MUON/AliMUONGain.cxx

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  14 **************************************************************************/
  15
  16 // $Id$
  17
  18 #include "AliMUONGain.h"
  19 #include "AliMUONPedestal.h"
  20 #include "AliMUONErrorCounter.h"
  21 #include "AliMUON2DMap.h"
  22 #include "AliMUONVCalibParam.h"
  23 #include "AliMUONVStore.h"
  24 #include "AliMpIntPair.h"
  25
  26 #include <TString.h>
  27 #include <THashList.h>
  28 #include <TTimeStamp.h>
  29 #include <TTree.h>
  30 #include <TFile.h>
  31 #include <TF1.h>
  32 #include <TGraphErrors.h>
  33 #include <TMath.h>
  34 #include <Riostream.h>
  35
  36 #include <sstream>
  37
  38 #define  NFITPARAMS 4
  39
  40 //-----------------------------------------------------------------------------
  41 /// \class AliMUONGain
  42 ///
  43 /// Implementation of calibration computing
  44 ///
  45 /// add
  46 ///
  47 ///
  48 /// \author Alberto Baldisseri, JL Charvet
  49 //-----------------------------------------------------------------------------
  50
  51
  52
  53
  54 // functions
  55
  56 namespace {
  57
  58   //______________________________________________________________________________
  59   Double_t funcLin (const Double_t *x, const Double_t *par)
  60   {
  61     /// Linear function
  62     return par[0] + par[1]*x[0];
  63   }
  64
  65   //______________________________________________________________________________
  66   Double_t funcParabolic (const Double_t *x, const Double_t *par)
  67   {
  68     /// Parabolic function
  69     return par[0]*x[0]*x[0];
  70   }
  71
  72   //______________________________________________________________________________
  73   Double_t funcCalib (const Double_t *x, const Double_t *par)
  74   {
  75     /// Calibration function
  76     Double_t xLim= par[3];
  77
  78     if(x[0] <= xLim) return par[0] + par[1]*x[0];
  79
  80     Double_t yLim = par[0]+ par[1]*xLim;
  81     return yLim + par[1]*(x[0] - xLim) + par[2]*(x[0] - xLim)*(x[0] - xLim);
  82   }
  83
  84 }
  85
  86 /// \cond CLASSIMP
  87 ClassImp(AliMUONGain)
  88 /// \endcond
  89
  90 //______________________________________________________________________________
  91 AliMUONGain::AliMUONGain()
  92 : AliMUONPedestal(),
  93 fInjCharge(0),
  94 fRootDataFileName(),
  95 fnInit(1),
  96 fnEntries(11),
  97 fnbpf1(6),
  98 fPrintLevel(0),
  99 fPlotLevel(0)
 100 {
 101 /// Default constructor
 102
 103 }
 104
 105 //______________________________________________________________________________
 106 AliMUONGain::~AliMUONGain()
 107 {
 108 /// Destructor
 109 }
 110
 111 //______________________________________________________________________________
 112 TString AliMUONGain::WriteDummyHeader(void)
 113 {
 114 ///
 115
 116   ostringstream stream;
 117   stream<<"//DUMMY FILE (to prevent Shuttle failure)"<< endl;
 118   stream<<"//================================================" << endl;
 119   stream<<"//       MUONTRKGAINda: Calibration run  " << endl;
 120   stream<<"//================================================" << endl;
 121   stream<<"//   * Run           : " << fRunNumber << endl;
 122   stream<<"//   * Date          : " << fDate->AsString("l") <<endl;
 123   stream<<"//   * DAC           : " << fInjCharge << endl;
 124   stream<<"//-------------------------------------------------" << endl;
 125
 126   return TString(stream.str().c_str());
 127 }
 128
 129 //______________________________________________________________________________
 130 void AliMUONGain::MakePedStoreForGain(TString shuttleFile)
 131 {
 132 /// Store Pedmean and sigma to pedestal-like ascii file
