EMCAL/AliEMCALReconstructor.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
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   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
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  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18 //_________________________________________________________________________
  19 //--
  20 //-- Yves Schutz (SUBATECH)
  21 // Reconstruction class. Redesigned from the old AliReconstructionner class and
  22 // derived from STEER/AliReconstructor.
  23 //
  24 //-- Aleksei Pavlinov : added staf for EMCAL jet trigger 9Apr 25, 2008)
  25 //                    : fgDigitsArr should read just once at event
  26
  27 // --- ROOT system ---
  28 #include <TList.h>
  29 #include <TClonesArray.h>
  30 #include <TH2.h>
  31 #include "TGeoManager.h"
  32 #include "TGeoMatrix.h"
  33
  34 // --- Standard library ---
  35
  36 // --- AliRoot header files ---
  37 #include "AliEMCALReconstructor.h"
  38
  39 #include "AliCodeTimer.h"
  40 #include "AliCaloCalibPedestal.h"
  41 #include "AliEMCALCalibData.h"
  42 #include "AliESDEvent.h"
  43 #include "AliESDCaloCluster.h"
  44 #include "AliESDCaloCells.h"
  45 #include "AliESDtrack.h"
  46 #include "AliEMCALLoader.h"
  47 #include "AliEMCALRawUtils.h"
  48 #include "AliEMCALDigit.h"
  49 #include "AliEMCALClusterizerv1.h"
  50 #include "AliEMCALClusterizerNxN.h"
  51 #include "AliEMCALRecPoint.h"
  52 #include "AliEMCALPID.h"
  53 #include "AliEMCALTrigger.h"
  54 #include "AliRawReader.h"
  55 #include "AliCDBEntry.h"
  56 #include "AliCDBManager.h"
  57 #include "AliEMCALGeometry.h"
  58 #include "AliEMCAL.h"
  59 #include "AliESDVZERO.h"
  60 #include "AliCDBManager.h"
  61 #include "AliRunLoader.h"
  62 #include "AliRun.h"
  63 #include "AliEMCALTriggerData.h"
  64 #include "AliEMCALTriggerElectronics.h"
  65 #include "AliEMCALTriggerDCSConfigDB.h"
  66 #include "AliEMCALTriggerDCSConfig.h"
  67 #include "AliEMCALTriggerData.h"
  68 #include "AliEMCALTriggerRawDigit.h"
  69 #include "AliEMCALTriggerPatch.h"
  70 #include "AliEMCALTriggerTypes.h"
  71
  72 ClassImp(AliEMCALReconstructor)
  73
  74 const AliEMCALRecParam*     AliEMCALReconstructor::fgkRecParam        = 0;   // EMCAL rec. parameters
  75 AliEMCALRawUtils*           AliEMCALReconstructor::fgRawUtils         = 0;   // EMCAL raw utilities class
  76 AliEMCALClusterizer*        AliEMCALReconstructor::fgClusterizer      = 0;   // EMCAL clusterizer class
  77 TClonesArray*               AliEMCALReconstructor::fgDigitsArr        = 0;   // list of digits, to be used multiple times
  78 TObjArray*                  AliEMCALReconstructor::fgClustersArr      = 0;   // list of clusters, to be used multiple times
  79 AliEMCALTriggerElectronics* AliEMCALReconstructor::fgTriggerProcessor = 0x0;
  80 //____________________________________________________________________________
  81 AliEMCALReconstructor::AliEMCALReconstructor()
  82   : fDebug(kFALSE), fList(0), fGeom(0),fCalibData(0),fPedestalData(0),fTriggerData(0x0)
  83 {
  84   // ctor
  85
  86   fgRawUtils = new AliEMCALRawUtils;
  87
  88   //To make sure we match with the geometry in a simulation file,
