MUON/AliMUONClusterSplitterMLEM.cxx

   1 /**************************************************************************
   2 * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3 *                                                                        *
   4 * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5 * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6 *                                                                        *
   7 * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8 * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9 * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10 * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11 * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12 * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13 * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14 **************************************************************************/
  15
  16 // $Id$
  17
  18 /// \class AliMUONClusterSplitterMLEM
  19 ///
  20 /// Splitter class for the MLEM algorithm...
  21 ///
  22 /// FIXME: describe it a little bit more here...
  23 ///
  24 /// \author Laurent Aphecetche (for the "new" C++ structure) and
  25 /// Alexander Zinchenko, JINR Dubna, for the hardcore of it ;-)
  26
  27 #include "AliMUONClusterSplitterMLEM.h"
  28
  29 #include "AliLog.h"
  30 #include "AliMUONCluster.h"
  31 #include "AliMUONPad.h"
  32 #include "AliMUONPad.h"
  33 #include "AliMpStationType.h"
  34 #include "AliMUONConstants.h"
  35 #include "AliMpDEManager.h"
  36 #include "AliMUONMathieson.h"
  37
  38 #include "TClonesArray.h"
  39 #include "TH2.h"
  40 #include "TMath.h"
  41 #include "TObjArray.h"
  42 #include "TMatrixD.h"
  43 #include "TRandom.h"
  44
  45 ClassImp(AliMUONClusterSplitterMLEM)
  46
  47 const Double_t AliMUONClusterSplitterMLEM::fgkCouplMin = 1.e-3; // threshold on coupling
  48
  49 //_____________________________________________________________________________
  50 AliMUONClusterSplitterMLEM::AliMUONClusterSplitterMLEM(Int_t detElemId,
  51                                                        TObjArray* fPixArray)
  52 : TObject(),
  53 fPixArray(fPixArray),
  54 fMathieson(0x0),
  55 fDetElemId(detElemId),
  56 fNpar(0),
  57 fQtot(0),
  58 fnCoupled(0)
  59 {
  60   /// Constructor
  61
  62   AliMpStationType stationType = AliMpDEManager::GetStationType(fDetElemId);
  63
  64   Float_t kx3 = AliMUONConstants::SqrtKx3();
  65   Float_t ky3 = AliMUONConstants::SqrtKy3();
  66   Float_t pitch = AliMUONConstants::Pitch();
  67
  68   if ( stationType == kStation1 )
  69   {
  70     kx3 = AliMUONConstants::SqrtKx3St1();
  71     ky3 = AliMUONConstants::SqrtKy3St1();
  72     pitch = AliMUONConstants::PitchSt1();
  73   }
  74
  75   fMathieson = new AliMUONMathieson;
  76
  77   fMathieson->SetPitch(pitch);
  78   fMathieson->SetSqrtKx3AndDeriveKx2Kx4(kx3);
  79   fMathieson->SetSqrtKy3AndDeriveKy2Ky4(ky3);
  80
  81 }
  82
  83 //_____________________________________________________________________________
  84 AliMUONClusterSplitterMLEM::~AliMUONClusterSplitterMLEM()
  85 {
  86   delete fMathieson;
  87 }
  88
  89 //_____________________________________________________________________________
  90 void
  91 AliMUONClusterSplitterMLEM::AddBin(TH2 *mlem,
  92                                    Int_t ic, Int_t jc, Int_t mode,
  93                                    Bool_t *used, TObjArray *pix)
  94 {
  95   /// Add a bin to the cluster
  96
  97   Int_t nx = mlem->GetNbinsX();
  98   Int_t ny = mlem->GetNbinsY();
  99   Double_t cont1, cont = mlem->GetCellContent(jc,ic);
 100   AliMUONPad *pixPtr = 0;
 101
 102   for (Int_t i=TMath::Max(ic-1,1); i<=TMath::Min(ic+1,ny); i++) {
 103     for (Int_t j=TMath::Max(jc-1,1); j<=TMath::Min(jc+1,nx); j++) {
 104       if (i != ic && j != jc) continue;
 105       if (used[(i-1)*nx+j-1]) continue;
 106       cont1 = mlem->GetCellContent(j,i);
 107       if (mode && cont1 > cont) continue;
 108       used[(i-1)*nx+j-1] = kTRUE;
 109       if (cont1 < 0.5) continue;
 110       if (pix) pix->Add(BinToPix(mlem,j,i));
 111       else {
 112         pixPtr = new AliMUONPad (mlem->GetXaxis()->GetBinCenter(j),
 113                                    mlem->GetYaxis()->GetBinCenter(i), 0, 0, cont1);
 114         fPixArray->Add((TObject*)pixPtr);
 115       }
 116       AddBin(mlem, i, j, mode, used, pix); // recursive call
 117     }
 118   }
 119 }
 120
 121 //_____________________________________________________________________________
 122 void
 123 AliMUONClusterSplitterMLEM::AddCluster(Int_t ic, Int_t nclust,
 124                                        TMatrixD& aijcluclu,
 125                                        Bool_t *used, Int_t *clustNumb, Int_t &nCoupled)
 126 {
 127   /// Add a cluster to the group of coupled clusters
 128
 129   for (Int_t i=0; i<nclust; i++) {
 130     if (used[i]) continue;
 131     if (aijcluclu(i,ic) < fgkCouplMin) continue;
 132     used[i] = kTRUE;
 133     clustNumb[nCoupled++] = i;
 134     AddCluster(i, nclust, aijcluclu, used, clustNumb, nCoupled);
 135   }
 136 }
 137
 138 //_____________________________________________________________________________
 139 TObject*
 140 AliMUONClusterSplitterMLEM::BinToPix(TH2 *mlem,
 141                                      Int_t jc, Int_t ic)
 142 {
 143   /// Translate histogram bin to pixel
 144
 145   Double_t yc = mlem->GetYaxis()->GetBinCenter(ic);
 146   Double_t xc = mlem->GetXaxis()->GetBinCenter(jc);
 147
 148   Int_t nPix = fPixArray->GetEntriesFast();
 149   AliMUONPad *pixPtr = NULL;
 150
 151   // Compare pixel and bin positions
 152   for (Int_t i=0; i<nPix; i++) {
 153     pixPtr = (AliMUONPad*) fPixArray->UncheckedAt(i);
 154     if (pixPtr->Charge() < 0.5) continue;
 155     if (TMath::Abs(pixPtr->Coord(0)-xc)<1.e-4 && TMath::Abs(pixPtr->Coord(1)-yc)<1.e-4)
 156     {
 157       return (TObject*) pixPtr;
 158     }
 159   }
 160   AliError(Form(" Something wrong ??? %f %f ", xc, yc));
 161   return NULL;
 162 }
 163