 133
 134   ofstream fileout;
 135   TString tempstring;
 136   TString flatFile;
 137   TString outputFile;
 138
 139   // Store pedestal map in root file
 140   TTree* tree = 0x0;
 141
 142   // write dummy ascii file -> Shuttle
 143   if(fIndex<fnEntries)
 144     {
 145       FILE *pfilew=0;
 146       pfilew = fopen (shuttleFile,"w");
 147
 148       fprintf(pfilew,"//DUMMY FILE (to prevent Shuttle failure)\n");
 149       fprintf(pfilew,"//================================================\n");
 150       fprintf(pfilew,"//       MUONTRKGAINda: Calibration run  \n");
 151       fprintf(pfilew,"//=================================================\n");
 152       fprintf(pfilew,"//   * Run           : %d \n",fRunNumber);
 153       fprintf(pfilew,"//   * Date          : %s \n",fDate->AsString("l"));
 154       fprintf(pfilew,"//   * DAC           : %d \n",fInjCharge);
 155       fprintf(pfilew,"//-------------------------------------------------\n");
 156       fclose(pfilew);
 157     }
 158
 159
 160
 161   Finalize();
 162   MakeControlHistos();
 163   if(fPrintLevel>0)
 164     {
 165       // compute and store mean DAC values (like pedestals)
 166       flatFile = Form("%s.ped",fPrefixDA.Data());
 167       outputFile=flatFile;
 168       cout << "\n" << fPrefixDA.Data() << " : Flat file  generated  : " << flatFile.Data() << "\n";
 169       if (!outputFile.IsNull())
 170       {
 171         ofstream out(outputFile.Data());
 172         MakeASCIIoutput(out);
 173         out.close();
 174       }
 175     }
 176
 177   TString mode("UPDATE");
 178
 179   if (fIndex==1) {
 180     mode = "RECREATE";
 181   }
 182   TFile* histoFile = new TFile(fRootDataFileName.Data(), mode.Data(), "MUON Tracking Gains");
 183
 184   // second argument should be the injected charge, taken from config crocus file
 185   // put also info about run number could be usefull
 186   AliMpIntPair* pair   = new AliMpIntPair(fRunNumber,fInjCharge );
 187
 188   if (mode.CompareTo("UPDATE") == 0) {
 189     tree = (TTree*)histoFile->Get("t");
 190     tree->SetBranchAddress("run",&pair);
 191     tree->SetBranchAddress("ped",&fPedestalStore);
 192
 193   } else {
 194     tree = new TTree("t","Pedestal tree");
 195     tree->Branch("run", "AliMpIntPair",&pair);
 196     tree->Branch("ped", "AliMUON2DMap",&fPedestalStore);
 197     tree->SetBranchAddress("run",&pair);
 198     tree->SetBranchAddress("ped",&fPedestalStore);
 199
 200   }
 201
 202   tree->Fill();
 203   tree->Write("t", TObject::kOverwrite); // overwrite the tree
 204   histoFile->Close();
 205
 206   delete pair;
 207 }
 208
 209 //______________________________________________________________________________
 210 TString AliMUONGain::WriteGainHeader(Int_t nInit, Int_t nEntries, Int_t nbpf2, Int_t *numrun, Double_t *injCharge)
 211 {
 212 /// Header of the calibration output file
 213
 214   ostringstream stream;
 215
 216
 217   stream<<"//=======================================================" << endl;
 218   stream<<"//      Calibration file calculated by " << fPrefixDA.Data() <<endl;
 219   stream<<"//=======================================================" << endl;
 220   stream<<"//   * Run           : " << fRunNumber << endl;
 221   stream<<"//   * Date          : " << fDate->AsString("l") <<endl;
 222   stream<<"//   * Statictics    : " << fNEvents << endl;
 223   if(fConfig)
 224   stream<<"//   * # of MANUS    : " << fNManuConfig << " read in the Det. config. " << endl;
 225   stream<<"//   * # of MANUS    : " << fNManu << " read in raw data " << endl;
 226   stream<<"//   * # of MANUS    : " << fNChannel/64 << " written in calibration file " << endl;
