Fixing a little overlap. Adding flags to perform material budget studies (Mario)
[u/mrichter/AliRoot.git] / ITS / AliITSclustererV2.cxx
1 //-------------------------------------------------------------------------
2 //            Implementation of the ITS clusterer V2 class
3 //
4 //          Origin: Iouri Belikov, CERN, Jouri.Belikov@cern.ch
5 // This class is no longer used for ITS recosntruction:
6 // it has been replaced by the AliITSClusterFinderV2SXD classes
7 // It is still used as mother class by HLT reconstruction
8 //-------------------------------------------------------------------------
9
10
11 #include "AliLoader.h"
12 #include "AliRun.h"
13
14 #include "AliITSclustererV2.h"
15 #include "AliITSclusterV2.h"
16 #include "AliITSDetTypeRec.h"
17 #include "AliRawReader.h"
18 #include "AliITSRawStreamSPD.h"
19 #include "AliITSRawStreamSDD.h"
20 #include "AliITSRawStreamSSD.h"
21
22 #include <TFile.h>
23 #include <TTree.h>
24 #include <TClonesArray.h>
25 #include "AliITSgeomTGeo.h"
26 #include "AliITSdigitSPD.h"
27 #include "AliITSdigitSDD.h"
28 #include "AliITSdigitSSD.h"
29 #include "AliMC.h"
30
31 ClassImp(AliITSclustererV2)
32
33 extern AliRun *gAlice;
34
35 AliITSclustererV2::AliITSclustererV2():
36 fNModules(0),
37 fEvent(0),
38 fI(0),
39 fLastSPD1(0),
40 fNySPD(0),
41 fNzSPD(0),
42 fYpitchSPD(0),
43 fZ1pitchSPD(0),
44 fZ2pitchSPD(0),
45 fHwSPD(0),
46 fHlSPD(0),
47 fNySDD(0),
48 fNzSDD(0),
49 fYpitchSDD(0),
50 fZpitchSDD(0),
51 fHwSDD(0),
52 fHlSDD(0),
53 fYoffSDD(0),
54 fLastSSD1(0),
55 fYpitchSSD(0),
56 fHwSSD(0),
57 fHlSSD(0),
58 fTanP(0),
59 fTanN(0){
60    //default constructor
61   for(Int_t i=0;i<260;i++)fYSPD[i]=0.;
62   for(Int_t i=0;i<170;i++)fZSPD[i]=0.;
63   for(Int_t i=0;i<2200;i++){
64     fYshift[i]=0.;
65     fZshift[i]=0.;
66     fNdet[i]=0;
67     fNlayer[i]=0;
68   }
69
70 }
71 AliITSclustererV2::AliITSclustererV2(const Char_t *geom):
72 fNModules(AliITSgeomTGeo::GetNModules()),
73 fEvent(0),
74 fI(0),
75 fLastSPD1(AliITSgeomTGeo::GetModuleIndex(2,1,1)-1),
76 fNySPD(256),
77 fNzSPD(160),
78 fYpitchSPD(0.0050),
79 fZ1pitchSPD(0.0425),
80 fZ2pitchSPD(0.0625),
81 fHwSPD(0.64),
82 fHlSPD(3.48),
83 fNySDD(256),
84 fNzSDD(256),
85 fYpitchSDD(0.01825),
86 fZpitchSDD(0.02940),
87 fHwSDD(3.5085),
88 fHlSDD(3.7632),
89 fYoffSDD(0.0425),
90 fLastSSD1(AliITSgeomTGeo::GetModuleIndex(6,1,1)-1),
91 fYpitchSSD(0.0095),
92 fHwSSD(3.65),
93 fHlSSD(2.00),
94 fTanP(0.0275),
95 fTanN(0.0075) {
96   //------------------------------------------------------------
97   // Standard constructor
98   //------------------------------------------------------------
99   if (geom) {
100     AliWarning("\"geom\" is actually a dummy argument !");
101   }
102   Int_t m;
103   for (m=0; m<fNModules; m++) {
104      Int_t lay,lad,det; AliITSgeomTGeo::GetModuleId(m,lay,lad,det);
105      const TGeoHMatrix *tm=AliITSgeomTGeo::GetTracking2LocalMatrix(m);
106      fYshift[m] = (tm->Inverse()).GetTranslation()[1];
107      fZshift[m] = (tm->Inverse()).GetTranslation()[2];
108      fNdet[m] = (lad-1)*AliITSgeomTGeo::GetNDetectors(lay) + (det-1);
109      fNlayer[m] = lay-1;
110   }
111
112   //SPD geometry  
113   fYSPD[0]=0.5*fYpitchSPD;
114   for (m=1; m<fNySPD; m++) fYSPD[m]=fYSPD[m-1]+fYpitchSPD; 
115   fZSPD[0]=fZ1pitchSPD;
116   for (m=1; m<fNzSPD; m++) {
117     Double_t dz=fZ1pitchSPD;
118     if (m==31 || m==32 || m==63  || m==64  || m==95 || m==96 || 
119         m==127 || m==128) dz=fZ2pitchSPD; 
120     fZSPD[m]=fZSPD[m-1]+dz;
121   }
122   for (m=0; m<fNzSPD; m++) {
123     Double_t dz=0.5*fZ1pitchSPD;
124     if (m==31 || m==32 || m==63  || m==64  || m==95 || m==96 || 
125         m==127 || m==128) dz=0.5*fZ2pitchSPD; 
126     fZSPD[m]-=dz;
127   }
128
129 }
130
131
132 Int_t AliITSclustererV2::Digits2Clusters(TTree *dTree, TTree *cTree) {
133   //------------------------------------------------------------
134   // This function creates ITS clusters
135   //------------------------------------------------------------
136   Int_t ncl=0;
137
138   if (!dTree) {
139     Error("Digits2Clusters","Can't get the tree with digits !");
140     return 1;
141   }
142
143   TClonesArray *digitsSPD=new TClonesArray("AliITSdigitSPD",3000);
144   dTree->SetBranchAddress("ITSDigitsSPD",&digitsSPD);
145   TClonesArray *digitsSDD=new TClonesArray("AliITSdigitSDD",3000);
146   dTree->SetBranchAddress("ITSDigitsSDD",&digitsSDD);
147   TClonesArray *digitsSSD=new TClonesArray("AliITSdigitSSD",3000);
148   dTree->SetBranchAddress("ITSDigitsSSD",&digitsSSD);
149
150   TClonesArray *clusters=new TClonesArray("AliITSclusterV2",1000);
151   TBranch *branch=cTree->GetBranch("Clusters");
152   if (!branch) cTree->Branch("Clusters",&clusters);
153   else branch->SetAddress(&clusters);
154
155   Int_t mmax=(Int_t)dTree->GetEntries();
156   if (mmax!=fNModules) {
157     Error("Digits2Clusters","Number of entries != number of modules !");
158     return 1;
159   }
160
161   for (fI=0; fI<mmax; fI++) {
162     dTree->GetEvent(fI);
163
164     if     (digitsSPD->GetEntriesFast()!=0) 
165       FindClustersSPD(digitsSPD,clusters);
166     else 
167       if(digitsSDD->GetEntriesFast()!=0) 
168         FindClustersSDD(digitsSDD,clusters);
169       else if(digitsSSD->GetEntriesFast()!=0) 
170         FindClustersSSD(digitsSSD,clusters);
171     
172     ncl+=clusters->GetEntriesFast();
173
174     cTree->Fill();
175
176     digitsSPD->Clear();
177     digitsSDD->Clear();
178     digitsSSD->Clear();
179     clusters->Clear();
180   }
181
182   //cTree->Write();
183
184   delete clusters;
185
186   delete digitsSPD;
187   delete digitsSDD;
188   delete digitsSSD;
189
190   //delete dTree;
191
192   Info("Digits2Clusters","Number of found clusters : %d",ncl);
193
194   return 0;
195 }
196
197 void AliITSclustererV2::Digits2Clusters(AliRawReader* rawReader) {
198   //------------------------------------------------------------
199   // This function creates ITS clusters from raw data
200   //------------------------------------------------------------
201   AliRunLoader* runLoader = AliRunLoader::Instance();
202   if (!runLoader) {
203     Error("Digits2Clusters", "no run loader found");
204     return;
205   }
206   runLoader->LoadKinematics();
207   AliLoader* itsLoader = runLoader->GetLoader("ITSLoader");
208   if (!itsLoader) {
209     Error("Digits2Clusters", "no loader for ITS found");
210     return;
211   }
212   if (!itsLoader->TreeR()) itsLoader->MakeTree("R");
213   TTree* cTree = itsLoader->TreeR();
214
215   TClonesArray *array=new TClonesArray("AliITSclusterV2",1000);
216   cTree->Branch("Clusters",&array);
217   delete array;
218
219   TClonesArray** clusters = new TClonesArray*[fNModules]; 
220   for (Int_t iModule = 0; iModule < fNModules; iModule++) {
221     clusters[iModule] = NULL;
222   }
223   // one TClonesArray per module
224
225   rawReader->Reset();
226   AliITSRawStreamSPD inputSPD(rawReader);
227   FindClustersSPD(&inputSPD, clusters);
228
229   rawReader->Reset();
230   AliITSRawStreamSDD inputSDD(rawReader);
231   FindClustersSDD(&inputSDD, clusters);
232
233   rawReader->Reset();
234   AliITSRawStreamSSD inputSSD(rawReader);
235   FindClustersSSD(&inputSSD, clusters);
236
237   // write all clusters to the tree
238   Int_t nClusters = 0;
239   TClonesArray *emptyArray=new TClonesArray("AliITSclusterV2");
240   for (Int_t iModule = 0; iModule < fNModules; iModule++) {
241     array = clusters[iModule];
242     if (!array) {
243       Error("Digits2Clusters", "data for module %d missing!", iModule);
244       array = emptyArray;
245     }
246     cTree->SetBranchAddress("Clusters", &array);
247     cTree->Fill();
248     nClusters += array->GetEntriesFast();
249   }
250   delete emptyArray;
251
252   itsLoader->WriteRecPoints("OVERWRITE");
253
254   delete[] clusters;
255
256   Info("Digits2Clusters", "total number of found clusters in ITS: %d\n", 
257        nClusters);
258 }
259
260 //**** Fast clusters *******************************
261 #include "TParticle.h"
262
263 //#include "AliITS.h"
264 #include "AliITSmodule.h"
265 #include "AliITSRecPoint.h"