 164 //_____________________________________________________________________________
 165 Float_t
 166 AliMUONClusterSplitterMLEM::ChargeIntegration(Double_t x, Double_t y,
 167                                               const AliMUONPad& pad)
 168 {
 169   /// Compute the Mathieson integral on pad area, assuming the center
 170   /// of the Mathieson is at (x,y)
 171
 172   TVector2 lowerLeft(TVector2(x,y)-pad.Position()-pad.Dimensions());
 173   TVector2 upperRight(lowerLeft + pad.Dimensions()*2.0);
 174
 175         return fMathieson->IntXY(lowerLeft.X(),lowerLeft.Y(),
 176                            upperRight.X(),upperRight.Y());
 177 }
 178
 179 //_____________________________________________________________________________
 180 void
 181 AliMUONClusterSplitterMLEM::Fcn1(const AliMUONCluster& cluster,
 182                                     Int_t & /*fNpar*/, Double_t * /*gin*/,
 183                                     Double_t &f, Double_t *par, Int_t /*iflag*/)
 184 {
 185   /// Fit for one track
 186
 187   Int_t indx, npads=0;
 188   Double_t charge, delta, coef=0, chi2=0, qTot = 0;
 189
 190   for (Int_t j=0; j< cluster.Multiplicity(); ++j)
 191   {
 192     AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
 193     if ( pad->Status() != 1 ) continue;
 194     if ( pad->DX() > 0 ) npads++; // exclude virtual pads
 195     qTot += pad->Charge(); // c.fXyq[2][j];
 196     charge = 0;
 197     for (Int_t i=fNpar/3; i>=0; --i)
 198     { // sum over tracks
 199       indx = i<2 ? 2*i : 2*i+1;
 200       if (fNpar == 2)
 201       {
 202         coef = 1;
 203       }
 204       else
 205       {
 206         coef = i==fNpar/3 ? par[indx+2] : 1-coef;
 207       }
 208       coef = TMath::Max (coef, 0.);
 209       if ( fNpar == 8 && i < 2)
 210       {
 211         coef = i==1 ? coef*par[indx+2] : coef - par[7];
 212       }
 213       coef = TMath::Max (coef, 0.);
 214       charge += ChargeIntegration(par[indx],par[indx+1],*pad);
 215     }
 216     charge *= fQtot;
 217     delta = charge - pad->Charge(); //c.fXyq[2][j];
 218     delta *= delta;
 219     delta /= pad->Charge(); //c.fXyq[2][j];
 220     chi2 += delta;
 221   } // for (Int_t j=0;
 222   f = chi2;
 223   Double_t qAver = qTot/npads;
 224   f = chi2/qAver;
 225 }
 226
 227 //_____________________________________________________________________________
 228 Int_t
 229 AliMUONClusterSplitterMLEM::Fit(const AliMUONCluster& cluster,
 230                                 Int_t iSimple, Int_t nfit,
 231                                 Int_t *clustFit, TObjArray **clusters,
 232                                 Double_t *parOk,
 233                                 TObjArray& clusterList)
 234 {
 235   /// Find selected clusters to selected pad charges
 236
 237   //  AliDebug(2,Form("iSimple=%d nfit=%d",iSimple,nfit));
 238
 239   TH2D *mlem = (TH2D*) gROOT->FindObject("mlem");
 240   Double_t xmin = mlem->GetXaxis()->GetXmin() - mlem->GetXaxis()->GetBinWidth(1);
 241   Double_t xmax = mlem->GetXaxis()->GetXmax() + mlem->GetXaxis()->GetBinWidth(1);
 242   Double_t ymin = mlem->GetYaxis()->GetXmin() - mlem->GetYaxis()->GetBinWidth(1);
 243   Double_t ymax = mlem->GetYaxis()->GetXmax() + mlem->GetYaxis()->GetBinWidth(1);
 244   Double_t step[3]={0.01,0.002,0.02}, xPad = 0, yPad = 99999;
 245
 246   // Number of pads to use and number of virtual pads
 247   Int_t npads = 0, nVirtual = 0, nfit0 = nfit;
 248   for (Int_t i=0; i<cluster.Multiplicity(); ++i )
 249   {
 250     AliMUONPad* pad = cluster.Pad(i);
 251     if ( pad->DX() < 0 ) ++nVirtual;
 252     if ( pad->Status() !=1 ) continue;
 253     if ( pad->DX() > 0 )
 254     {
 255       ++npads;
 256       if (yPad > 9999)
 257       {
 258         xPad = pad->X();//fXyq[0][i];
 259         yPad = pad->Y();//fXyq[1][i];
 260       }
 261       else
 262       {
 263         if (pad->DY() < pad->DX() ) //fXyq[4][i] < fXyq[3][i])
 264         {
 265           yPad = pad->Y();//fXyq[1][i];
 266         }
 267         else
 268         {
 269           xPad = pad->X();//fXyq[0][i];
 270         }
 271       }
 272     }
 273   }
 274
 275   fNpar = 0;
 276   fQtot = 0;
 277
 278   if (npads < 2) return 0;
 279
 280   // FIXME : AliWarning("Reconnect the following code for hit/track passing ?");
 281
 282   //  Int_t tracks[3] = {-1, -1, -1};
 283
 284   /*
 285    Int_t digit = 0;
 286    AliMUONDigit *mdig = 0;
 287    for (Int_t cath=0; cath<2; cath++) {
 288      for (Int_t i=0; i<fnPads[0]+fnPads[1]; i++) {
 289        if (fPadIJ[0][i] != cath) continue;
 290        if (fPadIJ[1][i] != 1) continue;
 291        if (fXyq[3][i] < 0) continue; // exclude virtual pads
 292        digit = TMath::Nint (fXyq[5][i]);
 293        if (digit >= 0) mdig = fInput->Digit(cath,digit);
 294        else mdig = fInput->Digit(TMath::Even(cath),-digit-1);
 295        //if (!mdig) mdig = fInput->Digit(TMath::Even(cath),digit);
 296        if (!mdig) continue; // protection for cluster display
 297        if (mdig->Hit() >= 0) {
 298          if (tracks[0] < 0) {
 299            tracks[0] = mdig->Hit();
 300            tracks[1] = mdig->Track(0);
 301          } else if (mdig->Track(0) < tracks[1]) {
 302            tracks[0] = mdig->Hit();
 303            tracks[1] = mdig->Track(0);
 304          }
 305        }
 306        if (mdig->Track(1) >= 0 && mdig->Track(1) != tracks[1]) {
 307          if (tracks[2] < 0) tracks[2] = mdig->Track(1);
 308          else tracks[2] = TMath::Min (tracks[2], mdig->Track(1));
 309        }
 310      } // for (Int_t i=0;
 311   } // for (Int_t cath=0;
 312    */
 313
 314   // Get number of pads in X and Y
 315 //  Int_t nInX = 0, nInY;
 316 //  PadsInXandY(cluster,nInX, nInY);
 317   const Int_t kStatusToTest(1);
 318
 319   AliMpIntPair nofPads = cluster.NofPads(kStatusToTest);
 320   Int_t nInX = nofPads.GetFirst();
 321   Int_t nInY = nofPads.GetSecond();
 322   //cout << " nInX and Y: " << nInX << " " << nInY << endl;
 323
 324   Int_t nfitMax = 3;
 325   nfitMax = TMath::Min (nfitMax, (npads + 1) / 3);
