New class AliESDEvent, backward compatibility with the old AliESD (Christian)
[u/mrichter/AliRoot.git] / MUON / AliMUONClusterSplitterMLEM.cxx
1 /**************************************************************************
2 * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3 *                                                                        *
4 * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5 * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6 *                                                                        *
7 * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8 * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9 * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10 * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11 * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12 * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13 * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14 **************************************************************************/
15
16 // $Id$
17
18 /// \class AliMUONClusterSplitterMLEM
19 /// 
20 /// Splitter class for the MLEM algorithm...
21 ///
22 /// FIXME: describe it a little bit more here...
23 ///
24 /// \author Laurent Aphecetche (for the "new" C++ structure) and 
25 /// Alexander Zinchenko, JINR Dubna, for the hardcore of it ;-)
26
27 #include "AliMUONClusterSplitterMLEM.h"
28
29 #include "AliMUONCluster.h"
30 #include "AliMUONPad.h"
31 #include "AliMUONPad.h"
32 #include "AliMpStationType.h"
33 #include "AliMUONConstants.h"
34 #include "AliMpDEManager.h"
35 #include "AliMUONMathieson.h"
36
37 #include "AliLog.h"
38
39 #include <TClonesArray.h>
40 #include <TH2.h>
41 #include <TMath.h>
42 #include <TMatrixD.h>
43 #include <TObjArray.h>
44 #include <TROOT.h>
45 #include <TRandom.h>
46 #include <Riostream.h>
47
48 /// \cond CLASSIMP
49 ClassImp(AliMUONClusterSplitterMLEM)
50 /// \endcond
51
52 const Double_t AliMUONClusterSplitterMLEM::fgkCouplMin = 1.e-3; // threshold on coupling 
53
54 //_____________________________________________________________________________
55 AliMUONClusterSplitterMLEM::AliMUONClusterSplitterMLEM(Int_t detElemId, 
56                                                        TObjArray* fPixArray) 
57 : TObject(),
58 fPixArray(fPixArray),
59 fMathieson(0x0),
60 fDetElemId(detElemId),
61 fNpar(0),
62 fQtot(0),
63 fnCoupled(0),
64 fDebug(0)
65 {
66   /// Constructor
67   
68   AliMp::StationType stationType = AliMpDEManager::GetStationType(fDetElemId);
69   
70   Float_t kx3 = AliMUONConstants::SqrtKx3();
71   Float_t ky3 = AliMUONConstants::SqrtKy3();
72   Float_t pitch = AliMUONConstants::Pitch();
73   
74   if ( stationType == AliMp::kStation1 )
75   {
76     kx3 = AliMUONConstants::SqrtKx3St1();
77     ky3 = AliMUONConstants::SqrtKy3St1();
78     pitch = AliMUONConstants::PitchSt1();
79   }
80   
81   fMathieson = new AliMUONMathieson;
82   
83   fMathieson->SetPitch(pitch);
84   fMathieson->SetSqrtKx3AndDeriveKx2Kx4(kx3);
85   fMathieson->SetSqrtKy3AndDeriveKy2Ky4(ky3);
86   
87 }
88
89 //_____________________________________________________________________________
90 AliMUONClusterSplitterMLEM::~AliMUONClusterSplitterMLEM()
91 {
92   /// Destructor
93   
94   delete fMathieson;
95 }
96
97 //_____________________________________________________________________________
98 void 
99 AliMUONClusterSplitterMLEM::AddBin(TH2 *mlem, 
100                                    Int_t ic, Int_t jc, Int_t mode, 
101                                    Bool_t *used, TObjArray *pix)
102 {
103   /// Add a bin to the cluster
104   
105   Int_t nx = mlem->GetNbinsX();
106   Int_t ny = mlem->GetNbinsY();
107   Double_t cont1, cont = mlem->GetCellContent(jc,ic);
108   AliMUONPad *pixPtr = 0;
109   
110   for (Int_t i=TMath::Max(ic-1,1); i<=TMath::Min(ic+1,ny); i++) {
111     for (Int_t j=TMath::Max(jc-1,1); j<=TMath::Min(jc+1,nx); j++) {
112       if (i != ic && j != jc) continue;
113       if (used[(i-1)*nx+j-1]) continue;
114       cont1 = mlem->GetCellContent(j,i);
115       if (mode && cont1 > cont) continue;
116       used[(i-1)*nx+j-1] = kTRUE;
117       if (cont1 < 0.5) continue;
118       if (pix) pix->Add(BinToPix(mlem,j,i)); 
119       else {
120         pixPtr = new AliMUONPad (mlem->GetXaxis()->GetBinCenter(j), 
121                                    mlem->GetYaxis()->GetBinCenter(i), 0, 0, cont1);
122         fPixArray->Add((TObject*)pixPtr);
123       }
124       AddBin(mlem, i, j, mode, used, pix); // recursive call
125     }
126   }
127 }
128
129 //_____________________________________________________________________________
130 void 
131 AliMUONClusterSplitterMLEM::AddCluster(Int_t ic, Int_t nclust, 
132                                        TMatrixD& aijcluclu, 
133                                        Bool_t *used, Int_t *clustNumb, Int_t &nCoupled)
134 {
135   /// Add a cluster to the group of coupled clusters
136   
137   for (Int_t i=0; i<nclust; i++) {
138     if (used[i]) continue;
139     if (aijcluclu(i,ic) < fgkCouplMin) continue;
140     used[i] = kTRUE;
141     clustNumb[nCoupled++] = i;
142     AddCluster(i, nclust, aijcluclu, used, clustNumb, nCoupled);
143   }
144 }
145
146 //_____________________________________________________________________________
147 TObject* 
148 AliMUONClusterSplitterMLEM::BinToPix(TH2 *mlem,
149                                      Int_t jc, Int_t ic)
150 {
151   /// Translate histogram bin to pixel 
152   
153   Double_t yc = mlem->GetYaxis()->GetBinCenter(ic);
154   Double_t xc = mlem->GetXaxis()->GetBinCenter(jc);
155   
156   Int_t nPix = fPixArray->GetEntriesFast();
157   AliMUONPad *pixPtr = NULL;
158   
159   // Compare pixel and bin positions
160   for (Int_t i=0; i<nPix; i++) {
161     pixPtr = (AliMUONPad*) fPixArray->UncheckedAt(i);
162     if (pixPtr->Charge() < 0.5) continue;
163     if (TMath::Abs(pixPtr->Coord(0)-xc)<1.e-4 && TMath::Abs(pixPtr->Coord(1)-yc)<1.e-4) 
164     {
165       return (TObject*) pixPtr;
166     }
167   }
168   AliError(Form(" Something wrong ??? %f %f ", xc, yc));
169   return NULL;
170 }
171
172 //_____________________________________________________________________________
