]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blob - ITS/AliITSHandleDaSSD.h
Add method to apply offline zero suppression to SDD raw data
[u/mrichter/AliRoot.git] / ITS / AliITSHandleDaSSD.h
1 #ifndef ALIITSHANDLEDASSD_H
2 #define ALIITSHANDLEDASSD_H
3
4 /* Copyright(c) 2007-2009, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
5  * See cxx source for full Copyright notice                               */
6 /*                                                                        */
7 /* $Id$ */
8
9 #include <string>
10 #include "TObject.h"
11 #include "TArrayS.h"
12 #include "AliITSModuleDaSSD.h"
13 #include "AliITSBadChannelsSSDv2.h"
14 #include "AliITSNoiseSSDv2.h"
15
16 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
17 ///
18 /// This class provides ITS SSD data handling
19 /// used by DA. 
20 //  Author: Oleksandr Borysov
21 //  Date: 09/02/2010
22 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
23
24 using namespace std;
25
26 class AliITSHandleDaSSD : public TObject {
27   public :
28     AliITSHandleDaSSD();
29     explicit AliITSHandleDaSSD(Char_t *rdfname);
30     AliITSHandleDaSSD(const AliITSHandleDaSSD& ssdadldc);
31     AliITSHandleDaSSD& operator = (const AliITSHandleDaSSD& ssdadldc);
32     virtual ~AliITSHandleDaSSD();
33
34     virtual Bool_t Init(Char_t *rdfname);
35     Bool_t  SetRawFileName (Char_t *rdfname) {return Init(rdfname); }
36
37     void    SetZsDefaul(const Int_t zs)        { fZsDefault = zs;       }
38     void    SetOffsetDefault(const Int_t offs) { fOffsetDefault = offs; }
39     void    SetZsMinimum(const Int_t zsm)      { if (zsm >= 0) if (static_cast<UInt_t>(zsm) <= fgkZsBitMask) fZsMinimum = zsm; }
40     void    SetMergeBCFlag(const Byte_t mbcf)  { fMergeBCLists = mbcf;  }
41     void    SetZsFactor(const Float_t zsf)     { fZsFactor = zsf;       }
42     void    SetPedestalThresholdFactor(const Float_t pthf) { fPedestalThresholdFactor = pthf; }
43     void    SetCmThresholdFactor(const Float_t cmthf)      { fCmThresholdFactor = cmthf;      }
44     void    SetALaddersOff(const Int_t n, const Short_t *allist) { fALaddersOff.Set(n, allist); }
45     void    SetCLaddersOff(const Int_t n, const Short_t *cllist) { fCLaddersOff.Set(n, cllist); }
46     void    SetLaddersOff(const Int_t na, const Short_t *allist, const Int_t nc, const Short_t *cllist) 
47                           { SetALaddersOff(na, allist); SetCLaddersOff(nc, cllist); }
48
49     Int_t   GetNumberOfEvents() const  { return fNumberOfEvents; }
50     Int_t   GetZsDefault() const       { return fZsDefault;     }
51     Int_t   GetOffsetDefault() const   { return fOffsetDefault; }
52     Float_t GetZsFactor() const        { return fZsFactor;      }
53     Int_t   GetZsMinimum() const       { return fZsMinimum;     }
54     Bool_t  GetMergeBCFlag() const     { return static_cast<Bool_t>(fMergeBCLists); }
55     Float_t GetPedestalThresholdFactor() const { return fPedestalThresholdFactor; }
56     Float_t GetCmThresholdFactor() const       { return fCmThresholdFactor;       }
57     TArrayS GetALaddersOff () const { return fALaddersOff; }
58     TArrayS GetCLaddersOff () const { return fCLaddersOff; }
59     Int_t   GetEqIndex(const Short_t eq) const { for(Int_t i = 0; i < fEqIndex.GetSize(); i++) if (eq == fEqIndex.At(i)) return i; return -1; }
60         
61     Int_t              GetNumberOfModules() const { return fNumberOfModules; }
62     UInt_t             GetLdcId() const { return fLdcId; }
63     UInt_t             GetRunId() const { return fRunId; }
64     AliITSModuleDaSSD* GetModule (const UChar_t ddlID, const UChar_t ad, const UChar_t adc) const;
65     AliITSModuleDaSSD* GetModule (const Int_t index) const 
66                                {if ((fModules) && (index < fNumberOfModules)) return fModules[index]; else return NULL;}
67     Int_t GetModuleIndex (const UChar_t ddlID, const UChar_t ad, const UChar_t adc) const;
