MUON/AliMUONGain.cxx

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   3 *
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  14 **************************************************************************/
  15
  16 // $Id$
  17
  18 #include "AliMUONGain.h"
  19 #include "AliMUONPedestal.h"
  20 #include "AliMUONErrorCounter.h"
  21 #include "AliMUON2DMap.h"
  22 #include "AliMUONVCalibParam.h"
  23 #include "AliMUONVStore.h"
  24 #include "AliMpIntPair.h"
  25
  26 #include <TString.h>
  27 #include <THashList.h>
  28 #include <TTimeStamp.h>
  29 #include <TTree.h>
  30 #include <TFile.h>
  31 #include <TF1.h>
  32 #include <TGraphErrors.h>
  33 #include <TMath.h>
  34 #include <Riostream.h>
  35
  36 #include <sstream>
  37 #include <cstdio>
  38
  39 #define  NFITPARAMS 4
  40
  41 //-----------------------------------------------------------------------------
  42 /// \class AliMUONGain
  43 ///
  44 /// Implementation of calibration computing
  45 ///
  46 /// add
  47 ///
  48 ///
  49 /// \author Alberto Baldisseri, JL Charvet
  50 //-----------------------------------------------------------------------------
  51
  52
  53
  54
  55 // functions
  56
  57 namespace {
  58
  59   //______________________________________________________________________________
  60   Double_t funcLin (const Double_t *x, const Double_t *par)
  61   {
  62     /// Linear function
  63     return par[0] + par[1]*x[0];
  64   }
  65
  66   //______________________________________________________________________________
  67   Double_t funcParabolic (const Double_t *x, const Double_t *par)
  68   {
  69     /// Parabolic function
  70     return par[0]*x[0]*x[0];
  71   }
  72
  73   //______________________________________________________________________________
  74   Double_t funcCalib (const Double_t *x, const Double_t *par)
  75   {
  76     /// Calibration function
  77     Double_t xLim= par[3];
  78
  79     if(x[0] <= xLim) return par[0] + par[1]*x[0];
  80
  81     Double_t yLim = par[0]+ par[1]*xLim;
  82     return yLim + par[1]*(x[0] - xLim) + par[2]*(x[0] - xLim)*(x[0] - xLim);
  83   }
  84
  85 }
  86
  87 /// \cond CLASSIMP
  88 ClassImp(AliMUONGain)
  89 /// \endcond
  90
  91 //______________________________________________________________________________
  92 AliMUONGain::AliMUONGain()
  93 : AliMUONPedestal(),
  94 fInjCharge(0),
  95 fRootDataFileName(),
  96 fnInit(1),
  97 fnEntries(11),
  98 fnbpf1(6),
  99 fPrintLevel(0),
 100 fPlotLevel(0)
 101 {
 102 /// Default constructor
 103
 104 }
 105
 106 //______________________________________________________________________________
 107 AliMUONGain::~AliMUONGain()
 108 {
 109 /// Destructor
 110 }
 111
 112 //______________________________________________________________________________
 113 TString AliMUONGain::WriteDummyHeader(void)
 114 {
 115 ///
 116
 117   ostringstream stream;
 118   stream<<"//DUMMY FILE (to prevent Shuttle failure)"<< endl;
 119   stream<<"//================================================" << endl;
 120   stream<<"//       MUONTRKGAINda: Calibration run  " << endl;
 121   stream<<"//================================================" << endl;
 122   stream<<"//   * Run           : " << fRunNumber << endl;
 123   stream<<"//   * Date          : " << fDate->AsString("l") <<endl;
 124   stream<<"//   * DAC           : " << fInjCharge << endl;
 125   stream<<"//-------------------------------------------------" << endl;
 126
 127   return TString(stream.str().c_str());
 128 }
 129
 130 //______________________________________________________________________________
 131 void AliMUONGain::MakePedStoreForGain(TString shuttleFile)
 132 {
 133 /// Store Pedmean and sigma to pedestal-like ascii file
