technial fix to suppress the warning
[u/mrichter/AliRoot.git] / ITS / AliITSPreprocessorSDD.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 2007-2009, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16 /* $Id$ */
17
18 ///////////////////////////////////////////////////////////////////
19 //                                                               //
20 // Implementation of the class for SDD preprocessing             //
21 // Run Types treated:                                            // 
22 // PULSER, INJECTOR -> Store OCDB parameters                     //
23 // ALL RUNS -> Store DCS reference data                          //
24 // Origin: E.Crescio, Torino, crescio@to.infn.it                 //
25 //         F.Prino, Torino, prino@to.infn.it                     //
26 //                                                               //
27 ///////////////////////////////////////////////////////////////////
28
29 #include "AliITSDDLModuleMapSDD.h"
30 #include "AliITSPreprocessorSDD.h"
31 #include "AliITSCalibrationSDD.h"
32 #include "AliITSDriftSpeedSDD.h"
33 #include "AliITSDriftSpeedArraySDD.h"
34 #include "AliITSDCSAnalyzerSDD.h"
35 #include "AliShuttleInterface.h"
36 #include "AliCDBEntry.h"
37 #include "AliCDBMetaData.h"
38 #include "TObjArray.h"
39 #include "AliLog.h"
40 #include <TObjString.h>
41 #include <TSystem.h>
42 #include <TList.h>
43 #include <TF1.h>
44 #include <TH1D.h>
45
46 const TString AliITSPreprocessorSDD::fgkNameHistoPedestals = "hpedestal";
47 const TString AliITSPreprocessorSDD::fgkNameHistoNoise = "hnoise";
48 ClassImp(AliITSPreprocessorSDD)
49
50 //______________________________________________________________________
51 AliITSPreprocessorSDD::AliITSPreprocessorSDD( AliShuttleInterface* shuttle):
52     AliPreprocessor("SDD", shuttle)
53 {
54   // constructor
55   AddRunType("PULSER");
56   AddRunType("INJECTOR");
57   AddRunType("PHYSICS"); 
58 }
59
60 //______________________________________________________________________
61 UInt_t AliITSPreprocessorSDD::Process(TMap* dcsAliasMap){
62
63
64   // Get DDL map from OCDB
65   AliCDBEntry* entry = GetFromOCDB("Calib", "DDLMapSDD");
66   if(!entry){
67     Log("DDL map file not found in OCDB.");  
68     return 2;
69   }
70   AliITSDDLModuleMapSDD* ddlmap = (AliITSDDLModuleMapSDD*)entry->GetObject();
71   if(!ddlmap){ 
72     Log("AliITSDDLModuleMapSDD object not in file.");
73     return 2;
74   }
75   ddlmap->PrintDDLMap();
76
77   //preprocessing
78   TString runType = GetRunType();
79   Int_t retcode=0;
80
81   if (runType == "PULSER"){
82     Log("Process FXS files from PULSER RUN");
83     retcode=ProcessPulser(ddlmap);
84   }else if(runType== "INJECTOR"){
85     Log("Process FXS files from INJECTOR RUN");
86     retcode=ProcessInjector(ddlmap);
87   }
88   if(retcode!=0) return retcode;
89
90   Log("Process DCS data");
91   Bool_t retcodedcs =ProcessDCSDataPoints(dcsAliasMap);
92   if(retcodedcs) return 0; 
93   else return 1;           
94
95 }
96 //______________________________________________________________________
97 UInt_t AliITSPreprocessorSDD::ProcessPulser(AliITSDDLModuleMapSDD* ddlmap){
98   // Process FXS files from PULSER run (baseline, noise, gain)
99   // returns 0 in case of success, 
100   //         1 in case of storage error, 
101   //         2 in case of error with input files
102   TObjArray calSDD(kNumberOfSDD);
103   calSDD.SetOwner(kFALSE);
104
105   Float_t baseline,rawnoise,cmn,corn,gain;
106   Int_t isgoodan,i,im,is,isgoodmod,basmin,basoff;
107   Int_t th,tl;
108   Int_t numOfBadChannels[kNumberOfSDD];
109   
110   TList* sourceList = GetFileSources(kDAQ, "SDD_Calib");
111   if (!sourceList){ 
112     Log("Error: no sources found for SDD_Calib");
113     return 2;
114   }
115
116   Int_t ind = 0;
117   while (sourceList->At(ind)!=NULL) {
118     TObjString* tarId = (TObjString*) sourceList->At(ind);
119     TString tarName = GetFile(kDAQ, "SDD_Calib", tarId->GetString().Data());
120     if(tarName.Length()==0){
121       Log(Form("Baseline tar file from source %d not found.",ind));
122       return 2;
123     }
124     TString command;
125     command.Form("tar -xf %s",tarName.Data());
126     gSystem->Exec(command);
127     ind++;
128   }
129   delete sourceList;
