ITS/AliITS.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
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   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
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  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18
  19 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  20 //                                                                           //
  21 //      An overview of the basic philosophy of the ITS code development      //
  22 // and analysis is show in the figure below.                                 //
  23 //Begin_Html                                                                 //
  24 /*
  25 <img src="picts/ITS/ITS_Analysis_schema.gif">
  26 </pre>
  27 <br clear=left>
  28 <font size=+2 color=red>
  29 <p>Roberto Barbera is in charge of the ITS Offline code (1999).
  30 <a href="mailto:roberto.barbera@ct.infn.it">Roberto Barbera</a>.
  31 </font>
  32 <pre>
  33 */
  34 //End_Html
  35 //
  36 //  AliITS. Inner Traking System base class.
  37 //  This class contains the base procedures for the Inner Tracking System
  38 //
  39 //Begin_Html
  40 /*
  41 <img src="picts/ITS/AliITS_Class_Diagram.gif">
  42 </pre>
  43 <br clear=left>
  44 <font size=+2 color=red>
  45 <p>This show the class diagram of the different elements that are part of
  46 the AliITS class.
  47 </font>
  48 <pre>
  49 */
  50 //End_Html
  51 //
  52 // Version: 0
  53 // Written by Rene Brun, Federico Carminati, and Roberto Barbera
  54 //
  55 // Version: 1
  56 // Modified and documented by Bjorn S. Nilsen
  57 // July 11 1999
  58 //
  59 // Version: 2
  60 // Modified and documented by A. Bologna
  61 // October 18 1999
  62 //
  63 // AliITS is the general base class for the ITS. Also see AliDetector for
  64 // futher information.
  65 //
  66 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  67
  68 #include <stdlib.h>
  69 #include <TClonesArray.h>
  70 #include <TFile.h>
  71 #include <TParticle.h>
  72 #include <TString.h>
  73 #include <TTree.h>
  74 #include <TVirtualMC.h>
  75 #include "AliDetector.h"
  76 #include "AliITS.h"
  77 #include "AliITSDetTypeSim.h"
  78 #include "AliITSDDLRawData.h"
  79 #include "AliITSLoader.h"
  80 #include "AliITShit.h"
  81 #include "AliITSmodule.h"
  82 #include "AliITSpListItem.h"
  83 #include "AliITSsimulation.h"
  84 #include "AliITSsimulationFastPoints.h"
  85 #include "AliMC.h"
  86 #include "AliITSDigitizer.h"
  87 #include "AliITSRecPoint.h"
  88 #include "AliITSsegmentationSPD.h"
  89 #include "AliITSsegmentationSDD.h"
  90 #include "AliITSsimulationSDD.h"
  91 #include "AliITSCalibrationSDD.h"
  92 #include "AliITSCalibrationSSD.h"
  93 #include "AliITSsegmentationSSD.h"
  94 #include "AliITSRawStreamSPD.h"
  95 #include "AliITSRawStreamSSD.h"
  96 #include "AliITSRawStreamSDD.h"
  97 #include "AliRawReader.h"
  98 #include "AliRun.h"
  99 #include "AliLog.h"
 100 #include "AliITSInitGeometry.h"
 101 #include "AliITSFOSignalsSPD.h"
 102
 103 ClassImp(AliITS)
 104
 105 //______________________________________________________________________
 106 AliITS::AliITS() : AliDetector(),
 107 fDetTypeSim(0),
 108 fEuclidOut(0),
 109 fOpt("All"),
 110 fIdN(0),
 111 fIdSens(0),
 112 fIdName(0),
 113 fITSmodules(0),
 114 fTiming(kFALSE),
 115 fSimuParam(0)
 116 {
 117   // Default initializer for ITS
 118   //      The default constructor of the AliITS class. In addition to
 119   // creating the AliITS class it zeros the variables fIshunt (a member
 120   // of AliDetector class), fEuclidOut, and fIdN, and zeros the pointers
 121   // fIdSens, and fIdName. The AliDetector default constructor
 122   // is also called.
 123
 124 //    SetDetectors(); // default to fOpt="All". This variable not written out.
 125 //PH    SetMarkerColor(kRed);
 126 }
 127 //______________________________________________________________________
 128 AliITS::AliITS(const Char_t *title):
 129   AliDetector("ITS",title),
 130   fDetTypeSim(0),
 131   fEuclidOut(0),
 132   fOpt("All"),
 133   fIdN(0),
 134   fIdSens(0),
 135   fIdName(0),
 136   fITSmodules(0),
 137   fTiming(kFALSE),
 138   fSimuParam(0)
 139 {
 140     //     The standard Constructor for the ITS class.
 141     // It also zeros the variables
 142     // fIshunt (a member of AliDetector class), fEuclidOut, and zeros
 143     // the pointers fIdSens and fIdName. To help in displaying hits via the
 144     // ROOT macro display.C AliITS also sets the marker color to red. The
 145     // variables passes with this constructor, const char *name and *title,
 146     // are used by the constructor of AliDetector class. See AliDetector
 147     // class for a description of these parameters and its constructor
 148     // functions.
 149     // Inputs:
 150     //   Char_t *title  Simulation title for the ITS
 151     // Outputs:
 152     //   none.
 153     // Return:
 154     //   none.
 155
 156     fHits = new TClonesArray("AliITShit",1560); // from AliDetector
 157     if(gAlice->GetMCApp()) gAlice->GetMCApp()->AddHitList(fHits);
 158     //fNhits=0;  //done in AliDetector(name,title)
 159     SetDetectors(); // default to fOpt="All". This variable not written out.
 160     fDetTypeSim   = new AliITSDetTypeSim();
 161     //PH  SetMarkerColor(kRed);
 162     if(!fLoader) MakeLoader(AliConfig::GetDefaultEventFolderName());
 163     fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 164 }
 165 //______________________________________________________________________
 166 AliITS::AliITS(const char *name, const char *title):
 167   AliDetector(name,title),
 168   fDetTypeSim(0),
 169   fEuclidOut(0),
 170   fOpt("All"),
 171   fIdN(0),
 172   fIdSens(0),
 173   fIdName(0),
 174   fITSmodules(0),
 175   fTiming(kFALSE),
 176   fSimuParam(0)
 177 {
 178   //     The standard Constructor for the ITS class.
 179   // It also zeros the variables
 180   // fIshunt (a member of AliDetector class), fEuclidOut, and zeros
 181   // the pointers fIdSens and fIdName. To help in displaying hits via the
 182   // ROOT macro display.C AliITS also sets the marker color to red. The
 183   // variables passes with this constructor, const char *name and *title,
 184   // are used by the constructor of AliDetector class. See AliDetector
 185   // class for a description of these parameters and its constructor
 186   // functions.
