Reduced QA output (Yves)
[u/mrichter/AliRoot.git] / ITS / AliITSClusterFinderV2SDD.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-2003, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
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8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
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13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16 /* $Id$*/
17
18 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
19 //            Implementation of the ITS clusterer V2 class                //
20 //                                                                        //
21 //          Origin: Iouri Belikov, CERN, Jouri.Belikov@cern.ch            //
22 //                                                                        //
23 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
24
25
26
27 #include <TClonesArray.h>
28 #include "AliITSClusterFinderV2SDD.h"
29 #include "AliITSRecPoint.h"
30 #include "AliITSDetTypeRec.h"
31 #include "AliRawReader.h"
32 #include "AliITSRawStreamSDD.h"
33 #include "AliITSRawStreamSDDCompressed.h"
34 #include "AliITSCalibrationSDD.h"
35 #include "AliITSresponseSDD.h"
36 #include "AliITSDetTypeRec.h"
37 #include "AliITSReconstructor.h"
38 #include "AliITSsegmentationSDD.h"
39 #include "AliITSdigitSDD.h"
40 #include "AliITSgeomTGeo.h"
41
42 ClassImp(AliITSClusterFinderV2SDD)
43
44 AliITSClusterFinderV2SDD::AliITSClusterFinderV2SDD(AliITSDetTypeRec* dettyp):AliITSClusterFinder(dettyp)
45 {
46
47   //Default constructor
48
49 }
50  
51
52 void AliITSClusterFinderV2SDD::FindRawClusters(Int_t mod){
53
54   //Find clusters V2
55   SetModule(mod);
56   FindClustersSDD(fDigits);
57
58 }
59
60 void AliITSClusterFinderV2SDD::FindClustersSDD(TClonesArray *digits) {
61   //------------------------------------------------------------
62   // Actual SDD cluster finder
63   //------------------------------------------------------------
64   Int_t nAnodes = GetSeg()->NpzHalf();
65   Int_t nzBins = nAnodes+2;
66   Int_t nTimeBins = GetSeg()->Npx();
67   Int_t nxBins = nTimeBins+2;
68   const Int_t kMaxBin=nzBins*nxBins;
69
70   AliBin *bins[2];
71   bins[0]=new AliBin[kMaxBin];
72   bins[1]=new AliBin[kMaxBin];
73   AliITSCalibrationSDD* cal = (AliITSCalibrationSDD*)GetResp(fModule);
74   if(cal==0){
75     AliError(Form("Calibration object not present for SDD module %d\n",fModule));
76     return;
77   }
78
79   AliITSdigitSDD *d=0;
80   Int_t i, ndigits=digits->GetEntriesFast();
81   for (i=0; i<ndigits; i++) {
82      d=(AliITSdigitSDD*)digits->UncheckedAt(i);
83      Int_t ian=d->GetCoord1();
84      Int_t itb=d->GetCoord2();
85      Int_t iSide=0;
86      if (ian >= nAnodes) iSide=1;    
87      Float_t gain=cal->GetChannelGain(ian)/fDetTypeRec->GetAverageGainSDD();
88      Float_t charge=d->GetSignal(); // returns expanded signal 
89                                     // (10 bit, low threshold already added)
90      Float_t baseline = cal->GetBaseline(ian);
91      if(charge>baseline) charge-=baseline;
92      else charge=0;
93
94      if(gain>0.){ // Bad channels have gain=0.