 227   stream<<"//   * # of channels : " << fNChannel << endl;
 228   stream<<"//-------------------------------------------------------" << endl;
 229
 230   if(nInit==0)
 231     stream<<"//  "<< nEntries <<" DAC values  fit: "<< fnbpf1 << " pts (1st order) " << nbpf2 << " pts (2nd order)" << endl;
 232   if(nInit==1)
 233     stream<<"//  "<< nEntries <<" DAC values  fit: "<< fnbpf1 << " pts (1st order) " << nbpf2 << " pts (2nd order) DAC=0 excluded" << endl;
 234   stream<<"//   *  nInit = " << nInit << "  *  f1nbp = " << fnbpf1 << "  *  f2nbp = " <<  nbpf2 << endl;
 235
 236   stream<<"//   RUN     DAC   " << endl;
 237   stream<<"//-----------------" << endl;
 238   for (Int_t i = 0; i < nEntries; ++i) {
 239         stream<<Form("//   %d    %5.0f \n",numrun[i],injCharge[i]);
 240   }
 241   stream<<"//=======================================" << endl;
 242   stream<<"// BP MANU CH.   a1      a2     thres. q " << endl;
 243   stream<<"//=======================================" << endl;
 244
 245   return TString(stream.str().c_str());
 246 }
 247
 248 //______________________________________________________________________________
 249 TString AliMUONGain::WriteGainData(Int_t BP, Int_t Manu, Int_t ch, Double_t p1, Double_t p2, Int_t threshold, Int_t q)
 250 {
 251 /// Write calibration parameters per channel
 252
 253   ostringstream stream("");
 254   stream << Form("%4i %5i %2i %7.4f %10.3e %4i %2x\n",BP,Manu,ch,p1,p2,threshold,q);
 255   return TString(stream.str().c_str());
 256
 257 }
 258
 259 //_______________________________________________________________________________
 260 void AliMUONGain::MakeGainStore(TString shuttleFile)
 261 {
 262   /// Store gains in ASCII files
 263   ofstream fileout;
 264   ofstream filcouc;
 265   TString tempstring;
 266   TString filename;
 267
 268   Double_t goodA1Min =  0.5;
 269   Double_t goodA1Max =  2.;
 270 //   Double_t goodA2Min = -0.5E-03;
 271 //   Double_t goodA2Max =  1.E-03;
 272   Double_t goodA2Min = -0.5E-01; // changed 28/10/2009 (JLC) <=> enlarged condition on a2
 273   Double_t goodA2Max =  1.E-01;
 274   // Table for uncalibrated  buspatches and manus
 275   THashList* uncalBuspatchManuTable = new THashList(1000,2);
 276
 277   Int_t numrun[11];
 278
 279   // open file MUONTRKda_gain_data.root
 280   // read again the pedestal for the calibration runs (11 runs)
 281   // need the injection charge from config file (to be done)
 282   // For each channel make a TGraphErrors (mean, sigma) vs injected charge
 283   // Fit with a polynomial fct
 284   // store the result in a flat file.
 285
 286   if(fIndex==0)cout << " Root data file = " << fRootDataFileName.Data() << endl;
 287   TFile*  histoFile = new TFile(fRootDataFileName.Data());
 288
 289   AliMUON2DMap* map[11];
 290   AliMUONVCalibParam* ped[11];
 291   AliMpIntPair* run[11];
 292
 293   //read back from root file
 294   TTree* tree = (TTree*)histoFile->Get("t");
 295   Int_t nEntries = tree->GetEntries();
 296
 297   Int_t nbpf2 = nEntries - (fnInit + fnbpf1) + 1; // nb pts used for 2nd order fit
 298
 299   // read back info
 300   for (Int_t i = 0; i < nEntries; ++i) {
 301     map[i] = 0x0;
 302     run[i] = 0x0;
 303     tree->SetBranchAddress("ped",&map[i]);
 304     tree->SetBranchAddress("run",&run[i]);
 305     tree->GetEvent(i);
 306     //        std::cout << map[i] << " " << run[i] << std::endl;
 307   }
 308   // RunNumber extracted from Root data fil
 309   if(fIndex==0)fRunNumber=(UInt_t)run[nEntries-1]->GetFirst();
 310   //     sscanf(getenv("DATE_RUN_NUMBER"),"%d",&gAliRunNumber);
 311
 312   Double_t pedMean[11];
