ITS/AliITS.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /*
  17 $Log$
  18 Revision 1.37  2001/03/07 12:36:35  barbera
  19 A change added in the tracking part to manage delta rays
  20
  21 Revision 1.36  2001/03/02 19:44:11  barbera
  22  modified to taking into account new version tracking v1
  23
  24 Revision 1.35  2001/02/28 18:16:46  mariana
  25 Make the code compatible with the new AliRun
  26
  27 Revision 1.34  2001/02/11 15:51:39  mariana
  28 Set protection in MakeBranch
  29
  30 Revision 1.33  2001/02/10 22:26:39  mariana
  31 Move the initialization of the containers for raw clusters in MakeTreeC()
  32
  33 Revision 1.32  2001/02/08 23:55:31  nilsen
  34 Removed fMajor/MinorVersion variables in favor of variables in derived classes.
  35 Set arrays char *det[3] = {"SPD","SDD","SSD"} as const.
  36
  37 Revision 1.31  2001/02/02 23:57:28  nilsen
  38 Added include file that are no londer included in AliITSgeom.h
  39
  40 Revision 1.30  2001/01/30 09:23:13  hristov
  41 Streamers removed (R.Brun)
  42
  43 Revision 1.29  2001/01/26 20:01:09  hristov
  44 Major upgrade of AliRoot code
  45
  46 Revision 1.28  2000/12/18 14:02:00  barbera
  47 new version of the ITS tracking to take into account the new TPC track parametrization
  48
  49 Revision 1.27  2000/12/08 13:49:27  barbera
  50 Hidden declaration in a for loop removed to be compliant with HP-UX compiler
  51
  52 Revision 1.26  2000/11/27 13:12:13  barbera
  53 New version containing the files for tracking
  54
  55 Revision 1.25  2000/11/12 22:38:05  barbera
  56 Added header file for the SPD Bari model
  57
  58 Revision 1.24  2000/10/09 22:18:12  barbera
  59 Bug fixes from MAriana to le AliITStest.C run correctly
  60
  61 Revision 1.23  2000/10/05 20:47:42  nilsen
  62 fixed dependencies of include files. Tryed but failed to get a root automaticly
  63 generates streamer function to work. Modified SetDefaults.
  64
  65 Revision 1.9.2.15  2000/10/04 16:56:40  nilsen
  66 Needed to include stdlib.h
  67
  68 =======
  69 Revision 1.22  2000/10/04 19:45:52  barbera
  70 Corrected by F. Carminati for v3.04
  71
  72 Revision 1.21  2000/10/02 21:28:08  fca
  73 Removal of useless dependecies via forward declarations
  74
  75 Revision 1.20  2000/10/02 16:31:39  barbera
  76 General code clean-up
  77
  78 Revision 1.9.2.14  2000/10/02 15:43:51  barbera
  79 General code clean-up (e.g., printf -> cout)
  80
  81 Revision 1.19  2000/09/22 12:13:25  nilsen
  82 Patches and updates for fixes to this and other routines.
  83
  84 Revision 1.18  2000/07/12 05:32:20  fca
  85 Correcting several syntax problem with static members
  86
  87 Revision 1.17  2000/07/10 16:07:18  fca
  88 Release version of ITS code
  89
  90 Revision 1.9.2.3  2000/02/02 13:42:09  barbera
  91 fixed AliITS.cxx for new AliRun structure. Added ITS hits list to list of hits which will have their track numbers updated
  92
  93 Revision 1.9.2.2  2000/01/23 03:03:13  nilsen
  94 //fixed FillModule. Removed fi(fabs(xl)<dx....
  95
  96 Revision 1.9.2.1  2000/01/12 19:03:32  nilsen
  97 This is the version of the files after the merging done in December 1999.
  98 See the ReadMe110100.txt file for details
  99
 100 Revision 1.9  1999/11/14 14:33:25  fca
 101 Correct problems with distructors and pointers, thanks to I.Hrivnacova
 102
 103 Revision 1.8  1999/09/29 09:24:19  fca
 104 Introduction of the Copyright and cvs Log
 105
 106 */
 107
 108 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 109 //
 110 //      An overview of the basic philosophy of the ITS code development
 111 // and analysis is show in the figure below.
 112 //Begin_Html
 113 /*
 114 <img src="picts/ITS/ITS_Analysis_schema.gif">
 115 </pre>
 116 <br clear=left>
 117 <font size=+2 color=red>
 118 <p>Roberto Barbera is in charge of the ITS Offline code (1999).
 119 <a href="mailto:roberto.barbera@ct.infn.it">Roberto Barbera</a>.
 120 </font>
 121 <pre>
 122 */
 123 //End_Html
 124 //
 125 //  AliITS. Inner Traking System base class.
 126 //  This class contains the base procedures for the Inner Tracking System
 127 //
 128 //Begin_Html
 129 /*
 130 <img src="picts/ITS/AliITS_Class_Diagram.gif">
 131 </pre>
 132 <br clear=left>
 133 <font size=+2 color=red>
 134 <p>This show the class diagram of the different elements that are part of
 135 the AliITS class.
 136 </font>
 137 <pre>
 138 */
 139 //End_Html
 140 //
 141 // Version: 0
 142 // Written by Rene Brun, Federico Carminati, and Roberto Barbera
 143 //
 144 // Version: 1
 145 // Modified and documented by Bjorn S. Nilsen
 146 // July 11 1999
 147 //
 148 // Version: 2
 149 // Modified and documented by A. Bologna
 150 // October 18 1999
 151 //
 152 // AliITS is the general base class for the ITS. Also see AliDetector for
 153 // futher information.
 154 //
 155 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 156 #include <iostream.h>
 157 #include <iomanip.h>
 158 #include <fstream.h>
 159 #include <stdlib.h>
 160 #include <TMath.h>
 161 #include <TRandom.h>
 162 #include <TBranch.h>
 163 #include <TVector.h>
 164 #include <TClonesArray.h>
 165 #include <TROOT.h>
 166 #include <TObjectTable.h>
 167 #include <TFile.h>
 168 #include <TTree.h>
 169 #include <TString.h>
 170 #include <TParticle.h>
 171
 172
 173 #include "AliRun.h"
 174 #include "AliITS.h"
 175 #include "AliITSMap.h"
 176 #include "AliITSDetType.h"
 177 #include "AliITSClusterFinder.h"
 178 //#include "AliITSsimulation.h"
 179 #include "AliITSsimulationSPD.h"
 180 #include "AliITSsimulationSDD.h"
 181 #include "AliITSsimulationSSD.h"
 182 #include "AliITSresponse.h"
 183 #include "AliITSsegmentationSPD.h"
 184 #include "AliITSresponseSPD.h"
 185 #include "AliITSresponseSPDbari.h"
 186 #include "AliITSsegmentationSDD.h"
 187 #include "AliITSresponseSDD.h"
 188 #include "AliITSsegmentationSSD.h"
 189 #include "AliITSresponseSSD.h"
 190 #include "AliITShit.h"
 191 #include "AliITSgeom.h"
 192 #include "AliITSdigit.h"
 193 #include "AliITSmodule.h"
 194 #include "AliITSRecPoint.h"
 195 #include "AliITSRawCluster.h"
 196 #include "AliMC.h"
 197 #include "stdlib.h"
 198
 199 #include "AliITStrack.h"
 200 #include "AliITSiotrack.h"
 201 #include "AliITStracking.h"
 202 #include "AliITSRad.h"
 203 #include "../TPC/AliTPC.h"
 204 #include "../TPC/AliTPCParam.h"
 205
 206
 207 ClassImp(AliITS)
 208
 209 //_____________________________________________________________________________
 210 AliITS::AliITS() : AliDetector() {
 211   //
 212   // Default initialiser for ITS
 213   //     The default constructor of the AliITS class. In addition to
 214   // creating the AliITS class it zeros the variables fIshunt (a member
 215   // of AliDetector class), fEuclidOut, and fIdN, and zeros the pointers
 216   // fITSpoints, fIdSens, and fIdName. The AliDetector default constructor
 217   // is also called.
