next50 trigger mask in AliHLTGlobalEsdConverterComponent
[u/mrichter/AliRoot.git] / HLT / global / AliHLTGlobalEsdConverterComponent.cxx
1 // $Id$
2
3 //**************************************************************************
4 //* This file is property of and copyright by the ALICE HLT Project        * 
5 //* ALICE Experiment at CERN, All rights reserved.                         *
6 //*                                                                        *
7 //* Primary Authors: Matthias Richter <Matthias.Richter@ift.uib.no>        *
8 //*                  for The ALICE HLT Project.                            *
9 //*                                                                        *
10 //* Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
11 //* documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
12 //* without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
13 //* copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
14 //* appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
15 //* about the suitability of this software for any purpose. It is          *
16 //* provided "as is" without express or implied warranty.                  *
17 //**************************************************************************
18
19 //  @file   AliHLTGlobalEsdConverterComponent.cxx
20 //  @author Matthias Richter
21 //  @date   
22 //  @brief  Global ESD converter component.
23 // 
24
25 // see header file for class documentation
26 // or
27 // refer to README to build package
28 // or
29 // visit http://web.ift.uib.no/~kjeks/doc/alice-hlt
30
31 #include <cassert>
32 #include "AliHLTGlobalEsdConverterComponent.h"
33 #include "AliHLTGlobalBarrelTrack.h"
34 #include "AliHLTExternalTrackParam.h"
35 #include "AliHLTTrackMCLabel.h"
36 #include "AliHLTCTPData.h"
37 #include "AliHLTErrorGuard.h"
38 #include "AliESDEvent.h"
39 #include "AliESDtrack.h"
40 #include "AliESDMuonTrack.h"
41 #include "AliESDMuonCluster.h"
42 #include "AliCDBEntry.h"
43 #include "AliCDBManager.h"
44 #include "AliPID.h"
45 #include "TTree.h"
46 #include "TList.h"
47 #include "TClonesArray.h"
48 #include "AliHLTESDCaloClusterMaker.h"
49 #include "AliHLTCaloClusterDataStruct.h"
50 #include "AliHLTCaloClusterReader.h"
51 #include "AliESDCaloCluster.h"
52 #include "AliESDVZERO.h"
53 #include "AliHLTGlobalVertexerComponent.h"
54 #include "AliHLTVertexFinderBase.h"
55
56 /** ROOT macro for the implementation of ROOT specific class methods */
57 ClassImp(AliHLTGlobalEsdConverterComponent)
58
59 AliHLTGlobalEsdConverterComponent::AliHLTGlobalEsdConverterComponent()
60   : AliHLTProcessor()
61   , fWriteTree(0)
62   , fVerbosity(0)
63   , fESD(NULL)
64   , fSolenoidBz(-5.00668)
65   , fBenchmark("EsdConverter")
66 {
67   // see header file for class documentation
68   // or
69   // refer to README to build package
70   // or
71   // visit http://web.ift.uib.no/~kjeks/doc/alice-hlt
72 }
73
74 AliHLTGlobalEsdConverterComponent::~AliHLTGlobalEsdConverterComponent()
75 {
76   // see header file for class documentation
77   if (fESD) delete fESD;
78   fESD=NULL;
79 }
80
81 int AliHLTGlobalEsdConverterComponent::Configure(const char* arguments)
82 {
83   // see header file for class documentation
84   int iResult=0;
85   if (!arguments) return iResult;
86
87   TString allArgs=arguments;
88   TString argument;
89   int bMissingParam=0;
90
91   TObjArray* pTokens=allArgs.Tokenize(" ");
92   if (pTokens) {
93     for (int i=0; i<pTokens->GetEntries() && iResult>=0; i++) {
94       argument=((TObjString*)pTokens->At(i))->String(); 
95       if (argument.IsNull()) continue;
96       
97       if (argument.CompareTo("-solenoidBz")==0) {
98         if ((bMissingParam=(++i>=pTokens->GetEntries()))) break;
99         HLTWarning("argument -solenoidBz is deprecated, magnetic field set up globally (%f)", GetBz());
100         continue;
101       } else {
102         HLTError("unknown argument %s", argument.Data());
103         iResult=-EINVAL;
104         break;
105       }
106     }
107     delete pTokens;
108   }
109   if (bMissingParam) {
110     HLTError("missing parameter for argument %s", argument.Data());
111     iResult=-EINVAL;
112   }
113
114   return iResult;
115 }
116
117 int AliHLTGlobalEsdConverterComponent::Reconfigure(const char* cdbEntry, const char* chainId)
118 {
119   // see header file for class documentation
120   int iResult=0;
121   const char* path=NULL;
122   const char* defaultNotify="";
123   if (cdbEntry) {
124     path=cdbEntry;
125     defaultNotify=" (default)";
126   }
127   if (path) {
128     HLTInfo("reconfigure from entry %s%s, chain id %s", path, defaultNotify,(chainId!=NULL && chainId[0]!=0)?chainId:"<none>");
129     AliCDBEntry *pEntry = AliCDBManager::Instance()->Get(path/*,GetRunNo()*/);
130     if (pEntry) {
131       TObjString* pString=dynamic_cast<TObjString*>(pEntry->GetObject());
132       if (pString) {
133         HLTInfo("received configuration object string: \'%s\'", pString->String().Data());