 326   if (nfitMax > 1) {
 327     if (nInX < 3 && nInY < 3 || nInX == 3 && nInY < 3 || nInX < 3 && nInY == 3) nfitMax = 1; // not enough pads in each direction
 328   }
 329   if (nfit > nfitMax) nfit = nfitMax;
 330
 331   // Take cluster maxima as fitting seeds
 332   TObjArray *pix;
 333   AliMUONPad *pixPtr;
 334   Int_t npxclu;
 335   Double_t cont, cmax = 0, xseed = 0, yseed = 0, errOk[8], qq = 0;
 336   Double_t xyseed[3][2], qseed[3], xyCand[3][2] = {{0},{0}}, sigCand[3][2] = {{0},{0}};
 337
 338   for (Int_t ifit=1; ifit<=nfit0; ifit++)
 339   {
 340     cmax = 0;
 341     pix = clusters[clustFit[ifit-1]];
 342     npxclu = pix->GetEntriesFast();
 343     //qq = 0;
 344     for (Int_t clu=0; clu<npxclu; ++clu)
 345     {
 346       pixPtr = (AliMUONPad*) pix->UncheckedAt(clu);
 347       cont = pixPtr->Charge();
 348       fQtot += cont;
 349       if (cont > cmax)
 350       {
 351         cmax = cont;
 352         xseed = pixPtr->Coord(0);
 353         yseed = pixPtr->Coord(1);
 354       }
 355       qq += cont;
 356       xyCand[0][0] += pixPtr->Coord(0) * cont;
 357       xyCand[0][1] += pixPtr->Coord(1) * cont;
 358       sigCand[0][0] += pixPtr->Coord(0) * pixPtr->Coord(0) * cont;
 359       sigCand[0][1] += pixPtr->Coord(1) * pixPtr->Coord(1) * cont;
 360     }
 361     xyseed[ifit-1][0] = xseed;
 362     xyseed[ifit-1][1] = yseed;
 363     qseed[ifit-1] = cmax;
 364   } // for (Int_t ifit=1;
 365
 366   xyCand[0][0] /= qq; // <x>
 367   xyCand[0][1] /= qq; // <y>
 368   sigCand[0][0] = sigCand[0][0]/qq - xyCand[0][0]*xyCand[0][0]; // <x^2> - <x>^2
 369   sigCand[0][0] = sigCand[0][0] > 0 ? TMath::Sqrt (sigCand[0][0]) : 0;
 370   sigCand[0][1] = sigCand[0][1]/qq - xyCand[0][1]*xyCand[0][1]; // <y^2> - <y>^2
 371   sigCand[0][1] = sigCand[0][1] > 0 ? TMath::Sqrt (sigCand[0][1]) : 0;
 372 //  if (fDebug) cout << xyCand[0][0] << " " << xyCand[0][1] << " " << sigCand[0][0] << " " << sigCand[0][1] << endl;
 373
 374   Int_t nDof, maxSeed[3];//, nMax = 0;
 375     Double_t fmin, chi2o = 9999, chi2n;
 376
 377     TMath::Sort(nfit0, qseed, maxSeed, kTRUE); // in decreasing order
 378
 379     Double_t *gin = 0, func0, func1, param[8], step0[8];
 380     Double_t param0[2][8]={{0},{0}}, deriv[2][8]={{0},{0}};
 381     Double_t shift[8], stepMax, derMax, parmin[8], parmax[8], func2[2], shift0;
 382     Double_t delta[8], scMax, dder[8], estim, shiftSave = 0;
 383     Int_t min, max, nCall = 0, memory[8] = {0}, nLoop, idMax = 0, iestMax = 0, nFail;
 384     Double_t rad, dist[3] = {0};
 385
 386     // Try to fit with one-track hypothesis, then 2-track. If chi2/dof is
 387     // lower, try 3-track (if number of pads is sufficient).
 388     for (Int_t iseed=0; iseed<nfit; iseed++)
 389     {
 390
 391       if (iseed)
 392       {
 393         for (Int_t j=0; j<fNpar; j++)
 394         {
 395           param[j] = parOk[j];
 396         }
 397       } // for bounded params
 398
 399       for (Int_t j=0; j<3; j++)
 400       {
 401         step0[fNpar+j] = shift[fNpar+j] = step[j];
 402       }
 403
 404       if (nfit == 1)
 405       {
 406         param[fNpar] = xyCand[0][0]; // take COG
 407       }
 408       else
 409       {
 410         param[fNpar] = xyseed[maxSeed[iseed]][0];
 411       }
 412       parmin[fNpar] = xmin;
 413       parmax[fNpar++] = xmax;
 414       if (nfit == 1)
 415       {
 416         param[fNpar] = xyCand[0][1]; // take COG
 417       }
 418       else
 419       {
 420         param[fNpar] = xyseed[maxSeed[iseed]][1];
 421       }
 422       parmin[fNpar] = ymin;
 423       parmax[fNpar++] = ymax;
 424       if (fNpar > 2)
 425       {
 426         param[fNpar] = fNpar == 4 ? 0.5 : 0.3;
 427         parmin[fNpar] = 0;
 428         parmax[fNpar++] = 1;
 429       }
 430       if (iseed)
 431       {
 432         for (Int_t j=0; j<fNpar; j++)
 433         {
 434           param0[1][j] = 0;
 435         }
 436       }
 437
 438       // Try new algorithm
 439       min = nLoop = 1; stepMax = func2[1] = derMax = 999999; nFail = 0;
 440
 441       while (1)
 442       {
 443         max = !min;
 444         Fcn1(cluster,fNpar, gin, func0, param, 1); nCall++;
 445         //cout << " Func: " << func0 << endl;
 446
 447         func2[max] = func0;
 448         for (Int_t j=0; j<fNpar; j++)
 449         {
 450           param0[max][j] = param[j];
 451           delta[j] = step0[j];
 452           param[j] += delta[j] / 10;
 453           if (j > 0) param[j-1] -= delta[j-1] / 10;
 454           Fcn1(cluster,fNpar, gin, func1, param, 1); nCall++;
 455           deriv[max][j] = (func1 - func0) / delta[j] * 10; // first derivative
 456                                                            //cout << j << " " << deriv[max][j] << endl;
 457           dder[j] = param0[0][j] != param0[1][j] ? (deriv[0][j] - deriv[1][j]) /
 458             (param0[0][j] - param0[1][j]) : 0; // second derivative
 459         }
 460         param[fNpar-1] -= delta[fNpar-1] / 10;
 461         if (nCall > 2000) break;
 462
 463         min = func2[0] < func2[1] ? 0 : 1;
 464         nFail = min == max ? 0 : nFail + 1;
 465
 466         stepMax = derMax = estim = 0;
 467         for (Int_t j=0; j<fNpar; j++)
 468         {
 469           // Estimated distance to minimum
 470           shift0 = shift[j];
 471           if (nLoop == 1)
 472           {
 473             shift[j] = TMath::Sign (step0[j], -deriv[max][j]); // first step
 474           }
 475           else if (TMath::Abs(deriv[0][j]) < 1.e-3 && TMath::Abs(deriv[1][j]) < 1.e-3)
 476           {
 477             shift[j] = 0;
 478           }
 479           else if (deriv[min][j]*deriv[!min][j] > 0 && TMath::Abs(deriv[min][j]) > TMath::Abs(deriv[!min][j])
 480                    || TMath::Abs(deriv[0][j]-deriv[1][j]) < 1.e-3 || TMath::Abs(dder[j]) < 1.e-6)
 481           {
 482             shift[j] = -TMath::Sign (shift[j], (func2[0]-func2[1]) * (param0[0][j]-param0[1][j]));
 483           }
 484           if (min == max)
 485           {
 486             if (memory[j] > 1)
