Coverity and some clean-up
[u/mrichter/AliRoot.git] / ITS / AliITS.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16 /* $Id$ */
17
18
19 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
20 //                                                                           //
21 //      An overview of the basic philosophy of the ITS code development      //
22 // and analysis is show in the figure below.                                 //
23 //Begin_Html                                                                 //
24 /*                                               
25 <img src="picts/ITS/ITS_Analysis_schema.gif">
26 </pre>
27 <br clear=left>
28 <font size=+2 color=red>
29 <p>Roberto Barbera is in charge of the ITS Offline code (1999).
30 <a href="mailto:roberto.barbera@ct.infn.it">Roberto Barbera</a>.
31 </font>
32 <pre>
33 */
34 //End_Html
35 //
36 //  AliITS. Inner Traking System base class.
37 //  This class contains the base procedures for the Inner Tracking System
38 //
39 //Begin_Html
40 /*
41 <img src="picts/ITS/AliITS_Class_Diagram.gif">
42 </pre>
43 <br clear=left>
44 <font size=+2 color=red>
45 <p>This show the class diagram of the different elements that are part of
46 the AliITS class.
47 </font>
48 <pre>
49 */
50 //End_Html
51 //
52 // Version: 0
53 // Written by Rene Brun, Federico Carminati, and Roberto Barbera
54 //
55 // Version: 1
56 // Modified and documented by Bjorn S. Nilsen
57 // July 11 1999
58 //
59 // Version: 2
60 // Modified and documented by A. Bologna
61 // October 18 1999
62 //
63 // AliITS is the general base class for the ITS. Also see AliDetector for
64 // futher information.
65 //
66 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
67
68 #include <stdlib.h>
69 #include <TClonesArray.h>
70 #include <TFile.h>
71 #include <TParticle.h>
72 #include <TString.h>
73 #include <TTree.h>
74 #include <TVirtualMC.h>
75 #include "AliDetector.h"
76 #include "AliITS.h"
77 #include "AliITSDetTypeSim.h"
78 #include "AliITSDDLRawData.h"
79 #include "AliITSLoader.h"
80 #include "AliITShit.h"
81 #include "AliITSmodule.h"
82 #include "AliITSpListItem.h"
83 #include "AliITSsimulation.h"
84 #include "AliITSsimulationFastPoints.h"
85 #include "AliMC.h"
86 #include "AliITSRecPoint.h"
87 #include "AliITSsegmentationSPD.h"
88 #include "AliITSsegmentationSDD.h"
89 #include "AliITSsimulationSDD.h"
90 #include "AliITSCalibrationSDD.h"
91 #include "AliITSCalibrationSSD.h"
92 #include "AliITSsegmentationSSD.h"
93 #include "AliITSRawStreamSPD.h"
94 #include "AliITSRawStreamSSD.h"
95 #include "AliITSRawStreamSDD.h"
96 #include "AliRawReader.h"
97 #include "AliRun.h"
98 #include "AliLog.h"
99 #include "AliITSInitGeometry.h"
100 #include "AliITSFOSignalsSPD.h"
101
102 ClassImp(AliITS)
103
104 //______________________________________________________________________
105 AliITS::AliITS() : AliDetector(),
106 fDetTypeSim(0),
107 fEuclidOut(0),
108 fOpt("All"),
109 fIdN(0),
110 fIdSens(0),
111 fIdName(0),
112 fITSmodules(0),
113 fTiming(kFALSE),
114 fSimuParam(0),
115 fModA(0),
116 fpSDigits(0)
117 {
118   // Default initializer for ITS
119   //      The default constructor of the AliITS class. In addition to
120   // creating the AliITS class it zeros the variables fIshunt (a member
121   // of AliDetector class), fEuclidOut, and fIdN, and zeros the pointers
122   // fIdSens, and fIdName. The AliDetector default constructor
123   // is also called.
124   
125 //    SetDetectors(); // default to fOpt="All". This variable not written out.
126 //PH    SetMarkerColor(kRed);
127 }
128 //______________________________________________________________________
129 AliITS::AliITS(const Char_t *title):
130   AliDetector("ITS",title),
131   fDetTypeSim(0),
132   fEuclidOut(0),
133   fOpt("All"),
134   fIdN(0),
135   fIdSens(0),
136   fIdName(0),
137   fITSmodules(0),
138   fTiming(kFALSE),
139   fSimuParam(0),
140   fModA(0),
141   fpSDigits(0)
142 {
143     //     The standard Constructor for the ITS class. 
144     // It also zeros the variables
145     // fIshunt (a member of AliDetector class), fEuclidOut, and zeros
146     // the pointers fIdSens and fIdName. To help in displaying hits via the
147     // ROOT macro display.C AliITS also sets the marker color to red. The
148     // variables passes with this constructor, const char *name and *title,
149     // are used by the constructor of AliDetector class. See AliDetector
150     // class for a description of these parameters and its constructor
151     // functions.
152     // Inputs:
153     //   Char_t *title  Simulation title for the ITS
154     // Outputs:
155     //   none.
156     // Return:
157     //   none.
158   
159     fHits = new TClonesArray("AliITShit",1560); // from AliDetector
160     if(gAlice->GetMCApp()) gAlice->GetMCApp()->AddHitList(fHits);
161     //fNhits=0;  //done in AliDetector(name,title)
162     SetDetectors(); // default to fOpt="All". This variable not written out.
163     fDetTypeSim   = new AliITSDetTypeSim();
164     //PH  SetMarkerColor(kRed);
165     if(!fLoader) MakeLoader(AliConfig::GetDefaultEventFolderName());
166     fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
167 }
168 //______________________________________________________________________
169 AliITS::AliITS(const char *name, const char *title):
170   AliDetector(name,title),
171   fDetTypeSim(0),
172   fEuclidOut(0),
173   fOpt("All"),
174   fIdN(0),
175   fIdSens(0),
176   fIdName(0),
177   fITSmodules(0),
178   fTiming(kFALSE),
179   fSimuParam(0),
180   fModA(0),
181   fpSDigits(0)
182 {
183   //     The standard Constructor for the ITS class. 
184   // It also zeros the variables
185   // fIshunt (a member of AliDetector class), fEuclidOut, and zeros
186   // the pointers fIdSens and fIdName. To help in displaying hits via the
187   // ROOT macro display.C AliITS also sets the marker color to red. The
188   // variables passes with this constructor, const char *name and *title,
189   // are used by the constructor of AliDetector class. See AliDetector
190   // class for a description of these parameters and its constructor
191   // functions.