266 #include "AliITSsimulationFastPoints.h"
267 #include "AliITSRecPoint.h"
268
269
270 static void CheckLabels(Int_t lab[3]) {
271   //------------------------------------------------------------
272   // Tries to find mother's labels
273   //------------------------------------------------------------
274   AliRunLoader *rl = AliRunLoader::Instance();
275   TTree *trK=(TTree*)rl->TreeK();
276
277   if(trK){
278     Int_t label=lab[0];
279     if (label>=0) {
280       TParticle *part=(TParticle*)gAlice->GetMCApp()->Particle(label);
281       label=-3;
282       while (part->P() < 0.005) {
283         Int_t m=part->GetFirstMother();
284         if (m<0) {
285           Info("CheckLabels","Primary momentum: %f",part->P()); 
286           break;
287         }
288         if (part->GetStatusCode()>0) {
289           Info("CheckLabels","Primary momentum: %f",part->P()); 
290           break;
291         }
292         label=m;
293         part=(TParticle*)gAlice->GetMCApp()->Particle(label);
294       }
295       if(lab[1]<0){
296         lab[1]=label;
297       }
298       else if (lab[2]<0) {
299         lab[2]=label;
300       }
301       else {
302         //      cerr<<"CheckLabels : No empty labels !\n";
303       }
304     }
305   }
306 }
307
308 /*
309 static void CheckLabels(Int_t lab[3]) {
310   //------------------------------------------------------------
311   // Tries to find mother's labels
312   //------------------------------------------------------------
313
314   if(lab[0]<0 && lab[1]<0 && lab[2]<0) return; // In case of no labels just exit
315
316   Int_t ntracks = gAlice->GetMCApp()->GetNtrack();
317   for (Int_t i=0;i<3;i++){
318     Int_t label = lab[i];
319     if (label>=0 && label<ntracks) {
320       TParticle *part=(TParticle*)gAlice->GetMCApp()->Particle(label);
321       if (part->P() < 0.005) {
322         Int_t m=part->GetFirstMother();
323         if (m<0) {      
324           continue;
325         }
326         if (part->GetStatusCode()>0) {
327           continue;
328         }
329         lab[i]=m;       
330       }
331     }    
332   }
333   
334 }
335 */
336 static void CheckLabels2(Int_t lab[10]) {
337   //------------------------------------------------------------
338   // Tries to find mother's labels
339   //------------------------------------------------------------
340   AliRunLoader *rl = AliRunLoader::Instance();
341   TTree *trK=(TTree*)rl->TreeK();
342
343   if(trK){
344     Int_t nlabels =0; 
345     for (Int_t i=0;i<10;i++) if (lab[i]>=0) nlabels++;
346     if(nlabels == 0) return; // In case of no labels just exit
347
348     Int_t ntracks = gAlice->GetMCApp()->GetNtrack();
349
350     for (Int_t i=0;i<10;i++){
351       Int_t label = lab[i];
352       if (label>=0 && label<ntracks) {
353         TParticle *part=(TParticle*)gAlice->GetMCApp()->Particle(label);
354         if (part->P() < 0.02) {
355           Int_t m=part->GetFirstMother();
356           if (m<0) {    
357             continue;
358           }
359           if (part->GetStatusCode()>0) {
360             continue;
361           }
362           lab[i]=m;       
363         }
364         else
365           if (part->P() < 0.12 && nlabels>3) {
366             lab[i]=-2;
367             nlabels--;
368           } 
369       }
370       else{
371         if ( (label>ntracks||label <0) && nlabels>3) {
372           lab[i]=-2;
373           nlabels--;
374         } 
375       }
376     }  
377     if (nlabels>3){
378       for (Int_t i=0;i<10;i++){
379         if (nlabels>3){
380           Int_t label = lab[i];
381           if (label>=0 && label<ntracks) {
382             TParticle *part=(TParticle*)gAlice->GetMCApp()->Particle(label);
383             if (part->P() < 0.1) {
384               lab[i]=-2;
385               nlabels--;
386             }
387           }
388         }
389       }
390     }
391
392     //compress labels -- if multi-times the same
393     Int_t lab2[10];
394     for (Int_t i=0;i<10;i++) lab2[i]=-2;
395     for (Int_t i=0;i<10  ;i++){
396       if (lab[i]<0) continue;
397       for (Int_t j=0;j<10 &&lab2[j]!=lab[i];j++){
398         if (lab2[j]<0) {
399           lab2[j]= lab[i];
400           break;
401         }
402       }
403     }
404     for (Int_t j=0;j<10;j++) lab[j]=lab2[j];
405   }
406 }
407
408 static void AddLabel(Int_t lab[10], Int_t label) {
409 // add label of the particle in the kine tree which originates this cluster
410 // (used for reconstruction of MC data only, for comparison purposes)
411   AliRunLoader *rl = AliRunLoader::Instance();
412   TTree *trK=(TTree*)rl->TreeK();
413
414   if(trK){
415     if(label<0) return; // In case of no label just exit
416
417     Int_t ntracks = gAlice->GetMCApp()->GetNtrack();
418     if (label>ntracks) return;
419     for (Int_t i=0;i<10;i++){
420       //    if (label<0) break;
421       if (lab[i]==label) break;
422       if (lab[i]<0) {
423         lab[i]= label;
424         break;
425       }
426     }
427   }
428 }
429
430 void AliITSclustererV2::RecPoints2Clusters
431 (const TClonesArray *points, Int_t idx, TClonesArray *clusters) {
432   //------------------------------------------------------------
433   // Conversion AliITSRecPoint -> AliITSclusterV2 for the ITS 
434   // subdetector indexed by idx 
435   //------------------------------------------------------------
436   TClonesArray &cl=*clusters;
437   Int_t ncl=points->GetEntriesFast();
438   for (Int_t i=0; i<ncl; i++) {
439     AliITSRecPoint *p = (AliITSRecPoint *)points->UncheckedAt(i);
440     Float_t lp[5];
441     lp[0]=-(-p->GetDetLocalX()+fYshift[idx]); if (idx<=fLastSPD1) lp[0]*=-1; //SPD1
442     lp[1]=  -p->GetZ()+fZshift[idx];
443     lp[2]=p->GetSigmaDetLocX2();
444     lp[3]=p->GetSigmaZ2();
445     lp[4]=p->GetQ()*36./23333.;  //electrons -> ADC
446     Int_t lab[4]; 
447     lab[0]=p->GetLabel(0); lab[1]=p->GetLabel(1); lab[2]=p->GetLabel(2);
448     lab[3]=fNdet[idx];
449     CheckLabels(lab);
450     Int_t dummy[3]={0,0,0};
451     new (cl[i]) AliITSclusterV2(lab,lp, dummy);
452   }  
453
454
455 //***********************************
456
457
458 void AliITSclustererV2:: 
459 FindCluster(Int_t k,Int_t maxz,AliBin *bins,Int_t &n,Int_t *idx) {
460   //------------------------------------------------------------
461   // returns an array of indices of digits belonging to the cluster
462   // (needed when the segmentation is not regular) 
463   //------------------------------------------------------------
464   if (n<200) idx[n++]=bins[k].GetIndex();
465   bins[k].Use();
466
467   if (bins[k-maxz].IsNotUsed()) FindCluster(k-maxz,maxz,bins,n,idx);
468   if (bins[k-1   ].IsNotUsed()) FindCluster(k-1   ,maxz,bins,n,idx);
469   if (bins[k+maxz].IsNotUsed()) FindCluster(k+maxz,maxz,bins,n,idx);
470   if (bins[k+1   ].IsNotUsed()) FindCluster(k+1   ,maxz,bins,n,idx);
471   /*
472   if (bins[k-maxz-1].IsNotUsed()) FindCluster(k-maxz-1,maxz,bins,n,idx);
473   if (bins[k-maxz+1].IsNotUsed()) FindCluster(k-maxz+1,maxz,bins,n,idx);
474   if (bins[k+maxz-1].IsNotUsed()) FindCluster(k+maxz-1,maxz,bins,n,idx);
475   if (bins[k+maxz+1].IsNotUsed()) FindCluster(k+maxz+1,maxz,bins,n,idx);
476   */
477 }
478
479 void AliITSclustererV2::
480 FindClustersSPD(const TClonesArray *digits, TClonesArray *clusters) {
481   //------------------------------------------------------------
482   // Actual SPD cluster finder
483   //------------------------------------------------------------
484   Int_t kNzBins = fNzSPD + 2;
485   const Int_t kMAXBIN=kNzBins*(fNySPD+2);
486
487   Int_t ndigits=digits->GetEntriesFast();
488   AliBin *bins=new AliBin[kMAXBIN];
489
490   Int_t k;
491   AliITSdigitSPD *d=0;
492   for (k=0; k<ndigits; k++) {
493      d=(AliITSdigitSPD*)digits->UncheckedAt(k);
494      Int_t i=d->GetCoord2()+1;   //y
495      Int_t j=d->GetCoord1()+1;
496      bins[i*kNzBins+j].SetIndex(k);
497      bins[i*kNzBins+j].SetMask(1);
498   }
499    
500   Int_t n=0; TClonesArray &cl=*clusters;
501   for (k=0; k<kMAXBIN; k++) {
502      if (!bins[k].IsNotUsed()) continue;
