MUON/AliMUONClusterSplitterMLEM.cxx

   1 /**************************************************************************
   2 * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3 *                                                                        *
   4 * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5 * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6 *                                                                        *
   7 * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8 * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9 * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10 * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11 * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12 * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13 * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14 **************************************************************************/
  15
  16 // $Id$
  17
  18 /// \class AliMUONClusterSplitterMLEM
  19 ///
  20 /// Splitter class for the MLEM algorithm...
  21 ///
  22 /// FIXME: describe it a little bit more here...
  23 ///
  24 /// \author Laurent Aphecetche (for the "new" C++ structure) and
  25 /// Alexander Zinchenko, JINR Dubna, for the hardcore of it ;-)
  26
  27 #include "AliMUONClusterSplitterMLEM.h"
  28
  29 #include "AliMUONCluster.h"
  30 #include "AliMUONPad.h"
  31 #include "AliMUONPad.h"
  32 #include "AliMpStationType.h"
  33 #include "AliMUONConstants.h"
  34 #include "AliMpDEManager.h"
  35 #include "AliMUONMathieson.h"
  36
  37 #include "AliLog.h"
  38
  39 #include <TClonesArray.h>
  40 #include <TH2.h>
  41 #include <TMath.h>
  42 #include <TMatrixD.h>
  43 #include <TObjArray.h>
  44 #include <TROOT.h>
  45 #include <TRandom.h>
  46
  47 /// \cond CLASSIMP
  48 ClassImp(AliMUONClusterSplitterMLEM)
  49 /// \endcond
  50
  51 const Double_t AliMUONClusterSplitterMLEM::fgkCouplMin = 1.e-3; // threshold on coupling
  52
  53 //_____________________________________________________________________________
  54 AliMUONClusterSplitterMLEM::AliMUONClusterSplitterMLEM(Int_t detElemId,
  55                                                        TObjArray* fPixArray)
  56 : TObject(),
  57 fPixArray(fPixArray),
  58 fMathieson(0x0),
  59 fDetElemId(detElemId),
  60 fNpar(0),
  61 fQtot(0),
  62 fnCoupled(0)
  63 {
  64   /// Constructor
  65
  66   AliMp::StationType stationType = AliMpDEManager::GetStationType(fDetElemId);
  67
  68   Float_t kx3 = AliMUONConstants::SqrtKx3();
  69   Float_t ky3 = AliMUONConstants::SqrtKy3();
  70   Float_t pitch = AliMUONConstants::Pitch();
  71
  72   if ( stationType == AliMp::kStation1 )
  73   {
  74     kx3 = AliMUONConstants::SqrtKx3St1();
  75     ky3 = AliMUONConstants::SqrtKy3St1();
  76     pitch = AliMUONConstants::PitchSt1();
  77   }
  78
  79   fMathieson = new AliMUONMathieson;
  80
  81   fMathieson->SetPitch(pitch);
  82   fMathieson->SetSqrtKx3AndDeriveKx2Kx4(kx3);
  83   fMathieson->SetSqrtKy3AndDeriveKy2Ky4(ky3);
  84
  85 }
  86
  87 //_____________________________________________________________________________
  88 AliMUONClusterSplitterMLEM::~AliMUONClusterSplitterMLEM()
  89 {
  90   /// Destructor
  91
  92   delete fMathieson;
  93 }
  94
  95 //_____________________________________________________________________________
  96 void
  97 AliMUONClusterSplitterMLEM::AddBin(TH2 *mlem,
  98                                    Int_t ic, Int_t jc, Int_t mode,
  99                                    Bool_t *used, TObjArray *pix)
 100 {
 101   /// Add a bin to the cluster
 102
 103   Int_t nx = mlem->GetNbinsX();
 104   Int_t ny = mlem->GetNbinsY();
 105   Double_t cont1, cont = mlem->GetCellContent(jc,ic);
 106   AliMUONPad *pixPtr = 0;
 107
 108   for (Int_t i=TMath::Max(ic-1,1); i<=TMath::Min(ic+1,ny); i++) {
 109     for (Int_t j=TMath::Max(jc-1,1); j<=TMath::Min(jc+1,nx); j++) {
 110       if (i != ic && j != jc) continue;
 111       if (used[(i-1)*nx+j-1]) continue;
 112       cont1 = mlem->GetCellContent(j,i);
 113       if (mode && cont1 > cont) continue;
 114       used[(i-1)*nx+j-1] = kTRUE;
 115       if (cont1 < 0.5) continue;
 116       if (pix) pix->Add(BinToPix(mlem,j,i));
 117       else {
 118         pixPtr = new AliMUONPad (mlem->GetXaxis()->GetBinCenter(j),
 119                                    mlem->GetYaxis()->GetBinCenter(i), 0, 0, cont1);
 120         fPixArray->Add((TObject*)pixPtr);
 121       }
 122       AddBin(mlem, i, j, mode, used, pix); // recursive call
 123     }
 124   }
 125 }
 126
 127 //_____________________________________________________________________________
 128 void
 129 AliMUONClusterSplitterMLEM::AddCluster(Int_t ic, Int_t nclust,
 130                                        TMatrixD& aijcluclu,
 131                                        Bool_t *used, Int_t *clustNumb, Int_t &nCoupled)
 132 {
 133   /// Add a cluster to the group of coupled clusters
 134
 135   for (Int_t i=0; i<nclust; i++) {
 136     if (used[i]) continue;
 137     if (aijcluclu(i,ic) < fgkCouplMin) continue;
 138     used[i] = kTRUE;
 139     clustNumb[nCoupled++] = i;
 140     AddCluster(i, nclust, aijcluclu, used, clustNumb, nCoupled);
 141   }
 142 }
 143
 144 //_____________________________________________________________________________
 145 TObject*
 146 AliMUONClusterSplitterMLEM::BinToPix(TH2 *mlem,
 147                                      Int_t jc, Int_t ic)
 148 {
 149   /// Translate histogram bin to pixel
 150
 151   Double_t yc = mlem->GetYaxis()->GetBinCenter(ic);
 152   Double_t xc = mlem->GetXaxis()->GetBinCenter(jc);
 153
 154   Int_t nPix = fPixArray->GetEntriesFast();
 155   AliMUONPad *pixPtr = NULL;
 156
 157   // Compare pixel and bin positions
 158   for (Int_t i=0; i<nPix; i++) {
 159     pixPtr = (AliMUONPad*) fPixArray->UncheckedAt(i);
 160     if (pixPtr->Charge() < 0.5) continue;
 161     if (TMath::Abs(pixPtr->Coord(0)-xc)<1.e-4 && TMath::Abs(pixPtr->Coord(1)-yc)<1.e-4)
 162     {
 163       return (TObject*) pixPtr;
 164     }
 165   }
 166   AliError(Form(" Something wrong ??? %f %f ", xc, yc));