 313   Double_t pedSigma[11];
 314   for ( Int_t i=0 ; i<11 ; i++) {pedMean[i]=0.;pedSigma[i]=1.;};
 315   Double_t injCharge[11];
 316   Double_t injChargeErr[11];
 317   for ( Int_t i=0 ; i<11 ; i++) {injCharge[i]=0.;injChargeErr[i]=1.;};
 318
 319   // some print
 320   cout<<"\n ********  MUONTRKGAINda for Gain computing (Last Run = " << fRunNumber << ") ********\n" << endl;
 321   cout<<" * Date          : " << fDate->AsString("l") << "\n" << endl;
 322   cout << " Entries = " << nEntries << " DAC values \n" << endl;
 323   for (Int_t i = 0; i < nEntries; ++i) {
 324     cout<< " Run = " << run[i]->GetFirst() << "    DAC = " << run[i]->GetSecond() << endl;
 325     numrun[i] = run[i]->GetFirst();
 326     injCharge[i] = run[i]->GetSecond();
 327     injChargeErr[i] = 0.01*injCharge[i];
 328     if(injChargeErr[i] <= 1.) injChargeErr[i]=1.;
 329   }
 330   cout << "" << endl;
 331
 332   //  print out in .log file
 333
 334   (*fFilcout)<<"\n\n//=================================================" << endl;
 335   (*fFilcout)<<"//    MUONTRKGAINda: Gain Computing  Run = " << fRunNumber << endl;
 336   (*fFilcout)<<"//    RootDataFile  = "<< fRootDataFileName.Data() << endl;
 337   (*fFilcout)<<"//=================================================" << endl;
 338   (*fFilcout)<<"//* Date          : " << fDate->AsString("l") << "\n" << endl;
 339
 340
 341
 342   // why 2 files ? (Ch. F.)  => second file contains detailed results
 343     FILE *pfilen = 0;
 344     if(fPrintLevel>1)
 345       {
 346         filename=Form("%s.param",fPrefixDA.Data());
 347         cout << " Second fit parameter file        = " << filename.Data() << "\n";
 348         pfilen = fopen (filename.Data(),"w");
 349
 350         fprintf(pfilen,"//===================================================================\n");
 351         fprintf(pfilen,"//  BP MANU CH. par[0]     [1]     [2]     [3]      xlim          P(chi2) p1        P(chi2)2  p2\n");
 352         fprintf(pfilen,"//===================================================================\n");
 353         fprintf(pfilen,"//   * Run           : %d \n",fRunNumber);
 354         fprintf(pfilen,"//===================================================================\n");
 355       }
 356
 357
 358   // file outputs for gain
 359
 360   ofstream pfilew;
 361   pfilew.open(shuttleFile.Data());
 362   // Write Header Data of the .par file
 363   pfilew << WriteGainHeader(fnInit,nEntries,nbpf2,numrun,injCharge);
 364
 365   // print mean and sigma values in file
 366   FILE *pfilep = 0;
 367   if(fPrintLevel>1)
 368     {
 369       filename=Form("%s.peak",fPrefixDA.Data());
 370       cout << " File containing Peak mean values = " << filename << "\n";
 371       pfilep = fopen (filename,"w");
 372
 373       fprintf(pfilep,"//==============================================================================================================================\n");
 374       fprintf(pfilep,"//   * Run           : %d \n",fRunNumber);
 375       fprintf(pfilep,"//==============================================================================================================================\n");
 376       fprintf(pfilep,"// BP  MANU  CH.    Ped.     <0>      <1>      <2>      <3>      <4>      <5>      <6>      <7>      <8>      <9>     <10> \n");
 377       fprintf(pfilep,"//==============================================================================================================================\n");
 378       fprintf(pfilep,"//                 DAC= %9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f  fC\n",injCharge[0],injCharge[1],injCharge[2],injCharge[3],injCharge[4],injCharge[5],injCharge[6],injCharge[7],injCharge[8],injCharge[9],injCharge[10]);