68     AliITSChannelDaSSD*    GetStrip (const UChar_t ddlID, const UChar_t ad, const UChar_t adc, const UShort_t stripID) const;
69     AliITSNoiseSSDv2*        GetCalibrationOCDBNoise()  const;
70     AliITSBadChannelsSSDv2*  GetCalibrationBadChannels() const;
71     Bool_t      SaveCalibrationSSDLDC(Char_t*& dafname);
72     Int_t       MergeBadChannels(AliITSBadChannelsSSDv2*& bcl) const;    
73     
74     void    SetModIndProcessed(Int_t mi) {fModIndProcessed = mi;}
75     void    SetModIndRead (Int_t mr)  {fModIndRead = mr;}
76     Bool_t  SetNumberOfModules (const Int_t numberofmodules);
77     Bool_t  SetModule(AliITSModuleDaSSD *const module, const Int_t index); 
78     virtual Bool_t  ReadStaticBadChannelsMap(const Char_t *filename = NULL);  
79     virtual Bool_t  ReadDDLModuleMap(const Char_t *filename = NULL);  
80     Int_t   ReadCalibrationDataFile (char* fileName, const Long_t eventsnumber);
81     virtual Int_t   ReadModuleRawData (const Int_t modulesnumber);  
82
83     virtual Bool_t  CalculatePedestal(AliITSModuleDaSSD *const module);
84     virtual Bool_t  CalculateNoise(AliITSModuleDaSSD *const module);
85     virtual Bool_t  CalculateNoiseCM(AliITSModuleDaSSD *const module);
86     virtual Bool_t  CalculateCM(AliITSModuleDaSSD *const module);
87     virtual Bool_t  CalculatePedNoiseW(AliITSModuleDaSSD *const module);
88     virtual Bool_t  CalculateCMW(AliITSModuleDaSSD *const module);
89     virtual Bool_t  CalculateNoiseCMW(AliITSModuleDaSSD *const module);
90     virtual Bool_t  AddFeromCm(AliITSModuleDaSSD *const module);
91     virtual Bool_t  ProcessRawData(const Int_t nmread = fgkNumberOfSSDModulesPerDdl,  const Bool_t usewelford = kTRUE);
92     virtual Bool_t  RelocateModules();
93     virtual Bool_t  AllocateSimulatedModules(const Int_t copymodind = 0);
94
95     Bool_t  AdDataPresent(const Int_t ddl, const Int_t ad) const;
96     Int_t   DdlToEquipmentId (Int_t ddl) const { return (512 + ddl); }
97     Int_t   ChannelIsBad(const UChar_t ddl, const UChar_t ad, const UChar_t adc, const Int_t strn) const;
98     UChar_t EvaluateIfChannelIsBad(const AliITSModuleDaSSD *const module, const Int_t stripn) const;
99     Int_t   LadderIsOff(const UChar_t ddl, const UChar_t ad, const UChar_t adc) const;
100     Bool_t  SaveEqSlotCalibrationData(const Int_t ddl, const Int_t ad, const Char_t *fname) const;
101     ULong_t OffsetValue(const AliITSChannelDaSSD *strip, const UChar_t ddl = 0, const UChar_t ad = 0, 
102                                  const UChar_t adc = 0, const Int_t strn = -1) const;
103     ULong_t OffsetValue(const UChar_t ddl, const UChar_t ad, const UChar_t adc, const Int_t strn) const;
104     ULong_t ZsThreshold(AliITSChannelDaSSD *strip) const;
105     ULong_t ZsThreshold(const UChar_t ddl, const UChar_t ad, const UChar_t adc, const Int_t strn) const;
106     
107     virtual void    Reset();
108     virtual Short_t RetrieveModuleId(const UChar_t ddlID, const UChar_t ad, const UChar_t adc) const;
109     Bool_t  DumpModInfo(const Float_t meannosethreshold) const;
110     Bool_t  PrintModCalibrationData(const UChar_t ddlID, const UChar_t ad, const UChar_t adc, const Char_t *fname = NULL) const;
111     Int_t   CheckOffChips() const;
112     void    DumpInitData(const Char_t *str = "") const;
113     void    DeleteSignalAll() { if (fModules) for (Int_t i = 0; i < fNumberOfModules; i++) if (fModules[i]) fModules[i]->DeleteSignal();}
114     void    DeleteSignal() { if (fModules) for (Int_t i = fModIndProcessed; i < fModIndRead; i++) if (fModules[i]) fModules[i]->DeleteSignal();}
115     void    DeleteCMAll() { if (fModules) for (Int_t i = 0; i < fNumberOfModules; i++) if (fModules[i]) fModules[i]->DeleteCM();}
116     void    DeleteCM() { if (fModules) for (Int_t i = fModIndProcessed; i < fModIndRead; i++) if (fModules[i]) fModules[i]->DeleteCM();}
117     void    DeleteCMFerom() { if (fModules) for (Int_t i = fModIndProcessed; i < fModIndRead; i++) if (fModules[i]) fModules[i]->DeleteCMFerom ();}
