EMCAL/AliEMCALReconstructor.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
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   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
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  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18 //_________________________________________________________________________
  19 //--
  20 //-- Yves Schutz (SUBATECH)
  21 // Reconstruction class. Redesigned from the old AliReconstructionner class and
  22 // derived from STEER/AliReconstructor.
  23 //
  24
  25
  26 // --- ROOT system ---
  27 #include <TClonesArray.h>
  28 #include "TGeoManager.h"
  29 #include "TGeoMatrix.h"
  30
  31 // --- Standard library ---
  32
  33 // --- AliRoot header files ---
  34 #include "AliEMCALReconstructor.h"
  35
  36 #include "AliCodeTimer.h"
  37 #include "AliCaloCalibPedestal.h"
  38 #include "AliEMCALCalibData.h"
  39 #include "AliESDEvent.h"
  40 #include "AliESDCaloCluster.h"
  41 #include "AliESDCaloCells.h"
  42 #include "AliESDtrack.h"
  43 #include "AliEMCALLoader.h"
  44 #include "AliEMCALRawUtils.h"
  45 #include "AliEMCALDigit.h"
  46 #include "AliEMCALClusterizerv1.h"
  47 #include "AliEMCALClusterizerNxN.h"
  48 #include "AliEMCALRecPoint.h"
  49 #include "AliEMCALPID.h"
  50 #include "AliEMCALTrigger.h"
  51 #include "AliRawReader.h"
  52 #include "AliCDBEntry.h"
  53 #include "AliCDBManager.h"
  54 #include "AliEMCALGeometry.h"
  55 #include "AliEMCAL.h"
  56 #include "AliESDVZERO.h"
  57 #include "AliCDBManager.h"
  58 #include "AliRunLoader.h"
  59 #include "AliRun.h"
  60 #include "AliEMCALTriggerData.h"
  61 #include "AliEMCALTriggerElectronics.h"
  62 #include "AliEMCALTriggerDCSConfigDB.h"
  63 #include "AliEMCALTriggerDCSConfig.h"
  64 #include "AliEMCALTriggerData.h"
  65 #include "AliEMCALTriggerRawDigit.h"
  66 #include "AliEMCALTriggerPatch.h"
  67 #include "AliEMCALTriggerTypes.h"
  68
  69 ClassImp(AliEMCALReconstructor)
  70
  71 const AliEMCALRecParam*     AliEMCALReconstructor::fgkRecParam        = 0;   // EMCAL rec. parameters
  72 AliEMCALRawUtils*           AliEMCALReconstructor::fgRawUtils         = 0;   // EMCAL raw utilities class
  73 AliEMCALClusterizer*        AliEMCALReconstructor::fgClusterizer      = 0;   // EMCAL clusterizer class
  74 TClonesArray*               AliEMCALReconstructor::fgDigitsArr        = 0;   // list of digits, to be used multiple times
  75 TObjArray*                  AliEMCALReconstructor::fgClustersArr      = 0;   // list of clusters, to be used multiple times
  76 TClonesArray*               AliEMCALReconstructor::fgTriggerDigits    = 0;   // list of trigger digits, to be used multiple times
  77 AliEMCALTriggerElectronics* AliEMCALReconstructor::fgTriggerProcessor = 0x0;
  78 //____________________________________________________________________________
  79 AliEMCALReconstructor::AliEMCALReconstructor()
  80   : fGeom(0),fCalibData(0),fPedestalData(0),fTriggerData(0x0)
  81 {
  82   // ctor
  83
  84   fgRawUtils = new AliEMCALRawUtils;
  85
  86   //To make sure we match with the geometry in a simulation file,
