ITS/AliITS.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
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   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
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  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18
  19 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  20 //                                                                           //
  21 //      An overview of the basic philosophy of the ITS code development      //
  22 // and analysis is show in the figure below.                                 //
  23 //Begin_Html                                                                 //
  24 /*
  25 <img src="picts/ITS/ITS_Analysis_schema.gif">
  26 </pre>
  27 <br clear=left>
  28 <font size=+2 color=red>
  29 <p>Roberto Barbera is in charge of the ITS Offline code (1999).
  30 <a href="mailto:roberto.barbera@ct.infn.it">Roberto Barbera</a>.
  31 </font>
  32 <pre>
  33 */
  34 //End_Html
  35 //
  36 //  AliITS. Inner Traking System base class.
  37 //  This class contains the base procedures for the Inner Tracking System
  38 //
  39 //Begin_Html
  40 /*
  41 <img src="picts/ITS/AliITS_Class_Diagram.gif">
  42 </pre>
  43 <br clear=left>
  44 <font size=+2 color=red>
  45 <p>This show the class diagram of the different elements that are part of
  46 the AliITS class.
  47 </font>
  48 <pre>
  49 */
  50 //End_Html
  51 //
  52 // Version: 0
  53 // Written by Rene Brun, Federico Carminati, and Roberto Barbera
  54 //
  55 // Version: 1
  56 // Modified and documented by Bjorn S. Nilsen
  57 // July 11 1999
  58 //
  59 // Version: 2
  60 // Modified and documented by A. Bologna
  61 // October 18 1999
  62 //
  63 // AliITS is the general base class for the ITS. Also see AliDetector for
  64 // futher information.
  65 //
  66 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  67
  68 #include <stdlib.h>
  69 #include <TClonesArray.h>
  70 #include <TFile.h>
  71 #include <TParticle.h>
  72 #include <TString.h>
  73 #include <TTree.h>
  74 #include <TVirtualMC.h>
  75 #include "AliDetector.h"
  76 #include "AliITS.h"
  77 #include "AliITSDetTypeSim.h"
  78 #include "AliITSDDLRawData.h"
  79 #include "AliITSLoader.h"
  80 #include "AliITShit.h"
  81 #include "AliITSmodule.h"
  82 #include "AliITSpListItem.h"
  83 #include "AliITSsimulation.h"
  84 #include "AliITSsimulationFastPoints.h"
  85 #include "AliMC.h"
  86 #include "AliITSDigitizer.h"
  87 #include "AliITSRecPoint.h"
  88 #include "AliITSsegmentationSPD.h"
  89 #include "AliITSsegmentationSDD.h"
  90 #include "AliITSsimulationSDD.h"
  91 #include "AliITSCalibrationSDD.h"
  92 #include "AliITSCalibrationSSD.h"
  93 #include "AliITSsegmentationSSD.h"
  94 #include "AliITSRawStreamSPD.h"
  95 #include "AliITSRawStreamSSD.h"
  96 #include "AliITSRawStreamSDD.h"
  97 #include "AliRawReader.h"
  98 #include "AliRun.h"
  99 #include "AliLog.h"
 100 #include "AliITSInitGeometry.h"
 101 #include "AliITSFOSignalsSPD.h"
 102
 103 ClassImp(AliITS)
 104
 105 //______________________________________________________________________
 106 AliITS::AliITS() : AliDetector(),
 107 fDetTypeSim(0),
 108 fEuclidOut(0),
 109 fOpt("All"),
 110 fIdN(0),
 111 fIdSens(0),
 112 fIdName(0),
 113 fITSmodules(0),
 114 fTiming(kFALSE),
 115 fSimuParam(0),
 116 fModA(0),
 117 fpSDigits(0)
 118 {
 119   // Default initializer for ITS
 120   //      The default constructor of the AliITS class. In addition to
 121   // creating the AliITS class it zeros the variables fIshunt (a member
 122   // of AliDetector class), fEuclidOut, and fIdN, and zeros the pointers
 123   // fIdSens, and fIdName. The AliDetector default constructor
 124   // is also called.
 125
 126 //    SetDetectors(); // default to fOpt="All". This variable not written out.
 127 //PH    SetMarkerColor(kRed);
 128 }
 129 //______________________________________________________________________
 130 AliITS::AliITS(const Char_t *title):
 131   AliDetector("ITS",title),
 132   fDetTypeSim(0),
 133   fEuclidOut(0),
 134   fOpt("All"),
 135   fIdN(0),
 136   fIdSens(0),
 137   fIdName(0),
 138   fITSmodules(0),
 139   fTiming(kFALSE),
 140   fSimuParam(0),
 141   fModA(0),
 142   fpSDigits(0)
 143 {
 144     //     The standard Constructor for the ITS class.
 145     // It also zeros the variables
 146     // fIshunt (a member of AliDetector class), fEuclidOut, and zeros
 147     // the pointers fIdSens and fIdName. To help in displaying hits via the
 148     // ROOT macro display.C AliITS also sets the marker color to red. The
 149     // variables passes with this constructor, const char *name and *title,
 150     // are used by the constructor of AliDetector class. See AliDetector
 151     // class for a description of these parameters and its constructor
 152     // functions.
 153     // Inputs:
 154     //   Char_t *title  Simulation title for the ITS
 155     // Outputs:
 156     //   none.
 157     // Return:
 158     //   none.
 159
 160     fHits = new TClonesArray("AliITShit",1560); // from AliDetector
 161     if(gAlice->GetMCApp()) gAlice->GetMCApp()->AddHitList(fHits);
 162     //fNhits=0;  //done in AliDetector(name,title)
 163     SetDetectors(); // default to fOpt="All". This variable not written out.
 164     fDetTypeSim   = new AliITSDetTypeSim();
 165     //PH  SetMarkerColor(kRed);
 166     if(!fLoader) MakeLoader(AliConfig::GetDefaultEventFolderName());
 167     fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 168 }
 169 //______________________________________________________________________
 170 AliITS::AliITS(const char *name, const char *title):
 171   AliDetector(name,title),
 172   fDetTypeSim(0),
 173   fEuclidOut(0),
 174   fOpt("All"),
 175   fIdN(0),
 176   fIdSens(0),
 177   fIdName(0),
 178   fITSmodules(0),
 179   fTiming(kFALSE),
 180   fSimuParam(0),
 181   fModA(0),
 182   fpSDigits(0)
 183 {
 184   //     The standard Constructor for the ITS class.
 185   // It also zeros the variables
 186   // fIshunt (a member of AliDetector class), fEuclidOut, and zeros
 187   // the pointers fIdSens and fIdName. To help in displaying hits via the
 188   // ROOT macro display.C AliITS also sets the marker color to red. The
 189   // variables passes with this constructor, const char *name and *title,
 190   // are used by the constructor of AliDetector class. See AliDetector
 191   // class for a description of these parameters and its constructor
 192   // functions.