  89   //let's try to get it first.  If not, take the default geometry
  90   AliRunLoader *rl = AliRunLoader::Instance();
  91   if (rl->GetAliRun()){
  92     AliEMCAL * emcal = dynamic_cast<AliEMCAL*>(rl->GetAliRun()->GetDetector("EMCAL"));
  93     if(emcal) fGeom = emcal->GetGeometry();
  94   }
  95
  96   if(!fGeom) {
  97     AliInfo(Form("Using default geometry in reconstruction"));
  98     fGeom =  AliEMCALGeometry::GetInstance(AliEMCALGeometry::GetDefaultGeometryName());
  99   }
 100
 101   //Get calibration parameters
 102   if(!fCalibData)
 103     {
 104                 AliCDBEntry *entry = (AliCDBEntry*)
 105                 AliCDBManager::Instance()->Get("EMCAL/Calib/Data");
 106                 if (entry) fCalibData =  (AliEMCALCalibData*) entry->GetObject();
 107     }
 108
 109   if(!fCalibData)
 110                 AliFatal("Calibration parameters not found in CDB!");
 111
 112   //Get calibration parameters
 113   if(!fPedestalData)
 114     {
 115       AliCDBEntry *entry = (AliCDBEntry*)
 116       AliCDBManager::Instance()->Get("EMCAL/Calib/Pedestals");
 117       if (entry) fPedestalData =  (AliCaloCalibPedestal*) entry->GetObject();
 118     }
 119
 120   if(!fPedestalData)
 121     AliFatal("Dead map not found in CDB!");
 122
 123   InitClusterizer();
 124
 125   if(!fGeom) AliFatal(Form("Could not get geometry!"));
 126
 127   AliEMCALTriggerDCSConfigDB* dcsConfigDB = AliEMCALTriggerDCSConfigDB::Instance();
 128
 129   const AliEMCALTriggerDCSConfig* dcsConfig = dcsConfigDB->GetTriggerDCSConfig();
 130
 131   if (!dcsConfig) AliFatal("No Trigger DCS Configuration from OCDB!");
 132   fgTriggerProcessor = new AliEMCALTriggerElectronics( dcsConfig );
 133
 134   fTriggerData = new AliEMCALTriggerData();
 135
 136   //Init temporary list of digits
 137   fgDigitsArr   = new TClonesArray("AliEMCALDigit",1000);
 138   fgClustersArr = new TObjArray(1000);
 139
 140 }
 141
 142 //____________________________________________________________________________
 143 AliEMCALReconstructor::~AliEMCALReconstructor()
 144 {
 145   // dtor
 146
 147   if(fGeom)              delete fGeom;
 148
 149   //No need to delete, recovered from OCDB
 150   //if(fCalibData)         delete fCalibData;
 151   //if(fPedestalData)      delete fPedestalData;
 152
 153   if(fgDigitsArr){
 154     fgDigitsArr->Clear("C");
 155     delete fgDigitsArr;
 156   }
 157
 158   if(fgClustersArr){
 159     fgClustersArr->Clear();
 160     delete fgClustersArr;
 161   }
 162
 163   if(fgRawUtils)         delete fgRawUtils;
 164   if(fgClusterizer)      delete fgClusterizer;
 165   if(fgTriggerProcessor) delete fgTriggerProcessor;
 166
 167   AliCodeTimer::Instance()->Print();
 168 }
 169
 170 // //____________________________________________________________________________
 171 // void AliEMCALReconstructor::Init()
 172 // {
 173 //   // Trigger hists - Oct 24, 2007
 174 //    fList = AliEMCALHistoUtilities::GetTriggersListOfHists(kTRUE);
 175 // }
 176
 177 //____________________________________________________________________________
 178 void AliEMCALReconstructor::InitClusterizer()
 179 {
 180   //Init the clusterizer with geometry and calibration pointers, avoid doing it twice.