 167   return NULL;
 168 }
 169
 170 //_____________________________________________________________________________
 171 Float_t
 172 AliMUONClusterSplitterMLEM::ChargeIntegration(Double_t x, Double_t y,
 173                                               const AliMUONPad& pad)
 174 {
 175   /// Compute the Mathieson integral on pad area, assuming the center
 176   /// of the Mathieson is at (x,y)
 177
 178   TVector2 lowerLeft(TVector2(x,y)-pad.Position()-pad.Dimensions());
 179   TVector2 upperRight(lowerLeft + pad.Dimensions()*2.0);
 180
 181         return fMathieson->IntXY(lowerLeft.X(),lowerLeft.Y(),
 182                            upperRight.X(),upperRight.Y());
 183 }
 184
 185 //_____________________________________________________________________________
 186 void
 187 AliMUONClusterSplitterMLEM::Fcn1(const AliMUONCluster& cluster,
 188                                     Int_t & /*fNpar*/, Double_t * /*gin*/,
 189                                     Double_t &f, Double_t *par, Int_t /*iflag*/)
 190 {
 191   /// Fit for one track
 192
 193   Int_t indx, npads=0;
 194   Double_t charge, delta, coef=0, chi2=0, qTot = 0;
 195
 196   for (Int_t j=0; j< cluster.Multiplicity(); ++j)
 197   {
 198     AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
 199     if ( pad->Status() != 1 ) continue;
 200     if ( pad->DX() > 0 ) npads++; // exclude virtual pads
 201     qTot += pad->Charge(); // c.fXyq[2][j];
 202     charge = 0;
 203     for (Int_t i=fNpar/3; i>=0; --i)
 204     { // sum over tracks
 205       indx = i<2 ? 2*i : 2*i+1;
 206       if (fNpar == 2)
 207       {
 208         coef = 1;
 209       }
 210       else
 211       {
 212         coef = i==fNpar/3 ? par[indx+2] : 1-coef;
 213       }
 214       coef = TMath::Max (coef, 0.);
 215       if ( fNpar == 8 && i < 2)
 216       {
 217         coef = i==1 ? coef*par[indx+2] : coef - par[7];
 218       }
 219       coef = TMath::Max (coef, 0.);
 220       charge += ChargeIntegration(par[indx],par[indx+1],*pad);
 221     }
 222     charge *= fQtot;
 223     delta = charge - pad->Charge(); //c.fXyq[2][j];
 224     delta *= delta;
 225     delta /= pad->Charge(); //c.fXyq[2][j];
 226     chi2 += delta;
 227   } // for (Int_t j=0;
 228   f = chi2;
 229   Double_t qAver = qTot/npads;
 230   f = chi2/qAver;
 231 }
 232
 233 //_____________________________________________________________________________
 234 Int_t
 235 AliMUONClusterSplitterMLEM::Fit(const AliMUONCluster& cluster,
 236                                 Int_t iSimple, Int_t nfit,
 237                                 Int_t *clustFit, TObjArray **clusters,
 238                                 Double_t *parOk,
 239                                 TObjArray& clusterList)
 240 {
 241   /// Find selected clusters to selected pad charges
 242
 243   //  AliDebug(2,Form("iSimple=%d nfit=%d",iSimple,nfit));
 244
 245   TH2D *mlem = (TH2D*) gROOT->FindObject("mlem");
 246   Double_t xmin = mlem->GetXaxis()->GetXmin() - mlem->GetXaxis()->GetBinWidth(1);
 247   Double_t xmax = mlem->GetXaxis()->GetXmax() + mlem->GetXaxis()->GetBinWidth(1);
 248   Double_t ymin = mlem->GetYaxis()->GetXmin() - mlem->GetYaxis()->GetBinWidth(1);
 249   Double_t ymax = mlem->GetYaxis()->GetXmax() + mlem->GetYaxis()->GetBinWidth(1);
 250   Double_t step[3]={0.01,0.002,0.02}, xPad = 0, yPad = 99999;
 251
 252   // Number of pads to use and number of virtual pads
 253   Int_t npads = 0, nVirtual = 0, nfit0 = nfit;
 254   for (Int_t i=0; i<cluster.Multiplicity(); ++i )
 255   {
 256     AliMUONPad* pad = cluster.Pad(i);
 257     if ( pad->DX() < 0 ) ++nVirtual;
 258     if ( pad->Status() !=1 ) continue;
 259     if ( pad->DX() > 0 )
 260     {
 261       ++npads;
 262       if (yPad > 9999)
 263       {
 264         xPad = pad->X();//fXyq[0][i];
 265         yPad = pad->Y();//fXyq[1][i];
 266       }
 267       else
 268       {
 269         if (pad->DY() < pad->DX() ) //fXyq[4][i] < fXyq[3][i])
 270         {
 271           yPad = pad->Y();//fXyq[1][i];
 272         }
 273         else
 274         {
 275           xPad = pad->X();//fXyq[0][i];
 276         }
 277       }
 278     }
 279   }
 280
 281   fNpar = 0;
 282   fQtot = 0;
 283
 284   if (npads < 2) return 0;
 285
 286   // FIXME : AliWarning("Reconnect the following code for hit/track passing ?");
 287
 288   //  Int_t tracks[3] = {-1, -1, -1};
 289
 290   /*
 291    Int_t digit = 0;
 292    AliMUONDigit *mdig = 0;
 293    for (Int_t cath=0; cath<2; cath++) {
 294      for (Int_t i=0; i<fnPads[0]+fnPads[1]; i++) {
 295        if (fPadIJ[0][i] != cath) continue;
 296        if (fPadIJ[1][i] != 1) continue;
 297        if (fXyq[3][i] < 0) continue; // exclude virtual pads
 298        digit = TMath::Nint (fXyq[5][i]);
 299        if (digit >= 0) mdig = fInput->Digit(cath,digit);
 300        else mdig = fInput->Digit(TMath::Even(cath),-digit-1);
 301        //if (!mdig) mdig = fInput->Digit(TMath::Even(cath),digit);
 302        if (!mdig) continue; // protection for cluster display
 303        if (mdig->Hit() >= 0) {
 304          if (tracks[0] < 0) {
 305            tracks[0] = mdig->Hit();
 306            tracks[1] = mdig->Track(0);
 307          } else if (mdig->Track(0) < tracks[1]) {
 308            tracks[0] = mdig->Hit();
 309            tracks[1] = mdig->Track(0);
 310          }
 311        }
 312        if (mdig->Track(1) >= 0 && mdig->Track(1) != tracks[1]) {
 313          if (tracks[2] < 0) tracks[2] = mdig->Track(1);
 314          else tracks[2] = TMath::Min (tracks[2], mdig->Track(1));
 315        }
 316      } // for (Int_t i=0;
 317   } // for (Int_t cath=0;
 318    */
 319
 320   // Get number of pads in X and Y
 321 //  Int_t nInX = 0, nInY;
 322 //  PadsInXandY(cluster,nInX, nInY);
 323   const Int_t kStatusToTest(1);
 324
 325   AliMpIntPair nofPads = cluster.NofPads(kStatusToTest);
 326   Int_t nInX = nofPads.GetFirst();
 327   Int_t nInY = nofPads.GetSecond();
 328   //cout << " nInX and Y: " << nInX << " " << nInY << endl;
 329
 330   Int_t nfitMax = 3;
