MUON/AliMUONClusterSplitterMLEM.cxx

   1 /**************************************************************************
   2 * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3 *                                                                        *
   4 * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5 * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6 *                                                                        *
   7 * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8 * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9 * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10 * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11 * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12 * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13 * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14 **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18 //-----------------------------------------------------------------------------
  19 /// \class AliMUONClusterSplitterMLEM
  20 ///
  21 /// Splitter class for the MLEM algorithm. Performs fitting procedure
  22 /// with up to 3 hit candidates and tries to split clusters if the number
  23 /// of candidates exceeds 3.
  24 ///
  25 /// \author Laurent Aphecetche (for the "new" C++ structure) and
  26 /// Alexander Zinchenko, JINR Dubna, for the hardcore of it ;-)
  27 //-----------------------------------------------------------------------------
  28
  29 #include "AliMUONClusterSplitterMLEM.h"
  30 #include "AliMUONClusterFinderMLEM.h" // for status flag constants
  31
  32 #include "AliMUONCluster.h"
  33 #include "AliMUONPad.h"
  34 #include "AliMUONPad.h"
  35 #include "AliMpStationType.h"
  36 #include "AliMUONConstants.h"
  37 #include "AliMpDEManager.h"
  38 #include "AliMUONMathieson.h"
  39
  40 #include "AliLog.h"
  41
  42 #include <TClonesArray.h>
  43 #include <TH2.h>
  44 #include <TMath.h>
  45 #include <TMatrixD.h>
  46 #include <TObjArray.h>
  47 #include <TRandom.h>
  48 #include <Riostream.h>
  49
  50 /// \cond CLASSIMP
  51 ClassImp(AliMUONClusterSplitterMLEM)
  52 /// \endcond
  53
  54 //const Double_t AliMUONClusterSplitterMLEM::fgkCouplMin = 1.e-3; // threshold on coupling
  55 const Double_t AliMUONClusterSplitterMLEM::fgkCouplMin = 1.e-2; // threshold on coupling
  56
  57 //_____________________________________________________________________________
  58 AliMUONClusterSplitterMLEM::AliMUONClusterSplitterMLEM(Int_t detElemId,
  59                                                        TObjArray* fPixArray)
  60 : TObject(),
  61 fPixArray(fPixArray),
  62 fMathieson(0x0),
  63 fDetElemId(detElemId),
  64 fNpar(0),
  65 fQtot(0),
  66 fnCoupled(0),
  67 fDebug(0)
  68 {
  69   /// Constructor
  70
  71   AliMp::StationType stationType = AliMpDEManager::GetStationType(fDetElemId);
  72
  73   Float_t kx3 = AliMUONConstants::SqrtKx3();
  74   Float_t ky3 = AliMUONConstants::SqrtKy3();
  75   Float_t pitch = AliMUONConstants::Pitch();
  76
  77   if ( stationType == AliMp::kStation1 )
  78   {
  79     kx3 = AliMUONConstants::SqrtKx3St1();
  80     ky3 = AliMUONConstants::SqrtKy3St1();
  81     pitch = AliMUONConstants::PitchSt1();
  82   }
  83
  84   fMathieson = new AliMUONMathieson;
  85
  86   fMathieson->SetPitch(pitch);
  87   fMathieson->SetSqrtKx3AndDeriveKx2Kx4(kx3);
  88   fMathieson->SetSqrtKy3AndDeriveKy2Ky4(ky3);
  89
  90 }
  91
  92 //_____________________________________________________________________________
  93 AliMUONClusterSplitterMLEM::~AliMUONClusterSplitterMLEM()
  94 {
  95   /// Destructor
  96
  97   delete fMathieson;
  98 }
  99
 100 //_____________________________________________________________________________
 101 void
 102 AliMUONClusterSplitterMLEM::AddBin(TH2 *mlem,
 103                                    Int_t ic, Int_t jc, Int_t mode,
 104                                    Bool_t *used, TObjArray *pix)
 105 {
 106   /// Add a bin to the cluster
 107
 108   Int_t nx = mlem->GetNbinsX();
 109   Int_t ny = mlem->GetNbinsY();
 110   Double_t cont1, cont = mlem->GetCellContent(jc,ic);
 111   AliMUONPad *pixPtr = 0;
 112
 113   Int_t ie = TMath::Min(ic+1,ny), je = TMath::Min(jc+1,nx);
 114   for (Int_t i = TMath::Max(ic-1,1); i <= ie; ++i) {
 115     for (Int_t j = TMath::Max(jc-1,1); j <= je; ++j) {
 116       if (i != ic && j != jc) continue;
 117       if (used[(i-1)*nx+j-1]) continue;
 118       cont1 = mlem->GetCellContent(j,i);
 119       if (mode && cont1 > cont) continue;
 120       used[(i-1)*nx+j-1] = kTRUE;
 121       if (cont1 < 0.5) continue;
 122       if (pix) pix->Add(BinToPix(mlem,j,i));
 123       else {
 124         pixPtr = new AliMUONPad (mlem->GetXaxis()->GetBinCenter(j),
 125                                  mlem->GetYaxis()->GetBinCenter(i), 0, 0, cont1);
 126         fPixArray->Add(pixPtr);
 127       }
 128       AddBin(mlem, i, j, mode, used, pix); // recursive call
 129     }
 130   }
 131 }
 132
 133 //_____________________________________________________________________________
 134 void
 135 AliMUONClusterSplitterMLEM::AddCluster(Int_t ic, Int_t nclust,
 136                                        TMatrixD& aijcluclu,
 137                                        Bool_t *used, Int_t *clustNumb, Int_t &nCoupled)
 138 {
 139   /// Add a cluster to the group of coupled clusters
 140
 141   for (Int_t i = 0; i < nclust; ++i) {
 142     if (used[i]) continue;
 143     if (aijcluclu(i,ic) < fgkCouplMin) continue;
 144     used[i] = kTRUE;
 145     clustNumb[nCoupled++] = i;
 146     AddCluster(i, nclust, aijcluclu, used, clustNumb, nCoupled);
 147   }
 148 }
 149
 150 //_____________________________________________________________________________
 151 TObject*
 152 AliMUONClusterSplitterMLEM::BinToPix(TH2 *mlem,
 153                                      Int_t jc, Int_t ic)
 154 {
 155   /// Translate histogram bin to pixel
 156
 157   Double_t yc = mlem->GetYaxis()->GetBinCenter(ic);
 158   Double_t xc = mlem->GetXaxis()->GetBinCenter(jc);
 159
 160   Int_t nPix = fPixArray->GetEntriesFast();
 161   AliMUONPad *pixPtr = NULL;
 162
 163   // Compare pixel and bin positions
 164   for (Int_t i = 0; i < nPix; ++i) {
 165     pixPtr = (AliMUONPad*) fPixArray->UncheckedAt(i);
 166     if (pixPtr->Charge() < 0.5) continue;
 167     if (TMath::Abs(pixPtr->Coord(0)-xc)<1.e-4 && TMath::Abs(pixPtr->Coord(1)-yc)<1.e-4)
 168     {