 379       fprintf(pfilep,"//                      %9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f\n",injChargeErr[0],injChargeErr[1],injChargeErr[2],injChargeErr[3],injChargeErr[4],injChargeErr[5],injChargeErr[6],injChargeErr[7],injChargeErr[8],injChargeErr[9],injChargeErr[10]);
 380       fprintf(pfilep,"//==============================================================================================================================\n");
 381     }
 382
 383   Double_t chi2    = 0.;
 384   Double_t chi2P2  = 0.;
 385   Double_t prChi2  = 0;
 386   Double_t prChi2P2 =0;
 387   Double_t a0=0.,a1=1.,a2=0.;
 388   Int_t busPatchId ;
 389   Int_t manuId     ;
 390   Int_t channelId ;
 391   Int_t threshold = 0;
 392   Int_t q = 0;
 393   Int_t p1 =0;
 394   Int_t p2 =0;
 395   Double_t gain=10.; // max value (= bad value)
 396   Double_t capa=0.2; // internal capacitor (pF)
 397
 398   //  plot out
 399
 400   TFile* gainFile = 0x0;
 401   TTree* tg = 0x0;
 402   if(fPlotLevel>0)
 403     {
 404       fHistoFileName=Form("%s.root",fPrefixDA.Data());
 405       gainFile = new TFile(fHistoFileName.Data(),"RECREATE","MUON Tracking gains");
 406       tg = new TTree("tg","TTree avec class Manu_DiMu");
 407
 408       tg->Branch("bp",&busPatchId, "busPatchId/I");
 409       tg->Branch("manu",&manuId, "manuId/I");
 410       tg->Branch("channel",&channelId, "channelId/I");
 411
 412       tg->Branch("a0",&a0, "a0/D");
 413       tg->Branch("a1",&a1, "a1/D");
 414       tg->Branch("a2",&a2, "a2/D");
 415       tg->Branch("Pchi2",&prChi2, "prChi2/D");
 416       tg->Branch("Pchi2_2",&prChi2P2, "prChi2P2/D");
 417       tg->Branch("Threshold",&threshold, "threshold/I");
 418       tg->Branch("q",&q, "q/I");
 419       tg->Branch("p1",&p1, "p1/I");
 420       tg->Branch("p2",&p2, "p2/I");
 421       tg->Branch("gain",&gain, "gain/D");
 422     }
 423
 424   char graphName[256];
 425
 426   // iterates over the first pedestal run
 427   TIter next(map[0]->CreateIterator());
 428   AliMUONVCalibParam* p;
 429
 430   Int_t    nmanu         = 0;
 431   Int_t    nGoodChannel   = 0;
 432   Int_t    nBadChannel   = 0;
 433   Int_t    noFitChannel   = 0;
 434   Int_t    nplot=0;
 435   Double_t sumProbChi2   = 0.;
 436   Double_t sumA1         = 0.;
 437   Double_t sumProbChi2P2 = 0.;
 438   Double_t sumA2         = 0.;
 439
 440   Double_t x[11], xErr[11], y[11], yErr[11];
 441   Double_t xp[11], xpErr[11], yp[11], ypErr[11];
 442
 443   Int_t uncalcountertotal=0 ;
 444   Int_t unparabolicfit=0;
 445
 446   while ( ( p = dynamic_cast<AliMUONVCalibParam*>(next() ) ) )
 447     {
 448       ped[0]  = p;
 449       unparabolicfit=0;
 450
 451       busPatchId = p->ID0();
 452       manuId     = p->ID1();
 453
 454       // read back pedestal from the other runs for the given (bupatch, manu)
 455       for (Int_t i = 1; i < nEntries; ++i) {
 456         ped[i] = static_cast<AliMUONVCalibParam*>(map[i]->FindObject(busPatchId, manuId));
 457       }
 458
 459       // compute for each channel the gain parameters
 460       for ( channelId = 0; channelId < ped[0]->Size() ; ++channelId )
 461         {
 462
 463           Int_t n = 0;
 464           for (Int_t i = 0; i < nEntries; ++i) {
 465
 466             if (!ped[i]) continue; //shouldn't happen.
 467             pedMean[i]      = ped[i]->ValueAsDouble(channelId, 0);
 468             pedSigma[i]     = ped[i]->ValueAsDouble(channelId, 1);
 469
 470             if (pedMean[i] < 0) continue; // not connected
 471
 472             if (pedSigma[i] <= 0) pedSigma[i] = 1.; // should not happen.