503      Int_t ni=0, idx[200];
504      FindCluster(k,kNzBins,bins,ni,idx);
505      if (ni==200) {
506         Info("FindClustersSPD","Too big cluster !"); 
507         continue;
508      }
509      Int_t milab[10];
510      for (Int_t ilab=0;ilab<10;ilab++){
511        milab[ilab]=-2;
512      }
513
514      d=(AliITSdigitSPD*)digits->UncheckedAt(idx[0]);
515      Int_t ymin=d->GetCoord2(),ymax=ymin;
516      Int_t zmin=d->GetCoord1(),zmax=zmin;
517
518      for (Int_t l=0; l<ni; l++) {
519         d=(AliITSdigitSPD*)digits->UncheckedAt(idx[l]);
520
521         if (ymin > d->GetCoord2()) ymin=d->GetCoord2();
522         if (ymax < d->GetCoord2()) ymax=d->GetCoord2();
523         if (zmin > d->GetCoord1()) zmin=d->GetCoord1();
524         if (zmax < d->GetCoord1()) zmax=d->GetCoord1();
525         // MI addition - find all labels in cluster
526         for (Int_t dlab=0;dlab<10;dlab++){
527           Int_t digitlab = (d->GetTracks())[dlab];
528           if (digitlab<0) continue;
529           AddLabel(milab,digitlab);       
530         }
531         if (milab[9]>0) CheckLabels2(milab);
532      }
533      CheckLabels2(milab);
534      //
535      //Int_t idy = (fNlayer[fI]==0)? 2:3; 
536      //for (Int_t iz=zmin; iz<=zmax;iz+=2)
537      //Int_t idy = (ymax-ymin)/4.; // max 2 clusters
538      Int_t idy = 0; // max 2 clusters
539      if (fNlayer[fI]==0 &&idy<3) idy=3;
540      if (fNlayer[fI]==1 &&idy<4) idy=4; 
541      Int_t idz =3;
542      for (Int_t iz=zmin; iz<=zmax;iz+=idz)
543        for (Int_t iy=ymin; iy<=ymax;iy+=idy){
544          //
545          Int_t nodigits =0;
546          Float_t y=0.,z=0.,q=0.;         
547          for (Int_t l=0; l<ni; l++) {
548            d=(AliITSdigitSPD*)digits->UncheckedAt(idx[l]);
549            if (zmax-zmin>=idz || ymax-ymin>=idy){
550              if (TMath::Abs( d->GetCoord2()-iy)>0.75*idy) continue;
551              if (TMath::Abs( d->GetCoord1()-iz)>0.75*idz) continue;
552            }
553            nodigits++;
554            Float_t qq=d->GetSignal();
555            y+=qq*fYSPD[d->GetCoord2()]; z+=qq*fZSPD[d->GetCoord1()]; q+=qq;   
556           
557          }     
558          if (nodigits==0) continue;
559          y/=q; z/=q;
560          y-=fHwSPD; z-=fHlSPD;
561          
562          Float_t lp[5];
563          lp[0]=-(-y+fYshift[fI]); if (fI<=fLastSPD1) lp[0]=-lp[0];
564          lp[1]=  -z+fZshift[fI];
565          // Float_t factor=TMath::Max(double(ni-3.),1.5);
566          Float_t factory=TMath::Max(ymax-ymin,1);
567          Float_t factorz=TMath::Max(zmax-zmin,1);
568          factory*= factory;
569          factorz*= factorz;     
570          //lp[2]= (fYpitchSPD*fYpitchSPD/12.)*factory;
571          //lp[3]= (fZ1pitchSPD*fZ1pitchSPD/12.)*factorz;
572          lp[2]= (fYpitchSPD*fYpitchSPD/12.);
573          lp[3]= (fZ1pitchSPD*fZ1pitchSPD/12.);
574          //lp[4]= q;
575          lp[4]= (zmax-zmin+1)*100 + (ymax-ymin+1);
576          
577          milab[3]=fNdet[fI];
578          Int_t info[3] = {ymax-ymin+1,zmax-zmin+1,fNlayer[fI]};
579          new (cl[n]) AliITSclusterV2(milab,lp,info); n++;        
580        }
581   }
582   
583   delete [] bins;
584 }
585
586 void AliITSclustererV2::FindClustersSPD(AliITSRawStream* input, 
587                                         TClonesArray** clusters) 
588 {
589   //------------------------------------------------------------
590   // Actual SPD cluster finder for raw data
591   //------------------------------------------------------------
592
593   Int_t nClustersSPD = 0;
594   Int_t kNzBins = fNzSPD + 2;
595   Int_t kNyBins = fNySPD + 2;
596   Int_t kMaxBin = kNzBins * kNyBins;
597   AliBin *binsSPD = new AliBin[kMaxBin];
598   AliBin *binsSPDInit = new AliBin[kMaxBin];
599   AliBin *bins = NULL;
600
601   // read raw data input stream
602   while (kTRUE) {
603     Bool_t next = input->Next();
604     if (!next || input->IsNewModule()) {
605       Int_t iModule = input->GetPrevModuleID();
606
607       // when all data from a module was read, search for clusters
608       if (bins) { 
609         clusters[iModule] = new TClonesArray("AliITSclusterV2");
610         Int_t nClusters = 0;
611
612         for (Int_t iBin = 0; iBin < kMaxBin; iBin++) {
613           if (bins[iBin].IsUsed()) continue;
614           Int_t nBins = 0;
615           Int_t idxBins[200];
616           FindCluster(iBin, kNzBins, bins, nBins, idxBins);
617           if (nBins == 200) {
618             Error("FindClustersSPD", "SPD: Too big cluster !\n"); 
619             continue;
620           }
621
622           Int_t label[4]; 
623           label[0] = -2;
624           label[1] = -2;
625           label[2] = -2;
626 //        label[3] = iModule;
627           label[3] = fNdet[iModule];
628
629           Int_t ymin = (idxBins[0] / kNzBins) - 1;
630           Int_t ymax = ymin;
631           Int_t zmin = (idxBins[0] % kNzBins) - 1;
632           Int_t zmax = zmin;
633           for (Int_t idx = 0; idx < nBins; idx++) {
634             Int_t iy = (idxBins[idx] / kNzBins) - 1;
635             Int_t iz = (idxBins[idx] % kNzBins) - 1;
636             if (ymin > iy) ymin = iy;
637             if (ymax < iy) ymax = iy;
638             if (zmin > iz) zmin = iz;
639             if (zmax < iz) zmax = iz;
640           }
641
642           Int_t idy = 0; // max 2 clusters
643           if ((iModule <= fLastSPD1) &&idy<3) idy=3;
644           if ((iModule > fLastSPD1) &&idy<4) idy=4; 
645           Int_t idz =3;
646           for (Int_t iiz=zmin; iiz<=zmax;iiz+=idz)
647             for (Int_t iiy=ymin; iiy<=ymax;iiy+=idy){
648               //
649               Int_t ndigits =0;
650               Float_t y=0.,z=0.,q=0.;    
651               for (Int_t idx = 0; idx < nBins; idx++) {
652                 Int_t iy = (idxBins[idx] / kNzBins) - 1;
653                 Int_t iz = (idxBins[idx] % kNzBins) - 1;
654                 if (zmax-zmin>=idz || ymax-ymin>=idy){
655                   if (TMath::Abs(iy-iiy)>0.75*idy) continue;
656                   if (TMath::Abs(iz-iiz)>0.75*idz) continue;
657                 }
658                 ndigits++;
659                 Float_t qBin = bins[idxBins[idx]].GetQ();
660                 y += qBin * fYSPD[iy]; 
661                 z += qBin * fZSPD[iz]; 
662                 q += qBin;   
663               }
664               if (ndigits==0) continue;
665               y /= q; 
666               z /= q;
667               y -= fHwSPD; 
668               z -= fHlSPD;
669
670               Float_t hit[5];  // y, z, sigma(y)^2, sigma(z)^2, charge
671               hit[0] = -(-y+fYshift[iModule]); 
672               if (iModule <= fLastSPD1) hit[0] = -hit[0];
673               hit[1] = -z+fZshift[iModule];
674               hit[2] = fYpitchSPD*fYpitchSPD/12.;
675               hit[3] = fZ1pitchSPD*fZ1pitchSPD/12.;
676               //          hit[4] = q;
677               hit[4] = (zmax-zmin+1)*100 + (ymax-ymin+1);
678               //          CheckLabels(label);
679               Int_t info[3]={ymax-ymin+1,zmax-zmin+1,fNlayer[iModule]};
680               new (clusters[iModule]->AddrAt(nClusters)) 
681                 AliITSclusterV2(label, hit,info); 
682               nClusters++;
683             }
684         }
685
686         nClustersSPD += nClusters;
687         bins = NULL;
688       }
689
690       if (!next) break;
691       bins = binsSPD;
692       memcpy(binsSPD,binsSPDInit,sizeof(AliBin)*kMaxBin);
693     }
694
695     // fill the current digit into the bins array
696     if(bins){
697       Int_t index = (input->GetCoord2()+1) * kNzBins + (input->GetCoord1()+1);
698       bins[index].SetIndex(index);
699       bins[index].SetMask(1);
700       bins[index].SetQ(1);
701     }
702   }
703
704   delete [] binsSPDInit;
705   delete [] binsSPD;
706
707   Info("FindClustersSPD", "found clusters in ITS SPD: %d", nClustersSPD);
708 }
709
710
711 Bool_t AliITSclustererV2::IsMaximum(Int_t k,Int_t max,const AliBin *bins) {
712   //------------------------------------------------------------
713   //is this a local maximum ?
