ITS/AliITSPreprocessorSDD.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 2007-2009, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18 ///////////////////////////////////////////////////////////////////
  19 //                                                               //
  20 // Implementation of the class for SDD preprocessing             //
  21 // Origin: E.Crescio, Torino, crescio@to.infn.it                 //
  22 //         F.Prino, Torino, prino@to.infn.it                     //
  23 //                                                               //
  24 ///////////////////////////////////////////////////////////////////
  25
  26 #include "AliITSPreprocessorSDD.h"
  27 #include "AliITSCalibrationSDD.h"
  28 #include "AliITSDriftSpeedArraySDD.h"
  29 #include "AliITSDCSAnalyzerSDD.h"
  30 #include "AliShuttleInterface.h"
  31 #include "AliCDBEntry.h"
  32 #include "AliCDBMetaData.h"
  33 #include "TObjArray.h"
  34 #include "AliLog.h"
  35 #include <TObjString.h>
  36 #include <TSystem.h>
  37 #include <TList.h>
  38 #include <TF1.h>
  39 #include <TH1D.h>
  40
  41 const TString AliITSPreprocessorSDD::fgkNameHistoPedestals = "hpedestal";
  42 const TString AliITSPreprocessorSDD::fgkNameHistoNoise = "hnoise";
  43 ClassImp(AliITSPreprocessorSDD)
  44
  45 //______________________________________________________________________
  46 AliITSPreprocessorSDD::AliITSPreprocessorSDD( AliShuttleInterface* shuttle):
  47     AliPreprocessor("SDD", shuttle)
  48 {
  49   // constructor
  50   AddRunType("PULSER");
  51   AddRunType("INJECTOR");
  52   AddRunType("PHYSICS");
  53 }
  54
  55 //______________________________________________________________________
  56 UInt_t AliITSPreprocessorSDD::Process(TMap* dcsAliasMap){
  57
  58
  59   // Get DDL map from OCDB
  60   AliCDBEntry* entry = GetFromOCDB("Calib", "DDLMapSDD");
  61   if(!entry){
  62     Log("DDL map file not found in OCDB.");
  63     return 2;
  64   }
  65   AliITSDDLModuleMapSDD* ddlmap = (AliITSDDLModuleMapSDD*)entry->GetObject();
  66   if(!ddlmap){
  67     Log("AliITSDDLModuleMapSDD object not in file.");
  68     return 2;
  69   }
  70   ddlmap->PrintDDLMap();
  71
  72   //preprocessing
  73   TString runType = GetRunType();
  74   Int_t retcode=0;
  75
  76   if (runType == "PULSER"){
  77     Log("Process FXS files from PULSER RUN");
  78     retcode=ProcessPulser(ddlmap);
  79   }else if(runType== "INJECTOR"){
  80     Log("Process FXS files from INJECTOR RUN");
  81     retcode=ProcessInjector(ddlmap);
  82   }
  83   if(retcode!=0) return retcode;
  84
  85   Log("Process DCS data");
  86   Bool_t retcodedcs =ProcessDCSDataPoints(dcsAliasMap);
  87   if(retcodedcs) return 0;
  88   else return 1;
  89
  90 }
  91 //______________________________________________________________________
  92 UInt_t AliITSPreprocessorSDD::ProcessPulser(AliITSDDLModuleMapSDD* ddlmap){
  93   // Process FXS files from PULSER run (baseline, noise, gain)
  94   // returns 0 in case of success,
  95   //         1 in case of storage error,
  96   //         2 in case of error with input files
  97   TObjArray calSDD(kNumberOfSDD);
  98   calSDD.SetOwner(kFALSE);
  99
 100   Float_t baseline,rawnoise,cmn,corn,gain;
 101   Int_t isgoodan,i,im,is,isgoodmod,basmin,basoff;
 102   Int_t th,tl;
 103   Int_t numOfBadChannels[kNumberOfSDD];
 104
 105   TList* sourceList = GetFileSources(kDAQ, "SDD_Calib");
 106   if (!sourceList){
 107     Log("Error: no sources found for SDD_Calib");
 108     return 2;
 109   }
 110
 111   Int_t ind = 0;
 112   while (sourceList->At(ind)!=NULL) {
 113     TObjString* tarId = (TObjString*) sourceList->At(ind);
 114     TString tarName = GetFile(kDAQ, "SDD_Calib", tarId->GetString().Data());
 115     if(tarName.Length()==0){
 116       Log(Form("Baseline tar file from source %d not found.",ind));
 117       return 2;
 118     }
 119     TString command;
 120     command.Form("tar -xf %s",tarName.Data());
 121     gSystem->Exec(command);
 122     ind++;
 123   }
 124   delete sourceList;
 125   // Read ADC sampling frequency from fee.conf
 126   Int_t amSamplFreq=40;
 127   Int_t retfscf;
 128   FILE* feefil=fopen("fee.conf","r");