 193
 194   fHits = new TClonesArray("AliITShit",1560);
 195   if(gAlice->GetMCApp()) gAlice->GetMCApp()->AddHitList(fHits);
 196   //fNhits=0;  //done in AliDetector(name,title)
 197
 198   SetDetectors(); // default to fOpt="All". This variable not written out.
 199
 200   fDetTypeSim   = new AliITSDetTypeSim();
 201   //PH  SetMarkerColor(kRed);
 202   if(!fLoader) MakeLoader(AliConfig::GetDefaultEventFolderName());
 203   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 204
 205 }
 206 //______________________________________________________________________
 207 AliITS::~AliITS(){
 208     // Default destructor for ITS.
 209     //     The default destructor of the AliITS class. In addition to deleting
 210     // the AliITS class it deletes the memory pointed to by
 211     // fIdSens, fIdName, fDetTypeSim and it's contents.
 212     // Inputs:
 213     //      none.
 214     // Outputs:
 215     //      none.
 216     // Return:
 217     //      none.
 218
 219     if (fHits) {
 220       fHits->Delete();
 221       delete fHits;
 222       fHits=0;
 223     }
 224     if(fITSmodules) {
 225         this->ClearModules();
 226         delete fITSmodules;
 227         fITSmodules = 0;
 228     }// end if fITSmodules!=0
 229
 230     delete[] fIdName;  // Array of TStrings
 231     delete[] fIdSens;
 232     Int_t size   = AliITSgeomTGeo::GetNModules();
 233     if (fDetTypeSim){
 234       delete fDetTypeSim;
 235       fDetTypeSim = 0;
 236     }
 237     if(fSimuParam){
 238       delete fSimuParam;
 239       fSimuParam=0;
 240     }
 241     if(fModA){
 242       if(size>0){
 243         for(Int_t j=0; j<size; j++){
 244           fModA[j]->Delete();
 245           delete fModA[j];
 246         }
 247       }
 248       delete []fModA;
 249     }
 250     if(fpSDigits){
 251       fpSDigits->Delete();
 252       delete fpSDigits;
 253     }
 254 }
 255
 256 //______________________________________________________________________
 257 AliDigitizer* AliITS::CreateDigitizer(AliRunDigitizer* manager)const{
 258     // Creates the AliITSDigitizer in a standard way for use via AliModule.
 259     // This function can not be included in the .h file because of problems
 260     // with the order of inclusion (recursive).
 261     // Inputs:
 262     //    AliRunDigitizer *manager  The Manger class for Digitization
 263     // Output:
 264     //    none.
 265     // Return:
 266     //    A new AliITSRunDigitizer (cast as a AliDigitizer).
 267
 268      return new AliITSDigitizer(manager);
 269 }
 270 //______________________________________________________________________
 271 void AliITS::Init(){
 272     // Initializer ITS after it has been built
 273     //     This routine initializes the AliITS class. It is intended to be
 274     // called from the Init function in AliITSv?. Besides displaying a banner
 275     // indicating that it has been called it initializes the array fIdSens
 276     // and sets the default segmentation, response, digit and raw cluster
 277     // classes therefore it should be called after a call to CreateGeometry.
 278     // Inputs:
 279     //      none.
 280     // Outputs:
 281     //      none.
 282     // Return:
 283     //      none.
 284     Int_t i;
 285     // Array of TStrings
 286     if(gMC) for(i=0;i<fIdN;i++) fIdSens[i] = gMC->VolId(fIdName[i]);
 287
 288 }
 289 //______________________________________________________________________
 290 void AliITS::SetDefaults(){
 291     // sets the default segmentation, response, digit and raw cluster classes.
 292     // Inputs:
 293     //      none.
 294     // Outputs:
 295     //      none.
 296     // Return:
 297     //      none.
 298     AliInfoClass("AliITS::Setting Defaults");
 299     if(!fDetTypeSim) {
 300      Error("SetDefaults()","fDetTypeSim is 0!");
 301      return;
 302     }
 303
 304     fDetTypeSim->SetDefaults();
 305     if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 306
 307 }
 308 //______________________________________________________________________
 309 void AliITS::SetDefaultSimulation(){
 310     // sets the default simulation.
 311     // Inputs:
 312     //      none.
 313     // Outputs:
 314     //      none.
 315     // Return:
 316     //      none.
 317     if(!fDetTypeSim) {
 318      Error("SetDefaultSimulation()","fDetTypeSim is 0!");
 319      return;
 320     }
 321
 322     fDetTypeSim->SetDefaultSimulation();
 323     if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 324
 325 }
 326
 327
 328 //______________________________________________________________________
 329 void AliITS::MakeBranch(Option_t* option){
 330     // Creates Tree branches for the ITS.
 331     // Inputs:
 332     //      Option_t *option    String of Tree types S,D, and/or R.
 333     //      const char *file    String of the file name where these branches
 334     //                          are to be stored. If blank then these branches
 335     //                          are written to the same tree as the Hits were
 336     //                          read from.
 337     // Outputs:
 338     //      none.
 339     // Return:
 340     //      none.
 341   if(!fDetTypeSim) {
 342     Error("MakeBranch","fDetTypeSim is 0!");
 343     return;
 344   }
 345
 346   Bool_t cH = (strstr(option,"H")!=0);
 347   Bool_t cS = (strstr(option,"S")!=0);
 348   Bool_t cD = (strstr(option,"D")!=0);
 349
 350   if(cH && (fHits == 0x0)) fHits = new TClonesArray("AliITShit", 1560);
 351   AliDetector::MakeBranch(option);
 352
 353   if(cS) MakeBranchS(0);
 354   if(cD) MakeBranchD(0);
 355
 356
 357 }
 358 //___________________________________________________________________
 359 void AliITS::MakeBranchS(const char* fl){
 360
 361   // Creates Tree Branch for the ITS summable digits.
 362   // Inputs:
 363   //      cont char *fl  File name where SDigits branch is to be written
 364   //                     to. If blank it write the SDigits to the same
 365   //                     file in which the Hits were found.
 366
 367
 368   if(!fDetTypeSim){
 369     Error("MakeBranchS","fDetTypeSim is 0!");
 370   }
 371   Int_t buffersize = 4000;
 372   char branchname[31];
 373
 374   // only one branch for SDigits.
 375   snprintf(branchname,30,"%s",GetName());
 376
 377   if(fLoader->TreeS()){
 378     TClonesArray* sdig = (TClonesArray*)fDetTypeSim->GetSDigits();
 379     MakeBranchInTree(fLoader->TreeS(),branchname,&sdig,buffersize,fl);
 380   }
 381 }
 382 //______________________________________________________________________
 383 void AliITS::MakeBranchD(const char* file){
 384
 385   //Make branch for digits
 386   if(!fDetTypeSim) {
 387     Warning("MakeBranchD","fDetTypeSim is 0!");
 388     return;
 389   }
 390   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 391   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 392   MakeBranchInTreeD(fLoader->TreeD(),file);
 393 }
 394
 395 //___________________________________________________________________
 396 void AliITS:: MakeBranchInTreeD(TTree* treeD, const char* file){
 397   // Creates Tree branches for the ITS.