714   //------------------------------------------------------------
715   UShort_t q=bins[k].GetQ();
716   if (q==1023) return kFALSE;
717   if (bins[k-max].GetQ() > q) return kFALSE;
718   if (bins[k-1  ].GetQ() > q) return kFALSE; 
719   if (bins[k+max].GetQ() > q) return kFALSE; 
720   if (bins[k+1  ].GetQ() > q) return kFALSE; 
721   if (bins[k-max-1].GetQ() > q) return kFALSE;
722   if (bins[k+max-1].GetQ() > q) return kFALSE; 
723   if (bins[k+max+1].GetQ() > q) return kFALSE; 
724   if (bins[k-max+1].GetQ() > q) return kFALSE;
725   return kTRUE; 
726 }
727
728 void AliITSclustererV2::
729 FindPeaks(Int_t k,Int_t max,AliBin *b,Int_t *idx,UInt_t *msk,Int_t& n) {
730   //------------------------------------------------------------
731   //find local maxima
732   //------------------------------------------------------------
733   if (n<31)
734   if (IsMaximum(k,max,b)) {
735     idx[n]=k; msk[n]=(2<<n);
736     n++;
737   }
738   b[k].SetMask(0);
739   if (b[k-max].GetMask()&1) FindPeaks(k-max,max,b,idx,msk,n);
740   if (b[k-1  ].GetMask()&1) FindPeaks(k-1  ,max,b,idx,msk,n);
741   if (b[k+max].GetMask()&1) FindPeaks(k+max,max,b,idx,msk,n);
742   if (b[k+1  ].GetMask()&1) FindPeaks(k+1  ,max,b,idx,msk,n);
743 }
744
745 void AliITSclustererV2::
746 MarkPeak(Int_t k, Int_t max, AliBin *bins, UInt_t m) {
747   //------------------------------------------------------------
748   //mark this peak
749   //------------------------------------------------------------
750   UShort_t q=bins[k].GetQ();
751
752   bins[k].SetMask(bins[k].GetMask()|m); 
753
754   if (bins[k-max].GetQ() <= q)
755      if ((bins[k-max].GetMask()&m) == 0) MarkPeak(k-max,max,bins,m);
756   if (bins[k-1  ].GetQ() <= q)
757      if ((bins[k-1  ].GetMask()&m) == 0) MarkPeak(k-1  ,max,bins,m);
758   if (bins[k+max].GetQ() <= q)
759      if ((bins[k+max].GetMask()&m) == 0) MarkPeak(k+max,max,bins,m);
760   if (bins[k+1  ].GetQ() <= q)
761      if ((bins[k+1  ].GetMask()&m) == 0) MarkPeak(k+1  ,max,bins,m);
762 }
763
764 void AliITSclustererV2::
765 MakeCluster(Int_t k,Int_t max,AliBin *bins,UInt_t m,AliITSclusterV2 &c) {
766   //------------------------------------------------------------
767   //make cluster using digits of this peak
768   //------------------------------------------------------------
769   Float_t q=(Float_t)bins[k].GetQ();
770   Int_t i=k/max, j=k-i*max;
771
772   c.SetQ(c.GetQ()+q);
773   c.SetY(c.GetY()+i*q); 
774   c.SetZ(c.GetZ()+j*q); 
775   c.SetSigmaY2(c.GetSigmaY2()+i*i*q);
776   c.SetSigmaZ2(c.GetSigmaZ2()+j*j*q);
777
778   bins[k].SetMask(0xFFFFFFFE);
779   
780   if (bins[k-max].GetMask() == m) MakeCluster(k-max,max,bins,m,c);
781   if (bins[k-1  ].GetMask() == m) MakeCluster(k-1  ,max,bins,m,c);
782   if (bins[k+max].GetMask() == m) MakeCluster(k+max,max,bins,m,c);
783   if (bins[k+1  ].GetMask() == m) MakeCluster(k+1  ,max,bins,m,c);
784 }
785
786 void AliITSclustererV2::
787 FindClustersSDD(AliBin* bins[2], Int_t nMaxBin, Int_t nzBins, 
788                 const TClonesArray *digits, TClonesArray *clusters) {
789   //------------------------------------------------------------
790   // Actual SDD cluster finder
791   //------------------------------------------------------------
792   Int_t ncl=0; TClonesArray &cl=*clusters;
793   for (Int_t s=0; s<2; s++)
794     for (Int_t i=0; i<nMaxBin; i++) {
795       if (bins[s][i].IsUsed()) continue;
796       Int_t idx[32]; UInt_t msk[32]; Int_t npeaks=0;
797       FindPeaks(i, nzBins, bins[s], idx, msk, npeaks);
798
799       if (npeaks>30) continue;
800       if (npeaks==0) continue;
801
802       Int_t k,l;
803       for (k=0; k<npeaks-1; k++){//mark adjacent peaks
804         if (idx[k] < 0) continue; //this peak is already removed
805         for (l=k+1; l<npeaks; l++) {
806            if (idx[l] < 0) continue; //this peak is already removed
807            Int_t ki=idx[k]/nzBins, kj=idx[k] - ki*nzBins;
808            Int_t li=idx[l]/nzBins, lj=idx[l] - li*nzBins;
809            Int_t di=TMath::Abs(ki - li);
810            Int_t dj=TMath::Abs(kj - lj);
811            if (di>1 || dj>1) continue;
812            if (bins[s][idx[k]].GetQ() > bins[s][idx[l]].GetQ()) {
813               msk[l]=msk[k];
814               idx[l]*=-1;
815            } else {
816               msk[k]=msk[l];
817               idx[k]*=-1;
818               break;
819            } 
820         }
821       }
822
823       for (k=0; k<npeaks; k++) {
824         MarkPeak(TMath::Abs(idx[k]), nzBins, bins[s], msk[k]);
825       }
826         
827       for (k=0; k<npeaks; k++) {
828          if (idx[k] < 0) continue; //removed peak
829          AliITSclusterV2 c;
830          MakeCluster(idx[k], nzBins, bins[s], msk[k], c);
831          //mi change
832          Int_t milab[10];
833          for (Int_t ilab=0;ilab<10;ilab++){
834            milab[ilab]=-2;
835          }
836          Int_t maxi=0,mini=0,maxj=0,minj=0;
837          //AliBin *bmax=&bins[s][idx[k]];
838          //Float_t max = TMath::Max(TMath::Abs(bmax->GetQ())/5.,3.);
839          Float_t max=3;
840          for (Int_t di=-2; di<=2;di++)
841            for (Int_t dj=-3;dj<=3;dj++){
842              Int_t index = idx[k]+di+dj*nzBins;
843              if (index<0) continue;
844              if (index>=nMaxBin) continue;
845              AliBin *b=&bins[s][index];
846              if (TMath::Abs(b->GetQ())>max){
847                if (di>maxi) maxi=di;
848                if (di<mini) mini=di;
849                if (dj>maxj) maxj=dj;
850                if (dj<minj) minj=dj;
851                //
852                if(digits) {
853                  if (TMath::Abs(di)<2&&TMath::Abs(dj)<2){
854                    AliITSdigitSDD* d=(AliITSdigitSDD*)digits->UncheckedAt(b->GetIndex());
855                    for (Int_t itrack=0;itrack<10;itrack++){
856                      Int_t track = (d->GetTracks())[itrack];
857                      if (track>=0) {
858                        AddLabel(milab, track); 
859                      }
860                    }
861                  }
862                }
863              }
864            }
865          
866          /* 
867             Float_t s2 = c.GetSigmaY2()/c.GetQ() - c.GetY()*c.GetY();
868             Float_t w=par->GetPadPitchWidth(sec);
869             c.SetSigmaY2(s2);
870             if (s2 != 0.) {
871             c.SetSigmaY2(c.GetSigmaY2()*0.108);
872             if (sec<par->GetNInnerSector()) c.SetSigmaY2(c.GetSigmaY2()*2.07);
873             }    
874             s2 = c.GetSigmaZ2()/c.GetQ() - c.GetZ()*c.GetZ();
875             w=par->GetZWidth();
876             c.SetSigmaZ2(s2);
877             
878             if (s2 != 0.) {
879             c.SetSigmaZ2(c.GetSigmaZ2()*0.169);
880             if (sec<par->GetNInnerSector()) c.SetSigmaZ2(c.GetSigmaZ2()*1.77);
881             }
882          */
883
884          Float_t y=c.GetY(),z=c.GetZ(), q=c.GetQ();
885          y/=q; z/=q;
886          //
887          //Float_t s2 = c.GetSigmaY2()/c.GetQ() - y*y;
888          // c.SetSigmaY2(s2);
889          //s2 = c.GetSigmaZ2()/c.GetQ() - z*z;
890          //c.SetSigmaZ2(s2);
891          //
892          y=(y-0.5)*fYpitchSDD;
893          y-=fHwSDD;
894          y-=fYoffSDD;  //delay ?