130   // Read ADC sampling frequency from fee.conf
131   Int_t amSamplFreq=40;
132   Int_t retfscf;
133   FILE* feefil=fopen("fee.conf","r");
134   if(feefil){
135     retfscf=fscanf(feefil,"%d \n",&amSamplFreq);
136     fclose(feefil);
137     Log(Form("AM sampling frequency = %d MHz",amSamplFreq));
138   }else{
139     Log("File fee.conf not found. AM sampling set at 40 MHz by default");
140   }
141   
142   for(Int_t iddl=0;iddl<kNumberOfDDL;iddl++){
143     for(Int_t imod=0;imod<kModulesPerDDL;imod++){
144       Int_t modID=ddlmap->GetModuleNumber(iddl,imod);
145       if(modID==-1) continue;
146       modID-=240; // to have SDD modules numbering from 0 to 260
147       AliITSCalibrationSDD *cal = new AliITSCalibrationSDD("simulated");
148       if(amSamplFreq!=40) cal->SetAMAt20MHz();
149       numOfBadChannels[modID]=0;
150       Int_t badch[kNumberOfChannels];
151       Bool_t sid0ok=kTRUE;
152       Bool_t sid1ok=kTRUE;
153       for(Int_t isid=0;isid<=1;isid++){
154         TString inpFileName;
155         inpFileName.Form("./SDDbase_ddl%02dc%02d_sid%d.data",iddl,imod,isid);
156
157         FILE* basFil = fopen(inpFileName,"read");
158         if (basFil == 0) {
159           Log(Form("File %s not found.",inpFileName.Data()));
160           if(isid==0){
161             sid0ok=kFALSE;
162             for(Int_t iChip=0; iChip<4; iChip++) cal->SetChipBad(iChip);
163             cal->SetDeadChannels(cal->GetDeadChannels()+256);
164             for(Int_t iAnode=0; iAnode<256; iAnode++) cal->SetBadChannel(iAnode,iAnode);
165           }else{
166             sid1ok=kFALSE;
167             for(Int_t iChip=4; iChip<8; iChip++) cal->SetChipBad(iChip);
168             cal->SetDeadChannels(cal->GetDeadChannels()+256);
169             for(Int_t iAnode=0; iAnode<256; iAnode++) cal->SetBadChannel(iAnode,iAnode+256);
170           }
171           continue;
172         }
173
174         retfscf=fscanf(basFil,"%d %d %d\n",&im,&is,&isgoodmod);
175         if(!isgoodmod){
176           if(isid==0){
177             sid0ok=kFALSE;
178             for(Int_t iChip=0; iChip<4; iChip++) cal->SetChipBad(iChip);
179           }else{
180             sid1ok=kFALSE;
181             for(Int_t iChip=4; iChip<8; iChip++) cal->SetChipBad(iChip);
182           }
183         }
184         retfscf=fscanf(basFil,"%d\n",&th);
185         retfscf=fscanf(basFil,"%d\n",&tl);
186         cal->SetZSLowThreshold(isid,tl);
187         cal->SetZSHighThreshold(isid,th);
188         for(Int_t ian=0;ian<(kNumberOfChannels/2);ian++){
189           retfscf=fscanf(basFil,"%d %d %f %d %d %f %f %f %f\n",&i,&isgoodan,&baseline,&basmin,&basoff,&rawnoise,&cmn,&corn,&gain);
190           Int_t ich=ian;
191           if(isid==1) ich+=256;
192           if(!isgoodan){ 
193             Int_t ibad=numOfBadChannels[modID];
194             badch[ibad]=ich;
195             numOfBadChannels[modID]++;
196           }
197           cal->SetBaseline(ich,baseline-basoff);
198           cal->SetNoiseAfterElectronics(ich,rawnoise);
199           cal->SetGain(ich,gain);
200         }
201         cal->SetDeadChannels(numOfBadChannels[modID]);
202         for(Int_t ibad=0;ibad<numOfBadChannels[modID];ibad++){
203           cal->SetBadChannel(ibad,badch[ibad]);
204         }
205         fclose(basFil);
206       }
207       if(!sid0ok && !sid1ok) cal->SetBad();
208       Log(Form("Put calib obj for module %d (DDL %d  Carlos %d)",modID,iddl,imod));
209       calSDD.AddAt(cal,modID);
210     }
211   }
212   AliCDBMetaData *md= new AliCDBMetaData();
213   md->SetResponsible("Francesco Prino");
214   md->SetBeamPeriod(0);
215   md->SetComment("AliITSCalibrationSDD from PEDESTAL+PULSER runs");
216   Bool_t retCode = Store("Calib","CalibSDD",&calSDD,md, 0, kTRUE);
217   if(retCode) return 0;
218   else return 1;
219 }
220 //______________________________________________________________________
221 UInt_t AliITSPreprocessorSDD::ProcessInjector(AliITSDDLModuleMapSDD* ddlmap){
222   // Process FXS files from injector events (INJECTOR or PHYSICS runs)
223   // returns 0 in case of success, 
224   //         1 in case of storage error, 
225   //         2 in case of error with input files
226   TObjArray vdrift(2*kNumberOfSDD);
227   vdrift.SetOwner(kFALSE);