173 Float_t
174 AliMUONClusterSplitterMLEM::ChargeIntegration(Double_t x, Double_t y,
175                                               const AliMUONPad& pad)
176 {
177   /// Compute the Mathieson integral on pad area, assuming the center
178   /// of the Mathieson is at (x,y)
179   
180   TVector2 lowerLeft(TVector2(x,y)-pad.Position()-pad.Dimensions());
181   TVector2 upperRight(lowerLeft + pad.Dimensions()*2.0);
182   
183         return fMathieson->IntXY(lowerLeft.X(),lowerLeft.Y(),
184                            upperRight.X(),upperRight.Y());
185 }
186
187 //_____________________________________________________________________________
188 void 
189 AliMUONClusterSplitterMLEM::Fcn1(const AliMUONCluster& cluster, 
190                                     Int_t & /*fNpar*/, Double_t * /*gin*/, 
191                                     Double_t &f, Double_t *par, Int_t /*iflag*/)
192 {
193   /// Fit for one track
194   
195   Int_t indx, npads=0;
196   Double_t charge, delta, coef=0, chi2=0, qTot = 0;
197   
198   for (Int_t j=0; j< cluster.Multiplicity(); ++j) 
199   {
200     AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
201     if ( pad->Status() !=1 || pad->IsSaturated() ) continue;
202     if ( pad->IsReal() ) npads++; // exclude virtual pads
203     qTot += pad->Charge(); // c.fXyq[2][j];
204     charge = 0;
205     for (Int_t i=fNpar/3; i>=0; --i)
206     { // sum over tracks
207       indx = i<2 ? 2*i : 2*i+1;
208       if (fNpar == 2) 
209       {
210         coef = 1;
211       }
212       else 
213       {
214         coef = i==fNpar/3 ? par[indx+2] : 1-coef;
215       }
216       coef = TMath::Max (coef, 0.);
217       if ( fNpar == 8 && i < 2) 
218       {
219         coef = i==1 ? coef*par[indx+2] : coef - par[7];
220       }
221       coef = TMath::Max (coef, 0.);
222       charge += ChargeIntegration(par[indx],par[indx+1],*pad) * coef;
223     }
224     charge *= fQtot;
225     delta = charge - pad->Charge(); //c.fXyq[2][j];
226     delta *= delta;
227     delta /= pad->Charge(); //c.fXyq[2][j];
228     chi2 += delta;
229   } // for (Int_t j=0;
230   f = chi2; 
231   Double_t qAver = qTot/npads;
232   f = chi2/qAver;
233 }
234
235 //_____________________________________________________________________________
236 Int_t 
237 AliMUONClusterSplitterMLEM::Fit(const AliMUONCluster& cluster,
238                                 Int_t iSimple, Int_t nfit, 
239                                 Int_t *clustFit, TObjArray **clusters, 
240                                 Double_t *parOk,
241                                 TObjArray& clusterList)
242 {
243   /// Find selected clusters to selected pad charges
244   
245   //  AliDebug(2,Form("iSimple=%d nfit=%d",iSimple,nfit));
246   
247   TH2D *mlem = (TH2D*) gROOT->FindObject("mlem");
248   Double_t xmin = mlem->GetXaxis()->GetXmin() - mlem->GetXaxis()->GetBinWidth(1);
249   Double_t xmax = mlem->GetXaxis()->GetXmax() + mlem->GetXaxis()->GetBinWidth(1);
250   Double_t ymin = mlem->GetYaxis()->GetXmin() - mlem->GetYaxis()->GetBinWidth(1);
251   Double_t ymax = mlem->GetYaxis()->GetXmax() + mlem->GetYaxis()->GetBinWidth(1);
252   Double_t step[3]={0.01,0.002,0.02}, xPad = 0, yPad = 99999;
253   
254   // Number of pads to use and number of virtual pads
255   Int_t npads = 0, nVirtual = 0, nfit0 = nfit;
256   //cluster.Print("full");
257   for (Int_t i=0; i<cluster.Multiplicity(); ++i ) 
258   {
259     AliMUONPad* pad = cluster.Pad(i);
260     if ( !pad->IsReal() ) ++nVirtual;
261     if ( pad->Status() !=1 || pad->IsSaturated() ) continue;
262     if ( pad->IsReal() )
263     {
264       ++npads;
265       if (yPad > 9999) 
266       { 
267         xPad = pad->X();//fXyq[0][i]; 
268         yPad = pad->Y();//fXyq[1][i]; 
269       } 
270       else 
271       {
272         if (pad->DY() < pad->DX() ) //fXyq[4][i] < fXyq[3][i]) 
273         {
274           yPad = pad->Y();//fXyq[1][i]; 
275         }
276         else 
277         {
278           xPad = pad->X();//fXyq[0][i]; 
279         }
280       }
281     }
282   }
283   
284   fNpar = 0;
285   fQtot = 0;
286   
287   if (npads < 2) return 0; 
288   
289   // FIXME : AliWarning("Reconnect the following code for hit/track passing ?");
290   
291   //  Int_t tracks[3] = {-1, -1, -1};
292   
293   /*
294    Int_t digit = 0;
295    AliMUONDigit *mdig = 0;
296    for (Int_t cath=0; cath<2; cath++) {  
297      for (Int_t i=0; i<fnPads[0]+fnPads[1]; i++) {
298        if (fPadIJ[0][i] != cath) continue;
299        if (fPadIJ[1][i] != 1) continue;
300        if (fXyq[3][i] < 0) continue; // exclude virtual pads
301        digit = TMath::Nint (fXyq[5][i]);
302        if (digit >= 0) mdig = fInput->Digit(cath,digit);
303        else mdig = fInput->Digit(TMath::Even(cath),-digit-1);
304        //if (!mdig) mdig = fInput->Digit(TMath::Even(cath),digit);
305        if (!mdig) continue; // protection for cluster display
306        if (mdig->Hit() >= 0) {
307          if (tracks[0] < 0) {
308            tracks[0] = mdig->Hit();
309            tracks[1] = mdig->Track(0);
310          } else if (mdig->Track(0) < tracks[1]) {
311            tracks[0] = mdig->Hit();
312            tracks[1] = mdig->Track(0);
313          }
314        }
315        if (mdig->Track(1) >= 0 && mdig->Track(1) != tracks[1]) {
316          if (tracks[2] < 0) tracks[2] = mdig->Track(1);
317          else tracks[2] = TMath::Min (tracks[2], mdig->Track(1));
318        }
319      } // for (Int_t i=0;
320   } // for (Int_t cath=0;
321    */
322   
323   // Get number of pads in X and Y 
324 //  Int_t nInX = 0, nInY;
325 //  PadsInXandY(cluster,nInX, nInY);
326   const Int_t kStatusToTest(1);
327   
328   AliMpIntPair nofPads = cluster.NofPads(kStatusToTest);
329   Int_t nInX = nofPads.GetFirst();
330   Int_t nInY = nofPads.GetSecond();
331
332   if (fDebug) {
333     Int_t npadOK = 0;
334     for (Int_t j = 0; j < cluster.Multiplicity(); ++j) {
335       AliMUONPad *pad = cluster.Pad(j);
336       if (pad->Status() == 1 && !pad->IsSaturated()) npadOK++;
337     }
338     cout << " Number of pads to fit: " << npadOK << endl;