95        charge/=gain;
96        if(charge<cal->GetThresholdAnode(ian)) continue;
97        Int_t q=(Int_t)(charge+0.5);
98        Int_t y=itb+1;   
99        Int_t z=ian+1;   
100        if (z <= nAnodes){
101          bins[0][y*nzBins+z].SetQ(q);
102          bins[0][y*nzBins+z].SetMask(1);
103          bins[0][y*nzBins+z].SetIndex(i);
104        } else {
105          z-=nAnodes;
106          bins[1][y*nzBins+z].SetQ(q);
107          bins[1][y*nzBins+z].SetMask(1);
108          bins[1][y*nzBins+z].SetIndex(i);
109        }
110      }
111   }
112   
113   FindClustersSDD(bins, kMaxBin, nzBins, digits);
114
115   delete[] bins[0];
116   delete[] bins[1];
117
118 }
119
120 void AliITSClusterFinderV2SDD::
121 FindClustersSDD(AliBin* bins[2], Int_t nMaxBin, Int_t nzBins, 
122                 TClonesArray *digits, TClonesArray *clusters, Int_t jitter) {
123   //------------------------------------------------------------
124   // Actual SDD cluster finder
125   //------------------------------------------------------------
126
127   static AliITSRecoParam *repa = NULL;
128   if(!repa){
129     repa = (AliITSRecoParam*) AliITSReconstructor::GetRecoParam();
130     if(!repa){
131       repa = AliITSRecoParam::GetHighFluxParam();
132       AliWarning("Using default AliITSRecoParam class");
133     }
134   }
135   const TGeoHMatrix *mT2L=AliITSgeomTGeo::GetTracking2LocalMatrix(fModule);
136   AliITSCalibrationSDD* cal = (AliITSCalibrationSDD*)GetResp(fModule);
137   if(cal==0){
138     AliError(Form("Calibration object not present for SDD module %d\n",fModule));
139     return;
140   }
141   Int_t ncl=0; 
142   TClonesArray &cl=*clusters;
143   for (Int_t s=0; s<2; s++)
144     for (Int_t i=0; i<nMaxBin; i++) {
145       if(NoiseSuppress(i,s,nzBins,bins[s],cal)) continue;
146       if (bins[s][i].IsUsed()) continue;
147       Int_t idx[32]; UInt_t msk[32]; Int_t npeaks=0;
148       FindPeaks(i, nzBins, bins[s], idx, msk, npeaks);
149
150       if (npeaks>30) continue;
151       if (npeaks==0) continue;
152
153       Int_t k,l;
154       for (k=0; k<npeaks-1; k++){//mark adjacent peaks
155         if (idx[k] < 0) continue; //this peak is already removed
156         for (l=k+1; l<npeaks; l++) {
157           if (idx[l] < 0) continue; //this peak is already removed
158           Int_t ki=idx[k]/nzBins, kj=idx[k] - ki*nzBins;
159           Int_t li=idx[l]/nzBins, lj=idx[l] - li*nzBins;
160           Int_t di=TMath::Abs(ki - li);
161           Int_t dj=TMath::Abs(kj - lj);
162           if (di>1 || dj>1) continue;
163           if (bins[s][idx[k]].GetQ() > bins[s][idx[l]].GetQ()) {
164             msk[l]=msk[k];
165             idx[l]*=-1;
166           } else {
167             msk[k]=msk[l];
168             idx[k]*=-1;
169             break;
170           } 
171         }
172       }
173
174       for (k=0; k<npeaks; k++) {
175         if(repa->GetUseUnfoldingInClusterFinderSDD()==kFALSE) msk[k]=msk[0];
176         MarkPeak(TMath::Abs(idx[k]), nzBins, bins[s], msk[k]);
177       }
178         
179       for (k=0; k<npeaks; k++) {
180         if (idx[k] < 0) continue; //removed peak
181         AliITSRecPoint c;
182         MakeCluster(idx[k], nzBins, bins[s], msk[k], c);
183         //mi change
184         Int_t milab[10];
185         for (Int_t ilab=0;ilab<10;ilab++){
186           milab[ilab]=-2;
187         }
188         Int_t maxi=0,mini=0,maxj=0,minj=0;
189
190         for (Int_t di=-5; di<=5;di++){
191           for (Int_t dj=-10;dj<=10;dj++){
192             Int_t index = idx[k]+di+dj*nzBins;
193             if (index<0) continue;
194             if (index>=nMaxBin) continue;
195             AliBin *b=&bins[s][index];
196             Int_t nAnode=index%nzBins-1;
197             Int_t adcSignal=b->GetQ();
198             if(adcSignal>cal->GetThresholdAnode(nAnode)){
199               if (di>maxi) maxi=di;
200               if (di<mini) mini=di;
201               if (dj>maxj) maxj=dj;
202               if (dj<minj) minj=dj;
203             }
204             //
205             if(digits) {
206               if (TMath::Abs(di)<2&&TMath::Abs(dj)<2){
207                 AliITSdigitSDD* d=(AliITSdigitSDD*)digits->UncheckedAt(b->GetIndex());
208                 for (Int_t itrack=0;itrack<10;itrack++){
209                   Int_t track = (d->GetTracks())[itrack];
210                   if (track>=0) {
211                     AddLabel(milab, track); 
212                   }
213                 }
214               }
215             }
216           }
217         }
218         Int_t clSizAnode=maxi-mini+1;
219         Int_t clSizTb=maxj-minj+1;
220         if(repa->GetUseSDDClusterSizeSelection()){
221           if(clSizTb==1) continue; // cut common mode noise spikes
222           if(clSizAnode>3)  continue; // cut common mode noise spikes
223           if(clSizTb>10)  continue; // cut clusters on noisy anodes
224         }
225
226         AliITSresponseSDD* rsdd = fDetTypeRec->GetResponseSDD();
227         Float_t y=c.GetY(),z=c.GetZ(), q=c.GetQ();
228         y/=q; z/=q;
229         Float_t zAnode=z-0.5;  // to have anode in range 0.-255. and centered on the mid of the pitch
230         Float_t timebin=y-0.5;  // to have time bin in range 0.-255. amd centered on the mid of the bin
231         if(s==1) zAnode += GetSeg()->NpzHalf();  // right side has anodes from 256. to 511.