228   Int_t evNumb,polDeg; 
229   UInt_t timeStamp,statusInj;
230   Bool_t modSet[2*kNumberOfSDD]; // flag modules with good inj.
231   for(Int_t ihyb=0; ihyb<2*kNumberOfSDD; ihyb++) modSet[ihyb]=0;
232   Double_t nPtLay3 = 0;
233   Double_t nPtLay4 = 0;
234
235   Double_t param[4];    // parameters of poly fit
236   Double_t minValP0=5.; // min value for param[0]
237   Double_t maxValP0=8.; // max value for param[0]
238   Double_t minValP1=0.; // min value for param[1]
239   Double_t aveCoefLay3[4]={0.,0.,0.,0.};  // average param for good mod.
240   Double_t aveCoefLay4[4]={0.,0.,0.,0.};  // average param for good mod.
241   Double_t defCoef[4]={6.53227,0.00128941,-5.14493e-06,0};  // default values for param
242   Float_t auxP;
243
244   TList* sourceList = GetFileSources(kDAQ, "SDD_Injec");
245   if (!sourceList){ 
246     Log("Error: no sources found for SDD_Injec");
247     return 2;
248   }
249   Int_t ind = 0;
250   while (sourceList->At(ind)!=NULL) {
251     TObjString* tarId = (TObjString*) sourceList->At(ind);
252     TString tarName = GetFile(kDAQ, "SDD_Injec", tarId->GetString().Data());
253     if(tarName.Length()==0){
254       Log(Form("Injector tar file from source %d not found.",ind));
255       return 2;
256     }
257     TString command;
258     command.Form("tar -xf %s",tarName.Data());
259     gSystem->Exec(command);
260     ind++;
261   }
262   delete sourceList;
263   Int_t retfscf;
264   
265
266   for(Int_t iddl=0;iddl<kNumberOfDDL;iddl++){
267     for(Int_t imod=0;imod<kModulesPerDDL;imod++){
268       Int_t modID=ddlmap->GetModuleNumber(iddl,imod);
269       if(modID==-1) continue;
270       modID-=240; // to have SDD modules numbering from 0 to 260
271       for(Int_t isid=0;isid<=1;isid++){
272         AliITSDriftSpeedArraySDD *arr=new AliITSDriftSpeedArraySDD();
273         TString inpFileName;
274         inpFileName.Form("./SDDinj_ddl%02dc%02d_sid%d.data",iddl,imod,isid);
275         FILE* injFil = fopen(inpFileName,"read");
276         if (injFil == 0) {
277           Log(Form("File %s not found.",inpFileName.Data()));
278           continue;
279         }
280         retfscf=fscanf(injFil,"%d",&polDeg);
281         while (!feof(injFil)){
282           retfscf=fscanf(injFil,"%d %u ",&evNumb,&timeStamp);
283           if(evNumb==-99){
284             statusInj=timeStamp;
285             arr->SetInjectorStatus(statusInj);
286           }else{
287             if(feof(injFil)) break;
288             for(Int_t ic=0;ic<4;ic++){ 
289               retfscf=fscanf(injFil,"%f ",&auxP);
290               param[ic]=auxP;
291             }
292
293             if(polDeg>=0 && polDeg<=AliITSDriftSpeedSDD::GetMaxPolDeg() && 
294                param[0]>minValP0 && param[0]<maxValP0 && param[1]>minValP1){
295               if(polDeg==3){
296                 if(modID<kNumberOfSDDLay3){ 
297                   for(Int_t ic=0;ic<4;ic++) aveCoefLay3[ic]+=param[ic];
298                   nPtLay3++;
299                 }else{ 
300                   for(Int_t ic=0;ic<4;ic++) aveCoefLay4[ic]+=param[ic];
301                   nPtLay4++;
302                 }
303               }
304               AliITSDriftSpeedSDD *dsp=new AliITSDriftSpeedSDD(evNumb,timeStamp,polDeg,param);
305               arr->AddDriftSpeed(dsp);
306               modSet[2*modID+isid]=1;