339     cout << " nInX and Y: " << nInX << " " << nInY << endl;
340   }
341   
342   Int_t nfitMax = 3; 
343   nfitMax = TMath::Min (nfitMax, (npads + 1) / 3);
344   if (nfitMax > 1) {
345     if (nInX < 3 && nInY < 3 || nInX == 3 && nInY < 3 || nInX < 3 && nInY == 3) nfitMax = 1; // not enough pads in each direction
346   }
347   if (nfit > nfitMax) nfit = nfitMax;
348   
349   // Take cluster maxima as fitting seeds
350   TObjArray *pix;
351   AliMUONPad *pixPtr;
352   Int_t npxclu;
353   Double_t cont, cmax = 0, xseed = 0, yseed = 0, errOk[8], qq = 0;
354   Double_t xyseed[3][2], qseed[3], xyCand[3][2] = {{0},{0}}, sigCand[3][2] = {{0},{0}};
355   
356   for (Int_t ifit=1; ifit<=nfit0; ifit++) 
357   {
358     cmax = 0;
359     pix = clusters[clustFit[ifit-1]];
360     npxclu = pix->GetEntriesFast();
361     //qq = 0;
362     for (Int_t clu=0; clu<npxclu; ++clu) 
363     {
364       pixPtr = (AliMUONPad*) pix->UncheckedAt(clu);
365       cont = pixPtr->Charge();
366       fQtot += cont;
367       if (cont > cmax) 
368       { 
369         cmax = cont; 
370         xseed = pixPtr->Coord(0);
371         yseed = pixPtr->Coord(1);
372       }
373       qq += cont;
374       xyCand[0][0] += pixPtr->Coord(0) * cont;
375       xyCand[0][1] += pixPtr->Coord(1) * cont;
376       sigCand[0][0] += pixPtr->Coord(0) * pixPtr->Coord(0) * cont;
377       sigCand[0][1] += pixPtr->Coord(1) * pixPtr->Coord(1) * cont;
378     }
379     xyseed[ifit-1][0] = xseed;
380     xyseed[ifit-1][1] = yseed;
381     qseed[ifit-1] = cmax;
382   } // for (Int_t ifit=1;
383   
384   xyCand[0][0] /= qq; // <x>
385   xyCand[0][1] /= qq; // <y>
386   sigCand[0][0] = sigCand[0][0]/qq - xyCand[0][0]*xyCand[0][0]; // <x^2> - <x>^2
387   sigCand[0][0] = sigCand[0][0] > 0 ? TMath::Sqrt (sigCand[0][0]) : 0;
388   sigCand[0][1] = sigCand[0][1]/qq - xyCand[0][1]*xyCand[0][1]; // <y^2> - <y>^2
389   sigCand[0][1] = sigCand[0][1] > 0 ? TMath::Sqrt (sigCand[0][1]) : 0;
390   if (fDebug) cout << xyCand[0][0] << " " << xyCand[0][1] << " " << sigCand[0][0] << " " << sigCand[0][1] << endl;
391   
392   Int_t nDof, maxSeed[3];//, nMax = 0;
393     Double_t fmin, chi2o = 9999, chi2n;
394     
395     TMath::Sort(nfit0, qseed, maxSeed, kTRUE); // in decreasing order
396     
397     Double_t *gin = 0, func0, func1, param[8], step0[8];
398     Double_t param0[2][8]={{0},{0}}, deriv[2][8]={{0},{0}}; 
399     Double_t shift[8], stepMax, derMax, parmin[8], parmax[8], func2[2], shift0;
400     Double_t delta[8], scMax, dder[8], estim, shiftSave = 0;
401     Int_t min, max, nCall = 0, nLoop, idMax = 0, iestMax = 0, nFail;
402     Double_t rad, dist[3] = {0};
403     
404     // Try to fit with one-track hypothesis, then 2-track. If chi2/dof is 
405     // lower, try 3-track (if number of pads is sufficient).
406     for (Int_t iseed=0; iseed<nfit; iseed++) 
407     {
408       
409       Int_t memory[8] = {0};
410       if (iseed) 
411       { 
412         for (Int_t j=0; j<fNpar; j++) 
413         {
414           param[j] = parOk[j]; 
415         }
416       } // for bounded params
417       
418       for (Int_t j=0; j<3; j++) 
419       {
420         step0[fNpar+j] = shift[fNpar+j] = step[j];
421       }
422       
423       if (nfit == 1) 
424       {
425         param[fNpar] = xyCand[0][0]; // take COG
426       }
427       else 
428       {
429         param[fNpar] = xyseed[maxSeed[iseed]][0];
430       }
431       parmin[fNpar] = xmin; 
432       parmax[fNpar++] = xmax; 
433       if (nfit == 1) 
434       {
435         param[fNpar] = xyCand[0][1]; // take COG
436       }
437       else 
438       {
439         param[fNpar] = xyseed[maxSeed[iseed]][1];
440       }
441       parmin[fNpar] = ymin; 
442       parmax[fNpar++] = ymax; 
443       if (fNpar > 2) 
444       {
445         param[fNpar] = fNpar == 4 ? 0.5 : 0.3;
446         parmin[fNpar] = 0; 
447         parmax[fNpar++] = 1; 
448       }
449       if (iseed) 
450       { 
451         for (Int_t j=0; j<fNpar; j++) 
452         {
453           param0[1][j] = 0; 
454         }
455       }
456       
457       // Try new algorithm
458       min = nLoop = 1; stepMax = func2[1] = derMax = 999999; nFail = 0;
459       
460       while (1) 
461       {
462         max = !min;
463         Fcn1(cluster,fNpar, gin, func0, param, 1); nCall++;
464         //cout << " Func: " << func0 << endl;
465         
466         func2[max] = func0;
467         for (Int_t j=0; j<fNpar; j++) 
468         {
469           param0[max][j] = param[j];
470           delta[j] = step0[j];
471           param[j] += delta[j] / 10;
472           if (j > 0) param[j-1] -= delta[j-1] / 10;
473           Fcn1(cluster,fNpar, gin, func1, param, 1); nCall++;
474           deriv[max][j] = (func1 - func0) / delta[j] * 10; // first derivative
475                                                            //cout << j << " " << deriv[max][j] << endl;
476           dder[j] = param0[0][j] != param0[1][j] ? (deriv[0][j] - deriv[1][j]) / 
477             (param0[0][j] - param0[1][j]) : 0; // second derivative
478         }
479         param[fNpar-1] -= delta[fNpar-1] / 10;
480         if (nCall > 2000) break;
481         
482         min = func2[0] < func2[1] ? 0 : 1;
483         nFail = min == max ? 0 : nFail + 1;
484         
485         stepMax = derMax = estim = 0;
486         for (Int_t j=0; j<fNpar; j++) 
487         { 
488           // Estimated distance to minimum
489           shift0 = shift[j];
490           if (nLoop == 1) 
491           {
492             shift[j] = TMath::Sign (step0[j], -deriv[max][j]); // first step
493           }
494           else if (TMath::Abs(deriv[0][j]) < 1.e-3 && TMath::Abs(deriv[1][j]) < 1.e-3) 
495           {
496             shift[j] = 0;
497           }
498           else if (deriv[min][j]*deriv[!min][j] > 0 && TMath::Abs(deriv[min][j]) > TMath::Abs(deriv[!min][j])
499                    || TMath::Abs(deriv[0][j]-deriv[1][j]) < 1.e-3 || TMath::Abs(dder[j]) < 1.e-6) 
500           {
501             shift[j] = -TMath::Sign (shift[j], (func2[0]-func2[1]) * (param0[0][j]-param0[1][j]));
502             if (min == max) 
503             { 