 398
 399   if(!fDetTypeSim){
 400     Error("MakeBranchS","fDetTypeSim is 0!");
 401   }
 402   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 403   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 404
 405   const Char_t *det[3] = {"SPD","SDD","SSD"};
 406   const Char_t* digclass;
 407   Int_t buffersize = 4000;
 408   Char_t branchname[31];
 409
 410   if(!fDetTypeSim->GetDigits()){
 411     fDetTypeSim->SetDigits(new TObjArray(fgkNTYPES));
 412   }
 413   for(Int_t i=0;i<fgkNTYPES;i++){
 414     digclass = fDetTypeSim->GetDigitClassName(i);
 415     TString classn = digclass;
 416     if(!((fDetTypeSim->GetDigits())->At(i))){
 417       (fDetTypeSim->GetDigits())->AddAt(new TClonesArray(classn.Data(),1000),i);
 418     }
 419     else ResetDigits(i);
 420     if(fgkNTYPES==3) snprintf(branchname,30,"%sDigits%s",GetName(),det[i]);
 421     else sprintf(branchname,"%sDigits%d",GetName(),i+1);
 422     TObjArray* dig = DigitsAddress(i);
 423     if(GetDigits() && treeD) AliDetector::MakeBranchInTree(treeD,branchname, &dig,buffersize,file);
 424   }
 425
 426 }
 427 //______________________________________________________________________
 428 void AliITS::SetTreeAddress(){
 429     // Set branch address for the Trees.
 430     // Inputs:
 431     //      none.
 432     // Outputs:
 433     //      none.
 434     // Return:
 435     //      none.
 436
 437   if(!fDetTypeSim) {
 438     Error("SetTreeAddress","fDetTypeSim is 0!");
 439     return;
 440   }
 441
 442   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 443   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 444
 445   TTree *treeS = fLoader->TreeS();
 446   TTree *treeD = fLoader->TreeD();
 447   if (fLoader->TreeH() && (fHits == 0x0)) {
 448       fHits = new TClonesArray("AliITShit", 1560);
 449   }
 450   AliDetector::SetTreeAddress();
 451
 452   fDetTypeSim->SetTreeAddressS(treeS, (Char_t*)GetName());
 453   fDetTypeSim->SetTreeAddressD(treeD, (Char_t*)GetName());
 454 }
 455 //______________________________________________________________________
 456 void AliITS::AddHit(Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits){
 457     // Add an ITS hit
 458     //     The function to add information to the AliITShit class. See the
 459     // AliITShit class for a full description. This function allocates the
 460     // necessary new space for the hit information and passes the variable
 461     // track, and the pointers *vol and *hits to the AliITShit constructor
 462     // function.
 463     // Inputs:
 464     //      Int_t   track   Track number which produced this hit.
 465     //      Int_t   *vol    Array of Integer Hit information. See AliITShit.h
 466     //      Float_t *hits   Array of Floating Hit information.  see AliITShit.h
 467     // Outputs:
 468     //      none.
 469     // Return:
 470     //      none.
 471   TClonesArray &lhits = *fHits;
 472   new(lhits[fNhits++]) AliITShit(fIshunt,track,vol,hits);
 473 }
 474
 475 //______________________________________________________________________
 476 void AliITS::FillModules(Int_t /* evnt */,Int_t bgrev,Int_t /* nmodules */,
 477                          Option_t *option, const char *filename){
 478   // fill the modules with the sorted by module hits; add hits from
 479   // background if option=Add.
 480
 481   static TTree *trH1;                 //Tree with background hits
 482   static Bool_t first=kTRUE;
 483   static TFile *file;
 484   const char *addBgr = strstr(option,"Add");
 485
 486   if (addBgr ) {
 487     if(first) {
 488       file=new TFile(filename);
 489     } // end if first
 490     first=kFALSE;
 491     file->cd();
 492     file->ls();
 493     // Get Hits Tree header from file
 494     if(trH1) delete trH1;
 495     trH1=0;
 496
 497     char treeName[21];
 498     snprintf(treeName,20,"TreeH%d",bgrev);
 499     trH1 = (TTree*)gDirectory->Get(treeName);
 500     if (!trH1) {
 501       Error("FillModules","cannot find Hits Tree for event:%d",bgrev);
 502     } // end if !trH1
 503     // Set branch addresses
 504   } // end if addBgr
 505
 506   FillModules(fLoader->TreeH(),0); // fill from this file's tree.
 507
 508   if (addBgr ) {
 509     FillModules(trH1,10000000); // Default mask 10M.
 510     TTree *fAli=fLoader->GetRunLoader()->TreeK();
 511     TFile *fileAli=0;
 512     if (fAli) {
 513       fileAli =fAli->GetCurrentFile();
 514       fileAli->cd();
 515     }
 516   } // end if add
 517
 518
 519 }
 520 //______________________________________________________________________
 521 void AliITS::FillModules(TTree *treeH, Int_t mask) {
 522     // fill the modules with the sorted by module hits;
 523     // can be called many times to do a merging
 524     // Inputs:
 525     //      TTree *treeH  The tree containing the hits to be copied into
 526     //                    the modules.
 527     //      Int_t mask    The track number mask to indecate which file
 528     //                    this hits came from.
 529     // Outputs:
 530     //      none.
 531     // Return:
 532     //      none.
 533
 534     if (treeH == 0x0)
 535      {
 536        AliError("Tree H  is NULL");
 537        return;
 538      }
 539     Int_t lay,lad,det,index;
 540     AliITShit *itsHit=0;
 541     AliITSmodule *mod=0;
 542     char branchname[21];
 543     snprintf(branchname,20,"%s",GetName());
 544     TBranch *branch = treeH->GetBranch(branchname);
 545     if (!branch) {
 546         Error("FillModules","%s branch in TreeH not found",branchname);
 547         return;
 548     } // end if !branch
 549     branch->SetAddress(&fHits);
 550     Int_t nTracks =(Int_t) treeH->GetEntries();
 551     Int_t iPrimTrack,h;
 552     for(iPrimTrack=0; iPrimTrack<nTracks; iPrimTrack++){
 553         ResetHits();
 554         Int_t nBytes = treeH->GetEvent(iPrimTrack);
 555         if (nBytes <= 0) continue;
 556         Int_t nHits = fHits->GetEntriesFast();
 557         for(h=0; h<nHits; h++){
 558             itsHit = (AliITShit *)fHits->UncheckedAt(h);
 559             itsHit->GetDetectorID(lay,lad,det);
 560             if (GetITSgeom()) {
 561                 index = GetITSgeom()->GetModuleIndex(lay,lad,det);
 562             } else {
 563                 index=det-1; // This should not be used.