 181
 182   AliEMCALRecParam *recParam = NULL;
 183   AliCDBEntry *entry = (AliCDBEntry*)
 184   AliCDBManager::Instance()->Get("EMCAL/Calib/RecoParam");
 185   //Get The reco param for the default event specie
 186   if (entry)
 187     recParam = (AliEMCALRecParam*)((TObjArray *) entry->GetObject())->At(0);
 188
 189   if(!recParam){
 190     AliFatal("RecoParam not found in CDB!");
 191   }
 192   else{
 193     if (recParam->GetClusterizerFlag() == AliEMCALRecParam::kClusterizerv1)
 194     {
 195       fgClusterizer = new AliEMCALClusterizerv1(fGeom, fCalibData,fPedestalData);
 196     }
 197     else
 198     {
 199       fgClusterizer = new AliEMCALClusterizerNxN(fGeom, fCalibData,fPedestalData);
 200     }
 201   }
 202
 203 }
 204
 205 //____________________________________________________________________________
 206 void AliEMCALReconstructor::Reconstruct(TTree* digitsTree, TTree* clustersTree) const
 207 {
 208   // method called by AliReconstruction;
 209   // Only the clusterization is performed,; the rest of the reconstruction is done in FillESD because the track
 210   // segment maker needs access to the AliESD object to retrieve the tracks reconstructed by
 211   // the global tracking.
 212   // Works on the current event.
 213
 214   AliCodeTimerAuto("",0)
 215
 216   ReadDigitsArrayFromTree(digitsTree);
 217
 218   fgClusterizer->InitParameters();
 219   fgClusterizer->SetOutput(clustersTree);
 220
 221   //Skip clusterization of LED events
 222   if (GetRecParam()->GetEventSpecie()!=AliRecoParam::kCalib){
 223
 224                 if(fgDigitsArr && fgDigitsArr->GetEntries()) {
 225
 226                   fgClusterizer->SetInput(digitsTree);
 227
 228                   if(Debug())
 229                           fgClusterizer->Digits2Clusters("deb all") ;
 230                   else
 231                           fgClusterizer->Digits2Clusters("");
 232
 233                   fgClusterizer->Clear();
 234
 235           }//digits array exists and has somethind
 236   }//not a LED event
 237
 238   clustersTree->Fill();
 239 }
 240
 241 //____________________________________________________________________________
 242 void AliEMCALReconstructor::ConvertDigits(AliRawReader* rawReader, TTree* digitsTree) const
 243
 244 {
 245   // Conversion from raw data to
 246   // EMCAL digits.
 247   // Works on a single-event basis
 248
 249   rawReader->Reset() ;
 250
 251   fTriggerData->SetMode(1);
 252
 253   if(fgDigitsArr) fgDigitsArr->Clear("C");
 254
 255   TClonesArray *digitsTrg = new TClonesArray("AliEMCALTriggerRawDigit", 32 * 96);
 256
 257   Int_t bufsize = 32000;
 258   digitsTree->Branch("EMCAL", &fgDigitsArr, bufsize);
 259   digitsTree->Branch("EMTRG", &digitsTrg, bufsize);
 260
 261   //Skip calibration events do the rest
 262   Bool_t doFit = kTRUE;
 263   if ( !(GetRecParam()->FitLEDEvents()) && GetRecParam()->GetEventSpecie()==AliRecoParam::kCalib) doFit = kFALSE;
 264   if (doFit){
 265           //must be done here because, in constructor, option is not yet known
 266           fgRawUtils->SetOption(GetOption());
 267
 268           fgRawUtils->SetRawFormatHighLowGainFactor(GetRecParam()->GetHighLowGainFactor());
 269           fgRawUtils->SetRawFormatOrder(GetRecParam()->GetOrderParameter());
 270           fgRawUtils->SetRawFormatTau(GetRecParam()->GetTau());
