Protection if UserCut not present in OCDB (Sigma=3 as default)
[u/mrichter/AliRoot.git] / HMPID / AliHMPIDReconstructor.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15 //.
16 // HMPID base class to reconstruct an event
17 //.
18 //.
19 //.
20 #include "AliHMPIDReconstructor.h" //class header
21 #include "AliHMPID.h"              //Reconstruct() 
22 #include "AliHMPIDCluster.h"       //Dig2Clu()
23 #include "AliHMPIDPid.h"           //FillEsd() 
24 #include "AliHMPIDParam.h"         //FillEsd() 
25 #include <AliCDBEntry.h>           //ctor
26 #include <AliCDBManager.h>         //ctor
27 #include <AliESDEvent.h>           //FillEsd()
28 #include <AliRawReader.h>          //Reconstruct() for raw digits
29 #include "AliHMPIDRawStream.h"     //ConvertDigits()
30 #include "AliHMPIDRecoParam.h"     //ctor
31 ClassImp(AliHMPIDReconstructor)
32
33 AliHMPIDRecoParam* AliHMPIDReconstructor::fgkRecoParam =0;  // 
34 //++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
35 AliHMPIDReconstructor::AliHMPIDReconstructor():AliReconstructor(),fUserCut(0),fDaqSig(0),fDig(0),fClu(0)
36 {
37 //
38 //ctor
39 //
40   AliHMPIDParam::Instance();                                                        //geometry loaded for reconstruction
41   fUserCut = new Int_t[7];
42   fClu=new TObjArray(AliHMPIDParam::kMaxCh+1); fClu->SetOwner(kTRUE);
43   fDig=new TObjArray(AliHMPIDParam::kMaxCh+1); fDig->SetOwner(kTRUE);
44   
45   for(int i=AliHMPIDParam::kMinCh;i<=AliHMPIDParam::kMaxCh;i++){ 
46     fDig->AddAt(new TClonesArray("AliHMPIDDigit",24000),i);
47     TClonesArray *pClus = new TClonesArray("AliHMPIDCluster",24000);
48     pClus->SetUniqueID(i);
49     fClu->AddAt(pClus,i);
50   }
51
52    if(fgkRecoParam!=0x0 && fgkRecoParam->GetUserCutMode()==kFALSE)
53   {
54       for(Int_t iCh=AliHMPIDParam::kMinCh;iCh<=AliHMPIDParam::kMaxCh;iCh++) {
55       fUserCut[iCh] = fgkRecoParam->GetUserCut(iCh);
56       AliDebug(1,Form("UserCut successfully loaded (from RecoParam) for chamber %i -> %i ",iCh,fUserCut[iCh]));
57    }
58   }  
59   else {
60   AliCDBEntry *pUserCutEnt =AliCDBManager::Instance()->Get("HMPID/Calib/UserCut");    //contains TObjArray of 14 TObject with n. of sigmas to cut charge 
61   if(pUserCutEnt) {
62     TObjArray *pUserCut = (TObjArray*)pUserCutEnt->GetObject(); 
63     for(Int_t iCh=AliHMPIDParam::kMinCh;iCh<=AliHMPIDParam::kMaxCh;iCh++){                  //chambers loop 
64       fUserCut[iCh] = pUserCut->At(iCh)->GetUniqueID();
65       AliDebug(1,Form("UserCut successfully loaded (from OCDB) for chamber %i -> %i ",iCh,fUserCut[iCh]));
66     }
67    }
68    else {for(Int_t iCh=AliHMPIDParam::kMinCh;iCh<=AliHMPIDParam::kMaxCh;iCh++) fUserCut[iCh] = 3;}
69   }
70
71   AliCDBEntry *pQthreEnt =AliCDBManager::Instance()->Get("HMPID/Calib/Qthre"); //contains TObjArray of 7 TF1
72   if(!pQthreEnt) AliFatal("No Qthre available");
73   TObjArray *pQthre = (TObjArray*)pQthreEnt->GetObject();
74   for(Int_t iCh=AliHMPIDParam::kMinCh;iCh<=AliHMPIDParam::kMaxCh;iCh++) {
75     for(Int_t isec=0;isec<=5;isec++) {
76      TF1 *pfQthre = (TF1*)pQthre->At(6*iCh+isec); 
77      Double_t tMin,tMax;
78      pfQthre->GetRange(tMin,tMax);
79      Double_t qthre=pfQthre->Eval(tMin);
80      AliDebug(1,Form("Qthre successfully loaded for chamber %i  sector %i -> %f ",iCh,isec,qthre));
81     }
82   }
83
84      
85   AliCDBEntry *pDaqSigEnt =AliCDBManager::Instance()->Get("HMPID/Calib/DaqSig");  //contains TObjArray of TObjArray 14 TMatrixF sigmas values for pads 
86   if(!pDaqSigEnt) AliFatal("No pedestals from DAQ!");
87   fDaqSig = (TObjArray*)pDaqSigEnt->GetObject();
88   for(Int_t iCh=AliHMPIDParam::kMinCh;iCh<=AliHMPIDParam::kMaxCh;iCh++){                  //chambers loop 
89     AliDebug(1,Form("DaqSigCut successfully loaded for chamber %i -> %i ",iCh,(Int_t)fDaqSig->At(iCh)->GetUniqueID()));
90   }
91 }//AliHMPIDReconstructor
92 //++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
93 void AliHMPIDReconstructor::Dig2Clu(TObjArray *pDigAll,TObjArray *pCluAll,Int_t *pUserCut,Bool_t isTryUnfold)
94 {
95 // Finds all clusters for a given digits list provided not empty. Currently digits list is a list of all digits for a single chamber.