 187
 188   fHits = new TClonesArray("AliITShit",1560);
 189   if(gAlice->GetMCApp()) gAlice->GetMCApp()->AddHitList(fHits);
 190   //fNhits=0;  //done in AliDetector(name,title)
 191
 192   SetDetectors(); // default to fOpt="All". This variable not written out.
 193
 194   fDetTypeSim   = new AliITSDetTypeSim();
 195   //PH  SetMarkerColor(kRed);
 196   if(!fLoader) MakeLoader(AliConfig::GetDefaultEventFolderName());
 197   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 198
 199 }
 200 //______________________________________________________________________
 201 AliITS::~AliITS(){
 202     // Default destructor for ITS.
 203     //     The default destructor of the AliITS class. In addition to deleting
 204     // the AliITS class it deletes the memory pointed to by
 205     // fIdSens, fIdName, fDetTypeSim and it's contents.
 206     // Inputs:
 207     //      none.
 208     // Outputs:
 209     //      none.
 210     // Return:
 211     //      none.
 212
 213     if (fHits) {
 214       fHits->Delete();
 215       delete fHits;
 216       fHits=0;
 217     }
 218     if(fITSmodules) {
 219         this->ClearModules();
 220         delete fITSmodules;
 221         fITSmodules = 0;
 222     }// end if fITSmodules!=0
 223
 224     delete[] fIdName;  // Array of TStrings
 225     delete[] fIdSens;
 226
 227     if (fDetTypeSim){
 228       delete fDetTypeSim;
 229       fDetTypeSim = 0;
 230     }
 231     if(fSimuParam){
 232       delete fSimuParam;
 233       fSimuParam=0;
 234     }
 235 }
 236 //______________________________________________________________________
 237 AliDigitizer* AliITS::CreateDigitizer(AliRunDigitizer* manager)const{
 238     // Creates the AliITSDigitizer in a standard way for use via AliModule.
 239     // This function can not be included in the .h file because of problems
 240     // with the order of inclusion (recursive).
 241     // Inputs:
 242     //    AliRunDigitizer *manager  The Manger class for Digitization
 243     // Output:
 244     //    none.
 245     // Return:
 246     //    A new AliITSRunDigitizer (cast as a AliDigitizer).
 247
 248      return new AliITSDigitizer(manager);
 249 }
 250 //______________________________________________________________________
 251 void AliITS::Init(){
 252     // Initializer ITS after it has been built
 253     //     This routine initializes the AliITS class. It is intended to be
 254     // called from the Init function in AliITSv?. Besides displaying a banner
 255     // indicating that it has been called it initializes the array fIdSens
 256     // and sets the default segmentation, response, digit and raw cluster
 257     // classes therefore it should be called after a call to CreateGeometry.
 258     // Inputs:
 259     //      none.
 260     // Outputs:
 261     //      none.
 262     // Return:
 263     //      none.
 264     Int_t i;
 265     // Array of TStrings
 266     if(gMC) for(i=0;i<fIdN;i++) fIdSens[i] = gMC->VolId(fIdName[i]);
 267
 268 }
 269 //______________________________________________________________________
 270 void AliITS::SetDefaults(){
 271     // sets the default segmentation, response, digit and raw cluster classes.
 272     // Inputs:
 273     //      none.
 274     // Outputs:
 275     //      none.
 276     // Return:
 277     //      none.
 278     AliInfoClass("AliITS::Setting Defaults");
 279     if(!fDetTypeSim) {
 280      Error("SetDefaults()","fDetTypeSim is 0!");
 281      return;
 282     }
 283
 284     fDetTypeSim->SetDefaults();
 285     if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 286
 287 }
 288 //______________________________________________________________________
 289 void AliITS::SetDefaultSimulation(){
 290     // sets the default simulation.
 291     // Inputs:
 292     //      none.
 293     // Outputs:
 294     //      none.
 295     // Return:
 296     //      none.
 297     if(!fDetTypeSim) {
 298      Error("SetDefaultSimulation()","fDetTypeSim is 0!");
 299      return;
 300     }
 301
 302     fDetTypeSim->SetDefaultSimulation();
 303     if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 304
 305 }
 306
 307
 308 //______________________________________________________________________
 309 void AliITS::MakeBranch(Option_t* option){
 310     // Creates Tree branches for the ITS.
 311     // Inputs:
 312     //      Option_t *option    String of Tree types S,D, and/or R.
 313     //      const char *file    String of the file name where these branches
 314     //                          are to be stored. If blank then these branches
 315     //                          are written to the same tree as the Hits were
 316     //                          read from.
 317     // Outputs:
 318     //      none.
 319     // Return:
 320     //      none.
 321   if(!fDetTypeSim) {
 322     Error("MakeBranch","fDetTypeSim is 0!");
 323     return;
 324   }
 325
 326   Bool_t cH = (strstr(option,"H")!=0);
 327   Bool_t cS = (strstr(option,"S")!=0);
 328   Bool_t cD = (strstr(option,"D")!=0);
 329
 330   if(cH && (fHits == 0x0)) fHits = new TClonesArray("AliITShit", 1560);
 331   AliDetector::MakeBranch(option);
 332
 333   if(cS) MakeBranchS(0);
 334   if(cD) MakeBranchD(0);
 335
 336
 337 }
 338 //___________________________________________________________________
 339 void AliITS::MakeBranchS(const char* fl){
 340
 341   // Creates Tree Branch for the ITS summable digits.
 342   // Inputs:
 343   //      cont char *fl  File name where SDigits branch is to be written
 344   //                     to. If blank it write the SDigits to the same
 345   //                     file in which the Hits were found.
 346
 347
 348   if(!fDetTypeSim){
 349     Error("MakeBranchS","fDetTypeSim is 0!");
 350   }
 351   Int_t buffersize = 4000;
 352   char branchname[30];
 353
 354   // only one branch for SDigits.
 355   sprintf(branchname,"%s",GetName());
 356
 357   if(fLoader->TreeS()){
 358     TClonesArray* sdig = (TClonesArray*)fDetTypeSim->GetSDigits();
 359     MakeBranchInTree(fLoader->TreeS(),branchname,&sdig,buffersize,fl);
 360   }
 361 }
 362 //______________________________________________________________________
 363 void AliITS::MakeBranchD(const char* file){
 364
 365   //Make branch for digits
 366   if(!fDetTypeSim) {
 367     Warning("MakeBranchD","fDetTypeSim is 0!");
 368     return;
 369   }
 370   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 371   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 372   MakeBranchInTreeD(fLoader->TreeD(),file);
 373 }
 374
 375 //___________________________________________________________________
 376 void AliITS:: MakeBranchInTreeD(TTree* treeD, const char* file){
 377   // Creates Tree branches for the ITS.