 331   nfitMax = TMath::Min (nfitMax, (npads + 1) / 3);
 332   if (nfitMax > 1) {
 333     if (nInX < 3 && nInY < 3 || nInX == 3 && nInY < 3 || nInX < 3 && nInY == 3) nfitMax = 1; // not enough pads in each direction
 334   }
 335   if (nfit > nfitMax) nfit = nfitMax;
 336
 337   // Take cluster maxima as fitting seeds
 338   TObjArray *pix;
 339   AliMUONPad *pixPtr;
 340   Int_t npxclu;
 341   Double_t cont, cmax = 0, xseed = 0, yseed = 0, errOk[8], qq = 0;
 342   Double_t xyseed[3][2], qseed[3], xyCand[3][2] = {{0},{0}}, sigCand[3][2] = {{0},{0}};
 343
 344   for (Int_t ifit=1; ifit<=nfit0; ifit++)
 345   {
 346     cmax = 0;
 347     pix = clusters[clustFit[ifit-1]];
 348     npxclu = pix->GetEntriesFast();
 349     //qq = 0;
 350     for (Int_t clu=0; clu<npxclu; ++clu)
 351     {
 352       pixPtr = (AliMUONPad*) pix->UncheckedAt(clu);
 353       cont = pixPtr->Charge();
 354       fQtot += cont;
 355       if (cont > cmax)
 356       {
 357         cmax = cont;
 358         xseed = pixPtr->Coord(0);
 359         yseed = pixPtr->Coord(1);
 360       }
 361       qq += cont;
 362       xyCand[0][0] += pixPtr->Coord(0) * cont;
 363       xyCand[0][1] += pixPtr->Coord(1) * cont;
 364       sigCand[0][0] += pixPtr->Coord(0) * pixPtr->Coord(0) * cont;
 365       sigCand[0][1] += pixPtr->Coord(1) * pixPtr->Coord(1) * cont;
 366     }
 367     xyseed[ifit-1][0] = xseed;
 368     xyseed[ifit-1][1] = yseed;
 369     qseed[ifit-1] = cmax;
 370   } // for (Int_t ifit=1;
 371
 372   xyCand[0][0] /= qq; // <x>
 373   xyCand[0][1] /= qq; // <y>
 374   sigCand[0][0] = sigCand[0][0]/qq - xyCand[0][0]*xyCand[0][0]; // <x^2> - <x>^2
 375   sigCand[0][0] = sigCand[0][0] > 0 ? TMath::Sqrt (sigCand[0][0]) : 0;
 376   sigCand[0][1] = sigCand[0][1]/qq - xyCand[0][1]*xyCand[0][1]; // <y^2> - <y>^2
 377   sigCand[0][1] = sigCand[0][1] > 0 ? TMath::Sqrt (sigCand[0][1]) : 0;
 378 //  if (fDebug) cout << xyCand[0][0] << " " << xyCand[0][1] << " " << sigCand[0][0] << " " << sigCand[0][1] << endl;
 379
 380   Int_t nDof, maxSeed[3];//, nMax = 0;
 381     Double_t fmin, chi2o = 9999, chi2n;
 382
 383     TMath::Sort(nfit0, qseed, maxSeed, kTRUE); // in decreasing order
 384
 385     Double_t *gin = 0, func0, func1, param[8], step0[8];
 386     Double_t param0[2][8]={{0},{0}}, deriv[2][8]={{0},{0}};
 387     Double_t shift[8], stepMax, derMax, parmin[8], parmax[8], func2[2], shift0;
 388     Double_t delta[8], scMax, dder[8], estim, shiftSave = 0;
 389     Int_t min, max, nCall = 0, memory[8] = {0}, nLoop, idMax = 0, iestMax = 0, nFail;
 390     Double_t rad, dist[3] = {0};
 391
 392     // Try to fit with one-track hypothesis, then 2-track. If chi2/dof is
 393     // lower, try 3-track (if number of pads is sufficient).
 394     for (Int_t iseed=0; iseed<nfit; iseed++)
 395     {
 396
 397       if (iseed)
 398       {
 399         for (Int_t j=0; j<fNpar; j++)
 400         {
 401           param[j] = parOk[j];
 402         }
 403       } // for bounded params
 404
 405       for (Int_t j=0; j<3; j++)
 406       {
 407         step0[fNpar+j] = shift[fNpar+j] = step[j];
 408       }
 409
 410       if (nfit == 1)
 411       {
 412         param[fNpar] = xyCand[0][0]; // take COG
 413       }
 414       else
 415       {
 416         param[fNpar] = xyseed[maxSeed[iseed]][0];
 417       }
 418       parmin[fNpar] = xmin;
 419       parmax[fNpar++] = xmax;
 420       if (nfit == 1)
 421       {
 422         param[fNpar] = xyCand[0][1]; // take COG
 423       }
 424       else
 425       {
 426         param[fNpar] = xyseed[maxSeed[iseed]][1];
 427       }
 428       parmin[fNpar] = ymin;
 429       parmax[fNpar++] = ymax;
 430       if (fNpar > 2)
 431       {
 432         param[fNpar] = fNpar == 4 ? 0.5 : 0.3;
 433         parmin[fNpar] = 0;
 434         parmax[fNpar++] = 1;
 435       }
 436       if (iseed)
 437       {
 438         for (Int_t j=0; j<fNpar; j++)
 439         {
 440           param0[1][j] = 0;
 441         }
 442       }
 443
 444       // Try new algorithm
 445       min = nLoop = 1; stepMax = func2[1] = derMax = 999999; nFail = 0;
 446
 447       while (1)
 448       {
 449         max = !min;
 450         Fcn1(cluster,fNpar, gin, func0, param, 1); nCall++;
 451         //cout << " Func: " << func0 << endl;
 452
 453         func2[max] = func0;
 454         for (Int_t j=0; j<fNpar; j++)
 455         {
 456           param0[max][j] = param[j];
 457           delta[j] = step0[j];
 458           param[j] += delta[j] / 10;
 459           if (j > 0) param[j-1] -= delta[j-1] / 10;
 460           Fcn1(cluster,fNpar, gin, func1, param, 1); nCall++;
 461           deriv[max][j] = (func1 - func0) / delta[j] * 10; // first derivative
 462                                                            //cout << j << " " << deriv[max][j] << endl;
 463           dder[j] = param0[0][j] != param0[1][j] ? (deriv[0][j] - deriv[1][j]) /
 464             (param0[0][j] - param0[1][j]) : 0; // second derivative
 465         }
 466         param[fNpar-1] -= delta[fNpar-1] / 10;
 467         if (nCall > 2000) break;
 468
 469         min = func2[0] < func2[1] ? 0 : 1;
 470         nFail = min == max ? 0 : nFail + 1;
 471
 472         stepMax = derMax = estim = 0;
 473         for (Int_t j=0; j<fNpar; j++)
 474         {
 475           // Estimated distance to minimum
 476           shift0 = shift[j];
 477           if (nLoop == 1)
 478           {
 479             shift[j] = TMath::Sign (step0[j], -deriv[max][j]); // first step
 480           }
 481           else if (TMath::Abs(deriv[0][j]) < 1.e-3 && TMath::Abs(deriv[1][j]) < 1.e-3)
 482           {
 483             shift[j] = 0;
 484           }
 485           else if (deriv[min][j]*deriv[!min][j] > 0 && TMath::Abs(deriv[min][j]) > TMath::Abs(deriv[!min][j])
 486                    || TMath::Abs(deriv[0][j]-deriv[1][j]) < 1.e-3 || TMath::Abs(dder[j]) < 1.e-6)
 487           {
 488             shift[j] = -TMath::Sign (shift[j], (func2[0]-func2[1]) * (param0[0][j]-param0[1][j]));
 489           }
 490           if (min == max)
 491           {