 487             {
 488               shift[j] *= 2;
 489             }
 490             memory[j]++;
 491           }
 492           else
 493           {
 494             shift[j] = dder[j] != 0 ? -deriv[min][j] / dder[j] : 0;
 495             memory[j] = 0;
 496           }
 497
 498           if (TMath::Abs(shift[j])/step0[j] > estim)
 499           {
 500             estim = TMath::Abs(shift[j])/step0[j];
 501             iestMax = j;
 502           }
 503
 504           // Too big step
 505           if (TMath::Abs(shift[j])/step0[j] > 10) shift[j] = TMath::Sign(10.,shift[j]) * step0[j]; //
 506
 507           // Failed to improve minimum
 508           if (min != max)
 509           {
 510             memory[j] = 0;
 511             param[j] = param0[min][j];
 512             if (TMath::Abs(shift[j]+shift0) > 0.1*step0[j])
 513             {
 514               shift[j] = (shift[j] + shift0) / 2;
 515             }
 516             else
 517             {
 518               shift[j] /= -2;
 519             }
 520           }
 521
 522           // Too big step
 523           if (TMath::Abs(shift[j]*deriv[min][j]) > func2[min])
 524           {
 525             shift[j] = TMath::Sign (func2[min]/deriv[min][j], shift[j]);
 526           }
 527
 528           // Introduce step relaxation factor
 529           if (memory[j] < 3)
 530           {
 531             scMax = 1 + 4 / TMath::Max(nLoop/2.,1.);
 532             if (TMath::Abs(shift0) > 0 && TMath::Abs(shift[j]/shift0) > scMax)
 533             {
 534               shift[j] = TMath::Sign (shift0*scMax, shift[j]);
 535             }
 536           }
 537           param[j] += shift[j];
 538           //MLEM Check parameter limits 27-12-2004
 539           if (param[j] < parmin[j])
 540           {
 541             shift[j] = parmin[j] - param[j];
 542             param[j] = parmin[j];
 543           }
 544           else if (param[j] > parmax[j])
 545           {
 546             shift[j] = parmax[j] - param[j];
 547             param[j] = parmax[j];
 548           }
 549           //cout << " xxx " << j << " " << shift[j] << " " << param[j] << endl;
 550           stepMax = TMath::Max (stepMax, TMath::Abs(shift[j]/step0[j]));
 551           if (TMath::Abs(deriv[min][j]) > derMax)
 552           {
 553             idMax = j;
 554             derMax = TMath::Abs (deriv[min][j]);
 555           }
 556         } // for (Int_t j=0; j<fNpar;
 557
 558         if (estim < 1 && derMax < 2 || nLoop > 150) break; // minimum was found
 559
 560         nLoop++;
 561
 562         // Check for small step
 563         if (shift[idMax] == 0)
 564         {
 565           shift[idMax] = step0[idMax]/10;
 566           param[idMax] += shift[idMax];
 567           continue;
 568         }
 569
 570         if (!memory[idMax] && derMax > 0.5 && nLoop > 10)
 571         {
 572           if (dder[idMax] != 0 && TMath::Abs(deriv[min][idMax]/dder[idMax]/shift[idMax]) > 10)
 573           {
 574             if (min == max) dder[idMax] = -dder[idMax];
 575             shift[idMax] = -deriv[min][idMax] / dder[idMax] / 10;
 576             param[idMax] += shift[idMax];
 577             stepMax = TMath::Max (stepMax, TMath::Abs(shift[idMax])/step0[idMax]);
 578             if (min == max) shiftSave = shift[idMax];
 579           }
 580           if (nFail > 10)
 581           {
 582             param[idMax] -= shift[idMax];
 583             shift[idMax] = 4 * shiftSave * (gRandom->Rndm(0) - 0.5);
 584             param[idMax] += shift[idMax];
 585           }
 586         }
 587   } // while (1)
 588
 589       fmin = func2[min];
 590
 591       nDof = npads - fNpar + nVirtual;
 592       if (!nDof) nDof++;
 593       chi2n = fmin / nDof;
 594 //      if (fDebug) cout << " Chi2 " << chi2n << " " << fNpar << endl;
 595
 596       if (chi2n*1.2+1.e-6 > chi2o ) { fNpar -= 3; break; }
 597
 598       // Save parameters and errors
 599
 600       if (nInX == 1) {
 601         // One pad per direction
 602         for (Int_t i=0; i<fNpar; i++) if (i == 0 || i == 2 || i == 5) param0[min][i] = xPad;
 603       }
 604       if (nInY == 1) {
 605         // One pad per direction
 606         for (Int_t i=0; i<fNpar; i++) if (i == 1 || i == 3 || i == 6) param0[min][i] = yPad;
 607       }
 608
 609       /*
 610        if (iseed > 0) {
 611          // Find distance to the nearest neighbour
 612          dist[0] = dist[1] = TMath::Sqrt ((param0[min][0]-param0[min][2])*
 613                                           (param0[min][0]-param0[min][2])
 614                                           +(param0[min][1]-param0[min][3])*
 615                                           (param0[min][1]-param0[min][3]));
 616          if (iseed > 1) {
 617            dist[2] = TMath::Sqrt ((param0[min][0]-param0[min][5])*
 618                                   (param0[min][0]-param0[min][5])
 619                                   +(param0[min][1]-param0[min][6])*
 620                                   (param0[min][1]-param0[min][6]));
 621            rad = TMath::Sqrt ((param0[min][2]-param0[min][5])*
 622                               (param0[min][2]-param0[min][5])
 623                               +(param0[min][3]-param0[min][6])*
 624                               (param0[min][3]-param0[min][6]));
 625            if (dist[2] < dist[0]) dist[0] = dist[2];
 626            if (rad < dist[1]) dist[1] = rad;
 627            if (rad < dist[2]) dist[2] = rad;
 628          }
 629          cout << dist[0] << " " << dist[1] << " " << dist[2] << endl;
 630          if (dist[TMath::LocMin(iseed+1,dist)] < 1.) { fNpar -= 3; break; }
 631        }
 632        */
 633
 634       for (Int_t i=0; i<fNpar; i++) {
 635         parOk[i] = param0[min][i];
 636         //errOk[i] = fmin;
 637         errOk[i] = chi2n;
 638         // Bounded params
 639         parOk[i] = TMath::Max (parOk[i], parmin[i]);
 640         parOk[i] = TMath::Min (parOk[i], parmax[i]);
 641       }
 642
 643       chi2o = chi2n;
 644       if (fmin < 0.1) break; // !!!???
