FMD/AliFMDPreprocessor.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 2004, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15 /* $Id$ */
  16 /** @file    AliFMDPreprocessor.cxx
  17     @author  Hans Hjersing Dalsgaard <canute@nbi.dk>
  18     @date    Mon Mar 27 12:39:09 2006
  19     @brief   Shuttle "preprocessor" for the FMD
  20 */
  21 //___________________________________________________________________
  22 //
  23 // The class processes data points from DCS (via Amanada), and DAQ DA
  24 // files (via FXS) to make calibration data for the FMD.
  25 //
  26 // Data points:
  27 //    *  Nothing yet.
  28 //
  29 // DAQ FXS file:
  30 //    * pedestals - a (ASCII) Comma Separated Values files with the
  31 //                  fields
  32 //                       rcu     DDL number
  33 //                       board   FEC board number
  34 //                       chip    ALTRO chip number on FEC
  35 //                       channel ALTRO channel number
  36 //                       strip   VA1 strip number
  37 //                       sample  Sample number
  38 //                       ped     Mean of ADC spectra
  39 //                       noise   Spread of ADC spectra
  40 //                       mu      Mean of Gaussian fit to ADC spectra
  41 //                       sigma   Variance of Gaussian fit to ADC spectra
  42 //                       chi2    Chi^2 per degrees of freedom of fit
  43 //    * Gains     - a (ASCII) Comma Separated Values files with the
  44 //                  fields
  45 //                       rcu     DDL number
  46 //                       board   FEC board number
  47 //                       chip    ALTRO chip number on FEC
  48 //                       channel ALTRO channel number
  49 //                       strip   VA1 strip number
  50 //                       gain    Slope of gain
  51 //                       error   Error on gain
  52 //                       chi2    Chi^2 per degrees of freedom of fit
  53 //
  54 // See also
  55 //
  56 //   http://aliceinfo.cern.ch/Offline/Activities/Shuttle.html
  57 //
  58 // Latest changes by Christian Holm Christensen
  59 //
  60
  61  #include <iostream>
  62
  63 #include <fstream>
  64 #include "AliFMDPreprocessor.h"
  65 #include "AliFMDCalibPedestal.h"
  66 #include "AliFMDCalibGain.h"
  67 #include "AliFMDCalibStripRange.h"
  68 #include "AliFMDCalibSampleRate.h"
  69 #include "AliFMDParameters.h"
  70 #include "AliCDBMetaData.h"
  71 #include "AliCDBManager.h"
  72 // #include "AliDCSValue.h"
  73 #include "AliLog.h"
  74 #include <TTimeStamp.h>
  75 // #include <TFile.h>
  76 #include <TObjString.h>
  77 #include <TString.h>
  78 #include <TNamed.h>
  79
  80
  81 ClassImp(AliFMDPreprocessor)
  82 #if 0 // Do not remove - here to make Emacs happy
  83 ;
  84 #endif
  85
  86
  87 //____________________________________________________
  88 AliFMDPreprocessor::AliFMDPreprocessor(AliShuttleInterface* shuttle)
  89   : AliPreprocessor("FMD", shuttle)
  90 {
  91   AddRunType("PHYSICS");
  92   AddRunType("STANDALONE");
  93   AddRunType("PEDESTAL");
  94   AddRunType("GAIN");
  95 }
  96
  97
  98 //____________________________________________________
  99 Bool_t AliFMDPreprocessor::GetAndCheckFileSources(TList*&     list,
 100                                                   Int_t       system,
 101                                                   const char* id)
 102 {
 103   // Convinience function
 104   // Parameters:
 105   //   list     On return, list of files.
 106   //   system   Alice system (DAQ, DCS, ...)
 107   //   id       File id
 108   // Return:
 109   //   kTRUE on success.
