89e1bf64689095d469745a7e6c56dbe569d845f3
[u/mrichter/AliRoot.git] / ITS / AliITSgeom.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16 /* $Id$ */
17
18 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////
19 // ITS geometry manipulation routines.                               //
20 // Created April 15 1999.                                            //
21 // version: 0.0.0                                                    //
22 // By: Bjorn S. Nilsen                                               //
23 // version: 0.0.1                                                    //
24 // Updated May 27 1999.                                              //
25 // Added Cylindrical random and global based changes.               //
26 // Added  function PrintComparison.                                  //
27 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////
28
29
30 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////
31 //     The local coordinate system by, default, is show in the following
32 // figures. Also shown are the ladder numbering scheme.
33 //Begin_Html
34 /*
35 <img src="picts/ITS/AliITSgeomMatrix_L1.gif">
36 </pre>
37 <br clear=left>
38 <font size=+2 color=blue>
39 <p>This shows the relative geometry differences between the ALICE Global
40 coordinate system and the local detector coordinate system.
41 </font>
42 <pre>
43
44 <pre>
45 <img src="picts/ITS/its1+2_convention_front_5.gif">
46 </pre>
47 <br clear=left>
48 <font size=+2 color=blue>
49 <p>This shows the front view of the SPDs and the orientation of the local
50 pixel coordinate system. Note that the inner pixel layer has its y coordinate
51 in the opposite direction from all of the other layers.
52 </font>
53 <pre>
54
55 <pre>
56 <img src="picts/ITS/its3+4_convention_front_5.gif">
57 </pre>
58 <br clear=left>
59 <font size=+2 color=blue>
60 <p>This shows the front view of the SDDs and the orientation of the local
61 pixel coordinate system.
62 </font>
63 <pre>
64
65 <pre>
66 <img src="picts/ITS/its5+6_convention_front_5.gif">
67 </pre>
68 <br clear=left>
69 <font size=+2 color=blue>
70 <p>This shows the front view of the SSDs and the orientation of the local
71 pixel coordinate system.
72 </font>
73 <pre>
74 */
75 //End_Html
76 //
77 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////
78
79 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////
80 //
81 // version: 0
82 // Written by Bjorn S. Nilsen
83 //
84 // Data Members:
85 //
86 // Int_t fNlayers
87 //     The number of ITS layers for this geometry. By default this
88 //  is 6, but can be modified by the creator function if there are
89 // more layers defined.
90 //
91 // Int_t *fNlad
92 //     A pointer to an array fNlayers long containing the number of 
93 // ladders for each layer. This array is typically created and filled 
94 // by the AliITSgeom creator function.
95 //
96 // Int_t *fNdet
97 //     A pointer to an array fNlayers long containing the number of
98 // active detector volumes for each ladder. This array is typically
99 // created and filled by the AliITSgeom creator function.
100 //
101 // AliITSgeomMatrix *fGm
102 //     A pointer to an array of AliITSgeomMatrix classes. One element 
103 // per module (detector) in the ITS. AliITSgeomMatrix basicly contains
104 // all of the necessary information about the detector and it's coordinate
105 // transformations.
106 //
107 // TObjArray *fShape
108 //     A pointer to an array of TObjects containing the detailed shape
109 // information for each type of detector used in the ITS. For example
110 // I have created AliITSgeomSPD, AliITSgeomSDD, and AliITSgeomSSD as
111 // example structures, derived from TObjects, to hold the detector
112 // information. I would recommend that one element in each of these
113 // structures, that which describes the shape of the active volume,
114 // be one of the ROOT classes derived from TShape. In this way it would
115 // be easy to have the display program display the correct active
116 // ITS volumes. See the example classes AliITSgeomSPD, AliITSgeomSDD,
117 // and AliITSgeomSSD for a more detailed example.
118 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////
119 #include <Riostream.h>
120 //#include <stdlib.h>
121 //#include <stdio.h>
122 //#include <string.h>
123 //#include <ctype.h>
124
125 #include <TSystem.h>
126 #include <TRandom.h>
127
128 #include "AliITSgeom.h"
129 #include "AliITSgeomSPD.h"
130 #include "AliITSgeomSDD.h"
131 #include "AliITSgeomSSD.h"
132
133 ClassImp(AliITSgeom)
134
135 //______________________________________________________________________
136 AliITSgeom::AliITSgeom(){
137     //     The default constructor for the AliITSgeom class. It, by default,
138     // sets fNlayers to zero and zeros all pointers.
139     // Do not allocate anything zero everything.
140
141     fTrans   = 0; // standard GEANT global/local coordinate system.
142     fNlayers = 0;
143     fNlad    = 0;
144     fNdet    = 0;
145     fGm      = 0;
146     fShape   = 0;
147     strcpy(fVersion,"test");
148     return;
149 }
150 //______________________________________________________________________
151 AliITSgeom::AliITSgeom(Int_t itype,Int_t nlayers,Int_t *nlads,Int_t *ndets,
152                        Int_t mods){
153     //     A simple constructor to set basic geometry class variables
154     // Inputs:
155     // Int_t itype   the type of transformation kept.
156     //               bit 0 => Standard GEANT
157     //               bit 1 => ITS tracking
158     //               bit 2 => A change in the coordinate system has been made.
159     //               others are still to be defined as needed.
160     // Int_t nlayers The number of ITS layers also set the size of the arrays
161     // Int_t *nlads  an array of the number of ladders for each layer. This
162     //               array must be nlayers long.
163     // Int_t *ndets  an array of the number of detectors per ladder for each
164     //               layer. This array must be nlayers long.
165     // Int_t mods    The number of modules. Typicaly the sum of all the 
166     //               detectors on every layer and ladder.
167     // Outputs:
168     // none
169     Int_t i;
170
171     fTrans    = itype;
172     fNlayers  = nlayers;
173     fNlad     = new Int_t[nlayers];
174     fNdet     = new Int_t[nlayers];
175     for(i=0;i<nlayers;i++){fNlad[i] = nlads[i];fNdet[i] = ndets[i];}
176     fNmodules = mods;
177     fGm       = new TObjArray(mods,0);
178     fShape    = new TObjArray(5); // default value
179     for(i=0;i<5;i++) fShape->AddAt(0,i);
180     strcpy(fVersion,"test");
181     return;
182 }
183 //______________________________________________________________________
184 void AliITSgeom::CreatMatrix(Int_t mod,Int_t lay,Int_t lad,Int_t det,
185                              AliITSDetector idet,const Double_t tran[3],
186                              const Double_t rot[10]){
187     // Given the translation vector tran[3] and the rotation matrix rot[1],
188     // this function creates and adds to the TObject Array fGm the
189     // AliITSgeomMatrix object.