 564             } // end if [You must have fITSgeom for this to work!]
 565             mod = GetModule(index);
 566             itsHit->SetTrack(itsHit->GetTrack()+mask); // Set track mask.
 567             mod->AddHit(itsHit,iPrimTrack,h);
 568         } // end loop over hits
 569     } // end loop over tracks
 570 }
 571
 572 //______________________________________________________________________
 573 Bool_t AliITS::InitModules(Int_t size,Int_t &nmodules){
 574     // Initialize the modules array.
 575     // Inputs:
 576     //      Int_t size  Size of array of the number of modules to be
 577     //                  created. If size <=0 then the number of modules
 578     //                  is gotten from AliITSgeom class kept in fITSgeom.
 579     // Outputs:
 580     //      Int_t &nmodules The number of modules existing.
 581     // Return:
 582     //      none.
 583
 584     if(fITSmodules){
 585         fITSmodules->Delete();
 586         delete fITSmodules;
 587     } // end fir fITSmoudles
 588
 589     if(!fDetTypeSim) {
 590       Error("InitModules","fDetTypeSim is null!");
 591       return kFALSE;
 592     }
 593     if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 594
 595     Int_t nl,indexMAX,index;
 596
 597     if(size<=0){ // default to using data stored in AliITSgeom
 598         if(fDetTypeSim->GetITSgeom()==0) {
 599             Error("InitModules","fITSgeom not defined");
 600             return kFALSE;
 601         } // end if fITSgeom==0
 602         nl = fDetTypeSim->GetITSgeom()->GetNlayers();
 603         indexMAX = fDetTypeSim->GetITSgeom()->GetIndexMax();
 604         nmodules = indexMAX;
 605         fITSmodules = new TObjArray(indexMAX);
 606         for(index=0;index<indexMAX;index++){
 607             fITSmodules->AddAt( new AliITSmodule(index),index);
 608         } // end for index
 609     }else{
 610         fITSmodules = new TObjArray(size);
 611         for(index=0;index<size;index++) {
 612             fITSmodules->AddAt( new AliITSmodule(index),index);
 613         } // end for index
 614
 615         nmodules = size;
 616     } // end i size<=0
 617     return kTRUE;
 618 }
 619 //______________________________________________________________________
 620 void AliITS::Hits2SDigits(){
 621     // Standard Hits to summable Digits function.
 622     // Inputs:
 623     //      none.
 624     // Outputs:
 625     //      none.
 626
 627
 628    if(!fDetTypeSim) {
 629      Error("Hits2SDigits","fDetTypeSim is null!");
 630      return;
 631   }
 632
 633   SetDefaults();
 634   fLoader->LoadHits("read");
 635   fLoader->LoadSDigits("recreate");
 636   AliRunLoader* rl = fLoader->GetRunLoader();
 637   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 638   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 639
 640   for (Int_t iEvent = 0; iEvent < rl->GetNumberOfEvents(); iEvent++) {
 641         // Do the Hits to Digits operation. Use Standard input values.
 642         // Event number from file, no background hit merging , use size from
 643         // AliITSgeom class, option="All", input from this file only.
 644     rl->GetEvent(iEvent);
 645     if (!fLoader->TreeS()) fLoader->MakeTree("S");
 646     MakeBranch("S");
 647     SetTreeAddress();
 648     HitsToPreDigits(iEvent,0,-1," ",fOpt," ");
 649   } // end for iEvent
 650
 651   fLoader->UnloadHits();
 652   fLoader->UnloadSDigits();
 653
 654 }
 655 //______________________________________________________________________
 656 void AliITS::Hits2Digits(){
 657
 658   //Conversion from hits to digits
 659   if(!fDetTypeSim) {
 660     Error("Hits2SDigits","fDetTypeSim is 0!");
 661     return;
 662   }
 663
 664   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 665   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 666   SetDefaults();
 667
 668   fLoader->LoadHits("read");
 669   fLoader->LoadDigits("recreate");
 670   AliRunLoader* rl = fLoader->GetRunLoader();
 671   for (Int_t iEvent = 0; iEvent < rl->GetNumberOfEvents(); iEvent++) {
 672     rl->GetEvent(iEvent);
 673     if (!fLoader->TreeD()) fLoader->MakeTree("D");
 674     MakeBranch("D");
 675     SetTreeAddress();
 676     HitsToDigits(iEvent,0,-1," ",fOpt," ");
 677   }
 678
 679   fLoader->UnloadHits();
 680   fLoader->UnloadDigits();
 681
 682 }
 683
 684 //______________________________________________________________________
 685 void AliITS::HitsToDigits(Int_t evNumber,Int_t bgrev,Int_t size,
 686                           Option_t *option,Option_t *opt,
 687                           const char *filename){
 688     //   Keep galice.root for signal and name differently the file for
 689     // background when add! otherwise the track info for signal will be lost !
 690     // the condition below will disappear when the geom class will be
 691     // initialized for all versions - for the moment it is only for v5 !
 692     // 7 is the SDD beam test version.
 693     // Inputs:
 694     //      Int_t evnt       Event to be processed.
 695     //      Int_t bgrev      Background Hit tree number.
 696     //      Int_t nmodules   Not used.
 697     //      Option_t *option String indicating if merging hits or not. To
 698     //                       merge hits set equal to "Add". Otherwise no
 699     //                       background hits are considered.
 700     //      Test_t *filename File name containing the background hits..
 701     // Outputs:
 702     //      none.
 703     // Return:
 704     //      none.
 705
 706   if(!fDetTypeSim) {
 707     Error("HitsToDigits","fDetTypeSim is null!");
 708     return;
 709   }
 710   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 711   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 712   if(!GetITSgeom()) return; // need transformations to do digitization.