 134
 135   ofstream fileout;
 136   TString tempstring;
 137   TString flatFile;
 138   TString outputFile;
 139
 140   // Store pedestal map in root file
 141   TTree* tree = 0x0;
 142
 143   // write dummy ascii file -> Shuttle
 144   if(fIndex<fnEntries)
 145     {
 146       FILE *pfilew=0;
 147       pfilew = fopen (shuttleFile,"w");
 148
 149       fprintf(pfilew,"//DUMMY FILE (to prevent Shuttle failure)\n");
 150       fprintf(pfilew,"//================================================\n");
 151       fprintf(pfilew,"//       MUONTRKGAINda: Calibration run  \n");
 152       fprintf(pfilew,"//=================================================\n");
 153       fprintf(pfilew,"//   * Run           : %d \n",fRunNumber);
 154       fprintf(pfilew,"//   * Date          : %s \n",fDate->AsString("l"));
 155       fprintf(pfilew,"//   * DAC           : %d \n",fInjCharge);
 156       fprintf(pfilew,"//-------------------------------------------------\n");
 157       fclose(pfilew);
 158     }
 159
 160
 161
 162   Finalize();
 163   MakeControlHistos();
 164   if(fPrintLevel>0)
 165     {
 166       // compute and store mean DAC values (like pedestals)
 167       flatFile = Form("%s.ped",fPrefixDA.Data());
 168       outputFile=flatFile;
 169       cout << "\n" << fPrefixLDC.Data() << " : Flat file  generated  : " << flatFile.Data() << "\n";
 170       if (!outputFile.IsNull())
 171       {
 172         ofstream out(outputFile.Data());
 173         MakeASCIIoutput(out);
 174         out.close();
 175       }
 176     }
 177
 178   TString mode("UPDATE");
 179
 180   if (fIndex==1) {
 181     mode = "RECREATE";
 182   }
 183   TFile* histoFile = new TFile(fRootDataFileName.Data(), mode.Data(), "MUON Tracking Gains");
 184
 185   // second argument should be the injected charge, taken from config crocus file
 186   // put also info about run number could be usefull
 187   AliMpIntPair* pair   = new AliMpIntPair(fRunNumber,fInjCharge );
 188
 189   if (mode.CompareTo("UPDATE") == 0) {
 190     tree = (TTree*)histoFile->Get("t");
 191     tree->SetBranchAddress("run",&pair);
 192     tree->SetBranchAddress("ped",&fPedestalStore);
 193
 194   } else {
 195     tree = new TTree("t","Pedestal tree");
 196     tree->Branch("run", "AliMpIntPair",&pair);
 197     tree->Branch("ped", "AliMUON2DMap",&fPedestalStore);
 198     tree->SetBranchAddress("run",&pair);
 199     tree->SetBranchAddress("ped",&fPedestalStore);
 200
 201   }
 202
 203   tree->Fill();
 204   tree->Write("t", TObject::kOverwrite); // overwrite the tree
 205   histoFile->Close();
 206
 207   delete pair;
 208 }
 209
 210 //______________________________________________________________________________
 211 TString AliMUONGain::WriteGainHeader(Int_t nInit, Int_t nEntries, Int_t nbpf2, Int_t *numrun, Double_t *injCharge)
 212 {
 213 /// Header of the calibration output file
 214
 215   ostringstream stream;
 216
 217
 218   stream<<"//=======================================================" << endl;
 219   stream<<"//      Calibration file calculated by " << fPrefixDA.Data() <<endl;
 220   stream<<"//=======================================================" << endl;
 221   stream<<"//   * Run           : " << fRunNumber << endl;
 222   stream<<"//   * Date          : " << fDate->AsString("l") <<endl;
 223   stream<<"//   * Statictics    : " << fNEvents << endl;
 224   if(fConfig)
 225   stream<<"//   * # of MANUS    : " << fNManuConfig << " read in the Det. config. " << endl;
 226   stream<<"//   * # of MANUS    : " << fNManu << " read in raw data " << endl;
 227   stream<<"//   * # of MANUS    : " << fNChannel/64 << " written in calibration file " << endl;
 228   stream<<"//   * # of channels : " << fNChannel << endl;