 378
 379   if(!fDetTypeSim){
 380     Error("MakeBranchS","fDetTypeSim is 0!");
 381   }
 382   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 383   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 384
 385   const Char_t *det[3] = {"SPD","SDD","SSD"};
 386   const Char_t* digclass;
 387   Int_t buffersize = 4000;
 388   Char_t branchname[30];
 389
 390   if(!fDetTypeSim->GetDigits()){
 391     fDetTypeSim->SetDigits(new TObjArray(fgkNTYPES));
 392   }
 393   for(Int_t i=0;i<fgkNTYPES;i++){
 394     digclass = fDetTypeSim->GetDigitClassName(i);
 395     TString classn = digclass;
 396     if(!((fDetTypeSim->GetDigits())->At(i))){
 397       (fDetTypeSim->GetDigits())->AddAt(new TClonesArray(classn.Data(),1000),i);
 398     }
 399     else ResetDigits(i);
 400     if(fgkNTYPES==3) sprintf(branchname,"%sDigits%s",GetName(),det[i]);
 401     else sprintf(branchname,"%sDigits%d",GetName(),i+1);
 402     TObjArray* dig = DigitsAddress(i);
 403     if(GetDigits() && treeD) AliDetector::MakeBranchInTree(treeD,branchname, &dig,buffersize,file);
 404   }
 405
 406 }
 407 //______________________________________________________________________
 408 void AliITS::SetTreeAddress(){
 409     // Set branch address for the Trees.
 410     // Inputs:
 411     //      none.
 412     // Outputs:
 413     //      none.
 414     // Return:
 415     //      none.
 416
 417   if(!fDetTypeSim) {
 418     Error("SetTreeAddress","fDetTypeSim is 0!");
 419     return;
 420   }
 421
 422   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 423   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 424
 425   TTree *treeS = fLoader->TreeS();
 426   TTree *treeD = fLoader->TreeD();
 427   if (fLoader->TreeH() && (fHits == 0x0)) {
 428       fHits = new TClonesArray("AliITShit", 1560);
 429   }
 430   AliDetector::SetTreeAddress();
 431
 432   fDetTypeSim->SetTreeAddressS(treeS, (Char_t*)GetName());
 433   fDetTypeSim->SetTreeAddressD(treeD, (Char_t*)GetName());
 434 }
 435 //______________________________________________________________________
 436 void AliITS::AddHit(Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits){
 437     // Add an ITS hit
 438     //     The function to add information to the AliITShit class. See the
 439     // AliITShit class for a full description. This function allocates the
 440     // necessary new space for the hit information and passes the variable
 441     // track, and the pointers *vol and *hits to the AliITShit constructor
 442     // function.
 443     // Inputs:
 444     //      Int_t   track   Track number which produced this hit.
 445     //      Int_t   *vol    Array of Integer Hit information. See AliITShit.h
 446     //      Float_t *hits   Array of Floating Hit information.  see AliITShit.h
 447     // Outputs:
 448     //      none.
 449     // Return:
 450     //      none.
 451   TClonesArray &lhits = *fHits;
 452   new(lhits[fNhits++]) AliITShit(fIshunt,track,vol,hits);
 453 }
 454
 455 //______________________________________________________________________
 456 void AliITS::FillModules(Int_t evnt,Int_t bgrev,Int_t nmodules,
 457                          Option_t *option, const char *filename){
 458   // fill the modules with the sorted by module hits; add hits from
 459   // background if option=Add.
 460
 461   static TTree *trH1;                 //Tree with background hits
 462   static Bool_t first=kTRUE;
 463   static TFile *file;
 464   const char *addBgr = strstr(option,"Add");
 465
 466   evnt = nmodules; // Dummy use of variables to remove warnings
 467   if (addBgr ) {
 468     if(first) {
 469       file=new TFile(filename);
 470     } // end if first
 471     first=kFALSE;
 472     file->cd();
 473     file->ls();
 474     // Get Hits Tree header from file
 475     if(trH1) delete trH1;
 476     trH1=0;
 477
 478     char treeName[20];
 479     sprintf(treeName,"TreeH%d",bgrev);
 480     trH1 = (TTree*)gDirectory->Get(treeName);
 481     if (!trH1) {
 482       Error("FillModules","cannot find Hits Tree for event:%d",bgrev);
 483     } // end if !trH1
 484     // Set branch addresses
 485   } // end if addBgr
 486
 487   FillModules(fLoader->TreeH(),0); // fill from this file's tree.
 488
 489   if (addBgr ) {
 490     FillModules(trH1,10000000); // Default mask 10M.
 491     TTree *fAli=fLoader->GetRunLoader()->TreeK();
 492     TFile *fileAli=0;
 493     if (fAli) fileAli =fAli->GetCurrentFile();
 494     fileAli->cd();
 495   } // end if add
 496
 497
 498 }
 499 //______________________________________________________________________
 500 void AliITS::FillModules(TTree *treeH, Int_t mask) {
 501     // fill the modules with the sorted by module hits;
 502     // can be called many times to do a merging
 503     // Inputs:
 504     //      TTree *treeH  The tree containing the hits to be copied into
 505     //                    the modules.
 506     //      Int_t mask    The track number mask to indecate which file
 507     //                    this hits came from.
 508     // Outputs:
 509     //      none.
 510     // Return:
 511     //      none.
 512
 513     if (treeH == 0x0)
 514      {
 515        Error("FillModules","Tree is NULL");
 516      }
 517     Int_t lay,lad,det,index;
 518     AliITShit *itsHit=0;
 519     AliITSmodule *mod=0;
 520     char branchname[20];
 521     sprintf(branchname,"%s",GetName());
 522     TBranch *branch = treeH->GetBranch(branchname);
 523     if (!branch) {
 524         Error("FillModules","%s branch in TreeH not found",branchname);
 525         return;
 526     } // end if !branch
 527     branch->SetAddress(&fHits);
 528     Int_t nTracks =(Int_t) treeH->GetEntries();
 529     Int_t iPrimTrack,h;
 530     for(iPrimTrack=0; iPrimTrack<nTracks; iPrimTrack++){
 531         ResetHits();
 532         Int_t nBytes = treeH->GetEvent(iPrimTrack);
 533         if (nBytes <= 0) continue;
 534         Int_t nHits = fHits->GetEntriesFast();
 535         for(h=0; h<nHits; h++){
 536             itsHit = (AliITShit *)fHits->UncheckedAt(h);
 537             itsHit->GetDetectorID(lay,lad,det);
 538             if (GetITSgeom()) {
 539                 index = GetITSgeom()->GetModuleIndex(lay,lad,det);
 540             } else {
 541                 index=det-1; // This should not be used.
 542             } // end if [You must have fITSgeom for this to work!]
 543             mod = GetModule(index);
 544             itsHit->SetTrack(itsHit->GetTrack()+mask); // Set track mask.