 169       //return (TObject*) pixPtr;
 170       return pixPtr;
 171     }
 172   }
 173   AliError(Form(" Something wrong ??? %f %f ", xc, yc));
 174   return NULL;
 175 }
 176
 177 //_____________________________________________________________________________
 178 Float_t
 179 AliMUONClusterSplitterMLEM::ChargeIntegration(Double_t x, Double_t y,
 180                                               const AliMUONPad& pad)
 181 {
 182   /// Compute the Mathieson integral on pad area, assuming the center
 183   /// of the Mathieson is at (x,y)
 184
 185   TVector2 lowerLeft(TVector2(x,y)-pad.Position()-pad.Dimensions());
 186   TVector2 upperRight(lowerLeft + pad.Dimensions()*2.0);
 187
 188         return fMathieson->IntXY(lowerLeft.X(),lowerLeft.Y(),
 189                            upperRight.X(),upperRight.Y());
 190 }
 191
 192 //_____________________________________________________________________________
 193 void
 194 AliMUONClusterSplitterMLEM::Fcn1(const AliMUONCluster& cluster,
 195                                     Int_t & /*fNpar*/, Double_t * /*gin*/,
 196                                     Double_t &f, Double_t *par, Int_t iflag)
 197 {
 198   /// Computes the functional to be minimized
 199
 200   Int_t indx, npads=0;
 201   Double_t charge, delta, coef=0, chi2=0, qTot = 0;
 202   static Double_t qAver = 0;
 203
 204   Int_t mult = cluster.Multiplicity(), iend = fNpar / 3;
 205   for (Int_t j = 0; j < mult; ++j)
 206   {
 207     AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
 208     //if ( pad->Status() !=1 || pad->IsSaturated() ) continue;
 209     if ( pad->Status() != AliMUONClusterFinderMLEM::GetUseForFitFlag()) continue;
 210     if (iflag == 0) {
 211       if ( pad->IsReal() ) npads++; // exclude virtual pads
 212       qTot += pad->Charge();
 213     }
 214     charge = 0;
 215     for (Int_t i = 0; i <= iend; ++i)
 216     {
 217       // sum over hits
 218       indx = 3 * i;
 219       coef = Param2Coef(i, coef, par);
 220       charge += ChargeIntegration(par[indx],par[indx+1],*pad) * coef;
 221     }
 222     charge *= fQtot;
 223     delta = charge - pad->Charge();
 224     delta *= delta;
 225     delta /= pad->Charge();
 226     chi2 += delta;
 227   } // for (Int_t j=0;
 228   if (iflag == 0) qAver = qTot / npads;
 229   f = chi2 / qAver;
 230 }
 231
 232 //_____________________________________________________________________________
 233 Double_t AliMUONClusterSplitterMLEM::Param2Coef(Int_t icand, Double_t coef, Double_t *par)
 234 {
 235   /// Extract hit contribution scale factor from fit parameters
 236
 237   if (fNpar == 2) return 1.;
 238   if (fNpar == 5) return icand==0 ? par[2] : TMath::Max(1.-par[2],0.);
 239   if (icand == 0) return par[2];
 240   if (icand == 1) return TMath::Max((1.-par[2])*par[5], 0.);
 241   return TMath::Max(1.-par[2]-coef,0.);
 242 }
 243
 244 //_____________________________________________________________________________
 245 Int_t
 246 AliMUONClusterSplitterMLEM::Fit(const AliMUONCluster& cluster,
 247                                 Int_t iSimple, Int_t nfit,
 248                                 Int_t *clustFit, TObjArray **clusters,
 249                                 Double_t *parOk,
 250                                 TObjArray& clusterList, TH2 *mlem)
 251 {
 252   /// Steering function and fitting procedure for the fit of pad charge distribution
 253
 254   //  AliDebug(2,Form("iSimple=%d nfit=%d",iSimple,nfit));
 255
 256   Double_t xmin = mlem->GetXaxis()->GetXmin() - mlem->GetXaxis()->GetBinWidth(1);
 257   Double_t xmax = mlem->GetXaxis()->GetXmax() + mlem->GetXaxis()->GetBinWidth(1);
 258   Double_t ymin = mlem->GetYaxis()->GetXmin() - mlem->GetYaxis()->GetBinWidth(1);
 259   Double_t ymax = mlem->GetYaxis()->GetXmax() + mlem->GetYaxis()->GetBinWidth(1);
 260   Double_t xPad = 0, yPad = 99999;
 261
 262   // Number of pads to use and number of virtual pads
 263   Int_t npads = 0, nVirtual = 0, nfit0 = nfit;
 264   //cluster.Print("full");
 265   Int_t mult = cluster.Multiplicity();
 266   for (Int_t i = 0; i < mult; ++i )
 267   {
 268     AliMUONPad* pad = cluster.Pad(i);
 269     if ( !pad->IsReal() ) ++nVirtual;
 270     //if ( pad->Status() !=1 || pad->IsSaturated() ) continue;
 271     if ( pad->Status() != AliMUONClusterFinderMLEM::GetUseForFitFlag() ) continue;
 272     if ( pad->IsReal() )
 273     {
 274       ++npads;
 275       if (yPad > 9999)
 276       {
 277         xPad = pad->X();
 278         yPad = pad->Y();
 279       }
 280       else
 281       {
 282         if (pad->DY() < pad->DX() )
 283         {
 284           yPad = pad->Y();
 285         }
 286         else
 287         {
 288           xPad = pad->X();
 289         }
 290       }
 291     }
 292   }
 293
 294   fNpar = 0;
 295   fQtot = 0;
 296
 297   if (npads < 2) return 0;
 298
 299   // FIXME : AliWarning("Reconnect the following code for hit/track passing ?");
 300
 301   //  Int_t tracks[3] = {-1, -1, -1};
 302
 303   /*
 304    Int_t digit = 0;
 305    AliMUONDigit *mdig = 0;
 306    for (Int_t cath=0; cath<2; cath++) {
 307      for (Int_t i=0; i<fnPads[0]+fnPads[1]; i++) {
 308        if (fPadIJ[0][i] != cath) continue;
 309        if (fPadIJ[1][i] != 1) continue;
 310        if (fXyq[3][i] < 0) continue; // exclude virtual pads
 311        digit = TMath::Nint (fXyq[5][i]);
 312        if (digit >= 0) mdig = fInput->Digit(cath,digit);
 313        else mdig = fInput->Digit(TMath::Even(cath),-digit-1);
 314        //if (!mdig) mdig = fInput->Digit(TMath::Even(cath),digit);
 315        if (!mdig) continue; // protection for cluster display
 316        if (mdig->Hit() >= 0) {
 317          if (tracks[0] < 0) {
 318            tracks[0] = mdig->Hit();
 319            tracks[1] = mdig->Track(0);
 320          } else if (mdig->Track(0) < tracks[1]) {
 321            tracks[0] = mdig->Hit();
 322            tracks[1] = mdig->Track(0);
 323          }
 324        }
 325        if (mdig->Track(1) >= 0 && mdig->Track(1) != tracks[1]) {
 326          if (tracks[2] < 0) tracks[2] = mdig->Track(1);
 327          else tracks[2] = TMath::Min (tracks[2], mdig->Track(1));
 328        }
 329      } // for (Int_t i=0;
 330   } // for (Int_t cath=0;
 331    */
 332
 333   // Get number of pads in X and Y
 334   //const Int_t kStatusToTest(1);
 335   const Int_t kStatusToTest(AliMUONClusterFinderMLEM::GetUseForFitFlag());
 336
 337   AliMpIntPair nofPads = cluster.NofPads(kStatusToTest);