  87   //let's try to get it first.  If not, take the default geometry
  88   AliRunLoader *rl = AliRunLoader::Instance();
  89   if (rl->GetAliRun()){
  90     AliEMCAL * emcal = dynamic_cast<AliEMCAL*>(rl->GetAliRun()->GetDetector("EMCAL"));
  91     if(emcal) fGeom = emcal->GetGeometry();
  92   }
  93
  94   if(!fGeom) {
  95     AliInfo(Form("Using default geometry in reconstruction"));
  96     fGeom =  AliEMCALGeometry::GetInstance(AliEMCALGeometry::GetDefaultGeometryName());
  97   }
  98
  99   //Get calibration parameters
 100   if(!fCalibData)
 101     {
 102       AliCDBEntry *entry = (AliCDBEntry*)
 103         AliCDBManager::Instance()->Get("EMCAL/Calib/Data");
 104       if (entry) fCalibData =  (AliEMCALCalibData*) entry->GetObject();
 105     }
 106
 107   if(!fCalibData)
 108     AliFatal("Calibration parameters not found in CDB!");
 109
 110   //Get calibration parameters
 111   if(!fPedestalData)
 112     {
 113       AliCDBEntry *entry = (AliCDBEntry*)
 114         AliCDBManager::Instance()->Get("EMCAL/Calib/Pedestals");
 115       if (entry) fPedestalData =  (AliCaloCalibPedestal*) entry->GetObject();
 116     }
 117
 118   if(!fPedestalData)
 119     AliFatal("Dead map not found in CDB!");
 120
 121   if(!fGeom) AliFatal(Form("Could not get geometry!"));
 122
 123   AliEMCALTriggerDCSConfigDB* dcsConfigDB = AliEMCALTriggerDCSConfigDB::Instance();
 124
 125   const AliEMCALTriggerDCSConfig* dcsConfig = dcsConfigDB->GetTriggerDCSConfig();
 126
 127   if (!dcsConfig) AliFatal("No Trigger DCS Configuration from OCDB!");
 128   fgTriggerProcessor = new AliEMCALTriggerElectronics( dcsConfig );
 129
 130   fTriggerData = new AliEMCALTriggerData();
 131
 132   //Init temporary list of digits
 133   fgDigitsArr     = new TClonesArray("AliEMCALDigit",1000);
 134   fgClustersArr   = new TObjArray(1000);
 135   fgTriggerDigits = new TClonesArray("AliEMCALTriggerRawDigit",1000);
 136 }
 137
 138 //____________________________________________________________________________
 139 AliEMCALReconstructor::~AliEMCALReconstructor()
 140 {
 141   // dtor
 142
 143   if(fGeom)              delete fGeom;
 144
 145   //No need to delete, recovered from OCDB
 146   //if(fCalibData)         delete fCalibData;
 147   //if(fPedestalData)      delete fPedestalData;
 148
 149   if(fgDigitsArr){
 150     fgDigitsArr->Clear("C");
 151     delete fgDigitsArr;
 152   }
 153
 154   if(fgClustersArr){
 155     fgClustersArr->Clear();
 156     delete fgClustersArr;
 157   }
 158
 159   if(fgTriggerDigits){
 160     fgTriggerDigits->Clear();
 161     delete fgTriggerDigits;
 162   }
 163
 164   if(fgRawUtils)         delete fgRawUtils;
 165   if(fgClusterizer)      delete fgClusterizer;
 166   if(fgTriggerProcessor) delete fgTriggerProcessor;
 167
 168   AliCodeTimer::Instance()->Print();
 169 }
 170
 171 //____________________________________________________________________________
 172 void AliEMCALReconstructor::InitClusterizer() const
 173 {
 174   //Init the clusterizer with geometry and calibration pointers, avoid doing it twice.