134         iResult=Configure(pString->String().Data());
135       } else {
136         HLTError("configuration object \"%s\" has wrong type, required TObjString", path);
137       }
138     } else {
139       HLTError("can not fetch object \"%s\" from CDB", path);
140     }
141   }
142   
143   return iResult;
144 }
145
146 void AliHLTGlobalEsdConverterComponent::GetInputDataTypes(AliHLTComponentDataTypeList& list)
147 {
148   // see header file for class documentation
149   list.push_back(kAliHLTDataTypeTrack);
150   list.push_back(kAliHLTDataTypeTrackMC);
151   list.push_back(kAliHLTDataTypeCaloCluster);
152   list.push_back(kAliHLTDataTypedEdx );
153   list.push_back(kAliHLTDataTypeESDVertex );
154   list.push_back(kAliHLTDataTypeESDObject);
155   list.push_back(kAliHLTDataTypeTObject);
156   list.push_back(kAliHLTDataTypeGlobalVertexer);
157   list.push_back(kAliHLTDataTypeV0Finder); // array of track ids for V0s
158   list.push_back(kAliHLTDataTypeKFVertex); // KFVertex object from vertexer
159   list.push_back(kAliHLTDataTypePrimaryFinder); // array of track ids for prim vertex
160   list.push_back(kAliHLTDataTypeESDContent);
161 }
162
163 AliHLTComponentDataType AliHLTGlobalEsdConverterComponent::GetOutputDataType()
164 {
165   // see header file for class documentation
166   return kAliHLTDataTypeESDObject|kAliHLTDataOriginOut;
167 }
168
169 void AliHLTGlobalEsdConverterComponent::GetOutputDataSize(unsigned long& constBase, double& inputMultiplier)
170 {
171   // see header file for class documentation
172   constBase=2000000;
173   inputMultiplier=10.0;
174 }
175
176 int AliHLTGlobalEsdConverterComponent::DoInit(int argc, const char** argv)
177 {
178   // see header file for class documentation
179   int iResult=0;
180   TString argument="";
181   int bMissingParam=0;
182
183   // default list of skiped ESD objects
184   TString skipObjects=
185     // "AliESDRun,"
186     // "AliESDHeader,"
187     // "AliESDZDC,"
188     "AliESDFMD,"
189     // "AliESDVZERO,"
190     // "AliESDTZERO,"
191     // "TPCVertex,"
192     // "SPDVertex,"
193     // "PrimaryVertex,"
194     // "AliMultiplicity,"
195     // "PHOSTrigger,"
196     // "EMCALTrigger,"
197     // "SPDPileupVertices,"
198     // "TrkPileupVertices,"
199     "Cascades,"
200     "Kinks,"
201     "AliRawDataErrorLogs,"
202     "AliESDACORDE";
203
204   iResult=Reconfigure(NULL, NULL);
205   TString allArgs = "";
206   for ( int i = 0; i < argc; i++ ) {
207     if ( !allArgs.IsNull() ) allArgs += " ";
208     allArgs += argv[i];
209   }
210
211   TObjArray* pTokens=allArgs.Tokenize(" ");
212   if (pTokens) {
213     for (int i=0; i<pTokens->GetEntries() && iResult>=0; i++) {
214       argument=((TObjString*)pTokens->At(i))->String(); 
215       if (argument.IsNull()) continue;
216
217       // -notree
218       if (argument.CompareTo("-notree")==0) {
219         fWriteTree=0;
220         
221         // -tree
222       } else if (argument.CompareTo("-tree")==0) {
223         fWriteTree=1;
224       } else if (argument.CompareTo("-solenoidBz")==0) {
225         if ((bMissingParam=(++i>=pTokens->GetEntries()))) break;
226         HLTInfo("Magnetic Field set to: %s", ((TObjString*)pTokens->At(i))->String().Data());
227         HLTWarning("argument '-solenoidBz' is deprecated, solenoid field initiaized from CDB settings");
228         continue;
229       } else if (argument.Contains("-skipobject=")) {
230         argument.ReplaceAll("-skipobject=", "");
231         skipObjects=argument;
232       } else {
233         HLTError("unknown argument %s", argument.Data());
234         iResult=-EINVAL;
235         break;
236       }
237     }
238   }
239   if (bMissingParam) {
240     HLTError("missing parameter for argument %s", argument.Data());
241     iResult=-EINVAL;
242   }
243
244   fSolenoidBz=GetBz();
245
246   if (iResult>=0) {
247     fESD = new AliESDEvent;
248     if (fESD) {
249       fESD->CreateStdContent();
250
251       // remove some of the objects which are not needed
252       if (fESD->GetList() && !skipObjects.IsNull()) {
253         pTokens=skipObjects.Tokenize(",");
254         if (pTokens) {
255           const char* id=NULL;
256           TIter next(pTokens);
257           TObject* pObject=NULL;
258           while ((pObject=next())!=NULL) {
259             id=((TObjString*)pObject)->String().Data();
260             TObject* pObj=fESD->GetList()->FindObject(id);
261             if (pObj) {
262               HLTDebug("removing object %s", id);
263               fESD->GetList()->Remove(pObj);
264               delete pObj;
265             } else {
266               HLTWarning("failed to remove object '%s' from ESD", id);
267             }
268           }
269           fESD->GetStdContent();
270           delete pTokens;
271         }
272       }
273     } else {
274       iResult=-ENOMEM;
275     }
276
277     SetupCTPData();
278   }
279
280   fBenchmark.SetTimer(0,"total");
281
282   return iResult;
283 }
284