 218   //
 219
 220
 221   fIshunt     = 0;
 222   fEuclidOut  = 0;
 223
 224   fNDetTypes = kNTYPES;
 225   fIdN        = 0;
 226   fIdName     = 0;
 227   fIdSens     = 0;
 228   fITSmodules = 0;
 229   //
 230   fDetTypes   = 0;
 231   //
 232   fDtype  = 0;
 233   fNdtype = 0;
 234   fCtype  = 0;
 235   fNctype = 0;
 236   fRecPoints = 0;
 237   fNRecPoints = 0;
 238   fTreeC = 0;
 239   //
 240   fITSgeom=0;
 241 }
 242
 243 //_____________________________________________________________________________
 244 AliITS::AliITS(const char *name, const char *title):AliDetector(name,title){
 245   //
 246   // Default initialiser for ITS
 247   //     The constructor of the AliITS class. In addition to creating the
 248   // AliITS class, it allocates memory for the TClonesArrays fHits and
 249   // fDigits, and for the TObjArray fITSpoints. It also zeros the variables
 250   // fIshunt (a member of AliDetector class), fEuclidOut, and fIdN, and zeros
 251   // the pointers fIdSens and fIdName. To help in displaying hits via the ROOT
 252   // macro display.C AliITS also sets the marker color to red. The variables
 253   // passes with this constructor, const char *name and *title, are used by
 254   // the constructor of AliDetector class. See AliDetector class for a
 255   // description of these parameters and its constructor functions.
 256   //
 257
 258
 259   fHits       = new TClonesArray("AliITShit", 1560);
 260   gAlice->AddHitList(fHits);
 261
 262   fNDetTypes = kNTYPES;
 263
 264   fNdtype = new Int_t[kNTYPES];
 265   fDtype = new TObjArray(kNTYPES);
 266
 267   fNctype = new Int_t[kNTYPES];
 268   fCtype = new TObjArray(kNTYPES);
 269
 270
 271   fRecPoints = 0;
 272   fNRecPoints = 0;
 273
 274   fTreeC = 0;
 275
 276   fITSmodules = 0;
 277
 278   fIshunt     = 0;
 279   fEuclidOut  = 0;
 280   fIdN        = 0;
 281   fIdName     = 0;
 282   fIdSens     = 0;
 283
 284   fDetTypes = new TObjArray(kNTYPES);
 285
 286   Int_t i;
 287   for(i=0;i<kNTYPES;i++) {
 288     (*fDetTypes)[i]=new AliITSDetType();
 289     fNdtype[i]=0;
 290     fNctype[i]=0;
 291    }
 292   //
 293
 294   SetMarkerColor(kRed);
 295
 296   fITSgeom=0;
 297 }
 298 //___________________________________________________________________________
 299 AliITS::AliITS(AliITS &source){
 300   // copy constructor
 301   if(this==&source) return;
 302   Error("AliITS::Copy constructor",
 303         "You are not allowed to make a copy of the AliITS");
 304   exit(1);
 305 }
 306 //____________________________________________________________________________
 307 AliITS& AliITS::operator=(AliITS &source){
 308   // assignment operator
 309   if(this==&source) return *this;
 310   Error("AliITS::operator=",
 311         "You are not allowed to make a copy of the AliITS");
 312   exit(1);
 313   return *this; //fake return
 314 }
 315 //____________________________________________________________________________
 316 void AliITS::ClearModules(){
 317   //clear the modules TObjArray
 318
 319   if(fITSmodules) fITSmodules->Delete();
 320
 321 }
 322 //_____________________________________________________________________________
 323 AliITS::~AliITS(){
 324   //
 325   // Default distructor for ITS
 326   //     The default destructor of the AliITS class. In addition to deleting
 327   // the AliITS class it deletes the memory pointed to by the fHits, fDigits,
 328   // fIdSens, fIdName, and fITSpoints.
 329   //
 330
 331
 332   delete fHits;
 333   delete fDigits;
 334   delete fRecPoints;
 335 //  delete fIdName;        // TObjArray of TObjStrings
 336   if(fIdName!=0) delete[] fIdName;  // Array of TStrings
 337   if(fIdSens!=0) delete[] fIdSens;
 338   if(fITSmodules!=0) {
 339       this->ClearModules();
 340       delete fITSmodules;
 341   }// end if fITSmodules!=0
 342
 343   //
 344   if(fDtype) {
 345     fDtype->Delete();
 346     delete fDtype;
 347   }
 348   delete [] fNdtype;
 349   if (fCtype) {
 350     fCtype->Delete();
 351     delete fCtype;
 352   }
 353   delete [] fNctype;
 354   //
 355
 356   if (fDetTypes) {
 357     fDetTypes->Delete();
 358     delete fDetTypes;
 359   }
 360
 361   if (fTreeC) delete fTreeC;
 362
 363   if (fITSgeom) delete fITSgeom;
 364
 365 }
 366
 367 //___________________________________________
 368 AliITSDetType* AliITS::DetType(Int_t id)
 369 {
 370   //return pointer to id detector type
 371     return ((AliITSDetType*) (*fDetTypes)[id]);
 372
 373 }
 374 //___________________________________________
 375 void AliITS::SetClasses(Int_t id, const char *digit, const char *cluster)
 376 {
 377   //set the digit and cluster classes to be used for the id detector type
 378     ((AliITSDetType*) (*fDetTypes)[id])->ClassNames(digit,cluster);
 379
 380 }
 381 //___________________________________________
 382 void AliITS::SetResponseModel(Int_t id, AliITSresponse *response)
 383 {
 384   //set the response model for the id detector type
 385
 386     ((AliITSDetType*) (*fDetTypes)[id])->ResponseModel(response);
 387
 388 }
 389
 390 //___________________________________________
 391 void AliITS::SetSegmentationModel(Int_t id, AliITSsegmentation *seg)
 392 {
 393   //set the segmentation model for the id detector type
 394
 395     ((AliITSDetType*) (*fDetTypes)[id])->SegmentationModel(seg);
 396
 397 }
 398
 399 //___________________________________________
 400 void AliITS::SetSimulationModel(Int_t id, AliITSsimulation *sim)
 401 {
 402   //set the simulation model for the id detector type
 403
 404    ((AliITSDetType*) (*fDetTypes)[id])->SimulationModel(sim);
 405
 406 }
 407 //___________________________________________
 408 void AliITS::SetReconstructionModel(Int_t id, AliITSClusterFinder *reconst)
 409 {
 410   //set the cluster finder model for the id detector type
 411
 412    ((AliITSDetType*) (*fDetTypes)[id])->ReconstructionModel(reconst);
 413
 414 }
 415
 416 //_____________________________________________________________________________
 417 void AliITS::AddHit(Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits){
 418   //
 419   // Add an ITS hit
 420   //     The function to add information to the AliITShit class. See the
 421   // AliITShit class for a full description. This function allocates the
 422   // necessary new space for the hit information and passes the variable
 423   // track, and the pointers *vol and *hits to the AliITShit constructor
 424   // function.