190     // Inputs are:
191     // Int_t           mod     The module number. The location in TObjArray
192     // Int_t           lay     The layer where this module is
193     // Int_t           lad     On which ladder this module is
194     // Int_t           det     Which detector on this ladder this module is
195     // AliITSDetector idet     The type of detector see AliITSgeom.h
196     // Double_t       tran[3]  The translation vector
197     // Double_t       rot[10]  The rotation matrix.
198     // Outputs are:
199     //   none
200     // The rot[10] matrix is set up like:
201     /*   / rot[0]  rot[1]  rot[2] \
202     //  |  rot[3]  rot[4]  rot[5]  |
203     //   \ rot[6]  rot[7]  rot[8] /  if(rot[9]!=0) then the Identity matrix
204     // is used regardless of the values in rot[0]-rot[8].
205     */
206     Int_t id[3];
207     Double_t r[3][3] = {{1.0,0.0,0.0},{0.0,1.0,0.0},{0.0,0.0,1.0}};
208
209     if(fGm->At(mod)!=0) delete fGm->At(mod);
210     id[0] = lay; id[1] = lad; id[2] = det;
211     if(rot[9]!=0.0) { // null rotation
212         r[0][0] = rot[0]; r[0][1] = rot[1]; r[0][2] = rot[2];
213         r[1][0] = rot[3]; r[1][1] = rot[4]; r[1][2] = rot[5];
214         r[2][0] = rot[6]; r[2][1] = rot[7]; r[2][2] = rot[8];
215     } // end if
216     fGm->AddAt(new AliITSgeomMatrix(idet,id,r,tran),mod);
217 }
218 //______________________________________________________________________
219 AliITSgeom::~AliITSgeom(){
220     //     The destructor for the AliITSgeom class. If the arrays fNlad,
221     // fNdet, or fGm have had memory allocated to them, there pointer values
222     // are non zero, then this memory space is freed and they are set
223     // to zero. In addition, fNlayers is set to zero. The destruction of
224     // TObjArray fShape is, by default, handled by the TObjArray destructor.
225
226    if(fGm!=0){
227      //for(Int_t i=0;i<fNlayers;i++) delete fGm->At(i);
228       fGm->Delete();
229       delete fGm;
230    } // end if fGm!=0
231    if(fNlad!=0) delete[] fNlad;
232    if(fNdet!=0) delete[] fNdet;
233    fNlayers = 0;
234    fNlad    = 0;
235    fNdet    = 0;
236    fGm      = 0;
237    return;
238 }
239 //______________________________________________________________________
240 void AliITSgeom::ReadNewFile(const char *filename){
241     // It is generaly preferred to define the geometry in AliITSgeom
242     // directly from the GEANT geometry, see AliITSvPPRasymm.cxx for
243     // and example. Under some circumstances this may not be possible.
244     // This function will read in a formatted file for all of the
245     // information needed to define the geometry in AliITSgeom.
246     // Unlike the older file format, this file may contain comments
247     // and the order of the data does not need to be completely
248     // respected. A file can be created using the function WriteNewFile
249     // defined below.
250     // Inputs are:
251     // const char *filename The file name of the file to be read in.
252     // Outputs are:
253     //  none
254     Int_t ncmd=9;
255     const char *cmda[]={"Version"        ,"fTrans"  ,"fNmodules",
256                         "fNlayers"       ,"fNladers","fNdetectors",
257                         "fNDetectorTypes","fShape"  ,"Matrix"};
258     Int_t i,j,lNdetTypes,ldet;
259     char cmd[20],c;
260     AliITSgeomSPD *spd=0;
261     AliITSgeomSDD *sdd=0;
262     AliITSgeomSSD *ssd=0;
263     AliITSgeomMatrix *m=0;
264     ifstream *fp=0;
265     char *filtmp=0;
266
267     filtmp = gSystem->ExpandPathName(filename);
268     cout << "AliITSgeom, Reading New .det file " << filtmp << endl;
269     fp = new ifstream(filtmp,ios::in);  // open file to write
270     while(fp->get(c)!=NULL){ // for ever loop
271         if(c==' ') continue; // remove blanks
272         if(c=='\n') continue;
273         if(c=='#' || c=='!'){for(;fp->get(c)!=NULL,c!='\n';); continue;}
274         if(c=='/'){
275             fp->get(c);{
276                 if(c=='/'){for(;fp->get(c)!=NULL,c!='\n';);continue;}
277                 if(c=='*'){
278                 NotYet:
279                     for(;fp->get(c)!=NULL,c!='*';);
280                     fp->get(c);{
281                         if(c=='/') continue;
282                         goto NotYet;
283                     } //
284                 } // end if c=='*'
285             } // end if second /
286         } // end if first /
287         fp->putback(c);
288         *fp >> cmd;
289         for(i=0;i<ncmd;i++) if(strcmp(cmd,cmda[i])==0) break;
290         switch (i){
291         case 0:   // Version
292             *fp >> fVersion;
293             break;
294         case 1:  // fTrans
295             *fp >> fTrans;
296             break;
297         case 2:  // fNModules
298             *fp >> fNmodules;
299             if(fGm!=0){
300                 for(j=0;j<fGm->GetEntriesFast();j++) delete fGm->At(j);
301                 delete fGm;
302             } // end if
303             fGm = new TObjArray(fNmodules,0);
304             break;
305         case 3:  // fNlayers
306             *fp >> fNlayers;
307             if(fNlad!=0) delete fNlad;
308             if(fNdet!=0) delete fNdet;
309             fNlad = new Int_t[fNlayers];
310             fNdet = new Int_t[fNlayers];
311             break;
312         case 4:  // fNladers
313             for(j=0;j<fNlayers;j++) *fp >> fNlad[j];
314             break;
315         case 5:  // fNdetectors
316             for(j=0;j<fNlayers;j++) *fp >> fNdet[j];
317             break;
318         case 6:  // fNDetectorTypes
319             *fp >> lNdetTypes;
320             if(fShape!=0){
321                 for(j=0;j<fShape->GetEntriesFast();j++) delete fShape->At(j);
322                 delete fShape;
323             } // end if
324             fShape = new TObjArray(lNdetTypes,0);
325             break;
326         case 7:  // fShape
327             *fp >> ldet;
328             if(fShape==0) fShape = new TObjArray(5,0);
329             switch (ldet){
330             case kSPD :
331                 spd = new AliITSgeomSPD();
332                 *fp >> *spd;
333                 ReSetShape(ldet,spd);
334                 spd = 0;
335                 break;
336             case kSDD : case kSDDp:
337                 sdd = new AliITSgeomSDD();
338                 *fp >> *sdd;
339                 ReSetShape(ldet,sdd);
340                 sdd = 0;
341                 break;
342             case kSSD : case kSSDp :
343                 ssd = new AliITSgeomSSD();
344                 *fp >> *ssd;
345                 ReSetShape(ldet,ssd);
346                 ssd = 0;
347                 break;
348             default:
349                 Error("ReadNewFile","Unknown fShape type number=%d c=%c",ldet,c);
350                 for(;fp->get(c)==NULL,c!='\n';); // skip to end of line.
