MUON/AliMUONGain.cxx

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   3 *
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  14 **************************************************************************/
  15
  16 // $Id$
  17
  18 #include "AliMUONGain.h"
  19 #include "AliMUONPedestal.h"
  20 #include "AliMUONErrorCounter.h"
  21 #include "AliMUON2DMap.h"
  22 #include "AliMUONVCalibParam.h"
  23 #include "AliMUONVStore.h"
  24 #include "AliMpIntPair.h"
  25
  26 #include <TString.h>
  27 #include <THashList.h>
  28 #include <TTimeStamp.h>
  29 #include <TTree.h>
  30 #include <TFile.h>
  31 #include <TF1.h>
  32 #include <TGraphErrors.h>
  33 #include <TMath.h>
  34 #include <Riostream.h>
  35
  36 #include <sstream>
  37 #include <cstdio>
  38
  39 #define  NFITPARAMS 4
  40
  41 //-----------------------------------------------------------------------------
  42 /// \class AliMUONGain
  43 ///
  44 /// Implementation of calibration computing
  45 ///
  46 /// add
  47 ///
  48 ///
  49 /// \author Alberto Baldisseri, JL Charvet
  50 //-----------------------------------------------------------------------------
  51
  52
  53
  54
  55 // functions
  56
  57 namespace {
  58
  59   //______________________________________________________________________________
  60   Double_t funcLin (const Double_t *x, const Double_t *par)
  61   {
  62     /// Linear function
  63     return par[0] + par[1]*x[0];
  64   }
  65
  66   //______________________________________________________________________________
  67   Double_t funcParabolic (const Double_t *x, const Double_t *par)
  68   {
  69     /// Parabolic function
  70     return par[0]*x[0]*x[0];
  71   }
  72
  73   //______________________________________________________________________________
  74   Double_t funcCalib (const Double_t *x, const Double_t *par)
  75   {
  76     /// Calibration function
  77     Double_t xLim= par[3];
  78
  79     if(x[0] <= xLim) return par[0] + par[1]*x[0];
  80
  81     Double_t yLim = par[0]+ par[1]*xLim;
  82     return yLim + par[1]*(x[0] - xLim) + par[2]*(x[0] - xLim)*(x[0] - xLim);
  83   }
  84
  85 }
  86
  87 using std::endl;
  88 using std::cout;
  89 using std::istringstream;
  90 using std::ostringstream;
  91 /// \cond CLASSIMP
  92 ClassImp(AliMUONGain)
  93 /// \endcond
  94
  95 //______________________________________________________________________________
  96 AliMUONGain::AliMUONGain()
  97 : AliMUONPedestal(),
  98 fInjCharge(0),
  99 fRootDataFileName(),
 100 fnInit(1),
 101 fnEntries(11),
 102 fnbpf1(6),
 103 fPrintLevel(0),
 104 fPlotLevel(0)
 105 {
 106 /// Default constructor
 107
 108 }
 109
 110 //______________________________________________________________________________
 111 AliMUONGain::~AliMUONGain()
 112 {
 113 /// Destructor
 114 }
 115
 116 //______________________________________________________________________________
 117 TString AliMUONGain::WriteDummyHeader(void)
 118 {
 119 ///
 120
 121   ostringstream stream;
 122   stream<<"//DUMMY FILE (to prevent Shuttle failure)"<< endl;
 123   stream<<"//================================================" << endl;
 124   stream<<"//       MUONTRKGAINda: Calibration run  " << endl;
 125   stream<<"//================================================" << endl;
 126   stream<<"//   * Run           : " << fRunNumber << endl;
 127   stream<<"//   * Date          : " << fDate->AsString("l") <<endl;
 128   stream<<"//   * DAC           : " << fInjCharge << endl;
 129   stream<<"//-------------------------------------------------" << endl;
 130
 131   return TString(stream.str().c_str());
 132 }
 133
 134 //______________________________________________________________________________