 425   //
 426   TClonesArray &lhits = *fHits;
 427   new(lhits[fNhits++]) AliITShit(fIshunt,track,vol,hits);
 428 }
 429 //_____________________________________________________________________________
 430 void AliITS::AddRealDigit(Int_t id, Int_t *digits)
 431 {
 432   // add a real digit - as coming from data
 433
 434   TClonesArray &ldigits = *((TClonesArray*)(*fDtype)[id]);
 435   new(ldigits[fNdtype[id]++]) AliITSdigit(digits);
 436
 437 }
 438 //_____________________________________________________________________________
 439 void AliITS::AddSimDigit(Int_t id, AliITSdigit *d)
 440 {
 441
 442   // add a simulated digit
 443
 444   TClonesArray &ldigits = *((TClonesArray*)(*fDtype)[id]);
 445
 446   switch(id)
 447   {
 448   case 0:
 449      new(ldigits[fNdtype[id]++]) AliITSdigitSPD(*((AliITSdigitSPD*)d));
 450      break;
 451   case 1:
 452      new(ldigits[fNdtype[id]++]) AliITSdigitSDD(*((AliITSdigitSDD*)d));
 453      break;
 454   case 2:
 455      new(ldigits[fNdtype[id]++]) AliITSdigitSSD(*((AliITSdigitSSD*)d));
 456      break;
 457   }
 458
 459 }
 460
 461 //_____________________________________________________________________________
 462 void AliITS::AddSimDigit(Int_t id,Float_t phys,Int_t *digits,Int_t *tracks,Int_t *hits,Float_t *charges){
 463
 464   // add a simulated digit to the list
 465
 466   TClonesArray &ldigits = *((TClonesArray*)(*fDtype)[id]);
 467   switch(id)
 468   {
 469   case 0:
 470      new(ldigits[fNdtype[id]++]) AliITSdigitSPD(digits,tracks,hits);
 471      break;
 472   case 1:
 473      new(ldigits[fNdtype[id]++]) AliITSdigitSDD(phys,digits,tracks,hits,charges);
 474      break;
 475   case 2:
 476      new(ldigits[fNdtype[id]++]) AliITSdigitSSD(digits,tracks,hits);
 477      break;
 478   }
 479
 480 }
 481
 482 //_____________________________________________________________________________
 483 void AliITS::AddCluster(Int_t id, AliITSRawCluster *c)
 484 {
 485
 486   // add a cluster to the list
 487
 488   TClonesArray &lcl = *((TClonesArray*)(*fCtype)[id]);
 489
 490   switch(id)
 491   {
 492   case 0:
 493      new(lcl[fNctype[id]++]) AliITSRawClusterSPD(*((AliITSRawClusterSPD*)c));
 494      break;
 495   case 1:
 496      new(lcl[fNctype[id]++]) AliITSRawClusterSDD(*((AliITSRawClusterSDD*)c));
 497      break;
 498   case 2:
 499      new(lcl[fNctype[id]++]) AliITSRawClusterSSD(*((AliITSRawClusterSSD*)c));
 500      break;
 501   }
 502
 503 }
 504
 505
 506 //_____________________________________________________________________________
 507 void AliITS::AddRecPoint(const AliITSRecPoint &r)
 508 {
 509   //
 510   // Add a reconstructed space point to the list
 511   //
 512   TClonesArray &lrecp = *fRecPoints;
 513   new(lrecp[fNRecPoints++]) AliITSRecPoint(r);
 514 }
 515
 516
 517 //____________________________________________
 518 void AliITS::ResetDigits()
 519 {
 520     //
 521     // Reset number of digits and the digits array for the ITS detector
 522     //
 523
 524     if (!fDtype) return;
 525
 526     Int_t i;
 527     for (i=0;i<kNTYPES;i++ ) {
 528         if ((*fDtype)[i])    ((TClonesArray*)(*fDtype)[i])->Clear();
 529         if (fNdtype)  fNdtype[i]=0;
 530     }
 531 }
 532
 533 //____________________________________________
 534 void AliITS::ResetDigits(Int_t i)
 535 {
 536     //
 537     // Reset number of digits and the digits array for this branch
 538     //
 539   if ((*fDtype)[i])    ((TClonesArray*)(*fDtype)[i])->Clear();
 540   if (fNdtype)  fNdtype[i]=0;
 541 }
 542
 543
 544 //____________________________________________
 545 void AliITS::ResetClusters()
 546 {
 547     //
 548     // Reset number of clusters and the clusters array for ITS
 549     //
 550
 551     Int_t i;
 552     for (i=0;i<kNTYPES;i++ ) {
 553         if ((*fCtype)[i])    ((TClonesArray*)(*fCtype)[i])->Clear();
 554         if (fNctype)  fNctype[i]=0;
 555     }
 556
 557 }
 558
 559 //____________________________________________
 560 void AliITS::ResetClusters(Int_t i)
 561 {
 562     //
 563     // Reset number of clusters and the clusters array for this branch
 564     //
 565         if ((*fCtype)[i])    ((TClonesArray*)(*fCtype)[i])->Clear();
 566         if (fNctype)  fNctype[i]=0;
 567
 568 }
 569
 570
 571 //____________________________________________
 572 void AliITS::ResetRecPoints()
 573 {
 574     //
 575     // Reset number of rec points and the rec points array
 576     //
 577     if (fRecPoints) fRecPoints->Clear();
 578     fNRecPoints = 0;
 579
 580 }
 581
 582 //_____________________________________________________________________________
 583 Int_t AliITS::DistancetoPrimitive(Int_t , Int_t ){
 584   //
 585   // Distance from mouse to ITS on the screen. Dummy routine
 586   //     A dummy routine used by the ROOT macro display.C to allow for the
 587   // use of the mouse (pointing device) in the macro. In general this should
 588   // never be called. If it is it returns the number 9999 for any value of
 589   // x and y.
 590   //
 591   return 9999;
 592 }
 593
 594 //_____________________________________________________________________________
 595 void AliITS::Init(){
 596   //
 597   // Initialise ITS after it has been built
 598   //     This routine initializes the AliITS class. It is intended to be called
 599   // from the Init function in AliITSv?. Besides displaying a banner
 600   // indicating that it has been called it initializes the array fIdSens
 601   // and sets the default segmentation, response, digit and raw cluster classes
 602   // Therefore it should be called after a call to CreateGeometry.
 603   //
 604   Int_t i;
 605
 606 //
 607   SetDefaults();
 608 // Array of TStrings
 609   for(i=0;i<fIdN;i++) fIdSens[i] = gMC->VolId(fIdName[i]);
 610 //
 611 }
 612
 613 //_____________________________________________________________________________
 614 void AliITS::SetDefaults()
 615 {
 616   // sets the default segmentation, response, digit and raw cluster classes
 617
 618   printf("SetDefaults\n");
 619
 620   AliITSDetType *iDetType;
 621
 622
 623   //SPD
 624
 625   iDetType=DetType(0);
 626   if (!iDetType->GetSegmentationModel()) {
 627     AliITSsegmentationSPD *seg0=new AliITSsegmentationSPD(fITSgeom);
 628     SetSegmentationModel(0,seg0);
 629   }
 630   if (!iDetType->GetResponseModel()) {
 631      SetResponseModel(0,new AliITSresponseSPD());
 632   }
 633   // set digit and raw cluster classes to be used
 634
 635   const char *kData0=(iDetType->GetResponseModel())->DataType();
 636   if (strstr(kData0,"real")) {
 637       iDetType->ClassNames("AliITSdigit","AliITSRawClusterSPD");
 638   } else iDetType->ClassNames("AliITSdigitSPD","AliITSRawClusterSPD");
 639
 640   // SDD                                          //
 641   iDetType=DetType(1);
 642   if (!iDetType->GetResponseModel()) {
 643     SetResponseModel(1,new AliITSresponseSDD());
 644   }
 645   AliITSresponse *resp1=iDetType->GetResponseModel();
 646   if (!iDetType->GetSegmentationModel()) {
 647     AliITSsegmentationSDD *seg1=new AliITSsegmentationSDD(fITSgeom,resp1);
 648     SetSegmentationModel(1,seg1);
 649   }
 650   const char *kData1=(iDetType->GetResponseModel())->DataType();
 651   const char *kopt=iDetType->GetResponseModel()->ZeroSuppOption();
 652   if ((!strstr(kopt,"2D")) && (!strstr(kopt,"1D")) || strstr(kData1,"real") ) {
 653       iDetType->ClassNames("AliITSdigit","AliITSRawClusterSDD");
 654   } else iDetType->ClassNames("AliITSdigitSDD","AliITSRawClusterSDD");
 655
 656   // SSD
 657   iDetType=DetType(2);
 658   if (!iDetType->GetSegmentationModel()) {
 659     AliITSsegmentationSSD *seg2=new AliITSsegmentationSSD(fITSgeom);
 660     SetSegmentationModel(2,seg2);
 661   }
 662   if (!iDetType->GetResponseModel()) {
 663     SetResponseModel(2,new AliITSresponseSSD());
 664   }
 665   const char *kData2=(iDetType->GetResponseModel())->DataType();
 666   if (strstr(kData2,"real")) {
 667       iDetType->ClassNames("AliITSdigit","AliITSRawClusterSSD");
 668   } else iDetType->ClassNames("AliITSdigitSSD","AliITSRawClusterSSD");
 669
 670   if (kNTYPES>3) {
 671     Warning("SetDefaults","Only the three basic detector types are initialised!");
 672   }
 673
 674 }
 675
 676
 677
 678 //_____________________________________________________________________________
 679 void AliITS::SetDefaultSimulation()
 680 {
 681   // to be written
 682
 683 }
 684 //_____________________________________________________________________________
 685 void AliITS::SetDefaultClusterFinders()
 686 {
 687   // to be written
 688
 689 }
 690 //_____________________________________________________________________________
 691
 692 void AliITS::MakeTreeC(Option_t *option)
 693 {
 694   // create a separate tree to store the clusters
 695
 696   cout << "AliITS::MakeTreeC" << endl;
 697
 698      char *optC = strstr(option,"C");
 699      if (optC && !fTreeC) fTreeC = new TTree("TC","Clusters in ITS");
 700      else return;
 701
 702      Int_t buffersize = 4000;
 703      char branchname[30];
 704
 705      const char *det[3] = {"SPD","SDD","SSD"};
 706
 707      char digclass[40];
 708      char clclass[40];
 709
 710      // one branch for Clusters per type of detector
 711      Int_t i;
 712      for (i=0; i<kNTYPES ;i++) {
 713        AliITSDetType *iDetType=DetType(i);
 714        iDetType->GetClassNames(digclass,clclass);
 715        // clusters
 716        (*fCtype)[i] = new TClonesArray(clclass,10000);
 717         if (kNTYPES==3) sprintf(branchname,"%sClusters%s",GetName(),det[i]);
 718         else  sprintf(branchname,"%sClusters%d",GetName(),i+1);
 719         if (fCtype   && fTreeC) {
 720            TreeC()->Branch(branchname,&((*fCtype)[i]), buffersize);
 721            cout << "Making Branch " << branchname;
 722            cout << " for Clusters of detector type " << i+1 << endl;
 723         }
 724      }
 725
 726 }
 727
 728 //_____________________________________________________________________________
 729 void AliITS::GetTreeC(Int_t event)
 730 {
 731
 732   cout << "AliITS::GetTreeC" << endl;
 733
 734   // get the clusters tree for this event and set the branch address
 735     char treeName[20];
 736     char branchname[30];
 737
 738     const char *det[3] = {"SPD","SDD","SSD"};
 739
 740     ResetClusters();
 741     if (fTreeC) {
 742           delete fTreeC;
 743     }
 744
 745     sprintf(treeName,"TreeC%d",event);
 746     fTreeC = (TTree*)gDirectory->Get(treeName);
 747
 748     TBranch *branch;
 749     if (fTreeC) {
 750         Int_t i;
 751         for (i=0; i<kNTYPES; i++) {
 752            if (kNTYPES==3) sprintf(branchname,"%sClusters%s",GetName(),det[i]);
 753            else  sprintf(branchname,"%sClusters%d",GetName(),i+1);
 754            if (fCtype) {
 755                 branch = fTreeC->GetBranch(branchname);
 756                 if (branch) branch->SetAddress(&((*fCtype)[i]));
 757             }
 758         }
 759     } else {
 760         Error("AliITS::GetTreeC",
 761                 "cannot find Clusters Tree for event:%d\n",event);
 762     }
 763
 764 }
 765 //_____________________________________________________________________________
 766 void AliITS::MakeBranch(Option_t* option, char *file)
 767 {
 768   //
 769   // Creates Tree branches for the ITS.