 545             mod->AddHit(itsHit,iPrimTrack,h);
 546         } // end loop over hits
 547     } // end loop over tracks
 548 }
 549
 550 //______________________________________________________________________
 551 Bool_t AliITS::InitModules(Int_t size,Int_t &nmodules){
 552     // Initialize the modules array.
 553     // Inputs:
 554     //      Int_t size  Size of array of the number of modules to be
 555     //                  created. If size <=0 then the number of modules
 556     //                  is gotten from AliITSgeom class kept in fITSgeom.
 557     // Outputs:
 558     //      Int_t &nmodules The number of modules existing.
 559     // Return:
 560     //      none.
 561
 562     if(fITSmodules){
 563         fITSmodules->Delete();
 564         delete fITSmodules;
 565     } // end fir fITSmoudles
 566
 567     if(!fDetTypeSim) {
 568       Error("InitModules","fDetTypeSim is null!");
 569       return kFALSE;
 570     }
 571     if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 572
 573     Int_t nl,indexMAX,index;
 574
 575     if(size<=0){ // default to using data stored in AliITSgeom
 576         if(fDetTypeSim->GetITSgeom()==0) {
 577             Error("InitModules","fITSgeom not defined");
 578             return kFALSE;
 579         } // end if fITSgeom==0
 580         nl = fDetTypeSim->GetITSgeom()->GetNlayers();
 581         indexMAX = fDetTypeSim->GetITSgeom()->GetIndexMax();
 582         nmodules = indexMAX;
 583         fITSmodules = new TObjArray(indexMAX);
 584         for(index=0;index<indexMAX;index++){
 585             fITSmodules->AddAt( new AliITSmodule(index),index);
 586         } // end for index
 587     }else{
 588         fITSmodules = new TObjArray(size);
 589         for(index=0;index<size;index++) {
 590             fITSmodules->AddAt( new AliITSmodule(index),index);
 591         } // end for index
 592
 593         nmodules = size;
 594     } // end i size<=0
 595     return kTRUE;
 596 }
 597 //______________________________________________________________________
 598 void AliITS::Hits2SDigits(){
 599     // Standard Hits to summable Digits function.
 600     // Inputs:
 601     //      none.
 602     // Outputs:
 603     //      none.
 604
 605
 606    if(!fDetTypeSim) {
 607      Error("Hits2SDigits","fDetTypeSim is null!");
 608      return;
 609   }
 610
 611   SetDefaults();
 612   fLoader->LoadHits("read");
 613   fLoader->LoadSDigits("recreate");
 614   AliRunLoader* rl = fLoader->GetRunLoader();
 615   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 616   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 617
 618   for (Int_t iEvent = 0; iEvent < rl->GetNumberOfEvents(); iEvent++) {
 619         // Do the Hits to Digits operation. Use Standard input values.
 620         // Event number from file, no background hit merging , use size from
 621         // AliITSgeom class, option="All", input from this file only.
 622     rl->GetEvent(iEvent);
 623     if (!fLoader->TreeS()) fLoader->MakeTree("S");
 624     MakeBranch("S");
 625     SetTreeAddress();
 626     HitsToPreDigits(iEvent,0,-1," ",fOpt," ");
 627   } // end for iEvent
 628
 629   fLoader->UnloadHits();
 630   fLoader->UnloadSDigits();
 631
 632 }
 633 //______________________________________________________________________
 634 void AliITS::Hits2Digits(){
 635
 636   //Conversion from hits to digits
 637   if(!fDetTypeSim) {
 638     Error("Hits2SDigits","fDetTypeSim is 0!");
 639     return;
 640   }
 641
 642   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 643   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 644   SetDefaults();
 645
 646   fLoader->LoadHits("read");
 647   fLoader->LoadDigits("recreate");
 648   AliRunLoader* rl = fLoader->GetRunLoader();
 649   for (Int_t iEvent = 0; iEvent < rl->GetNumberOfEvents(); iEvent++) {
 650     rl->GetEvent(iEvent);
 651     if (!fLoader->TreeD()) fLoader->MakeTree("D");
 652     MakeBranch("D");
 653     SetTreeAddress();
 654     HitsToDigits(iEvent,0,-1," ",fOpt," ");
 655   }
 656
 657   fLoader->UnloadHits();
 658   fLoader->UnloadDigits();
 659
 660 }
 661
 662 //______________________________________________________________________
 663 void AliITS::HitsToDigits(Int_t evNumber,Int_t bgrev,Int_t size,
 664                           Option_t *option,Option_t *opt,
 665                           const char *filename){
 666     //   Keep galice.root for signal and name differently the file for
 667     // background when add! otherwise the track info for signal will be lost !
 668     // the condition below will disappear when the geom class will be
 669     // initialized for all versions - for the moment it is only for v5 !
 670     // 7 is the SDD beam test version.
 671     // Inputs:
 672     //      Int_t evnt       Event to be processed.
 673     //      Int_t bgrev      Background Hit tree number.
 674     //      Int_t nmodules   Not used.
 675     //      Option_t *option String indicating if merging hits or not. To
 676     //                       merge hits set equal to "Add". Otherwise no
 677     //                       background hits are considered.
 678     //      Test_t *filename File name containing the background hits..
 679     // Outputs:
 680     //      none.
 681     // Return:
 682     //      none.
 683
 684   if(!fDetTypeSim) {
 685     Error("HitsToDigits","fDetTypeSim is null!");
 686     return;
 687   }
 688   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 689   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 690   if(!GetITSgeom()) return; // need transformations to do digitization.