504               if (memory[j] > 1) 
505               { 
506                 shift[j] *= 2; 
507               } 
508               memory[j]++;
509             }
510           }
511           else 
512           {
513             shift[j] = dder[j] != 0 ? -deriv[min][j] / dder[j] : 0;
514             memory[j] = 0;
515           }
516           
517           if (TMath::Abs(shift[j])/step0[j] > estim) 
518           { 
519             estim = TMath::Abs(shift[j])/step0[j];
520             iestMax = j;
521           }
522           
523           // Too big step
524           if (TMath::Abs(shift[j])/step0[j] > 10) shift[j] = TMath::Sign(10.,shift[j]) * step0[j]; // 
525           
526           // Failed to improve minimum
527           if (min != max) 
528           {
529             memory[j] = 0;
530             param[j] = param0[min][j];
531             if (TMath::Abs(shift[j]+shift0) > 0.1*step0[j]) 
532             {
533               shift[j] = (shift[j] + shift0) / 2;
534             }
535             else 
536             {
537               shift[j] /= -2;
538             }
539           } 
540           
541           // Too big step
542           if (TMath::Abs(shift[j]*deriv[min][j]) > func2[min]) 
543           {
544             shift[j] = TMath::Sign (func2[min]/deriv[min][j], shift[j]);
545           }
546           
547           // Introduce step relaxation factor
548           if (memory[j] < 3) 
549           {
550             scMax = 1 + 4 / TMath::Max(nLoop/2.,1.);
551             if (TMath::Abs(shift0) > 0 && TMath::Abs(shift[j]/shift0) > scMax) 
552             {
553               shift[j] = TMath::Sign (shift0*scMax, shift[j]);
554             }
555           }
556           param[j] += shift[j]; 
557           //MLEM Check parameter limits 27-12-2004
558           if (param[j] < parmin[j]) 
559           { 
560             shift[j] = parmin[j] - param[j]; 
561             param[j] = parmin[j]; 
562           } 
563           else if (param[j] > parmax[j]) 
564           {
565             shift[j] = parmax[j] - param[j];
566             param[j] = parmax[j];
567           }
568           //cout << " xxx " << j << " " << shift[j] << " " << param[j] << endl;
569           stepMax = TMath::Max (stepMax, TMath::Abs(shift[j]/step0[j]));
570           if (TMath::Abs(deriv[min][j]) > derMax) 
571           {
572             idMax = j;
573             derMax = TMath::Abs (deriv[min][j]);
574           }
575         } // for (Int_t j=0; j<fNpar;
576         
577         if (estim < 1 && derMax < 2 || nLoop > 150) break; // minimum was found
578         
579         nLoop++;
580         
581         // Check for small step
582         if (shift[idMax] == 0) 
583         { 
584           shift[idMax] = step0[idMax]/10; 
585           param[idMax] += shift[idMax]; 
586           continue; 
587         }
588         
589         if (!memory[idMax] && derMax > 0.5 && nLoop > 10) 
590         {
591           if (dder[idMax] != 0 && TMath::Abs(deriv[min][idMax]/dder[idMax]/shift[idMax]) > 10) 
592           {
593             if (min == max) dder[idMax] = -dder[idMax];
594             shift[idMax] = -deriv[min][idMax] / dder[idMax] / 10; 
595             param[idMax] += shift[idMax];
596             stepMax = TMath::Max (stepMax, TMath::Abs(shift[idMax])/step0[idMax]);
597             if (min == max) shiftSave = shift[idMax];
598           }
599           if (nFail > 10) 
600           {
601             param[idMax] -= shift[idMax];
602             shift[idMax] = 4 * shiftSave * (gRandom->Rndm(0) - 0.5);
603             param[idMax] += shift[idMax];
604           }
605         }      
606   } // while (1)
607       
608       fmin = func2[min];
609       
610       nDof = npads - fNpar + nVirtual;
611       if (!nDof) nDof++;
612       chi2n = fmin / nDof;
613       if (fDebug) cout << " Chi2 " << chi2n << " " << fNpar << endl;
614       
615       if (chi2n*1.2+1.e-6 > chi2o ) { fNpar -= 3; break; }
616       
617       // Save parameters and errors
618       
619       if (nInX == 1) {
620         // One pad per direction 
621         for (Int_t i=0; i<fNpar; i++) if (i == 0 || i == 2 || i == 5) param0[min][i] = xPad;
622       }
623       if (nInY == 1) {
624         // One pad per direction 
625         for (Int_t i=0; i<fNpar; i++) if (i == 1 || i == 3 || i == 6) param0[min][i] = yPad;
626       }
627       
628       /*
629        if (iseed > 0) {
630          // Find distance to the nearest neighbour
631          dist[0] = dist[1] = TMath::Sqrt ((param0[min][0]-param0[min][2])*
632                                           (param0[min][0]-param0[min][2])
633                                           +(param0[min][1]-param0[min][3])*
634                                           (param0[min][1]-param0[min][3]));
635          if (iseed > 1) {
636            dist[2] = TMath::Sqrt ((param0[min][0]-param0[min][5])*
637                                   (param0[min][0]-param0[min][5])
638                                   +(param0[min][1]-param0[min][6])*
639                                   (param0[min][1]-param0[min][6]));
640            rad = TMath::Sqrt ((param0[min][2]-param0[min][5])*
641                               (param0[min][2]-param0[min][5])
642                               +(param0[min][3]-param0[min][6])*
643                               (param0[min][3]-param0[min][6]));
644            if (dist[2] < dist[0]) dist[0] = dist[2];
645            if (rad < dist[1]) dist[1] = rad;
646            if (rad < dist[2]) dist[2] = rad;
647          }
648          cout << dist[0] << " " << dist[1] << " " << dist[2] << endl;
649          if (dist[TMath::LocMin(iseed+1,dist)] < 1.) { fNpar -= 3; break; }
650        }
651        */
652       
653       for (Int_t i=0; i<fNpar; i++) {
654         parOk[i] = param0[min][i];
655         //errOk[i] = fmin;
656         errOk[i] = chi2n;
657         // Bounded params
658         parOk[i] = TMath::Max (parOk[i], parmin[i]);
659         parOk[i] = TMath::Min (parOk[i], parmax[i]);
660       }
661       
662       chi2o = chi2n;
663       if (fmin < 0.1) break; // !!!???