192   
193   fHits = new TClonesArray("AliITShit",1560);
194   if(gAlice->GetMCApp()) gAlice->GetMCApp()->AddHitList(fHits);
195   //fNhits=0;  //done in AliDetector(name,title)
196
197   SetDetectors(); // default to fOpt="All". This variable not written out.
198     
199   fDetTypeSim   = new AliITSDetTypeSim();
200   //PH  SetMarkerColor(kRed);
201   if(!fLoader) MakeLoader(AliConfig::GetDefaultEventFolderName());
202   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
203
204 }
205 //______________________________________________________________________
206 AliITS::~AliITS(){
207     // Default destructor for ITS.
208     //     The default destructor of the AliITS class. In addition to deleting
209     // the AliITS class it deletes the memory pointed to by 
210     // fIdSens, fIdName, fDetTypeSim and it's contents.
211     // Inputs:
212     //      none.
213     // Outputs:
214     //      none.
215     // Return:
216     //      none.
217
218     if (fHits) {
219       fHits->Delete();
220       delete fHits;
221       fHits=0;
222     }
223     if(fITSmodules) {
224         this->ClearModules();
225         delete fITSmodules;
226         fITSmodules = 0;
227     }// end if fITSmodules!=0
228
229     delete[] fIdName;  // Array of TStrings
230     delete[] fIdSens;
231     Int_t size   = AliITSgeomTGeo::GetNModules();
232     if (fDetTypeSim){
233       delete fDetTypeSim;
234       fDetTypeSim = 0;
235     }
236     if(fSimuParam){
237       delete fSimuParam;
238       fSimuParam=0;
239     }
240     if(fModA){
241       if(size>0){
242         for(Int_t j=0; j<size; j++){
243           fModA[j]->Delete();
244           delete fModA[j];
245         }
246       }
247       delete []fModA;
248     }
249     if(fpSDigits){
250       fpSDigits->Delete();
251       delete fpSDigits;
252     }
253 }
254
255 //______________________________________________________________________
256 void AliITS::Init(){
257     // Initializer ITS after it has been built
258     //     This routine initializes the AliITS class. It is intended to be
259     // called from the Init function in AliITSv?. Besides displaying a banner
260     // indicating that it has been called it initializes the array fIdSens
261     // and sets the default segmentation, response, digit and raw cluster
262     // classes therefore it should be called after a call to CreateGeometry.
263     // Inputs:
264     //      none.
265     // Outputs:
266     //      none.
267     // Return:
268     //      none.
269     Int_t i;
270     // Array of TStrings
271     if(gMC) for(i=0;i<fIdN;i++) fIdSens[i] = gMC->VolId(fIdName[i]);
272  
273 }
274 //______________________________________________________________________
275 void AliITS::SetDefaults(){
276     // sets the default segmentation, response, digit and raw cluster classes.
277     // Inputs:
278     //      none.
279     // Outputs:
280     //      none.
281     // Return:
282     //      none.
283     AliInfoClass("AliITS::Setting Defaults");
284     if(!fDetTypeSim) { 
285      Error("SetDefaults()","fDetTypeSim is 0!"); 
286      return;
287     }
288
289     fDetTypeSim->SetDefaults();
290     if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
291
292 }
293 //______________________________________________________________________
294 void AliITS::SetDefaultSimulation(){
295     // sets the default simulation.
296     // Inputs:
297     //      none.
298     // Outputs:
299     //      none.
300     // Return:
301     //      none.
302     if(!fDetTypeSim) { 
303      Error("SetDefaultSimulation()","fDetTypeSim is 0!"); 
304      return;
305     }
306
307     fDetTypeSim->SetDefaultSimulation();
308     if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
309
310 }
311
312
313 //______________________________________________________________________
314 void AliITS::MakeBranch(Option_t* option){
315     // Creates Tree branches for the ITS.
316     // Inputs:
317     //      Option_t *option    String of Tree types S,D, and/or R.
318     //      const char *file    String of the file name where these branches
319     //                          are to be stored. If blank then these branches
320     //                          are written to the same tree as the Hits were
321     //                          read from.
322     // Outputs:
323     //      none.
324     // Return:
325     //      none.
326   if(!fDetTypeSim) {
327     Error("MakeBranch","fDetTypeSim is 0!");
328     return;
329   }
330
331   Bool_t cH = (strstr(option,"H")!=0);
332   Bool_t cS = (strstr(option,"S")!=0);
333   Bool_t cD = (strstr(option,"D")!=0);
334   
335   if(cH && (fHits == 0x0)) fHits = new TClonesArray("AliITShit", 1560);
336   AliDetector::MakeBranch(option);
337   
338   if(cS) MakeBranchS(0);
339   if(cD) MakeBranchD(0);
340
341
342 }
343 //___________________________________________________________________
344 void AliITS::MakeBranchS(const char* fl){
345
346   // Creates Tree Branch for the ITS summable digits.
347   // Inputs:
348   //      cont char *fl  File name where SDigits branch is to be written
349   //                     to. If blank it write the SDigits to the same
350   //                     file in which the Hits were found.
351
352   
353   if(!fDetTypeSim){
354     Error("MakeBranchS","fDetTypeSim is 0!");
355   }
356   Int_t buffersize = 4000;
357   char branchname[30];
358
359   // only one branch for SDigits.
360   sprintf(branchname,"%s",GetName());
361
362   if(fLoader->TreeS()){
363     TClonesArray* sdig = (TClonesArray*)fDetTypeSim->GetSDigits();
364     MakeBranchInTree(fLoader->TreeS(),branchname,&sdig,buffersize,fl);
365   } 
366 }
367 //______________________________________________________________________
368 void AliITS::MakeBranchD(const char* file){
369
370   //Make branch for digits
371   if(!fDetTypeSim) {
372     Warning("MakeBranchD","fDetTypeSim is 0!");
373     return;
374   }
375   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
376   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
377   MakeBranchInTreeD(fLoader->TreeD(),file);
378 }
379
380 //___________________________________________________________________
381 void AliITS:: MakeBranchInTreeD(TTree* treeD, const char* file){
382   // Creates Tree branches for the ITS.