 691   AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
 692
 693   const char *all = strstr(opt,"All");
 694   const char *det[3] = {strstr(opt,"SPD"),strstr(opt,"SDD"),
 695                         strstr(opt,"SSD")};
 696   static Bool_t setDef=kTRUE;
 697   if (setDef) SetDefaultSimulation();
 698   setDef=kFALSE;
 699
 700   Int_t nmodules;
 701   InitModules(size,nmodules);
 702   FillModules(evNumber,bgrev,nmodules,option,filename);
 703
 704   // Reset Fast-OR signals for this event
 705   fDetTypeSim->ResetFOSignals();
 706
 707   AliITSsimulation *sim      = 0;
 708   AliITSmodule     *mod      = 0;
 709   Int_t id;
 710   for(Int_t module=0;module<geom->GetIndexMax();module++){
 711     id       = geom->GetModuleType(module);
 712     if (!all && !det[id]) continue;
 713     sim      = (AliITSsimulation*)fDetTypeSim->GetSimulationModel(id);
 714     if (!sim) {
 715       Error("HitsToDigits","The simulation class was not "
 716             "instanciated for module %d type %s!",module,
 717             geom->GetModuleTypeName(module));
 718       exit(1);
 719     } // end if !sim
 720     mod      = (AliITSmodule *)fITSmodules->At(module);
 721     sim->DigitiseModule(mod,module,evNumber);
 722     // fills all branches - wasted disk space
 723     fLoader->TreeD()->Fill();
 724     ResetDigits();
 725   } // end for module
 726
 727   ClearModules();
 728
 729   // Add random noise to FO signals
 730   if (all || det[0]) { // SPD present
 731     fDetTypeSim->ProcessNoiseForFastOr();
 732   }
 733
 734   // Add Fast-OR signals to event (only one object per event)
 735   if (all || det[0]) { // SPD present
 736     fDetTypeSim->WriteFOSignals();
 737   }
 738
 739
 740   fLoader->TreeD()->GetEntries();
 741   fLoader->TreeD()->AutoSave();
 742   // reset tree
 743   fLoader->TreeD()->Reset();
 744 }
 745 //_____________________________________________________________________
 746 void AliITS::Hits2PreDigits(){
 747   // Turn hits into SDigits
 748
 749   if(!fDetTypeSim) {
 750     Error("Hits2SDigits","fDetTypeSim is 0!");
 751     return;
 752   }
 753
 754   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 755   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 756   SetDefaults();
 757
 758   HitsToPreDigits(fLoader->GetRunLoader()->GetEventNumber(),
 759                   0,-1," ",fOpt," ");
 760 }
 761
 762 //______________________________________________________________________
 763 void AliITS::HitsToPreDigits(Int_t evNumber,Int_t bgrev,Int_t size,
 764                              Option_t *option,Option_t *opt,
 765                              const char *filename){
 766     //   Keep galice.root for signal and name differently the file for
 767     // background when add! otherwise the track info for signal will be lost !
 768     // the condition below will disappear when the geom class will be
 769     // initialized for all versions - for the moment it is only for v5 !
 770     // 7 is the SDD beam test version.
 771     // Inputs:
 772     //      Int_t evnt       Event to be processed.
 773     //      Int_t bgrev      Background Hit tree number.
 774     //      Int_t nmodules   Not used.
 775     //      Option_t *option String indicating if merging hits or not. To
 776     //                       merge hits set equal to "Add". Otherwise no
 777     //                       background hits are considered.
 778     //      Test_t *filename File name containing the background hits..
 779     // Outputs:
 780     //      none.
 781     // Return:
 782     //      none.
 783
 784
 785   if(!fDetTypeSim) {
 786     Error("HitsToPreDigits","fDetTypeSim is null!");
 787     return;
 788   }
 789   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
 790   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 791
 792   if(!GetITSgeom()){
 793     Error("HitsToPreDigits","fGeom is null!");
 794     return; // need transformations to do digitization.
 795   }
 796   AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
 797
 798   const char *all = strstr(opt,"All");
 799   const char *det[3] = {strstr(opt,"SPD"),strstr(opt,"SDD"),
 800                         strstr(opt,"SSD")};
 801   static Bool_t setDef=kTRUE;
 802   if (setDef) SetDefaultSimulation();
 803   setDef=kFALSE;
 804
 805   Int_t nmodules;
 806   InitModules(size,nmodules);
 807   FillModules(evNumber,bgrev,nmodules,option,filename);
 808
 809
 810   AliITSsimulation *sim      = 0;
 811   AliITSmodule     *mod      = 0;
 812   Int_t id,module;
 813   for(module=0;module<geom->GetIndexMax();module++){
 814     id       = geom->GetModuleType(module);
 815     if (!all && !det[id]) continue;
 816     sim      = (AliITSsimulation*)GetSimulationModel(id);
 817     if (!sim) {
 818       Error("HitsToPreDigits","The simulation class was not "
 819             "instanciated for module %d type %s!",module,
 820             geom->GetModuleTypeName(module));
 821       exit(1);
 822     } // end if !sim
 823     mod      = (AliITSmodule *)fITSmodules->At(module);
 824     sim->SDigitiseModule(mod,module,evNumber);
 825     // fills all branches - wasted disk space
 826     fLoader->TreeS()->Fill();
 827     fDetTypeSim->ResetSDigits();
 828   } // end for module
 829
 830   ClearModules();
 831
 832
 833   fLoader->TreeS()->GetEntries();
 834   fLoader->TreeS()->AutoSave();
 835   fLoader->WriteSDigits("OVERWRITE");
 836   // reset tree
 837   fLoader->TreeS()->Reset();
 838 }
 839
 840 //_____________________________________________________________________
 841 void AliITS::HitsToFastRecPoints(Int_t evNumber,Int_t bgrev,Int_t size,
 842                                   Option_t *opt0,Option_t *opt1,
 843                                  const char *flnm){
 844     // keep galice.root for signal and name differently the file for
 845     // background when add! otherwise the track info for signal will be lost !
 846     // the condition below will disappear when the geom class will be
 847     // initialized for all versions - for the moment it is only for v5 !
 848     // Inputs:
 849     //      Int_t evnt       Event to be processed.
 850     //      Int_t bgrev      Background Hit tree number.
 851     //      Int_t size       Size used by InitModules. See InitModules.
 852     //      Option_t *opt0   Option passed to FillModules. See FillModules.
 853     //      Option_t *opt1   String indicating if merging hits or not. To
 854     //                       merge hits set equal to "Add". Otherwise no
 855     //                       background hits are considered.
 856     //      Test_t *flnm     File name containing the background hits..
 857     // Outputs:
 858     //      none.
 859     // Return:
 860     //      none.
 861
 862
 863
 864   if(!GetITSgeom()){
 865     Error("HitsToPreDigits","fGeom is null!");
 866     return; // need transformations to do digitization.
 867   }
 868   AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
 869
 870   AliITSLoader *pITSloader = (AliITSLoader*)fLoader;
 871
 872   const char *all = strstr(opt1,"All");
 873   const char *det[3] ={strstr(opt1,"SPD"),strstr(opt1,"SDD"),
 874                        strstr(opt1,"SSD")};
 875   Int_t nmodules;
 876   InitModules(size,nmodules);
 877   FillModules(evNumber,bgrev,nmodules,opt0,flnm);
 878
 879   AliITSsimulation *sim      = 0;
 880   AliITSmodule     *mod      = 0;
 881   Int_t id,module;
 882
 883   TTree *lTR = pITSloader->TreeR();
 884   if(!lTR) {
 885     pITSloader->MakeTree("R");
 886     lTR = pITSloader->TreeR();
 887   }
 888
 889   TClonesArray* ptarray = new TClonesArray("AliITSRecPoint",1000);
 890   TBranch* branch = (TBranch*)lTR->Branch("ITSRecPointsF",&ptarray);
 891   branch->SetAddress(&ptarray);
 892   //m.b. : this change is nothing but a nice way to make sure
 893   //the CPU goes up !