664     } // for (Int_t iseed=0; 
665    
666     if (fDebug) {
667       for (Int_t i=0; i<fNpar; i++) {
668         if (i == 4 || i == 7) {
669           if (i == 7 || i == 4 && fNpar < 7) cout << parOk[i] << endl;
670           else cout << parOk[i] * (1-parOk[7]) << endl;
671           continue;
672         }
673         cout << parOk[i] << " " << errOk[i] << endl;
674       }
675     }
676     nfit = (fNpar + 1) / 3;
677     dist[0] = dist[1] = dist[2] = 0;
678     
679     if (nfit > 1) {
680       // Find distance to the nearest neighbour
681       dist[0] = dist[1] = TMath::Sqrt ((parOk[0]-parOk[2])*
682                                        (parOk[0]-parOk[2])
683                                        +(parOk[1]-parOk[3])*
684                                        (parOk[1]-parOk[3]));
685       if (nfit > 2) {
686         dist[2] = TMath::Sqrt ((parOk[0]-parOk[5])*
687                                (parOk[0]-parOk[5])
688                                +(parOk[1]-parOk[6])*
689                                (parOk[1]-parOk[6]));
690         rad = TMath::Sqrt ((parOk[2]-parOk[5])*
691                            (parOk[2]-parOk[5])
692                            +(parOk[3]-parOk[6])*
693                            (parOk[3]-parOk[6]));
694         if (dist[2] < dist[0]) dist[0] = dist[2];
695         if (rad < dist[1]) dist[1] = rad;
696         if (rad < dist[2]) dist[2] = rad;
697       }
698     }
699     
700     Int_t indx;
701     
702     //if (!fDraw) {
703     
704     Double_t coef = 0;
705     if (iSimple) fnCoupled = 0;
706     //for (Int_t j=0; j<nfit; j++) {
707     for (Int_t j=nfit-1; j>=0; j--) {
708       indx = j<2 ? j*2 : j*2+1;  
709       if (nfit == 1) coef = 1;
710       else coef = j==nfit-1 ? parOk[indx+2] : 1-coef;
711       coef = TMath::Max (coef, 0.);
712       if (nfit == 3 && j < 2) coef = j==1 ? coef*parOk[indx+2] : coef - parOk[7];
713       coef = TMath::Max (coef, 0.);
714       
715       //void AliMUONClusterFinderMLEM::AddRawCluster(Double_t x, Double_t y, 
716       //                                             Double_t qTot, Double_t fmin,
717       //                                             Int_t nfit, Int_t *tracks, 
718       //                                             Double_t /*sigx*/, 
719       //                                             Double_t /*sigy*/, 
720       //                                             Double_t /*dist*/)
721       
722       if ( coef*fQtot >= 14 )
723       {
724         //AZ AliMUONCluster* cluster1 = new AliMUONCluster();
725         AliMUONCluster* cluster1 = new AliMUONCluster(cluster);
726         
727         cluster1->SetCharge(coef*fQtot,coef*fQtot);
728         cluster1->SetPosition(TVector2(parOk[indx],parOk[indx+1]),TVector2(sigCand[0][0],sigCand[0][1]));
729         cluster1->SetChi2(dist[TMath::LocMin(nfit,dist)]);
730         
731         // FIXME: we miss some information in this cluster, as compared to 
732         // the original AddRawCluster code.