232         Float_t zdet = GetSeg()->GetLocalZFromAnode(zAnode);
233         Float_t driftTimeUncorr = GetSeg()->GetDriftTimeFromTb(timebin)+jitter*rsdd->GetCarlosRXClockPeriod();
234         Float_t driftTime=driftTimeUncorr-rsdd->GetTimeZero(fModule);
235         Float_t driftSpeed = cal->GetDriftSpeedAtAnode(zAnode) + rsdd->GetDeltaVDrift(fModule);
236         Float_t driftPathMicron = driftTime*driftSpeed;
237         const Double_t kMicronTocm = 1.0e-4; 
238         Float_t xdet=(driftPathMicron-GetSeg()->Dx())*kMicronTocm; // xdet is negative
239         if (s==0) xdet=-xdet; // left side has positive local x
240         
241         if(repa->GetUseSDDCorrectionMaps()){
242           Float_t corrx=0, corrz=0;
243           cal->GetCorrections(zdet,xdet,corrz,corrx,GetSeg());
244           zdet+=corrz;
245           xdet+=corrx;
246         }
247
248         Double_t loc[3]={xdet,0.,zdet},trk[3]={0.,0.,0.};
249         mT2L->MasterToLocal(loc,trk);
250         y=trk[1];
251         z=trk[2]; 
252
253         q/=rsdd->GetADC2keV();  //to have MPV 1 MIP = 86.4 KeV
254         if(cal-> IsAMAt20MHz()) q*=2.; // account for 1/2 sampling freq.
255         if(q<repa->GetMinClusterChargeSDD()) continue; // remove noise clusters
256
257         Float_t hit[5] = {y, z, 0.0030*0.0030, 0.0020*0.0020, q};
258         Int_t  info[3] = {clSizTb, clSizAnode, fNlayer[fModule]};
259         if (digits) {     
260           //       AliBin *b=&bins[s][idx[k]];
261           //       AliITSdigitSDD* d=(AliITSdigitSDD*)digits->UncheckedAt(b->GetIndex());
262           {
263             //Int_t lab[3];
264             //lab[0]=(d->GetTracks())[0];
265             //lab[1]=(d->GetTracks())[1];
266             //lab[2]=(d->GetTracks())[2];
267             //CheckLabels(lab);
268             CheckLabels2(milab); 
269           }
270         }
271         milab[3]=fNdet[fModule];
272         AliITSRecPoint cc(milab,hit,info);
273         cc.SetType(npeaks);
274         cc.SetDriftTime(driftTimeUncorr);
275         if(clusters) new (cl[ncl]) AliITSRecPoint(cc); 
276         else {
277           fDetTypeRec->AddRecPoint(cc);
278         }
279         ncl++;
280       }
281     }
282   
283 }
284 //______________________________________________________________________
285 void AliITSClusterFinderV2SDD::RawdataToClusters(AliRawReader* rawReader,TClonesArray** clusters){
286     //------------------------------------------------------------
287   // This function creates ITS clusters from raw data
288   //------------------------------------------------------------
289   rawReader->Reset();
290   AliITSRawStream* inputSDD;
291   if(fDetTypeRec->IsHLTmodeC()==kTRUE){
292     inputSDD=new AliITSRawStreamSDDCompressed(rawReader);
293   }else{
294     inputSDD=new AliITSRawStreamSDD(rawReader);
295   }
296
297   AliITSDDLModuleMapSDD *ddlmap=(AliITSDDLModuleMapSDD*)fDetTypeRec->GetDDLModuleMapSDD();
298   inputSDD->SetDDLModuleMap(ddlmap);
299   for(Int_t iddl=0; iddl<AliITSDDLModuleMapSDD::GetNDDLs(); iddl++){
300     for(Int_t icar=0; icar<AliITSDDLModuleMapSDD::GetNModPerDDL();icar++){
301       Int_t iMod=ddlmap->GetModuleNumber(iddl,icar);