 894   for(module=0;module<geom->GetIndexMax();module++){
 895     id       = geom->GetModuleType(module);
 896     if (!all && !det[id]) continue;
 897     sim      = (AliITSsimulation*)GetSimulationModel(id);
 898     if (!sim) {
 899       Error("HitsToFastPoints","The simulation class was not "
 900             "instanciated for module %d type %x!",module,
 901             geom->GetModuleTypeName(module));
 902       exit(1);
 903     } // end if !sim
 904     mod      = (AliITSmodule *)fITSmodules->At(module);
 905     sim->CreateFastRecPoints(mod,module,gRandom,ptarray);
 906     lTR->Fill();
 907     ptarray->Clear();
 908   } // end for module
 909
 910   ClearModules();
 911   fLoader->WriteRecPoints("OVERWRITE");
 912   delete ptarray;
 913 }
 914 //_____________________________________________________________________
 915 Int_t AliITS::Hits2Clusters(TTree *hTree, TTree *cTree) {
 916   //------------------------------------------------------------
 917   // This function creates ITS clusters
 918   //------------------------------------------------------------
 919   if(!GetITSgeom()){
 920     Error("HitsToPreDigits","fGeom is null!");
 921     return 1; // need transformations to do digitization.
 922   }
 923   AliITSgeom *geom=GetITSgeom();
 924   Int_t mmax=geom->GetIndexMax();
 925
 926   InitModules(-1,mmax);
 927   FillModules(hTree,0);
 928
 929   TClonesArray *points = new TClonesArray("AliITSRecPoint",1000);
 930   TBranch *branch=cTree->GetBranch("ITSRecPoints");
 931   if (!branch) cTree->Branch("ITSRecPoints",&points);
 932   else branch->SetAddress(&points);
 933
 934   AliITSsimulationFastPoints sim;
 935   Int_t ncl=0;
 936   for (Int_t m=0; m<mmax; m++) {
 937     AliITSmodule *mod=GetModule(m);
 938     sim.CreateFastRecPoints(mod,m,gRandom,points);
 939     ncl+=points->GetEntriesFast();
 940     cTree->Fill();
 941     points->Clear();
 942   }
 943
 944   AliDebug(1,Form("Number of found fast clusters : %d",ncl));
 945
 946   //cTree->Write();
 947
 948   delete points;
 949   return 0;
 950 }
 951
 952 //_____________________________________________________________________
 953 void AliITS::CheckLabels(Int_t lab[3]) const {
 954   //------------------------------------------------------------
 955   // Tries to find mother's labels
 956   //------------------------------------------------------------
 957
 958   if(lab[0]<0 && lab[1]<0 && lab[2]<0) return; // In case of no labels just exit
 959
 960   Int_t ntracks = gAlice->GetMCApp()->GetNtrack();
 961   for (Int_t i=0;i<3;i++){
 962     Int_t label = lab[i];
 963     if (label>=0 && label<ntracks) {
 964       TParticle *part=(TParticle*)gAlice->GetMCApp()->Particle(label);
 965       if (part->P() < 0.005) {
 966         Int_t m=part->GetFirstMother();
 967         if (m<0) {
 968           continue;
 969         }
 970         if (part->GetStatusCode()>0) {
 971           continue;
 972         }
 973         lab[i]=m;
 974       }
 975     }
 976   }
 977
 978 }
 979
 980 //______________________________________________________________________
 981 void AliITS::SDigitsToDigits(Option_t *opt){
 982   // Standard Summable digits to Digits function.
 983   // Inputs:
 984   //      none.
 985   // Outputs:
 986   //      none.
 987   if (!fDetTypeSim) {
 988     AliError("fDetTypeSim is 0!");
 989     return;
 990   }
 991
 992   const char *all = strstr(opt,"All");
 993   const char *det[3] ={strstr(opt,"SPD"),strstr(opt,"SDD"),
 994                        strstr(opt,"SSD")};
 995
 996   // Reset Fast-OR signals for this event
 997   fDetTypeSim->ResetFOSignals();
 998
 999   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
1000   SetDefaults();
1001   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
1002   fDetTypeSim->SDigitsToDigits(opt,(Char_t*)GetName());
1003
1004   // Add random noise to FO signals
1005   if (all || det[0]) { // SPD present
1006     fDetTypeSim->ProcessNoiseForFastOr();
1007   }
1008   // Add Fast-OR signals to event (only one object per event)
1009   if (all || det[0]) { // SPD present
1010     fDetTypeSim->WriteFOSignals();
1011   }
1012 }
1013
1014 //______________________________________________________________________
1015 void AliITS::ResetDigits(){
1016     // Reset number of digits and the digits array for the ITS detector.
1017     // Inputs:
1018     //      none.
1019     // Outputs:
1020     //      none.
1021     if(!fDetTypeSim) {
1022       Error("ResetDigits","fDetTypeSim is 0!");
1023       return;
1024     }
1025
1026     fDetTypeSim->ResetDigits();
1027
1028
1029 }
1030 //______________________________________________________________________
1031 void AliITS::ResetDigits(Int_t branch){
1032     // Reset number of digits and the digits array for this branch.
1033     // Inputs:
1034     //      none.
1035     // Outputs:
1036     //      none.
1037
1038     if(!fDetTypeSim) {
1039       Error("ResetDigits","fDetTypeSim is 0!");
1040       return;
1041     }
1042
1043     fDetTypeSim->ResetDigits(branch);
1044
1045 }
1046 //______________________________________________________________________
1047 void AliITS::AddSumDigit(AliITSpListItem &sdig){
1048     // Adds the a module full of summable digits to the summable digits tree.
1049     // Inputs:
1050     //      AliITSpListItem &sdig   SDigit to be added to SDigits tree.
1051     // Outputs:
1052     //      none.
1053     // Return:
1054     //      none.
1055
1056     if(!fDetTypeSim) {
1057       Error("AddSumDigit","fDetTypeSim is 0!");
1058       return;
1059     }
1060     fDetTypeSim->AddSumDigit(sdig);
1061
1062 }
1063 //______________________________________________________________________
1064 void AliITS::AddSimDigit(Int_t branch, AliITSdigit *d){
1065     //    Add a simulated digit.
1066     // Inputs:
1067     //      Int_t id        Detector type number.
1068     //      AliITSdigit *d  Digit to be added to the Digits Tree. See
1069     //                      AliITSdigit.h
1070     // Outputs:
1071     //      none.
1072     // Return:
1073     //      none.
1074
1075     if(!fDetTypeSim) {
1076       Error("AddSimDigit","fDetTypeSim is 0!");
1077       return;
1078     }
1079     fDetTypeSim->AddSimDigit(branch,d);
1080
1081 }
1082 //______________________________________________________________________
1083 void AliITS::AddSimDigit(Int_t branch,Float_t phys,Int_t *digits,Int_t *tracks,
1084                          Int_t *hits,Float_t *charges, Int_t sigexpanded){
1085   //   Add a simulated digit to the list.
1086   // Inputs:
1087   //      Int_t id        Detector type number.