307             }else{
308               Log(Form("Module %d side %d not accepted, degree=%d, params=%g %g %g %g",modID+240,isid,polDeg,param[0],param[1],param[2],param[3]));
309             }
310           }
311         }
312         fclose(injFil);
313         Log(Form("Put calib obj for hybrid %d (DDL %d  Carlos %d)",2*modID+isid,iddl,imod));
314         if(modSet[2*modID+isid]) vdrift.AddAt(arr,2*modID+isid);
315       }
316     }
317   }
318
319   // set drift speed for modules with bad injectors
320   for(Int_t ic=0;ic<4;ic++){ 
321     if(nPtLay3>0) aveCoefLay3[ic]/=nPtLay3; // mean parameters
322     else aveCoefLay3[ic]=defCoef[ic]; // default parameters
323     if(nPtLay4>0) aveCoefLay4[ic]/=nPtLay4; // mean parameters
324     else aveCoefLay4[ic]=defCoef[ic]; // default parameters
325   }
326   AliITSDriftSpeedSDD *avdsp3=new AliITSDriftSpeedSDD(evNumb,timeStamp,3,aveCoefLay3);
327   AliITSDriftSpeedSDD *avdsp4=new AliITSDriftSpeedSDD(evNumb,timeStamp,3,aveCoefLay4);
328
329   // Check status of golden modules
330   Int_t idGoldenMod=-1, idGoldenSide=-1;
331   Int_t idGoldenModList[5]={319,319,321,243,243};
332   Int_t idGoldenSideList[5]={0,1,0,0,1};
333   AliITSDriftSpeedSDD* refSpeed=0x0;
334   for(Int_t iGold=0; iGold<5; iGold++){
335     Int_t indexG=2*(idGoldenModList[iGold]-240)+idGoldenSideList[iGold];
336     if(modSet[indexG]){
337       idGoldenMod=idGoldenModList[iGold];
338       idGoldenSide=idGoldenSideList[iGold];
339       AliITSDriftSpeedArraySDD* arrRef=(AliITSDriftSpeedArraySDD*)vdrift.At(indexG);
340       refSpeed=arrRef->GetDriftSpeedObject(0);
341       break;
342     }
343   }
344   TList* correctionList=0x0;
345   if(idGoldenMod>=240 && idGoldenSide>=0){
346     // Get rescaling corrections from OCDB
347     AliCDBEntry* entry = GetFromOCDB("Calib", "RescaleDriftSpeedSDD");
348     if(!entry){
349       Log("RescaleDriftSpeedSDD file not found in OCDB.");  
350     }
351     TList* fullList=(TList*)entry->GetObject();
352     if(!fullList){ 
353       Log("TList object not found in file.");
354     }
355     TString listName=Form("RefMod%d_Side%d",idGoldenMod,idGoldenSide);
356     correctionList=(TList*)fullList->FindObject(listName.Data());
357     if(!correctionList){
358       Log(Form("TList for requested module %d side %d not found",idGoldenMod,idGoldenSide));
359     }else{
360       Log(Form("Use module %d side %d as reference module",idGoldenMod,idGoldenSide));
361       if(refSpeed){
362         Log(Form("Drift speed params for golden module = %g %g %g %g",refSpeed->GetDriftSpeedParameter(0),refSpeed->GetDriftSpeedParameter(1),refSpeed->GetDriftSpeedParameter(2),refSpeed->GetDriftSpeedParameter(3)));
363       }else{
364         AliError("No drift speed object for golden module");
365       }
366     }
367   }
368   
369   for(Int_t ihyb=0; ihyb<2*kNumberOfSDDLay3; ihyb++){
370     AliITSDriftSpeedArraySDD *arr=new AliITSDriftSpeedArraySDD();
371     if(modSet[ihyb]==0){ 
372       Int_t iBadMod=ihyb/2+240;
373       Int_t iBadSide=ihyb%2;
374       Bool_t goldenUsed=kFALSE;
375       if(correctionList && refSpeed){
376         Double_t *params=RescaleDriftSpeedModule(correctionList,iBadMod,iBadSide,refSpeed);
377         if(params){
378           AliWarning(Form("No good injector events for mod. %d side %d --> use rescaled values from golden module",iBadMod,iBadSide));