302       if(iMod==-1) continue;
303       AliITSCalibrationSDD* cal = (AliITSCalibrationSDD*)GetResp(iMod);
304       if(cal==0){
305         AliError(Form("Calibration object not present for SDD module %d\n",iMod));
306         continue;
307       }
308       Bool_t isZeroSupp=cal->GetZeroSupp();
309       if(isZeroSupp){ 
310         for(Int_t iSid=0; iSid<2; iSid++) inputSDD->SetZeroSuppLowThreshold(iMod-240,iSid,cal->GetZSLowThreshold(iSid));
311       }else{
312         for(Int_t iSid=0; iSid<2; iSid++) inputSDD->SetZeroSuppLowThreshold(iMod-240,iSid,0);
313       }
314     }
315   }
316   FindClustersSDD(inputSDD,clusters);
317   delete inputSDD;
318 }
319
320 void AliITSClusterFinderV2SDD::FindClustersSDD(AliITSRawStream* input, 
321                                         TClonesArray** clusters) 
322 {
323   //------------------------------------------------------------
324   // Actual SDD cluster finder for raw data
325   //------------------------------------------------------------
326   Int_t nClustersSDD = 0;
327   Int_t nAnodes = GetSeg()->NpzHalf();
328   Int_t nzBins = nAnodes+2;
329   Int_t nTimeBins = GetSeg()->Npx();
330   Int_t nxBins = nTimeBins+2;
331   const Int_t kMaxBin=nzBins*nxBins;
332   AliBin *bins[2];
333   AliBin *ddlbins[kHybridsPerDDL]; // 12 modules (=24 hybrids) of 1 DDL read "in parallel"
334   for(Int_t iHyb=0;iHyb<kHybridsPerDDL;iHyb++) ddlbins[iHyb]=new AliBin[kMaxBin];
335   Int_t vectModId[kModulesPerDDL];
336   for(Int_t iMod=0; iMod<kModulesPerDDL; iMod++) vectModId[iMod]=-1;
337
338   // read raw data input stream
339   while (input->Next()) {
340     Int_t iModule = input->GetModuleID();
341     if(iModule<0){
342       AliWarning(Form("Invalid SDD module number %d\n", iModule));
343       continue;
344     }
345     Int_t iCarlos =input->GetCarlosId();
346     Int_t iSide = input->GetChannel();
347     Int_t iHybrid=iCarlos*2+iSide;
348
349     if (input->IsCompletedModule()) {
350       // store the module number
351       vectModId[iCarlos]=iModule;
352     }
353     else if (input->IsCompletedDDL()) {
354       // when all data from a DDL was read, search for clusters
355       Int_t jitter=input->GetJitter();
356       for(Int_t iMod=0; iMod<kModulesPerDDL; iMod++){
357         if(vectModId[iMod]>=0){
358           fModule = vectModId[iMod];
359           clusters[fModule] = new TClonesArray("AliITSRecPoint");
360           bins[0]=ddlbins[iMod*2];   // first hybrid of the module
361           bins[1]=ddlbins[iMod*2+1]; // second hybrid of the module
362           FindClustersSDD(bins, kMaxBin, nzBins, NULL, clusters[fModule],jitter);
363           Int_t nClusters = clusters[fModule]->GetEntriesFast();
364           nClustersSDD += nClusters;
365           vectModId[iMod]=-1;
366         }
367         for(Int_t iBin=0;iBin<kMaxBin; iBin++){
368           ddlbins[iMod*2][iBin].Reset();
369           ddlbins[iMod*2+1][iBin].Reset();
370         }
371       }
372     }else{
373     // fill the current digit into the bins array
374       if(iHybrid<0 || iHybrid>=kHybridsPerDDL){ 
375         AliWarning(Form("Invalid SDD hybrid number %d on module %d\n", iHybrid,iModule));