 229   stream<<"//-------------------------------------------------------" << endl;
 230
 231   if(nInit==0)
 232     stream<<"//  "<< nEntries <<" DAC values  fit: "<< fnbpf1 << " pts (1st order) " << nbpf2 << " pts (2nd order)" << endl;
 233   if(nInit==1)
 234     stream<<"//  "<< nEntries <<" DAC values  fit: "<< fnbpf1 << " pts (1st order) " << nbpf2 << " pts (2nd order) DAC=0 excluded" << endl;
 235   stream<<"//   *  nInit = " << nInit << "  *  f1nbp = " << fnbpf1 << "  *  f2nbp = " <<  nbpf2 << endl;
 236
 237   stream<<"//   RUN     DAC   " << endl;
 238   stream<<"//-----------------" << endl;
 239   for (Int_t i = 0; i < nEntries; ++i) {
 240         stream<<Form("//   %d    %5.0f \n",numrun[i],injCharge[i]);
 241   }
 242   stream<<"//=======================================" << endl;
 243   stream<<"// BP MANU CH.   a1      a2     thres. q " << endl;
 244   stream<<"//=======================================" << endl;
 245
 246   return TString(stream.str().c_str());
 247 }
 248
 249 //______________________________________________________________________________
 250 TString AliMUONGain::WriteGainData(Int_t BP, Int_t Manu, Int_t ch, Double_t p1, Double_t p2, Int_t threshold, Int_t q)
 251 {
 252 /// Write calibration parameters per channel
 253
 254   ostringstream stream("");
 255   stream << Form("%4i %5i %2i %7.4f %10.3e %4i %2x\n",BP,Manu,ch,p1,p2,threshold,q);
 256   return TString(stream.str().c_str());
 257
 258 }
 259
 260 //_______________________________________________________________________________
 261 void AliMUONGain::MakeGainStore(TString shuttleFile)
 262 {
 263   Int_t status=0;
 264   /// Store gains in ASCII files
 265   ofstream fileout;
 266   ofstream filcouc;
 267   TString tempstring;
 268   TString filename;
 269   char* detail;
 270
 271   Double_t goodA1Min =  0.5;
 272   Double_t goodA1Max =  2.;
 273 //   Double_t goodA2Min = -0.5E-03;
 274 //   Double_t goodA2Max =  1.E-03;
 275   Double_t goodA2Min = -0.5E-01; // changed 28/10/2009 (JLC) <=> enlarged condition on a2
 276   Double_t goodA2Max =  1.E-01;
 277   // Table for uncalibrated  buspatches and manus
 278   THashList* uncalBuspatchManuTable = new THashList(1000,2);
 279
 280   Int_t numrun[11];
 281
 282   // open file MUONTRKda_gain_data.root
 283   // read again the pedestal for the calibration runs (11 runs)
 284   // need the injection charge from config file (to be done)
 285   // For each channel make a TGraphErrors (mean, sigma) vs injected charge
 286   // Fit with a polynomial fct
 287   // store the result in a flat file.
 288
 289   if(fIndex==0)cout << " Root data file = " << fRootDataFileName.Data() << endl;
 290   TFile*  histoFile = new TFile(fRootDataFileName.Data());
 291
 292   AliMUON2DMap* map[11];
 293   AliMUONVCalibParam* ped[11];
 294   AliMpIntPair* run[11];
 295
 296   //read back from root file
 297   TTree* tree = (TTree*)histoFile->Get("t");
 298   Int_t nEntries = tree->GetEntries();
 299
 300   Int_t nbpf2 = nEntries - (fnInit + fnbpf1) + 1; // nb pts used for 2nd order fit
 301
 302   // read back info
 303   for (Int_t i = 0; i < nEntries; ++i) {
 304     map[i] = 0x0;
 305     run[i] = 0x0;
 306     tree->SetBranchAddress("ped",&map[i]);
 307     tree->SetBranchAddress("run",&run[i]);
 308     tree->GetEvent(i);
 309     //        std::cout << map[i] << " " << run[i] << std::endl;
 310   }
 311   // RunNumber extracted from Root data fil
 312   if(fIndex==0)fRunNumber=(UInt_t)run[nEntries-1]->GetFirst();
 313   //     sscanf(getenv("DATE_RUN_NUMBER"),"%d",&gAliRunNumber);
 314
 315   Double_t pedMean[11];
 316   Double_t pedSigma[11];
 317   for ( Int_t i=0 ; i<11 ; i++) {pedMean[i]=0.;pedSigma[i]=1.;};
