ITS/AliITSAlignMille.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 2007-2009, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18 //-----------------------------------------------------------------------------
  19 /// \class AliITSAlignMille
  20 /// Alignment class for the ALICE ITS detector
  21 ///
  22 /// ITS specific alignment class which interface to AliMillepede.
  23 /// For each track ProcessTrack calculates the local and global derivatives
  24 /// at each hit and fill the corresponding local equations. Provide methods for
  25 /// fixing or constraining detection elements for best results.
  26 ///
  27 /// \author M. Lunardon (thanks to J. Castillo)
  28 //-----------------------------------------------------------------------------
  29
  30 #include <TF1.h>
  31 #include <TFile.h>
  32 #include <TClonesArray.h>
  33 #include <TGraph.h>
  34 #include <TMath.h>
  35 #include <TGraphErrors.h>
  36
  37 #include "AliITSAlignMilleModule.h"
  38 #include "AliITSAlignMille.h"
  39 #include "AliITSAlignMilleData.h"
  40 #include "AliITSgeomTGeo.h"
  41 #include "AliGeomManager.h"
  42 #include "AliMillepede.h"
  43 #include "AliTrackPointArray.h"
  44 #include "AliAlignObjParams.h"
  45 #include "AliLog.h"
  46 #include <TSystem.h>
  47 #include "AliTrackFitterRieman.h"
  48
  49 /// \cond CLASSIMP
  50 ClassImp(AliITSAlignMille)
  51 /// \endcond
  52
  53 Int_t AliITSAlignMille::fgNDetElem = ITSMILLENDETELEM;
  54 Int_t AliITSAlignMille::fgNParCh = ITSMILLENPARCH;
  55
  56 AliITSAlignMille::AliITSAlignMille(const Char_t *configFilename, Bool_t initmille)
  57   : TObject(),
  58     fMillepede(0),
  59     fStartFac(16.),
  60     fResCutInitial(100.),
  61     fResCut(100.),
  62     fNGlobal(ITSMILLENDETELEM*ITSMILLENPARCH),
  63     fNLocal(4),
  64     fNStdDev(ITSMILLENSTDEV),
  65     fIsMilleInit(kFALSE),
  66     fParSigTranslations(0.0100),
  67     fParSigRotations(0.1),
  68     fTrack(NULL),
  69     fCluster(),
  70     fGlobalDerivatives(NULL),
  71     fSigmaXfactor(1.0),
  72     fSigmaZfactor(1.0),
  73     fTempAlignObj(NULL),
  74     fDerivativeXLoc(0),
  75     fDerivativeZLoc(0),
  76     fMinNPtsPerTrack(3),
  77     fInitTrackParamsMeth(1),
  78     fProcessedPoints(NULL),
  79     fTotBadLocEqPoints(0),
  80     fRieman(NULL),
  81     fRequirePoints(kFALSE),
  82     fTempExcludedModule(-1),
  83     fGeometryFileName("geometry.root"),
  84     fPreAlignmentFileName(""),
  85     fGeoManager(0),
  86     fCurrentModuleIndex(0),
  87     fCurrentModuleInternalIndex(0),
  88     fCurrentSensVolIndex(0),
  89     fNModules(0),
  90     fUseLocalShifts(kTRUE),
  91     fUseSuperModules(kFALSE),
  92     fUsePreAlignment(kFALSE),
  93     fUseSortedTracks(kTRUE),
  94     fBOn(kFALSE),
  95     fBField(0.0),
  96     fNSuperModules(0),
  97     fCurrentModuleHMatrix(NULL),
  98     fIsConfigured(kFALSE),
  99     fBug(0)
 100 {
 101   /// main constructor that takes input from configuration file
 102
 103   fMillepede = new AliMillepede();
 104   fGlobalDerivatives = new Double_t[fNGlobal];
 105
 106   for (Int_t i=0; i<ITSMILLENDETELEM*2; i++) {
 107     fPreAlignQF[i]=-1;
 108     fSensVolSigmaXfactor[i]=1.0;
 109     fSensVolSigmaZfactor[i]=1.0;
 110   }
 111
 112   for (Int_t i=0; i<6; i++) {
 113     fNReqLayUp[i]=0;
 114     fNReqLayDown[i]=0;
 115     fNReqLay[i]=0;
 116   }
 117   for (Int_t i=0; i<3; i++) {
 118     fNReqDetUp[i]=0;
 119     fNReqDetDown[i]=0;
 120     fNReqDet[i]=0;
 121   }
 122
 123   Int_t lc=LoadConfig(configFilename);
 124   if (lc) {
 125     AliInfo(Form("Error %d loading configuration from %s",lc,configFilename));
 126   }
 127   else {
 128     fIsConfigured=kTRUE;
 129     if (initmille && fNGlobal<20000) {
 130       AliInfo(Form("Initializing Millepede with %d gpar, %d lpar and %d stddev ...",fNGlobal, fNLocal, fNStdDev));
 131       Init(fNGlobal, fNLocal, fNStdDev);
 132       ResetLocalEquation();
 133       AliInfo("Parameters initialized to zero");
 134     }
 135     else {
 136       AliInfo("Millepede has not been initialized ... ");
 137     }
 138   }
 139
 140   if (fNModules) {
 141     fProcessedPoints=new Int_t[fNModules];
 142     for (Int_t ipp=0; ipp<fNModules; ipp++) fProcessedPoints[ipp]=0;
 143   }
 144 }
 145
 146 AliITSAlignMille::~AliITSAlignMille() {
 147   /// Destructor
 148   if (fMillepede) delete fMillepede;
 149   delete [] fGlobalDerivatives;
 150   for (int i=0; i<fNModules; i++) delete fMilleModule[i];
 151   for (int i=0; i<fNSuperModules; i++) delete fSuperModule[i];
 152   if (fNModules) delete [] fProcessedPoints;
 153   if (fRieman) delete fRieman;
 154 }
 155
 156 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////
 157 Int_t AliITSAlignMille::LoadConfig(const Char_t *cfile) {
 158   /// return 0 if success
 159   ///        1 if error in module index or voluid
 160
 161   FILE *pfc=fopen(cfile,"r");
 162   if (!pfc) return -1;
 163
 164   Char_t st[200],st2[200];
 165   Char_t tmp[100];
 166   Int_t idx,itx,ity,itz,ith,ips,iph;
 167   Float_t f1,f2;
 168   UShort_t voluid;
 169   Int_t nmod=0;
 170
 171   while (fgets(st,200,pfc)) {
 172
 173     // skip comments
 174     for (int i=0; i<int(strlen(st)); i++) {
 175       if (st[i]=='#') st[i]=0;
 176     }
 177
 178     if (strstr(st,"GEOMETRY_FILE")) {
 179       sscanf(st,"%s %s",tmp,st2);
 180       if (gSystem->AccessPathName(st2)) {
 181         AliInfo("*** WARNING! *** geometry file not found! ");
 182         return -1;
 183       }
 184       fGeometryFileName=st2;
 185       InitGeometry();
 186     }
 187
 188     if (strstr(st,"PREALIGNMENT_FILE")) {
 189       sscanf(st,"%s %s",tmp,st2);
 190       if (gSystem->AccessPathName(st2)) {
 191         AliInfo("*** WARNING! *** prealignment file not found! ");
 192         return -1;
 193       }
 194       fPreAlignmentFileName=st2;
 195       itx=ApplyToGeometry();
 196       if (itx) {
 197         AliInfo(Form("*** WARNING! *** error %d reading prealignment file! ",itx));
 198         return -6;
 199       }
 200     }
 201
 202     if (strstr(st,"SUPERMODULE_FILE")) {
 203       sscanf(st,"%s %s",tmp,st2);
 204       if (gSystem->AccessPathName(st2)) {
 205         AliInfo("*** WARNING! *** supermodule file not found! ");
 206         return -1;
 207       }
 208       if (LoadSuperModuleFile(st2)) return -1;
 209     }
 210
 211     if (strstr(st,"SET_B_FIELD")) {
 212       sscanf(st,"%s %f",tmp,&f1);
 213       if (f1>0) {
 214         fBField = f1;
 215         fBOn = kTRUE;
 216         fNLocal = 5; // helices
 217         fRieman = new AliTrackFitterRieman();
 218       }
 219       else {
 220         fBField = 0.0;
 221         fBOn = kFALSE;
 222         fNLocal = 4;
 223       }
 224     }
 225
 226     if (strstr(st,"SET_PARSIG_TRA")) {
 227       sscanf(st,"%s %f",tmp,&f1);
 228       fParSigTranslations=f1;
 229     }
 230
 231     if (strstr(st,"SET_PARSIG_ROT")) {
 232       sscanf(st,"%s %f",tmp,&f1);
 233       fParSigRotations=f1;
 234     }
 235
 236     if (strstr(st,"SET_NSTDDEV")) {
 237       sscanf(st,"%s %d",tmp,&idx);
 238       fNStdDev=idx;
 239     }
 240
 241     if (strstr(st,"SET_RESCUT_INIT")) {
 242       sscanf(st,"%s %f",tmp,&f1);
 243       fResCutInitial=f1;
 244     }
 245
 246     if (strstr(st,"SET_RESCUT_OTHER")) {
 247       sscanf(st,"%s %f",tmp,&f1);
 248       fResCut=f1;
 249     }
 250
 251     if (strstr(st,"SET_LOCALSIGMAFACTOR")) {
 252       sscanf(st,"%s %f %f",tmp,&f1,&f2);
 253       if (f1>0 && f2>0) {
 254         fSigmaXfactor=f1;
 255         fSigmaZfactor=f2;
 256       }
 257     }
 258
 259     if (strstr(st,"SET_STARTFAC")) {
 260       sscanf(st,"%s %f",tmp,&f1);
 261       fStartFac=f1;
 262     }
 263
 264     if (strstr(st,"REQUIRE_POINT")) {
 265       // syntax:   REQUIRE_POINT where ndet updw nreqpts
 266       //    where = LAYER or DETECTOR
 267       //    ndet = detector number: 1-6 for LAYER and 1-3 for DETECTOR (SPD=1, SDD=2, SSD=3)
 268       //    updw = 1 for Y>0, -1 for Y<0, 0 if not specified
 269       //    nreqpts = minimum number of points of that type
 270       sscanf(st,"%s %s %d %d %d",tmp,st2,&itx,&ity,&itz);
 271       itx--;
 272       if (strstr(st2,"LAYER")) {
 273         if (itx<0 || itx>5) return -7;
 274         if (ity>0) fNReqLayUp[itx]=itz;
 275         else if (ity<0) fNReqLayDown[itx]=itz;
 276         else fNReqLay[itx]=itz;
 277         fRequirePoints=kTRUE;
 278       }
 279       else if (strstr(st2,"DETECTOR")) { // DETECTOR
 280         if (itx<0 || itx>2) return -7;
 281         if (ity>0) fNReqDetUp[itx]=itz;
 282         else if (ity<0) fNReqDetDown[itx]=itz;
 283         else fNReqDet[itx]=itz;
 284         fRequirePoints=kTRUE;
 285       }
 286     }
 287
 288
 289     if (strstr(st,"SET_LOCAL_SHIFTS")) { // only enabled mode...