351                 break;
352             } // end switch
353             break;
354         case 8:  // Matrix
355             *fp >> ldet;
356             if(fGm==0) fGm = new TObjArray(2270,0);
357             if(fGm->At(ldet)!=0) delete (fGm->At(ldet));
358             fGm->AddAt((TObject*)new AliITSgeomMatrix(),ldet);
359             m = (AliITSgeomMatrix*) fGm->At(ldet);
360             *fp >> *m;
361             m = 0;
362             break;
363         default:
364             Error("ReadNewFile","Data line i=%d c=%c",i,c);
365             for(;fp->get(c)==NULL,c!='\n';); // skip this line
366             break;
367         } // end switch i
368     } // end while
369     delete fp;
370
371     return;
372 }
373 //______________________________________________________________________
374 void AliITSgeom::WriteNewFile(const char *filename){
375     // Writes AliITSgeom, AliITSgeomMatrix, and the defined AliITSgeomS*D
376     // classes to a file in a format that is more readable and commendable.
377     // Inputs are:
378     // const char *filename The file name of the file to be write to.
379     // Outputs are:
380     //  none
381     ofstream *fp;
382     Int_t i;
383     char *filtmp;
384
385     filtmp = gSystem->ExpandPathName(filename);
386     cout << "AliITSgeom, Writing New .det file " << filtmp << endl;
387     fp = new ofstream(filtmp,ios::out);  // open file to write
388     *fp << "//Comment lines begin with two //, one #, or one !" << endl;
389     *fp << "#Blank lines are skipped including /* and */ sections." << endl;
390     *fp << "!and, in principle the order of the lines is not important" <<endl;
391     *fp << "/* In AliITSgeom.h are defined an enumerated type called" << endl;
392     *fp << " AliITSDetectors These are kSPD=" << (Int_t) kSPD ;
393     *fp << ", kSDD=" << (Int_t) kSDD << ", kSSD=" << (Int_t) kSSD;
394     *fp << ", kSSDp=" << (Int_t) kSSDp << ", and kSDDp=" << (Int_t) kSDDp;
395     *fp << "*/" << endl;
396     *fp << "Version " << fVersion << endl;//This should be consistent with the
397                                            // geometry version.
398     *fp << "fTrans " << fTrans << endl;
399     *fp << "fNmodules " << fNmodules << endl;
400     *fp << "fNlayers " << fNlayers << endl;
401     *fp << "fNladers ";
402     for(i=0;i<fNlayers;i++) *fp << fNlad[i] << " ";
403     *fp << endl;
404     *fp << "fNdetectors ";
405     for(i=0;i<fNlayers;i++) *fp << fNdet[i] << " ";
406     *fp << endl;
407     *fp << "fNDetectorTypes " << fShape->GetEntriesFast() << endl;
408     for(i=0;i<fShape->GetEntriesFast();i++){
409         if(!IsShapeDefined(i)) continue; // only print out used shapes.
410         switch (i){
411         case kSPD :
412             *fp << "fShape " << (Int_t) kSPD << " ";
413             *fp << *((AliITSgeomSPD*)(fShape->At(i)));
414             break;
415         case kSDD :
416             *fp << "fShape " << (Int_t) kSDD << " ";
417             *fp << *((AliITSgeomSDD*)(fShape->At(i)));
418             break;
419         case kSSD : case kSSDp :
420             *fp << "fShape " << i << " ";
421             *fp << *((AliITSgeomSSD*)(fShape->At(i)));
422             break;
423         default:
424             Error("AliITSgeom::WriteNewFile","Unknown Shape value");
425         } // end switch (i)
426     } // end for i
427     for(i=0;i<fNmodules;i++){
428         *fp << "Matrix " << i << " ";
429         *fp << *GetGeomMatrix(i);
430     } // end for i
431     *fp << "//End of File" << endl;;
432
433     delete fp;
434     return;
435 }
436 //______________________________________________________________________
437 AliITSgeom::AliITSgeom(const char *filename){
438     //     The constructor for the AliITSgeom class. All of the data to fill
439     // this structure is read in from the file given my the input filename.
440     // Inputs are:
441     // const char *filename The file name of the file to be read in.
442     // Outputs are:
443     //  none
444     FILE     *pf=0;
445     Int_t    i,lm=0,id[3];
446     Int_t    l,a,d;
447     Float_t  x,y,z,o,p,q,r,s,t;
448     Double_t rot6[6],tran[3];
449     char     buf[200],*buff=0; // input character buffer;
450     char *filtmp;
451
452     filtmp = gSystem->ExpandPathName(filename);
453     cout << "AliITSgeom reading old .det file " << filtmp << endl;
454     fShape = 0;
455     strcpy(fVersion,"DefauleV5");
456     pf = fopen(filtmp,"r");
457
458     fNlayers = 6; // set default number of ladders
459  TryAgain:
460     fNlad    = new Int_t[fNlayers];
461     fNdet    = new Int_t[fNlayers];
462     fNmodules = 0;
463     // find the number of ladders and detectors in this geometry.
464     for(i=0;i<fNlayers;i++){fNlad[i]=fNdet[i]=0;} // zero out arrays
465     while(fgets(buf,200,pf)!=NULL){ // for ever loop
466         for(i=0;i<200;i++)if(buf[i]!=' '){ // remove blank spaces.
467             buff = &(buf[i]);
468             break;
469         } // end for i
470         // remove blank lines and comments.
471         if(buff[0]=='\n'||buff[0]=='#'||buff[0]=='!'||
472            (buff[0]=='/'&&buff[1]=='/')) continue;
473         if(isalpha(buff[0])) { // must be the new file formated file.
474             fclose(pf);
475             delete[] fNlad;delete[] fNdet;
476             ReadNewFile(filename);
477             return;
478         } // end if isalpha(buff[0])
479         sscanf(buff,"%d %d %d %f %f %f %f %f %f %f %f %f",
480                &l,&a,&d,&x,&y,&z,&o,&p,&q,&r,&s,&t);
481         if(l>lm) lm = l;
482         if(l<1 || l>fNlayers) {
483             printf("error in file %s layer=%d min. is 1 max is %d\n",
484                    filename,l,fNlayers);
485             continue;
486         }// end if l
487         fNmodules++;
488         if(l<=fNlayers&&fNlad[l-1]<a) fNlad[l-1] = a;
489         if(l<=fNlayers&&fNdet[l-1]<d) fNdet[l-1] = d;
490     } // end while ever loop
491     if(lm>fNlayers){
492         delete[] fNlad;
493         delete[] fNdet;
494         fNlayers = lm;
495         goto TryAgain;
496     } // end if lm>fNlayers
497     // counted the number of ladders and detectors now allocate space.