285 int AliHLTGlobalEsdConverterComponent::DoDeinit()
286 {
287   // see header file for class documentation
288   if (fESD) delete fESD;
289   fESD=NULL;
290
291   return 0;
292 }
293
294 int AliHLTGlobalEsdConverterComponent::DoEvent(const AliHLTComponentEventData& /*evtData*/, 
295                                                AliHLTComponentTriggerData& trigData)
296 {
297   // see header file for class documentation
298   int iResult=0;
299   if (!fESD) return -ENODEV;
300
301   if (IsDataEvent()) fBenchmark.StartNewEvent();
302   fBenchmark.Start(0);
303
304   AliESDEvent* pESD = fESD;
305
306   pESD->Reset(); 
307   pESD->SetMagneticField(fSolenoidBz);
308   pESD->SetRunNumber(GetRunNo());
309   pESD->SetPeriodNumber(GetPeriodNumber());
310   pESD->SetOrbitNumber(GetOrbitNumber());
311   pESD->SetBunchCrossNumber(GetBunchCrossNumber());
312   pESD->SetTimeStamp(GetTimeStamp());
313
314   const AliHLTCTPData* pCTPData=CTPData();
315   if (pCTPData) {
316     AliHLTTriggerMask_t mask=pCTPData->ActiveTriggers(trigData);
317     for (int index=0; index<gkNCTPTriggerClasses; index++) {
318       if ((mask&(AliHLTTriggerMask_t(0x1)<<index)) == 0) continue;
319       pESD->SetTriggerClass(pCTPData->Name(index), index);
320     }
321     //first 50 triggers
322     AliHLTTriggerMask_t mask50;
323     mask50.set(); // set all bits
324     mask50 >>= 50; // shift 50 right
325     pESD->SetTriggerMask((mask&mask50).to_ulong());
326     //next 50
327     pESD->SetTriggerMaskNext50((mask>>50).to_ulong());
328   }
329
330   TTree* pTree = NULL;
331   if (fWriteTree)
332     pTree = new TTree("esdTree", "Tree with HLT ESD objects");
333  
334   if (pTree) {
335     pTree->SetDirectory(0);
336   }
337
338   if ((iResult=ProcessBlocks(pTree, pESD))>=0) {
339     // TODO: set the specification correctly
340     if (pTree) {
341       // the esd structure is written to the user info and is
342       // needed in te ReadFromTree method to read all objects correctly
343       pTree->GetUserInfo()->Add(pESD);
344       pESD->WriteToTree(pTree);
345       iResult=PushBack(pTree, kAliHLTDataTypeESDTree|kAliHLTDataOriginOut, 0);
346     } else {
347       iResult=PushBack(pESD, kAliHLTDataTypeESDObject|kAliHLTDataOriginOut, 0);
348     }
349     fBenchmark.AddOutput(GetLastObjectSize());
350   }
351   if (pTree) {
352     // clear user info list to prevent objects from being deleted
353     pTree->GetUserInfo()->Clear();
354     delete pTree;
355   }
356
357   fBenchmark.Stop(0);
358   HLTInfo( fBenchmark.GetStatistics() );
359
360   return iResult;
361 }
362
363 int AliHLTGlobalEsdConverterComponent::ProcessBlocks(TTree* pTree, AliESDEvent* pESD)
364 {
365   // see header file for class documentation
366
367   int iResult=0;
368   int iAddedDataBlocks=0;
369
370   // check if there is an ESD block in the input and copy its content first to the
371   // ESD
372   const TObject* pEsdObj = GetFirstInputObject(kAliHLTDataTypeESDObject, "AliESDEvent");
373   AliESDEvent* pInputESD=NULL;
374   if (pEsdObj) pInputESD=dynamic_cast<AliESDEvent*>(const_cast<TObject*>(pEsdObj));
375   if (pInputESD) {
376     pInputESD->GetStdContent();
377     *pESD=*pInputESD;
378   }
379   if (GetNextInputObject()!=NULL) {
380     HLTWarning("handling of multiple ESD input objects not implemented, skipping input");
381   }
382
383   // Barrel tracking
384   // tracks are based on the TPC tracks, and only updated from the ITS information
385   // Sequence:
386   // 1) extract MC information for TPC and ITS from specific data blocks and store in
387   //    intermediate vector arrays
388   // 2) extract TPC tracks, update with MC labels if available, the track parameters
389   //    are estimated at the first cluster position
390   // 2.1) propagate to last cluster position and update kTPCout, sets also outer param (fOp)
391   // 2.2) update kTPCin, sets also inner param (fIp) and TPC inner param (fTPCInner)
392   // 2.3) update kTPCrefit using the same parameters at the first cluster position
393   //      HLT has strictly spoking no refit, but we want the flag to be set
394   //      can be changed to be done after all the individual barrel detector parameters
395   //      have been updated by looping over the tracks again
396   // 3) extract ITS tracks, the tracks are actually TPC tracks updated from the ITS
397   //    tracking information
398   // 3.1) TODO 2010-07-12: handle ITS standalone tracks by updating kITSout before kITSin
399   // 3.2) update with kITSin
400   //    TODO 2010-07-12 find out if the kITSrefit has to be set as well
401   // 4) extract TRD tracks and add to ESD
402   //    TODO 2010-07-12 at the moment there is no matching or merging of TPC and TRD tracks
403   // 5) Add Trigger Detectors 
404   //    VZERO, ZDC
405
406   // 1) first read MC information (if present)
407   std::map<int,int> mcLabelsTPC;
408   std::map<int,int> mcLabelsITS;
409
410   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeTrackMC|kAliHLTDataOriginTPC);
