MUON/AliMUONClusterSplitterMLEM.cxx

   1 /**************************************************************************
   2 * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3 *                                                                        *
   4 * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5 * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6 *                                                                        *
   7 * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8 * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9 * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10 * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11 * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12 * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13 * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14 **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18 //-----------------------------------------------------------------------------
  19 /// \class AliMUONClusterSplitterMLEM
  20 ///
  21 /// Splitter class for the MLEM algorithm. Performs fitting procedure
  22 /// with up to 3 hit candidates and tries to split clusters if the number
  23 /// of candidates exceeds 3.
  24 ///
  25 /// \author Laurent Aphecetche (for the "new" C++ structure) and
  26 /// Alexander Zinchenko, JINR Dubna, for the hardcore of it ;-)
  27 //-----------------------------------------------------------------------------
  28
  29 #include "AliMUONClusterSplitterMLEM.h"
  30 #include "AliMUONClusterFinderMLEM.h" // for status flag constants
  31
  32 #include "AliMUONCluster.h"
  33 #include "AliMUONPad.h"
  34 #include "AliMUONPad.h"
  35 #include "AliMUONConstants.h"
  36 #include "AliMpDEManager.h"
  37 #include "AliMUONMathieson.h"
  38
  39 #include "AliMpEncodePair.h"
  40
  41 #include "AliLog.h"
  42
  43 #include <TClonesArray.h>
  44 #include <TH2.h>
  45 #include <TMath.h>
  46 #include <TMatrixD.h>
  47 #include <TObjArray.h>
  48 #include <TRandom.h>
  49 #include <Riostream.h>
  50
  51 /// \cond CLASSIMP
  52 ClassImp(AliMUONClusterSplitterMLEM)
  53 /// \endcond
  54
  55 //const Double_t AliMUONClusterSplitterMLEM::fgkCouplMin = 1.e-3; // threshold on coupling
  56 const Double_t AliMUONClusterSplitterMLEM::fgkCouplMin = 1.e-2; // threshold on coupling
  57
  58 //_____________________________________________________________________________
  59 AliMUONClusterSplitterMLEM::AliMUONClusterSplitterMLEM(Int_t detElemId,
  60                                                        TObjArray* pixArray)
  61 : TObject(),
  62 fPixArray(pixArray),
  63 fMathieson(0x0),
  64 fDetElemId(detElemId),
  65 fNpar(0),
  66 fQtot(0),
  67 fnCoupled(0),
  68 fDebug(0)
  69 {
  70   /// Constructor
  71
  72   AliMq::Station12Type stationType = AliMpDEManager::GetStation12Type(fDetElemId);
  73
  74   Float_t kx3 = AliMUONConstants::SqrtKx3();
  75   Float_t ky3 = AliMUONConstants::SqrtKy3();
  76   Float_t pitch = AliMUONConstants::Pitch();
  77
  78   if ( stationType == AliMq::kStation1 )
  79   {
  80     kx3 = AliMUONConstants::SqrtKx3St1();
  81     ky3 = AliMUONConstants::SqrtKy3St1();
  82     pitch = AliMUONConstants::PitchSt1();
  83   }
  84
  85   fMathieson = new AliMUONMathieson;
  86
  87   fMathieson->SetPitch(pitch);
  88   fMathieson->SetSqrtKx3AndDeriveKx2Kx4(kx3);
  89   fMathieson->SetSqrtKy3AndDeriveKy2Ky4(ky3);
  90
  91 }
  92
  93 //_____________________________________________________________________________
  94 AliMUONClusterSplitterMLEM::~AliMUONClusterSplitterMLEM()
  95 {
  96   /// Destructor
  97
  98   delete fMathieson;
  99 }
 100
 101 //_____________________________________________________________________________
 102 void
 103 AliMUONClusterSplitterMLEM::AddBin(TH2 *mlem,
 104                                    Int_t ic, Int_t jc, Int_t mode,
 105                                    Bool_t *used, TObjArray *pix)
 106 {
 107   /// Add a bin to the cluster
 108
 109   Int_t nx = mlem->GetNbinsX();
 110   Int_t ny = mlem->GetNbinsY();
 111   Double_t cont1, cont = mlem->GetCellContent(jc,ic);
 112   AliMUONPad *pixPtr = 0;
 113
 114   Int_t ie = TMath::Min(ic+1,ny), je = TMath::Min(jc+1,nx);
 115   for (Int_t i = TMath::Max(ic-1,1); i <= ie; ++i) {
 116     for (Int_t j = TMath::Max(jc-1,1); j <= je; ++j) {
 117       if (i != ic && j != jc) continue;
 118       if (used[(i-1)*nx+j-1]) continue;
 119       cont1 = mlem->GetCellContent(j,i);
 120       if (mode && cont1 > cont) continue;
 121       used[(i-1)*nx+j-1] = kTRUE;
 122       if (cont1 < 0.5) continue;
 123       if (pix) pix->Add(BinToPix(mlem,j,i));
 124       else {
 125         pixPtr = new AliMUONPad (mlem->GetXaxis()->GetBinCenter(j),
 126                                  mlem->GetYaxis()->GetBinCenter(i), 0, 0, cont1);
 127         fPixArray->Add(pixPtr);
 128       }
 129       AddBin(mlem, i, j, mode, used, pix); // recursive call
 130     }
 131   }
 132 }
 133
 134 //_____________________________________________________________________________
 135 void
 136 AliMUONClusterSplitterMLEM::AddCluster(Int_t ic, Int_t nclust,
 137                                        TMatrixD& aijcluclu,
 138                                        Bool_t *used, Int_t *clustNumb, Int_t &nCoupled)
 139 {
 140   /// Add a cluster to the group of coupled clusters
 141
 142   for (Int_t i = 0; i < nclust; ++i) {
 143     if (used[i]) continue;
 144     if (aijcluclu(i,ic) < fgkCouplMin) continue;
 145     used[i] = kTRUE;
 146     clustNumb[nCoupled++] = i;
 147     AddCluster(i, nclust, aijcluclu, used, clustNumb, nCoupled);
 148   }
 149 }
 150
 151 //_____________________________________________________________________________
 152 TObject*
 153 AliMUONClusterSplitterMLEM::BinToPix(TH2 *mlem,
 154                                      Int_t jc, Int_t ic)
 155 {
 156   /// Translate histogram bin to pixel
 157
 158   Double_t yc = mlem->GetYaxis()->GetBinCenter(ic);
 159   Double_t xc = mlem->GetXaxis()->GetBinCenter(jc);
 160
 161   Int_t nPix = fPixArray->GetEntriesFast();
 162   AliMUONPad *pixPtr = NULL;
 163
 164   // Compare pixel and bin positions
 165   for (Int_t i = 0; i < nPix; ++i) {
 166     pixPtr = (AliMUONPad*) fPixArray->UncheckedAt(i);
 167     if (pixPtr->Charge() < 0.5) continue;
 168     if (TMath::Abs(pixPtr->Coord(0)-xc)<1.e-4 && TMath::Abs(pixPtr->Coord(1)-yc)<1.e-4)
 169     {
 170       //return (TObject*) pixPtr;