 290       fUseLocalShifts = kTRUE;
 291     }
 292
 293     if (strstr(st,"MODULE_INDEX")) { // works only for sensitive modules
 294       f1=0; f2=0;
 295       sscanf(st,"%s %d %d %d %d %d %d %d %f %f",tmp,&idx,&itx,&ity,&itz,&iph,&ith,&ips,&f1,&f2);
 296       if (idx<0 || idx>2197) return 1; // bad index
 297       voluid=GetModuleVolumeID(idx);
 298       if (!voluid || voluid>14300) return 1; // bad index
 299       fModuleIndex[nmod]=idx;
 300       fModuleVolumeID[nmod]=voluid;
 301       fFreeParam[nmod][0]=itx;
 302       fFreeParam[nmod][1]=ity;
 303       fFreeParam[nmod][2]=itz;
 304       fFreeParam[nmod][3]=iph;
 305       fFreeParam[nmod][4]=ith;
 306       fFreeParam[nmod][5]=ips;
 307       fMilleModule[nmod] = new AliITSAlignMilleModule(voluid);
 308       if (f1>0) fSensVolSigmaXfactor[idx]=f1;
 309       if (f2>0) fSensVolSigmaZfactor[idx]=f2;
 310       nmod++;
 311     }
 312
 313     if (strstr(st,"MODULE_VOLUID")) {
 314       f1=0; f2=0;
 315       sscanf(st,"%s %d %d %d %d %d %d %d %f %f",tmp,&idx,&itx,&ity,&itz,&iph,&ith,&ips,&f1,&f2);
 316       voluid=UShort_t(idx);
 317       if (voluid>14335 && fUseSuperModules) { // custom supermodule
 318         int ism=-1;
 319         for (int j=0; j<fNSuperModules; j++) {
 320           if (voluid==fSuperModule[j]->GetVolumeID()) ism=j;
 321         }
 322         if (ism<0) return -1; // bad volid
 323         fModuleIndex[nmod]=fSuperModule[ism]->GetIndex();
 324         fModuleVolumeID[nmod]=voluid;
 325         fFreeParam[nmod][0]=itx;
 326         fFreeParam[nmod][1]=ity;
 327         fFreeParam[nmod][2]=itz;
 328         fFreeParam[nmod][3]=iph;
 329         fFreeParam[nmod][4]=ith;
 330         fFreeParam[nmod][5]=ips;
 331         fMilleModule[nmod] = new AliITSAlignMilleModule(*fSuperModule[ism]);
 332         if (f1>0) {
 333           for (int kk=0; kk<fMilleModule[nmod]->GetNSensitiveVolumes(); kk++) {
 334             idx=AliITSAlignMilleModule::GetIndexFromVolumeID(fMilleModule[nmod]->GetSensitiveVolumeVolumeID()[kk]);
 335             if (idx>=0) fSensVolSigmaXfactor[idx]=f1;
 336           }
 337         }
 338         if (f2>0) {
 339           for (int kk=0; kk<fMilleModule[nmod]->GetNSensitiveVolumes(); kk++) {
 340             idx=AliITSAlignMilleModule::GetIndexFromVolumeID(fMilleModule[nmod]->GetSensitiveVolumeVolumeID()[kk]);
 341             if (idx>=0) fSensVolSigmaZfactor[idx]=f2;
 342           }
 343         }       nmod++;
 344       }
 345       else { // sensitive volume
 346         idx=GetModuleIndex(voluid);
 347         if (idx<0 || idx>2197) return 1; // bad index
 348         fModuleIndex[nmod]=idx;
 349         fModuleVolumeID[nmod]=voluid;
 350         fFreeParam[nmod][0]=itx;
 351         fFreeParam[nmod][1]=ity;
 352         fFreeParam[nmod][2]=itz;
 353         fFreeParam[nmod][3]=iph;
 354         fFreeParam[nmod][4]=ith;
 355         fFreeParam[nmod][5]=ips;
 356         fMilleModule[nmod] = new AliITSAlignMilleModule(voluid);
 357         if (f1>0) fSensVolSigmaXfactor[idx]=f1;
 358         if (f2>0) fSensVolSigmaZfactor[idx]=f2;
 359         nmod++;
 360       }
 361     }
 362     //----------
 363
 364   } // end while
 365
 366   fNModules = nmod;
 367   fNGlobal = fNModules*fgNParCh;
 368
 369   fclose(pfc);
 370   return 0;
 371 }
 372
 373 void AliITSAlignMille::SetRequiredPoint(Char_t* where, Int_t ndet, Int_t updw, Int_t nreqpts)
 374 {
 375   // set minimum number of points in specific detector or layer
 376   // where = LAYER or DETECTOR
 377   // ndet = detector number: 1-6 for LAYER and 1-3 for DETECTOR (SPD=1, SDD=2, SSD=3)
 378   // updw = 1 for Y>0, -1 for Y<0, 0 if not specified
 379   // nreqpts = minimum number of points of that type
 380   ndet--;
 381   if (strstr(where,"LAYER")) {
 382     if (ndet<0 || ndet>5) return;
 383     if (updw>0) fNReqLayUp[ndet]=nreqpts;
 384     else if (updw<0) fNReqLayDown[ndet]=nreqpts;
 385     else fNReqLay[ndet]=nreqpts;
 386     fRequirePoints=kTRUE;
 387   }
 388   else if (strstr(where,"DETECTOR")) {
 389     if (ndet<0 || ndet>2) return;
 390     if (updw>0) fNReqDetUp[ndet]=nreqpts;
 391     else if (updw<0) fNReqDetDown[ndet]=nreqpts;
 392     else fNReqDet[ndet]=nreqpts;
 393     fRequirePoints=kTRUE;
 394   }
 395 }
 396
 397 Int_t AliITSAlignMille::GetModuleIndex(const Char_t *symname) {
 398   /// index from symname
 399   if (!symname) return -1;
 400   for (Int_t i=0; i<2198; i++) {
 401     if (!strcmp(symname,AliITSgeomTGeo::GetSymName(i))) return i;
 402   }
 403   return -1;
 404 }
 405
 406 Int_t AliITSAlignMille::GetModuleIndex(UShort_t voluid) {
 407   /// index from volume ID
 408   AliGeomManager::ELayerID lay = AliGeomManager::VolUIDToLayer(voluid);
 409   if (lay<1|| lay>6) return -1;
 410   Int_t idx=Int_t(voluid)-2048*lay;
 411   if (idx>=AliGeomManager::LayerSize(lay)) return -1;
 412   for (Int_t ilay=1; ilay<lay; ilay++)
 413     idx += AliGeomManager::LayerSize(ilay);
 414   return idx;
 415 }
 416
 417 UShort_t AliITSAlignMille::GetModuleVolumeID(const Char_t *symname) {
 418   /// volume ID from symname
 419   /// works for sensitive volumes only
 420   if (!symname) return 0;
 421
 422   for (UShort_t voluid=2000; voluid<13300; voluid++) {
 423     Int_t modId;
 424     AliGeomManager::ELayerID layerId = AliGeomManager::VolUIDToLayer(voluid,modId);
 425     if (layerId>0 && layerId<7 && modId>=0 && modId<AliGeomManager::LayerSize(layerId)) {
 426       if (!strcmp(symname,AliGeomManager::SymName(layerId,modId))) return voluid;
 427     }
 428   }
 429
 430   return 0;
 431 }
 432
 433 UShort_t AliITSAlignMille::GetModuleVolumeID(Int_t index) {
 434   /// volume ID from index
 435   if (index<0) return 0;
 436   if (index<2198)
 437     return GetModuleVolumeID(AliITSgeomTGeo::GetSymName(index));
 438   else {
 439     for (int i=0; i<fNSuperModules; i++) {
 440       if (fSuperModule[i]->GetIndex()==index) return fSuperModule[i]->GetVolumeID();
 441     }
 442   }
 443   return 0;
 444 }
 445
 446 void AliITSAlignMille::InitGeometry() {
 447   /// initialize geometry
 448   AliGeomManager::LoadGeometry(fGeometryFileName.Data());
 449   fGeoManager = AliGeomManager::GetGeometry();
 450   if (!fGeoManager) {
 451     AliInfo("Couldn't initialize geometry");
 452     return;
 453   }
 454   // temporary align object, just use the rotation...
 455   fTempAlignObj=new AliAlignObjParams;
 456 }
 457
 458 void AliITSAlignMille::Init(Int_t nGlobal,  /* number of global paramers */
 459                            Int_t nLocal,   /* number of local parameters */
 460                            Int_t nStdDev   /* std dev cut */ )
 461 {
 462   /// Initialization of AliMillepede. Fix parameters, define constraints ...