 135 void AliMUONGain::MakePedStoreForGain(TString shuttleFile)
 136 {
 137 /// Store Pedmean and sigma to pedestal-like ascii file
 138
 139   ofstream fileout;
 140   TString tempstring;
 141   TString flatFile;
 142   TString outputFile;
 143
 144   // Store pedestal map in root file
 145   TTree* tree = 0x0;
 146
 147   // write dummy ascii file -> Shuttle
 148   if(fIndex<fnEntries)
 149     {
 150       FILE *pfilew=0;
 151       pfilew = fopen (shuttleFile,"w");
 152
 153       fprintf(pfilew,"//DUMMY FILE (to prevent Shuttle failure)\n");
 154       fprintf(pfilew,"//================================================\n");
 155       fprintf(pfilew,"//       MUONTRKGAINda: Calibration run  \n");
 156       fprintf(pfilew,"//=================================================\n");
 157       fprintf(pfilew,"//   * Run           : %d \n",fRunNumber);
 158       fprintf(pfilew,"//   * Date          : %s \n",fDate->AsString("l"));
 159       fprintf(pfilew,"//   * DAC           : %d \n",fInjCharge);
 160       fprintf(pfilew,"//-------------------------------------------------\n");
 161       fclose(pfilew);
 162     }
 163
 164
 165
 166   Finalize();
 167   MakeControlHistos();
 168   if(fPrintLevel>0)
 169     {
 170       // compute and store mean DAC values (like pedestals)
 171       flatFile = Form("%s.ped",fPrefixDA.Data());
 172       outputFile=flatFile;
 173       cout << "\n" << fPrefixLDC.Data() << " : Flat file  generated  : " << flatFile.Data() << "\n";
 174       if (!outputFile.IsNull())
 175       {
 176         ofstream out(outputFile.Data());
 177         MakeASCIIoutput(out);
 178         out.close();
 179       }
 180     }
 181
 182   TString mode("UPDATE");
 183
 184   if (fIndex==1) {
 185     mode = "RECREATE";
 186   }
 187   TFile* histoFile = new TFile(fRootDataFileName.Data(), mode.Data(), "MUON Tracking Gains");
 188
 189   // second argument should be the injected charge, taken from config crocus file
 190   // put also info about run number could be usefull
 191   AliMpIntPair* pair   = new AliMpIntPair(fRunNumber,fInjCharge );
 192
 193   if (mode.CompareTo("UPDATE") == 0) {
 194     tree = (TTree*)histoFile->Get("t");
 195     tree->SetBranchAddress("run",&pair);
 196     tree->SetBranchAddress("ped",&fPedestalStore);
 197
 198   } else {
 199     tree = new TTree("t","Pedestal tree");
 200     tree->Branch("run", "AliMpIntPair",&pair);
 201     tree->Branch("ped", "AliMUON2DMap",&fPedestalStore);
 202     tree->SetBranchAddress("run",&pair);
 203     tree->SetBranchAddress("ped",&fPedestalStore);
 204
 205   }
 206
 207   tree->Fill();
 208   tree->Write("t", TObject::kOverwrite); // overwrite the tree
 209   histoFile->Close();
 210
 211   delete pair;
 212 }
 213
 214 //______________________________________________________________________________
 215 TString AliMUONGain::WriteGainHeader(Int_t nInit, Int_t nEntries, Int_t nbpf2, Int_t *numrun, Double_t *injCharge)
 216 {
 217 /// Header of the calibration output file
 218
 219   ostringstream stream;
 220
 221
 222   stream<<"//=======================================================" << endl;
 223   stream<<"//      Calibration file calculated by " << fPrefixDA.Data() <<endl;
 224   stream<<"//=======================================================" << endl;
 225   stream<<"//   * Run           : " << fRunNumber << endl;
 226   stream<<"//   * Date          : " << fDate->AsString("l") <<endl;
 227   stream<<"//   * Statictics    : " << fNEvents << endl;
 228   if(fConfig)
 229   stream<<"//   * # of MANUS    : " << fNManuConfig << " read in the Det. config. " << endl;
 230   stream<<"//   * # of MANUS    : " << fNManu << " read in raw data " << endl;
 231   stream<<"//   * # of MANUS    : " << fNChannel/64 << " written in calibration file " << endl;