 175   Int_t clusterizerType = -1;
 176   Int_t eventType = -1;
 177   if(GetRecParam()) {
 178     clusterizerType = GetRecParam()->GetClusterizerFlag();
 179     eventType       = GetRecParam()->GetEventSpecie();
 180   }
 181   else{
 182     AliCDBEntry *entry = (AliCDBEntry*)
 183       AliCDBManager::Instance()->Get("EMCAL/Calib/RecoParam");
 184     //Get The reco param for the default event specie
 185     if (entry) {
 186       AliEMCALRecParam *recParam  = (AliEMCALRecParam*)((TObjArray *) entry->GetObject())->At(0);
 187       if(recParam) clusterizerType = recParam->GetClusterizerFlag();
 188     }
 189   }
 190
 191   //Check if clusterizer previously set corresponds to what is needed for this event type
 192   if(fgClusterizer){
 193     if(eventType!=AliRecoParam::kCalib){
 194       //printf("ReCreate clusterizer? Clusterizer set <%d>, Clusterizer in use <%s>\n",
 195       //     clusterizerType, fgClusterizer->Version());
 196
 197       if     (clusterizerType == AliEMCALRecParam::kClusterizerv1 && !strcmp(fgClusterizer->Version(),"clu-v1")) return;
 198
 199       else if(clusterizerType == AliEMCALRecParam::kClusterizerNxN && !strcmp(fgClusterizer->Version(),"clu-NxN")) return;
 200
 201       //Need to create new clusterizer, the one set previously is not the correct one
 202       delete fgClusterizer;
 203     }
 204     else return;
 205   }
 206
 207   if (clusterizerType  == AliEMCALRecParam::kClusterizerv1)
 208     {
 209       fgClusterizer = new AliEMCALClusterizerv1(fGeom, fCalibData,fPedestalData);
 210     }
 211   else
 212     {
 213       fgClusterizer = new AliEMCALClusterizerNxN(fGeom, fCalibData,fPedestalData);
 214     }
 215 }
 216
 217 //____________________________________________________________________________
 218 void AliEMCALReconstructor::Reconstruct(TTree* digitsTree, TTree* clustersTree) const
 219 {
 220   // method called by AliReconstruction;
 221   // Only the clusterization is performed,; the rest of the reconstruction is done in FillESD because the track
 222   // segment maker needs access to the AliESD object to retrieve the tracks reconstructed by
 223   // the global tracking.
 224   // Works on the current event.
 225
 226   AliCodeTimerAuto("",0)
 227
 228   //Get input digits and put them in fgDigitsArr, clear the list before
 229   ReadDigitsArrayFromTree(digitsTree);
 230
 231   InitClusterizer();
 232
 233   fgClusterizer->InitParameters();
 234   fgClusterizer->SetOutput(clustersTree);
 235
 236   //Skip clusterization of LED events
 237   if (GetRecParam()->GetEventSpecie()!=AliRecoParam::kCalib){
 238
 239     if(fgDigitsArr && fgDigitsArr->GetEntries()) {
 240
 241       fgClusterizer->SetInput(digitsTree);
 242
 243       //fgClusterizer->Digits2Clusters("deb all") ; //For debugging
 244       fgClusterizer->Digits2Clusters("");
 245
 246       fgClusterizer->Clear();
 247
 248     }//digits array exists and has somethind
 249   }//not a LED event
 250
 251   clustersTree->Fill();
 252 }
 253
 254 //____________________________________________________________________________
 255 void AliEMCALReconstructor::ConvertDigits(AliRawReader* rawReader, TTree* digitsTree) const
 256
 257 {
 258   // Conversion from raw data to
 259   // EMCAL digits.