 338   Int_t nInX = nofPads.GetFirst();
 339   Int_t nInY = nofPads.GetSecond();
 340
 341   if (fDebug) {
 342     Int_t npadOK = 0;
 343     for (Int_t j = 0; j < cluster.Multiplicity(); ++j) {
 344       AliMUONPad *pad = cluster.Pad(j);
 345       //if (pad->Status() == 1 && !pad->IsSaturated()) npadOK++;
 346       if (pad->Status() == AliMUONClusterFinderMLEM::GetUseForFitFlag() && !pad->IsSaturated()) npadOK++;
 347     }
 348     cout << " Number of pads to fit: " << npadOK << endl;
 349     cout << " nInX and Y: " << nInX << " " << nInY << endl;
 350   }
 351
 352   Int_t nfitMax = 3;
 353   nfitMax = TMath::Min (nfitMax, (npads + 1) / 3);
 354   if (nfitMax > 1) {
 355     if (nInX < 3 && nInY < 3 || nInX == 3 && nInY < 3 || nInX < 3 && nInY == 3) nfitMax = 1; // not enough pads in each direction
 356   }
 357   if (nfit > nfitMax) nfit = nfitMax;
 358
 359   // Take cluster maxima as fitting seeds
 360   TObjArray *pix;
 361   AliMUONPad *pixPtr;
 362   Int_t npxclu;
 363   Double_t cont, cmax = 0, xseed = 0, yseed = 0, errOk[8], qq = 0;
 364   Double_t xyseed[3][2], qseed[3], xyCand[3][2] = {{0},{0}}, sigCand[3][2] = {{0},{0}};
 365
 366   for (Int_t ifit = 1; ifit <= nfit0; ++ifit)
 367   {
 368     cmax = 0;
 369     pix = clusters[clustFit[ifit-1]];
 370     npxclu = pix->GetEntriesFast();
 371     //qq = 0;
 372     for (Int_t clu = 0; clu < npxclu; ++clu)
 373     {
 374       pixPtr = (AliMUONPad*) pix->UncheckedAt(clu);
 375       cont = pixPtr->Charge();
 376       fQtot += cont;
 377       if (cont > cmax)
 378       {
 379         cmax = cont;
 380         xseed = pixPtr->Coord(0);
 381         yseed = pixPtr->Coord(1);
 382       }
 383       qq += cont;
 384       xyCand[0][0] += pixPtr->Coord(0) * cont;
 385       xyCand[0][1] += pixPtr->Coord(1) * cont;
 386       sigCand[0][0] += pixPtr->Coord(0) * pixPtr->Coord(0) * cont;
 387       sigCand[0][1] += pixPtr->Coord(1) * pixPtr->Coord(1) * cont;
 388     }
 389     xyseed[ifit-1][0] = xseed;
 390     xyseed[ifit-1][1] = yseed;
 391     qseed[ifit-1] = cmax;
 392   } // for (Int_t ifit=1;
 393
 394   xyCand[0][0] /= qq; // <x>
 395   xyCand[0][1] /= qq; // <y>
 396   sigCand[0][0] = sigCand[0][0]/qq - xyCand[0][0]*xyCand[0][0]; // <x^2> - <x>^2
 397   sigCand[0][0] = sigCand[0][0] > 0 ? TMath::Sqrt (sigCand[0][0]) : 0;
 398   sigCand[0][1] = sigCand[0][1]/qq - xyCand[0][1]*xyCand[0][1]; // <y^2> - <y>^2
 399   sigCand[0][1] = sigCand[0][1] > 0 ? TMath::Sqrt (sigCand[0][1]) : 0;
 400   if (fDebug) cout << xyCand[0][0] << " " << xyCand[0][1] << " " << sigCand[0][0] << " " << sigCand[0][1] << endl;
 401
 402   Int_t nDof, maxSeed[3];//, nMax = 0;
 403
 404   TMath::Sort(nfit0, qseed, maxSeed, kTRUE); // in decreasing order
 405
 406   Double_t step[3]={0.01,0.002,0.02}, fmin, chi2o = 9999, chi2n;
 407   Double_t *gin = 0, func0, func1, param[8], step0[8];
 408   Double_t param0[2][8]={{0},{0}}, deriv[2][8]={{0},{0}};
 409   Double_t shift[8], stepMax, derMax, parmin[8], parmax[8], func2[2], shift0;
 410   Double_t delta[8], scMax, dder[8], estim, shiftSave = 0;
 411   Int_t min, max, nCall = 0, nLoop, idMax = 0, iestMax = 0, nFail;
 412   Double_t rad, dist[3] = {0};
 413
 414   // Try to fit with one-track hypothesis, then 2-track. If chi2/dof is
 415   // lower, try 3-track (if number of pads is sufficient).
 416   Int_t iflag = 0; // for the first call of fcn1
 417   for (Int_t iseed = 0; iseed < nfit; ++iseed)
 418   {
 419
 420     Int_t memory[8] = {0};
 421     if (iseed)
 422     {
 423       for (Int_t j = 0; j < fNpar; ++j)
 424       {
 425         param[j] = parOk[j];
 426       }
 427       param[fNpar] = 0.6;
 428       parmin[fNpar] = 0;
 429       parmax[fNpar++] = 1;
 430     }
 431
 432     if (nfit == 1)
 433     {
 434       param[fNpar] = xyCand[0][0]; // take COG
 435     }
 436     else
 437     {
 438       param[fNpar] = xyseed[maxSeed[iseed]][0];
 439       //param[fNpar] = fNpar==0 ? -16.1651 : -15.2761;
 440     }
 441     parmin[fNpar] = xmin;
 442     parmax[fNpar++] = xmax;
 443     if (nfit == 1)
 444     {
 445       param[fNpar] = xyCand[0][1]; // take COG
 446     }
 447     else
 448     {
 449       param[fNpar] = xyseed[maxSeed[iseed]][1];
 450       //param[fNpar] = fNpar==1 ? -15.1737 : -15.8487;
 451     }
 452     parmin[fNpar] = ymin;
 453     parmax[fNpar++] = ymax;
 454
 455     for (Int_t j = 0; j < fNpar; ++j)
 456     {
 457       step0[j] = shift[j] = step[j%3];
 458     }
 459
 460     if (iseed)
 461     {
 462       for (Int_t j = 0; j < fNpar; ++j)
 463       {
 464         param0[1][j] = 0;
 465       }
 466     }
 467     if (fDebug) {
 468       for (Int_t j = 0; j < fNpar; ++j) cout << param[j] << " ";
 469       cout << endl;
 470     }
 471
 472     // Try new algorithm
 473     min = nLoop = 1; stepMax = func2[1] = derMax = 999999; nFail = 0;
 474
 475     while (1)
 476     {
 477       max = !min;
 478       Fcn1(cluster,fNpar, gin, func0, param, iflag); nCall++;
 479       iflag = 1;
 480       //cout << " Func: " << func0 << endl;
 481
 482       func2[max] = func0;
 483       for (Int_t j = 0; j < fNpar; ++j)
 484       {
 485         param0[max][j] = param[j];
 486         delta[j] = step0[j];
 487         param[j] += delta[j] / 10;
 488         if (j > 0) param[j-1] -= delta[j-1] / 10;
 489         Fcn1(cluster,fNpar, gin, func1, param, iflag); nCall++;
 490         deriv[max][j] = (func1 - func0) / delta[j] * 10; // first derivative
 491         //cout << j << " " << deriv[max][j] << endl;
 492         dder[j] = param0[0][j] != param0[1][j] ? (deriv[0][j] - deriv[1][j]) /
 493           (param0[0][j] - param0[1][j]) : 0; // second derivative
 494       }
 495       param[fNpar-1] -= delta[fNpar-1] / 10;
 496       if (nCall > 2000) break;
 497
 498       min = func2[0] < func2[1] ? 0 : 1;
 499       nFail = min == max ? 0 : nFail + 1;
 500
 501       stepMax = derMax = estim = 0;
 502       for (Int_t j = 0; j < fNpar; ++j)
 503       {
 504         // Estimated distance to minimum
 505         shift0 = shift[j];
 506         if (nLoop == 1)
 507         {
 508           shift[j] = TMath::Sign (step0[j], -deriv[max][j]); // first step
 509         }
 510         else if (TMath::Abs(deriv[0][j]) < 1.e-3 && TMath::Abs(deriv[1][j]) < 1.e-3)
 511         {
 512           shift[j] = 0;
 513         }