411        pBlock!=NULL; pBlock=GetNextInputBlock()) {
412
413     fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);
414
415     AliHLTTrackMCData* dataPtr = reinterpret_cast<AliHLTTrackMCData*>( pBlock->fPtr );
416     if (sizeof(AliHLTTrackMCData)+dataPtr->fCount*sizeof(AliHLTTrackMCLabel)==pBlock->fSize) {
417       for( unsigned int il=0; il<dataPtr->fCount; il++ ){
418         AliHLTTrackMCLabel &lab = dataPtr->fLabels[il];
419         mcLabelsTPC[lab.fTrackID] = lab.fMCLabel;
420       }
421     } else {
422       HLTWarning("data mismatch in block %s (0x%08x): count %d, size %d -> ignoring track MC information", 
423                  DataType2Text(pBlock->fDataType).c_str(), pBlock->fSpecification, 
424                  dataPtr->fCount, pBlock->fSize);
425     }
426   }
427  
428   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeTrackMC|kAliHLTDataOriginITS);
429        pBlock!=NULL; pBlock=GetNextInputBlock()) {
430
431     fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);
432
433     AliHLTTrackMCData* dataPtr = reinterpret_cast<AliHLTTrackMCData*>( pBlock->fPtr );
434     if (sizeof(AliHLTTrackMCData)+dataPtr->fCount*sizeof(AliHLTTrackMCLabel)==pBlock->fSize) {
435       for( unsigned int il=0; il<dataPtr->fCount; il++ ){
436         AliHLTTrackMCLabel &lab = dataPtr->fLabels[il];
437         mcLabelsITS[lab.fTrackID] = lab.fMCLabel;
438       }
439     } else {
440       HLTWarning("data mismatch in block %s (0x%08x): count %d, size %d -> ignoring track MC information", 
441                  DataType2Text(pBlock->fDataType).c_str(), pBlock->fSpecification, 
442                  dataPtr->fCount, pBlock->fSize);
443     }
444   }
445
446
447   // read dEdx information (if present)
448   // TODO 2010-07-12 this needs to be verified
449
450   AliHLTFloat32_t *dEdxTPC = 0; 
451   Int_t ndEdxTPC = 0;
452   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypedEdx|kAliHLTDataOriginTPC);
453        pBlock!=NULL; pBlock=NULL/*GetNextInputBlock() there is only one block*/) {
454     fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);
455     dEdxTPC = reinterpret_cast<AliHLTFloat32_t*>( pBlock->fPtr );
456     ndEdxTPC = pBlock->fSize / (3*sizeof(AliHLTFloat32_t));
457   }
458
459   // 2) convert the TPC tracks to ESD tracks
460   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeTrack|kAliHLTDataOriginTPC);
461        pBlock!=NULL; pBlock=GetNextInputBlock()) {
462     if (pInputESD && pInputESD->GetNumberOfTracks()>0) {
463       HLTWarning("Tracks array already filled from the input esd block, additional filling from TPC tracks block might cause inconsistent content");
464     }
465     fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);
466     vector<AliHLTGlobalBarrelTrack> tracks;
467     if ((iResult=AliHLTGlobalBarrelTrack::ConvertTrackDataArray(reinterpret_cast<const AliHLTTracksData*>(pBlock->fPtr), pBlock->fSize, tracks))>=0) {
468       for (vector<AliHLTGlobalBarrelTrack>::iterator element=tracks.begin();
469            element!=tracks.end(); element++) {
470         Float_t points[4] = {
471           static_cast<Float_t>(element->GetX()),
472           static_cast<Float_t>(element->GetY()),
473           static_cast<Float_t>(element->GetLastPointX()),
474           static_cast<Float_t>(element->GetLastPointY())
475         };
476
477         Int_t mcLabel = -1;
478         if( mcLabelsTPC.find(element->TrackID())!=mcLabelsTPC.end() )
479           mcLabel = mcLabelsTPC[element->TrackID()];
480         element->SetLabel( mcLabel );
481
482         AliESDtrack iotrack;
483
484         // for the moment, the number of clusters are not set when processing the
485         // kTPCin update, only at kTPCout
486         // there ar emainly three parameters updated for kTPCout
487         //   number of clusters
488         //   chi2
489         //   pid signal
490         // The first one can be updated already at that stage here, while the two others
491         // eventually require to update from the ITS tracks before. The exact scheme
492         // needs to be checked
493         iotrack.SetID( element->TrackID() );
494
495         // 2.1 set kTPCout
496         // TODO 2010-07-12 disabled for the moment because of bug
497         // https://savannah.cern.ch/bugs/index.php?69875
498         // the propagation does not work, there is an offset in z
499         // propagate to last cluster and update parameters with flag kTPCout
500         // Note: updating with flag kITSout further down will overwrite the outer
501         // parameter again so this can be done only for ITS standalone tracks, meaning
502         // tracks in the ITS not associated with any TPC track
503         // HLT does not provide such standalone tracking
504         {
505           AliHLTGlobalBarrelTrack outPar(*element);       
506           //outPar.AliExternalTrackParam::PropagateTo( element->GetLastPointX(), fSolenoidBz );
507           const Int_t N=10; // number of steps.