498     fGm = new TObjArray(fNmodules,0);
499
500     // Set up Shapes for a default configuration of 6 layers.
501     fTrans   = 0; // standard GEANT global/local coordinate system.
502     // prepare to read in transforms
503     lm = 0; // reuse lm as counter of modules.
504     rewind(pf); // start over reading file
505     while(fgets(buf,200,pf)!=NULL){ // for ever loop
506         for(i=0;i<200;i++)if(buf[i]!=' '){ // remove blank spaces.
507             buff = &(buf[i]);
508             break;
509         } // end for i
510         // remove blank lines and comments.
511         if(buff[0]=='\n'||buff[0]=='#'||buff[0]=='!'||
512            (buff[0]=='/'&&buff[1]=='/')) continue;
513         x = y = z = o = p = q = r = s = t = 0.0;
514         sscanf(buff,"%d %d %d %f %f %f %f %f %f %f %f %f",
515                &l,&a,&d,&x,&y,&z,&o,&p,&q,&r,&s,&t);
516         if(l<1 || l>fNlayers) {
517             printf("error in file %s layer=%d min. is 1 max is %d/n",
518                    filename,l,fNlayers);
519             continue;
520         }// end if l
521         id[0] = l;id[1] = a;id[2] = d;
522         tran[0] = tran[1] = tran[2]  = 0.0;
523         tran[0] = (Double_t)x;tran[1] = (Double_t)y;tran[2] = (Double_t)z;
524         rot6[0] = rot6[1] = rot6[2] = rot6[3] = rot6[4] = rot6[5] =0.0;
525         rot6[0] = (Double_t)o;rot6[1] = (Double_t)p;rot6[2] = (Double_t)q;
526         rot6[3] = (Double_t)r;rot6[4] = (Double_t)s;rot6[5] = (Double_t)t;
527         switch (l){
528         case 1: case 2: // layer 1 or2 SPD
529             fGm->AddAt(new AliITSgeomMatrix(rot6,kSPD,id,tran),lm++);
530             break;
531         case 3: case 4: // layer 3 or 4 SDD
532             fGm->AddAt(new AliITSgeomMatrix(rot6,kSDD,id,tran),lm++);
533             break;
534         case 5: case 6: // layer 5 or 6 SSD
535             fGm->AddAt(new AliITSgeomMatrix(rot6,kSSD,id,tran),lm++);
536             break;
537         } // end switch
538     } // end while ever loop
539     fclose(pf);
540 }
541 //______________________________________________________________________
542 AliITSgeom::AliITSgeom(const AliITSgeom &source) : TObject(source){
543     //     The copy constructor for the AliITSgeom class. It calls the
544     // = operator function. See the = operator function for more details.
545     // Inputs are:
546     // AliITSgeom &source  The AliITSgeom class with which to make this
547     //                     a copy of.
548     // Outputs are:
549     // none.
550
551     *this = source;  // Just use the = operator for now.
552     return;
553 }
554 //______________________________________________________________________
555 AliITSgeom& AliITSgeom::operator=(const AliITSgeom &source){
556     //     The = operator function for the AliITSgeom class. It makes an
557     // independent copy of the class in such a way that any changes made
558     // to the copied class will not affect the source class in any way.
559     // This is required for many ITS alignment studies where the copied
560     // class is then modified by introducing some misalignment.
561     // Inputs are:
562     // AliITSgeom &source  The AliITSgeom class with which to make this
563     //                     a copy of.
564     // Outputs are:
565     // return  *this       The a new copy of source.
566    Int_t i;
567
568    if(this == &source) return *this; // don't assign to ones self.
569
570    // if there is an old structure allocated delete it first.
571    if(this->fGm != 0){
572       for(i=0;i<this->fNmodules;i++) delete this->fGm->At(i);
573       delete this->fGm;
574    } // end if fGm != 0 
575    if(fNlad != 0) delete[] fNlad;
576    if(fNdet != 0) delete[] fNdet;
577
578    this->fTrans    = source.fTrans;
579    this->fNmodules = source.fNmodules;
580    this->fNlayers = source.fNlayers;
581    this->fNlad = new Int_t[fNlayers];
582    for(i=0;i<this->fNlayers;i++) this->fNlad[i] = source.fNlad[i];
583    this->fNdet = new Int_t[fNlayers];
584    for(i=0;i<this->fNlayers;i++) this->fNdet[i] = source.fNdet[i];
585    this->fShape = new TObjArray(*(source.fShape));//This does not make a proper copy.
586    this->fGm = new TObjArray(this->fNmodules,0);
587    for(i=0;i<this->fNmodules;i++){
588        this->fGm->AddAt(new AliITSgeomMatrix(*(
589            (AliITSgeomMatrix*)(source.fGm->At(i)))),i);
590    } // end for i
591    return *this;
592 }
593 //______________________________________________________________________
594 Int_t AliITSgeom::GetModuleIndex(Int_t lay,Int_t lad,Int_t det){
595     //      This routine computes the module index number from the layer,
596     // ladder, and detector numbers. The number of ladders and detectors
597     // per layer is determined when this geometry package is constructed,
598     // see AliITSgeom(const char *filename) for specifics.
599     // Inputs are:
600     // Int_t lay  The layer number. Starting from 1.
601     // Int_t lad  The ladder number. Starting from 1.
602     // Int_t det  The detector number. Starting from 1.
603     // Outputs are:
604     // return the module index number, starting from zero.
605     Int_t i,j,k,id[3];
606
607     i = fNdet[lay-1] * (lad-1) + det - 1;
608     j = 0;
609     for(k=0;k<lay-1;k++) j += fNdet[k]*fNlad[k];
610     i = i+j;
611     if(i>=fNmodules) return -1;
612     GetGeomMatrix(i)->GetIndex(id);
613     if(id[0]==lay&&id[1]==lad&&id[2]==det) return i;
614     // Array of modules fGm is not in expected order. Search for this index
615     for(i=0;i<fNmodules;i++){
616         GetGeomMatrix(i)->GetIndex(id);
617         if(id[0]==lay&&id[1]==lad&&id[2]==det) return i;
618     } // end for i
619     // This layer ladder and detector combination does not exist return -1.
620     return -1;
621 }
622 //______________________________________________________________________
623 void AliITSgeom::GetModuleId(Int_t index,Int_t &lay,Int_t &lad,Int_t &det){
624     //      This routine computes the layer, ladder and detector number 
625     // given the module index number. The number of ladders and detectors
626     // per layer is determined when this geometry package is constructed,
627     // see AliITSgeom(const char *filename) for specifics.
628     // Inputs are:
629     // Int_t index  The module index number, starting from zero.
630     // Outputs are:
631     // Int_t lay    The layer number. Starting from 1.
632     // Int_t lad    The ladder number. Starting from 1.