 232   stream<<"//   * # of channels : " << fNChannel << endl;
 233   stream<<"//-------------------------------------------------------" << endl;
 234
 235   if(nInit==0)
 236     stream<<"//  "<< nEntries <<" DAC values  fit: "<< fnbpf1 << " pts (1st order) " << nbpf2 << " pts (2nd order)" << endl;
 237   if(nInit==1)
 238     stream<<"//  "<< nEntries <<" DAC values  fit: "<< fnbpf1 << " pts (1st order) " << nbpf2 << " pts (2nd order) DAC=0 excluded" << endl;
 239   stream<<"//   *  nInit = " << nInit << "  *  f1nbp = " << fnbpf1 << "  *  f2nbp = " <<  nbpf2 << endl;
 240
 241   stream<<"//   RUN     DAC   " << endl;
 242   stream<<"//-----------------" << endl;
 243   for (Int_t i = 0; i < nEntries; ++i) {
 244         stream<<Form("//   %d    %5.0f \n",numrun[i],injCharge[i]);
 245   }
 246   stream<<"//=======================================" << endl;
 247   stream<<"// BP MANU CH.   a1      a2     thres. q " << endl;
 248   stream<<"//=======================================" << endl;
 249
 250   return TString(stream.str().c_str());
 251 }
 252
 253 //______________________________________________________________________________
 254 TString AliMUONGain::WriteGainData(Int_t BP, Int_t Manu, Int_t ch, Double_t p1, Double_t p2, Int_t threshold, Int_t q)
 255 {
 256 /// Write calibration parameters per channel
 257
 258   ostringstream stream("");
 259   stream << Form("%4i %5i %2i %7.4f %10.3e %4i %2x\n",BP,Manu,ch,p1,p2,threshold,q);
 260   return TString(stream.str().c_str());
 261
 262 }
 263
 264 //_______________________________________________________________________________
 265 void AliMUONGain::MakeGainStore(TString shuttleFile)
 266 {
 267   Int_t status=0;
 268   /// Store gains in ASCII files
 269   ofstream fileout;
 270   ofstream filcouc;
 271   TString tempstring;
 272   TString filename;
 273   char* detail;
 274
 275   Double_t goodA1Min =  0.5;
 276   Double_t goodA1Max =  2.;
 277 //   Double_t goodA2Min = -0.5E-03;
 278 //   Double_t goodA2Max =  1.E-03;
 279   Double_t goodA2Min = -0.5E-01; // changed 28/10/2009 (JLC) <=> enlarged condition on a2
 280   Double_t goodA2Max =  1.E-01;
 281   // Table for uncalibrated  buspatches and manus
 282   THashList* uncalBuspatchManuTable = new THashList(1000,2);
 283
 284   Int_t numrun[11];
 285
 286   // open file MUONTRKda_gain_data.root
 287   // read again the pedestal for the calibration runs (11 runs)
 288   // need the injection charge from config file (to be done)
 289   // For each channel make a TGraphErrors (mean, sigma) vs injected charge
 290   // Fit with a polynomial fct
 291   // store the result in a flat file.
 292
 293   if(fIndex==0)cout << " Root data file = " << fRootDataFileName.Data() << endl;
 294   TFile*  histoFile = new TFile(fRootDataFileName.Data());
 295
 296   AliMUON2DMap* map[11];
 297   AliMUONVCalibParam* ped[11];
 298   AliMpIntPair* run[11];
 299
 300   //read back from root file
 301   TTree* tree = (TTree*)histoFile->Get("t");
 302   Int_t nEntries = tree->GetEntries();
 303
 304   Int_t nbpf2 = nEntries - (fnInit + fnbpf1) + 1; // nb pts used for 2nd order fit
 305
 306   // read back info
 307   for (Int_t i = 0; i < nEntries; ++i) {
 308     map[i] = 0x0;
 309     run[i] = 0x0;
 310     tree->SetBranchAddress("ped",&map[i]);
 311     tree->SetBranchAddress("run",&run[i]);
 312     tree->GetEvent(i);
 313     //        std::cout << map[i] << " " << run[i] << std::endl;
 314   }
 315   // RunNumber extracted from Root data fil
 316   if(fIndex==0)fRunNumber=(UInt_t)run[nEntries-1]->GetFirst();
 317   //     sscanf(getenv("DATE_RUN_NUMBER"),"%d",&gAliRunNumber);
 318
 319   Double_t pedMean[11];
 320   Double_t pedSigma[11];