508           const Float_t xRange = element->GetLastPointX() - element->GetX();
509           const Float_t xStep = xRange / N ;
510           for(int i = 1; i <= N; ++i) {
511             if(!outPar.AliExternalTrackParam::PropagateTo(element->GetX() + xStep * i, fSolenoidBz)) break;
512           }
513           outPar.SetLabel(element->GetLabel());
514           iotrack.UpdateTrackParams(&outPar,AliESDtrack::kTPCout);
515         }
516         // 2.2 TPC tracking estimates parameters at first cluster
517         iotrack.UpdateTrackParams(&(*element),AliESDtrack::kTPCin);
518
519         // 2.3 use the same parameters also for kTPCrefit, there is no proper refit in HLT
520         // maybe this can be done later, however also the inner parameter is changed which
521         // is used as a reference point in the display. That point should be at the first
522         // TPC cluster
523         iotrack.UpdateTrackParams(&(*element),AliESDtrack::kTPCrefit);
524         iotrack.SetTPCPoints(points);
525         if( element->TrackID()<ndEdxTPC ){
526           AliHLTFloat32_t *val = &(dEdxTPC[3*element->TrackID()]);
527           iotrack.SetTPCsignal( val[0], val[1], (UChar_t) val[2] ); 
528           //AliTPCseed s;
529           //s.Set( element->GetX(), element->GetAlpha(),
530           //element->GetParameter(), element->GetCovariance() );
531           //s.SetdEdx( val[0] );
532           //s.CookPID();
533           //iotrack.SetTPCpid(s.TPCrPIDs() );
534         } else {
535           if( dEdxTPC ) HLTWarning("Wrong number of dEdx TPC labels");
536         }
537         iotrack.SetLabel(mcLabel);
538         pESD->AddTrack(&iotrack);
539         if (fVerbosity>0) element->Print();
540       }
541       HLTInfo("converted %d track(s) to AliESDtrack and added to ESD", tracks.size());
542       iAddedDataBlocks++;
543     } else if (iResult<0) {
544       HLTError("can not extract tracks from data block of type %s (specification %08x) of size %d: error %d", 
545                DataType2Text(pBlock->fDataType).c_str(), pBlock->fSpecification, pBlock->fSize, iResult);
546     }
547   }
548
549
550   // Get ITS SPD vertex
551   for( const AliHLTComponentBlockData *i= GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeESDVertex|kAliHLTDataOriginITS); i!=NULL; i=GetNextInputBlock() ){
552     fBenchmark.AddInput(i->fSize);
553   }
554
555   for ( const TObject *iter = GetFirstInputObject(kAliHLTDataTypeESDVertex|kAliHLTDataOriginITS); iter != NULL; iter = GetNextInputObject() ) {
556     AliESDVertex *vtx = dynamic_cast<AliESDVertex*>(const_cast<TObject*>( iter ) );
557     pESD->SetPrimaryVertexSPD( vtx );
558   }
559
560   // 3.1. now update ESD tracks with the ITSOut info
561   // updating track parameters with flag kITSout will overwrite parameter set above with flag kTPCout
562   // TODO 2010-07-12 there are some issues with this updating sequence, for the moment update with
563   // flag kITSout is disabled, would require
564   // a) to update kTPCout after kITSout
565   // b) update only for ITS standalone tracks. The HLT ITS tracker does not provide standalone
566   //    tracking, every track is related to a TPC track
567   // Furthermore there seems to be a bug as the data blocks describe track parameters around the
568   // vertex, not at the outer ITS
569   // bug https://savannah.cern.ch/bugs/index.php?69872
570   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeTrack|kAliHLTDataOriginITSOut);
571        pBlock!=NULL; pBlock=GetNextInputBlock()) {
572     fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);
573     vector<AliHLTGlobalBarrelTrack> tracks;
574     if ((iResult=AliHLTGlobalBarrelTrack::ConvertTrackDataArray(reinterpret_cast<const AliHLTTracksData*>(pBlock->fPtr), pBlock->fSize, tracks))>0) {
575       for (vector<AliHLTGlobalBarrelTrack>::iterator element=tracks.begin();
576            element!=tracks.end(); element++) {
577         int tpcID=element->TrackID();
578         // the ITS tracker assigns the TPC track used as seed for a certain track to
579         // the trackID
580         if( tpcID<0 || tpcID>=pESD->GetNumberOfTracks()) continue;
581         AliESDtrack *tESD = pESD->GetTrack( tpcID );
582         element->SetLabel(tESD->GetLabel());
583         // 2010-07-12 disabled, see above, bugfix https://savannah.cern.ch/bugs/index.php?69872
584         //if( tESD ) tESD->UpdateTrackParams( &(*element), AliESDtrack::kITSout );
585       }
586     }
587   }
588
589   // 3.2. now update ESD tracks with the ITS info
590   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeTrack|kAliHLTDataOriginITS);
591        pBlock!=NULL; pBlock=GetNextInputBlock()) {
592     fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);
593     vector<AliHLTGlobalBarrelTrack> tracks;
594     if ((iResult=AliHLTGlobalBarrelTrack::ConvertTrackDataArray(reinterpret_cast<const AliHLTTracksData*>(pBlock->fPtr), pBlock->fSize, tracks))>0) {