633     // Int_t det    The detector number. Starting from 1.
634     Int_t id[3];
635     AliITSgeomMatrix *g = GetGeomMatrix(index);
636     if (g == 0x0)
637      {
638       Error("GetModuleId","Can not get GeoMatrix for index = %d",index);
639       lay = -1; lad = -1; det = -1;
640      }
641     else
642      {
643       g->GetIndex(id);
644       lay = id[0]; lad = id[1]; det = id[2];
645      }
646     return;
647
648     // The old way kept for posterity.
649 /*
650     Int_t i,j,k;
651     j = 0;
652     for(k=0;k<fNlayers;k++){
653         j += fNdet[k]*fNlad[k];
654         if(j>index)break;
655     } // end for k
656     lay = k+1;
657     i = index -j + fNdet[k]*fNlad[k];
658     j = 0;
659     for(k=0;k<fNlad[lay-1];k++){
660         j += fNdet[lay-1];
661         if(j>i)break;
662     } // end for k
663     lad = k+1;
664     det = 1+i-fNdet[lay-1]*k;
665     return;
666 */
667 }
668 //______________________________________________________________________
669 Int_t AliITSgeom::GetStartDet(Int_t dtype){
670     // returns the starting module index value for a give type of detector id.
671     // This assumes that the detector types are different on different layers
672     // and that they are not mixed up.
673     // Inputs are:
674     // Int_t dtype A detector type number. 0 for SPD, 1 for SDD, and 2 for SSD.
675     // outputs:
676     // return the module index for the first occurance of that detector type.
677
678     switch(dtype){
679     case 0:
680         return GetModuleIndex(1,1,1);
681         break;
682     case 1:
683         return GetModuleIndex(3,1,1);
684         break;
685     case 2:
686         return GetModuleIndex(5,1,1);
687         break;
688     default:
689         Warning("GetStartDet","undefined detector type %d",dtype);
690         return 0;
691     } // end switch
692
693     Warning("GetStartDet","undefined detector type %d",dtype);
694     return 0;
695 }
696 //______________________________________________________________________
697 Int_t AliITSgeom::GetLastDet(Int_t dtype){
698     // returns the last module index value for a give type of detector id.
699     // This assumes that the detector types are different on different layers
700     // and that they are not mixed up.
701     // Inputs are:
702     // Int_t dtype A detector type number. 0 for SPD, 1 for SDD, and 2 for SSD.
703     // outputs are:
704     // return the module index for the last occurance of that detector type.
705
706     switch(dtype){
707     case 0:
708         return GetLastSPD();
709         break;
710     case 1:
711         return GetLastSDD();
712         break;
713     case 2:
714         return GetLastSSD();
715         break;
716     default:
717         Warning("GetLastDet","undefined detector type %d",dtype);
718         return 0;
719     } // end switch
720
721     Warning("GetLastDet","undefined detector type %d",dtype);
722     return 0;
723 }
724 //______________________________________________________________________
725 void AliITSgeom::PrintComparison(FILE *fp,AliITSgeom *other){
726     //     This function was primarily created for diagnostic reasons. It
727     // print to a file pointed to by the file pointer fp the difference
728     // between two AliITSgeom classes. The format of the file is basicly,
729     // define d? to be the difference between the same element of the two
730     // classes. For example dfrx = this->GetGeomMatrix(i)->frx 
731     // - other->GetGeomMatrix(i)->frx.
732     // if(at least one of dfx0, dfy0, dfz0,dfrx,dfry,dfrz are non zero) then
733     // print layer ladder detector dfx0 dfy0 dfz0 dfrx dfry dfrz
734     // if(at least one of the 9 elements of dfr[] are non zero) then print
735     // layer ladder detector dfr[0] dfr[1] dfr[2]
736     //                       dfr[3] dfr[4] dfr[5]
737     //                       dfr[6] dfr[7] dfr[8]
738     // Only non zero values are printed to save space. The differences are
739     // typical written to a file because there are usually a lot of numbers
740     // printed out and it is usually easier to read them in some nice editor
741     // rather than zooming quickly past you on a screen. fprintf is used to
742     // do the printing. The fShapeIndex difference is not printed at this time.
743     // Inputs are:
744     // FILE *fp           A file pointer to an opened file for writing in which
745     //                    the results of the comparison will be written.
746     // AliITSgeom *other  The other AliITSgeom class to which this one is
747     //                    being compared.
748     // outputs are:
749     // none
750     Int_t    i,j,idt[3],ido[3];
751     Double_t tt[3],to[3];  // translation
752     Double_t rt[3],ro[3];  // phi in radians
753     Double_t mt[3][3],mo[3][3]; // matrixes
754     AliITSgeomMatrix *gt,*go;
755     Bool_t   t;
756
757     for(i=0;i<this->fNmodules;i++){
758         gt  =  this->GetGeomMatrix(i);
759         go  = other->GetGeomMatrix(i);
760         gt->GetIndex(idt);
761         go->GetIndex(ido);
762         t = kFALSE;
763         for(i=0;i<3;i++) t = t&&idt[i]!=ido[i];
764         if(t) fprintf(fp,"%4.4d %1.1d %2.2d %2.2d %1.1d %2.2d %2.2d\n",i,
765                       idt[0],idt[1],idt[2],ido[0],ido[1],ido[2]);
766         gt->GetTranslation(tt);
767         go->GetTranslation(to);
768         gt->GetAngles(rt);
769         go->GetAngles(ro);
770         t = kFALSE;
771         for(i=0;i<3;i++) t = t&&tt[i]!=to[i];
772         if(t) fprintf(fp,"%1.1d %2.2d %2.2d dTrans=%f %f %f drot=%f %f %f\n",
773                       idt[0],idt[1],idt[2],
774                       tt[0]-to[0],tt[1]-to[1],tt[2]-to[2],
775                       rt[0]-ro[0],rt[1]-ro[1],rt[2]-ro[2]);
776         t = kFALSE;
777         gt->GetMatrix(mt);
778         go->GetMatrix(mo);
779         for(i=0;i<3;i++)for(j=0;j<3;j++)  t = mt[i][j] != mo[i][j];
780         if(t){
781             fprintf(fp,"%1.1d %2.2d %2.2d dfr= %e %e %e\n",
782                     idt[0],idt[1],idt[2],
783                     mt[0][0]-mo[0][0],mt[0][1]-mo[0][1],mt[0][2]-mo[0][2]);
784             fprintf(fp,"        dfr= %e %e %e\n",
785                     mt[1][0]-mo[1][0],mt[1][1]-mo[1][1],mt[1][2]-mo[1][2]);
786             fprintf(fp,"        dfr= %e %e %e\n",
787                     mt[2][0]-mo[2][0],mt[2][1]-mo[2][1],mt[2][2]-mo[2][2]);
788         } // end if t
789     } // end for i
790     return;
791 }
792 //______________________________________________________________________
793 void AliITSgeom::PrintData(FILE *fp,Int_t lay,Int_t lad,Int_t det){
794     //     This function prints out the coordinate transformations for
795     // the particular detector defined by layer, ladder, and detector
796     // to the file pointed to by the File pointer fp. fprintf statements
797     // are used to print out the numbers. The format is
798     // layer ladder detector Trans= fx0 fy0 fz0 rot= frx fry frz 
799     // Shape=fShapeIndex
800     //                         dfr= fr[0] fr[1] fr[2]
801     //                         dfr= fr[3] fr[4] fr[5]
802     //                         dfr= fr[6] fr[7] fr[8]
803     // By indicating which detector, some control over the information 
804     // is given to the user. The output it written to the file pointed
805     // to by the file pointer fp. This can be set to stdout if you want.