733         
734         AliDebug(2,Form("Adding RawCluster detElemId %4d mult %2d charge %5d (xl,yl)=(%9.6g,%9.6g)",
735                         fDetElemId,cluster1->Multiplicity(),(Int_t)cluster1->Charge(),
736                         cluster1->Position().X(),cluster1->Position().Y()));
737         
738         clusterList.Add(cluster1);
739       }
740       //      AddRawCluster (parOk[indx], // double x
741       //                     parOk[indx+1], // double y
742       //                     coef*qTot, // double charge
743       //                     errOk[indx], // double fmin
744       //                     nfit0+10*nfit+100*nMax+10000*fnCoupled, // int nfit
745       //                     tracks, // int* tracks
746       //                     sigCand[0][0], // double sigx
747       //                     sigCand[0][1], // double sigy
748       //                     dist[TMath::LocMin(nfit,dist)] // double dist
749       //                     );
750     }
751     return nfit;
752     }  
753
754
755 //_____________________________________________________________________________
756 void
757 AliMUONClusterSplitterMLEM::Split(const AliMUONCluster& cluster,
758                                   TH2 *mlem,
759                                   Double_t *coef,
760                                   TObjArray& clusterList)
761 {
762   /// The main steering function to work with clusters of pixels in anode
763   /// plane (find clusters, decouple them from each other, merge them (if
764   /// necessary), pick up coupled pads, call the fitting function)
765   
766   Int_t nx = mlem->GetNbinsX();
767   Int_t ny = mlem->GetNbinsY();
768   Int_t nPix = fPixArray->GetEntriesFast();
769   
770   Bool_t *used = new Bool_t[ny*nx];
771   Double_t cont;
772   Int_t nclust = 0, indx, indx1;
773   
774   for (Int_t i=0; i<ny*nx; i++) used[i] = kFALSE; 
775   
776   TObjArray *clusters[200]={0};
777   TObjArray *pix;
778   
779   // Find clusters of histogram bins (easier to work in 2-D space)
780   for (Int_t i=1; i<=ny; i++) 
781   {
782     for (Int_t j=1; j<=nx; j++) 
783     {
784       indx = (i-1)*nx + j - 1;
785       if (used[indx]) continue;
786       cont = mlem->GetCellContent(j,i);
787       if (cont < 0.5) continue;
788       pix = new TObjArray(20);
789       used[indx] = 1;
790       pix->Add(BinToPix(mlem,j,i));
791       AddBin(mlem, i, j, 0, used, pix); // recursive call
792       if (nclust >= 200) AliFatal(" Too many clusters !!!");
793       clusters[nclust++] = pix;
794     } // for (Int_t j=1; j<=nx; j++) {
795     } // for (Int_t i=1; i<=ny;
796 //  if (fDebug) cout << nclust << endl;
797   delete [] used; used = 0;
798   
799   // Compute couplings between clusters and clusters to pads
800   Int_t npad = cluster.Multiplicity();
801   
802   // Exclude pads with overflows
803   for (Int_t j=0; j<npad; ++j) 
804   {
805     AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
806     if ( pad->IsSaturated() )
807     {
808       pad->SetStatus(-5); 
809     }
810     else 
811     {
812       pad->SetStatus(0);
813     }
814   }
815   
816   // Compute couplings of clusters to pads
817   TMatrixD aijclupad(nclust,npad);
818   aijclupad = 0;
819   Int_t npxclu;
820   for (Int_t iclust=0; iclust<nclust; ++iclust) 
821   {
822     pix = clusters[iclust];
823     npxclu = pix->GetEntriesFast();
824     for (Int_t i=0; i<npxclu; ++i) 
825     {
826       indx = fPixArray->IndexOf(pix->UncheckedAt(i));
827       for (Int_t j=0; j<npad; ++j) 
828       {
829         AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
830         if ( pad->Status() < 0 && pad->Status() != -5) continue;
831         if (coef[j*nPix+indx] < fgkCouplMin) continue;
832         aijclupad(iclust,j) += coef[j*nPix+indx];
833       }
834     }
835   }
836   
837   // Compute couplings between clusters
838   TMatrixD aijcluclu(nclust,nclust);
839   aijcluclu = 0;
840   for (Int_t iclust=0; iclust<nclust; ++iclust) 
841   {
842     for (Int_t j=0; j<npad; ++j) 
843     {
844       // Exclude overflows
845       if ( cluster.Pad(j)->Status() < 0) continue;
846       if (aijclupad(iclust,j) < fgkCouplMin) continue;
847       for (Int_t iclust1=iclust+1; iclust1<nclust; iclust1++) 
848       {
849         if (aijclupad(iclust1,j) < fgkCouplMin) continue;
850         aijcluclu(iclust,iclust1) += 
851           TMath::Sqrt (aijclupad(iclust,j)*aijclupad(iclust1,j));
852       }
853     }
854   }
855   for (Int_t iclust=0; iclust<nclust; ++iclust) 
856   {
857     for (Int_t iclust1=iclust+1; iclust1<nclust; ++iclust1) 
858     {
859       aijcluclu(iclust1,iclust) = aijcluclu(iclust,iclust1);
860     }
861   }
862   
863   // Find groups of coupled clusters
864   used = new Bool_t[nclust];
865   for (Int_t i=0; i<nclust; i++) used[i] = kFALSE;
866   Int_t *clustNumb = new Int_t[nclust];
867   Int_t nCoupled, nForFit, minGroup[3], clustFit[3], nfit = 0;
868   Double_t parOk[8];
869   
870   for (Int_t igroup=0; igroup<nclust; igroup++) 
871   {
872     if (used[igroup]) continue;
873     used[igroup] = kTRUE;
874     clustNumb[0] = igroup;
875     nCoupled = 1;
876     // Find group of coupled clusters
877     AddCluster(igroup, nclust, aijcluclu, used, clustNumb, nCoupled); // recursive
878     
879     //    if (fDebug) {                                                                      
880     //      cout << " nCoupled: " << nCoupled << endl;                                                                      
881     //      for (Int_t i=0; i<nCoupled; i++) cout << clustNumb[i] << " "; cout << endl;                                                                       
882     //    }
883     
884     fnCoupled = nCoupled;
885     
886     while (nCoupled > 0) 
887     {
888       if (nCoupled < 4) 
889       {
890         nForFit = nCoupled;
891         for (Int_t i=0; i<nCoupled; i++) clustFit[i] = clustNumb[i];
892       } 
893       else 
894       {
895         // Too many coupled clusters to fit - try to decouple them
896         // Find the lowest coupling of 1, 2, min(3,nLinks/2) pixels with 
897         // all the others in the group 
898         for (Int_t j=0; j<3; j++) minGroup[j] = -1;
899         /*Double_t coupl =*/ MinGroupCoupl(nCoupled, clustNumb, aijcluclu, minGroup);
900         
901         // Flag clusters for fit
902         nForFit = 0;
903         while (minGroup[nForFit] >= 0 && nForFit < 3)
904         {
905           clustFit[nForFit] = clustNumb[minGroup[nForFit]];
906           clustNumb[minGroup[nForFit]] -= 999;
907           nForFit++;
908         }
909       } // else
910       
911       // Select pads for fit. 