1088   //      Float_t phys    Physics indicator. See AliITSdigits.h
1089   //      Int_t *digits   Integer array containing the digits info. See
1090   //                      AliITSdigit.h
1091   //      Int_t *tracks   Integer array [AliITSdigitS?D::GetNTracks()]
1092   //                      containing the track numbers that contributed to
1093   //                      this digit.
1094   //      Int_t *hits     Integer array [AliITSdigitS?D::GetNTracks()]
1095   //                      containing the hit numbers, from AliITSmodule, that
1096   //                      contributed to this digit.
1097   //      Float_t *charge Floating point array of the signals contributed
1098   //                      to this digit by each track.
1099   // Outputs:
1100   //      none.
1101   // Return:
1102   //      none.
1103
1104     if(!fDetTypeSim) {
1105       Error("AddSimDigit","fDetTypeSim is 0!");
1106       return;
1107     }
1108     fDetTypeSim->AddSimDigit(branch,phys,digits,tracks,hits,charges,sigexpanded);
1109
1110 }
1111 //______________________________________________________________________
1112 void AliITS::Digits2Raw(){
1113     // convert digits of the current event to raw data
1114
1115   if(!fDetTypeSim) {
1116     Error("Digits2Raw","fDetTypeSim is 0!");
1117     return;
1118   }
1119   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
1120   SetDefaults();
1121   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
1122   fDetTypeSim->GetLoader()->LoadDigits();
1123   TTree* digits = fDetTypeSim->GetLoader()->TreeD();
1124   if (!digits) {
1125       Error("Digits2Raw", "no digits tree");
1126       return;
1127   }
1128   fDetTypeSim->SetTreeAddressD(digits,(Char_t*)GetName());
1129
1130    // Get the FO signals for this event
1131   AliITSFOSignalsSPD* foSignals = NULL;
1132   AliRunLoader* runLoader = AliRunLoader::Instance();
1133   AliITSLoader* itsLoader = (AliITSLoader*) runLoader->GetLoader("ITSLoader");
1134   if (!itsLoader) {
1135     AliError("ITS loader is NULL.");
1136   }
1137    else {
1138       if(!itsLoader->TreeD()) AliError("   !!! No TreeD available !!!");
1139       foSignals = (AliITSFOSignalsSPD*)itsLoader->TreeD()->GetUserInfo()->FindObject("AliITSFOSignalsSPD");
1140       if(!foSignals) AliError("FO signals not retrieved");
1141      }
1142
1143   Bool_t deleteFOsignalsLater = kFALSE;
1144   if (!foSignals) {
1145     AliError("FO signals not available. No FO bits will be written.");
1146     foSignals = new AliITSFOSignalsSPD(); // make a temporary dummy signals object
1147     deleteFOsignalsLater = kTRUE;
1148   }
1149
1150
1151   AliITSDDLModuleMapSDD* ddlsdd=fDetTypeSim->GetDDLModuleMapSDD();
1152   Char_t rawSDD=fDetTypeSim->GetSimuParam()->GetSDDRawDataFormat();
1153   AliITSDDLRawData rawWriter;
1154
1155   rawWriter.SetSDDRawFormat(rawSDD);
1156   //Verbose level
1157   // 0: Silent
1158   // 1: cout messages
1159   // 2: txt files with digits
1160   //BE CAREFUL, verbose level 2 MUST be used only for debugging and
1161   //it is highly suggested to use this mode only for debugging digits files
1162   //reasonably small, because otherwise the size of the txt files can reach
1163   //quickly several MB wasting time and disk space.
1164   rawWriter.SetVerbose(0);
1165
1166   //SILICON PIXEL DETECTOR
1167   AliDebug(1,"Formatting raw data for SPD");
1168   rawWriter.RawDataSPD(digits->GetBranch("ITSDigitsSPD"),foSignals);
1169   if(deleteFOsignalsLater) delete foSignals;
1170
1171   //SILICON DRIFT DETECTOR
1172   AliDebug(1,Form("Formatting raw data for SDD - Format code =%d",rawSDD));
1173   rawWriter.RawDataSDD(digits->GetBranch("ITSDigitsSDD"),ddlsdd);
1174
1175   //SILICON STRIP DETECTOR
1176   AliDebug(1,"Formatting raw data for SSD");
1177   rawWriter.RawDataSSD(digits->GetBranch("ITSDigitsSSD"));
1178
1179   fLoader->UnloadDigits();
1180 }
1181 //______________________________________________________________________
1182 AliLoader* AliITS::MakeLoader(const char* topfoldername){
1183     //builds ITSgetter (AliLoader type)
1184     //if detector wants to use castomized getter, it must overload this method
1185
1186     AliDebug(1,Form("Creating AliITSLoader. Top folder is %s.",
1187          topfoldername));
1188     fLoader = new AliITSLoader(GetName(),topfoldername);
1189     return fLoader;
1190 }
1191 //______________________________________________________________________
1192 Bool_t AliITS::Raw2SDigits(AliRawReader* rawReader)
1193 {
1194   //
1195   // Converts RAW data to SDigits
1196   //
1197   // Get TreeS
1198   //
1199     Int_t last   = -1;
1200     Int_t size   = GetITSgeom()->GetIndexMax();
1201     TClonesArray** modA = new TClonesArray*[size];
1202     for (Int_t mod = 0; mod < size; mod++) modA[mod] = new TClonesArray("AliITSpListItem", 10000);
1203
1204     AliLoader* loader =  (AliRunLoader::Instance())->GetLoader("ITSLoader");
1205     if (!loader){
1206         Error("Open","Can not get ITS loader from Run Loader");
1207         return kFALSE;
1208     }
1209
1210     TTree* tree = 0;
1211     tree = loader->TreeS();
1212     if (!tree){
1213         loader->MakeTree("S");
1214         tree = loader->TreeS();
1215     }
1216     //
1217     // Array for SDigits
1218     //
1219     TClonesArray aSDigits("AliITSpListItem",10000), *itsSDigits=&aSDigits;
1220     Int_t bufsize = 32000;
1221     tree->Branch("ITS", &itsSDigits, bufsize);
1222     Int_t npx = 0;
1223     //
1224     // SPD
1225     //
1226     AliITSsegmentationSPD* segSPD = (AliITSsegmentationSPD*) fDetTypeSim->GetSegmentationModel(0);
1227     if(!segSPD){
1228       AliWarning("Set AliITS defaults");
1229       SetDefaults();
1230       segSPD = (AliITSsegmentationSPD*) fDetTypeSim->GetSegmentationModel(0);
1231     }
1232     npx = segSPD->Npx();