 645   } // for (Int_t iseed=0;
 646
 647 //    if (fDebug) {
 648 //      for (Int_t i=0; i<fNpar; i++) {
 649 //        if (i == 4 || i == 7) {
 650 //          if (i == 7 || i == 4 && fNpar < 7) cout << parOk[i] << endl;
 651 //          else cout << parOk[i] * (1-parOk[7]) << endl;
 652 //          continue;
 653 //        }
 654 //        cout << parOk[i] << " " << errOk[i] << endl;
 655 //      }
 656 //    }
 657     nfit = (fNpar + 1) / 3;
 658     dist[0] = dist[1] = dist[2] = 0;
 659
 660     if (nfit > 1) {
 661       // Find distance to the nearest neighbour
 662       dist[0] = dist[1] = TMath::Sqrt ((parOk[0]-parOk[2])*
 663                                        (parOk[0]-parOk[2])
 664                                        +(parOk[1]-parOk[3])*
 665                                        (parOk[1]-parOk[3]));
 666       if (nfit > 2) {
 667         dist[2] = TMath::Sqrt ((parOk[0]-parOk[5])*
 668                                (parOk[0]-parOk[5])
 669                                +(parOk[1]-parOk[6])*
 670                                (parOk[1]-parOk[6]));
 671         rad = TMath::Sqrt ((parOk[2]-parOk[5])*
 672                            (parOk[2]-parOk[5])
 673                            +(parOk[3]-parOk[6])*
 674                            (parOk[3]-parOk[6]));
 675         if (dist[2] < dist[0]) dist[0] = dist[2];
 676         if (rad < dist[1]) dist[1] = rad;
 677         if (rad < dist[2]) dist[2] = rad;
 678       }
 679     }
 680
 681     Int_t indx;
 682
 683     //if (!fDraw) {
 684
 685     Double_t coef = 0;
 686     if (iSimple) fnCoupled = 0;
 687     //for (Int_t j=0; j<nfit; j++) {
 688     for (Int_t j=nfit-1; j>=0; j--) {
 689       indx = j<2 ? j*2 : j*2+1;
 690       if (nfit == 1) coef = 1;
 691       else coef = j==nfit-1 ? parOk[indx+2] : 1-coef;
 692       coef = TMath::Max (coef, 0.);
 693       if (nfit == 3 && j < 2) coef = j==1 ? coef*parOk[indx+2] : coef - parOk[7];
 694       coef = TMath::Max (coef, 0.);
 695
 696       //void AliMUONClusterFinderMLEM::AddRawCluster(Double_t x, Double_t y,
 697       //                                             Double_t qTot, Double_t fmin,
 698       //                                             Int_t nfit, Int_t *tracks,
 699       //                                             Double_t /*sigx*/,
 700       //                                             Double_t /*sigy*/,
 701       //                                             Double_t /*dist*/)
 702
 703       if ( coef*fQtot >= 14 )
 704       {
 705         AliMUONCluster* cluster = new AliMUONCluster();
 706
 707         cluster->SetCharge(coef*fQtot,coef*fQtot);
 708         cluster->SetPosition(TVector2(parOk[indx],parOk[indx+1]),TVector2(sigCand[0][0],sigCand[0][1]));
 709         cluster->SetChi2(dist[TMath::LocMin(nfit,dist)]);
 710
 711         // FIXME: we miss some information in this cluster, as compared to
 712         // the original AddRawCluster code.