379           AliITSDriftSpeedSDD* dspres=new AliITSDriftSpeedSDD(0,refSpeed->GetEventTimestamp(),3,params);
380           arr->AddDriftSpeed(dspres);
381           arr->SetInjectorStatus(1);
382           goldenUsed=kTRUE;
383         }
384       }
385       if(!goldenUsed){
386         AliWarning(Form("No good injector events for mod. %d side %d --> use average values for layer 3",iBadMod,iBadSide));
387         arr->AddDriftSpeed(avdsp3);
388         arr->SetInjectorStatus(0);
389       }
390       vdrift.AddAt(arr,ihyb);
391     }
392   }
393
394   for(Int_t ihyb=2*kNumberOfSDDLay3; ihyb<2*kNumberOfSDD; ihyb++){
395     if(modSet[ihyb]==0){ 
396       AliWarning(Form("No good injector events for mod. %d side %d --> use average values for layer 4",ihyb/2,ihyb%2));
397       AliITSDriftSpeedArraySDD *arr=new AliITSDriftSpeedArraySDD();
398       arr->AddDriftSpeed(avdsp4);
399       arr->SetInjectorStatus(0);
400       vdrift.AddAt(arr,ihyb);
401     }
402   }
403
404   AliCDBMetaData *md= new AliCDBMetaData();
405   md->SetResponsible("Francesco Prino");
406   md->SetBeamPeriod(0);
407   md->SetComment("AliITSDriftSpeedSDD from injector events");
408   Bool_t retCode = Store("Calib","DriftSpeedSDD",&vdrift,md,0, kTRUE);
409   if(retCode) return 0;
410   else return 1;
411 }
412
413 //______________________________________________________________________
414 Double_t* AliITSPreprocessorSDD::RescaleDriftSpeedModule(const TList* theList,
415                                                          Int_t iBadMod, 
416                                                          Int_t iBadSide,
417                                                          const AliITSDriftSpeedSDD* refSpeed)
418   const
419 {
420   // Rescale driftSpeed for a drift region starting from values of golden module
421
422   if(!refSpeed) return 0x0;
423   TString hisName=Form("hRatioMod%d_Side%d",iBadMod,iBadSide);
424   TH1D* h=(TH1D*)theList->FindObject(hisName.Data());
425   if(!h) return 0x0;
426
427   TF1* fpoly=new TF1("fpoly","pol3",0.,255.);
428   for(Int_t iAnode=0; iAnode<256; iAnode++){
429     Double_t vref=refSpeed->GetDriftSpeedAtAnode((Double_t)iAnode);
430     Double_t vcorr=h->GetBinContent(iAnode+1)*vref;
431     h->SetBinContent(iAnode+1,vcorr);
432   }
433   h->Fit(fpoly,"RNQ");
434   Double_t *params=new Double_t[4];
435   for(Int_t iPar=0; iPar<4; iPar++) params[iPar]=fpoly->GetParameter(iPar);
436   delete fpoly;
437   return params;
438 }
439
440 //______________________________________________________________________
441 Bool_t AliITSPreprocessorSDD::ProcessDCSDataPoints(TMap* dcsAliasMap){
442   // Process DCS data
443   AliITSDCSAnalyzerSDD *dcs=new AliITSDCSAnalyzerSDD();
444   dcs->AnalyzeData(dcsAliasMap);
445   TObjArray refDCS(kNumberOfSDD);
446   refDCS.SetOwner(kFALSE);
447   for(Int_t imod=0;imod<kNumberOfSDD;imod++){
448     AliITSDCSDataSDD *dcsdata=dcs->GetDCSData(imod);
449     refDCS.Add(dcsdata);
450   }    
451   AliCDBMetaData *md= new AliCDBMetaData();
452   md->SetResponsible("Francesco Prino");
453   md->SetBeamPeriod(0);
454   md->SetComment("AliITSDCSDataSDD objects from DCS DB");
455   Bool_t retCode = StoreReferenceData("DCS","DataSDD",&refDCS,md);
456   return retCode;
457 }
458