595       for (vector<AliHLTGlobalBarrelTrack>::iterator element=tracks.begin();
596            element!=tracks.end(); element++) {
597         int tpcID=element->TrackID();
598         // the ITS tracker assigns the TPC track used as seed for a certain track to
599         // the trackID
600         if( tpcID<0 || tpcID>=pESD->GetNumberOfTracks()) continue;
601         Int_t mcLabel = -1;
602         if( mcLabelsITS.find(element->TrackID())!=mcLabelsITS.end() )
603           mcLabel = mcLabelsITS[element->TrackID()];
604         AliESDtrack *tESD = pESD->GetTrack( tpcID );
605         if (!tESD) continue;
606         // the labels for the TPC and ITS tracking params can be different, e.g.
607         // there can be a decay. The ITS label should then be the better one, the
608         // TPC label is saved in a member of AliESDtrack
609         if (mcLabel>=0) {
610           // upadte only if the ITS label is available, otherwise keep TPC label
611           element->SetLabel( mcLabel );
612         } else {
613           // bugfix https://savannah.cern.ch/bugs/?69713
614           element->SetLabel( tESD->GetLabel() );          
615         }
616         tESD->UpdateTrackParams( &(*element), AliESDtrack::kITSin );
617
618         // TODO: add a proper refit
619         //tESD->UpdateTrackParams( &(*element), AliESDtrack::kTPCrefit );
620       }
621     }
622   }
623
624   // update with  vertices and vertex-fitted tracks
625   // output of the GlobalVertexerComponent
626   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeGlobalVertexer);
627        pBlock!=NULL; pBlock=GetNextInputBlock()) {
628     fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);   
629     AliHLTGlobalVertexerComponent::FillESD( pESD, reinterpret_cast<AliHLTGlobalVertexerComponent::AliHLTGlobalVertexerData* >(pBlock->fPtr) );
630   }
631
632   // update with  vertices and vertex-fitted tracks
633   // output of PrimaryVertexer and V0Finder components
634   TObject* pBase = (TObject*)GetFirstInputObject(kAliHLTDataTypeKFVertex | kAliHLTDataOriginOut);
635   if (pBase) {
636     AliKFVertex* kfVertex = dynamic_cast<AliKFVertex *>(pBase);
637     if (kfVertex) {
638       const AliHLTComponentBlockData* pP = GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypePrimaryFinder | kAliHLTDataOriginOut);
639       if (pP && pP->fSize && pP->fPtr) {
640         const AliHLTComponentBlockData* pV0 = GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeV0Finder | kAliHLTDataOriginOut);
641         if (pV0 && pV0->fPtr && pInputESD && pInputESD->GetNumberOfV0s()>0) {
642           const int* v0s = static_cast<const int*>(pV0->fPtr);
643           HLTWarning("V0 array already filled from the input esd block, additional filling from V0 block of %d entries might cause inconsistent content", v0s[0]);
644         }
645         AliHLTVertexFinderBase::FillESD(pESD, kfVertex, pP->fPtr, pV0?pV0->fPtr:NULL);
646       } else
647         HLTWarning("Problem with primary finder's data block");
648     } else {
649       HLTWarning("primary vertex block of wrong type, expecting AliKFVertex instead of %s", pBase->GetName());
650     }
651   } else {
652     // throw an error if there is a V0 data block which can not be handled without
653     // the AliKFVertex object
654     if (GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeV0Finder | kAliHLTDataOriginOut)!=NULL) {
655       ALIHLTERRORGUARD(1, "missing AliKFVertex object ignoring V0 data block of type %s",
656                        DataType2Text(kAliHLTDataTypeV0Finder|kAliHLTDataOriginOut).c_str());
657     }
658   }
659
660   // Fill DCA parameters for TPC tracks
661   // TODO 2010-07-12 this propagates also the TPC inner param to beamline
662   // sounds not very reasonable
663   // https://savannah.cern.ch/bugs/index.php?69873
664   for (int i=0; i<pESD->GetNumberOfTracks(); i++) {
665     if (!pESD->GetTrack(i) || 
666         !pESD->GetTrack(i)->GetTPCInnerParam() ) continue;
667     pESD->GetTrack(i)->RelateToVertexTPC(pESD->GetPrimaryVertexTracks(), fSolenoidBz, 1000 );    
668   }
669
670   // loop over all tracks and set the TPC refit flag by updating with the
671   // original TPC inner parameter if not yet set
672   // TODO: replace this by a proper refit
673   // code is comented for the moment as it does not fully solve the problems with
674   // the display
675   // - would set the main parameters to the TPC inner wall again, or
676   // - changes the inner param if the parameters are propagated, so we loose the track
677   //   reference point for the display
678   // with the current sequence we have the latter case as the DCA operations above
679   // change the TPC inner parameters
680   /*
681   for (int i=0; i<pESD->GetNumberOfTracks(); i++) {
682     if (!pESD->GetTrack(i) || 
683         !pESD->GetTrack(i)->GetTPCInnerParam() ||
684         pESD->GetTrack(i)->IsOn(AliESDtrack::kTPCrefit)) continue;