 463   fMillepede->InitMille(nGlobal,nLocal,nStdDev,fResCut,fResCutInitial);
 464   fIsMilleInit = kTRUE;
 465
 466   /// Fix non free parameters
 467   for (Int_t i=0; i<fNModules; i++) {
 468     for (Int_t j=0; j<ITSMILLENPARCH; j++) {
 469       if (!fFreeParam[i][j]) FixParameter(i*ITSMILLENPARCH+j,0.0);
 470       else {
 471         // pepopepo: da verificare il settaggio delle sigma, ma forse va bene...
 472         Double_t parsig=0;
 473         if (j<3) parsig=fParSigTranslations; // translations (0.0100 cm)
 474         else parsig=fParSigRotations; // rotations (1/10 deg)
 475         FixParameter(i*ITSMILLENPARCH+j,parsig);
 476       }
 477     }
 478   }
 479
 480
 481 //   // Set iterations
 482   if (fStartFac>1) fMillepede->SetIterations(fStartFac);
 483 }
 484
 485
 486 void AliITSAlignMille::AddConstraint(Double_t *par, Double_t value) {
 487   /// Constrain equation defined by par to value
 488   if (!fIsMilleInit) {
 489     AliInfo("Millepede has not been initialized!");
 490     return;
 491   }
 492   fMillepede->SetGlobalConstraint(par, value);
 493   AliInfo("Adding constraint");
 494 }
 495
 496 void AliITSAlignMille::InitGlobalParameters(Double_t *par) {
 497   /// Initialize global parameters with par array
 498   if (!fIsMilleInit) {
 499     AliInfo("Millepede has not been initialized!");
 500     return;
 501   }
 502   fMillepede->SetGlobalParameters(par);
 503   AliInfo("Init Global Parameters");
 504 }
 505
 506 void AliITSAlignMille::FixParameter(Int_t iPar, Double_t value) {
 507   /// Parameter iPar is encourage to vary in [-value;value].
 508   /// If value == 0, parameter is fixed
 509   if (!fIsMilleInit) {
 510     AliInfo("Millepede has not been initialized!");
 511     return;
 512   }
 513   fMillepede->SetParSigma(iPar, value);
 514   if (value==0) AliInfo(Form("Parameter %i Fixed", iPar));
 515 }
 516
 517 void AliITSAlignMille::ResetLocalEquation()
 518 {
 519   /// Reset the derivative vectors
 520   for(int i=0; i<fNLocal; i++) {
 521     fLocalDerivatives[i] = 0.0;
 522   }
 523   for(int i=0; i<fNGlobal; i++) {
 524     fGlobalDerivatives[i] = 0.0;
 525   }
 526 }
 527
 528 // newpep
 529 Int_t AliITSAlignMille::ApplyToGeometry() {
 530   /// apply starting realignment to ideal geometry
 531   if(!AliGeomManager::GetGeometry()) return -1;
 532
 533   TFile *pref = new TFile(fPreAlignmentFileName.Data());
 534   if (!pref->IsOpen()) return -2;
 535   TClonesArray *prea=(TClonesArray*)pref->Get("ITSAlignObjs");
 536   if (!prea) return -3;
 537   Int_t nprea=prea->GetEntriesFast();
 538   AliInfo(Form("Array of input misalignments with %d entries",nprea));
 539
 540   AliGeomManager::ApplyAlignObjsToGeom(*prea); // apply all levels of objs
 541
 542   // set prealignment factor if defined...
 543   for (int ix=0; ix<nprea; ix++) {
 544     AliAlignObjParams *preo=(AliAlignObjParams*) prea->UncheckedAt(ix);
 545     Int_t index=AliITSAlignMilleModule::GetIndexFromVolumeID(preo->GetVolUID());
 546     if (index>=0) {
 547       fPreAlignQF[index] = (int) preo->GetUniqueID();
 548       //printf("index=%d   QF=%d\n",index,preo->GetUniqueID());
 549     }
 550     //if (!preo->ApplyToGeometry()) return -4;
 551   }
 552   pref->Close();
 553   delete pref;
 554
 555   fUsePreAlignment = kTRUE;
 556   return 0;
 557 }
 558 // endnewpep
 559
 560 Int_t AliITSAlignMille::GetPreAlignmentQualityFactor(Int_t index) const {
 561   /// works for sensitive volumes
 562   if (!fUsePreAlignment || index<0 || index>2197) return -1;
 563   return fPreAlignQF[index];
 564 }
 565
 566 AliTrackPointArray *AliITSAlignMille::PrepareTrack(AliTrackPointArray *atp) {
 567   /// create a new AliTrackPointArray keeping only defined modules
 568   /// move points according to a given prealignment, if any
 569   /// sort alitrackpoints w.r.t. global Y direction, if selected
 570
 571   AliTrackPointArray *atps=NULL;
 572   Int_t idx[20];
 573   Int_t npts=atp->GetNPoints();
 574
 575   /// checks if AliTrackPoints belong to defined modules
 576   Int_t ngoodpts=0;
 577   Int_t intidx[20];
 578
 579   for (int j=0; j<npts; j++) {
 580     intidx[j] = IsContained(atp->GetVolumeID()[j]);
 581     if (intidx[j]>=0) ngoodpts++;
 582   }
 583   AliDebug(3,Form("Number of points in defined modules: %d",ngoodpts));
 584
 585   // reject track if not enough points are left
 586   if (ngoodpts<fMinNPtsPerTrack) {
 587     AliInfo("Track with not enough points!");
 588     return NULL;
 589   }
 590
 591   AliTrackPoint p;
 592   // check points in specific places
 593   if (fRequirePoints) {
 594     Int_t nlayup[6],nlaydown[6],nlay[6];
 595     Int_t ndetup[3],ndetdown[3],ndet[3];
 596     for (Int_t j=0; j<6; j++) {nlayup[j]=0; nlaydown[j]=0; nlay[j]=0;}
 597     for (Int_t j=0; j<3; j++) {ndetup[j]=0; ndetdown[j]=0; ndet[j]=0;}
 598
 599     for (int i=0; i<npts; i++) {
 600       // skip not defined points
 601       if (intidx[i]<0) continue;
 602       Float_t xx=atp->GetX()[i];
 603       Float_t yy=atp->GetY()[i];
 604       Float_t r=TMath::Sqrt(xx*xx + yy*yy);
 605       int lay=-1;
 606       if (r<5) lay=0;
 607       else if (r>5 && r<10) lay=1;
 608       else if (r>10 && r<18) lay=2;
 609       else if (r>18 && r<30) lay=3;
 610       else if (r>30 && r<40) lay=4;
 611       else if (r>40) lay=5;
 612       if (lay<0) continue;
 613       int det=lay/2;
 614       //printf("Point %d - x=%f  y=%f  R=%f  lay=%d  det=%d\n",i,xx,yy,r,lay,det);
 615
 616       if (yy>=0.0) { // UP point
 617         nlayup[lay]++;
 618         nlay[lay]++;
 619         ndetup[det]++;
 620         ndet[det]++;
 621       }
 622       else {
 623         nlaydown[lay]++;
 624         nlay[lay]++;
 625         ndetdown[det]++;
 626         ndet[det]++;
 627       }
 628     }
 629
 630     // checks minimum values
 631     Bool_t isok=kTRUE;
 632     for (Int_t j=0; j<6; j++) {
 633       if (nlayup[j]<fNReqLayUp[j]) isok=kFALSE;
 634       if (nlaydown[j]<fNReqLayDown[j]) isok=kFALSE;
 635       if (nlay[j]<fNReqLay[j]) isok=kFALSE;
 636     }
 637     for (Int_t j=0; j<3; j++) {
 638       if (ndetup[j]<fNReqDetUp[j]) isok=kFALSE;
 639       if (ndetdown[j]<fNReqDetDown[j]) isok=kFALSE;
 640       if (ndet[j]<fNReqDet[j]) isok=kFALSE;
 641     }
 642     if (!isok) {
 643       AliDebug(2,Form("Track does not meet all location point requirements!"));
 644       return NULL;
 645     }
 646   }
 647
 648   // build a new track with (sorted) (prealigned) good points
 649   atps=new AliTrackPointArray(ngoodpts);
 650
 651   for (int i=0; i<npts; i++) idx[i]=i;
 652   // sort track if required
 653   if (fUseSortedTracks) TMath::Sort(npts,atp->GetY(),idx); // sort descending...
 654
 655   Int_t npto=0;
 656   for (int i=0; i<npts; i++) {
 657     // skip not defined points
 658     if (intidx[idx[i]]<0) continue;
 659     atp->GetPoint(p,idx[i]);
 660
 661     // prealign point if required
 662     // get IDEAL matrix
 663     TGeoHMatrix *svOrigMatrix = fMilleModule[intidx[idx[i]]]->GetSensitiveVolumeOrigGlobalMatrix(p.GetVolumeID());
 664     // get back real local coordinates: use OriginalGlobalMatrix because AliTrackPoints were written
 665     // with idel geometry
 666     Double_t pg[3],pl[3];
 667     pg[0]=p.GetX();
 668     pg[1]=p.GetY();
 669     pg[2]=p.GetZ();
 670     AliDebug(3,Form("Global coordinates of measured point : X=%f  Y=%f  Z=%f \n",pg[0],pg[1],pg[2]));
 671     svOrigMatrix->MasterToLocal(pg,pl);
 672
 673     AliDebug(3,Form("Local coordinates of measured point : X=%f  Y=%f  Z=%f \n",pl[0],pl[1],pl[2]));
 674
 675     // update covariance matrix
 676     TGeoHMatrix hcov;
 677     Double_t hcovel[9];
 678     hcovel[0]=double(p.GetCov()[0]);
 679     hcovel[1]=double(p.GetCov()[1]);
 680     hcovel[2]=double(p.GetCov()[2]);
 681     hcovel[3]=double(p.GetCov()[1]);
 682     hcovel[4]=double(p.GetCov()[3]);
 683     hcovel[5]=double(p.GetCov()[4]);
 684     hcovel[6]=double(p.GetCov()[2]);
 685     hcovel[7]=double(p.GetCov()[4]);
 686     hcovel[8]=double(p.GetCov()[5]);
 687     hcov.SetRotation(hcovel);
 688     // now rotate in local system
 689     hcov.Multiply(svOrigMatrix);
 690     hcov.MultiplyLeft(&svOrigMatrix->Inverse());
 691     // now hcov is LOCAL COVARIANCE MATRIX
 692
 693
 694     // pepopepo
 695     if (fBug==1) {
 696       // correzione bug LAYER 5  SSD temporanea..