 171       return pixPtr;
 172     }
 173   }
 174   AliError(Form(" Something wrong ??? %f %f ", xc, yc));
 175   return NULL;
 176 }
 177
 178 //_____________________________________________________________________________
 179 Float_t
 180 AliMUONClusterSplitterMLEM::ChargeIntegration(Double_t x, Double_t y,
 181                                               const AliMUONPad& pad)
 182 {
 183   /// Compute the Mathieson integral on pad area, assuming the center
 184   /// of the Mathieson is at (x,y)
 185
 186   TVector2 lowerLeft(TVector2(x,y)-pad.Position()-pad.Dimensions());
 187   TVector2 upperRight(lowerLeft + pad.Dimensions()*2.0);
 188
 189         return fMathieson->IntXY(lowerLeft.X(),lowerLeft.Y(),
 190                            upperRight.X(),upperRight.Y());
 191 }
 192
 193 //_____________________________________________________________________________
 194 void
 195 AliMUONClusterSplitterMLEM::Fcn1(const AliMUONCluster& cluster,
 196                                     Int_t & /*fNpar*/, Double_t * /*gin*/,
 197                                     Double_t &f, Double_t *par, Int_t iflag)
 198 {
 199   /// Computes the functional to be minimized
 200
 201   Int_t indx, npads=0;
 202   Double_t charge, delta, coef=0, chi2=0, qTot = 0;
 203   static Double_t qAver = 0;
 204
 205   Int_t mult = cluster.Multiplicity(), iend = fNpar / 3;
 206   for (Int_t j = 0; j < mult; ++j)
 207   {
 208     AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
 209     //if ( pad->Status() !=1 || pad->IsSaturated() ) continue;
 210     if ( pad->Status() != AliMUONClusterFinderMLEM::GetUseForFitFlag()) continue;
 211     if (iflag == 0) {
 212       if ( pad->IsReal() ) npads++; // exclude virtual pads
 213       qTot += pad->Charge();
 214     }
 215     charge = 0;
 216     for (Int_t i = 0; i <= iend; ++i)
 217     {
 218       // sum over hits
 219       indx = 3 * i;
 220       coef = Param2Coef(i, coef, par);
 221       charge += ChargeIntegration(par[indx],par[indx+1],*pad) * coef;
 222     }
 223     charge *= fQtot;
 224     delta = charge - pad->Charge();
 225     delta *= delta;
 226     delta /= pad->Charge();
 227     chi2 += delta;
 228   } // for (Int_t j=0;
 229   if (iflag == 0) qAver = qTot / npads;
 230   f = chi2 / qAver;
 231 }
 232
 233 //_____________________________________________________________________________
 234 Double_t AliMUONClusterSplitterMLEM::Param2Coef(Int_t icand, Double_t coef, Double_t *par)
 235 {
 236   /// Extract hit contribution scale factor from fit parameters
 237
 238   if (fNpar == 2) return 1.;
 239   if (fNpar == 5) return icand==0 ? par[2] : TMath::Max(1.-par[2],0.);
 240   if (icand == 0) return par[2];
 241   if (icand == 1) return TMath::Max((1.-par[2])*par[5], 0.);
 242   return TMath::Max(1.-par[2]-coef,0.);
 243 }
 244
 245 //_____________________________________________________________________________
 246 Int_t
 247 AliMUONClusterSplitterMLEM::Fit(const AliMUONCluster& cluster,
 248                                 Int_t iSimple, Int_t nfit,
 249                                 Int_t *clustFit, TObjArray **clusters,
 250                                 Double_t *parOk,
 251                                 TObjArray& clusterList, TH2 *mlem)
 252 {
 253   /// Steering function and fitting procedure for the fit of pad charge distribution
 254
 255   //  AliDebug(2,Form("iSimple=%d nfit=%d",iSimple,nfit));
 256
 257   Double_t xmin = mlem->GetXaxis()->GetXmin() - mlem->GetXaxis()->GetBinWidth(1);
 258   Double_t xmax = mlem->GetXaxis()->GetXmax() + mlem->GetXaxis()->GetBinWidth(1);
 259   Double_t ymin = mlem->GetYaxis()->GetXmin() - mlem->GetYaxis()->GetBinWidth(1);
 260   Double_t ymax = mlem->GetYaxis()->GetXmax() + mlem->GetYaxis()->GetBinWidth(1);
 261   Double_t xPad = 0, yPad = 99999;
 262
 263   // Number of pads to use and number of virtual pads
 264   Int_t npads = 0, nVirtual = 0, nfit0 = nfit;
 265   //cluster.Print("full");
 266   Int_t mult = cluster.Multiplicity();
 267   for (Int_t i = 0; i < mult; ++i )
 268   {
 269     AliMUONPad* pad = cluster.Pad(i);
 270     if ( !pad->IsReal() ) ++nVirtual;
 271     //if ( pad->Status() !=1 || pad->IsSaturated() ) continue;
 272     if ( pad->Status() != AliMUONClusterFinderMLEM::GetUseForFitFlag() ) continue;
 273     if ( pad->IsReal() )
 274     {
 275       ++npads;
 276       if (yPad > 9999)
 277       {
 278         xPad = pad->X();
 279         yPad = pad->Y();
 280       }
 281       else
 282       {
 283         if (pad->DY() < pad->DX() )
 284         {
 285           yPad = pad->Y();
 286         }
 287         else
 288         {
 289           xPad = pad->X();
 290         }
 291       }
 292     }
 293   }
 294
 295   fNpar = 0;
 296   fQtot = 0;
 297
 298   if (npads < 2) return 0;
 299
 300   // FIXME : AliWarning("Reconnect the following code for hit/track passing ?");
 301
 302   //  Int_t tracks[3] = {-1, -1, -1};
 303
 304   /*
 305    Int_t digit = 0;
 306    AliMUONDigit *mdig = 0;
 307    for (Int_t cath=0; cath<2; cath++) {
 308      for (Int_t i=0; i<fnPads[0]+fnPads[1]; i++) {
 309        if (fPadIJ[0][i] != cath) continue;
 310        if (fPadIJ[1][i] != 1) continue;
 311        if (fXyq[3][i] < 0) continue; // exclude virtual pads
 312        digit = TMath::Nint (fXyq[5][i]);
 313        if (digit >= 0) mdig = fInput->Digit(cath,digit);
 314        else mdig = fInput->Digit(TMath::Even(cath),-digit-1);
 315        //if (!mdig) mdig = fInput->Digit(TMath::Even(cath),digit);
 316        if (!mdig) continue; // protection for cluster display
 317        if (mdig->Hit() >= 0) {
 318          if (tracks[0] < 0) {
 319            tracks[0] = mdig->Hit();
 320            tracks[1] = mdig->Track(0);
 321          } else if (mdig->Track(0) < tracks[1]) {
 322            tracks[0] = mdig->Hit();
 323            tracks[1] = mdig->Track(0);
 324          }
 325        }
 326        if (mdig->Track(1) >= 0 && mdig->Track(1) != tracks[1]) {
 327          if (tracks[2] < 0) tracks[2] = mdig->Track(1);
 328          else tracks[2] = TMath::Min (tracks[2], mdig->Track(1));
 329        }
 330      } // for (Int_t i=0;
 331   } // for (Int_t cath=0;
 332    */
 333
 334   // Get number of pads in X and Y
 335   //const Int_t kStatusToTest(1);
 336   const Int_t kStatusToTest(AliMUONClusterFinderMLEM::GetUseForFitFlag());
 337
 338   Long_t nofPads = cluster.NofPads(kStatusToTest);