 473             n++;
 474           }
 475
 476           // print_peak_mean_values
 477           if(fPrintLevel>1)
 478             {
 479
 480               fprintf(pfilep,"%4i%5i%5i%10.3f",busPatchId,manuId,channelId,0.);
 481               fprintf(pfilep,"%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f%9.1f \n",pedMean[0],pedMean[1],pedMean[2],pedMean[3],pedMean[4],pedMean[5],pedMean[6],pedMean[7],pedMean[8],pedMean[9],pedMean[10]);
 482               fprintf(pfilep,"                   sig= %9.3f%9.3f%9.3f%9.3f%9.3f%9.3f%9.3f%9.3f%9.3f%9.3f%9.3f \n",pedSigma[0],pedSigma[1],pedSigma[2],pedSigma[3],pedSigma[4],pedSigma[5],pedSigma[6],pedSigma[7],pedSigma[8],pedSigma[9],pedSigma[10]);
 483             }
 484
 485           // makegain
 486
 487
 488           // Fit Method:  Linear fit over gAlinbpf1 points + parabolic fit  over nbpf2  points)
 489           // nInit=1 : 1st pt DAC=0 excluded
 490
 491           // 1. - linear fit over gAlinbpf1 points
 492
 493           Double_t par[4] = {0.,0.5,0.,ADCMax()};
 494           Int_t nbs   = nEntries - fnInit;
 495           if(nbs < fnbpf1)fnbpf1=nbs;
 496
 497           Int_t fitproceed=1;
 498           Int_t nbpf2Dynamic=nbpf2;
 499           Int_t adcLimit=4090; // when RMS < 0.5 (in other cases mean values forced to 4095, see DA_PED)
 500           for (Int_t j = 0; j < nbs; ++j)
 501             {
 502               Int_t k = j + fnInit;
 503               x[j]    = pedMean[k];
 504               if(x[j]<=0.){fitproceed=0; break;}
 505               //              if(x[j]>= ADCMax())
 506               if(x[j]>= adcLimit)
 507                 {
 508                   if(j < nbs-1){fitproceed=0; break;}
 509                   else { nbpf2Dynamic=nbpf2-1; break;}
 510                 }
 511               xErr[j] = pedSigma[k];
 512               y[j]    = injCharge[k];
 513               yErr[j] = injChargeErr[k];
 514
 515             }
 516
 517           TGraphErrors *graphErr;
 518           if(!fitproceed) { p1=0; p2=0; noFitChannel++;}
 519
 520           if(fitproceed)
 521             {
 522
 523               TF1 *f1 = new TF1("f1",funcLin,0.,ADCMax(),2);
 524               graphErr = new TGraphErrors(fnbpf1, x, y, xErr, yErr);
 525
 526               f1->SetParameters(0,0);
 527
 528               graphErr->Fit("f1","RQ");
 529
 530               chi2 = f1->GetChisquare();
 531               f1->GetParameters(par);
 532
 533               delete graphErr;
 534               graphErr=0;
 535               delete f1;
 536
 537               prChi2 = TMath::Prob(chi2, fnbpf1 - 2);
 538
 539               Double_t xLim = pedMean[fnInit + fnbpf1 - 1];
 540               Double_t yLim = par[0]+par[1] * xLim;
 541
 542               a0 = par[0];
 543               a1 = par[1];
 544
 545               // 2. - Translation : new origin (xLim, yLim) + parabolic fit over nbf2 points
 546               //checking:         if(busPatchId ==1841 && manuId==4)nbpf2Dynamic=2;
 547               if(nbpf2Dynamic > 2)
 548                 {
 549                   for (Int_t j = 0; j < nbpf2Dynamic; j++)
 550                     {
 551                       Int_t k  = j + (fnInit + fnbpf1) - 1;
 552                       xp[j]    = pedMean[k] - xLim;
 553                       xpErr[j] = pedSigma[k];
 554
 555                       yp[j]    = injCharge[k] - yLim - par[1]*xp[j];
 556                       ypErr[j] = injChargeErr[k];
 557                     }
 558
 559                   TF1 *f2 = new TF1("f2",funcParabolic,0.,ADCMax(),1);
 560                   graphErr = new TGraphErrors(nbpf2Dynamic, xp, yp, xpErr, ypErr);
 561
 562                   graphErr->Fit(f2,"RQ");
 563                   chi2P2 = f2->GetChisquare();
 564                   f2->GetParameters(par);
 565
 566                   delete graphErr;
 567                   graphErr=0;
 568                   delete f2;
 569
 570                   prChi2P2 = TMath::Prob(chi2P2, nbpf2Dynamic-1);
 571                   a2 = par[0];
 572                 }
 573               else
 574                 {
 575                   unparabolicfit++;
 576                   (*fFilcout) << " Warning : BP = " << busPatchId << " Manu = " << manuId <<  " Channel = " << channelId <<": parabolic fit not possible (nbpf2=" <<  nbpf2Dynamic  << ") => a2=0 and linear fit OK" << std::endl;
 577                   if(unparabolicfit==1) std::cout << " Warning : BP = " << busPatchId << " Manu = " << manuId <<  ": no parabolic fit for some channels (nbpf2=" <<  nbpf2Dynamic  << "), linear fit is OK (see .log for details)" << std::endl;
 578                   a2=0. ; prChi2P2=0. ;
 579                 }
 580
 581               par[0] = a0;
 582               par[1] = a1;
 583               par[2] = a2;
 584               par[3] = xLim;
 585
 586               if(prChi2>0.999999)prChi2=0.999999 ; if(prChi2P2>0.999999)prChi2P2=0.9999999; // avoiding Pr(Chi2)=1 value
 587               p1 = TMath::Nint(floor(prChi2*15))+1;    // round down value : floor(2.8)=2.