 110   list = GetFileSources(system, id);
 111   if (!list) {
 112     TString sys;
 113     switch (system) {
 114     case kDAQ: sys = "DAQ";     break;
 115     case kDCS: sys = "DCS";     break;
 116     default:   sys = "unknown"; break;
 117     }
 118     Log(Form("Failed to get file sources for %s/%s", sys.Data(), system));
 119     return kFALSE;
 120   }
 121   return kTRUE;
 122 }
 123
 124 //____________________________________________________
 125 AliCDBEntry*
 126 AliFMDPreprocessor::GetFromCDB(const char* second, const char* third)
 127 {
 128   return GetFromOCDB(second, third);
 129 }
 130
 131
 132 //____________________________________________________
 133 UInt_t AliFMDPreprocessor::Process(TMap* /* dcsAliasMap */)
 134 {
 135   // Main member function.
 136   // Parameters:
 137   //    dcsAliassMap   Map of DCS data point aliases.
 138   // Return
 139   //    0 on success, >0 otherwise
 140   Bool_t resultPed   = kTRUE;
 141   Bool_t resultGain  = kTRUE;
 142   Bool_t resultRange = kTRUE;
 143   Bool_t resultRate  = kTRUE;
 144   Bool_t resultZero  = kTRUE;
 145   Bool_t infoCalib   = kTRUE;
 146   // Do we need this ?
 147   // if(!dcsAliasMap) return 1;
 148   //
 149   // Invoking the cdb manager and the FMD parameters class
 150   // AliCDBManager* cdb   = AliCDBManager::Instance();
 151   // cdb->SetDefaultStorage("local://$ALICE_ROOT/OCDB");
 152   // cdb->SetRun(0);
 153   AliFMDParameters* pars = AliFMDParameters::Instance();
 154   pars->Init(this, false, AliFMDParameters::kAltroMap);
 155   // This is if the SOR contains Fee parameters, and we run a DA to
 156   // extract these parameters.   The same code could work if we get
 157   // the information from DCS via the FXS
 158   TList* files = 0;
 159   AliFMDCalibSampleRate*      calibRate  = 0;
 160   AliFMDCalibStripRange*      calibRange = 0;
 161   AliFMDCalibZeroSuppression* calibZero  = 0;
 162
 163   if (GetAndCheckFileSources(files, kDAQ,pars->GetConditionsShuttleID()))
 164     infoCalib = GetInfoCalibration(files, calibRate, calibRange, calibZero);
 165
 166   resultRate  = (!calibRate  ? kFALSE : kTRUE);
 167   resultRange = (!calibRange ? kFALSE : kTRUE);
 168   resultZero  = (!calibZero  ? kFALSE : kTRUE);
 169
 170
 171   // Get the run type
 172   TString runType(GetRunType());
 173
 174   //Creating calibration objects
 175   AliFMDCalibPedestal* calibPed  = 0;
 176   AliFMDCalibGain*     calibGain = 0;
 177   if (runType.Contains("PEDESTAL", TString::kIgnoreCase)) {
 178     if (GetAndCheckFileSources(files, kDAQ, pars->GetPedestalShuttleID())) {
 179       if(files->GetSize())
 180         calibPed = GetPedestalCalibration(files);
 181     }
 182     resultPed = (calibPed ? kTRUE : kFALSE);
 183   }
 184   if (runType.Contains("GAIN", TString::kIgnoreCase)) {
 185     if (GetAndCheckFileSources(files, kDAQ, pars->GetGainShuttleID())) {
 186       if(files->GetSize())
 187         calibGain = GetGainCalibration(files);
 188     }
 189     resultGain = (calibGain ? kTRUE : kFALSE);
 190   }
 191
 192   //Storing Calibration objects
 193   AliCDBMetaData metaData;
 194   metaData.SetBeamPeriod(0);
 195   metaData.SetResponsible("Hans H. Dalsgaard");
 196   metaData.SetComment("Preprocessor stores pedestals and gains for the FMD.");
 197
 198   if(calibPed)  {
 199     resultPed  = Store("Calib","Pedestal", calibPed, &metaData, 0, kTRUE);
 200     delete calibPed;
 201   }
 202   if(calibGain) {
 203     resultGain = Store("Calib","PulseGain", calibGain, &metaData, 0, kTRUE);
 204     delete calibGain;
 205   }
 206   if(calibRange) {
 207     resultRange = Store("Calib","StripRange", calibRange, &metaData, 0, kTRUE);
 208     delete calibRange;
 209   }
 210   if(calibRate) {
 211     resultRate = Store("Calib","SampleRate", calibRate, &metaData, 0, kTRUE);
 212     delete calibRate;
 213   }
 214   if(calibZero) {
 215     resultZero = Store("Calib","ZeroSuppression", calibZero,&metaData,0,kTRUE);
 216     delete calibZero;
 217   }
 218
 219   Bool_t success = (resultPed && resultGain  && resultRange &&
 220                     resultRate  && resultZero && infoCalib);
 221
 222   Log(Form("FMD preprocessor was %s", (success ? "successful" : "failed")));
 223   return (success ? 0 : 1);
 224 }
 225
 226 //____________________________________________________________________
 227 Bool_t
 228 AliFMDPreprocessor::GetInfoCalibration(TList* files,
 229                                        AliFMDCalibSampleRate*&      s,
 230                                        AliFMDCalibStripRange*&      r,
 231                                        AliFMDCalibZeroSuppression*& z)
 232 {
 233   // Get info calibrations.