 339   Int_t nInX = AliMp::PairFirst(nofPads);
 340   Int_t nInY = AliMp::PairSecond(nofPads);
 341
 342   if (fDebug) {
 343     Int_t npadOK = 0;
 344     for (Int_t j = 0; j < cluster.Multiplicity(); ++j) {
 345       AliMUONPad *pad = cluster.Pad(j);
 346       //if (pad->Status() == 1 && !pad->IsSaturated()) npadOK++;
 347       if (pad->Status() == AliMUONClusterFinderMLEM::GetUseForFitFlag() && !pad->IsSaturated()) npadOK++;
 348     }
 349     cout << " Number of pads to fit: " << npadOK << endl;
 350     cout << " nInX and Y: " << nInX << " " << nInY << endl;
 351   }
 352
 353   Int_t nfitMax = 3;
 354   nfitMax = TMath::Min (nfitMax, (npads + 1) / 3);
 355   if (nfitMax > 1) {
 356     if (((nInX < 3) && (nInY < 3)) || ((nInX == 3) && (nInY < 3)) || ((nInX < 3) && (nInY == 3))) nfitMax = 1; // not enough pads in each direction
 357   }
 358   if (nfit > nfitMax) nfit = nfitMax;
 359
 360   // Take cluster maxima as fitting seeds
 361   TObjArray *pix;
 362   AliMUONPad *pixPtr;
 363   Int_t npxclu;
 364   Double_t cont, cmax = 0, xseed = 0, yseed = 0, errOk[8], qq = 0;
 365   Double_t xyseed[3][2], qseed[3], xyCand[3][2] = {{0},{0}}, sigCand[3][2] = {{0},{0}};
 366
 367   for (Int_t ifit = 1; ifit <= nfit0; ++ifit)
 368   {
 369     cmax = 0;
 370     pix = clusters[clustFit[ifit-1]];
 371     npxclu = pix->GetEntriesFast();
 372     //qq = 0;
 373     for (Int_t clu = 0; clu < npxclu; ++clu)
 374     {
 375       pixPtr = (AliMUONPad*) pix->UncheckedAt(clu);
 376       cont = pixPtr->Charge();
 377       fQtot += cont;
 378       if (cont > cmax)
 379       {
 380         cmax = cont;
 381         xseed = pixPtr->Coord(0);
 382         yseed = pixPtr->Coord(1);
 383       }
 384       qq += cont;
 385       xyCand[0][0] += pixPtr->Coord(0) * cont;
 386       xyCand[0][1] += pixPtr->Coord(1) * cont;
 387       sigCand[0][0] += pixPtr->Coord(0) * pixPtr->Coord(0) * cont;
 388       sigCand[0][1] += pixPtr->Coord(1) * pixPtr->Coord(1) * cont;
 389     }
 390     xyseed[ifit-1][0] = xseed;
 391     xyseed[ifit-1][1] = yseed;
 392     qseed[ifit-1] = cmax;
 393   } // for (Int_t ifit=1;
 394
 395   xyCand[0][0] /= qq; // <x>
 396   xyCand[0][1] /= qq; // <y>
 397   sigCand[0][0] = sigCand[0][0]/qq - xyCand[0][0]*xyCand[0][0]; // <x^2> - <x>^2
 398   sigCand[0][0] = sigCand[0][0] > 0 ? TMath::Sqrt (sigCand[0][0]) : 0;
 399   sigCand[0][1] = sigCand[0][1]/qq - xyCand[0][1]*xyCand[0][1]; // <y^2> - <y>^2
 400   sigCand[0][1] = sigCand[0][1] > 0 ? TMath::Sqrt (sigCand[0][1]) : 0;
 401   if (fDebug) cout << xyCand[0][0] << " " << xyCand[0][1] << " " << sigCand[0][0] << " " << sigCand[0][1] << endl;
 402
 403   Int_t nDof, maxSeed[3];//, nMax = 0;
 404
 405   TMath::Sort(nfit0, qseed, maxSeed, kTRUE); // in decreasing order
 406
 407   Double_t step[3]={0.01,0.002,0.02}, fmin, chi2o = 9999, chi2n;
 408   Double_t *gin = 0, func0, func1, param[8], step0[8];
 409   Double_t param0[2][8]={{0},{0}}, deriv[2][8]={{0},{0}};
 410   Double_t shift[8], stepMax, derMax, parmin[8], parmax[8], func2[2], shift0;
 411   Double_t delta[8], scMax, dder[8], estim, shiftSave = 0;
 412   Int_t min, max, nCall = 0, nLoop, idMax = 0, iestMax = 0, nFail;
 413   Double_t rad, dist[3] = {0};
 414
 415   // Try to fit with one-track hypothesis, then 2-track. If chi2/dof is
 416   // lower, try 3-track (if number of pads is sufficient).
 417   Int_t iflag = 0; // for the first call of fcn1
 418   for (Int_t iseed = 0; iseed < nfit; ++iseed)
 419   {
 420
 421     Int_t memory[8] = {0};
 422     if (iseed)
 423     {
 424       for (Int_t j = 0; j < fNpar; ++j)
 425       {
 426         param[j] = parOk[j];
 427       }
 428       param[fNpar] = 0.6;
 429       parmin[fNpar] = 0;
 430       parmax[fNpar++] = 1;
 431     }
 432
 433     if (nfit == 1)
 434     {
 435       param[fNpar] = xyCand[0][0]; // take COG
 436     }
 437     else
 438     {
 439       param[fNpar] = xyseed[maxSeed[iseed]][0];
 440       //param[fNpar] = fNpar==0 ? -16.1651 : -15.2761;
 441     }
 442     parmin[fNpar] = xmin;
 443     parmax[fNpar++] = xmax;
 444     if (nfit == 1)
 445     {
 446       param[fNpar] = xyCand[0][1]; // take COG
 447     }
 448     else
 449     {
 450       param[fNpar] = xyseed[maxSeed[iseed]][1];
 451       //param[fNpar] = fNpar==1 ? -15.1737 : -15.8487;
 452     }
 453     parmin[fNpar] = ymin;
 454     parmax[fNpar++] = ymax;
 455
 456     for (Int_t j = 0; j < fNpar; ++j)
 457     {
 458       step0[j] = shift[j] = step[j%3];
 459     }
 460
 461     if (iseed)
 462     {
 463       for (Int_t j = 0; j < fNpar; ++j)
 464       {
 465         param0[1][j] = 0;
 466       }
 467     }
 468     if (fDebug) {
 469       for (Int_t j = 0; j < fNpar; ++j) cout << param[j] << " ";
 470       cout << endl;
 471     }
 472
 473     // Try new algorithm
 474     min = nLoop = 1; stepMax = func2[1] = derMax = 999999; nFail = 0;
 475
 476     while (1)
 477     {
 478       max = !min;
 479       Fcn1(cluster,fNpar, gin, func0, param, iflag); nCall++;
 480       iflag = 1;
 481       //cout << " Func: " << func0 << endl;
 482
 483       func2[max] = func0;
 484       for (Int_t j = 0; j < fNpar; ++j)
 485       {
 486         param0[max][j] = param[j];
 487         delta[j] = step0[j];
 488         param[j] += delta[j] / 10;
 489         if (j > 0) param[j-1] -= delta[j-1] / 10;
 490         Fcn1(cluster,fNpar, gin, func1, param, iflag); nCall++;
 491         deriv[max][j] = (func1 - func0) / delta[j] * 10; // first derivative
 492         //cout << j << " " << deriv[max][j] << endl;
 493         dder[j] = param0[0][j] != param0[1][j] ? (deriv[0][j] - deriv[1][j]) /
 494           (param0[0][j] - param0[1][j]) : 0; // second derivative
 495       }
 496       param[fNpar-1] -= delta[fNpar-1] / 10;
 497       if (nCall > 2000) break;
 498
 499       min = func2[0] < func2[1] ? 0 : 1;
 500       nFail = min == max ? 0 : nFail + 1;
 501
 502       stepMax = derMax = estim = 0;
 503       for (Int_t j = 0; j < fNpar; ++j)
 504       {
 505         // Estimated distance to minimum
 506         shift0 = shift[j];
 507         if (nLoop == 1)
 508         {
 509           shift[j] = TMath::Sign (step0[j], -deriv[max][j]); // first step
 510         }
 511         else if (TMath::Abs(deriv[0][j]) < 1.e-3 && TMath::Abs(deriv[1][j]) < 1.e-3)
 512         {
 513           shift[j] = 0;
 514         }
 515         else if (((deriv[min][j]*deriv[!min][j] > 0) && (TMath::Abs(deriv[min][j]) > TMath::Abs(deriv[!min][j])))