 770   //
 771   //
 772   Int_t buffersize = 4000;
 773   char branchname[30];
 774   sprintf(branchname,"%s",GetName());
 775
 776   AliDetector::MakeBranch(option,file);
 777
 778   char *cD = strstr(option,"D");
 779   char *cR = strstr(option,"R");
 780
 781   if (cD) {
 782   //
 783   // one branch for digits per type of detector
 784   //
 785    const char *det[3] = {"SPD","SDD","SSD"};
 786
 787    char digclass[40];
 788    char clclass[40];
 789
 790    Int_t i;
 791    for (i=0; i<kNTYPES ;i++) {
 792        AliITSDetType *iDetType=DetType(i);
 793        iDetType->GetClassNames(digclass,clclass);
 794        // digits
 795        if(!((*fDtype)[i])) (*fDtype)[i] = new TClonesArray(digclass,10000);
 796        else ResetDigits(i);
 797    }
 798
 799    for (i=0; i<kNTYPES ;i++) {
 800       if (kNTYPES==3) sprintf(branchname,"%sDigits%s",GetName(),det[i]);
 801       else  sprintf(branchname,"%sDigits%d",GetName(),i+1);
 802       if (fDtype && gAlice->TreeD()) {
 803         gAlice->MakeBranchInTree(gAlice->TreeD(),
 804                          branchname, &((*fDtype)[i]), buffersize, file);
 805             cout << "Making Branch " << branchname;
 806             cout << " for digits of type "<< i+1 << endl;
 807       }
 808     }
 809   }
 810
 811   if (cR) {
 812   //
 813   // only one branch for rec points for all detector types
 814   //
 815     sprintf(branchname,"%sRecPoints",GetName());
 816
 817     if(!fRecPoints) fRecPoints=new TClonesArray("AliITSRecPoint",10000);
 818
 819     if (fRecPoints && gAlice->TreeR()) {
 820       gAlice->MakeBranchInTree(gAlice->TreeR(),
 821                                branchname, &fRecPoints, buffersize, file) ;
 822       cout << "Making Branch " << branchname;
 823       cout << " for reconstructed space points" << endl;
 824     }
 825   }
 826 }
 827
 828 //___________________________________________
 829 void AliITS::SetTreeAddress()
 830 {
 831
 832   // Set branch address for the Trees.
 833
 834   char branchname[30];
 835   AliDetector::SetTreeAddress();
 836
 837   const char *det[3] = {"SPD","SDD","SSD"};
 838
 839   TBranch *branch;
 840   TTree *treeD = gAlice->TreeD();
 841   TTree *treeR = gAlice->TreeR();
 842
 843   Int_t i;
 844   if (treeD) {
 845       for (i=0; i<kNTYPES; i++) {
 846           if (kNTYPES==3) sprintf(branchname,"%sDigits%s",GetName(),det[i]);
 847           else  sprintf(branchname,"%sDigits%d",GetName(),i+1);
 848           if (fDtype) {
 849               branch = treeD->GetBranch(branchname);
 850               if (branch) branch->SetAddress(&((*fDtype)[i]));
 851           }
 852       }
 853   }
 854
 855
 856   if (treeR) {
 857     sprintf(branchname,"%sRecPoints",GetName());
 858       branch = treeR->GetBranch(branchname);
 859       if (branch) branch->SetAddress(&fRecPoints);
 860   }
 861
 862
 863 }
 864
 865 //____________________________________________________________________________
 866 void AliITS::InitModules(Int_t size,Int_t &nmodules){
 867
 868   //initialize the modules array
 869
 870   if(fITSmodules){
 871       fITSmodules->Delete();
 872       delete fITSmodules;
 873   }
 874
 875     Int_t nl,indexMAX,index;
 876
 877     if(size<=0){ // default to using data stored in AliITSgeom
 878         if(fITSgeom==0) {
 879             Error("AliITS::InitModules",
 880                 "in AliITS::InitModule fITSgeom not defined\n");
 881             return;
 882         } // end if fITSgeom==0
 883         nl = fITSgeom->GetNlayers();
 884         indexMAX = fITSgeom->GetModuleIndex(nl,fITSgeom->GetNladders(nl),
 885                                             fITSgeom->GetNdetectors(nl))+1;
 886         nmodules = indexMAX;
 887         fITSmodules = new TObjArray(indexMAX);
 888         for(index=0;index<indexMAX;index++){
 889                 fITSmodules->AddAt( new AliITSmodule(index),index);
 890         } // end for index
 891     }else{
 892         fITSmodules = new TObjArray(size);
 893         for(index=0;index<size;index++) {
 894             fITSmodules->AddAt( new AliITSmodule(index),index);
 895         }
 896
 897         nmodules = size;
 898     } // end i size<=0
 899 }
 900
 901 //____________________________________________________________________________
 902 void AliITS::FillModules(Int_t evnt,Int_t bgrev,Int_t nmodules,Option_t *option,Text_t *filename){
 903
 904   // fill the modules with the sorted by module hits; add hits from background
 905   // if option=Add
 906
 907
 908     static TTree *trH1;                 //Tree with background hits
 909     static TClonesArray *fHits2;        //List of hits for one track only
 910
 911     static Bool_t first=kTRUE;
 912     static TFile *file;
 913     char *addBgr = strstr(option,"Add");
 914
 915
 916     if (addBgr ) {
 917         if(first) {
 918             cout<<"filename "<<filename<<endl;
 919             file=new TFile(filename);
 920             cout<<"I have opened "<<filename<<" file "<<endl;
 921             fHits2     = new TClonesArray("AliITShit",1000  );
 922         }
 923         first=kFALSE;
 924         file->cd();
 925         file->ls();
 926         // Get Hits Tree header from file
 927         if(fHits2) fHits2->Clear();
 928         if(trH1) delete trH1;
 929         trH1=0;
 930
 931         char treeName[20];
 932         sprintf(treeName,"TreeH%d",bgrev);
 933         trH1 = (TTree*)gDirectory->Get(treeName);
 934         //printf("TrH1 %p of treename %s for event %d \n",trH1,treeName,bgrev);
 935
 936         if (!trH1) {
 937             Error("AliITS::FillModules",
 938             "cannot find Hits Tree for event:%d\n",bgrev);
 939         }
 940         // Set branch addresses
 941         TBranch *branch;
 942         char branchname[20];
 943         sprintf(branchname,"%s",GetName());
 944         if (trH1 && fHits2) {
 945             branch = trH1->GetBranch(branchname);
 946             if (branch) branch->SetAddress(&fHits2);
 947         }
 948
 949         // test
 950         //Int_t ntracks1 =(Int_t)TrH1->GetEntries();
 951         //printf("background - ntracks1 - %d\n",ntracks1);
 952    }
 953
 954     //Int_t npart = gAlice->GetEvent(evnt);
 955     //if(npart<=0) return;
 956     TClonesArray *itsHits = this->Hits();
 957     Int_t lay,lad,det,index;
 958     AliITShit *itsHit=0;
 959     AliITSmodule *mod=0;
 960
 961     TTree *iTH = gAlice->TreeH();
 962     Int_t ntracks =(Int_t) iTH->GetEntries();
 963
 964     Int_t t,h;
 965     for(t=0; t<ntracks; t++){
 966         gAlice->ResetHits();
 967         iTH->GetEvent(t);
 968         Int_t nhits = itsHits->GetEntriesFast();
 969         //printf("nhits %d\n",nhits);
 970         if (!nhits) continue;
 971         for(h=0; h<nhits; h++){
 972             itsHit = (AliITShit *)itsHits->UncheckedAt(h);
 973             itsHit->GetDetectorID(lay,lad,det);
 974             // temporarily index=det-1 !!!