 321   for ( Int_t i=0 ; i<11 ; i++) {pedMean[i]=0.;pedSigma[i]=1.;};
 322   Double_t injCharge[11];
 323   Double_t injChargeErr[11];
 324   for ( Int_t i=0 ; i<11 ; i++) {injCharge[i]=0.;injChargeErr[i]=1.;};
 325
 326   //  print out in .log file
 327   detail=Form("\n%s : ------  MUONTRKGAINda for Gain computing (Last Run = %d) ------\n",fPrefixLDC.Data(),fRunNumber); printf("%s",detail);
 328   (*fFilcout)<<"\n\n//=================================================" << endl;
 329   (*fFilcout)<<"//    MUONTRKGAINda: Gain Computing  Run = " << fRunNumber << endl;
 330   (*fFilcout)<<"//    RootDataFile  = "<< fRootDataFileName.Data() << endl;
 331   (*fFilcout)<<"//=================================================" << endl;
 332   (*fFilcout)<<"//* Date          : " << fDate->AsString("l") << "\n" << endl;
 333
 334   (*fFilcout) << " Entries = " << nEntries << " DAC values \n" << endl;
 335   for (Int_t i = 0; i < nEntries; ++i) {
 336     (*fFilcout) << " Run = " << run[i]->GetFirst() << "    DAC = " << run[i]->GetSecond() << endl;
 337     numrun[i] = run[i]->GetFirst();
 338     injCharge[i] = run[i]->GetSecond();
 339     injChargeErr[i] = 0.01*injCharge[i];
 340     if(injChargeErr[i] <= 1.) injChargeErr[i]=1.;
 341   }
 342   detail=Form("%s : .... Fitting .... \n",fPrefixLDC.Data()); printf("%s",detail);
 343
 344
 345   // why 2 files ? (Ch. F.)  => second file contains detailed results
 346     FILE *pfilen = 0;
 347     if(fPrintLevel>1)
 348       {
 349         filename=Form("%s.param",fPrefixDA.Data());
 350         detail=Form("%s : Second fit parameter file        = %s\n",fPrefixLDC.Data(),filename.Data()); printf("%s",detail);
 351         //       cout << " Second fit parameter file        = " << filename.Data() << "\n";
 352         pfilen = fopen (filename.Data(),"w");
 353
 354         fprintf(pfilen,"//===================================================================\n");
 355         fprintf(pfilen,"//  BP MANU CH. par[0]     [1]     [2]     [3]      xlim          P(chi2) p1        P(chi2)2  p2\n");
 356         fprintf(pfilen,"//===================================================================\n");
 357         fprintf(pfilen,"//   * Run           : %d \n",fRunNumber);
 358         fprintf(pfilen,"//===================================================================\n");
 359       }
 360
 361
 362   // file outputs for gain
 363
 364   ofstream pfilew;
 365   pfilew.open(shuttleFile.Data());
 366   // Write Header Data of the .par file
 367   pfilew << WriteGainHeader(fnInit,nEntries,nbpf2,numrun,injCharge);
 368
 369   // print mean and sigma values in file
 370   FILE *pfilep = 0;
 371   if(fPrintLevel>1)
 372     {
 373       filename=Form("%s.peak",fPrefixDA.Data());
 374       detail=Form("%s : File containing Peak mean values = %s\n",fPrefixLDC.Data(),filename.Data()); printf("%s",detail);
 375       //      cout << " File containing Peak mean values = " << filename << "\n";
 376       pfilep = fopen (filename,"w");
 377
 378       fprintf(pfilep,"//==============================================================================================================================\n");
 379       fprintf(pfilep,"//   * Run           : %d \n",fRunNumber);
 380       fprintf(pfilep,"//==============================================================================================================================\n");
 381       fprintf(pfilep,"// BP  MANU  CH.    Ped.     <0>      <1>      <2>      <3>      <4>      <5>      <6>      <7>      <8>      <9>     <10> \n");
 382       fprintf(pfilep,"//==============================================================================================================================\n");