376         continue;
377       }
378       AliITSCalibrationSDD* cal = (AliITSCalibrationSDD*)GetResp(iModule);    
379       if(cal==0){
380         AliError(Form("Calibration object not present for SDD module %d\n",iModule));
381         continue;
382       }
383       Float_t charge=input->GetSignal();
384       Int_t chan=input->GetCoord1()+nAnodes*iSide;
385       Float_t gain=cal->GetChannelGain(chan)/fDetTypeRec->GetAverageGainSDD();;
386       Float_t baseline = cal->GetBaseline(chan);
387       if(charge>baseline) charge-=baseline;
388       else charge=0;
389       if(gain>0.){ // Bad channels have gain=0
390         charge/=gain;
391         if(charge>=cal->GetThresholdAnode(chan)) {
392           Int_t q=(Int_t)(charge+0.5);
393           Int_t iz = input->GetCoord1();
394           Int_t itb = input->GetCoord2();
395           Int_t index = (itb+1) * nzBins + (iz+1);
396           if(index<kMaxBin){
397             ddlbins[iHybrid][index].SetQ(q);
398             ddlbins[iHybrid][index].SetMask(1);
399             ddlbins[iHybrid][index].SetIndex(index);
400           }else{
401             AliWarning(Form("Invalid SDD cell: Anode=%d   TimeBin=%d",iz,itb));   
402           }
403         }
404       }
405     }
406   }
407   for(Int_t iHyb=0;iHyb<kHybridsPerDDL;iHyb++) delete [] ddlbins[iHyb];
408   Info("FindClustersSDD", "found clusters in ITS SDD: %d", nClustersSDD);
409 }
410
411 //______________________________________________________________________
412 Bool_t AliITSClusterFinderV2SDD::NoiseSuppress(Int_t k, Int_t sid,Int_t nzBins, AliBin* bins, AliITSCalibrationSDD* cal) const {
413   // applies zero suppression using the measured noise of each anode
414   // threshold values from ALICE-INT-1999-28 V10
415   // returns kTRUE if the digit should eb noise suppressed, kFALSE if it should be kept
416   Float_t xfactL=2.2; 
417   Float_t xfactH=4.0;
418   //
419
420   Int_t iAn=(k%nzBins)-1;
421   if(iAn<0 || iAn>255) return kTRUE;
422   if(sid==1) iAn+=256;
423   Int_t nLow=0, nHigh=0;
424   Float_t noise=cal->GetNoiseAfterElectronics(iAn);
425   Float_t noisem1=noise;
426   if(iAn>1) noisem1=cal->GetNoiseAfterElectronics(iAn-1);
427   Float_t noisep1=noise;
428   if(iAn<511) noisep1=cal->GetNoiseAfterElectronics(iAn+1);
429   Float_t tL=noise*xfactL;
430   Float_t tH=noise*xfactH;
431   Float_t tLp1=noisep1*xfactL;
432   Float_t tHp1=noisep1*xfactH;
433   Float_t tLm1=noisem1*xfactL;
434   Float_t tHm1=noisem1*xfactH;
435   Int_t cC=bins[k].GetQ();
436   if(cC<=tL){
437     bins[k].SetQ(0);
438     bins[k].SetMask(0xFFFFFFFE);
439     return kTRUE;;
440   }
441   nLow++; // cC is greater than tL
442   if(cC>tH) nHigh++;
443   Int_t sS=bins[k-1].GetQ();
444   if(sS>tLm1) nLow++;
445   if(sS>tHm1) nHigh++;
446   Int_t nN=bins[k+1].GetQ();
447   if(nN>tLp1) nLow++;
448   if(nN>tHp1) nHigh++;
449   Int_t eE=bins[k-nzBins].GetQ();
450   if(eE>tL) nLow++;
451   if(eE>tH) nHigh++;
452   Int_t wW=bins[k+nzBins].GetQ();
453   if(wW>tL) nLow++;
454   if(wW>tH) nHigh++;
455   if(nLow<3 || nHigh<1) return kTRUE;
456   else return kFALSE;
457 }
458
459
460