 975             if(fITSgeom) index = fITSgeom->GetModuleIndex(lay,lad,det);
 976             else index=det-1;
 977             //
 978             mod = this->GetModule(index);
 979             mod->AddHit(itsHit,t,h);
 980         } // end loop over hits
 981     } // end loop over tracks
 982
 983     // open the file with background
 984
 985     if (addBgr ) {
 986           Int_t track,i;
 987           ntracks =(Int_t)trH1->GetEntries();
 988             //printf("background - ntracks1 %d\n",ntracks);
 989             //printf("background - Start loop over tracks \n");
 990             //   Loop over tracks
 991
 992             for (track=0; track<ntracks; track++) {
 993
 994                 if (fHits2)       fHits2->Clear();
 995                 trH1->GetEvent(track);
 996                 //   Loop over hits
 997                 for(i=0;i<fHits2->GetEntriesFast();++i) {
 998
 999                     itsHit=(AliITShit*) (*fHits2)[i];
1000                     itsHit->GetDetectorID(lay,lad,det);
1001                     // temporarily index=det-1 !!!
1002                     if(fITSgeom) index = fITSgeom->GetModuleIndex(lay,lad,det);
1003                     else index=det-1;
1004                     //
1005                     mod = this->GetModule(index);
1006                     mod->AddHit(itsHit,track,i);
1007                }  // end loop over hits
1008             } // end loop over tracks
1009
1010             TTree *fAli=gAlice->TreeK();
1011             TFile *fileAli=0;
1012
1013             if (fAli) fileAli =fAli->GetCurrentFile();
1014             fileAli->cd();
1015
1016     } // end if add
1017
1018     //gObjectTable->Print();
1019
1020 }
1021
1022 //____________________________________________________________________________
1023
1024 void AliITS::SDigits2Digits()
1025 {
1026
1027   AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
1028
1029   // SPD
1030   AliITSDetType *iDetType;
1031   iDetType=DetType(0);
1032   AliITSsegmentationSPD *seg0=(AliITSsegmentationSPD*)iDetType->GetSegmentationModel();
1033   AliITSresponseSPD *res0 = (AliITSresponseSPD*)iDetType->GetResponseModel();
1034   AliITSsimulationSPD *sim0=new AliITSsimulationSPD(seg0,res0);
1035   SetSimulationModel(0,sim0);
1036   // test
1037   // printf("SPD dimensions %f %f \n",seg0->Dx(),seg0->Dz());
1038   // printf("SPD npixels %d %d \n",seg0->Npz(),seg0->Npx());
1039   // printf("SPD pitches %d %d \n",seg0->Dpz(0),seg0->Dpx(0));
1040   // end test
1041   //
1042   // SDD
1043   //Set response functions
1044   Float_t baseline = 10.;
1045   Float_t noise = 1.75;
1046
1047   // SDD compression param: 2 fDecrease, 2fTmin, 2fTmax or disable, 2 fTolerance
1048
1049   iDetType=DetType(1);
1050   AliITSresponseSDD *res1 = (AliITSresponseSDD*)iDetType->GetResponseModel();
1051   if (!res1) {
1052     res1=new AliITSresponseSDD();
1053     SetResponseModel(1,res1);
1054   }
1055    res1->SetMagicValue(900.);
1056    Float_t maxadc = res1->MaxAdc();
1057    Float_t topValue = res1->MagicValue();
1058    Float_t norm = maxadc/topValue;
1059
1060    Float_t fCutAmp = baseline + 2.*noise;
1061    fCutAmp *= norm;
1062    Int_t cp[8]={0,0,(int)fCutAmp,(int)fCutAmp,0,0,0,0}; //1D
1063
1064   //res1->SetZeroSupp("2D");
1065   res1->SetZeroSupp("1D");
1066   res1->SetNoiseParam(noise,baseline);
1067   res1->SetDo10to8(kTRUE);
1068   res1->SetCompressParam(cp);
1069   res1->SetMinVal(4);
1070   res1->SetDiffCoeff(3.6,40.);
1071   //res1->SetMagicValue(96.95);
1072   AliITSsegmentationSDD *seg1=(AliITSsegmentationSDD*)iDetType->GetSegmentationModel();
1073   if (!seg1) {
1074     seg1 = new AliITSsegmentationSDD(geom,res1);
1075     SetSegmentationModel(1,seg1);
1076   }
1077   AliITSsimulationSDD *sim1=new AliITSsimulationSDD(seg1,res1);
1078   sim1->SetDoFFT(1);
1079   sim1->SetCheckNoise(kFALSE);
1080   SetSimulationModel(1,sim1);
1081
1082   // SSD
1083   iDetType=DetType(2);
1084   AliITSsegmentationSSD *seg2=(AliITSsegmentationSSD*)iDetType->GetSegmentationModel();
1085   AliITSresponseSSD *res2 = (AliITSresponseSSD*)iDetType->GetResponseModel();
1086   res2->SetSigmaSpread(3.,2.);
1087   AliITSsimulationSSD *sim2=new AliITSsimulationSSD(seg2,res2);
1088   SetSimulationModel(2,sim2);
1089
1090   cerr<<"Digitizing ITS...\n";
1091
1092   TStopwatch timer;
1093   timer.Start();
1094   HitsToDigits(0,0,-1," ","All"," ");
1095   timer.Stop(); timer.Print();
1096
1097   delete sim0;
1098   delete sim1;
1099   delete sim2;
1100 }
1101
1102
1103 //____________________________________________________________________________
1104 void AliITS::HitsToDigits(Int_t evNumber,Int_t bgrev,Int_t size, Option_t *option, Option_t *opt,Text_t *filename)
1105 {
1106     // keep galice.root for signal and name differently the file for
1107     // background when add! otherwise the track info for signal will be lost !
1108
1109    // the condition below will disappear when the geom class will be
1110    // initialised for all versions - for the moment it is only for v5 !
1111    // 7 is the SDD beam test version
1112    Int_t ver = this->IsVersion();
1113    if(ver!=5 && ver!=7) return;
1114
1115    char *all = strstr(opt,"All");
1116    char *det[3] = {strstr(opt,"SPD"),strstr(opt,"SDD"),strstr(opt,"SSD")};
1117
1118    Int_t nmodules;
1119    InitModules(size,nmodules);
1120    FillModules(evNumber,bgrev,nmodules,option,filename);
1121
1122    //TBranch *branch;
1123    AliITSsimulation* sim;
1124    //TObjArray *branches=gAlice->TreeD()->GetListOfBranches();
1125    AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
1126
1127    Int_t id,module;
1128    Int_t first,last;
1129    for (id=0;id<kNTYPES;id++) {
1130         if (!all && !det[id]) continue;
1131         //branch = (TBranch*)branches->UncheckedAt(id);
1132         AliITSDetType *iDetType=DetType(id);
1133         sim = (AliITSsimulation*)iDetType->GetSimulationModel();
1134         if (!sim) {
1135            Error("HitsToDigits","The simulation class was not instantiated!");
1136            exit(1);
1137            // or SetDefaultSimulation();
1138         }
1139         if(geom) {
1140           first = geom->GetStartDet(id);
1141           last = geom->GetLastDet(id);
1142         } else first=last=0;
1143         cout << "det type " << id << " first, last "<< first << last << endl;
1144         for(module=first;module<=last;module++) {
1145             AliITSmodule *mod = (AliITSmodule *)fITSmodules->At(module);
1146             sim->DigitiseModule(mod,module,evNumber);
1147             // fills all branches - wasted disk space
1148             gAlice->TreeD()->Fill();
1149             ResetDigits();
1150             // try and fill only the branch
1151             //branch->Fill();
1152             //ResetDigits(id);
1153         } // loop over modules
1154    } // loop over detector types
1155
1156    ClearModules();
1157
1158    Int_t nentries=(Int_t)gAlice->TreeD()->GetEntries();
1159    cout << "nentries in TreeD" << nentries << endl;
1160
1161    char hname[30];
1162    sprintf(hname,"TreeD%d",evNumber);
1163    gAlice->TreeD()->Write(hname,TObject::kOverwrite);
1164    // reset tree
1165    gAlice->TreeD()->Reset();
1166
1167 }
1168
1169
1170 //____________________________________________________________________________
1171 void AliITS::DigitsToRecPoints(Int_t evNumber,Int_t lastentry,Option_t *opt)
1172 {
1173   // cluster finding and reconstruction of space points
1174
1175    // the condition below will disappear when the geom class will be
1176    // initialised for all versions - for the moment it is only for v5 !
