ITS/AliITSPreprocessorSDD.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 2007-2009, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18 ///////////////////////////////////////////////////////////////////
  19 //                                                               //
  20 // Implementation of the class for SDD preprocessing             //
  21 // Origin: E.Crescio, Torino, crescio@to.infn.it                 //
  22 //         F.Prino, Torino, prino@to.infn.it                     //
  23 //                                                               //
  24 ///////////////////////////////////////////////////////////////////
  25
  26 #include "AliITSPreprocessorSDD.h"
  27 #include "AliITSCalibrationSDD.h"
  28 #include "AliITSDriftSpeedSDD.h"
  29 #include "AliITSDriftSpeedArraySDD.h"
  30 #include "AliITSDCSAnalyzerSDD.h"
  31 #include "AliITSHLTforSDD.h"
  32 #include "AliShuttleInterface.h"
  33 #include "AliCDBEntry.h"
  34 #include "AliCDBMetaData.h"
  35 #include "TObjArray.h"
  36 #include "AliLog.h"
  37 #include <TObjString.h>
  38 #include <TSystem.h>
  39 #include <TList.h>
  40
  41 const TString AliITSPreprocessorSDD::fgkNameHistoPedestals = "hpedestal";
  42 const TString AliITSPreprocessorSDD::fgkNameHistoNoise = "hnoise";
  43 ClassImp(AliITSPreprocessorSDD)
  44
  45 //______________________________________________________________________
  46 AliITSPreprocessorSDD::AliITSPreprocessorSDD( AliShuttleInterface* shuttle):
  47     AliPreprocessor("SDD", shuttle)
  48 {
  49   // constructor
  50   AddRunType("PULSER");
  51   AddRunType("INJECTOR");
  52   AddRunType("PHYSICS");
  53 }
  54
  55 //______________________________________________________________________
  56 UInt_t AliITSPreprocessorSDD::Process(TMap* dcsAliasMap){
  57
  58
  59   // Get DDL map from OCDB
  60   AliCDBEntry* entry = GetFromOCDB("Calib", "DDLMapSDD");
  61   if(!entry){
  62     Log("DDL map file not found in OCDB.");
  63     return 2;
  64   }
  65   AliITSDDLModuleMapSDD* ddlmap = (AliITSDDLModuleMapSDD*)entry->GetObject();
  66   if(!ddlmap){
  67     Log("AliITSDDLModuleMapSDD object not in file.");
  68     return 2;
  69   }
  70   ddlmap->PrintDDLMap();
  71
  72   //preprocessing
  73   TString runType = GetRunType();
  74   Int_t retcode=0;
  75
  76   if (runType == "PULSER"){
  77     Log("Process FXS files from PULSER RUN");
  78     retcode=ProcessPulser(ddlmap);
  79   }else if(runType== "INJECTOR"){
  80     Log("Process FXS files from INJECTOR RUN");
  81     retcode=ProcessInjector(ddlmap);
  82   }else if(runType== "PHYSICS"){
  83     retcode=ProcessPhysics();
  84   }
  85   if(retcode!=0) return retcode;
  86
  87   Log("Process DCS data");
  88   Bool_t retcodedcs =ProcessDCSDataPoints(dcsAliasMap);
  89   if(retcodedcs) return 0;
  90   else return 1;
  91
  92 }
  93 //______________________________________________________________________
  94 UInt_t AliITSPreprocessorSDD::ProcessPhysics(){
  95   // Get the HLT status for the PHYSICS run
  96   // needeed to define the raw data format
  97
  98   AliITSHLTforSDD *hltSDD=new AliITSHLTforSDD();
  99   TString hltMode = GetRunParameter("HLTmode");