 129   if(feefil){
 130     retfscf=fscanf(feefil,"%d \n",&amSamplFreq);
 131     fclose(feefil);
 132     Log(Form("AM sampling frequency = %d MHz",amSamplFreq));
 133   }else{
 134     Log("File fee.conf not found. AM sampling set at 40 MHz by default");
 135   }
 136
 137   for(Int_t iddl=0;iddl<kNumberOfDDL;iddl++){
 138     for(Int_t imod=0;imod<kModulesPerDDL;imod++){
 139       Int_t modID=ddlmap->GetModuleNumber(iddl,imod);
 140       if(modID==-1) continue;
 141       modID-=240; // to have SDD modules numbering from 0 to 260
 142       AliITSCalibrationSDD *cal = new AliITSCalibrationSDD("simulated");
 143       if(amSamplFreq!=40) cal->SetAMAt20MHz();
 144       numOfBadChannels[modID]=0;
 145       Int_t badch[kNumberOfChannels];
 146       Bool_t sid0ok=kTRUE;
 147       Bool_t sid1ok=kTRUE;
 148       for(Int_t isid=0;isid<=1;isid++){
 149         TString inpFileName;
 150         inpFileName.Form("./SDDbase_ddl%02dc%02d_sid%d.data",iddl,imod,isid);
 151
 152         FILE* basFil = fopen(inpFileName,"read");
 153         if (basFil == 0) {
 154           Log(Form("File %s not found.",inpFileName.Data()));
 155           if(isid==0){
 156             sid0ok=kFALSE;
 157             for(Int_t iChip=0; iChip<4; iChip++) cal->SetChipBad(iChip);
 158             cal->SetDeadChannels(cal->GetDeadChannels()+256);
 159             for(Int_t iAnode=0; iAnode<256; iAnode++) cal->SetBadChannel(iAnode,iAnode);
 160           }else{
 161             sid1ok=kFALSE;
 162             for(Int_t iChip=4; iChip<8; iChip++) cal->SetChipBad(iChip);
 163             cal->SetDeadChannels(cal->GetDeadChannels()+256);
 164             for(Int_t iAnode=0; iAnode<256; iAnode++) cal->SetBadChannel(iAnode,iAnode+256);
 165           }
 166           continue;
 167         }
 168
 169         retfscf=fscanf(basFil,"%d %d %d\n",&im,&is,&isgoodmod);
 170         if(!isgoodmod){
 171           if(isid==0){
 172             sid0ok=kFALSE;
 173             for(Int_t iChip=0; iChip<4; iChip++) cal->SetChipBad(iChip);
 174           }else{
 175             sid1ok=kFALSE;
 176             for(Int_t iChip=4; iChip<8; iChip++) cal->SetChipBad(iChip);
 177           }
 178         }
 179         retfscf=fscanf(basFil,"%d\n",&th);
 180         retfscf=fscanf(basFil,"%d\n",&tl);
 181         cal->SetZSLowThreshold(isid,tl);
 182         cal->SetZSHighThreshold(isid,th);
 183         for(Int_t ian=0;ian<(kNumberOfChannels/2);ian++){
 184           retfscf=fscanf(basFil,"%d %d %f %d %d %f %f %f %f\n",&i,&isgoodan,&baseline,&basmin,&basoff,&rawnoise,&cmn,&corn,&gain);
 185           Int_t ich=ian;
 186           if(isid==1) ich+=256;
 187           if(!isgoodan){
 188             Int_t ibad=numOfBadChannels[modID];
 189             badch[ibad]=ich;
 190             numOfBadChannels[modID]++;
 191           }
 192           cal->SetBaseline(ich,baseline-basoff);
 193           cal->SetNoiseAfterElectronics(ich,rawnoise);
 194           cal->SetGain(ich,gain);
 195         }
 196         cal->SetDeadChannels(numOfBadChannels[modID]);
 197         for(Int_t ibad=0;ibad<numOfBadChannels[modID];ibad++){
 198           cal->SetBadChannel(ibad,badch[ibad]);
 199         }
 200         fclose(basFil);
 201       }
 202       if(!sid0ok && !sid1ok) cal->SetBad();
 203       Log(Form("Put calib obj for module %d (DDL %d  Carlos %d)",modID,iddl,imod));
 204       calSDD.AddAt(cal,modID);
 205     }
 206   }
 207   AliCDBMetaData *md= new AliCDBMetaData();
 208   md->SetResponsible("Francesco Prino");
 209   md->SetBeamPeriod(0);
 210   md->SetComment("AliITSCalibrationSDD from PEDESTAL+PULSER runs");
 211   Bool_t retCode = Store("Calib","CalibSDD",&calSDD,md, 0, kTRUE);
 212   if(retCode) return 0;
 213   else return 1;
 214 }
 215 //______________________________________________________________________
 216 UInt_t AliITSPreprocessorSDD::ProcessInjector(AliITSDDLModuleMapSDD* ddlmap){
 217   // Process FXS files from injector events (INJECTOR or PHYSICS runs)
 218   // returns 0 in case of success,
 219   //         1 in case of storage error,
 220   //         2 in case of error with input files
 221   TObjArray vdrift(2*kNumberOfSDD);
 222   vdrift.SetOwner(kFALSE);