685     AliESDtrack* tESD=pESD->GetTrack(i);
686     AliHLTGlobalBarrelTrack inner(*tESD->GetTPCInnerParam());
687     inner.SetLabel(tESD->GetLabel());
688     tESD->UpdateTrackParams(&inner, AliESDtrack::kTPCrefit);
689   }
690   */
691
692   // 4. convert the HLT TRD tracks to ESD tracks                        
693   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeTrack | kAliHLTDataOriginTRD);
694        pBlock!=NULL; pBlock=GetNextInputBlock()) {
695     fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);
696     vector<AliHLTGlobalBarrelTrack> tracks;
697     if ((iResult=AliHLTGlobalBarrelTrack::ConvertTrackDataArray(reinterpret_cast<const AliHLTTracksData*>(pBlock->fPtr), pBlock->fSize, tracks))>0) {
698       for (vector<AliHLTGlobalBarrelTrack>::iterator element=tracks.begin();
699            element!=tracks.end(); element++) {
700         
701         Double_t TRDpid[AliPID::kSPECIES], eProb(0.2), restProb((1-eProb)/(AliPID::kSPECIES-1)); //eprob(element->GetTRDpid...);
702         for(Int_t i=0; i<AliPID::kSPECIES; i++){
703           switch(i){
704           case AliPID::kElectron: TRDpid[AliPID::kElectron]=eProb; break;
705           default: TRDpid[i]=restProb; break;
706           }
707         }
708         
709         AliESDtrack iotrack;
710         iotrack.UpdateTrackParams(&(*element),AliESDtrack::kTRDout);
711         iotrack.SetStatus(AliESDtrack::kTRDin);
712         iotrack.SetTRDpid(TRDpid);
713         
714         pESD->AddTrack(&iotrack);
715         if (fVerbosity>0) element->Print();
716       }
717       HLTInfo("converted %d track(s) to AliESDtrack and added to ESD", tracks.size());
718       iAddedDataBlocks++;
719     } else if (iResult<0) {
720       HLTError("can not extract tracks from data block of type %s (specification %08x) of size %d: error %d", 
721                DataType2Text(pBlock->fDataType).c_str(), pBlock->fSpecification, pBlock->fSize, iResult);
722     }
723   }
724   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeCaloCluster | kAliHLTDataOriginAny); pBlock!=NULL; pBlock=GetNextInputBlock()) 
725     {
726       fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);
727       AliHLTCaloClusterHeaderStruct *caloClusterHeaderPtr = reinterpret_cast<AliHLTCaloClusterHeaderStruct*>(pBlock->fPtr);
728
729       HLTDebug("%d HLT clusters from spec: 0x%X", caloClusterHeaderPtr->fNClusters, pBlock->fSpecification);
730
731       //AliHLTCaloClusterReader reader;
732       //reader.SetMemory(caloClusterHeaderPtr);
733
734       AliHLTESDCaloClusterMaker clusterMaker;
735
736       int nClusters = clusterMaker.FillESD(pESD, caloClusterHeaderPtr);
737      
738       HLTInfo("converted %d cluster(s) to AliESDCaloCluster and added to ESD", nClusters);
739       iAddedDataBlocks++;
740     }
741   
742   // 5) Add Trigger Detectors 
743   //    VZERO, ZDC
744
745   // FIXME: the size of all input blocks can be added in one loop
746   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeESDContent|kAliHLTDataOriginVZERO);
747        pBlock!=NULL; pBlock=GetNextInputBlock()) {
748     fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);
749   }
750
751   for ( const TObject *pObject = GetFirstInputObject(kAliHLTDataTypeESDContent|kAliHLTDataOriginVZERO); 
752         pObject != NULL; pObject = GetNextInputObject() ) {
753     AliESDVZERO *esdVZERO = dynamic_cast<AliESDVZERO*>(const_cast<TObject*>( pObject ) );
754     if (esdVZERO) {
755       pESD->SetVZEROData( esdVZERO );
756       break;
757     } else {
758       ALIHLTERRORGUARD(1, "input object of data type %s is not of class AliESDVZERO",
759                        DataType2Text(kAliHLTDataTypeESDContent|kAliHLTDataOriginVZERO).c_str());
760     }
761   }
762
763   // FIXME: the size of all input blocks can be added in one loop
764   for (const AliHLTComponentBlockData* pBlock=GetFirstInputBlock(kAliHLTDataTypeESDContent|kAliHLTDataOriginZDC);
765        pBlock!=NULL; pBlock=GetNextInputBlock()) {
766     fBenchmark.AddInput(pBlock->fSize);
767   }
768   for ( const TObject *pObject = GetFirstInputObject(kAliHLTDataTypeESDContent|kAliHLTDataOriginZDC); 
769         pObject != NULL; pObject = GetNextInputObject() ) {
770     AliESDZDC *esdZDC = dynamic_cast<AliESDZDC*>(const_cast<TObject*>( pObject ) );
771     if (esdZDC) {
772 #ifndef HAVE_NOT_ALIZDCRECONSTRUCTOR_r43770
773       pESD->SetZDCData( esdZDC );
774 #else
775       ALIHLTERRORGUARD(1, "Processing of ZDC data requires AliRoot r43770m skipping data block of type %s",
776                        DataType2Text(kAliHLTDataTypeESDContent|kAliHLTDataOriginZDC).c_str());
777 #endif
778       break;
779     } else {
780       ALIHLTERRORGUARD(1, "input object of data type %s is not of class AliESDZDC",
781                        DataType2Text(kAliHLTDataTypeESDContent|kAliHLTDataOriginZDC).c_str());
782     }
783   }
784
785   // Add tracks and clusters from MUON.