 514         else if (deriv[min][j]*deriv[!min][j] > 0 && TMath::Abs(deriv[min][j]) > TMath::Abs(deriv[!min][j])
 515                  || TMath::Abs(deriv[0][j]-deriv[1][j]) < 1.e-3 || TMath::Abs(dder[j]) < 1.e-6)
 516         {
 517           shift[j] = -TMath::Sign (shift[j], (func2[0]-func2[1]) * (param0[0][j]-param0[1][j]));
 518           if (min == max)
 519           {
 520             if (memory[j] > 1)
 521             {
 522               shift[j] *= 2;
 523             }
 524             memory[j]++;
 525           }
 526         }
 527         else
 528         {
 529           shift[j] = dder[j] != 0 ? -deriv[min][j] / dder[j] : 0;
 530           memory[j] = 0;
 531         }
 532
 533         Double_t es = TMath::Abs(shift[j]) / step0[j];
 534         if (es > estim)
 535         {
 536           estim = es;
 537           iestMax = j;
 538         }
 539
 540         // Too big step
 541         if (TMath::Abs(shift[j])/step0[j] > 10) shift[j] = TMath::Sign(10.,shift[j]) * step0[j]; //
 542
 543         // Failed to improve minimum
 544         if (min != max)
 545         {
 546           memory[j] = 0;
 547           param[j] = param0[min][j];
 548           if (TMath::Abs(shift[j]+shift0) > 0.1*step0[j])
 549           {
 550             shift[j] = (shift[j] + shift0) / 2;
 551           }
 552           else
 553           {
 554             shift[j] /= -2;
 555           }
 556         }
 557
 558         // Too big step
 559         if (TMath::Abs(shift[j]*deriv[min][j]) > func2[min])
 560         {
 561           shift[j] = TMath::Sign (func2[min]/deriv[min][j], shift[j]);
 562         }
 563
 564         // Introduce step relaxation factor
 565         if (memory[j] < 3)
 566         {
 567           scMax = 1 + 4 / TMath::Max(nLoop/2.,1.);
 568           if (TMath::Abs(shift0) > 0 && TMath::Abs(shift[j]/shift0) > scMax)
 569           {
 570             shift[j] = TMath::Sign (shift0*scMax, shift[j]);
 571           }
 572         }
 573         param[j] += shift[j];
 574         // Check parameter limits
 575         if (param[j] < parmin[j])
 576         {
 577           shift[j] = parmin[j] - param[j];
 578           param[j] = parmin[j];
 579         }
 580         else if (param[j] > parmax[j])
 581         {
 582           shift[j] = parmax[j] - param[j];
 583           param[j] = parmax[j];
 584         }
 585         //cout << " xxx " << j << " " << shift[j] << " " << param[j] << endl;
 586         stepMax = TMath::Max (stepMax, TMath::Abs(shift[j]/step0[j]));
 587         if (TMath::Abs(deriv[min][j]) > derMax)
 588         {
 589           idMax = j;
 590           derMax = TMath::Abs (deriv[min][j]);
 591         }
 592       } // for (Int_t j=0; j<fNpar;
 593
 594       if (estim < 1 && derMax < 2 || nLoop > 150) break; // minimum was found
 595
 596       nLoop++;
 597
 598       // Check for small step
 599       if (shift[idMax] == 0)
 600       {
 601         shift[idMax] = step0[idMax]/10;
 602         param[idMax] += shift[idMax];
 603         continue;
 604       }
 605
 606       if (!memory[idMax] && derMax > 0.5 && nLoop > 10)
 607       {
 608         if (dder[idMax] != 0 && TMath::Abs(deriv[min][idMax]/dder[idMax]/shift[idMax]) > 10)
 609         {
 610           if (min == max) dder[idMax] = -dder[idMax];
 611           shift[idMax] = -deriv[min][idMax] / dder[idMax] / 10;
 612           param[idMax] += shift[idMax];
 613           stepMax = TMath::Max (stepMax, TMath::Abs(shift[idMax])/step0[idMax]);
 614           if (min == max) shiftSave = shift[idMax];
 615         }
 616         if (nFail > 10)
 617         {
 618           param[idMax] -= shift[idMax];
 619           shift[idMax] = 4 * shiftSave * (gRandom->Rndm(0) - 0.5);
 620           param[idMax] += shift[idMax];
 621         }
 622       }
 623     } // while (1)
 624
 625     fmin = func2[min];
 626
 627     nDof = npads - fNpar + nVirtual;
 628     if (!nDof) nDof++;
 629     chi2n = fmin / nDof;
 630     if (fDebug) cout << " Chi2 " << chi2n << " " << fNpar << endl;
 631
 632     //if (fNpar > 2) cout << param0[min][fNpar-3] << " " << chi2n * (1+TMath::Min(1-param0[min][fNpar-3],0.25)) << endl;
 633     //if (chi2n*1.2+1.e-6 > chi2o )
 634     if (fNpar > 2 && (chi2n > chi2o || iseed == nfit-1
 635                       && chi2n * (1+TMath::Min(1-param0[min][fNpar-3],0.25)) > chi2o))
 636       { fNpar -= 3; break; }
 637
 638     // Save parameters and errors
 639
 640     if (nInX == 1) {
 641       // One pad per direction
 642       //for (Int_t i=0; i<fNpar; ++i) if (i == 0 || i == 2 || i == 5) param0[min][i] = xPad;
 643       for (Int_t i=0; i<fNpar; ++i) if (i == 0 || i == 2 || i == 5)
 644         param0[min][i] = xyCand[0][0];
 645     }
 646     if (nInY == 1) {
 647       // One pad per direction
 648       //for (Int_t i=0; i<fNpar; ++i) if (i == 1 || i == 3 || i == 6) param0[min][i] = yPad;
 649       for (Int_t i=0; i<fNpar; ++i) if (i == 1 || i == 3 || i == 6)
 650         param0[min][i] = xyCand[0][1];
 651     }
 652
 653     /*
 654       if (iseed > 0) {
 655       // Find distance to the nearest neighbour
 656       dist[0] = dist[1] = TMath::Sqrt ((param0[min][0]-param0[min][2])*
 657       (param0[min][0]-param0[min][2])
 658       +(param0[min][1]-param0[min][3])*
 659       (param0[min][1]-param0[min][3]));
 660       if (iseed > 1) {
 661       dist[2] = TMath::Sqrt ((param0[min][0]-param0[min][5])*
 662       (param0[min][0]-param0[min][5])
 663       +(param0[min][1]-param0[min][6])*
 664       (param0[min][1]-param0[min][6]));
 665       rad = TMath::Sqrt ((param0[min][2]-param0[min][5])*
 666       (param0[min][2]-param0[min][5])
 667       +(param0[min][3]-param0[min][6])*
 668       (param0[min][3]-param0[min][6]));
 669       if (dist[2] < dist[0]) dist[0] = dist[2];
 670       if (rad < dist[1]) dist[1] = rad;
 671       if (rad < dist[2]) dist[2] = rad;
 672       }
 673       cout << dist[0] << " " << dist[1] << " " << dist[2] << endl;
 674       if (dist[TMath::LocMin(iseed+1,dist)] < 1.) { fNpar -= 3; break; }
 675       }
 676     */
 677
 678     for (Int_t i = 0; i < fNpar; ++i) {
 679       parOk[i] = param0[min][i];
 680       //errOk[i] = fmin;
 681       errOk[i] = chi2n;
 682       // Bounded params
 683       parOk[i] = TMath::Max (parOk[i], parmin[i]);
 684       parOk[i] = TMath::Min (parOk[i], parmax[i]);
 685     }
 686
 687     chi2o = chi2n;
 688     if (fmin < 0.1) break; // !!!???