 100   TSubString firstChar = hltMode(0,1);
 101   if (firstChar == "C") hltSDD->SetHLTmodeC(kTRUE);
 102   else hltSDD->SetHLTmodeC(kFALSE);
 103
 104   AliCDBMetaData *md= new AliCDBMetaData();
 105   md->SetResponsible("Francesco Prino");
 106   md->SetBeamPeriod(0);
 107   md->SetComment("HLT mode C flag for PHYSICS run");
 108   Bool_t retCode = Store("Calib","HLTforSDD",hltSDD,md);
 109   if(retCode) return 0;
 110   else return 1;
 111 }
 112 //______________________________________________________________________
 113 UInt_t AliITSPreprocessorSDD::ProcessPulser(AliITSDDLModuleMapSDD* ddlmap){
 114   // Process FXS files from PULSER run (baseline, noise, gain)
 115   // returns 0 in case of success,
 116   //         1 in case of storage error,
 117   //         2 in case of error with input files
 118   TObjArray calSDD(kNumberOfSDD);
 119   calSDD.SetOwner(kFALSE);
 120
 121   Float_t baseline,rawnoise,cmn,corn,gain;
 122   Int_t isgoodan,i,im,is,isgoodmod,basmin,basoff;
 123   Int_t th,tl;
 124   Int_t numOfBadChannels[kNumberOfSDD];
 125
 126   TList* sourceList = GetFileSources(kDAQ, "SDD_Calib");
 127   if (!sourceList){
 128     Log("Error: no sources found for SDD_Calib");
 129     return 2;
 130   }
 131
 132   Int_t ind = 0;
 133   while (sourceList->At(ind)!=NULL) {
 134     TObjString* tarId = (TObjString*) sourceList->At(ind);
 135     TString tarName = GetFile(kDAQ, "SDD_Calib", tarId->GetString().Data());
 136     if(tarName.Length()==0){
 137       Log(Form("Baseline tar file from source %d not found.",ind));
 138       return 2;
 139     }
 140     TString command;
 141     command.Form("tar -xf %s",tarName.Data());
 142     gSystem->Exec(command);
 143     ind++;
 144   }
 145   delete sourceList;
 146
 147   for(Int_t iddl=0;iddl<kNumberOfDDL;iddl++){
 148     for(Int_t imod=0;imod<kModulesPerDDL;imod++){
 149       Int_t modID=ddlmap->GetModuleNumber(iddl,imod);
 150       if(modID==-1) continue;
 151       modID-=240; // to have SDD modules numbering from 0 to 260
 152       AliITSCalibrationSDD *cal = new AliITSCalibrationSDD("simulated");
 153       cal->SetAMAt20MHz();            // for runs > 51275 with clock at 20 MHz
 154       numOfBadChannels[modID]=0;
 155       Int_t badch[kNumberOfChannels];
 156       for(Int_t isid=0;isid<=1;isid++){
 157         TString inpFileName;
 158         inpFileName.Form("./SDDbase_ddl%02dc%02d_sid%d.data",iddl,imod,isid);
 159
 160         FILE* basFil = fopen(inpFileName,"read");
 161         if (basFil == 0) {
 162           Log(Form("File %s not found.",inpFileName.Data()));
 163           cal->SetBad();
 164           continue;
 165         }
 166         fscanf(basFil,"%d %d %d\n",&im,&is,&isgoodmod);
 167         if(!isgoodmod) cal->SetBad();
 168         fscanf(basFil,"%d\n",&th);
 169         fscanf(basFil,"%d\n",&tl);
 170         cal->SetZSLowThreshold(isid,tl);
 171         cal->SetZSHighThreshold(isid,th);
 172         for(Int_t ian=0;ian<(kNumberOfChannels/2);ian++){
 173           fscanf(basFil,"%d %d %f %d %d %f %f %f %f\n",&i,&isgoodan,&baseline,&basmin,&basoff,&rawnoise,&cmn,&corn,&gain);
 174           Int_t ich=ian;
 175           if(isid==1) ich+=256;