895          if (s) y=-y;
896
897          z=(z-0.5)*fZpitchSDD;
898          z-=fHlSDD;
899
900          y=-(-y+fYshift[fI]);
901          z=  -z+fZshift[fI];
902
903          q/=12.7;  //this WAS consistent with SSD. To be reassessed 
904                    // 23-MAR-2007
905          Float_t hit[5] = {y, z, 0.0030*0.0030, 0.0020*0.0020, q};
906          Int_t  info[3] = {maxj-minj+1, maxi-mini+1, fNlayer[fI]};
907
908          if (c.GetQ() < 20.) continue; //noise cluster
909          
910          if (digits) {    
911            //      AliBin *b=&bins[s][idx[k]];
912            //      AliITSdigitSDD* d=(AliITSdigitSDD*)digits->UncheckedAt(b->GetIndex());
913            {
914              //Int_t lab[3];
915              //lab[0]=(d->GetTracks())[0];
916              //lab[1]=(d->GetTracks())[1];
917              //lab[2]=(d->GetTracks())[2];
918              //CheckLabels(lab);
919              CheckLabels2(milab); 
920            }
921          }
922          milab[3]=fNdet[fI];
923
924          AliITSclusterV2 *cc = new (cl[ncl]) AliITSclusterV2(milab,hit,info);
925          cc->SetType(npeaks); 
926          ncl++;
927       }
928     }
929 }
930
931 void AliITSclustererV2::
932 FindClustersSDD(const TClonesArray *digits, TClonesArray *clusters) {
933   //------------------------------------------------------------
934   // Actual SDD cluster finder
935   //------------------------------------------------------------
936   Int_t kNzBins = fNzSDD + 2;
937   const Int_t kMAXBIN=kNzBins*(fNySDD+2);
938
939   AliBin *bins[2];
940   bins[0]=new AliBin[kMAXBIN];
941   bins[1]=new AliBin[kMAXBIN];
942
943   AliITSdigitSDD *d=0;
944   Int_t i, ndigits=digits->GetEntriesFast();
945   for (i=0; i<ndigits; i++) {
946      d=(AliITSdigitSDD*)digits->UncheckedAt(i);
947      Int_t y=d->GetCoord2()+1;   //y
948      Int_t z=d->GetCoord1()+1;   //z
949      Int_t q=d->GetSignal();
950      if (q<3) continue;
951
952      if (z <= fNzSDD) {
953        bins[0][y*kNzBins+z].SetQ(q);
954        bins[0][y*kNzBins+z].SetMask(1);
955        bins[0][y*kNzBins+z].SetIndex(i);
956      } else {
957        z-=fNzSDD; 
958        bins[1][y*kNzBins+z].SetQ(q);
959        bins[1][y*kNzBins+z].SetMask(1);
960        bins[1][y*kNzBins+z].SetIndex(i);
961      }
962   }
963   
964   FindClustersSDD(bins, kMAXBIN, kNzBins, digits, clusters);
965
966   delete[] bins[0];
967   delete[] bins[1];
968
969 }
970
971 void AliITSclustererV2::FindClustersSDD(AliITSRawStream* input, 
972                                         TClonesArray** clusters) 
973 {
974   //------------------------------------------------------------
975   // Actual SDD cluster finder for raw data
976   //------------------------------------------------------------
977   Int_t nClustersSDD = 0;
978   Int_t kNzBins = fNzSDD + 2;
979   Int_t kMaxBin = kNzBins * (fNySDD+2);
980   AliBin *binsSDDInit = new AliBin[kMaxBin];
981   AliBin *binsSDD1 = new AliBin[kMaxBin];
982   AliBin *binsSDD2 = new AliBin[kMaxBin];
983   AliBin *bins[2] = {NULL, NULL};
984
985   // read raw data input stream
986   while (kTRUE) {
987     Bool_t next = input->Next();
988     if (!next || input->IsNewModule()) {
989       Int_t iModule = input->GetPrevModuleID();
990
991       // when all data from a module was read, search for clusters
992       if (bins[0]) { 
993         clusters[iModule] = new TClonesArray("AliITSclusterV2");
994         fI = iModule;
995         FindClustersSDD(bins, kMaxBin, kNzBins, NULL, clusters[iModule]);
996         Int_t nClusters = clusters[iModule]->GetEntriesFast();
997         nClustersSDD += nClusters;
998         bins[0] = bins[1] = NULL;
999       }
1000
1001       if (!next) break;
1002       bins[0]=binsSDD1;
1003       bins[1]=binsSDD2;
1004       memcpy(binsSDD1,binsSDDInit,sizeof(AliBin)*kMaxBin);
1005       memcpy(binsSDD2,binsSDDInit,sizeof(AliBin)*kMaxBin);
1006     }
1007
1008     // fill the current digit into the bins array
1009     if(input->GetSignal()>=3) {
1010       Int_t iz = input->GetCoord1()+1;
1011       Int_t side = ((iz <= fNzSDD) ? 0 : 1);
1012       iz -= side*fNzSDD;
1013       Int_t index = (input->GetCoord2()+1) * kNzBins + iz;
1014       bins[side][index].SetQ(input->GetSignal());
1015       bins[side][index].SetMask(1);
1016       bins[side][index].SetIndex(index);
1017     }
1018   }
1019
1020   delete[] binsSDD1;
1021   delete[] binsSDD2;
1022   delete[] binsSDDInit;
1023
1024   Info("FindClustersSDD", "found clusters in ITS SDD: %d", nClustersSDD);
1025 }
1026
1027
1028
1029 void AliITSclustererV2::
1030 FindClustersSSD(Ali1Dcluster* neg, Int_t nn, 
1031                 Ali1Dcluster* pos, Int_t np,
1032                 TClonesArray *clusters) {
1033   //------------------------------------------------------------
1034   // Actual SSD cluster finder
1035   //------------------------------------------------------------
1036   TClonesArray &cl=*clusters;
1037   //
1038   Float_t tanp=fTanP, tann=fTanN;
1039   if (fI>fLastSSD1) {tann=fTanP; tanp=fTanN;}
1040   Int_t idet=fNdet[fI];
1041   Int_t ncl=0;
1042   //
1043   Int_t negativepair[30000];
1044   Int_t cnegative[3000];  
1045   Int_t cused1[3000];
1046   Int_t positivepair[30000];
1047   Int_t cpositive[3000];
1048   Int_t cused2[3000];
1049   for (Int_t i=0;i<3000;i++) {cnegative[i]=0; cused1[i]=0;}
1050   for (Int_t i=0;i<3000;i++) {cpositive[i]=0; cused2[i]=0;}
1051   for (Int_t i=0;i<30000;i++){negativepair[i]=positivepair[i]=0;}
1052   static Short_t pairs[1000][1000];
1053   memset(pairs,0,sizeof(Short_t)*1000000);
1054 //   Short_t ** pairs = new Short_t*[1000];
1055 //   for (Int_t i=0; i<1000; i++) {
1056 //     pairs[i] = new Short_t[1000];
1057 //     memset(pairs[i],0,sizeof(Short_t)*1000);
1058 //   }  
1059   //
1060   // find available pairs
1061   //
1062   for (Int_t i=0; i<np; i++) {
1063     Float_t yp=pos[i].GetY()*fYpitchSSD; 
1064     if (pos[i].GetQ()<3) continue;
1065     for (Int_t j=0; j<nn; j++) {
1066       if (neg[j].GetQ()<3) continue;
1067       Float_t yn=neg[j].GetY()*fYpitchSSD;
1068       Float_t zt=(2*fHlSSD*tanp + yp - yn)/(tann+tanp);
1069       Float_t yt=yn + tann*zt;
1070       zt-=fHlSSD; yt-=fHwSSD;
1071       if (TMath::Abs(yt)<fHwSSD+0.01)
1072       if (TMath::Abs(zt)<fHlSSD+0.01*(neg[j].GetNd()+pos[i].GetNd())) {
1073         negativepair[i*10+cnegative[i]] =j;  //index
1074         positivepair[j*10+cpositive[j]] =i;
1075         cnegative[i]++;  //counters
1076         cpositive[j]++; 
1077         pairs[i][j]=100;
1078       }
1079     }
1080   }
1081   //
1082   for (Int_t i=0; i<np; i++) {
1083     Float_t yp=pos[i].GetY()*fYpitchSSD; 
1084     if (pos[i].GetQ()<3) continue;
1085     for (Int_t j=0; j<nn; j++) {
1086       if (neg[j].GetQ()<3) continue;
1087       if (cpositive[j]&&cnegative[i]) continue;
1088       Float_t yn=neg[j].GetY()*fYpitchSSD;
1089       Float_t zt=(2*fHlSSD*tanp + yp - yn)/(tann+tanp);
1090       Float_t yt=yn + tann*zt;
1091       zt-=fHlSSD; yt-=fHwSSD;
1092       if (TMath::Abs(yt)<fHwSSD+0.1)
1093       if (TMath::Abs(zt)<fHlSSD+0.15) {
1094         if (cnegative[i]==0) pos[i].SetNd(100);  // not available pair
1095         if (cpositive[j]==0) neg[j].SetNd(100);  // not available pair
1096         negativepair[i*10+cnegative[i]] =j;  //index
1097         positivepair[j*10+cpositive[j]] =i;
1098         cnegative[i]++;  //counters
1099         cpositive[j]++; 
1100         pairs[i][j]=100;
1101       }
1102     }
1103   }
1104   //
1105   Float_t lp[5];
1106   Int_t milab[10];
1107   Double_t ratio;
1108   
1109   //
1110   // sign gold tracks