 516                  || (TMath::Abs(deriv[0][j]-deriv[1][j]) < 1.e-3) || (TMath::Abs(dder[j]) < 1.e-6))
 517         {
 518           shift[j] = -TMath::Sign (shift[j], (func2[0]-func2[1]) * (param0[0][j]-param0[1][j]));
 519           if (min == max)
 520           {
 521             if (memory[j] > 1)
 522             {
 523               shift[j] *= 2;
 524             }
 525             memory[j]++;
 526           }
 527         }
 528         else
 529         {
 530           shift[j] = dder[j] != 0 ? -deriv[min][j] / dder[j] : 0;
 531           memory[j] = 0;
 532         }
 533
 534         Double_t es = TMath::Abs(shift[j]) / step0[j];
 535         if (es > estim)
 536         {
 537           estim = es;
 538           iestMax = j;
 539         }
 540
 541         // Too big step
 542         if (TMath::Abs(shift[j])/step0[j] > 10) shift[j] = TMath::Sign(10.,shift[j]) * step0[j]; //
 543
 544         // Failed to improve minimum
 545         if (min != max)
 546         {
 547           memory[j] = 0;
 548           param[j] = param0[min][j];
 549           if (TMath::Abs(shift[j]+shift0) > 0.1*step0[j])
 550           {
 551             shift[j] = (shift[j] + shift0) / 2;
 552           }
 553           else
 554           {
 555             shift[j] /= -2;
 556           }
 557         }
 558
 559         // Too big step
 560         if (TMath::Abs(shift[j]*deriv[min][j]) > func2[min])
 561         {
 562           shift[j] = TMath::Sign (func2[min]/deriv[min][j], shift[j]);
 563         }
 564
 565         // Introduce step relaxation factor
 566         if (memory[j] < 3)
 567         {
 568           scMax = 1 + 4 / TMath::Max(nLoop/2.,1.);
 569           if (TMath::Abs(shift0) > 0 && TMath::Abs(shift[j]/shift0) > scMax)
 570           {
 571             shift[j] = TMath::Sign (shift0*scMax, shift[j]);
 572           }
 573         }
 574         param[j] += shift[j];
 575         // Check parameter limits
 576         if (param[j] < parmin[j])
 577         {
 578           shift[j] = parmin[j] - param[j];
 579           param[j] = parmin[j];
 580         }
 581         else if (param[j] > parmax[j])
 582         {
 583           shift[j] = parmax[j] - param[j];
 584           param[j] = parmax[j];
 585         }
 586         //cout << " xxx " << j << " " << shift[j] << " " << param[j] << endl;
 587         stepMax = TMath::Max (stepMax, TMath::Abs(shift[j]/step0[j]));
 588         if (TMath::Abs(deriv[min][j]) > derMax)
 589         {
 590           idMax = j;
 591           derMax = TMath::Abs (deriv[min][j]);
 592         }
 593       } // for (Int_t j=0; j<fNpar;
 594
 595       if (((estim < 1) && (derMax < 2)) || nLoop > 150) break; // minimum was found
 596
 597       nLoop++;
 598
 599       // Check for small step
 600       if (shift[idMax] == 0)
 601       {
 602         shift[idMax] = step0[idMax]/10;
 603         param[idMax] += shift[idMax];
 604         continue;
 605       }
 606
 607       if (!memory[idMax] && derMax > 0.5 && nLoop > 10)
 608       {
 609         if (dder[idMax] != 0 && TMath::Abs(deriv[min][idMax]/dder[idMax]/shift[idMax]) > 10)
 610         {
 611           if (min == max) dder[idMax] = -dder[idMax];
 612           shift[idMax] = -deriv[min][idMax] / dder[idMax] / 10;
 613           param[idMax] += shift[idMax];
 614           stepMax = TMath::Max (stepMax, TMath::Abs(shift[idMax])/step0[idMax]);
 615           if (min == max) shiftSave = shift[idMax];
 616         }
 617         if (nFail > 10)
 618         {
 619           param[idMax] -= shift[idMax];
 620           shift[idMax] = 4 * shiftSave * (gRandom->Rndm(0) - 0.5);
 621           param[idMax] += shift[idMax];
 622         }
 623       }
 624     } // while (1)
 625
 626     fmin = func2[min];
 627
 628     nDof = npads - fNpar + nVirtual;
 629     if (!nDof) nDof++;
 630     chi2n = fmin / nDof;
 631     if (fDebug) cout << " Chi2 " << chi2n << " " << fNpar << endl;
 632
 633     //if (fNpar > 2) cout << param0[min][fNpar-3] << " " << chi2n * (1+TMath::Min(1-param0[min][fNpar-3],0.25)) << endl;
 634     //if (chi2n*1.2+1.e-6 > chi2o )
 635     if (fNpar > 2 && (chi2n > chi2o || ((iseed == nfit-1)
 636                                         && (chi2n * (1+TMath::Min(1-param0[min][fNpar-3],0.25)) > chi2o))))
 637       { fNpar -= 3; break; }
 638
 639     // Save parameters and errors
 640
 641     if (nInX == 1) {
 642       // One pad per direction
 643       //for (Int_t i=0; i<fNpar; ++i) if (i == 0 || i == 2 || i == 5) param0[min][i] = xPad;
 644       for (Int_t i=0; i<fNpar; ++i) if (i == 0 || i == 2 || i == 5)
 645         param0[min][i] = xyCand[0][0];
 646     }
 647     if (nInY == 1) {
 648       // One pad per direction
 649       //for (Int_t i=0; i<fNpar; ++i) if (i == 1 || i == 3 || i == 6) param0[min][i] = yPad;
 650       for (Int_t i=0; i<fNpar; ++i) if (i == 1 || i == 3 || i == 6)
 651         param0[min][i] = xyCand[0][1];
 652     }
 653
 654     /*
 655       if (iseed > 0) {
 656       // Find distance to the nearest neighbour
 657       dist[0] = dist[1] = TMath::Sqrt ((param0[min][0]-param0[min][2])*
 658       (param0[min][0]-param0[min][2])
 659       +(param0[min][1]-param0[min][3])*
 660       (param0[min][1]-param0[min][3]));
 661       if (iseed > 1) {
 662       dist[2] = TMath::Sqrt ((param0[min][0]-param0[min][5])*
 663       (param0[min][0]-param0[min][5])
 664       +(param0[min][1]-param0[min][6])*
 665       (param0[min][1]-param0[min][6]));
 666       rad = TMath::Sqrt ((param0[min][2]-param0[min][5])*
 667       (param0[min][2]-param0[min][5])
 668       +(param0[min][3]-param0[min][6])*
 669       (param0[min][3]-param0[min][6]));
 670       if (dist[2] < dist[0]) dist[0] = dist[2];
 671       if (rad < dist[1]) dist[1] = rad;
 672       if (rad < dist[2]) dist[2] = rad;
 673       }
 674       cout << dist[0] << " " << dist[1] << " " << dist[2] << endl;
 675       if (dist[TMath::LocMin(iseed+1,dist)] < 1.) { fNpar -= 3; break; }
 676       }
 677     */
 678
 679     for (Int_t i = 0; i < fNpar; ++i) {
 680       parOk[i] = param0[min][i];
 681       //errOk[i] = fmin;
 682       errOk[i] = chi2n;
 683       // Bounded params
 684       parOk[i] = TMath::Max (parOk[i], parmin[i]);
 685       parOk[i] = TMath::Min (parOk[i], parmax[i]);
 686     }
 687
 688     chi2o = chi2n;
 689     if (fmin < 0.1) break; // !!!???