118
119     static Int_t GetNumberOfSSDModulesConst() { return fgkNumberOfSSDModules; }
120
121   protected :
122
123     static const Int_t    fgkNumberOfSSDModules ;        // Number of SSD modules in ITS
124     static const Int_t    fgkNumberOfSSDModulesPerDdl;   // Number of SSD modules in DDL
125     static const Int_t    fgkNumberOfSSDModulesPerSlot;  // Number of SSD modules in Slot
126     static const Short_t  fgkMinSSDModuleId;             // Initial SSD modules number
127     static const Int_t    fgkNumberOfSSDDDLs;            // Number of DDLs in SSD
128     static const Int_t    fgkNumberOfSSDSlotsPerDDL;     // Number of SSD slots per DDL
129     static const Float_t  fgkPedestalThresholdFactor;    // Defalt value for fPedestalThresholdFactor 
130     static const Float_t  fgkCmThresholdFactor;          // Defalt value for fCmThresholdFactor 
131    
132     static const UInt_t   fgkZsBitMask ;           // Bit mask for FEROM ZS
133     static const UInt_t   fgkOffSetBitMask;        // Bit mask for FEROM Offset correction
134     static const UInt_t   fgkBadChannelMask;       // Mask to suppress the channel from the bad channel list
135     static const Int_t    fgkAdcPerDBlock;         // FEROM configuration file constant
136      
137     Char_t               *fRawDataFileName;       // Name of the file with raw data
138     Int_t                 fNumberOfModules;       // number of AliITSModuleDaSSD to allocate
139     AliITSModuleDaSSD   **fModules;               //[fNumberOfModules] array of pointer on AliITSModuleDaSSD objects (1698 SSD  Modules)
140     Int_t                 fModIndProcessed;       //! index of the last module in fModules array with processed data
141     Int_t                 fModIndRead;            //! index of the last module in fModules array with adc data present (read)
142     Int_t                *fModIndex;              //! index array for fModules
143     TArrayS               fEqIndex;               //! index array of equipmnts (DDLs).
144     Long_t                fNumberOfEvents;        // Number of physics or calibration events in raw data file fRawDataFileName
145
146     AliITSBadChannelsSSDv2 *fBadChannelsList;       //! List of bad channels: static or created on base of calculated noise and pedestal
147     Int_t                *fDDLModuleMap;          //! DDL map  
148     TArrayS               fALaddersOff;           //! Lisst of ladders of side A that are off and should be suppressed
149     TArrayS               fCLaddersOff;           //! Lisst of ladders of side C that are off and should be suppressed
150     
151     UInt_t                fLdcId;                 //  LDC number, read from header
152     UInt_t                fRunId;                 //  Run number, read from header
153
154     Float_t         fPedestalThresholdFactor;        // configuration parameter: ThresholdFactor for pedestal calculation 
155     Float_t         fCmThresholdFactor;              // configuration parameter: ThresholdFactor for CM calculation 
156     Int_t           fZsDefault;                      // default value for ZS threshold
157     Int_t           fOffsetDefault;                  // default value for offset correction
158     Int_t           fZsMinimum;                      // minimum value for ZS threshold
159     Byte_t          fMergeBCLists;                   // Flag, if it is not zero the static bad channels list is merged with dynamic one
160     Float_t         fZsFactor;                       // zs factor 3.0
161     
162   protected :
163     Bool_t   SignalOutOfRange (const Short_t signal) const { return ((signal >= AliITSChannelDaSSD::GetOverflowConst()) || 
164                                                                      (signal <= AliITSChannelDaSSD::GetUnderflowConst())); }
165     string   ConvBase(const unsigned long value, const long base) const;
166
167     ClassDef(AliITSHandleDaSSD, 8)
168
169 };
170
171 #endif
172