 492             if (memory[j] > 1)
 493             {
 494               shift[j] *= 2;
 495             }
 496             memory[j]++;
 497           }
 498           else
 499           {
 500             shift[j] = dder[j] != 0 ? -deriv[min][j] / dder[j] : 0;
 501             memory[j] = 0;
 502           }
 503
 504           if (TMath::Abs(shift[j])/step0[j] > estim)
 505           {
 506             estim = TMath::Abs(shift[j])/step0[j];
 507             iestMax = j;
 508           }
 509
 510           // Too big step
 511           if (TMath::Abs(shift[j])/step0[j] > 10) shift[j] = TMath::Sign(10.,shift[j]) * step0[j]; //
 512
 513           // Failed to improve minimum
 514           if (min != max)
 515           {
 516             memory[j] = 0;
 517             param[j] = param0[min][j];
 518             if (TMath::Abs(shift[j]+shift0) > 0.1*step0[j])
 519             {
 520               shift[j] = (shift[j] + shift0) / 2;
 521             }
 522             else
 523             {
 524               shift[j] /= -2;
 525             }
 526           }
 527
 528           // Too big step
 529           if (TMath::Abs(shift[j]*deriv[min][j]) > func2[min])
 530           {
 531             shift[j] = TMath::Sign (func2[min]/deriv[min][j], shift[j]);
 532           }
 533
 534           // Introduce step relaxation factor
 535           if (memory[j] < 3)
 536           {
 537             scMax = 1 + 4 / TMath::Max(nLoop/2.,1.);
 538             if (TMath::Abs(shift0) > 0 && TMath::Abs(shift[j]/shift0) > scMax)
 539             {
 540               shift[j] = TMath::Sign (shift0*scMax, shift[j]);
 541             }
 542           }
 543           param[j] += shift[j];
 544           //MLEM Check parameter limits 27-12-2004
 545           if (param[j] < parmin[j])
 546           {
 547             shift[j] = parmin[j] - param[j];
 548             param[j] = parmin[j];
 549           }
 550           else if (param[j] > parmax[j])
 551           {
 552             shift[j] = parmax[j] - param[j];
 553             param[j] = parmax[j];
 554           }
 555           //cout << " xxx " << j << " " << shift[j] << " " << param[j] << endl;
 556           stepMax = TMath::Max (stepMax, TMath::Abs(shift[j]/step0[j]));
 557           if (TMath::Abs(deriv[min][j]) > derMax)
 558           {
 559             idMax = j;
 560             derMax = TMath::Abs (deriv[min][j]);
 561           }
 562         } // for (Int_t j=0; j<fNpar;
 563
 564         if (estim < 1 && derMax < 2 || nLoop > 150) break; // minimum was found
 565
 566         nLoop++;
 567
 568         // Check for small step
 569         if (shift[idMax] == 0)
 570         {
 571           shift[idMax] = step0[idMax]/10;
 572           param[idMax] += shift[idMax];
 573           continue;
 574         }
 575
 576         if (!memory[idMax] && derMax > 0.5 && nLoop > 10)
 577         {
 578           if (dder[idMax] != 0 && TMath::Abs(deriv[min][idMax]/dder[idMax]/shift[idMax]) > 10)
 579           {
 580             if (min == max) dder[idMax] = -dder[idMax];
 581             shift[idMax] = -deriv[min][idMax] / dder[idMax] / 10;
 582             param[idMax] += shift[idMax];
 583             stepMax = TMath::Max (stepMax, TMath::Abs(shift[idMax])/step0[idMax]);
 584             if (min == max) shiftSave = shift[idMax];
 585           }
 586           if (nFail > 10)
 587           {
 588             param[idMax] -= shift[idMax];
 589             shift[idMax] = 4 * shiftSave * (gRandom->Rndm(0) - 0.5);
 590             param[idMax] += shift[idMax];
 591           }
 592         }
 593   } // while (1)
 594
 595       fmin = func2[min];
 596
 597       nDof = npads - fNpar + nVirtual;
 598       if (!nDof) nDof++;
 599       chi2n = fmin / nDof;
 600 //      if (fDebug) cout << " Chi2 " << chi2n << " " << fNpar << endl;
 601
 602       if (chi2n*1.2+1.e-6 > chi2o ) { fNpar -= 3; break; }
 603
 604       // Save parameters and errors
 605
 606       if (nInX == 1) {
 607         // One pad per direction
 608         for (Int_t i=0; i<fNpar; i++) if (i == 0 || i == 2 || i == 5) param0[min][i] = xPad;
 609       }
 610       if (nInY == 1) {
 611         // One pad per direction
 612         for (Int_t i=0; i<fNpar; i++) if (i == 1 || i == 3 || i == 6) param0[min][i] = yPad;
 613       }
 614
 615       /*
 616        if (iseed > 0) {
 617          // Find distance to the nearest neighbour
 618          dist[0] = dist[1] = TMath::Sqrt ((param0[min][0]-param0[min][2])*
 619                                           (param0[min][0]-param0[min][2])
 620                                           +(param0[min][1]-param0[min][3])*
 621                                           (param0[min][1]-param0[min][3]));
 622          if (iseed > 1) {
 623            dist[2] = TMath::Sqrt ((param0[min][0]-param0[min][5])*
 624                                   (param0[min][0]-param0[min][5])
 625                                   +(param0[min][1]-param0[min][6])*
 626                                   (param0[min][1]-param0[min][6]));
 627            rad = TMath::Sqrt ((param0[min][2]-param0[min][5])*
 628                               (param0[min][2]-param0[min][5])
 629                               +(param0[min][3]-param0[min][6])*
 630                               (param0[min][3]-param0[min][6]));
 631            if (dist[2] < dist[0]) dist[0] = dist[2];
 632            if (rad < dist[1]) dist[1] = rad;
 633            if (rad < dist[2]) dist[2] = rad;
 634          }
 635          cout << dist[0] << " " << dist[1] << " " << dist[2] << endl;
 636          if (dist[TMath::LocMin(iseed+1,dist)] < 1.) { fNpar -= 3; break; }
 637        }
 638        */
 639
 640       for (Int_t i=0; i<fNpar; i++) {
 641         parOk[i] = param0[min][i];
 642         //errOk[i] = fmin;
 643         errOk[i] = chi2n;
 644         // Bounded params
 645         parOk[i] = TMath::Max (parOk[i], parmin[i]);
 646         parOk[i] = TMath::Min (parOk[i], parmax[i]);
 647       }
 648
 649       chi2o = chi2n;
 650       if (fmin < 0.1) break; // !!!???