 234   // Parameters:
 235   //     files List of files.
 236   //     s     On return, newly allocated object
 237   //     r     On return, newly allocated object
 238   //     z     On return, newly allocated object
 239   // Return:
 240   //     kTRUE on success
 241   if (!files) return kFALSE; // Should really be false
 242   if (files->GetEntries() <= 0) return kFALSE;
 243
 244   s = new AliFMDCalibSampleRate();
 245   r = new AliFMDCalibStripRange();
 246   z = new AliFMDCalibZeroSuppression();
 247
 248   AliFMDParameters*    pars     = AliFMDParameters::Instance();
 249   TIter                iter(files);
 250   TObjString*          fileSource;
 251
 252   while((fileSource = dynamic_cast<TObjString*>(iter.Next()))) {
 253     const Char_t* filename = GetFile(kDAQ, pars->GetConditionsShuttleID(), fileSource->GetName());
 254     std::ifstream in(filename);
 255     if(!in) {
 256       Log(Form("File %s not found!", filename));
 257       continue;
 258     }
 259     s->ReadFromFile(in);
 260     r->ReadFromFile(in);
 261   }
 262   return kTRUE;
 263 }
 264
 265
 266 //____________________________________________________________________
 267 AliFMDCalibPedestal*
 268 AliFMDPreprocessor::GetPedestalCalibration(TList* pedFiles)
 269 {
 270   // Read DAQ DA produced CSV files of pedestals, and return a
 271   // calibration object.
 272   // Parameters:
 273   //   pedFiles     List of pedestal files
 274   // Return
 275   //   A pointer to a newly allocated AliFMDCalibPedestal object, or
 276   //   null in case of errors.
 277   if(!pedFiles) return 0;
 278
 279   AliFMDCalibPedestal* calibPed = new AliFMDCalibPedestal();
 280   AliFMDParameters*    pars     = AliFMDParameters::Instance();
 281   TIter                iter(pedFiles);
 282   TObjString*          fileSource;
 283
 284   while((fileSource = dynamic_cast<TObjString*>(iter.Next()))) {
 285     const Char_t* filename = GetFile(kDAQ, pars->GetPedestalShuttleID(), fileSource->GetName());
 286     std::ifstream in(filename);
 287     if(!in) {
 288       Log(Form("File %s not found!", filename));
 289       continue;
 290     }
 291
 292     // Get header (how long is it ?)