383
384   if(!fDetTypeSim){
385     Error("MakeBranchS","fDetTypeSim is 0!");
386   }
387   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
388   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
389
390   const Char_t *det[3] = {"SPD","SDD","SSD"};
391   const Char_t* digclass;
392   Int_t buffersize = 4000;
393   Char_t branchname[30];
394   
395   if(!fDetTypeSim->GetDigits()){
396     fDetTypeSim->SetDigits(new TObjArray(fgkNTYPES));
397   }
398   for(Int_t i=0;i<fgkNTYPES;i++){
399     digclass = fDetTypeSim->GetDigitClassName(i);
400     TString classn = digclass;
401     if(!((fDetTypeSim->GetDigits())->At(i))){
402       (fDetTypeSim->GetDigits())->AddAt(new TClonesArray(classn.Data(),1000),i);
403     }
404     else ResetDigits(i);  
405     if(fgkNTYPES==3) sprintf(branchname,"%sDigits%s",GetName(),det[i]);
406     else sprintf(branchname,"%sDigits%d",GetName(),i+1);
407     TObjArray* dig = DigitsAddress(i);
408     if(GetDigits() && treeD) AliDetector::MakeBranchInTree(treeD,branchname, &dig,buffersize,file);
409   }
410
411 }
412 //______________________________________________________________________
413 void AliITS::SetTreeAddress(){
414     // Set branch address for the Trees.
415     // Inputs:
416     //      none.
417     // Outputs:
418     //      none.
419     // Return:
420     //      none.
421     
422   if(!fDetTypeSim) {
423     Error("SetTreeAddress","fDetTypeSim is 0!");
424     return;
425   }
426
427   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
428   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
429
430   TTree *treeS = fLoader->TreeS();
431   TTree *treeD = fLoader->TreeD();
432   if (fLoader->TreeH() && (fHits == 0x0)) {
433       fHits = new TClonesArray("AliITShit", 1560);
434   }
435   AliDetector::SetTreeAddress();
436
437   fDetTypeSim->SetTreeAddressS(treeS, (Char_t*)GetName());
438   fDetTypeSim->SetTreeAddressD(treeD, (Char_t*)GetName());
439 }
440 //______________________________________________________________________
441 void AliITS::AddHit(Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits){
442     // Add an ITS hit
443     //     The function to add information to the AliITShit class. See the
444     // AliITShit class for a full description. This function allocates the
445     // necessary new space for the hit information and passes the variable
446     // track, and the pointers *vol and *hits to the AliITShit constructor
447     // function.
448     // Inputs:
449     //      Int_t   track   Track number which produced this hit.
450     //      Int_t   *vol    Array of Integer Hit information. See AliITShit.h
451     //      Float_t *hits   Array of Floating Hit information.  see AliITShit.h
452     // Outputs:
453     //      none.
454     // Return:
455     //      none.
456   TClonesArray &lhits = *fHits;
457   new(lhits[fNhits++]) AliITShit(fIshunt,track,vol,hits);
458 }
459
460 //______________________________________________________________________
461 void AliITS::FillModules(Int_t evnt,Int_t bgrev,Int_t nmodules,
462                          Option_t *option, const char *filename){
463   // fill the modules with the sorted by module hits; add hits from
464   // background if option=Add.
465
466   static TTree *trH1;                 //Tree with background hits
467   static Bool_t first=kTRUE;
468   static TFile *file;
469   const char *addBgr = strstr(option,"Add");
470   
471   evnt = nmodules; // Dummy use of variables to remove warnings
472   if (addBgr ) {
473     if(first) {
474       file=new TFile(filename);
475     } // end if first
476     first=kFALSE;
477     file->cd();
478     file->ls();
479     // Get Hits Tree header from file
480     if(trH1) delete trH1;
481     trH1=0;
482     
483     char treeName[20];
484     sprintf(treeName,"TreeH%d",bgrev);
485     trH1 = (TTree*)gDirectory->Get(treeName);
486     if (!trH1) {
487       Error("FillModules","cannot find Hits Tree for event:%d",bgrev);
488     } // end if !trH1
489     // Set branch addresses
490   } // end if addBgr
491   
492   FillModules(fLoader->TreeH(),0); // fill from this file's tree.
493     
494   if (addBgr ) {
495     FillModules(trH1,10000000); // Default mask 10M.
496     TTree *fAli=fLoader->GetRunLoader()->TreeK();
497     TFile *fileAli=0;
498     if (fAli) fileAli =fAli->GetCurrentFile();
499     fileAli->cd();
500   } // end if add
501   
502   
503 }
504 //______________________________________________________________________
505 void AliITS::FillModules(TTree *treeH, Int_t mask) {
506     // fill the modules with the sorted by module hits; 
507     // can be called many times to do a merging
508     // Inputs:
509     //      TTree *treeH  The tree containing the hits to be copied into
510     //                    the modules.
511     //      Int_t mask    The track number mask to indecate which file
512     //                    this hits came from.
513     // Outputs:
514     //      none.
515     // Return:
516     //      none.
517
518     if (treeH == 0x0)
519      {
520        Error("FillModules","Tree is NULL");
521      }
522     Int_t lay,lad,det,index;
523     AliITShit *itsHit=0;
524     AliITSmodule *mod=0;
525     char branchname[20];
526     sprintf(branchname,"%s",GetName());
527     TBranch *branch = treeH->GetBranch(branchname);
528     if (!branch) {
529         Error("FillModules","%s branch in TreeH not found",branchname);
530         return;
531     } // end if !branch
532     branch->SetAddress(&fHits);
533     Int_t nTracks =(Int_t) treeH->GetEntries();
534     Int_t iPrimTrack,h;
535     for(iPrimTrack=0; iPrimTrack<nTracks; iPrimTrack++){
536         ResetHits();
537         Int_t nBytes = treeH->GetEvent(iPrimTrack);
538         if (nBytes <= 0) continue;
539         Int_t nHits = fHits->GetEntriesFast();
540         for(h=0; h<nHits; h++){
541             itsHit = (AliITShit *)fHits->UncheckedAt(h);
542             itsHit->GetDetectorID(lay,lad,det);
543             if (GetITSgeom()) {
544                 index = GetITSgeom()->GetModuleIndex(lay,lad,det);
545             } else {
546                 index=det-1; // This should not be used.
547             } // end if [You must have fITSgeom for this to work!]
548             mod = GetModule(index);
549             itsHit->SetTrack(itsHit->GetTrack()+mask); // Set track mask.
550             mod->AddHit(itsHit,iPrimTrack,h);
551         } // end loop over hits 
552     } // end loop over tracks
553 }
554
555 //______________________________________________________________________
556 Bool_t AliITS::InitModules(Int_t size,Int_t &nmodules){
557     // Initialize the modules array.
558     // Inputs:
559     //      Int_t size  Size of array of the number of modules to be
560     //                  created. If size <=0 then the number of modules
561     //                  is gotten from AliITSgeom class kept in fITSgeom.
562     // Outputs:
563     //      Int_t &nmodules The number of modules existing.
564     // Return:
565     //      none.