 651   } // for (Int_t iseed=0;
 652
 653 //    if (fDebug) {
 654 //      for (Int_t i=0; i<fNpar; i++) {
 655 //        if (i == 4 || i == 7) {
 656 //          if (i == 7 || i == 4 && fNpar < 7) cout << parOk[i] << endl;
 657 //          else cout << parOk[i] * (1-parOk[7]) << endl;
 658 //          continue;
 659 //        }
 660 //        cout << parOk[i] << " " << errOk[i] << endl;
 661 //      }
 662 //    }
 663     nfit = (fNpar + 1) / 3;
 664     dist[0] = dist[1] = dist[2] = 0;
 665
 666     if (nfit > 1) {
 667       // Find distance to the nearest neighbour
 668       dist[0] = dist[1] = TMath::Sqrt ((parOk[0]-parOk[2])*
 669                                        (parOk[0]-parOk[2])
 670                                        +(parOk[1]-parOk[3])*
 671                                        (parOk[1]-parOk[3]));
 672       if (nfit > 2) {
 673         dist[2] = TMath::Sqrt ((parOk[0]-parOk[5])*
 674                                (parOk[0]-parOk[5])
 675                                +(parOk[1]-parOk[6])*
 676                                (parOk[1]-parOk[6]));
 677         rad = TMath::Sqrt ((parOk[2]-parOk[5])*
 678                            (parOk[2]-parOk[5])
 679                            +(parOk[3]-parOk[6])*
 680                            (parOk[3]-parOk[6]));
 681         if (dist[2] < dist[0]) dist[0] = dist[2];
 682         if (rad < dist[1]) dist[1] = rad;
 683         if (rad < dist[2]) dist[2] = rad;
 684       }
 685     }
 686
 687     Int_t indx;
 688
 689     //if (!fDraw) {
 690
 691     Double_t coef = 0;
 692     if (iSimple) fnCoupled = 0;
 693     //for (Int_t j=0; j<nfit; j++) {
 694     for (Int_t j=nfit-1; j>=0; j--) {
 695       indx = j<2 ? j*2 : j*2+1;
 696       if (nfit == 1) coef = 1;
 697       else coef = j==nfit-1 ? parOk[indx+2] : 1-coef;
 698       coef = TMath::Max (coef, 0.);
 699       if (nfit == 3 && j < 2) coef = j==1 ? coef*parOk[indx+2] : coef - parOk[7];
 700       coef = TMath::Max (coef, 0.);
 701
 702       //void AliMUONClusterFinderMLEM::AddRawCluster(Double_t x, Double_t y,
 703       //                                             Double_t qTot, Double_t fmin,
 704       //                                             Int_t nfit, Int_t *tracks,
 705       //                                             Double_t /*sigx*/,
 706       //                                             Double_t /*sigy*/,
 707       //                                             Double_t /*dist*/)
 708
 709       if ( coef*fQtot >= 14 )
 710       {
 711         AliMUONCluster* cluster = new AliMUONCluster();
 712
 713         cluster->SetCharge(coef*fQtot,coef*fQtot);
 714         cluster->SetPosition(TVector2(parOk[indx],parOk[indx+1]),TVector2(sigCand[0][0],sigCand[0][1]));
 715         cluster->SetChi2(dist[TMath::LocMin(nfit,dist)]);
 716
 717         // FIXME: we miss some information in this cluster, as compared to
 718         // the original AddRawCluster code.