 697       int ssdidx=AliITSAlignMilleModule::GetIndexFromVolumeID(p.GetVolumeID());
 698       if (ssdidx>=500 && ssdidx<1248) {
 699         int ladder=(ssdidx-500)%22;
 700       if (ladder==18) p.SetVolumeID(AliITSAlignMilleModule::GetVolumeIDFromIndex(ssdidx+1));
 701       if (ladder==19) p.SetVolumeID(AliITSAlignMilleModule::GetVolumeIDFromIndex(ssdidx-1));
 702       }
 703     }
 704
 705     /// get (evenctually prealigned) matrix of sens. vol.
 706     TGeoHMatrix *svMatrix = fMilleModule[intidx[idx[i]]]->GetSensitiveVolumeMatrix(p.GetVolumeID());
 707     // modify global coordinates according with pre-aligment
 708     svMatrix->LocalToMaster(pl,pg);
 709     // now rotate in local system
 710     hcov.Multiply(&svMatrix->Inverse());
 711     hcov.MultiplyLeft(svMatrix);
 712     // hcov is back in GLOBAL RF
 713     Float_t pcov[6];
 714     pcov[0]=hcov.GetRotationMatrix()[0];
 715     pcov[1]=hcov.GetRotationMatrix()[1];
 716     pcov[2]=hcov.GetRotationMatrix()[2];
 717     pcov[3]=hcov.GetRotationMatrix()[4];
 718     pcov[4]=hcov.GetRotationMatrix()[5];
 719     pcov[5]=hcov.GetRotationMatrix()[8];
 720
 721     p.SetXYZ(pg[0],pg[1],pg[2],pcov);
 722     AliDebug(3,Form("New global coordinates of measured point : X=%f  Y=%f  Z=%f \n",pg[0],pg[1],pg[2]));
 723     atps->AddPoint(npto,&p);
 724     AliDebug(2,Form("Adding point[%d] = ( %f , %f , %f )     volid = %d",npto,atps->GetX()[npto],atps->GetY()[npto],atps->GetZ()[npto],atps->GetVolumeID()[npto] ));
 725
 726     npto++;
 727   }
 728
 729   return atps;
 730 }
 731
 732
 733
 734 AliTrackPointArray *AliITSAlignMille::SortTrack(AliTrackPointArray *atp) {
 735   /// sort alitrackpoints w.r.t. global Y direction
 736   AliTrackPointArray *atps=NULL;
 737   Int_t idx[20];
 738   Int_t npts=atp->GetNPoints();
 739   AliTrackPoint p;
 740   atps=new AliTrackPointArray(npts);
 741
 742   TMath::Sort(npts,atp->GetY(),idx);
 743
 744   for (int i=0; i<npts; i++) {
 745     atp->GetPoint(p,idx[i]);
 746     atps->AddPoint(i,&p);
 747     AliDebug(2,Form("Point[%d] = ( %f , %f , %f )     volid = %d",i,atps->GetX()[i],atps->GetY()[i],atps->GetZ()[i],atps->GetVolumeID()[i] ));
 748   }
 749   return atps;
 750 }
 751
 752
 753 Int_t AliITSAlignMille::InitModuleParams() {
 754   /// initialize geometry parameters for a given detector
 755   /// for current cluster (fCluster)
 756   /// fGlobalInitParam[] is set as:
 757   ///    [tx,ty,tz,psi,theta,phi]
 758   ///
 759   /// return 0 if success
 760
 761   if (!fGeoManager) {
 762     AliInfo("ITS geometry not initialized!");
 763     return -1;
 764   }
 765
 766   // now 'voluid' is the volumeID of a SENSITIVE VOLUME (coming from a cluster)
 767
 768   // set the internal index (index in module list)
 769   UShort_t voluid=fCluster.GetVolumeID();
 770   Int_t k=fNModules-1;
 771   while (k>=0 && !(fMilleModule[k]->IsIn(voluid)) ) k--;
 772   if (k<0) return -3;
 773   fCurrentModuleInternalIndex=k; // the internal index of the SUPERMODULE
 774
 775   fCurrentModuleIndex=fMilleModule[k]->GetIndex(); // index of the SUPERMODULE
 776
 777   // set the index
 778   Int_t index = GetModuleIndex(voluid);
 779   if (index<0) return -2;
 780   fCurrentSensVolIndex = index; // the index of the SENSITIVE VOLUME
 781
 782   fModuleInitParam[0] = 0.0;
 783   fModuleInitParam[1] = 0.0;
 784   fModuleInitParam[2] = 0.0;
 785   fModuleInitParam[3] = 0.0; // psi   (X)
 786   fModuleInitParam[4] = 0.0; // theta (Y)
 787   fModuleInitParam[5] = 0.0; // phi   (Z)
 788
 789   fCurrentModuleHMatrix = fMilleModule[fCurrentModuleInternalIndex]->GetMatrix();
 790
 791   for (int ii=0; ii<3; ii++)
 792     fCurrentModuleTranslation[ii]=fCurrentModuleHMatrix->GetTranslation()[ii];
 793
 794   /// get (evenctually prealigned) matrix of sens. vol.
 795   TGeoHMatrix *svMatrix = fMilleModule[fCurrentModuleInternalIndex]->GetSensitiveVolumeMatrix(voluid);
 796
 797   fMeasGlo[0] = fCluster.GetX();
 798   fMeasGlo[1] = fCluster.GetY();
 799   fMeasGlo[2] = fCluster.GetZ();
 800   svMatrix->MasterToLocal(fMeasGlo,fMeasLoc);
 801   AliDebug(2,Form("Local coordinates of measured point : X=%f  Y=%f  Z=%f \n",fMeasLoc[0] ,fMeasLoc[1] ,fMeasLoc[2] ));
 802
 803   // set stdev from cluster
 804   TGeoHMatrix hcov;
 805   Double_t hcovel[9];
 806   hcovel[0]=double(fCluster.GetCov()[0]);
 807   hcovel[1]=double(fCluster.GetCov()[1]);
 808   hcovel[2]=double(fCluster.GetCov()[2]);
 809   hcovel[3]=double(fCluster.GetCov()[1]);
 810   hcovel[4]=double(fCluster.GetCov()[3]);
 811   hcovel[5]=double(fCluster.GetCov()[4]);
 812   hcovel[6]=double(fCluster.GetCov()[2]);
 813   hcovel[7]=double(fCluster.GetCov()[4]);
 814   hcovel[8]=double(fCluster.GetCov()[5]);
 815   hcov.SetRotation(hcovel);
 816   // now rotate in local system
 817   hcov.Multiply(svMatrix);
 818   hcov.MultiplyLeft(&svMatrix->Inverse());
 819
 820   // set local sigmas
 821   fSigmaLoc[0] = TMath::Sqrt(TMath::Abs(hcov.GetRotationMatrix()[0]));
 822   fSigmaLoc[1] = TMath::Sqrt(TMath::Abs(hcov.GetRotationMatrix()[4]));
 823   fSigmaLoc[2] = TMath::Sqrt(TMath::Abs(hcov.GetRotationMatrix()[8]));
 824
 825   // set minimum value for SigmaLoc to 10 micron
 826   if (fSigmaLoc[0]<0.0010) fSigmaLoc[0]=0.0010;
 827   if (fSigmaLoc[2]<0.0010) fSigmaLoc[2]=0.0010;
 828
 829   // multiply local sigmas by global factor
 830   fSigmaLoc[0] *= fSigmaXfactor;
 831   fSigmaLoc[2] *= fSigmaZfactor;
 832
 833   // multiply local sigmas by individual factor
 834   fSigmaLoc[0] *= fSensVolSigmaXfactor[index];
 835   fSigmaLoc[2] *= fSensVolSigmaZfactor[index];
 836
 837   AliDebug(2,Form("Setting StDev from CovMat : fSigmaLocX=%g  fSigmaLocY=%g fSigmaLocZ=%g \n",fSigmaLoc[0] ,fSigmaLoc[1] ,fSigmaLoc[2] ));
 838
 839   return 0;
 840 }
 841
 842 void AliITSAlignMille::SetCurrentModule(Int_t index) {
 843   /// set as current the SuperModule that contains the 'index' sens.vol.
 844   if (index<0 || index>2197) {
 845     AliInfo("index does not correspond to a sensitive volume!");
 846     return;
 847   }
 848   UShort_t voluid=GetModuleVolumeID(index);
 849   Int_t k=IsContained(voluid);
 850   if (k>=0){
 851     fCluster.SetVolumeID(voluid);
 852     fCluster.SetXYZ(0,0,0);
 853     InitModuleParams();
 854   }
 855   else
 856     AliInfo(Form("module %d not defined\n",index));
 857 }
 858
 859 void AliITSAlignMille::SetCurrentSensitiveModule(Int_t index) {
 860   /// set as current the SuperModule that contains the 'index' sens.vol.