 690   } // for (Int_t iseed=0;
 691
 692   if (fDebug) {
 693     for (Int_t i=0; i<fNpar; ++i) {
 694       if (i == 4 || i == 7) {
 695         if ((i == 7) || ((i == 4) && (fNpar < 7))) cout << parOk[i] << endl;
 696         else cout << parOk[i] * (1-parOk[7]) << endl;
 697         continue;
 698       }
 699       cout << parOk[i] << " " << errOk[i] << endl;
 700     }
 701   }
 702   nfit = (fNpar + 1) / 3;
 703   dist[0] = dist[1] = dist[2] = 0;
 704
 705   if (nfit > 1) {
 706     // Find distance to the nearest neighbour
 707     dist[0] = dist[1] = TMath::Sqrt ((parOk[0]-parOk[2])*
 708                                      (parOk[0]-parOk[2])
 709                                      +(parOk[1]-parOk[3])*
 710                                      (parOk[1]-parOk[3]));
 711     if (nfit > 2) {
 712       dist[2] = TMath::Sqrt ((parOk[0]-parOk[5])*
 713                              (parOk[0]-parOk[5])
 714                              +(parOk[1]-parOk[6])*
 715                              (parOk[1]-parOk[6]));
 716       rad = TMath::Sqrt ((parOk[2]-parOk[5])*
 717                          (parOk[2]-parOk[5])
 718                          +(parOk[3]-parOk[6])*
 719                          (parOk[3]-parOk[6]));
 720       if (dist[2] < dist[0]) dist[0] = dist[2];
 721       if (rad < dist[1]) dist[1] = rad;
 722       if (rad < dist[2]) dist[2] = rad;
 723     }
 724   }
 725
 726   Int_t indx;
 727
 728   Double_t coef = 0;
 729   if (iSimple) fnCoupled = 0;
 730   for (Int_t j = 0; j < nfit; ++j) {
 731     indx = 3 * j;
 732     coef = Param2Coef(j, coef, parOk);
 733
 734     //void AliMUONClusterFinderMLEM::AddRawCluster(Double_t x, Double_t y,
 735     //                                             Double_t qTot, Double_t fmin,
 736     //                                             Int_t nfit, Int_t *tracks,
 737     //                                             Double_t /*sigx*/,
 738     //                                             Double_t /*sigy*/,
 739     //                                             Double_t /*dist*/)
 740
 741     if ( coef*fQtot >= 14 )
 742     {
 743       //AZ AliMUONCluster* cluster1 = new AliMUONCluster();
 744       AliMUONCluster* cluster1 = new AliMUONCluster(cluster);
 745
 746       cluster1->SetCharge(coef*fQtot,coef*fQtot);
 747       cluster1->SetPosition(TVector2(parOk[indx],parOk[indx+1]),TVector2(sigCand[0][0],sigCand[0][1]));
 748       cluster1->SetChi2(dist[TMath::LocMin(nfit,dist)]);
 749
 750       // FIXME: we miss some information in this cluster, as compared to
 751       // the original AddRawCluster code.
 752
 753       AliDebug(2,Form("Adding RawCluster detElemId %4d mult %2d charge %5d (xl,yl)=(%9.6g,%9.6g)",
 754                       fDetElemId,cluster1->Multiplicity(),(Int_t)cluster1->Charge(),
 755                       cluster1->Position().X(),cluster1->Position().Y()));
 756
 757       clusterList.Add(cluster1);
 758     }
 759     //      AddRawCluster (parOk[indx], // double x
 760     //                     parOk[indx+1], // double y
 761     //                     coef*qTot, // double charge
 762     //                     errOk[indx], // double fmin
 763     //                     nfit0+10*nfit+100*nMax+10000*fnCoupled, // int nfit
 764     //                     tracks, // int* tracks
 765     //                     sigCand[0][0], // double sigx
 766     //                     sigCand[0][1], // double sigy
 767     //                     dist[TMath::LocMin(nfit,dist)] // double dist
 768     //                     );
 769   }
 770   return nfit;
 771 }
 772
 773
 774 //_____________________________________________________________________________
 775 void
 776 AliMUONClusterSplitterMLEM::Split(const AliMUONCluster& cluster,
 777                                   TH2 *mlem, Double_t *coef,
 778                                   TObjArray& clusterList)
 779 {
 780   /// The main steering function to work with clusters of pixels in anode
 781   /// plane (find clusters, decouple them from each other, merge them (if
 782   /// necessary), pick up coupled pads, call the fitting function)
 783
 784   Int_t nx = mlem->GetNbinsX();
 785   Int_t ny = mlem->GetNbinsY();
 786   Int_t nPix = fPixArray->GetEntriesFast();
 787
 788   Double_t cont;
 789   Int_t nclust = 0, indx, indx1, nxy = ny * nx;
 790   Bool_t *used = new Bool_t[nxy];
 791
 792   for (Int_t j = 0; j < nxy; ++j) used[j] = kFALSE;
 793
 794   TObjArray *clusters[200]={0};
 795   TObjArray *pix;
 796
 797   // Find clusters of histogram bins (easier to work in 2-D space)
 798   for (Int_t i = 1; i <= ny; ++i)
 799   {
 800     for (Int_t j = 1; j <= nx; ++j)
 801     {
 802       indx = (i-1)*nx + j - 1;
 803       if (used[indx]) continue;
 804       cont = mlem->GetCellContent(j,i);
 805       if (cont < 0.5) continue;
 806       pix = new TObjArray(20);
 807       used[indx] = 1;
 808       pix->Add(BinToPix(mlem,j,i));
 809       AddBin(mlem, i, j, 0, used, pix); // recursive call
 810       if (nclust >= 200) AliFatal(" Too many clusters !!!");
 811       clusters[nclust++] = pix;
 812     } // for (Int_t j=1; j<=nx; j++) {
 813   } // for (Int_t i=1; i<=ny;
 814   if (fDebug) cout << nclust << endl;
 815   delete [] used;
 816
 817   // Compute couplings between clusters and clusters to pads
 818   Int_t npad = cluster.Multiplicity();