 689   } // for (Int_t iseed=0;
 690
 691   if (fDebug) {
 692     for (Int_t i=0; i<fNpar; ++i) {
 693       if (i == 4 || i == 7) {
 694         if (i == 7 || i == 4 && fNpar < 7) cout << parOk[i] << endl;
 695         else cout << parOk[i] * (1-parOk[7]) << endl;
 696         continue;
 697       }
 698       cout << parOk[i] << " " << errOk[i] << endl;
 699     }
 700   }
 701   nfit = (fNpar + 1) / 3;
 702   dist[0] = dist[1] = dist[2] = 0;
 703
 704   if (nfit > 1) {
 705     // Find distance to the nearest neighbour
 706     dist[0] = dist[1] = TMath::Sqrt ((parOk[0]-parOk[2])*
 707                                      (parOk[0]-parOk[2])
 708                                      +(parOk[1]-parOk[3])*
 709                                      (parOk[1]-parOk[3]));
 710     if (nfit > 2) {
 711       dist[2] = TMath::Sqrt ((parOk[0]-parOk[5])*
 712                              (parOk[0]-parOk[5])
 713                              +(parOk[1]-parOk[6])*
 714                              (parOk[1]-parOk[6]));
 715       rad = TMath::Sqrt ((parOk[2]-parOk[5])*
 716                          (parOk[2]-parOk[5])
 717                          +(parOk[3]-parOk[6])*
 718                          (parOk[3]-parOk[6]));
 719       if (dist[2] < dist[0]) dist[0] = dist[2];
 720       if (rad < dist[1]) dist[1] = rad;
 721       if (rad < dist[2]) dist[2] = rad;
 722     }
 723   }
 724
 725   Int_t indx;
 726
 727   Double_t coef = 0;
 728   if (iSimple) fnCoupled = 0;
 729   for (Int_t j = 0; j < nfit; ++j) {
 730     indx = 3 * j;
 731     coef = Param2Coef(j, coef, parOk);
 732
 733     //void AliMUONClusterFinderMLEM::AddRawCluster(Double_t x, Double_t y,
 734     //                                             Double_t qTot, Double_t fmin,
 735     //                                             Int_t nfit, Int_t *tracks,
 736     //                                             Double_t /*sigx*/,
 737     //                                             Double_t /*sigy*/,
 738     //                                             Double_t /*dist*/)
 739
 740     if ( coef*fQtot >= 14 )
 741     {
 742       //AZ AliMUONCluster* cluster1 = new AliMUONCluster();
 743       AliMUONCluster* cluster1 = new AliMUONCluster(cluster);
 744
 745       cluster1->SetCharge(coef*fQtot,coef*fQtot);
 746       cluster1->SetPosition(TVector2(parOk[indx],parOk[indx+1]),TVector2(sigCand[0][0],sigCand[0][1]));
 747       cluster1->SetChi2(dist[TMath::LocMin(nfit,dist)]);
 748
 749       // FIXME: we miss some information in this cluster, as compared to
 750       // the original AddRawCluster code.
 751
 752       AliDebug(2,Form("Adding RawCluster detElemId %4d mult %2d charge %5d (xl,yl)=(%9.6g,%9.6g)",
 753                       fDetElemId,cluster1->Multiplicity(),(Int_t)cluster1->Charge(),
 754                       cluster1->Position().X(),cluster1->Position().Y()));
 755
 756       clusterList.Add(cluster1);
 757     }
 758     //      AddRawCluster (parOk[indx], // double x
 759     //                     parOk[indx+1], // double y
 760     //                     coef*qTot, // double charge
 761     //                     errOk[indx], // double fmin
 762     //                     nfit0+10*nfit+100*nMax+10000*fnCoupled, // int nfit
 763     //                     tracks, // int* tracks
 764     //                     sigCand[0][0], // double sigx
 765     //                     sigCand[0][1], // double sigy
 766     //                     dist[TMath::LocMin(nfit,dist)] // double dist
 767     //                     );
 768   }
 769   return nfit;
 770 }
 771
 772
 773 //_____________________________________________________________________________
 774 void
 775 AliMUONClusterSplitterMLEM::Split(const AliMUONCluster& cluster,
 776                                   TH2 *mlem, Double_t *coef,
 777                                   TObjArray& clusterList)
 778 {
 779   /// The main steering function to work with clusters of pixels in anode
 780   /// plane (find clusters, decouple them from each other, merge them (if
 781   /// necessary), pick up coupled pads, call the fitting function)
 782
 783   Int_t nx = mlem->GetNbinsX();
 784   Int_t ny = mlem->GetNbinsY();
 785   Int_t nPix = fPixArray->GetEntriesFast();
 786
 787   Double_t cont;
 788   Int_t nclust = 0, indx, indx1, nxy = ny * nx;
 789   Bool_t *used = new Bool_t[nxy];
 790
 791   for (Int_t j = 0; j < nxy; ++j) used[j] = kFALSE;
 792
 793   TObjArray *clusters[200]={0};
 794   TObjArray *pix;
 795
 796   // Find clusters of histogram bins (easier to work in 2-D space)
 797   for (Int_t i = 1; i <= ny; ++i)
 798   {
 799     for (Int_t j = 1; j <= nx; ++j)
 800     {
 801       indx = (i-1)*nx + j - 1;
 802       if (used[indx]) continue;
 803       cont = mlem->GetCellContent(j,i);
 804       if (cont < 0.5) continue;
 805       pix = new TObjArray(20);
 806       used[indx] = 1;
 807       pix->Add(BinToPix(mlem,j,i));
 808       AddBin(mlem, i, j, 0, used, pix); // recursive call
 809       if (nclust >= 200) AliFatal(" Too many clusters !!!");
 810       clusters[nclust++] = pix;
 811     } // for (Int_t j=1; j<=nx; j++) {
 812   } // for (Int_t i=1; i<=ny;
 813   if (fDebug) cout << nclust << endl;
 814   delete [] used;
 815
 816   // Compute couplings between clusters and clusters to pads
 817   Int_t npad = cluster.Multiplicity();