1111   //
1112   for (Int_t ip=0;ip<np;ip++){
1113     Float_t ybest=1000,zbest=1000,qbest=0;
1114     //
1115     // select gold clusters
1116     if ( (cnegative[ip]==1) && cpositive[negativepair[10*ip]]==1){ 
1117       Float_t yp=pos[ip].GetY()*fYpitchSSD; 
1118       Int_t j = negativepair[10*ip];      
1119       ratio = (pos[ip].GetQ()-neg[j].GetQ())/(pos[ip].GetQ()+neg[j].GetQ());
1120       //
1121       Float_t yn=neg[j].GetY()*fYpitchSSD;
1122       Float_t zt=(2*fHlSSD*tanp + yp - yn)/(tann+tanp);
1123       Float_t yt=yn + tann*zt;
1124       zt-=fHlSSD; yt-=fHwSSD;
1125       ybest=yt; zbest=zt; 
1126       qbest=0.5*(pos[ip].GetQ()+neg[j].GetQ());
1127       lp[0]=-(-ybest+fYshift[fI]);
1128       lp[1]=  -zbest+fZshift[fI];
1129       lp[2]=0.0025*0.0025;  //SigmaY2
1130       lp[3]=0.110*0.110;  //SigmaZ2
1131       
1132       lp[4]=qbest;        //Q
1133       for (Int_t ilab=0;ilab<10;ilab++) milab[ilab]=-2;
1134       for (Int_t ilab=0;ilab<3;ilab++){
1135         milab[ilab] = pos[ip].GetLabel(ilab);
1136         milab[ilab+3] = neg[j].GetLabel(ilab);
1137       }
1138       //
1139       CheckLabels2(milab);
1140       milab[3]=(((ip<<10) + j)<<10) + idet; // pos|neg|det
1141       Int_t info[3] = {pos[ip].GetNd(),neg[j].GetNd(),fNlayer[fI]};
1142       AliITSclusterV2 * cl2 = new (cl[ncl]) AliITSclusterV2(milab,lp,info);
1143       ncl++;
1144       cl2->SetChargeRatio(ratio);       
1145       cl2->SetType(1);
1146       pairs[ip][j]=1;
1147       if ((pos[ip].GetNd()+neg[j].GetNd())>6){ //multi cluster
1148         cl2->SetType(2);
1149         pairs[ip][j]=2;
1150       }
1151       cused1[ip]++;
1152       cused2[j]++;
1153     }
1154   }
1155     
1156   for (Int_t ip=0;ip<np;ip++){
1157     Float_t ybest=1000,zbest=1000,qbest=0;
1158     //
1159     //
1160     // select "silber" cluster
1161     if ( cnegative[ip]==1 && cpositive[negativepair[10*ip]]==2){
1162       Int_t in  = negativepair[10*ip];
1163       Int_t ip2 = positivepair[10*in];
1164       if (ip2==ip) ip2 =  positivepair[10*in+1];
1165       Float_t pcharge = pos[ip].GetQ()+pos[ip2].GetQ();
1166       if (TMath::Abs(pcharge-neg[in].GetQ())<10){
1167         //
1168         // add first pair
1169         if (pairs[ip][in]==100){  //
1170           Float_t yp=pos[ip].GetY()*fYpitchSSD; 
1171           Float_t yn=neg[in].GetY()*fYpitchSSD;
1172           Float_t zt=(2*fHlSSD*tanp + yp - yn)/(tann+tanp);
1173           Float_t yt=yn + tann*zt;
1174           zt-=fHlSSD; yt-=fHwSSD;
1175           ybest =yt;  zbest=zt; 
1176           qbest =pos[ip].GetQ();
1177           lp[0]=-(-ybest+fYshift[fI]);
1178           lp[1]=  -zbest+fZshift[fI];
1179           lp[2]=0.0025*0.0025;  //SigmaY2
1180           lp[3]=0.110*0.110;  //SigmaZ2
1181           
1182           lp[4]=qbest;        //Q
1183           for (Int_t ilab=0;ilab<10;ilab++) milab[ilab]=-2;
1184           for (Int_t ilab=0;ilab<3;ilab++){
1185             milab[ilab] = pos[ip].GetLabel(ilab);
1186             milab[ilab+3] = neg[in].GetLabel(ilab);
1187           }
1188           //
1189           CheckLabels2(milab);
1190           ratio = (pos[ip].GetQ()-neg[in].GetQ())/(pos[ip].GetQ()+neg[in].GetQ());
1191           milab[3]=(((ip<<10) + in)<<10) + idet; // pos|neg|det
1192           Int_t info[3] = {pos[ip].GetNd(),neg[in].GetNd(),fNlayer[fI]};
1193           AliITSclusterV2 * cl2 = new (cl[ncl]) AliITSclusterV2(milab,lp,info);
1194           ncl++;
1195           cl2->SetChargeRatio(ratio);           
1196           cl2->SetType(5);
1197           pairs[ip][in] = 5;
1198           if ((pos[ip].GetNd()+neg[in].GetNd())>6){ //multi cluster
1199             cl2->SetType(6);
1200             pairs[ip][in] = 6;
1201           }
1202         }
1203         //
1204         // add second pair
1205         
1206         //      if (!(cused1[ip2] || cused2[in])){  //
1207         if (pairs[ip2][in]==100){
1208           Float_t yp=pos[ip2].GetY()*fYpitchSSD;
1209           Float_t yn=neg[in].GetY()*fYpitchSSD;
1210           Float_t zt=(2*fHlSSD*tanp + yp - yn)/(tann+tanp);
1211           Float_t yt=yn + tann*zt;
1212           zt-=fHlSSD; yt-=fHwSSD;
1213           ybest =yt;  zbest=zt; 
1214           qbest =pos[ip2].GetQ();
1215           lp[0]=-(-ybest+fYshift[fI]);
1216           lp[1]=  -zbest+fZshift[fI];
1217           lp[2]=0.0025*0.0025;  //SigmaY2
1218           lp[3]=0.110*0.110;  //SigmaZ2
1219           
1220           lp[4]=qbest;        //Q
1221           for (Int_t ilab=0;ilab<10;ilab++) milab[ilab]=-2;
1222           for (Int_t ilab=0;ilab<3;ilab++){
1223             milab[ilab] = pos[ip2].GetLabel(ilab);
1224             milab[ilab+3] = neg[in].GetLabel(ilab);
1225           }
1226           //
1227           CheckLabels2(milab);
1228           ratio = (pos[ip2].GetQ()-neg[in].GetQ())/(pos[ip2].GetQ()+neg[in].GetQ());
1229           milab[3]=(((ip2<<10) + in)<<10) + idet; // pos|neg|det
1230           Int_t info[3] = {pos[ip2].GetNd(),neg[in].GetNd(),fNlayer[fI]};
1231           AliITSclusterV2 *cl2 = new (cl[ncl]) AliITSclusterV2(milab,lp,info);
1232           ncl++;
1233           cl2->SetChargeRatio(ratio);           
1234           cl2->SetType(5);
1235           pairs[ip2][in] =5;
1236           if ((pos[ip2].GetNd()+neg[in].GetNd())>6){ //multi cluster
1237             cl2->SetType(6);
1238             pairs[ip2][in] =6;
1239           }
1240         }       
1241         cused1[ip]++;
1242         cused1[ip2]++;
1243         cused2[in]++;
1244       }
1245     }    
1246   }
1247   
1248   //  
1249   for (Int_t jn=0;jn<nn;jn++){
1250     if (cused2[jn]) continue;
1251     Float_t ybest=1000,zbest=1000,qbest=0;
1252     // select "silber" cluster
1253     if ( cpositive[jn]==1 && cnegative[positivepair[10*jn]]==2){
1254       Int_t ip  = positivepair[10*jn];
1255       Int_t jn2 = negativepair[10*ip];
1256       if (jn2==jn) jn2 =  negativepair[10*ip+1];
1257       Float_t pcharge = neg[jn].GetQ()+neg[jn2].GetQ();
1258       //
1259       if (TMath::Abs(pcharge-pos[ip].GetQ())<10){
1260         //
1261         // add first pair
1262         //      if (!(cused1[ip]||cused2[jn])){
1263         if (pairs[ip][jn]==100){
1264           Float_t yn=neg[jn].GetY()*fYpitchSSD; 
1265           Float_t yp=pos[ip].GetY()*fYpitchSSD;
1266           Float_t zt=(2*fHlSSD*tanp + yp - yn)/(tann+tanp);
1267           Float_t yt=yn + tann*zt;
1268           zt-=fHlSSD; yt-=fHwSSD;
1269           ybest =yt;  zbest=zt; 
1270           qbest =neg[jn].GetQ();
1271           lp[0]=-(-ybest+fYshift[fI]);
1272           lp[1]=  -zbest+fZshift[fI];
1273           lp[2]=0.0025*0.0025;  //SigmaY2
1274           lp[3]=0.110*0.110;  //SigmaZ2
1275           
1276           lp[4]=qbest;        //Q
1277           for (Int_t ilab=0;ilab<10;ilab++) milab[ilab]=-2;
1278           for (Int_t ilab=0;ilab<3;ilab++){
1279             milab[ilab] = pos[ip].GetLabel(ilab);
1280             milab[ilab+3] = neg[jn].GetLabel(ilab);
1281           }
1282           //
1283           CheckLabels2(milab);
1284           ratio = (pos[ip].GetQ()-neg[jn].GetQ())/(pos[ip].GetQ()+neg[jn].GetQ());
1285           milab[3]=(((ip<<10) + jn)<<10) + idet; // pos|neg|det
1286           Int_t info[3] = {pos[ip].GetNd(),neg[jn].GetNd(),fNlayer[fI]};
1287           AliITSclusterV2 * cl2 = new (cl[ncl]) AliITSclusterV2(milab,lp,info);
1288           ncl++;
1289           cl2->SetChargeRatio(ratio);           
1290           cl2->SetType(7);
1291           pairs[ip][jn] =7;
1292           if ((pos[ip].GetNd()+neg[jn].GetNd())>6){ //multi cluster