 271           fgRawUtils->SetNoiseThreshold(GetRecParam()->GetNoiseThreshold());
 272           fgRawUtils->SetNPedSamples(GetRecParam()->GetNPedSamples());
 273           fgRawUtils->SetRemoveBadChannels(GetRecParam()->GetRemoveBadChannels());
 274           fgRawUtils->SetFittingAlgorithm(GetRecParam()->GetFittingAlgorithm());
 275           fgRawUtils->SetFALTROUsage(GetRecParam()->UseFALTRO());
 276           fgRawUtils->SetTimeMin(GetRecParam()->GetTimeMin());
 277           fgRawUtils->SetTimeMax(GetRecParam()->GetTimeMax());
 278
 279           fgRawUtils->Raw2Digits(rawReader,fgDigitsArr,fPedestalData,digitsTrg,fTriggerData);
 280   }//skip calibration event
 281   else{
 282         AliDebug(1," Calibration Event, skip!");
 283   }
 284
 285   digitsTree->Fill();
 286   digitsTrg->Delete();
 287   delete digitsTrg;
 288
 289 }
 290
 291
 292 //____________________________________________________________________________
 293 void AliEMCALReconstructor::FillESD(TTree* digitsTree, TTree* clustersTree,
 294                                     AliESDEvent* esd) const
 295 {
 296   // Called by AliReconstruct after Reconstruct() and global tracking and vertexing
 297   // and V0
 298   // Works on the current event
 299   // printf(" ## AliEMCALReconstructor::FillESD() is started ### \n ");
 300   //return;
 301
 302   //########################################
 303   // Trigger
 304   //########################################
 305
 306    Int_t v0M[2] = {0, 0};
 307
 308    AliESDVZERO* esdV0 = esd->GetVZEROData();
 309
 310    if (esdV0)
 311    {
 312           for (Int_t i = 0; i < 32; i++)
 313           {
 314                   v0M[0] += (Int_t)esdV0->GetAdcV0C(i);
 315                   v0M[1] += (Int_t)esdV0->GetAdcV0A(i);
 316           }
 317    }
 318    else
 319    {
 320           AliWarning("Cannot retrieve V0 ESD! Run w/ null V0 charges");
 321    }
 322
 323    TClonesArray *trgDigits = new TClonesArray("AliEMCALTriggerRawDigit",1000);
 324
 325    TBranch *branchtrg = digitsTree->GetBranch("EMTRG");
 326
 327    if (!branchtrg)
 328    {
 329           AliError("Can't get the branch with the EMCAL trigger digits!");
 330           return;
 331    }
 332
 333    branchtrg->SetAddress(&trgDigits);
 334    branchtrg->GetEntry(0);
 335
 336    // Note: fgTriggerProcessor reset done at the end of this method
 337    fgTriggerProcessor->Digits2Trigger(trgDigits, v0M, fTriggerData);
 338
 339    // Fill ESD
 340    AliESDCaloTrigger* trgESD = esd->GetCaloTrigger("EMCAL");
 341
 342    if (trgESD)
 343    {
 344           trgESD->Allocate(trgDigits->GetEntriesFast());
 345
 346           for (Int_t i = 0; i < trgDigits->GetEntriesFast(); i++)
 347           {
 348                   AliEMCALTriggerRawDigit* rdig = (AliEMCALTriggerRawDigit*)trgDigits->At(i);
 349
 350                   Int_t px, py;
 351                   if (fGeom->GetPositionInEMCALFromAbsFastORIndex(rdig->GetId(), px, py))
 352                   {
 353                           Int_t a = -1, t = -1, times[10];
 354
 355                           rdig->GetMaximum(a, t);
 356                           rdig->GetL0Times(times);
 357
 358                           trgESD->Add(px, py, a, t, times, rdig->GetNL0Times(), rdig->GetL1TimeSum());
 359                   }
 360           }
 361
 362           trgESD->SetL1Threshold(0, fTriggerData->GetL1GammaThreshold());
