]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blob - ITS/AliITSClusterFinderV2SDD.cxx
ITSSPDPHYSda: New detector algorithm for finding dead and noisy pixels.
[u/mrichter/AliRoot.git] / ITS / AliITSClusterFinderV2SDD.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-2003, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16 /* $Id$*/
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18 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
19 //            Implementation of the ITS clusterer V2 class                //
20 //                                                                        //
21 //          Origin: Iouri Belikov, CERN, Jouri.Belikov@cern.ch            //
22 //                                                                        //
23 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
24
25
26
27 #include <TClonesArray.h>
28 #include "AliITSClusterFinderV2SDD.h"
29 #include "AliITSRecPoint.h"
30 #include "AliITSDetTypeRec.h"
31 #include "AliRawReader.h"
32 #include "AliITSRawStreamSDD.h"
33 #include "AliITSCalibrationSDD.h"
34 #include "AliITSDetTypeRec.h"
35 #include "AliITSsegmentationSDD.h"
36 #include "AliITSdigitSDD.h"
37 #include "AliITSgeomTGeo.h"
38 ClassImp(AliITSClusterFinderV2SDD)
39
40 AliITSClusterFinderV2SDD::AliITSClusterFinderV2SDD(AliITSDetTypeRec* dettyp):AliITSClusterFinderV2(dettyp)
41 {
42
43   //Default constructor
44
45 }
46  
47
48 void AliITSClusterFinderV2SDD::FindRawClusters(Int_t mod){
49
50   //Find clusters V2
51   SetModule(mod);
52   FindClustersSDD(fDigits);
53
54 }
55
56 void AliITSClusterFinderV2SDD::FindClustersSDD(TClonesArray *digits) {
57   //------------------------------------------------------------
58   // Actual SDD cluster finder
59   //------------------------------------------------------------
60   Int_t nAnodes = GetSeg()->NpzHalf();
61   Int_t nzBins = nAnodes+2;
62   Int_t nTimeBins = GetSeg()->Npx();
63   Int_t nxBins = nTimeBins+2;
64   const Int_t kMaxBin=nzBins*(nxBins+2);
65
66   AliBin *bins[2];
67   bins[0]=new AliBin[kMaxBin];
68   bins[1]=new AliBin[kMaxBin];
69   AliITSCalibrationSDD* cal = (AliITSCalibrationSDD*)GetResp(fModule);
70   AliITSresponseSDD* res  = (AliITSresponseSDD*)cal->GetResponse();
71   const char *option=res->ZeroSuppOption();
72   AliITSdigitSDD *d=0;
73   Int_t i, ndigits=digits->GetEntriesFast();
74   for (i=0; i<ndigits; i++) {
75      d=(AliITSdigitSDD*)digits->UncheckedAt(i);
76      Int_t y=d->GetCoord2()+1;   //y
77      Int_t z=d->GetCoord1()+1;   //z
78      Int_t q=d->GetSignal();
79      if(!((strstr(option,"1D")) || (strstr(option,"2D")))){
80        Float_t baseline = cal->GetBaseline(d->GetCoord1());
81        if(q>baseline) q-=(Int_t)baseline;
82        else q=0;
83      }
84      if(q<cal->GetThresholdAnode(d->GetCoord1())) continue;
85      //if (q<3) continue;
86
87      if (z <= nAnodes){
88        bins[0][y*nzBins+z].SetQ(q);
89        bins[0][y*nzBins+z].SetMask(1);
90        bins[0][y*nzBins+z].SetIndex(i);
91      } else {
92        z-=nAnodes;
93        bins[1][y*nzBins+z].SetQ(q);
94        bins[1][y*nzBins+z].SetMask(1);
95        bins[1][y*nzBins+z].SetIndex(i);
96      }
97   }
98   
99   FindClustersSDD(bins, kMaxBin, nzBins, digits);
100
101   delete[] bins[0];
102   delete[] bins[1];
103
104 }
105
106 void AliITSClusterFinderV2SDD::
107 FindClustersSDD(AliBin* bins[2], Int_t nMaxBin, Int_t nzBins, 
108                 TClonesArray *digits, TClonesArray *clusters) {
109   //------------------------------------------------------------
110   // Actual SDD cluster finder
111   //------------------------------------------------------------
112
113   const TGeoHMatrix *mT2L=AliITSgeomTGeo::GetTracking2LocalMatrix(fModule);
114   AliITSCalibrationSDD* cal = (AliITSCalibrationSDD*)GetResp(fModule);
115   Int_t ncl=0; 
116   TClonesArray &cl=*clusters;
117   for (Int_t s=0; s<2; s++)
118     for (Int_t i=0; i<nMaxBin; i++) {
119       if (bins[s][i].IsUsed()) continue;
120       Int_t idx[32]; UInt_t msk[32]; Int_t npeaks=0;
121       FindPeaks(i, nzBins, bins[s], idx, msk, npeaks);
122
123       if (npeaks>30) continue;
124       if (npeaks==0) continue;
125