 318   Double_t injCharge[11];
 319   Double_t injChargeErr[11];
 320   for ( Int_t i=0 ; i<11 ; i++) {injCharge[i]=0.;injChargeErr[i]=1.;};
 321
 322   //  print out in .log file
 323   detail=Form("\n%s : ------  MUONTRKGAINda for Gain computing (Last Run = %d) ------\n",fPrefixLDC.Data(),fRunNumber); printf("%s",detail);
 324   (*fFilcout)<<"\n\n//=================================================" << endl;
 325   (*fFilcout)<<"//    MUONTRKGAINda: Gain Computing  Run = " << fRunNumber << endl;
 326   (*fFilcout)<<"//    RootDataFile  = "<< fRootDataFileName.Data() << endl;
 327   (*fFilcout)<<"//=================================================" << endl;
 328   (*fFilcout)<<"//* Date          : " << fDate->AsString("l") << "\n" << endl;
 329
 330   (*fFilcout) << " Entries = " << nEntries << " DAC values \n" << endl;
 331   for (Int_t i = 0; i < nEntries; ++i) {
 332     (*fFilcout) << " Run = " << run[i]->GetFirst() << "    DAC = " << run[i]->GetSecond() << endl;
 333     numrun[i] = run[i]->GetFirst();
 334     injCharge[i] = run[i]->GetSecond();
 335     injChargeErr[i] = 0.01*injCharge[i];
 336     if(injChargeErr[i] <= 1.) injChargeErr[i]=1.;
 337   }
 338   detail=Form("%s : .... Fitting .... \n",fPrefixLDC.Data()); printf("%s",detail);
 339
 340
 341   // why 2 files ? (Ch. F.)  => second file contains detailed results
 342     FILE *pfilen = 0;
 343     if(fPrintLevel>1)
 344       {
 345         filename=Form("%s.param",fPrefixDA.Data());
 346         detail=Form("%s : Second fit parameter file        = %s\n",fPrefixLDC.Data(),filename.Data()); printf("%s",detail);
 347         //       cout << " Second fit parameter file        = " << filename.Data() << "\n";
 348         pfilen = fopen (filename.Data(),"w");
 349
 350         fprintf(pfilen,"//===================================================================\n");
 351         fprintf(pfilen,"//  BP MANU CH. par[0]     [1]     [2]     [3]      xlim          P(chi2) p1        P(chi2)2  p2\n");
 352         fprintf(pfilen,"//===================================================================\n");
 353         fprintf(pfilen,"//   * Run           : %d \n",fRunNumber);
 354         fprintf(pfilen,"//===================================================================\n");
 355       }
 356
 357
 358   // file outputs for gain
 359
 360   ofstream pfilew;
 361   pfilew.open(shuttleFile.Data());
 362   // Write Header Data of the .par file
 363   pfilew << WriteGainHeader(fnInit,nEntries,nbpf2,numrun,injCharge);
 364
 365   // print mean and sigma values in file
 366   FILE *pfilep = 0;
 367   if(fPrintLevel>1)
 368     {
 369       filename=Form("%s.peak",fPrefixDA.Data());
 370       detail=Form("%s : File containing Peak mean values = %s\n",fPrefixLDC.Data(),filename.Data()); printf("%s",detail);
 371       //      cout << " File containing Peak mean values = " << filename << "\n";
 372       pfilep = fopen (filename,"w");
 373
 374       fprintf(pfilep,"//==============================================================================================================================\n");
 375       fprintf(pfilep,"//   * Run           : %d \n",fRunNumber);
 376       fprintf(pfilep,"//==============================================================================================================================\n");
 377       fprintf(pfilep,"// BP  MANU  CH.    Ped.     <0>      <1>      <2>      <3>      <4>      <5>      <6>      <7>      <8>      <9>     <10> \n");
 378       fprintf(pfilep,"//==============================================================================================================================\n");