 363
 364           trgESD->SetL1Threshold(1, fTriggerData->GetL1JetThreshold()  );
 365
 366           for (Int_t i = 0; i < kTriggerTypeEnd; i++)
 367           {
 368                   for (Int_t j = 0; j < 2; j++)
 369                   {
 370                           TClonesArray* patches = fTriggerData->GetPatches((TriggerType_t)i, j);
 371
 372                           TIter NextPatch(patches);
 373                           while (AliEMCALTriggerPatch* p = (AliEMCALTriggerPatch*)NextPatch())
 374                           {
 375                                   TVector2 pos; p->Position(pos);
 376                                   trgESD->SetTriggerBits((Int_t) pos.X(), (Int_t) pos.Y(), i, j);
 377                           }
 378                   }
 379           }
 380    }
 381
 382    // Resetting
 383    fTriggerData->Reset();
 384
 385   //########################################
 386   //##############Fill CaloCells###############
 387   //########################################
 388   ReadDigitsArrayFromTree(digitsTree);
 389
 390 //   TClonesArray *digits = new TClonesArray("AliEMCALDigit",1000);
 391 //   TBranch *branchdig = digitsTree->GetBranch("EMCAL");
 392 //   if (!branchdig) {
 393 //     AliError("can't get the branch with the EMCAL digits !");
 394 //     return;
 395 //   }
 396 //   branchdig->SetAddress(&digits);
 397 //   digitsTree->GetEvent(0);
 398   Int_t nDigits = fgDigitsArr->GetEntries(), idignew = 0 ;
 399   AliDebug(1,Form("%d digits",nDigits));
 400
 401   AliESDCaloCells &emcCells = *(esd->GetEMCALCells());
 402   emcCells.CreateContainer(nDigits);
 403   emcCells.SetType(AliVCaloCells::kEMCALCell);
 404   Float_t energy = 0;
 405   for (Int_t idig = 0 ; idig < nDigits ; idig++) {
 406     const AliEMCALDigit * dig = (const AliEMCALDigit*)fgDigitsArr->At(idig);
 407     if(dig->GetAmplitude() > 0 ){
 408           energy = fgClusterizer->Calibrate(dig->GetAmplitude(),dig->GetTime(),dig->GetId()); //TimeR or Time?
 409           if(energy > 0){ //Digits tagged as bad (dead, hot, not alive) are set to 0 in calibrate, remove them
 410                   emcCells.SetCell(idignew,dig->GetId(),energy, dig->GetTime());
 411                   idignew++;
 412           }
 413     }
 414   }
 415   emcCells.SetNumberOfCells(idignew);
 416   emcCells.Sort();
 417
 418   //------------------------------------------------------------
 419   //-----------------CLUSTERS-----------------------------
 420   //------------------------------------------------------------
 421   clustersTree->SetBranchStatus("*",0); //disable all branches
 422   clustersTree->SetBranchStatus("EMCALECARP",1); //Enable only the branch we need
 423   if(fgClustersArr) fgClustersArr->Clear();
 424   TBranch *branch = clustersTree->GetBranch("EMCALECARP");
 425   branch->SetAddress(&fgClustersArr);
 426   branch->GetEntry(0);
 427   //clustersTree->GetEvent(0);
 428
 429   Int_t nClusters = fgClustersArr->GetEntries(),  nClustersNew=0;
 430   AliDebug(1,Form("%d clusters",nClusters));
 431
 432   //######################################################
 433   //#######################TRACK MATCHING###############
 434   //######################################################
 435   //Fill list of integers, each one is index of track to which the cluster belongs.