566
567     if(fITSmodules){ 
568         fITSmodules->Delete();
569         delete fITSmodules;
570     } // end fir fITSmoudles
571
572     if(!fDetTypeSim) {
573       Error("InitModules","fDetTypeSim is null!");
574       return kFALSE;
575     }
576     if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
577
578     Int_t nl,indexMAX,index;
579
580     if(size<=0){ // default to using data stored in AliITSgeom
581         if(fDetTypeSim->GetITSgeom()==0) {
582             Error("InitModules","fITSgeom not defined");
583             return kFALSE;
584         } // end if fITSgeom==0
585         nl = fDetTypeSim->GetITSgeom()->GetNlayers();
586         indexMAX = fDetTypeSim->GetITSgeom()->GetIndexMax();
587         nmodules = indexMAX;
588         fITSmodules = new TObjArray(indexMAX);
589         for(index=0;index<indexMAX;index++){
590             fITSmodules->AddAt( new AliITSmodule(index),index);
591         } // end for index
592     }else{
593         fITSmodules = new TObjArray(size);
594         for(index=0;index<size;index++) {
595             fITSmodules->AddAt( new AliITSmodule(index),index);
596         } // end for index
597
598         nmodules = size;
599     } // end i size<=0
600     return kTRUE;
601 }
602 //______________________________________________________________________
603 void AliITS::Hits2SDigits(){
604     // Standard Hits to summable Digits function.
605     // Inputs:
606     //      none.
607     // Outputs:
608     //      none.
609   
610
611    if(!fDetTypeSim) {
612      Error("Hits2SDigits","fDetTypeSim is null!");
613      return; 
614   } 
615      
616   SetDefaults();
617   fLoader->LoadHits("read");
618   fLoader->LoadSDigits("recreate");
619   AliRunLoader* rl = fLoader->GetRunLoader(); 
620   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
621   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
622
623   for (Int_t iEvent = 0; iEvent < rl->GetNumberOfEvents(); iEvent++) {
624         // Do the Hits to Digits operation. Use Standard input values.
625         // Event number from file, no background hit merging , use size from
626         // AliITSgeom class, option="All", input from this file only.
627     rl->GetEvent(iEvent);
628     if (!fLoader->TreeS()) fLoader->MakeTree("S");
629     MakeBranch("S");
630     SetTreeAddress();
631     HitsToPreDigits(iEvent,0,-1," ",fOpt," ");
632   } // end for iEvent
633     
634   fLoader->UnloadHits();
635   fLoader->UnloadSDigits();
636   
637 }
638 //______________________________________________________________________
639 void AliITS::Hits2Digits(){
640
641   //Conversion from hits to digits
642   if(!fDetTypeSim) {
643     Error("Hits2SDigits","fDetTypeSim is 0!");
644     return;
645   }
646    
647   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
648   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
649   SetDefaults();
650
651   fLoader->LoadHits("read");
652   fLoader->LoadDigits("recreate");
653   AliRunLoader* rl = fLoader->GetRunLoader(); 
654   for (Int_t iEvent = 0; iEvent < rl->GetNumberOfEvents(); iEvent++) {
655     rl->GetEvent(iEvent);
656     if (!fLoader->TreeD()) fLoader->MakeTree("D");
657     MakeBranch("D");
658     SetTreeAddress();   
659     HitsToDigits(iEvent,0,-1," ",fOpt," ");
660   } 
661   
662   fLoader->UnloadHits();
663   fLoader->UnloadDigits();
664   
665 }
666
667 //______________________________________________________________________
668 void AliITS::HitsToDigits(Int_t evNumber,Int_t bgrev,Int_t size,
669                           Option_t *option,Option_t *opt,
670                           const char *filename){
671     //   Keep galice.root for signal and name differently the file for 
672     // background when add! otherwise the track info for signal will be lost !
673     // the condition below will disappear when the geom class will be
674     // initialized for all versions - for the moment it is only for v5 !
675     // 7 is the SDD beam test version.
676     // Inputs:
677     //      Int_t evnt       Event to be processed.
678     //      Int_t bgrev      Background Hit tree number.
679     //      Int_t nmodules   Not used.
680     //      Option_t *option String indicating if merging hits or not. To
681     //                       merge hits set equal to "Add". Otherwise no
682     //                       background hits are considered.
683     //      Test_t *filename File name containing the background hits..
684     // Outputs:
685     //      none.
686     // Return:
687     //      none.
688
689   if(!fDetTypeSim) {
690     Error("HitsToDigits","fDetTypeSim is null!");
691     return;
692   }
693   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
694   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
695   if(!GetITSgeom()) return; // need transformations to do digitization.
696   AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
697
698   const char *all = strstr(opt,"All");
699   const char *det[3] = {strstr(opt,"SPD"),strstr(opt,"SDD"),
700                         strstr(opt,"SSD")};
701   static Bool_t setDef=kTRUE;
702   if (setDef) SetDefaultSimulation();
703   setDef=kFALSE;
704   
705   Int_t nmodules;
706   InitModules(size,nmodules);
707   FillModules(evNumber,bgrev,nmodules,option,filename);
708  
709   // Reset Fast-OR signals for this event
710   fDetTypeSim->ResetFOSignals();
711
712   AliITSsimulation *sim      = 0;
713   AliITSmodule     *mod      = 0;
714   Int_t id;
715   for(Int_t module=0;module<geom->GetIndexMax();module++){
716     id       = geom->GetModuleType(module);
717     if (!all && !det[id]) continue;
718     sim      = (AliITSsimulation*)fDetTypeSim->GetSimulationModel(id);
719     if (!sim) {
720       Error("HitsToDigits","The simulation class was not "
721             "instanciated for module %d type %s!",module,
722             geom->GetModuleTypeName(module));
723       exit(1);
724     } // end if !sim
725     mod      = (AliITSmodule *)fITSmodules->At(module);
726     sim->DigitiseModule(mod,module,evNumber);
727     // fills all branches - wasted disk space
728     fLoader->TreeD()->Fill(); 
729     ResetDigits();
730   } // end for module
731   
732   ClearModules();
733  
734   // Add random noise to FO signals
735   if (all || det[0]) { // SPD present
736     fDetTypeSim->ProcessNoiseForFastOr();
737   }
738
739   // Add Fast-OR signals to event (only one object per event)
740   if (all || det[0]) { // SPD present
741     fDetTypeSim->WriteFOSignals();
742   }
743
744   
745   fLoader->TreeD()->GetEntries();
746   fLoader->TreeD()->AutoSave();
747   // reset tree
748   fLoader->TreeD()->Reset();
749 }
750 //_____________________________________________________________________
751 void AliITS::Hits2PreDigits(){ 
752   // Turn hits into SDigits
753
754   if(!fDetTypeSim) {
755     Error("Hits2SDigits","fDetTypeSim is 0!");
756     return;
757   }
758    
759   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
760   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
761   SetDefaults();
762   
763   HitsToPreDigits(fLoader->GetRunLoader()->GetEventNumber(),
764                   0,-1," ",fOpt," ");
765 }
766
767 //______________________________________________________________________
768 void AliITS::HitsToPreDigits(Int_t evNumber,Int_t bgrev,Int_t size,
769                              Option_t *option,Option_t *opt,
770                              const char *filename){
771     //   Keep galice.root for signal and name differently the file for 
772     // background when add! otherwise the track info for signal will be lost !