1293             cl2->SetType(8);
1294             pairs[ip][jn]=8;
1295           }
1296         }
1297         //
1298         // add second pair
1299         //      if (!(cused1[ip]||cused2[jn2])){
1300         if (pairs[ip][jn2]==100){
1301           Float_t yn=neg[jn2].GetY()*fYpitchSSD; 
1302           Double_t yp=pos[ip].GetY()*fYpitchSSD; 
1303           Double_t zt=(2*fHlSSD*tanp + yp - yn)/(tann+tanp);
1304           Double_t yt=yn + tann*zt;
1305           zt-=fHlSSD; yt-=fHwSSD;
1306           ybest =yt;  zbest=zt; 
1307           qbest =neg[jn2].GetQ();
1308           lp[0]=-(-ybest+fYshift[fI]);
1309           lp[1]=  -zbest+fZshift[fI];
1310           lp[2]=0.0025*0.0025;  //SigmaY2
1311           lp[3]=0.110*0.110;  //SigmaZ2
1312           
1313           lp[4]=qbest;        //Q
1314           for (Int_t ilab=0;ilab<10;ilab++) milab[ilab]=-2;
1315           for (Int_t ilab=0;ilab<3;ilab++){
1316             milab[ilab] = pos[ip].GetLabel(ilab);
1317             milab[ilab+3] = neg[jn2].GetLabel(ilab);
1318           }
1319           //
1320           CheckLabels2(milab);
1321           ratio = (pos[ip].GetQ()-neg[jn2].GetQ())/(pos[ip].GetQ()+neg[jn2].GetQ());
1322           milab[3]=(((ip<<10) + jn2)<<10) + idet; // pos|neg|det
1323           Int_t info[3] = {pos[ip].GetNd(),neg[jn2].GetNd(),fNlayer[fI]};
1324           AliITSclusterV2* cl2 = new (cl[ncl]) AliITSclusterV2(milab,lp,info);
1325           ncl++;
1326           cl2->SetChargeRatio(ratio);           
1327           pairs[ip][jn2]=7;
1328           cl2->SetType(7);
1329           if ((pos[ip].GetNd()+neg[jn2].GetNd())>6){ //multi cluster
1330             cl2->SetType(8);
1331             pairs[ip][jn2]=8;
1332           }
1333         }
1334         cused1[ip]++;
1335         cused2[jn]++;
1336         cused2[jn2]++;
1337       }
1338     }    
1339   }
1340   
1341   for (Int_t ip=0;ip<np;ip++){
1342     Float_t ybest=1000,zbest=1000,qbest=0;
1343     //
1344     // 2x2 clusters
1345     //
1346     if ( (cnegative[ip]<5) && cpositive[negativepair[10*ip]]<5){ 
1347       Float_t minchargediff =4.;
1348       Int_t j=-1;
1349       for (Int_t di=0;di<cnegative[ip];di++){
1350         Int_t   jc = negativepair[ip*10+di];
1351         Float_t chargedif = pos[ip].GetQ()-neg[jc].GetQ();
1352         if (TMath::Abs(chargedif)<minchargediff){
1353           j =jc;
1354           minchargediff = TMath::Abs(chargedif);
1355         }
1356       }
1357       if (j<0) continue;  // not proper cluster      
1358       Int_t count =0;
1359       for (Int_t di=0;di<cnegative[ip];di++){
1360         Int_t   jc = negativepair[ip*10+di];
1361         Float_t chargedif = pos[ip].GetQ()-neg[jc].GetQ();
1362         if (TMath::Abs(chargedif)<minchargediff+3.) count++;
1363       }
1364       if (count>1) continue;  // more than one "proper" cluster for positive
1365       //
1366       count =0;
1367       for (Int_t dj=0;dj<cpositive[j];dj++){
1368         Int_t   ic  = positivepair[j*10+dj];
1369         Float_t chargedif = pos[ic].GetQ()-neg[j].GetQ();
1370         if (TMath::Abs(chargedif)<minchargediff+3.) count++;
1371       }
1372       if (count>1) continue;  // more than one "proper" cluster for negative
1373       
1374       Int_t jp = 0;
1375       
1376       count =0;
1377       for (Int_t dj=0;dj<cnegative[jp];dj++){
1378         Int_t   ic = positivepair[jp*10+dj];
1379         Float_t chargedif = pos[ic].GetQ()-neg[jp].GetQ();
1380         if (TMath::Abs(chargedif)<minchargediff+4.) count++;
1381       }
1382       if (count>1) continue;   
1383       if (pairs[ip][j]<100) continue;
1384       //
1385       //almost gold clusters
1386       Float_t yp=pos[ip].GetY()*fYpitchSSD; 
1387       Float_t yn=neg[j].GetY()*fYpitchSSD;
1388       Float_t zt=(2*fHlSSD*tanp + yp - yn)/(tann+tanp);
1389       Float_t yt=yn + tann*zt;
1390       zt-=fHlSSD; yt-=fHwSSD;
1391       ybest=yt; zbest=zt; 
1392       qbest=0.5*(pos[ip].GetQ()+neg[j].GetQ());
1393       lp[0]=-(-ybest+fYshift[fI]);
1394       lp[1]=  -zbest+fZshift[fI];
1395       lp[2]=0.0025*0.0025;  //SigmaY2
1396       lp[3]=0.110*0.110;  //SigmaZ2     
1397       lp[4]=qbest;        //Q
1398       for (Int_t ilab=0;ilab<10;ilab++) milab[ilab]=-2;
1399       for (Int_t ilab=0;ilab<3;ilab++){
1400         milab[ilab] = pos[ip].GetLabel(ilab);
1401         milab[ilab+3] = neg[j].GetLabel(ilab);
1402       }
1403       //
1404       CheckLabels2(milab);
1405       ratio = (pos[ip].GetQ()-neg[j].GetQ())/(pos[ip].GetQ()+neg[j].GetQ());
1406       milab[3]=(((ip<<10) + j)<<10) + idet; // pos|neg|det
1407       Int_t info[3] = {pos[ip].GetNd(),neg[j].GetNd(),fNlayer[fI]};
1408       AliITSclusterV2 * cl2 = new (cl[ncl]) AliITSclusterV2(milab,lp,info);
1409       ncl++;
1410       cl2->SetChargeRatio(ratio);       
1411       cl2->SetType(10);
1412       pairs[ip][j]=10;
1413       if ((pos[ip].GetNd()+neg[j].GetNd())>6){ //multi cluster
1414         cl2->SetType(11);
1415         pairs[ip][j]=11;
1416       }
1417       cused1[ip]++;
1418       cused2[j]++;      
1419     }
1420
1421   }
1422   
1423   //  
1424   for (Int_t i=0; i<np; i++) {
1425     Float_t ybest=1000,zbest=1000,qbest=0;
1426     Float_t yp=pos[i].GetY()*fYpitchSSD; 
1427     if (pos[i].GetQ()<3) continue;
1428     for (Int_t j=0; j<nn; j++) {
1429     //    for (Int_t di = 0;di<cpositive[i];di++){
1430     //  Int_t j = negativepair[10*i+di];
1431       if (neg[j].GetQ()<3) continue;
1432       if (cused2[j]||cused1[i]) continue;      
1433       if (pairs[i][j]>0 &&pairs[i][j]<100) continue;
1434       ratio = (pos[i].GetQ()-neg[j].GetQ())/(pos[i].GetQ()+neg[j].GetQ());      
1435       Float_t yn=neg[j].GetY()*fYpitchSSD;
1436       Float_t zt=(2*fHlSSD*tanp + yp - yn)/(tann+tanp);
1437       Float_t yt=yn + tann*zt;
1438       zt-=fHlSSD; yt-=fHwSSD;
1439       if (TMath::Abs(yt)<fHwSSD+0.01)
1440       if (TMath::Abs(zt)<fHlSSD+0.01*(neg[j].GetNd()+pos[i].GetNd())) {
1441         ybest=yt; zbest=zt; 
1442         qbest=0.5*(pos[i].GetQ()+neg[j].GetQ());
1443         lp[0]=-(-ybest+fYshift[fI]);
1444         lp[1]=  -zbest+fZshift[fI];
1445         lp[2]=0.0025*0.0025;  //SigmaY2
1446         lp[3]=0.110*0.110;  //SigmaZ2
1447
1448         lp[4]=qbest;        //Q
1449         for (Int_t ilab=0;ilab<10;ilab++) milab[ilab]=-2;
1450         for (Int_t ilab=0;ilab<3;ilab++){
1451           milab[ilab] = pos[i].GetLabel(ilab);
1452           milab[ilab+3] = neg[j].GetLabel(ilab);
1453         }
1454         //
1455         CheckLabels2(milab);
1456         milab[3]=(((i<<10) + j)<<10) + idet; // pos|neg|det
1457         Int_t info[3] = {pos[i].GetNd(),neg[j].GetNd(),fNlayer[fI]};
1458         AliITSclusterV2 * cl2 = new (cl[ncl]) AliITSclusterV2(milab,lp,info); 
1459         ncl++;
1460         cl2->SetChargeRatio(ratio);
1461         cl2->SetType(100+cpositive[j]+cnegative[i]);
1462         //cl2->SetType(0);
1463         /*
1464           if (pairs[i][j]<100){
1465           printf("problem:- %d\n", pairs[i][j]);
1466           }
1467           if (cnegative[i]<2&&cpositive[j]<2){
1468           printf("problem:- %d\n", pairs[i][j]);
1469           }
1470         */
1471       }
1472     }
1473   }
1474
1475 //   for (Int_t i=0; i<1000; i++) delete [] pairs[i];
1476 //   delete [] pairs;
1477
1478 }
1479
1480
1481 void AliITSclustererV2::
1482 FindClustersSSD(const TClonesArray *alldigits, TClonesArray *clusters) {
1483   //------------------------------------------------------------
1484   // Actual SSD cluster finder
1485   //------------------------------------------------------------