96 // Puts all found clusters in separate lists, one per clusters. 
97 // Arguments: pDigAll     - list of digits for all chambers 
98 //            pCluAll     - list of clusters for all chambers
99 //            isTryUnfold - flag to choose between CoG and Mathieson fitting  
100 //  Returns: none    
101   TMatrixF padMap(AliHMPIDParam::kMinPx,AliHMPIDParam::kMaxPcx,AliHMPIDParam::kMinPy,AliHMPIDParam::kMaxPcy);  //pads map for single chamber 0..159 x 0..143 
102   
103   for(Int_t iCh=AliHMPIDParam::kMinCh;iCh<=AliHMPIDParam::kMaxCh;iCh++){                  //chambers loop 
104     TClonesArray *pDigCur=(TClonesArray*)pDigAll->At(iCh);                                //get list of digits for current chamber
105     if(pDigCur->GetEntriesFast()==0) continue;                                            //no digits for current chamber
106   
107     padMap=(Float_t)-1;                                                                   //reset map to -1 (means no digit for this pad)  
108     TClonesArray *pCluCur=(TClonesArray*)pCluAll->At(iCh);                                //get list of clusters for current chamber
109     
110     for(Int_t iDig=0;iDig<pDigCur->GetEntriesFast();iDig++){                              //digits loop to fill pads map
111       AliHMPIDDigit *pDig= (AliHMPIDDigit*)pDigCur->At(iDig);                             //get current digit
112       padMap( pDig->PadChX(), pDig->PadChY() )=iDig;                                      //fill the map, (padx,pady) cell takes digit index
113     }//digits loop to fill digits map 
114     
115     AliHMPIDCluster clu;                                                                  //tmp cluster to be used as current
116     for(Int_t iDig=0;iDig<pDigCur->GetEntriesFast();iDig++){                              //digits loop for current chamber
117       AliHMPIDDigit *pDig=(AliHMPIDDigit*)pDigCur->At(iDig);                              //take current digit
118       if(!(pDig=UseDig(pDig->PadChX(),pDig->PadChY(),pDigCur,&padMap))) continue;         //this digit is already taken in FormClu(), go after next digit
119       FormClu(&clu,pDig,pDigCur,&padMap);                                                 //form cluster starting from this digit by recursion
120       clu.Solve(pCluCur,pUserCut,isTryUnfold);                                 //solve this cluster and add all unfolded clusters to provided list  
121       clu.Reset();                                                                        //empty current cluster
122     }//digits loop for current chamber
123   }//chambers loop
124 }//Dig2Clu()
125 //++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
126 void  AliHMPIDReconstructor::FormClu(AliHMPIDCluster *pClu,AliHMPIDDigit *pDig,TClonesArray *pDigLst,TMatrixF *pDigMap)
127 {
128 // Forms the initial cluster as a combination of all adjascent digits. Starts from the given digit then calls itself recursevly  for all neighbours.