 713
 714         AliDebug(2,Form("Adding RawCluster detElemId %4d mult %2d charge %5d (xl,yl)=(%9.6g,%9.6g)",
 715                         fDetElemId,cluster->Multiplicity(),(Int_t)cluster->Charge(),
 716                         cluster->Position().X(),cluster->Position().Y()));
 717
 718         clusterList.Add(cluster);
 719       }
 720       //      AddRawCluster (parOk[indx], // double x
 721       //                     parOk[indx+1], // double y
 722       //                     coef*qTot, // double charge
 723       //                     errOk[indx], // double fmin
 724       //                     nfit0+10*nfit+100*nMax+10000*fnCoupled, // int nfit
 725       //                     tracks, // int* tracks
 726       //                     sigCand[0][0], // double sigx
 727       //                     sigCand[0][1], // double sigy
 728       //                     dist[TMath::LocMin(nfit,dist)] // double dist
 729       //                     );
 730     }
 731     return nfit;
 732     }
 733
 734
 735 //_____________________________________________________________________________
 736 void
 737 AliMUONClusterSplitterMLEM::Split(const AliMUONCluster& cluster,
 738                                   TH2 *mlem,
 739                                   Double_t *coef,
 740                                   TObjArray& clusterList)
 741 {
 742   /// The main steering function to work with clusters of pixels in anode
 743   /// plane (find clusters, decouple them from each other, merge them (if
 744   /// necessary), pick up coupled pads, call the fitting function)
 745
 746   Int_t nx = mlem->GetNbinsX();
 747   Int_t ny = mlem->GetNbinsY();
 748   Int_t nPix = fPixArray->GetEntriesFast();
 749
 750   Bool_t *used = new Bool_t[ny*nx];
 751   Double_t cont;
 752   Int_t nclust = 0, indx, indx1;
 753
 754   for (Int_t i=0; i<ny*nx; i++) used[i] = kFALSE;
 755
 756   TObjArray *clusters[200]={0};
 757   TObjArray *pix;
 758
 759   // Find clusters of histogram bins (easier to work in 2-D space)
 760   for (Int_t i=1; i<=ny; i++)
 761   {
 762     for (Int_t j=1; j<=nx; j++)
 763     {
 764       indx = (i-1)*nx + j - 1;
 765       if (used[indx]) continue;
 766       cont = mlem->GetCellContent(j,i);
 767       if (cont < 0.5) continue;
 768       pix = new TObjArray(20);
 769       used[indx] = 1;
 770       pix->Add(BinToPix(mlem,j,i));
 771       AddBin(mlem, i, j, 0, used, pix); // recursive call
 772       if (nclust >= 200) AliFatal(" Too many clusters !!!");
 773       clusters[nclust++] = pix;
 774     } // for (Int_t j=1; j<=nx; j++) {
 775     } // for (Int_t i=1; i<=ny;
 776 //  if (fDebug) cout << nclust << endl;
 777   delete [] used; used = 0;
 778
 779   // Compute couplings between clusters and clusters to pads
 780   Int_t npad = cluster.Multiplicity();
 781
 782   // Exclude pads with overflows
 783   for (Int_t j=0; j<npad; ++j)
 784   {
 785     AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
 786     if ( pad->IsSaturated() )
 787     {
 788       pad->SetStatus(-5);
 789     }
 790     else
 791     {
 792       pad->SetStatus(0);
 793     }
 794   }
 795
 796   // Compute couplings of clusters to pads
 797   TMatrixD aijclupad(nclust,npad);
 798   aijclupad = 0;
 799   Int_t npxclu;
 800   for (Int_t iclust=0; iclust<nclust; ++iclust)
 801   {
 802     pix = clusters[iclust];
 803     npxclu = pix->GetEntriesFast();
 804     for (Int_t i=0; i<npxclu; ++i)
 805     {
 806       indx = fPixArray->IndexOf(pix->UncheckedAt(i));
 807       for (Int_t j=0; j<npad; ++j)
 808       {
 809         AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
 810         if ( pad->Status() < 0 && pad->Status() != -5) continue;
 811         if (coef[j*nPix+indx] < fgkCouplMin) continue;
 812         aijclupad(iclust,j) += coef[j*nPix+indx];
 813       }
 814     }
 815   }
 816
 817   // Compute couplings between clusters
 818   TMatrixD aijcluclu(nclust,nclust);
 819   aijcluclu = 0;
 820   for (Int_t iclust=0; iclust<nclust; ++iclust)
 821   {
 822     for (Int_t j=0; j<npad; ++j)
 823     {
 824       // Exclude overflows
 825       if ( cluster.Pad(j)->Status() < 0) continue;
 826       if (aijclupad(iclust,j) < fgkCouplMin) continue;
 827       for (Int_t iclust1=iclust+1; iclust1<nclust; iclust1++)
 828       {
 829         if (aijclupad(iclust1,j) < fgkCouplMin) continue;
 830         aijcluclu(iclust,iclust1) +=
 831           TMath::Sqrt (aijclupad(iclust,j)*aijclupad(iclust1,j));
 832       }
 833     }
 834   }
 835   for (Int_t iclust=0; iclust<nclust; ++iclust)
 836   {
 837     for (Int_t iclust1=iclust+1; iclust1<nclust; ++iclust1)
 838     {
 839       aijcluclu(iclust1,iclust) = aijcluclu(iclust,iclust1);
 840     }
 841   }
 842
 843   // Find groups of coupled clusters
 844   used = new Bool_t[nclust];
 845   for (Int_t i=0; i<nclust; i++) used[i] = kFALSE;
 846   Int_t *clustNumb = new Int_t[nclust];
 847   Int_t nCoupled, nForFit, minGroup[3], clustFit[3], nfit = 0;
 848   Double_t parOk[8];
 849
 850   for (Int_t igroup=0; igroup<nclust; igroup++)
 851   {
 852     if (used[igroup]) continue;
 853     used[igroup] = kTRUE;
 854     clustNumb[0] = igroup;
 855     nCoupled = 1;
 856     // Find group of coupled clusters
 857     AddCluster(igroup, nclust, aijcluclu, used, clustNumb, nCoupled); // recursive
 858
 859     //    if (fDebug) {
 860     //      cout << " nCoupled: " << nCoupled << endl;
 861     //      for (Int_t i=0; i<nCoupled; i++) cout << clustNumb[i] << " "; cout << endl;
 862     //    }
 863
 864     fnCoupled = nCoupled;
 865
 866     while (nCoupled > 0)
 867     {
 868       if (nCoupled < 4)
 869       {
 870         nForFit = nCoupled;
 871         for (Int_t i=0; i<nCoupled; i++) clustFit[i] = clustNumb[i];
 872       }
 873       else
 874       {
 875         // Too many coupled clusters to fit - try to decouple them
 876         // Find the lowest coupling of 1, 2, min(3,nLinks/2) pixels with
 877         // all the others in the group
 878         for (Int_t j=0; j<3; j++) minGroup[j] = -1;
 879         /*Double_t coupl =*/ MinGroupCoupl(nCoupled, clustNumb, aijcluclu, minGroup);
 880
 881         // Flag clusters for fit
 882         nForFit = 0;
 883         while (minGroup[nForFit] >= 0 && nForFit < 3)
 884         {
 885           clustFit[nForFit] = clustNumb[minGroup[nForFit]];
 886           clustNumb[minGroup[nForFit]] -= 999;
 887           nForFit++;
 888         }
 889       } // else
 890
 891       // Select pads for fit.