 818
 819   // Exclude pads with overflows
 820   /*
 821   for (Int_t j = 0; j < npad; ++j)
 822   {
 823     AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
 824     if ( pad->IsSaturated() )
 825     {
 826       pad->SetStatus(-5);
 827     }
 828     else
 829     {
 830       pad->SetStatus(0);
 831     }
 832   }
 833   */
 834
 835   // Compute couplings of clusters to pads (including overflows)
 836   TMatrixD aijclupad(nclust,npad);
 837   aijclupad = 0;
 838   Int_t npxclu;
 839   for (Int_t iclust = 0; iclust < nclust; ++iclust)
 840   {
 841     pix = clusters[iclust];
 842     npxclu = pix->GetEntriesFast();
 843     for (Int_t i = 0; i < npxclu; ++i)
 844     {
 845       indx = fPixArray->IndexOf(pix->UncheckedAt(i));
 846       for (Int_t j = 0; j < npad; ++j)
 847       {
 848         //AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
 849         //if ( pad->Status() < 0 && pad->Status() != -5) continue;
 850         if (coef[j*nPix+indx] < fgkCouplMin) continue;
 851         aijclupad(iclust,j) += coef[j*nPix+indx];
 852       }
 853     }
 854   }
 855
 856   // Compute couplings between clusters (exclude overflows)
 857   TMatrixD aijcluclu(nclust,nclust);
 858   aijcluclu = 0;
 859   for (Int_t iclust = 0; iclust < nclust; ++iclust)
 860   {
 861     for (Int_t j = 0; j < npad; ++j)
 862     {
 863       // Exclude overflows
 864       //if ( cluster.Pad(j)->Status() < 0) continue;
 865       if ( cluster.Pad(j)->IsSaturated()) continue;
 866       if (aijclupad(iclust,j) < fgkCouplMin) continue;
 867       for (Int_t iclust1=iclust+1; iclust1<nclust; iclust1++)
 868       {
 869         if (aijclupad(iclust1,j) < fgkCouplMin) continue;
 870         aijcluclu(iclust,iclust1) +=
 871           TMath::Sqrt (aijclupad(iclust,j)*aijclupad(iclust1,j));
 872       }
 873     }
 874   }
 875   for (Int_t iclust = 0; iclust < nclust; ++iclust)
 876   {
 877     for (Int_t iclust1 = iclust+1; iclust1 < nclust; ++iclust1)
 878     {
 879       aijcluclu(iclust1,iclust) = aijcluclu(iclust,iclust1);
 880     }
 881   }
 882
 883   if (fDebug && nclust > 1) aijcluclu.Print();
 884
 885   // Find groups of coupled clusters
 886   used = new Bool_t[nclust];
 887   for (Int_t j = 0; j < nclust; ++j) used[j] = kFALSE;
 888
 889   Int_t *clustNumb = new Int_t[nclust];
 890   Int_t nCoupled, nForFit, minGroup[3], clustFit[3], nfit = 0;
 891   //Double_t parOk[8];
 892   Double_t parOk[8] = {0}; //AZ
 893
 894   for (Int_t igroup = 0; igroup < nclust; ++igroup)
 895   {
 896     if (used[igroup]) continue;
 897     used[igroup] = kTRUE;
 898     clustNumb[0] = igroup;
 899     nCoupled = 1;
 900     // Find group of coupled clusters
 901     AddCluster(igroup, nclust, aijcluclu, used, clustNumb, nCoupled); // recursive
 902
 903     if (fDebug) {
 904       cout << " nCoupled: " << nCoupled << endl;
 905       for (Int_t i=0; i<nCoupled; ++i) cout << clustNumb[i] << " "; cout << endl;
 906     }
 907
 908     fnCoupled = nCoupled;
 909
 910     while (nCoupled > 0)
 911     {
 912       if (nCoupled < 4)
 913       {
 914         nForFit = nCoupled;
 915         for (Int_t i = 0; i < nCoupled; ++i) clustFit[i] = clustNumb[i];
 916       }
 917       else
 918       {
 919         // Too many coupled clusters to fit - try to decouple them
 920         // Find the lowest coupling of 1, 2, min(3,nLinks/2) pixels with
 921         // all the others in the group
 922         for (Int_t j = 0; j < 3; ++j) minGroup[j] = -1;
 923         Double_t coupl = MinGroupCoupl(nCoupled, clustNumb, aijcluclu, minGroup);
 924
 925         // Flag clusters for fit
 926         nForFit = 0;
 927         while (minGroup[nForFit] >= 0 && nForFit < 3)
 928         {
 929           if (fDebug) cout << clustNumb[minGroup[nForFit]] << " ";
 930           clustFit[nForFit] = clustNumb[minGroup[nForFit]];
 931           clustNumb[minGroup[nForFit]] -= 999;
 932           nForFit++;
 933         }
 934         if (fDebug) cout << " nForFit " << nForFit << " " << coupl << endl;
 935       } // else
 936
 937       // Select pads for fit.
 938       if (SelectPad(cluster,nCoupled, nForFit, clustNumb, clustFit, aijclupad) < 3 && nCoupled > 1)
 939       {
 940         // Deselect pads
 941         for (Int_t j = 0; j < npad; ++j)
 942         {
 943           AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
 944           //if ( pad->Status()==1 ) pad->SetStatus(0);
 945           //if ( pad->Status()==-9) pad->SetStatus(-5);
 946           if ( pad->Status() == AliMUONClusterFinderMLEM::GetUseForFitFlag() ||
 947                pad->Status() == AliMUONClusterFinderMLEM::GetCoupledFlag())
 948             pad->SetStatus(AliMUONClusterFinderMLEM::GetZeroFlag());
 949         }
 950         // Merge the failed cluster candidates (with too few pads to fit) with
 951         // the one with the strongest coupling
 952         Merge(cluster,nForFit, nCoupled, clustNumb, clustFit, clusters, aijcluclu, aijclupad);
 953       }
 954       else
 955       {
 956         // Do the fit
 957         nfit = Fit(cluster,0, nForFit, clustFit, clusters, parOk, clusterList, mlem);
 958         if (nfit == 0) {
 959           //cout << " (nfit == 0) " << fNpar << " " << cluster.Multiplicity() << endl;
 960           fNpar = 0; // should be 0 by itself but just in case ...