 819
 820   // Exclude pads with overflows
 821   /*
 822   for (Int_t j = 0; j < npad; ++j)
 823   {
 824     AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
 825     if ( pad->IsSaturated() )
 826     {
 827       pad->SetStatus(-5);
 828     }
 829     else
 830     {
 831       pad->SetStatus(0);
 832     }
 833   }
 834   */
 835
 836   // Compute couplings of clusters to pads (including overflows)
 837   TMatrixD aijclupad(nclust,npad);
 838   aijclupad = 0;
 839   Int_t npxclu;
 840   for (Int_t iclust = 0; iclust < nclust; ++iclust)
 841   {
 842     pix = clusters[iclust];
 843     npxclu = pix->GetEntriesFast();
 844     for (Int_t i = 0; i < npxclu; ++i)
 845     {
 846       indx = fPixArray->IndexOf(pix->UncheckedAt(i));
 847       for (Int_t j = 0; j < npad; ++j)
 848       {
 849         //AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
 850         //if ( pad->Status() < 0 && pad->Status() != -5) continue;
 851         if (coef[j*nPix+indx] < fgkCouplMin) continue;
 852         aijclupad(iclust,j) += coef[j*nPix+indx];
 853       }
 854     }
 855   }
 856
 857   // Compute couplings between clusters (exclude overflows)
 858   TMatrixD aijcluclu(nclust,nclust);
 859   aijcluclu = 0;
 860   for (Int_t iclust = 0; iclust < nclust; ++iclust)
 861   {
 862     for (Int_t j = 0; j < npad; ++j)
 863     {
 864       // Exclude overflows
 865       //if ( cluster.Pad(j)->Status() < 0) continue;
 866       if ( cluster.Pad(j)->IsSaturated()) continue;
 867       if (aijclupad(iclust,j) < fgkCouplMin) continue;
 868       for (Int_t iclust1=iclust+1; iclust1<nclust; iclust1++)
 869       {
 870         if (aijclupad(iclust1,j) < fgkCouplMin) continue;
 871         aijcluclu(iclust,iclust1) +=
 872           TMath::Sqrt (aijclupad(iclust,j)*aijclupad(iclust1,j));
 873       }
 874     }
 875   }
 876   for (Int_t iclust = 0; iclust < nclust; ++iclust)
 877   {
 878     for (Int_t iclust1 = iclust+1; iclust1 < nclust; ++iclust1)
 879     {
 880       aijcluclu(iclust1,iclust) = aijcluclu(iclust,iclust1);
 881     }
 882   }
 883
 884   if (fDebug && nclust > 1) aijcluclu.Print();
 885
 886   // Find groups of coupled clusters
 887   used = new Bool_t[nclust];
 888   for (Int_t j = 0; j < nclust; ++j) used[j] = kFALSE;
 889
 890   Int_t *clustNumb = new Int_t[nclust];
 891   Int_t nCoupled, nForFit, minGroup[3], clustFit[3], nfit = 0;
 892   //Double_t parOk[8];
 893   Double_t parOk[8] = {0}; //AZ
 894
 895   for (Int_t igroup = 0; igroup < nclust; ++igroup)
 896   {
 897     if (used[igroup]) continue;
 898     used[igroup] = kTRUE;
 899     clustNumb[0] = igroup;
 900     nCoupled = 1;
 901     // Find group of coupled clusters
 902     AddCluster(igroup, nclust, aijcluclu, used, clustNumb, nCoupled); // recursive
 903
 904     if (fDebug) {
 905       cout << " nCoupled: " << nCoupled << endl;
 906       for (Int_t i=0; i<nCoupled; ++i) cout << clustNumb[i] << " "; cout << endl;
 907     }
 908
 909     fnCoupled = nCoupled;
 910
 911     while (nCoupled > 0)
 912     {
 913       if (nCoupled < 4)
 914       {
 915         nForFit = nCoupled;
 916         for (Int_t i = 0; i < nCoupled; ++i) clustFit[i] = clustNumb[i];
 917       }
 918       else
 919       {
 920         // Too many coupled clusters to fit - try to decouple them
 921         // Find the lowest coupling of 1, 2, min(3,nLinks/2) pixels with
 922         // all the others in the group
 923         for (Int_t j = 0; j < 3; ++j) minGroup[j] = -1;
 924         Double_t coupl = MinGroupCoupl(nCoupled, clustNumb, aijcluclu, minGroup);
 925
 926         // Flag clusters for fit
 927         nForFit = 0;
 928         while (minGroup[nForFit] >= 0 && nForFit < 3)
 929         {
 930           if (fDebug) cout << clustNumb[minGroup[nForFit]] << " ";
 931           clustFit[nForFit] = clustNumb[minGroup[nForFit]];
 932           clustNumb[minGroup[nForFit]] -= 999;
 933           nForFit++;
 934         }
 935         if (fDebug) cout << " nForFit " << nForFit << " " << coupl << endl;
 936       } // else
 937
 938       // Select pads for fit.
 939       if (SelectPad(cluster,nCoupled, nForFit, clustNumb, clustFit, aijclupad) < 3 && nCoupled > 1)
 940       {
 941         // Deselect pads
 942         for (Int_t j = 0; j < npad; ++j)
 943         {
 944           AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
 945           //if ( pad->Status()==1 ) pad->SetStatus(0);
 946           //if ( pad->Status()==-9) pad->SetStatus(-5);
 947           if ( pad->Status() == AliMUONClusterFinderMLEM::GetUseForFitFlag() ||
 948                pad->Status() == AliMUONClusterFinderMLEM::GetCoupledFlag())
 949             pad->SetStatus(AliMUONClusterFinderMLEM::GetZeroFlag());
 950         }
 951         // Merge the failed cluster candidates (with too few pads to fit) with
 952         // the one with the strongest coupling
 953         Merge(cluster,nForFit, nCoupled, clustNumb, clustFit, clusters, aijcluclu, aijclupad);
 954       }
 955       else
 956       {
 957         // Do the fit
 958         nfit = Fit(cluster,0, nForFit, clustFit, clusters, parOk, clusterList, mlem);
 959         if (nfit == 0) {
 960           //cout << " (nfit == 0) " << fNpar << " " << cluster.Multiplicity() << endl;
 961           fNpar = 0; // should be 0 by itself but just in case ...