129 // Arguments: pClu - pointer to cluster being formed
130 //   Returns: none   
131   pClu->DigAdd(pDig);//take this digit in cluster
132
133   Int_t cnt=0,cx[4],cy[4];
134   
135   if(pDig->PadPcX() != AliHMPIDParam::kMinPx){cx[cnt]=pDig->PadChX()-1; cy[cnt]=pDig->PadChY()  ;cnt++;}       //left
136   if(pDig->PadPcX() != AliHMPIDParam::kMaxPx){cx[cnt]=pDig->PadChX()+1; cy[cnt]=pDig->PadChY()  ;cnt++;}       //right
137   if(pDig->PadPcY() != AliHMPIDParam::kMinPy){cx[cnt]=pDig->PadChX()  ; cy[cnt]=pDig->PadChY()-1;cnt++;}       //down
138   if(pDig->PadPcY() != AliHMPIDParam::kMaxPy){cx[cnt]=pDig->PadChX()  ; cy[cnt]=pDig->PadChY()+1;cnt++;}       //up
139   
140   for (Int_t i=0;i<cnt;i++){//neighbours loop
141     if((pDig=UseDig(cx[i],cy[i],pDigLst,pDigMap))) FormClu(pClu,pDig,pDigLst,pDigMap);   //check if this neighbour pad fired and mark it as taken  
142   }//neighbours loop  
143 }//FormClu()
144 //++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
145 void AliHMPIDReconstructor::Reconstruct(TTree *pDigTree,TTree *pCluTree)const
146 {
147 //Invoked  by AliReconstruction to convert digits to clusters i.e. reconstruct simulated data
148 //Arguments: pDigTree - pointer to Digit tree
149 //           pCluTree - poitner to Cluster tree
150 //  Returns: none    
151   AliDebug(1,"Start.");
152   for(Int_t iCh=AliHMPIDParam::kMinCh;iCh<=AliHMPIDParam::kMaxCh;iCh++) {
153     pCluTree->Branch(Form("HMPID%d",iCh),&((*fClu)[iCh]),7);
154     pDigTree->SetBranchAddress(Form("HMPID%d",iCh),&((*fDig)[iCh]));
155   }   
156   pDigTree->GetEntry(0);
157   Dig2Clu(fDig,fClu,fUserCut);     //cluster finder 
158   pCluTree->Fill();                //fill tree for current event
159   
160   for(Int_t iCh=AliHMPIDParam::kMinCh;iCh<=AliHMPIDParam::kMaxCh;iCh++){
161     fDig->At(iCh)->Clear();
162     fClu->At(iCh)->Clear();
163   }
164   
165   AliDebug(1,"Stop.");      
166 }//Reconstruct(for simulated digits)
167 //++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
168 void AliHMPIDReconstructor::ConvertDigits(AliRawReader *pRR,TTree *pDigTree)const
169 {
170 //Invoked  by AliReconstruction to convert raw digits from DDL files to digits
171 //Arguments: pRR - ALICE raw reader pointer
172 //           pDigTree - pointer to Digit tree
173 //  Returns: none    
174   AliDebug(1,"Start.");
175 //  Int_t digcnt=0;
176   
177   Int_t iDigCnt[7]={0,0,0,0,0,0,0};
178
179   for(Int_t iCh=AliHMPIDParam::kMinCh;iCh<=AliHMPIDParam::kMaxCh;iCh++){
180     pDigTree->Branch(Form("HMPID%d",iCh),&((*fDig)[iCh]));
181   }
182     
183   AliHMPIDRawStream stream(pRR);    
184   
185   while(stream.Next())
186   {
187     Int_t ch = AliHMPIDParam::DDL2C(stream.GetDDLNumber());
188     for(Int_t iPad=0;iPad<stream.GetNPads();iPad++) {
189       AliHMPIDDigit dig(stream.GetPadArray()[iPad],stream.GetChargeArray()[iPad]);
190       if(!IsDigSurvive(&dig)) continue; 
191       new((*((TClonesArray*)fDig->At(ch)))[iDigCnt[ch]++]) AliHMPIDDigit(dig); //add this digit to the tmp list 
192     }
193   }
194   
195   pDigTree->Fill();
196   
197   for(Int_t iCh=AliHMPIDParam::kMinCh;iCh<=AliHMPIDParam::kMaxCh;iCh++)fDig->At(iCh)->Clear();
198   
199   AliDebug(1,"Stop.");
200 }//Reconstruct digits from raw digits
201 //++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
202 void AliHMPIDReconstructor::FillESD(TTree */*digitsTree*/, TTree */*clustersTree*/, AliESDEvent *pESD) const
203 {
204 // Fill ESD with all the infos from HMPID
205 // Probability vector from AliHMPIDPid
206 //...
207   AliHMPIDPid pID;
208   Double_t prob[AliPID::kSPECIES];
209   
210   for(Int_t iTrk=0;iTrk<pESD->GetNumberOfTracks();iTrk++){//ESD tracks loop
211     AliESDtrack *pTrk = pESD->GetTrack(iTrk);// get next reconstructed track
212     pID.FindPid(pTrk,AliPID::kSPECIES,prob);
213     pTrk->SetHMPIDpid(prob);
214   }//ESD tracks loop
215   
216 }//FillESD()