1233     Double_t thr, sigma;
1234
1235     AliITSRawStreamSPD inputSPD(rawReader);
1236     while(1){
1237         Bool_t next  = inputSPD.Next();
1238         if (!next) break;
1239
1240         Int_t module = inputSPD.GetModuleID();
1241         Int_t column = inputSPD.GetColumn();
1242         Int_t row    = inputSPD.GetRow();
1243         Int_t index  = npx * column + row;
1244
1245         if (module >= size) continue;
1246
1247         last = (modA[module])->GetEntries();
1248         TClonesArray& dum = *modA[module];
1249         fDetTypeSim->GetSimuParam()->SPDThresholds(module,thr,sigma);
1250         thr += 1.;
1251         new (dum[last]) AliITSpListItem(-1, -1, module, index, thr);
1252     }
1253     rawReader->Reset();
1254
1255     //
1256     // SDD
1257     //
1258     AliITSsegmentationSDD* segSDD = (AliITSsegmentationSDD*) fDetTypeSim->GetSegmentationModel(1);
1259     npx = segSDD->Npx();
1260     Int_t scalef=AliITSsimulationSDD::ScaleFourier(segSDD);
1261     Int_t firstSDD=AliITSgeomTGeo::GetModuleIndex(3,1,1);
1262     Int_t firstSSD=AliITSgeomTGeo::GetModuleIndex(5,1,1);
1263
1264     AliITSRawStream* inputSDD=AliITSRawStreamSDD::CreateRawStreamSDD(rawReader);
1265     for(Int_t iMod=firstSDD; iMod<firstSSD; iMod++){
1266       AliITSCalibrationSDD* cal = (AliITSCalibrationSDD*)fDetTypeSim->GetCalibrationModel(iMod);
1267       Bool_t isZeroSupp=cal->GetZeroSupp();
1268       if(isZeroSupp){
1269         for(Int_t iSid=0; iSid<2; iSid++) inputSDD->SetZeroSuppLowThreshold(iMod-firstSDD,iSid,cal->GetZSLowThreshold(iSid));
1270      }else{
1271         for(Int_t iSid=0; iSid<2; iSid++) inputSDD->SetZeroSuppLowThreshold(iMod-firstSDD,iSid,0);
1272       }
1273     }
1274
1275     AliITSDDLModuleMapSDD* ddlmap=fDetTypeSim->GetDDLModuleMapSDD();
1276     inputSDD->SetDDLModuleMap(ddlmap);
1277     while(inputSDD->Next()){
1278         if(inputSDD->IsCompletedModule()==kFALSE &&
1279            inputSDD->IsCompletedDDL()==kFALSE){
1280
1281           Int_t module = inputSDD->GetModuleID();
1282           Int_t anode  = inputSDD->GetCoord1()+segSDD->NpzHalf()*inputSDD->GetChannel();
1283           Int_t time   = inputSDD->GetCoord2();
1284           Int_t signal10 = inputSDD->GetSignal();
1285           Int_t index = AliITSpList::GetIndex(anode,time,scalef*npx);
1286
1287           if (module >= size) continue;
1288           last = modA[module]->GetEntries();
1289           TClonesArray& dum = *modA[module];
1290           new (dum[last]) AliITSpListItem(-1, -1, module, index, Double_t(signal10));
1291           ((AliITSpListItem*) dum.At(last))->AddSignalAfterElect(module, index, Double_t(signal10));
1292         }
1293     }
1294     delete inputSDD;
1295     rawReader->Reset();
1296
1297     //
1298     // SSD
1299     //
1300     AliITSsegmentationSSD* segSSD = (AliITSsegmentationSSD*) fDetTypeSim->GetSegmentationModel(2);
1301     npx = segSSD->Npx();
1302     AliITSRawStreamSSD inputSSD(rawReader);
1303     while(1){
1304         Bool_t next  = inputSSD.Next();
1305         if (!next) break;
1306
1307         Int_t module  = inputSSD.GetModuleID();
1308         Int_t side    = inputSSD.GetSideFlag();
1309         Int_t strip   = inputSSD.GetStrip();
1310         Int_t signal  = inputSSD.GetSignal();
1311         Int_t index  = npx * side + strip;
1312
1313         if (module >= size) continue;
1314
1315         last = modA[module]->GetEntries();
1316         TClonesArray& dum = *modA[module];
1317         new (dum[last]) AliITSpListItem(-1, -1, module, index, Double_t(signal));
1318     }
1319     rawReader->Reset();
1320     AliITSpListItem* sdig = 0;
1321
1322     Int_t firstssd = GetITSgeom()->GetStartDet(kSSD);
1323     Double_t adcToEv = 1.;
1324     for (Int_t mod = 0; mod < size; mod++)
1325       {
1326       if(mod>=firstssd) {
1327         AliITSCalibrationSSD* calssd = (AliITSCalibrationSSD*)fDetTypeSim->GetCalibrationModel(mod);
1328         adcToEv = 1./calssd->GetSSDDEvToADC(1.);
1329       }
1330       Int_t nsdig =  modA[mod]->GetEntries();
1331       for (Int_t ie = 0; ie < nsdig; ie++) {
1332         sdig = (AliITSpListItem*) (modA[mod]->At(ie));
1333         Int_t digsig = sdig->GetSignal();
1334         if(mod>=firstssd) digsig*=adcToEv; // for SSD: convert back charge from ADC to electron
1335         new (aSDigits[ie]) AliITSpListItem(-1, -1, mod, sdig->GetIndex(), digsig);
1336             Float_t sig = sdig->GetSignalAfterElect();
1337             if(mod>=firstssd) sig*=adcToEv;
1338             if (sig > 0.) {
1339                 sdig = (AliITSpListItem*)aSDigits[ie];
1340                 sdig->AddSignalAfterElect(mod, sdig->GetIndex(), Double_t(sig));
1341             }
1342         }
1343
1344         tree->Fill();
1345         aSDigits.Clear();
1346         modA[mod]->Clear();
1347     }
1348     loader->WriteSDigits("OVERWRITE");
1349     delete modA;
1350     return kTRUE;
1351 }
1352
1353
1354 //______________________________________________________________________
1355 void AliITS::UpdateInternalGeometry(){
1356
1357   //reads new geometry from TGeo
1358 //   AliDebug(1,"Delete ITSgeom and create a new one reading TGeo");
1359
1360   AliITSVersion_t version = (AliITSVersion_t)IsVersion();
1361   Int_t minor = 0;
1362   if(version==kvPPRasymmFMD) minor=2;  // default minor version for this geom.
1363   AliITSInitGeometry initgeom;
1364   AliITSgeom* geom = initgeom.CreateAliITSgeom(version,minor);
1365   SetITSgeom(geom);
1366 }
1367 //______________________________________________________________________
1368 AliTriggerDetector* AliITS::CreateTriggerDetector() const {
1369   // create an AliITSTrigger object (and set trigger conditions as input)
1370   return new AliITSTrigger(fDetTypeSim->GetTriggerConditions());
1371 }