 223   Int_t evNumb,polDeg;
 224   UInt_t timeStamp,statusInj;
 225   Bool_t modSet[2*kNumberOfSDD]; // flag modules with good inj.
 226   for(Int_t ihyb=0; ihyb<2*kNumberOfSDD; ihyb++) modSet[ihyb]=0;
 227   Double_t nPtLay3 = 0;
 228   Double_t nPtLay4 = 0;
 229
 230   Double_t param[4];    // parameters of poly fit
 231   Double_t minValP0=5.; // min value for param[0]
 232   Double_t maxValP0=8.; // max value for param[0]
 233   Double_t minValP1=0.; // min value for param[1]
 234   Double_t aveCoefLay3[4]={0.,0.,0.,0.};  // average param for good mod.
 235   Double_t aveCoefLay4[4]={0.,0.,0.,0.};  // average param for good mod.
 236   Double_t defCoef[4]={6.53227,0.00128941,-5.14493e-06,0};  // default values for param
 237   Float_t auxP;
 238
 239   TList* sourceList = GetFileSources(kDAQ, "SDD_Injec");
 240   if (!sourceList){
 241     Log("Error: no sources found for SDD_Injec");
 242     return 2;
 243   }
 244   Int_t ind = 0;
 245   while (sourceList->At(ind)!=NULL) {
 246     TObjString* tarId = (TObjString*) sourceList->At(ind);
 247     TString tarName = GetFile(kDAQ, "SDD_Injec", tarId->GetString().Data());
 248     if(tarName.Length()==0){
 249       Log(Form("Injector tar file from source %d not found.",ind));
 250       return 2;
 251     }
 252     TString command;
 253     command.Form("tar -xf %s",tarName.Data());
 254     gSystem->Exec(command);
 255     ind++;
 256   }
 257   delete sourceList;
 258   Int_t retfscf;
 259
 260
 261   for(Int_t iddl=0;iddl<kNumberOfDDL;iddl++){
 262     for(Int_t imod=0;imod<kModulesPerDDL;imod++){
 263       Int_t modID=ddlmap->GetModuleNumber(iddl,imod);
 264       if(modID==-1) continue;
 265       modID-=240; // to have SDD modules numbering from 0 to 260
 266       for(Int_t isid=0;isid<=1;isid++){
 267         AliITSDriftSpeedArraySDD *arr=new AliITSDriftSpeedArraySDD();
 268         TString inpFileName;
 269         inpFileName.Form("./SDDinj_ddl%02dc%02d_sid%d.data",iddl,imod,isid);
 270         FILE* injFil = fopen(inpFileName,"read");
 271         if (injFil == 0) {
 272           Log(Form("File %s not found.",inpFileName.Data()));
 273           continue;
 274         }
 275         retfscf=fscanf(injFil,"%d",&polDeg);
 276         while (!feof(injFil)){
 277           retfscf=fscanf(injFil,"%d %u ",&evNumb,&timeStamp);
 278           if(evNumb==-99){
 279             statusInj=timeStamp;
 280             arr->SetInjectorStatus(statusInj);
 281           }else{
 282             if(feof(injFil)) break;
 283             for(Int_t ic=0;ic<4;ic++){
 284               retfscf=fscanf(injFil,"%f ",&auxP);
 285               param[ic]=auxP;
 286             }
 287
 288             if(polDeg>=0 && polDeg<=AliITSDriftSpeedSDD::GetMaxPolDeg() &&
 289                param[0]>minValP0 && param[0]<maxValP0 && param[1]>minValP1){
 290               if(polDeg==3){
 291                 if(modID<kNumberOfSDDLay3){
 292                   for(Int_t ic=0;ic<4;ic++) aveCoefLay3[ic]+=param[ic];
 293                   nPtLay3++;
 294                 }else{
 295                   for(Int_t ic=0;ic<4;ic++) aveCoefLay4[ic]+=param[ic];
 296                   nPtLay4++;
 297                 }
 298               }
 299               AliITSDriftSpeedSDD *dsp=new AliITSDriftSpeedSDD(evNumb,timeStamp,polDeg,param);
 300               arr->AddDriftSpeed(dsp);
 301               modSet[2*modID+isid]=1;