 719
 720         AliDebug(2,Form("Adding RawCluster detElemId %4d mult %2d charge %5d (xl,yl)=(%9.6g,%9.6g)",
 721                         fDetElemId,cluster->Multiplicity(),(Int_t)cluster->Charge(),
 722                         cluster->Position().X(),cluster->Position().Y()));
 723
 724         clusterList.Add(cluster);
 725       }
 726       //      AddRawCluster (parOk[indx], // double x
 727       //                     parOk[indx+1], // double y
 728       //                     coef*qTot, // double charge
 729       //                     errOk[indx], // double fmin
 730       //                     nfit0+10*nfit+100*nMax+10000*fnCoupled, // int nfit
 731       //                     tracks, // int* tracks
 732       //                     sigCand[0][0], // double sigx
 733       //                     sigCand[0][1], // double sigy
 734       //                     dist[TMath::LocMin(nfit,dist)] // double dist
 735       //                     );
 736     }
 737     return nfit;
 738     }
 739
 740
 741 //_____________________________________________________________________________
 742 void
 743 AliMUONClusterSplitterMLEM::Split(const AliMUONCluster& cluster,
 744                                   TH2 *mlem,
 745                                   Double_t *coef,
 746                                   TObjArray& clusterList)
 747 {
 748   /// The main steering function to work with clusters of pixels in anode
 749   /// plane (find clusters, decouple them from each other, merge them (if
 750   /// necessary), pick up coupled pads, call the fitting function)
 751
 752   Int_t nx = mlem->GetNbinsX();
 753   Int_t ny = mlem->GetNbinsY();
 754   Int_t nPix = fPixArray->GetEntriesFast();
 755
 756   Bool_t *used = new Bool_t[ny*nx];
 757   Double_t cont;
 758   Int_t nclust = 0, indx, indx1;
 759
 760   for (Int_t i=0; i<ny*nx; i++) used[i] = kFALSE;
 761
 762   TObjArray *clusters[200]={0};
 763   TObjArray *pix;
 764
 765   // Find clusters of histogram bins (easier to work in 2-D space)
 766   for (Int_t i=1; i<=ny; i++)
 767   {
 768     for (Int_t j=1; j<=nx; j++)
 769     {
 770       indx = (i-1)*nx + j - 1;
 771       if (used[indx]) continue;
 772       cont = mlem->GetCellContent(j,i);
 773       if (cont < 0.5) continue;
 774       pix = new TObjArray(20);
 775       used[indx] = 1;
 776       pix->Add(BinToPix(mlem,j,i));
 777       AddBin(mlem, i, j, 0, used, pix); // recursive call
 778       if (nclust >= 200) AliFatal(" Too many clusters !!!");
 779       clusters[nclust++] = pix;
 780     } // for (Int_t j=1; j<=nx; j++) {
 781     } // for (Int_t i=1; i<=ny;
 782 //  if (fDebug) cout << nclust << endl;
 783   delete [] used; used = 0;
 784
 785   // Compute couplings between clusters and clusters to pads
 786   Int_t npad = cluster.Multiplicity();
 787
 788   // Exclude pads with overflows
 789   for (Int_t j=0; j<npad; ++j)
 790   {
 791     AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
 792     if ( pad->IsSaturated() )
 793     {
 794       pad->SetStatus(-5);
 795     }
 796     else
 797     {
 798       pad->SetStatus(0);
 799     }
 800   }
 801
 802   // Compute couplings of clusters to pads
 803   TMatrixD aijclupad(nclust,npad);
 804   aijclupad = 0;
 805   Int_t npxclu;
 806   for (Int_t iclust=0; iclust<nclust; ++iclust)
 807   {
 808     pix = clusters[iclust];
 809     npxclu = pix->GetEntriesFast();
 810     for (Int_t i=0; i<npxclu; ++i)
 811     {
 812       indx = fPixArray->IndexOf(pix->UncheckedAt(i));
 813       for (Int_t j=0; j<npad; ++j)
 814       {
 815         AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
 816         if ( pad->Status() < 0 && pad->Status() != -5) continue;
 817         if (coef[j*nPix+indx] < fgkCouplMin) continue;
 818         aijclupad(iclust,j) += coef[j*nPix+indx];
 819       }
 820     }
 821   }
 822
 823   // Compute couplings between clusters
 824   TMatrixD aijcluclu(nclust,nclust);
 825   aijcluclu = 0;
 826   for (Int_t iclust=0; iclust<nclust; ++iclust)
 827   {
 828     for (Int_t j=0; j<npad; ++j)
 829     {
 830       // Exclude overflows
 831       if ( cluster.Pad(j)->Status() < 0) continue;
 832       if (aijclupad(iclust,j) < fgkCouplMin) continue;
 833       for (Int_t iclust1=iclust+1; iclust1<nclust; iclust1++)
 834       {
 835         if (aijclupad(iclust1,j) < fgkCouplMin) continue;
 836         aijcluclu(iclust,iclust1) +=
 837           TMath::Sqrt (aijclupad(iclust,j)*aijclupad(iclust1,j));
 838       }
 839     }
 840   }
 841   for (Int_t iclust=0; iclust<nclust; ++iclust)
 842   {
 843     for (Int_t iclust1=iclust+1; iclust1<nclust; ++iclust1)
 844     {
 845       aijcluclu(iclust1,iclust) = aijcluclu(iclust,iclust1);
 846     }
 847   }
 848
 849   // Find groups of coupled clusters
 850   used = new Bool_t[nclust];
 851   for (Int_t i=0; i<nclust; i++) used[i] = kFALSE;
 852   Int_t *clustNumb = new Int_t[nclust];
 853   Int_t nCoupled, nForFit, minGroup[3], clustFit[3], nfit = 0;
 854   Double_t parOk[8];
 855
 856   for (Int_t igroup=0; igroup<nclust; igroup++)
 857   {
 858     if (used[igroup]) continue;
 859     used[igroup] = kTRUE;
 860     clustNumb[0] = igroup;
 861     nCoupled = 1;
 862     // Find group of coupled clusters
 863     AddCluster(igroup, nclust, aijcluclu, used, clustNumb, nCoupled); // recursive
 864
 865     //    if (fDebug) {
 866     //      cout << " nCoupled: " << nCoupled << endl;
 867     //      for (Int_t i=0; i<nCoupled; i++) cout << clustNumb[i] << " "; cout << endl;
 868     //    }
 869
 870     fnCoupled = nCoupled;
 871
 872     while (nCoupled > 0)
 873     {
 874       if (nCoupled < 4)
 875       {
 876         nForFit = nCoupled;
 877         for (Int_t i=0; i<nCoupled; i++) clustFit[i] = clustNumb[i];
 878       }
 879       else
 880       {
 881         // Too many coupled clusters to fit - try to decouple them
 882         // Find the lowest coupling of 1, 2, min(3,nLinks/2) pixels with
 883         // all the others in the group
 884         for (Int_t j=0; j<3; j++) minGroup[j] = -1;
 885         /*Double_t coupl =*/ MinGroupCoupl(nCoupled, clustNumb, aijcluclu, minGroup);
 886
 887         // Flag clusters for fit
 888         nForFit = 0;
 889         while (minGroup[nForFit] >= 0 && nForFit < 3)
 890         {
 891           clustFit[nForFit] = clustNumb[minGroup[nForFit]];
 892           clustNumb[minGroup[nForFit]] -= 999;
 893           nForFit++;
 894         }
 895       } // else
 896
 897       // Select pads for fit.