 436
 437   // step 1 - initialize array of matched track indexes
 438   Int_t *matchedTrack = new Int_t[nClusters];
 439   for (Int_t iclus = 0; iclus < nClusters; iclus++)
 440     matchedTrack[iclus] = -1;  // neg. index --> no matched track
 441
 442   // step 2, change the flag for all matched clusters found in tracks
 443   Int_t iemcalMatch = -1;
 444   Int_t endtpc = esd->GetNumberOfTracks();
 445   for (Int_t itrack = 0; itrack < endtpc; itrack++) {
 446     AliESDtrack * track = esd->GetTrack(itrack) ; // retrieve track
 447     iemcalMatch = track->GetEMCALcluster();
 448     if(iemcalMatch >= 0) matchedTrack[iemcalMatch] = itrack;
 449   }
 450
 451   //########################################
 452   //##############Fill CaloClusters#############
 453   //########################################
 454   for (Int_t iClust = 0 ; iClust < nClusters ; iClust++) {
 455     const AliEMCALRecPoint * clust = (const AliEMCALRecPoint*)fgClustersArr->At(iClust);
 456     //if(clust->GetClusterType()== AliVCluster::kEMCALClusterv1) nRP++; else nPC++;
 457     if (Debug()) clust->Print();
 458     // Get information from EMCAL reconstruction points
 459     Float_t xyz[3];
 460     TVector3 gpos;
 461     clust->GetGlobalPosition(gpos);
 462     for (Int_t ixyz=0; ixyz<3; ixyz++)
 463       xyz[ixyz] = gpos[ixyz];
 464     Float_t elipAxis[2];
 465     clust->GetElipsAxis(elipAxis);
 466        //Create digits lists
 467     Int_t cellMult = clust->GetMultiplicity();
 468     //TArrayS digiList(digitMult);
 469     Float_t *amplFloat = clust->GetEnergiesList();
 470     Int_t   *digitInts = clust->GetAbsId();
 471     TArrayS absIdList(cellMult);
 472     TArrayD fracList(cellMult);
 473
 474     Int_t newCellMult = 0;
 475     for (Int_t iCell=0; iCell<cellMult; iCell++) {
 476       if (amplFloat[iCell] > 0) {
 477       absIdList[newCellMult] = (UShort_t)(digitInts[iCell]);
 478       //Calculate Fraction
 479       if(emcCells.GetCellAmplitude(digitInts[iCell])>0 && GetRecParam()->GetUnfold())
 480         fracList[newCellMult] = amplFloat[iCell]/(emcCells.GetCellAmplitude(digitInts[iCell]));//get cell calibration value
 481       else
 482         fracList[newCellMult] = 0;
 483       newCellMult++;
 484       }
 485     }
 486
 487     absIdList.Set(newCellMult);
 488     fracList.Set(newCellMult);
 489
 490     if(newCellMult > 0) { // accept cluster if it has some digit
 491       nClustersNew++;
 492       //Primaries
 493       Int_t  parentMult  = 0;
 494       Int_t *parentList =  clust->GetParents(parentMult);
 495       // fills the ESDCaloCluster
 496       AliESDCaloCluster * ec = new AliESDCaloCluster() ;
 497       ec->SetType(AliVCluster::kEMCALClusterv1);
 498       ec->SetPosition(xyz);
 499       ec->SetE(clust->GetEnergy());
 500
 501       //Distance to the nearest bad crystal
 502       ec->SetDistanceToBadChannel(clust->GetDistanceToBadTower());
 503
 504       ec->SetNCells(newCellMult);
 505       //Change type of list from short to ushort
 506       UShort_t *newAbsIdList  = new UShort_t[newCellMult];
 507       Double_t *newFracList   = new Double_t[newCellMult];
 508       for(Int_t i = 0; i < newCellMult ; i++) {
 509         newAbsIdList[i]=absIdList[i];
 510         newFracList[i] =fracList[i];
 511       }
 512       ec->SetCellsAbsId(newAbsIdList);
 513       ec->SetCellsAmplitudeFraction(newFracList);
 514       ec->SetDispersion(clust->GetDispersion());
 515       ec->SetChi2(-1); //not yet implemented
 516       ec->SetM02(elipAxis[0]*elipAxis[0]) ;
 517       ec->SetM20(elipAxis[1]*elipAxis[1]) ;