 379       fprintf(pfilep,"//                 DAC= %9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f  fC\n",injCharge[0],injCharge[1],injCharge[2],injCharge[3],injCharge[4],injCharge[5],injCharge[6],injCharge[7],injCharge[8],injCharge[9],injCharge[10]);
 380       fprintf(pfilep,"//                      %9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f\n",injChargeErr[0],injChargeErr[1],injChargeErr[2],injChargeErr[3],injChargeErr[4],injChargeErr[5],injChargeErr[6],injChargeErr[7],injChargeErr[8],injChargeErr[9],injChargeErr[10]);
 381       fprintf(pfilep,"//==============================================================================================================================\n");
 382     }
 383
 384   Double_t chi2    = 0.;
 385   Double_t chi2P2  = 0.;
 386   Double_t prChi2  = 0;
 387   Double_t prChi2P2 =0;
 388   Double_t a0=0.,a1=1.,a2=0.;
 389   Int_t busPatchId ;
 390   Int_t manuId     ;
 391   Int_t channelId ;
 392   Int_t threshold = 0;
 393   Int_t q = 0;
 394   Int_t p1 =0;
 395   Int_t p2 =0;
 396   Double_t gain=10.; // max value (= bad value)
 397   Double_t capa=0.2; // internal capacitor (pF)
 398
 399   //  plot out
 400
 401   TTree* tg = 0x0;
 402   if(fPlotLevel>0)
 403     {
 404       fHistoFileName=Form("%s.root",fPrefixDA.Data());
 405       new TFile(fHistoFileName.Data(),"RECREATE","MUON Tracking gains");
 406       tg = new TTree("tg","TTree avec class Manu_DiMu");
 407
 408       tg->Branch("bp",&busPatchId, "busPatchId/I");
 409       tg->Branch("manu",&manuId, "manuId/I");
 410       tg->Branch("channel",&channelId, "channelId/I");
 411
 412       tg->Branch("a0",&a0, "a0/D");
 413       tg->Branch("a1",&a1, "a1/D");
 414       tg->Branch("a2",&a2, "a2/D");
 415       tg->Branch("Pchi2",&prChi2, "prChi2/D");
 416       tg->Branch("Pchi2_2",&prChi2P2, "prChi2P2/D");
 417       tg->Branch("Threshold",&threshold, "threshold/I");
 418       tg->Branch("q",&q, "q/I");
 419       tg->Branch("p1",&p1, "p1/I");
 420       tg->Branch("p2",&p2, "p2/I");
 421       tg->Branch("gain",&gain, "gain/D");
 422     }
 423
 424   char graphName[256];
 425
 426   // iterates over the first pedestal run
 427   TIter next(map[0]->CreateIterator());
 428   AliMUONVCalibParam* p;
 429
 430   Int_t    nmanu         = 0;
 431   Int_t    nGoodChannel   = 0;
 432   Int_t    nBadChannel   = 0;
 433   Int_t    noFitChannel   = 0;
 434   Int_t    nplot=0;
 435   Double_t sumProbChi2   = 0.;
 436   Double_t sumA1         = 0.;
 437   Double_t sumProbChi2P2 = 0.;
 438   Double_t sumA2         = 0.;
 439
 440   Double_t x[11], xErr[11], y[11], yErr[11];
 441   Double_t xp[11], xpErr[11], yp[11], ypErr[11];
 442
 443   Int_t uncalcountertotal=0 ;
 444   Int_t unparabolicfit=0;
 445
 446   while ( ( p = dynamic_cast<AliMUONVCalibParam*>(next() ) ) )
 447     {
 448       ped[0]  = p;
 449       unparabolicfit=0;
 450
 451       busPatchId = p->ID0();
 452       manuId     = p->ID1();
 453
 454       // read back pedestal from the other runs for the given (bupatch, manu)
 455       for (Int_t i = 1; i < nEntries; ++i) {
 456         ped[i] = static_cast<AliMUONVCalibParam*>(map[i]->FindObject(busPatchId, manuId));
 457       }
 458
 459       // compute for each channel the gain parameters
 460       for ( channelId = 0; channelId < ped[0]->Size() ; ++channelId )
 461         {
 462
 463           Int_t n = 0;
 464           for (Int_t i = 0; i < nEntries; ++i) {
 465
 466             if (!ped[i]) continue; //shouldn't happen.
 467             pedMean[i]      = ped[i]->ValueAsDouble(channelId, 0);
 468             pedSigma[i]     = ped[i]->ValueAsDouble(channelId, 1);
 469
 470             if (pedMean[i] < 0) continue; // not connected
 471
 472             if (pedSigma[i] <= 0) pedSigma[i] = 1.; // should not happen.