 302             }else{
 303               Log(Form("Module %d side %d not accepted, degree=%d, params=%g %g %g %g",modID+240,isid,polDeg,param[0],param[1],param[2],param[3]));
 304             }
 305           }
 306         }
 307         fclose(injFil);
 308         Log(Form("Put calib obj for hybrid %d (DDL %d  Carlos %d)",2*modID+isid,iddl,imod));
 309         if(modSet[2*modID+isid]) vdrift.AddAt(arr,2*modID+isid);
 310       }
 311     }
 312   }
 313
 314   // set drift speed for modules with bad injectors
 315   for(Int_t ic=0;ic<4;ic++){
 316     if(nPtLay3>0) aveCoefLay3[ic]/=nPtLay3; // mean parameters
 317     else aveCoefLay3[ic]=defCoef[ic]; // default parameters
 318     if(nPtLay4>0) aveCoefLay4[ic]/=nPtLay4; // mean parameters
 319     else aveCoefLay4[ic]=defCoef[ic]; // default parameters
 320   }
 321   AliITSDriftSpeedSDD *avdsp3=new AliITSDriftSpeedSDD(evNumb,timeStamp,3,aveCoefLay3);
 322   AliITSDriftSpeedSDD *avdsp4=new AliITSDriftSpeedSDD(evNumb,timeStamp,3,aveCoefLay4);
 323
 324   // Check status of golden modules
 325   Int_t idGoldenMod=-1, idGoldenSide=-1;
 326   Int_t idGoldenModList[5]={319,319,321,243,243};
 327   Int_t idGoldenSideList[5]={0,1,0,0,1};
 328   AliITSDriftSpeedSDD* refSpeed=0x0;
 329   for(Int_t iGold=0; iGold<5; iGold++){
 330     Int_t indexG=2*(idGoldenModList[iGold]-240)+idGoldenSideList[iGold];
 331     if(modSet[indexG]){
 332       idGoldenMod=idGoldenModList[iGold];
 333       idGoldenSide=idGoldenSideList[iGold];
 334       AliITSDriftSpeedArraySDD* arrRef=(AliITSDriftSpeedArraySDD*)vdrift.At(indexG);
 335       refSpeed=arrRef->GetDriftSpeedObject(0);
 336       break;
 337     }
 338   }
 339   TList* correctionList=0x0;
 340   if(idGoldenMod>=240 && idGoldenSide>=0){
 341     // Get rescaling corrections from OCDB
 342     AliCDBEntry* entry = GetFromOCDB("Calib", "RescaleDriftSpeedSDD");
 343     if(!entry){
 344       Log("RescaleDriftSpeedSDD file not found in OCDB.");
 345     }
 346     TList* fullList=(TList*)entry->GetObject();
 347     if(!fullList){
 348       Log("TList object not found in file.");
 349     }
 350     TString listName=Form("RefMod%d_Side%d",idGoldenMod,idGoldenSide);
 351     correctionList=(TList*)fullList->FindObject(listName.Data());
 352     if(!correctionList){
 353       Log(Form("TList for requested module %d side %d not found",idGoldenMod,idGoldenSide));
 354     }else{
 355       Log(Form("Use module %d side %d as reference module",idGoldenMod,idGoldenSide));
 356       if(refSpeed){
 357         Log(Form("Drift speed params for golden module = %g %g %g %g",refSpeed->GetDriftSpeedParameter(0),refSpeed->GetDriftSpeedParameter(1),refSpeed->GetDriftSpeedParameter(2),refSpeed->GetDriftSpeedParameter(3)));
 358       }else{
 359         AliError("No drift speed object for golden module");
 360       }
 361     }
 362   }
 363
 364   for(Int_t ihyb=0; ihyb<2*kNumberOfSDDLay3; ihyb++){
 365     AliITSDriftSpeedArraySDD *arr=new AliITSDriftSpeedArraySDD();
 366     if(modSet[ihyb]==0){
 367       Int_t iBadMod=ihyb/2+240;
 368       Int_t iBadSide=ihyb%2;
 369       Bool_t goldenUsed=kFALSE;
 370       if(correctionList && refSpeed){
 371         Double_t *params=RescaleDriftSpeedModule(correctionList,iBadMod,iBadSide,refSpeed);
 372         if(params){
 373           AliWarning(Form("No good injector events for mod. %d side %d --> use rescaled values from golden module",iBadMod,iBadSide));