1177    // 7 is the SDD beam test version
1178    Int_t ver = this->IsVersion();
1179    if(ver!=5) return;
1180
1181    char *all = strstr(opt,"All");
1182    char *det[3] = {strstr(opt,"SPD"),strstr(opt,"SDD"),strstr(opt,"SSD")};
1183
1184    static Bool_t first=kTRUE;
1185    if (!TreeC() && first) {
1186        MakeTreeC("C");
1187        first=kFALSE;
1188    }
1189
1190    TTree *treeC=TreeC();
1191
1192
1193    //TBranch *branch;
1194    AliITSClusterFinder* rec;
1195
1196    //TObjArray *branches=gAlice->TreeR()->GetListOfBranches();
1197    AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
1198
1199    Int_t id,module;
1200    for (id=0;id<kNTYPES;id++) {
1201         if (!all && !det[id]) continue;
1202         //branch = (TBranch*)branches->UncheckedAt(id);
1203         AliITSDetType *iDetType=DetType(id);
1204         rec = (AliITSClusterFinder*)iDetType->GetReconstructionModel();
1205         if (!rec) {
1206            Error("DigitsToRecPoints","The cluster finder class was not instantiated!");
1207            exit(1);
1208            // or SetDefaultClusterFinders();
1209         }
1210         TClonesArray *itsDigits  = this->DigitsAddress(id);
1211
1212         Int_t first,last;
1213         if(geom) {
1214           first = geom->GetStartDet(id);
1215           last = geom->GetLastDet(id);
1216         } else first=last=0;
1217         //printf("first last %d %d\n",first,last);
1218         for(module=first;module<=last;module++) {
1219               this->ResetDigits();
1220               if (all) gAlice->TreeD()->GetEvent(lastentry+module);
1221               else gAlice->TreeD()->GetEvent(lastentry+(module-first));
1222               Int_t ndigits = itsDigits->GetEntriesFast();
1223               if (ndigits) rec->FindRawClusters();
1224               gAlice->TreeR()->Fill();
1225               ResetRecPoints();
1226               treeC->Fill();
1227               ResetClusters();
1228               // try and fill only the branch
1229               //branch->Fill();
1230               //ResetRecPoints(id);
1231         } // loop over modules
1232    } // loop over detector types
1233
1234
1235    Int_t nentries=(Int_t)gAlice->TreeR()->GetEntries();
1236    Int_t ncentries=(Int_t)treeC->GetEntries();
1237    cout << " nentries ncentries " << nentries << ncentries <<  endl;
1238
1239    char hname[30];
1240    sprintf(hname,"TreeR%d",evNumber);
1241    gAlice->TreeR()->Write(hname,TObject::kOverwrite);
1242    // reset tree
1243    gAlice->TreeR()->Reset();
1244
1245    sprintf(hname,"TreeC%d",evNumber);
1246    treeC->Write(hname,TObject::kOverwrite);
1247    treeC->Reset();
1248 }
1249
1250
1251 //____________________________________________________________________________
1252 void AliITS::HitsToFastRecPoints(Int_t evNumber,Int_t bgrev,Int_t size,
1253 Option_t *option,Option_t *opt,Text_t *filename)
1254 {
1255     // keep galice.root for signal and name differently the file for
1256     // background when add! otherwise the track info for signal will be lost !
1257
1258
1259    // the condition below will disappear when the geom class will be
1260    // initialised for all versions - for the moment it is only for v5 !
1261    Int_t ver = this->IsVersion();
1262    if(ver!=5) return;
1263
1264    char *all = strstr(opt,"All");
1265    char *det[3] = {strstr(opt,"SPD"),strstr(opt,"SDD"),strstr(opt,"SSD")};
1266
1267    Int_t nmodules;
1268    InitModules(size,nmodules);
1269    FillModules(evNumber,bgrev,nmodules,option,filename);
1270
1271
1272    AliITSsimulation* sim;
1273    AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
1274
1275    TRandom *random=new TRandom[9];
1276    random[0].SetSeed(111);
1277    random[1].SetSeed(222);
1278    random[2].SetSeed(333);
1279    random[3].SetSeed(444);
1280    random[4].SetSeed(555);
1281    random[5].SetSeed(666);
1282    random[6].SetSeed(777);
1283    random[7].SetSeed(888);
1284    random[8].SetSeed(999);
1285
1286
1287    Int_t id,module;
1288    for (id=0;id<kNTYPES;id++) {
1289         if (!all && !det[id]) continue;
1290         AliITSDetType *iDetType=DetType(id);
1291         sim = (AliITSsimulation*)iDetType->GetSimulationModel();
1292         if (!sim) {
1293            Error("HitsToFastPoints","The simulation class was not instantiated!");
1294            exit(1);
1295            // or SetDefaultSimulation();
1296         }
1297         Int_t first = geom->GetStartDet(id);
1298         Int_t last = geom->GetLastDet(id);
1299         for(module=first;module<=last;module++) {
1300             AliITSmodule *mod = (AliITSmodule *)fITSmodules->At(module);
1301             sim->CreateFastRecPoints(mod,module,random);
1302             gAlice->TreeR()->Fill();
1303             ResetRecPoints();
1304         } // loop over modules
1305    } // loop over detector types
1306
1307
1308    ClearModules();
1309
1310    //Int_t nentries=(Int_t)gAlice->TreeR()->GetEntries();
1311
1312    char hname[30];
1313    sprintf(hname,"TreeR%d",evNumber);
1314    gAlice->TreeR()->Write(hname,TObject::kOverwrite);
1315    // reset tree
1316    gAlice->TreeR()->Reset();
1317
1318    delete [] random;
1319
1320 }
1321
1322 //________________________________________________________________
1323
1324 AliITStrack  AliITS::Tracking(AliITStrack &track, AliITStrack *reference,TObjArray *fastpoints, Int_t
1325 **vettid, Bool_t flagvert,  AliITSRad *rl  ) {
1326
1327 //Origin  A. Badala' and G.S. Pappalardo:  e-mail Angela.Badala@ct.infn.it, Giuseppe.S.Pappalardo@ct.infn.it
1328
1329
1330   TList *list= new TList();
1331
1332   AliITStrack tr(track);
1333
1334   list->AddLast(&tr);
1335
1336   Double_t Pt=(tr).GetPt();
1337   //cout << "\n Pt = " << Pt <<"\n";
1338
1339   AliITStracking obj(list, reference, this, fastpoints,TMath::Abs(Pt),vettid, flagvert, rl);
1340   list->Delete();
1341   delete list;
1342
1343   Int_t itot=-1;
1344   TVector VecTotLabref(18);
1345   Int_t lay, k;
1346   for(lay=5; lay>=0; lay--) {
1347     TVector VecLabref(3);
1348     VecLabref=(*reference).GetLabTrack(lay);
1349     Float_t ClustZ=(*reference).GetZclusterTrack( lay);   //modified il 5-3-2001
1350     for(k=0; k<3; k++) { // {itot++; VecTotLabref(itot)=VecLabref(k);}  // modified 5-3-2002
1351
1352         Int_t lpp=(Int_t)VecLabref(k);
1353         if(lpp>=0) {
1354           TParticle *p=(TParticle*) gAlice->Particle(lpp);
1355           Int_t pcode=p->GetPdgCode();
1356           if(pcode==11) VecLabref(k)=p->GetFirstMother();
1357         }
1358
1359         itot++; VecTotLabref(itot)=VecLabref(k);
1360         if(VecLabref(k)==0. && ClustZ == 0.) VecTotLabref(itot) =-3.;
1361     }
1362   }
1363   Long_t labref;
1364   Int_t freq;
1365   (*reference).Search(VecTotLabref, labref, freq);
1366
1367   if(freq < 5) labref=-labref;
1368   (*reference).SetLabel(labref);
1369
1370   return *reference;