 588               p2 = TMath::Nint(floor(prChi2P2*15))+1;
 589               q  = p1*16 + p2;  // fit quality
 590
 591               Double_t x0 = -par[0]/par[1]; // value of x corresponding to à 0 fC
 592               threshold = TMath::Nint(ceil(par[3]-x0)); // linear if x < threshold
 593
 594               if(fPrintLevel>1)
 595                 {
 596                   fprintf(pfilen,"%4i %4i %2i",busPatchId,manuId,channelId);
 597                   fprintf(pfilen," %6.2f %6.4f %10.3e %4.2f %4i          %8.6f %8.6f   %x          %8.6f  %8.6f   %x\n",
 598                           par[0], par[1], par[2], par[3], threshold, prChi2, floor(prChi2*15), p1,  prChi2P2, floor(prChi2P2*15),p2);
 599                 }
 600
 601
 602               // tests
 603               if(par[1]< goodA1Min ||  par[1]> goodA1Max) p1=0;
 604               if(par[2]< goodA2Min ||  par[2]> goodA2Max) p2=0;
 605
 606             } // fitproceed
 607
 608           if(fitproceed && p1>0 && p2>0)
 609             {
 610               nGoodChannel++;
 611               sumProbChi2   += prChi2;
 612               sumA1         += par[1];
 613               sumProbChi2P2   += prChi2P2;
 614               sumA2         += par[2];
 615             }
 616           else // bad calibration
 617             {
 618               nBadChannel++;
 619               q=0;
 620               par[1]=0.5; a1=0.5; p1=0;
 621               par[2]=0.;  a2=0.;  p2=0;
 622               threshold=ADCMax();
 623
 624               // bad calibration counter
 625               char bpmanuname[256];
 626               AliMUONErrorCounter* uncalcounter;
 627
 628               sprintf(bpmanuname,"bp%dmanu%d",busPatchId,manuId);
 629               if (!(uncalcounter = (AliMUONErrorCounter*)uncalBuspatchManuTable->FindObject(bpmanuname)))
 630                 {
 631                   // New buspatch_manu name
 632                   uncalcounter= new AliMUONErrorCounter (busPatchId,manuId);
 633                   uncalcounter->SetName(bpmanuname);
 634                   uncalBuspatchManuTable->Add(uncalcounter);
 635                 }
 636               else
 637                 {
 638                   // Existing buspatch_manu name
 639                   uncalcounter->Increment();
 640                 }
 641               //                            uncalcounter->Print_uncal()
 642               uncalcountertotal ++;
 643             }
 644           gain=1./(par[1]*capa); // mv/fC
 645
 646           if(fPlotLevel>0)
 647             {if(fPlotLevel>1)
 648                 {
 649                   //                  if(q==0  and  nplot < 100)
 650                   //      if(p1>1 && p2==0  and  nplot < 100)
 651                   //                        if(p1>10 && p2>10  and  nplot < 100)
 652                   //    if(p1>=1 and p1<=2  and  nplot < 100)
 653 //                if((p1==1 || p2==1) and  nplot < 100)
 654                             if(nbpf2Dynamic<nbpf2  and  nplot < 100)
 655                     {
 656                       nplot++;
 657                       //              cout << " nplot = " << nplot << endl;
 658                       TF1 *f2Calib = new TF1("f2Calib",funcCalib,0.,ADCMax(),NFITPARAMS);
 659
 660                       graphErr = new TGraphErrors(nEntries,pedMean,injCharge,pedSigma,injChargeErr);
 661
 662                       sprintf(graphName,"BusPatch_%d_Manu_%d_Ch_%d",busPatchId, manuId,channelId);
 663
 664                       graphErr->SetTitle(graphName);
 665                       graphErr->SetMarkerColor(3);
 666                       graphErr->SetMarkerStyle(12);
 667                       graphErr->Write(graphName);
 668
 669                       sprintf(graphName,"f2_BusPatch_%d_Manu_%d_Ch_%d",busPatchId, manuId,channelId);