773     // the condition below will disappear when the geom class will be
774     // initialized for all versions - for the moment it is only for v5 !
775     // 7 is the SDD beam test version.
776     // Inputs:
777     //      Int_t evnt       Event to be processed.
778     //      Int_t bgrev      Background Hit tree number.
779     //      Int_t nmodules   Not used.
780     //      Option_t *option String indicating if merging hits or not. To
781     //                       merge hits set equal to "Add". Otherwise no
782     //                       background hits are considered.
783     //      Test_t *filename File name containing the background hits..
784     // Outputs:
785     //      none.
786     // Return:
787     //      none.
788
789  
790   if(!fDetTypeSim) {
791     Error("HitsToPreDigits","fDetTypeSim is null!");
792     return;
793   }
794   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
795   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
796
797   if(!GetITSgeom()){
798     Error("HitsToPreDigits","fGeom is null!");
799     return; // need transformations to do digitization.
800   }
801   AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
802
803   const char *all = strstr(opt,"All");
804   const char *det[3] = {strstr(opt,"SPD"),strstr(opt,"SDD"),
805                         strstr(opt,"SSD")};
806   static Bool_t setDef=kTRUE;
807   if (setDef) SetDefaultSimulation();
808   setDef=kFALSE;
809   
810   Int_t nmodules;
811   InitModules(size,nmodules);
812   FillModules(evNumber,bgrev,nmodules,option,filename);
813   
814
815   AliITSsimulation *sim      = 0;
816   AliITSmodule     *mod      = 0;
817   Int_t id,module;
818   for(module=0;module<geom->GetIndexMax();module++){
819     id       = geom->GetModuleType(module);
820     if (!all && !det[id]) continue;
821     sim      = (AliITSsimulation*)GetSimulationModel(id);
822     if (!sim) {
823       Error("HitsToPreDigits","The simulation class was not "
824             "instanciated for module %d type %s!",module,
825             geom->GetModuleTypeName(module));
826       exit(1);
827     } // end if !sim
828     mod      = (AliITSmodule *)fITSmodules->At(module);
829     sim->SDigitiseModule(mod,module,evNumber);
830     // fills all branches - wasted disk space
831     fLoader->TreeS()->Fill(); 
832     fDetTypeSim->ResetSDigits();
833   } // end for module
834
835   ClearModules();
836
837   
838   fLoader->TreeS()->GetEntries();
839   fLoader->TreeS()->AutoSave();
840   fLoader->WriteSDigits("OVERWRITE");
841   // reset tree
842   fLoader->TreeS()->Reset();
843 }
844
845 //_____________________________________________________________________
846 void AliITS::HitsToFastRecPoints(Int_t evNumber,Int_t bgrev,Int_t size,
847                                   Option_t *opt0,Option_t *opt1,
848                                  const char *flnm){
849     // keep galice.root for signal and name differently the file for 
850     // background when add! otherwise the track info for signal will be lost !
851     // the condition below will disappear when the geom class will be
852     // initialized for all versions - for the moment it is only for v5 !
853     // Inputs:
854     //      Int_t evnt       Event to be processed.
855     //      Int_t bgrev      Background Hit tree number.
856     //      Int_t size       Size used by InitModules. See InitModules.
857     //      Option_t *opt0   Option passed to FillModules. See FillModules.
858     //      Option_t *opt1   String indicating if merging hits or not. To
859     //                       merge hits set equal to "Add". Otherwise no
860     //                       background hits are considered.
861     //      Test_t *flnm     File name containing the background hits..
862     // Outputs:
863     //      none.
864     // Return:
865     //      none.
866
867
868
869   if(!GetITSgeom()){
870     Error("HitsToPreDigits","fGeom is null!");
871     return; // need transformations to do digitization.
872   }
873   AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
874
875   AliITSLoader *pITSloader = (AliITSLoader*)fLoader;
876
877   const char *all = strstr(opt1,"All");
878   const char *det[3] ={strstr(opt1,"SPD"),strstr(opt1,"SDD"),
879                        strstr(opt1,"SSD")};
880   Int_t nmodules;
881   InitModules(size,nmodules);
882   FillModules(evNumber,bgrev,nmodules,opt0,flnm);
883
884   AliITSsimulation *sim      = 0;
885   AliITSmodule     *mod      = 0;
886   Int_t id,module;
887
888   TTree *lTR = pITSloader->TreeR();
889   if(!lTR) {
890     pITSloader->MakeTree("R");
891     lTR = pITSloader->TreeR();
892   }
893   
894   TClonesArray* ptarray = new TClonesArray("AliITSRecPoint",1000);
895   TBranch* branch = (TBranch*)lTR->Branch("ITSRecPointsF",&ptarray);
896   branch->SetAddress(&ptarray);
897   //m.b. : this change is nothing but a nice way to make sure
898   //the CPU goes up !    
899   for(module=0;module<geom->GetIndexMax();module++){
900     id       = geom->GetModuleType(module);
901     if (!all && !det[id]) continue;
902     sim      = (AliITSsimulation*)GetSimulationModel(id);
903     if (!sim) {
904       Error("HitsToFastPoints","The simulation class was not "
905             "instantiated for module %d type %s!",module,
906             geom->GetModuleTypeName(module));
907       exit(1);
908     } // end if !sim
909     mod      = (AliITSmodule *)fITSmodules->At(module);
910     sim->CreateFastRecPoints(mod,module,gRandom,ptarray);
911     lTR->Fill();
912     ptarray->Clear();
913   } // end for module
914
915   ClearModules();
916   fLoader->WriteRecPoints("OVERWRITE");
917   delete ptarray;
918 }
919 //_____________________________________________________________________
920 Int_t AliITS::Hits2Clusters(TTree *hTree, TTree *cTree) {
921   //------------------------------------------------------------
922   // This function creates ITS clusters
923   //------------------------------------------------------------
924   if(!GetITSgeom()){
925     Error("HitsToPreDigits","fGeom is null!");
926     return 1; // need transformations to do digitization.