 260   // Works on a single-event basis
 261
 262   rawReader->Reset() ;
 263
 264   fTriggerData->SetMode(1);
 265
 266   if(fgDigitsArr) fgDigitsArr->Clear("C");
 267
 268   TClonesArray *digitsTrg = new TClonesArray("AliEMCALTriggerRawDigit", 32 * 96);
 269
 270   Int_t bufsize = 32000;
 271   digitsTree->Branch("EMCAL", &fgDigitsArr, bufsize);
 272   digitsTree->Branch("EMTRG", &digitsTrg, bufsize);
 273
 274   //Skip calibration events do the rest
 275   Bool_t doFit = kTRUE;
 276   if ( !(GetRecParam()->FitLEDEvents()) && GetRecParam()->GetEventSpecie()==AliRecoParam::kCalib) doFit = kFALSE;
 277   if (doFit){
 278     //must be done here because, in constructor, option is not yet known
 279     fgRawUtils->SetOption(GetOption());
 280
 281     fgRawUtils->SetRawFormatHighLowGainFactor(GetRecParam()->GetHighLowGainFactor());
 282     fgRawUtils->SetRawFormatOrder(GetRecParam()->GetOrderParameter());
 283     fgRawUtils->SetRawFormatTau(GetRecParam()->GetTau());
 284     fgRawUtils->SetNoiseThreshold(GetRecParam()->GetNoiseThreshold());
 285     fgRawUtils->SetNPedSamples(GetRecParam()->GetNPedSamples());
 286     fgRawUtils->SetRemoveBadChannels(GetRecParam()->GetRemoveBadChannels());
 287     fgRawUtils->SetFittingAlgorithm(GetRecParam()->GetFittingAlgorithm());
 288     fgRawUtils->SetFALTROUsage(GetRecParam()->UseFALTRO());
 289     fgRawUtils->SetTimeMin(GetRecParam()->GetTimeMin());
 290     fgRawUtils->SetTimeMax(GetRecParam()->GetTimeMax());
 291
 292     fgRawUtils->Raw2Digits(rawReader,fgDigitsArr,fPedestalData,digitsTrg,fTriggerData);
 293   }//skip calibration event
 294   else{
 295     AliDebug(1," Calibration Event, skip!");
 296   }
 297
 298   digitsTree->Fill();
 299   digitsTrg->Delete();
 300   delete digitsTrg;
 301
 302 }
 303
 304
 305 //____________________________________________________________________________
 306 void AliEMCALReconstructor::FillESD(TTree* digitsTree, TTree* clustersTree,
 307                                     AliESDEvent* esd) const
 308 {
 309   // Called by AliReconstruct after Reconstruct() and global tracking and vertexing
 310   // and V0
 311   // Works on the current event
 312   // printf(" ## AliEMCALReconstructor::FillESD() is started ### \n ");
 313   //return;
 314
 315   //########################################
 316   // Trigger
 317   //########################################
 318
 319   Int_t v0M[2] = {0, 0};
 320
 321   AliESDVZERO* esdV0 = esd->GetVZEROData();
 322
 323   if (esdV0)
 324     {
 325       for (Int_t i = 0; i < 32; i++)
 326         {
 327           v0M[0] += (Int_t)esdV0->GetAdcV0C(i);
 328           v0M[1] += (Int_t)esdV0->GetAdcV0A(i);
 329         }
 330     }
 331   else
 332     {
 333       AliWarning("Cannot retrieve V0 ESD! Run w/ null V0 charges");
 334     }
 335
 336   if (fgTriggerDigits) fgTriggerDigits->Clear();
 337
 338   TBranch *branchtrg = digitsTree->GetBranch("EMTRG");
 339
 340   if (!branchtrg)
 341     {
 342       AliError("Can't get the branch with the EMCAL trigger digits!");
 343       return;
 344     }
 345
 346   branchtrg->SetAddress(&fgTriggerDigits);
 347   branchtrg->GetEntry(0);
 348
 349   // Note: fgTriggerProcessor reset done at the end of this method
