353   Float_t    fMisalTransShift[15];       // Shift parameters
354   Float_t    fMisalRotShift[15];         // Shift parameters
355   Int_t      fParticleType;              // Particle type for depth calculation
356   Int_t      fPosAlgo;                   // Position recalculation algorithm
357   Float_t    fW0;                        // Weight0
358     
359   // Non linearity
360   Int_t      fNonLinearityFunction;      // Non linearity function choice
361   Float_t    fNonLinearityParams[7];     // Parameters for the non linearity function
362   Int_t      fNonLinearThreshold;        // Non linearity threshold value for kBeamTesh non linearity function 
363   
364   // Energy smearing for MC
365   Bool_t     fSmearClusterEnergy;        // Smear cluster energy, to be done only for simulated data to match real data
366   Float_t    fSmearClusterParam[3];      // Smearing parameters
367   TRandom3   fRandom;                    // Random generator
368     
369   // Energy Recalibration 
370   Bool_t     fCellsRecalibrated;         // Internal bool to check if cells (time/energy) where recalibrated and not recalibrate them when recalculating different things
371   Bool_t     fRecalibration;             // Switch on or off the recalibration
372   TObjArray* fEMCALRecalibrationFactors; // Array of histograms with map of recalibration factors, EMCAL
373     
374   // Time Recalibration 
375   Bool_t     fTimeRecalibration;             // Switch on or off the time recalibration
376   TObjArray* fEMCALTimeRecalibrationFactors; // Array of histograms with map of time recalibration factors, EMCAL
377   
378   // Recalibrate with run dependent corrections, energy
379   Bool_t     fUseRunCorrectionFactors;   // Use Run Dependent Correction
380   Bool_t     fRunCorrectionFactorsSet;   // Run Correction set at leat once
381     
382   // Bad Channels
383   Bool_t     fRemoveBadChannels;         // Check the channel status provided and remove clusters with bad channels
384   Bool_t     fRecalDistToBadChannels;    // Calculate distance from highest energy tower of cluster to closes bad channel
385   TObjArray* fEMCALBadChannelMap;        // Array of histograms with map of bad channels, EMCAL
386
387   // Border cells
388   Int_t      fNCellsFromEMCALBorder;     // Number of cells from EMCAL border the cell with maximum amplitude has to be.
389   Bool_t     fNoEMCALBorderAtEta0;       // Do fiducial cut in EMCAL region eta = 0?
390   
391   // Exotic cell / cluster
392   Bool_t     fRejectExoticCluster;       // Switch on or off exotic cluster rejection
393   Bool_t     fRejectExoticCells;         // Remove exotic cells
394   Float_t    fExoticCellFraction;        // Good cell if fraction < 1-ecross/ecell
395   Float_t    fExoticCellDiffTime;        // If time of candidate to exotic and close cell is too different (in ns), it must be noisy, set amp to 0
396   Float_t    fExoticCellMinAmplitude;    // Check for exotic only if amplitud is larger than this value
397   
398   // PID
399   AliEMCALPIDUtils * fPIDUtils;          // Recalculate PID parameters
400     
401   //Track matching
402   UInt_t     fAODFilterMask;             // Filter mask to select AOD tracks. Refer to $ALICE_ROOT/ANALYSIS/macros/AddTaskESDFilter.C
403   TArrayI  * fMatchedTrackIndex;         // Array that stores indexes of matched tracks      
404   TArrayI  * fMatchedClusterIndex;       // Array that stores indexes of matched clusters
405   TArrayF  * fResidualEta;               // Array that stores the residual eta
406   TArrayF  * fResidualPhi;               // Array that stores the residual phi
407   Bool_t     fCutEtaPhiSum;              // Place cut on sqrt(dEta^2+dPhi^2)
408   Bool_t     fCutEtaPhiSeparate;         // Cut on dEta and dPhi separately
409   Float_t    fCutR;                      // sqrt(dEta^2+dPhi^2) cut on matching
410   Float_t    fCutEta;                    // dEta cut on matching
411   Float_t    fCutPhi;                    // dPhi cut on matching
412   Double_t   fClusterWindow;             // Select clusters in the window to be matched
413   Double_t   fMass;                      // Mass hypothesis of the track
414   Double_t   fStepSurface;               // Length of step to extrapolate tracks to EMCal surface
415   Double_t   fStepCluster;               // Length of step to extrapolate tracks to clusters
416
417   // Track cuts  
418   Int_t      fTrackCutsType;             // Esd track cuts type for matching
419   Double_t   fCutMinTrackPt;             // Cut on track pT
420   Int_t      fCutMinNClusterTPC;         // Min number of tpc clusters
421   Int_t      fCutMinNClusterITS;         // Min number of its clusters  
422   Float_t    fCutMaxChi2PerClusterTPC;   // Max tpc fit chi2 per tpc cluster
423   Float_t    fCutMaxChi2PerClusterITS;   // Max its fit chi2 per its cluster
424   Bool_t     fCutRequireTPCRefit;        // Require TPC refit
425   Bool_t     fCutRequireITSRefit;        // Require ITS refit
426   Bool_t     fCutAcceptKinkDaughters;    // Accepting kink daughters?
427   Float_t    fCutMaxDCAToVertexXY;       // Track-to-vertex cut in max absolute distance in xy-plane
428   Float_t    fCutMaxDCAToVertexZ;        // Track-to-vertex cut in max absolute distance in z-plane
429   Bool_t     fCutDCAToVertex2D;          // If true a 2D DCA cut is made.
430   
431   ClassDef(AliEMCALRecoUtils, 17)
432   
433 };
434
435 #endif // ALIEMCALRECOUTILS_H
436
437