 383       fprintf(pfilep,"//                 DAC= %9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f  fC\n",injCharge[0],injCharge[1],injCharge[2],injCharge[3],injCharge[4],injCharge[5],injCharge[6],injCharge[7],injCharge[8],injCharge[9],injCharge[10]);
 384       fprintf(pfilep,"//                      %9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f\n",injChargeErr[0],injChargeErr[1],injChargeErr[2],injChargeErr[3],injChargeErr[4],injChargeErr[5],injChargeErr[6],injChargeErr[7],injChargeErr[8],injChargeErr[9],injChargeErr[10]);
 385       fprintf(pfilep,"//==============================================================================================================================\n");
 386     }
 387
 388   Double_t chi2    = 0.;
 389   Double_t chi2P2  = 0.;
 390   Double_t prChi2  = 0;
 391   Double_t prChi2P2 =0;
 392   Double_t a0=0.,a1=1.,a2=0.;
 393   Int_t busPatchId ;
 394   Int_t manuId     ;
 395   Int_t channelId ;
 396   Int_t threshold = 0;
 397   Int_t q = 0;
 398   Int_t p1 =0;
 399   Int_t p2 =0;
 400   Double_t gain=10.; // max value (= bad value)
 401   Double_t capa=0.2; // internal capacitor (pF)
 402
 403   //  plot out
 404
 405   TTree* tg = 0x0;
 406   if(fPlotLevel>0)
 407     {
 408       fHistoFileName=Form("%s.root",fPrefixDA.Data());
 409       new TFile(fHistoFileName.Data(),"RECREATE","MUON Tracking gains");
 410       tg = new TTree("tg","TTree avec class Manu_DiMu");
 411
 412       tg->Branch("bp",&busPatchId, "busPatchId/I");
 413       tg->Branch("manu",&manuId, "manuId/I");
 414       tg->Branch("channel",&channelId, "channelId/I");
 415
 416       tg->Branch("a0",&a0, "a0/D");
 417       tg->Branch("a1",&a1, "a1/D");
 418       tg->Branch("a2",&a2, "a2/D");
 419       tg->Branch("Pchi2",&prChi2, "prChi2/D");
 420       tg->Branch("Pchi2_2",&prChi2P2, "prChi2P2/D");
 421       tg->Branch("Threshold",&threshold, "threshold/I");
 422       tg->Branch("q",&q, "q/I");
 423       tg->Branch("p1",&p1, "p1/I");
 424       tg->Branch("p2",&p2, "p2/I");
 425       tg->Branch("gain",&gain, "gain/D");
 426     }
 427
 428   char graphName[256];
 429
 430   // iterates over the first pedestal run
 431   TIter next(map[0]->CreateIterator());
 432   AliMUONVCalibParam* p;
 433
 434   Int_t    nmanu         = 0;
 435   Int_t    nGoodChannel   = 0;
 436   Int_t    nBadChannel   = 0;
 437   Int_t    noFitChannel   = 0;
 438   Int_t    nplot=0;
 439   Double_t sumProbChi2   = 0.;
 440   Double_t sumA1         = 0.;
 441   Double_t sumProbChi2P2 = 0.;
 442   Double_t sumA2         = 0.;
 443
 444   Double_t x[11], xErr[11], y[11], yErr[11];
 445   Double_t xp[11], xpErr[11], yp[11], ypErr[11];
 446
 447   Int_t uncalcountertotal=0 ;
 448   Int_t unparabolicfit=0;
 449
 450   while ( ( p = dynamic_cast<AliMUONVCalibParam*>(next() ) ) )
 451     {
 452       ped[0]  = p;
 453       unparabolicfit=0;
 454
 455       busPatchId = p->ID0();
 456       manuId     = p->ID1();
 457
 458       // read back pedestal from the other runs for the given (bupatch, manu)
 459       for (Int_t i = 1; i < nEntries; ++i) {
 460         ped[i] = static_cast<AliMUONVCalibParam*>(map[i]->FindObject(busPatchId, manuId));
 461       }
 462
 463       // compute for each channel the gain parameters
 464       for ( channelId = 0; channelId < ped[0]->Size() ; ++channelId )
 465         {
 466
 467           Int_t n = 0;
 468           for (Int_t i = 0; i < nEntries; ++i) {
 469
 470             if (!ped[i]) continue; //shouldn't happen.
 471             pedMean[i]      = ped[i]->ValueAsDouble(channelId, 0);
 472             pedSigma[i]     = ped[i]->ValueAsDouble(channelId, 1);
 473
 474             if (pedMean[i] < 0) continue; // not connected
 475
 476             if (pedSigma[i] <= 0) pedSigma[i] = 1.; // should not happen.