1371
1372 }
1373
1374
1375
1376 //________________________________________________________________
1377
1378
1379
1380 void AliITS::DoTracking(Int_t evNumber, Int_t min_t, Int_t max_t, TFile *file, Bool_t flagvert) {
1381
1382 //   ex macro for tracking ITS
1383
1384   printf("begin DoTracking - file %p\n",file);
1385
1386   const char *pname="75x40_100x60";
1387
1388  Int_t imax=200,jmax=450;
1389   AliITSRad *rl = new AliITSRad(imax,jmax);
1390   //cout<<" dopo costruttore AliITSRad\n"; getchar();
1391
1392   struct GoodTrack {
1393     Int_t lab,code;
1394     Float_t px,py,pz,x,y,z,pxg,pyg,pzg,ptg;
1395     Bool_t flag;
1396   };
1397
1398
1399   gAlice->GetEvent(0);
1400
1401   AliTPC *TPC=(AliTPC*)gAlice->GetDetector("TPC");
1402   AliTPCParam *digp = (AliTPCParam*)file->Get(pname);
1403   if (digp!=0) TPC->SetParam(digp);
1404
1405   GoodTrack gt[15000];
1406   Int_t ngood=0;
1407   ifstream in("itsgood_tracks");
1408
1409   cerr<<"Reading itsgood tracks...\n";
1410   while (in>>gt[ngood].lab>>gt[ngood].code
1411           >>gt[ngood].px >>gt[ngood].py>>gt[ngood].pz
1412           >>gt[ngood].x  >>gt[ngood].y >>gt[ngood].z
1413           >>gt[ngood].pxg  >>gt[ngood].pyg >>gt[ngood].pzg
1414           >>gt[ngood].ptg >>gt[ngood].flag) {
1415     ngood++;
1416     cerr<<ngood<<'\r';
1417     if (ngood==15000) {
1418       cerr<<"Too many good tracks !\n";
1419       break;
1420     }
1421   }
1422   if (!in.eof()) cerr<<"Read error (itsgood_tracks) !\n";
1423
1424
1425 // Load tracks
1426   TFile *tf=TFile::Open("tpctracks.root");
1427   if (!tf->IsOpen()) {cerr<<"Can't open tpctracks.root !\n"; return ;}
1428   TObjArray tracks(200000);
1429   TTree *tracktree=(TTree*)tf->Get("TreeT");
1430   TBranch *tbranch=tracktree->GetBranch("tracks");
1431   Int_t nentr=(Int_t)tracktree->GetEntries();
1432   Int_t kk;
1433   for (kk=0; kk<nentr; kk++) {
1434     AliTPCtrack *iotrack=new AliTPCtrack;
1435     tbranch->SetAddress(&iotrack);
1436     tracktree->GetEvent(kk);
1437     tracks.AddLast(iotrack);
1438   }
1439   tf->Close();
1440
1441
1442   Int_t nt = tracks.GetEntriesFast();
1443   cerr<<"Number of found tracks "<<nt<<endl;
1444
1445   TVector DataOut(9);
1446   Int_t kkk=0;
1447
1448   Double_t ptg=0.,pxg=0.,pyg=0.,pzg=0.;
1449
1450   //////////////////////////////  good tracks definition in TPC  ////////////////////////////////
1451
1452   ofstream out1 ("AliITSTrag.out");
1453   Int_t i;
1454   for (i=0; i<ngood; i++) out1 << gt[i].ptg << "\n";
1455   out1.close();
1456
1457
1458   TVector vec(5);
1459   TTree *TR=gAlice->TreeR();
1460   Int_t nent=(Int_t)TR->GetEntries();
1461   TClonesArray  *recPoints = RecPoints();
1462   Int_t numbpoints;
1463   Int_t totalpoints=0;
1464   Int_t *np = new Int_t[nent];
1465   Int_t **vettid = new Int_t* [nent];
1466   Int_t mod;
1467   for (mod=0; mod<nent; mod++) {
1468     vettid[mod]=0;
1469     this->ResetRecPoints();
1470     //gAlice->TreeR()->GetEvent(mod+1); //first entry in TreeR is empty
1471     gAlice->TreeR()->GetEvent(mod); //first entry in TreeR is empty
1472     numbpoints = recPoints->GetEntries();
1473     totalpoints+=numbpoints;
1474     np[mod] = numbpoints;
1475   //cout<<" mod = "<<mod<<"   numbpoints = "<<numbpoints<<"\n"; getchar();
1476     vettid[mod] = new Int_t[numbpoints];
1477     Int_t ii;
1478     for (ii=0;ii<numbpoints; ii++) *(vettid[mod]+ii)=0;
1479   }
1480
1481   AliTPCtrack *track;
1482
1483
1484   if(min_t < 0) {min_t = 0; max_t = nt-1;}
1485
1486 /*
1487   ///////////////////////////////// Definition of vertex end its error ////////////////////////////
1488   ////////////////////////// In the future it will be given by a method ///////////////////////////
1489   Double_t Vx=0.;
1490   Double_t Vy=0.;
1491   Double_t Vz=0.;
1492
1493   Float_t sigmavx=0.0050;      // 50  microns
1494   Float_t sigmavy=0.0050;      // 50  microns
1495   Float_t sigmavz=0.010;       // 100 microns
1496
1497   //Vx+=gRandom->Gaus(0,sigmavx);  Vy+=gRandom->Gaus(0,sigmavy);  Vz+=gRandom->Gaus(0,sigmavz);
1498   TVector vertex(3), ervertex(3)
1499   vertex(0)=Vx; vertex(1)=Vy; vertex(2)=Vz;
1500   ervertex(0)=sigmavx;  ervertex(1)=sigmavy;  ervertex(2)=sigmavz;
1501   /////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1502 */
1503
1504   //TDirectory *savedir=gDirectory;
1505
1506   TTree tracktree1("TreeT","Tree with ITS tracks");
1507   AliITSiotrack *iotrack=0;
1508   tracktree1.Branch("ITStracks","AliITSiotrack",&iotrack,32000,0);
1509
1510   ofstream out ("AliITSTra.out");
1511
1512   Int_t j;
1513   for (j=min_t; j<=max_t; j++) {
1514     track=(AliTPCtrack*)tracks.UncheckedAt(j);
1515     Int_t flaglab=0;
1516     if (!track) continue;
1517     ////// elimination of not good tracks ////////////
1518     Int_t ilab=TMath::Abs(track->GetLabel());
1519     Int_t iii;
1520     for (iii=0;iii<ngood;iii++) {
1521          //cout<<" ilab, gt[iii].lab = "<<ilab<<" "<<gt[iii].lab<<"\n"; getchar();
1522       if (ilab==gt[iii].lab) {
1523         flaglab=1;
1524         ptg=gt[iii].ptg;
1525         pxg=gt[iii].pxg;
1526         pyg=gt[iii].pyg;
1527         pzg=gt[iii].pzg;
1528         break;
1529       }
1530     }
1531          //cout<<" j flaglab =  " <<j<<" "<<flaglab<<"\n";  getchar();
1532     if (!flaglab) continue;
1533          //cout<<" j =  " <<j<<"\n";  getchar();
1534   /*
1535     ////// old propagation to the end of TPC //////////////
1536     Double_t xk=76.;
1537     track->PropagateTo(xk);
1538     xk-=0.11;
1539     track->PropagateTo(xk,42.7,2.27); //C
1540     xk-=2.6;
1541     track->PropagateTo(xk,36.2,1.98e-3); //C02
1542     xk-=0.051;
1543     track->PropagateTo(xk,42.7,2.27); //C
1544     ///////////////////////////////////////////////////
1545          */
1546
1547          ////// new propagation to the end of TPC //////////////
1548     Double_t xk=77.415;
1549     track->PropagateTo(xk, 28.94, 1.204e-3);     //Ne
1550          xk -=0.01;
1551     track->PropagateTo(xk, 44.77, 1.71);         //Tedlar
1552          xk -=0.04;
1553     track->PropagateTo(xk, 44.86, 1.45);         //Kevlar
1554          xk -=2.0;
1555     track->PropagateTo(xk, 41.28, 0.029);        //Nomex
1556     xk-=16;
1557     track->PropagateTo(xk,36.2,1.98e-3); //C02
1558          xk -=0.01;
1559     track->PropagateTo(xk, 24.01, 2.7);  //Al
1560          xk -=0.01;
1561     track->PropagateTo(xk, 44.77, 1.71);         //Tedlar
1562          xk -=0.04;
1563     track->PropagateTo(xk, 44.86, 1.45);         //Kevlar
1564          xk -=0.5;
1565     track->PropagateTo(xk, 41.28, 0.029);        //Nomex
1566
1567        ///////////////////////////////////////////////////////////////
1568
1569    ///////////////////////////////////////////////////////////////
1570     AliITStrack trackITS(*track);
1571     AliITStrack result(*track);
1572     AliITStrack primarytrack(*track);