 898       if (SelectPad(cluster,nCoupled, nForFit, clustNumb, clustFit, aijclupad) < 3 && nCoupled > 1)
 899       {
 900         // Deselect pads
 901         for (Int_t j=0; j<npad; ++j)
 902         {
 903           AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
 904           if ( pad->Status()==1 ) pad->SetStatus(0);
 905           if ( pad->Status()==-9) pad->SetStatus(-5);
 906         }
 907         // Merge the failed cluster candidates (with too few pads to fit) with
 908         // the one with the strongest coupling
 909         Merge(cluster,nForFit, nCoupled, clustNumb, clustFit, clusters, aijcluclu, aijclupad);
 910       }
 911       else
 912       {
 913         // Do the fit
 914         nfit = Fit(cluster,0, nForFit, clustFit, clusters, parOk, clusterList);
 915       }
 916
 917       // Subtract the fitted charges from pads with strong coupling and/or
 918       // return pads for further use
 919       UpdatePads(cluster,nfit, parOk);
 920
 921       // Mark used pads
 922       for (Int_t j=0; j<npad; ++j)
 923       {
 924         AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
 925         if ( pad->Status()==1 ) pad->SetStatus(-1);
 926         if ( pad->Status()==-9) pad->SetStatus(-5);
 927       }
 928
 929       // Sort the clusters (move to the right the used ones)
 930       Int_t beg = 0, end = nCoupled - 1;
 931       while (beg < end)
 932       {
 933         if (clustNumb[beg] >= 0) { ++beg; continue; }
 934         for (Int_t j=end; j>beg; --j)
 935         {
 936           if (clustNumb[j] < 0) continue;
 937           end = j - 1;
 938           indx = clustNumb[beg];
 939           clustNumb[beg] = clustNumb[j];
 940           clustNumb[j] = indx;
 941           break;
 942         }
 943         ++beg;
 944       }
 945
 946       nCoupled -= nForFit;
 947       if (nCoupled > 3)
 948       {
 949         // Remove couplings of used clusters
 950         for (Int_t iclust=nCoupled; iclust<nCoupled+nForFit;++ iclust)
 951         {
 952           indx = clustNumb[iclust] + 999;
 953           for (Int_t iclust1=0; iclust1<nCoupled; ++iclust1)
 954           {
 955             indx1 = clustNumb[iclust1];
 956             aijcluclu(indx,indx1) = aijcluclu(indx1,indx) = 0;
 957           }
 958         }
 959
 960         // Update the remaining clusters couplings (exclude couplings from
 961         // the used pads)
 962         for (Int_t j=0; j<npad; ++j)
 963         {
 964           AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
 965           if ( pad->Status() != -1) continue;
 966           for (Int_t iclust=0; iclust<nCoupled; ++iclust)
 967           {
 968             indx = clustNumb[iclust];
 969             if (aijclupad(indx,j) < fgkCouplMin) continue;
 970             for (Int_t iclust1=iclust+1; iclust1<nCoupled; ++iclust1)
 971             {
 972               indx1 = clustNumb[iclust1];
 973               if (aijclupad(indx1,j) < fgkCouplMin) continue;
 974               // Check this
 975               aijcluclu(indx,indx1) -=
 976                 TMath::Sqrt (aijclupad(indx,j)*aijclupad(indx1,j));
 977               aijcluclu(indx1,indx) = aijcluclu(indx,indx1);
 978             }
 979           }
 980           pad->SetStatus(-8);
 981         } // for (Int_t j=0; j<npad;
 982       } // if (nCoupled > 3)
 983     } // while (nCoupled > 0)
 984   } // for (Int_t igroup=0; igroup<nclust;
 985
 986   for (Int_t iclust=0; iclust<nclust; iclust++)
 987   {
 988     pix = clusters[iclust];
 989     pix->Clear();
 990     delete pix;
 991     pix = 0;
 992   }
 993   delete [] clustNumb;
 994   clustNumb = 0;
 995   delete [] used;
 996   used = 0;
 997
 998 }
 999
1000 //_____________________________________________________________________________
1001 void
1002 AliMUONClusterSplitterMLEM::Merge(const AliMUONCluster& cluster,
1003                                      Int_t nForFit, Int_t nCoupled,
1004                                      Int_t *clustNumb, Int_t *clustFit,
1005                                      TObjArray **clusters,
1006                                      TMatrixD& aijcluclu, TMatrixD& aijclupad)
1007 {
1008   /// Merge the group of clusters with the one having the strongest coupling with them
1009
1010   Int_t indx, indx1, npxclu, npxclu1, imax=0;
1011   TObjArray *pix, *pix1;
1012   Double_t couplMax;
1013
1014   for (Int_t icl=0; icl<nForFit; ++icl)
1015   {
1016     indx = clustFit[icl];
1017     pix = clusters[indx];
1018     npxclu = pix->GetEntriesFast();
1019     couplMax = -1;
1020     for (Int_t icl1=0; icl1<nCoupled; ++icl1)
1021     {
1022       indx1 = clustNumb[icl1];
1023       if (indx1 < 0) continue;
1024       if ( aijcluclu(indx,indx1) > couplMax)
1025       {
1026         couplMax = aijcluclu(indx,indx1);
1027         imax = indx1;
1028       }
1029     } // for (Int_t icl1=0;
1030       // Add to it
1031     pix1 = clusters[imax];
1032     npxclu1 = pix1->GetEntriesFast();
1033     // Add pixels
1034     for (Int_t i=0; i<npxclu; ++i)
1035     {
1036       pix1->Add(pix->UncheckedAt(i));
1037       pix->RemoveAt(i);
1038     }
1039
1040     //Add cluster-to-cluster couplings
1041     for (Int_t icl1=0; icl1<nCoupled; ++icl1)
1042     {
1043       indx1 = clustNumb[icl1];
1044       if (indx1 < 0 || indx1 == imax) continue;
1045       aijcluclu(indx1,imax) += aijcluclu(indx,indx1);
1046       aijcluclu(imax,indx1) = aijcluclu(indx1,imax);
1047     }
1048     aijcluclu(indx,imax) = aijcluclu(imax,indx) = 0;
1049
1050     //Add cluster-to-pad couplings
1051     for (Int_t j=0; j<cluster.Multiplicity(); ++j)
1052     {
1053       AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
1054       if ( pad->Status() < 0 && pad->Status() != -5 ) continue;// exclude used pads
1055         aijclupad(imax,j) += aijclupad(indx,j);
1056         aijclupad(indx,j) = 0;
1057     }
1058   } // for (Int_t icl=0; icl<nForFit;
1059 }
1060
1061
1062 //_____________________________________________________________________________
1063 Double_t
1064 AliMUONClusterSplitterMLEM::MinGroupCoupl(Int_t nCoupled, Int_t *clustNumb,
1065                                           TMatrixD& aijcluclu, Int_t *minGroup)
1066 {
1067   /// Find group of clusters with minimum coupling to all the others
1068
1069   Int_t i123max = TMath::Min(3,nCoupled/2);
1070   Int_t indx, indx1, indx2, indx3, nTot = 0;
1071   Double_t *coupl1 = 0, *coupl2 = 0, *coupl3 = 0;