126       Int_t k,l;
127       for (k=0; k<npeaks-1; k++){//mark adjacent peaks
128         if (idx[k] < 0) continue; //this peak is already removed
129         for (l=k+1; l<npeaks; l++) {
130            if (idx[l] < 0) continue; //this peak is already removed
131            Int_t ki=idx[k]/nzBins, kj=idx[k] - ki*nzBins;
132            Int_t li=idx[l]/nzBins, lj=idx[l] - li*nzBins;
133            Int_t di=TMath::Abs(ki - li);
134            Int_t dj=TMath::Abs(kj - lj);
135            if (di>1 || dj>1) continue;
136            if (bins[s][idx[k]].GetQ() > bins[s][idx[l]].GetQ()) {
137               msk[l]=msk[k];
138               idx[l]*=-1;
139            } else {
140               msk[k]=msk[l];
141               idx[k]*=-1;
142               break;
143            } 
144         }
145       }
146
147       for (k=0; k<npeaks; k++) {
148         MarkPeak(TMath::Abs(idx[k]), nzBins, bins[s], msk[k]);
149       }
150         
151       for (k=0; k<npeaks; k++) {
152          if (idx[k] < 0) continue; //removed peak
153          AliITSRecPoint c;
154          MakeCluster(idx[k], nzBins, bins[s], msk[k], c);
155          //mi change
156          Int_t milab[10];
157          for (Int_t ilab=0;ilab<10;ilab++){
158            milab[ilab]=-2;
159          }
160          Int_t maxi=0,mini=0,maxj=0,minj=0;
161          //AliBin *bmax=&bins[s][idx[k]];
162          //Float_t max = TMath::Max(TMath::Abs(bmax->GetQ())/5.,3.);
163     
164          for (Int_t di=-2; di<=2;di++){
165            for (Int_t dj=-3;dj<=3;dj++){
166              Int_t index = idx[k]+di+dj*nzBins;
167              if (index<0) continue;
168              if (index>=nMaxBin) continue;
169              AliBin *b=&bins[s][index];
170              Int_t nAnode=index%nzBins-1;
171              Int_t adcSignal=b->GetQ();
172              if(adcSignal>cal->GetThresholdAnode(nAnode)){
173                if (di>maxi) maxi=di;
174                if (di<mini) mini=di;
175                if (dj>maxj) maxj=dj;
176                if (dj<minj) minj=dj;
177              }
178              //
179              if(digits) {
180                if (TMath::Abs(di)<2&&TMath::Abs(dj)<2){
181                  AliITSdigitSDD* d=(AliITSdigitSDD*)digits->UncheckedAt(b->GetIndex());
182                  for (Int_t itrack=0;itrack<10;itrack++){
183                    Int_t track = (d->GetTracks())[itrack];
184                    if (track>=0) {
185                      AddLabel(milab, track); 
186                    }
187                  }
188                }
189              }
190            }
191          }
192
193
194          Float_t y=c.GetY(),z=c.GetZ(), q=c.GetQ();
195          y/=q; z/=q;
196
197
198          const Double_t kMicronTocm = 1.0e-4; 
199          Float_t timeBinCenter = y-0.5;
200          Float_t zAnode=z-0.5;
201          Float_t zdet = (zAnode*GetSeg()->Dpz(0)-GetSeg()->Dz()/2.)*kMicronTocm;
202          Float_t driftTime =  timeBinCenter*GetSeg()->Dpx(0) - cal->GetTimeOffset();
203          Float_t xdet = cal->GetDriftPath(driftTime,zAnode);
204          xdet=(xdet-GetSeg()->Dx())*kMicronTocm;
205          if (s) xdet=-xdet;
206          
207          
208          CorrectPosition(zdet,xdet);
209
210          Double_t loc[3]={xdet,0.,zdet},trk[3]={0.,0.,0.};
211          mT2L->MasterToLocal(loc,trk);
212          y=trk[1];
213          z=trk[2]; 
214
215          q/=cal->GetADC2keV();  //to have MPV 1 MIP = 86.4 KeV
216          Float_t hit[5] = {y, z, 0.0030*0.0030, 0.0020*0.0020, q};
217          Int_t  info[3] = {maxj-minj+1, maxi-mini+1, fNlayer[fModule]};
218          if (digits) {    
219            //      AliBin *b=&bins[s][idx[k]];
220            //      AliITSdigitSDD* d=(AliITSdigitSDD*)digits->UncheckedAt(b->GetIndex());
221            {
222              //Int_t lab[3];
223              //lab[0]=(d->GetTracks())[0];
224              //lab[1]=(d->GetTracks())[1];
225              //lab[2]=(d->GetTracks())[2];
226              //CheckLabels(lab);
227              CheckLabels2(milab); 
228            }
229          }
230          milab[3]=fNdet[fModule];
231
232          AliITSRecPoint cc(milab,hit,info);
233          cc.SetType(npeaks);