927   }
928   AliITSgeom *geom=GetITSgeom();
929   Int_t mmax=geom->GetIndexMax();
930
931   InitModules(-1,mmax);
932   FillModules(hTree,0);
933
934   TClonesArray *points = new TClonesArray("AliITSRecPoint",1000);
935   TBranch *branch=cTree->GetBranch("ITSRecPoints");
936   if (!branch) cTree->Branch("ITSRecPoints",&points);
937   else branch->SetAddress(&points);
938
939   AliITSsimulationFastPoints sim;
940   Int_t ncl=0;
941   for (Int_t m=0; m<mmax; m++) {
942     AliITSmodule *mod=GetModule(m);      
943     sim.CreateFastRecPoints(mod,m,gRandom,points);      
944     ncl+=points->GetEntriesFast();
945     cTree->Fill();
946     points->Clear();
947   }
948
949   AliDebug(1,Form("Number of found fast clusters : %d",ncl));
950
951   //cTree->Write();
952
953   delete points;
954   return 0;
955 }
956
957 //_____________________________________________________________________
958 void AliITS::CheckLabels(Int_t lab[3]) const {
959   //------------------------------------------------------------
960   // Tries to find mother's labels
961   //------------------------------------------------------------
962
963   if(lab[0]<0 && lab[1]<0 && lab[2]<0) return; // In case of no labels just exit
964
965   Int_t ntracks = gAlice->GetMCApp()->GetNtrack();
966   for (Int_t i=0;i<3;i++){
967     Int_t label = lab[i];
968     if (label>=0 && label<ntracks) {
969       TParticle *part=(TParticle*)gAlice->GetMCApp()->Particle(label);
970       if (part->P() < 0.005) {
971         Int_t m=part->GetFirstMother();
972         if (m<0) {      
973           continue;
974         }
975         if (part->GetStatusCode()>0) {
976           continue;
977         }
978         lab[i]=m;       
979       }
980     }    
981   }
982   
983 }
984
985 //______________________________________________________________________
986 void AliITS::SDigitsToDigits(Option_t *opt){
987   // Standard Summable digits to Digits function.
988   // Inputs:
989   //      none.
990   // Outputs:
991   //      none.
992   if (!fDetTypeSim) {
993     AliError("fDetTypeSim is 0!");
994     return;
995   }
996
997   const char *all = strstr(opt,"All");
998   const char *det[3] ={strstr(opt,"SPD"),strstr(opt,"SDD"),
999                        strstr(opt,"SSD")};
1000
1001   // Reset Fast-OR signals for this event
1002   fDetTypeSim->ResetFOSignals();
1003
1004   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
1005   SetDefaults();
1006   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
1007   fDetTypeSim->SDigitsToDigits(opt,(Char_t*)GetName());
1008
1009   // Add random noise to FO signals
1010   if (all || det[0]) { // SPD present
1011     fDetTypeSim->ProcessNoiseForFastOr();
1012   }
1013   // Add Fast-OR signals to event (only one object per event)
1014   if (all || det[0]) { // SPD present
1015     fDetTypeSim->WriteFOSignals();
1016   }
1017 }
1018
1019 //______________________________________________________________________
1020 void AliITS::ResetDigits(){
1021     // Reset number of digits and the digits array for the ITS detector.
1022     // Inputs:
1023     //      none.
1024     // Outputs:
1025     //      none.
1026     if(!fDetTypeSim) {
1027       Error("ResetDigits","fDetTypeSim is 0!");
1028       return;
1029     }
1030    
1031     fDetTypeSim->ResetDigits();
1032
1033
1034 }
1035 //______________________________________________________________________
1036 void AliITS::ResetDigits(Int_t branch){
1037     // Reset number of digits and the digits array for this branch.
1038     // Inputs:
1039     //      none.
1040     // Outputs:
1041     //      none.
1042
1043     if(!fDetTypeSim) {
1044       Error("ResetDigits","fDetTypeSim is 0!");
1045       return;
1046     }
1047    
1048     fDetTypeSim->ResetDigits(branch);
1049
1050 }
1051 //______________________________________________________________________
1052 void AliITS::AddSumDigit(AliITSpListItem &sdig){
1053     // Adds the a module full of summable digits to the summable digits tree.
1054     // Inputs:
1055     //      AliITSpListItem &sdig   SDigit to be added to SDigits tree.
1056     // Outputs:
1057     //      none.
1058     // Return:
1059     //      none.
1060
1061     if(!fDetTypeSim) {
1062       Error("AddSumDigit","fDetTypeSim is 0!");
1063       return;
1064     }
1065     fDetTypeSim->AddSumDigit(sdig);
1066     
1067 }
1068 //______________________________________________________________________
1069 void AliITS::AddSimDigit(Int_t branch, AliITSdigit *d){
1070     //    Add a simulated digit.
1071     // Inputs:
1072     //      Int_t id        Detector type number.
1073     //      AliITSdigit *d  Digit to be added to the Digits Tree. See 
1074     //                      AliITSdigit.h
1075     // Outputs:
1076     //      none.
1077     // Return:
1078     //      none.
1079
1080     if(!fDetTypeSim) {
1081       Error("AddSimDigit","fDetTypeSim is 0!");
1082       return;
1083     }
1084     fDetTypeSim->AddSimDigit(branch,d);
1085
1086 }
1087 //______________________________________________________________________
1088 void AliITS::AddSimDigit(Int_t branch,Float_t phys,Int_t *digits,Int_t *tracks,
1089                          Int_t *hits,Float_t *charges, Int_t sigexpanded){
1090   //   Add a simulated digit to the list.
1091   // Inputs:
1092   //      Int_t id        Detector type number.
1093   //      Float_t phys    Physics indicator. See AliITSdigits.h
1094   //      Int_t *digits   Integer array containing the digits info. See 
1095   //                      AliITSdigit.h
1096   //      Int_t *tracks   Integer array [AliITSdigitS?D::GetNTracks()] 
1097   //                      containing the track numbers that contributed to
1098   //                      this digit.
1099   //      Int_t *hits     Integer array [AliITSdigitS?D::GetNTracks()]
1100   //                      containing the hit numbers, from AliITSmodule, that
1101   //                      contributed to this digit.
1102   //      Float_t *charge Floating point array of the signals contributed
1103   //                      to this digit by each track.
1104   // Outputs:
1105   //      none.
1106   // Return:
1107   //      none.