 861   if (index<0 || index>2197) {
 862     AliInfo("index does not correspond to a sensitive volume!");
 863     return;
 864   }
 865   UShort_t voluid=AliITSAlignMilleModule::GetVolumeIDFromIndex(index);
 866   Int_t k=IsDefined(voluid);
 867   if (k>=0){
 868     fCluster.SetVolumeID(voluid);
 869     fCluster.SetXYZ(0,0,0);
 870     InitModuleParams();
 871   }
 872   else
 873     AliInfo(Form("module %d not defined\n",index));
 874 }
 875
 876 void AliITSAlignMille::Print(Option_t*) const
 877 {
 878   /// print infos
 879   printf("*** AliMillepede for ITS ***\n");
 880   printf("    number of defined super modules: %d\n",fNModules);
 881
 882   if (fGeoManager)
 883     printf("    geometry loaded from %s\n",fGeometryFileName.Data());
 884   else
 885     printf("    geometry not loaded\n");
 886
 887   if (fUseSuperModules)
 888     printf("    using custom supermodules ( %d defined )\n",fNSuperModules);
 889   else
 890     printf("    custom supermodules not used\n");
 891
 892   if (fUsePreAlignment)
 893     printf("    using prealignment from %s \n",fPreAlignmentFileName.Data());
 894   else
 895     printf("    prealignment not used\n");
 896
 897   if (fBOn)
 898     printf("    B Field set to %f T - using Riemann's helices\n",fBField);
 899   else
 900     printf("    B Field OFF - using straight lines \n");
 901
 902   if (fUseLocalShifts)
 903     printf("    Alignment shifts will be computed in LOCAL RS\n");
 904   else
 905     printf("    Alignment shifts will be computed in GLOBAL RS\n");
 906
 907   if (fRequirePoints) printf("    Required points in tracks:\n");
 908   for (Int_t i=0; i<6; i++) {
 909     if (fNReqLayUp[i]>0) printf("        Layer %d : %d points with Y>0\n",i+1,fNReqLayUp[i]);
 910     if (fNReqLayDown[i]>0) printf("        Layer %d : %d points with Y<0\n",i+1,fNReqLayDown[i]);
 911     if (fNReqLay[i]>0) printf("        Layer %d : %d points \n",i+1,fNReqLay[i]);
 912   }
 913   for (Int_t i=0; i<3; i++) {
 914     if (fNReqDetUp[i]>0) printf("        Detector %d : %d points with Y>0\n",i+1,fNReqDetUp[i]);
 915     if (fNReqDetDown[i]>0) printf("        Detector %d : %d points with Y<0\n",i+1,fNReqDetDown[i]);
 916     if (fNReqDet[i]>0) printf("        Detector %d : %d points \n",i+1,fNReqDet[i]);
 917   }
 918
 919   printf("\n    Millepede configuration parameters:\n");
 920   printf("        init parsig for translations  : %.4f\n",fParSigTranslations);
 921   printf("        init parsig for rotations     : %.4f\n",fParSigRotations);
 922   printf("        init value for chi2 cut       : %.4f\n",fStartFac);
 923   printf("        first iteration cut value     : %.4f\n",fResCutInitial);
 924   printf("        other iterations cut value    : %.4f\n",fResCut);
 925   printf("        number of stddev for chi2 cut : %d\n",fNStdDev);
 926   printf("        mult. fact. for local sigmas  : %.4f %.4f\n",fSigmaXfactor, fSigmaZfactor);
 927
 928   printf("List of defined modules:\n");
 929   printf("  intidx\tindex\tvoluid\tname\n");
 930   for (int i=0; i<fNModules; i++)
 931     printf("  %d\t%d\t%d\t%s\n",i,fModuleIndex[i],fModuleVolumeID[i],fMilleModule[i]->GetName());
 932
 933 }
 934
 935 AliITSAlignMilleModule  *AliITSAlignMille::GetMilleModule(UShort_t voluid)
 936 {
 937   // return pointer to a define supermodule
 938   // return NULL if error
 939   Int_t i=IsDefined(voluid);
 940   if (i<0) return NULL;
 941   return fMilleModule[i];
 942 }
 943
 944 AliITSAlignMilleModule *AliITSAlignMille::GetCurrentModule() const
 945 {
 946   if (fNModules) return fMilleModule[fCurrentModuleInternalIndex];
 947   return NULL;
 948 }
 949
 950 void AliITSAlignMille::PrintCurrentModuleInfo()
 951 {
 952   ///
 953   Int_t k=fCurrentModuleInternalIndex;
 954   if (k<0 || k>=fNModules) return;
 955   fMilleModule[k]->Print("");
 956 }
 957
 958 Bool_t AliITSAlignMille::InitRiemanFit() {
 959   // Initialize Riemann Fitter for current track
 960   // return kFALSE if error
 961
 962   if (!fBOn) return kFALSE;
 963
 964   Int_t npts=0;
 965   AliTrackPoint ap;
 966   npts = fTrack->GetNPoints();
 967   AliDebug(3,Form("Fitting track with %d points",npts));
 968
 969   fRieman->Reset();
 970   fRieman->SetTrackPointArray(fTrack);
 971
 972   TArrayI ai(npts);
 973   for (Int_t ipt=0; ipt<npts; ipt++) ai[ipt]=fTrack->GetVolumeID()[ipt];
 974
 975   // fit track with 5 params in his own tracking-rotated reference system
 976   // xc = -p[1]/p[0];
 977   // yc = 1/p[0];
 978   // R  = sqrt( x0*x0 + y0*y0 - y0*p[2]);
 979   if (!fRieman->Fit(&ai,NULL,(AliGeomManager::ELayerID)1,(AliGeomManager::ELayerID)6)) {
 980     return kFALSE;
 981   }
 982
 983   for (int i=0; i<5; i++)
 984     fLocalInitParam[i] = fRieman->GetParam()[i];
 985
 986   return kTRUE;
 987 }
 988
 989
 990 void AliITSAlignMille::InitTrackParams(int meth) {
 991   /// initialize local parameters with different methods
 992   /// for current track (fTrack)
 993
 994   Int_t npts=0;
 995   TF1 *f1=NULL;
 996   TGraph *g=NULL;
 997   Float_t sigmax[20],sigmay[20],sigmaz[20];
 998   AliTrackPoint ap;
 999   TGraphErrors *ge=NULL;
1000
1001   switch (meth) {
1002   case 1:   // simple linear interpolation
1003     // get local starting parameters (to be substituted by ESD track parms)
1004     // local parms (fLocalInitParam[]) are:
1005     //      [0] = global x coord. of straight line intersection at y=0 plane
1006     //      [1] = global z coord. of straight line intersection at y=0 plane
1007     //      [2] = px/py
1008     //      [3] = pz/py
1009
1010     // test #1: linear fit in x(y) and z(y)
1011     npts = fTrack->GetNPoints();
1012     AliDebug(3,Form("*** initializing track with %d points ***",npts));
1013
1014     f1=new TF1("f1","[0]+x*[1]",-50,50);
1015
1016     g=new TGraph(npts,fTrack->GetY(),fTrack->GetX());
1017     g->Fit(f1,"RNQ");
1018     fLocalInitParam[0] = f1->GetParameter(0);
1019     fLocalInitParam[2] = f1->GetParameter(1);
1020     AliDebug(2,Form("X = p0gx + ugx*Y : p0gx = %f +- %f    ugx = %f +- %f\n",fLocalInitParam[0],f1->GetParError(0),fLocalInitParam[2],f1->GetParError(1)));
1021     delete g; g=NULL;
1022
1023     g=new TGraph(npts,fTrack->GetY(),fTrack->GetZ());
1024     g->Fit(f1,"RNQ");
1025     fLocalInitParam[1] = f1->GetParameter(0);
1026     fLocalInitParam[3] = f1->GetParameter(1);
1027     AliDebug(2,Form("Z = p0gz + ugz*Y : p0gz=%f  ugz=%f\n",fLocalInitParam[1],fLocalInitParam[3]));
1028     delete g;
1029     delete f1;
1030
1031     break;
1032
1033   case 2:   // simple linear interpolation weighted using sigmas
1034     // get local starting parameters (to be substituted by ESD track parms)
1035     // local parms (fLocalInitParam[]) are:
1036     //      [0] = global x coord. of straight line intersection at y=0 plane
1037     //      [1] = global z coord. of straight line intersection at y=0 plane
1038     //      [2] = px/py
1039     //      [3] = pz/py
1040
1041     // test #1: linear fit in x(y) and z(y)
1042     npts = fTrack->GetNPoints();
1043     AliDebug(3,Form("*** initializing track with %d points ***",npts));
1044
1045     for (Int_t isig=0; isig<npts; isig++) {
1046       fTrack->GetPoint(ap,isig);
1047       sigmax[isig]=ap.GetCov()[0];
1048       if (sigmax[isig]<1.0e-07) sigmax[isig]=1.0e-07; // minimum sigma=3 mu
1049       sigmax[isig]=TMath::Sqrt(sigmax[isig]);
1050
1051       sigmay[isig]=ap.GetCov()[3];
1052       if (sigmay[isig]<1.0e-07) sigmay[isig]=1.0e-07; // minimum sigma=3 mu
1053       sigmay[isig]=TMath::Sqrt(sigmay[isig]);
1054
1055       sigmaz[isig]=ap.GetCov()[5];
1056       if (sigmaz[isig]<1.0e-07) sigmaz[isig]=1.0e-07; // minimum sigma=3 mu
1057       sigmaz[isig]=TMath::Sqrt(sigmaz[isig]);
1058
1059       if (fTempExcludedModule>=0 && fTempExcludedModule==AliITSAlignMilleModule::GetIndexFromVolumeID(ap.GetVolumeID())) {
1060         sigmax[isig] *= 1000.;
1061         sigmay[isig] *= 1000.;
1062         sigmaz[isig] *= 1000.;
1063         fTempExcludedModule=-1;
1064       }
1065     }
1066
1067     f1=new TF1("f1","[0]+x*[1]",-50,50);
1068
1069     ge=new TGraphErrors(npts,fTrack->GetY(),fTrack->GetX(),sigmay,sigmax);
1070     ge->Fit(f1,"RNQ");
1071     fLocalInitParam[0] = f1->GetParameter(0);
1072     fLocalInitParam[2] = f1->GetParameter(1);
1073     AliDebug(2,Form("X = p0gx + ugx*Y : p0gx = %f +- %f    ugx = %f +- %f\n",fLocalInitParam[0],f1->GetParError(0),fLocalInitParam[2],f1->GetParError(1)));