 293     TString header;
 294     header.ReadLine(in);
 295     header.ToLower();
 296     if(!header.Contains(pars->GetPedestalShuttleID())) {
 297       Log("File header is not from pedestal!");
 298       continue;
 299     }
 300     Log("File contains data from pedestals");
 301
 302     // Read columns line
 303     int lineno = 2;
 304     header.ReadLine(in);
 305
 306     // Loop until EOF
 307     while(in.peek()!=EOF) {
 308       if(in.bad()) {
 309         Log(Form("Bad read at line %d in %s", lineno, filename));
 310         break;
 311       }
 312       UShort_t det, sec, strip;
 313       Char_t ring;
 314       Float_t ped, noise, mu, sigma, chi2ndf;
 315       Char_t c[8];
 316
 317       in >> det      >> c[0]
 318          >> ring     >> c[1]
 319          >> sec      >> c[2]
 320          >> strip    >> c[3]
 321          >> ped      >> c[4]
 322          >> noise    >> c[5]
 323          >> mu       >> c[6]
 324          >> sigma    >> c[7]
 325          >> chi2ndf;
 326       lineno++;
 327
 328       // Ignore trailing garbage
 329       // if (strip > 127) continue;
 330
 331       //Setting DDL to comply with the FMD in DAQ
 332       // UInt_t FmdDDLBase = 3072;
 333       // ddl = ddl - FmdDDLBase;
 334       //Setting the pedestals via the hardware address
 335
 336
 337       // pars->Hardware2Detector(ddl,board,chip,channel,det,ring,sec,str);
 338       // strip += str;
 339
 340       calibPed->Set(det,ring,sec,strip,ped,noise);
 341
 342     }
 343   }
 344   return calibPed;
 345 }
 346
 347 //____________________________________________________________________
 348 AliFMDCalibGain*
 349 AliFMDPreprocessor::GetGainCalibration(TList* gainFiles)
 350 {
 351   // Read DAQ DA produced CSV files of pedestals, and return a
 352   // calibration object.
 353   // Parameters:
 354   //   pedFiles     List of pedestal files
 355   // Return
 356   //   A pointer to a newly allocated AliFMDCalibPedestal object, or
 357   //   null in case of errors.
 358   if(!gainFiles) return 0;
 359
 360   AliFMDCalibGain*  calibGain  = new AliFMDCalibGain();
 361   AliFMDParameters* pars       = AliFMDParameters::Instance();
 362   TIter             iter(gainFiles);
 363   TObjString*       fileSource;
 364   while((fileSource = dynamic_cast<TObjString *>(iter.Next()))) {
 365     const Char_t* filename = GetFile(kDAQ, pars->GetGainShuttleID(), fileSource->GetName());
 366     std::ifstream in(filename);
 367     if(!in) {
 368       Log(Form("File %s not found!", filename));
 369       continue;
 370     }
 371
 372     //Get header (how long is it ?)
 373     TString header;
 374     header.ReadLine(in);
 375     header.ToLower();
 376     if(!header.Contains(pars->GetGainShuttleID())) {
 377       Log("File header is not from gain!");
 378       continue;
 379     }
 380     Log("File contains data from pulse gain");
 381
 382     // Read column headers
 383     header.ReadLine(in);
 384
 385     int lineno  = 2;
 386     // Read until EOF
 387     while(in.peek()!=EOF) {
 388       if(in.bad()) {
 389         Log(Form("Bad read at line %d in %s", lineno, filename));
 390         break;
 391       }
 392       UShort_t det, sec, strip;
 393       Char_t ring;
 394
 395       Float_t gain,error,  chi2ndf;
 396       Char_t c[6];
 397
 398       in >> det      >> c[0]
 399          >> ring     >> c[1]
 400          >> sec      >> c[2]
 401          >> strip    >> c[3]
 402          >> gain     >> c[4]
 403          >> error    >> c[5]
 404          >> chi2ndf;
 405       lineno++;
 406       // Ignore trailing garbage
 407       //if(strip > 127) continue;
 408
 409       //Setting DDL to comply with the FMD in DAQ
 410       // UInt_t FmdDDLBase = 3072;
 411       // ddl = ddl - FmdDDLBase;
 412       //Setting the pedestals via the hardware address
 413       //   pars->Hardware2Detector(ddl,board,chip,channel,det,ring,sec,str);
 414
 415       // strip += str;
 416       calibGain->Set(det,ring,sec,strip,gain);
 417     }
 418   }
 419   return calibGain;
 420 }
 421
 422 //____________________________________________________________________
 423 //
 424 // EOF
 425 //