786   for( const AliHLTComponentBlockData *i= GetFirstInputBlock(kAliHLTAnyDataType | kAliHLTDataOriginMUON); i!=NULL; i=GetNextInputBlock() ){
787     fBenchmark.AddInput(i->fSize);
788   }
789
790   for (const TObject* obj = GetFirstInputObject(kAliHLTAnyDataType | kAliHLTDataOriginMUON);
791        obj != NULL;
792        obj = GetNextInputObject()
793       )
794   {
795     const TClonesArray* tracklist = NULL;
796     const TClonesArray* clusterlist = NULL;
797     if (obj->IsA() == AliESDEvent::Class())
798     {
799       const AliESDEvent* event = static_cast<const AliESDEvent*>(obj);
800       HLTDebug("Received a MUON ESD with specification: 0x%X", GetSpecification(obj));
801       if (event->GetList() == NULL) continue;
802       tracklist = dynamic_cast<const TClonesArray*>(event->GetList()->FindObject("MuonTracks"));
803       if (tracklist == NULL) continue;
804       clusterlist = dynamic_cast<const TClonesArray*>(event->GetList()->FindObject("MuonClusters"));
805       if (clusterlist == NULL) continue;
806     }
807     else if (obj->IsA() == TClonesArray::Class())
808     {
809       if (!strcmp(obj->GetName(), "MuonTracks")) {
810         tracklist = static_cast<const TClonesArray*>(obj);
811         HLTDebug("Received a MUON TClonesArray of tracks with specification: 0x%X", GetSpecification(obj));
812       } else {
813         clusterlist = static_cast<const TClonesArray*>(obj);
814         HLTDebug("Received a MUON TClonesArray of clusters with specification: 0x%X", GetSpecification(obj));
815       }
816     }
817     else
818     {
819       // Cannot handle this object type.
820       continue;
821     }
822     // copy tracks
823     if (tracklist) {
824       HLTDebug("Received %d MUON tracks.", tracklist->GetEntriesFast());
825       if (tracklist->GetEntriesFast() > 0)
826       {
827         const AliESDMuonTrack* track = dynamic_cast<const AliESDMuonTrack*>(tracklist->UncheckedAt(0));
828         if (track == NULL)
829         {
830           HLTError(Form("%s from MUON does not contain AliESDMuonTrack objects.", obj->ClassName()));
831           continue;
832         }
833       }
834       for (Int_t i = 0; i < tracklist->GetEntriesFast(); ++i)
835       {
836         AliESDMuonTrack* track = pESD->NewMuonTrack();
837         *track = *(static_cast<const AliESDMuonTrack*>(tracklist->UncheckedAt(i)));
838       }
839     }
840     // copy clusters
841     if (clusterlist) {
842       HLTDebug("Received %d MUON clusters.", clusterlist->GetEntriesFast());
843       if (clusterlist->GetEntriesFast() > 0)
844       {
845         const AliESDMuonCluster* cluster = dynamic_cast<const AliESDMuonCluster*>(clusterlist->UncheckedAt(0));
846         if (cluster == NULL)
847         {
848           HLTError(Form("%s from MUON does not contain AliESDMuonCluster objects.", obj->ClassName()));
849           continue;
850         }
851       }
852       for (Int_t i = 0; i < clusterlist->GetEntriesFast(); ++i)
853       {
854         AliESDMuonCluster* cluster = pESD->NewMuonCluster();
855         *cluster = *(static_cast<const AliESDMuonCluster*>(clusterlist->UncheckedAt(i)));
856       }
857     }
858   }
859   
860   if (iAddedDataBlocks>0 && pTree) {
861     pTree->Fill();
862   }
863   
864   if (iResult>=0) iResult=iAddedDataBlocks;
865   return iResult;
866 }