 473             n++;
 474           }
 475
 476           // print_peak_mean_values
 477           if(fPrintLevel>1)
 478             {
 479
 480               fprintf(pfilep,"%4i%5i%5i%10.3f",busPatchId,manuId,channelId,0.);
 481               fprintf(pfilep,"%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f \n",pedMean[0],pedMean[1],pedMean[2],pedMean[3],pedMean[4],pedMean[5],pedMean[6],pedMean[7],pedMean[8],pedMean[9],pedMean[10]);
 482               fprintf(pfilep,"                   sig= %9.3f%9.3f%9.3f%9.3f%9.3f%9.3f%9.3f%9.3f%9.3f%9.3f%9.3f \n",pedSigma[0],pedSigma[1],pedSigma[2],pedSigma[3],pedSigma[4],pedSigma[5],pedSigma[6],pedSigma[7],pedSigma[8],pedSigma[9],pedSigma[10]);
 483             }
 484
 485           // makegain
 486           // Fit Method:  Linear fit over gAlinbpf1 points + parabolic fit  over nbpf2  points)
 487           // nInit=1 : 1st pt DAC=0 excluded
 488
 489           // 1. - linear fit over gAlinbpf1 points
 490
 491           Double_t par[4] = {0.,0.5,0.,ADCMax()};
 492           Int_t nbs   = nEntries - fnInit;
 493           if(nbs < fnbpf1)fnbpf1=nbs;
 494
 495           Int_t fitproceed=1;
 496           Int_t nbpf2Dynamic=nbpf2;
 497           Int_t adcLimit=4090; // when RMS < 0.5 (in other cases mean values forced to 4095, see DA_PED)
 498           for (Int_t j = 0; j < nbs; ++j)
 499             {
 500               Int_t k = j + fnInit;
 501               x[j]    = pedMean[k];
 502               if(x[j]<=0.){fitproceed=0; break;}
 503               //              if(x[j]>= ADCMax())
 504               if(x[j]>= adcLimit)
 505                 {
 506                   if(j < nbs-1){fitproceed=0; break;}
 507                   else { nbpf2Dynamic=nbpf2-1; break;}
 508                 }
 509               xErr[j] = pedSigma[k];
 510               y[j]    = injCharge[k];
 511               yErr[j] = injChargeErr[k];
 512
 513             }
 514
 515           TGraphErrors *graphErr;
 516           if(!fitproceed) { p1=0; p2=0; noFitChannel++;}
 517
 518           if(fitproceed)
 519             {
 520
 521               TF1 *f1 = new TF1("f1",funcLin,0.,ADCMax(),2);
 522               graphErr = new TGraphErrors(fnbpf1, x, y, xErr, yErr);
 523
 524               f1->SetParameters(0,0);
 525
 526               graphErr->Fit("f1","RQ");
 527
 528               chi2 = f1->GetChisquare();
 529               f1->GetParameters(par);
 530
 531               delete graphErr;
 532               graphErr=0;
 533               delete f1;
 534
 535               prChi2 = TMath::Prob(chi2, fnbpf1 - 2);
 536
 537               Double_t xLim = pedMean[fnInit + fnbpf1 - 1];
 538               Double_t yLim = par[0]+par[1] * xLim;
 539
 540               a0 = par[0];
 541               a1 = par[1];
 542
 543               // 2. - Translation : new origin (xLim, yLim) + parabolic fit over nbf2 points
 544               //checking:         if(busPatchId ==1841 && manuId==4)nbpf2Dynamic=2;
 545               if(nbpf2Dynamic > 2)
 546                 {
 547                   for (Int_t j = 0; j < nbpf2Dynamic; j++)
 548                     {
 549                       Int_t k  = j + (fnInit + fnbpf1) - 1;
 550                       xp[j]    = pedMean[k] - xLim;
 551                       xpErr[j] = pedSigma[k];
 552
 553                       yp[j]    = injCharge[k] - yLim - par[1]*xp[j];
 554                       ypErr[j] = injChargeErr[k];
 555                     }
 556
 557                   TF1 *f2 = new TF1("f2",funcParabolic,0.,ADCMax(),1);
 558                   graphErr = new TGraphErrors(nbpf2Dynamic, xp, yp, xpErr, ypErr);
 559
 560                   graphErr->Fit(f2,"RQ");
 561                   chi2P2 = f2->GetChisquare();
 562                   f2->GetParameters(par);
 563
 564                   delete graphErr;
 565                   graphErr=0;
 566                   delete f2;
 567
 568                   prChi2P2 = TMath::Prob(chi2P2, nbpf2Dynamic-1);
 569                   a2 = par[0];
 570                 }
 571               else
 572                 {
 573                   unparabolicfit++;
 574                   (*fFilcout) << " Warning : BP = " << busPatchId << " Manu = " << manuId <<  " Channel = " << channelId <<": parabolic fit not possible (nbpf2=" <<  nbpf2Dynamic  << ") => a2=0 and linear fit OK" << std::endl;
 575                   if(unparabolicfit==1) std::cout << " Warning : BP = " << busPatchId << " Manu = " << manuId <<  ": no parabolic fit for some channels (nbpf2=" <<  nbpf2Dynamic  << "), linear fit is OK (see .log for details)" << std::endl;
 576                   a2=0. ; prChi2P2=0. ;
 577                 }
 578
 579               par[0] = a0;
 580               par[1] = a1;
 581               par[2] = a2;
 582               par[3] = xLim;
 583
 584               if(prChi2>0.999999)prChi2=0.999999 ; if(prChi2P2>0.999999)prChi2P2=0.9999999; // avoiding Pr(Chi2)=1 value
 585               p1 = TMath::Nint(floor(prChi2*15))+1;    // round down value : floor(2.8)=2.