 350   fgTriggerProcessor->Digits2Trigger(fgTriggerDigits, v0M, fTriggerData);
 351
 352   // Fill ESD
 353   AliESDCaloTrigger* trgESD = esd->GetCaloTrigger("EMCAL");
 354
 355   if (trgESD)
 356     {
 357       trgESD->Allocate(fgTriggerDigits->GetEntriesFast());
 358
 359       for (Int_t i = 0; i < fgTriggerDigits->GetEntriesFast(); i++)
 360         {
 361           AliEMCALTriggerRawDigit* rdig = (AliEMCALTriggerRawDigit*)fgTriggerDigits->At(i);
 362
 363           Int_t px, py;
 364           if (fGeom->GetPositionInEMCALFromAbsFastORIndex(rdig->GetId(), px, py))
 365             {
 366               Int_t a = -1, t = -1, times[10];
 367
 368               rdig->GetMaximum(a, t);
 369               rdig->GetL0Times(times);
 370
 371               trgESD->Add(px, py, a, t, times, rdig->GetNL0Times(), rdig->GetL1TimeSum(), rdig->GetTriggerBits());
 372             }
 373         }
 374
 375       trgESD->SetL1Threshold(0, fTriggerData->GetL1GammaThreshold());
 376
 377       trgESD->SetL1Threshold(1, fTriggerData->GetL1JetThreshold()  );
 378     }
 379
 380   // Resetting
 381   fTriggerData->Reset();
 382
 383   //########################################
 384   //##############Fill CaloCells###############
 385   //########################################
 386
 387   //Get input digits and put them in fgDigitsArr, clear the list before
 388   ReadDigitsArrayFromTree(digitsTree);
 389
 390   Int_t nDigits = fgDigitsArr->GetEntries(), idignew = 0 ;
 391   AliDebug(1,Form("%d digits",nDigits));
 392
 393   AliESDCaloCells &emcCells = *(esd->GetEMCALCells());
 394   emcCells.CreateContainer(nDigits);
 395   emcCells.SetType(AliVCaloCells::kEMCALCell);
 396   Float_t energy = 0;
 397   for (Int_t idig = 0 ; idig < nDigits ; idig++) {
 398     const AliEMCALDigit * dig = (const AliEMCALDigit*)fgDigitsArr->At(idig);
 399     if(dig->GetAmplitude() > 0 ){
 400       energy = fgClusterizer->Calibrate(dig->GetAmplitude(),dig->GetTime(),dig->GetId()); //TimeR or Time?
 401       if(energy > 0){ //Digits tagged as bad (dead, hot, not alive) are set to 0 in calibrate, remove them
 402         emcCells.SetCell(idignew,dig->GetId(),energy, dig->GetTime());
 403         idignew++;
 404       }
 405     }
 406   }
 407   emcCells.SetNumberOfCells(idignew);
 408   emcCells.Sort();
 409
 410   //------------------------------------------------------------
 411   //-----------------CLUSTERS-----------------------------
 412   //------------------------------------------------------------
 413   clustersTree->SetBranchStatus("*",0); //disable all branches
 414   clustersTree->SetBranchStatus("EMCALECARP",1); //Enable only the branch we need
 415   if(fgClustersArr) fgClustersArr->Clear();
 416   TBranch *branch = clustersTree->GetBranch("EMCALECARP");
 417   branch->SetAddress(&fgClustersArr);
 418   branch->GetEntry(0);
 419   //clustersTree->GetEvent(0);
 420
 421   Int_t nClusters = fgClustersArr->GetEntries(),  nClustersNew=0;
 422   AliDebug(1,Form("%d clusters",nClusters));
 423
 424   //######################################################
 425   //#######################TRACK MATCHING###############
 426   //######################################################
 427   //Fill list of integers, each one is index of track to which the cluster belongs.