 477             n++;
 478           }
 479
 480           // print_peak_mean_values
 481           if(fPrintLevel>1)
 482             {
 483
 484               fprintf(pfilep,"%4i%5i%5i%10.3f",busPatchId,manuId,channelId,0.);
 485               fprintf(pfilep,"%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f \n",pedMean[0],pedMean[1],pedMean[2],pedMean[3],pedMean[4],pedMean[5],pedMean[6],pedMean[7],pedMean[8],pedMean[9],pedMean[10]);
 486               fprintf(pfilep,"                   sig= %9.3f%9.3f%9.3f%9.3f%9.3f%9.3f%9.3f%9.3f%9.3f%9.3f%9.3f \n",pedSigma[0],pedSigma[1],pedSigma[2],pedSigma[3],pedSigma[4],pedSigma[5],pedSigma[6],pedSigma[7],pedSigma[8],pedSigma[9],pedSigma[10]);
 487             }
 488
 489           // makegain
 490           // Fit Method:  Linear fit over gAlinbpf1 points + parabolic fit  over nbpf2  points)
 491           // nInit=1 : 1st pt DAC=0 excluded
 492
 493           // 1. - linear fit over gAlinbpf1 points
 494
 495           Double_t par[4] = {0.,0.5,0.,ADCMax()};
 496           Int_t nbs   = nEntries - fnInit;
 497           if(nbs < fnbpf1)fnbpf1=nbs;
 498
 499           Int_t fitproceed=1;
 500           Int_t nbpf2Dynamic=nbpf2;
 501           Int_t adcLimit=4090; // when RMS < 0.5 (in other cases mean values forced to 4095, see DA_PED)
 502           for (Int_t j = 0; j < nbs; ++j)
 503             {
 504               Int_t k = j + fnInit;
 505               x[j]    = pedMean[k];
 506               if(x[j]<=0.){fitproceed=0; break;}
 507               //              if(x[j]>= ADCMax())
 508               if(x[j]>= adcLimit)
 509                 {
 510                   if(j < nbs-1){fitproceed=0; break;}
 511                   else { nbpf2Dynamic=nbpf2-1; break;}
 512                 }
 513               xErr[j] = pedSigma[k];
 514               y[j]    = injCharge[k];
 515               yErr[j] = injChargeErr[k];
 516
 517             }
 518
 519           TGraphErrors *graphErr;
 520           if(!fitproceed) { p1=0; p2=0; noFitChannel++;}
 521
 522           if(fitproceed)
 523             {
 524
 525               TF1 *f1 = new TF1("f1",funcLin,0.,ADCMax(),2);
 526               graphErr = new TGraphErrors(fnbpf1, x, y, xErr, yErr);
 527
 528               f1->SetParameters(0,0);
 529
 530               graphErr->Fit("f1","RQ");
 531
 532               chi2 = f1->GetChisquare();
 533               f1->GetParameters(par);
 534
 535               delete graphErr;
 536               graphErr=0;
 537               delete f1;
 538
 539               prChi2 = TMath::Prob(chi2, fnbpf1 - 2);
 540
 541               Double_t xLim = pedMean[fnInit + fnbpf1 - 1];
 542               Double_t yLim = par[0]+par[1] * xLim;
 543
 544               a0 = par[0];
 545               a1 = par[1];
 546
 547               // 2. - Translation : new origin (xLim, yLim) + parabolic fit over nbf2 points
 548               //checking:         if(busPatchId ==1841 && manuId==4)nbpf2Dynamic=2;
 549               if(nbpf2Dynamic > 2)
 550                 {
 551                   for (Int_t j = 0; j < nbpf2Dynamic; j++)
 552                     {
 553                       Int_t k  = j + (fnInit + fnbpf1) - 1;
 554                       xp[j]    = pedMean[k] - xLim;
 555                       xpErr[j] = pedSigma[k];
 556
 557                       yp[j]    = injCharge[k] - yLim - par[1]*xp[j];
 558                       ypErr[j] = injChargeErr[k];
 559                     }
 560
 561                   TF1 *f2 = new TF1("f2",funcParabolic,0.,ADCMax(),1);
 562                   graphErr = new TGraphErrors(nbpf2Dynamic, xp, yp, xpErr, ypErr);
 563
 564                   graphErr->Fit(f2,"RQ");
 565                   chi2P2 = f2->GetChisquare();
 566                   f2->GetParameters(par);
 567
 568                   delete graphErr;
 569                   graphErr=0;
 570                   delete f2;
 571
 572                   prChi2P2 = TMath::Prob(chi2P2, nbpf2Dynamic-1);
 573                   a2 = par[0];
 574                 }
 575               else
 576                 {
 577                   unparabolicfit++;
 578                   (*fFilcout) << " Warning : BP = " << busPatchId << " Manu = " << manuId <<  " Channel = " << channelId <<": parabolic fit not possible (nbpf2=" <<  nbpf2Dynamic  << ") => a2=0 and linear fit OK" << std::endl;
 579                   if(unparabolicfit==1) std::cout << " Warning : BP = " << busPatchId << " Manu = " << manuId <<  ": no parabolic fit for some channels (nbpf2=" <<  nbpf2Dynamic  << "), linear fit is OK (see .log for details)" << std::endl;
 580                   a2=0. ; prChi2P2=0. ;
 581                 }
 582
 583               par[0] = a0;
 584               par[1] = a1;
 585               par[2] = a2;
 586               par[3] = xLim;
 587
 588               if(prChi2>0.999999)prChi2=0.999999 ; if(prChi2P2>0.999999)prChi2P2=0.9999999; // avoiding Pr(Chi2)=1 value
 589               p1 = TMath::Nint(floor(prChi2*15))+1;    // round down value : floor(2.8)=2.