 586               p2 = TMath::Nint(floor(prChi2P2*15))+1;
 587               q  = p1*16 + p2;  // fit quality
 588
 589               Double_t x0 = -par[0]/par[1]; // value of x corresponding to à 0 fC
 590               threshold = TMath::Nint(ceil(par[3]-x0)); // linear if x < threshold
 591
 592               if(fPrintLevel>1)
 593                 {
 594                   fprintf(pfilen,"%4i %4i %2i",busPatchId,manuId,channelId);
 595                   fprintf(pfilen," %6.2f %6.4f %10.3e %4.2f %4i          %8.6f %8.6f   %x          %8.6f  %8.6f   %x\n",
 596                           par[0], par[1], par[2], par[3], threshold, prChi2, floor(prChi2*15), p1,  prChi2P2, floor(prChi2P2*15),p2);
 597                 }
 598
 599
 600               // tests
 601               if(par[1]< goodA1Min ||  par[1]> goodA1Max) p1=0;
 602               if(par[2]< goodA2Min ||  par[2]> goodA2Max) p2=0;
 603
 604             } // fitproceed
 605
 606           if(fitproceed && p1>0 && p2>0)
 607             {
 608               nGoodChannel++;
 609               sumProbChi2   += prChi2;
 610               sumA1         += par[1];
 611               sumProbChi2P2   += prChi2P2;
 612               sumA2         += par[2];
 613             }
 614           else // bad calibration
 615             {
 616               nBadChannel++;
 617               q=0;
 618               par[1]=0.5; a1=0.5; p1=0;
 619               par[2]=0.;  a2=0.;  p2=0;
 620               threshold=ADCMax();
 621
 622               // bad calibration counter
 623               char bpmanuname[256];
 624               AliMUONErrorCounter* uncalcounter;
 625
 626               snprintf(bpmanuname,256,"bp%dmanu%d",busPatchId,manuId);
 627               if (!(uncalcounter = (AliMUONErrorCounter*)uncalBuspatchManuTable->FindObject(bpmanuname)))
 628                 {
 629                   // New buspatch_manu name
 630                   uncalcounter= new AliMUONErrorCounter (busPatchId,manuId);
 631                   uncalcounter->SetName(bpmanuname);
 632                   uncalBuspatchManuTable->Add(uncalcounter);
 633                 }
 634               else
 635                 {
 636                   // Existing buspatch_manu name
 637                   uncalcounter->Increment();
 638                 }
 639               //                            uncalcounter->Print_uncal()
 640               uncalcountertotal ++;
 641             }
 642           gain=1./(par[1]*capa); // mv/fC
 643
 644           if(fPlotLevel>0)
 645             {if(fPlotLevel>1)
 646                 {
 647                   //                  if(q==0  and  nplot < 100)
 648                   //      if(p1>1 && p2==0  and  nplot < 100)
 649                   //                        if(p1>10 && p2>10  and  nplot < 100)
 650                   //    if(p1>=1 and p1<=2  and  nplot < 100)
 651 //                if((p1==1 || p2==1) and  nplot < 100)
 652                             if(nbpf2Dynamic<nbpf2  and  nplot < 100)
 653                     {
 654                       nplot++;
 655                       //              cout << " nplot = " << nplot << endl;
 656                       TF1 *f2Calib = new TF1("f2Calib",funcCalib,0.,ADCMax(),NFITPARAMS);
 657
 658                       graphErr = new TGraphErrors(nEntries,pedMean,injCharge,pedSigma,injChargeErr);
 659
 660                       snprintf(graphName,256,"BusPatch_%d_Manu_%d_Ch_%d",busPatchId, manuId,channelId);
 661
 662                       graphErr->SetTitle(graphName);
 663                       graphErr->SetMarkerColor(3);
 664                       graphErr->SetMarkerStyle(12);
 665                       graphErr->Write(graphName);
 666
 667                       snprintf(graphName,256,"f2_BusPatch_%d_Manu_%d_Ch_%d",busPatchId, manuId,channelId);
 668                       f2Calib->SetTitle(graphName);
 669                       f2Calib->SetLineColor(4);
 670                       f2Calib->SetParameters(par);