806     // Inputs are:
807     // FILE *fp           A file pointer to an opened file for writing in which
808     //                    the results of the comparison will be written.
809     // Int_t lay          The layer number. Starting from 1.
810     // Int_t lad          The ladder number. Starting from 1.
811     // Int_t det          The detector number. Starting from 1.
812     // outputs are:
813     // none
814     AliITSgeomMatrix *gt;
815     Double_t t[3],r[3],m[3][3];
816
817     gt = this->GetGeomMatrix(GetModuleIndex(lay,lad,det));
818     gt->GetTranslation(t);
819     gt->GetAngles(r);
820     fprintf(fp,"%1.1d %2.2d %2.2d Trans=%f %f %f rot=%f %f %f Shape=%d\n",
821             lay,lad,det,t[0],t[1],t[2],r[0],r[1],r[2],
822             gt->GetDetectorIndex());
823     gt->GetMatrix(m);
824     fprintf(fp,"        dfr= %e %e %e\n",m[0][0],m[0][1],m[0][2]);
825     fprintf(fp,"        dfr= %e %e %e\n",m[1][0],m[1][1],m[1][2]);
826     fprintf(fp,"        dfr= %e %e %e\n",m[2][0],m[2][1],m[2][2]);
827     return;
828 }
829 //______________________________________________________________________
830 ofstream & AliITSgeom::PrintGeom(ofstream &rb){
831     //     Stream out an object of class AliITSgeom to standard output.
832     // Intputs are:
833     // ofstream &rb    The output streaming buffer.
834     // Outputs are:
835     // ofstream &rb    The output streaming buffer.
836     Int_t i;
837
838     rb.setf(ios::scientific);
839     rb << fTrans << " ";
840     rb << fNmodules << " ";
841     rb << fNlayers << " ";
842     for(i=0;i<fNlayers;i++) rb << fNlad[i] << " ";
843     for(i=0;i<fNlayers;i++) rb << fNdet[i] << "\n";
844     for(i=0;i<fNmodules;i++) {
845         rb <<setprecision(16) << *(GetGeomMatrix(i)) << "\n";
846     } // end for i
847     rb << fShape->GetEntries()<<endl;
848     for(i=0;i<fShape->GetEntries();i++) if(fShape->At(i)!=0) switch (i){
849     case kSPD:
850         rb << kSPD <<","<< (AliITSgeomSPD*)(fShape->At(kSPD));
851         break;
852     case kSDD:
853         rb << kSDD <<","<< (AliITSgeomSDD*)(fShape->At(kSDD));
854         break;
855     case kSSD:
856         rb << kSSD <<","<< (AliITSgeomSSD*)(fShape->At(kSSD));
857         break;
858     case kSSDp:
859         rb << kSSDp <<","<< (AliITSgeomSSD*)(fShape->At(kSSDp));
860         break;
861     case kSDDp:
862         rb << kSDDp <<","<< (AliITSgeomSDD*)(fShape->At(kSDDp));
863         break;
864     } // end for i / switch
865     return rb;
866 }
867 //______________________________________________________________________
868 ifstream & AliITSgeom::ReadGeom(ifstream &rb){
869     //     Stream in an object of class AliITSgeom from standard input.
870     // Intputs are:
871     // ifstream &rb    The input streaming buffer.
872     // Outputs are:
873     // ifstream &rb    The input streaming buffer.
874     Int_t i,j;
875
876     fNlad = new Int_t[fNlayers];
877     fNdet = new Int_t[fNlayers];
878     if(fGm!=0){
879         for(i=0;i<fNmodules;i++) delete GetGeomMatrix(i);
880         delete fGm;
881     } // end if fGm!=0
882
883     rb >> fTrans >> fNmodules >> fNlayers;
884     fNlad = new Int_t[fNlayers];
885     fNdet = new Int_t[fNlayers];
886     for(i=0;i<fNlayers;i++) rb >> fNlad[i];
887     for(i=0;i<fNlayers;i++) rb >> fNdet[i];
888     fGm = new TObjArray(fNmodules,0);
889     for(i=0;i<fNmodules;i++){
890         fGm->AddAt(new AliITSgeomMatrix,i);
891         rb >> *(GetGeomMatrix(i));
892     } // end for i
893     rb >> i;
894     fShape = new TObjArray(i);
895     for(i=0;i<fShape->GetEntries();i++) {
896         rb >> j;
897         switch (j){
898         case kSPD:{
899             AliITSgeomSPD *s = new AliITSgeomSPD();
900             rb >> *s;
901             fShape->AddAt(s,kSPD);}
902             break;
903         case kSDD:{
904             AliITSgeomSDD *s = new AliITSgeomSDD();
905             rb >> *s;
906             fShape->AddAt(s,kSDD);}
907             break;
908         case kSSD:{
909             AliITSgeomSSD *s = new AliITSgeomSSD();
910             rb >> *s;
911             fShape->AddAt(s,kSSD);}
912             break;
913         case kSSDp:{
914             AliITSgeomSSD *s = new AliITSgeomSSD();
915             rb >> *s;
916             fShape->AddAt(s,kSSDp);}
917             break;
918         case kSDDp:{
919             AliITSgeomSDD *s = new AliITSgeomSDD();
920             rb >> *s;
921             fShape->AddAt(s,kSDDp);}
922             break;
923         } // end  switch
924     } //  end for i
925     return rb;
926 }
927 //______________________________________________________________________
928 //     The following routines modify the transformation of "this"
929 // geometry transformations in a number of different ways.
930 //______________________________________________________________________
931 void AliITSgeom::GlobalChange(const Float_t *tran,const Float_t *rot){
932     //     This function performs a Cartesian translation and rotation of
933     // the full ITS from its default position by an amount determined by
934     // the three element arrays tran and rot. If every element
935     // of tran and rot are zero then there is no change made
936     // the geometry. The change is global in that the exact same translation
937     // and rotation is done to every detector element in the exact same way.