 428
 429   // step 1 - initialize array of matched track indexes
 430   Int_t *matchedTrack = new Int_t[nClusters];
 431   for (Int_t iclus = 0; iclus < nClusters; iclus++)
 432     matchedTrack[iclus] = -1;  // neg. index --> no matched track
 433
 434   // step 2, change the flag for all matched clusters found in tracks
 435   Int_t iemcalMatch = -1;
 436   Int_t endtpc = esd->GetNumberOfTracks();
 437   for (Int_t itrack = 0; itrack < endtpc; itrack++) {
 438     AliESDtrack * track = esd->GetTrack(itrack) ; // retrieve track
 439     iemcalMatch = track->GetEMCALcluster();
 440     if(iemcalMatch >= 0) matchedTrack[iemcalMatch] = itrack;
 441   }
 442
 443   //########################################
 444   //##############Fill CaloClusters#############
 445   //########################################
 446   for (Int_t iClust = 0 ; iClust < nClusters ; iClust++) {
 447     const AliEMCALRecPoint * clust = (const AliEMCALRecPoint*)fgClustersArr->At(iClust);
 448     //if(clust->GetClusterType()== AliVCluster::kEMCALClusterv1) nRP++; else nPC++;
 449     // clust->Print(); //For debugging
 450     // Get information from EMCAL reconstruction points
 451     Float_t xyz[3];
 452     TVector3 gpos;
 453     clust->GetGlobalPosition(gpos);
 454     for (Int_t ixyz=0; ixyz<3; ixyz++)
 455       xyz[ixyz] = gpos[ixyz];
 456     Float_t elipAxis[2];
 457     clust->GetElipsAxis(elipAxis);
 458     //Create digits lists
 459     Int_t cellMult = clust->GetMultiplicity();
 460     //TArrayS digiList(digitMult);
 461     Float_t *amplFloat = clust->GetEnergiesList();
 462     Int_t   *digitInts = clust->GetAbsId();
 463     TArrayS absIdList(cellMult);
 464     TArrayD fracList(cellMult);
 465
 466     Int_t newCellMult = 0;
 467     for (Int_t iCell=0; iCell<cellMult; iCell++) {
 468       if (amplFloat[iCell] > 0) {
 469         absIdList[newCellMult] = (UShort_t)(digitInts[iCell]);
 470         //Calculate Fraction
 471         if(emcCells.GetCellAmplitude(digitInts[iCell])>0 && GetRecParam()->GetUnfold()){
 472           fracList[newCellMult] = amplFloat[iCell]/(emcCells.GetCellAmplitude(digitInts[iCell]));//get cell calibration value
 473
 474         }
 475         else{
 476           fracList[newCellMult] = 0;
 477         }
 478         newCellMult++;
 479       }
 480     }
 481
 482     absIdList.Set(newCellMult);
 483     fracList.Set(newCellMult);
 484
 485     if(newCellMult > 0) { // accept cluster if it has some digit
 486       nClustersNew++;
 487       //Primaries
 488       Int_t  parentMult  = 0;
 489       Int_t *parentList =  clust->GetParents(parentMult);
 490       // fills the ESDCaloCluster
 491       AliESDCaloCluster * ec = new AliESDCaloCluster() ;
 492       ec->SetType(AliVCluster::kEMCALClusterv1);
 493       ec->SetPosition(xyz);
 494       ec->SetE(clust->GetEnergy());
 495
 496       //Distance to the nearest bad crystal
 497       ec->SetDistanceToBadChannel(clust->GetDistanceToBadTower());
 498
 499       ec->SetNCells(newCellMult);
 500       //Change type of list from short to ushort
 501       UShort_t *newAbsIdList  = new UShort_t[newCellMult];
 502       Double_t *newFracList   = new Double_t[newCellMult];
 503       for(Int_t i = 0; i < newCellMult ; i++) {
 504         newAbsIdList[i]=absIdList[i];
 505         newFracList[i] =fracList[i];
 506       }
 507       ec->SetCellsAbsId(newAbsIdList);
 508       ec->SetCellsAmplitudeFraction(newFracList);
 509       ec->SetDispersion(clust->GetDispersion());
 510       ec->SetChi2(-1); //not yet implemented
 511       ec->SetM02(elipAxis[0]*elipAxis[0]) ;
 512       ec->SetM20(elipAxis[1]*elipAxis[1]) ;