 713   AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
 714
 715   const char *all = strstr(opt,"All");
 716   const char *det[3] = {strstr(opt,"SPD"),strstr(opt,"SDD"),
 717                         strstr(opt,"SSD")};
 718   static Bool_t setDef=kTRUE;
 719   if (setDef) SetDefaultSimulation();
 720   setDef=kFALSE;
 721
 722   Int_t nmodules;
 723   InitModules(size,nmodules);
 724   FillModules(evNumber,bgrev,nmodules,option,filename);
 725
 726   // Reset Fast-OR signals for this event
 727   fDetTypeSim->ResetFOSignals();
 728
 729   AliITSsimulation *sim      = 0;
 730   AliITSmodule     *mod      = 0;
 731   Int_t id;
 732   for(Int_t module=0;module<geom->GetIndexMax();module++){
 733     id       = geom->GetModuleType(module);
 734     if (!all && !det[id]) continue;
 735     sim      = (AliITSsimulation*)fDetTypeSim->GetSimulationModel(id);
 736     if (!sim) {
 737       Error("HitsToDigits","The simulation class was not "
 738             "instanciated for module %d type %s!",module,
 739             geom->GetModuleTypeName(module));
 740       exit(1);
 741     } // end if !sim
 742     mod      = (AliITSmodule *)fITSmodules->At(module);
 743     sim->DigitiseModule(mod,module,evNumber);
 744     // fills all branches - wasted disk space
 745     fLoader->TreeD()->Fill();
 746     ResetDigits();
 747   } // end for module
 748
 749   ClearModules();
 750
 751   // Add Fast-OR signals to event (only one object per event)
 752   if (all || det[0]) { // SPD present
 753     WriteFOSignals();
 754   }
 755
 756   fLoader->TreeD()->GetEntries();
 757   fLoader->TreeD()->AutoSave();
 758   // reset tree
 759   fLoader->TreeD()->Reset();
 760 }
 761 //_____________________________________________________________________
 762 void AliITS::Hits2PreDigits(){
 763   // Turn hits into SDigits
 764
 765   if(!fDetTypeSim) {
 766     Error("Hits2SDigits","fDetTypeSim is 0!");
 767     return;
 768   }
 769
 770   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 771   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 772   SetDefaults();
 773
 774   HitsToPreDigits(fLoader->GetRunLoader()->GetEventNumber(),
 775                   0,-1," ",fOpt," ");
 776 }
 777
 778 //______________________________________________________________________
 779 void AliITS::HitsToPreDigits(Int_t evNumber,Int_t bgrev,Int_t size,
 780                              Option_t *option,Option_t *opt,
 781                              const char *filename){
 782     //   Keep galice.root for signal and name differently the file for
 783     // background when add! otherwise the track info for signal will be lost !
 784     // the condition below will disappear when the geom class will be
 785     // initialized for all versions - for the moment it is only for v5 !
 786     // 7 is the SDD beam test version.
 787     // Inputs:
 788     //      Int_t evnt       Event to be processed.
 789     //      Int_t bgrev      Background Hit tree number.
 790     //      Int_t nmodules   Not used.
 791     //      Option_t *option String indicating if merging hits or not. To
 792     //                       merge hits set equal to "Add". Otherwise no
 793     //                       background hits are considered.
 794     //      Test_t *filename File name containing the background hits..
 795     // Outputs:
 796     //      none.
 797     // Return:
 798     //      none.
 799
 800
 801   if(!fDetTypeSim) {
 802     Error("HitsToPreDigits","fDetTypeSim is null!");
 803     return;
 804   }
 805   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 806   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 807
 808   if(!GetITSgeom()){
 809     Error("HitsToPreDigits","fGeom is null!");
 810     return; // need transformations to do digitization.
 811   }
 812   AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
 813
 814   const char *all = strstr(opt,"All");
 815   const char *det[3] = {strstr(opt,"SPD"),strstr(opt,"SDD"),
 816                         strstr(opt,"SSD")};
 817   static Bool_t setDef=kTRUE;
 818   if (setDef) SetDefaultSimulation();
 819   setDef=kFALSE;
 820
 821   Int_t nmodules;
 822   InitModules(size,nmodules);
 823   FillModules(evNumber,bgrev,nmodules,option,filename);
 824
 825
 826   AliITSsimulation *sim      = 0;
 827   AliITSmodule     *mod      = 0;
 828   Int_t id,module;
 829   for(module=0;module<geom->GetIndexMax();module++){
 830     id       = geom->GetModuleType(module);
 831     if (!all && !det[id]) continue;
 832     sim      = (AliITSsimulation*)GetSimulationModel(id);
 833     if (!sim) {
 834       Error("HitsToPreDigits","The simulation class was not "
 835             "instanciated for module %d type %s!",module,
 836             geom->GetModuleTypeName(module));
 837       exit(1);
 838     } // end if !sim
 839     mod      = (AliITSmodule *)fITSmodules->At(module);
 840     sim->SDigitiseModule(mod,module,evNumber);
 841     // fills all branches - wasted disk space
 842     fLoader->TreeS()->Fill();
 843     fDetTypeSim->ResetSDigits();
 844   } // end for module
 845
 846   ClearModules();
 847
 848
 849   fLoader->TreeS()->GetEntries();
 850   fLoader->TreeS()->AutoSave();
 851   fLoader->WriteSDigits("OVERWRITE");
 852   // reset tree
 853   fLoader->TreeS()->Reset();
 854 }
 855
 856 //_____________________________________________________________________
 857 void AliITS::HitsToFastRecPoints(Int_t evNumber,Int_t bgrev,Int_t size,
 858                                   Option_t *opt0,Option_t *opt1,
 859                                  const char *flnm){
 860     // keep galice.root for signal and name differently the file for
 861     // background when add! otherwise the track info for signal will be lost !
 862     // the condition below will disappear when the geom class will be
 863     // initialized for all versions - for the moment it is only for v5 !
 864     // Inputs:
 865     //      Int_t evnt       Event to be processed.
 866     //      Int_t bgrev      Background Hit tree number.
 867     //      Int_t size       Size used by InitModules. See InitModules.
 868     //      Option_t *opt0   Option passed to FillModules. See FillModules.
 869     //      Option_t *opt1   String indicating if merging hits or not. To
 870     //                       merge hits set equal to "Add". Otherwise no
 871     //                       background hits are considered.
 872     //      Test_t *flnm     File name containing the background hits..
 873     // Outputs:
 874     //      none.
 875     // Return:
 876     //      none.
 877
 878
 879
 880   if(!GetITSgeom()){
 881     Error("HitsToPreDigits","fGeom is null!");
 882     return; // need transformations to do digitization.
 883   }
 884   AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
 885
 886   AliITSLoader *pITSloader = (AliITSLoader*)fLoader;
 887
 888   const char *all = strstr(opt1,"All");
 889   const char *det[3] ={strstr(opt1,"SPD"),strstr(opt1,"SDD"),
 890                        strstr(opt1,"SSD")};
 891   Int_t nmodules;
 892   InitModules(size,nmodules);
 893   FillModules(evNumber,bgrev,nmodules,opt0,flnm);
 894
 895   AliITSsimulation *sim      = 0;
 896   AliITSmodule     *mod      = 0;
 897   Int_t id,module;
 898
 899   TTree *lTR = pITSloader->TreeR();
 900   if(!lTR) {
 901     pITSloader->MakeTree("R");
 902     lTR = pITSloader->TreeR();
 903   }
 904
 905   TClonesArray* ptarray = new TClonesArray("AliITSRecPoint",1000);
 906   TBranch* branch = (TBranch*)lTR->Branch("ITSRecPointsF",&ptarray);
 907   branch->SetAddress(&ptarray);
 908   //m.b. : this change is nothing but a nice way to make sure
 909   //the CPU goes up !