912       if (SelectPad(cluster,nCoupled, nForFit, clustNumb, clustFit, aijclupad) < 3 && nCoupled > 1) 
913       {
914         // Deselect pads
915         for (Int_t j=0; j<npad; ++j)
916         {
917           AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
918           if ( pad->Status()==1 ) pad->SetStatus(0);
919           if ( pad->Status()==-9) pad->SetStatus(-5);
920         }
921         // Merge the failed cluster candidates (with too few pads to fit) with 
922         // the one with the strongest coupling
923         Merge(cluster,nForFit, nCoupled, clustNumb, clustFit, clusters, aijcluclu, aijclupad);
924       } 
925       else 
926       {
927         // Do the fit
928         nfit = Fit(cluster,0, nForFit, clustFit, clusters, parOk, clusterList);
929       }
930       
931       // Subtract the fitted charges from pads with strong coupling and/or
932       // return pads for further use
933       UpdatePads(cluster,nfit, parOk);
934       
935       // Mark used pads
936       for (Int_t j=0; j<npad; ++j) 
937       {
938         AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
939         if ( pad->Status()==1 ) pad->SetStatus(-1);
940         if ( pad->Status()==-9) pad->SetStatus(-5);
941       }
942       
943       // Sort the clusters (move to the right the used ones)
944       Int_t beg = 0, end = nCoupled - 1;
945       while (beg < end) 
946       {
947         if (clustNumb[beg] >= 0) { ++beg; continue; }
948         for (Int_t j=end; j>beg; --j) 
949         {
950           if (clustNumb[j] < 0) continue;
951           end = j - 1;
952           indx = clustNumb[beg];
953           clustNumb[beg] = clustNumb[j];
954           clustNumb[j] = indx;
955           break;
956         }
957         ++beg;
958       }
959       
960       nCoupled -= nForFit;
961       if (nCoupled > 3) 
962       {
963         // Remove couplings of used clusters
964         for (Int_t iclust=nCoupled; iclust<nCoupled+nForFit;++ iclust) 
965         {
966           indx = clustNumb[iclust] + 999;
967           for (Int_t iclust1=0; iclust1<nCoupled; ++iclust1) 
968           {
969             indx1 = clustNumb[iclust1];
970             aijcluclu(indx,indx1) = aijcluclu(indx1,indx) = 0;
971           }
972         }
973         
974         // Update the remaining clusters couplings (exclude couplings from 
975         // the used pads)
976         for (Int_t j=0; j<npad; ++j) 
977         {
978           AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
979           if ( pad->Status() != -1) continue;
980           for (Int_t iclust=0; iclust<nCoupled; ++iclust) 
981           {
982             indx = clustNumb[iclust];
983             if (aijclupad(indx,j) < fgkCouplMin) continue;
984             for (Int_t iclust1=iclust+1; iclust1<nCoupled; ++iclust1) 
985             {
986               indx1 = clustNumb[iclust1];
987               if (aijclupad(indx1,j) < fgkCouplMin) continue;
988               // Check this
989               aijcluclu(indx,indx1) -= 
990                 TMath::Sqrt (aijclupad(indx,j)*aijclupad(indx1,j));
991               aijcluclu(indx1,indx) = aijcluclu(indx,indx1);
992             }
993           }
994           pad->SetStatus(-8);
995         } // for (Int_t j=0; j<npad;
996       } // if (nCoupled > 3)
997     } // while (nCoupled > 0)
998   } // for (Int_t igroup=0; igroup<nclust;
999   
1000   for (Int_t iclust=0; iclust<nclust; iclust++)
1001   {
1002     pix = clusters[iclust]; 
1003     pix->Clear();
1004     delete pix; 
1005     pix = 0;
1006   }
1007   delete [] clustNumb; 
1008   clustNumb = 0; 
1009   delete [] used; 
1010   used = 0;
1011
1012 }
1013
1014 //_____________________________________________________________________________
1015 void 
1016 AliMUONClusterSplitterMLEM::Merge(const AliMUONCluster& cluster,
1017                                      Int_t nForFit, Int_t nCoupled, 
1018                                      Int_t *clustNumb, Int_t *clustFit, 
1019                                      TObjArray **clusters, 
1020                                      TMatrixD& aijcluclu, TMatrixD& aijclupad)
1021 {
1022   /// Merge the group of clusters with the one having the strongest coupling with them
1023   
1024   Int_t indx, indx1, npxclu, npxclu1, imax=0;
1025   TObjArray *pix, *pix1;
1026   Double_t couplMax;
1027   
1028   for (Int_t icl=0; icl<nForFit; ++icl) 
1029   {
1030     indx = clustFit[icl];
1031     pix = clusters[indx];
1032     npxclu = pix->GetEntriesFast();
1033     couplMax = -1;
1034     for (Int_t icl1=0; icl1<nCoupled; ++icl1) 
1035     {
1036       indx1 = clustNumb[icl1];
1037       if (indx1 < 0) continue;
1038       if ( aijcluclu(indx,indx1) > couplMax) 
1039       {
1040         couplMax = aijcluclu(indx,indx1);
1041         imax = indx1;
1042       }
1043     } // for (Int_t icl1=0;
1044       // Add to it
1045     pix1 = clusters[imax];
1046     npxclu1 = pix1->GetEntriesFast();
1047     // Add pixels 
1048     for (Int_t i=0; i<npxclu; ++i) 
1049     { 
1050       pix1->Add(pix->UncheckedAt(i)); 
1051       pix->RemoveAt(i); 
1052     }
1053     
1054     //Add cluster-to-cluster couplings
1055     for (Int_t icl1=0; icl1<nCoupled; ++icl1) 
1056     {
1057       indx1 = clustNumb[icl1];
1058       if (indx1 < 0 || indx1 == imax) continue;
1059       aijcluclu(indx1,imax) += aijcluclu(indx,indx1);
1060       aijcluclu(imax,indx1) = aijcluclu(indx1,imax);
1061     }
1062     aijcluclu(indx,imax) = aijcluclu(imax,indx) = 0;
1063     
1064     //Add cluster-to-pad couplings
1065     for (Int_t j=0; j<cluster.Multiplicity(); ++j) 
1066     {
1067       AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
1068       if ( pad->Status() < 0 && pad->Status() != -5 ) continue;// exclude used pads
1069         aijclupad(imax,j) += aijclupad(indx,j);
1070         aijclupad(indx,j) = 0;
1071     }
1072   } // for (Int_t icl=0; icl<nForFit;
1073 }
1074
1075
1076 //_____________________________________________________________________________
1077 Double_t 
1078 AliMUONClusterSplitterMLEM::MinGroupCoupl(Int_t nCoupled, Int_t *clustNumb, 
1079                                           TMatrixD& aijcluclu, Int_t *minGroup)
1080 {
1081   /// Find group of clusters with minimum coupling to all the others
1082   
1083   Int_t i123max = TMath::Min(3,nCoupled/2); 
1084   Int_t indx, indx1, indx2, indx3, nTot = 0;
1085   Double_t *coupl1 = 0, *coupl2 = 0, *coupl3 = 0;
1086   