 176           if(!isgoodan){
 177             Int_t ibad=numOfBadChannels[modID];
 178             badch[ibad]=ich;
 179             numOfBadChannels[modID]++;
 180           }
 181           cal->SetBaseline(ich,baseline-basoff);
 182           cal->SetNoiseAfterElectronics(ich,rawnoise);
 183           cal->SetGain(ich,gain);
 184         }
 185         cal->SetDeadChannels(numOfBadChannels[modID]);
 186         for(Int_t ibad=0;ibad<numOfBadChannels[modID];ibad++){
 187           cal->SetBadChannel(ibad,badch[ibad]);
 188         }
 189         fclose(basFil);
 190       }
 191       Log(Form("Put calib obj for module %d (DDL %d  Carlos %d)",modID,iddl,imod));
 192       calSDD.AddAt(cal,modID);
 193     }
 194   }
 195   AliCDBMetaData *md= new AliCDBMetaData();
 196   md->SetResponsible("Francesco Prino");
 197   md->SetBeamPeriod(0);
 198   md->SetComment("AliITSCalibrationSDD from PEDESTAL+PULSER runs");
 199   Bool_t retCode = Store("Calib","CalibSDD",&calSDD,md, 0, kTRUE);
 200   if(retCode) return 0;
 201   else return 1;
 202 }
 203 //______________________________________________________________________
 204 UInt_t AliITSPreprocessorSDD::ProcessInjector(AliITSDDLModuleMapSDD* ddlmap){
 205   // Process FXS files from injector events (INJECTOR or PHYSICS runs)
 206   // returns 0 in case of success,
 207   //         1 in case of storage error,
 208   //         2 in case of error with input files
 209   TObjArray vdrift(2*kNumberOfSDD);
 210   vdrift.SetOwner(kFALSE);
 211   Int_t evNumb,polDeg;
 212   UInt_t timeStamp;
 213   Bool_t modSet[2*kNumberOfSDD]; // flag modules with good inj.
 214   for(Int_t ihyb=0; ihyb<2*kNumberOfSDD; ihyb++) modSet[ihyb]=0;
 215   Double_t nPt = 0;
 216
 217   Double_t param[4];    // parameters of poly fit
 218   Double_t minValP0=4.; // min value for param[0]
 219   Double_t maxValP0=9.; // max value for param[0]
 220   Double_t minValP1=0.; // min value for param[1]
 221   Double_t aveCoef[4]={0.,0.,0.,0.};  // average param for good mod.
 222   Double_t defCoef[4]={6.53227,0.00128941,-5.14493e-06,0};  // default values for param
 223   Float_t auxP;
 224
 225   TList* sourceList = GetFileSources(kDAQ, "SDD_Injec");
 226   if (!sourceList){
 227     Log("Error: no sources found for SDD_Injec");
 228     return 2;
 229   }
 230   Int_t ind = 0;
 231   while (sourceList->At(ind)!=NULL) {
 232     TObjString* tarId = (TObjString*) sourceList->At(ind);
 233     TString tarName = GetFile(kDAQ, "SDD_Injec", tarId->GetString().Data());
 234     if(tarName.Length()==0){
 235       Log(Form("Injector tar file from source %d not found.",ind));
 236       return 2;
 237     }
 238     TString command;
 239     command.Form("tar -xf %s",tarName.Data());
 240     gSystem->Exec(command);
 241     ind++;
 242   }
 243   delete sourceList;
 244
 245
 246   for(Int_t iddl=0;iddl<kNumberOfDDL;iddl++){
 247     for(Int_t imod=0;imod<kModulesPerDDL;imod++){
 248       Int_t modID=ddlmap->GetModuleNumber(iddl,imod);
 249       if(modID==-1) continue;
 250       modID-=240; // to have SDD modules numbering from 0 to 260
 251       for(Int_t isid=0;isid<=1;isid++){
 252         AliITSDriftSpeedArraySDD *arr=new AliITSDriftSpeedArraySDD();