 670                       f2Calib->SetTitle(graphName);
 671                       f2Calib->SetLineColor(4);
 672                       f2Calib->SetParameters(par);
 673                       f2Calib->Write(graphName);
 674
 675                       delete graphErr;
 676                       graphErr=0;
 677                       delete f2Calib;
 678                     }
 679                 }
 680               tg->Fill();
 681             }
 682           pfilew << WriteGainData(busPatchId,manuId,channelId,par[1],par[2],threshold,q);
 683         }
 684       nmanu++;
 685       Int_t step=500;
 686       if(nmanu % step == 0)std::cout << " Nb manu = " << nmanu << std::endl;
 687     }
 688
 689   //      print in logfile
 690   if (uncalBuspatchManuTable->GetSize())
 691     {
 692       uncalBuspatchManuTable->Sort();  // use compare
 693       TIterator* iter = uncalBuspatchManuTable->MakeIterator();
 694       AliMUONErrorCounter* uncalcounter;
 695       (*fFilcout) << "\n List of problematic BusPatch and Manu " << endl;
 696       (*fFilcout) << " ========================================" << endl;
 697       (*fFilcout) << "        BP       Manu        Nb Channel  " << endl ;
 698       (*fFilcout) << " ========================================" << endl;
 699       while((uncalcounter = (AliMUONErrorCounter*) iter->Next()))
 700         {
 701           (*fFilcout) << "\t" << uncalcounter->BusPatch() << "\t " << uncalcounter->ManuId() << "\t\t"   << uncalcounter->Events() << endl;
 702         }
 703       (*fFilcout) << " ========================================" << endl;
 704
 705       (*fFilcout) << " Number of bad calibrated Manu    = " << uncalBuspatchManuTable->GetSize() << endl ;
 706       (*fFilcout) << " Number of bad calibrated channel = " << uncalcountertotal << endl;
 707
 708     }
 709
 710
 711   (*fFilcout) << "\n Nb of channels in raw data = " << nmanu*64 << " (" << nmanu << " Manu)" <<  endl;
 712   (*fFilcout) << " Nb of calibrated channel   = " << nGoodChannel << " (" << goodA1Min << "<a1<" << goodA1Max
 713               << " and " << goodA2Min << "<a2<" << goodA2Max << ") " << endl;
 714   (*fFilcout) << " Nb of uncalibrated channel = " << nBadChannel << " (" << noFitChannel << " unfitted)" << endl;
 715
 716   cout << "\n Nb of channels in raw data = " << nmanu*64 << " (" << nmanu << " Manu)" <<  endl;
 717   cout << " Nb of calibrated channel   = " << nGoodChannel << " (" << goodA1Min << "<a1<" << goodA1Max
 718        << " and " << goodA2Min << "<a2<" << goodA2Max << ") " << endl;
 719   cout << " Nb of uncalibrated channel = " << nBadChannel << " (" << noFitChannel << " unfitted)" << endl;
 720
 721   Double_t meanA1         = sumA1/(nGoodChannel);
 722   Double_t meanProbChi2   = sumProbChi2/(nGoodChannel);
 723   Double_t meanA2         = sumA2/(nGoodChannel);
 724   Double_t meanProbChi2P2 = sumProbChi2P2/(nGoodChannel);
 725
 726   Double_t capaManu = 0.2; // pF
 727   (*fFilcout) << "\n linear fit   : <a1> = " << meanA1 << "\t  <gain>  = " <<  1./(meanA1*capaManu)
 728               << " mV/fC (capa= " << capaManu << " pF)" << endl;
 729   (*fFilcout) <<   "        Prob(chi2)>  = " <<  meanProbChi2 << endl;
 730   (*fFilcout) << "\n parabolic fit: <a2> = " << meanA2  << endl;
 731   (*fFilcout) <<   "        Prob(chi2)>  = " <<  meanProbChi2P2 << "\n" << endl;
 732
 733   cout << "\n  <gain>  = " <<  1./(meanA1*capaManu)
 734        << " mV/fC (capa= " << capaManu << " pF)"
 735        <<  "  Prob(chi2)>  = " <<  meanProbChi2 << endl;
 736
 737   pfilew.close();
 738
 739   if(fPlotLevel>0){tg->Write();histoFile->Close();}
 740   if(fPrintLevel>1){fclose(pfilep); fclose(pfilen);}
 741 }