 671                       f2Calib->Write(graphName);
 672
 673                       delete graphErr;
 674                       graphErr=0;
 675                       delete f2Calib;
 676                     }
 677                 }
 678               tg->Fill();
 679             }
 680           pfilew << WriteGainData(busPatchId,manuId,channelId,par[1],par[2],threshold,q);
 681         }
 682       nmanu++;
 683       Int_t step=500;
 684       if(nmanu % step == 0)printf("%s : Nb manu = %d\n",fPrefixLDC.Data(),nmanu);
 685     }
 686
 687   //      print in logfile
 688   if (uncalBuspatchManuTable->GetSize())
 689     {
 690       uncalBuspatchManuTable->Sort();  // use compare
 691       TIterator* iter = uncalBuspatchManuTable->MakeIterator();
 692       AliMUONErrorCounter* uncalcounter;
 693       (*fFilcout) << "\n List of problematic BusPatch and Manu " << endl;
 694       (*fFilcout) << " ========================================" << endl;
 695       (*fFilcout) << "        BP       Manu        Nb Channel  " << endl ;
 696       (*fFilcout) << " ========================================" << endl;
 697       while((uncalcounter = (AliMUONErrorCounter*) iter->Next()))
 698         {
 699           (*fFilcout) << "\t" << uncalcounter->BusPatch() << "\t " << uncalcounter->ManuId() << "\t\t"   << uncalcounter->Events() << endl;
 700         }
 701       (*fFilcout) << " ========================================" << endl;
 702
 703       (*fFilcout) << " Number of bad calibrated Manu    = " << uncalBuspatchManuTable->GetSize() << endl ;
 704       (*fFilcout) << " Number of bad calibrated channel = " << uncalcountertotal << endl;
 705
 706     }
 707   if(nmanu && nGoodChannel)
 708     {
 709       Double_t ratio_limit=0.25;
 710       Double_t ratio=float (nBadChannel)/float (nmanu*64);
 711
 712       detail=Form("\n%s : Nb of channels in raw data = %d (%d Manu)",fPrefixLDC.Data(),nmanu*64,nmanu);
 713       (*fFilcout) << detail ; printf("%s",detail);
 714       detail=Form("\n%s : Nb of calibrated channel   = %d  (%4.2f <a1< %4.2f and %4.2f <a2< %4.2f)",fPrefixLDC.Data(),nGoodChannel,goodA1Min,goodA1Max, goodA2Min,goodA2Max);
 715       (*fFilcout) << detail ; printf("%s",detail);
 716       detail=Form("\n%s : Nb of uncalibrated channel = %d  [%6.4f] (%d unfitted channels) ",fPrefixLDC.Data(),nBadChannel,ratio,noFitChannel);
 717       (*fFilcout) << detail ; printf("%s",detail);
 718
 719       if(ratio > ratio_limit) { status=-1;
 720         detail=Form("\n%s : !!!!! WARNING : Nb of uncalibrated channels very large : %6.4f > %6.4f (status= %d) ",fPrefixLDC.Data(),ratio,ratio_limit,status);
 721         (*fFilcout) << detail ; printf("%s",detail);
 722       }
 723
 724       Double_t meanA1         = sumA1/(nGoodChannel);
 725       Double_t meanProbChi2   = sumProbChi2/(nGoodChannel);
 726       Double_t meanA2         = sumA2/(nGoodChannel);
 727       Double_t meanProbChi2P2 = sumProbChi2P2/(nGoodChannel);
 728       Double_t capaManu = 0.2; // pF
 729       (*fFilcout) << "\n linear fit   : <a1> = " << meanA1 << "     Prob(chi2)>  = " <<  meanProbChi2 <<  "    <gain>  = " <<  1./(meanA1*capaManu)
 730                   << " mV/fC (capa= " << capaManu << " pF)" << endl;
 731       (*fFilcout)   <<" parabolic fit: <a2> = " << meanA2  << "    Prob(chi2)>  = " <<  meanProbChi2P2 << "\n" <<  endl;
 732
 733       detail=Form("\n%s : <gain>  = %7.5f  mV/fC (capa= %3.1f pF)  Prob(chi2) = %5.3f\n" ,fPrefixLDC.Data(),1./(meanA1*capaManu),capaManu,meanProbChi2);
 734       printf("%s",detail);
 735     }
 736   else
 737     { status=-1;
 738       detail=Form("\n%s : !!!!! ERROR :  Nb of Manu = %d or Nb calibrated channel = %d !!!!! (status= %d)\n",fPrefixLDC.Data(),nmanu,nGoodChannel,status);
 739       (*fFilcout) << detail ; printf("%s",detail);
 740     }
 741   pfilew.close();
 742
 743   if(fPlotLevel>0){tg->Write();histoFile->Close();}
 744   if(fPrintLevel>1){fclose(pfilep); fclose(pfilen);}
 745   SetStatusDA(status);
 746 }