 590               p2 = TMath::Nint(floor(prChi2P2*15))+1;
 591               q  = p1*16 + p2;  // fit quality
 592
 593               Double_t x0 = -par[0]/par[1]; // value of x corresponding to à 0 fC
 594               threshold = TMath::Nint(ceil(par[3]-x0)); // linear if x < threshold
 595
 596               if(fPrintLevel>1)
 597                 {
 598                   fprintf(pfilen,"%4i %4i %2i",busPatchId,manuId,channelId);
 599                   fprintf(pfilen," %6.2f %6.4f %10.3e %4.2f %4i          %8.6f %8.6f   %x          %8.6f  %8.6f   %x\n",
 600                           par[0], par[1], par[2], par[3], threshold, prChi2, floor(prChi2*15), p1,  prChi2P2, floor(prChi2P2*15),p2);
 601                 }
 602
 603
 604               // tests
 605               if(par[1]< goodA1Min ||  par[1]> goodA1Max) p1=0;
 606               if(par[2]< goodA2Min ||  par[2]> goodA2Max) p2=0;
 607
 608             } // fitproceed
 609
 610           if(fitproceed && p1>0 && p2>0)
 611             {
 612               nGoodChannel++;
 613               sumProbChi2   += prChi2;
 614               sumA1         += par[1];
 615               sumProbChi2P2   += prChi2P2;
 616               sumA2         += par[2];
 617             }
 618           else // bad calibration
 619             {
 620               nBadChannel++;
 621               q=0;
 622               par[1]=0.5; a1=0.5; p1=0;
 623               par[2]=0.;  a2=0.;  p2=0;
 624               threshold=ADCMax();
 625
 626               // bad calibration counter
 627               char bpmanuname[256];
 628               AliMUONErrorCounter* uncalcounter;
 629
 630               snprintf(bpmanuname,256,"bp%dmanu%d",busPatchId,manuId);
 631               if (!(uncalcounter = (AliMUONErrorCounter*)uncalBuspatchManuTable->FindObject(bpmanuname)))
 632                 {
 633                   // New buspatch_manu name
 634                   uncalcounter= new AliMUONErrorCounter (busPatchId,manuId);
 635                   uncalcounter->SetName(bpmanuname);
 636                   uncalBuspatchManuTable->Add(uncalcounter);
 637                 }
 638               else
 639                 {
 640                   // Existing buspatch_manu name
 641                   uncalcounter->Increment();
 642                 }
 643               //                            uncalcounter->Print_uncal()
 644               uncalcountertotal ++;
 645             }
 646           gain=1./(par[1]*capa); // mv/fC
 647
 648           if(fPlotLevel>0)
 649             {if(fPlotLevel>1)
 650                 {
 651                   //                  if(q==0  and  nplot < 100)
 652                   //      if(p1>1 && p2==0  and  nplot < 100)
 653                   //                        if(p1>10 && p2>10  and  nplot < 100)
 654                   //    if(p1>=1 and p1<=2  and  nplot < 100)
 655 //                if((p1==1 || p2==1) and  nplot < 100)
 656                             if(nbpf2Dynamic<nbpf2  and  nplot < 100)
 657                     {
 658                       nplot++;
 659                       //              cout << " nplot = " << nplot << endl;
 660                       TF1 *f2Calib = new TF1("f2Calib",funcCalib,0.,ADCMax(),NFITPARAMS);
 661
 662                       graphErr = new TGraphErrors(nEntries,pedMean,injCharge,pedSigma,injChargeErr);
 663
 664                       snprintf(graphName,256,"BusPatch_%d_Manu_%d_Ch_%d",busPatchId, manuId,channelId);
 665
 666                       graphErr->SetTitle(graphName);
 667                       graphErr->SetMarkerColor(3);
 668                       graphErr->SetMarkerStyle(12);
 669                       graphErr->Write(graphName);
 670
 671                       snprintf(graphName,256,"f2_BusPatch_%d_Manu_%d_Ch_%d",busPatchId, manuId,channelId);
 672                       f2Calib->SetTitle(graphName);
 673                       f2Calib->SetLineColor(4);
 674                       f2Calib->SetParameters(par);