234
235          if(clusters) new (cl[ncl]) AliITSRecPoint(cc); 
236          else {
237            fDetTypeRec->AddRecPoint(cc);
238          }
239          ncl++;
240       }
241     }
242   
243 }
244
245
246
247 void AliITSClusterFinderV2SDD::RawdataToClusters(AliRawReader* rawReader,TClonesArray** clusters){
248     //------------------------------------------------------------
249   // This function creates ITS clusters from raw data
250   //------------------------------------------------------------
251   rawReader->Reset();
252   AliITSRawStreamSDD inputSDD(rawReader);
253   FindClustersSDD(&inputSDD,clusters);
254
255 }
256
257 void AliITSClusterFinderV2SDD::FindClustersSDD(AliITSRawStream* input, 
258                                         TClonesArray** clusters) 
259 {
260   //------------------------------------------------------------
261   // Actual SDD cluster finder for raw data
262   //------------------------------------------------------------
263   Int_t nClustersSDD = 0;
264   Int_t nAnodes = GetSeg()->NpzHalf();
265   Int_t nzBins = nAnodes+2;
266   Int_t nTimeBins = GetSeg()->Npx();
267   Int_t nxBins = nTimeBins+2;
268   const Int_t kMaxBin=nzBins*(nxBins+2);
269   AliBin *bins[2];
270   bins[0]=new AliBin[kMaxBin];
271   bins[1]=new AliBin[kMaxBin];
272
273   // read raw data input stream
274   while (kTRUE) {
275     Bool_t next = input->Next();
276     if (!next || input->IsCompletedModule()) {
277       // when all data from a module was read, search for clusters
278       Int_t iModule = input->GetModuleID();
279       clusters[iModule] = new TClonesArray("AliITSRecPoint");
280       fModule = iModule;
281       FindClustersSDD(bins, kMaxBin, nzBins, NULL, clusters[iModule]);
282       Int_t nClusters = clusters[iModule]->GetEntriesFast();
283       nClustersSDD += nClusters;
284       for(Int_t iBin=0;iBin<kMaxBin; iBin++){
285         bins[0][iBin].Reset();
286         bins[1][iBin].Reset();
287       }
288       if (!next) break;
289     }else{
290     // fill the current digit into the bins array
291       AliITSCalibrationSDD* cal = (AliITSCalibrationSDD*)GetResp(input->GetModuleID());    
292       AliITSresponseSDD* res  = (AliITSresponseSDD*)cal->GetResponse();
293       const char *option=res->ZeroSuppOption();
294       Int_t q=input->GetSignal();
295       if(!((strstr(option,"1D")) || (strstr(option,"2D")))){
296         Float_t baseline = cal->GetBaseline(input->GetCoord1());
297         if(q>baseline) q-=(Int_t)baseline;
298         else q=0;
299       }
300       if(q>=cal->GetThresholdAnode(input->GetCoord1())) {
301         Int_t iz = input->GetCoord1()+1;
302         Int_t side = ((AliITSRawStreamSDD*)input)->GetChannel();
303         Int_t index = (input->GetCoord2()+1) * nzBins + iz;
304         bins[side][index].SetQ(q);
305         bins[side][index].SetMask(1);
306         bins[side][index].SetIndex(index);
307       }
308     }
309   }
310   delete [] bins[0];
311   delete [] bins[1];
312
313   Info("FindClustersSDD", "found clusters in ITS SDD: %d", nClustersSDD);
314 }
315
316
317 //_________________________________________________________________________
318 void AliITSClusterFinderV2SDD::CorrectPosition(Float_t &z, Float_t&y){
319
320   //correction of coordinates using the maps stored in the DB
321
322   AliITSCalibrationSDD* cal = (AliITSCalibrationSDD*)GetResp(fModule);
323   static const Int_t knbint = cal->GetMapTimeNBin();
324   static const Int_t knbina = cal->Chips()*cal->Channels();
325   const Double_t kMicronTocm = 1.0e-4; 
326   Float_t stepa = (GetSeg()->Dpz(0))*kMicronTocm; //anode pitch in cm
327   Float_t stept = (GetSeg()->Dx()/cal->GetMapTimeNBin()/2.)/10.;
328   
329   Int_t bint = TMath::Abs((Int_t)(y/stept));
330   if(y>=0) bint+=(Int_t)(knbint/2.);
331   if(bint>knbint) AliError("Wrong bin number!");
332
333   Int_t bina = TMath::Abs((Int_t)(z/stepa));
334   if(z>=0) bina+=(Int_t)(knbina/2.);
335   if(bina>knbina) AliError("Wrong bin number!");
336
337   Float_t devz = cal->GetMapACell(bina,bint)*kMicronTocm;
338   Float_t devx = cal->GetMapTCell(bina,bint)*kMicronTocm;
339   z+=devz;
340   y+=devx;
341
342
343 }