938     // The units of the translation are those of the Monte Carlo, usually cm,
939     // and those of the rotation are in radians. The elements of tran
940     // are tran[0] = x, tran[1] = y, and tran[2] = z.
941     // The elements of rot are rot[0] = rx, rot[1] = ry, and
942     // rot[2] = rz. A change in x will move the hole ITS in the ALICE
943     // global x direction, the same for a change in y. A change in z will
944     // result in a translation of the ITS as a hole up or down the beam line.
945     // A change in the angles will result in the inclination of the ITS with
946     // respect to the beam line, except for an effective rotation about the
947     // beam axis which will just rotate the ITS as a hole about the beam axis.
948     // Intputs are:
949     // Float_t *tran   A 3 element array representing the global translations.
950     //                 the elements are x,y,z in cm.
951     // Float_t *rot    A 3 element array representing the global rotation
952     //                 angles about the three axis x,y,z in radians
953     // Outputs are:
954     // none.
955     Int_t    i,j;
956     Double_t t[3],r[3];
957     AliITSgeomMatrix *g;
958
959     fTrans = (fTrans && 0xfffd) + 2;  // set bit 1 true.
960     for(i=0;i<fNmodules;i++){
961         g = this->GetGeomMatrix(i);
962         g->GetTranslation(t);
963         g->GetAngles(r);
964         for(j=0;j<3;j++){
965             t[j] += tran[j];
966             r[j] += rot[j];
967         } // end for j
968         g->SetTranslation(t);
969         g->SetAngles(r);
970     } // end for i
971     return;
972 }
973 //______________________________________________________________________
974 void AliITSgeom::GlobalCylindericalChange(const Float_t *tran,
975                                           const Float_t *rot){
976     //     This function performs a cylindrical translation and rotation of
977     // each ITS element by a fixed about in radius, rphi, and z from its
978     // default position by an amount determined by the three element arrays
979     // tran and rot. If every element of tran and
980     // rot are zero then there is no change made the geometry. The
981     // change is global in that the exact same distance change in translation
982     // and rotation is done to every detector element in the exact same way.
983     // The units of the translation are those of the Monte Carlo, usually cm,
984     // and those of the rotation are in radians. The elements of tran
985     // are tran[0] = r, tran[1] = rphi, and tran[2] = z.
986     // The elements of rot are rot[0] = rx, rot[1] = ry, and
987     // rot[2] = rz. A change in r will results in the increase of the
988     // radius of each layer by the same about. A change in rphi will results in
989     // the rotation of each layer by a different angle but by the same
990     // circumferential distance. A change in z will result in a translation
991     // of the ITS as a hole up or down the beam line. A change in the angles
992     // will result in the inclination of the ITS with respect to the beam
993     // line, except for an effective rotation about the beam axis which will
994     // just rotate the ITS as a hole about the beam axis.
995     // Intputs are:
996     // Float_t *tran   A 3 element array representing the global translations.
997     //                 the elements are r,theta,z in cm/radians.
998     // Float_t *rot    A 3 element array representing the global rotation
999     //                 angles about the three axis x,y,z in radians
1000     // Outputs are:
1001     // none.
1002     Int_t    i,j;
1003     Double_t t[3],ro[3],r,r0,phi,rphi;
1004     AliITSgeomMatrix *g;
1005
1006     fTrans = (fTrans && 0xfffd) + 2;  // set bit 1 true.
1007     for(i=0;i<fNmodules;i++){
1008         g = this->GetGeomMatrix(i);
1009         g->GetTranslation(t);
1010         g->GetAngles(ro);
1011         r = r0= TMath::Hypot(t[1],t[0]);
1012         phi   = TMath::ATan2(t[1],t[0]);
1013         rphi  = r0*phi;
1014         r    += tran[0];
1015         rphi += tran[1];
1016         phi   = rphi/r0;
1017         t[0]  = r*TMath::Cos(phi);
1018         t[1]  = r*TMath::Sin(phi);
1019         t[2] += tran[2];
1020         for(j=0;j<3;j++){
1021             ro[j] += rot[j];
1022         } // end for j
1023         g->SetTranslation(t);
1024         g->SetAngles(ro);
1025     } // end for i
1026     return;
1027 }
1028 //______________________________________________________________________
1029 void AliITSgeom::RandomChange(const Float_t *stran,const Float_t *srot){
1030     //     This function performs a Gaussian random displacement and/or
1031     // rotation about the present global position of each active
1032     // volume/detector of the ITS. The sigma of the random displacement
1033     // is determined by the three element array stran, for the
1034     // x y and z translations, and the three element array srot,
1035     // for the three rotation about the axis x y and z.
1036     // Intputs are:
1037     // Float_t *stran  A 3 element array representing the global translations
1038     //                 variances. The elements are x,y,z in cm.
1039     // Float_t *srot   A 3 element array representing the global rotation
1040     //                 angles variances about the three axis x,y,z in radians.
1041     // Outputs are:
1042     // none.
1043     Int_t    i,j;
1044     Double_t t[3],r[3];
1045     AliITSgeomMatrix *g;
1046
1047     fTrans = (fTrans && 0xfffd) + 2;  // set bit 1 true.
1048     for(i=0;i<fNmodules;i++){
1049         g = this->GetGeomMatrix(i);
1050         g->GetTranslation(t);
1051         g->GetAngles(r);
1052         for(j=0;j<3;j++){
1053             t[j] += gRandom->Gaus(0.0,stran[j]);
1054             r[j] += gRandom->Gaus(0.0, srot[j]);
1055         } // end for j
1056         g->SetTranslation(t);
1057         g->SetAngles(r);
1058     } // end for i
1059     return;
1060 }
1061 //______________________________________________________________________
1062 void AliITSgeom::RandomCylindericalChange(const Float_t *stran,
1063                                           const Float_t *srot){
1064     //     This function performs a Gaussian random displacement and/or
1065     // rotation about the present global position of each active
1066     // volume/detector of the ITS. The sigma of the random displacement
1067     // is determined by the three element array stran, for the
1068     // r rphi and z translations, and the three element array srot,
1069     // for the three rotation about the axis x y and z. This random change
1070     // in detector position allow for the simulation of a random uncertainty
1071     // in the detector positions of the ITS.
1072     // Intputs are:
1073     // Float_t *stran  A 3 element array representing the global translations
1074     //                 variances. The elements are r,theta,z in cm/readians.
1075     // Float_t *srot   A 3 element array representing the global rotation
1076     //                 angles variances about the three axis x,y,z in radians.
1077     // Outputs are:
1078     // none.
1079     Int_t    i,j;
1080     Double_t t[3],ro[3],r,r0,phi,rphi;
1081     TRandom ran;
1082     AliITSgeomMatrix *g;
1083
1084     fTrans = (fTrans && 0xfffd) + 2;  // set bit 1 true.