 675                       f2Calib->Write(graphName);
 676
 677                       delete graphErr;
 678                       graphErr=0;
 679                       delete f2Calib;
 680                     }
 681                 }
 682               tg->Fill();
 683             }
 684           pfilew << WriteGainData(busPatchId,manuId,channelId,par[1],par[2],threshold,q);
 685         }
 686       nmanu++;
 687       Int_t step=500;
 688       if(nmanu % step == 0)printf("%s : Nb manu = %d\n",fPrefixLDC.Data(),nmanu);
 689     }
 690
 691   //      print in logfile
 692   if (uncalBuspatchManuTable->GetSize())
 693     {
 694       uncalBuspatchManuTable->Sort();  // use compare
 695       TIterator* iter = uncalBuspatchManuTable->MakeIterator();
 696       AliMUONErrorCounter* uncalcounter;
 697       (*fFilcout) << "\n List of problematic BusPatch and Manu " << endl;
 698       (*fFilcout) << " ========================================" << endl;
 699       (*fFilcout) << "        BP       Manu        Nb Channel  " << endl ;
 700       (*fFilcout) << " ========================================" << endl;
 701       while((uncalcounter = (AliMUONErrorCounter*) iter->Next()))
 702         {
 703           (*fFilcout) << "\t" << uncalcounter->BusPatch() << "\t " << uncalcounter->ManuId() << "\t\t"   << uncalcounter->Events() << endl;
 704         }
 705       (*fFilcout) << " ========================================" << endl;
 706
 707       (*fFilcout) << " Number of bad calibrated Manu    = " << uncalBuspatchManuTable->GetSize() << endl ;
 708       (*fFilcout) << " Number of bad calibrated channel = " << uncalcountertotal << endl;
 709
 710     }
 711   if(nmanu && nGoodChannel)
 712     {
 713       Double_t ratio_limit=0.25;
 714       Double_t ratio=float (nBadChannel)/float (nmanu*64);
 715
 716       detail=Form("\n%s : Nb of channels in raw data = %d (%d Manu)",fPrefixLDC.Data(),nmanu*64,nmanu);
 717       (*fFilcout) << detail ; printf("%s",detail);
 718       detail=Form("\n%s : Nb of calibrated channel   = %d  (%4.2f <a1< %4.2f and %4.2f <a2< %4.2f)",fPrefixLDC.Data(),nGoodChannel,goodA1Min,goodA1Max, goodA2Min,goodA2Max);
 719       (*fFilcout) << detail ; printf("%s",detail);
 720       detail=Form("\n%s : Nb of uncalibrated channel = %d  [%6.4f] (%d unfitted channels) ",fPrefixLDC.Data(),nBadChannel,ratio,noFitChannel);
 721       (*fFilcout) << detail ; printf("%s",detail);
 722
 723       if(ratio > ratio_limit) { status=-1;
 724         detail=Form("\n%s : !!!!! WARNING : Nb of uncalibrated channels very large : %6.4f > %6.4f (status= %d) ",fPrefixLDC.Data(),ratio,ratio_limit,status);
 725         (*fFilcout) << detail ; printf("%s",detail);
 726       }
 727
 728       Double_t meanA1         = sumA1/(nGoodChannel);
 729       Double_t meanProbChi2   = sumProbChi2/(nGoodChannel);
 730       Double_t meanA2         = sumA2/(nGoodChannel);
 731       Double_t meanProbChi2P2 = sumProbChi2P2/(nGoodChannel);
 732       Double_t capaManu = 0.2; // pF
 733       (*fFilcout) << "\n linear fit   : <a1> = " << meanA1 << "     Prob(chi2)>  = " <<  meanProbChi2 <<  "    <gain>  = " <<  1./(meanA1*capaManu)
 734                   << " mV/fC (capa= " << capaManu << " pF)" << endl;
 735       (*fFilcout)   <<" parabolic fit: <a2> = " << meanA2  << "    Prob(chi2)>  = " <<  meanProbChi2P2 << "\n" <<  endl;
 736
 737       detail=Form("\n%s : <gain>  = %7.5f  mV/fC (capa= %3.1f pF)  Prob(chi2) = %5.3f\n" ,fPrefixLDC.Data(),1./(meanA1*capaManu),capaManu,meanProbChi2);
 738       printf("%s",detail);
 739     }
 740   else
 741     { status=-1;
 742       detail=Form("\n%s : !!!!! ERROR :  Nb of Manu = %d or Nb calibrated channel = %d !!!!! (status= %d)\n",fPrefixLDC.Data(),nmanu,nGoodChannel,status);
 743       (*fFilcout) << detail ; printf("%s",detail);
 744     }
 745   pfilew.close();
 746
 747   if(fPlotLevel>0){tg->Write();histoFile->Close();}
 748   if(fPrintLevel>1){fclose(pfilep); fclose(pfilen);}
 749   SetStatusDA(status);
 750 }