1087   for (Int_t i123=1; i123<=i123max; i123++) {
1088     
1089     if (i123 == 1) {
1090       coupl1 = new Double_t [nCoupled];
1091       for (Int_t i=0; i<nCoupled; i++) coupl1[i] = 0;
1092     }
1093     else if (i123 == 2) {
1094       nTot = nCoupled*nCoupled;
1095       coupl2 = new Double_t [nTot];
1096       for (Int_t i=0; i<nTot; i++) coupl2[i] = 9999;
1097     } else {
1098       nTot = nTot*nCoupled;
1099       coupl3 = new Double_t [nTot];
1100       for (Int_t i=0; i<nTot; i++) coupl3[i] = 9999;
1101     } // else
1102     
1103     for (Int_t i=0; i<nCoupled; i++) {
1104       indx1 = clustNumb[i];
1105       for (Int_t j=i+1; j<nCoupled; j++) {
1106         indx2 = clustNumb[j];
1107         if (i123 == 1) {
1108           coupl1[i] += aijcluclu(indx1,indx2);
1109           coupl1[j] += aijcluclu(indx1,indx2);
1110         } 
1111         else if (i123 == 2) {
1112           indx = i*nCoupled + j;
1113           coupl2[indx] = coupl1[i] + coupl1[j];
1114           coupl2[indx] -= 2 * (aijcluclu(indx1,indx2));
1115         } else {
1116           for (Int_t k=j+1; k<nCoupled; k++) {
1117             indx3 = clustNumb[k];
1118             indx = i*nCoupled*nCoupled + j*nCoupled + k;
1119             coupl3[indx] = coupl2[i*nCoupled+j] + coupl1[k];
1120             coupl3[indx] -= 2 * (aijcluclu(indx1,indx3)+aijcluclu(indx2,indx3));
1121           }
1122         } // else
1123       } // for (Int_t j=i+1;
1124     } // for (Int_t i=0;
1125   } // for (Int_t i123=1;
1126   
1127   // Find minimum coupling
1128   Double_t couplMin = 9999;
1129   Int_t locMin = 0;
1130   
1131   for (Int_t i123=1; i123<=i123max; i123++) {
1132     if (i123 == 1) {
1133       locMin = TMath::LocMin(nCoupled, coupl1);
1134       couplMin = coupl1[locMin];
1135       minGroup[0] = locMin;
1136       delete [] coupl1; coupl1 = 0;
1137     } 
1138     else if (i123 == 2) {
1139       locMin = TMath::LocMin(nCoupled*nCoupled, coupl2);
1140       if (coupl2[locMin] < couplMin) {
1141         couplMin = coupl2[locMin];
1142         minGroup[0] = locMin/nCoupled;
1143         minGroup[1] = locMin%nCoupled;
1144       }
1145       delete [] coupl2; coupl2 = 0;
1146     } else {
1147       locMin = TMath::LocMin(nTot, coupl3);
1148       if (coupl3[locMin] < couplMin) {
1149         couplMin = coupl3[locMin];
1150         minGroup[0] = locMin/nCoupled/nCoupled;
1151         minGroup[1] = locMin%(nCoupled*nCoupled)/nCoupled;
1152         minGroup[2] = locMin%nCoupled;
1153       }
1154       delete [] coupl3; coupl3 = 0;
1155     } // else
1156   } // for (Int_t i123=1;
1157   return couplMin;
1158 }
1159
1160 //_____________________________________________________________________________
1161 Int_t 
1162 AliMUONClusterSplitterMLEM::SelectPad(const AliMUONCluster& cluster,
1163                                           Int_t nCoupled, Int_t nForFit, 
1164                                           Int_t *clustNumb, Int_t *clustFit, 
1165                                           TMatrixD& aijclupad)
1166 {
1167   /// Select pads for fit. If too many coupled clusters, find pads giving 
1168   /// the strongest coupling with the rest of clusters and exclude them from the fit.
1169   
1170   Int_t npad = cluster.Multiplicity();
1171   Double_t *padpix = 0;
1172   
1173   if (nCoupled > 3) 
1174   {
1175     padpix = new Double_t[npad];
1176     for (Int_t i=0; i<npad; i++) padpix[i] = 0; 
1177   }
1178   
1179   Int_t nOK = 0, indx, indx1;
1180   for (Int_t iclust=0; iclust<nForFit; ++iclust)
1181   {
1182     indx = clustFit[iclust];
1183     for (Int_t j=0; j<npad; j++) 
1184     {
1185       if ( aijclupad(indx,j) < fgkCouplMin) continue;
1186       AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
1187       if ( pad->Status() == -5 ) pad->SetStatus(-0); // flag overflow
1188       if ( pad->Status() < 0 ) continue; // exclude overflows and used pads
1189       if ( !pad->Status() ) 
1190       {
1191         pad->SetStatus(1);
1192         ++nOK; // pad to be used in fit
1193       }      
1194       if (nCoupled > 3) 
1195       {
1196         // Check other clusters
1197         for (Int_t iclust1=0; iclust1<nCoupled; ++iclust1) 
1198         {
1199           indx1 = clustNumb[iclust1];
1200           if (indx1 < 0) continue;
1201           if ( aijclupad(indx1,j) < fgkCouplMin ) continue;
1202           padpix[j] += aijclupad(indx1,j);
1203         }
1204       } // if (nCoupled > 3)
1205     } // for (Int_t j=0; j<npad;
1206   } // for (Int_t iclust=0; iclust<nForFit
1207   if (nCoupled < 4) return nOK;
1208   
1209   Double_t aaa = 0;
1210   for (Int_t j=0; j<npad; ++j) 
1211   {
1212     if (padpix[j] < fgkCouplMin) continue;
1213     aaa += padpix[j];
1214     cluster.Pad(j)->SetStatus(-1); // exclude pads with strong coupling to the other clusters
1215     nOK--;
1216   }
1217   delete [] padpix; 
1218   padpix = 0;
1219   return nOK;
1220 }
1221
1222 //_____________________________________________________________________________
1223 void 
1224 AliMUONClusterSplitterMLEM::UpdatePads(const AliMUONCluster& cluster,
1225                                           Int_t /*nfit*/, Double_t *par)
1226 {
1227   /// Subtract the fitted charges from pads with strong coupling
1228   
1229   Int_t indx;
1230   Double_t charge, coef=0;
1231   
1232   for (Int_t j=0; j<cluster.Multiplicity(); ++j) 
1233   {
1234     AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
1235     if ( pad->Status() != -1 ) continue;
1236     if (fNpar != 0) 
1237     {
1238       charge = 0;
1239       for (Int_t i=fNpar/3; i>=0; --i) 
1240       { 
1241         // sum over tracks
1242         indx = i<2 ? 2*i : 2*i+1;
1243         if (fNpar == 2) 
1244         {
1245           coef = 1;
1246         }
1247         else 
1248         {
1249           coef = i==fNpar/3 ? par[indx+2] : 1-coef;
1250         }
1251         coef = TMath::Max (coef, 0.);
1252         if (fNpar == 8 && i < 2) 
1253         {
1254           coef = i==1 ? coef*par[indx+2] : coef - par[7];
1255         }
1256         coef = TMath::Max (coef, 0.);
1257         charge += ChargeIntegration(par[indx],par[indx+1],*pad) * coef;
1258       }
1259       charge *= fQtot;
1260       pad->SetCharge(pad->Charge()-charge);
1261     } // if (fNpar != 0)
1262     
1263     if (pad->Charge() > 6 /*fgkZeroSuppression*/) pad->SetStatus(0); 
1264     // return pad for further using // FIXME: remove usage of zerosuppression here
1265     
1266   } // for (Int_t j=0;
1267 }  
1268
1269