1108
1109     if(!fDetTypeSim) {
1110       Error("AddSimDigit","fDetTypeSim is 0!");
1111       return;
1112     }
1113     fDetTypeSim->AddSimDigit(branch,phys,digits,tracks,hits,charges,sigexpanded);
1114
1115 }
1116 //______________________________________________________________________
1117 void AliITS::Digits2Raw(){
1118     // convert digits of the current event to raw data
1119
1120   if(!fDetTypeSim) {
1121     Error("Digits2Raw","fDetTypeSim is 0!");
1122     return;
1123   }
1124   fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
1125   SetDefaults();
1126   if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
1127   fDetTypeSim->GetLoader()->LoadDigits();
1128   TTree* digits = fDetTypeSim->GetLoader()->TreeD();
1129   if (!digits) {
1130       Error("Digits2Raw", "no digits tree");
1131       return;
1132   }
1133   fDetTypeSim->SetTreeAddressD(digits,(Char_t*)GetName());
1134   
1135    // Get the FO signals for this event
1136   AliITSFOSignalsSPD* foSignals = NULL;
1137   AliRunLoader* runLoader = AliRunLoader::Instance();
1138   AliITSLoader* itsLoader = (AliITSLoader*) runLoader->GetLoader("ITSLoader");
1139   if (!itsLoader) {
1140     AliError("ITS loader is NULL.");
1141   }
1142    else {
1143       if(!itsLoader->TreeD()) AliError("   !!! No TreeD available !!!");
1144       foSignals = (AliITSFOSignalsSPD*)itsLoader->TreeD()->GetUserInfo()->FindObject("AliITSFOSignalsSPD");
1145       if(!foSignals) AliError("FO signals not retrieved");
1146      }
1147  
1148   Bool_t deleteFOsignalsLater = kFALSE;
1149   if (!foSignals) {
1150     AliError("FO signals not available. No FO bits will be written.");
1151     foSignals = new AliITSFOSignalsSPD(); // make a temporary dummy signals object
1152     deleteFOsignalsLater = kTRUE;
1153   }
1154   
1155   
1156   AliITSDDLModuleMapSDD* ddlsdd=fDetTypeSim->GetDDLModuleMapSDD();
1157   Char_t rawSDD=fDetTypeSim->GetSimuParam()->GetSDDRawDataFormat();
1158   AliITSDDLRawData rawWriter;
1159   
1160   rawWriter.SetSDDRawFormat(rawSDD);
1161   //Verbose level
1162   // 0: Silent
1163   // 1: cout messages
1164   // 2: txt files with digits 
1165   //BE CAREFUL, verbose level 2 MUST be used only for debugging and
1166   //it is highly suggested to use this mode only for debugging digits files
1167   //reasonably small, because otherwise the size of the txt files can reach
1168   //quickly several MB wasting time and disk space.
1169   rawWriter.SetVerbose(0);
1170     
1171   //SILICON PIXEL DETECTOR
1172   AliDebug(1,"Formatting raw data for SPD");
1173   rawWriter.RawDataSPD(digits->GetBranch("ITSDigitsSPD"),foSignals);
1174   if(deleteFOsignalsLater) delete foSignals;
1175     
1176   //SILICON DRIFT DETECTOR
1177   AliDebug(1,Form("Formatting raw data for SDD - Format code =%d",rawSDD));
1178   rawWriter.RawDataSDD(digits->GetBranch("ITSDigitsSDD"),ddlsdd);
1179     
1180   //SILICON STRIP DETECTOR
1181   AliDebug(1,"Formatting raw data for SSD");
1182   rawWriter.RawDataSSD(digits->GetBranch("ITSDigitsSSD"));
1183
1184   fLoader->UnloadDigits();
1185 }
1186 //______________________________________________________________________
1187 AliLoader* AliITS::MakeLoader(const char* topfoldername){ 
1188     //builds ITSgetter (AliLoader type)
1189     //if detector wants to use castomized getter, it must overload this method
1190
1191     AliDebug(1,Form("Creating AliITSLoader. Top folder is %s.",
1192          topfoldername));
1193     fLoader = new AliITSLoader(GetName(),topfoldername);
1194     return fLoader;
1195 }
1196 //______________________________________________________________________
1197 Bool_t AliITS::Raw2SDigits(AliRawReader* rawReader)
1198 {
1199   //
1200   // Converts RAW data to SDigits
1201   //
1202   // Get TreeS
1203   //
1204   Int_t last   = -1;
1205   Int_t size   = AliITSgeomTGeo::GetNModules();
1206   if(!fModA) {
1207     fModA = new TClonesArray*[size];
1208     for (Int_t mod = 0; mod < size; mod++) fModA[mod] = new TClonesArray("AliITSpListItem", 10000);
1209   }
1210   AliLoader* loader =  (AliRunLoader::Instance())->GetLoader("ITSLoader");
1211   if (!loader){
1212     Error("Open","Can not get ITS loader from Run Loader");
1213     return kFALSE;
1214   }
1215
1216   TTree* tree = 0;
1217   tree = loader->TreeS();
1218   if (!tree){
1219     loader->MakeTree("S");
1220     tree = loader->TreeS();
1221   }
1222   //
1223   // Array for SDigits
1224   // 
1225   if(!fpSDigits){
1226     fpSDigits = new TClonesArray("AliITSpListItem",10000);
1227   }
1228   TClonesArray& aSDigits = *fpSDigits;
1229   Int_t bufsize = 32000;
1230   tree->Branch("ITS", &fpSDigits, bufsize);
1231   Int_t npx = 0;
1232   //
1233   // SPD
1234   //
1235   AliITSsegmentationSPD* segSPD = (AliITSsegmentationSPD*) fDetTypeSim->GetSegmentationModel(0);
1236   if(!segSPD){
1237     AliWarning("Set AliITS defaults");
1238     SetDefaults();
1239     segSPD = (AliITSsegmentationSPD*) fDetTypeSim->GetSegmentationModel(0);
1240   }
1241   npx = segSPD->Npx();
1242   Double_t thr, sigma; 
1243     
1244   AliITSRawStreamSPD inputSPD(rawReader);
1245   while(1){
1246     Bool_t next  = inputSPD.Next();
1247     if (!next) break;
1248
1249     Int_t module = inputSPD.GetModuleID();
1250     Int_t column = inputSPD.GetColumn();
1251     Int_t row    = inputSPD.GetRow();