1074     delete ge; ge=NULL;
1075
1076     ge=new TGraphErrors(npts,fTrack->GetY(),fTrack->GetZ(),sigmay,sigmaz);
1077     ge->Fit(f1,"RNQ");
1078     fLocalInitParam[1] = f1->GetParameter(0);
1079     fLocalInitParam[3] = f1->GetParameter(1);
1080     AliDebug(2,Form("Z = p0gz + ugz*Y : p0gz=%f  ugz=%f\n",fLocalInitParam[1],fLocalInitParam[3]));
1081     delete ge;
1082     delete f1;
1083
1084     break;
1085
1086   }
1087 }
1088
1089 Int_t AliITSAlignMille::IsDefined(UShort_t voluid) const
1090 {
1091   // checks if supermodule 'voluid' is defined and return the internal index
1092   // return -1 if error
1093   Int_t k=fNModules-1;
1094   while (k>=0 && !(voluid==fModuleVolumeID[k]) ) k--;
1095   if (k<0) return -1;
1096   return k;
1097 }
1098
1099 Int_t AliITSAlignMille::IsContained(UShort_t voluid) const
1100 {
1101   // checks if the sensitive module 'voluid' is contained inside a supermodule and return the internal index of the last identified supermodule
1102   // return -1 if error
1103   if (AliITSAlignMilleModule::GetIndexFromVolumeID(voluid)<0) return -1;
1104   Int_t k=fNModules-1;
1105   while (k>=0 && !(fMilleModule[k]->IsIn(voluid)) ) k--;
1106   if (k<0) return -1;
1107   return k;
1108 }
1109
1110 Bool_t AliITSAlignMille::CheckVolumeID(UShort_t voluid) const
1111 {
1112   /// check if a sensitive volume is contained inside one of the defined supermodules
1113   Int_t k=fNModules-1;
1114   while (k>=0 && !(fMilleModule[k]->IsIn(voluid)) ) k--;
1115   if (k>=0) return kTRUE;
1116   return kFALSE;
1117 }
1118
1119 Int_t AliITSAlignMille::CheckCurrentTrack() {
1120   /// checks if AliTrackPoints belongs to defined modules
1121   /// return number of good poins
1122   /// return 0 if not enough points
1123
1124   Int_t npts = fTrack->GetNPoints();
1125   Int_t ngoodpts=0;
1126   // debug points
1127   for (int j=0; j<npts; j++) {
1128     UShort_t voluid = fTrack->GetVolumeID()[j];
1129     if (CheckVolumeID(voluid)) {
1130       ngoodpts++;
1131     }
1132   }
1133
1134   if (ngoodpts<fMinNPtsPerTrack) return 0;
1135
1136   return ngoodpts;
1137 }
1138
1139 Int_t AliITSAlignMille::ProcessTrack(AliTrackPointArray *track) {
1140   /// Process track; Loop over hits and set local equations
1141   /// here 'track' is a AliTrackPointArray
1142   /// return 0 if success;
1143
1144   if (!fIsMilleInit) {
1145     AliInfo("Millepede has not been initialized!");
1146     return -1;
1147   }
1148
1149   Int_t npts = track->GetNPoints();
1150   AliDebug(2,Form("*** Input track with %d points ***",npts));
1151
1152   // preprocessing of the input track: keep only points in defined volumes,
1153   // move points if prealignment is set, sort by Yglo if required
1154
1155   fTrack=PrepareTrack(track);
1156   if (!fTrack) return -1;
1157
1158   npts = fTrack->GetNPoints();
1159   AliDebug(2,Form("*** Processing prepared track with %d points ***",npts));
1160
1161   if (!fBOn) { // straight lines
1162     // set local starting parameters (to be substituted by ESD track parms)
1163     // local parms (fLocalInitParam[]) are:
1164     //      [0] = global x coord. of straight line intersection at y=0 plane
1165     //      [1] = global z coord. of straight line intersection at y=0 plane
1166     //      [2] = px/py
1167     //      [3] = pz/py
1168     InitTrackParams(fInitTrackParamsMeth);
1169   }
1170   else {
1171     // local parms (fLocalInitParam[]) are the Riemann Fitter params
1172     if (!InitRiemanFit()) {
1173       AliInfo("Riemann fit failed! skipping this track...");
1174       delete fTrack;
1175       fTrack=NULL;
1176       return -5;
1177     }
1178   }
1179
1180   Int_t nloceq=0;
1181   AliITSAlignMilleData *md = new AliITSAlignMilleData[npts];
1182
1183   for (Int_t ipt=0; ipt<npts; ipt++) {
1184     fTrack->GetPoint(fCluster,ipt);
1185     AliDebug(2,Form("\n--- processing point %d --- \n",ipt));
1186
1187     // set geometry parameters for the the current module
1188     if (InitModuleParams()) continue;
1189     AliDebug(2,Form("    VolID=%d  Index=%d  InternalIdx=%d  symname=%s\n", track->GetVolumeID()[ipt], fCurrentModuleIndex ,fCurrentModuleInternalIndex, AliGeomManager::SymName(track->GetVolumeID()[ipt]) ));
1190     AliDebug(2,Form("    Preprocessed Point = ( %f , %f , %f ) \n",fCluster.GetX(),fCluster.GetY(),fCluster.GetZ()));
1191
1192     if (!AddLocalEquation(md[nloceq])) {
1193       nloceq++;
1194       fProcessedPoints[fCurrentModuleInternalIndex]++;
1195     }
1196     else {
1197       fTotBadLocEqPoints++;
1198     }
1199
1200   } // end loop over points
1201
1202   delete fTrack;
1203   fTrack=NULL;
1204
1205   // not enough good points!
1206   if (nloceq<fMinNPtsPerTrack) {
1207     delete [] md;
1208     return -1;
1209   }
1210
1211   // finally send local equations to millepede
1212   SetLocalEquations(md,nloceq);
1213
1214   delete [] md;
1215
1216   return 0;
1217 }
1218
1219 Int_t AliITSAlignMille::CalcIntersectionPoint(Double_t *lpar, Double_t *gpar) {
1220   /// calculate intersection point of track with current module in local coordinates
1221   /// according with a given set of parameters (local(4/5) and global(6))
1222   /// and fill fPintLoc/Glo
1223   ///    local are:   pgx0, pgz0, ugx, ugz   OR   riemann fitters pars
1224   ///    global are:  tx,ty,tz,psi,theta,phi (Raff's delta angles in deg.)
1225   /// return 0 if success
1226
1227   AliDebug(3,Form("lpar = %g %g %g %g %g\ngpar= %g %g %g %g %g %g\n",lpar[0],lpar[1],lpar[2],lpar[3],lpar[4],gpar[0],gpar[1],gpar[2],gpar[3],gpar[4],gpar[5]));
1228   AliDebug(3,Form("deltalpar = %g %g %g %g %g\n",lpar[0]-fLocalInitParam[0],lpar[1]-fLocalInitParam[1],lpar[2]-fLocalInitParam[2],lpar[3]-fLocalInitParam[3],lpar[4]-fLocalInitParam[4]));
1229
1230
1231   // prepare the TGeoHMatrix
1232   TGeoHMatrix *fTempHMat = fMilleModule[fCurrentModuleInternalIndex]->GetSensitiveVolumeModifiedMatrix(fCluster.GetVolumeID(),gpar);
1233   if (!fTempHMat) return -1;
1234
1235   Double_t v0g[3]; // vector with straight line direction in global coord.
1236   Double_t p0g[3]; // point of the straight line (glo)
1237
1238   if (fBOn) { // B FIELD!
1239     AliTrackPoint prf;
1240     for (int ip=0; ip<5; ip++)
1241       fRieman->SetParam(ip,lpar[ip]);
1242
1243     if (!fRieman->GetPCA(fCluster,prf))  {
1244       AliInfo(Form("error in GetPCA for point %d",fCluster.GetVolumeID()));
1245       return -3;
1246     }
1247     // now determine straight line passing tangent to fit curve at prf
1248     // ugx = dX/dY_glo = DeltaX/DeltaY_glo
1249     // mo' P1=(X,Y,Z)_glo_prf
1250     //       => (x,y,Z)_trk_prf ruotando di alpha...
1251     Double_t alpha=fRieman->GetAlpha();
1252     Double_t x1g = prf.GetX();
1253     Double_t y1g = prf.GetY();
1254     Double_t z1g = prf.GetZ();
1255     Double_t x1t =  x1g*TMath::Cos(alpha) + y1g*TMath::Sin(alpha);
1256     Double_t y1t = -x1g*TMath::Sin(alpha) + y1g*TMath::Cos(alpha);
1257     Double_t z1t =  z1g;
1258
1259     Double_t x2t = x1t+1.0;
1260     Double_t y2t = y1t+fRieman->GetDYat(x1t);
1261     Double_t z2t = z1t+fRieman->GetDZat(x1t);
1262     Double_t x2g =  x2t*TMath::Cos(alpha) - y2t*TMath::Sin(alpha);
1263     Double_t y2g =  x2t*TMath::Sin(alpha) + y2t*TMath::Cos(alpha);
1264     Double_t z2g =  z2t;
1265
1266     AliDebug(3,Form("Riemann frame:  fAlpha = %f  =  %f  ",alpha,alpha*180./TMath::Pi()));
1267     AliDebug(3,Form("   prf_glo=( %f , %f , %f )  prf_rf=( %f , %f , %f )\n", x1g,y1g,z1g, x1t,y1t,z1t));
1268     AliDebug(3,Form("   mov_glo=( %f , %f , %f )      rf=( %f , %f , %f )\n",x2g,y2g,z2g, x2t,y2t,z2t));
1269
1270     if (TMath::Abs(y2g-y1g)<1e-15) {
1271       AliInfo("DeltaY=0! Cannot proceed...");
1272       return -1;
1273     }
1274     // ugx,1,ugz
1275     v0g[0] = (x2g-x1g)/(y2g-y1g);
1276     v0g[1]=1.0;
1277     v0g[2] = (z2g-z1g)/(y2g-y1g);
1278
1279     // point: just keep prf
1280     p0g[0]=x1g;
1281     p0g[1]=y1g;
1282     p0g[2]=z1g;
1283   }
1284   else { // staight line
1285     // vector of initial straight line direction in glob. coord
1286     v0g[0]=lpar[2];
1287     v0g[1]=1.0;
1288     v0g[2]=lpar[3];
1289
1290     // intercept in yg=0 plane in glob coord
1291     p0g[0]=lpar[0];
1292     p0g[1]=0.0;
1293     p0g[2]=lpar[1];
1294   }
1295   AliDebug(3,Form("Line vector: ( %f , %f , %f )  point:( %f , %f , %f )\n",v0g[0],v0g[1],v0g[2],p0g[0],p0g[1],p0g[2]));
1296
1297   // same in local coord.