 910   for(module=0;module<geom->GetIndexMax();module++){
 911     id       = geom->GetModuleType(module);
 912     if (!all && !det[id]) continue;
 913     sim      = (AliITSsimulation*)GetSimulationModel(id);
 914     if (!sim) {
 915       Error("HitsToFastPoints","The simulation class was not "
 916             "instantiated for module %d type %s!",module,
 917             geom->GetModuleTypeName(module));
 918       exit(1);
 919     } // end if !sim
 920     mod      = (AliITSmodule *)fITSmodules->At(module);
 921     sim->CreateFastRecPoints(mod,module,gRandom,ptarray);
 922     lTR->Fill();
 923     ptarray->Clear();
 924   } // end for module
 925
 926   ClearModules();
 927   fLoader->WriteRecPoints("OVERWRITE");
 928   delete ptarray;
 929 }
 930 //_____________________________________________________________________
 931 Int_t AliITS::Hits2Clusters(TTree *hTree, TTree *cTree) {
 932   //------------------------------------------------------------
 933   // This function creates ITS clusters
 934   //------------------------------------------------------------
 935   if(!GetITSgeom()){
 936     Error("HitsToPreDigits","fGeom is null!");
 937     return 1; // need transformations to do digitization.
 938   }
 939   AliITSgeom *geom=GetITSgeom();
 940   Int_t mmax=geom->GetIndexMax();
 941
 942   InitModules(-1,mmax);
 943   FillModules(hTree,0);
 944
 945   TClonesArray *points = new TClonesArray("AliITSRecPoint",1000);
 946   TBranch *branch=cTree->GetBranch("ITSRecPoints");
 947   if (!branch) cTree->Branch("ITSRecPoints",&points);
 948   else branch->SetAddress(&points);
 949
 950   AliITSsimulationFastPoints sim;
 951   Int_t ncl=0;
 952   for (Int_t m=0; m<mmax; m++) {
 953     AliITSmodule *mod=GetModule(m);
 954     sim.CreateFastRecPoints(mod,m,gRandom,points);
 955     ncl+=points->GetEntriesFast();
 956     cTree->Fill();
 957     points->Clear();
 958   }
 959
 960   AliDebug(1,Form("Number of found fast clusters : %d",ncl));
 961
 962   //cTree->Write();
 963
 964   delete points;
 965   return 0;
 966 }
 967
 968 //_____________________________________________________________________
 969 void AliITS::CheckLabels(Int_t lab[3]) const {
 970   //------------------------------------------------------------
 971   // Tries to find mother's labels
 972   //------------------------------------------------------------
 973
 974   if(lab[0]<0 && lab[1]<0 && lab[2]<0) return; // In case of no labels just exit
 975
 976   Int_t ntracks = gAlice->GetMCApp()->GetNtrack();
 977   for (Int_t i=0;i<3;i++){
 978     Int_t label = lab[i];
 979     if (label>=0 && label<ntracks) {
 980       TParticle *part=(TParticle*)gAlice->GetMCApp()->Particle(label);
 981       if (part->P() < 0.005) {
 982         Int_t m=part->GetFirstMother();
 983         if (m<0) {
 984           continue;
 985         }
 986         if (part->GetStatusCode()>0) {
 987           continue;
 988         }
 989         lab[i]=m;
 990       }
 991     }
 992   }
 993
 994 }
 995
 996 //______________________________________________________________________
 997 void AliITS::SDigitsToDigits(Option_t *opt){
 998   // Standard Summable digits to Digits function.
 999   // Inputs:
1000   //      none.
1001   // Outputs:
1002   //      none.
1003   if (!fDetTypeSim) {
1004     AliError("fDetTypeSim is 0!");
1005     return;
1006   }
1007   const char *all = strstr(opt,"All");
1008   const char *det[3] ={strstr(opt,"SPD"),strstr(opt,"SDD"),
1009                        strstr(opt,"SSD")};
1010
1011   // Reset Fast-OR signals for this event
1012   fDetTypeSim->ResetFOSignals();
1013
1014   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
1015   SetDefaults();
1016   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
1017   fDetTypeSim->SDigitsToDigits(opt,(Char_t*)GetName());
1018
1019   // Add Fast-OR signals to event (only one object per event)
1020   if (all || det[0]) { // SPD present
1021    WriteFOSignals();
1022   }
1023 }
1024
1025 //______________________________________________________________________
1026 void AliITS::ResetDigits(){
1027     // Reset number of digits and the digits array for the ITS detector.
1028     // Inputs:
1029     //      none.
1030     // Outputs:
1031     //      none.
1032     if(!fDetTypeSim) {
1033       Error("ResetDigits","fDetTypeSim is 0!");
1034       return;
1035     }
1036
1037     fDetTypeSim->ResetDigits();
1038
1039
1040 }
1041 //______________________________________________________________________
1042 void AliITS::ResetDigits(Int_t branch){
1043     // Reset number of digits and the digits array for this branch.
1044     // Inputs:
1045     //      none.
1046     // Outputs:
1047     //      none.
1048
1049     if(!fDetTypeSim) {
1050       Error("ResetDigits","fDetTypeSim is 0!");
1051       return;
1052     }
1053
1054     fDetTypeSim->ResetDigits(branch);
1055
1056 }
1057 //______________________________________________________________________
1058 void AliITS::AddSumDigit(AliITSpListItem &sdig){
1059     // Adds the a module full of summable digits to the summable digits tree.
1060     // Inputs:
1061     //      AliITSpListItem &sdig   SDigit to be added to SDigits tree.
1062     // Outputs:
1063     //      none.
1064     // Return:
1065     //      none.
1066
1067     if(!fDetTypeSim) {
1068       Error("AddSumDigit","fDetTypeSim is 0!");
1069       return;
1070     }
1071     fDetTypeSim->AddSumDigit(sdig);
1072
1073 }
1074 //______________________________________________________________________
1075 void AliITS::AddSimDigit(Int_t branch, AliITSdigit *d){
1076     //    Add a simulated digit.
1077     // Inputs:
1078     //      Int_t id        Detector type number.
1079     //      AliITSdigit *d  Digit to be added to the Digits Tree. See
1080     //                      AliITSdigit.h
1081     // Outputs:
1082     //      none.
1083     // Return:
1084     //      none.
1085
1086     if(!fDetTypeSim) {
1087       Error("AddSimDigit","fDetTypeSim is 0!");
1088       return;
1089     }
1090     fDetTypeSim->AddSimDigit(branch,d);
1091
1092 }
1093 //______________________________________________________________________
1094 void AliITS::AddSimDigit(Int_t branch,Float_t phys,Int_t *digits,Int_t *tracks,
1095                          Int_t *hits,Float_t *charges, Int_t sigexpanded){
1096   //   Add a simulated digit to the list.
1097   // Inputs:
1098   //      Int_t id        Detector type number.
1099   //      Float_t phys    Physics indicator. See AliITSdigits.h
1100   //      Int_t *digits   Integer array containing the digits info. See
1101   //                      AliITSdigit.h
1102   //      Int_t *tracks   Integer array [AliITSdigitS?D::GetNTracks()]
1103   //                      containing the track numbers that contributed to
1104   //                      this digit.