 518       ec->SetTOF(clust->GetTime()) ; //time-of-fligh
 519       ec->SetNExMax(clust->GetNExMax());          //number of local maxima
 520       TArrayI arrayTrackMatched(1);// Only one track, temporal solution.
 521       arrayTrackMatched[0]= matchedTrack[iClust];
 522       ec->AddTracksMatched(arrayTrackMatched);
 523
 524       TArrayI arrayParents(parentMult,parentList);
 525       ec->AddLabels(arrayParents);
 526
 527       // add the cluster to the esd object
 528       esd->AddCaloCluster(ec);
 529       delete ec;
 530       delete [] newAbsIdList ;
 531       delete [] newFracList ;
 532    }
 533  } // cycle on clusters
 534
 535  delete [] matchedTrack;
 536
 537  //Fill ESDCaloCluster with PID weights
 538  AliEMCALPID *pid = new AliEMCALPID;
 539  //pid->SetPrintInfo(kTRUE);
 540  pid->SetReconstructor(kTRUE);
 541  pid->RunPID(esd);
 542  delete pid;
 543
 544  //Store EMCAL misalignment matrixes
 545  FillMisalMatrixes(esd) ;
 546
 547 }
 548
 549 //==================================================================================
 550 void AliEMCALReconstructor::FillMisalMatrixes(AliESDEvent* esd)const{
 551         //Store EMCAL matrixes in ESD Header
 552
 553         //Check, if matrixes was already stored
 554         for(Int_t sm = 0 ; sm < fGeom->GetNumberOfSuperModules(); sm++){
 555                 if(esd->GetEMCALMatrix(sm)!=0)
 556                         return ;
 557         }
 558
 559         //Create and store matrixes
 560         if(!gGeoManager){
 561                 AliError("Can not store misal. matrixes: no gGeoManager! \n") ;
 562                 return ;
 563         }
 564         //Note, that owner of copied marixes will be header
 565   const Int_t bufsize = 255;
 566         char path[bufsize] ;
 567         TGeoHMatrix * m = 0x0;
 568         for(Int_t sm = 0; sm < fGeom->GetNumberOfSuperModules(); sm++){
 569                 snprintf(path,bufsize,"/ALIC_1/XEN1_1/SMOD_%d",sm+1) ; //In Geometry modules numbered 1,2,.,5
 570                 if(sm >= 10) snprintf(path,bufsize,"/ALIC_1/XEN1_1/SM10_%d",sm-10+1) ;
 571
 572                 if (gGeoManager->CheckPath(path)){
 573                         gGeoManager->cd(path);
 574                         m = gGeoManager->GetCurrentMatrix() ;
 575 //                      printf("================================================= \n");
 576 //                      printf("AliEMCALReconstructor::FixMisalMatrixes(), sm %d, \n",sm);
 577 //                      m->Print("");
 578                         esd->SetEMCALMatrix(new TGeoHMatrix(*m),sm) ;
 579 //                      printf("================================================= \n");
 580                 }
 581                 else{
 582                         esd->SetEMCALMatrix(NULL,sm) ;
 583                 }
 584         }
 585 }
 586
 587
 588
 589 //__________________________________________________________________________
 590 void AliEMCALReconstructor::ReadDigitsArrayFromTree(TTree *digitsTree) const
 591 {
 592   // See AliEMCALClusterizer::SetInput(TTree *digitsTree);
 593   if(fgDigitsArr) {
 594     // Clear previous digits
 595     fgDigitsArr->Clear("C");
 596     //delete fgDigitsArr;
 597   }
 598   // Read the digits from the input tree
 599   TBranch *branch = digitsTree->GetBranch("EMCAL");
 600   if (!branch) {
 601     AliError("can't get the branch with the EMCAL digits !");
 602     return;
 603   }
 604   fgDigitsArr = new TClonesArray("AliEMCALDigit",100);
 605   branch->SetAddress(&fgDigitsArr);
 606   branch->GetEntry(0);
 607 }
 608
 609