1298   Double_t p0l[3],v0l[3];
1299   fTempHMat->MasterToLocalVect(v0g,v0l);
1300   fTempHMat->MasterToLocal(p0g,p0l);
1301
1302   if (TMath::Abs(v0l[1])<1e-15) {
1303     AliInfo("Track Y direction in local frame is zero! Cannot proceed...");
1304     return -1;
1305   }
1306
1307   // local intersection point
1308   fPintLoc[0] = p0l[0] - (v0l[0]/v0l[1])*p0l[1];
1309   fPintLoc[1] = 0;
1310   fPintLoc[2] = p0l[2] - (v0l[2]/v0l[1])*p0l[1];
1311
1312   // global intersection point
1313   fTempHMat->LocalToMaster(fPintLoc,fPintGlo);
1314   AliDebug(3,Form("Intesect. point: L( %f , %f , %f )  G( %f , %f , %f )\n",fPintLoc[0],fPintLoc[1],fPintLoc[2],fPintGlo[0],fPintGlo[1],fPintGlo[2]));
1315
1316   return 0;
1317 }
1318
1319 Int_t AliITSAlignMille::CalcDerivatives(Int_t paridx, Bool_t islpar) {
1320   /// calculate numerically (ROOT's style) the derivatives for
1321   /// local X intersection  and local Z intersection
1322   /// parlist: local  (islpar=kTRUE)  pgx0, pgz0, ugx0, ugz0  OR riemann's params
1323   ///          global (islpar=kFALSE) tx, ty, tz, psi, theta, phi (Raf's angles in deg)
1324   /// return 0 if success
1325
1326   // copy initial parameters
1327   Double_t lpar[ITSMILLENLOCAL];
1328   Double_t gpar[ITSMILLENPARCH];
1329   for (Int_t i=0; i<ITSMILLENLOCAL; i++) lpar[i]=fLocalInitParam[i];
1330   for (Int_t i=0; i<ITSMILLENPARCH; i++) gpar[i]=fModuleInitParam[i];
1331
1332   // trial with fixed dpar...
1333   Double_t dpar=0.0;
1334
1335   if (islpar) { // track parameters
1336     //dpar=fLocalInitParam[paridx]*0.001;
1337     // set minimum dpar
1338     if (!fBOn) {
1339       if (paridx<2) dpar=1.0e-4; // translations
1340       else dpar=1.0e-6; // direction
1341     }
1342     else { // B Field
1343       // pepo: proviamo con 1/1000, poi evenctually 1/100...
1344       Double_t dfrac=0.01;
1345       switch(paridx) {
1346       case 0:
1347         // RMS cosmics: 1e-4
1348         dpar = TMath::Max(1.0e-6,TMath::Abs(fLocalInitParam[paridx]*dfrac));
1349         break;
1350       case 1:
1351         // RMS cosmics: 0.2
1352         dpar = TMath::Max(0.002,TMath::Abs(fLocalInitParam[paridx]*dfrac));
1353         break;
1354       case 2:
1355         // RMS cosmics: 9
1356         dpar = TMath::Max(0.09,TMath::Abs(fLocalInitParam[paridx]*dfrac));
1357         break;
1358       case 3:
1359         // RMS cosmics: 7
1360         dpar = TMath::Max(0.07,TMath::Abs(fLocalInitParam[paridx]*dfrac));
1361         break;
1362       case 4:
1363         // RMS cosmics: 0.3
1364         dpar = TMath::Max(0.003,TMath::Abs(fLocalInitParam[paridx]*dfrac));
1365         break;
1366       }
1367     }
1368   }
1369   else { // alignment global parameters
1370     //dpar=fModuleInitParam[paridx]*0.001;
1371     if (paridx<3) dpar=1.0e-4; // translations
1372     else dpar=1.0e-2; // angles
1373   }
1374
1375   AliDebug(3,Form("+++ using dpar=%g",dpar));
1376
1377   // calculate derivative ROOT's like:
1378   //  using f(x+h),f(x-h),f(x+h/2),f(x-h2)...
1379   Double_t pintl1[3]; // f(x-h)
1380   Double_t pintl2[3]; // f(x-h/2)
1381   Double_t pintl3[3]; // f(x+h/2)
1382   Double_t pintl4[3]; // f(x+h)
1383
1384   // first values
1385   if (islpar) lpar[paridx] -= dpar;
1386   else gpar[paridx] -= dpar;
1387   if (CalcIntersectionPoint(lpar, gpar)) return -2;
1388   for (Int_t i=0; i<3; i++) pintl1[i]=fPintLoc[i];
1389
1390   // second values
1391   if (islpar) lpar[paridx] += dpar/2;
1392   else gpar[paridx] += dpar/2;
1393   if (CalcIntersectionPoint(lpar, gpar)) return -2;
1394   for (Int_t i=0; i<3; i++) pintl2[i]=fPintLoc[i];
1395
1396   // third values
1397   if (islpar) lpar[paridx] += dpar;
1398   else gpar[paridx] += dpar;
1399   if (CalcIntersectionPoint(lpar, gpar)) return -2;
1400   for (Int_t i=0; i<3; i++) pintl3[i]=fPintLoc[i];
1401
1402   // fourth values
1403   if (islpar) lpar[paridx] += dpar/2;
1404   else gpar[paridx] += dpar/2;
1405   if (CalcIntersectionPoint(lpar, gpar)) return -2;
1406   for (Int_t i=0; i<3; i++) pintl4[i]=fPintLoc[i];
1407
1408   Double_t h2 = 1./(2.*dpar);
1409   Double_t d0 = pintl4[0]-pintl1[0];
1410   Double_t d2 = 2.*(pintl3[0]-pintl2[0]);
1411   fDerivativeXLoc = h2*(4*d2 - d0)/3.;
1412   if (TMath::Abs(fDerivativeXLoc) < 1.0e-9) fDerivativeXLoc=0.0;
1413
1414   d0 = pintl4[2]-pintl1[2];
1415   d2 = 2.*(pintl3[2]-pintl2[2]);
1416   fDerivativeZLoc = h2*(4*d2 - d0)/3.;
1417   if (TMath::Abs(fDerivativeZLoc) < 1.0e-9) fDerivativeZLoc=0.0;
1418
1419   AliDebug(3,Form("\n+++ derivatives +++ \n"));
1420   AliDebug(3,Form("+++ dXLoc/dpar = %g +++\n",fDerivativeXLoc));
1421   AliDebug(3,Form("+++ dZLoc/dpar = %g +++\n\n",fDerivativeZLoc));
1422
1423   return 0;
1424 }
1425
1426
1427 Int_t AliITSAlignMille::AddLocalEquation(AliITSAlignMilleData &m) {
1428   /// Define local equation for current cluster in X and Z coor.