1105   //      Int_t *hits     Integer array [AliITSdigitS?D::GetNTracks()]
1106   //                      containing the hit numbers, from AliITSmodule, that
1107   //                      contributed to this digit.
1108   //      Float_t *charge Floating point array of the signals contributed
1109   //                      to this digit by each track.
1110   // Outputs:
1111   //      none.
1112   // Return:
1113   //      none.
1114
1115     if(!fDetTypeSim) {
1116       Error("AddSimDigit","fDetTypeSim is 0!");
1117       return;
1118     }
1119     fDetTypeSim->AddSimDigit(branch,phys,digits,tracks,hits,charges,sigexpanded);
1120
1121 }
1122 //______________________________________________________________________
1123 void AliITS::Digits2Raw(){
1124     // convert digits of the current event to raw data
1125
1126   if(!fDetTypeSim) {
1127     Error("Digits2Raw","fDetTypeSim is 0!");
1128     return;
1129   }
1130   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
1131   SetDefaults();
1132   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
1133   fDetTypeSim->GetLoader()->LoadDigits();
1134   TTree* digits = fDetTypeSim->GetLoader()->TreeD();
1135   if (!digits) {
1136       Error("Digits2Raw", "no digits tree");
1137       return;
1138   }
1139   fDetTypeSim->SetTreeAddressD(digits,(Char_t*)GetName());
1140
1141    // Get the FO signals for this event
1142   AliITSFOSignalsSPD* foSignals = NULL;
1143   AliRunLoader* runLoader = AliRunLoader::Instance();
1144   AliITSLoader* itsLoader = (AliITSLoader*) runLoader->GetLoader("ITSLoader");
1145   if (!itsLoader) {
1146     AliError("ITS loader is NULL.");
1147   }
1148    else {
1149       if(!itsLoader->TreeD()) AliError("   !!! No TreeD available !!!");
1150       foSignals = (AliITSFOSignalsSPD*)itsLoader->TreeD()->GetUserInfo()->FindObject("AliITSFOSignalsSPD");
1151       if(!foSignals) AliError("FO signals not retrieved");
1152      }
1153
1154   Bool_t deleteFOsignalsLater = kFALSE;
1155   if (!foSignals) {
1156     AliError("FO signals not available. No FO bits will be written.");
1157     foSignals = new AliITSFOSignalsSPD(); // make a temporary dummy signals object
1158     deleteFOsignalsLater = kTRUE;
1159   }
1160
1161
1162   AliITSDDLModuleMapSDD* ddlsdd=fDetTypeSim->GetDDLModuleMapSDD();
1163   Char_t rawSDD=fDetTypeSim->GetSimuParam()->GetSDDRawDataFormat();
1164   AliITSDDLRawData rawWriter;
1165
1166   rawWriter.SetSDDRawFormat(rawSDD);
1167   //Verbose level
1168   // 0: Silent
1169   // 1: cout messages
1170   // 2: txt files with digits
1171   //BE CAREFUL, verbose level 2 MUST be used only for debugging and
1172   //it is highly suggested to use this mode only for debugging digits files
1173   //reasonably small, because otherwise the size of the txt files can reach
1174   //quickly several MB wasting time and disk space.
1175   rawWriter.SetVerbose(0);
1176
1177   //SILICON PIXEL DETECTOR
1178   AliDebug(1,"Formatting raw data for SPD");
1179   rawWriter.RawDataSPD(digits->GetBranch("ITSDigitsSPD"),foSignals);
1180   if(deleteFOsignalsLater) delete foSignals;
1181
1182   //SILICON DRIFT DETECTOR
1183   AliDebug(1,Form("Formatting raw data for SDD - Format code =%d",rawSDD));
1184   rawWriter.RawDataSDD(digits->GetBranch("ITSDigitsSDD"),ddlsdd);
1185
1186   //SILICON STRIP DETECTOR
1187   AliDebug(1,"Formatting raw data for SSD");
1188   rawWriter.RawDataSSD(digits->GetBranch("ITSDigitsSSD"));
1189
1190   fLoader->UnloadDigits();
1191 }
1192 //______________________________________________________________________
1193 AliLoader* AliITS::MakeLoader(const char* topfoldername){
1194     //builds ITSgetter (AliLoader type)
1195     //if detector wants to use castomized getter, it must overload this method
1196
1197     AliDebug(1,Form("Creating AliITSLoader. Top folder is %s.",
1198          topfoldername));
1199     fLoader = new AliITSLoader(GetName(),topfoldername);
1200     return fLoader;
1201 }
1202 //______________________________________________________________________
1203 Bool_t AliITS::Raw2SDigits(AliRawReader* rawReader)
1204 {
1205   //
1206   // Converts RAW data to SDigits
1207   //
1208   // Get TreeS
1209   //
1210   Int_t last   = -1;
1211   Int_t size   = AliITSgeomTGeo::GetNModules();
1212   if(!fModA) {
1213     fModA = new TClonesArray*[size];
1214     for (Int_t mod = 0; mod < size; mod++) fModA[mod] = new TClonesArray("AliITSpListItem", 10000);
1215   }
1216   AliLoader* loader =  (AliRunLoader::Instance())->GetLoader("ITSLoader");
1217   if (!loader){
1218     Error("Open","Can not get ITS loader from Run Loader");
1219     return kFALSE;
1220   }
1221
1222   TTree* tree = 0;
1223   tree = loader->TreeS();
1224   if (!tree){
1225     loader->MakeTree("S");
1226     tree = loader->TreeS();
1227   }
1228   //
1229   // Array for SDigits
1230   //
1231   if(!fpSDigits){
1232     fpSDigits = new TClonesArray("AliITSpListItem",10000);
1233   }
1234   TClonesArray& aSDigits = *fpSDigits;
1235   Int_t bufsize = 32000;
1236   tree->Branch("ITS", &fpSDigits, bufsize);
1237   Int_t npx = 0;
1238   //
1239   // SPD
1240   //
1241   AliITSsegmentationSPD* segSPD = (AliITSsegmentationSPD*) fDetTypeSim->GetSegmentationModel(0);
1242   if(!segSPD){
1243     AliWarning("Set AliITS defaults");
1244     SetDefaults();
1245     segSPD = (AliITSsegmentationSPD*) fDetTypeSim->GetSegmentationModel(0);
1246   }
1247   npx = segSPD->Npx();
1248   Double_t thr, sigma;
1249
1250   AliITSRawStreamSPD inputSPD(rawReader);
1251   while(1){
1252     Bool_t next  = inputSPD.Next();
1253     if (!next) break;
1254
1255     Int_t module = inputSPD.GetModuleID();