 374           AliITSDriftSpeedSDD* dspres=new AliITSDriftSpeedSDD(0,refSpeed->GetEventTimestamp(),3,params);
 375           arr->AddDriftSpeed(dspres);
 376           arr->SetInjectorStatus(1);
 377           goldenUsed=kTRUE;
 378         }
 379       }
 380       if(!goldenUsed){
 381         AliWarning(Form("No good injector events for mod. %d side %d --> use average values for layer 3",iBadMod,iBadSide));
 382         arr->AddDriftSpeed(avdsp3);
 383         arr->SetInjectorStatus(0);
 384       }
 385       vdrift.AddAt(arr,ihyb);
 386     }
 387   }
 388
 389   for(Int_t ihyb=2*kNumberOfSDDLay3; ihyb<2*kNumberOfSDD; ihyb++){
 390     if(modSet[ihyb]==0){
 391       AliWarning(Form("No good injector events for mod. %d side %d --> use average values for layer 4",ihyb/2,ihyb%2));
 392       AliITSDriftSpeedArraySDD *arr=new AliITSDriftSpeedArraySDD();
 393       arr->AddDriftSpeed(avdsp4);
 394       arr->SetInjectorStatus(0);
 395       vdrift.AddAt(arr,ihyb);
 396     }
 397   }
 398
 399   AliCDBMetaData *md= new AliCDBMetaData();
 400   md->SetResponsible("Francesco Prino");
 401   md->SetBeamPeriod(0);
 402   md->SetComment("AliITSDriftSpeedSDD from injector events");
 403   Bool_t retCode = Store("Calib","DriftSpeedSDD",&vdrift,md,0, kTRUE);
 404   if(retCode) return 0;
 405   else return 1;
 406 }
 407
 408 //______________________________________________________________________
 409 Double_t* AliITSPreprocessorSDD::RescaleDriftSpeedModule(TList* theList,
 410                                                          Int_t iBadMod,
 411                                                          Int_t iBadSide,
 412                                                          AliITSDriftSpeedSDD* refSpeed)
 413   const
 414 {
 415   // Rescale driftSpeed for a drift region starting from values of golden module
 416
 417   if(!refSpeed) return 0x0;
 418   TString hisName=Form("hRatioMod%d_Side%d",iBadMod,iBadSide);
 419   TH1D* h=(TH1D*)theList->FindObject(hisName.Data());
 420   if(!h) return 0x0;
 421
 422   TF1* fpoly=new TF1("fpoly","pol3",0.,255.);
 423   for(Int_t iAnode=0; iAnode<256; iAnode++){
 424     Double_t vref=refSpeed->GetDriftSpeedAtAnode((Double_t)iAnode);
 425     Double_t vcorr=h->GetBinContent(iAnode+1)*vref;
 426     h->SetBinContent(iAnode+1,vcorr);
 427   }
 428   h->Fit(fpoly,"RNQ");
 429   Double_t *params=new Double_t[4];
 430   for(Int_t iPar=0; iPar<4; iPar++) params[iPar]=fpoly->GetParameter(iPar);
 431   delete fpoly;
 432   return params;
 433 }
 434
 435 //______________________________________________________________________
 436 Bool_t AliITSPreprocessorSDD::ProcessDCSDataPoints(TMap* dcsAliasMap){
 437   // Process DCS data
 438   AliITSDCSAnalyzerSDD *dcs=new AliITSDCSAnalyzerSDD();
 439   dcs->AnalyzeData(dcsAliasMap);
 440   TObjArray refDCS(kNumberOfSDD);
 441   refDCS.SetOwner(kFALSE);
 442   for(Int_t imod=0;imod<kNumberOfSDD;imod++){
 443     AliITSDCSDataSDD *dcsdata=dcs->GetDCSData(imod);
 444     refDCS.Add(dcsdata);
 445   }
 446   AliCDBMetaData *md= new AliCDBMetaData();
 447   md->SetResponsible("Francesco Prino");
 448   md->SetBeamPeriod(0);
 449   md->SetComment("AliITSDCSDataSDD objects from DCS DB");
 450   Bool_t retCode = StoreReferenceData("DCS","DataSDD",&refDCS,md);
 451   return retCode;
 452 }
 453