1252     Int_t index  = npx * column + row;
1253
1254     if (module >= size) continue;
1255  
1256     last = (fModA[module])->GetEntries();
1257     TClonesArray& dum = *fModA[module];
1258     fDetTypeSim->GetSimuParam()->SPDThresholds(module,thr,sigma);
1259     thr += 1.;
1260     new (dum[last]) AliITSpListItem(-1, -1, module, index, thr);
1261   }
1262   rawReader->Reset();
1263
1264   //
1265   // SDD
1266   // 
1267   AliITSsegmentationSDD* segSDD = (AliITSsegmentationSDD*) fDetTypeSim->GetSegmentationModel(1);
1268   npx = segSDD->Npx();
1269   Int_t scalef=AliITSsimulationSDD::ScaleFourier(segSDD);
1270   Int_t firstSDD=AliITSgeomTGeo::GetModuleIndex(3,1,1);
1271   Int_t firstSSD=AliITSgeomTGeo::GetModuleIndex(5,1,1);
1272
1273   AliITSRawStream* inputSDD=AliITSRawStreamSDD::CreateRawStreamSDD(rawReader);
1274   for(Int_t iMod=firstSDD; iMod<firstSSD; iMod++){
1275     AliITSCalibrationSDD* cal = (AliITSCalibrationSDD*)fDetTypeSim->GetCalibrationModel(iMod);
1276     Bool_t isZeroSupp=cal->GetZeroSupp();
1277     if(isZeroSupp){ 
1278       for(Int_t iSid=0; iSid<2; iSid++) inputSDD->SetZeroSuppLowThreshold(iMod-firstSDD,iSid,cal->GetZSLowThreshold(iSid));
1279     }else{
1280       for(Int_t iSid=0; iSid<2; iSid++) inputSDD->SetZeroSuppLowThreshold(iMod-firstSDD,iSid,0);
1281     }
1282   }
1283
1284   AliITSDDLModuleMapSDD* ddlmap=fDetTypeSim->GetDDLModuleMapSDD();
1285   inputSDD->SetDDLModuleMap(ddlmap);
1286   while(inputSDD->Next()){
1287     if(inputSDD->IsCompletedModule()==kFALSE && 
1288        inputSDD->IsCompletedDDL()==kFALSE){
1289
1290       Int_t module = inputSDD->GetModuleID();
1291       Int_t anode  = inputSDD->GetCoord1()+segSDD->NpzHalf()*inputSDD->GetChannel();
1292       Int_t time   = inputSDD->GetCoord2();
1293       Int_t signal10 = inputSDD->GetSignal();
1294       Int_t index = AliITSpList::GetIndex(anode,time,scalef*npx);
1295
1296       if (module >= size) continue;
1297       last = fModA[module]->GetEntries();
1298       TClonesArray& dum = *fModA[module];
1299       new (dum[last]) AliITSpListItem(-1, -1, module, index, Double_t(signal10));
1300       ((AliITSpListItem*) dum.At(last))->AddSignalAfterElect(module, index, Double_t(signal10));
1301     }
1302   }
1303   delete inputSDD;
1304   rawReader->Reset();
1305     
1306   //
1307   // SSD
1308   // 
1309   AliITSsegmentationSSD* segSSD = (AliITSsegmentationSSD*) fDetTypeSim->GetSegmentationModel(2);
1310   npx = segSSD->Npx();
1311   AliITSRawStreamSSD inputSSD(rawReader);
1312   while(1){
1313     Bool_t next  = inputSSD.Next();
1314     if (!next) break;
1315
1316     Int_t module  = inputSSD.GetModuleID();
1317     if(module<0)AliError(Form("Invalid SSD  module %d \n",module));
1318     if(module<0)continue;
1319     Int_t side    = inputSSD.GetSideFlag();
1320     Int_t strip   = inputSSD.GetStrip();
1321     Int_t signal  = inputSSD.GetSignal();
1322     Int_t index  = npx * side + strip;
1323
1324     if (module >= size) continue;
1325         
1326     last = fModA[module]->GetEntries();
1327     TClonesArray& dum = *fModA[module];
1328     new (dum[last]) AliITSpListItem(-1, -1, module, index, Double_t(signal));
1329   }
1330   rawReader->Reset();
1331   AliITSpListItem* sdig = 0;
1332     
1333   Int_t firstssd = GetITSgeom()->GetStartDet(kSSD);
1334   Double_t adcToEv = 1.;
1335   for (Int_t mod = 0; mod < size; mod++)
1336     {
1337       if(mod>=firstssd) {
1338         AliITSCalibrationSSD* calssd = (AliITSCalibrationSSD*)fDetTypeSim->GetCalibrationModel(mod);
1339         adcToEv = 1./calssd->GetSSDDEvToADC(1.);
1340       }
1341       Int_t nsdig =  fModA[mod]->GetEntries();
1342       for (Int_t ie = 0; ie < nsdig; ie++) {
1343         sdig = (AliITSpListItem*) (fModA[mod]->At(ie));
1344         Double_t digsig = sdig->GetSignal();
1345         if(mod>=firstssd) digsig*=adcToEv; // for SSD: convert back charge from ADC to electron
1346         new (aSDigits[ie]) AliITSpListItem(-1, -1, mod, sdig->GetIndex(), digsig);
1347         Float_t sig = sdig->GetSignalAfterElect();
1348         if(mod>=firstssd) sig*=adcToEv;
1349         if (sig > 0.) {
1350           sdig = (AliITSpListItem*)aSDigits[ie];
1351           sdig->AddSignalAfterElect(mod, sdig->GetIndex(), Double_t(sig));
1352         }
1353       }
1354         
1355       tree->Fill();
1356       aSDigits.Clear();
1357       fModA[mod]->Clear();
1358     }
1359   loader->WriteSDigits("OVERWRITE");    
1360   return kTRUE;
1361 }
1362
1363 //______________________________________________________________________
1364 void AliITS::UpdateInternalGeometry(){
1365   //reads new geometry from TGeo 
1366 //   AliDebug(1,"Delete ITSgeom and create a new one reading TGeo");
1367
1368   AliITSVersion_t version = (AliITSVersion_t)IsVersion();
1369   Int_t minor = 0;
1370   if(version==kvPPRasymmFMD) minor=2;  // default minor version for this geom.
1371   AliITSInitGeometry initgeom;
1372   AliITSgeom* geom = initgeom.CreateAliITSgeom(version,minor);
1373   SetITSgeom(geom);
1374 }
1375 //______________________________________________________________________
1376 AliTriggerDetector* AliITS::CreateTriggerDetector() const {
1377   // create an AliITSTrigger object (and set trigger conditions as input)
1378   return new AliITSTrigger(fDetTypeSim->GetTriggerConditions());
1379 }