 513       ec->SetTOF(clust->GetTime()) ; //time-of-fligh
 514       ec->SetNExMax(clust->GetNExMax());          //number of local maxima
 515       TArrayI arrayTrackMatched(1);// Only one track, temporal solution.
 516       arrayTrackMatched[0]= matchedTrack[iClust];
 517       ec->AddTracksMatched(arrayTrackMatched);
 518
 519       TArrayI arrayParents(parentMult,parentList);
 520       ec->AddLabels(arrayParents);
 521
 522       // add the cluster to the esd object
 523       esd->AddCaloCluster(ec);
 524       delete ec;
 525       delete [] newAbsIdList ;
 526       delete [] newFracList ;
 527     }
 528   } // cycle on clusters
 529
 530   delete [] matchedTrack;
 531
 532   //Fill ESDCaloCluster with PID weights
 533   AliEMCALPID *pid = new AliEMCALPID;
 534   //pid->SetPrintInfo(kTRUE);
 535   pid->SetReconstructor(kTRUE);
 536   pid->RunPID(esd);
 537   delete pid;
 538
 539   //Store EMCAL misalignment matrixes
 540   FillMisalMatrixes(esd) ;
 541
 542 }
 543
 544 //==================================================================================
 545 void AliEMCALReconstructor::FillMisalMatrixes(AliESDEvent* esd)const{
 546   //Store EMCAL matrixes in ESD Header
 547
 548   //Check, if matrixes was already stored
 549   for(Int_t sm = 0 ; sm < fGeom->GetNumberOfSuperModules(); sm++){
 550     if(esd->GetEMCALMatrix(sm)!=0)
 551       return ;
 552   }
 553
 554   //Create and store matrixes
 555   if(!gGeoManager){
 556     AliError("Can not store misal. matrixes: no gGeoManager! \n") ;
 557     return ;
 558   }
 559   //Note, that owner of copied marixes will be header
 560   const Int_t bufsize = 255;
 561   char path[bufsize] ;
 562   TGeoHMatrix * m = 0x0;
 563   for(Int_t sm = 0; sm < fGeom->GetNumberOfSuperModules(); sm++){
 564     snprintf(path,bufsize,"/ALIC_1/XEN1_1/SMOD_%d",sm+1) ; //In Geometry modules numbered 1,2,.,5
 565     if(sm >= 10) snprintf(path,bufsize,"/ALIC_1/XEN1_1/SM10_%d",sm-10+1) ;
 566
 567     if (gGeoManager->CheckPath(path)){
 568       gGeoManager->cd(path);
 569       m = gGeoManager->GetCurrentMatrix() ;
 570       //                        printf("================================================= \n");
 571       //                        printf("AliEMCALReconstructor::FixMisalMatrixes(), sm %d, \n",sm);
 572       //                        m->Print("");
 573       esd->SetEMCALMatrix(new TGeoHMatrix(*m),sm) ;
 574       //                        printf("================================================= \n");
 575     }
 576     else{
 577       esd->SetEMCALMatrix(NULL,sm) ;
 578     }
 579   }
 580 }
 581
 582 //__________________________________________________________________________
 583 void AliEMCALReconstructor::ReadDigitsArrayFromTree(TTree *digitsTree) const
 584 {
 585   // Read the digits from the input tree
 586   // See AliEMCALClusterizer::SetInput(TTree *digitsTree);
 587
 588   // Clear previous digits in the list
 589   if(fgDigitsArr){
 590     fgDigitsArr->Clear("C");
 591   }
 592   else{
 593     // It should not happen, but just in case ...
 594     fgDigitsArr = new TClonesArray("AliEMCALDigit",100);
 595   }
 596
 597   // Read the digits from the input tree
 598   TBranch *branch = digitsTree->GetBranch("EMCAL");
 599   if (!branch) {
 600     AliError("can't get the branch with the EMCAL digits !");
 601     return;
 602   }
 603
 604   branch->SetAddress(&fgDigitsArr);
 605   branch->GetEntry(0);
 606 }
 607
 608