 961         }
 962       }
 963
 964       // Subtract the fitted charges from pads with strong coupling and/or
 965       // return pads for further use
 966       UpdatePads(cluster,nfit, parOk);
 967
 968       // Mark used pads
 969       for (Int_t j = 0; j < npad; ++j)
 970       {
 971         AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
 972         //if ( pad->Status()==1 ) pad->SetStatus(-2);
 973         //if ( pad->Status()==-9) pad->SetStatus(-5);
 974         if ( pad->Status() == AliMUONClusterFinderMLEM::GetUseForFitFlag() )
 975           pad->SetStatus(AliMUONClusterFinderMLEM::GetModifiedFlag());
 976       }
 977
 978       // Sort the clusters (move to the right the used ones)
 979       Int_t beg = 0, end = nCoupled - 1;
 980       while (beg < end)
 981       {
 982         if (clustNumb[beg] >= 0) { ++beg; continue; }
 983         for (Int_t j = end; j > beg; --j)
 984         {
 985           if (clustNumb[j] < 0) continue;
 986           end = j - 1;
 987           indx = clustNumb[beg];
 988           clustNumb[beg] = clustNumb[j];
 989           clustNumb[j] = indx;
 990           break;
 991         }
 992         ++beg;
 993       }
 994
 995       nCoupled -= nForFit;
 996       if (nCoupled > 3)
 997       {
 998         // Remove couplings of used clusters
 999         for (Int_t iclust = nCoupled; iclust < nCoupled+nForFit; ++iclust)
1000         {
1001           indx = clustNumb[iclust] + 999;
1002           for (Int_t iclust1 = 0; iclust1 < nCoupled; ++iclust1)
1003           {
1004             indx1 = clustNumb[iclust1];
1005             aijcluclu(indx,indx1) = aijcluclu(indx1,indx) = 0;
1006           }
1007         }
1008
1009         // Update the remaining clusters couplings (subtract couplings from
1010         // the used pads) - overflows excluded
1011         for (Int_t j = 0; j < npad; ++j)
1012         {
1013           AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
1014           //if ( pad->Status() != -2) continue;
1015           if ( pad->Status() != AliMUONClusterFinderMLEM::GetModifiedFlag()) continue;
1016           for (Int_t iclust=0; iclust<nCoupled; ++iclust)
1017           {
1018             indx = clustNumb[iclust];
1019             if (aijclupad(indx,j) < fgkCouplMin) continue;
1020             for (Int_t iclust1 = iclust+1; iclust1 < nCoupled; ++iclust1)
1021             {
1022               indx1 = clustNumb[iclust1];
1023               if (aijclupad(indx1,j) < fgkCouplMin) continue;
1024               // Check this
1025               aijcluclu(indx,indx1) -=
1026                 TMath::Sqrt (aijclupad(indx,j)*aijclupad(indx1,j));
1027               aijcluclu(indx1,indx) = aijcluclu(indx,indx1);
1028             }
1029           }
1030           //pad->SetStatus(-8);
1031           pad->SetStatus(AliMUONClusterFinderMLEM::GetOverFlag());
1032         } // for (Int_t j=0; j<npad;
1033       } // if (nCoupled > 3)
1034     } // while (nCoupled > 0)
1035   } // for (Int_t igroup=0; igroup<nclust;
1036
1037   for (Int_t iclust = 0; iclust < nclust; ++iclust)
1038   {
1039     pix = clusters[iclust];
1040     pix->Clear();
1041     delete pix;
1042   }
1043   delete [] clustNumb;
1044   delete [] used;
1045
1046 }
1047
1048 //_____________________________________________________________________________
1049 void
1050 AliMUONClusterSplitterMLEM::Merge(const AliMUONCluster& cluster,
1051                                      Int_t nForFit, Int_t nCoupled,
1052                                      Int_t *clustNumb, Int_t *clustFit,
1053                                      TObjArray **clusters,
1054                                      TMatrixD& aijcluclu, TMatrixD& aijclupad)
1055 {
1056   /// Merge the group of clusters with the one having the strongest coupling with them
1057
1058   Int_t indx, indx1, npxclu, npxclu1, imax=0;
1059   TObjArray *pix, *pix1;
1060   Double_t couplMax;
1061
1062   for (Int_t icl = 0; icl < nForFit; ++icl)
1063   {
1064     indx = clustFit[icl];
1065     pix = clusters[indx];
1066     npxclu = pix->GetEntriesFast();
1067     couplMax = -1;
1068     for (Int_t icl1 = 0; icl1 < nCoupled; ++icl1)
1069     {
1070       indx1 = clustNumb[icl1];
1071       if (indx1 < 0) continue;
1072       if ( aijcluclu(indx,indx1) > couplMax)
1073       {
1074         couplMax = aijcluclu(indx,indx1);
1075         imax = indx1;
1076       }
1077     } // for (Int_t icl1=0;
1078       // Add to it
1079     pix1 = clusters[imax];
1080     npxclu1 = pix1->GetEntriesFast();
1081     // Add pixels
1082     for (Int_t i = 0; i < npxclu; ++i)
1083     {
1084       pix1->Add(pix->UncheckedAt(i));
1085       pix->RemoveAt(i);
1086     }
1087
1088     //Add cluster-to-cluster couplings
1089     for (Int_t icl1 = 0; icl1 < nCoupled; ++icl1)
1090     {
1091       indx1 = clustNumb[icl1];
1092       if (indx1 < 0 || indx1 == imax) continue;
1093       aijcluclu(indx1,imax) += aijcluclu(indx,indx1);
1094       aijcluclu(imax,indx1) = aijcluclu(indx1,imax);
1095     }
1096     aijcluclu(indx,imax) = aijcluclu(imax,indx) = 0;
1097
1098     //Add cluster-to-pad couplings
1099     Int_t mult = cluster.Multiplicity();
1100     for (Int_t j = 0; j < mult; ++j)
1101     {
1102       AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
1103       //if ( pad->Status() < 0 && pad->Status() != -5 ) continue;// exclude used pads
1104       if ( pad->Status() != AliMUONClusterFinderMLEM::GetZeroFlag()) continue;// exclude used pads
1105         aijclupad(imax,j) += aijclupad(indx,j);
1106         aijclupad(indx,j) = 0;
1107     }
1108   } // for (Int_t icl=0; icl<nForFit;
1109 }
1110
1111
1112 //_____________________________________________________________________________
1113 Double_t
1114 AliMUONClusterSplitterMLEM::MinGroupCoupl(Int_t nCoupled, Int_t *clustNumb,
1115                                           TMatrixD& aijcluclu, Int_t *minGroup)
1116 {
1117   /// Find group of clusters with minimum coupling to all the others
1118
1119   Int_t i123max = TMath::Min(3,nCoupled/2);
1120   Int_t indx, indx1, indx2, indx3, nTot = 0;
1121   Double_t *coupl1 = 0, *coupl2 = 0, *coupl3 = 0;
1122
1123   for (Int_t i123 = 1; i123 <= i123max; ++i123) {
1124
1125     if (i123 == 1) {
1126       coupl1 = new Double_t [nCoupled];
1127       for (Int_t i = 0; i < nCoupled; ++i) coupl1[i] = 0;
1128     }
1129     else if (i123 == 2) {
1130       nTot = nCoupled*nCoupled;
1131       coupl2 = new Double_t [nTot];