 962         }
 963       }
 964
 965       // Subtract the fitted charges from pads with strong coupling and/or
 966       // return pads for further use
 967       UpdatePads(cluster,nfit, parOk);
 968
 969       // Mark used pads
 970       for (Int_t j = 0; j < npad; ++j)
 971       {
 972         AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
 973         //if ( pad->Status()==1 ) pad->SetStatus(-2);
 974         //if ( pad->Status()==-9) pad->SetStatus(-5);
 975         if ( pad->Status() == AliMUONClusterFinderMLEM::GetUseForFitFlag() )
 976           pad->SetStatus(AliMUONClusterFinderMLEM::GetModifiedFlag());
 977       }
 978
 979       // Sort the clusters (move to the right the used ones)
 980       Int_t beg = 0, end = nCoupled - 1;
 981       while (beg < end)
 982       {
 983         if (clustNumb[beg] >= 0) { ++beg; continue; }
 984         for (Int_t j = end; j > beg; --j)
 985         {
 986           if (clustNumb[j] < 0) continue;
 987           end = j - 1;
 988           indx = clustNumb[beg];
 989           clustNumb[beg] = clustNumb[j];
 990           clustNumb[j] = indx;
 991           break;
 992         }
 993         ++beg;
 994       }
 995
 996       nCoupled -= nForFit;
 997       if (nCoupled > 3)
 998       {
 999         // Remove couplings of used clusters
1000         for (Int_t iclust = nCoupled; iclust < nCoupled+nForFit; ++iclust)
1001         {
1002           indx = clustNumb[iclust] + 999;
1003           for (Int_t iclust1 = 0; iclust1 < nCoupled; ++iclust1)
1004           {
1005             indx1 = clustNumb[iclust1];
1006             aijcluclu(indx,indx1) = aijcluclu(indx1,indx) = 0;
1007           }
1008         }
1009
1010         // Update the remaining clusters couplings (subtract couplings from
1011         // the used pads) - overflows excluded
1012         for (Int_t j = 0; j < npad; ++j)
1013         {
1014           AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
1015           //if ( pad->Status() != -2) continue;
1016           if ( pad->Status() != AliMUONClusterFinderMLEM::GetModifiedFlag()) continue;
1017           for (Int_t iclust=0; iclust<nCoupled; ++iclust)
1018           {
1019             indx = clustNumb[iclust];
1020             if (aijclupad(indx,j) < fgkCouplMin) continue;
1021             for (Int_t iclust1 = iclust+1; iclust1 < nCoupled; ++iclust1)
1022             {
1023               indx1 = clustNumb[iclust1];
1024               if (aijclupad(indx1,j) < fgkCouplMin) continue;
1025               // Check this
1026               aijcluclu(indx,indx1) -=
1027                 TMath::Sqrt (aijclupad(indx,j)*aijclupad(indx1,j));
1028               aijcluclu(indx1,indx) = aijcluclu(indx,indx1);
1029             }
1030           }
1031           //pad->SetStatus(-8);
1032           pad->SetStatus(AliMUONClusterFinderMLEM::GetOverFlag());
1033         } // for (Int_t j=0; j<npad;
1034       } // if (nCoupled > 3)
1035     } // while (nCoupled > 0)
1036   } // for (Int_t igroup=0; igroup<nclust;
1037
1038   for (Int_t iclust = 0; iclust < nclust; ++iclust)
1039   {
1040     pix = clusters[iclust];
1041     pix->Clear();
1042     delete pix;
1043   }
1044   delete [] clustNumb;
1045   delete [] used;
1046
1047 }
1048
1049 //_____________________________________________________________________________
1050 void
1051 AliMUONClusterSplitterMLEM::Merge(const AliMUONCluster& cluster,
1052                                      Int_t nForFit, Int_t nCoupled,
1053                                      Int_t *clustNumb, Int_t *clustFit,
1054                                      TObjArray **clusters,
1055                                      TMatrixD& aijcluclu, TMatrixD& aijclupad)
1056 {
1057   /// Merge the group of clusters with the one having the strongest coupling with them
1058
1059   Int_t indx, indx1, npxclu, npxclu1, imax=0;
1060   TObjArray *pix, *pix1;
1061   Double_t couplMax;
1062
1063   for (Int_t icl = 0; icl < nForFit; ++icl)
1064   {
1065     indx = clustFit[icl];
1066     pix = clusters[indx];
1067     npxclu = pix->GetEntriesFast();
1068     couplMax = -1;
1069     for (Int_t icl1 = 0; icl1 < nCoupled; ++icl1)
1070     {
1071       indx1 = clustNumb[icl1];
1072       if (indx1 < 0) continue;
1073       if ( aijcluclu(indx,indx1) > couplMax)
1074       {
1075         couplMax = aijcluclu(indx,indx1);
1076         imax = indx1;
1077       }
1078     } // for (Int_t icl1=0;
1079       // Add to it
1080     pix1 = clusters[imax];
1081     npxclu1 = pix1->GetEntriesFast();
1082     // Add pixels
1083     for (Int_t i = 0; i < npxclu; ++i)
1084     {
1085       pix1->Add(pix->UncheckedAt(i));
1086       pix->RemoveAt(i);
1087     }
1088
1089     //Add cluster-to-cluster couplings
1090     for (Int_t icl1 = 0; icl1 < nCoupled; ++icl1)
1091     {
1092       indx1 = clustNumb[icl1];
1093       if (indx1 < 0 || indx1 == imax) continue;
1094       aijcluclu(indx1,imax) += aijcluclu(indx,indx1);
1095       aijcluclu(imax,indx1) = aijcluclu(indx1,imax);
1096     }
1097     aijcluclu(indx,imax) = aijcluclu(imax,indx) = 0;
1098
1099     //Add cluster-to-pad couplings
1100     Int_t mult = cluster.Multiplicity();
1101     for (Int_t j = 0; j < mult; ++j)
1102     {
1103       AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
1104       //if ( pad->Status() < 0 && pad->Status() != -5 ) continue;// exclude used pads
1105       if ( pad->Status() != AliMUONClusterFinderMLEM::GetZeroFlag()) continue;// exclude used pads
1106         aijclupad(imax,j) += aijclupad(indx,j);
1107         aijclupad(indx,j) = 0;
1108     }
1109   } // for (Int_t icl=0; icl<nForFit;
1110 }
1111
1112
1113 //_____________________________________________________________________________
1114 Double_t
1115 AliMUONClusterSplitterMLEM::MinGroupCoupl(Int_t nCoupled, Int_t *clustNumb,
1116                                           TMatrixD& aijcluclu, Int_t *minGroup)
1117 {
1118   /// Find group of clusters with minimum coupling to all the others
1119
1120   Int_t i123max = TMath::Min(3,nCoupled/2);
1121   Int_t indx, indx1, indx2, indx3, nTot = 0;
1122   Double_t *coupl1 = 0, *coupl2 = 0, *coupl3 = 0;
1123
1124   for (Int_t i123 = 1; i123 <= i123max; ++i123) {
1125
1126     if (i123 == 1) {
1127       coupl1 = new Double_t [nCoupled];
1128       for (Int_t i = 0; i < nCoupled; ++i) coupl1[i] = 0;
1129     }
1130     else if (i123 == 2) {
1131       nTot = nCoupled*nCoupled;
1132       coupl2 = new Double_t [nTot];