1429   /// and store them to memory
1430   /// return 0 if success
1431
1432   // store first interaction point
1433   if (CalcIntersectionPoint(fLocalInitParam, fModuleInitParam)) return -4;
1434   for (Int_t i=0; i<3; i++) fPintLoc0[i]=fPintLoc[i];
1435   AliDebug(2,Form("Intesect. point: L( %f , %f , %f )",fPintLoc[0],fPintLoc[1],fPintLoc[2]));
1436
1437   // calculate local derivatives numerically
1438   Double_t dXdL[ITSMILLENLOCAL],dZdL[ITSMILLENLOCAL];
1439   for (Int_t i=0; i<fNLocal; i++) {
1440     if (CalcDerivatives(i,kTRUE)) return -1;
1441     dXdL[i]=fDerivativeXLoc;
1442     dZdL[i]=fDerivativeZLoc;
1443   }
1444
1445   Double_t dXdG[ITSMILLENPARCH],dZdG[ITSMILLENPARCH];
1446   for (Int_t i=0; i<ITSMILLENPARCH; i++) {
1447     if (CalcDerivatives(i,kFALSE)) return -1;
1448     dXdG[i]=fDerivativeXLoc;
1449     dZdG[i]=fDerivativeZLoc;
1450   }
1451
1452   AliDebug(2,Form("\n***************\n"));
1453   for (Int_t i=0; i<fNLocal; i++)
1454     AliDebug(2,Form("Local parameter %d - dXdpar = %g  - dZdpar = %g\n",i,dXdL[i],dZdL[i]));
1455   for (Int_t i=0; i<ITSMILLENPARCH; i++)
1456     AliDebug(2,Form("Global parameter %d - dXdpar = %g  - dZdpar = %g\n",i,dXdG[i],dZdG[i]));
1457   AliDebug(2,Form("\n***************\n"));
1458
1459   // check if at least 1 local and 1 global derivs. are not null
1460   Double_t nonzero=0.0;
1461   for (Int_t i=0; i<fNLocal; i++) nonzero += TMath::Abs(dXdL[i]);
1462   if (nonzero==0.0) {
1463     AliInfo("Aborting local equations for this point beacuse of zero local X derivatives!");
1464     return -2;
1465   }
1466   nonzero=0.0;
1467   for (Int_t i=0; i<ITSMILLENPARCH; i++) nonzero += TMath::Abs(dXdG[i]);
1468   if (nonzero==0.0) {
1469     AliInfo("Aborting local equations for this point beacuse of zero global X derivatives!");
1470     return -2;
1471   }
1472   nonzero=0.0;
1473   for (Int_t i=0; i<fNLocal; i++) nonzero += TMath::Abs(dZdL[i]);
1474   if (nonzero==0.0) {
1475     AliInfo("Aborting local equations for this point beacuse of zero local Z derivatives!");
1476     return -2;
1477   }
1478   nonzero=0.0;
1479   for (Int_t i=0; i<ITSMILLENPARCH; i++) nonzero += TMath::Abs(dZdG[i]);
1480   if (nonzero==0.0) {
1481     AliInfo("Aborting local equations for this point beacuse of zero global Z derivatives!");
1482     return -2;
1483   }
1484
1485   // ok, can copy to m
1486
1487   AliDebug(2,Form("Adding local equation X with fMeas=%.6f  and fSigma=%.6f",(fMeasLoc[0]-fPintLoc0[0]), fSigmaLoc[0]));
1488   // set equation for Xloc coordinate
1489   for (Int_t i=0; i<fNLocal; i++) {
1490     m.GetIdxlocX()[i]=i;
1491     m.GetDerlocX()[i]=dXdL[i];
1492   }
1493   for (Int_t i=0; i<ITSMILLENPARCH; i++) {
1494     m.GetIdxgloX()[i]=fCurrentModuleInternalIndex*ITSMILLENPARCH+i;
1495     m.GetDergloX()[i]=dXdG[i];
1496   }
1497   m.SetMeasX(fMeasLoc[0]-fPintLoc0[0]);
1498   m.SetSigmaX(fSigmaLoc[0]);
1499
1500   AliDebug(2,Form("Adding local equation Z with fMeas=%.6f  and fSigma=%.6f",(fMeasLoc[2]-fPintLoc0[2]), fSigmaLoc[2]));
1501   // set equation for Zloc coordinate
1502   for (Int_t i=0; i<fNLocal; i++) {
1503     m.GetIdxlocZ()[i]=i;
1504     m.GetDerlocZ()[i]=dZdL[i];
1505   }
1506   for (Int_t i=0; i<ITSMILLENPARCH; i++) {
1507     m.GetIdxgloZ()[i]=fCurrentModuleInternalIndex*ITSMILLENPARCH+i;
1508     m.GetDergloZ()[i]=dZdG[i];
1509   }
1510   m.SetMeasZ(fMeasLoc[2]-fPintLoc0[2]);
1511   m.SetSigmaZ(fSigmaLoc[2]);
1512
1513   return 0;
1514 }
1515
1516
1517 void AliITSAlignMille::SetLocalEquations(AliITSAlignMilleData *m, Int_t neq) {
1518   /// Set local equations with data stored in m
1519   /// return 0 if success
1520
1521   for (Int_t j=0; j<neq; j++) {
1522
1523     AliDebug(2,Form("setting local equation X with fMeas=%.6f  and fSigma=%.6f",m[j].GetMeasX(), m[j].GetSigmaX()));
1524     // set equation for Xloc coordinate
1525     for (Int_t i=0; i<fNLocal; i++)
1526       SetLocalDerivative( m[j].GetIdxlocX()[i], m[j].GetDerlocX()[i] );
1527
1528     for (Int_t i=0; i<ITSMILLENPARCH; i++)
1529       SetGlobalDerivative( m[j].GetIdxgloX()[i], m[j].GetDergloX()[i] );
1530
1531     fMillepede->SetLocalEquation(fGlobalDerivatives, fLocalDerivatives, m[j].GetMeasX(), m[j].GetSigmaX());
1532
1533
1534     AliDebug(2,Form("setting local equation Z with fMeas=%.6f  and fSigma=%.6f",m[j].GetMeasZ(), m[j].GetSigmaZ()));
1535     // set equation for Zloc coordinate
1536     for (Int_t i=0; i<fNLocal; i++)
1537       SetLocalDerivative( m[j].GetIdxlocZ()[i], m[j].GetDerlocZ()[i] );
1538
1539     for (Int_t i=0; i<ITSMILLENPARCH; i++)
1540       SetGlobalDerivative( m[j].GetIdxgloZ()[i], m[j].GetDergloZ()[i] );
1541
1542     fMillepede->SetLocalEquation(fGlobalDerivatives, fLocalDerivatives, m[j].GetMeasZ(), m[j].GetSigmaZ());
1543   }
1544 }
1545
1546
1547 void AliITSAlignMille::LocalFit(Int_t iTrack, Double_t *lTrackParam, Int_t lSingleFit) {
1548   /// Call local fit for this track
1549   if (!fIsMilleInit) {
1550     AliInfo("Millepede has not been initialized!");
1551     return;
1552   }
1553   Int_t iRes = fMillepede->LocalFit(iTrack,lTrackParam,lSingleFit);
1554   AliDebug(2,Form("iRes = %d",iRes));
1555   //if (iRes && !lSingleFit) {
1556   if (!lSingleFit) { // Ruben Shahoyan's bug fix
1557     fMillepede->SetNLocalEquations(fMillepede->GetNLocalEquations()+1);
1558   }
1559 }
1560
1561 void AliITSAlignMille::GlobalFit(Double_t *parameters,Double_t *errors,Double_t *pulls) {
1562   /// Call global fit; Global parameters are stored in parameters
1563   if (!fIsMilleInit) {
1564     AliInfo("Millepede has not been initialized!");
1565     return;
1566   }
1567   fMillepede->GlobalFit(parameters,errors,pulls);
1568   AliInfo("Done fitting global parameters!");
1569 }
1570
1571 Double_t AliITSAlignMille::GetParError(Int_t iPar) {
1572   /// Get error of parameter iPar
1573   if (!fIsMilleInit) {
1574     AliInfo("Millepede has not been initialized!");
1575     return 0;
1576   }
1577   Double_t lErr = fMillepede->GetParError(iPar);
1578   return lErr;
1579 }
1580
1581 void AliITSAlignMille::PrintGlobalParameters() {
1582   /// Print global parameters
1583   if (!fIsMilleInit) {
1584     AliInfo("Millepede has not been initialized!");
1585     return;
1586   }
1587   fMillepede->PrintGlobalParameters();
1588 }
1589
1590 // //_________________________________________________________________________
1591 Int_t AliITSAlignMille::LoadSuperModuleFile(const Char_t *sfile)
1592 {
1593   // load definitions of supermodules from a root file
1594   // return 0 if success
1595
1596   TFile *smf=TFile::Open(sfile);
1597   if (!smf->IsOpen()) {
1598     AliInfo(Form("Cannot open supermodule file %s",sfile));
1599     return -1;
1600   }
1601
1602   TClonesArray *sma=(TClonesArray*)smf->Get("ITSMilleSuperModules");
1603   if (!sma) {
1604     AliInfo(Form("Cannot find ITSMilleSuperModules array in file"));
1605     return -2;
1606   }
1607   Int_t nsma=sma->GetEntriesFast();
1608   AliInfo(Form("Array of SuperModules with %d entries\n",nsma));
1609
1610   Char_t st[2048];
1611   char symname[250];
1612   UShort_t volid;
1613   TGeoHMatrix m;
1614
1615   for (Int_t i=0; i<nsma; i++) {
1616     AliAlignObjParams *a = (AliAlignObjParams*)sma->UncheckedAt(i);
1617     volid=a->GetVolUID();
1618     strcpy(st,a->GetSymName());
1619     a->GetMatrix(m);
1620
1621     sscanf(st,"%s",symname);
1622     // decode module list
1623     char *stp=strstr(st,"ModuleList:");
1624     if (!stp) return -3;
1625     stp += 11;
1626     int idx[2200];
1627     char spp[200]; int jp=0;
1628     char cl[20];
1629     strcpy(st,stp);
1630     int l=strlen(st);
1631     int j=0;
1632     int n=0;
1633
1634     while (j<=l) {
1635       if (st[j]==9 || st[j]==32 || st[j]==10 || st[j]==0) {
1636         spp[jp]=0;
1637         jp=0;
1638         if (strlen(spp)) {
1639           int k=strcspn(spp,"-");
1640           if (k<int(strlen(spp))) { // c'e' il -
1641             strcpy(cl,&(spp[k+1]));
1642             spp[k]=0;
1643             int ifrom=atoi(spp); int ito=atoi(cl);
1644             for (int b=ifrom; b<=ito; b++) {
1645               idx[n]=b;
1646               n++;
1647             }
1648           }
1649           else { // numerillo singolo
1650             idx[n]=atoi(spp);
1651             n++;
1652           }
1653         }
1654       }
1655       else {
1656         spp[jp]=st[j];
1657         jp++;
1658       }
1659       j++;
1660     }
1661     UShort_t volidsv[2198];
1662     for (j=0;j<n;j++) {
1663       volidsv[j]=AliITSAlignMilleModule::GetVolumeIDFromIndex(idx[j]);
1664       if (!volidsv[j]) {
1665         AliInfo(Form("Index %d not valid (range 0->2197)",idx[j]));
1666         return -5;
1667       }
1668     }
1669     Int_t smindex=int(2198+volid-14336); // virtual index
1670     fSuperModule[fNSuperModules]=new AliITSAlignMilleModule(smindex,volid,symname,&m,n,volidsv);
1671
1672     //-------------
1673     fNSuperModules++;
1674   }
1675
1676   smf->Close();
1677
1678   fUseSuperModules=1;
1679   return 0;
1680 }
1681