 892       if (SelectPad(cluster,nCoupled, nForFit, clustNumb, clustFit, aijclupad) < 3 && nCoupled > 1)
 893       {
 894         // Deselect pads
 895         for (Int_t j=0; j<npad; ++j)
 896         {
 897           AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
 898           if ( pad->Status()==1 ) pad->SetStatus(0);
 899           if ( pad->Status()==-9) pad->SetStatus(-5);
 900         }
 901         // Merge the failed cluster candidates (with too few pads to fit) with
 902         // the one with the strongest coupling
 903         Merge(cluster,nForFit, nCoupled, clustNumb, clustFit, clusters, aijcluclu, aijclupad);
 904       }
 905       else
 906       {
 907         // Do the fit
 908         nfit = Fit(cluster,0, nForFit, clustFit, clusters, parOk, clusterList);
 909       }
 910
 911       // Subtract the fitted charges from pads with strong coupling and/or
 912       // return pads for further use
 913       UpdatePads(cluster,nfit, parOk);
 914
 915       // Mark used pads
 916       for (Int_t j=0; j<npad; ++j)
 917       {
 918         AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
 919         if ( pad->Status()==1 ) pad->SetStatus(-1);
 920         if ( pad->Status()==-9) pad->SetStatus(-5);
 921       }
 922
 923       // Sort the clusters (move to the right the used ones)
 924       Int_t beg = 0, end = nCoupled - 1;
 925       while (beg < end)
 926       {
 927         if (clustNumb[beg] >= 0) { ++beg; continue; }
 928         for (Int_t j=end; j>beg; --j)
 929         {
 930           if (clustNumb[j] < 0) continue;
 931           end = j - 1;
 932           indx = clustNumb[beg];
 933           clustNumb[beg] = clustNumb[j];
 934           clustNumb[j] = indx;
 935           break;
 936         }
 937         ++beg;
 938       }
 939
 940       nCoupled -= nForFit;
 941       if (nCoupled > 3)
 942       {
 943         // Remove couplings of used clusters
 944         for (Int_t iclust=nCoupled; iclust<nCoupled+nForFit;++ iclust)
 945         {
 946           indx = clustNumb[iclust] + 999;
 947           for (Int_t iclust1=0; iclust1<nCoupled; ++iclust1)
 948           {
 949             indx1 = clustNumb[iclust1];
 950             aijcluclu(indx,indx1) = aijcluclu(indx1,indx) = 0;
 951           }
 952         }
 953
 954         // Update the remaining clusters couplings (exclude couplings from
 955         // the used pads)
 956         for (Int_t j=0; j<npad; ++j)
 957         {
 958           AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
 959           if ( pad->Status() != -1) continue;
 960           for (Int_t iclust=0; iclust<nCoupled; ++iclust)
 961           {
 962             indx = clustNumb[iclust];
 963             if (aijclupad(indx,j) < fgkCouplMin) continue;
 964             for (Int_t iclust1=iclust+1; iclust1<nCoupled; ++iclust1)
 965             {
 966               indx1 = clustNumb[iclust1];
 967               if (aijclupad(indx1,j) < fgkCouplMin) continue;
 968               // Check this
 969               aijcluclu(indx,indx1) -=
 970                 TMath::Sqrt (aijclupad(indx,j)*aijclupad(indx1,j));
 971               aijcluclu(indx1,indx) = aijcluclu(indx,indx1);
 972             }
 973           }
 974           pad->SetStatus(-8);
 975         } // for (Int_t j=0; j<npad;
 976       } // if (nCoupled > 3)
 977     } // while (nCoupled > 0)
 978   } // for (Int_t igroup=0; igroup<nclust;
 979
 980   for (Int_t iclust=0; iclust<nclust; iclust++)
 981   {
 982     pix = clusters[iclust];
 983     pix->Clear();
 984     delete pix;
 985     pix = 0;
 986   }
 987   delete [] clustNumb;
 988   clustNumb = 0;
 989   delete [] used;
 990   used = 0;
 991
 992 }
 993
 994 //_____________________________________________________________________________
 995 void
 996 AliMUONClusterSplitterMLEM::Merge(const AliMUONCluster& cluster,
 997                                      Int_t nForFit, Int_t nCoupled,
 998                                      Int_t *clustNumb, Int_t *clustFit,
 999                                      TObjArray **clusters,
1000                                      TMatrixD& aijcluclu, TMatrixD& aijclupad)
1001 {
1002   /// Merge the group of clusters with the one having the strongest coupling with them
1003
1004   Int_t indx, indx1, npxclu, npxclu1, imax=0;
1005   TObjArray *pix, *pix1;
1006   Double_t couplMax;
1007
1008   for (Int_t icl=0; icl<nForFit; ++icl)
1009   {
1010     indx = clustFit[icl];
1011     pix = clusters[indx];
1012     npxclu = pix->GetEntriesFast();
1013     couplMax = -1;
1014     for (Int_t icl1=0; icl1<nCoupled; ++icl1)
1015     {
1016       indx1 = clustNumb[icl1];
1017       if (indx1 < 0) continue;
1018       if ( aijcluclu(indx,indx1) > couplMax)
1019       {
1020         couplMax = aijcluclu(indx,indx1);
1021         imax = indx1;
1022       }
1023     } // for (Int_t icl1=0;
1024       // Add to it
1025     pix1 = clusters[imax];
1026     npxclu1 = pix1->GetEntriesFast();
1027     // Add pixels
1028     for (Int_t i=0; i<npxclu; ++i)
1029     {
1030       pix1->Add(pix->UncheckedAt(i));
1031       pix->RemoveAt(i);
1032     }
1033
1034     //Add cluster-to-cluster couplings
1035     for (Int_t icl1=0; icl1<nCoupled; ++icl1)
1036     {
1037       indx1 = clustNumb[icl1];
1038       if (indx1 < 0 || indx1 == imax) continue;
1039       aijcluclu(indx1,imax) += aijcluclu(indx,indx1);
1040       aijcluclu(imax,indx1) = aijcluclu(indx1,imax);
1041     }
1042     aijcluclu(indx,imax) = aijcluclu(imax,indx) = 0;
1043
1044     //Add cluster-to-pad couplings
1045     for (Int_t j=0; j<cluster.Multiplicity(); ++j)
1046     {
1047       AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
1048       if ( pad->Status() < 0 && pad->Status() != -5 ) continue;// exclude used pads
1049         aijclupad(imax,j) += aijclupad(indx,j);
1050         aijclupad(indx,j) = 0;
1051     }
1052   } // for (Int_t icl=0; icl<nForFit;
1053 }
1054
1055
1056 //_____________________________________________________________________________
1057 Double_t
1058 AliMUONClusterSplitterMLEM::MinGroupCoupl(Int_t nCoupled, Int_t *clustNumb,
1059                                           TMatrixD& aijcluclu, Int_t *minGroup)
1060 {
1061   /// Find group of clusters with minimum coupling to all the others
1062
1063   Int_t i123max = TMath::Min(3,nCoupled/2);
1064   Int_t indx, indx1, indx2, indx3, nTot = 0;
1065   Double_t *coupl1 = 0, *coupl2 = 0, *coupl3 = 0;