1133       for (Int_t i = 0; i < nTot; ++i) coupl2[i] = 9999;
1134     } else {
1135       nTot = nTot*nCoupled;
1136       coupl3 = new Double_t [nTot];
1137       for (Int_t i = 0; i < nTot; ++i) coupl3[i] = 9999;
1138     } // else
1139
1140     for (Int_t i = 0; i < nCoupled; ++i) {
1141       indx1 = clustNumb[i];
1142       for (Int_t j = i+1; j < nCoupled; ++j) {
1143         indx2 = clustNumb[j];
1144         if (i123 == 1) {
1145           coupl1[i] += aijcluclu(indx1,indx2);
1146           coupl1[j] += aijcluclu(indx1,indx2);
1147         }
1148         else if (i123 == 2) {
1149           indx = i*nCoupled + j;
1150           coupl2[indx] = coupl1[i] + coupl1[j];
1151           coupl2[indx] -= 2 * (aijcluclu(indx1,indx2));
1152         } else {
1153           for (Int_t k = j+1; k < nCoupled; ++k) {
1154             indx3 = clustNumb[k];
1155             indx = i*nCoupled*nCoupled + j*nCoupled + k;
1156             coupl3[indx] = coupl2[i*nCoupled+j] + coupl1[k];
1157             coupl3[indx] -= 2 * (aijcluclu(indx1,indx3)+aijcluclu(indx2,indx3));
1158           }
1159         } // else
1160       } // for (Int_t j=i+1;
1161     } // for (Int_t i=0;
1162   } // for (Int_t i123=1;
1163
1164   // Find minimum coupling
1165   Double_t couplMin = 9999;
1166   Int_t locMin = 0;
1167
1168   for (Int_t i123 = 1; i123 <= i123max; ++i123) {
1169     if (i123 == 1) {
1170       locMin = TMath::LocMin(nCoupled, coupl1);
1171       couplMin = coupl1[locMin];
1172       minGroup[0] = locMin;
1173       delete [] coupl1;
1174     }
1175     else if (i123 == 2) {
1176       locMin = TMath::LocMin(nCoupled*nCoupled, coupl2);
1177       if (coupl2[locMin] < couplMin) {
1178         couplMin = coupl2[locMin];
1179         minGroup[0] = locMin/nCoupled;
1180         minGroup[1] = locMin%nCoupled;
1181       }
1182       delete [] coupl2;
1183     } else {
1184       locMin = TMath::LocMin(nTot, coupl3);
1185       if (coupl3[locMin] < couplMin) {
1186         couplMin = coupl3[locMin];
1187         minGroup[0] = locMin/nCoupled/nCoupled;
1188         minGroup[1] = locMin%(nCoupled*nCoupled)/nCoupled;
1189         minGroup[2] = locMin%nCoupled;
1190       }
1191       delete [] coupl3;
1192     } // else
1193   } // for (Int_t i123=1;
1194   return couplMin;
1195 }
1196
1197 //_____________________________________________________________________________
1198 Int_t
1199 AliMUONClusterSplitterMLEM::SelectPad(const AliMUONCluster& cluster,
1200                                           Int_t nCoupled, Int_t nForFit,
1201                                           Int_t *clustNumb, Int_t *clustFit,
1202                                           TMatrixD& aijclupad)
1203 {
1204   /// Select pads for fit. If too many coupled clusters, find pads giving
1205   /// the strongest coupling with the rest of clusters and exclude them from the fit.
1206
1207   Int_t npad = cluster.Multiplicity();
1208   Double_t *padpix = 0;
1209
1210   if (nCoupled > 3)
1211   {
1212     padpix = new Double_t[npad];
1213     for (Int_t i = 0; i < npad; ++i) padpix[i] = 0.;
1214   }
1215
1216   Int_t nOK = 0, indx, indx1;
1217   for (Int_t iclust = 0; iclust < nForFit; ++iclust)
1218   {
1219     indx = clustFit[iclust];
1220     for (Int_t j = 0; j < npad; ++j)
1221     {
1222       if ( aijclupad(indx,j) < fgkCouplMin) continue;
1223       AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
1224       /*
1225       if ( pad->Status() == -5 ) pad->SetStatus(-9); // flag overflow
1226       if ( pad->Status() < 0 ) continue; // exclude overflows and used pads
1227       if ( !pad->Status() )
1228       {
1229         pad->SetStatus(1);
1230         ++nOK; // pad to be used in fit
1231       }
1232       */
1233       if ( pad->Status() != AliMUONClusterFinderMLEM::GetZeroFlag()
1234            || pad->IsSaturated() ) continue; // used pads and overflows
1235       pad->SetStatus(AliMUONClusterFinderMLEM::GetUseForFitFlag());
1236       ++nOK; // pad to be used in fit
1237
1238       if (nCoupled > 3)
1239       {
1240         // Check other clusters
1241         for (Int_t iclust1 = 0; iclust1 < nCoupled; ++iclust1)
1242         {
1243           indx1 = clustNumb[iclust1];
1244           if (indx1 < 0) continue;
1245           if ( aijclupad(indx1,j) < fgkCouplMin ) continue;
1246           padpix[j] += aijclupad(indx1,j);
1247         }
1248       } // if (nCoupled > 3)
1249     } // for (Int_t j=0; j<npad;
1250   } // for (Int_t iclust=0; iclust<nForFit
1251   if (nCoupled < 4) return nOK;
1252
1253   Double_t aaa = 0;
1254   for (Int_t j = 0; j < npad; ++j)
1255   {
1256     if (padpix[j] < fgkCouplMin) continue;
1257     aaa += padpix[j];
1258     //cluster.Pad(j)->SetStatus(-1); // exclude pads with strong coupling to the other clusters
1259     cluster.Pad(j)->SetStatus(AliMUONClusterFinderMLEM::GetCoupledFlag()); // exclude pads with strong coupling to the other clusters
1260     nOK--;
1261   }
1262   delete [] padpix;
1263   return nOK;
1264 }
1265
1266 //_____________________________________________________________________________
1267 void
1268 AliMUONClusterSplitterMLEM::UpdatePads(const AliMUONCluster& cluster,
1269                                           Int_t /*nfit*/, Double_t *par)
1270 {
1271   /// Subtract the fitted charges from pads with strong coupling
1272
1273   Int_t indx, mult = cluster.Multiplicity(), iend = fNpar/3;
1274   Double_t charge, coef=0;
1275
1276   for (Int_t j = 0; j < mult; ++j)
1277   {
1278     AliMUONPad* pad = cluster.Pad(j);
1279     //if ( pad->Status() != -1 ) continue;
1280     if ( pad->Status() != AliMUONClusterFinderMLEM::GetCoupledFlag() ) continue;
1281     if (fNpar != 0)
1282     {
1283       charge = 0;
1284       for (Int_t i = 0; i <= iend; ++i)
1285       {
1286         // sum over hits
1287         indx = 3 * i;
1288         coef = Param2Coef(i, coef, par);
1289         charge += ChargeIntegration(par[indx],par[indx+1],*pad) * coef;
1290       }
1291       charge *= fQtot;
1292       pad->SetCharge(pad->Charge()-charge);
1293     } // if (fNpar != 0)
1294
1295     //if (pad->Charge() > 6 /*fgkZeroSuppression*/) pad->SetStatus(0);
1296     if (pad->Charge() > 6 /*fgkZeroSuppression*/) pad->SetStatus(AliMUONClusterFinderMLEM::GetZeroFlag());
1297     // return pad for further using // FIXME: remove usage of zerosuppression here
1298     else pad->SetStatus(AliMUONClusterFinderMLEM::GetOverFlag()); // do not use anymore
1299
1300   } // for (Int_t j=0;
1301 }
1302
1303