1573
1574 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1575          TVector Vgeant(3);
1576          Vgeant=result.GetVertex();
1577
1578   // Definition of Dv and Zv for vertex constraint
1579      Double_t sigmaDv=0.0050;  Double_t sigmaZv=0.010;
1580     //Double_t sigmaDv=0.0015;  Double_t sigmaZv=0.0015;
1581         Double_t uniform= gRandom->Uniform();
1582         Double_t signdv;
1583         if(uniform<=0.5) signdv=-1.;
1584            else
1585                  signdv=1.;
1586
1587         Double_t Vr=TMath::Sqrt(Vgeant(0)*Vgeant(0)+ Vgeant(1)*Vgeant(1));
1588           Double_t Dv=gRandom->Gaus(signdv*Vr,(Float_t)sigmaDv);
1589     Double_t Zv=gRandom->Gaus(Vgeant(2),(Float_t)sigmaZv);
1590
1591   //cout<<" Dv e Zv = "<<Dv<<" "<<Zv<<"\n";
1592     trackITS.SetDv(Dv);  trackITS.SetZv(Zv);
1593     trackITS.SetsigmaDv(sigmaDv); trackITS.SetsigmaZv(sigmaZv);
1594     result.SetDv(Dv);  result.SetZv(Zv);
1595     result.SetsigmaDv(sigmaDv); result.SetsigmaZv(sigmaZv);
1596     primarytrack.SetDv(Dv);  primarytrack.SetZv(Zv);
1597     primarytrack.SetsigmaDv(sigmaDv); primarytrack.SetsigmaZv(sigmaZv);
1598
1599 /////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1600
1601     primarytrack.PrimaryTrack(rl);
1602     TVector  d2=primarytrack.Getd2();
1603     TVector  tgl2=primarytrack.Gettgl2();
1604     TVector  dtgl=primarytrack.Getdtgl();
1605     trackITS.Setd2(d2); trackITS.Settgl2(tgl2);  trackITS.Setdtgl(dtgl);
1606     result.Setd2(d2); result.Settgl2(tgl2);  result.Setdtgl(dtgl);
1607          /*
1608     trackITS.SetVertex(vertex); trackITS.SetErrorVertex(ervertex);
1609     result.SetVertex(vertex);   result.SetErrorVertex(ervertex);
1610     */
1611     Tracking(trackITS,&result,recPoints,vettid, flagvert,rl);
1612
1613     // cout<<" progressive track number = "<<j<<"\r";
1614    // cout<<j<<"\r";
1615    // cout<<" progressive track number = "<<j<<"\n";
1616     Long_t labITS=result.GetLabel();
1617    // cout << " ITS track label = " << labITS << "\n";
1618     int lab=track->GetLabel();
1619    // cout << " TPC track label = " << lab <<"\n";
1620     //result.GetClusters(); getchar();  //to print the cluster matrix
1621
1622 //propagation to vertex
1623
1624     Double_t rbeam=3.;
1625
1626     result.Propagation(rbeam);
1627
1628     TMatrix *cov;
1629          cov=&result.GetCMatrix();
1630     Double_t pt=TMath::Abs(result.GetPt());
1631     Double_t Dr=result.GetD();
1632     Double_t Z=result.GetZ();
1633     Double_t tgl=result.GetTgl();
1634     Double_t C=result.GetC();
1635     Double_t Cy=C/2.;
1636     Double_t Dz=Z-(tgl/Cy)*TMath::ASin(result.arga(rbeam));
1637           Dz-=Vgeant(2);
1638
1639          // cout<<" Dr e dz alla fine = "<<Dr<<" "<<Dz<<"\n"; getchar();
1640     Double_t phi=result.Getphi();
1641     Double_t phivertex = phi - TMath::ASin(result.argA(rbeam));
1642     Double_t duepi=2.*TMath::Pi();
1643     if(phivertex>duepi) phivertex-=duepi;
1644     if(phivertex<0.) phivertex+=duepi;
1645     Double_t Dtot=TMath::Sqrt(Dr*Dr+Dz*Dz);
1646
1647 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1648     Int_t NumofCluster, idmodule,idpoint;
1649     NumofCluster=result.GetNumClust();
1650     if(NumofCluster >=5)  {
1651
1652
1653       AliITSiotrack outtrack;
1654
1655       iotrack=&outtrack;
1656
1657       iotrack->SetStatePhi(phi);
1658       iotrack->SetStateZ(Z);
1659       iotrack->SetStateD(Dr);
1660       iotrack->SetStateTgl(tgl);
1661       iotrack->SetStateC(C);
1662                 Double_t radius=result.Getrtrack();
1663                 iotrack->SetRadius(radius);
1664                 Int_t charge;
1665                 if(C>0.) charge=-1;  else charge=1;
1666                 iotrack->SetCharge(charge);
1667
1668
1669
1670       iotrack->SetCovMatrix(cov);
1671
1672       Double_t px=pt*TMath::Cos(phi);
1673       Double_t py=pt*TMath::Sin(phi);
1674       Double_t pz=pt*tgl;
1675
1676       Double_t xtrack=Dr*TMath::Sin(phi);
1677       Double_t ytrack=Dr*TMath::Cos(phi);
1678       Double_t ztrack=Dz+Vgeant(2);
1679
1680
1681       iotrack->SetPx(px);
1682       iotrack->SetPy(py);
1683       iotrack->SetPz(pz);
1684       iotrack->SetX(xtrack);
1685       iotrack->SetY(ytrack);
1686       iotrack->SetZ(ztrack);
1687       iotrack->SetLabel(labITS);
1688
1689       Int_t il;
1690                 for(il=0;il<6; il++){
1691                   iotrack->SetIdPoint(il,result.GetIdPoint(il));
1692                   iotrack->SetIdModule(il,result.GetIdModule(il));
1693                 }
1694       tracktree1.Fill();
1695
1696    //cout<<" labITS = "<<labITS<<"\n";
1697         //cout<<" phi z Dr tgl C = "<<phi<<" "<<Z<<" "<<Dr<<" "<<tgl<<" "<<C<<"\n";  getchar();
1698
1699      DataOut(kkk) = ptg; kkk++; DataOut(kkk)=labITS; kkk++; DataOut(kkk)=lab; kkk++;
1700
1701       for (il=0;il<6;il++) {
1702         idpoint=result.GetIdPoint(il);
1703         idmodule=result.GetIdModule(il);
1704         *(vettid[idmodule]+idpoint)=1;
1705         iotrack->SetIdPoint(il,idpoint);
1706         iotrack->SetIdModule(il,idmodule);
1707       }
1708
1709     //  cout<<"  +++++++++++++  pt e ptg = "<<pt<<" "<<ptg<<"  ++++++++++\n";
1710       Double_t difpt= (pt-ptg)/ptg*100.;
1711       DataOut(kkk)=difpt; kkk++;
1712       Double_t lambdag=TMath::ATan(pzg/ptg);
1713       Double_t   lam=TMath::ATan(tgl);
1714       Double_t diflam = (lam - lambdag)*1000.;
1715       DataOut(kkk) = diflam; kkk++;
1716       Double_t phig=TMath::ATan(pyg/pxg);
1717       Double_t phi=phivertex;
1718       Double_t difphi = (phi - phig)*1000.;
1719       DataOut(kkk)=difphi; kkk++;
1720       DataOut(kkk)=Dtot*1.e4; kkk++;
1721       DataOut(kkk)=Dr*1.e4; kkk++;
1722       DataOut(kkk)=Dz*1.e4; kkk++;
1723       Int_t r;
1724       for (r=0; r<9; r++) { out<<DataOut(r)<<" ";}
1725       out<<"\n";
1726       kkk=0;
1727
1728
1729     } // end if on NumofCluster
1730   //gObjectTable->Print();    // stampa memoria
1731   }  //  end for (int j=min_t; j<=max_t; j++)
1732
1733   out.close();
1734
1735
1736   static Bool_t first=kTRUE;
1737   static TFile *tfile;
1738
1739         if(first) {
1740             tfile=new TFile("itstracks.root","RECREATE");
1741             //cout<<"I have opened itstracks.root file "<<endl;
1742         }
1743         first=kFALSE;
1744         tfile->cd();
1745         tfile->ls();
1746
1747    char hname[30];
1748    sprintf(hname,"TreeT%d",evNumber);
1749
1750   tracktree1.Write(hname);
1751
1752
1753
1754             TTree *fAli=gAlice->TreeK();
1755             TFile *fileAli=0;
1756
1757             if (fAli) fileAli =fAli->GetCurrentFile();
1758             fileAli->cd();
1759
1760   ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
1761
1762   printf("delete vectors\n");
1763   if(np) delete [] np;
1764   if(vettid) delete [] vettid;
1765
1766 }