1066
1067   for (Int_t i123=1; i123<=i123max; i123++) {
1068
1069     if (i123 == 1) {
1070       coupl1 = new Double_t [nCoupled];
1071       for (Int_t i=0; i<nCoupled; i++) coupl1[i] = 0;
1072     }
1073     else if (i123 == 2) {
1074       nTot = nCoupled*nCoupled;
1075       coupl2 = new Double_t [nTot];
1076       for (Int_t i=0; i<nTot; i++) coupl2[i] = 9999;
1077     } else {
1078       nTot = nTot*nCoupled;
1079       coupl3 = new Double_t [nTot];
1080       for (Int_t i=0; i<nTot; i++) coupl3[i] = 9999;
1081     } // else
1082
1083     for (Int_t i=0; i<nCoupled; i++) {
1084       indx1 = clustNumb[i];
1085       for (Int_t j=i+1; j<nCoupled; j++) {
1086         indx2 = clustNumb[j];
1087         if (i123 == 1) {
1088           coupl1[i] += aijcluclu(indx1,indx2);
1089           coupl1[j] += aijcluclu(indx1,indx2);
1090         }
1091         else if (i123 == 2) {
1092           indx = i*nCoupled + j;
1093           coupl2[indx] = coupl1[i] + coupl1[j];
1094           coupl2[indx] -= 2 * (aijcluclu(indx1,indx2));
1095         } else {
1096           for (Int_t k=j+1; k<nCoupled; k++) {
1097             indx3 = clustNumb[k];
1098             indx = i*nCoupled*nCoupled + j*nCoupled + k;
1099             coupl3[indx] = coupl2[i*nCoupled+j] + coupl1[k];
1100             coupl3[indx] -= 2 * (aijcluclu(indx1,indx3)+aijcluclu(indx2,indx3));
1101           }
1102         } // else
1103       } // for (Int_t j=i+1;
1104     } // for (Int_t i=0;
1105   } // for (Int_t i123=1;
1106
1107   // Find minimum coupling
1108   Double_t couplMin = 9999;
1109   Int_t locMin = 0;
1110
1111   for (Int_t i123=1; i123<=i123max; i123++) {
1112     if (i123 == 1) {
1113       locMin = TMath::LocMin(nCoupled, coupl1);
1114       couplMin = coupl1[locMin];
1115       minGroup[0] = locMin;
1116       delete [] coupl1; coupl1 = 0;
1117     }
1118     else if (i123 == 2) {
1119       locMin = TMath::LocMin(nCoupled*nCoupled, coupl2);
1120       if (coupl2[locMin] < couplMin) {
1121         couplMin = coupl2[locMin];
1122         minGroup[0] = locMin/nCoupled;
1123         minGroup[1] = locMin%nCoupled;
1124       }
1125       delete [] coupl2; coupl2 = 0;
1126     } else {
1127       locMin = TMath::LocMin(nTot, coupl3);
1128       if (coupl3[locMin] < couplMin) {
1129         couplMin = coupl3[locMin];
1130         minGroup[0] = locMin/nCoupled/nCoupled;
1131         minGroup[1] = locMin%(nCoupled*nCoupled)/nCoupled;
1132         minGroup[2] = locMin%nCoupled;
1133       }
1134       delete [] coupl3; coupl3 = 0;
1135     } // else
1136   } // for (Int_t i123=1;
1137   return couplMin;
1138 }
1139
1140 //_____________________________________________________________________________
1141 Int_t
1142 AliMUONClusterSplitterMLEM::SelectPad(const AliMUONCluster& cluster,
1143                                           Int_t nCoupled, Int_t nForFit,
1144                                           Int_t *clustNumb, Int_t *clustFit,
1145                                           TMatrixD& aijclupad)
1146 {
1147   /// Select pads for fit. If too many coupled clusters, find pads giving
1148   /// the strongest coupling with the rest of clusters and exclude them from the fit.
1149
1150   Int_t npad = cluster.Multiplicity();
1151   Double_t *padpix = 0;
1152
1153   if (nCoupled > 3)
1154   {
1155     padpix = new Double_t[npad];
1156     for (Int_t i=0; i<npad; i++) padpix[i] = 0;
1157   }
1158
1159   Int_t nOK = 0, indx, indx1;
1160   for (Int_t iclust=0; iclust<nForFit; ++iclust)
1161   {
1162     indx = clustFit[iclust];
1163     for (Int_t j=0; j<npad; j++)
1164     {
1165       if ( aijclupad(indx,j) < fgkCouplMin) continue;
1166       AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
1167       if ( pad->Status() == -5 ) pad->SetStatus(-0); // flag overflow
1168       if ( pad->Status() < 0 ) continue; // exclude overflows and used pads
1169       if ( !pad->Status() )
1170       {
1171         pad->SetStatus(1);
1172         ++nOK; // pad to be used in fit
1173       }
1174       if (nCoupled > 3)
1175       {
1176         // Check other clusters
1177         for (Int_t iclust1=0; iclust1<nCoupled; ++iclust1)
1178         {
1179           indx1 = clustNumb[iclust1];
1180           if (indx1 < 0) continue;
1181           if ( aijclupad(indx1,j) < fgkCouplMin ) continue;
1182           padpix[j] += aijclupad(indx1,j);
1183         }
1184       } // if (nCoupled > 3)
1185     } // for (Int_t j=0; j<npad;
1186   } // for (Int_t iclust=0; iclust<nForFit
1187   if (nCoupled < 4) return nOK;
1188
1189   Double_t aaa = 0;
1190   for (Int_t j=0; j<npad; ++j)
1191   {
1192     if (padpix[j] < fgkCouplMin) continue;
1193     aaa += padpix[j];
1194     cluster.Pad(j)->SetStatus(-1); // exclude pads with strong coupling to the other clusters
1195     nOK--;
1196   }
1197   delete [] padpix;
1198   padpix = 0;
1199   return nOK;
1200 }
1201
1202 //_____________________________________________________________________________
1203 void
1204 AliMUONClusterSplitterMLEM::UpdatePads(const AliMUONCluster& cluster,
1205                                           Int_t /*nfit*/, Double_t *par)
1206 {
1207   /// Subtract the fitted charges from pads with strong coupling
1208
1209   Int_t indx;
1210   Double_t charge, coef=0;
1211
1212   for (Int_t j=0; j<cluster.Multiplicity(); ++j)
1213   {
1214     AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
1215     if ( pad->Status() != 1 ) continue;
1216     if (fNpar != 0)
1217     {
1218       charge = 0;
1219       for (Int_t i=fNpar/3; i>=0; --i)
1220       {
1221         // sum over tracks
1222         indx = i<2 ? 2*i : 2*i+1;
1223         if (fNpar == 2)
1224         {
1225           coef = 1;
1226         }
1227         else
1228         {
1229           coef = i==fNpar/3 ? par[indx+2] : 1-coef;
1230         }
1231         coef = TMath::Max (coef, 0.);
1232         if (fNpar == 8 && i < 2)
1233         {
1234           coef = i==1 ? coef*par[indx+2] : coef - par[7];
1235         }
1236         coef = TMath::Max (coef, 0.);
1237         charge += ChargeIntegration(par[indx],par[indx+1],*pad);
1238       }
1239       charge *= fQtot;
1240       pad->SetCharge(pad->Charge()-charge);
1241     } // if (fNpar != 0)
1242
1243     if (pad->Charge() > 6 /*fgkZeroSuppression*/) pad->SetStatus(0);
1244     // return pad for further using // FIXME: remove usage of zerosuppression here
1245
1246   } // for (Int_t j=0;
1247 }
1248
1249