1132       for (Int_t i = 0; i < nTot; ++i) coupl2[i] = 9999;
1133     } else {
1134       nTot = nTot*nCoupled;
1135       coupl3 = new Double_t [nTot];
1136       for (Int_t i = 0; i < nTot; ++i) coupl3[i] = 9999;
1137     } // else
1138
1139     for (Int_t i = 0; i < nCoupled; ++i) {
1140       indx1 = clustNumb[i];
1141       for (Int_t j = i+1; j < nCoupled; ++j) {
1142         indx2 = clustNumb[j];
1143         if (i123 == 1) {
1144           coupl1[i] += aijcluclu(indx1,indx2);
1145           coupl1[j] += aijcluclu(indx1,indx2);
1146         }
1147         else if (i123 == 2) {
1148           indx = i*nCoupled + j;
1149           coupl2[indx] = coupl1[i] + coupl1[j];
1150           coupl2[indx] -= 2 * (aijcluclu(indx1,indx2));
1151         } else {
1152           for (Int_t k = j+1; k < nCoupled; ++k) {
1153             indx3 = clustNumb[k];
1154             indx = i*nCoupled*nCoupled + j*nCoupled + k;
1155             coupl3[indx] = coupl2[i*nCoupled+j] + coupl1[k];
1156             coupl3[indx] -= 2 * (aijcluclu(indx1,indx3)+aijcluclu(indx2,indx3));
1157           }
1158         } // else
1159       } // for (Int_t j=i+1;
1160     } // for (Int_t i=0;
1161   } // for (Int_t i123=1;
1162
1163   // Find minimum coupling
1164   Double_t couplMin = 9999;
1165   Int_t locMin = 0;
1166
1167   for (Int_t i123 = 1; i123 <= i123max; ++i123) {
1168     if (i123 == 1) {
1169       locMin = TMath::LocMin(nCoupled, coupl1);
1170       couplMin = coupl1[locMin];
1171       minGroup[0] = locMin;
1172       delete [] coupl1;
1173     }
1174     else if (i123 == 2) {
1175       locMin = TMath::LocMin(nCoupled*nCoupled, coupl2);
1176       if (coupl2[locMin] < couplMin) {
1177         couplMin = coupl2[locMin];
1178         minGroup[0] = locMin/nCoupled;
1179         minGroup[1] = locMin%nCoupled;
1180       }
1181       delete [] coupl2;
1182     } else {
1183       locMin = TMath::LocMin(nTot, coupl3);
1184       if (coupl3[locMin] < couplMin) {
1185         couplMin = coupl3[locMin];
1186         minGroup[0] = locMin/nCoupled/nCoupled;
1187         minGroup[1] = locMin%(nCoupled*nCoupled)/nCoupled;
1188         minGroup[2] = locMin%nCoupled;
1189       }
1190       delete [] coupl3;
1191     } // else
1192   } // for (Int_t i123=1;
1193   return couplMin;
1194 }
1195
1196 //_____________________________________________________________________________
1197 Int_t
1198 AliMUONClusterSplitterMLEM::SelectPad(const AliMUONCluster& cluster,
1199                                           Int_t nCoupled, Int_t nForFit,
1200                                           Int_t *clustNumb, Int_t *clustFit,
1201                                           TMatrixD& aijclupad)
1202 {
1203   /// Select pads for fit. If too many coupled clusters, find pads giving
1204   /// the strongest coupling with the rest of clusters and exclude them from the fit.
1205
1206   Int_t npad = cluster.Multiplicity();
1207   Double_t *padpix = 0;
1208
1209   if (nCoupled > 3)
1210   {
1211     padpix = new Double_t[npad];
1212     for (Int_t i = 0; i < npad; ++i) padpix[i] = 0.;
1213   }
1214
1215   Int_t nOK = 0, indx, indx1;
1216   for (Int_t iclust = 0; iclust < nForFit; ++iclust)
1217   {
1218     indx = clustFit[iclust];
1219     for (Int_t j = 0; j < npad; ++j)
1220     {
1221       if ( aijclupad(indx,j) < fgkCouplMin) continue;
1222       AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
1223       /*
1224       if ( pad->Status() == -5 ) pad->SetStatus(-9); // flag overflow
1225       if ( pad->Status() < 0 ) continue; // exclude overflows and used pads
1226       if ( !pad->Status() )
1227       {
1228         pad->SetStatus(1);
1229         ++nOK; // pad to be used in fit
1230       }
1231       */
1232       if ( pad->Status() != AliMUONClusterFinderMLEM::GetZeroFlag()
1233            || pad->IsSaturated() ) continue; // used pads and overflows
1234       pad->SetStatus(AliMUONClusterFinderMLEM::GetUseForFitFlag());
1235       ++nOK; // pad to be used in fit
1236
1237       if (nCoupled > 3)
1238       {
1239         // Check other clusters
1240         for (Int_t iclust1 = 0; iclust1 < nCoupled; ++iclust1)
1241         {
1242           indx1 = clustNumb[iclust1];
1243           if (indx1 < 0) continue;
1244           if ( aijclupad(indx1,j) < fgkCouplMin ) continue;
1245           padpix[j] += aijclupad(indx1,j);
1246         }
1247       } // if (nCoupled > 3)
1248     } // for (Int_t j=0; j<npad;
1249   } // for (Int_t iclust=0; iclust<nForFit
1250   if (nCoupled < 4) return nOK;
1251
1252   Double_t aaa = 0;
1253   for (Int_t j = 0; j < npad; ++j)
1254   {
1255     if (padpix[j] < fgkCouplMin) continue;
1256     aaa += padpix[j];
1257     //cluster.Pad(j)->SetStatus(-1); // exclude pads with strong coupling to the other clusters
1258     cluster.Pad(j)->SetStatus(AliMUONClusterFinderMLEM::GetCoupledFlag()); // exclude pads with strong coupling to the other clusters
1259     nOK--;
1260   }
1261   delete [] padpix;
1262   return nOK;
1263 }
1264
1265 //_____________________________________________________________________________
1266 void
1267 AliMUONClusterSplitterMLEM::UpdatePads(const AliMUONCluster& cluster,
1268                                           Int_t /*nfit*/, Double_t *par)
1269 {
1270   /// Subtract the fitted charges from pads with strong coupling
1271
1272   Int_t indx, mult = cluster.Multiplicity(), iend = fNpar/3;
1273   Double_t charge, coef=0;
1274
1275   for (Int_t j = 0; j < mult; ++j)
1276   {
1277     AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
1278     //if ( pad->Status() != -1 ) continue;
1279     if ( pad->Status() != AliMUONClusterFinderMLEM::GetCoupledFlag() ) continue;
1280     if (fNpar != 0)
1281     {
1282       charge = 0;
1283       for (Int_t i = 0; i <= iend; ++i)
1284       {
1285         // sum over hits
1286         indx = 3 * i;
1287         coef = Param2Coef(i, coef, par);
1288         charge += ChargeIntegration(par[indx],par[indx+1],*pad) * coef;
1289       }
1290       charge *= fQtot;
1291       pad->SetCharge(pad->Charge()-charge);
1292     } // if (fNpar != 0)
1293
1294     //if (pad->Charge() > 6 /*fgkZeroSuppression*/) pad->SetStatus(0);
1295     if (pad->Charge() > 6 /*fgkZeroSuppression*/) pad->SetStatus(AliMUONClusterFinderMLEM::GetZeroFlag());
1296     // return pad for further using // FIXME: remove usage of zerosuppression here
1297     else pad->SetStatus(AliMUONClusterFinderMLEM::GetOverFlag()); // do not use anymore
1298
1299   } // for (Int_t j=0;
1300 }
1301
1302