1085     for(i=0;i<fNmodules;i++){
1086         g = this->GetGeomMatrix(i);
1087         g->GetTranslation(t);
1088         g->GetAngles(ro);
1089         r = r0= TMath::Hypot(t[1],t[0]);
1090         phi   = TMath::ATan2(t[1],t[0]);
1091         rphi  = r0*phi;
1092         r    += ran.Gaus(0.0,stran[0]);
1093         rphi += ran.Gaus(0.0,stran[1]);
1094         phi   = rphi/r0;
1095         t[0]  = r*TMath::Cos(phi);
1096         t[1]  = r*TMath::Sin(phi);
1097         t[2] += ran.Gaus(0.0,stran[2]);
1098         for(j=0;j<3;j++){
1099             ro[j] += ran.Gaus(0.0, srot[j]);
1100         } // end for j
1101         g->SetTranslation(t);
1102         g->SetAngles(ro);
1103     } // end for i
1104     return;
1105 }
1106 //______________________________________________________________________
1107 void AliITSgeom::GeantToTracking(AliITSgeom &source){
1108     //     Copy the geometry data but change it to go between the ALICE
1109     // Global coordinate system to that used by the ITS tracking. A slightly
1110     // different coordinate system is used when tracking. This coordinate 
1111     // system is only relevant when the geometry represents the cylindrical
1112     // ALICE ITS geometry. For tracking the Z axis is left alone but X-> -Y
1113     // and Y-> X such that X always points out of the ITS cylinder for every
1114     // layer including layer 1 (where the detectors are mounted upside down).
1115     // Inputs are:
1116     // AliITSgeom &source  The AliITSgeom class with which to make this
1117     //                     a copy of.
1118     // Outputs are:
1119     // return  *this       The a new copy of source.
1120     //Begin_Html
1121     /*
1122       <img src="picts/ITS/AliITSgeomMatrix_T1.gif">
1123     */
1124     //End_Html
1125     Int_t    i,j,k,l,id[3];
1126     Double_t r0[3][3],r1[3][3];
1127     Double_t a0[3][3] = {{0.,+1.,0.},{-1.,0.,0.},{0.,0.,+1.}};
1128     Double_t a1[3][3] = {{0.,-1.,0.},{+1.,0.,0.},{0.,0.,+1.}};
1129
1130     *this = source;  // copy everything
1131     for(i=0;i<GetIndexMax();i++){
1132         GetGeomMatrix(i)->GetIndex(id);
1133         GetGeomMatrix(i)->GetMatrix(r0);
1134         if(id[0]==1){ // Layer 1 is treated different from the others.
1135             for(j=0;j<3;j++) for(k=0;k<3;k++){
1136                 r1[j][k] = 0.;
1137                 for(l=0;l<3;l++) r1[j][k] += a0[j][l]*r0[l][k];
1138             } // end for j,k
1139         }else{
1140             for(j=0;j<3;j++) for(k=0;k<3;k++){
1141                 r1[j][k] = 0.;
1142                 for(l=0;l<3;l++) r1[j][k] += a1[j][l]*r0[l][k];
1143             } // end for j,k
1144         } // end if
1145         GetGeomMatrix(i)->SetMatrix(r1);
1146     } // end for i
1147     this->fTrans = (this->fTrans && 0xfffe) + 1;  // set bit 0 true.
1148     return;
1149 }
1150 //______________________________________________________________________
1151 Int_t AliITSgeom::GetNearest(const Double_t g[3],Int_t lay){
1152     //      Finds the Detector (Module) that is nearest the point g [cm] in
1153     // ALICE Global coordinates. If layer !=0 then the search is restricted
1154     // to Detectors (Modules) in that particular layer.
1155     // Inputs are:
1156     // Double_t g[3]  The ALICE Cartesean global coordinate from which the
1157     //                distance is to be calculated with.
1158     // Int_t lay      The layer to restrict the search to. If layer=0 then
1159     //                all layers are searched. Default is lay=0.
1160     // Outputs are:
1161     // return         The module number representing the nearest module.
1162     Int_t    i,l,a,e,in=0;
1163     Double_t d,dn=1.0e10;
1164     Bool_t   t=lay!=0; // skip if lay = 0 default value check all layers.
1165
1166     for(i=0;i<fNmodules;i++){
1167         if(t){GetModuleId(i,l,a,e);if(l!=lay) continue;}
1168         if((d=GetGeomMatrix(i)->Distance2(g))<dn){
1169             dn = d;
1170             in = i;
1171         } // end if
1172     } // end for i
1173     return in;
1174 }
1175 //______________________________________________________________________
1176 void AliITSgeom::GetNearest27(const Double_t g[3],Int_t n[27],Int_t lay){
1177     //      Finds 27 Detectors (Modules) that are nearest the point g [cm] in
1178     // ALICE Global coordinates. If layer !=0 then the search is restricted
1179     // to Detectors (Modules) in that particular layer. The number 27 comes 
1180     // from including the nearest detector and all those around it (up, down,
1181     // left, right, forwards, backwards, and the corners).
1182     // Inputs are:
1183     // Double_t g[3]  The ALICE Cartesean global coordinate from which the
1184     //                distance is to be calculated with.
1185     // Int_t lay      The layer to restrict the search to. If layer=0 then
1186     //                all layers are searched. Default is lay=0.
1187     // Outputs are:
1188     // Int_t n[27]    The module number representing the nearest 27 modules
1189     //                in order.
1190     Int_t    i,l,a,e,in[27]={0,0,0,0,0,0,0,0,0,
1191                              0,0,0,0,0,0,0,0,0,
1192                              0,0,0,0,0,0,0,0,0,};
1193     Double_t d,dn[27]={1.0e10,1.0e10,1.0e10,1.0e10,1.0e10,1.0e10,
1194                        1.0e10,1.0e10,1.0e10,1.0e10,1.0e10,1.0e10,
1195                        1.0e10,1.0e10,1.0e10,1.0e10,1.0e10,1.0e10,
1196                        1.0e10,1.0e10,1.0e10,1.0e10,1.0e10,1.0e10,
1197                        1.0e10,1.0e10,1.0e10};
1198     Bool_t   t=(lay!=0); // skip if lay = 0 default value check all layers.
1199
1200     for(i=0;i<fNmodules;i++){
1201         if(t){GetModuleId(i,l,a,e);if(l!=lay) continue;}
1202         for(a=0;a<27;a++){
1203             d = GetGeomMatrix(i)->Distance2(g);
1204             if(d<dn[a]){
1205                 for(e=26;e>a;e--){dn[e] = dn[e-1];in[e] = in[e-1];}
1206                 dn[a] = d; in[a] = i;
1207             } // end if d<dn[i]
1208         } // end for a
1209     } // end for i
1210     for(i=0;i<27;i++) n[i] = in[i];
1211 }
1212 //----------------------------------------------------------------------