 253         TString inpFileName;
 254         inpFileName.Form("./SDDinj_ddl%02dc%02d_sid%d.data",iddl,imod,isid);
 255         FILE* injFil = fopen(inpFileName,"read");
 256         if (injFil == 0) {
 257           Log(Form("File %s not found.",inpFileName.Data()));
 258           AliITSDriftSpeedSDD *dsp=new AliITSDriftSpeedSDD();
 259           arr->AddDriftSpeed(dsp);
 260           vdrift.AddAt(arr,2*modID+isid);
 261           continue;
 262         }
 263         fscanf(injFil,"%d",&polDeg);
 264         while (!feof(injFil)){
 265           fscanf(injFil,"%d %u ",&evNumb,&timeStamp);
 266           if(feof(injFil)) break;
 267           for(Int_t ic=0;ic<4;ic++){
 268             fscanf(injFil,"%f ",&auxP);
 269             param[ic]=auxP;
 270           }
 271
 272           if(param[0]>minValP0 && param[0]<maxValP0 && param[1]>minValP1){
 273             for(Int_t ic=0;ic<4;ic++) aveCoef[ic]+=param[ic];
 274             nPt++;
 275             AliITSDriftSpeedSDD *dsp=new AliITSDriftSpeedSDD(evNumb,timeStamp,polDeg,param);
 276             arr->AddDriftSpeed(dsp);
 277             modSet[2*modID+isid]=1;
 278           }
 279         }
 280         Log(Form("Put calib obj for hybrid %d (DDL %d  Carlos %d)",2*modID+isid,iddl,imod));
 281         if(modSet[2*modID+isid]) vdrift.AddAt(arr,2*modID+isid);
 282       }
 283     }
 284   }
 285
 286   // set drift speed for modules with bad injectors
 287   for(Int_t ic=0;ic<4;ic++){
 288     if(nPt>0) aveCoef[ic]/=nPt; // mean parameters
 289     else aveCoef[ic]=defCoef[ic]; // default parameters
 290   }
 291   AliITSDriftSpeedSDD *avdsp=new AliITSDriftSpeedSDD(evNumb,timeStamp,polDeg,aveCoef);
 292
 293   for(Int_t ihyb=0; ihyb<2*kNumberOfSDD; ihyb++){
 294     if(modSet[ihyb]==0){
 295       AliWarning(Form("No good injector events for mod. %d --> use average values",ihyb/2));
 296       AliITSDriftSpeedArraySDD *arr=new AliITSDriftSpeedArraySDD();
 297       arr->AddDriftSpeed(avdsp);
 298       vdrift.AddAt(arr,ihyb);
 299     }
 300   }
 301
 302
 303   AliCDBMetaData *md= new AliCDBMetaData();
 304   md->SetResponsible("Francesco Prino");
 305   md->SetBeamPeriod(0);
 306   md->SetComment("AliITSDriftSpeedSDD from injector events");
 307   Bool_t retCode = Store("Calib","DriftSpeedSDD",&vdrift,md,0, kTRUE);
 308   if(retCode) return 0;
 309   else return 1;
 310 }
 311 //______________________________________________________________________
 312 Bool_t AliITSPreprocessorSDD::ProcessDCSDataPoints(TMap* dcsAliasMap){
 313   // Process DCS data
 314   AliITSDCSAnalyzerSDD *dcs=new AliITSDCSAnalyzerSDD();
 315   dcs->AnalyzeData(dcsAliasMap);
 316   TObjArray refDCS(kNumberOfSDD);
 317   refDCS.SetOwner(kFALSE);
 318   for(Int_t imod=0;imod<kNumberOfSDD;imod++){
 319     AliITSDCSDataSDD *dcsdata=dcs->GetDCSData(imod);
 320     refDCS.Add(dcsdata);
 321   }
 322   AliCDBMetaData *md= new AliCDBMetaData();
 323   md->SetResponsible("Francesco Prino");
 324   md->SetBeamPeriod(0);
 325   md->SetComment("AliITSDCSDataSDD objects from DCS DB");
 326   Bool_t retCode = StoreReferenceData("DCS","DataSDD",&refDCS,md);
 327   return retCode;
 328 }
 329