1486   Int_t smaxall=alldigits->GetEntriesFast();
1487   if (smaxall==0) return;
1488   TObjArray *digits = new TObjArray;
1489   for (Int_t i=0;i<smaxall; i++){
1490     AliITSdigitSSD *d=(AliITSdigitSSD*)alldigits->UncheckedAt(i);
1491     if (d->GetSignal()<3) continue;
1492     digits->AddLast(d);
1493   }
1494   Int_t smax = digits->GetEntriesFast();
1495   if (smax==0) return;
1496   
1497   const Int_t mMAX=1000;
1498   Int_t np=0, nn=0; 
1499   Ali1Dcluster pos[mMAX], neg[mMAX];
1500   Float_t y=0., q=0., qmax=0.; 
1501   Int_t lab[4]={-2,-2,-2,-2};
1502   
1503   AliITSdigitSSD *d=(AliITSdigitSSD*)digits->UncheckedAt(0);
1504   q += d->GetSignal();
1505   y += d->GetCoord2()*d->GetSignal();
1506   qmax=d->GetSignal();
1507   lab[0]=d->GetTrack(0); lab[1]=d->GetTrack(1); lab[2]=d->GetTrack(2);
1508   Int_t curr=d->GetCoord2();
1509   Int_t flag=d->GetCoord1();
1510   Int_t *n=&nn;
1511   Ali1Dcluster *c=neg;
1512   Int_t nd=1;
1513   Int_t milab[10];
1514   for (Int_t ilab=0;ilab<10;ilab++){
1515     milab[ilab]=-2;
1516   }
1517   milab[0]=d->GetTrack(0); milab[1]=d->GetTrack(1); milab[2]=d->GetTrack(2);
1518
1519   for (Int_t s=1; s<smax; s++) {
1520       d=(AliITSdigitSSD*)digits->UncheckedAt(s);      
1521       Int_t strip=d->GetCoord2();
1522       if ((strip-curr) > 1 || flag!=d->GetCoord1()) {
1523          c[*n].SetY(y/q);
1524          c[*n].SetQ(q);
1525          c[*n].SetNd(nd);
1526          CheckLabels2(milab);
1527          c[*n].SetLabels(milab);
1528          //Split suspiciously big cluster
1529          /*
1530          if (nd>10&&nd<16){
1531            c[*n].SetY(y/q-0.3*nd);
1532            c[*n].SetQ(0.5*q);
1533            (*n)++;
1534            if (*n==mMAX) {
1535              Error("FindClustersSSD","Too many 1D clusters !");
1536               return;
1537            }
1538            c[*n].SetY(y/q-0.0*nd);
1539            c[*n].SetQ(0.5*q);
1540            c[*n].SetNd(nd);
1541            (*n)++;
1542            if (*n==mMAX) {
1543              Error("FindClustersSSD","Too many 1D clusters !");
1544               return;
1545            }
1546            //
1547            c[*n].SetY(y/q+0.3*nd);
1548            c[*n].SetQ(0.5*q);
1549            c[*n].SetNd(nd);
1550            c[*n].SetLabels(milab);
1551          }
1552          else{
1553          */
1554          if (nd>4&&nd<25) {
1555            c[*n].SetY(y/q-0.25*nd);
1556            c[*n].SetQ(0.5*q);
1557            (*n)++;
1558            if (*n==mMAX) {
1559              Error("FindClustersSSD","Too many 1D clusters !");
1560              return;
1561            }
1562            c[*n].SetY(y/q+0.25*nd);
1563            c[*n].SetQ(0.5*q);
1564            c[*n].SetNd(nd);
1565            c[*n].SetLabels(milab);
1566          }       
1567          (*n)++;
1568          if (*n==mMAX) {
1569           Error("FindClustersSSD","Too many 1D clusters !");
1570           return;
1571          }
1572          y=q=qmax=0.;
1573          nd=0;
1574          lab[0]=lab[1]=lab[2]=-2;
1575          //
1576          for (Int_t ilab=0;ilab<10;ilab++){
1577            milab[ilab]=-2;
1578          }
1579          //
1580          if (flag!=d->GetCoord1()) { n=&np; c=pos; }
1581       }
1582       flag=d->GetCoord1();
1583       q += d->GetSignal();
1584       y += d->GetCoord2()*d->GetSignal();
1585       nd++;
1586       if (d->GetSignal()>qmax) {
1587          qmax=d->GetSignal();
1588          lab[0]=d->GetTrack(0); lab[1]=d->GetTrack(1); lab[2]=d->GetTrack(2);
1589       }
1590       for (Int_t ilab=0;ilab<10;ilab++) {
1591         if (d->GetTrack(ilab)>=0) AddLabel(milab, (d->GetTrack(ilab))); 
1592       }
1593       curr=strip;
1594   }
1595   c[*n].SetY(y/q);
1596   c[*n].SetQ(q);
1597   c[*n].SetNd(nd);
1598   c[*n].SetLabels(lab);
1599   //Split suspiciously big cluster
1600   if (nd>4 && nd<25) {
1601      c[*n].SetY(y/q-0.25*nd);
1602      c[*n].SetQ(0.5*q);
1603      (*n)++;
1604      if (*n==mMAX) {
1605         Error("FindClustersSSD","Too many 1D clusters !");
1606         return;
1607      }
1608      c[*n].SetY(y/q+0.25*nd);
1609      c[*n].SetQ(0.5*q);
1610      c[*n].SetNd(nd);
1611      c[*n].SetLabels(lab);
1612   }
1613   (*n)++;
1614   if (*n==mMAX) {
1615      Error("FindClustersSSD","Too many 1D clusters !");
1616      return;
1617   }
1618
1619   FindClustersSSD(neg, nn, pos, np, clusters);
1620 }
1621
1622 void AliITSclustererV2::FindClustersSSD(AliITSRawStream* input, 
1623                                         TClonesArray** clusters) 
1624 {
1625   //------------------------------------------------------------
1626   // Actual SSD cluster finder for raw data
1627   //------------------------------------------------------------
1628   Int_t nClustersSSD = 0;
1629   const Int_t mMAX = 1000;
1630   Ali1Dcluster clusters1D[2][mMAX];
1631   Int_t nClusters[2] = {0, 0};
1632   Int_t lab[3]={-2,-2,-2};
1633   Float_t q = 0.;
1634   Float_t y = 0.;
1635   Int_t nDigits = 0;
1636   Int_t prevStrip = -1;
1637   Int_t prevFlag = -1;
1638   Int_t prevModule = -1;
1639
1640   // read raw data input stream
1641   while (kTRUE) {
1642     Bool_t next = input->Next();
1643
1644     if(input->GetSignal()<3 && next) continue;
1645     // check if a new cluster starts
1646     Int_t strip = input->GetCoord2();
1647     Int_t flag = input->GetCoord1();
1648     if ((!next || (input->GetModuleID() != prevModule)||
1649          (strip-prevStrip > 1) || (flag != prevFlag)) &&
1650         (nDigits > 0)) {
1651       if (nClusters[prevFlag] == mMAX) {
1652         Error("FindClustersSSD", "Too many 1D clusters !");
1653         return;
1654       }
1655       Ali1Dcluster& cluster = clusters1D[prevFlag][nClusters[prevFlag]++];
1656       cluster.SetY(y/q);
1657       cluster.SetQ(q);
1658       cluster.SetNd(nDigits);
1659       cluster.SetLabels(lab);
1660
1661       //Split suspiciously big cluster
1662       if (nDigits > 4&&nDigits < 25) {
1663         cluster.SetY(y/q - 0.25*nDigits);
1664         cluster.SetQ(0.5*q);
1665         if (nClusters[prevFlag] == mMAX) {
1666           Error("FindClustersSSD", "Too many 1D clusters !");
1667           return;
1668         }
1669         Ali1Dcluster& cluster2 = clusters1D[prevFlag][nClusters[prevFlag]++];
1670         cluster2.SetY(y/q + 0.25*nDigits);
1671         cluster2.SetQ(0.5*q);
1672         cluster2.SetNd(nDigits);
1673         cluster2.SetLabels(lab);
1674       }
1675       y = q = 0.;
1676       nDigits = 0;
1677     }
1678
1679     if (!next || (input->GetModuleID() != prevModule)) {
1680       Int_t iModule = prevModule;
1681
1682       // when all data from a module was read, search for clusters
1683       if (prevFlag >= 0) {
1684         clusters[iModule] = new TClonesArray("AliITSclusterV2");
1685         fI = iModule;
1686         FindClustersSSD(&clusters1D[0][0], nClusters[0], 
1687                         &clusters1D[1][0], nClusters[1], clusters[iModule]);
1688         Int_t noClusters = clusters[iModule]->GetEntriesFast();
1689         nClustersSSD += noClusters;
1690       }
1691
1692       if (!next) break;
1693       nClusters[0] = nClusters[1] = 0;
1694       y = q = 0.;
1695       nDigits = 0;
1696     }
1697
1698     // add digit to current cluster
1699     q += input->GetSignal();
1700     y += strip * input->GetSignal();
1701     nDigits++;
1702     prevStrip = strip;
1703     prevFlag = flag;
1704     prevModule = input->GetModuleID();
1705
1706   }
1707
1708   Info("FindClustersSSD", "found clusters in ITS SSD: %d", nClustersSSD);
1709 }
1710