1072
1073   for (Int_t i123=1; i123<=i123max; i123++) {
1074
1075     if (i123 == 1) {
1076       coupl1 = new Double_t [nCoupled];
1077       for (Int_t i=0; i<nCoupled; i++) coupl1[i] = 0;
1078     }
1079     else if (i123 == 2) {
1080       nTot = nCoupled*nCoupled;
1081       coupl2 = new Double_t [nTot];
1082       for (Int_t i=0; i<nTot; i++) coupl2[i] = 9999;
1083     } else {
1084       nTot = nTot*nCoupled;
1085       coupl3 = new Double_t [nTot];
1086       for (Int_t i=0; i<nTot; i++) coupl3[i] = 9999;
1087     } // else
1088
1089     for (Int_t i=0; i<nCoupled; i++) {
1090       indx1 = clustNumb[i];
1091       for (Int_t j=i+1; j<nCoupled; j++) {
1092         indx2 = clustNumb[j];
1093         if (i123 == 1) {
1094           coupl1[i] += aijcluclu(indx1,indx2);
1095           coupl1[j] += aijcluclu(indx1,indx2);
1096         }
1097         else if (i123 == 2) {
1098           indx = i*nCoupled + j;
1099           coupl2[indx] = coupl1[i] + coupl1[j];
1100           coupl2[indx] -= 2 * (aijcluclu(indx1,indx2));
1101         } else {
1102           for (Int_t k=j+1; k<nCoupled; k++) {
1103             indx3 = clustNumb[k];
1104             indx = i*nCoupled*nCoupled + j*nCoupled + k;
1105             coupl3[indx] = coupl2[i*nCoupled+j] + coupl1[k];
1106             coupl3[indx] -= 2 * (aijcluclu(indx1,indx3)+aijcluclu(indx2,indx3));
1107           }
1108         } // else
1109       } // for (Int_t j=i+1;
1110     } // for (Int_t i=0;
1111   } // for (Int_t i123=1;
1112
1113   // Find minimum coupling
1114   Double_t couplMin = 9999;
1115   Int_t locMin = 0;
1116
1117   for (Int_t i123=1; i123<=i123max; i123++) {
1118     if (i123 == 1) {
1119       locMin = TMath::LocMin(nCoupled, coupl1);
1120       couplMin = coupl1[locMin];
1121       minGroup[0] = locMin;
1122       delete [] coupl1; coupl1 = 0;
1123     }
1124     else if (i123 == 2) {
1125       locMin = TMath::LocMin(nCoupled*nCoupled, coupl2);
1126       if (coupl2[locMin] < couplMin) {
1127         couplMin = coupl2[locMin];
1128         minGroup[0] = locMin/nCoupled;
1129         minGroup[1] = locMin%nCoupled;
1130       }
1131       delete [] coupl2; coupl2 = 0;
1132     } else {
1133       locMin = TMath::LocMin(nTot, coupl3);
1134       if (coupl3[locMin] < couplMin) {
1135         couplMin = coupl3[locMin];
1136         minGroup[0] = locMin/nCoupled/nCoupled;
1137         minGroup[1] = locMin%(nCoupled*nCoupled)/nCoupled;
1138         minGroup[2] = locMin%nCoupled;
1139       }
1140       delete [] coupl3; coupl3 = 0;
1141     } // else
1142   } // for (Int_t i123=1;
1143   return couplMin;
1144 }
1145
1146 //_____________________________________________________________________________
1147 Int_t
1148 AliMUONClusterSplitterMLEM::SelectPad(const AliMUONCluster& cluster,
1149                                           Int_t nCoupled, Int_t nForFit,
1150                                           Int_t *clustNumb, Int_t *clustFit,
1151                                           TMatrixD& aijclupad)
1152 {
1153   /// Select pads for fit. If too many coupled clusters, find pads giving
1154   /// the strongest coupling with the rest of clusters and exclude them from the fit.
1155
1156   Int_t npad = cluster.Multiplicity();
1157   Double_t *padpix = 0;
1158
1159   if (nCoupled > 3)
1160   {
1161     padpix = new Double_t[npad];
1162     for (Int_t i=0; i<npad; i++) padpix[i] = 0;
1163   }
1164
1165   Int_t nOK = 0, indx, indx1;
1166   for (Int_t iclust=0; iclust<nForFit; ++iclust)
1167   {
1168     indx = clustFit[iclust];
1169     for (Int_t j=0; j<npad; j++)
1170     {
1171       if ( aijclupad(indx,j) < fgkCouplMin) continue;
1172       AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
1173       if ( pad->Status() == -5 ) pad->SetStatus(-0); // flag overflow
1174       if ( pad->Status() < 0 ) continue; // exclude overflows and used pads
1175       if ( !pad->Status() )
1176       {
1177         pad->SetStatus(1);
1178         ++nOK; // pad to be used in fit
1179       }
1180       if (nCoupled > 3)
1181       {
1182         // Check other clusters
1183         for (Int_t iclust1=0; iclust1<nCoupled; ++iclust1)
1184         {
1185           indx1 = clustNumb[iclust1];
1186           if (indx1 < 0) continue;
1187           if ( aijclupad(indx1,j) < fgkCouplMin ) continue;
1188           padpix[j] += aijclupad(indx1,j);
1189         }
1190       } // if (nCoupled > 3)
1191     } // for (Int_t j=0; j<npad;
1192   } // for (Int_t iclust=0; iclust<nForFit
1193   if (nCoupled < 4) return nOK;
1194
1195   Double_t aaa = 0;
1196   for (Int_t j=0; j<npad; ++j)
1197   {
1198     if (padpix[j] < fgkCouplMin) continue;
1199     aaa += padpix[j];
1200     cluster.Pad(j)->SetStatus(-1); // exclude pads with strong coupling to the other clusters
1201     nOK--;
1202   }
1203   delete [] padpix;
1204   padpix = 0;
1205   return nOK;
1206 }
1207
1208 //_____________________________________________________________________________
1209 void
1210 AliMUONClusterSplitterMLEM::UpdatePads(const AliMUONCluster& cluster,
1211                                           Int_t /*nfit*/, Double_t *par)
1212 {
1213   /// Subtract the fitted charges from pads with strong coupling
1214
1215   Int_t indx;
1216   Double_t charge, coef=0;
1217
1218   for (Int_t j=0; j<cluster.Multiplicity(); ++j)
1219   {
1220     AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
1221     if ( pad->Status() != 1 ) continue;
1222     if (fNpar != 0)
1223     {
1224       charge = 0;
1225       for (Int_t i=fNpar/3; i>=0; --i)
1226       {
1227         // sum over tracks
1228         indx = i<2 ? 2*i : 2*i+1;
1229         if (fNpar == 2)
1230         {
1231           coef = 1;
1232         }
1233         else
1234         {
1235           coef = i==fNpar/3 ? par[indx+2] : 1-coef;
1236         }
1237         coef = TMath::Max (coef, 0.);
1238         if (fNpar == 8 && i < 2)
1239         {
1240           coef = i==1 ? coef*par[indx+2] : coef - par[7];
1241         }
1242         coef = TMath::Max (coef, 0.);
1243         charge += ChargeIntegration(par[indx],par[indx+1],*pad);
1244       }
1245       charge *= fQtot;
1246       pad->SetCharge(pad->Charge()-charge);
1247     } // if (fNpar != 0)
1248
1249     if (pad->Charge() > 6 /*fgkZeroSuppression*/) pad->SetStatus(0);
1250     // return pad for further using // FIXME: remove usage of zerosuppression here
1251
1252   } // for (Int_t j=0;
1253 }
1254
1255