1256     Int_t column = inputSPD.GetColumn();
1257     Int_t row    = inputSPD.GetRow();
1258     Int_t index  = npx * column + row;
1259
1260     if (module >= size) continue;
1261
1262     last = (fModA[module])->GetEntries();
1263     TClonesArray& dum = *fModA[module];
1264     fDetTypeSim->GetSimuParam()->SPDThresholds(module,thr,sigma);
1265     thr += 1.;
1266     new (dum[last]) AliITSpListItem(-1, -1, module, index, thr);
1267   }
1268   rawReader->Reset();
1269
1270   //
1271   // SDD
1272   //
1273   AliITSsegmentationSDD* segSDD = (AliITSsegmentationSDD*) fDetTypeSim->GetSegmentationModel(1);
1274   npx = segSDD->Npx();
1275   Int_t scalef=AliITSsimulationSDD::ScaleFourier(segSDD);
1276   Int_t firstSDD=AliITSgeomTGeo::GetModuleIndex(3,1,1);
1277   Int_t firstSSD=AliITSgeomTGeo::GetModuleIndex(5,1,1);
1278
1279   AliITSRawStream* inputSDD=AliITSRawStreamSDD::CreateRawStreamSDD(rawReader);
1280   for(Int_t iMod=firstSDD; iMod<firstSSD; iMod++){
1281     AliITSCalibrationSDD* cal = (AliITSCalibrationSDD*)fDetTypeSim->GetCalibrationModel(iMod);
1282     Bool_t isZeroSupp=cal->GetZeroSupp();
1283     if(isZeroSupp){
1284       for(Int_t iSid=0; iSid<2; iSid++) inputSDD->SetZeroSuppLowThreshold(iMod-firstSDD,iSid,cal->GetZSLowThreshold(iSid));
1285     }else{
1286       for(Int_t iSid=0; iSid<2; iSid++) inputSDD->SetZeroSuppLowThreshold(iMod-firstSDD,iSid,0);
1287     }
1288   }
1289
1290   AliITSDDLModuleMapSDD* ddlmap=fDetTypeSim->GetDDLModuleMapSDD();
1291   inputSDD->SetDDLModuleMap(ddlmap);
1292   while(inputSDD->Next()){
1293     if(inputSDD->IsCompletedModule()==kFALSE &&
1294        inputSDD->IsCompletedDDL()==kFALSE){
1295
1296       Int_t module = inputSDD->GetModuleID();
1297       Int_t anode  = inputSDD->GetCoord1()+segSDD->NpzHalf()*inputSDD->GetChannel();
1298       Int_t time   = inputSDD->GetCoord2();
1299       Int_t signal10 = inputSDD->GetSignal();
1300       Int_t index = AliITSpList::GetIndex(anode,time,scalef*npx);
1301
1302       if (module >= size) continue;
1303       last = fModA[module]->GetEntries();
1304       TClonesArray& dum = *fModA[module];
1305       new (dum[last]) AliITSpListItem(-1, -1, module, index, Double_t(signal10));
1306       ((AliITSpListItem*) dum.At(last))->AddSignalAfterElect(module, index, Double_t(signal10));
1307     }
1308   }
1309   delete inputSDD;
1310   rawReader->Reset();
1311
1312   //
1313   // SSD
1314   //
1315   AliITSsegmentationSSD* segSSD = (AliITSsegmentationSSD*) fDetTypeSim->GetSegmentationModel(2);
1316   npx = segSSD->Npx();
1317   AliITSRawStreamSSD inputSSD(rawReader);
1318   while(1){
1319     Bool_t next  = inputSSD.Next();
1320     if (!next) break;
1321
1322     Int_t module  = inputSSD.GetModuleID();
1323     if(module<0)AliError(Form("Invalid SSD  module %d \n",module));
1324     if(module<0)continue;
1325     Int_t side    = inputSSD.GetSideFlag();
1326     Int_t strip   = inputSSD.GetStrip();
1327     Int_t signal  = inputSSD.GetSignal();
1328     Int_t index  = npx * side + strip;
1329
1330     if (module >= size) continue;
1331
1332     last = fModA[module]->GetEntries();
1333     TClonesArray& dum = *fModA[module];
1334     new (dum[last]) AliITSpListItem(-1, -1, module, index, Double_t(signal));
1335   }
1336   rawReader->Reset();
1337   AliITSpListItem* sdig = 0;
1338
1339   Int_t firstssd = GetITSgeom()->GetStartDet(kSSD);
1340   Double_t adcToEv = 1.;
1341   for (Int_t mod = 0; mod < size; mod++)
1342     {
1343       if(mod>=firstssd) {
1344         AliITSCalibrationSSD* calssd = (AliITSCalibrationSSD*)fDetTypeSim->GetCalibrationModel(mod);
1345         adcToEv = 1./calssd->GetSSDDEvToADC(1.);
1346       }
1347       Int_t nsdig =  fModA[mod]->GetEntries();
1348       for (Int_t ie = 0; ie < nsdig; ie++) {
1349         sdig = (AliITSpListItem*) (fModA[mod]->At(ie));
1350         Double_t digsig = sdig->GetSignal();
1351         if(mod>=firstssd) digsig*=adcToEv; // for SSD: convert back charge from ADC to electron
1352         new (aSDigits[ie]) AliITSpListItem(-1, -1, mod, sdig->GetIndex(), digsig);
1353         Float_t sig = sdig->GetSignalAfterElect();
1354         if(mod>=firstssd) sig*=adcToEv;
1355         if (sig > 0.) {
1356           sdig = (AliITSpListItem*)aSDigits[ie];
1357           sdig->AddSignalAfterElect(mod, sdig->GetIndex(), Double_t(sig));
1358         }
1359       }
1360
1361       tree->Fill();
1362       aSDigits.Clear();
1363       fModA[mod]->Clear();
1364     }
1365   loader->WriteSDigits("OVERWRITE");
1366   return kTRUE;
1367 }
1368
1369 //______________________________________________________________________
1370 void AliITS::UpdateInternalGeometry(){
1371   //reads new geometry from TGeo
1372 //   AliDebug(1,"Delete ITSgeom and create a new one reading TGeo");
1373
1374   AliITSVersion_t version = (AliITSVersion_t)IsVersion();
1375   Int_t minor = 0;
1376   AliITSInitGeometry initgeom;
1377   AliITSgeom* geom = initgeom.CreateAliITSgeom(version,minor);
1378   SetITSgeom(geom);
1379 }
1380 //______________________________________________________________________
1381 AliTriggerDetector* AliITS::CreateTriggerDetector() const {
1382   // create an AliITSTrigger object (and set trigger conditions as input)
1383   return new AliITSTrigger(fDetTypeSim->GetTriggerConditions());
1384 }
1385 //______________________________________________________________________
1386 void AliITS::WriteFOSignals(){
1387 // This method write FO signals in Digits tree both in Hits2Digits
1388 // or SDigits2Digits
1389
1390   fDetTypeSim->ProcessNoiseForFastOr();
1391   fDetTypeSim->WriteFOSignals();
1392 }